3LSXA

Piracetam bound to the ligand binding domain of glua3
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
RTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGTPVNLAVLKLSEQGILDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords GluA3 S1S2 domain
publication title Piracetam Defines a New Binding Site for Allosteric Modulators of alpha-Amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazole-propionic Acid (AMPA) Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 85
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-02-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lsxA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lsxA02
3K6XA 1AMFA 1JEVA 3KJ7A 3WAEA 3TTRA 2ESNA 3BKIB 4NTLA 2Q9TA 2H25A 4NMYA 1IITA 4LZ5A 2P2AA 5I57B 3O9PA 2Z8EA 4EQBA 3TTMA 4MBPA 4ZEFA 1IIWA 1QW0A 2UVHA 3FUZA 1B2HA 3SEWA 1GGGA 4F3SA 3K01A 5I2NB 1IXCA 3PMWA 4KPTA 3CSBA 5I57A 3S9MC 3KN7A 2E1SA 1S50A 1M5CA 5I2NA 2HQ0A 1MXVA 1Z7NE 1UIVA 2AL5A 3SEYA 2I3VA 4ZZEA 3TAJA 3T66A 2RCAA 1OLAA 1SW5A 4LATA 3N94A 1WDNA 3IO6A 4KI0E 4QSCA 1DPPA 2DWAA 3KSJA 5AE4A 1B5IA 1IXIA 2VGQA 4F1VA 2DOJA 1QJMA 2XXYA 1MQJA 1B0HA 4IO3A 1B3HA 4GL0A 5L9SA 1VR5A 1LAFE 3QYTA 5CI5A 1EZ9A 2VOZA 2UYEA 4YKJA 3RTWB 1JVXA 4OYVA 5FHOA 4R9FA 2B3FA 3H7MA 4BDMA 1RKMA 2DWJA 4YU0A 4EXKA 4PETA 3LBSA 2QRYA 2VP1A 4RJZA 3RNNA 3USDA 2Q89A 2DVZA 4KCCA 4X1BA 3FVKA 4F1UA 2YJPA 4OFJA 3BBRA 3K6WA 4PFUA 3FASA 2F6PA 2HZLA 3DP4A 1LGBC 1FW0A 5AA2B 2Y84A 3G3JA 2RF1A 3C4MA 4ELRA 3DLNA 4U22A 3H6VA 3C31A 2HAVA 3PU5A 1F9BA 3LR1A 1B4HA 5AA2A 4PFWA 2XD3A 4DCXA 2R71A 4AB5A 1BKAA 3FATA 4BDOA 3GLBA 4XTCQ 3LSXA 1IEJA 1NH7A 2XX9A 1LBCA 2IEEA 4IY6A 3SKPA 2H99A 2PT2A 4WKMA 1VE4A 3TDJA 1ZIUA 4GQOA 1YCJA 4YB6A 3UIFA 5CMKA 3G3IA 1A7LA 3D4GA 3RN8A 1LFIA 2G29A 3RT6B 1P1UA 1IXHA 1ATGA 2Y7WA 4WXJA 3KGCA 5ELVA 3RY3A 3L6HA 3K1NA 3V8XB 1AIVA 3EHUA 4EQ9A 5A5XB 2ONKE 1MH3A 3C9HA 1MPDA 1SI1A 1SBPA 5DT6A 1H45A 1B3LA 2D5WA 1SI0A 3RPWA 1FTJA 4K3FA 2F35A 3P7IA 1Q1KA 1A55A 5A5XA 2PT1A 1D4NA 1QVSA 4OFLA 1BIYA 4MF3A 2OWSA 2DE2A 3KN8A 1VFEA 4QHQA 2F97A 3KJTA 5BWJA 1R9LA 1Y20A 3MVXA 2Y7RA 4IO6A 3KOTA 3TTLA 4U2RA 5JK4A 4BDLA 5ICQA 3ZSFA 1BP5A 4DXCA 1LBBA 3T96B 1CB6A 2VD2A 4N07A 3BFTA 1DPEA 1JW4A 4I62A 2NOOA 3E4RA 4F1YA 3JYRA 5CMCA 3H3GA 3TELA 3VVDA 3FGSA 2RKMA 5F7VA 2HXWA 3LC8A 3FXUA 3CG1A 1J1NA 3HPIA 5CBRA 2I0BA 2O84X 1PB9A 1SW1A 4F18A 1FQCA 4F3PA 1B0LA 4POXA 2I48A 3F11A 4RNSA 3E3KA 5I58B 1MPBA 2V3TA 1EZPA 2QMXA 4DE8A 4GLIA 1VSOA 1II5A 1URGA 4F2OA 1JVYA 4I1DA 3IORA 3FXRA 5I58A 1N3XA 4Z0IA 2DE4A 3UN6A 2H5YA 4L17A 4FORA 5CBSA 3CFZA 1A8EA 3TEPA 4KFQA 1P1WA 2RC7A 4O3BA 2F8DA 1NNTA 3MW0A 3CSGA 3CVGA 1T0KA 3JZJA 3TUSA 3KZGA 3VVFA 3MC2A 1LB9A 2HAUA 2ZYKA 3SESA 5ITPA 4GRKA 1MDP1 4QSEA 4ESWA 2Q88A 5EHMA 3VDFA 3W9WA 1FQAA 3VE1B 4QFPA 3PPPA 3R6UA 1US4A 3CIJA 2XXRA 2B65A 2XXWA 1NFTA 4G68C 1Y3PA 3OEMA 2R9JA 4QSDA 2XXPA 1QUIA 2QS1A 4DZ1A 3OELA 5M2VA 1H3DA 2B3BA 2ANJA 3TCFA 5AA4A 3CRBA 4IO2A 4RA1A 2I4BA 1XC1A 1B32A 3U1OA 4PFTA 2YLNA 3U72A 5K2YA 3OO8A 2PX1A 1XHYA 1I69A 1QKBA 1DMBA 2DS9A 3C32A 5ITOA 4DIGA 1DTGA 4OQOA 2V3UA 3OSQA 3RUMA 3O6GA 3G3KA 1QULA 3KBRA 2QL3A 3I6VA 4C1UA 5DYHA 4YKPA 4EUOA 4JSDA 4PFYA 5DEXA 1TWYA 4E0WA 5KDTB 3BFUA 3K1MA 5CMBA 4R75A 2QMWA 4IGTA 5F1QA 3A09A 5AA2D 3T9VA 4YAHX 4RPNA 4OTEA 1I6BA 3E13X 5B7DA 2F36A 5KDTA 4OERA 4QFNA 3MVZA 5FHMA 3EPEA 1FQEA 1B4ZA 3EHSA 4YMBA 3OO7A 4U4SA 4ELOA 1N0TA 3RT8A 2O7UA 3JV9A 1OVTA 1ZJLA 4XIGQ 3KEIA 1USYE 3MZ9A 3PUWE 4ZECA 3PMXA 2G93A 3EF7A 4YB5A 5KCJB 1B5JA 2VD3A 2DVCA 4OENA 1MQHA 2F5XA 4QFOA 4JSOA 4RK2A 4BDRA 1MPCA 3MJNA 2I49A 1DTZA 3SEXA 5KCJA 5CC2A 3ODBA 1PBPA 4WEPA 4ESXA 1IZ1A 1GTKA 1A40A 4YKIA 3WAFA 2RCBA 5HM4B 2DP8A 4H67A 3U93A 1Y9UA 4FATA 2X26A 1OMPA 3K4UA 3H6WA 1H44A 1MXYA 1DSNA 3TODA 3SERA 1JNFA 5EHSA 2YPNA 4ONYA 4XKRA 4EXLA 1PDAA 1Y3NA 3M8UA 1B1XA 3IL1B 4HCYA 1QUKA 2QS4A 3D4CA 1VFDA 1I6AA 2DQVA 2IA4A 4LZ7A 3MVYA 2QPQA 3HV1A 1NH8A 5IKBA 5H8QB 3UP9A 1XVXA 3CFXA 4GXAA 3KFMA 5DVJA 3MWBA 1JW1A 4OZ9A 1MDQA 1HSJA 1BLFA 1LB8A 1TFDA 3S9EA 4I8CA 3DP6A 3PPNA 2CMOA 1MY4A 1NKXA 3RTFB 5H8QA 3O29A 2O7IA 2UVIA 4GIZA 2ZYMA 3MZBA 1N7XA 3DP8A 5H8HB 3MP6A 2THIA 2I6EA 1B58A 2A5TB 2F6GA 4Z7EA 3GZGA 2O1MA 3TQLA 1GVCA 1M5BA 1MXUA 5H8SA 3FVNA 1P1OA 3Q25A 1LSTA 5I84A 1N76A 4FAJA 3EQ1A 4UACA 4H6DA 4G4PA 1MY0A 5I56B 4F2QA 3MQ9A 4H8IA 1B3FA 4NE4A 3HSTA 4GF8A 3K02A 4KR5A 5I56A 2CZLA 3OXNA 1FTMA 4LP2B 4NEDA 2RINA 2XD2A 4FECA 2XHDA 4H5FA 4XKQA 4FE8A 2DSFA 4AB6A 2F78A 2ZXTA 4IO4A 2A5SA 4P0GA 1O7TA 1N7WA 5ICTA 3O6IA 1P1NA 1XT8A 3EHTA 4C0RA 4NF4B 1B3GA 4BLAA 4NWCA 3GBBA 4U21A 3FZVA 3PD8A 1EZOA 1LCTA 1PB7A 2PYYA 2ZNTA 1NNFA 1KWHA 4IB2A 4LZ8A 4NF4A 4MLQA 3S9LC 4LVQA 1FQFA 3I3VA 3MAMA 2M8CA 5LOMA 5TPAB 1GR2A 3VVEA 2PVUA 3CR9A 3L6GA 2NWJA 2OBGA 1MY2A 1SD3A 2Y7KA 4HCWA 5TPAA 2GHAA 3FJMA 2GHBA 1R1NA 3FVGA 4OWDA 4U23A 5DVFA 4OXVA 3ZS6A 3IOUA 2Q8JA 4DXBA 4YMAA 2NVUB 3TFLA 1Y4CA 3M3LA 1UTBB 2R6GE 3C33A 1IQ7A 3VXBA 4ZEBA 3U94A 1MQGA 1UIUA 1EH3A 3IB0A 3IAZA 1Q35A 1UTBA 4ZEKA 1B52A 1I6QA 3LSFB 1POTA 1FCKA 1MM6A 3C36A 3R26A 1MXXA 3Q28A 1S7YA 2ZYNA 4R74A 4LQ5A 3O2AA 1MH4A 2Y7IA 3IOTA 1N04A 2NUVA 4R6HA 3IJXB 1B1HA 3T9UA 4U1ZA 4GD5A 3T93B 2W7YA 5I2KB 1ZLQA 5DVIA 4JWYA 2ZNUA 1LFHA 4HTGA 4XXUA 1ZKBA 3RQTA 3THIA 2F7AA 4U1OA 4N6PA 3SEVA 5CMMA 3IK6B 1P1QA 1XS5A 2V93A 1FQDA 4KCDA 2H98A 4NF6B 3TYHA 2Q2AA 1MS7A 4FEDA 2ZNSA 4FEBA 2QS3A 1MY1A 4NF5B 4TQUQ 4JXIA 2LAOA 1ZTYA 2Z8DA 1OLCA 4ZEIA 3TCHA 2HCAA 4NF6A 3A3UA 2PMSA 3UA8A 2ZMBA 4GL8A 4NF5A 1MG1A 2O69A 4TOZA 2V3QA 4JWOA 3TMGA 3ZKKA 2AIXA 3A3CA 2ALUA 3MPKA 3H6UA 1XOCA 1URSA 1BTJA 4OEUA 4ECFA 1MQDA 4POWA 4R73A 3MP8A 3M3KA 1FQBA 1TT1A 2Z22A 3PMVA 2ABHA 4R72A 4GOTA 1M5EA 2OLBA 4YZZA 4EF2A 4F19A 1YPNA 4IY5A 3G3GA 4F29A 1O63A 2HFBA 4RYAA 1JW5A 1NL5A 1USYH 2XXVA 1B6HA 4EQ7A 1OQHA 4QFKA 4X9TA 1ELJA 1TFAA 4ZDMA 3VLUA 1AL3A 1MY3A 1MRPA 5L9MA 4FIMA 4GFRA 1B51A 3QUFA 3KN3A 3FJGA 5TU0A 3B7DA 3PUXE 4F39A 4MFIA 1H43A 2VHAA 3C34A 5H8NB 2RC8A 4PQJA 2REGA 4P0IA 5KZTA 4G8HA 2FYIA 1Y1ZA 1Y1MA 3ZKLA 5CRYA 3PUYE 3QK6A 4DDDA 5H8NA 4ZEDA 3FV1A 4Q0CA 4O3AA 2OJTA 3QUJA 4GVOA 2XXQA 1ZBMA 1S9TA 1D9VA 3AXFA 5H8FB 4G68B 2KLFA 1CE2A 3U8QA 1SQYA 3OO9A 4Q5TA 5TP9B 3VV5A 2O1LA 4Q8RA 1B05A 1B5HA 5H8FA 4QRZA 3ONMA 4G68A 1HSLA 3N5LA 2BJJX 4ZZAA 1SVXB 2OK2A 5TP9A 3FD3A 4EF1A 1A8FA 3N6TA 1GV8A 3OO6A 4QFLA 3UGWA 4OEVA 3Q29A 1TXFA 4RY1A 1OQGA 4LQ2A 5I59B 3PPOA 2GRVA 4P11A 1M5FA 1LAHE 3G3FA 4KYSA 5B70A 4KQPA 1A99A 3HHFA 4YICA 1ZMGA 3CG3A 5AA3A 2I4CA 1D9YA 5I59A 1B3EA 2F7BA 4OFOA 3K0VA 1WODA 3S2VA 3SDFA 1POY1 4JWXA 4PE5B 3T22A 3FV2A 3TKDA 4YB7A 3DM0A 2V25A 4ND9A 4FJPA 4H1XA 3MP1A 4F31B 3PGFA 4H0WA 1NMUA 3IB2A 3O6HA 1LAGE 4KYEA 1MXWA 3KOSA 1R9QA 4U4XA 4G77A 4MLVA 1LLSA 3B6QA 3VXCA 1PC3A 2Q2CA 1AH5A 3IOWA 4X1DA 2P0SA 3ECRA 5H8HA 3FVOA 5JTYB 3S4UA 2X7QA 2H4IA 4EDPA 3HO7A 5IAIA 1OIBA 4R2BA 2A5TA 1URDA 2XXIA 4X48A 3C35A 3MVWA 1UQWA 4G8NA 1IUDA 5JTYA 3KG2A 1Y4TA 4HW8A 4JB7A 3VFJA 3B6TA 4OHNA 2QSXA 4C1TA 2XX8A 5J1DA 4NWDA 3I5OA 1LFGA 1QUJA 3IR1A 5EYFA 1SYHA 2OWTA 4F3BA 2FA7A 1QKAA 1RYXA 1SW2A 4KHZE 4RK9A 5L8DA 1L5TA 4ISUA 2X7PA 2UYFA 3T9HB 4RPOA 4DXUA 2XXTA 3QSLA 2REJA 4OVJA 1H76A 3U92A 2O68A 2I3WA 5DTBA 3TTNA 3CFLA 5FTIA 4TLMB 5AA1A 5K2XA 5HPQA 2QJEA 4R6KA 1MXZA 1XVYA 2OCUA 3HCQA 2AL4A 3ILUB 3N6UA 3O97A 3V83A 3PD9A 2UXAA 3FIRA 1PB8A 5BUUA 1FTKA 2D3IA 3OENA 2XXXA 3TTKA 2Z8FA 2E0SA 2GH9A 4H8JA 2RC9A 3G3HA 4R2FA 3H03A 4LONB 4XKNA 3SETA 3OD7A 2F7CA 2DWIA 4UA8A 2DXRA 1O64A 1R6ZA 3VLVA 4H65A 1EU8A 3IO4A 3IX1A 1JQFA 4OMBA 4BDNA 1B7HA 4R6YA 2WKYA 3PV0E 1PBQA 1US5A 1AOVA 3PUVE 2PBWA 4ZE9A 2P1SA 1Z7ME 5FHNA 2I0CA 1B9JA 4ELPA 3W15C 2HEUA 4LUBA 1HSEA 4I9DA 4E0XA 3Q27A 5L9OA 1Y3QA 4DLDA 3EN3A 3KSXA 3FXQA 2O6AA 1MM7A 2XXHA 4ZS9A 5JEIA 5FTHA 3V89B 4O3CA 1N3WA 4Q30B 3K6VA 3UK4A 3IB1A 2F34A 3K00A 2I58A 2QS2A 4IO5A 3K6UA 4OESA 4G8MA 3T9XB 2GFEA 2DXYA 5I2KA 3MBPA 1FTOA 1UTHB 4H5GA 3B6WA 4DCYA 3OSRA 4JDFA 3V5AA 1M5DA 4N13A 1UTHA 3N26A 4OETA 3LSLA 3HHGA 3CI8A 2ONSA 4F3GA 3MPLA 4KD5A 1DOTA 3GXAA 2HZKA 5CM6A 3PUZE 3M3FA 1OVBA 3PPRA 1JEUA 2FNCA 3H06B 4YKKA 3LSWA 3TZAA 1B7ZA 4KYDA 4BDQA 4LA9A 3RLFE 2ONRA 4JBZA 4GWOA 4TLLB 4R9GA 3PPQA 4XKPA 3E9XA 5AA4B 3DELB 3S9NC 3O66A 1JETA 1RYOA 2ZYOA 3TPAA 3IJOB 4F22A 1LCFA 1FTLA 3LUYA 2XXUA 2Y7PA 1A54A 1ZU0A 3GBAA 4WEDA 3TCGA 2D21A 3QIMA 3QAXA 1NNKA 3SEUA 3FJ7A 3H4ZA 3G7WA 2UVGA 1MQIA 2DWHA 5DEXB 4HS7A 1YTVA 1P99A 3MZ1A 2O51A 5HBCA 5ISUA 2Z23A 3K2DA 3OEKA 4NF8B 3Q26A 3TQWA 1ANFA 1SW4A 1B40A 2NXOA 1IXGA 4IGRA 3OMBA 3K1PA 1D3KA 1WVJA 3H6TA 2AYSA 4NF8A 4IO7A 1YAEA 3HN0A 1SYIA 2UVJA 2DYXA 4MH5A 4AQ4A 3OOAA 4QF9A 4M4GA 4G2ZA 3O28A 1B7UA 3RGYA 2XX7A 3MUQA 3QXMA 1PEBA 4THIA 4ELQA 3ILTB 1SDXA 3R7XA 4GXSB 3IOVA 2V84A 4M1VA 2OZZA 1N84A 1LAXA 3W9VA 4ZE8A 4PP0A 1B46A 2DE3A 1NNPA 4RXLA 3UORA 3VLWA 2H9BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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