3TMGA

Crystal structure of glycine betaine, l-proline abc transporter, glycine/betaine/l-proline-binding protein (prox) from borrelia burgdorferi
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
266
structure length
266
Chain Sequence
LKSVKIGYVNWGGETAATNVLKVVFEKMGYNAEIFSVTTSIMYQYLASGKIDGTVSSWVPTADKFYYEKLKTKFVDLGANYEGTIQGFVVPSYVPISSISELKGKGDKFKNKMIGIDAGAGTQIVTEQALNYYGLSKEYELVPSSESVMLASLDSSIKRNEWILVPLWKPHWAFSRYDIKFLDDPDLIMGGIESVHTLVRLGLENDDFDAYYVFDHFYWSDDLILPLMDKNDKEPGKEYRNAVEFVEKNKEIVKTWVPEKYKTLFD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
source organism Borrelia burgdorferi
publication title Crystal structure of Glycine betaine, L-proline ABC transporter, glycine/betaine/L-proline-binding protein (ProX) from Borrelia burgdorferi
rcsb
molecule keywords Glycine betaine, L-proline ABC transporter, glycine/betaine/
total genus 98
structure length 266
sequence length 266
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04069 OpuAC Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3tmgA01
3.40.190.100 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Glycine betaine-binding periplasmic protein; domain 2 3tmgA02
1GR2A 1IITA 1FQDA 2I4CA 1A40A 2GRVA 4EQBA 4KFQA 1Y4TA 3WAFA 3N5LA 4WEPA 2CMOA 4PE5B 3LSXA 5TP9A 1H76A 1A8EA 3PMWA 3ZS6A 2RF1A 1NL5A 2F7CA 3MAMA 3VLVA 1OQHA 4PFUA 1NNKA 3TYHA 5H8FB 1ZMGA 4OXVA 3SESA 1AH5A 1D9VA 4LQ2A 2F34A 1D9YA 4GVOA 2XXWA 3T96B 2PVUA 3SETA 5K2XA 2ALUA 3LR1A 3TAJA 2H25A 5I2NA 3PD9A 4U4SA 1NNFA 1POTA 4P0IA 4IO6A 1OLCA 3UIFA 4DE8A 2R9JA 5J1DA 4ZEKA 2VOZA 3GBBA 1QJMA 4ELRA 4OVJA 4ZZAA 4OTEA 3F11A 2Y7PA 1AMFA 4GD5A 4NF8B 3TQWA 3TQLA 1MQJA 3PMVA 5AA2A 4ZEDA 3QUJA 1MXUA 1SI1A 2XHDA 1FTKA 2OLBA 3FVOA 3K6WA 1BIYA 4BDRA 3K6UA 1QULA 2GHAA 3D4CA 1MY1A 2RC7A 4X48A 5AE4A 4DIGA 5JTYB 2X26A 1B4HA 2RC8A 2P0SA 4KI0E 3PPPA 5FTHA 1NMUA 5DTBA 3LSLA 1SI0A 4R6YA 4C0RA 2XXXA 4O3AA 1FTJA 2YPNA 2Q2CA 5LOMA 2O1MA 3MVZA 4YICA 4R6KA 2DP8A 2OJTA 4WXJA 2XXUA 4H1XA 5FHMA 5I58A 2ZNSA 2I0CA 2A5SA 2AYSA 3IAZA 1PEBA 1XVYA 3TMGA 2O7UA 3MQ9A 1R9LA 2F78A 3UN6A 3H7MA 4U2RA 2RCAA 4GF8A 1P99A 4NF6B 3ILTB 4Q5TA 5DVFA 4R75A 3FD3A 3D4GA 4IO4A 1B5IA 3FXQA 5DT6A 3OSRA 3TZAA 2THIA 4E0XA 1N7XA 1OMPA 4GOTA 3MBPA 3FUZA 1SW4A 4F3SA 3V89B 1UTBB 3E9XA 5H8FA 1JW1A 2Q89A 4ZDMA 4GWOA 5JK4A 4FECA 1NNPA 3IX1A 3ZSFA 5H8NB 4I1DA 1GV8A 1UIVA 2Y7WA 3UGWA 3U72A 1NFTA 4JWYA 3SKPA 5A5XB 3BKIB 3M3FA 3MZ1A 1L5TA 1B3FA 3R26A 2Z23A 4IB2A 2DQVA 3CSGA 4FEBA 1UTHB 4EUOA 1UIUA 2O68A 1N3XA 4IO2A 2OWTA 3ZKLA 2GFEA 5AA3A 4NF8A 4YB6A 4KHZE 1SVXB 2YLNA 1LAXA 3K2DA 3PPQA 3GXAA 3QAXA 1GGGA 1IZ1A 4O3CA 1OVBA 4R72A 1I6BA 4JSOA 4PFYA 1B3HA 5DVIA 3IO4A 3LSWA 4OEVA 1MPDA 1URSA 3FXRA 3S9LC 5B7DA 5JTYA 1DSNA 3H6TA 4OERA 1DMBA 3PUVE 1FQBA 3FJGA 1ZBMA 3OO7A 3H6VA 1MQHA 3IB2A 3VDFA 2F7AA 1B0LA 2NVUB 1B3LA 5IKBA 1O7TA 3UP9A 4I8CA 3I3VA 5HPQA 1LCTA 1B3GA 1PC3A 4TLLB 4F29A 2GHBA 4WEDA 4YB5A 3OO9A 2E0SA 3LUYA 2DOJA 4OHNA 5B70A 3VVEA 1VFDA 1MQIA 3W9WA 3G3FA 3RUMA 3FIRA 3DLNA 3H03A 3VXCA 1FTMA 3SEUA 4NF6A 3RNNA 1GVCA 4F39A 1MPCA 1LBCA 2PX1A 4LVQA 2ONSA 1YPNA 1B0HA 1H43A 1AL3A 4G2ZA 1SW2A 4KQPA 4ZE9A 4EF1A 5CRYA 4EXLA 4DXUA 3DP6A 1S9TA 1MRPA 1JEUA 2DWJA 3RTWB 1A8FA 1FCKA 3IOWA 2FNCA 1UTBA 2OBGA 2UVIA 3OEMA 1B51A 1FQEA 1MDP1 2VD3A 2PYYA 3O6IA 3KJTA 2FYIA 2V3TA 5H8NA 2PT2A 2XD2A 1TWYA 4IY6A 4ZZEA 5A5XA 1Y3NA 4X1BA 4FEDA 4QFPA 3C4MA 1WDNA 5L9MA 3G3JA 3SEXA 1DPEA 1UTHA 5CMCA 3TPAA 2XXVA 2NWJA 2DE3A 3DP4A 2AL5A 4TOZA 3TTKA 3PPRA 3E4RA 2QS2A 4GXAA 1ZLQA 3ILUB 3N94A 3MZBA 1RYOA 4N07A 1LFIA 1A55A 3ECRA 2HZLA 1MXWA 1N0TA 1YAEA 4HW8A 4JWXA 4DLDA 4R2BA 1Z7ME 1MY2A 3IORA 3FV1A 5L8DA 1MXXA 4ELOA 3IOVA 4GLIA 1PDAA 1TFDA 3JZJA 2DWHA 2G93A 3SDFA 3QYTA 4LQ5A 5JEIA 3PUYE 3DP8A 1XHYA 4G77A 3PU5A 3VE1B 1EZ9A 4H8JA 3MZ9A 1AIVA 4QFNA 1LFGA 5CMBA 4U22A 4MBPA 4LZ8A 4ESWA 3K0VA 1B2HA 4KCDA 3CIJA 2I49A 4E0WA 3U8QA 1OVTA 2QMWA 3KZGA 2ZYMA 2F97A 3CR9A 2RKMA 2ZMBA 5I57B 4HS7A 1IIWA 3C36A 2H99A 3MP1A 2QS4A 1Y3QA 3H4ZA 3RGYA 1URGA 3RLFE 4KYEA 1H45A 4NEDA 1O63A 4R2FA 2V93A 4RA1A 3MWBA 1XVXA 2Q2AA 2D3IA 2QPQA 4IO5A 3A09A 2NOOA 2PMSA 5CI5A 1MDQA 1PBQA 2Y7IA 3Q25A 1B52A 4POXA 1LAGE 2XXYA 3H3GA 4F31B 3A3UA 2RC9A 4UACA 2QMXA 1ATGA 4DDDA 1P1WA 4NTLA 5IAIA 1TXFA 3S2VA 1JETA 1F9BA 4LA9A 5AA2D 3ZKKA 3Q27A 3TTMA 4FJPA 2E1SA 3O97A 4IGTA 5FHOA 4QSDA 5EHSA 2QL3A 3C31A 2XXRA 2NUVA 3GLBA 3KN3A 3KOSA 4F2OA 1GTKA 1XT8A 3DM0A 1DTGA 3U1OA 1HSLA 4F19A 4KCCA 4U4XA 4ECFA 3N6TA 4FE8A 4EDPA 1JNFA 4MFIA 3O6HA 3VV5A 2I6EA 3PV0E 2P2AA 4BLAA 3K1PA 4F22A 4FAJA 4XKRA 2V25A 3OO6A 4GXSB 5ICTA 4QF9A 1POY1 3HSTA 3K6VA 2V84A 5CBSA 4JXIA 2R71A 1PB7A 3OENA 1Y3PA 5H8SA 1B6HA 5DEXB 2A5TB 3KG2A 4YZZA 1LCFA 1SDXA 1IXCA 4R73A 1CE2A 3L6GA 3LC8A 1OLAA 1N84A 1IXHA 4RK2A 1R9QA 4ZE8A 1FW0A 2RCBA 3OMBA 4AB5A 3K02A 1MH4A 3FVNA 5I57A 3TUSA 4Z0IA 2NXOA 4G68B 1Y1ZA 1D4NA 2DWAA 3OOAA 1WVJA 3T66A 5AA4B 1DOTA 3USDA 1QW0A 2I58A 3MJNA 2Q9TA 2Z8EA 4OESA 3VVFA 3IB1A 3IB0A 4YU0A 3UA8A 2F35A 1B1HA 4ONYA 3HHFA 3C35A 4AQ4A 3CRBA 1SW1A 3KBRA 4IO3A 2I4BA 2R6GE 1M5DA 1A7LA 4WKMA 1A54A 4POWA 4BDMA 2GH9A 2O84X 1P1UA 1FQFA 5F1QA 1IXGA 1MS7A 4KPTA 3R6UA 3O29A 1NKXA 1YTVA 1LLSA 1PB9A 2HAVA 4OQOA 3PD8A 1N76A 4IY5A 4M1VA 2UYEA 4DCXA 3TELA 2H4IA 4N13A 4R74A 1EZPA 3TFLA 3DELB 1R6ZA 3LSFB 3OELA 5I84A 1HSJA 4XTCQ 2UVJA 2Q88A 3T9HB 1URDA 4FIMA 3FV2A 1JW4A 4YKKA 2RINA 3UK4A 3OSQA 4EQ9A 2Q8JA 4LZ5A 3RY3A 2ABHA 4XIGQ 5ITPA 4JDFA 4OFJA 2ZYNA 1O64A 4QSCA 3H06B 4LUBA 4OMBA 2B65A 3EF7A 4KR5A 2ZNTA 4DZ1A 3THIA 2D5WA 3H6UA 2PBWA 2XX9A 2HEUA 3T9UA 3IOUA 1NH7A 2OCUA 1KWHA 3TEPA 3G3IA 1Y4CA 1MQGA 3U94A 3K4UA 4Z7EA 4OYVA 1P1NA 3E3KA 5DEXA 2A5TA 2REGA 3TDJA 2UVGA 4GQOA 1B58A 3PUXE 4UA8A 3G7WA 3MW0A 1OQGA 4H6DA 2HAUA 4GL0A 2W7YA 3K1NA 3C33A 3IOTA 3GBAA 5CMKA 4PP0A 4F2QA 2OWSA 1YCJA 1BLFA 2O7IA 3C32A 4JWOA 1S7YA 4G68A 1JQFA 4H5FA 5AA4A 1MXVA 4TLMB 1AOVA 3FATA 3CFLA 3QK6A 3MPKA 5ITOA 3G3GA 2P1SA 4M4GA 4OFOA 3Q29A 1ZKBA 5I2KB 1FTLA 1ZU0A 4P0GA 3U92A 1Y9UA 3H6WA 3S4UA 2Y84A 1SW5A 3IO6A 2WKYA 4GFRA 3TTNA 4DXCA 1J1NA 3KN7A 4GL8A 3KGCA 1B9JA 1B4ZA 1MH3A 2Z8FA 1Y20A 2VP1A 3KOTA 4XXUA 4XKPA 5KDTB 4O3BA 4EQ7A 3OD7A 2YJPA 3CVGA 1TT1A 2X7PA 2DVZA 4I62A 2Z8DA 4C1TA 3FVGA 1FQCA 4NWCA 4RPOA 1EZOA 3V5AA 2QSXA 1B5HA 1I6AA 5BWJA 3FJ7A 5H8HB 3PUWE 4LZ7A 1SBPA 4F3BA 4G8HA 3O28A 4G8MA 2FA7A 3O2AA 4RJZA 2F7BA 1DPPA 4ND9A 3EHSA 3RN8A 5KCJB 4L17A 4JBZA 4KYDA 4P11A 3TODA 2XXPA 4AB6A 1WODA 3IL1B 4ZS9A 5I59B 4Q30B 3B7DA 3C9HA 1Q1KA 4THIA 2DWIA 2DXYA 1T0KA 4Q0CA 3OXNA 1IEJA 1R1NA 4BDLA 1US5A 2I0BA 1B05A 3HCQA 2ONKE 5TU0A 5CMMA 5FTIA 3O9PA 2O69A 4YKPA 5HBCA 1EU8A 4RPNA 3HV1A 5H8QB 4NF5B 2O1LA 1H3DA 3K01A 4R9FA 4PFWA 3JV9A 1MY3A 1M5CA 4EXKA 3B6WA 3IJXB 3TCFA 5HM4B 1JW5A 1MM7A 3CG1A 5KZTA 3TCHA 2F36A 5ISUA 1VSOA 3CI8A 4MLQA 4QFKA 3S9MC 5EHMA 1II5A 1BP5A 3TKDA 2DS9A 3RT8A 4NMYA 2XXQA 2O51A 4QSEA 1LB8A 3BFUA 3QUFA 4OETA 1PBPA 3PPNA 5TPAB 5I2KA 2DSFA 3SEVA 4HCYA 1I6QA 1CB6A 2UXAA 3M3KA 3OEKA 1RYXA 2F6GA 4I9DA 3TCGA 2ZNUA 4DCYA 3Q28A 3SEWA 2PT1A 4LATA 4DXBA 2DE4A 4QHQA 2Z22A 1QUJA 4MH5A 2F8DA 1RKMA 3N6UA 1USYE 2G29A 2ESNA 3KEIA 4F1VA 5KDTA 3PGFA 4R9GA 3KFMA 3Q26A 1QUIA 3A3CA 2HCAA 2QRYA 4HTGA 4U21A 4F3PA 2DE2A 2XXIA 3L6HA 3LBSA 1N04A 3MVXA 1MG1A 3FZVA 3IR1A 3O6GA 5H8HA 4F1YA 4G4PA 3PMXA 3QXMA 1BKAA 3T9VA 3CFXA 3SERA 4GRKA 3AXFA 1DTZA 1LSTA 1MY0A 3SEYA 4QFOA 4FATA 4BDNA 1OIBA 3B6TA 3PUZE 4QFLA 2I3WA 1VFEA 4F1UA 4ZEBA 2DXRA 1SD3A 5KCJA 1A99A 3HO7A 5M2VA 1VE4A 3EHUA 1VR5A 1USYH 4KD5A 5I59A 4NF4B 3VXBA 3WAEA 3K1MA 2AIXA 3CSBA 1ELJA 3JYRA 1QKBA 5FHNA 1BTJA 4LP2B 1N7WA 4H5GA 2H9BA 2O6AA 3S9EA 1MQDA 1JEVA 2V3QA 3M8UA 3MUQA 3QSLA 4C1UA 4MF3A 3CG3A 5H8QA 4NF5A 2AL4A 3EHTA 1LB9A 4YMAA 1Y1MA 3OO8A 2LAOA 2QJEA 2UYFA 2HFBA 1MPBA 2VGQA 4G8NA 1UQWA 3B6QA 2I48A 1B7ZA 3BBRA 3VVDA 3W15C 1MY4A 3HPIA 1D3KA 3RT6B 4F18A 3CFZA 3FJMA 2ZYOA 4NE4A 1B1XA 4X9TA 2H98A 5TPAA 3P7IA 4PETA 1M5BA 2V3UA 2OK2A 4H67A 4IO7A 4ZEFA 1JVYA 2H5YA 3KSJA 4YB7A 4U1OA 1ZJLA 2ZXTA 4ESXA 4JSDA 1P1OA 1B3EA 5DYHA 1N3WA 4ELPA 2BJJX 1B7UA 1ZTYA 2B3BA 3RPWA 1XS5A 3PPOA 4RNSA 1B5JA 4RYAA 2DYXA 3BFTA 4BDOA 3I5OA 4OFLA 3S9NC 3IK6B 4KYSA 5I56B 1M5EA 3U93A 3VLUA 3K00A 1H44A 1LGBC 1Q35A 4RXLA 1IQ7A 4ELQA 3FASA 3R7XA 3K6XA 1IXIA 3EN3A 1PB8A 1NNTA 3TTLA 3TTRA 3V8XB 4N6PA 3EPEA 1LAFE 1JVXA 1B32A 1B40A 3GZGA 1QKAA 2D21A 4H0WA 4BDQA 3KSXA 3MVWA 3RTFB 2QS3A 4ZEIA 4JB7A 2Y7KA 3KN8A 1TFAA 2I3VA 3MP8A 3MPLA 1MXYA 2ONRA 3FXUA 1FQAA 3G3KA 5TP9B 2X7QA 4OEUA 3HN0A 1S50A 2UVHA 4NF4A 2XX7A 4EF2A 3FVKA 4H65A 3IJOB 2KLFA 1MM6A 2XD3A 4U1ZA 1ANFA 3N26A 1HSEA 4FORA 3W9VA 3MVYA 3T93B 4XKQA 1XC1A 4QRZA 2F5XA 1SYIA 1LFHA 5I2NB 4H8IA 1Z7NE 4ZECA 3MP6A 4YKJA 2ANJA 4Q8RA 5EYFA 4R6HA 2QS1A 3HHGA 3VFJA 1ZIUA 3EQ1A 3VLWA 3T22A 2DVCA 4TQUQ 1XOCA 4MLVA 4PFTA 3MC2A 3T9XB 3QIMA 4G68C 2ZYKA 2REJA 2VD2A 5ICQA 5BUUA 1LBBA 1FTOA 4OZ9A 4HCWA 1B7HA 5AA2B 5AA1A 5L9OA 5F7VA 5DVJA 5CM6A 4YKIA 5L9SA 1US4A 2HZKA 2IA4A 2HQ0A 3E13X 3FGSA 2F6PA 2HXWA 2B3FA 4ISUA 3KJ7A 2OZZA 4GIZA 4IGRA 2Y7RA 4OENA 4RK9A 4X1DA 3ONMA 5CBRA 1EH3A 4NWDA 1B46A 2VHAA 3I6VA 2CZLA 2M8CA 4LONB 1QUKA 4K3FA 2XXHA 3ODBA 5I56A 1QVSA 1MXZA 2XX8A 4OWDA 4RY1A 5CC2A 1SYHA 1NH8A 4U23A 1M5FA 3C34A 3V83A 3M3LA 1LAHE 1IUDA 1P1QA 4YMBA 5I58B 4YAHX 4F3GA 4PQJA 2XXTA 3UORA 3RQTA 1I69A 4XKNA 2IEEA 5ELVA 1SQYA 3O66A 5K2YA 3G3HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1DBZA 1GR2A 1IITA 1FQDA 2I4CA 1A40A 2GRVA 4EQBA 4KFQA 1Y4TA 3WAFA 3N5LA 4WEPA 2CMOA 4PE5B 1FBHA 3LSXA 3QMFA 5TP9A 1H76A 1A8EA 3PMWA 3ZS6A 5EQ7A 2RF1A 1NL5A 2F7CA 3MAMA 3VLVA 4PGNA 1OQHA 4PFUA 4XFEA 1NNKA 3TYHA 5H8FB 4MJOA 1ZMGA 4OXVA 3SESA 4OA4A 5LTCA 1AH5A 1D9VA 4LQ2A 2B4LA 2F34A 1D9YA 4GVOA 2XXWA 4GBWA 5ESYA 3T96B 2MKZA 2PVUA 3SETA 5K2XA 2ALUA 3LR1A 3TAJA 2H25A 5I2NA 3PD9A 4U4SA 1NNFA 1POTA 4P0IA 1IMCA 4IO6A 1OLCA 3UIFA 4DE8A 2R9JA 5J1DA 4ZEKA 2VOZA 3GBBA 1FTAA 1QJMA 4ELRA 4OVJA 4ZZAA 4OTEA 3F11A 4P1LA 4I3YA 2Y7PA 1AMFA 4PDHA 4GD5A 4NF8B 3TQWA 3TQLA 1MQJA 2CZIA 3PMVA 1NV5A 5AA2A 4ZEDA 3QUJA 1MXUA 1SI1A 2XHDA 1FTKA 2OLBA 3FVOA 3K6WA 1BIYA 4BDRA 3K6UA 2ZZWA 1QULA 2GHAA 3D4CA 1MY1A 2RC7A 3ISPA 4X48A 5AE4A 4DIGA 5JTYB 2X26A 4GWSA 1B4HA 2RC8A 2P0SA 4KI0E 3PPPA 5FTHA 1NMUA 5DTBA 3LSLA 2QVVA 1SI0A 1FJ6A 4R6YA 4C0RA 2XXXA 4O3AA 1FTJA 2YPNA 2Q2CA 5LOMA 4G61A 2O1MA 3MVZA 4P9KA 4YICA 4R6KA 2DP8A 2DDKA 2OJTA 4WXJA 2XXUA 4H1XA 5FHMA 5I58A 2ZNSA 2I0CA 2A5SA 2AYSA 3IAZA 1Q9DA 1PEBA 1XVYA 4AS4A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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