2R71A

Crystal structure of the complex of bovine c-lobe with inositol at 2.1a resolution
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal structure of the complex of bovine C-lobe with inositol at 2.1A resolution
rcsb
molecule tags Metal binding protein
total genus 114
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2007-09-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2r71A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2r71A02
1JNFA 2O6AA 3SERA 4O3BA 2XX7A 2O84X 1IIWA 4AB5A 5M2VA 4NF4B 4GD5A 3IAZA 5EHMA 3K6UA 2Y7PA 3PUZE 3SETA 5H8QB 2QJEA 3MQ9A 5FTHA 1MDQA 3L6GA 2E0SA 3TKDA 3ILUB 3SEYA 2REJA 4O3AA 3G3KA 4RY1A 1YCJA 5AA4A 2UVIA 4KCCA 1LFGA 2RKMA 3H6WA 1NNPA 1PBPA 3M3FA 1R9LA 5DT6A 4ELPA 4M4GA 1N84A 3EF7A 1FQBA 2H99A 1SBPA 1QVSA 2I0BA 2PMSA 4JB7A 3TDJA 3OMBA 3T9UA 1RKMA 3U94A 2F6GA 5CMBA 3MVZA 3Q29A 4Z0IA 3V8XB 3VXCA 1AH5A 4I8CA 5FHMA 2RC8A 1F9BA 3OXNA 1WDNA 3EQ1A 4BDRA 3HHFA 4R9GA 1Q1KA 3RNNA 4H0WA 1OIBA 2B3BA 3KOTA 4YZZA 3BKIB 1USYE 3MPLA 4XKNA 3QUFA 5ITPA 3MW0A 4WXJA 1XHYA 1SW2A 4KR5A 3IO6A 2Y7WA 4GRKA 3T93B 2GH9A 2PT2A 4E0XA 1B5JA 3C31A 1JVYA 1B05A 2YLNA 5AA2B 4ZS9A 4G8HA 2B3FA 4EF1A 4H5GA 4H8IA 4NMYA 2P2AA 3PPOA 3KJTA 3QXMA 4LA9A 1MPCA 3GBAA 4H67A 5DEXA 2X26A 3OO7A 2OJTA 3PPQA 3HCQA 4Q0CA 4R6YA 3M8UA 2H5YA 4F3SA 3MVWA 4YMAA 3CI8A 3FXRA 4H65A 2PBWA 3N94A 4FEDA 3KG2A 3TCHA 1M5DA 1B3GA 2AL5A 1OMPA 4R74A 4NF6B 4QFLA 4TLMB 4EQ7A 1UTBA 1DPEA 4LP2B 4TQUQ 4OTEA 3MP8A 2YJPA 4LZ8A 3FGSA 3K0VA 1ZU0A 4BDNA 4X1DA 2XXQA 3VDFA 1URSA 4ONYA 2QMXA 1FTJA 3SEVA 2O69A 2H9BA 3S4UA 4YKPA 3WAEA 5JTYB 2ZNUA 2QRYA 3B6TA 5L9MA 1PC3A 4GFRA 2ONRA 5CC2A 1CB6A 2FA7A 3RT6B 3L6HA 4IO6A 3VVFA 1P1QA 1Y20A 2P0SA 4IO7A 3MAMA 4ZEIA 2Q88A 1BIYA 1DMBA 4MFIA 5B70A 2W7YA 1YTVA 4MH5A 3GXAA 1B32A 1ZIUA 1URDA 1YAEA 1B5IA 1MY4A 3K6VA 4IGRA 4PFWA 1MDP1 2QS2A 3DM0A 3TQLA 4ZEBA 3O97A 4JWXA 1VR5A 2D3IA 2Z8DA 3S2VA 3N6TA 3QYTA 2XD2A 2ZYMA 1BLFA 1B40A 3M3KA 5BWJA 1QULA 1Y1MA 3RQTA 3UN6A 5ICQA 1TXFA 5CI5A 3T9VA 1B6HA 2D21A 4PP0A 2DP8A 1IITA 3HO7A 4EUOA 3TZAA 4YB5A 1ZBMA 4RYAA 4OVJA 4IO5A 1OQGA 2PT1A 1BKAA 2UVGA 3EHSA 1GV8A 4G8NA 2GHAA 2HAUA 2ESNA 3TTRA 1LB9A 4PFUA 2RCAA 1TWYA 5CMCA 1MS7A 3UA8A 3C33A 2ZXTA 5H8NA 5TP9B 4F2OA 5KCJA 2F7AA 1A54A 1B7ZA 4TLLB 2DQVA 3CFXA 4GWOA 4F1UA 4IY5A 2AL4A 1MM7A 3OEKA 1KWHA 2DWAA 3SKPA 2QPQA 4ZEKA 3K4UA 2Q9TA 1FTMA 3MJNA 2XXTA 2DE3A 5H8FB 1SI1A 4WEDA 4IB2A 3PUVE 1IZ1A 5I59B 3CSGA 4GXSB 3LBSA 1N7WA 4NF5B 3RTFB 2XXIA 1XC1A 3CVGA 3CSBA 3IOWA 5JK4A 5I57B 2DWJA 3K1NA 3HHGA 3H03A 1MY0A 3MVXA 3G3FA 4DXUA 3IR1A 1Z7ME 4MLQA 3H6VA 4I62A 3C34A 4FEBA 2ABHA 3T22A 4NF8B 3KFMA 5H8QA 4F3PA 2IA4A 3CFLA 5FHNA 1IXGA 3CRBA 4HTGA 1TFAA 3ECRA 2REGA 3O6GA 4QFOA 3G3HA 4XKRA 4OENA 1SI0A 4XIGQ 1OQHA 4KYSA 2RC7A 3FIRA 1FQFA 1H3DA 3N6UA 1MY2A 1MXWA 4IO2A 5CM6A 1MPBA 3C32A 1N3XA 4G77A 1H45A 5F1QA 3HV1A 4PE5B 2XXUA 4DDDA 4KHZE 4QSDA 5IAIA 2CMOA 4MBPA 2HZLA 4MF3A 4R73A 2P1SA 2HCAA 1MQJA 4NE4A 4OESA 1QKAA 3U72A 1MQHA 2XD3A 1RYOA 3Q27A 1B52A 1HSJA 1NNKA 4C1TA 3MZ1A 3H06B 4OFOA 4YKJA 1BTJA 4PETA 2F36A 4BDQA 3CG1A 3RLFE 4DZ1A 3B6WA 5CMKA 2V84A 3O2AA 2ONKE 4GOTA 3TYHA 1SVXB 1N04A 5AA2A 1MXUA 2VHAA 2OZZA 5AA3A 3M3LA 1B0HA 2PYYA 1B0LA 1SW5A 2H98A 1B7UA 2HXWA 3FV1A 2O51A 4QFPA 3PGFA 1P99A 2DVZA 4HCYA 4ESWA 3U93A 3SEXA 2Z8FA 4RNSA 2DS9A 3IJXB 1SDXA 1II5A 1IXCA 1IXIA 3RPWA 4RJZA 3C36A 1B1XA 2R9JA 4M1VA 2Q8JA 4POWA 5DVIA 2DXYA 3QK6A 3T9XB 5H8HB 3LSWA 5A5XA 1NFTA 3RT8A 1R9QA 4OFLA 2Z23A 3E9XA 3G3JA 1AMFA 3FJ7A 1B51A 2RC9A 3O28A 4ZE8A 4RXLA 4FECA 4MLVA 3CIJA 1LAHE 1MXYA 3G3IA 1IEJA 4LZ5A 3LUYA 1N0TA 4EDPA 1VE4A 2XX8A 4ND9A 3MBPA 1P1NA 3CFZA 4O3CA 3IK6B 2HEUA 4P0GA 1N76A 1A55A 5I2NB 4U1OA 2ZYKA 3D4CA 2GRVA 1WVJA 4FATA 3PD8A 1PB7A 4OZ9A 4ESXA 4N6PA 4QHQA 3UIFA 2VP1A 3IO4A 1T0KA 2DYXA 5I56B 3KSXA 1DOTA 2VD3A 2KLFA 1P1OA 1JW1A 3OENA 3KBRA 3T9HB 4OHNA 3OD7A 4H1XA 3DELB 4F18A 4AQ4A 1EU8A 4YB7A 2NOOA 2GFEA 2ONSA 1FTLA 3PMVA 4RK2A 4H6DA 1HSLA 3TCFA 4X1BA 3V5AA 3GZGA 2PVUA 1ZKBA 2F35A 4JXIA 2I3WA 1A99A 3A3CA 2NVUB 4F31B 5AA4B 3QSLA 1D9VA 5EYFA 1SQYA 4R2FA 3ZKLA 1R1NA 1B4ZA 3TCGA 3FJGA 3PPPA 1NNTA 5FTIA 1Q35A 4DCXA 1M5FA 3IOTA 4WKMA 3K01A 5I58A 3K00A 4ECFA 3RUMA 1H76A 2NUVA 3H6TA 1PDAA 3BFTA 4EQBA 4R6HA 5DTBA 3Q28A 1I6BA 3QUJA 3FD3A 3BFUA 5DVJA 3B6QA 2I3VA 4K3FA 2V3UA 3VVEA 4ELQA 3IORA 4YU0A 2A5TB 3LSFB 2V3QA 1Y3PA 2I48A 1XVYA 1MY1A 3VE1B 4ELRA 3IX1A 1H43A 5HPQA 3TTKA 4OQOA 5KDTA 1QJMA 4LONB 3UK4A 2FYIA 5H8FA 1M5BA 2G93A 2LAOA 1EZOA 3EPEA 2B65A 4GIZA 1B3FA 2ZMBA 1TT1A 3OSRA 3KZGA 4NF5A 2NXOA 3KN7A 3G7WA 4G2ZA 3VV5A 1UTHA 1FQAA 2I0CA 1MH4A 5K2YA 1QKBA 1QUJA 3THIA 2F6PA 3FASA 1FQEA 3K6WA 5ICTA 2Q2CA 1I6AA 1NH8A 1LCFA 4KD5A 1R6ZA 4ISUA 3FUZA 1D3KA 2F7BA 3PPRA 4NF8A 1I69A 3N26A 4QFNA 1JW5A 4G4PA 2QSXA 1D4NA 4JWOA 4OEUA 2WKYA 4UACA 3VLUA 1NMUA 3I6VA 3KSJA 1IXHA 1I6QA 3AXFA 2OCUA 3T96B 4FJPA 4YMBA 3FVGA 4F1VA 5CBSA 3W9WA 2PX1A 2R6GE 2QS4A 1EZ9A 4YKIA 1OLCA 1FTKA 2I49A 4ZDMA 4DXCA 1O64A 2I58A 5ISUA 4ZZAA 3VVDA 2O7IA 1MM6A 2Y84A 3PU5A 2G29A 5TPAB 3TTNA 3K1PA 4U22A 3FXUA 4FIMA 1USYH 4FE8A 3H6UA 1Y3NA 4THIA 1Y4TA 3IOVA 1QW0A 3E3KA 1H44A 5J1DA 3SESA 1NNFA 4GQOA 4UA8A 1ZJLA 1ELJA 3DLNA 4NWDA 1MQGA 3DP4A 5TU0A 2VD2A 1IQ7A 2XXYA 4LQ5A 4JSDA 3FATA 4C0RA 2HQ0A 1P1UA 1A7LA 3TFLA 3TTLA 4DLDA 4OYVA 1PB8A 2Y7RA 3PMXA 1B1HA 2XXHA 3T66A 4NF4A 4GXAA 1LCTA 2OBGA 4C1UA 1MXVA 1B3LA 4YB6A 4EXLA 3H4ZA 5HM4B 4U1ZA 3FZVA 3EHUA 1PBQA 2O7UA 2O68A 2XXRA 1XOCA 3U92A 4DCYA 2RINA 3FJMA 3FVNA 3QAXA 1GVCA 3DP8A 3BBRA 2THIA 4ZZEA 1SD3A 1XVXA 1GTKA 2DOJA 4DXBA 5H8HA 3HPIA 4RK9A 5IKBA 5L9OA 4TOZA 4DIGA 4R6KA 4I9DA 2H25A 2NWJA 3TPAA 1S7YA 2F7CA 3C4MA 1J1NA 4FORA 5JEIA 2AIXA 1SW4A 4YICA 4LVQA 4L17A 1JVXA 4U23A 3I5OA 4R9FA 1N7XA 2F5XA 3GBBA 3DP6A 2UVJA 4OWDA 2V3TA 1S50A 1NH7A 5K2XA 3VLVA 1DTGA 4JBZA 4HCWA 3ONMA 4HW8A 1S9TA 3Q25A 4RPOA 3VLWA 3A09A 1M5CA 2V25A 4G68B 3IL1B 5I56A 1A8EA 5DYHA 2X7PA 1OVTA 4PQJA 2XXXA 4U4XA 3JYRA 2OWSA 3UORA 2DVCA 4NTLA 2E1SA 3PUYE 4P11A 4OETA 2ZYNA 4R2BA 4H5FA 2QS1A 4F19A 3V83A 1MQIA 3KEIA 3R7XA 5BUUA 4OMBA 1A40A 3OO9A 3K02A 1FCKA 5DVFA 1OVBA 3S9EA 4KFQA 4QF9A 1B4HA 1P1WA 1VSOA 3TEPA 2OLBA 3O66A 4NF6A 1JW4A 3PMWA 3VXBA 3OO6A 1BP5A 2F97A 2A5SA 5AA1A 4I1DA 1MY3A 1Y4CA 3IB1A 3RGYA 2XXVA 3RTWB 4X9TA 3E4RA 3RY3A 2I4BA 5I84A 3R26A 2RF1A 2QL3A 1ZLQA 1LB8A 3ZKKA 1PEBA 4BLAA 3N5LA 1PB9A 2BJJX 1FQDA 3E13X 5L8DA 1DPPA 1POTA 1ZMGA 5JTYA 4EF2A 2I4CA 1UQWA 4KCDA 1GGGA 5FHOA 2F34A 1FW0A 4ZEFA 1CE2A 2FNCA 5HBCA 5CBRA 3K6XA 5I2KB 1TFDA 2UYEA 2M8CA 5KZTA 1MXZA 2A5TA 1OLAA 3W9VA 2VGQA 4GL8A 3ODBA 1XT8A 2AYSA 3ILTB 5CRYA 2XX9A 1ATGA 3RN8A 1VFEA 3SEWA 4OFJA 4QFKA 1QUIA 4G68C 4E0WA 2QS3A 1VFDA 3CR9A 4DE8A 3B7DA 3MWBA 3FVOA 3SEUA 4WEPA 4YAHX 5CMMA 2DWIA 3PUWE 4IO3A 1B9JA 5ELVA 4NWCA 2OK2A 1O63A 2DWHA 3TAJA 3CG3A 4N07A 4N13A 4X48A 4XKQA 1JETA 2Q2AA 3FVKA 1ZTYA 4JWYA 2XXPA 4BDOA 5A5XB 4LUBA 4P0IA 1EH3A 3S9NC 1MXXA 4AB6A 1AL3A 4F22A 2Q89A 3TMGA 3LSLA 4NEDA 4OXVA 5EHSA 2XHDA 1D9YA 1FTOA 3MZBA 2YPNA 1YPNA 5TP9A 1L5TA 4QSCA 3KN3A 1XS5A 3V89B 5TPAA 4EXKA 3EN3A 2DE2A 3U1OA 4F3GA 3KJ7A 2X7QA 3PD9A 1N3WA 3H7MA 3UGWA 1UIVA 4JDFA 1LBCA 1JQFA 3MPKA 4GLIA 3K1MA 3S9MC 2DE4A 4HS7A 2IEEA 3OO8A 2OWTA 3OELA 5I59A 3OSQA 3S9LC 3LSXA 3EHTA 3LR1A 3A3UA 2I6EA 4OEVA 4F29A 1MQDA 2ZYOA 3MP6A 5DEXB 5I57A 3C35A 1SW1A 4BDMA 3O6IA 2UXAA 1LAGE 3TODA 3GLBA 4LZ7A 1MPDA 3TTMA 3FV2A 4FAJA 1AOVA 4EQ9A 5B7DA 3D4GA 3TUSA 1SYIA 3MVYA 3O29A 3VFJA 4KPTA 4F39A 4IY6A 2V93A 1RYXA 4RPNA 1JEUA 1UTBB 1FQCA 2DSFA 3MC2A 2UYFA 1LBBA 4Q30B 1MRPA 1MH3A 3USDA 3I3VA 2QMWA 4R72A 4YKKA 4KI0E 3P7IA 5I58B 3UP9A 3TELA 1JEVA 3F11A 1POY1 3PPNA 3PUXE 4Q5TA 2ANJA 1LAXA 3H3GA 4JSOA 4PFTA 3KGCA 3ZS6A 3IJOB 4ZECA 2CZLA 3IB0A 3HSTA 2DXRA 4R75A 4F2QA 2O1MA 4G8MA 4KYDA 1B7HA 4GVOA 1GR2A 4GL0A 3HN0A 2D5WA 5KDTB 1UIUA 3ZSFA 3OEMA 3SDFA 2XXWA 1MG1A 5LOMA 4BDLA 1Y3QA 1LFIA 1AIVA 4F3BA 4ZE9A 3W15C 2Y7KA 2ZNTA 1US5A 2F78A 3U8QA 5AA2D 3MUQA 4POXA 4G68A 1UTHB 2H4IA 2RCBA 4U21A 5ITOA 2ALUA 3JV9A 4U4SA 3QIMA 1EZPA 1NKXA 4OERA 1URGA 1QUKA 1Y1ZA 4ZEDA 1LSTA 4RA1A 2F8DA 1LFHA 4Q8RA 2ZNSA 1A8FA 3FXQA 1NL5A 1B2HA 2UVHA 4U2RA 3KOSA 4KYEA 3WAFA 1O7TA 1B3EA 3K2DA 4XXUA 3R6UA 1ANFA 4XKPA 5L9SA 4XTCQ 4QRZA 3O6HA 3Q26A 3PV0E 1B46A 4Z7EA 3G3GA 3KN8A 5H8NB 3TQWA 1HSEA 5KCJB 1LGBC 1IUDA 3JZJA 1LAFE 2HFBA 3IB2A 1Z7NE 4IO4A 4IGTA 3LC8A 4LQ2A 1B58A 2VOZA 2HAVA 2GHBA 5AE4A 1US4A 1DSNA 2R71A 3O9PA 4KQPA 5F7VA 1B5HA 2Y7IA 3C9HA 4F1YA 2O1LA 3MP1A 1LLSA 4PFYA 5I2NA 1DTZA 4QSEA 1Y9UA 4GF8A 4H8JA 5I2KA 2Z22A 1M5EA 1B3HA 2HZKA 3IOUA 5H8SA 3MZ9A 1WODA 1SYHA 4ELOA 3OOAA 2Z8EA 4LATA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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