3OENA

Crystal structure of glun2d ligand-binding core in complex with l-glutamate
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
282
structure length
250
Chain Sequence
TQHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQLPEKRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRADMAIGSLTINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARPLKFGTVPNGSTEKNIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate [NMDA] receptor subunit epsilon-4
publication title Ligand-specific deactivation time course of GluN1/GluN2D NMDA receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 81
structure length 250
sequence length 282
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-08-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oenA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oenA02
1WDNA 3GBBA 3N5LA 4I9DA 2PX1A 5L9SA 4GVOA 1OQGA 3H7MA 3O29A 1B3LA 4RPOA 1NMUA 5K2YA 4KYSA 4OZ9A 3HN0A 3JV9A 1OLCA 1B51A 1SW5A 1DMBA 1UIVA 2AYSA 1BKAA 2ZNSA 1POTA 5AA1A 3TELA 4YMAA 4M4GA 4RYAA 2DE4A 2ZNTA 1LB9A 4Z7EA 3QIMA 3PPNA 4KFQA 1OLAA 4BDRA 2VGQA 3C31A 4GOTA 4OXVA 4GD5A 1GVCA 1OVBA 5A5XA 1N3XA 2Q2CA 3M3KA 2AIXA 3IL1B 1PBQA 3LSLA 3I5OA 1ZBMA 4DDDA 4NMYA 2O6AA 4NF8B 4R74A 3UORA 4ELRA 1Y9UA 4M1VA 5H8QB 3RT8A 1A7LA 3VE1B 2PT1A 4OETA 1MDP1 4H6DA 4KI0E 4KYEA 2Y7PA 4GFRA 2O7UA 4PFYA 4F2QA 4LQ2A 1P1WA 4JWXA 5DTBA 3ZKKA 4DE8A 3C36A 5KDTA 3OXNA 3FD3A 4Q8RA 3IR1A 5I57A 1LFIA 4KQPA 2E1SA 1MQDA 3K0VA 1AH5A 2QPQA 3PMXA 4U4SA 1CE2A 2Y7IA 1TXFA 4NEDA 2V3UA 1MQJA 2THIA 4POWA 1H76A 3KN7A 2HZKA 4JSDA 4THIA 2XXTA 2XXPA 2AL4A 4KPTA 3K1MA 5CBRA 3SDFA 2XXVA 3LR1A 4AQ4A 1I6AA 3TTLA 3L6GA 1O63A 1MM7A 1DPPA 3SEXA 4EDPA 1B4HA 3MP8A 3MP6A 3HHGA 3KEIA 1TFAA 3IJOB 4TOZA 3O9PA 5A5XB 3EHUA 3FVOA 4G8NA 1B7UA 1Y20A 1RYXA 4OVJA 1JQFA 4H5GA 3CSGA 3LUYA 3ILUB 4E0WA 2PT2A 3VDFA 2BJJX 4P0GA 3WAFA 3A09A 5EHSA 3T9UA 1N0TA 5DVJA 1Y4CA 4MF3A 1PB8A 2NUVA 1TWYA 3LBSA 3S4UA 3K6WA 3RNNA 3TTKA 3IOUA 2OZZA 3O28A 4FE8A 1I6QA 4YB5A 3IB0A 3T66A 5KDTB 5TPAA 3M3LA 3PMVA 5I57B 4HTGA 3IAZA 1B3FA 2QS4A 3KOSA 5DVIA 2XXYA 1EH3A 1MY2A 5ELVA 2AL5A 3UP9A 2PBWA 2H9BA 4ECFA 1FQCA 1HSEA 1NH8A 5HPQA 1B40A 1S7YA 3KN3A 3KSJA 3RQTA 1P1NA 4OESA 1FQFA 1HSLA 2REGA 1M5DA 2DP8A 3SEVA 2Q89A 1LLSA 4KCCA 3G7WA 4RK9A 4IO5A 3B6TA 4ZS9A 2DVCA 3I3VA 1DPEA 4MLVA 4EF1A 1SDXA 4F29A 4U23A 4LATA 2DXYA 3D4GA 4FECA 4LQ5A 3IORA 2B65A 4FIMA 5AA2D 2WKYA 3OO9A 3MZBA 5ITOA 1P1QA 1Z7ME 1Q35A 1LBCA 1LBBA 3KSXA 2DWAA 3O97A 3TZAA 1SYHA 2F7CA 2FYIA 4YKKA 4KCDA 5DEXA 2NXOA 4U21A 3K02A 3PUVE 2VHAA 4O3BA 4YKJA 5CI5A 2VP1A 4F1YA 3OO8A 2D3IA 3RGYA 5TPAB 2F6PA 1QVSA 2DWJA 1URDA 3HPIA 5CRYA 1LCFA 1N7XA 5CBSA 1IXIA 3MVZA 3C35A 3KGCA 4OQOA 1FCKA 3CFXA 3G3IA 3O6GA 4PP0A 1QULA 3FASA 1H3DA 3TDJA 4RK2A 4F3SA 1BIYA 1SBPA 3U8QA 3MPKA 5JTYA 2X26A 3QK6A 4RPNA 4NF5A 2YJPA 2Y7RA 2ZYMA 3MZ9A 3K2DA 1XS5A 4AB6A 1ZMGA 1FTMA 3TEPA 4F22A 1Y1ZA 3IB1A 4Q30B 2G29A 1AMFA 3TCHA 4OENA 4DXBA 1NL5A 3LSXA 2UVJA 3G3FA 4F1VA 2F5XA 5HBCA 2O68A 4ELQA 4OFLA 4GXAA 3VXBA 3ODBA 3SEUA 3FV1A 1JW1A 4FEDA 1QKAA 2ZYOA 1SW4A 2XX8A 4YMBA 5I56A 2D21A 4ESWA 3UIFA 4OERA 5TU0A 1IZ1A 3QAXA 1M5FA 4WEDA 1R9QA 5I59A 5DEXB 1NNPA 2Y7KA 3H6VA 4G68A 3THIA 2ZYNA 4XXUA 3UN6A 3GLBA 2QS1A 3EN3A 3OSRA 4R75A 4YZZA 4ZEBA 1LAGE 4QFOA 1N76A 4DXUA 1MPDA 3H4ZA 2UYEA 3MVXA 1MXWA 3CVGA 5CM6A 1Y3QA 2DSFA 4ZEKA 4WEPA 2HAVA 3CI8A 5AA2A 1MXVA 1P1UA 3DP8A 3DELB 1M5CA 3HV1A 1MPCA 1FW0A 3DLNA 3HSTA 3V83A 1MRPA 4N6PA 3TQWA 3CRBA 5I2KA 1ZIUA 5JTYB 1M5BA 4NF5B 4ND9A 1N3WA 1OQHA 4OYVA 1ZTYA 3K4UA 3OD7A 1M5EA 1B4ZA 4R2BA 4NWCA 4G8HA 3TPAA 1ZJLA 2ESNA 3H03A 2XX7A 2F35A 1J1NA 4F2OA 2OLBA 1XVXA 2NVUB 2UYFA 3UK4A 1B58A 1DTGA 3M3FA 1I69A 1WVJA 3MJNA 4UA8A 3UGWA 1O7TA 2F6GA 2V25A 4H1XA 4L17A 1B5HA 1LAFE 3FXQA 3I6VA 3Q28A 3PUZE 5I56B 1JNFA 1IEJA 4GLIA 1B46A 1FQDA 3PD8A 1AOVA 4ZZEA 4YKIA 4RJZA 5I59B 1B52A 4G68B 3E3KA 1S50A 4R2FA 4NF6A 1LFHA 4RA1A 1B5IA 3RT6B 4GL0A 4DXCA 5AE4A 3K6XA 4QSEA 3BBRA 3BFTA 3PPPA 3JZJA 1PC3A 1JW4A 2I49A 5L8DA 4HW8A 5AA2B 3OENA 2KLFA 1UTBA 5I2KB 3SESA 4YKPA 3PPRA 3MBPA 1YPNA 4YAHX 4GF8A 3FVNA 3TFLA 4BDQA 2H98A 1B7HA 3R7XA 2RC9A 3EQ1A 1IXCA 1SI0A 2P0SA 1DOTA 2QMWA 1QJMA 2LAOA 1D4NA 1R9LA 4QFNA 1MQHA 4EQ7A 2HFBA 1NNTA 3AXFA 3M8UA 4XKNA 3E4RA 2PYYA 2XXHA 2Y7WA 3H6WA 1NFTA 4XKPA 1QUKA 3VVDA 2IEEA 1ZKBA 1B1HA 3VVEA 1MY4A 3FATA 4EQBA 4QFKA 1SD3A 1B6HA 5M2VA 4OEUA 4GXSB 3C33A 2DE2A 1HSJA 4PFWA 4IO3A 3K00A 4FATA 1B3EA 2DE3A 3FV2A 4ZEIA 1JETA 1JEVA 2UVHA 4BDLA 3O2AA 2DQVA 3T9HB 4ZE9A 4NF6B 3S9EA 3VVFA 4YICA 4LONB 3H3GA 3SETA 4QRZA 2XX9A 2QS3A 2M8CA 3RTFB 1MQIA 2YPNA 5CC2A 5AA4A 2I3VA 4PQJA 1US5A 4O3AA 1US4A 2RINA 2Z8DA 1MS7A 2UXAA 3OO6A 4JB7A 3PD9A 3ONMA 1USYH 1MXYA 2HQ0A 1UTBB 2VOZA 1NKXA 3H6TA 1ELJA 1T0KA 2F7BA 3QSLA 3OOAA 2ONRA 2YLNA 5I84A 3QUJA 1XC1A 2A5SA 1URGA 3Q25A 4JDFA 3N94A 1QUJA 2ONKE 2F36A 4OTEA 1SI1A 4DCXA 4IO6A 2O69A 5F7VA 3SEYA 4RXLA 1ZLQA 2I3WA 1VFDA 4DCYA 4OHNA 2R6GE 4BDNA 4C1UA 3U1OA 4OMBA 1MXXA 1II5A 4QHQA 3MPLA 1B9JA 1B05A 3MVYA 4OFJA 1ZU0A 1A40A 4LZ7A 1FQAA 3H6UA 5FTIA 1SVXB 5LOMA 1B1XA 3TCGA 1N04A 4DZ1A 2PMSA 4G68C 2OBGA 1YAEA 3MVWA 1B0LA 3QXMA 3B6WA 3LSWA 5AA3A 2I6EA 3LSFB 4OEVA 4N13A 5F1QA 3PUXE 1LFGA 3KFMA 5H8SA 1A8FA 2H99A 4E0XA 1RKMA 5EYFA 5ICTA 5TP9A 5AA4B 4RNSA 1VE4A 2E0SA 4IY6A 1CB6A 3SEWA 5B7DA 3FVGA 1FTKA 1B3GA 3DP4A 3CG1A 4QSCA 1UIUA 2V3QA 1B7ZA 1AIVA 4EXKA 1MPBA 1DSNA 3CR9A 4U4XA 1F9BA 3ZS6A 4U1OA 1IUDA 1MXZA 2Z23A 1FTOA 3F11A 3KJTA 2ONSA 2OWTA 3SERA 1OVTA 2HEUA 2ZXTA 2NWJA 1TT1A 1LAHE 2O1MA 4F18A 4NF4A 3IK6B 2NOOA 1H45A 1EZOA 2W7YA 5I2NA 5KZTA 3A3UA 3EPEA 2H5YA 2QL3A 5L9MA 5BWJA 1B2HA 4LP2B 3T9XB 5CMMA 2VD2A 3PV0E 3U92A 2OCUA 5FHNA 3V5AA 3W15C 4BLAA 5KCJA 4IB2A 3KN8A 2HAUA 2R9JA 2F34A 4XIGQ 1EU8A 5DVFA 3TKDA 5DYHA 3DM0A 1FTJA 4GRKA 4NWDA 1EZ9A 1LCTA 1L5TA 1MH4A 1N7WA 4I62A 4Q0CA 2VD3A 4JBZA 3WAEA 5TP9B 1MQGA 4YU0A 2Q9TA 2P2AA 3KJ7A 1LAXA 1S9TA 1JEUA 4U1ZA 4ZEDA 5I58A 3OELA 4OWDA 1JVYA 3PPOA 3B6QA 3E9XA 3IO6A 1UQWA 2B3BA 3RLFE 2Z8FA 2QS2A 3VV5A 3RPWA 4Q5TA 4BDMA 3JYRA 4OFOA 4XKQA 1D9YA 1LGBC 1R6ZA 1XT8A 3E13X 4C0RA 1XOCA 4R6KA 1URSA 3TTNA 3IOTA 4NF4B 3BKIB 4KYDA 3PGFA 1QKBA 2V93A 5I2NB 2FA7A 3FUZA 2A5TA 4GQOA 1PB7A 3R6UA 3TQLA 4PFTA 1IXGA 3G3JA 3ZSFA 3D4CA 4IO2A 5ICQA 5KCJB 3UA8A 2OJTA 3S2VA 1MM6A 4G77A 1OIBA 3TYHA 3MC2A 2DS9A 2ABHA 2XXXA 1Z7NE 2XXQA 3T9VA 2RCAA 4HS7A 4TLLB 1B32A 1BLFA 4X48A 3K1PA 2XXWA 3VLVA 5ITPA 3PPQA 2I0BA 2RCBA 1NNKA 4MFIA 4XTCQ 1MY1A 4ZECA 4POXA 4ISUA 4GIZA 4PFUA 1AL3A 2XD3A 5I58B 2Q2AA 2XXUA 2DWHA 3N6UA 1JVXA 1UTHA 3TODA 1FQEA 3FJMA 3KZGA 4EF2A 3O6HA 1I6BA 2UVGA 4IO7A 1P99A 4N07A 4AB5A 1YCJA 4FAJA 4JSOA 1GTKA 3CSBA 4MLQA 3K6VA 2DOJA 4H8IA 2F7AA 3IOWA 2GH9A 3GXAA 1VR5A 2ZMBA 3FXUA 1OMPA 3KOTA 5CMBA 4RY1A 4G4PA 1Y1MA 4F3BA 2O7IA 3U72A 2QMXA 3IJXB 5H8FA 1FQBA 2H25A 3P7IA 2XHDA 3MP1A 4ELOA 5CMKA 2A5TB 5H8HA 2I48A 5IAIA 2ALUA 2GHBA 4NE4A 2XXIA 5HM4B 3EF7A 3R26A 4KHZE 4KR5A 4ZEFA 2CMOA 5FHOA 3U93A 3TUSA 1JW5A 3W9WA 3VXCA 1GGGA 1BTJA 2UVIA 2X7QA 2OK2A 3L6HA 3DP6A 3USDA 4EXLA 3TTMA 3W9VA 3KBRA 4DLDA 1NH7A 2D5WA 1IITA 2IA4A 4JXIA 1Y3PA 3HCQA 2RF1A 1Q1KA 2OWSA 4MBPA 3PUWE 3K1NA 4U2RA 3ILTB 5FHMA 3FJGA 5JEIA 4EQ9A 1MH3A 1UTHB 4QFPA 3S9MC 3T22A 3K6UA 1H44A 4IGTA 1QUIA 1MY3A 2O51A 4YB6A 1MDQA 3G3HA 2RC8A 3N6TA 3TCFA 3Q26A 2P1SA 3G3KA 3GZGA 1NNFA 2GHAA 2X7PA 2DXRA 3OEMA 4H67A 1IQ7A 4P11A 1SW2A 4YB7A 3O66A 5H8FB 4TQUQ 1KWHA 1USYE 4NTLA 1N84A 3ZKLA 3C32A 5H8HB 5H8NA 2XXRA 1RYOA 1LSTA 4BDOA 3QUFA 2HXWA 3CFLA 1MG1A 3FZVA 3ECRA 3U94A 1GV8A 2O1LA 2G93A 3PU5A 4IGRA 3HHFA 5K2XA 4FORA 4UACA 1A54A 3OO7A 2QRYA 3N26A 2PVUA 3T93B 3IO4A 4G8MA 4PE5B 3VLWA 2F8DA 4R6HA 5JK4A 1PEBA 4WXJA 2O84X 3OMBA 4P0IA 4XKRA 3C9HA 4K3FA 1R1NA 2ZNUA 4TLMB 3RTWB 1IIWA 1YTVA 4ZZAA 2CZLA 1MXUA 3V8XB 3IX1A 4ZDMA 2QSXA 2RC7A 3FJ7A 1B0HA 4ELPA 5FTHA 4LUBA 2HZLA 1IXHA 1POY1 1TFDA 3T96B 1H43A 3G3GA 5EHMA 3PMWA 3A3CA 3EHTA 3FGSA 1WODA 4QSDA 2I58A 2QJEA 4H5FA 4X9TA 4HCYA 1D3KA 4H8JA 3PUYE 1Y4TA 4QFLA 3H06B 2I4CA 2V84A 1PB9A 4LA9A 2REJA 4F31B 2H4IA 3CG3A 2I4BA 2ZYKA 4F3PA 3VLUA 3EHSA 3B7DA 4IY5A 5H8NB 4F3GA 3CIJA 2FNCA 4GWOA 5B70A 4R72A 3S9LC 4JWOA 4R6YA 1D9VA 5BUUA 3Q27A 3OSQA 1B3HA 1LB8A 1A55A 4PETA 3SKPA 1B5JA 4H0WA 3C34A 2F78A 1BP5A 1VSOA 3C4MA 2GFEA 5DT6A 3TTRA 1Y3NA 4IO4A 3BFUA 3K01A 4I1DA 3RN8A 4EUOA 3TMGA 2GRVA 1ATGA 3HO7A 2Y84A 4LZ5A 1QW0A 3V89B 4O3CA 1ANFA 3RUMA 3TAJA 4R9FA 5L9OA 5CMCA 4FEBA 2V3TA 3IB2A 4R73A 3FXRA 1SQYA 3MAMA 4F39A 3FIRA 1XHYA 1MY0A 3O6IA 4LZ8A 3IOVA 2HCAA 4HCWA 4I8CA 2R71A 4U22A 3VFJA 2DYXA 1PBPA 3FVKA 1EZPA 1SYIA 3CFZA 3OEKA 2DVZA 2XD2A 4DIGA 2Z22A 4C1TA 3S9NC 3QYTA 4GL8A 4KD5A 1A99A 1GR2A 4G2ZA 3Q29A 3MUQA 5ISUA 1A8EA 1PDAA 4Z0IA 2RKMA 3MZ1A 2Q88A 4X1DA 1O64A 3KG2A 4H65A 3RY3A 3LC8A 1FTLA 4ESXA 4WKMA 2F97A 2I0CA 4QF9A 4ZE8A 4X1BA 1DTZA 4NF8A 4JWYA 1XVYA 5J1DA 4F19A 2DWIA 5H8QA 4ONYA 4R9GA 3GBAA 3MQ9A 2Z8EA 1P1OA 1VFEA 3MW0A 5IKBA 4LVQA 2ANJA 4MH5A 4F1UA 2B3FA 3MWBA 2Q8JA 1SW1A 4FJPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WDNA 3GBBA 3N5LA 4I9DA 2PX1A 4OVTA 5L9SA 4GVOA 4OANA 1OQGA 3H7MA 3O29A 1B3LA 4RPOA 1NMUA 5K2YA 2XWVA 4KYSA 4OZ9A 3HN0A 1FRPA 3JV9A 1DBZA 1OLCA 1B51A 1SW5A 1DMBA 1UIVA 2AYSA 1BKAA 2ZNSA 1POTA 4XF5A 5AA1A 3TELA 4YMAA 4M4GA 1FPLA 4RYAA 2DE4A 2ZNTA 1LB9A 4Z7EA 3QIMA 1SPIA 3PPNA 4KFQA 1OLAA 4BDRA 2VGQA 4PAKA 3C31A 4X8RA 1FPFA 4GOTA 4OXVA 2FBPA 4GD5A 1GVCA 1OVBA 5A5XA 1N3XA 4MHFA 2QVVA 2Q2CA 3M3KA 2AIXA 3IL1B 1PBQA 3LSLA 3I5OA 1ZBMA 4DDDA 4NMYA 2O6AA 4NF8B 4R74A 3UORA 4ELRA 3RPLA 1Y9UA 4M1VA 5H8QB 3RT8A 1A7LA 3VE1B 2PT1A 4OETA 1MDP1 4H6DA 3LV0A 4P9KA 4KI0E 4KYEA 2Y7PA 4GFRA 2O7UA 4PFYA 4LQ2A 5DTBA 1P1WA 4JWXA 4F2QA 3ZKKA 1NUWA 4DE8A 1BK4A 3C36A 5KDTA 3OXNA 4NQ8A 4JVCA 3FD3A 1NV4A 4Q8RA 3IR1A 5I57A 1LFIA 4KQPA 2E1SA 1MQDA 3K0VA 1AH5A 2QPQA 3PMXA 4U4SA 1CE2A 2Y7IA 1TXFA 4NEDA 2V3UA 3IFAA 1MQJA 2THIA 4POWA 1H76A 3KN7A 2FIEA 2HZKA 4JSDA 2FHYA 4THIA 2XXTA 2XXPA 2ZZXA 2AL4A 4KPTA 3K1MA 4DI4B 3CHGA 5CBRA 3SDFA 2XXVA 3LR1A 1IMCA 4AQ4A 1I6AA 3TTLA 4XEQA 1KA0A 4PBHA 3L6GA 1O63A 1MM7A 4N81A 1DPPA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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