2R71A

Crystal structure of the complex of bovine c-lobe with inositol at 2.1a resolution
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of the complex of bovine C-lobe with inositol at 2.1A resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Metal binding protein
total genus 114
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2007-09-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2r71A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2r71A02
3KSJA 3K2DA 4G68C 4LZ5A 5DEXB 2H99A 1P1UA 2DOJA 3E3KA 3O28A 2XHDA 1N0TA 1USYH 3B6QA 2F7AA 1IXCA 2HZLA 2HCAA 3K6UA 2O7UA 4F3BA 3KN8A 5JTYA 4F19A 3FVOA 3ILTB 3PPNA 3KN3A 4ZECA 1NNPA 4X1BA 1SW1A 3JZJA 2F5XA 1YTVA 1IIWA 2ZYKA 3USDA 1B0HA 2NUVA 4L17A 3KFMA 4OHNA 5DTBA 3MZ9A 4NEDA 4NMYA 4YB7A 3MUQA 4KI0E 2D21A 2DSFA 1OIBA 3V5AA 1MY0A 1H45A 2D5WA 4FATA 2E1SA 3FVGA 1NL5A 3KBRA 2DWAA 1NKXA 3FXRA 5F1QA 3Q27A 4ZEDA 4H0WA 1A8FA 3H06B 2UVHA 3CI8A 5H8HA 3TELA 3LR1A 2R6GE 3G3GA 3LSXA 5LOMA 4RJZA 3IK6B 1GGGA 1GVCA 3K1PA 4OFOA 3OSRA 4KCCA 4I9DA 3E9XA 3S2VA 3A09A 4YICA 3OOAA 3UN6A 4NF6A 4LP2B 4YMBA 4FECA 2AYSA 3CVGA 2HAUA 3V83A 4DXBA 3FXQA 2DWIA 4YKIA 1B0LA 4BDMA 4RK9A 3U8QA 5TPAA 3CFXA 4MFIA 2OK2A 1EU8A 4JBZA 4C1UA 3D4GA 5I57A 4IO7A 2X26A 3S9NC 2XXRA 3ILUB 4BDRA 3TCHA 4QFKA 3PUVE 1US4A 2X7PA 3KZGA 5DVFA 2GHBA 1LAFE 1MM7A 4LZ8A 1H3DA 2F8DA 5IAIA 2W7YA 3CG3A 4GWOA 1EZOA 2DQVA 2VP1A 3PUWE 1R9LA 4YB5A 4LQ2A 2H5YA 3OEKA 3T9HB 4ELOA 1WVJA 1M5CA 1JW4A 5CMMA 4P0IA 3MPKA 2VOZA 3FD3A 4FJPA 5DEXA 2UVJA 2V93A 4R73A 5I58A 2ONSA 2CZLA 2NOOA 1B46A 2QSXA 1P1QA 2FNCA 4O3CA 4U1ZA 5BUUA 3BBRA 3PUYE 4NWCA 4O3AA 2AIXA 1O63A 2I3VA 2QPQA 1UTBB 3HCQA 3TUSA 1OQHA 3O97A 2AL5A 3ZKLA 4GRKA 2XXXA 1BIYA 2UVGA 3G3IA 1POY1 1ZMGA 4BDNA 1URDA 2IEEA 2Y7RA 1SD3A 4EF2A 2ZNTA 1MXUA 4BDLA 3B6WA 3RUMA 3PD8A 1I6AA 4LQ5A 5F7VA 4F3SA 4DCYA 2DXRA 4QFOA 2DS9A 1LAXA 5ICTA 3G3HA 1O64A 1LB9A 3N94A 5DT6A 4O3BA 2I0BA 5AA3A 3EF7A 3TAJA 5KCJB 1R9QA 2FYIA 4ZE9A 4F3PA 3K1MA 1MPCA 1A54A 1D4NA 3OSQA 1D3KA 2QMWA 3O6IA 4THIA 2ZNSA 1B1XA 1EH3A 1OVBA 2PBWA 1VFDA 4KHZE 4WXJA 2I48A 3FV2A 3OXNA 1B1HA 3V89B 4ZE8A 4X1DA 5AA1A 1FQEA 1MXZA 3VFJA 3C31A 1XOCA 2NXOA 3H3GA 3MP8A 4H65A 4OWDA 2Z23A 2DWJA 4YU0A 2UYFA 1LSTA 3LBSA 3VVDA 4YMAA 3SETA 3T93B 4IO2A 5CBSA 1TFAA 3TCFA 4H5FA 1LFGA 3U1OA 3MBPA 4U2RA 4NF4B 4DIGA 4GL8A 1LBCA 2QS2A 4ELPA 5H8QB 1B7ZA 2ZXTA 3ONMA 2F36A 4LVQA 3PMXA 5EHMA 3AXFA 3TEPA 3G7WA 1SW2A 2AL4A 1S7YA 2O69A 4ZDMA 2XXIA 1A40A 3TTKA 3MC2A 2OJTA 1SYIA 4U4SA 2DVZA 1QUJA 2X7QA 4NWDA 3O66A 2V3TA 4FE8A 4G8MA 2REJA 4EUOA 2LAOA 1AL3A 5I59B 1D9VA 3H6UA 3LUYA 4H8IA 4FEBA 1NNTA 3ECRA 3DP4A 4I62A 3RT6B 4GXSB 5A5XB 4R6YA 3M8UA 5FTHA 1B3GA 4EQ9A 3K01A 3FJMA 5KDTA 3IOVA 4G8HA 4OERA 4F31B 3RTWB 1P1NA 2FA7A 1B3EA 1UTHB 3FIRA 2HXWA 4GD5A 1JVYA 4QSEA 1TT1A 2RC7A 1IUDA 2G29A 1LGBC 3PUZE 4KYDA 4ONYA 1B05A 4F18A 5H8SA 5FHNA 2RF1A 3JYRA 3L6GA 4LATA 3RGYA 3DM0A 3A3UA 3LSFB 1Y1MA 3TODA 1P1WA 2YPNA 4F1UA 2M8CA 3EHSA 3IJOB 3PV0E 2Q88A 5KCJA 4OXVA 4QRZA 1QUIA 3C9HA 4AB5A 3R6UA 4U4XA 3K1NA 5L9OA 3VLUA 5ITOA 1US5A 2F7BA 3TPAA 1BLFA 4YKPA 1DPEA 5ICQA 4EXLA 4Q0CA 2ZYOA 1FQCA 4R6KA 1TFDA 2PT1A 4N07A 3K6WA 3FXUA 3PD9A 3HHFA 3IR1A 2Q2AA 1Y3NA 3H03A 3RLFE 1PBPA 5ISUA 3N6TA 3TTRA 1LFIA 1N3XA 3PMWA 1LLSA 1B2HA 4PP0A 5B70A 2F6GA 3KOSA 3OEMA 3R7XA 1RYOA 1B3HA 4GLIA 5I2NB 3FJGA 4NTLA 3C36A 1NNFA 4EQBA 3T9VA 4NF8B 2I4CA 1ZIUA 2H4IA 4AB6A 4HS7A 3MVZA 2XXPA 4NF4A 1B3LA 3M3FA 5H8QA 4XTCQ 2DE3A 4PQJA 4OVJA 4DDDA 2I58A 3VVFA 3HHGA 1MH3A 3FUZA 3Q28A 4OFJA 3C34A 3G3FA 4NF5B 1LAGE 4R75A 1AMFA 4U21A 5JEIA 4YAHX 4I8CA 1PB7A 3EHTA 5CBRA 2QL3A 3Q26A 3QSLA 5AA4A 2RCBA 1QJMA 2HEUA 5I59A 4MF3A 4IO6A 3M3KA 3FASA 5A5XA 2XD2A 2PMSA 3EN3A 3IO4A 3TTNA 1B7HA 3PPRA 1SI1A 1N04A 3KN7A 2Z8DA 4JSDA 3CSBA 1I6QA 1UTHA 1DTZA 1B58A 4C1TA 3QAXA 2B65A 3MW0A 4OFLA 3BFTA 2XXTA 3OD7A 4FEDA 2O68A 5H8NB 3VVEA 4LONB 1XT8A 1NMUA 3GLBA 4QF9A 2I49A 1ZLQA 3M3LA 5I56B 1OVTA 4F39A 5HM4B 2RCAA 3IOUA 3RY3A 4E0WA 3SEUA 2DE2A 1XHYA 1ATGA 4IGTA 4F22A 2UVIA 1A7LA 1MQDA 4TLLB 2Y7PA 1LAHE 5M2VA 1SVXB 3O9PA 1AH5A 4RY1A 5I84A 2O6AA 4OMBA 2Z8EA 5I2KB 4ESWA 3RNNA 4F1YA 2NVUB 3N6UA 3PPPA 4TOZA 1A99A 2P1SA 3VDFA 3TKDA 2RINA 3RTFB 5CC2A 3GXAA 2G93A 1VE4A 4OYVA 3KSXA 1JEUA 1LFHA 3GBBA 3K02A 1B4HA 5TP9B 3PPQA 4TQUQ 4ELQA 5DYHA 3FJ7A 1DTGA 4G68B 5I2NA 1URGA 1OQGA 4R9FA 1MDQA 5IKBA 4QFNA 4NF8A 1PB8A 1B7UA 3OENA 2HQ0A 3L6HA 3MP6A 3UGWA 1OMPA 4EXKA 4QHQA 4RPNA 1MS7A 1MXWA 1YCJA 3VLWA 3TMGA 2B3BA 4PFWA 1UIVA 4MLQA 2YLNA 4MBPA 3UA8A 3IB0A 4NF5A 1S50A 1BTJA 1B52A 1SW5A 4GVOA 3DLNA 3IO6A 1QW0A 4GOTA 4N13A 1DSNA 1II5A 3WAEA 4M4GA 5CMCA 1M5EA 2UXAA 1WDNA 4RPOA 2VD3A 5CRYA 1B5HA 1ZJLA 3OO8A 4BDQA 4FORA 4K3FA 2XXYA 3GZGA 1CB6A 3E4RA 4XKQA 4POWA 3B7DA 4EF1A 3LSLA 1Q1KA 2XX9A 3SEYA 1FTJA 2D3IA 4G2ZA 1JW1A 3T66A 4XIGQ 4RK2A 4M1VA 4NE4A 4MH5A 1A55A 1B40A 2F6PA 5H8NA 1IXIA 1MQJA 5AE4A 1JW5A 2Q9TA 3SERA 1FTLA 3HN0A 3FATA 3DELB 3RQTA 4UACA 1IZ1A 3WAFA 4WEPA 4ESXA 4R6HA 4QFPA 2VD2A 4WEDA 2ZYNA 2ZYMA 3ZS6A 4GQOA 2F78A 4RNSA 4JWXA 4F2QA 4EQ7A 4DE8A 3SEWA 2OBGA 3H6WA 3S9LC 1N7WA 4UA8A 5I2KA 4JDFA 4R2FA 1URSA 1Q35A 2I0CA 1Y4TA 1O7TA 3W9WA 1PDAA 3QYTA 1I69A 1Z7NE 2Y7IA 1ZTYA 3U94A 3V8XB 2E0SA 5TP9A 4OENA 1UTBA 3S9MC 4QSDA 5EYFA 1KWHA 3UP9A 2XXQA 2ZMBA 2H25A 2XXUA 4QFLA 2WKYA 4KR5A 4GL0A 3I3VA 4BLAA 4JWYA 3JV9A 2UYEA 3T9UA 4H1XA 3PGFA 4TLMB 2QMXA 1M5BA 1MPBA 1SDXA 2ALUA 2Z8FA 3IB2A 3MWBA 3PUXE 4ZEBA 1DPPA 1FQDA 3G3JA 1MQHA 4R72A 3UIFA 3TQWA 1QKAA 1ELJA 3TDJA 1VSOA 2V84A 2RC9A 2OWSA 3BFUA 4KYEA 4PFUA 1JEVA 3FVNA 4YKJA 1TXFA 2VGQA 4N6PA 3KOTA 1N3WA 3H6VA 1Y20A 4C0RA 1IXHA 1PBQA 1M5FA 5HBCA 2I6EA 2Q2CA 3GBAA 3OMBA 3MAMA 1IITA 2H9BA 4Q8RA 3FZVA 5AA2B 5CMBA 3D4CA 4KQPA 3VE1B 2Q89A 4KCDA 1R6ZA 2B3FA 3SEVA 4ZEKA 1USYE 3CIJA 2XX7A 2Q8JA 2IA4A 3IX1A 1BKAA 4DZ1A 5I58B 1XVYA 3HO7A 5FTIA 4R9GA 3VXBA 3ZSFA 1EZ9A 3SKPA 5K2YA 1R1NA 3IL1B 3CRBA 3IOWA 3O6GA 5JK4A 3C35A 4X48A 4RYAA 3BKIB 3CFZA 1YPNA 4POXA 2Y84A 2DWHA 1MY4A 3ZKKA 1XC1A 3R26A 1RKMA 4OQOA 2F97A 3EHUA 5L9SA 3QIMA 2GFEA 2DP8A 2NWJA 4KFQA 3MQ9A 1MQGA 4HTGA 4XKNA 4R2BA 2V3QA 2XXVA 1F9BA 3O29A 3TZAA 4DXUA 1PEBA 2OCUA 1FQAA 1Y4CA 2P2AA 2F7CA 1Y3PA 3CG1A 4IO4A 4IY5A 1B6HA 4U22A 1AIVA 4IO5A 1MPDA 5CI5A 4ZEFA 1N76A 2PVUA 3G3KA 4RXLA 3UORA 1FCKA 3MZBA 4OZ9A 5J1DA 3QUFA 3RN8A 3K4UA 3MVWA 5KZTA 4FIMA 3OO6A 2F34A 4DLDA 4EDPA 3FVKA 4GFRA 4H5GA 5B7DA 3Q25A 1S9TA 4G4PA 1QVSA 3KJTA 4JB7A 1Y3QA 3MP1A 3HV1A 3P7IA 1N84A 5AA2D 2QS3A 4OETA 3H7MA 4MLVA 5CMKA 2P0SA 2REGA 3PPOA 1MDP1 3TQLA 2O7IA 4KPTA 2QRYA 1B4ZA 4IB2A 2PX1A 1WODA 1GR2A 5K2XA 3SESA 4H8JA 2V25A 3B6TA 4KD5A 1NH8A 1QULA 1DMBA 3H6TA 1LBBA 3RT8A 3HPIA 1FTKA 1UIUA 4Q5TA 3KEIA 2OZZA 4XKPA 3CFLA 5FHMA 3VV5A 1JNFA 3HSTA 1VFEA 3PU5A 4ECFA 3QXMA 1P99A 3LSWA 1OLCA 1ZBMA 4PFYA 3EPEA 5DVJA 1OLAA 4OTEA 1ANFA 2DE4A 3F11A 4GF8A 3DP6A 4IY6A 4LZ7A 1FQBA 4Z7EA 3IORA 2GH9A 3VXCA 4ND9A 4AQ4A 4ELRA 1B51A 4ISUA 2YJPA 3FGSA 3RPWA 2DYXA 5AA2A 1B5JA 4ZZEA 2F35A 1B3FA 1LB8A 3IAZA 1SQYA 1JVXA 4G8NA 4ZZAA 3T9XB 1LCFA 2A5TB 3TTMA 2O84X 3OELA 2DVCA 3K00A 3PMVA 4GXAA 1H76A 1FTOA 5H8FB 1B9JA 2ZNUA 4YB6A 4DCXA 1DOTA 3THIA 4I1DA 2ESNA 4RA1A 3E13X 4LUBA 4ZS9A 2Y7WA 1IQ7A 3QUJA 4XXUA 4DXCA 3I5OA 2GHAA 1JETA 4GIZA 1SBPA 2ONRA 1FQFA 5KDTB 5ITPA 1NNKA 1POTA 3IOTA 4Q30B 1GV8A 1MQIA 1QUKA 1TWYA 1T0KA 3U72A 2I3WA 3U93A 1JQFA 3KGCA 3UK4A 1LCTA 3S9EA 3VLVA 1I6BA 1J1NA 4KYSA 1MRPA 1IEJA 1MY3A 1PB9A 4BDOA 2Y7KA 1SYHA 1Y9UA 3H4ZA 4ZEIA 1BP5A 3W9VA 4LA9A 4XKRA 1Y1ZA 3KG2A 2KLFA 5EHSA 2ANJA 5HPQA 3TTLA 3K0VA 2O51A 4HCWA 4PFTA 2DXYA 5L9MA 4Z0IA 1GTKA 4JXIA 2QS4A 1D9YA 1MY2A 2ABHA 2V3UA 3DP8A 3U92A 2PT2A 2HAVA 1HSLA 5ELVA 1M5DA 4YZZA 1MXXA 2R9JA 2OWTA 3MVYA 3N5LA 4E0XA 4PE5B 3TFLA 5I56A 1MY1A 2XX8A 2BJJX 4F3GA 4H67A 4YKKA 1N7XA 3T22A 5JTYB 2A5SA 3CR9A 3SDFA 1XS5A 1PC3A 4F29A 1H43A 3IB1A 2HFBA 1CE2A 1NFTA 2XD3A 1H44A 1YAEA 3OO9A 2Z22A 3IJXB 5BWJA 1MXVA 5CM6A 1A8EA 3A3CA 3K6VA 5L8DA 1B32A 2VHAA 3N26A 4HW8A 4X9TA 2R71A 3OO7A 2GRVA 3C32A 4QSCA 3SEXA 1XVXA 2A5TA 1B5IA 2RC8A 3S4UA 1P1OA 3MZ1A 3ODBA 5H8HB 3CSGA 4FAJA 1UQWA 5H8FA 2THIA 3FV1A 1IXGA 2HZKA 4G68A 1Z7ME 4JWOA 2O1MA 4OESA 5AA4B 4OEVA 4H6DA 4U23A 4R74A 2QS1A 3C4MA 4P11A 5DVIA 1MH4A 3MJNA 4NF6B 4HCYA 1AOVA 2OLBA 1FW0A 2QJEA 3O2AA 4IGRA 1ZU0A 1MXYA 3K6XA 4P0GA 1SW4A 2XXHA 4U1OA 1HSJA 3W15C 1EZPA 2RKMA 5FHOA 3TYHA 1NH7A 4F2OA 2O1LA 2H98A 5TPAB 3Q29A 1SI0A 3MVXA 1VR5A 1ZKBA 5TU0A 1MM6A 5I57B 3KJ7A 2CMOA 1QKBA 4JSOA 3LC8A 4F1VA 1MG1A 1HSEA 4OEUA 1RYXA 2I4BA 3C33A 3TCGA 3I6VA 2XXWA 3QK6A 4WKMA 1L5TA 4IO3A 2ONKE 3EQ1A 4G77A 2PYYA 3O6HA 1FTMA 3T96B 4PETA 3MPLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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