3LSXA

Piracetam bound to the ligand binding domain of glua3
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
RTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGTPVNLAVLKLSEQGILDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GluA3 S1S2 domain
publication title Piracetam Defines a New Binding Site for Allosteric Modulators of alpha-Amino-3-hydroxy-5-methyl-4-isoxazole-propionic Acid (AMPA) Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 85
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-02-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lsxA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3lsxA02
1NNFA 2YJPA 3K1NA 4YICA 4NF5A 1FW0A 3UA8A 4RA1A 1LB9A 4F31B 3K2DA 1OVTA 4YB5A 5CC2A 4IO2A 2DXYA 2ZNSA 4OZ9A 2P0SA 4RJZA 3HSTA 4GVOA 3TTLA 3BBRA 1IXHA 1B7UA 5KCJA 3V89B 5HPQA 1YPNA 3VXCA 3I6VA 4HW8A 1N3WA 4N13A 4F19A 2HXWA 3A3UA 3A09A 3OXNA 4G68A 2UVJA 1VSOA 1USYH 5I2KA 2F6PA 5M2VA 5CMCA 2I4BA 3QIMA 3A3CA 1R1NA 1YCJA 1MDQA 1H43A 4DIGA 2H9BA 1JW1A 1ANFA 2NOOA 4F18A 4XTCQ 2B65A 4QSDA 3OO8A 4I8CA 4IO4A 3UORA 3SETA 2Q2AA 3OEMA 3V83A 2XXTA 3U72A 4R6YA 2X7PA 3I5OA 4OHNA 1H45A 4H0WA 5ICTA 2ONRA 1LAHE 3MVYA 2O6AA 2NWJA 3DP8A 3SKPA 3PMWA 2ESNA 2QMWA 3K4UA 1OQHA 4OVJA 3B6WA 3TTMA 2VHAA 3P7IA 2DWJA 1ELJA 3GBAA 2DE4A 4BDNA 1FQAA 3H3GA 1M5CA 3WAEA 1FTJA 4DXUA 4N6PA 1LFGA 4YKJA 3PPQA 1MQIA 3IOWA 3ILUB 3PD9A 2UXAA 3KN8A 4F39A 4F1VA 2H25A 2H4IA 4BDRA 4R2FA 1EZOA 2Z8EA 4DLDA 2OK2A 4KR5A 2OLBA 2V84A 3U93A 4DZ1A 2RF1A 2ZYOA 1B5IA 2HFBA 2G93A 5KDTB 4RPNA 3M8UA 5AA2B 1SW1A 2QS2A 2PBWA 3HHGA 4NF8A 1N7XA 3DP4A 4QFOA 4JWYA 4U23A 2XXHA 4E0XA 2THIA 4JSOA 5L8DA 1A55A 3E3KA 4G8MA 1B7HA 3CVGA 4G68C 3V8XB 1NMUA 3PU5A 3HHFA 3D4GA 2ABHA 3ONMA 3FV1A 5AA4B 1Q35A 1Y1ZA 3VFJA 3MPKA 3FXUA 1NFTA 4QSCA 5DVJA 1XHYA 1IXGA 1TFAA 4OWDA 2XXXA 3DM0A 4DXBA 1MXXA 1Y3NA 4IO7A 2R6GE 4LZ8A 2XXYA 3O97A 2GRVA 3IO4A 4QFPA 1P1WA 5AA2A 3U1OA 1MQHA 4GLIA 1HSLA 1MDP1 4KYSA 1TFDA 3TFLA 1B05A 2REGA 3VXBA 3T66A 1OLCA 4E0WA 3KBRA 4I9DA 1H3DA 4DXCA 3N26A 5CMKA 1NNTA 4Z0IA 2UYEA 4NTLA 3KGCA 4IB2A 1MS7A 4Q0CA 1MRPA 1Z7ME 3Q27A 2O7IA 3H6WA 3ZS6A 4Q8RA 5AA4A 5CBSA 4LQ2A 4JWOA 3Q29A 3MC2A 3TMGA 2UYFA 2ZYKA 5A5XB 4XKPA 5TP9A 5H8FB 3OSQA 1R6ZA 4QHQA 5JTYA 2PVUA 4M4GA 3HCQA 4X1BA 5ELVA 2FNCA 1QUJA 4EQBA 3CFZA 1SYHA 4G8NA 2Q2CA 3O6HA 5J1DA 3C36A 3TTKA 1MPCA 4LA9A 1TXFA 2ONSA 4GQOA 4HCWA 1P1QA 4GD5A 3C4MA 3PPPA 2F7CA 1UTHB 2VOZA 1LB8A 3ZKKA 1LBCA 3LR1A 2VGQA 3T22A 4WEPA 3H06B 1J1NA 1M5EA 2B3BA 3PPNA 4OEUA 5JK4A 2GFEA 3C32A 1N7WA 4DE8A 4TQUQ 4ZE8A 1B3EA 4MLVA 1XOCA 4P0IA 4G8HA 5FHOA 1B5JA 3O66A 4FIMA 2Y84A 1A40A 1KWHA 3V5AA 3RY3A 1UTBB 3RTFB 2V3UA 3OO7A 1BTJA 2AIXA 2KLFA 4R75A 3IK6B 3SEVA 4NE4A 2ZYNA 5DTBA 4QFKA 1D3KA 4ZZEA 4NMYA 4EUOA 1LLSA 2XXVA 4TLLB 2Q88A 5LOMA 1RYXA 2F7BA 2DXRA 3RGYA 3PUYE 1RKMA 3Q26A 2XXPA 3IJXB 1UIVA 4X9TA 1FQCA 3R7XA 4NF6B 2HCAA 1LFHA 3LSLA 4LP2B 2ZYMA 3PMVA 4OFOA 3S9NC 4WXJA 3QXMA 4EF2A 2CMOA 2YLNA 1B32A 2I48A 4JSDA 2F36A 3SEXA 2A5TA 2REJA 4F1UA 1UTBA 1JQFA 4RXLA 3CFXA 4KYDA 2P2AA 3BKIB 1QVSA 1D9VA 3N6UA 4LQ5A 3PPOA 1B3HA 3K6VA 2R71A 1MY4A 3HN0A 3BFTA 1USYE 3MZ1A 2XX7A 2AYSA 1SD3A 5KCJB 1BLFA 2UVHA 4ELRA 2RKMA 2F5XA 2IA4A 5I2NA 4G68B 3SEUA 3PUWE 5ITPA 2Y7PA 1XT8A 2ONKE 2I49A 5CMBA 1B52A 3R6UA 1ZLQA 4YB7A 3DELB 3MVXA 4ZS9A 3B6QA 3N6TA 5AA1A 4OFLA 4LZ5A 3FXQA 2I3WA 1SVXB 1NNPA 1OIBA 3FVNA 2O51A 2DVZA 1FTKA 5FTIA 3FD3A 4NEDA 1OQGA 3H6UA 4AQ4A 1I6QA 5B7DA 2OZZA 3H6TA 4FAJA 3IB0A 3EHSA 3S9MC 2G29A 1SW5A 2DYXA 4IY5A 3O28A 1QJMA 5I59A 4PETA 3K6XA 1MY3A 1IEJA 4ZECA 2Q8JA 2XHDA 3E13X 4KQPA 3S4UA 4HS7A 3VE1B 2IEEA 1P1UA 4ISUA 4IY6A 3PUXE 1B5HA 4H6DA 1Z7NE 1H76A 5HM4B 4RPOA 1IITA 2UVGA 2DE2A 3LBSA 3H4ZA 2E0SA 1FQEA 2XX8A 3C35A 1ZKBA 1R9LA 3FJMA 3K6UA 3CG1A 2F97A 1IZ1A 3PMXA 4F29A 3IAZA 5IKBA 1JETA 1OVBA 3K00A 5TU0A 1D9YA 2UVIA 5CMMA 4H1XA 1M5DA 3GBBA 4R72A 5CBRA 3C9HA 5CI5A 2O7UA 2F34A 4NWCA 4O3CA 3FIRA 1US5A 1L5TA 4NF8B 3VV5A 3UGWA 3QUFA 3IJOB 4BLAA 2RCBA 1FTOA 2P1SA 5F1QA 3L6GA 2NXOA 2Y7WA 3K01A 2X7QA 2E1SA 4KI0E 4P11A 2QRYA 5BWJA 1BKAA 4XXUA 2AL4A 2QMXA 3MP1A 3ECRA 2HZLA 1QW0A 1B46A 1Y4CA 3MQ9A 2RC9A 5BUUA 4LVQA 1Q1KA 1VE4A 4Q5TA 2HQ0A 4G4PA 3T9UA 3G3GA 1YAEA 2I4CA 2VD3A 4AB6A 4IGTA 2Z8DA 4YB6A 3O6IA 3IORA 1B1HA 1ZIUA 4ZEFA 1DPPA 4YKPA 3U8QA 3EN3A 3TAJA 4Z7EA 1MM7A 4EQ9A 4H8IA 3OMBA 4YMBA 1UIUA 1M5BA 1B6HA 1TT1A 3MP8A 2ZNUA 5DYHA 2HZKA 4GFRA 2F78A 1MXYA 2DWHA 3K6WA 4MF3A 3VLWA 5EYFA 1B4ZA 5TP9B 3TPAA 5JTYB 4N07A 4KYEA 4PFYA 5L9OA 1DTGA 1A99A 2QS4A 1MPDA 4ELQA 1JW5A 2Y7RA 2F7AA 4OTEA 4YZZA 3PUZE 1CE2A 4POXA 4GXSB 1NNKA 3OSRA 3EPEA 3RLFE 4YMAA 3F11A 4R6KA 3AXFA 2OWTA 3O29A 4EXLA 1EH3A 1B4HA 4XKNA 1XC1A 3G3IA 4ELPA 4BDQA 2ZXTA 3QYTA 4H5FA 1QKBA 4Q30B 1D4NA 5ICQA 1S9TA 3T9VA 4U22A 2QPQA 5DVIA 1SW2A 3L6HA 1B3GA 4JB7A 3TUSA 5ITOA 1B51A 3BFUA 1B9JA 4OERA 1RYOA 1DTZA 4PP0A 1MXWA 3K1PA 3LC8A 3IOTA 4DDDA 3W15C 1BP5A 4RY1A 1OLAA 4PQJA 3HPIA 3OEKA 4FEDA 1PB7A 4GXAA 5B70A 3SESA 2F8DA 1MPBA 1MG1A 3TZAA 4U2RA 1P1NA 3JYRA 1XVXA 5I57A 3WAFA 2D5WA 3IB2A 4OXVA 5DT6A 5HBCA 4NWDA 2XXRA 3FUZA 3IR1A 3IOUA 3R26A 1A8FA 2GH9A 1LAGE 3OENA 1IIWA 4YAHX 3KFMA 5I58A 4TOZA 4IO5A 3MPLA 3KJTA 3EHUA 4POWA 5I56A 4DCXA 3GZGA 4G77A 1MQGA 3K02A 2AL5A 3QUJA 3KSXA 1PB8A 4H5GA 1HSJA 4NF4A 4EXKA 3CR9A 3H6VA 2A5TB 3VVFA 4RK9A 1A8EA 4EDPA 5L9SA 1Y3PA 4JDFA 1TWYA 2O1MA 4C1TA 2VD2A 4FE8A 1I6BA 4KPTA 1JVYA 3PD8A 1FQFA 4GRKA 4F3PA 4L17A 4HCYA 1WDNA 2YPNA 3ZKLA 3VDFA 2XXUA 3CIJA 2DP8A 5IAIA 1LCTA 4UACA 1R9QA 5I2NB 1B2HA 4FJPA 1FTMA 4GL8A 1P99A 1MXUA 5FHMA 3SEYA 3QSLA 5JEIA 4U21A 3S9LC 2D21A 4DCYA 3FGSA 4WEDA 5DVFA 2QS1A 3OO9A 3RPWA 1NKXA 2WKYA 3TYHA 3KOTA 2W7YA 2A5SA 4C1UA 4FEBA 4ZEDA 2XD2A 5H8HA 4JWXA 1XVYA 3T9XB 4R2BA 3VLUA 1ZU0A 1EU8A 1B1XA 2HAUA 5EHSA 1LAXA 2XXWA 3KG2A 2RC8A 4JBZA 2QJEA 5I59B 4F3SA 3TCGA 4X1DA 3VVEA 4EF1A 1PC3A 3E4RA 3G3FA 2XD3A 3TCFA 4ZDMA 1B3FA 1URSA 2VP1A 1LGBC 3K0VA 3TDJA 3TKDA 4H8JA 3C31A 1WVJA 1I6AA 3G3JA 4MFIA 4OQOA 3T96B 4KFQA 3MBPA 3DLNA 4BDOA 2OBGA 3T9HB 5I84A 3LSFB 1AL3A 3E9XA 4H67A 1GV8A 3RT8A 1MY0A 2V25A 4YKIA 1II5A 4RK2A 1VR5A 1MH3A 1MM6A 2V93A 3CFLA 3KEIA 4ZEIA 1S7YA 2RINA 4OEVA 3N94A 4THIA 1FCKA 3OD7A 5H8NA 3SEWA 2BJJX 4R9FA 4HTGA 5AA3A 3GXAA 4OFJA 4X48A 4GL0A 4U1OA 3GLBA 2ALUA 4GF8A 1B58A 4U4XA 3IOVA 1LCFA 1ZBMA 4WKMA 3UK4A 2Y7IA 2PT2A 2V3TA 5EHMA 4YKKA 5K2XA 2QSXA 1GR2A 1XS5A 1Y1MA 4OETA 2I0CA 3EQ1A 4F22A 3N5LA 1SW4A 4I62A 5KZTA 1DSNA 1S50A 3TODA 1JW4A 4PE5B 2I3VA 3RUMA 2O69A 3MW0A 3UIFA 4JXIA 1AOVA 3KJ7A 1NH8A 1O64A 4M1VA 4OENA 3UP9A 3VVDA 4EQ7A 4MH5A 2I6EA 4ESXA 3OELA 1SDXA 1MXZA 3K1MA 3QAXA 4ZZAA 1SI1A 3W9WA 1M5FA 3RT6B 4MLQA 3RTWB 1MQJA 2XXIA 4O3AA 1Y9UA 1SQYA 4QF9A 1SBPA 2ZMBA 1EZ9A 2DS9A 2XXQA 3ODBA 4BDMA 4RNSA 3HO7A 5FTHA 2Y7KA 1N84A 5H8SA 4XKRA 4R6HA 1O63A 2NVUB 1PEBA 5H8QB 3TTNA 1ZTYA 5L9MA 3M3KA 3FV2A 3THIA 4ESWA 2LAOA 1JVXA 1N76A 4R9GA 3O2AA 4RYAA 3T93B 2ZNTA 5AE4A 3FATA 3FJ7A 3G3KA 1MXVA 3I3VA 3RQTA 1GTKA 2ANJA 1N04A 3FXRA 3USDA 1F9BA 1AIVA 4H65A 4R73A 1HSEA 3G7WA 3MWBA 1A7LA 1JNFA 2M8CA 3MVWA 4TLMB 1US4A 2DE3A 4QFLA 3EF7A 3FJGA 1WODA 4I1DA 4F2QA 3B6TA 2PX1A 3FVGA 3JV9A 1SI0A 5H8QA 3U94A 3TTRA 2B3FA 3SDFA 1NL5A 2FA7A 3CSBA 4BDLA 3MZ9A 2DQVA 3S9EA 1EZPA 1O7TA 3CRBA 3KOSA 3MJNA 5ISUA 1PBQA 4ND9A 1POY1 5I57B 3C34A 3Q28A 5TPAB 4OMBA 4F2OA 1DOTA 3PGFA 4ZEKA 4QRZA 3D4CA 4YU0A 1IXIA 1QKAA 3MP6A 3PV0E 2I58A 2QS3A 3TELA 3B7DA 1H44A 5KDTA 3LUYA 4U1ZA 1MY1A 2F6GA 3ILTB 5FHNA 3TCHA 2H5YA 1A54A 4KD5A 5I58B 5CRYA 4GOTA 3O6GA 4XIGQ 2Z8FA 2HEUA 5DEXB 4ZEBA 3TEPA 4U4SA 1LAFE 1B0HA 1MH4A 2OWSA 1VFDA 5I56B 1B3LA 2Q9TA 1ZJLA 2Q89A 2D3IA 3C33A 2CZLA 5F7VA 4NF4B 4O3BA 3LSWA 1MQDA 3MUQA 4QFNA 1B7ZA 1IQ7A 2NUVA 1I69A 3M3FA 3PPRA 3U92A 1NH7A 4C0RA 1MY2A 1JEVA 2DWAA 4PFWA 1QUKA 4LUBA 5TPAA 1CB6A 4IO6A 1FQBA 1Y4TA 5CM6A 1SYIA 1PB9A 1QUIA 4KCCA 1GVCA 2QL3A 3KSJA 1YTVA 1VFEA 4OYVA 2GHAA 1AMFA 4GIZA 1LSTA 2H98A 1LFIA 3CSGA 3ZSFA 4QSEA 2GHBA 4GWOA 4LONB 4ELOA 2XX9A 4ECFA 5DEXA 3FVOA 1P1OA 4LZ7A 3KN7A 4OESA 3RN8A 4FATA 1GGGA 2F35A 1PDAA 1ZMGA 5H8HB 2V3QA 2OJTA 2PT1A 5A5XA 5H8FA 3IL1B 1AH5A 3Q25A 4FORA 4XKQA 3MAMA 2X26A 3PUVE 1ATGA 3FVKA 2OCUA 1Y20A 3W9VA 2O68A 4UA8A 1N0TA 2DWIA 2R9JA 4LATA 2DVCA 3S2VA 2PMSA 1POTA 1UTHA 3OO6A 4AB5A 1IUDA 4F3BA 3KZGA 3VLVA 3LSXA 3MZBA 4MBPA 3EHTA 2I0BA 1T0KA 2RC7A 1Y3QA 3SERA 2H99A 3TQWA 3H03A 4KCDA 2FYIA 2RCAA 4R74A 2Z23A 3DP6A 1FQDA 1DPEA 3HV1A 3G3HA 3RNNA 4F1YA 1JEUA 4ZE9A 3FASA 4NF5B 1B40A 1N3XA 1PBPA 3O9PA 4FECA 5AA2D 3IX1A 1URDA 4PFTA 4PFUA 5H8NB 1FTLA 4F3GA 3M3LA 3UN6A 3TQLA 1URGA 3KN3A 1OMPA 3IB1A 3CI8A 4G2ZA 1BIYA 1LBBA 2O1LA 2DSFA 3MVZA 4IO3A 3IO6A 2HAVA 2O84X 3FZVA 4K3FA 1IXCA 3JZJA 4IGRA 4KHZE 1B0LA 2DOJA 4ONYA 5I2KB 1QULA 1UQWA 3OOAA 2Z22A 3H7MA 4P0GA 2PYYA 5K2YA 1DMBA 3QK6A 4NF6A 3CG3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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