1FQAA

Structure of maltotetraitol bound to open-form maltodextrin binding protein in p2(1)crystal form
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
AIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding protein
source organism Escherichia coli
publication title Crystal structures of the maltodextrin/maltose-binding protein complexed with reduced oligosaccharides: flexibility of tertiary structure and ligand binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
total genus 125
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqaA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqaA01
3HPIA 5AA4A 4R6HA 4FAJA 4F22A 1SI1A 4ELQA 4GRKA 3RGYA 3BBRA 4P0IA 1WDNA 3LSFB 2HFBA 3ZS6A 3DLNA 3VXCA 3IORA 3H6UA 1MY3A 5FTIA 1B3LA 2DP8A 4GVOA 3TTRA 1T0KA 2DVZA 4DE8A 3HN0A 4YKPA 4DXUA 5ICQA 4G8MA 4RPNA 4IO2A 3Q25A 5F7VA 3PPOA 2OJTA 3FJMA 3UA8A 2QJEA 5A5XA 3KFMA 3UIFA 3K00A 3M8UA 1Y4TA 4FEBA 4G77A 4NF5B 3RT6B 1UTHB 2P2AA 4KYDA 3FVGA 4YB6A 5BUUA 1ZU0A 4LVQA 1Q1KA 2Q2AA 2B65A 4R2BA 1II5A 3Q27A 5CBRA 3RN8A 1SW2A 1B3GA 3ZSFA 4PFTA 2DWJA 4GWOA 5JTYB 1ZJLA 1MQGA 2HAUA 4ZDMA 3SEWA 3K6VA 1R9QA 3EN3A 3RPWA 4F39A 4IY5A 5I56A 4NF6B 4FJPA 5FHOA 3PMWA 3CSGA 1PDAA 5IAIA 1FW0A 4GL0A 3WAFA 3G3JA 4DXBA 4QFLA 3B7DA 1B58A 2V84A 3O9PA 4U4SA 3RTWB 4F2QA 4M1VA 4IB2A 2G29A 5EYFA 4H5FA 3IR1A 4E0XA 3FJ7A 3T22A 3JV9A 4PETA 2CMOA 4LQ5A 4QF9A 4RK9A 1MY4A 2H5YA 3OSQA 3IJXB 4WKMA 2F97A 2B3FA 1USYE 2V93A 2ZNTA 1I6AA 3CSBA 2A5TA 4YKKA 3LC8A 4F3GA 1MPCA 1N7XA 1UTBA 4QRZA 2XXIA 3A3CA 3B6QA 3IO6A 3FASA 3GBAA 2X7PA 3G3FA 3MP8A 1RYOA 3IK6B 3Q28A 2RC8A 2GHBA 1YAEA 3CRBA 2O1LA 2O7UA 1NH8A 4ZZAA 1DSNA 2XXVA 3IOUA 3H7MA 3TQWA 1XHYA 3KGCA 2ALUA 3PU5A 5ELVA 3KSJA 1OIBA 1PB7A 4LP2B 1US5A 2R6GE 4C1TA 1DTGA 2ESNA 3K1PA 2RKMA 1NNTA 2GHAA 4U1ZA 1MXUA 4FE8A 2UYEA 1N04A 3JZJA 5KDTA 2REGA 4N6PA 4H5GA 2DXYA 5M2VA 2RCAA 4EXKA 4QFOA 4ELOA 4OYVA 2YJPA 4ELPA 3TMGA 4OXVA 2XXWA 4N07A 4F1UA 1TFAA 1SQYA 1D9YA 3QK6A 3HSTA 2ZYOA 4HCWA 4G4PA 3K1MA 2GFEA 1M5EA 4ZS9A 2O69A 4NF8B 2DE2A 1MQJA 4XXUA 3K02A 2HEUA 3FXUA 4F19A 1BKAA 3C4MA 2X26A 4GF8A 1SD3A 1B1HA 1P1OA 3MVXA 1XT8A 1Y3PA 1CE2A 2F34A 4ZECA 2Q9TA 1OVBA 4EQ7A 2Z8FA 4JBZA 3T66A 3USDA 3OXNA 1PC3A 3KN8A 2DQVA 1PB9A 1MXWA 1LFHA 1OQGA 3QUJA 5H8FB 2PT1A 1B7UA 1ATGA 2ZXTA 1B6HA 1JEUA 5I2KB 4BDLA 3KJ7A 3UK4A 5DTBA 2THIA 4ZE9A 1LGBC 3C36A 1LAHE 1LCTA 4EDPA 4O3CA 1IQ7A 1NMUA 2ZYMA 4P0GA 4NWCA 4YICA 2OCUA 3K1NA 4XKPA 3SESA 2XD2A 4H67A 1FQCA 5IKBA 1VR5A 3ILTB 4I9DA 2F35A 3E13X 2ZNSA 3IOVA 2NUVA 5CM6A 2Z8EA 2O84X 5LOMA 4KCDA 2YLNA 3OO6A 2Z8DA 2RINA 4F29A 5H8HB 3CG3A 3UORA 1S9TA 1LB8A 3TYHA 4IO5A 3L6HA 5L8DA 3U92A 2RCBA 1GTKA 4QFKA 5B70A 3K0VA 3FJGA 1WVJA 4EF2A 4IO6A 2ZNUA 3H6WA 3E3KA 5TP9A 2Y7KA 2QS1A 4U21A 4AB5A 2V3QA 2Y7RA 3T9VA 1DTZA 5I58A 4I62A 4IGTA 3G3HA 3B6WA 4PE5B 2PVUA 1AL3A 3PMVA 2I4BA 2OBGA 5I57B 1JW1A 3K2DA 5ITOA 3MC2A 4OFJA 3H3GA 1LAXA 2V3TA 3H6TA 5H8QA 3DP8A 1MXYA 4Z0IA 3RT8A 5KCJA 3MUQA 3MQ9A 1B0LA 1P1WA 3GLBA 2F36A 3Q29A 1LBBA 4KD5A 2Q88A 1JNFA 3QIMA 3TKDA 3TTMA 1FQBA 4ESXA 2IA4A 1N84A 4DLDA 2ONSA 4XIGQ 4EF1A 3KJTA 1NNKA 4F3BA 3OEKA 3QAXA 3QUFA 4G68A 5DEXB 2REJA 4BDMA 3JYRA 1MDQA 4WXJA 3CIJA 4DIGA 3ECRA 3CFZA 3PMXA 1PBPA 1JW5A 3FV1A 2VP1A 4FEDA 1N76A 2QS4A 3SDFA 4R6KA 3SKPA 2PT2A 2H25A 5CMMA 2DOJA 1URDA 2RC7A 5JEIA 2H9BA 3R26A 5FTHA 4KYSA 3M3KA 2DS9A 4NEDA 1MQDA 4ZEKA 3N6UA 1CB6A 3UGWA 4L17A 3EQ1A 2AIXA 3LSWA 4PFYA 2DVCA 4JXIA 3C35A 3KOSA 3BFTA 4JSDA 1LCFA 3T9HB 1VFDA 3KN3A 4MF3A 3TTLA 5AA2B 3U93A 2OK2A 3FD3A 1H43A 1Y3QA 2NXOA 3TCFA 3ODBA 1A55A 2XXRA 3QYTA 1MM7A 3K4UA 1AMFA 4FORA 3O97A 4GFRA 1GGGA 4X1DA 1XVYA 4KR5A 1TFDA 3IX1A 5K2XA 4THIA 3PUVE 4RPOA 4NTLA 4EQBA 3PV0E 4NF4B 4OWDA 1B5IA 4POWA 1LAGE 4POXA 4YU0A 1OLCA 1A8FA 3G3IA 4OZ9A 3FVNA 1D9VA 3EHTA 3PPRA 3EHSA 3TFLA 4R74A 1N7WA 2XXUA 4U1OA 2NOOA 2UVGA 1QUJA 1DPEA 2I3WA 4IO4A 4LZ7A 2A5SA 4Q5TA 3TELA 1LAFE 1S7YA 1UIUA 4NF5A 4EXLA 1UTHA 2D21A 2I4CA 3TAJA 3TCGA 1UQWA 1SYHA 3CG1A 1B3HA 3I6VA 4DZ1A 1FCKA 2F6GA 2H4IA 2AL4A 5JTYA 3QSLA 3U8QA 4H8IA 4ESWA 3G3KA 4KHZE 3MPLA 3MJNA 1EU8A 4NF6A 2PMSA 1FTMA 3FZVA 3O2AA 2OWTA 2HQ0A 3LSLA 1BTJA 4YB7A 3W9VA 2Y7WA 1XS5A 4O3AA 3DP6A 4H0WA 5CBSA 4KFQA 4PFUA 4RJZA 3M3LA 3C31A 3IB0A 3E9XA 3PGFA 4PP0A 2IEEA 4OMBA 3RTFB 1TT1A 4TQUQ 2XD3A 4F31B 4WEPA 3RLFE 5AE4A 3H03A 4IGRA 2VHAA 2PBWA 3DELB 2FYIA 3PD8A 1MG1A 1MPDA 2I0CA 3N26A 2FNCA 1FQFA 5H8NB 3D4CA 5FHNA 3VVDA 4H1XA 1F9BA 3MWBA 4IY6A 5I59B 3VVEA 3TUSA 4LATA 1LFGA 2Q8JA 3SERA 4WEDA 3S9EA 5ITPA 1SW5A 3PUWE 1ELJA 2P1SA 3K01A 5TPAB 1AH5A 1OQHA 3FGSA 1OVTA 4FATA 5EHSA 1MDP1 2XXXA 2QRYA 3KN7A 2XX9A 5CRYA 4R75A 4OVJA 3MZ9A 1MRPA 4LA9A 1EZPA 3OELA 1QUKA 3P7IA 4ZEIA 4BDNA 3KSXA 3CI8A 1ZIUA 4JDFA 4U4XA 5HPQA 3HHGA 5HBCA 1FQAA 3IL1B 3TDJA 4JSOA 3IOTA 2UVJA 1IEJA 1URSA 3RNNA 1SW4A 1ZKBA 4KQPA 1US4A 4YZZA 1IXHA 2E0SA 3MVYA 2O68A 4NF8A 3V89B 3UN6A 2CZLA 5DT6A 1B1XA 4MBPA 1HSJA 3IB1A 3OEMA 1MY1A 1B5JA 4MFIA 5I2NB 1MY2A 4OESA 2VOZA 2QMWA 2UVHA 3IO4A 3RQTA 2YPNA 4UACA 2I6EA 1AIVA 3GBBA 2QS3A 4C1UA 2QSXA 2ONRA 3PPQA 3KEIA 1EZ9A 4BDQA 1YTVA 4BDOA 4ZZEA 4IO7A 4QHQA 3FV2A 2UVIA 4HTGA 5K2YA 5H8FA 3OD7A 4I8CA 3FVKA 1B4ZA 4H6DA 3IJOB 3SEVA 5I2KA 3SEXA 2D3IA 2HXWA 4YAHX 2I49A 1A99A 1M5DA 2I0BA 1OLAA 2UXAA 3VLUA 3O6HA 3N94A 4RK2A 5TP9B 4XKQA 2NWJA 1VSOA 1MXVA 4OETA 2Y84A 3HCQA 1H76A 1JQFA 4C0RA 3E4RA 1LLSA 5I58B 2BJJX 3U94A 2R71A 1USYH 5ISUA 2Q2CA 3MP6A 2ANJA 2DXRA 4GL8A 4YB5A 1IXGA 4RA1A 4ND9A 2QPQA 3PUYE 3FVOA 1HSEA 1B32A 4JWYA 3VLVA 2F6PA 1O64A 5FHMA 1JEVA 1P1QA 2QL3A 4H8JA 1GVCA 2DE4A 5B7DA 2VD3A 2O7IA 4OQOA 4X48A 5H8HA 4X1BA 2P0SA 3KBRA 4RXLA 1SYIA 5J1DA 2DWIA 1FTJA 4TOZA 1XC1A 1A8EA 4GXSB 3N6TA 3A3UA 5JK4A 2ABHA 3W15C 3U1OA 4F3SA 1IITA 1Y1ZA 3R7XA 4Z7EA 4FIMA 3MVWA 2XX8A 4ZEDA 1MPBA 1JETA 4MLQA 4F1VA 1P1NA 3PD9A 4LZ5A 3VLWA 3SEUA 2OZZA 3IOWA 5AA2D 5I57A 5AA4B 3ONMA 3UP9A 2Q89A 3H4ZA 1XVXA 4X9TA 1M5FA 4EQ9A 1DMBA 4LQ2A 1QULA 1IZ1A 2O51A 1NL5A 3IAZA 4KYEA 3S2VA 4DXCA 3THIA 3KOTA 2UYFA 2XXQA 5L9SA 2Y7PA 3CVGA 3V5AA 1QW0A 5I84A 2GRVA 4XKNA 1ZLQA 3VXBA 3ILUB 1B3FA 1B52A 2O1MA 1MXXA 2ZYNA 5A5XB 2XXTA 5DEXA 1BLFA 3DM0A 3PPPA 5H8SA 1JVXA 4NWDA 2HZKA 3TCHA 1WODA 2DE3A 2HZLA 3HHFA 2ZMBA 1MQHA 2Y7IA 4KPTA 1Q35A 1VE4A 2DWAA 1MM6A 1Z7ME 1MS7A 1LFIA 5I56B 4ZEFA 5DVJA 3O66A 3MZBA 4TLLB 1ZTYA 2V3UA 1SW1A 3D4GA 4Q30B 1YPNA 4FECA 3RY3A 4YMAA 4NMYA 3GZGA 5L9OA 5AA2A 4DCYA 3MPKA 1ZMGA 1B9JA 5KZTA 3BKIB 4I1DA 3VV5A 3K6WA 4OEVA 2DWHA 4RNSA 1VFEA 1FTOA 5ICTA 4RYAA 3MBPA 2D5WA 2A5TB 2XHDA 1IIWA 4QSCA 4KI0E 1N3XA 2X7QA 4GOTA 3MW0A 1UTBB 1MH4A 3I5OA 1I6BA 4XKRA 4MH5A 2M8CA 2QMXA 1IUDA 1LBCA 3PUXE 1Y20A 3CFXA 3OOAA 4JWXA 1QUIA 3CFLA 3EF7A 4PQJA 3PPNA 3C34A 4NF4A 3MP1A 5TU0A 3FATA 4MLVA 5DVIA 5AA3A 2V25A 2VD2A 2I48A 1O7TA 3OO8A 2R9JA 1O63A 1PBQA 3EPEA 5CMCA 3TTKA 4OHNA 3S9MC 4OTEA 1S50A 1MY0A 2LAOA 1EZOA 4U2RA 1TWYA 4OFOA 1ANFA 3MAMA 3W9WA 2HCAA 2F7BA 3OSRA 1Z7NE 4ELRA 4R9GA 4GD5A 1POY1 3VDFA 3C32A 5KDTB 3TQLA 4RY1A 2OWSA 1QVSA 3Q26A 4R9FA 5F1QA 2DSFA 3HO7A 3N5LA 3L6GA 2ZYKA 1B7HA 3MZ1A 4R6YA 3TTNA 4ECFA 1GV8A 1SDXA 3FIRA 3T9XB 2NVUB 3EHUA 3M3FA 4HS7A 4F1YA 3VFJA 1UIVA 1P1UA 3O29A 3VVFA 4LONB 1FTLA 2RF1A 2H98A 1RYXA 3V83A 2RC9A 4QFPA 1B05A 1H44A 4JB7A 1QKAA 4LUBA 5CI5A 3G3GA 4ISUA 2WKYA 1BP5A 4PFWA 2KLFA 4DCXA 1H45A 4AB6A 1DOTA 5L9MA 3SETA 3F11A 2GH9A 1B51A 5EHMA 1R9LA 1NNPA 5H8NA 4QFNA 1QKBA 2F78A 1A40A 3H06B 3O6IA 3CR9A 4F2OA 1NFTA 5AA1A 1M5CA 5I59A 1AOVA 4Q8RA 1LSTA 3A09A 4U23A 3K6XA 4U22A 1L5TA 1R6ZA 5TPAA 1H3DA 3LR1A 4YMBA 4K3FA 4GLIA 3IB2A 4OFLA 3FUZA 4ZEBA 1POTA 1IXIA 1FQEA 4G68C 3G7WA 3C33A 1PEBA 1B0HA 4OERA 3OO9A 3LSXA 1ZBMA 4DDDA 2XXPA 1PB8A 2DYXA 3LBSA 3TPAA 2XX7A 1GR2A 4F3PA 1MXZA 2Z23A 2H99A 1R1NA 3DP4A 4G8NA 3KG2A 4IO3A 3I3VA 1LB9A 3MVZA 3T96B 4YKJA 3RUMA 3FXQA 4QSEA 1KWHA 2E1SA 1Y9UA 2OLBA 3T93B 1TXFA 5CMKA 1Y3NA 2Z22A 4F18A 5I2NA 3S9LC 4BLAA 5BWJA 1SI0A 2O6AA 3QXMA 3TODA 1I69A 2F7AA 1URGA 5CMBA 5DYHA 4KCCA 4N13A 4OEUA 4G2ZA 1HSLA 1Y1MA 1Y4CA 3KZGA 4HCYA 3OO7A 5HM4B 1NNFA 2I58A 1JW4A 2XXHA 1RKMA 4EUOA 3T9UA 1DPPA 3V8XB 3WAEA 1P99A 2ONKE 5H8QB 1NH7A 1SVXB 5KCJB 3FXRA 3O28A 1B46A 1YCJA 2XXYA 1XOCA 2QS2A 3S9NC 5CC2A 1M5BA 4P11A 3TEPA 3PUZE 1A54A 3AXFA 4YKIA 3H6VA 3K6UA 3HV1A 3ZKKA 3O6GA 4E0WA 4HW8A 2F7CA 3GXAA 4GXAA 3OENA 3TZAA 4AQ4A 2HAVA 4H65A 1MH3A 4O3BA 3S4UA 2F8DA 4QSDA 2FA7A 4R2FA 1IXCA 1MQIA 2AYSA 4G68B 1FTKA 1BIYA 3B6TA 1N3WA 1B4HA 1B5HA 3OMBA 2I3VA 3ZKLA 4NE4A 4UA8A 1B3EA 1SBPA 1N0TA 4ZE8A 2VGQA 4OENA 4R73A 1D3KA 2B3BA 3U72A 1OMPA 3VE1B 1B40A 1B2HA 4BDRA 4GQOA 1I6QA 2PYYA 4M4GA 4TLMB 1A7LA 4Q0CA 4XTCQ 3LUYA 4JWOA 1EH3A 1D4NA 2W7YA 2AL5A 3C9HA 4R72A 2PX1A 2G93A 3R6UA 3SEYA 1J1NA 1NKXA 2F5XA 3BFUA 1FQDA 5DVFA 1JVYA 4ONYA 1QJMA 4G8HA 4LZ8A 4GIZA 1B7ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HPIA 5AA4A 4R6HA 4P3LA 4FAJA 4F22A 2CZKA 1SI1A 4ELQA 5I5PA 4N8YA 4GRKA 3RGYA 4OVSA 3BBRA 4P0IA 1WDNA 3LSFB 2HFBA 3ZS6A 3DLNA 3VXCA 2HPGA 3IORA 3H6UA 1MY3A 5FTIA 1B3LA 2DP8A 4GVOA 3TTRA 3KC0A 1T0KA 2DVZA 4DE8A 3HN0A 4YKPA 4DXUA 5ICQA 4G8MA 4RPNA 4IO2A 3Q25A 5F7VA 3PPOA 2OJTA 3FJMA 3UA8A 2QJEA 3MSTA 5A5XA 3KFMA 3UIFA 3K00A 3M8UA 1Y4TA 4FEBA 2WX9A 4G77A 4NF5B 3RT6B 1UTHB 2P2AA 4KYDA 3FVGA 4YB6A 5BUUA 2L5VA 1ZU0A 1EYKA 4LVQA 1Q1KA 4N91A 2Q2AA 2B65A 4R2BA 1II5A 3Q27A 5CBRA 3RN8A 1SW2A 1B3GA 3ZSFA 4PFTA 2DWJA 4GWOA 5JTYB 1ZJLA 1MQGA 2HAUA 4ZDMA 4DI3D 3SEWA 3K6VA 4N4UA 1R9QA 3EN3A 3RPWA 4P56A 2HHMA 4F39A 4IY5A 5I56A 4NF6B 5ESYA 4FJPA 1LBZA 5FHOA 3PMWA 4AS5A 3CSGA 1PDAA 5IAIA 1FW0A 4GL0A 3WAFA 3G3JA 4DXBA 4QFLA 3B7DA 2OX3A 1B58A 2V84A 3O9PA 4U4SA 3RTWB 4F2QA 4GX3A 4M1VA 4IB2A 2G29A 5EYFA 4H5FA 3IR1A 4E0XA 3FJ7A 3T22A 3JV9A 4NHBA 4PETA 2CMOA 4LQ5A 4QF9A 4RK9A 1MY4A 2H5YA 3OSQA 3IJXB 4WKMA 2F97A 2B3FA 1USYE 2V93A 2ZNTA 1I6AA 3CSBA 2A5TA 4YKKA 3LC8A 4F3GA 4DI4B 1MPCA 1N7XA 1UTBA 2R8TA 4QRZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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