1NMUA

Mbp-l30
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
368
structure length
368
Chain Sequence
EEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTNSSS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Inherent Protein Structural Flexibility at the RNA-binding Interface of L30e
pubmed doi rcsb
molecule keywords maltose-binding periplasmic protein
molecule tags Sugar binding protein/ribosome
source organism Escherichia coli
total genus 122
structure length 368
sequence length 368
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-01-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nmuA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nmuA01
1B4ZA 2Y7WA 3B6QA 3T9XB 3Q25A 1LGBC 2Y7KA 1BLFA 1WVJA 3KSXA 4O3CA 3LSXA 3TFLA 4IB2A 4Q30B 1MM7A 4ZS9A 3W15C 1PB9A 1IITA 1I6QA 5H8SA 3RGYA 2PT2A 2OLBA 3O28A 3O66A 1GTKA 1MH3A 5TPAA 4TLLB 3RQTA 2CMOA 3IOUA 3IAZA 1A7LA 2QRYA 1MH4A 1MPBA 4YKIA 5AE4A 3MZBA 3CR9A 1GV8A 2I4BA 2HEUA 3ZSFA 1XS5A 4NEDA 1AH5A 4H1XA 1JQFA 4OWDA 4Z0IA 1AMFA 3K4UA 3SKPA 5L9MA 3OENA 3OO6A 3BBRA 3PMWA 1NMUA 2ZMBA 3RT6B 2IEEA 1B0HA 5ISUA 3CG1A 3FJ7A 1B51A 1URSA 4I1DA 3Q27A 4P0IA 1ELJA 1AOVA 2O6AA 4PP0A 4YKKA 3MVXA 3V83A 2B3FA 3PUVE 4H8IA 4GXAA 4G68C 1ZIUA 5F7VA 1LLSA 4U2RA 1BTJA 5K2XA 3PUZE 1D9VA 1TFDA 5EYFA 4KYSA 3VLUA 1B3EA 5TP9B 3TDJA 4IO6A 4ELQA 5H8FA 2H4IA 1P1QA 2ONSA 3TQLA 3ILUB 4RPNA 2O7IA 3G3GA 3CG3A 3USDA 2ZXTA 3MZ9A 5L9OA 2DWHA 3K6VA 1P1UA 3B7DA 4KYDA 2OWSA 4YMAA 3AXFA 1MY0A 4R6KA 1EZOA 1SW4A 5F1QA 4GL8A 4RY1A 2ZYMA 3UGWA 4MLQA 1USYH 4BDQA 4IO7A 1UTHA 2THIA 4DCYA 5I56A 5AA3A 1NKXA 4I8CA 4QSDA 4Z7EA 4R74A 2V84A 2HZLA 1B1XA 3S2VA 2AL4A 4DE8A 4U22A 1QUIA 1EH3A 4IY6A 5FTHA 1LAGE 3M8UA 1B05A 1MDP1 2Q89A 5JK4A 1HSJA 3BKIB 1B6HA 2I6EA 5KDTB 3Q28A 4G8MA 1SYIA 4DLDA 1LAFE 4RA1A 4WEDA 3DLNA 2DWJA 4LUBA 1GR2A 4P0GA 3KOSA 1R9LA 4U4XA 2DWIA 1EZ9A 3FXUA 3IOVA 4E0XA 3OOAA 2M8CA 2XD2A 4BDMA 3RPWA 4KCCA 3MWBA 3D4GA 1XVXA 1SBPA 3S9NC 5CMMA 3C35A 2H98A 4OXVA 4R9FA 1Y9UA 2W7YA 1OQHA 3E4RA 3FV2A 3SESA 3GBAA 1VE4A 2R9JA 3G3IA 1B3LA 4F1UA 2QL3A 2AL5A 3H6TA 3VXCA 1FQFA 1S50A 2Z8FA 2UVJA 2P1SA 5DT6A 2ABHA 4GXSB 4EUOA 3PV0E 4ISUA 1OVBA 4QSCA 2F7CA 3GZGA 4NF5A 5FHNA 1B0LA 4NWDA 4BDLA 2F36A 4KFQA 4DDDA 2REGA 4KHZE 4QFKA 3MQ9A 4EF1A 3KFMA 5I57A 4NF8A 4GL0A 5BWJA 1CE2A 3PD8A 3QIMA 1ZLQA 1MPCA 2NXOA 1D3KA 4NTLA 4JXIA 4EXLA 3MP6A 5DVFA 5AA2D 3O6GA 4NWCA 2UXAA 1JVXA 1POY1 2ZNTA 3VVEA 2NWJA 2O69A 5LOMA 4MFIA 4IO4A 4NF4A 5AA4B 5I59B 4PFWA 3EHSA 3EQ1A 2NUVA 1T0KA 2RCBA 4XXUA 1ZMGA 4YB6A 3PUYE 4QFLA 4JSOA 2DXRA 1FQBA 2RF1A 3UORA 4EDPA 2NOOA 2XXRA 3OXNA 3IB0A 4H8JA 5I58B 2AIXA 3EPEA 3TMGA 1MQHA 2XXIA 2E1SA 1MY3A 4F1YA 2DQVA 1JETA 3WAEA 3LSLA 2O7UA 1OVTA 1R1NA 1H44A 4POXA 3W9WA 3H7MA 2LAOA 1SD3A 2VGQA 1UIUA 4F2QA 3O9PA 3T9UA 1DPPA 1MQDA 5CI5A 3DM0A 4IO3A 2RKMA 4XKQA 3MVWA 4GFRA 3I5OA 2AYSA 4LZ8A 4LA9A 3HN0A 4JWXA 4EF2A 3FXQA 1MQIA 5KCJB 2XX9A 3VDFA 2FA7A 2O84X 3R26A 2I0CA 3C31A 5DTBA 2QS4A 1ATGA 3CFXA 1JW1A 2VP1A 1B3FA 4HTGA 1A54A 1FTOA 2O1LA 4PFYA 3PPOA 3JV9A 3RN8A 4LQ5A 2I0BA 4AB6A 4QHQA 1POTA 2V3UA 3VVFA 1D9YA 3PPQA 4ECFA 2YPNA 3S4UA 1LSTA 4XKNA 3KGCA 4G8HA 4GVOA 4O3AA 4OFJA 3FVNA 3FGSA 4U23A 5I2KB 1LFGA 3RLFE 3IJXB 1PB8A 1TXFA 5CMKA 4ELPA 2D3IA 1PDAA 4F39A 2V93A 2X7QA 2DOJA 1US4A 1SW2A 2XX8A 3K0VA 1I69A 3CSBA 1NL5A 4R9GA 4H5FA 2I3VA 1MXXA 4RJZA 2I48A 1US5A 2PYYA 3K1NA 3K6XA 3CIJA 5ELVA 1CB6A 4MH5A 1IXCA 1FTJA 3U93A 5ICTA 2A5TA 2B3BA 4F1VA 3A3UA 4IO2A 3C9HA 1XOCA 2R6GE 1B4HA 1N76A 3IOWA 2ANJA 3ECRA 4GWOA 2ZYKA 4WKMA 4YMBA 4LZ7A 1YCJA 3Q26A 3OEMA 3TQWA 1MXYA 4FAJA 1IQ7A 4X9TA 1JNFA 1ZTYA 1UTBB 3FIRA 3FXRA 4F3GA 1D4NA 1B5IA 3TTNA 3QAXA 4JDFA 4N07A 1MQJA 4BDOA 4DIGA 2F7BA 3UA8A 4PFUA 2ONRA 2Z8EA 5CBRA 1P1NA 4ND9A 5DEXA 1WODA 1Y1ZA 5CBSA 2OZZA 4YICA 2DYXA 1B52A 1MXWA 4I9DA 2DE3A 3ODBA 1EU8A 3K6UA 5H8QB 3IR1A 4UA8A 1BP5A 1Z7ME 1ZKBA 1M5DA 4U4SA 1LAHE 4RXLA 1SQYA 2DVCA 4NF6A 3DP4A 3ZS6A 4OESA 5H8HA 2FYIA 1QJMA 3M3FA 4F18A 1YAEA 3QUJA 2ALUA 1YPNA 5I2NA 1XHYA 1YTVA 1FTMA 3HSTA 2RINA 3G3JA 1B3HA 4OZ9A 2GH9A 2UVIA 5DVJA 4LATA 3KEIA 1MRPA 5CM6A 4G68B 4FE8A 3RTWB 4FORA 3N26A 4OHNA 1L5TA 4X1BA 1IZ1A 1J1NA 4GIZA 3IO4A 3GLBA 1NH7A 1RKMA 4DZ1A 3LSWA 3S9LC 1OMPA 3EF7A 5TU0A 3L6HA 3QXMA 4KQPA 2I4CA 5CMBA 3TTMA 4MLVA 3E13X 1Y3QA 5H8NB 5AA2A 5A5XB 3KJTA 4DCXA 3TYHA 3U92A 4OEUA 3FVKA 2R71A 2Y7PA 3ILTB 4PFTA 4XKRA 3H06B 2HAUA 4E0WA 2ZNUA 4GF8A 5DVIA 4LP2B 2H9BA 3LUYA 5FHOA 4KD5A 1MS7A 3K1PA 2DWAA 3VXBA 4FIMA 2XXHA 4RYAA 3FVGA 5JTYA 1MPDA 1M5BA 3TELA 2GHBA 4GD5A 1BIYA 1QUKA 2O51A 3K6WA 1LAXA 3PPNA 3PUXE 2PVUA 4G4PA 1MXZA 3IB2A 4BDRA 1QKAA 1IXHA 3KZGA 2VOZA 3C36A 4QFPA 1M5CA 5TPAB 3FV1A 4OFOA 2QMXA 1URGA 3I3VA 1B5JA 1DOTA 1FQAA 3N6UA 2B65A 1B32A 1OQGA 1FW0A 4F31B 3MVYA 4HS7A 2PX1A 2QS2A 3U94A 4H65A 2DS9A 3U8QA 1USYE 1ANFA 1LBCA 4HCWA 5ITPA 1II5A 4GOTA 5HM4B 3MBPA 2QPQA 4G8NA 1O7TA 3IL1B 1LCFA 2F6GA 3P7IA 4OYVA 1B1HA 1H45A 3VE1B 4ZE9A 1MY2A 3H6VA 3CI8A 4R73A 4KPTA 4F3SA 1FQDA 3S9MC 1MXUA 1O64A 3G3FA 3HV1A 4EQ7A 3OO9A 1AL3A 2XXUA 3FATA 5H8HB 3O97A 3OMBA 5H8FB 1SI0A 1OLCA 3HPIA 3OO8A 2RC7A 4Q0CA 1FCKA 3IX1A 3FVOA 1GGGA 5BUUA 4R6YA 3T9VA 4U21A 4POWA 3KSJA 4H0WA 1JW5A 1ZU0A 1M5FA 3A3CA 3N6TA 1TWYA 2A5SA 3T22A 4DXCA 3V89B 1QW0A 2DXYA 5CMCA 3ONMA 1NFTA 3SEVA 5L9SA 3S9EA 2WKYA 4XIGQ 3TPAA 4JSDA 1NNFA 2XXTA 1QUJA 3RY3A 2H25A 1B46A 5FTIA 3MPLA 1UTHB 1B2HA 1MM6A 2Q8JA 4ZEFA 5I56B 4ZEDA 5IKBA 4KCDA 2XD3A 3I6VA 1Z7NE 1B3GA 1FTLA 1N0TA 4F22A 4IO5A 3PMVA 2F34A 5JEIA 4RNSA 3TEPA 1SDXA 4EQBA 3UK4A 3UP9A 5TP9A 2ZNSA 3FJMA 2GFEA 3TCFA 2YJPA 3TZAA 4R6HA 3VVDA 1A40A 4U1OA 2ESNA 2Y7RA 4YB5A 1SYHA 1ZJLA 2F97A 2XXWA 1I6AA 3V5AA 3U1OA 4IY5A 3MZ1A 2VD2A 3MPKA 1B7UA 2D5WA 1N7WA 2KLFA 4KI0E 1Y3PA 3K01A 3PPRA 2Q2CA 1B7HA 4R72A 3C4MA 4R2FA 1Y1MA 4R75A 4BLAA 4FJPA 4ONYA 4O3BA 1OLAA 4C1TA 4L17A 2RC9A 1KWHA 3T9HB 2F78A 4X1DA 4R2BA 3TKDA 1MXVA 1HSLA 1DMBA 2HZKA 1Y4CA 2UYFA 3SEXA 1A8EA 3TAJA 4NF5B 5KDTA 3UN6A 4GRKA 3D4CA 1O63A 2Z23A 1A8FA 3K2DA 3RNNA 1NH8A 1PBQA 1LCTA 3LBSA 5I57B 1I6BA 4H6DA 4NF8B 4EXKA 2X26A 2H5YA 4F19A 1LFIA 3SERA 1B58A 2RC8A 2HFBA 2BJJX 3V8XB 2QMWA 3EN3A 4OERA 5EHMA 3KN3A 3ZKKA 3FUZA 5CRYA 4ESXA 4F3PA 4C1UA 4H67A 4U1ZA 5CC2A 4YZZA 3T93B 4YU0A 1LB8A 4PE5B 2X7PA 1SVXB 2F5XA 3HCQA 1DSNA 5ITOA 2D21A 2GHAA 4NF4B 3DP6A 3HO7A 2OBGA 2HQ0A 3OD7A 1QKBA 4BDNA 3PMXA 3FD3A 1MY4A 2NVUB 2E0SA 4JWYA 2XHDA 1OIBA 1LBBA 4GLIA 1IXIA 3E9XA 1NNPA 4ZEIA 5J1DA 4FECA 3K1MA 3KJ7A 2CZLA 4THIA 1RYOA 4M1VA 3OEKA 4N13A 3TODA 3OELA 3QK6A 3H6WA 1XC1A 4QRZA 1PC3A 1A99A 2XX7A 4P11A 3Q29A 3LC8A 3TTLA 3N5LA 3K00A 4RPOA 1IUDA 4YKJA 3VFJA 3O6IA 4QF9A 4G2ZA 4F2OA 1EZPA 4AB5A 2OJTA 4OVJA 4HCYA 5AA1A 1DPEA 3MAMA 1R9QA 3RTFB 4Q5TA 1R6ZA 3IORA 2V3QA 3PD9A 2Y7IA 3O2AA 1Y20A 5AA4A 5I59A 2ZYOA 5K2YA 1P99A 4KYEA 3WAFA 4TLMB 3FASA 4LVQA 1VSOA 2XXYA 4FEDA 4LZ5A 4ELOA 3RT8A 1QVSA 2PBWA 2G93A 3FJGA 4YKPA 2QJEA 3QYTA 5I58A 1PEBA 3SEYA 4F3BA 3B6TA 2HCAA 3KN8A 1M5EA 2V25A 3ZKLA 1B7ZA 4X48A 1FQCA 3H03A 1B40A 1MG1A 1SW5A 1BKAA 4UACA 3N94A 4JBZA 4ZZEA 3MJNA 3O6HA 3DP8A 5EHSA 1MY1A 3VV5A 2DSFA 3OO7A 3KOTA 4RK2A 3C34A 3BFTA 2F35A 4FATA 3TTRA 3L6GA 3JZJA 4JWOA 4QFNA 3TTKA 5KCJA 1URDA 4ZZAA 1N3WA 1MDQA 1SW1A 1NNKA 3MVZA 1VR5A 2RCAA 4MF3A 1IXGA 4ZE8A 3R6UA 1TT1A 1FQEA 2A5TB 1ZBMA 3KBRA 3JYRA 4C0RA 3H4ZA 2IA4A 4LONB 4K3FA 3HHGA 3DELB 1JVYA 1B9JA 1AIVA 5B7DA 4ELRA 1XT8A 5I84A 4MBPA 4F29A 3G3KA 2DP8A 3G3HA 4M4GA 1N3XA 1TFAA 5HPQA 5FHMA 2UYEA 3SEWA 5I2KA 5IAIA 2VD3A 4TOZA 2XXVA 3A09A 3TUSA 3B6WA 4ZDMA 3GBBA 4OQOA 3T96B 3IB1A 1JW4A 3PGFA 4GQOA 1JEUA 5M2VA 4RK9A 5DEXB 1N84A 3GXAA 3CFZA 2Q9TA 3K02A 4KR5A 2ZYNA 3BFUA 4OMBA 1H3DA 1LFHA 4WEPA 4XTCQ 1N7XA 4H5GA 1H76A 1VFDA 2XXXA 1S7YA 3MC2A 4NF6B 3U72A 4AQ4A 5DYHA 5B70A 4PETA 3HHFA 4LQ2A 2QS3A 4NMYA 4ZEKA 2Q2AA 5KZTA 4OENA 2PT1A 4OFLA 5I2NB 2UVHA 1NNTA 3TCGA 3M3LA 2DE4A 2OCUA 3OSRA 2REJA 3SDFA 1PB7A 2O1MA 3O29A 4YB7A 2DE2A 4N6PA 4QFOA 1LB9A 3F11A 4PQJA 2HXWA 1RYXA 1UTBA 3QUFA 4OEVA 1A55A 2I58A 3MP1A 4XKPA 4I62A 1IIWA 1MQGA 1Q1KA 3CSGA 2VHAA 2XXPA 2DVZA 3KN7A 1FTKA 2Z8DA 1WDNA 3G7WA 2YLNA 3CRBA 3VLWA 1UQWA 3EHTA 3C32A 4JB7A 4NE4A 3W9VA 2P2AA 1PBPA 4OETA 3SETA 5AA2B 5ICQA 3OSQA 2HAVA 4QSEA 5H8QA 3RUMA 3C33A 3LSFB 3TCHA 1VFEA 3IOTA 2Z22A 2F8DA 4FEBA 3R7XA 4HW8A 2FNCA 3E3KA 3UIFA 2PMSA 4TQUQ 3MP8A 1N04A 1JEVA 2O68A 3IJOB 1HSEA 5JTYB 4Q8RA 4DXBA 3QSLA 1SI1A 2H99A 2V3TA 5L8DA 1Y4TA 3LR1A 1S9TA 1Y3NA 2Y84A 4G68A 2I49A 1XVYA 2F6PA 4IGTA 2G29A 1UIVA 3IK6B 2GRVA 3PPPA 2F7AA 4DXUA 1B5HA 2P0SA 3THIA 2QS1A 2XXQA 1H43A 4YAHX 1GVCA 1Q35A 4IGRA 2OK2A 3FZVA 3PUWE 3T66A 3PU5A 4G77A 3SEUA 3H3GA 4EQ9A 1DTZA 1IEJA 2Q88A 5H8NA 1P1OA 3CVGA 5A5XA 3CFLA 5HBCA 3EHUA 4OTEA 1DTGA 3VLVA 3M3KA 3H6UA 1F9BA 3KG2A 4ESWA 2UVGA 4WXJA 2OWTA 2ONKE 3MUQA 2I3WA 3MW0A 2QSXA 1P1WA 1QULA 4ZEBA 3IO6A 4ZECA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1B4ZA 2WBDA 3LV0A 2Y7WA 3B6QA 3T9XB 3Q25A 3FBPA 4PFIA 1LGBC 1INPA 2Y7KA 1BLFA 1WVJA 3KSXA 4O3CA 3LSXA 3TFLA 4IB2A 4Q30B 1MM7A 4ZS9A 3W15C 1PB9A 1IITA 1I6QA 5H8SA 3RGYA 2PT2A 2OLBA 3O28A 3O66A 1GTKA 1MH3A 5EYHA 5TPAA 4TLLB 3RQTA 1NUZA 2CMOA 3IOUA 3IAZA 1A7LA 2QRYA 1MH4A 1IMDA 1MPBA 4YKIA 5AE4A 3MZBA 3CR9A 1GV8A 2I4BA 2HEUA 3ZSFA 1XS5A 4NEDA 4MNIA 1AH5A 4H1XA 1JQFA 4OWDA 4Z0IA 1AMFA 3K4UA 3SKPA 1EYIA 5L9MA 3OENA 3OO6A 3BBRA 3PMWA 1NMUA 2ZMBA 3RT6B 2IEEA 1B0HA 5ISUA 3CG1A 3FJ7A 1B51A 1URSA 4I1DA 3Q27A 5IZ1A 4P0IA 1ELJA 1AOVA 2O6AA 4I40A 4MHFA 4PP0A 4YKKA 3MVXA 4LN5A 3V83A 2B3FA 3PUVE 4OANA 4H8IA 4GXAA 4G68C 1ZIUA 5F7VA 1LLSA 4U2RA 1BTJA 4PTKA 5K2XA 4PF6A 3BIHA 1D9VA 3PUZE 1TFDA 4GWWA 2QVUA 4N8GA 5EYFA 4KYSA 3U65A 2WBBA 3VLUA 1B3EA 5TP9B 1FJ9A 3TDJA 4IO6A 4ELQA 5H8FA 2H4IA 1FTAA 4IR8A 1NUXA 1P1QA 2ONSA 3TQLA 3ILUB 4RPNA 2O7IA 3G3GA 3CG3A 3CHGA 3USDA 2ZXTA 3MZ9A 5L9OA 2DWHA 3K6VA 1P1UA 3B7DA 4KYDA 2OWSA 5IZ3A 3AXFA 4YMAA 2MKZA 1MY0A 4R6KA 1EZOA 1SW4A 5F1QA 4GL8A 4N17A 4XEQA 1FPKA 4RY1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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