3LSXA

Piracetam bound to the ligand binding domain of glua3
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
RTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGTPVNLAVLKLSEQGILDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Piracetam Defines a New Binding Site for Allosteric Modulators of alpha-Amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazole-propionic Acid (AMPA) Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
molecule keywords GluA3 S1S2 domain
total genus 85
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-02-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lsxA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lsxA02
3IB1A 1ZMGA 1MQJA 4IY5A 1QKBA 1SI1A 4MBPA 1FQCA 2H9BA 1N84A 3O29A 4ELOA 4F3BA 4F31B 1RYOA 3EHUA 4GXAA 4FORA 3MZ1A 1A99A 1NH7A 4R75A 5TPAB 2I4BA 4GWOA 3OELA 2M8CA 1N7XA 2ZXTA 3FJ7A 1GVCA 3VV5A 3FXUA 1JQFA 2Q2CA 5A5XB 5CBRA 3TODA 2QS2A 1Y3QA 4F19A 3IB0A 3JYRA 1B9JA 4LUBA 4Z7EA 4QF9A 4TQUQ 4NF6A 2I0CA 3TCGA 3SEXA 1IXCA 1USYE 4ZEDA 1II5A 1B3FA 4G8HA 3RN8A 1SW5A 1POTA 1SW2A 4U21A 2F6GA 3V8XB 1JVXA 4IB2A 5DEXB 1GGGA 1SVXB 1Y1ZA 1ZTYA 4P0GA 1Q35A 2D3IA 2RKMA 2PT2A 2Q8JA 3I3VA 3LBSA 5FTHA 4F1UA 2F5XA 5AA2B 5I56A 2O1MA 1PB7A 3DELB 3HCQA 3T96B 3V5AA 1M5CA 4NF6B 3N26A 2G93A 1FTJA 4G77A 1JNFA 3C32A 3W9VA 3CI8A 2ANJA 1YTVA 1QJMA 2X26A 2HZKA 3UGWA 4BDNA 4NF5A 4RPOA 3C31A 4RY1A 3KG2A 4E0WA 2XD3A 3O28A 2GH9A 1MXVA 3PMVA 4YB5A 1URSA 2PYYA 4BDOA 1FTLA 1P99A 3UIFA 2ZYNA 3GXAA 3SEYA 3TEPA 4NTLA 3TMGA 3TPAA 3DLNA 4OMBA 4DCYA 3K02A 2DWJA 2B3BA 5ISUA 2AIXA 1JEVA 1LFIA 2H25A 2NUVA 2UYEA 3H03A 3HN0A 4GOTA 3TTRA 4EQBA 1RKMA 3E9XA 4YAHX 5I57B 1MQHA 3RT6B 4NF5B 2X7QA 5JEIA 2WKYA 2Q88A 1SBPA 2XD2A 1MQDA 1UTBA 3CFZA 3O2AA 4GRKA 1PEBA 3IL1B 4R72A 1JEUA 3Q27A 3LSLA 3H7MA 2V84A 5FHNA 1FQEA 3RGYA 1IUDA 3QAXA 4XIGQ 5EYFA 2V25A 4EF2A 4QFOA 3T9VA 3TDJA 3LSXA 4PE5B 5K2XA 3D4GA 3I6VA 3QYTA 3ZS6A 4DXCA 2RC7A 2A5TA 5DYHA 1Y9UA 4M4GA 1RYXA 1LAHE 4H5FA 5H8NB 1IXIA 3V83A 3Q25A 5CMBA 1P1QA 2F36A 1ZBMA 2B65A 4PFYA 3MBPA 4GF8A 2DVZA 3TTLA 4L17A 3SEVA 1B05A 2XHDA 3HO7A 1DPPA 2Y7RA 3MVZA 4X48A 1S9TA 1OVTA 4EUOA 2B3FA 1B7UA 2FA7A 4PFTA 4ZEKA 4OEVA 3S4UA 3F11A 2DOJA 2UVIA 1PB9A 3EF7A 1MQGA 1NL5A 4WKMA 3KBRA 3G3KA 3WAEA 5L8DA 3FV2A 3OEKA 4LA9A 1WODA 4R2BA 4PP0A 3IX1A 1HSJA 2OWSA 3HHGA 1N3XA 3PD9A 2I49A 3QUFA 4JSOA 1MXZA 4FJPA 4GLIA 3CFLA 3G3IA 4JWXA 4QRZA 3B6WA 2ONRA 3A3CA 1ZLQA 3UA8A 2P2AA 4XXUA 3BFTA 5TP9B 3A3UA 1XT8A 3H3GA 4AB5A 4F1VA 1UIVA 1MH3A 5AA1A 4MFIA 4OESA 3SEWA 4GQOA 3ZKLA 1Y1MA 2QRYA 3M3FA 3QXMA 1IQ7A 1OLAA 1OVBA 2XXIA 2GHBA 2Q89A 2DQVA 1MS7A 3O6HA 1P1NA 4TOZA 4FE8A 1Z7ME 2YPNA 4EDPA 4OFJA 1UQWA 2F97A 2QMWA 3DP4A 1LLSA 3K4UA 4NF4A 1BP5A 3MJNA 3KN3A 5I59B 5AA3A 4NE4A 4I62A 1SYIA 2CMOA 1B1HA 1I6QA 3CIJA 3A09A 1B3LA 2HEUA 5HBCA 5H8FB 4K3FA 4BDLA 4JDFA 4F22A 3O9PA 5KDTB 1S50A 2F7CA 1NMUA 3TTNA 3QUJA 1LCTA 2GHAA 3TTKA 4GL0A 3CSBA 3B6QA 4H5GA 1P1UA 1XOCA 1QVSA 2ZNSA 4GD5A 4MF3A 4DZ1A 5I56B 4R9GA 5I2NA 1B52A 3CFXA 3USDA 1QKAA 3H4ZA 4R2FA 1BKAA 1OMPA 3ZSFA 3IOVA 1O63A 3L6HA 1WDNA 3MAMA 2Z22A 5DVJA 2O84X 3VLVA 4Q8RA 1MPBA 1B0HA 3SERA 1ZIUA 5CM6A 2GFEA 3P7IA 4JBZA 2RC8A 2XXPA 3TYHA 1MDP1 2NXOA 3FJGA 1B3HA 1N7WA 2O1LA 1ZU0A 1CB6A 3PMWA 4ZE8A 3TAJA 2DXYA 4POXA 3RTWB 3PV0E 4E0XA 1QUKA 5ICTA 5JK4A 1MH4A 1P1WA 3FXQA 2OBGA 1NFTA 2Y7KA 1MDQA 1MY3A 1MY0A 3DM0A 4ZZEA 1QUIA 2NOOA 3VLUA 3BKIB 2E0SA 2VGQA 5KCJB 3OXNA 1TFAA 1A40A 4QSDA 4TLMB 5ITPA 4GFRA 4R6HA 5H8QB 1D9YA 4UA8A 1UTBB 4OYVA 2P1SA 1UTHB 2UVGA 5CI5A 5K2YA 2XXVA 3C9HA 4IGTA 4F2QA 2ZMBA 3MP1A 2QS4A 2VP1A 1Z7NE 4RJZA 5TP9A 3V89B 3FATA 3THIA 1A8FA 3IO6A 3MP8A 2Y7IA 2ESNA 2F34A 2I48A 3DP6A 4C0RA 2XXRA 4OVJA 3IB2A 3SKPA 5KCJA 1JW5A 1R1NA 3E3KA 3IOUA 1N3WA 1B40A 3FVNA 3I5OA 1B5HA 1JW1A 1N0TA 3PMXA 1AL3A 1FTMA 2UXAA 4Z0IA 1PBQA 4F1YA 3UN6A 4DCXA 1B3GA 3QSLA 1B32A 2XX9A 1DSNA 3QK6A 3FIRA 3HV1A 4G68C 3ECRA 4U1OA 3PU5A 5L9SA 4IO2A 1LAGE 4MLVA 1FCKA 1VR5A 4KCCA 3ILTB 1FTOA 3RY3A 4U1ZA 3RUMA 3RNNA 1DTZA 2DE2A 1VFEA 4JB7A 5JTYB 5AA4A 1MRPA 1MXUA 4X1BA 4ZECA 1D9VA 5CMKA 5IAIA 3KN7A 1DMBA 2O69A 3LC8A 4IO7A 4YKKA 3VXBA 3S9EA 1HSLA 2Z8DA 3FVOA 3ILUB 3H6UA 3S9NC 3TELA 5I2KA 4FEDA 1LAXA 4IY6A 4JWOA 1XVXA 1I69A 5I2NB 3H6TA 2Z8FA 1H44A 3W15C 1OIBA 3OO9A 1B51A 1TXFA 1DTGA 1Y20A 3MZBA 4IO4A 5EHMA 3PPPA 2Y7WA 4H8IA 3RPWA 2QS1A 2REGA 3TCHA 2RINA 4R73A 2Z8EA 3TQLA 5AE4A 3R7XA 2D21A 2PVUA 3HPIA 4P0IA 5AA2D 3MPKA 5EHSA 1KWHA 2A5SA 2DS9A 1FW0A 1P1OA 3G7WA 2DE4A 3IOWA 2ZNUA 3N6TA 4G8NA 4O3BA 4OHNA 5TPAA 2VD3A 2XXWA 2ZYOA 3FV1A 1HSEA 4H8JA 1JETA 1MY4A 2F7AA 2H5YA 2Y84A 4DLDA 4F2OA 4LONB 1IXHA 2XXTA 3GZGA 4G4PA 4IO5A 3U1OA 4MLQA 1LB9A 1LBCA 1B3EA 3LUYA 4YZZA 1EZ9A 3GBAA 4GVOA 3E13X 3VDFA 5I58A 4U4SA 4AQ4A 1F9BA 3KJTA 1MPCA 3MP6A 1YCJA 4PFWA 3K6XA 1NKXA 4P11A 3BBRA 4LVQA 2V3TA 4XKPA 5I59A 2H4IA 4ZS9A 3LSWA 4X9TA 3KJ7A 3OO8A 3FXRA 1N04A 3OO7A 2OJTA 4YKIA 3T9XB 2V3QA 1OQGA 1PDAA 2PT1A 1S7YA 4LQ5A 3RT8A 2O6AA 4KHZE 3PUZE 4EQ7A 3S9MC 4KQPA 4KD5A 1LCFA 2GRVA 2RCAA 3FASA 3O6IA 4ISUA 1VFDA 2R6GE 4RK9A 4RPNA 1GV8A 3SETA 3G3JA 2DXRA 1Y3NA 2Q2AA 1I6AA 2F35A 1I6BA 2F78A 2OCUA 2PBWA 3K2DA 3KN8A 1PBPA 4N13A 1QUJA 3OEMA 1MXYA 3KOTA 2XXUA 2DSFA 3SEUA 1M5EA 4ESXA 5HPQA 1PC3A 1MM6A 3QIMA 4HCYA 2LAOA 1A54A 4BLAA 1B58A 3FD3A 3PPOA 3LR1A 4EXKA 3PPRA 4DE8A 1DPEA 1SW1A 5DEXA 3T66A 2H99A 2I4CA 2O51A 2O7UA 1IIWA 3TCFA 1XS5A 5IKBA 3KSXA 1B4HA 1H45A 3G3GA 5ELVA 4H67A 3MQ9A 2ZYMA 1Y3PA 3U72A 4QFNA 1NNPA 3O66A 1DOTA 2I3WA 1EZOA 3ONMA 2QMXA 3O97A 4RXLA 2UYFA 3FVKA 4RA1A 3CSGA 4N6PA 4RYAA 3K01A 4XKQA 5ITOA 3H6VA 4QFPA 1MQIA 3C4MA 3K1NA 5I84A 4PFUA 4GIZA 1B5IA 4ZEBA 1EH3A 2CZLA 3CVGA 3K6UA 1M5FA 3N94A 2I3VA 2PMSA 3E4RA 2QPQA 2HXWA 3WAFA 2XXXA 4FECA 1ELJA 4YKPA 1LGBC 1B7HA 3S2VA 3T9UA 2F6PA 3FJMA 1BLFA 1IEJA 4LZ8A 4FAJA 1ANFA 4HW8A 5B7DA 4YMAA 2YLNA 4GXSB 4NF4B 2Z23A 3U8QA 3VFJA 1BIYA 3GLBA 4Q0CA 5FTIA 2R71A 1GTKA 4M1VA 3L6GA 3HSTA 1NNTA 1AH5A 1QULA 4MH5A 2QJEA 4Q5TA 4YU0A 5L9MA 3VVFA 3Q28A 1J1NA 1Y4CA 1SDXA 3KFMA 1SYHA 4POWA 3TZAA 4R6YA 2IA4A 5I2KB 4EF1A 4C1UA 3AXFA 4AB6A 4ELRA 3C35A 3K6WA 3S9LC 5AA2A 2ABHA 1B1XA 5H8HB 3PGFA 1TT1A 4OENA 5ICQA 1MPDA 2AL4A 4U4XA 1H43A 1JW4A 2F8DA 3EPEA 2OZZA 3G3FA 3MVYA 3PD8A 3PUXE 4DXUA 3M3KA 3MC2A 5AA4B 4KYDA 3M3LA 4UACA 4OERA 1CE2A 3ODBA 2DWIA 2QL3A 1URDA 3IO4A 4KI0E 4OFOA 3TFLA 4ELPA 5CC2A 4I8CA 1D3KA 3K6VA 5H8SA 3N5LA 2O68A 1GR2A 1AIVA 3EN3A 1TWYA 4KCDA 4YMBA 2OLBA 3IJOB 5F7VA 4H65A 3TUSA 2OWTA 4F18A 4I1DA 3UK4A 1M5DA 1A8EA 3RTFB 3VE1B 2I58A 4PETA 1Y4TA 2BJJX 2E1SA 5M2VA 1ATGA 3PUVE 1FQAA 3KOSA 1O64A 5H8NA 4U23A 4H6DA 2A5TB 3G3HA 4WEDA 2DVCA 4NMYA 5DT6A 4ZEIA 5BUUA 1QW0A 2DP8A 3H06B 3K00A 4G8MA 5I58B 1LSTA 2ONKE 4QFLA 3N6UA 3ZKKA 2HZLA 3MWBA 3OENA 3RLFE 3TTMA 4WEPA 1UTHA 2QS3A 4LATA 4ZE9A 5J1DA 2QSXA 2NVUB 1FQFA 2V93A 3B6TA 4IGRA 2VOZA 4WXJA 4GL8A 3PUWE 3T9HB 1B46A 3Q29A 4JSDA 2I6EA 3KGCA 4NEDA 4F39A 2D5WA 1EU8A 2HAVA 1XHYA 4KR5A 3T22A 1BTJA 3R6UA 5CMMA 1JVYA 3KEIA 2UVHA 3OMBA 2THIA 3PPNA 2OK2A 5H8QA 5B70A 3VXCA 4HTGA 4IO6A 1R9QA 2XXQA 4G68B 3W9WA 1B4ZA 1PB8A 4LP2B 3B7DA 1LFHA 4ZEFA 2ZNTA 3KZGA 4XKNA 5F1QA 4BDMA 4EQ9A 3CG3A 3R26A 5LOMA 3MZ9A 3UP9A 5L9OA 1AOVA 4H0WA 1B2HA 3O6GA 2RCBA 3MPLA 2Q9TA 2W7YA 4LZ5A 3T93B 1FTKA 3K0VA 1XVYA 4QFKA 1LFGA 2VD2A 1A7LA 1FQBA 1H3DA 2PX1A 3BFUA 3C34A 1MXWA 3FZVA 3H6WA 1TFDA 4OXVA 4F29A 1Q1KA 1NH8A 4BDQA 1EZPA 4Q30B 3U92A 1B6HA 4ZDMA 3MW0A 2XX7A 2DWAA 4QSEA 3MUQA 3OSRA 4HS7A 4YICA 3GBBA 4ZZAA 4FATA 4NWDA 3CR9A 4R74A 5H8HA 3IOTA 1D4NA 2HAUA 2XXYA 4N07A 1MG1A 5I57A 4PQJA 4OWDA 2YJPA 2DWHA 2DYXA 1USYH 2P0SA 5JTYA 3IK6B 2Y7PA 3OO6A 2NWJA 1IZ1A 1UIUA 2F7BA 4JXIA 4XKRA 5FHOA 3MVWA 3U94A 1OLCA 3VVEA 3CRBA 2HFBA 4H1XA 5CMCA 1NNFA 3MVXA 2O7IA 3OD7A 1WVJA 2IEEA 4G68A 4OTEA 4JWYA 1VE4A 1YPNA 2HCAA 1LAFE 1OQHA 1XC1A 4X1DA 5TU0A 2I0BA 1ZJLA 3IORA 1IITA 4DXBA 1SI0A 2ONSA 5KZTA 5DVFA 2AL5A 1US5A 1LB8A 4NWCA 4KYSA 3EHTA 4OEUA 1B0LA 3SESA 3CG1A 4LZ7A 4OQOA 5HM4B 3TKDA 3FUZA 1B5JA 2FYIA 3EHSA 3LSFB 1R6ZA 4RK2A 1MM7A 3C36A 1SW4A 4QHQA 4NF8A 5DVIA 3IAZA 1H76A 3K1PA 4KFQA 3M8UA 2RF1A 3PPQA 3HHFA 1M5BA 1MXXA 1MY2A 4I9DA 1US4A 1MY1A 3FGSA 2FNCA 4IO3A 3IR1A 4U22A 4U2RA 4F3GA 5BWJA 2V3UA 2UVJA 3FVGA 4KPTA 4QSCA 4KYEA 4OZ9A 5CRYA 3DP8A 3KSJA 3SDFA 4DIGA 1L5TA 1T0KA 4FEBA 5CBSA 3K1MA 4YB7A 4OFLA 1VSOA 3TQWA 2XX8A 4F3PA 4HCWA 1B7ZA 4ESWA 4G2ZA 3OSQA 5A5XA 1NNKA 2X7PA 3C33A 3D4CA 1SD3A 5FHMA 4O3CA 1IXGA 1LBBA 1YAEA 4BDRA 4XTCQ 1R9LA 4O3AA 2ZYKA 4THIA 4F3SA 4R6KA 2XXHA 4YB6A 5DTBA 2AYSA 2R9JA 4TLLB 1N76A 3PUYE 4LQ2A 4FIMA 3RQTA 2ALUA 3JV9A 2DE3A 3OOAA 4EXLA 3VLWA 1POY1 4R9FA 4C1TA 4RNSA 4ECFA 4NF8B 3Q26A 3IJXB 2KLFA 3JZJA 4ND9A 1URGA 1A55A 4DDDA 5KDTA 2G29A 1FQDA 1SQYA 2REJA 3EQ1A 4YKJA 3VVDA 5H8FA 3UORA 2H98A 3U93A 4OETA 2HQ0A 2RC9A 4ELQA 1AMFA 4ONYA 1O7TA 2VHAA 1ZKBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ZMGA 1MQJA 1FQCA 2H9BA 3O29A 4ELOA 4F3BA 1RYOA 3EHUA 4GXAA 2I4BA 3FXUA 4DI4B 4F19A 2QS2A 4Z7EA 2CZKA 1USYE 4ZEDA 1II5A 2R8TA 2V4CA 5DEXB 1GGGA 4P47A 1KA1A 3LBSA 4GBWA 1PB7A 3DELB 3HCQA 4MIJA 1QJMA 4RY1A 1DCUA 3RPLB 3PMVA 1MXVA 1URSA 2ZYNA 3SEYA 3TPAA 4DCYA 4GOTA 1LFIA 3HN0A 5ESYA 1YXIA 1FBPA 2X7QA 5JEIA 1SBPA 3O2AA 4GRKA 3IL1B 2V84A 1FBGA 1FQEA 3RGYA 4PBHA 5EYFA 3LUZA 1Y9UA 3V83A 5CMBA 1ZBMA 2F36A 2B65A 4GF8A 3SEVA 2XHDA 1S9TA 1OVTA 4EUOA 2B3FA 1B7UA 2HXRA 4OEVA 4P1LA 2DOJA 3G3KA 5L8DA 2OWSA 1ZLQA 4QXDA 5TP9B 4MFIA 3QXMA 1P1NA 1LLSA 4NF4A 3MJNA 5I59B 4NE4A 4I62A 1B1HA 3A09A 2HEUA 4JDFA 2F7CA 1RDYA 1NMUA 3TTNA 3QUJA 4P8BA 2ZNSA 4DZ1A 3USDA 1BKAA 1O63A 1NUYA 5EYHA 3VLVA 1KA0A 5LDZA 1FPFA 2GFEA 1NV0A 2O1LA 3FBPA 1CB6A 4POXA 5ICTA 1P1WA 1MY3A 1MY0A 3DM0A 3VLUA 2NOOA 3BKIB 2E0SA 2VGQA 5KCJB 4QSDA 1UTBB 5CI5A 5K2YA 3CHGA 4RJZA 3FATA 3MP8A 3DP6A 2I48A 4C0RA 3SKPA 3FVNA 2OWZA 1B3GA 2XX9A 4U1OA 4KCCA 2DE2A 5JTYB 2Y5LA 1NUZA 2XWIA 1D9VA 5IAIA 2O69A 3TELA 4IY6A 4JWOA 5I2NB 3H6TA 1H44A 1OIBA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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