1NMUA

Mbp-l30
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
368
structure length
368
Chain Sequence
EEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTNSSS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Inherent Protein Structural Flexibility at the RNA-binding Interface of L30e
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding protein/ribosome
source organism Escherichia coli
molecule keywords maltose-binding periplasmic protein
total genus 122
structure length 368
sequence length 368
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-01-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nmuA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nmuA01
3RQTA 3PD9A 4NF5A 1M5CA 3TPAA 3TKDA 1Y20A 5DVJA 1H76A 2ZXTA 3N5LA 3QYTA 4DCXA 3TELA 1DPEA 1R1NA 1R6ZA 3H4ZA 4F3PA 2X26A 2O1MA 4NF8B 1NNKA 3FUZA 1QUKA 4G8NA 3S9NC 4Q8RA 5I2NA 1P99A 5CI5A 2O68A 2V25A 5I58B 3MWBA 1B32A 2ALUA 2VD2A 1FTJA 2VOZA 3H6UA 5ITOA 1PC3A 3TZAA 3O2AA 1LB9A 5KZTA 3T9XB 1MPCA 3SEXA 1PB9A 3QSLA 1QUIA 1IXHA 3IOWA 2O7IA 3CG3A 4H0WA 5M2VA 1LCFA 4ZEKA 2A5TA 1UTBA 3V5AA 5I57B 4IO6A 1BP5A 2HZLA 3QAXA 2DWIA 4U23A 2F97A 3M8UA 3MZ9A 5CMMA 1IITA 4LONB 1TWYA 1SI0A 3SEWA 3E9XA 2HFBA 1FQCA 3A3CA 5H8QB 3ZKKA 1DTZA 2THIA 3HHGA 3OENA 4RXLA 3LSLA 4I1DA 3K6UA 4MLQA 5I56B 1PEBA 3N94A 5I59B 3C9HA 2F8DA 2PYYA 5EHSA 2XHDA 4BDOA 4K3FA 1MS7A 1TFAA 3FV2A 5J1DA 3MPLA 4OTEA 3RN8A 4X9TA 5AA4B 2F5XA 2NOOA 3KEIA 3UORA 3LC8A 2QRYA 1DTGA 4KYEA 4DIGA 2VP1A 2DE4A 4F3GA 1LSTA 4H1XA 3G3KA 3MQ9A 3C36A 1I6BA 2RCBA 4F29A 4ESXA 2ZYOA 2PT1A 4RPOA 3PD8A 1YPNA 1LAFE 3THIA 5DTBA 5LOMA 2I48A 3HO7A 4EDPA 4BDMA 3H6WA 1PB8A 4BDQA 4ND9A 4BDLA 1T0KA 2QS4A 3MZBA 4LVQA 5ITPA 2AL5A 1O64A 1XS5A 3S9EA 2UVHA 3T9UA 3PMXA 4NF6A 1DSNA 3K2DA 4LQ2A 4YZZA 4NWCA 1SVXB 1B1XA 2DSFA 2I58A 3N6TA 4DLDA 1WVJA 3PPOA 4IY5A 1MY1A 2B3FA 3T93B 1RYOA 3UIFA 3FVNA 4P0GA 4R6HA 2O1LA 5IKBA 1F9BA 3DP6A 3VLUA 2ZYNA 3SEYA 1N04A 1S7YA 2Y7KA 1ZU0A 3FVOA 1FTKA 4N13A 2I4BA 4EUOA 4I9DA 2YJPA 3H3GA 1FCKA 4F2OA 3K6WA 3FXRA 1B46A 5DVFA 3HHFA 1MY4A 1ANFA 4EXKA 4KD5A 2X7PA 4KCCA 4ELOA 1B3LA 4MLVA 2OJTA 4OERA 2H5YA 3KOTA 1FQBA 4L17A 5L9OA 1MQJA 1PBPA 4U4SA 3C32A 4G2ZA 4OETA 2Z8EA 1B52A 1Y3PA 3KN8A 3RLFE 2AIXA 4ZZAA 1QUJA 2F78A 3RT8A 1XOCA 1NFTA 2I6EA 1BTJA 3ZKLA 5H8NB 5KDTA 1US5A 1I6QA 4OQOA 4OFLA 1JEVA 5H8FA 2RINA 2UVIA 3KOSA 3IOUA 4YB5A 3TEPA 2DVCA 2O7UA 1CE2A 4E0WA 2XXVA 3PV0E 5KCJA 4XXUA 3PUXE 1B9JA 3G3IA 1GTKA 4KCDA 3EPEA 3U1OA 4O3BA 3BBRA 1FW0A 3V89B 1HSJA 2HCAA 4TLMB 4NWDA 2H99A 4FEDA 4PE5B 4ZDMA 3OEKA 4LZ5A 1XT8A 4NF4A 4DDDA 1XVYA 3LSWA 4JWXA 1MPBA 3FJ7A 2V84A 3G7WA 1KWHA 5EYFA 4FATA 1IXIA 3L6GA 3T9VA 4ZEBA 3FZVA 2Q88A 3I6VA 1MXUA 2OZZA 4FE8A 3EQ1A 1MH4A 2A5SA 3FXUA 4TOZA 3FGSA 3TODA 5K2YA 1N3WA 5A5XB 4GXAA 1MM6A 4YMAA 1Y9UA 3L6HA 4JBZA 2ZNUA 3VDFA 2RC7A 3N26A 3ECRA 4EQ7A 4LA9A 4GWOA 3LUYA 2XD3A 1QVSA 1VFEA 2QJEA 2Z8FA 2Y84A 3TQLA 3Q28A 2XXTA 2CMOA 4LUBA 3IO6A 1MY0A 1VR5A 4ZE9A 2HZKA 1EH3A 3PUWE 4YB6A 1RKMA 2HQ0A 2QS2A 2DWHA 3UN6A 1Y1ZA 3IO4A 3G3GA 1MPDA 4H65A 4E0XA 3GLBA 1LAGE 1JVYA 4IO2A 1JW1A 1LB8A 2O69A 2ZNTA 4OXVA 3OO8A 1FTLA 3ONMA 3FVKA 4RJZA 3PUZE 1H3DA 1B4HA 3RPWA 1EZOA 2OLBA 2XD2A 4QFNA 1B1HA 4H8IA 4R72A 1SW2A 3D4CA 2VD3A 1OVTA 4RY1A 1A8EA 3PMWA 4PP0A 3A09A 3KJTA 1Y1MA 5JEIA 2DYXA 2D5WA 3O29A 4U21A 1XVXA 4YMBA 3VVFA 4F19A 1AIVA 3QUFA 4AB6A 1OLAA 1MH3A 1B05A 4PQJA 1P1WA 3DP4A 3M3KA 4F1VA 2FYIA 4R2FA 5TP9B 2PT2A 3FJGA 3KBRA 3QUJA 2REJA 5ICQA 3UA8A 1B7HA 3DP8A 4GOTA 3FASA 1SD3A 2UXAA 3PMVA 1UIVA 3BKIB 1AH5A 4XKNA 3TAJA 1GVCA 5CMCA 4NE4A 5DEXB 5BWJA 2Q9TA 4LZ8A 4WEPA 2QL3A 2ZNSA 4F18A 4OFOA 1LCTA 3PPRA 1PB7A 4HCYA 1B3GA 2ONKE 4GVOA 5DT6A 4QFOA 4G68A 1MXZA 5CC2A 1SBPA 3RUMA 4XKRA 2I0CA 1FQDA 2AYSA 3O6IA 4ECFA 5ICTA 1LBBA 1UTHB 3HCQA 1RYXA 1FQFA 3FXQA 1AMFA 3WAFA 3U92A 4DE8A 3VLVA 2H98A 2Z22A 1B0HA 4Q5TA 3UGWA 2V3QA 3LSXA 1O7TA 3K0VA 3OXNA 4F39A 3SEUA 3VVDA 3H6TA 5TU0A 2YPNA 3B6QA 2ONRA 3VXCA 4IGTA 1MQIA 1M5DA 1ZMGA 4YKIA 4GL0A 1IZ1A 3USDA 4R73A 2DS9A 3MJNA 2F36A 4KFQA 2H4IA 3QK6A 5H8HA 1HSEA 4QFPA 1DOTA 3IB2A 4R2BA 5TPAA 1EU8A 3O6HA 4C1UA 4U4XA 3MW0A 3FJMA 3O97A 3EHTA 4X1BA 1IQ7A 5L8DA 4ESWA 4NF8A 4U1ZA 2R71A 2V3TA 1SYIA 3FV1A 4OHNA 2V3UA 4ZEIA 4DZ1A 3RY3A 2ABHA 5I58A 4THIA 5AA1A 1XHYA 2F6GA 1OIBA 3KN3A 3K01A 2QS1A 4KYSA 2I3WA 4F22A 3MP6A 4IO7A 4YB7A 3B6WA 2ESNA 1SW4A 3K4UA 1OMPA 4F31B 2FA7A 3QIMA 1B51A 2E0SA 5CRYA 1IUDA 3K1PA 1NNPA 1JNFA 5L9SA 5I57A 1B3EA 1ZKBA 3TDJA 1A40A 3IK6B 4UA8A 3FVGA 3TCGA 1FTMA 4RNSA 3UP9A 4ZEFA 1GGGA 4KQPA 2XXRA 3TQWA 1LBCA 1URGA 4C1TA 3IB1A 3PPPA 3MVXA 1HSLA 4QFLA 4H67A 1BKAA 5AA2D 2XX8A 2Y7RA 4H5FA 5H8QA 1SW5A 1SDXA 5FTIA 1H44A 3EHUA 4OVJA 3HPIA 2XXIA 3PUVE 1MY2A 1QKBA 5I56A 5I59A 1B4ZA 3DLNA 1SYHA 4MH5A 3HN0A 3TUSA 3R6UA 2H9BA 2F35A 3GBAA 5CBRA 1B7ZA 1URDA 4POXA 1AOVA 1IXCA 3MC2A 1B40A 3EN3A 3W9WA 5AA4A 1II5A 3G3HA 4Z0IA 4ELQA 5FHNA 1H43A 4GRKA 1ZLQA 4O3AA 3GXAA 4QSCA 4MF3A 5F7VA 3O28A 4F2QA 1VFDA 3RGYA 2GHBA 4DCYA 3VE1B 1MG1A 1B6HA 3VVEA 2R6GE 3DELB 4LATA 5JTYB 2B3BA 2REGA 4G68C 3SESA 3K6XA 3C34A 1B0LA 1B7UA 4F1YA 3P7IA 2DP8A 3SEVA 4MFIA 3IL1B 4ZECA 1FQEA 2HXWA 4OMBA 4XKPA 4NF5B 4FEBA 1EZPA 2Z23A 3O9PA 4QRZA 3PUYE 3VFJA 1YTVA 1M5BA 4WEDA 4ZZEA 2PMSA 3IX1A 3KSJA 2CZLA 2HEUA 3MP1A 3JYRA 1USYE 2GH9A 1I69A 1VSOA 4R6YA 1USYH 4GLIA 5I2NB 3I3VA 3RTFB 1N76A 1SW1A 3H06B 2RC9A 4PETA 2AL4A 3KGCA 1P1NA 1LFIA 3OO6A 3K1MA 4EXLA 2F7BA 4H8JA 2OWSA 1NL5A 3O66A 4F3SA 3S4UA 3TTNA 4AQ4A 3RT6B 1IIWA 2A5TB 1UTBB 3ZS6A 1PBQA 2VHAA 1EZ9A 3C4MA 4ZEDA 4JSDA 2Z8DA 3W9VA 3C31A 1D9YA 3VV5A 2I3VA 4KI0E 2IA4A 4JSOA 1A8FA 4U1OA 1VE4A 3MZ1A 1MQHA 4GL8A 3QXMA 5CMKA 5AA3A 5FHMA 2DXYA 4LP2B 4RA1A 3PU5A 3EF7A 1AL3A 4HW8A 3PGFA 4YKPA 4HS7A 2V93A 4AB5A 3V8XB 2Q8JA 2RKMA 1ELJA 5JK4A 1Z7ME 3KN7A 2P0SA 1OVBA 3SDFA 4YICA 3LBSA 3ZSFA 4IGRA 3OEMA 3SERA 1FTOA 4U22A 5IAIA 2OWTA 5H8NA 1M5EA 3CVGA 2GFEA 1P1UA 1B2HA 4YAHX 4RK9A 2Q89A 3V83A 3BFTA 3C35A 2OK2A 3JV9A 1M5FA 3Q27A 4RYAA 3OO9A 4QSEA 2QMWA 4EQ9A 1POTA 3N6UA 1OQHA 3KZGA 3GZGA 2DOJA 1Y3NA 3OSQA 2NVUB 4QHQA 2F7AA 2XX9A 4U2RA 2RC8A 4OEUA 3MAMA 1NNFA 1D3KA 1P1QA 3TTMA 2VGQA 2I0BA 4KHZE 2QMXA 4DXUA 2O51A 3LR1A 1D9VA 3TCFA 2GHAA 3OD7A 4NF6B 5BUUA 3EHSA 5AE4A 1A55A 4R6KA 5L9MA 4GF8A 1ZTYA 3IAZA 4JB7A 2R9JA 4BLAA 3U93A 2XXWA 2DE3A 3OMBA 1DMBA 2PX1A 5CMBA 1QULA 4X1DA 1P1OA 4TQUQ 5DVIA 2BJJX 1N7WA 3K1NA 5A5XA 4G4PA 3OOAA 3KJ7A 4H5GA 3WAEA 4M1VA 4Z7EA 4F3BA 3T96B 1JW5A 2Y7WA 1WDNA 3LSFB 4P0IA 1N0TA 5H8SA 4G8HA 1NH8A 1A99A 4ZS9A 5EHMA 4NTLA 1Y4CA 1YAEA 2XX7A 2UYEA 5K2XA 3ILUB 1MY3A 3GBBA 3IOVA 4NMYA 2Y7IA 2G29A 3VLWA 1SI1A 3PPQA 4OFJA 2OBGA 2FNCA 1LAHE 2PVUA 3G3FA 4WKMA 4R74A 4F1UA 4GFRA 3G3JA 4WXJA 3ILTB 3CIJA 1LAXA 3CFZA 3T9HB 4ONYA 3M3FA 5AA2B 1JQFA 2DWAA 1MDQA 1Q1KA 3SETA 4KPTA 4RPNA 3H03A 1JETA 4OWDA 4G77A 5KDTB 4DXCA 2XXHA 4BDRA 2ZYMA 3Q26A 5HM4B 5B7DA 5H8FB 1Z7NE 3K6VA 2X7QA 3OELA 1ZJLA 1MXWA 1R9LA 4YU0A 3MUQA 4OYVA 5KCJB 1TT1A 3KFMA 3E4RA 1MQDA 3S9LC 4I62A 3TMGA 3D4GA 1S50A 1JVXA 3MVYA 2QPQA 1TFDA 3CFXA 1B3FA 4X48A 5FTHA 3TCHA 3FD3A 4N07A 4QF9A 3KSXA 5B70A 3R26A 3CFLA 1QJMA 4R75A 1ATGA 1BIYA 5TP9A 2Y7PA 1A54A 4GIZA 2B65A 2XXYA 4XKQA 2F34A 5ISUA 3IR1A 2YLNA 4HCWA 2DWJA 3RTWB 2QSXA 4EQBA 4IO4A 5FHOA 4NF4B 3S2VA 2XXQA 2E1SA 3H6VA 4BDNA 4FECA 4LQ5A 1TXFA 5F1QA 3VXBA 3F11A 2GRVA 3UK4A 5DEXA 1LLSA 4ISUA 1OLCA 1POY1 4ZE8A 5I2KB 3B6TA 1QW0A 2NWJA 1JEUA 4PFUA 3C33A 1Y3QA 1OQGA 1ZIUA 3IORA 1LFHA 3MVWA 1MXXA 4IO3A 1MDP1 3E3KA 4FAJA 3OSRA 3U72A 1MM7A 3W15C 4QFKA 3B7DA 1XC1A 1LFGA 1DPPA 3IJXB 1UTHA 4FORA 1J1NA 2DQVA 1Y4TA 3CSGA 2XXUA 1B5JA 2P1SA 4KR5A 2UVJA 5DYHA 4POWA 3TTLA 2P2AA 5CM6A 3TYHA 4JWYA 4JXIA 1UIUA 2ONSA 3S9MC 2NXOA 1MXYA 3IB0A 3TFLA 5AA2A 1NH7A 3M3LA 2DVZA 4N6PA 1D4NA 3R7XA 4IO5A 3AXFA 3CR9A 4YKJA 2O84X 2Q2AA 2UVGA 1UQWA 1MQGA 3JZJA 4JDFA 2G93A 4IB2A 5HPQA 3PPNA 1US4A 4I8CA 1H45A 2WKYA 4KYDA 4PFWA 4Q0CA 4EF2A 1QKAA 4C0RA 1N84A 3FIRA 5HBCA 1ZBMA 2F7CA 2Q2CA 3CG1A 1MXVA 1O63A 3IOTA 4OENA 2XXPA 4HTGA 2I49A 1NKXA 2NUVA 3HV1A 2RCAA 1NMUA 4OESA 1R9QA 3A3UA 5CBSA 5I84A 4PFTA 3I5OA 2RF1A 1IEJA 4PFYA 4FJPA 1I6AA 2LAOA 3KG2A 1N7XA 1JW4A 1WODA 3MPKA 3U8QA 2W7YA 4IY6A 2ZYKA 3FATA 2UYFA 4RK2A 1B5IA 5ELVA 3TTRA 3CI8A 2M8CA 4XTCQ 3T22A 3HSTA 3RNNA 4GQOA 1PDAA 3BFUA 4M4GA 1LGBC 1GR2A 5I2KA 4DXBA 1S9TA 3Q25A 3OO7A 1MRPA 1URSA 4NEDA 4GD5A 2IEEA 2QS3A 4G68B 3H7MA 4UACA 3ODBA 4MBPA 1FQAA 1SQYA 3CRBA 1YCJA 3K00A 3Q29A 4R9GA 4OEVA 2O6AA 2DE2A 1BLFA 1NNTA 3MP8A 4YKKA 1N3XA 2ANJA 1GV8A 3O6GA 4TLLB 3IJOB 1CB6A 2D3IA 2HAUA 4JWOA 3U94A 1Q35A 3CSBA 4H6DA 2HAVA 2F6PA 1A7LA 4QSDA 4ELPA 1B5HA 2DXRA 4Q30B 3MVZA 2XXXA 3K02A 1B3HA 3MBPA 4GXSB 2D21A 2KLFA 4G8MA 4XIGQ 1IXGA 2I4CA 4O3CA 2OCUA 3E13X 4ELRA 4LZ7A 4P11A 3TTKA 4FIMA 2H25A 3T66A 5H8HB 2PBWA 3DM0A 5JTYA 1L5TA 4OZ9A 4R9FA 5TPAB 2ZMBA 4EF1A 1B58A 3SKPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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