3OENA

Crystal structure of glun2d ligand-binding core in complex with l-glutamate
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
282
structure length
250
Chain Sequence
TQHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQLPEKRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRADMAIGSLTINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARPLKFGTVPNGSTEKNIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Ligand-specific deactivation time course of GluN1/GluN2D NMDA receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate [NMDA] receptor subunit epsilon-4
total genus 81
structure length 250
sequence length 282
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-08-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oenA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oenA02
1D4NA 3RPWA 5I58B 1URGA 3KGCA 4R75A 3SEVA 4F31B 3LSLA 4GWOA 4QHQA 1QUIA 4P11A 4QF9A 4OMBA 1B9JA 3KOSA 5FHMA 3C32A 4TLLB 5ISUA 4U2RA 1CE2A 1B52A 4JBZA 1LB8A 3HV1A 2Y84A 5I2NB 4Q0CA 1GR2A 1RKMA 4IGRA 4OETA 4KCCA 1QVSA 2YJPA 5DEXB 2HCAA 3BFUA 1J1NA 3IO4A 2A5TA 3IJOB 4TOZA 2F8DA 3K4UA 5H8HB 5ITPA 4U23A 3G3JA 1DSNA 1I6AA 1M5CA 3Q26A 3TTMA 4IO7A 5ELVA 4H6DA 2E0SA 3MWBA 2OLBA 1YCJA 4NF6B 3MBPA 5K2YA 4NF8A 1IXIA 3T66A 1B3GA 4F3GA 1DTGA 4KFQA 1HSEA 2R6GE 1PB7A 3H03A 4DCYA 3MQ9A 4IO3A 1M5BA 2F34A 1LAHE 1ATGA 5ICQA 2XXQA 3MZ9A 3TDJA 3WAFA 1LAGE 2RF1A 2M8CA 3IOVA 3IJXB 5TP9A 3SESA 2XXUA 5CMMA 5IKBA 1Y3QA 3S9EA 3LSFB 1LAFE 3IL1B 4XKPA 1N7WA 3OEKA 1UTHB 1Y1MA 5M2VA 2UVIA 2IEEA 1UTBA 1GTKA 1P1NA 1NH8A 1USYH 4XKNA 4N13A 4LP2B 3FATA 5AE4A 2Q89A 1POY1 2DQVA 1XT8A 4C1UA 2E1SA 1I6QA 4M1VA 3V89B 3CI8A 4XXUA 3GZGA 1DOTA 2HAUA 3BKIB 3G3IA 3PUYE 3KSJA 3UN6A 4G68B 3HCQA 1B1XA 2Y7IA 4WEDA 1VFEA 3DP6A 4DDDA 4MLQA 1N76A 4LZ7A 5JK4A 3PD9A 4HCWA 4Q8RA 1LFGA 1JW5A 4G2ZA 1MM7A 3K6WA 3VE1B 1IZ1A 2HAVA 1SW2A 4IO4A 4LA9A 2RC9A 5I58A 3QUFA 3U94A 3N6UA 2Y7WA 2DWJA 3H6TA 1OQHA 2XXHA 3K01A 1OIBA 4QFPA 4X48A 4Z7EA 3FUZA 5FHOA 3DLNA 2H98A 2DOJA 3KBRA 5I2NA 3PPQA 1NL5A 1DPPA 2D21A 2VGQA 4E0XA 2P1SA 4NWDA 4G8HA 2QMWA 3FJMA 4JWOA 2F7AA 4QSDA 3B7DA 3ZS6A 4F3SA 3QAXA 2W7YA 5DEXA 3MW0A 1VE4A 5H8SA 4ELQA 1SW1A 4N6PA 5K2XA 2HFBA 3FVKA 3D4CA 3OEMA 1H45A 3U93A 3ONMA 3TZAA 2H5YA 1MS7A 3Q27A 1TFDA 4LQ2A 4F22A 5H8HA 2O6AA 4OVJA 3MVWA 3VLVA 2DS9A 4ZEKA 3VDFA 3CSGA 4QFLA 2OJTA 3KSXA 4G77A 1AOVA 3FJ7A 2ONKE 4XTCQ 2OK2A 2Z23A 3TAJA 4RA1A 3PUWE 1MQHA 2F36A 2V3UA 1NKXA 4YMAA 2FYIA 1H43A 1B6HA 4NF5B 4LVQA 3PPPA 3CR9A 1S9TA 3G3GA 2FA7A 3MPKA 3O6GA 1WDNA 4IO2A 3RGYA 1FQEA 1DTZA 4R2BA 4AB5A 3IR1A 3JYRA 1B51A 1B7ZA 3OO8A 5DTBA 1SDXA 4H8IA 1AMFA 4NTLA 4RXLA 3OELA 4R6YA 3MJNA 4IO5A 1OVTA 1LCFA 4OZ9A 1SBPA 1MXZA 3PPOA 1A55A 1DPEA 3PUVE 4R74A 2UYFA 1SI1A 1JETA 3VXCA 1B0HA 1EZ9A 2F7CA 5FHNA 1UTHA 1ZBMA 2Y7RA 1BKAA 4FJPA 4GD5A 1A8EA 3SDFA 4DLDA 1P1QA 3D4GA 3EHTA 2XXRA 1B3EA 3ILTB 5L8DA 2OCUA 3LSWA 4F1UA 1GVCA 2XXVA 3FVNA 1AH5A 4NEDA 4H5GA 4G68A 3V83A 3KN3A 1MM6A 2BJJX 3VVEA 1NNPA 3K6XA 3E13X 2QSXA 1R9LA 5DVFA 1R6ZA 1EH3A 5H8QB 2HZKA 4GOTA 1A7LA 1II5A 4ZZAA 1ZIUA 1SW4A 3R6UA 4N07A 2R9JA 3W9VA 1NNTA 2ZYOA 3VFJA 3THIA 3SEXA 2O1LA 3FV1A 2F5XA 3VLWA 4EQ9A 5CI5A 3VXBA 4KPTA 4R73A 2QMXA 2GHAA 2XHDA 1MXXA 3M3FA 3PV0E 1H3DA 4PQJA 5EHSA 3G7WA 2XD3A 1O64A 4YMBA 3KG2A 3H4ZA 4BDRA 3IX1A 3AXFA 1IUDA 2F6PA 4OYVA 2F6GA 4YB6A 5CMBA 3F11A 2Z8EA 3OO6A 2DWHA 4LQ5A 5HM4B 3O66A 2DXRA 1MXWA 1ZJLA 4GL8A 2XX7A 1B4ZA 1MPBA 3MPLA 4QRZA 4U21A 1Y3PA 3KJTA 4R72A 5ICTA 2PT2A 4GXAA 1JVXA 3QK6A 4O3AA 2Q88A 1XOCA 3JZJA 3BFTA 3S9LC 4I1DA 1IXGA 3IOWA 1PB8A 2I0CA 2RC7A 4XKRA 3UGWA 5AA3A 2XXIA 3RLFE 4NF5A 4RJZA 1UQWA 2A5SA 1LFIA 4DIGA 4DXUA 4OEUA 2REGA 3KN7A 3CG1A 4ONYA 5EYFA 1EZPA 3PUZE 1LCTA 1MH4A 5JTYB 4TLMB 1T0KA 4PFUA 1VSOA 4FIMA 1MXUA 5AA1A 2X26A 4U4SA 1TFAA 2I4CA 1XHYA 1KWHA 5LOMA 2O69A 2ABHA 4GLIA 3TQLA 4YKPA 3FXQA 4E0WA 4R6HA 5B7DA 3T22A 5I59B 1ZU0A 2OZZA 3HO7A 2X7QA 1Y9UA 1B4HA 1JVYA 4IY6A 3MVXA 4KHZE 1QULA 1JQFA 1YPNA 1O7TA 4Z0IA 2H25A 4OQOA 4OWDA 3TELA 3I3VA 3U1OA 2GH9A 4C0RA 4IB2A 3SETA 1IITA 4C1TA 4WXJA 5H8QA 1B2HA 4XKQA 1SVXB 3TCGA 3MVYA 3U72A 1FCKA 1B5IA 1MQJA 1UIVA 1B05A 4KD5A 1N04A 3V5AA 2RKMA 4YB5A 5FTIA 4R6KA 3T93B 1BTJA 3N5LA 4ESXA 3CRBA 3T96B 1HSJA 4EUOA 3I6VA 3T9UA 1TWYA 1Y1ZA 4EF2A 3PPNA 3M3KA 2DSFA 2DWAA 4OFLA 3MP1A 2HQ0A 1SYIA 4YU0A 4JWXA 3HPIA 1TT1A 4BLAA 1B46A 1A54A 3KEIA 2ZYKA 2RCBA 2Q2CA 4YKIA 3K1NA 5TPAB 4FE8A 2VOZA 2I3WA 3LUYA 5H8FB 3TTRA 4GIZA 3O6IA 3OO9A 4BDMA 3L6GA 1VR5A 1YAEA 4ZEFA 5BUUA 3A09A 4KR5A 3IB1A 5L9MA 1S7YA 4Q30B 1NMUA 3LR1A 1MY1A 3GXAA 1EU8A 4EDPA 3U92A 2QS2A 1OMPA 3C9HA 3K6UA 5BWJA 4KI0E 2DE3A 5JTYA 1FTOA 1QJMA 3H6UA 4M4GA 3DP4A 3EHSA 4F1VA 3UP9A 1QUJA 3B6QA 4THIA 1POTA 1H76A 4G8MA 2I58A 1OLAA 1MQGA 1URSA 2ZNUA 1PEBA 4NE4A 4POXA 1Y4TA 5I59A 2DP8A 3B6TA 1N84A 1LAXA 4ESWA 4H67A 3K1MA 3LBSA 2I49A 2UYEA 2ONSA 5F1QA 3RN8A 4I62A 3TPAA 4TQUQ 1R1NA 2DWIA 3TTKA 4GFRA 5JEIA 3TCFA 5FTHA 3TODA 4MF3A 1JEVA 1RYOA 1IQ7A 3H7MA 3DELB 3FIRA 1SQYA 2PBWA 3FJGA 4FEBA 3TQWA 1XC1A 2NWJA 3VLUA 4F1YA 3FXRA 4NF6A 4ZDMA 4U1ZA 3EF7A 3H6WA 2AL5A 1N0TA 1OVBA 1MQDA 3QIMA 4OENA 3E4RA 1P1WA 2ESNA 4X1BA 3RT8A 1MG1A 3OENA 2DYXA 5B70A 5AA4B 4WKMA 5DT6A 1D9YA 4G4PA 3SERA 3QUJA 3OSQA 2DVCA 1B40A 1ZKBA 3G3HA 3Q29A 3C35A 1I69A 4H8JA 3QYTA 3IOTA 3MP6A 3RUMA 4QFKA 4BDLA 1QW0A 4F29A 4KYEA 1NFTA 1B0LA 1S50A 1Q1KA 1MY4A 1B3HA 2I6EA 3EQ1A 4NF4B 5I57B 3IB0A 3SKPA 3KN8A 1CB6A 3MAMA 5TPAA 3L6HA 5H8FA 3OD7A 4KQPA 2V3QA 4MBPA 2AL4A 3I5OA 1FQCA 1ZTYA 4H65A 3C34A 3GBAA 2QJEA 5TU0A 2G29A 5IAIA 2A5TB 1GGGA 3PD8A 3DP8A 2F7BA 4ZE8A 2O51A 5I56B 4OFOA 2B65A 2Q2AA 4YKJA 4GQOA 2F35A 1MQIA 4P0IA 1Z7ME 4AQ4A 2XXPA 1FQFA 3HN0A 2AYSA 3TUSA 4UACA 1P99A 3K00A 4RNSA 3MC2A 4KYDA 1VFDA 3FVOA 2ZYMA 5HBCA 3CFXA 4DCXA 4LZ8A 3ODBA 4EF1A 5CMKA 4JSOA 3HHFA 1A40A 1MPDA 1M5EA 4EQBA 1JEUA 1Q35A 2Q8JA 1L5TA 3U8QA 3R26A 4KCDA 1B32A 2P0SA 4JSDA 3GBBA 4AB6A 2AIXA 4PFWA 3CFZA 4QFOA 2H9BA 2F97A 5CBSA 1I6BA 1Y3NA 2PYYA 1IIWA 5TP9B 5CBRA 5KDTB 3EHUA 5H8NB 4Q5TA 3HSTA 3H06B 4LONB 2ZMBA 1M5FA 1MXYA 1JW1A 1FTKA 4EXLA 5AA2B 1UTBB 2B3BA 1WVJA 3O29A 2ZNSA 3MUQA 3CIJA 2GFEA 4GL0A 4X1DA 4RY1A 1YTVA 5AA4A 1PBPA 4ELPA 2KLFA 2VD3A 3PPRA 3FD3A 4O3CA 3FASA 5DVIA 2V84A 4R9GA 1Z7NE 1SW5A 1B58A 2Z8FA 5CRYA 1PB9A 2DE2A 1US4A 2QS4A 4I9DA 2D3IA 4LATA 4ZECA 3RT6B 3Q28A 5CMCA 4ZEIA 2YPNA 4NF4A 5I57A 3ZKLA 1B3LA 1NH7A 2G93A 2FNCA 3S9MC 4DXBA 4MFIA 4QSCA 4GRKA 3S2VA 1BLFA 1F9BA 1NNKA 1B1HA 3C4MA 4OTEA 2Y7PA 1MY3A 1FQAA 3JV9A 3C36A 3TTNA 3MZ1A 3EN3A 3FXUA 1MH3A 3TKDA 2I48A 1B5HA 3K02A 4ZZEA 3N94A 3LC8A 4L17A 2ANJA 1LB9A 1MY2A 4U4XA 1P1UA 5I56A 2RCAA 3CG3A 2F78A 1R9QA 2I3VA 4LUBA 4QFNA 3C31A 2NVUB 4R9FA 3T9HB 4G8NA 4NWCA 4F19A 3RY3A 1MPCA 5HPQA 2V93A 2Y7KA 5I2KB 4F3PA 3KZGA 1MY0A 3ECRA 4H1XA 3A3UA 1IEJA 4FEDA 2B3FA 1QUKA 2UVHA 2UVJA 2CZLA 2DVZA 2PMSA 4RK2A 4K3FA 2I4BA 3O9PA 2XXWA 4YB7A 4QSEA 4F2QA 3RNNA 3GLBA 1ELJA 2CMOA 2DE4A 2DXYA 1O63A 1HSLA 2NOOA 5KDTA 2XX9A 3IK6B 3T9VA 5H8NA 3BBRA 1FQDA 4PP0A 2LAOA 1N3WA 4BDNA 5A5XB 5ITOA 3LSXA 2RINA 2ONRA 1SYHA 3S4UA 3K6VA 4ND9A 1PC3A 5AA2A 1LLSA 4HS7A 2R71A 1EZOA 4XIGQ 3IB2A 4YKKA 1D9VA 1FTLA 3A3CA 3Q25A 1A99A 3KJ7A 4EQ7A 4ZEDA 1FW0A 2ALUA 1PBQA 4EXKA 1N7XA 1Y4CA 1SD3A 1D3KA 2VHAA 3PU5A 1MXVA 3KFMA 1XVYA 4YICA 3TFLA 4JDFA 3MVZA 4RYAA 3QSLA 5F7VA 2I0BA 1ANFA 1LFHA 4FORA 4IY5A 3R7XA 4PE5B 3H3GA 4FAJA 3SEUA 2XXYA 2ZXTA 1OLCA 4PETA 3K1PA 3TEPA 3MZBA 3IOUA 2IA4A 2HZLA 2QS3A 4F2OA 4RPNA 2XXXA 3VV5A 2GHBA 5I84A 2NXOA 3S9NC 3UK4A 3ZKKA 2NUVA 4OERA 3UORA 2V25A 5KCJB 3HHGA 3UIFA 1H44A 3FGSA 5L9SA 4ZE9A 2THIA 5KZTA 2OWSA 1XS5A 1QKBA 3IO6A 4G68C 1GV8A 4OEVA 2PX1A 2QPQA 2UXAA 3OXNA 3TCHA 3QXMA 2WKYA 2RC8A 1MDQA 1JNFA 2QRYA 1UIUA 1FTJA 1ZLQA 3OO7A 3K0VA 1WODA 3V8XB 2PT1A 5I2KA 2O7IA 4F3BA 1LBCA 3C33A 5EHMA 4GF8A 4RPOA 1B7HA 2O68A 4YZZA 3OMBA 3ILUB 4IO6A 1DMBA 2VD2A 1FTMA 3CSBA 1AIVA 1LSTA 1US5A 3PMVA 4ECFA 3TMGA 4OHNA 4H5FA 3SEWA 2OBGA 1B7UA 2UVGA 4OESA 4MH5A 3PGFA 1RYXA 1PDAA 4PFTA 3O6HA 3USDA 2QS1A 4ISUA 1JW4A 5A5XA 2H4IA 1ZMGA 3RTFB 3TYHA 4UA8A 3FVGA 1SI0A 3SEYA 2HXWA 3WAEA 3TTLA 4DXCA 3M8UA 4JWYA 4LZ5A 2YLNA 3H6VA 3G3FA 4POWA 4JXIA 3FZVA 2Q9TA 3IORA 4P0GA 4ELOA 1AL3A 2Z8DA 3IAZA 1LGBC 1P1OA 1IXCA 1A8FA 3B6WA 5J1DA 2PVUA 2V3TA 1IXHA 4KYSA 4DZ1A 3OOAA 2OWTA 3W15C 1LBBA 4H0WA 1MRPA 5DVJA 5CC2A 4F39A 1BP5A 4HCYA 5L9OA 4PFYA 3VVDA 2X7PA 4F18A 3CFLA 4U22A 4NF8B 4HW8A 2REJA 3OSRA 3O97A 3O28A 2XD2A 2XX8A 3T9XB 3PUXE 2Z22A 4IGTA 4MLVA 3MP8A 1TXFA 4ZEBA 2ZNTA 3KOTA 3FV2A 3EPEA 3P7IA 2GRVA 2O7UA 4JB7A 3E9XA 4RK9A 5KCJA 1URDA 3PMWA 1USYE 4U1OA 3VVFA 4WEPA 3RQTA 4BDOA 4DE8A 3N26A 4ELRA 3UA8A 3PMXA 1MDP1 4OXVA 1BIYA 2VP1A 4HTGA 3E3KA 1XVXA 1QKAA 2QL3A 2O84X 2HEUA 2ZYNA 2D5WA 4YAHX 4R2FA 2H99A 3O2AA 3W9WA 2O1MA 1Y20A 1OQGA 2XXTA 4X9TA 1N3XA 3ZSFA 4BDQA 1B3FA 1FQBA 3RTWB 3G3KA 5AA2D 4OFJA 3CVGA 1NNFA 4FATA 3N6TA 4ZS9A 4GXSB 4O3BA 1B5JA 4NMYA 3DM0A 1M5DA 5CM6A 2P2AA 3M3LA 4FECA 4I8CA 4GVOA 5DYHA 3K2DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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