3PUXE

Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-bef3
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITKASAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Snapshots of the maltose transporter during ATP hydrolysis.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Hydrolase/transport protein
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
total genus 125
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puxE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puxE01
1PDAA 3T9HB 3JYRA 3O2AA 2AL5A 4ND9A 2H9BA 3H6TA 3OXNA 1IUDA 1DPEA 1NNPA 2HAUA 3MQ9A 2F7AA 1MQHA 3CFZA 4RYAA 2Q8JA 3O28A 3E4RA 1D3KA 2P1SA 5DYHA 3U92A 2VD2A 5AE4A 5CRYA 3H6UA 2OWTA 3D4CA 1B7HA 1UTHA 4QFLA 5I59B 5I2NA 4G68A 3TQLA 4GF8A 2XD2A 2V25A 3VE1B 3ZSFA 3D4GA 3IJOB 4NF5B 1NKXA 3Q27A 4YB7A 4PFTA 5H8FB 1TFAA 1FQAA 1DOTA 1USYE 3FUZA 3QUFA 1XT8A 1MXWA 3MP6A 4L17A 1MPCA 3PD9A 4PE5B 4DCXA 4DXUA 1PBQA 1LCTA 4ZEDA 3T9VA 5A5XB 3GXAA 1FQDA 2I6EA 2B3BA 1US4A 5AA4A 2H99A 4YKIA 5ELVA 1B3GA 1N3WA 1MQGA 3KSXA 1QUKA 3O9PA 4C1UA 1PB9A 5H8SA 1IITA 2XXPA 2A5TA 4Z7EA 1XVXA 2G93A 3PPNA 4XXUA 1B40A 2O1MA 3TTNA 3VDFA 4YKKA 5I84A 1MXYA 4OENA 1BKAA 1QUIA 4G68B 2ONSA 2IEEA 3DM0A 4GLIA 5FHNA 3T96B 4R75A 3SDFA 4EF2A 1B5HA 3N26A 1TFDA 3MPKA 3MP8A 1TXFA 4GL8A 2I3WA 3FJGA 3MW0A 4KPTA 1SW2A 1PB7A 4XKPA 1MS7A 3VV5A 3V83A 1LFGA 2Q9TA 5ICTA 1CE2A 1RYXA 1NNFA 2AYSA 3MJNA 1OLAA 3MVZA 3O6HA 4H67A 4LONB 4NF4A 3TKDA 2P2AA 3EPEA 5TP9B 2QS4A 1N76A 3PMXA 4OEUA 2OLBA 2QL3A 4AB6A 2XX8A 3N6TA 4RA1A 4AQ4A 1RKMA 3VLUA 1BTJA 3O97A 5CBRA 4F29A 3PMVA 2F35A 2R6GE 4LZ8A 3PGFA 3EN3A 4BDOA 4F18A 1SYIA 3QK6A 4HW8A 5I57B 3LC8A 5JK4A 4OYVA 5FTIA 3MVXA 4Z0IA 2DQVA 4Q30B 3O29A 1MQDA 1JW1A 4JWYA 3S9LC 3ECRA 1OLCA 3VVEA 3G3FA 3BBRA 3K1PA 1LGBC 2UXAA 5FHOA 2XXYA 2ABHA 3IOWA 4H65A 5ISUA 1JEVA 1ZLQA 2QPQA 4F2QA 4MFIA 1A7LA 1NNTA 2DXRA 1ZIUA 2RCBA 1A8FA 4LATA 3RGYA 1Z7ME 4QFOA 4HCWA 1ANFA 1PEBA 4PFYA 2DWJA 3LSLA 3PD8A 3U93A 1SW5A 3K1NA 1O63A 1OVTA 1B46A 2OWSA 1QKBA 3SEYA 3TODA 2REGA 5H8QB 2UVJA 1D9VA 4KYDA 2Z8DA 2UYEA 4MLVA 3OEMA 4QRZA 3A3UA 2VD3A 3FV2A 2I4BA 4PFUA 2QS2A 2Y84A 4IO3A 4LZ7A 1MY3A 4I1DA 3ZKKA 1POY1 5H8NA 3PPPA 1P1UA 3DLNA 1MQIA 3OSQA 1N3XA 2PYYA 4PQJA 3U72A 4GD5A 4ECFA 1B0LA 3FATA 3OD7A 4OEVA 4GQOA 3SETA 2H25A 4DE8A 4ESWA 3SEXA 3C35A 3OO8A 1Y1MA 2YLNA 5I56B 3TEPA 5HPQA 1S50A 3EF7A 1B58A 2O6AA 1H76A 4R6KA 2YJPA 4LP2B 3FVGA 2PVUA 4JSDA 3DP4A 1M5EA 2A5SA 1UIVA 4JB7A 4E0XA 1EZPA 1M5FA 1NNKA 2RKMA 3UK4A 3IAZA 2QMXA 3CG3A 4F3GA 3M8UA 1P1WA 4H5FA 4P0GA 4UA8A 2HCAA 3N94A 1WVJA 1XHYA 1BP5A 1IXIA 1FQCA 1TWYA 2E1SA 2H98A 3OMBA 1EZOA 5BWJA 1B7UA 1Q35A 2VP1A 3OSRA 1UTBA 4FEBA 4GXAA 3F11A 4GXSB 1XVYA 2XXRA 3QSLA 3PUZE 4OXVA 3S2VA 2VGQA 1A54A 4PETA 4R2FA 4IO2A 2OCUA 3JV9A 2Q2CA 3V8XB 1S9TA 2GRVA 3OO6A 1VR5A 4FAJA 3C9HA 5AA2A 2HEUA 4POWA 3CFXA 4OQOA 4ELOA 1OQGA 3G3HA 4NMYA 1MXVA 2PT1A 1B2HA 3KSJA 1AH5A 3G3GA 3HHGA 5I2KB 3A3CA 4Q8RA 1JNFA 1AIVA 1QW0A 3TTRA 4GL0A 4ISUA 2CMOA 1D9YA 1KWHA 3KJ7A 5TU0A 1PB8A 2ANJA 3L6HA 4P11A 4WEDA 4TLLB 2DS9A 1MM7A 3C33A 3KN8A 4LQ5A 3RUMA 2HFBA 3KGCA 5IKBA 1ATGA 4F2OA 3SKPA 2V3UA 3MC2A 2OJTA 3R6UA 3TAJA 1JVYA 3HN0A 3LR1A 4MF3A 2G29A 5K2XA 1A8EA 3C4MA 3K0VA 3ZKLA 2ZYKA 3IOUA 2F34A 3FXUA 3O6GA 2D3IA 3CFLA 3S9NC 2I4CA 1B5IA 3S4UA 1LB9A 1O64A 1QULA 1M5BA 1NH8A 1ZTYA 1FCKA 4IO5A 3Q28A 1H3DA 2I3VA 2QRYA 4Q5TA 2O68A 2Q89A 1I6BA 1MDP1 2O7IA 3USDA 1XS5A 4H0WA 1O7TA 1BLFA 4DXCA 2Z8EA 1FTLA 3LSFB 3S9MC 4I9DA 2Y7RA 4POXA 3KJTA 4FORA 4JBZA 2REJA 3MPLA 3MZ1A 1Y20A 3DP6A 3PPQA 5FTHA 3TTKA 3V5AA 5CC2A 5JTYB 4F3BA 4FE8A 3ZS6A 5H8QA 1B32A 4JWOA 1DMBA 3CI8A 4ZZEA 1SVXB 2AIXA 5IAIA 3E3KA 5EYFA 4IO6A 2FA7A 2D5WA 4U1ZA 3PPOA 4YMAA 1QKAA 2HXWA 1EH3A 4DCYA 4GIZA 1YTVA 3B7DA 4IO7A 1Y3QA 3UORA 3P7IA 2F5XA 3U8QA 1FTOA 2I49A 2DE3A 4ELQA 2DYXA 3M3KA 3DP8A 3HCQA 4O3BA 1P1OA 3Q29A 1JETA 4EF1A 4BLAA 4EQ9A 2DP8A 4KQPA 4ZE8A 3PUXE 1HSLA 4ZDMA 4NF8B 4DLDA 4YU0A 5ICQA 2NXOA 3MBPA 1SI1A 2F78A 1LAHE 3K2DA 1MXUA 4H5GA 2AL4A 5FHMA 3PUYE 5TPAB 1PBPA 1MXZA 5KDTA 4BDNA 2I0BA 3KZGA 1QVSA 5AA3A 4O3AA 4QHQA 1AL3A 3TCFA 4EQBA 2HQ0A 2Y7IA 3AXFA 3K6XA 4O3CA 4YICA 4IB2A 4OMBA 1XOCA 4RJZA 3K4UA 2RINA 4I62A 2XD3A 4ZEFA 1LAXA 1MY0A 2RCAA 1RYOA 2XX7A 3BFUA 3IB1A 4R74A 1B4ZA 2O51A 3TUSA 2ZMBA 2HAVA 5HBCA 4NF8A 5I59A 3RY3A 2Z23A 2XXVA 2ZYNA 3KEIA 3TYHA 3VVFA 1MM6A 1LAGE 3FASA 3MVYA 3OOAA 4ELPA 2F8DA 5LOMA 1B05A 3UIFA 1SW4A 2Y7KA 1II5A 2O1LA 1IXHA 3E9XA 2B65A 2BJJX 4YKJA 3UP9A 5HM4B 4M4GA 3HV1A 5DVFA 4NF6A 2ESNA 5CI5A 1ELJA 2XXXA 3FJMA 4LUBA 4IY6A 3OO7A 1USYH 3BKIB 1N0TA 2IA4A 1B1HA 2PMSA 4JXIA 4NTLA 5CMCA 2DOJA 5AA4B 1B3EA 1LLSA 1ZBMA 3EHUA 1ZU0A 4NE4A 4RY1A 3RNNA 3OENA 3W15C 1AOVA 3VLWA 4ZS9A 4EDPA 1A40A 1TT1A 2ZXTA 4ZEKA 3VXBA 4M1VA 1J1NA 3N5LA 3TCHA 5H8HB 2P0SA 3CSBA 1LFIA 2Z22A 5AA1A 5BUUA 1DPPA 1HSJA 2DWAA 4R73A 2V84A 4LQ2A 4F3SA 5ITPA 2THIA 3RT6B 3OELA 4ZEBA 1MG1A 3TQWA 2FYIA 3QXMA 2D21A 4RK9A 4KR5A 1MXXA 3MUQA 5A5XA 1LBBA 4DDDA 2KLFA 3G3IA 4C1TA 4EQ7A 3IB2A 4F1VA 3FVOA 2XXUA 4BDQA 4THIA 1URGA 1MDQA 3QYTA 4X48A 2A5TB 1B5JA 4PFWA 1H45A 3M3FA 3PUVE 3SESA 4YKPA 1IXGA 3W9WA 2QS1A 2DVCA 5J1DA 2DWHA 4QFKA 3DELB 3C31A 3FXQA 4R6YA 2R71A 5L8DA 1FW0A 3CSGA 1SBPA 1M5CA 3IO4A 1R1NA 1FQEA 4KCCA 4QFNA 4IY5A 4H8IA 5I2NB 4BDRA 1B6HA 1H44A 1M5DA 4GVOA 3CIJA 4G68C 4WXJA 2GH9A 1L5TA 1UQWA 2Y7PA 1ZMGA 3FGSA 2HZLA 4U21A 1DTGA 4JWXA 1P1QA 4WKMA 1N84A 5DTBA 2PT2A 2UVHA 2Z8FA 5TPAA 3W9VA 4JDFA 4F19A 5L9MA 1DSNA 1SW1A 4QF9A 5CMMA 3RN8A 3TTLA 2Q88A 2DE2A 3FXRA 3MAMA 1LBCA 1R9QA 4MH5A 2ONRA 4RNSA 5B70A 2RC7A 1GTKA 1UTBB 1LB8A 4U4SA 3T22A 3VXCA 1UIUA 3R7XA 4IGTA 4N13A 1MPBA 1ZJLA 3CVGA 4F1YA 4QSCA 2H5YA 3FVKA 1I6QA 5I58B 3T9UA 1LSTA 4KD5A 4RPOA 4OFOA 4OZ9A 4EXLA 1QJMA 4RPNA 4G8NA 5JEIA 3EQ1A 4LZ5A 5H8NB 1N04A 3HO7A 2FNCA 4YZZA 3UN6A 3C36A 1POTA 5I57A 5CM6A 1FTKA 3H7MA 3THIA 1VFDA 3L6GA 4XTCQ 2OZZA 4EUOA 1JVXA 4BDLA 2ZYMA 4ONYA 3LUYA 1UTHB 4ELRA 1NFTA 1URDA 3RTFB 3FIRA 1B52A 1FQFA 4KFQA 3R26A 4R9FA 4NF5A 4YAHX 3U94A 5EHMA 5L9OA 4U2RA 4NF6B 3UA8A 2ZYOA 2UYFA 4U4XA 5DVJA 3EHSA 3K6UA 4GRKA 3K6WA 3KN3A 2ZNTA 4GFRA 4U23A 3SEWA 4ZE9A 2Y7WA 4MBPA 2NVUB 1Y1ZA 4U1OA 2XXHA 3H3GA 4OESA 4X1BA 1FQBA 3H03A 3MVWA 1NL5A 3H06B 3PMWA 5AA2D 1MY1A 4P0IA 1IZ1A 4TQUQ 5KCJB 1ZKBA 2W7YA 4DZ1A 1YPNA 5I58A 3RPWA 3T66A 2DWIA 1MH3A 3K1MA 5L9SA 4G8MA 1I6AA 2PBWA 4X1DA 3FZVA 2R9JA 1SDXA 3KBRA 4YB5A 1NH7A 3MWBA 3GBBA 3OEKA 4QSEA 4YMBA 1Y3PA 2ONKE 1EZ9A 1MRPA 2F36A 4GWOA 4OFJA 4OERA 4OWDA 2X7QA 4U22A 4AB5A 2V93A 4ZECA 2V3QA 1GR2A 3O6IA 4OTEA 3V89B 4UACA 4C0RA 3PUWE 1Q1KA 4G77A 1Z7NE 2I58A 3CR9A 3K02A 1CB6A 3C32A 3KG2A 4FEDA 4HCYA 1JEUA 5F7VA 4MLQA 3TMGA 3KOSA 4TLMB 4KCDA 2F7CA 5CMBA 4LA9A 1A55A 3Q25A 2O84X 3IJXB 2GFEA 1F9BA 2F6PA 3K6VA 4H6DA 1NMUA 4R72A 1WODA 2QSXA 1EU8A 3IX1A 2RF1A 1P1NA 1SD3A 1SI0A 1I69A 2F7BA 3N6UA 2VHAA 3MZ9A 3ODBA 2Q2AA 3HSTA 4KI0E 5M2VA 3TDJA 5CBSA 5I56A 1D4NA 4TOZA 3GBAA 2DE4A 1IXCA 3Q26A 4KHZE 3E13X 1FTMA 3I5OA 3RQTA 3RTWB 4H1XA 4JSOA 3LBSA 4DXBA 3H6WA 1SYHA 3GLBA 3KFMA 1IEJA 1HSEA 5TP9A 3T93B 3A09A 3H4ZA 4LVQA 1B0HA 3FJ7A 5DEXB 1MH4A 3HHFA 3O66A 4ZEIA 5ITOA 1SQYA 4QSDA 1R9LA 3FV1A 3PPRA 3CG1A 3K01A 4F3PA 1JW5A 2GHAA 5DT6A 1PC3A 2H4IA 1GGGA 2O69A 1B3HA 4HS7A 3OO9A 3TCGA 2XXQA 2LAOA 3IOTA 2QS3A 1GVCA 4FATA 2ALUA 4F31B 1OQHA 4QFPA 4RK2A 1B4HA 3KN7A 1OVBA 3SERA 3T9XB 5EHSA 3BFTA 3CRBA 2DVZA 4XKNA 3RLFE 4DIGA 2NOOA 2QJEA 5I2KA 5KCJA 3EHTA 1B3FA 1DTZA 4G8HA 2XXTA 2ZNUA 3K00A 1MY2A 1B51A 4EXKA 1AMFA 4K3FA 4F1UA 4NWCA 3MZBA 1Y3NA 2RC8A 4N07A 4OFLA 3IORA 5K2YA 1GV8A 1N7WA 2F6GA 1JQFA 2HZKA 3QUJA 3GZGA 2I0CA 2XHDA 4IGRA 1QUJA 4HTGA 3G7WA 2E0SA 2RC9A 3HPIA 4OVJA 4R2BA 1S7YA 4FJPA 3WAFA 3JZJA 3IOVA 4ESXA 2WKYA 2UVGA 4X9TA 1US5A 2DXYA 4NEDA 3I6VA 5H8HA 4KYSA 1P99A 3B6QA 2F97A 4RXLA 1YCJA 3H6VA 4OETA 1IQ7A 2CZLA 2DSFA 4E0WA 3G3JA 2O7UA 2VOZA 2B3FA 3G3KA 3IL1B 5H8FA 3IO6A 2XX9A 1OMPA 1MPDA 1LAFE 2OBGA 3IR1A 1LFHA 3KOTA 3ILUB 3QAXA 1YAEA 1JW4A 3M3LA 4WEPA 1B1XA 3WAEA 3VVDA 3UGWA 3ILTB 5DVIA 2GHBA 1N7XA 4XIGQ 1B9JA 2PX1A 1OIBA 3TPAA 1T0KA 4FECA 1A99A 1FTJA 4F22A 3TELA 3I3VA 3LSWA 2V3TA 3QIMA 4Q0CA 1R6ZA 4GOTA 3U1OA 1WDNA 4ZZAA 1MQJA 4G2ZA 2ZNSA 1Y4CA 1Y9UA 2QMWA 1MY4A 4I8CA 4N6PA 1BIYA 3PV0E 4F39A 5AA2B 5KDTB 5CMKA 5F1QA 2XXIA 4PP0A 2X26A 3IK6B 1VE4A 3ONMA 4H8JA 2XXWA 1URSA 2NUVA 1IIWA 3VLVA 3C34A 5KZTA 2X7PA 4R9GA 4G4PA 4OHNA 3FD3A 1Y4TA 4YB6A 1VSOA 2OK2A 3SEVA 3TFLA 4KYEA 3RT8A 3TTMA 4XKRA 2NWJA 3S9EA 4NF4B 1XC1A 3FVNA 2I48A 1B3LA 2M8CA 3LSXA 4XKQA 3IB0A 4FIMA 5DEXA 3B6WA 3SEUA 3TZAA 4R6HA 2UVIA 2YPNA 3B6TA 5B7DA 3PU5A 1B7ZA 4BDMA 4NWDA 1VFEA 4IO4A 3MP1A 1H43A 3VFJA 1LCFA 5JTYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1JP4A 3JYRA 4ND9A 1DPEA 3MQ9A 2Q8JA 3O28A 4OVSA 1D3KA 2VD2A 5CRYA 2OWTA 2V25A 3IJOB 1NKXA 1USYE 3QUFA 3MP6A 3PD9A 4DCXA 4P8BA 1LBYA 3IFCA 4ZEDA 3T9VA 3E79A 2B3BA 1MQGA 1PB9A 4Z7EA 3PPNA 4KXPA 2O1MA 3TTNA 4YKKA 1QUIA 4GLIA 4R75A 3SDFA 1B5HA 3N26A 1TXFA 3ISPA 4KPTA 4P3LA 2Q9TA 5ICTA 1NV5A 4AB6A 4RA1A 2FBPA 4AQ4A 1RKMA 4NX1A 3O97A 5CBRA 4F29A 4PTKA 4HW8A 3QK6A 3MVXA 3O29A 1FBHA 1MQDA 1NV6A 3K1PA 1FPBA 2ABHA 4H65A 1LBXA 1ZLQA 4GX6A 4MFIA 2RCBA 1NNTA 4OVRA 2ZZWA 1ANFA 1SW5A 1O63A 5EQ8A 3TODA 4QRZA 3A3UA 2I4BA 1MY3A 5H8NA 3PPPA 3DLNA 2WYKA 4GD5A 3RPLB 3OD7A 4OEVA 3SETA 4GWSA 3SEXA 3TEPA 1Y1MA 5HPQA 3EF7A 1B58A 2PVUA 1M5EA 2RKMA 4H5FA 4P0GA 4UA8A 2HCAA 1XHYA 1IXIA 1FQCA 2Y5KA 2VP1A 3OSRA 4GXSB 2XXRA 3B8BA 1FBPA 4PDDA 3OO6A 1VR5A 4FAJA 3C9HA 2HEUA 4POWA 3CFXA 4ELOA 3G3GA 5I2KB 3TTRA 4ISUA 1PB8A 3KN8A 3KGCA 1FPFA 4F2OA 2V3UA 3R6UA 1JVYA 3HN0A 4MF3A 1A8EA 5IZ3B 3ZKLA 1B5IA 1O64A 1QULA 3Q28A 2O68A 3USDA 2O7IA 1O7TA 1BLFA 1FTLA 3LSFB 2FIXA 1FBCA 3TTKA 3PPQA 3MZ1A 4F3BA 4JWOA 1IMCA 3E3KA 5EYFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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