1ATGA

Azotobacter vinelandii periplasmic molybdate-binding protein
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
ELKVVTATNFLGTLEQLAGQFAKQTGHAVVISSGSSGPVYAQIVNGAPYNVFFSADEKSPEKLDNQGFALPGSRFTYAIGKLVLWSAKPGLVDNQGKVLAGNGWRHIAISNPQIAPYGLAGTQVLTHLGLLDKLTAQERIVEANSVGQAHSQTASGAADLGFVALAQIIQAAAKIPGSHWFPPANYYEPIVQQAVITKSTAEKANAEQFMSWMKGPKAVAIIKAAGYVLPQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Ligand size is a major determinant of specificity in periplasmic oxyanion-binding proteins: the 1.2 A resolution crystal structure of Azotobacter vinelandii ModA.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PERIPLASMIC MOLYBDATE-BINDING PROTEIN
molecule tags Binding protein
total genus 80
structure length 231
sequence length 231
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-08-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1atgA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1atgA02
1DMBA 4X9TA 1LLSA 2QS2A 3R7XA 1MY4A 1XT8A 4P0IA 1B2HA 2ZYOA 3OEKA 3K1PA 3CG3A 5AA1A 3MAMA 3CRBA 4QRZA 4XIGQ 4F29A 4O3AA 3KBRA 3S4UA 4ZDMA 5DEXA 2DWJA 1M5EA 4OEVA 4U1ZA 2I48A 2ZNUA 1FQBA 3MP1A 3THIA 2DS9A 3C4MA 1PBPA 1US4A 5I58A 1B51A 3MVWA 2Q88A 4KFQA 2F8DA 4K3FA 2VOZA 1I6BA 3DLNA 1AH5A 1R9QA 4PETA 2PT2A 3FATA 5CRYA 4DXUA 3OEMA 1MM6A 3IOUA 4F2OA 3SDFA 3WAFA 4DXCA 1NH7A 2XXHA 4OVJA 4BDQA 3M3KA 5IAIA 5DVIA 5KCJA 2F6GA 3VV5A 1A99A 3LC8A 2GHBA 1DTGA 1EH3A 1MQDA 3MP6A 1HSLA 4C1UA 4IY6A 4GXAA 4JSOA 4Q8RA 3EN3A 1JW4A 1MQGA 1B6HA 2NVUB 3FXRA 5ISUA 3ILTB 1OMPA 1BTJA 1MPCA 4ND9A 2XXIA 4HCWA 4OFLA 1BKAA 2YPNA 4FE8A 3FXQA 3T9XB 3W9VA 2VP1A 3TZAA 3FUZA 4U23A 5FTIA 1LGBC 4C1TA 3BBRA 1H76A 2QS3A 3H7MA 3U72A 3LR1A 3CI8A 2AL5A 4X48A 3C35A 1GV8A 1JETA 2F35A 2FNCA 2UVIA 5K2YA 4YICA 1B46A 5DVFA 2ONKE 3PV0E 3SEUA 5BWJA 1QJMA 4N6PA 4JBZA 4NF4A 1P1OA 4DCYA 2I4CA 1URDA 3FASA 5CBSA 3ZS6A 1LFHA 3K0VA 1JEVA 5TP9A 5BUUA 1P1QA 4OEUA 5ITPA 2RC9A 2OLBA 4G2ZA 4LP2B 1FCKA 3CVGA 1DOTA 2XX7A 3O66A 2Q2AA 2O1MA 4ZEDA 5FHMA 2FA7A 3IJXB 1ZIUA 5B7DA 1Y3PA 1EU8A 3O97A 4XKQA 3IB0A 4RPNA 3HHFA 4NF8A 3RY3A 3VFJA 3SETA 1DPEA 2F34A 4RA1A 5I59B 4XXUA 1IITA 2REGA 1O64A 4I62A 4RY1A 3PU5A 2XD2A 1S7YA 2XXQA 2GHAA 3E4RA 2QRYA 2DE3A 1MXXA 3KFMA 2AL4A 3FVNA 3K00A 1MXZA 2IEEA 1ZLQA 3K2DA 3KN8A 5M2VA 1NNFA 1BLFA 3PUYE 5EHMA 4ZEKA 1A8EA 2HQ0A 2I3WA 3CIJA 3G3GA 4QFOA 5H8HA 2I0BA 1LB8A 3LUYA 3TODA 2R9JA 1MDP1 3MUQA 3TKDA 1MQJA 5K2XA 5AE4A 1B7UA 4POXA 1YPNA 2O7IA 3IO4A 3TCFA 1URSA 3G3JA 2Q9TA 4R9GA 5KZTA 5I56B 1LBCA 2X7QA 2UVHA 3IO6A 4KI0E 3RUMA 1B7HA 4FEDA 1B5IA 1IEJA 1XVYA 3QAXA 4R74A 5ICQA 4U4SA 3MVXA 4ECFA 2FYIA 4JDFA 3I3VA 4IGTA 3RNNA 1OLCA 1Q1KA 1JVXA 2VGQA 3MC2A 4PFTA 4LA9A 3E3KA 1LAXA 1YCJA 1HSJA 4FEBA 3RQTA 4YU0A 3RN8A 3N94A 1I69A 1N7WA 4M4GA 5I2NA 1GGGA 3PGFA 4IO4A 3OO8A 4ZE8A 3MPKA 2B3FA 1EZPA 4IO6A 1OQGA 5DTBA 1MQHA 2I3VA 4UACA 1VE4A 3ONMA 4L17A 1OIBA 4ESWA 3PPOA 2QMXA 3IX1A 1D9YA 5LOMA 2RF1A 4Q0CA 4YB7A 3S9MC 3JV9A 4F18A 5HM4B 4R72A 4I9DA 1PBQA 3FZVA 1LAFE 3ILUB 2OBGA 4Z0IA 4G77A 5F1QA 1B5HA 2DWAA 4ZE9A 1IIWA 1LFIA 3ZKLA 5DT6A 4G68C 4JXIA 2ONRA 4F39A 3H3GA 2DE2A 3A09A 1URGA 4M1VA 1KWHA 2OZZA 3U1OA 3HO7A 1FTKA 1DTZA 5AA4B 3VLUA 4ELPA 3VVEA 4NF5B 1B05A 3SERA 4FORA 1N04A 4FAJA 1S9TA 3E13X 5FHOA 3MW0A 4MF3A 1B1XA 3O2AA 1B3GA 3BFTA 4I8CA 3K1NA 5TPAA 2F5XA 1VFDA 1R6ZA 4GL0A 3T96B 2UXAA 1P99A 1QW0A 3OO6A 1B5JA 2PMSA 4WEDA 2Y7RA 1IXIA 4H1XA 3RPWA 3TCGA 4ZECA 4G68A 1D3KA 4WEPA 1UIUA 3IB2A 4IO3A 3MJNA 4AB5A 5H8QA 1N76A 3RLFE 4F31B 2DVZA 4G4PA 4QFNA 2R6GE 1UTHB 5AA2A 3TELA 2V25A 4EDPA 3UA8A 4NF6A 4EF1A 5ICTA 1MY2A 2ZNSA 1O7TA 2Y7WA 1A7LA 2H99A 3C36A 1NNTA 5H8FB 3PPRA 1B7ZA 3MVZA 3FJGA 3TTLA 4H8JA 1MH4A 2D3IA 3Q28A 4LZ7A 3MP8A 2REJA 3R26A 3F11A 3T9HB 1R9LA 2QPQA 1MG1A 1SVXB 4ZZEA 4JSDA 3Q26A 1VSOA 4QFKA 1QKBA 4GFRA 3HHGA 1TWYA 3MZ9A 3W15C 3EPEA 4U2RA 4FJPA 3DP6A 2XXPA 3MBPA 1ZTYA 3OSRA 1HSEA 1IZ1A 1PB9A 3TDJA 2THIA 2XXXA 3V8XB 1CE2A 1NNKA 2XHDA 2Y7PA 4QFPA 3RGYA 1MXVA 3PMWA 1S50A 2V3TA 3O6IA 4OENA 2G93A 3U92A 2F78A 5F7VA 4F19A 4JB7A 3VDFA 3O28A 1Y4TA 3RT6B 3JYRA 4LZ5A 1I6AA 1UIVA 3VE1B 2OCUA 4LVQA 4KQPA 2ONSA 3CSBA 1ZU0A 2PVUA 4PP0A 1MQIA 1IXCA 3K6UA 5JK4A 4IO5A 4UA8A 2I6EA 4FECA 2Y7KA 1AOVA 3LSWA 4O3CA 3Q25A 4YKKA 1IXGA 4OERA 2UYEA 3L6GA 3S9EA 2XX8A 3ZSFA 4ISUA 5AA3A 1PC3A 1AMFA 1YAEA 3TTMA 3QXMA 3R6UA 3IAZA 1FW0A 4XKPA 4OZ9A 3MWBA 4NE4A 4OWDA 4PE5B 2Q2CA 1LFGA 2ANJA 4H0WA 4Q5TA 1B3HA 1ATGA 4X1BA 1SD3A 1ZJLA 3EHUA 1AL3A 5HBCA 1NMUA 3ODBA 3HCQA 4G8NA 1FQCA 3HSTA 2O7UA 3KZGA 3CSGA 3HPIA 1Z7ME 4QSEA 5DYHA 3KJTA 3CR9A 1FQAA 2RC8A 4EQ9A 3K6VA 2XD3A 5I57B 3H6VA 4MLQA 4U22A 1CB6A 5CBRA 3RT8A 1WVJA 5H8NB 4EUOA 1QUIA 1JVYA 1H43A 2XXRA 3K6XA 4OETA 3H6WA 4WKMA 4NF5A 3CFZA 4QSCA 1VR5A 2H4IA 4EQBA 2E1SA 4XKRA 2F36A 3VLWA 1SW2A 3UK4A 4R2FA 3MVYA 4KR5A 4H6DA 5IKBA 2DYXA 1B9JA 4DZ1A 3IB1A 2D5WA 4OXVA 3KSJA 3TYHA 2ESNA 2P1SA 1A40A 4LONB 2VHAA 1TXFA 2F7BA 3K02A 1B0LA 1H45A 3VVDA 1B4HA 1UQWA 4DLDA 2Z8FA 3AXFA 4MBPA 1EZOA 2GFEA 3M3FA 1SI1A 3UIFA 4BDNA 3T22A 1FQEA 1MY3A 1UTHA 3TQLA 3OMBA 1FQFA 1XS5A 1M5CA 4ZEFA 4KYSA 4YMBA 5JTYB 1SW1A 2OWTA 2I0CA 5H8FA 3EQ1A 3FD3A 4GD5A 3OO9A 2HEUA 4MFIA 4F3GA 1A8FA 4GQOA 2QL3A 3TTRA 4NMYA 1MPDA 3SKPA 2BJJX 1B4ZA 3HN0A 4ZEBA 5I2KB 2Q89A 1SBPA 4HCYA 1POTA 2F7AA 3PPPA 2R71A 4BDMA 2WKYA 4NTLA 3S9LC 2UVGA 4HTGA 3DM0A 1MDQA 1GR2A 4OFJA 1MY1A 3U94A 5KDTB 1Q35A 2QS1A 2DXYA 1DSNA 2H9BA 1MS7A 4OHNA 3T66A 1MH3A 3TAJA 2QS4A 3EF7A 1B3EA 4FATA 3JZJA 3KG2A 2VD3A 1Y9UA 4R75A 4DCXA 3FGSA 5KCJB 1M5BA 2F97A 3BKIB 3G3KA 1EZ9A 4PFWA 2KLFA 3KOSA 2A5TB 3GXAA 4HS7A 1SYIA 3PUVE 3OXNA 3H06B 2Z23A 4GL8A 2HXWA 3DP4A 1Y1ZA 2O6AA 3UGWA 3IORA 4FIMA 4EQ7A 3TUSA 1AIVA 5AA2D 4P11A 1J1NA 3FXUA 1RYXA 1ZMGA 2UVJA 3KN3A 1ZKBA 2H98A 2O69A 2O1LA 4TLMB 5FHNA 4EXKA 1B52A 1NNPA 3N6TA 4LQ2A 1N0TA 3WAEA 1QKAA 3T93B 4R6HA 1N7XA 4NWDA 1D9VA 2XXYA 4H65A 2IA4A 4TOZA 1MXYA 1IUDA 3H4ZA 1A54A 5A5XB 4H5GA 3ECRA 4DXBA 2B65A 4JWOA 4I1DA 2HZKA 2Z8EA 3KSXA 2V93A 5CM6A 2F7CA 2ZYKA 3PUXE 3FJ7A 3M8UA 4GWOA 1TFDA 2CMOA 4NF4B 4GF8A 4H8IA 2CZLA 4LZ8A 3K01A 3N26A 1N3WA 4E0XA 4IO2A 5L8DA 4JWXA 1B3LA 1RYOA 2O68A 4LUBA 5TP9B 3PUWE 3FV2A 4IB2A 2DE4A 4MH5A 3S9NC 2XXUA 2Y7IA 4N07A 5I84A 1BP5A 5EYFA 4G8MA 5CMBA 3G3IA 1LCFA 4R73A 4WXJA 4YB5A 4YB6A 1B3FA 4NF8B 3H6UA 3U93A 1USYH 4P0GA 4N13A 4AQ4A 1PDAA 4KCDA 3MPLA 5TU0A 1B1HA 3B6WA 3MQ9A 3Q29A 4GXSB 3PMVA 4PFUA 4ELRA 2O84X 1IQ7A 1PB8A 1ZBMA 3I6VA 1Y3QA 4DDDA 2F6PA 5I59A 2QSXA 2RC7A 5L9OA 3G7WA 4GLIA 1MXWA 4RNSA 2V84A 4F2QA 2OWSA 2QJEA 1MRPA 4OQOA 5JTYA 4LQ5A 3KGCA 3PD9A 3IR1A 3GBBA 4RPOA 1A55A 3SESA 3PPNA 2I58A 2HCAA 3LSLA 4PQJA 2ZMBA 3EHSA 3EHTA 5JEIA 2O51A 3KOTA 3KN7A 4R6KA 1LAGE 1SQYA 5I2KA 4Q30B 1XHYA 2Z22A 2DWHA 5CC2A 1WDNA 2V3QA 1Y4CA 3H6TA 5CMKA 5B70A 3TCHA 5I56A 4ZEIA 4POWA 5KDTA 4IO7A 1OQHA 5I2NB 3KEIA 4KYDA 1GVCA 4ZS9A 4DE8A 3PD8A 1QUJA 1VFEA 3U8QA 1UTBB 3PUZE 4YKJA 4F3SA 3C34A 2W7YA 3D4CA 4G8HA 3QIMA 4XTCQ 2H5YA 3G3HA 1ELJA 2ABHA 3VLVA 2A5TA 4BDOA 3M3LA 3T9VA 4U1OA 1Y3NA 4EXLA 2HFBA 4KPTA 1I6QA 3SEVA 4KCCA 1B0HA 4IY5A 3ZKKA 4YKPA 5CMMA 2DVCA 1NH8A 3B7DA 4QF9A 2PBWA 3D4GA 4R2BA 1D4NA 1SYHA 3QYTA 3A3UA 3L6HA 1YTVA 1OVBA 1ANFA 2ZNTA 3BFUA 1POY1 3TTNA 4QSDA 4IGRA 3P7IA 5DVJA 4GRKA 2AIXA 2XXVA 3O6GA 5TPAB 3QK6A 1XVXA 5A5XA 1H44A 1M5DA 4U4XA 5AA4A 3O29A 3SEYA 2NOOA 4R6YA 3H03A 4OESA 1L5TA 1PEBA 1MXUA 2AYSA 3B6QA 4G68B 2RCAA 1LCTA 5H8QB 4RK9A 3C9HA 4MLVA 5AA2B 1OLAA 3VXCA 3V83A 1MM7A 4EF2A 1JW5A 1JQFA 4NF6B 1JW1A 4X1DA 2DQVA 4RK2A 3W9WA 3HV1A 1WODA 3PMXA 2HAUA 3CG1A 4F1YA 4YZZA 5EHSA 2XXTA 2H25A 1NFTA 3K1MA 1JNFA 3FVGA 4LATA 3CFXA 3GBAA 5CMCA 3Q27A 4AB6A 1B58A 4KD5A 4BLAA 3T9UA 1FTLA 3QUJA 1Y1MA 3C31A 1SW5A 2ZYNA 3IK6B 4RJZA 1QUKA 1QULA 3TEPA 1SI0A 1LBBA 5DEXB 3UP9A 4F3PA 2XX9A 2D21A 4RYAA 2Y84A 1XOCA 4TLLB 2YJPA 3IOVA 2VD2A 2A5SA 4QFLA 1BIYA 4GIZA 2LAOA 3LSXA 2B3BA 4XKNA 3G3FA 5I58B 4ONYA 3TTKA 1H3DA 3VVFA 4R9FA 2RINA 3DP8A 3USDA 2I49A 4YAHX 2RCBA 4ESXA 4YMAA 4KHZE 4F22A 3SEWA 1SDXA 2V3UA 1LB9A 2QMWA 4H5FA 3IJOB 3KJ7A 5HPQA 1F9BA 1N3XA 3TPAA 2DOJA 4ELQA 3UN6A 1TFAA 3OO7A 3UORA 5L9SA 1Z7NE 1FTMA 1USYE 3FVKA 3OD7A 5H8SA 3RTWB 1II5A 3FVOA 2X7PA 4Z7EA 2NWJA 5CI5A 4HW8A 5ELVA 1Y20A 1UTBA 4OYVA 4RXLA 1P1WA 1P1UA 1RKMA 3PPQA 3N5LA 3E9XA 1LSTA 1FQDA 3A3CA 3I5OA 2M8CA 1O63A 4THIA 4OFOA 4TQUQ 2HZLA 3K6WA 2DSFA 2DP8A 3K4UA 5J1DA 3O9PA 1TT1A 3OOAA 2P2AA 1US5A 4F1UA 4OTEA 3FV1A 1FTOA 1MPBA 1IXHA 3IL1B 3IOTA 4NEDA 2ALUA 4F3BA 2Z8DA 1SW4A 3OSQA 2E0SA 2P0SA 3TMGA 2UYFA 1PB7A 1GTKA 3GZGA 2ZXTA 5I57A 1B40A 2X26A 4JWYA 2Q8JA 4ELOA 2DWIA 2XXWA 5H8NA 3LSFB 4YKIA 3MZ1A 1OVTA 3O6HA 5ITOA 2NXOA 4NWCA 3QUFA 3LBSA 1DPPA 5FTHA 2YLNA 2ZYMA 2OK2A 2HAVA 4H67A 4DIGA 3QSLA 3V5AA 2PX1A 1FTJA 3CFLA 1B32A 4E0WA 4U21A 3C33A 2PT1A 1JEUA 4GOTA 3FIRA 2DXRA 3N6UA 4BDLA 1P1NA 1MY0A 3VXBA 1NL5A 4QHQA 4PFYA 3B6TA 4ZZAA 4BDRA 4OMBA 1LAHE 2RKMA 1T0KA 1NKXA 4F1VA 4GVOA 3RTFB 3TQWA 2GH9A 1QVSA 3IOWA 3OELA 3V89B 1N84A 3SEXA 2G29A 1XC1A 3MZBA 2NUVA 2I4BA 1M5FA 4KYEA 2PYYA 2OJTA 4C0RA 1R1NA 3S2VA 2GRVA 4O3BA 5L9MA 3FJMA 3GLBA 3TFLA 3C32A 3DELB 5H8HB 3OENA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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