3OENA

Crystal structure of glun2d ligand-binding core in complex with l-glutamate
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
282
structure length
250
Chain Sequence
b'TQHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQLPEKRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRADMAIGSLTINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARPLKFGTVPNGSTEKNIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Ligand-specific deactivation time course of GluN1/GluN2D NMDA receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate [NMDA] receptor subunit epsilon-4
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 81
structure length 250
sequence length 282
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-08-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oenA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oenA02
4MLQA 2O84X 4UACA 5AA2D 2UXAA 5I2NB 3CRBA 5F7VA 2DVCA 4EUOA 2QL3A 3RUMA 2AYSA 2I0BA 4I8CA 4R2BA 4PFUA 1FTKA 1B4HA 2Q9TA 3SEWA 3PD9A 4KFQA 3T66A 3S4UA 2D5WA 1EU8A 3OEMA 1ZKBA 4ZEFA 3KSXA 3WAEA 2O6AA 3QK6A 1OVTA 2ANJA 1PB8A 5CM6A 3K2DA 2E1SA 5JEIA 3DP6A 4NF5B 3TDJA 3CFLA 1P1OA 1ZJLA 4LZ8A 1LAGE 5H8QB 3WAFA 1DSNA 4X9TA 5H8SA 1POTA 3UK4A 2XHDA 3MWBA 4QFNA 1I6QA 2RC7A 1MXVA 2G93A 3FVOA 1TFAA 4NWCA 1IXGA 1B1XA 2Q8JA 4N6PA 1VR5A 4BLAA 3BFTA 1BKAA 2ONKE 4G68A 3TFLA 2F6PA 1SW1A 3R6UA 4IO7A 3C32A 1A7LA 1R9LA 4EQ9A 3PV0E 4NF5A 4LONB 3OEKA 4AQ4A 1MH4A 4OETA 5FHMA 1SVXB 2FNCA 3TODA 1Y1MA 1Y3NA 5CMBA 4R73A 5H8QA 3U92A 2A5SA 1H43A 3Q28A 5L9OA 1GGGA 3UGWA 3TTLA 5L9MA 5I57A 2FA7A 3CG3A 2HAVA 5CMKA 4R75A 1B0LA 1VFEA 1ZTYA 1AH5A 5ITPA 3VLWA 3D4CA 4JDFA 1B5IA 1NH7A 4YB6A 1B3FA 3PMXA 1URSA 1ZIUA 4KYDA 5A5XB 4POWA 1MY4A 4ZEKA 3DP8A 4Q5TA 4FEDA 3S9MC 4Z7EA 4POXA 4OEVA 3MPLA 4R9GA 5CRYA 1MPBA 3MW0A 4H0WA 4ZZAA 1UTBA 4LUBA 4R74A 2R71A 2VGQA 2Q2AA 5H8FA 3OD7A 3T22A 3A3UA 3Q25A 4H67A 1HSJA 4HS7A 1N7XA 3EN3A 1RYXA 1B7HA 2I4BA 4P11A 1SQYA 1IQ7A 4K3FA 4QFOA 4F3GA 4O3BA 1N3XA 1LAHE 3EHTA 3LSLA 1LFIA 4DXBA 5H8NB 5KCJB 3ECRA 2ZYOA 2PBWA 1DTGA 5IAIA 4G68C 1FQDA 1A8EA 1B0HA 5H8HB 4I62A 4IO4A 2OBGA 3DM0A 2F34A 4DE8A 4HW8A 3C31A 4ELOA 3IB0A 3V8XB 3EF7A 1WDNA 5HBCA 4EQ7A 3CR9A 4ND9A 2DE3A 4EQBA 3S9EA 3SEXA 3TMGA 3K4UA 5EHMA 4GQOA 1A54A 2QMWA 1FQEA 3U1OA 3P7IA 4WKMA 3HSTA 1FCKA 3B7DA 4DZ1A 1UIVA 1B3LA 4E0XA 3CG1A 2HXWA 4MFIA 3PUZE 5I58A 1MQDA 5H8NA 3OO8A 1N0TA 5ICQA 1N04A 1MQGA 4JWYA 3G3KA 3ZKLA 1B05A 3SEUA 1BIYA 2QSXA 1D9VA 4G8HA 3IR1A 1MRPA 2D21A 3RLFE 3C36A 3TELA 5FHNA 4H5GA 1M5FA 2F7BA 1LFHA 4U4XA 4IO2A 2H25A 1URGA 4ZE9A 4F3BA 1KWHA 2F35A 2QS4A 4C1UA 4RY1A 5B7DA 1MY2A 3IOTA 3BFUA 2Y7PA 1A40A 2DYXA 4IY6A 4WEPA 3K0VA 3DP4A 5DVFA 3LSXA 4F39A 1YCJA 3T93B 1N84A 3N6UA 2F8DA 5CI5A 3T9XB 2XXYA 2Z23A 4X48A 2DOJA 3JZJA 2V3UA 1MY1A 3W9WA 4ESWA 1H45A 4IO5A 2Z8DA 3IO6A 5DVJA 1LBBA 2XXRA 4F31B 1MM6A 3GBBA 2ZYKA 3AXFA 4LZ7A 3VVFA 3VFJA 3LSFB 1NFTA 2O7IA 3IJXB 3PGFA 5TU0A 5CC2A 1P1WA 4GF8A 3TKDA 4NTLA 5LOMA 3MVWA 3Q29A 2GH9A 5M2VA 3RY3A 1IIWA 4XXUA 2XX7A 3B6WA 3O28A 2PT1A 5JTYB 3HPIA 4OMBA 4OZ9A 3G3JA 4JXIA 1SBPA 5DTBA 2QJEA 3PPQA 3MVZA 3KOTA 4GLIA 4E0WA 3USDA 1MPDA 4JSDA 1P1UA 3FD3A 5ISUA 1R1NA 3T9HB 4G4PA 2H99A 3E9XA 2V93A 4FECA 3IORA 4Q0CA 1US4A 1SW4A 4IO3A 4U1OA 1DPPA 3I3VA 1SYHA 3W9VA 3MBPA 3HHGA 3TCHA 3PMWA 1OLAA 3IX1A 3KJ7A 5K2YA 1FQAA 5AA4B 2OWSA 3E3KA 4RK2A 3EQ1A 1US5A 3PUYE 4I9DA 2Y7RA 4UA8A 4JWXA 4EF2A 5L9SA 3FATA 1XVYA 4NMYA 3THIA 1SD3A 2PMSA 4RNSA 3HN0A 3IOWA 3KN3A 3OSRA 2ABHA 5AA2B 1JNFA 1QKBA 4BDOA 1B2HA 1Y20A 2NOOA 4X1DA 1ANFA 1B4ZA 3H6TA 3TTRA 3PUVE 3IB1A 5ICTA 1J1NA 3FUZA 3GZGA 1VFDA 2THIA 4HTGA 4MH5A 2DS9A 3H6WA 4H65A 3SERA 2DP8A 2HEUA 1EZ9A 1UQWA 4ZECA 5AA4A 2I3VA 4C0RA 2V25A 5I56B 4NF6B 3KJTA 4QF9A 2RC8A 2Y7WA 2XXVA 1TFDA 2ZNUA 2Y7IA 4OHNA 3N26A 4MLVA 1ZLQA 5DEXB 2NWJA 3UORA 4YICA 4WXJA 4YKIA 1LBCA 4QFPA 2IEEA 2UYFA 4GRKA 2AL4A 1NH8A 3CSGA 2E0SA 2HQ0A 3A09A 3HHFA 4U22A 3T96B 2YJPA 4OEUA 1F9BA 1Y4CA 1Q35A 2O51A 3FIRA 1URDA 4EXLA 2O69A 2ALUA 2Y7KA 2ONSA 2UVJA 5I2NA 4GIZA 3TCFA 3K6WA 1WVJA 2I4CA 4QSEA 3VE1B 4ELQA 4WEDA 1DMBA 4YKKA 1JEVA 4O3CA 4TLLB 3UN6A 1NNFA 2F7AA 2GFEA 3MVYA 3FASA 1B5JA 4RXLA 3CFXA 1XS5A 1YAEA 2DSFA 4FE8A 4RYAA 1IXIA 1N7WA 2KLFA 3IB2A 1JVYA 5CBRA 1LFGA 3R26A 1D4NA 2DE4A 4F3PA 3M8UA 1MXWA 2ESNA 3LUYA 2NXOA 1IZ1A 1OQGA 2XX9A 5I84A 3OO9A 4G8MA 5FTHA 2RKMA 2O7UA 2RINA 1S7YA 3RT8A 4Q8RA 1N76A 4RA1A 1QKAA 3K00A 4MBPA 3FVNA 3OO7A 3CI8A 1B5HA 1B7UA 4EDPA 1I6BA 2I3WA 5BWJA 2F6GA 3O6HA 4AB5A 2V3TA 3VXCA 1M5DA 1SI0A 5DT6A 1SI1A 4TQUQ 2P0SA 4IO6A 1TWYA 3TYHA 2BJJX 3PU5A 4OFJA 2HAUA 3UP9A 1MY0A 1BP5A 1YPNA 3H4ZA 3PUWE 3O97A 3VLUA 5EHSA 3H3GA 5ITOA 5FHOA 1B58A 2I49A 2V84A 3TUSA 1HSEA 2B3FA 1IUDA 3K02A 2ZXTA 2XXPA 2VD2A 1GV8A 4H5FA 3CVGA 4YB5A 3ONMA 4QSDA 3M3FA 1O7TA 4THIA 2GHBA 4NF8B 3CFZA 4HCWA 5IKBA 5CMMA 3EHUA 2ZNTA 1RYOA 3U94A 3T9UA 1SDXA 3BKIB 4U23A 3QUJA 2F97A 5A5XA 4JSOA 2H98A 4ELRA 3FXQA 4O3AA 3S9LC 2Q88A 3KFMA 4TLMB 4ELPA 4JBZA 3M3LA 3RNNA 4L17A 4GVOA 2QRYA 1B51A 2M8CA 5I59B 4PP0A 4QFLA 3I6VA 4PFYA 1II5A 3MZ1A 4NEDA 3TAJA 2OJTA 3EPEA 3RGYA 3EHSA 5HPQA 1LGBC 3T9VA 3VDFA 4G8NA 4YMBA 5KCJA 3G7WA 1A99A 3IK6B 5DVIA 3V5AA 5H8HA 3SEYA 2H4IA 3VVEA 3TCGA 4F1UA 3MUQA 4XKQA 4F1YA 4ZEBA 3KN8A 1A8FA 3IL1B 3RTFB 4ISUA 2GRVA 4LP2B 2D3IA 1VSOA 4Z0IA 3CIJA 1PBPA 4LQ5A 5I2KB 3HO7A 1CB6A 3S9NC 3FGSA 4GD5A 4BDQA 1R9QA 3FJMA 4M1VA 4IGTA 4LQ2A 4NWDA 1PC3A 4EF1A 2XD3A 4PFTA 4YZZA 4OQOA 4QHQA 4YU0A 4BDNA 4GL0A 3SETA 4U1ZA 2A5TB 3C9HA 3CSBA 1LAXA 1SW5A 3LBSA 3O2AA 2O68A 3S2VA 1XHYA 1I69A 4YAHX 1MY3A 3K01A 1XVXA 1OLCA 2NVUB 4DXCA 1TT1A 4F29A 2ZMBA 5AA1A 2H5YA 5ELVA 3O29A 3BBRA 3HV1A 2X26A 3MQ9A 1H3DA 1NKXA 2DWAA 1NNKA 3QSLA 2AL5A 3OO6A 1JQFA 4ZEIA 3N94A 4GWOA 4NF4B 5F1QA 2XXWA 3C33A 4F1VA 1M5EA 2I58A 3OOAA 1BTJA 1QULA 2ZNSA 3K1PA 3MZBA 4R6KA 3GBAA 3KBRA 2REJA 1RKMA 3O66A 4OYVA 3FV2A 1JEUA 1B3HA 4KD5A 4R6YA 3E13X 4GXAA 3FXUA 4AB6A 1XOCA 4XIGQ 1B1HA 3FVKA 1CE2A 1AL3A 2F36A 2PYYA 1B40A 4TOZA 4OVJA 4PQJA 1USYE 1ELJA 5K2XA 4KI0E 1S50A 3IAZA 1FQCA 1B7ZA 1QUKA 2F5XA 4PE5B 3H06B 4GXSB 3MJNA 1D3KA 3OMBA 5CMCA 2VP1A 5TP9B 3JYRA 2UVIA 4NF4A 4DLDA 1FTLA 1SW2A 5JTYA 1SYIA 2YLNA 2HFBA 2Q89A 2Z8FA 1O64A 3LC8A 4KYEA 3ZKKA 1EZOA 4KQPA 3LSWA 4DDDA 3L6GA 4ZEDA 1P1NA 2RF1A 4JWOA 1MXUA 2DWHA 2RC9A 2P2AA 3N5LA 3FV1A 3TTMA 1O63A 2LAOA 2GHAA 2B65A 4U2RA 3VXBA 2G29A 3OELA 3H03A 4IY5A 4BDMA 1NNTA 5TP9A 3TQWA 1TXFA 4FJPA 3PPPA 1OIBA 1I6AA 3FJGA 3C4MA 3MPKA 5AA2A 2DWJA 1DOTA 3F11A 3R7XA 1A55A 4G68B 2RCAA 1YTVA 3O6GA 3FJ7A 3ZSFA 4IB2A 1NNPA 1H76A 3K1MA 1MPCA 1QVSA 4RJZA 1EZPA 2CMOA 4U4SA 4LA9A 2VHAA 4DIGA 4QRZA 2WKYA 1LB8A 4YB7A 1Z7ME 1Y9UA 2DVZA 3PPRA 3DELB 5EYFA 3TPAA 3V89B 1P99A 1MQIA 2FYIA 3QAXA 1USYH 2VOZA 2HZLA 1NL5A 1LAFE 2F78A 3RTWB 5I56A 4NF6A 5I57B 4KHZE 2OZZA 4ZS9A 4XTCQ 2QMXA 4MF3A 4F18A 1LSTA 2ONRA 1MXZA 1D9YA 5DEXA 3VVDA 3KZGA 5FTIA 3RN8A 2H9BA 4QFKA 3U72A 1GTKA 1Q1KA 4ZE8A 5J1DA 2RCBA 1MDQA 4R72A 3C34A 1B52A 2O1LA 2XXQA 1UTBB 4LATA 3PPOA 5H8FB 3B6QA 1H44A 1B3GA 4OXVA 1L5TA 3IJOB 1Y4TA 2X7PA 2F7CA 4BDLA 2P1SA 1MH3A 1JW4A 2OK2A 1T0KA 4F19A 3KG2A 1XT8A 2V3QA 2HZKA 3PUXE 5TPAB 2XXXA 3Q27A 1MQJA 4ZDMA 4BDRA 1WODA 3G3GA 3SEVA 1M5BA 4N13A 4GFRA 4H6DA 3V83A 1QUIA 4U21A 1Y3PA 2DE2A 1GR2A 1MXXA 3RPWA 1PB7A 3MVXA 1PBQA 1JVXA 2R6GE 4YKJA 3U8QA 3OXNA 4KCDA 3FXRA 5AE4A 2IA4A 1JW5A 2XX8A 2W7YA 1IXCA 4P0IA 2REGA 2OCUA 5BUUA 3ODBA 2ZYMA 2HCAA 2R9JA 2OWTA 3QYTA 3DLNA 3H6VA 1IEJA 4XKRA 2XD2A 5I58B 1UIUA 1LCFA 3TTNA 4DCXA 2DWIA 5TPAA 3QIMA 5L8DA 1AOVA 3JV9A 3D4GA 4OWDA 2PT2A 3MC2A 4KPTA 2Z22A 3LR1A 3VLVA 3K1NA 2I48A 3O6IA 3IOVA 4RPOA 1NMUA 4QSCA 1VE4A 4F2QA 4ECFA 2B3BA 4XKPA 3I5OA 1JW1A 2QPQA 1IXHA 4PFWA 3SDFA 3PMVA 2PVUA 1OQHA 4OFOA 1S9TA 4OERA 1ATGA 4OENA 4N07A 4DCYA 1GVCA 2XXUA 1FTMA 1N3WA 3PPNA 5KZTA 1LB9A 4I1DA 4NF8A 3TQLA 3HCQA 4KYSA 1FW0A 4R6HA 3SESA 4ZZEA 3FZVA 4OESA 1FQBA 5HM4B 4RPNA 1QJMA 1FTJA 1MG1A 2CZLA 1EH3A 3OENA 3TZAA 2VD3A 1M5CA 4F3SA 4M4GA 3KSJA 4H8IA 4KR5A 4EXKA 2UVHA 4HCYA 3A3CA 2Q2CA 5I59A 4H1XA 3QXMA 3KGCA 3UA8A 2ZYNA 1P1QA 1MDP1 4H8JA 1MQHA 1ZMGA 5CBSA 1LCTA 5JK4A 3G3FA 4RK9A 1B46A 4LVQA 3ZS6A 3FVGA 4ONYA 5AA3A 2Y84A 3O9PA 4GOTA 1DPEA 2DXYA 4LZ5A 2YPNA 3M3KA 1PB9A 3K6XA 3MP6A 1B32A 3RQTA 3L6HA 1MXYA 1POY1 3IO4A 1OVBA 5DYHA 3TEPA 3TTKA 3G3IA 1IITA 3MZ9A 2XXHA 3B6TA 5I2KA 1JETA 3K6VA 2UVGA 4OFLA 3GXAA 1MM7A 1UTHB 1QW0A 1Y1ZA 4DXUA 4FORA 1B3EA 2DQVA 2X7QA 2QS1A 4PETA 3ILTB 3OSQA 4YMAA 3ILUB 3G3HA 1QUJA 2A5TA 1OMPA 1ZU0A 1R6ZA 1BLFA 4G77A 2I0CA 5B70A 2PX1A 3N6TA 3KN7A 4JB7A 5KDTB 3Q26A 4IGRA 1Z7NE 3UIFA 3PD8A 3C35A 2QS2A 4Q30B 2XXIA 4FAJA 3H6UA 3SKPA 3VV5A 4FATA 1DTZA 2UYEA 3IOUA 1AMFA 4OTEA 2NUVA 3H7MA 1Y3QA 3QUFA 2DXRA 3RT6B 3E4RA 3KEIA 1AIVA 2Z8EA 2QS3A 4YKPA 4ESXA 3K6UA 4X1BA 1FQFA 1UTHA 1MS7A 1FTOA 4R9FA 4FIMA 4P0GA 1ZBMA 4G2ZA 1PDAA 1B9JA 2OLBA 3W15C 3KOSA 1LLSA 2I6EA 4XKNA 3MP1A 3U93A 3MAMA 3MP8A 2AIXA 4FEBA 1XC1A 4F22A 5KDTA 1B6HA 2O1MA 4C1TA 4R2FA 2XXTA 4NE4A 1HSLA 4GL8A 1PEBA 4F2OA 4KCCA 3GLBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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