3OENA

Crystal structure of glun2d ligand-binding core in complex with l-glutamate
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
282
structure length
250
Chain Sequence
TQHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQLPEKRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRADMAIGSLTINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARPLKFGTVPNGSTEKNIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Ligand-specific deactivation time course of GluN1/GluN2D NMDA receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate [NMDA] receptor subunit epsilon-4
total genus 81
structure length 250
sequence length 282
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-08-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oenA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oenA02
3ONMA 4EQBA 3EHTA 1B1HA 1JW1A 3A3CA 1KWHA 1XS5A 2QS4A 3PPPA 2PT2A 1LFHA 2X7PA 2E0SA 4KCDA 4OZ9A 4ELQA 3N6UA 1Z7ME 1JEVA 2B3BA 1MY4A 4EXKA 4FAJA 1JETA 1XHYA 3FXQA 1MH4A 2NXOA 3I6VA 1FQDA 2XXIA 4GRKA 3ZSFA 3VFJA 4FATA 2XXXA 3KGCA 4H5FA 1MXZA 3T93B 5H8SA 3UGWA 5CMCA 1H45A 2XXWA 1XOCA 2OWSA 1IITA 3L6GA 1B7ZA 3IJXB 1B05A 2RCAA 2Z8FA 1GV8A 3FVKA 2O84X 5I58A 1P99A 4KD5A 4H8IA 2OZZA 3H6VA 3MP6A 4EQ9A 1LB8A 1LB9A 4QSCA 4YB7A 5FHOA 4DIGA 1BIYA 1FTOA 4EXLA 1O64A 5ICTA 1AIVA 4C0RA 2Q2CA 2CZLA 4F39A 1WODA 1ZU0A 4F19A 1B52A 2QRYA 3FJ7A 3O28A 3UN6A 1UIVA 3DP4A 4ZEKA 3K1PA 3VLUA 1GTKA 3DELB 3RGYA 1NNTA 4HS7A 2IA4A 3S2VA 1MY3A 5AA4A 4OETA 1MPDA 1XT8A 3ZKKA 1N84A 5TP9A 2DXYA 1TXFA 4R74A 4OERA 2ZYMA 1Y9UA 2Z23A 3TFLA 4U2RA 4IGTA 4FJPA 4RPOA 3N6TA 3RUMA 2DYXA 1UIUA 5AA2D 3S9LC 1JW4A 5I2KB 4KCCA 1PBQA 2OWTA 4TLMB 4FE8A 2V84A 1MXYA 1QUIA 4JWOA 4LVQA 4BDNA 5ELVA 5DVJA 2XXHA 3JV9A 3Q27A 3K2DA 3CFLA 4N07A 4NEDA 1Y3PA 1ZIUA 4X48A 2DP8A 3GXAA 1MDP1 3R26A 3QAXA 3IL1B 4FEDA 4ZDMA 3TMGA 4IO2A 2Q9TA 4BDOA 1LAFE 2DE4A 3HN0A 1Q1KA 1USYE 3KN3A 4MLVA 3KJ7A 4UA8A 3RTFB 4BDRA 4F1YA 4MFIA 4E0XA 3KEIA 3UP9A 2AL5A 1USYH 1ANFA 3SEVA 4IB2A 2I3WA 3E9XA 4EUOA 1IIWA 4IY5A 1UTHB 1S50A 4F2OA 5F7VA 3CFZA 1BTJA 2Y7RA 1M5BA 3HPIA 1MQDA 1EH3A 3FASA 2H9BA 1OVBA 1P1UA 3M8UA 3OELA 1LBBA 3SEYA 5HPQA 1SW1A 3OO6A 4XKPA 4OQOA 5EYFA 5I59A 1OIBA 2YLNA 1H44A 4O3CA 4H65A 5ICQA 3IK6B 5CRYA 4X1DA 5H8HB 2HCAA 1LCTA 3K6VA 3MW0A 1B51A 3OO8A 1N3WA 4JSOA 4X1BA 3I5OA 5H8FA 2ONSA 3O29A 2A5SA 3O9PA 2Q8JA 2O1LA 2ZXTA 3IR1A 3TTMA 5A5XB 3C35A 3O6GA 2XXQA 4G77A 4XKQA 1B2HA 3O97A 1SYIA 3BFUA 1B5IA 3TTKA 3MPKA 3FJGA 3H4ZA 4THIA 1FTKA 4F1UA 1FTMA 2DWJA 3L6HA 2F5XA 4OFLA 4R2FA 4UACA 4YKKA 5DVFA 2H25A 3KJTA 5H8NA 1FQBA 3IOUA 5L9MA 2VP1A 3FIRA 3K1NA 1VSOA 3B6QA 2UXAA 4EQ7A 2V3TA 4EF2A 4R9FA 4GLIA 3MBPA 3FVGA 2QSXA 1I6BA 3HO7A 1N76A 3AXFA 4R6HA 3FGSA 4YAHX 4LA9A 2QJEA 5I59B 1QW0A 3C31A 2FNCA 1AL3A 2RCBA 2X7QA 4QSEA 5CC2A 4OYVA 3VXBA 3T9UA 3KN7A 4KQPA 5KCJA 1LBCA 2F7CA 1ZKBA 4QHQA 5F1QA 4JBZA 5KZTA 2V3QA 4NF4A 2DSFA 4GVOA 1A55A 2I3VA 5AE4A 3D4CA 2F78A 3LSWA 1NMUA 2P0SA 4OXVA 4LP2B 3HCQA 4QFOA 4YZZA 3G3GA 4YMAA 2OBGA 3TYHA 3A3UA 4DCXA 4QSDA 1TFAA 4ELRA 4RNSA 5JK4A 2RC7A 5H8HA 4R6YA 3W9VA 4Q8RA 1D9VA 4BLAA 5I2KA 1Y4CA 2I58A 3EHSA 1MQHA 2QS2A 3PMXA 1UQWA 3LSLA 1Y4TA 2F8DA 3H03A 3RTWB 2HEUA 1VFEA 2DVCA 1FQFA 2RC8A 3V5AA 3ZS6A 1MG1A 4KI0E 4OESA 4JB7A 2XX7A 4OFOA 4YKPA 5CBRA 3C33A 2PYYA 4FECA 4R73A 2Y7IA 1P1QA 3CG1A 2VD2A 2B3FA 4U1OA 4JXIA 1IXIA 3DM0A 5DT6A 5H8NB 2QMWA 4ESWA 2DWIA 1MS7A 2XD3A 3OENA 1B5JA 3O2AA 4H8JA 2XXUA 3K02A 4HTGA 1JEUA 2PX1A 4TQUQ 3VVFA 3LSFB 2ZYKA 3FXUA 5I56A 5K2YA 1N0TA 3PMVA 4TOZA 1MM7A 5HBCA 3FZVA 2ABHA 2NWJA 5KCJB 1TWYA 2BJJX 3DLNA 1P1WA 5A5XA 3MJNA 2DVZA 3SERA 1PB8A 2I4BA 3ECRA 1DTZA 1B4HA 2RC9A 4OEUA 3LR1A 4NWCA 1Y20A 3FUZA 3C32A 3Q26A 3TTLA 1B3LA 3N26A 4R72A 3RT8A 3TDJA 1LAHE 4QFNA 2ZYOA 5IKBA 3PUZE 5B7DA 2Y7PA 1MM6A 1WVJA 4DLDA 4YMBA 3BBRA 4C1UA 3MP8A 3P7IA 3U72A 4Z0IA 3T9VA 4H67A 1LGBC 2R9JA 1LLSA 2XHDA 1JVXA 5I2NB 3K0VA 4GOTA 4U1ZA 4ZEDA 3GBBA 1EZ9A 1YAEA 3TODA 1EU8A 1MQIA 2NUVA 2ZNTA 3FD3A 4NF8B 4NMYA 3B6TA 1OMPA 4IO4A 3OEKA 3PUXE 2HFBA 4IY6A 1IXGA 1TFDA 1MPBA 2O7IA 2UVJA 3CR9A 1URGA 1OLAA 3T9HB 3WAEA 5KDTA 1GVCA 1B3FA 3IOTA 4JWYA 2Y7WA 3MVYA 3QIMA 4ONYA 3OMBA 4OWDA 3U92A 4MBPA 5I56B 3Q28A 3B7DA 1MY2A 1D3KA 4DXUA 1YCJA 3TELA 2REJA 1RYOA 1L5TA 4U22A 4F29A 5HM4B 3O6HA 4G8NA 1IUDA 4WKMA 4H5GA 1B5HA 1A7LA 1R6ZA 2I0BA 3EF7A 3M3FA 2FA7A 2NVUB 3CIJA 4LZ8A 3SEWA 4ZZEA 2PT1A 2I4CA 2I0CA 4FORA 4HCWA 1B7UA 2Q2AA 4RXLA 2ANJA 3CSBA 3ZKLA 2PVUA 3V89B 3C36A 3LC8A 3FV1A 1DPPA 4FIMA 1ELJA 2I48A 4RY1A 5CI5A 2NOOA 2OJTA 3IO4A 3TQLA 5JTYA 4IGRA 1D9YA 1B7HA 1MDQA 2ESNA 1A40A 1XVXA 2W7YA 3OO9A 5K2XA 1PBPA 4QFKA 4DDDA 2Y84A 5FTIA 4R75A 3KZGA 3MVXA 1DOTA 3T22A 2F7BA 3HHGA 3T9XB 3V8XB 2B65A 1SDXA 4H1XA 4NF6A 4ZE9A 3M3KA 4PQJA 2AYSA 3FXRA 3H3GA 4M1VA 4P0GA 3W9WA 4EDPA 3MC2A 1SVXB 3HV1A 4H6DA 1SI0A 2XXVA 4XTCQ 3UORA 2DE3A 3VE1B 2Y7KA 1I6QA 1QUJA 4GFRA 4AB5A 4AB6A 1H3DA 3N5LA 3MZBA 1FQCA 2DWAA 4I1DA 3IB1A 2ONKE 2RKMA 5AA2B 3U93A 3TCFA 2HZLA 4Q30B 2H5YA 1OQGA 3D4GA 3U8QA 3JYRA 1MH3A 4IO5A 1LFIA 4TLLB 4PP0A 2ZYNA 4Q5TA 2QPQA 3S4UA 1NH7A 2RF1A 3KN8A 4P11A 2VD3A 4KHZE 1LFGA 4XXUA 4WEPA 3C4MA 4LQ2A 5BUUA 2O68A 3H06B 3E4RA 2CMOA 3MPLA 1SD3A 4OMBA 5EHSA 3R6UA 1B9JA 3CVGA 1FW0A 3C9HA 4ND9A 3VVEA 3TEPA 2QS3A 2G93A 2QMXA 3Q25A 5TU0A 5I58B 3VLVA 4ISUA 1JNFA 3S9NC 2DS9A 4R9GA 4RYAA 1QJMA 3HHFA 3MWBA 4IO7A 3BKIB 4O3BA 4C1TA 4G68A 4PFYA 4BDLA 3K01A 1N7WA 3EHUA 5LOMA 1Q35A 1QUKA 3E13X 3GBAA 1GGGA 2GFEA 3F11A 2A5TA 4FEBA 3UIFA 3KFMA 3IOWA 1POY1 2F35A 2XX9A 3EN3A 4XIGQ 5AA4B 4GXSB 5CMBA 2DQVA 2XXYA 4AQ4A 4KYDA 4Q0CA 4QF9A 1PB9A 3G3KA 1XVYA 3ILUB 1AOVA 1I69A 2R71A 1IXHA 1R1NA 3JZJA 3PPQA 3E3KA 4M4GA 3U94A 1ZBMA 4F3PA 4F2QA 3TAJA 2F6GA 5JEIA 3IB0A 3EQ1A 3T96B 3MUQA 2HQ0A 4F22A 4YU0A 1Y3NA 1JVYA 1M5CA 4LUBA 4OENA 3PMWA 3RT6B 4KFQA 3SKPA 4POWA 4QRZA 3SEXA 1M5FA 5I57A 4G8MA 4GF8A 1LAGE 4U23A 1OVTA 3RLFE 4RA1A 2UVGA 1IQ7A 3IORA 1AMFA 1FQAA 2X26A 3K4UA 4GIZA 3Q29A 3IAZA 2A5TB 5DVIA 3TCHA 5H8QB 2LAOA 4LONB 4ELPA 3VV5A 4F3GA 5I2NA 2ZNUA 4PETA 4GD5A 3RQTA 4YICA 4RJZA 5M2VA 1UTHA 1PEBA 2ZNSA 4DZ1A 3PPOA 5FHNA 5ISUA 3KSJA 5CBSA 1HSEA 1UTBA 1UTBB 1YTVA 4NF4B 3RY3A 1YPNA 2O7UA 3I3VA 3PD8A 5B70A 5KDTB 2P2AA 1PB7A 2THIA 2Z8DA 1MRPA 2XD2A 5DTBA 1A8FA 5CM6A 3QUJA 1POTA 3H7MA 1N3XA 2OK2A 2V93A 1R9QA 3G3JA 2O1MA 4IO6A 2ONRA 3HSTA 5AA3A 4I9DA 2OCUA 3EPEA 3CSGA 4YKIA 2DOJA 3QSLA 5H8FB 1H43A 3T66A 4R6KA 2F34A 1D4NA 3PGFA 1NL5A 3TPAA 4H0WA 4ZECA 5L9SA 4XKNA 1QKAA 3IO6A 2XXRA 1FCKA 3O66A 1NNPA 4KYSA 4EF1A 1IXCA 4ZE8A 4NTLA 1B3GA 3PU5A 3RN8A 5ITOA 1GR2A 2HZKA 3BFTA 2F36A 2VHAA 1NKXA 1JW5A 1QULA 2G29A 4OHNA 3TQWA 3TZAA 3KOSA 1A8EA 5DEXA 1US4A 4ZEFA 3U1OA 1P1OA 3K6XA 3KOTA 2Z22A 2Z8EA 3CFXA 3KG2A 3MZ9A 3H6TA 1B0HA 1M5EA 1DTGA 4R2BA 2KLFA 2XXTA 5AA1A 3FJMA 4Z7EA 1PC3A 1SYHA 2DXRA 3TUSA 3LSXA 1S9TA 3K6WA 4L17A 3S9EA 1DSNA 1VE4A 2D5WA 3IB2A 3FVNA 2VGQA 4ELOA 1Y1MA 1QVSA 1WDNA 3VXCA 3RPWA 5CMMA 3CI8A 4XKRA 3R7XA 1B4ZA 5AA2A 1URDA 2V25A 2ZMBA 5ITPA 1BLFA 1I6AA 1BP5A 1VFDA 3PPNA 2HXWA 5TPAA 3GZGA 3H6UA 3DP6A 4PE5B 3QUFA 5I57B 2QL3A 1IZ1A 1PDAA 1Z7NE 1SI1A 1FQEA 1F9BA 2O6AA 4RK2A 3OO7A 2D3IA 3PV0E 3A09A 4I8CA 4OFJA 5FTHA 4IO3A 4JSDA 4PFWA 3SETA 4DXCA 1ZLQA 3N94A 1SW2A 4WXJA 5H8QA 1R9LA 2R6GE 2H99A 1ZMGA 3ILTB 2XXPA 3K6UA 1URSA 1A54A 3K1MA 4GXAA 4JWXA 1N7XA 5DYHA 5L9OA 3LBSA 3TKDA 1LCFA 3M3LA 4GL8A 1RYXA 2UYFA 4NF8A 1SW4A 4GQOA 1DPEA 1MXVA 4ECFA 4LATA 1ZJLA 3OSRA 4HCYA 1B1XA 3MAMA 5EHMA 2GHAA 1SW5A 4F1VA 4U21A 3TTNA 3OSQA 5TPAB 2I49A 3PPRA 1IEJA 3B6WA 4OEVA 3MVZA 4POXA 4YB6A 4F3BA 2QS1A 5TP9B 2F6PA 1MXXA 3VDFA 4GL0A 3S9MC 1A99A 3MVWA 1P1NA 3PUVE 1OQHA 2DWHA 3WAFA 3PUYE 3FATA 1Y3QA 3K00A 2D21A 2GRVA 3OXNA 4LZ7A 3KSXA 4NF5B 4U4XA 1O7TA 2YPNA 3TCGA 3G3HA 4F31B 3UA8A 1NNFA 3IX1A 3ODBA 3IJOB 4G4PA 2GH9A 4P0IA 3LUYA 3QYTA 1MXWA 4G68B 3UK4A 1B6HA 1J1NA 3RNNA 4X9TA 2ALUA 1LSTA 3SESA 4ZEIA 1T0KA 4KR5A 1B3HA 4F18A 5J1DA 3THIA 3GLBA 2XX8A 2P1SA 2DE2A 1B46A 2UYEA 4K3FA 3SDFA 1RKMA 2HAVA 2RINA 2UVHA 1NNKA 3CRBA 1EZOA 3CG3A 1US5A 1MPCA 2E1SA 5BWJA 2IEEA 2I6EA 2VOZA 4KPTA 3C34A 1FTLA 2GHBA 3V83A 3MP1A 3IOVA 2UVIA 2F7AA 4JDFA 1ZTYA 4OVJA 5CMKA 4MF3A 2REGA 1S7YA 4OTEA 1QKBA 3G7WA 2V3UA 4NF5A 4HW8A 1Y1ZA 1ATGA 5L8DA 2Q89A 3KBRA 4U4SA 4RK9A 3OD7A 1N04A 2PMSA 2OLBA 3VLWA 2F97A 2H4IA 2WKYA 1B3EA 4QFPA 1B32A 1HSJA 5I84A 1NFTA 2H98A 4N6PA 2Q88A 4DE8A 2HAUA 4ZS9A 4BDQA 1DMBA 4YB5A 1M5DA 1HSLA 1JQFA 3TTRA 3VVDA 4NE4A 5FHMA 1II5A 3H6WA 1NH8A 4F3SA 1H76A 4G8HA 4MH5A 1B58A 4E0WA 5IAIA 1CB6A 2FYIA 2PBWA 2AIXA 3O6IA 4G2ZA 4O3AA 1SQYA 4ZZAA 4DCYA 3FVOA 1EZPA 1B0LA 3SEUA 1B40A 5JTYB 1AH5A 1XC1A 3QK6A 5DEXB 3FV2A 4LQ5A 4N13A 1MQJA 3MZ1A 1OLCA 3QXMA 4WEDA 3PD9A 3OOAA 4YKJA 4DXBA 4QFLA 3G3FA 1O63A 1MY1A 1MQGA 2O69A 3G3IA 3PUWE 4MLQA 1TT1A 4NF6B 1BKAA 2M8CA 2YJPA 1LAXA 4I62A 4LZ5A 4NWDA 3OEMA 2O51A 3W15C 4ESXA 4ZEBA 4PFUA 4KYEA 3MQ9A 1SBPA 3DP8A 1MY0A 1CE2A 4RPNA 1MXUA 4GWOA 1VR5A 4PFTA 3USDA 2AL4A 1FTJA 4BDMA 4G68C
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ONMA 1IMBA 2QS4A 1XS5A 2PT2A 4KCDA 1Z7ME 1MY4A 4EXKA 1FQDA 1FPDA 1MXZA 3IJXB 1GV8A 2O84X 1P99A 2B4MA 3H6VA 1LB8A 4YB7A 5FHOA 5ICTA 4F39A 4F19A 3FJ7A 3UN6A 3DP4A 3VLUA 3T0JA 4HS7A 2IA4A 2XXKA 3ZKKA 1NV4A 4OERA 1Y9UA 2Z23A 4OVTA 4IGTA 4U2RA 3RPLB 5AA2D 3S9LC 4KCCA 1PBQA 1VDWA 2V84A 5DVJA 2XXHA 3JV9A 3Q27A 2P3NA 1Y3PA 4O94A 1ZIUA 2HPGA 4FEDA 2Q9TA 4BDOA 3HN0A 1Q1KA 3KN3A 4F1YA 4MFIA 4E0XA 3KEIA 1ANFA 2I3WA 3E9XA 1UTHB 5F7VA 3CFZA 1BTJA 2Y7RA 1M5BA 1MQDA 3FASA 4HXVA 2H9BA 5ICQA 4OQOA 2HCAA 1LCTA 3OO8A 4OVQA 5H8FA 2ONSA 3O9PA 3TTMA 3EKIA 3C35A 3O6GA 3E78A 3MPKA 3H4ZA 2DWJA 2F5XA 4UACA 4YKKA 2VP1A 3K1NA 4EQ7A 3MBPA 3HO7A 4O8MA 3AXFA 4R6HA 3FGSA 4YAHX 2X7QA 5CC2A 4OYVA 3KN7A 4KQPA 4QHQA 4GX6A 4LP2B 3HCQA 3G3GA 3A3UA 4QSDA 1TFAA 5H8HA 4N4UA 5I2KA 1Y4CA 2I58A 3EHSA 2HEUA 2RC8A 4OESA 3C33A 2Y7IA 3CG1A 1FPGA 2VD2A 4U1OA 5DT6A 5DW8A 3QMFA 2DWIA 4H8JA 1FJ9A 1LEVA 5EQ7A 3FXUA 5I56A 4PDHA 3PMVA 3GYYA 5HBCA 2NWJA 5EQ8A 1P1WA 4H45A 2PFYA 4NGUA 1PB8A 3ECRA 1B4HA 2RC9A 1Y20A 1B3LA 3RT8A 3PUZE 4N6KA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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