4YAHX

Crystal structure of the methionine binding protein, metq
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
245
structure length
245
Chain Sequence
DPNHIKVGVIVGAEQQVAEVAQKVAKDKYGLDVELVTFNDYVLPNEALSKGDIDANAFQHKPYLDQQLKDRGYKLVAVGNTFVYPIAGYSKKIKSLDELQDGSQVAVPNDPTNLGRSLLLLQKVGLIKLKDGVGLLPTVLDVVENPKNLKIVELEAPQLPRSLDDAQIALAVINTTYASQIGLTPAKDGIFVEDKESPYVNLIVTREDNKDAENVKKFVQAYQSDEVYEAANKVFNGGAVKGWLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords D-methionine-binding lipoprotein MetQ
publication title The contribution of methionine to the stability of the Escherichia coli MetNIQ ABC transporter-substrate binding protein complex.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli (strain k12)
total genus 78
structure length 245
sequence length 245
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-02-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF03180 Lipoprotein_9 NLPA lipoprotein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4yahX01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4yahX02
2G29A 2ONRA 2VD3A 4POWA 4C0RA 5TP9A 4NF4B 2QL3A 3LSXA 4GQOA 4AQ4A 5AA4B 5A5XA 4NE4A 3MVXA 4U2RA 3WAEA 4YU0A 4YKPA 4EQ9A 3E3KA 3RPWA 4FAJA 4P0GA 5B70A 3D4CA 4EXKA 3TUSA 3K1PA 3DM0A 5I56A 1MQDA 1HSJA 3CSBA 2E1SA 5KCJA 1YTVA 3H06B 1SI1A 4TLLB 3RQTA 3IORA 3A3CA 4OFLA 1ZMGA 4LATA 3G3HA 1MQJA 4I1DA 1Y4TA 2QPQA 1TFAA 4IO4A 3U72A 1FQCA 3ZS6A 1QUIA 3V5AA 4H5FA 1US5A 1M5EA 3O29A 2UVIA 2D21A 4F3BA 2NWJA 3THIA 3SKPA 4NF8A 1Y3PA 1LCTA 1NH7A 1RKMA 3K00A 2OWTA 3N26A 4O3CA 4O3AA 3T9XB 4DXUA 2B3BA 3QK6A 2R9JA 1OVTA 2A5TB 5B7DA 4QF9A 3FV1A 4G8HA 1M5CA 2A5SA 4OZ9A 3MWBA 3LUYA 1FCKA 2ZYMA 4ZS9A 4R6HA 5EYFA 4NF4A 2IEEA 1URSA 1JW4A 4BDNA 4ZZEA 4F19A 4I9DA 4IY6A 2O1LA 4GL0A 2Z8EA 5I59B 1SYIA 4G8NA 4U1ZA 4HCYA 4R73A 5JK4A 1IXIA 3U93A 4RXLA 4F39A 1GR2A 3TQLA 2QRYA 3FASA 3QUFA 4JB7A 1URGA 1WODA 1N0TA 2UXAA 1N76A 4ELRA 2M8CA 2YJPA 3TDJA 2V93A 3W9WA 4OFJA 2F6PA 2H25A 3FUZA 1S50A 3MZ9A 2NOOA 3V83A 1A8EA 4R2FA 2QMXA 3GBAA 5FTIA 4QSDA 5CM6A 1MY1A 3PMXA 4LONB 1B3HA 4ND9A 4XKQA 1POY1 3TFLA 4OYVA 4KD5A 1QKBA 3TAJA 4N13A 1SW4A 1B5HA 1YCJA 4GFRA 2DWAA 2H98A 4ZZAA 4R6YA 5TPAB 5H8QB 4XXUA 4U23A 1MQHA 2I0CA 3UGWA 3FD3A 4F29A 2XX8A 3PUWE 3VXCA 1LGBC 1NKXA 1Y20A 4JWXA 1ZJLA 1XC1A 4LQ2A 2NUVA 4DZ1A 3KFMA 3W9VA 2DWJA 1AH5A 4G68C 4BDOA 3SEUA 3TTMA 1Y1ZA 3LBSA 1B1HA 3KGCA 1VFDA 1Y4CA 3IX1A 4XIGQ 4H8JA 5I59A 4WXJA 1MY3A 5LOMA 2F7CA 3MP6A 4ZEFA 5I84A 2FA7A 1Y1MA 3HO7A 2ZNSA 3MP1A 4HS7A 3OO9A 4GD5A 1NFTA 3LSWA 3S2VA 3UK4A 3CSGA 4GLIA 3VVDA 3OO8A 4NWDA 3KBRA 3E9XA 5EHMA 1N7WA 4R9GA 1B4ZA 1GGGA 3TTKA 5TU0A 3CFZA 2O7IA 3CG1A 3H6VA 2I3WA 4L17A 4XKNA 2P1SA 1SQYA 3MBPA 3TKDA 5L9OA 1OVBA 2F8DA 5TPAA 2DE2A 5H8QA 1JQFA 1ZLQA 4JWYA 1A99A 2Y7IA 3RGYA 3RNNA 1T0KA 1IXCA 2F7AA 3W15C 2V84A 4KI0E 5L9SA 4G77A 4ESWA 4NMYA 3TQWA 1M5FA 3TELA 3CFLA 3HSTA 3PPOA 4F31B 2R71A 5FTHA 2OZZA 3H6WA 3RY3A 2W7YA 1PEBA 4C1TA 4X48A 1B46A 2Y7KA 2GH9A 3HHFA 3BFTA 3IB1A 3FVKA 3OMBA 2VHAA 4MBPA 3SERA 3QXMA 3VLUA 3KG2A 3EHUA 3JV9A 2Y7PA 2X7PA 3JZJA 1EZPA 2Q8JA 2F97A 1HSEA 3O66A 2XXXA 4LVQA 4UACA 3PUVE 4ESXA 3IJOB 4EDPA 1J1NA 2O7UA 4IY5A 3KOTA 3T9UA 2AL4A 3MPKA 5AA1A 3IB2A 3VV5A 4OETA 1VFEA 4X9TA 2FYIA 1Z7ME 2QS3A 3FVNA 3IOUA 4YMAA 1I6BA 3I6VA 2HEUA 2QS1A 2DVZA 3DP6A 1Y9UA 5TP9B 2UYFA 2Q2AA 2FNCA 1GTKA 3EF7A 4MFIA 2QMWA 2DSFA 4HW8A 2DQVA 4JWOA 3T9HB 3ZSFA 1MXWA 1D9YA 2XXWA 4H1XA 1FQBA 3N5LA 1MH3A 3EPEA 5KCJB 5BWJA 3B7DA 1MQIA 4GWOA 4POXA 4OERA 1Y3NA 1CE2A 1MXUA 1TT1A 5IKBA 2ZYNA 3OD7A 4R74A 4HTGA 3B6QA 4PFTA 3TMGA 1MPDA 5CC2A 4R72A 2YLNA 3CFXA 1PBPA 2G93A 4G2ZA 1M5DA 1NNTA 5H8FB 1P1WA 5CMCA 3LSLA 4DXBA 3RTFB 1DMBA 1P1QA 4PFUA 2PX1A 4WEPA 2O51A 3JYRA 2DWIA 3C4MA 4FATA 4YKJA 4QRZA 4F3GA 1B05A 4QHQA 1DPPA 3RUMA 4EQ7A 3PMVA 1B0LA 2RCBA 2E0SA 1QUKA 2B65A 3MP8A 3L6GA 4FEBA 4PP0A 4KHZE 1H76A 1FQDA 1BLFA 1MM7A 3R26A 1IZ1A 3PUXE 1CB6A 1DTZA 2XXYA 5JEIA 4H67A 2HQ0A 4DIGA 1MQGA 4IGTA 4PFWA 2I4CA 1OIBA 1LSTA 2QSXA 1B32A 2XD3A 1B52A 1R6ZA 2HAVA 2WKYA 1XHYA 3VLVA 4DCYA 4H0WA 1N04A 1O7TA 4F1YA 4U4XA 5HPQA 4EQBA 4AB6A 2DWHA 3EHSA 3IO6A 2OLBA 1D3KA 1LFHA 3IAZA 4LZ5A 1ZBMA 1GV8A 3TTRA 1NMUA 4LA9A 3H4ZA 1JW1A 4ZE9A 4BDRA 3QYTA 2ESNA 3Q26A 1VSOA 1Q35A 5H8FA 4BDLA 4H5GA 4QFPA 2UYEA 5CMMA 2Z23A 3PUYE 1B5JA 4YB5A 2ONSA 4GVOA 2CMOA 2X7QA 3KEIA 1URDA 1R9LA 3S4UA 4IO2A 1IXHA 3QSLA 2HZKA 2AYSA 2Z22A 5ICQA 4E0WA 4EF1A 3PPQA 3R7XA 1JEUA 3FXQA 3DP4A 2ONKE 1N3XA 5DTBA 4GXSB 4KFQA 3MUQA 2XXUA 1LCFA 2DE4A 4OEUA 4LZ7A 2V3QA 4KPTA 1B2HA 3DP8A 5ISUA 5AE4A 3FVOA 3EN3A 1MY0A 3QIMA 4H8IA 1SW5A 3RN8A 1BKAA 3F11A 2XXHA 1H44A 1MM6A 3MVZA 3ONMA 3HV1A 3PUZE 3WAFA 2PYYA 3IR1A 4RPOA 2O6AA 2Y84A 3FIRA 4KQPA 4XTCQ 3MQ9A 2VGQA 4F22A 2UVGA 4YZZA 4F1UA 2V3UA 1VE4A 3C9HA 4OXVA 3M3FA 4N6PA 1Z7NE 2HFBA 2VD2A 1JETA 2KLFA 3UIFA 3K1NA 1IIWA 2I49A 3OO6A 1LB8A 3S9EA 4KYEA 2CZLA 4ZEIA 1P99A 2BJJX 2F35A 1NNFA 1PC3A 1H3DA 3N6TA 1P1NA 4FEDA 4OVJA 2P0SA 4RPNA 2I0BA 4Q5TA 3TTNA 2QJEA 1A8FA 4TOZA 1OMPA 2R6GE 3TEPA 5DVFA 4OESA 4XKRA 4JSDA 2ZNUA 3VXBA 1IQ7A 3DLNA 1MS7A 2AIXA 1B9JA 3H6UA 2O1MA 1B5IA 1USYE 4P0IA 1ELJA 2P2AA 1PB7A 4DDDA 5M2VA 3I3VA 1A54A 3OENA 4I8CA 5ITOA 2PBWA 3U94A 1LFGA 2DOJA 4ZECA 4IGRA 3IB0A 3VVFA 3O2AA 2DXRA 1OQHA 5I2NB 2DXYA 1B3FA 3G3KA 3Q28A 3BKIB 2XXIA 4F3PA 3IO4A 3FJ7A 4IO6A 5CRYA 4JBZA 3FZVA 2F78A 3QUJA 4C1UA 3CIJA 3FVGA 4X1BA 1XVYA 4RYAA 3FATA 4NWCA 3VFJA 3KN3A 1P1UA 5DEXA 1IEJA 3IJXB 1ZU0A 1QKAA 1UTBB 3UORA 4RK2A 4R9FA 3TYHA 4KR5A 1SYHA 4IB2A 3TTLA 2OCUA 1GVCA 1SBPA 3FJGA 1PB8A 1QUJA 5IAIA 2AL5A 3IL1B 4YMBA 2XX9A 3ODBA 3I5OA 2VP1A 3U92A 1SW2A 1FTOA 4Q30B 4F2OA 1B7UA 4NEDA 2XXRA 2Q89A 4DE8A 3E13X 3PD8A 4ELPA 5ICTA 3PMWA 2XD2A 1NH8A 3CR9A 1I6QA 4OMBA 3GZGA 5I2NA 3SEYA 3FXRA 1DOTA 4F2QA 3MZ1A 3C34A 2DYXA 3PGFA 3E4RA 3RT8A 4YB7A 3H3GA 2ALUA 1JEVA 1IITA 1LFIA 1FQEA 2PT1A 1BIYA 1MPCA 4OTEA 3ECRA 2ZYKA 1UTBA 3GBBA 1Y3QA 3FGSA 3U1OA 4BLAA 1R9QA 1F9BA 4ELOA 1ZKBA 4GF8A 4BDMA 5KZTA 1LAXA 1FTJA 4ZEBA 2HAUA 2RC9A 3H6TA 3K6UA 2DS9A 1MXZA 2GHBA 3P7IA 3K0VA 2OK2A 4ELQA 2Z8DA 4YKIA 5ITPA 4G68A 2Y7RA 3K02A 5HBCA 5AA3A 3LSFB 4YKKA 4ZDMA 3C36A 4DCXA 3O97A 4LZ8A 4LUBA 4RY1A 4P11A 4WKMA 2QS4A 3IK6B 3ILUB 3CI8A 3ILTB 3K6VA 4GRKA 3HPIA 1QW0A 3OSRA 4O3BA 3TCHA 4KCDA 2HXWA 2ANJA 4R2BA 4GIZA 3SESA 4AB5A 1FTKA 4R75A 5FHOA 4LP2B 1DSNA 4THIA 4QSCA 3B6WA 1NNPA 2H5YA 3VLWA 2RC8A 1EZOA 3K1MA 1MDQA 2DE3A 1NNKA 3T66A 3EHTA 3SETA 3O6GA 3PPPA 3S9NC 4PQJA 3IOVA 3N6UA 1B40A 1BTJA 3C33A 3K6WA 4N07A 4RNSA 1US4A 2O69A 4TLMB 3M3KA 4Z0IA 3PU5A 3KN8A 1MG1A 1OLAA 3MVWA 1JVXA 3LR1A 3SEWA 4KYSA 3SEVA 1B3GA 1FQAA 4FIMA 2PT2A 2YPNA 1AIVA 4JDFA 1A55A 1SI0A 4OWDA 1LAFE 1UTHB 4XKPA 1PB9A 5AA2B 1TWYA 1LBBA 3PPNA 4OQOA 1FTLA 3KJTA 1N7XA 3CVGA 1D9VA 4MLVA 1R1NA 4HCWA 1N3WA 3C35A 1MY2A 1IUDA 1A40A 4QSEA 3MJNA 1RYOA 3MZBA 1MXVA 3KJ7A 4E0XA 1TFDA 4FORA 3VVEA 3T22A 3RTWB 2V3TA 2Y7WA 1UIUA 3B6TA 3IOWA 4M1VA 3MPLA 2GHAA 2HCAA 1MH4A 3KN7A 4RK9A 3BFUA 3FXUA 3GXAA 3ZKLA 3S9MC 1ATGA 5K2XA 3G3FA 1S7YA 1MXXA 5FHMA 1II5A 1EU8A 1WDNA 4ZEDA 1TXFA 4F18A 3ZKKA 3GLBA 4PETA 3V89B 3IOTA 4GOTA 2X26A 1FQFA 1I69A 1FTMA 2PMSA 5CBSA 2F7BA 4PE5B 3VDFA 3O9PA 1B3EA 2B3FA 3PD9A 1P1OA 4UA8A 3O28A 5AA4A 1Q1KA 5H8SA 3TODA 4U4SA 2ZMBA 2H99A 3O6HA 1UTHA 1YPNA 4EUOA 4QFOA 5AA2A 4FJPA 3DELB 4KCCA 5H8HB 1MPBA 1M5BA 5J1DA 3RLFE 4OEVA 3G3IA 4GL8A 4Q8RA 4ONYA 4NF6B 1SW1A 2Q88A 2XX7A 3KOSA 1L5TA 4U21A 2I3VA 4YICA 1XT8A 3OEMA 3R6UA 3EQ1A 2UVHA 4GXAA 1B6HA 4FECA 3Q25A 1AMFA 3G7WA 3C31A 5DEXB 4NF5B 1AOVA 1POTA 2ZXTA 4R6KA 5L9MA 4NTLA 1KWHA 5DT6A 5L8DA 1LLSA 1JNFA 4I62A 1XVXA 2V25A 2F36A 5JTYB 2D3IA 1A7LA 1QULA 2REJA 3S9LC 4BDQA 2A5TA 1LBCA 1UQWA 2I6EA 1ZIUA 3OXNA 5I2KB 3N94A 4H65A 3BBRA 1LAGE 1FW0A 1O64A 5KDTB 1O63A 3U8QA 2F6GA 1AL3A 3HCQA 5BUUA 1HSLA 4PFYA 2I4BA 1S9TA 2ZYOA 3VE1B 3H03A 3M3LA 1EH3A 3K01A 3RT6B 5EHSA 3Q29A 4X1DA 5H8HA 3TZAA 4KYDA 1SD3A 3OO7A 4IO7A 3A3UA 2D5WA 4NF6A 4MF3A 1QJMA 1DTGA 3AXFA 3T9VA 4U22A 5HM4B 1XOCA 3O6IA 3M8UA 1OQGA 1H43A 2THIA 3UN6A 2F34A 4NF5A 5DVJA 3UA8A 3USDA 4YB6A 1QVSA 5F1QA 1ZTYA 3T93B 3CRBA 5I57B 5DYHA 3D4GA 5AA2D 1B1XA 5I58B 4JSOA 4IO5A 2OWSA 4K3FA 5JTYA 3L6HA 3TCGA 5CI5A 4MH5A 1MRPA 2XXVA 5ELVA 1MY4A 1MXYA 4RA1A 1IXGA 1JW5A 1RYXA 4QFLA 4QFNA 4G68B 3K6XA 5I2KA 2ZNTA 5CMBA 5FHNA 1B51A 3MC2A 3MAMA 5KDTA 2H4IA 4OFOA 3V8XB 1NL5A 1WVJA 2HZLA 3G3GA 3PPRA 4EF2A 1BP5A 4G8MA 2Z8FA 3K4UA 4MLQA 1H45A 1MDP1 1YAEA 1DPEA 1B0HA 4YAHX 1USYH 3OELA 1SVXB 2LAOA 3OSQA 3SDFA 1ANFA 5H8NB 3A09A 4G4PA 3SEXA 3OEKA 2RCAA 1LAHE 3MVYA 2IA4A 2O84X 1LB9A 2O68A 2OJTA 2I58A 4QFKA 3Q27A 3PV0E 2F5XA 3FJMA 4LQ5A 5DVIA 2NXOA 4ZEKA 2GRVA 5I57A 1B7ZA 3HHGA 2DVCA 3HN0A 5I58A 1B3LA 4Q0CA 2GFEA 1JVYA 5A5XB 1OLCA 5CMKA 4TQUQ 2XHDA 2XXQA 2RKMA 4WEDA 3UP9A 2H9BA 2VOZA 3C32A 1N84A 3KSJA 2RINA 4IO3A 5I56B 2NVUB 4U1OA 3LC8A 1XS5A 1B7HA 3K2DA 1I6AA 4JXIA 3H7MA 4ISUA 2OBGA 4OENA 1VR5A 3CG3A 2QS2A 4OHNA 2DP8A 3TCFA 1PDAA 4Z7EA 5F7VA 4F3SA 4H6DA 4ZE8A 4F1VA 2PVUA 3G3JA 5K2YA 4DLDA 3FV2A 4NF8B 2XXPA 2ABHA 1SDXA 4DXCA 3MW0A 4EXLA 5H8NA 2Q2CA 1EZ9A 1B58A 2RF1A 1D4NA 2XXTA 4FE8A 4M4GA 5CBRA 2Q9TA 2RC7A 1PBQA 3T96B 4ECFA 4RJZA 3KZGA 3TPAA 2REGA 3KSXA 3QAXA 1UIVA 1B4HA 2I48A 2UVJA 3OOAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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