3OENA

Crystal structure of glun2d ligand-binding core in complex with l-glutamate
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
282
structure length
250
Chain Sequence
TQHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQLPEKRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRADMAIGSLTINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARPLKFGTVPNGSTEKNIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate [NMDA] receptor subunit epsilon-4
publication title Ligand-specific deactivation time course of GluN1/GluN2D NMDA receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 81
structure length 250
sequence length 282
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-08-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oenA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oenA02
5A5XA 2PYYA 5I58A 4IGRA 4I9DA 4R9GA 3S9MC 4PQJA 2A5TA 1QUJA 3LSFB 1RKMA 3TODA 2XHDA 1Q35A 2I0CA 3QYTA 4RPOA 4XKQA 4JWXA 2XXVA 3S9EA 1SI1A 1IQ7A 1DTZA 3WAFA 1MRPA 4BDRA 3U94A 1FCKA 4C0RA 1FQFA 3HO7A 2VD2A 3THIA 4Q8RA 3SETA 3MP8A 4RA1A 1AL3A 3PMWA 2PT2A 3EHUA 2X7PA 3VFJA 2DE3A 4ZEKA 2OJTA 3TDJA 1QKBA 2HCAA 2XXTA 4HCWA 2F8DA 3PMVA 1MY4A 4OFLA 1OLAA 1BTJA 1A8EA 1FTKA 4KI0E 1MXZA 3OSRA 2YLNA 4IO6A 1OQHA 4OENA 2ONSA 3EF7A 4YICA 3T66A 3CFLA 5AA3A 4RK2A 1B0LA 4OVJA 3MPLA 4NF6A 3N6TA 3ZSFA 1FQBA 4F3SA 1US5A 1LBBA 1D9VA 1PDAA 3MWBA 3OMBA 1SYIA 3FV1A 3EPEA 1Y20A 2XXPA 4O3CA 3K1NA 1JW5A 4TOZA 1UQWA 3UP9A 2V3UA 1IEJA 2OLBA 4X48A 1WVJA 3M3FA 3FVOA 1SQYA 1HSJA 2DVCA 2HXWA 1H3DA 2HAUA 4TQUQ 2QS3A 4GWOA 3ZS6A 5CM6A 1B4ZA 1JEUA 3W15C 5CMCA 4U1ZA 4I1DA 3TTRA 3O6GA 1II5A 4F29A 3R26A 3KN7A 4ECFA 3SEWA 3O6HA 5DVJA 3MP1A 4EQBA 3V8XB 1ZBMA 4ZECA 3G3GA 2AL4A 1MS7A 1Y9UA 3MZ9A 4R2BA 5H8FB 3UORA 4OZ9A 4NWCA 3TQWA 4OMBA 4XIGQ 4LQ2A 2B3BA 2HZLA 4ZZAA 4F31B 3I5OA 2XX8A 3PPOA 4AB5A 2QMWA 5A5XB 4MF3A 4U4SA 4HW8A 1IIWA 4GOTA 3TFLA 2A5TB 1XC1A 2DSFA 3PD9A 4DXBA 1D4NA 1LBCA 3A3UA 3CSBA 1GGGA 3OO7A 1GVCA 3QUFA 1Y3QA 1JW4A 1R9QA 2RKMA 2A5SA 4FIMA 4ZEFA 3LR1A 5KDTB 4U4XA 1LAGE 1MDP1 2O68A 3MP6A 2ZNSA 4RJZA 2YJPA 4P11A 1P1NA 4JSOA 3T9VA 2OWTA 1EZ9A 2ONRA 3KG2A 3TELA 2VP1A 1PBQA 1UTBA 3LSWA 3K6VA 4KYDA 2F97A 4LA9A 5KCJA 1PBPA 4U22A 1ZKBA 2G93A 3KFMA 3MVXA 4OQOA 1I69A 3TZAA 3IX1A 2DXRA 4C1UA 4R72A 2IEEA 5H8NA 3K2DA 3O97A 4UA8A 5AA2B 3TTMA 1MY1A 4G4PA 4NMYA 1N84A 4ELRA 1B3EA 1ELJA 5AA4A 4OYVA 1M5BA 4L17A 4POWA 2THIA 4MLQA 4LUBA 4EQ7A 5I59B 2QS2A 2O69A 3LUYA 3FATA 2QL3A 3RNNA 5CMKA 4HTGA 3H6TA 4H65A 5JEIA 1JVXA 3RPWA 3IL1B 5DEXA 4OHNA 2ANJA 4QFKA 4PFWA 4RK9A 2O7UA 1MH4A 3RTFB 1TT1A 1B46A 5ICQA 2XXIA 5KZTA 5DVIA 2OCUA 2YPNA 1D3KA 2F6GA 2O6AA 1B3GA 4R6YA 1UTHB 1LCTA 1N0TA 3Q29A 3CFZA 3U92A 3VVDA 3FJGA 4KHZE 4H67A 1UIVA 3MC2A 1B52A 1P1UA 3IAZA 4R74A 1OVTA 3W9VA 5FHOA 1PC3A 4F1VA 1WDNA 4F3BA 3JZJA 4FATA 2Z8EA 3JYRA 2V25A 3K6XA 3KSJA 1B3FA 1JQFA 4G68B 3M3KA 2UVGA 2F7AA 1L5TA 5HPQA 1MXUA 1I6QA 2F36A 1Y1ZA 5TP9A 1QJMA 1NL5A 3AXFA 1S9TA 4YKIA 4P0GA 4YB5A 1CB6A 4IO4A 1MM6A 1MY2A 3H7MA 4R6HA 3C32A 2GHAA 1MM7A 2UVHA 4IO5A 3T96B 3TYHA 5KCJB 2ZYNA 3GBBA 1I6BA 1XOCA 1MXWA 5J1DA 3N94A 4GF8A 3PUWE 4E0WA 3MW0A 3H4ZA 1FTLA 2O1LA 3GZGA 4N6PA 4ONYA 3E3KA 1ANFA 3IR1A 3HHFA 3LSLA 3TQLA 3H06B 4PFTA 4JWOA 4ESXA 3DLNA 5CMMA 2NUVA 4F1YA 4G8MA 1H44A 2DE2A 4G8HA 2REGA 4PFYA 4IO3A 4Q30B 3TKDA 1O64A 5CRYA 3KGCA 1O63A 3TPAA 3IOUA 4YMBA 1DMBA 2QS4A 1URSA 1OQGA 2AL5A 4F2QA 1B40A 2E1SA 2UVIA 5L9OA 4E0XA 2XXWA 2Z8DA 3C9HA 4NF8B 5F7VA 4XTCQ 3VLUA 4U2RA 5H8HB 3IO4A 4BDQA 2B3FA 4KPTA 3PPQA 4XKPA 5JTYB 2R9JA 1H45A 2FA7A 3PUXE 3IORA 1SW4A 3IOTA 3IB0A 1PEBA 4KFQA 3E13X 1PB9A 2I58A 3KN3A 3HCQA 4OWDA 3RT8A 4F3GA 4X1DA 5EHSA 2R71A 4N07A 4EXLA 2RC9A 2XXQA 3D4GA 2NWJA 3PPNA 5IAIA 5L9MA 3QK6A 4DLDA 1LSTA 3R6UA 1BLFA 5AA1A 1JW1A 4AB6A 3MAMA 4PETA 3E4RA 1N3WA 3A3CA 1AIVA 4FJPA 4YKPA 3S9NC 1ZTYA 2VGQA 5FTHA 1NFTA 3OELA 4GXSB 4JXIA 2DWHA 5TPAB 3O28A 5HM4B 3L6GA 4WEDA 4YZZA 3MQ9A 1VFDA 3K02A 3S2VA 3ILUB 4GRKA 3SKPA 3SEUA 2WKYA 3DP4A 1SBPA 1CE2A 4FE8A 2XXUA 4GD5A 4H5GA 3H3GA 5H8SA 2NXOA 3T22A 4NF4A 3FVNA 5I56A 3N26A 1URDA 1POY1 2ABHA 2O51A 1VFEA 3QIMA 3G3FA 3CI8A 2VD3A 3C31A 3UK4A 2V84A 4MBPA 4NTLA 1R1NA 2F78A 3JV9A 2LAOA 2NOOA 2Z22A 1USYH 5EHMA 4KYSA 2ESNA 4KCDA 2F35A 3U8QA 1QW0A 3SERA 1AH5A 3MUQA 2P1SA 2VOZA 1DPEA 1DPPA 2HZKA 1VE4A 4Q5TA 4BDOA 1N3XA 3G3HA 1B32A 3USDA 2F5XA 4OFOA 3OOAA 1N04A 1TXFA 2RINA 3RN8A 3U93A 1PB8A 3LSXA 3CIJA 1QUKA 5I58B 3CR9A 3OSQA 1B3LA 4JWYA 1P1WA 1NNFA 3G7WA 2UYEA 1H76A 3RUMA 3B6WA 1HSEA 3RY3A 2XX9A 4THIA 3OD7A 2ZMBA 4YB7A 3VE1B 4DZ1A 4WKMA 2V93A 3R7XA 4LP2B 2DVZA 3BBRA 2PT1A 3P7IA 4GXAA 4H6DA 3RTWB 2XX7A 3MJNA 4FEBA 1LFHA 1IZ1A 4GL8A 3MZ1A 4DE8A 3QAXA 1FQDA 2H99A 1M5CA 2HEUA 3TCGA 5IKBA 2XXHA 4RPNA 1FTOA 1MXYA 4R73A 5K2XA 4NF6B 1LCFA 3RLFE 3GBAA 4C1TA 1Y3NA 2H4IA 2X26A 4R6KA 4OESA 3C34A 1BP5A 1FTMA 4OFJA 2NVUB 3KBRA 2BJJX 1LB8A 4X1BA 3LBSA 3K1MA 3QXMA 3UIFA 3S4UA 3EN3A 2DQVA 1IXCA 2Z8FA 5H8QA 3VXCA 4LZ7A 4IB2A 1IXIA 2PVUA 3Q28A 4MH5A 1QKAA 1LFGA 1LFIA 2D3IA 1QVSA 2QPQA 5I2NA 2H9BA 3Q25A 2F6PA 4RNSA 4ELOA 1Z7NE 4QF9A 3B6QA 3Q27A 3OEKA 1B1XA 3SESA 3L6HA 1S7YA 2QRYA 4K3FA 3UN6A 3MPKA 4ZE9A 1JETA 4NF5A 1B2HA 1Q1KA 4R75A 2Y7KA 2GRVA 3B7DA 2E0SA 1ZJLA 4ZEIA 1TFDA 1B1HA 3I6VA 4H8IA 3SEXA 3CSGA 3MVWA 3SDFA 1GV8A 2PMSA 3RQTA 1YTVA 4DIGA 3ECRA 1P99A 4P0IA 2ZYOA 2O7IA 5HBCA 3N6UA 3PPRA 3K0VA 3BFTA 3ZKLA 1B6HA 2Y7PA 1YCJA 3C4MA 3V89B 1B9JA 3FIRA 1UTBB 1B58A 5I84A 4ZDMA 5B7DA 1RYXA 4PFUA 4H1XA 3Q26A 2DWAA 1B0HA 3H6VA 4F39A 4TLLB 1FQCA 1NH8A 3KZGA 4FEDA 1B4HA 2HQ0A 4DDDA 2I0BA 5H8NB 4O3AA 3T9XB 3H03A 3UA8A 4JDFA 3PUVE 3VV5A 3I3VA 4WEPA 4MLVA 1LAXA 3SEVA 4DCYA 1KWHA 3PUZE 5ITPA 2Q2AA 2RC7A 4ELPA 2XXXA 5AA4B 2Q88A 4YU0A 2I4CA 1LGBC 3IB2A 5AA2D 1JNFA 4XKNA 4OERA 4OXVA 2OWSA 4O3BA 4FAJA 3CRBA 1YAEA 3PPPA 2OK2A 1SDXA 1JEVA 1FTJA 1A8FA 2DOJA 2ZYMA 3K6UA 4ZEBA 1B5IA 3RGYA 3T93B 4F1UA 3TTKA 5DEXB 1GR2A 4GFRA 1ZIUA 3CG1A 1MY0A 5ITOA 1MG1A 3FD3A 2CMOA 3MZBA 4LZ8A 3FASA 4H8JA 5JK4A 3C33A 2QJEA 1EZOA 1SW2A 2I4BA 4EF1A 3FGSA 2FNCA 4XXUA 3FV2A 2AYSA 1QULA 1SI0A 4U23A 1B5JA 1R6ZA 4BDMA 5H8FA 2UXAA 2F7CA 3VDFA 1NKXA 1US4A 3VVFA 4F3PA 1MY3A 2I6EA 2KLFA 1VR5A 1RYOA 4YB6A 1QUIA 1PB7A 5TP9B 2V3QA 4YKJA 2H5YA 1NNPA 4F2OA 2I3VA 3HSTA 1DOTA 4I8CA 4G8NA 5BWJA 2I3WA 3EHTA 3V5AA 1IUDA 2QMXA 4AQ4A 4OEUA 5EYFA 4BDNA 2R6GE 4GL0A 3KOTA 5KDTA 4QSDA 1N7XA 4GIZA 2DXYA 4G77A 5F1QA 4QFOA 3IO6A 3O2AA 4OEVA 3K6WA 2P0SA 4IY5A 1I6AA 1NNTA 2PX1A 4TLMB 3OO6A 4FORA 5I57A 3FJMA 1XHYA 2Y7IA 5CC2A 3TCHA 3DELB 3UGWA 4Z7EA 1MXXA 4NEDA 3U72A 3FXUA 4EUOA 3M8UA 2F34A 4QFLA 5ICTA 5AA2A 4ZEDA 3K01A 4YAHX 2I48A 3KN8A 3H6WA 3QSLA 3OXNA 4KQPA 3CFXA 3T9UA 1LB9A 2VHAA 4IGTA 1DTGA 1ZMGA 2DP8A 3B6TA 4GLIA 1B7UA 2G29A 1J1NA 3C35A 3PU5A 1B51A 4KYEA 4JBZA 5I59A 1NNKA 3PD8A 1D9YA 4DXUA 1MPBA 1MQHA 2HAVA 1P1QA 4F19A 3PUYE 4F18A 1FQAA 4BDLA 3FVKA 3IOVA 4KD5A 1IXGA 4IY6A 4DXCA 1MPCA 1S50A 1SW1A 4N13A 3W9WA 2O84X 5BUUA 1MDQA 3KSXA 1FQEA 4LVQA 4UACA 3N5LA 4PP0A 1AMFA 5TU0A 3FXRA 3DM0A 3OEMA 1BIYA 3RT6B 1UTHA 2HFBA 3MBPA 3FZVA 5CMBA 3HPIA 3VLVA 3A09A 4OTEA 3ILTB 1P1OA 1MPDA 3H6UA 2I49A 3FVGA 3SEYA 2Z23A 1SVXB 1Z7ME 3IB1A 5LOMA 4JSDA 1TWYA 5FHNA 1LLSA 4FECA 1TFAA 4G68A 1A7LA 3EHSA 3IK6B 2Y7RA 2ZNUA 4M4GA 3K00A 4Q0CA 5CBSA 1Y3PA 4YMAA 2OZZA 3MVZA 4HCYA 4KR5A 1ZLQA 4GVOA 5CI5A 3GLBA 4QFNA 3OO8A 2H25A 3KOSA 3LC8A 4G68C 3CVGA 1SW5A 3HHGA 3FUZA 1XT8A 3D4CA 2RC8A 4F22A 4ELQA 3F11A 3U1OA 3IJXB 4ESWA 5I57B 1LAHE 2Q89A 1OMPA 2ZNTA 2FYIA 4NF4B 4Z0IA 5I56B 2DE4A 1USYE 1B3HA 2PBWA 2DYXA 2CZLA 1N76A 3VLWA 2GHBA 1NH7A 1Y4TA 3G3JA 3OENA 4POXA 1EH3A 1IXHA 2P2AA 1O7TA 4QSEA 1MQGA 1ZU0A 4QRZA 3ODBA 1OVBA 3IJOB 1YPNA 1N7WA 2V3TA 1OIBA 3DP6A 3M3LA 2DWIA 1POTA 2ZXTA 1F9BA 4ZS9A 4RXLA 3TTLA 1DSNA 4G2ZA 4NWDA 2RF1A 3ZKKA 3BFUA 4R9FA 2ONKE 4ISUA 5K2YA 1EZPA 1GTKA 2DWJA 4RY1A 4OETA 5FTIA 4ND9A 4QFPA 4NF8A 3K4UA 5FHMA 2XXYA 4YKKA 3V83A 3BKIB 3TMGA 1XVXA 5H8HA 3QUJA 4LZ5A 5JTYA 5ELVA 2RCAA 1Y4CA 5I2KA 5DT6A 3TEPA 2XD3A 5DYHA 5CBRA 3EQ1A 3GXAA 3O6IA 4HS7A 1R9LA 1M5FA 4ZZEA 1URGA 4M1VA 1XVYA 4NE4A 1AOVA 3CG3A 1A55A 5DTBA 3G3KA 2GFEA 4GQOA 2O1MA 1MXVA 3MVYA 2XD2A 2Y7WA 1MQDA 1VSOA 3TTNA 4LATA 3OO9A 2XXRA 2Y84A 3O29A 4H0WA 2M8CA 3O66A 4ZE8A 3C36A 1M5EA 2UYFA 3KJTA 3S9LC 1MQIA 3ONMA 5B70A 1A99A 5L8DA 2QSXA 5TPAA 5ISUA 4X9TA 4U1OA 3PGFA 1H43A 2AIXA 2IA4A 4QHQA 4LQ5A 3TCFA 4KCCA 1OLCA 3VVEA 1FW0A 4RYAA 3VXBA 1WODA 2QS1A 3WAEA 2UVJA 2B65A 1NMUA 1M5DA 2Q9TA 1T0KA 2ALUA 1B7HA 1A54A 4EDPA 1EU8A 3G3IA 5H8QB 5L9SA 2X7QA 4QSCA 5AE4A 3K1PA 5DVFA 3DP8A 4IO2A 2DS9A 4H5FA 3IOWA 1SYHA 4DCXA 4WXJA 4JB7A 2GH9A 1IITA 2D5WA 4U21A 1B05A 4EF2A 1SD3A 4BLAA 4XKRA 1XS5A 5I2NB 3KJ7A 3O9PA 2W7YA 3HN0A 1B5HA 1A40A 4IO7A 4LONB 3FXQA 3KEIA 4PE5B 2D21A 1MH3A 4EQ9A 5M2VA 3T9HB 1ATGA 1JVYA 2OBGA 3E9XA 2F7BA 4NF5B 3PMXA 3TAJA 4EXKA 5I2KB 3HV1A 3TUSA 2REJA 1UIUA 3FJ7A 2Q2CA 4MFIA 2H98A 2Q8JA 1LAFE 2RCBA 1Y1MA 1HSLA 1MQJA 3PV0E 2ZYKA 4R2FA 4I62A 1B7ZA 1BKAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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