3PUXE

Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-bef3
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITKASAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
publication title Snapshots of the maltose transporter during ATP hydrolysis.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Hydrolase/transport protein
total genus 125
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puxE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puxE01
3W15C 2Q89A 2F7BA 4ZEDA 1B0HA 3MUQA 1SW2A 2HEUA 4Q0CA 1Y3QA 1FCKA 4IO2A 1NNTA 3CFXA 3G3HA 3BKIB 5JEIA 1LFHA 1H76A 1JVYA 4UACA 4BDOA 3IK6B 2WKYA 2DWJA 1Y3NA 3K02A 3VFJA 1LAFE 3H3GA 2QS3A 1WDNA 1QKAA 4QFKA 4LONB 3KSXA 1PC3A 2QMWA 4RK9A 3O2AA 2F6GA 3QIMA 1I6QA 3PUXE 4JXIA 3G3JA 1NMUA 3S4UA 3OENA 4GQOA 2H25A 5L9OA 1DOTA 5AA3A 1PBPA 2F34A 3O97A 3USDA 1OMPA 5HM4B 4YICA 1QVSA 3KOTA 4OZ9A 3OO7A 1EZPA 2V84A 2ZYKA 4OQOA 3MZ1A 5DTBA 2P1SA 2PVUA 5TU0A 3KOSA 3C34A 3PD8A 2ZXTA 4BDLA 2XXIA 4F3GA 1B5HA 2Y84A 1Z7ME 2NXOA 1ZTYA 1JW4A 1B32A 3EN3A 1B05A 4NWDA 4RPOA 2VHAA 3CSBA 1Q35A 4RJZA 3OEMA 1N0TA 2UVIA 1BKAA 2X26A 1UTBB 1GGGA 4NF8B 1ZKBA 2DYXA 3VDFA 1IUDA 4ZS9A 4LA9A 3KEIA 5FTHA 3C35A 3AXFA 1GV8A 2O7UA 2F7CA 5CMKA 3OEKA 1US4A 2DE3A 1NFTA 3EHTA 3G3GA 1QUJA 4F18A 2X7PA 4U22A 3RN8A 4OYVA 5B7DA 2Z22A 4WXJA 1DPPA 4IB2A 2P2AA 3LSXA 3LR1A 4IY5A 5CBRA 1IITA 1N3WA 3A3CA 1JNFA 5EHSA 4YZZA 3BFUA 4M4GA 4TQUQ 1A8FA 1LB9A 5AA4B 1I6AA 1Y9UA 1D9VA 1FQDA 3KBRA 1Z7NE 4X9TA 2DE4A 3K6UA 5I56B 3PUWE 1B4ZA 4YMAA 4G8MA 3TCFA 3TODA 1D3KA 1LFGA 4BDRA 1S7YA 2QS1A 3HCQA 3H6TA 4G8HA 2XXVA 3RPWA 1IQ7A 4PFUA 3ZKLA 3RQTA 1WVJA 1SBPA 2Q2AA 3DP8A 5KZTA 3FIRA 1TWYA 3K1NA 4ND9A 4PETA 1NL5A 5EHMA 4ZECA 1VSOA 4MLQA 1PBQA 2B3FA 4C1UA 4GWOA 3S9MC 5DVJA 2YJPA 4RY1A 4KYSA 5DVIA 4H1XA 3UP9A 4XKPA 2ZMBA 4MLVA 2UVGA 4GRKA 3RNNA 3IB2A 4YKJA 3K1PA 3FV1A 2F7AA 3TTLA 1AOVA 1IXGA 4KYDA 1N3XA 2RF1A 4KYEA 5ITOA 4H5GA 4ELOA 4YMBA 1MY2A 2VOZA 1LCTA 1XT8A 4QSCA 4N6PA 3IX1A 3I3VA 1M5CA 3FJGA 1MRPA 4FIMA 2O7IA 4R2FA 1US5A 1P1NA 4AB5A 3OO6A 3K01A 4PFWA 1JEUA 1B5IA 2F35A 3H6WA 5CMMA 4NF5B 4NE4A 3E9XA 4F39A 1MH4A 3VXCA 5I59B 3L6GA 3FVNA 1M5FA 3RTWB 3MVWA 5I57B 1MH3A 2ESNA 3H06B 4KD5A 3O28A 2OLBA 1ELJA 1R1NA 1A55A 4BDMA 1Y20A 3IORA 4BDQA 3K6XA 4X1BA 3A3UA 3RT6B 2I3VA 4OFOA 3PMXA 4U4XA 2D3IA 1XVYA 4OEVA 4ZZEA 2ONSA 2UXAA 3N6UA 1PEBA 4HCYA 4QFOA 2VP1A 3KSJA 2I0CA 4NTLA 3BBRA 2O69A 3H4ZA 4H5FA 1O7TA 3K4UA 1DSNA 1LCFA 1BTJA 3N6TA 2PT2A 5H8NA 4DXBA 3G3FA 1EZOA 3CG3A 4JDFA 3JZJA 3TEPA 4KQPA 3C32A 2FA7A 4GD5A 3FATA 4LZ7A 1LAGE 3U92A 5H8FB 1LBCA 1ZU0A 3LSWA 1N76A 1ZIUA 5CMCA 1RKMA 3TUSA 4ZEBA 3D4CA 4TLMB 3TQWA 4R74A 4ZEFA 5LOMA 5L8DA 4EF2A 1I6BA 2VD2A 1UIVA 1LLSA 4F22A 1FTKA 4NF4B 4JWXA 2DOJA 3S9EA 4H65A 5JTYB 5KDTB 3IJOB 2O6AA 4F1YA 4BDNA 4I9DA 4KHZE 5H8QB 3IO4A 2I4CA 3B6QA 4OERA 3KN7A 1MQDA 5I58A 1CE2A 5I2KA 4RXLA 1OVBA 5DEXB 3UN6A 1BLFA 4DCXA 5HPQA 3QUFA 3G3KA 2PBWA 3Q29A 1FQBA 3WAEA 3Q25A 4R2BA 3IOTA 4IO6A 1AIVA 3T93B 5H8HA 5A5XB 3CI8A 4DLDA 3FGSA 4JWOA 5M2VA 4I62A 3RUMA 1JVXA 2DQVA 2P0SA 3T9UA 2W7YA 3CFLA 1F9BA 1RYOA 3MZ9A 2DP8A 4NMYA 1UTHA 1XS5A 2KLFA 2OBGA 4R72A 1GVCA 3MC2A 1J1NA 2QJEA 4R6YA 4GLIA 5L9SA 3HPIA 4KFQA 1IEJA 4AB6A 1SW1A 4IY6A 4F19A 1URSA 3E3KA 2A5TA 4HS7A 2CMOA 3TTKA 4EQ9A 4NF6A 1LBBA 1B3EA 3T9HB 1A8EA 1LGBC 2ZNUA 2ZYOA 3RT8A 3SKPA 3IJXB 3OD7A 3FASA 1NH8A 1M5BA 4R9FA 3PU5A 3VVEA 1NNFA 4N07A 5I2NB 4OETA 4NWCA 3S9LC 2F8DA 3GBAA 1FTLA 1M5EA 3HSTA 4KR5A 5KCJA 1USYH 1JEVA 3VV5A 2NUVA 2XXXA 2BJJX 2NWJA 1SI0A 2DVZA 3PPOA 2DWHA 2XXTA 4YKKA 3SEXA 4ESXA 3LSFB 3B6TA 5DT6A 3K6VA 4GIZA 3U72A 3DP6A 3L6HA 4U1OA 1POTA 3C36A 4H8IA 5FHMA 5L9MA 3ZSFA 3BFTA 2XD2A 1B52A 2HFBA 4KCDA 4FE8A 4ONYA 4ZZAA 5FHNA 5B70A 2DXYA 4DXUA 1IIWA 1KWHA 1B3LA 4QRZA 3VVDA 3LUYA 1ANFA 3TKDA 1WODA 2XXQA 3U1OA 4OXVA 4QFLA 3P7IA 4TOZA 1PB8A 4YKPA 5AA2A 4G68A 1LSTA 2XX7A 3EHUA 4ZE9A 4G77A 1B4HA 3FJ7A 1O63A 1A54A 2V3UA 1BP5A 2V25A 3VVFA 3A09A 2AYSA 3ILTB 3IO6A 5TP9B 4THIA 4YKIA 4QF9A 3DLNA 3V89B 4TLLB 3SEVA 3FXQA 4ELQA 4FJPA 4Q8RA 5CMBA 4XXUA 3PGFA 2QRYA 2DVCA 3B7DA 5JK4A 1B58A 4LP2B 2H4IA 4KCCA 1LAHE 2RINA 1D9YA 2V3TA 1GTKA 3MVYA 2OJTA 3EF7A 3MAMA 4O3BA 4U2RA 2XHDA 4DIGA 3C4MA 5I84A 4EQ7A 3FUZA 1MPDA 4BLAA 2REGA 3JV9A 3Q28A 3T9XB 3B6WA 4XKRA 1TXFA 4C1TA 5TPAB 1HSEA 1P1WA 1B1HA 2G29A 3O66A 1A99A 4YAHX 2F36A 3TMGA 4QSEA 1MXZA 1O64A 3SDFA 3K1MA 4IO4A 3M3LA 1DTGA 3VLWA 2GH9A 4JSDA 4QFPA 1FQFA 4U21A 3CG1A 2H5YA 1MXUA 4RPNA 1IXCA 2OWSA 1I69A 5BWJA 3Q26A 1MG1A 3DELB 3SESA 5EYFA 1OIBA 3QSLA 3GXAA 4DDDA 3MPLA 4RYAA 1JW1A 3CFZA 4G2ZA 3K6WA 1QW0A 4FEDA 4OMBA 2NOOA 2RCBA 3TPAA 4XTCQ 2I0BA 3CRBA 4N13A 2Y7PA 2HAUA 1B0LA 3KN3A 3QXMA 5DVFA 2H9BA 2YPNA 2D5WA 1B5JA 1B1XA 1M5DA 3TAJA 1JETA 4U1ZA 2ONRA 4ZEKA 1NH7A 1N7XA 2DWIA 2XXRA 4I1DA 3C31A 3FXUA 1R9LA 3CVGA 4PFYA 4OEUA 2HXWA 4IO3A 4R75A 3OELA 3UORA 1YCJA 1MDQA 1SW4A 1ZBMA 2VGQA 3T22A 1NNPA 3F11A 3UIFA 1CB6A 1MDP1 5AA2D 3K0VA 2YLNA 2LAOA 1N04A 3U94A 4KI0E 1ZLQA 1H45A 2Z8DA 1MXXA 4FEBA 3PMVA 3PUZE 4YB5A 4IGTA 3S2VA 4LUBA 4X1DA 2THIA 1LFIA 1MS7A 2O51A 3M8UA 3FVOA 1QJMA 3PD9A 4G8NA 1MY0A 3DM0A 3T66A 2E1SA 4JSOA 4LQ2A 2XXUA 1FTOA 4ISUA 1FQEA 1MPCA 1IXHA 1UTBA 3GZGA 4U23A 3UA8A 4NF8A 1Y1MA 3EPEA 2ZNTA 2I49A 4LZ5A 3RY3A 1MXWA 3LSLA 1Y4CA 2HCAA 4R9GA 1B7UA 3ECRA 4G4PA 4ESWA 1B7HA 1URGA 4OVJA 3MW0A 4EXLA 4R6KA 2Q8JA 1MM6A 1MY1A 1ATGA 2CZLA 1B6HA 2B3BA 4OHNA 3THIA 4WKMA 3TELA 1QULA 4I8CA 1P99A 1L5TA 3PUVE 1JQFA 4YU0A 4ECFA 4X48A 5AA4A 4HW8A 5BUUA 4C0RA 2O68A 1TFDA 1UQWA 1SQYA 3VLVA 3O29A 3R26A 3QUJA 2QSXA 1S50A 1VE4A 5CBSA 4WEDA 5I56A 3R7XA 1R6ZA 1SI1A 5FHOA 4P0IA 4DXCA 3MQ9A 1B3GA 2XD3A 3D4GA 3MWBA 5F1QA 2HQ0A 2I3WA 1RYXA 3RGYA 3OXNA 1NNKA 4H67A 2UVHA 3TTMA 1QUKA 3FD3A 4ZEIA 2ZYMA 3FVGA 2RC8A 2R9JA 2DWAA 4QFNA 2E0SA 3PPNA 3G3IA 4P11A 2ONKE 2O1MA 4F2OA 2Y7KA 3M3KA 4XKQA 4MBPA 3O6IA 2A5SA 1B46A 5K2YA 5H8SA 1Y3PA 2QL3A 3HV1A 3S9NC 1B3FA 3SEUA 4R6HA 3TTRA 2Z23A 4F3SA 4FAJA 2XXYA 4F3PA 2XXWA 1DMBA 4NEDA 4F29A 3PV0E 2GHAA 3K2DA 1MQJA 4F31B 1HSJA 5CI5A 4U4SA 2QS4A 4ELPA 1MXYA 1QUIA 1XC1A 4F3BA 3G7WA 1MPBA 3H03A 3MP1A 2V3QA 2DSFA 2V93A 3SETA 4F1VA 1MM7A 4OESA 4MF3A 2R71A 1AMFA 3KFMA 3UGWA 1N84A 2FYIA 4MH5A 4POXA 1GR2A 2OWTA 3IR1A 3OSQA 4ELRA 3C33A 2REJA 1SVXB 4JWYA 2QPQA 2AL5A 3ZS6A 4Q30B 1OLCA 4L17A 5AE4A 3MBPA 1XHYA 2XXHA 3H7MA 5ITPA 4NF5A 3IB0A 3EQ1A 4KPTA 5H8NB 3KJ7A 3TCGA 3RTFB 3IOWA 5I59A 4FATA 1FW0A 4PFTA 5I57A 1B9JA 4WEPA 3PPRA 5F7VA 4HTGA 1Q1KA 2ZNSA 4IGRA 2B65A 4ZE8A 4Z0IA 5IKBA 3ONMA 3PPQA 2HAVA 1DTZA 1H43A 4LZ8A 1LB8A 3KG2A 3SERA 3O6HA 5ELVA 3C9HA 2M8CA 1MXVA 4PE5B 2Y7RA 1VR5A 1UIUA 3MP8A 1B7ZA 5ISUA 3MZBA 1TT1A 1YTVA 1MQIA 4H8JA 4RNSA 5ICTA 5I58B 1OQGA 1S9TA 2RC7A 2Y7WA 1JW5A 5I2KB 2O84X 1XVXA 1HSLA 4QSDA 2AL4A 1A40A 2H99A 4E0WA 2O1LA 1II5A 2Y7IA 3T96B 1FTJA 4QHQA 4IO7A 1USYE 3LBSA 5H8HB 3U93A 2DS9A 3UK4A 1IXIA 5H8FA 4EDPA 5CRYA 1MQGA 1AL3A 4DE8A 1UTHB 2Q88A 1MQHA 3O6GA 3U8QA 3PUYE 4LATA 1OQHA 5DYHA 2NVUB 1FQAA 2F78A 4H0WA 1P1UA 5AA1A 1OVTA 3SEYA 1SYHA 3VLUA 4AQ4A 2QS2A 4NF4A 4GOTA 3SEWA 3RLFE 2A5TB 5HBCA 5JTYA 5CC2A 5KDTA 4NF6B 3T9VA 4Q5TA 5H8QA 4GVOA 2PT1A 3HHFA 3PMWA 2Z8FA 2Z8EA 4YB7A 4RK2A 3QYTA 3FJMA 5IAIA 5DEXA 1XOCA 4GXSB 3OSRA 2F6PA 3R6UA 3V8XB 4MFIA 2IEEA 1OLAA 4UA8A 3ZKKA 1SYIA 5A5XA 1H3DA 1VFDA 3MPKA 3IOVA 3OO8A 4P0GA 4R73A 1LAXA 2XX9A 5KCJB 2ANJA 4EF1A 4E0XA 2RKMA 1EU8A 3MVZA 3CIJA 3OOAA 1EZ9A 3FXRA 1MY4A 2G93A 1P1OA 1VFEA 2I4BA 3KJTA 5J1DA 2R6GE 3LC8A 3N94A 1FQCA 3MP6A 4LVQA 4O3AA 1B51A 1H44A 3WAFA 1SD3A 1POY1 2D21A 1B2HA 4IO5A 2XX8A 4F1UA 4GFRA 2VD3A 2H98A 1ZJLA 1B3HA 4DZ1A 1AH5A 3TQLA 3K00A 2PYYA 2ALUA 2I6EA 3DP4A 1PB9A 2UYEA 5I2NA 2HZKA 4K3FA 1IZ1A 3TYHA 1T0KA 4M1VA 2UYFA 5CM6A 4FECA 5AA2B 3N26A 4G68B 3ODBA 3IB1A 2I58A 1YPNA 3IAZA 2UVJA 5FTIA 4PQJA 4OWDA 2OK2A 3KN8A 4JB7A 2Q2CA 2DE2A 4O3CA 3HO7A 2IA4A 2PX1A 4FORA 3I6VA 3KZGA 3OO9A 3TFLA 3HN0A 4GL0A 1PDAA 3H6UA 2PMSA 1B40A 4GXAA 2GFEA 3I5OA 3KGCA 1SDXA 3Q27A 1PB7A 1NKXA 1Y1ZA 4ZDMA 2I48A 3ILUB 4EQBA 3TTNA 3MJNA 3EHSA 1URDA 3E13X 3TCHA 4OENA 4OTEA 1DPEA 1MY3A 2RCAA 1ZMGA 4JBZA 3W9VA 2HZLA 2ABHA 2GRVA 3N5LA 4YB6A 3PPPA 3TZAA 3O9PA 2QMXA 2FNCA 3IL1B 3OMBA 4GL8A 3W9WA 4POWA 3MVXA 2ZYNA 4PP0A 2XXPA 2OCUA 2OZZA 1QKBA 3H6VA 2DXRA 1P1QA 3HHGA 5TP9A 4XKNA 1FTMA 3V83A 4LQ5A 3V5AA 2X7QA 3FV2A 5K2XA 1BIYA 3M3FA 1A7LA 4DCYA 2AIXA 4OFJA 1TFAA 1Y4TA 2F97A 2F5XA 1N7WA 3GBBA 4G68C 1R9QA 4Z7EA 3GLBA 3FZVA 3VE1B 1D4NA 3JYRA 4HCWA 4H6DA 2RC9A 4XIGQ 3VXBA 4EUOA 3FVKA 3CSGA 1EH3A 4F2QA 3CR9A 5ICQA 2Q9TA 3QAXA 4OFLA 1SW5A 5TPAA 4GF8A 3TDJA 3IOUA 4RA1A 2GHBA 1YAEA 3QK6A 3E4RA 4EXKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3W15C 2Q89A 2F7BA 4ZEDA 4GWWA 4AS5A 1B0HA 1NV2A 3MUQA 1SW2A 2HEUA 4Q0CA 1Y3QA 1FCKA 4IO2A 1NNTA 3CFXA 3G3HA 3BKIB 4HE0A 5JEIA 1LFHA 1H76A 1JVYA 4UACA 4BDOA 3IK6B 2WKYA 2DWJA 1Y3NA 4PCDA 5F24A 3K02A 3VFJA 1LAFE 3H3GA 4DI4B 2QS3A 1WDNA 1QKAA 4QFKA 4LONB 1NI9A 3KSXA 1PC3A 2QMWA 4PBQA 4RK9A 1AWBA 3O2AA 2F6GA 3QIMA 4QXDA 1I6QA 3PUXE 4JXIA 3G3JA 1NMUA 3S4UA 3OENA 4HXVA 1FPLA 4GQOA 2H25A 4GWZA 5L9OA 1DOTA 5AA3A 1PBPA 2F34A 3O97A 3USDA 1OMPA 5HM4B 4YICA 5DW8A 1QVSA 3KOTA 4OZ9A 3OO7A 1EZPA 2V84A 2ZYKA 4OQOA 3MZ1A 4MMPA 5DTBA 2P1SA 2PVUA 5TU0A 3KOSA 3C34A 1FTAA 3PD8A 2ZXTA 4BDLA 4PFIA 2XXIA 4F3GA 1B5HA 2Y84A 3HFUA 1Z7ME 2NXOA 1ZTYA 4MAGA 1FPBA 1JW4A 1B32A 1KZ8A 1B05A 4RPOA 3EN3A 4NWDA 2VHAA 3CSBA 1Q35A 4RJZA 3OEMA 1N0TA 2UVIA 1BKAA 2X26A 1UTBB 5IZ3A 1GGGA 4NF8B 1ZKBA 4XF5A 2DYXA 3VDFA 1IUDA 4ZS9A 4LA9A 2DDKA 3KEIA 5FTHA 2Q74A 3MYUA 3C35A 3AXFA 4NG7A 1GV8A 2O7UA 2F7CA 4PAIA 5CMKA 3OEKA 1US4A 2DE3A 1NFTA 3EHTA 3G3GA 1QUJA 4F18A 2X7PA 4PF8A 4U22A 3RN8A 4OYVA 2XXKA 5B7DA 2Z22A 4WXJA 1DPPA 4IB2A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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