1FQAA

Structure of maltotetraitol bound to open-form maltodextrin binding protein in p2(1)crystal form
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
AIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding protein
molecule keywords MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
publication title Crystal structures of the maltodextrin/maltose-binding protein complexed with reduced oligosaccharides: flexibility of tertiary structure and ligand binding.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 125
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqaA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqaA01
2F78A 4DCYA 1SBPA 3DP6A 1SW2A 4EUOA 3TEPA 2DXYA 4C0RA 1Q1KA 2VOZA 3DP8A 3N6TA 3T66A 1N3XA 5CBSA 4PFYA 4EXKA 3V8XB 1FQCA 4KYDA 4RNSA 3KGCA 1MQJA 4OHNA 3R26A 5B7DA 3C34A 5TP9B 3K6WA 3M3FA 2O69A 3HSTA 3CFXA 4M4GA 5AA2B 3HHFA 1MQIA 2XXYA 4YB7A 5TPAA 4I9DA 1DSNA 3OELA 1PEBA 3EN3A 5J1DA 4OENA 3JYRA 2XXVA 3FXUA 1SW1A 2F7BA 2PYYA 2Y7KA 3PU5A 3OSQA 3FVOA 3RUMA 3MVYA 4EQ9A 1Y3NA 4DLDA 4F3SA 4ESXA 5DT6A 2VD2A 3VXBA 5DTBA 2D3IA 2P2AA 3B6QA 1P99A 5DYHA 1NNKA 2UVGA 1BIYA 3KN7A 2PVUA 1FQAA 2QPQA 4HS7A 3MVZA 3RN8A 1H45A 5ITPA 4U22A 3OO9A 1Y1MA 1Y4CA 2R6GE 5EYFA 3S4UA 1FQFA 5AE4A 3IOUA 3K00A 4R9GA 4UACA 4NWCA 1N3WA 4QFPA 1JVXA 1XVYA 4OESA 1ZBMA 4OXVA 3O6IA 3I6VA 1AMFA 1SI0A 2F5XA 4BDOA 2RF1A 1R6ZA 1O7TA 1Y4TA 4YICA 2F34A 3G3KA 1B3HA 3ECRA 3EHTA 3FZVA 3VVDA 3K2DA 3HV1A 3RTWB 1B4HA 1UTHB 1OVBA 4BDMA 1JQFA 3MVWA 3FUZA 3KSJA 2E1SA 3IOVA 1AOVA 2VGQA 1AH5A 3FXRA 4RK2A 1TXFA 3RTFB 4OTEA 2OJTA 3C36A 1MRPA 4RPOA 1B40A 3UK4A 2G29A 2HXWA 2FA7A 1CB6A 3EQ1A 1B0HA 1O63A 3S9NC 2OLBA 3IB0A 1B3LA 3TQLA 3H03A 1URSA 4JWOA 5KDTB 3T9VA 1JEUA 1B1HA 1BP5A 1N84A 2XXHA 4FE8A 2I3VA 1R9QA 3OEKA 3AXFA 1DOTA 3O97A 1M5BA 2H25A 1NKXA 2ZXTA 3OO6A 3USDA 1FTMA 4X1DA 1IITA 3U72A 3ILTB 1Y1ZA 2V25A 1WVJA 4NF4A 4R2BA 2HZKA 4ELRA 3EHSA 2R9JA 2QS1A 5HM4B 5ELVA 3CFZA 3MZ9A 1ZLQA 3WAEA 1B7ZA 2HFBA 2Y7WA 4IO4A 1SI1A 4ZE8A 3TTLA 4POWA 4N13A 1B0LA 5BUUA 5ITOA 4NF6B 2QS4A 2ZNTA 3ZSFA 1M5FA 3WAFA 3T96B 4BDLA 3TUSA 5I2KB 1P1QA 4ELOA 5H8HB 3W9VA 4PFTA 4U1ZA 2Z23A 4KPTA 1IXCA 2B3FA 3RT8A 3TTKA 4O3BA 2I4BA 1A99A 2A5TA 1MS7A 4F2QA 2DE2A 4OWDA 1DTGA 1MY2A 3IORA 3FJMA 2ONKE 4GWOA 1FTJA 4FEDA 1YPNA 1SD3A 1N04A 1NH7A 4LVQA 2NUVA 4BLAA 1LGBC 1TWYA 2HQ0A 4YB5A 5CI5A 3EHUA 1DTZA 1JETA 3K0VA 1B5IA 2Z8DA 1B2HA 2RCBA 4LQ5A 3V5AA 1P1NA 4MBPA 3T9XB 4TOZA 3Q26A 1B3GA 3KFMA 3K1MA 3TFLA 4I62A 3TPAA 2VD3A 4YZZA 3T93B 3K6VA 3QIMA 4F3PA 4MH5A 1MXXA 2UYFA 1QKBA 4M1VA 1SYHA 4TLMB 4IO7A 3LSXA 4H65A 1S50A 4ZDMA 1B52A 2UVIA 1BTJA 5LOMA 3RY3A 3ILUB 2GH9A 2GFEA 1SDXA 3FIRA 5AA1A 1OIBA 4EQBA 1YTVA 1MY3A 4HCWA 4OFOA 3H7MA 4N07A 4ZE9A 1MPDA 3THIA 4R6HA 4U4XA 3IOTA 1MY1A 2Y7IA 3U1OA 3MPKA 4GLIA 3U94A 4JSOA 4YB6A 1MXYA 4H67A 3SEVA 1PDAA 4HTGA 4FATA 4PQJA 3TKDA 3N5LA 4GFRA 4OETA 3UIFA 2IA4A 3W15C 3MP1A 3IR1A 2Z22A 1Y9UA 1FQBA 2DE3A 1YCJA 4LONB 1KWHA 3O9PA 2Q89A 2P1SA 4K3FA 4DDDA 1BLFA 1XOCA 1EH3A 5K2YA 4N6PA 5I56A 1MXWA 5I58A 1ANFA 4KFQA 3CG3A 3KJ7A 3SEXA 2OK2A 4G68A 1BKAA 4OZ9A 2OZZA 3KOTA 4NMYA 5KCJB 5IAIA 4AB5A 3OO7A 2D21A 2DVCA 2XXPA 1MPCA 3I5OA 4XKPA 3SERA 4ECFA 4OMBA 1CE2A 3RNNA 1FTLA 3JV9A 3H3GA 2QSXA 3IO6A 2I0BA 4ELPA 4KI0E 4C1TA 4HW8A 4KR5A 3U93A 4H8IA 1MQDA 3G3HA 4F19A 1MY4A 1QVSA 1PB9A 3PV0E 2Q2AA 4QFLA 5ISUA 3QAXA 4GVOA 1MQGA 1UIVA 3ONMA 3FATA 4P0GA 4DXUA 5JTYB 4EF1A 1H3DA 3JZJA 2DWAA 4IY6A 3QUFA 3L6HA 4G77A 2NWJA 3F11A 2DWHA 1H44A 4F31B 3OD7A 3PPPA 3Q28A 4U1OA 3G3IA 4RJZA 3V89B 1P1OA 3CI8A 3VFJA 3CR9A 4ZEBA 2GHAA 2QJEA 1LLSA 3Q29A 1A8EA 1D9VA 5CM6A 4YMAA 5ICTA 2XX9A 1LCTA 4IY5A 4F2OA 3KOSA 4QSCA 1ZJLA 5L9SA 2YLNA 3IOWA 3E13X 3UA8A 4GF8A 5CRYA 2XXQA 2QMXA 4DIGA 3TCHA 1IXIA 3V83A 2ABHA 5H8FB 4F18A 4E0WA 5EHMA 4LP2B 1OLCA 3FGSA 3S9LC 1NL5A 2W7YA 4PE5B 4X48A 2QRYA 4OFJA 3QXMA 4EQ7A 3DM0A 4R72A 4NF4B 2DE4A 1NMUA 5I2NB 3Q27A 2OBGA 1DPEA 4JBZA 5I84A 3ZKKA 4AQ4A 1TT1A 3A09A 3CFLA 5I59B 3OSRA 3IJXB 3KN3A 2THIA 3IL1B 4NF5B 3S9MC 3MUQA 2I3WA 3TTMA 4BDNA 4UA8A 2O1MA 4LUBA 1Q35A 4IO3A 4HCYA 5CC2A 3CSBA 4DE8A 5B70A 1R1NA 1B9JA 4RA1A 4QSEA 1IXGA 4F29A 4G68C 1I6BA 3T22A 1FTOA 2Q88A 3PD9A 3RPWA 2A5SA 1OVTA 3PUXE 5KZTA 3D4CA 1FW0A 3PPQA 4JWXA 4FORA 4IO6A 1TFAA 1MQHA 1QUKA 3C9HA 4KD5A 4F3GA 4YMBA 1B4ZA 3MC2A 3RT6B 3QSLA 2E0SA 3MAMA 2FNCA 1FCKA 4NE4A 2G93A 3PUYE 3PPOA 1LCFA 4LZ5A 3K4UA 2XXTA 3S2VA 2ALUA 2O51A 1OMPA 5A5XB 1IZ1A 5TP9A 3S9EA 3PPNA 2DWIA 2ZYOA 5AA2A 2PT2A 5L9OA 3GLBA 1N76A 2D5WA 3RGYA 3VDFA 3ZS6A 2YJPA 4BDRA 2F6GA 2F36A 2OWTA 4L17A 4XTCQ 1MM7A 1H76A 1XVXA 2PT1A 1A40A 4P0IA 4R75A 1B6HA 3O29A 5DVJA 3TQWA 1JNFA 3KG2A 1P1UA 5JK4A 4X1BA 5FTHA 2Y84A 4F39A 1UTBB 3FJGA 4ZEDA 4FJPA 1FTKA 1EZOA 5CMCA 3UP9A 2HAVA 1USYH 2I58A 3C35A 1AIVA 3DELB 2HEUA 4NWDA 4WXJA 2O1LA 4PFWA 2RC8A 3SEYA 4TLLB 4X9TA 3PMVA 2PMSA 1A54A 2REGA 2DVZA 1QJMA 1MDP1 1USYE 4Z0IA 3IAZA 4OERA 3GXAA 3KEIA 1POTA 2DOJA 1B32A 4R2FA 4LA9A 3PMWA 4ZZAA 3IK6B 3MW0A 4LATA 1UTHA 1ZU0A 3EPEA 1ZIUA 2RC9A 5AA4A 2DWJA 3LSWA 3FVNA 1MH3A 2XHDA 3TZAA 3GBBA 5I58B 1HSEA 3K01A 3HN0A 1LFHA 3E4RA 4C1UA 1RKMA 3ODBA 3PD8A 2LAOA 1M5CA 2Z8FA 1NNPA 3U8QA 5H8QA 5H8NB 4JDFA 1UQWA 2AYSA 3CSGA 2RINA 2P0SA 1LB8A 2UXAA 2XXXA 3FV1A 3W9WA 3MZ1A 2QS2A 1HSLA 1XT8A 4R74A 1M5DA 4P11A 3A3CA 4PETA 5F7VA 5FHMA 5KDTA 4R73A 3KBRA 5H8SA 2DXRA 5FTIA 1GR2A 1PC3A 4RXLA 1GV8A 5IKBA 2QS3A 3O66A 3D4GA 2UVHA 2XX7A 4U23A 1IXHA 3O6HA 2Z8EA 3SEUA 2XXRA 4IGTA 4JWYA 4Q8RA 1YAEA 2F7AA 2HCAA 5FHOA 2F6PA 1LAFE 1PBPA 4O3CA 4OYVA 3LSFB 2ZMBA 4XXUA 4G8HA 2H5YA 5I57A 3M8UA 3PUZE 3R7XA 4G2ZA 2DS9A 1GVCA 3M3KA 2NVUB 2VP1A 3BFTA 4I8CA 2ONSA 4OFLA 4F1YA 2R71A 3K02A 5DEXA 3CVGA 4GXSB 2ZNSA 3T9UA 3MZBA 4NF6A 3G3FA 5TPAB 3I3VA 3MJNA 4I1DA 3SKPA 2O84X 5I2KA 3TMGA 3MWBA 3G3GA 4RPNA 3P7IA 3PUVE 3R6UA 4WEDA 4MF3A 4JSDA 1Y3QA 4NF8A 4ZEKA 3N6UA 4R6YA 4QSDA 3VV5A 4BDQA 2H9BA 1B05A 3VVFA 3VLWA 4FIMA 2H98A 1ELJA 4H0WA 2VHAA 4WKMA 2RCAA 2H99A 1M5EA 3PMXA 2I49A 3H6TA 4H1XA 1DPPA 4ZEFA 5DVIA 2AL5A 1B58A 1B51A 2DSFA 1ZTYA 2I48A 2ZNUA 1SQYA 4F3BA 3VXCA 2Q9TA 4Z7EA 1J1NA 3L6GA 4LZ7A 4IGRA 2OWSA 5ICQA 2WKYA 3T9HB 4H8JA 1QKAA 4XIGQ 4PP0A 1IUDA 2HZLA 2UYEA 5AA3A 4GRKA 3TODA 1I6QA 4EXLA 3Q25A 2HAUA 1B7UA 3SESA 1GTKA 4DXCA 2CZLA 1VE4A 4QF9A 4XKNA 4AB6A 1US4A 1MPBA 4OQOA 4KHZE 1IQ7A 2Y7RA 4WEPA 3SDFA 1NH8A 1MH4A 4KCDA 3TTRA 2M8CA 3KZGA 1O64A 4IO2A 1MXVA 3QYTA 1S7YA 2XXUA 4RY1A 1XC1A 4Q5TA 4ELQA 3OXNA 3PPRA 5L9MA 3DP4A 4RYAA 4GQOA 1RYOA 3HCQA 4ZECA 4LZ8A 1XS5A 3GBAA 3KN8A 4QRZA 2GHBA 4F1UA 1NNFA 3MQ9A 4ISUA 4THIA 1Y20A 2XXWA 2V3TA 1LFGA 5KCJA 1II5A 2ANJA 3N94A 2OCUA 3TELA 4GD5A 1A55A 2X7QA 2O7IA 1URGA 1ZKBA 1MY0A 1SW5A 3LSLA 1URDA 5L8DA 2I0CA 4R6KA 5K2XA 5CMBA 1P1WA 4ZZEA 2Y7PA 3FD3A 3BBRA 2I4CA 3C31A 3IX1A 2PX1A 1Y3PA 2A5TB 1UIUA 4YU0A 5JTYA 2F8DA 4KCCA 3HO7A 4QFKA 3IB2A 1LAXA 4GL0A 2BJJX 3IO4A 5AA4B 2ESNA 3CRBA 1QW0A 5FHNA 1OLAA 2XD2A 1I69A 3RLFE 1OQGA 1ATGA 3C32A 1GGGA 4DCXA 1B46A 4Q0CA 3TCFA 4POXA 5H8QB 3DLNA 3LBSA 4GIZA 3HHGA 1D9YA 3VLVA 4GOTA 4DXBA 1WDNA 2AIXA 2DP8A 3B6WA 1LFIA 3K1NA 4H5GA 1PB7A 1N7XA 4MLQA 5JEIA 5TU0A 3VE1B 2V93A 5H8FA 3FV2A 5CMKA 1I6AA 3HPIA 4FECA 4H6DA 3VVEA 3BKIB 2KLFA 1B1XA 3MP6A 3SEWA 1MXUA 1S9TA 3TCGA 3LR1A 1POY1 3TYHA 5M2VA 1L5TA 1IIWA 5I2NA 4GL8A 3O6GA 4U21A 5I57B 4PFUA 2B3BA 5BWJA 4H5FA 5I59A 1B5JA 4YAHX 3PGFA 1TFDA 4YKIA 1MXZA 4MLVA 1N0TA 5DEXB 1LAHE 3K6UA 4EDPA 4XKRA 4NF5A 1B7HA 1NFTA 3H06B 4R9FA 4NEDA 3MVXA 3K6XA 3BFUA 2X26A 3G3JA 1HSJA 4TQUQ 2F35A 2FYIA 3MP8A 4G4PA 3OMBA 4O3AA 3H4ZA 2ZYNA 1JW5A 5CMMA 4NF8B 2NOOA 1MM6A 3ZKLA 4YKPA 3OOAA 1IEJA 3M3LA 5I56B 5DVFA 1A8FA 1D4NA 1NNTA 1QULA 4XKQA 4FAJA 1VFDA 3U92A 4G68B 3OO8A 1JEVA 1F9BA 2RC7A 2F97A 5F1QA 4Q30B 3TDJA 2O7UA 3UORA 2O6AA 3FVGA 4ND9A 4QFOA 3GZGA 1PBQA 5A5XA 2XX8A 2IEEA 3UN6A 1JW4A 3FVKA 2YPNA 2F7CA 2XD3A 3G7WA 1RYXA 4JB7A 4FEBA 2V84A 4OEVA 1AL3A 2O68A 2DQVA 3CIJA 3QK6A 2Q8JA 2V3QA 1ZMGA 1LBCA 4YKKA 3N26A 3SETA 4NTLA 3FXQA 4U2RA 1T0KA 4E0XA 2H4IA 2REJA 1SW4A 3C33A 4ZEIA 4IB2A 1JW1A 4IO5A 4QHQA 3FJ7A 3E3KA 3K1PA 1R9LA 1EZ9A 1FQEA 1QUIA 4KYSA 1N7WA 3EF7A 2RKMA 5HBCA 4KYEA 1XHYA 1MDQA 3UGWA 1UTBA 2QL3A 3IJOB 1Z7ME 4ESWA 1B3FA 2ZYMA 3MPLA 4MFIA 3B7DA 1PB8A 1SVXB 2UVJA 3PUWE 2GRVA 1VFEA 2QMWA 2ZYKA 2X7PA 1SYIA 1H43A 4F1VA 3CG1A 5H8HA 3KJTA 1US5A 4YKJA 1JVYA 5AA2D 4RK9A 1MG1A 3RQTA 4F22A 1WODA 2V3UA 1A7LA 3OENA 3FASA 1EZPA 3KSXA 4OEUA 1FQDA 3QUJA 2DYXA 1B3EA 1LBBA 1VR5A 3O28A 2NXOA 3LC8A 1B5HA 1EU8A 3A3UA 2XXIA 4GXAA 4G8NA 3H6WA 1D3KA 4ZS9A 3MBPA 3H6UA 2B65A 4G8MA 3B6TA 3O2AA 5HPQA 4JXIA 2ONRA 2PBWA 1Z7NE 4DZ1A 5CBRA 5H8NA 4ONYA 1LB9A 3OEMA 4LQ2A 4KQPA 3H6VA 4U4SA 1OQHA 1DMBA 1VSOA 1QUJA 3TAJA 3TTNA 1LAGE 3VLUA 4EF2A 2CMOA 3C4MA 2Q2CA 4OVJA 1LSTA 2I6EA 2AL4A 4QFNA 3E9XA 5EHSA 3LUYA 3IB1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2F78A 5IZ3B 3LV0A 4DCYA 1SBPA 3DP6A 1SW2A 4EUOA 3TEPA 5DW8A 2DXYA 4C0RA 1Q1KA 2VOZA 3DP8A 4QBAA 3N6TA 3T66A 1N3XA 5CBSA 2CZKA 2MKZA 4PAKA 4PFYA 4EXKA 3V8XB 1FQCA 4KYDA 4RNSA 3KGCA 1MQJA 4OHNA 3RPLB 3R26A 5B7DA 3C34A 1K9ZA 5TP9B 1FPGA 3K6WA 3M3FA 2O69A 2Q74A 3HSTA 3CFXA 4M4GA 5AA2B 3HHFA 1MQIA 2XXYA 4YB7A 4PDDA 5TPAA 4I9DA 1DSNA 3OELA 1PEBA 3EN3A 5J1DA 4OENA 3JYRA 2XXVA 3FXUA 1SW1A 3D1RA 2F7BA 2PYYA 1LEVA 2Y7KA 3PU5A 3OSQA 3FVOA 3RUMA 3BIHA 3MVYA 4EQ9A 5LTCA 2P3VA 4XF5A 1Y3NA 4DLDA 4F3SA 4GX4A 4ESXA 4PFIA 5DT6A 2VD2A 3VXBA 5DTBA 2D3IA 2P2AA 3B6QA 1P99A 5DYHA 1NNKA 2UVGA 3KBZA 1BIYA 3KN7A 2PVUA 1FQAA 2QPQA 4HS7A 5J16A 3MVZA 3RN8A 1H45A 5ITPA 4U22A 3OO9A 1Y1MA 1Y4CA 1FPLA 2R6GE 5EYFA 3S4UA 1FQFA 5AE4A 3IOUA 3K00A 4R9GA 4UACA 2JJKA 4DI4B 4NWCA 1N3WA 4QFPA 1JVXA 1XVYA 4OESA 1ZBMA 4OXVA 3O6IA 3I6VA 1AMFA 1SI0A 5ET7A 2F5XA 4N15A 4BDOA 2RF1A 1R6ZA 1O7TA 1Y4TA 4YICA 2F34A 3G3KA 1B3HA 3ECRA 3EHTA 3FZVA 3VVDA 3K2DA 3HV1A 5I5PA 3RTWB 4MNIA 1B4HA 1UTHB 1OVBA 4BDMA 1JQFA 4N81A 3MVWA 1FBGA 3FUZA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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