3PUXE

Crystal structure of an outward-facing mbp-maltose transporter complex bound to adp-bef3
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
374
structure length
374
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITKASAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/transport protein
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
publication title Snapshots of the maltose transporter during ATP hydrolysis.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 125
structure length 374
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puxE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3puxE01
1B4HA 2WKYA 5CM6A 2XX8A 3RUMA 1LFHA 5EYFA 4YZZA 2V3TA 3QXMA 4PP0A 4EQBA 4R2FA 2RF1A 4PETA 1Z7NE 4EF1A 5H8NA 2UVJA 4MF3A 4R6YA 4TQUQ 1KWHA 2QJEA 2RC9A 4XIGQ 2D5WA 4F19A 3CVGA 3LC8A 2AL4A 1IITA 5ELVA 5EHMA 3FD3A 3VFJA 1PEBA 1Q1KA 4U1ZA 3TPAA 1B3EA 3MP6A 3L6HA 2Y7WA 1PDAA 4R6HA 4R6KA 4LP2B 1I69A 1MY3A 1DTZA 3Q29A 3SEVA 4PE5B 3CFZA 2DXRA 2GRVA 1MXWA 3W9VA 2O6AA 3RPWA 4KCDA 3I3VA 4FECA 3FJ7A 1DOTA 3FVGA 2DP8A 4JXIA 2VGQA 1A7LA 3TTLA 3PPPA 3KBRA 4OMBA 4C1TA 2NVUB 5CBRA 4PFYA 3EF7A 5I57B 4KYEA 2H4IA 3U1OA 3WAFA 1PBQA 5DEXB 1B58A 3K1MA 1JNFA 2DVCA 2UYFA 3H4ZA 1URGA 1B3HA 1M5CA 4G4PA 4OZ9A 4LZ8A 1LCFA 2QS4A 4AB5A 4BDQA 2PBWA 5CC2A 5H8NB 4YU0A 1UTBA 1Y3QA 3K0VA 2VD3A 1Y20A 3OELA 3CFLA 4QFKA 4G68A 1XT8A 4F3SA 1IQ7A 4H8IA 4ZEFA 4JB7A 1XS5A 1MG1A 1OQGA 1AMFA 1OVTA 5BUUA 1XHYA 1SBPA 4M4GA 4GF8A 3CFXA 4MBPA 3V5AA 4FEBA 3R7XA 1MQHA 1MQIA 1H3DA 3Q27A 3G3FA 4M1VA 2Z8DA 3OEKA 5JTYB 2DWHA 4R73A 1LGBC 3D4CA 1MH4A 4ELRA 3PPOA 2F78A 1PB9A 2XXWA 1TT1A 3LR1A 1A8EA 4OEUA 4LVQA 3R6UA 4JSOA 2R6GE 5K2XA 2I58A 4LZ7A 1B3LA 3FIRA 4YKKA 4LA9A 1SQYA 4F39A 3G3JA 2IEEA 3BBRA 3MQ9A 2O68A 5IKBA 1B4ZA 3VDFA 1B5JA 3IORA 2THIA 2Z22A 4ZEKA 4GIZA 3H7MA 4R2BA 1MPCA 3R26A 5CI5A 3KN7A 1UTBB 3UP9A 5H8FA 3K6XA 4ECFA 3ILUB 4R72A 4MH5A 4ZEBA 1FQEA 4O3BA 4OQOA 5B70A 3PPRA 5I56B 1LB8A 2HAVA 5L9OA 4DLDA 1LFGA 1DPPA 2I4CA 2E0SA 3EQ1A 1AOVA 4KYDA 4MFIA 1N3WA 3UORA 1LLSA 2XXYA 2O69A 4QFOA 4FJPA 3PGFA 3EHSA 1US4A 2XXVA 1N3XA 3W9WA 3FV1A 3U92A 1IXCA 3OO8A 3FJGA 2W7YA 4XKQA 3E3KA 1Y1ZA 1SW2A 4EUOA 5KDTA 4G8HA 1H44A 1OVBA 1R9LA 1A55A 3O6HA 4NF4B 3TCHA 3MVYA 4X9TA 5I58A 3UGWA 3K6VA 1SW4A 4YKJA 4EF2A 4U4SA 5DT6A 2YPNA 3FVNA 3HCQA 3HV1A 4H6DA 2ONSA 5ITPA 5H8FB 3MPLA 5ICTA 4KQPA 4YMAA 3CR9A 3ECRA 1Y9UA 1WODA 3IOTA 2XXPA 3H6WA 3GBAA 2PT2A 4LUBA 3A3CA 1YTVA 1O7TA 3VXBA 4UA8A 4OHNA 3GBBA 4DIGA 3IB1A 4QFPA 3KZGA 4XTCQ 3B7DA 4LQ5A 2R71A 3PUWE 1TWYA 5ITOA 4POXA 2ESNA 3N6UA 1MRPA 4HCYA 3IJXB 4YB6A 2ZNTA 2Q8JA 2XD3A 3OXNA 2I0CA 4UACA 2O1LA 5KDTB 2O1MA 4IGTA 2QS1A 3FVOA 1URDA 3K00A 3LSFB 1JEVA 2E1SA 4U2RA 5AA3A 5DVJA 4DXBA 2OJTA 3S2VA 1ATGA 4ELQA 3FVKA 4G8NA 3TAJA 2A5TB 5LOMA 2ZYMA 5IAIA 3M3FA 3VLUA 5TU0A 5CMKA 2Z8EA 1SW5A 2CMOA 2DXYA 3N26A 2OCUA 3PMVA 5H8HA 1NMUA 4YICA 3N94A 3TCFA 1FQCA 1IIWA 3O29A 1NH7A 2YLNA 1BIYA 3S9NC 2GH9A 4ZECA 4F2OA 3T66A 1B5HA 1QKAA 4NF5A 1P1NA 1I6AA 4YKPA 1MXZA 4MLVA 3OD7A 2Y7RA 4RXLA 2DS9A 1LFIA 2DSFA 4NMYA 3MVWA 4RK2A 3QIMA 3PD9A 1HSLA 4R74A 4U22A 1RYOA 3MZBA 1P1QA 3DP8A 3IL1B 4RPNA 3U8QA 2YJPA 4IO3A 1EH3A 1B7ZA 3KSJA 4IGRA 3H6VA 3KGCA 3N5LA 4KYSA 1HSEA 4ISUA 3RNNA 3PPNA 4X1DA 4NF6A 1D4NA 3HHGA 2UYEA 1FTOA 1N0TA 1MY0A 4OFJA 4FIMA 3MJNA 1MDQA 5H8HB 2DE2A 1UIUA 1UTHA 4TOZA 2DQVA 2AYSA 3PUYE 4KI0E 2KLFA 1WVJA 4HW8A 4DCYA 4R9GA 1JW4A 3C32A 4NF5B 3QAXA 1VE4A 3O6IA 2V25A 1Q35A 1L5TA 4Z7EA 3MPKA 3TFLA 2ZYNA 1M5EA 4YKIA 2PYYA 3H6UA 3UIFA 3T96B 3RTFB 3IAZA 3G3HA 3P7IA 4GOTA 3S4UA 1ZIUA 1D9YA 1ELJA 2V3UA 4ZE8A 1YPNA 4ELOA 5H8QB 3U94A 3CSBA 1B7UA 3CI8A 1DPEA 1LAGE 4YAHX 1NKXA 2O84X 3OO7A 1N76A 3CSGA 3SERA 3A3UA 3MZ1A 4JDFA 5F1QA 3ZS6A 4IY6A 3C36A 3O28A 4NF6B 4FAJA 2OWTA 2VHAA 5TP9A 2V3QA 3THIA 1OIBA 1ZTYA 4ELPA 1NH8A 2UVGA 4NEDA 3V8XB 4GFRA 5AA1A 2QS2A 2X7PA 2OBGA 4WKMA 2B3FA 3SDFA 1UTHB 3ILTB 3KOTA 2VD2A 4XKRA 2I49A 4Q5TA 2F7AA 4BDNA 4U23A 3SEUA 1VR5A 1R6ZA 4N07A 3T9UA 1IXIA 2NWJA 3OOAA 4U4XA 3JYRA 4OVJA 4OEVA 3W15C 4R9FA 2Y7PA 2IA4A 1NFTA 2HFBA 2ZYKA 2FA7A 3S9MC 3VXCA 3L6GA 1PC3A 4U21A 4R75A 4PFWA 1SW1A 3IO6A 3KEIA 4JBZA 2DYXA 3TCGA 3IJOB 3IX1A 2PT1A 1FTLA 4PFTA 4OTEA 1FTMA 1B5IA 2ZYOA 5DVFA 4KPTA 2NXOA 5L9MA 3H06B 5KZTA 2ALUA 1N84A 5I2NA 4LATA 1MM6A 4F1VA 5TP9B 4JWXA 3U93A 3E9XA 4GD5A 3SETA 5HBCA 3A09A 1USYE 2B3BA 4OWDA 4F2QA 3KOSA 2Q9TA 1OQHA 4NE4A 3MZ9A 1IZ1A 1XOCA 2H98A 1IXHA 4G68B 3I6VA 3PV0E 3IOWA 2HCAA 5FHMA 5KCJA 4ESXA 4ZEIA 4QFLA 1I6QA 3QYTA 1JW1A 3C9HA 3C33A 2ZXTA 4IO4A 5JK4A 2RC7A 3TZAA 4GWOA 4NWDA 1SYHA 3TYHA 2DWJA 3KN8A 5CRYA 2F7BA 4G2ZA 4H0WA 4EXLA 3FXQA 2XD2A 2RCBA 4TLMB 1LCTA 5F7VA 2OK2A 3DP4A 1A54A 3QSLA 2I6EA 3M3LA 3AXFA 1AL3A 1GV8A 4AB6A 2ANJA 1B05A 4RYAA 1B6HA 1WDNA 3S9EA 4OESA 3T9HB 3PUZE 3BFUA 5I2KA 4XKNA 1B46A 4ZZEA 5ICQA 3EHUA 3HPIA 2P1SA 3CG1A 4LQ2A 2UVHA 4H5FA 2G93A 4XXUA 3EPEA 5FHOA 3K4UA 1GGGA 3T93B 5KCJB 1B1HA 2DE3A 2VP1A 4POWA 4RA1A 3UN6A 1LAFE 2BJJX 2F36A 5AA2A 4GL8A 3VE1B 3IO4A 2I4BA 1B7HA 3RT8A 4H65A 4GVOA 4YB5A 1YCJA 2I3VA 3IB2A 1MS7A 2Y84A 4K3FA 2O51A 4F1YA 3K6WA 2XXQA 4YMBA 5AE4A 3LSWA 1AH5A 1LAXA 3BFTA 2Q89A 1P1WA 1FQBA 3FV2A 4RPOA 2QL3A 4F31B 2UVIA 3TTMA 3S9LC 2HXWA 4Q0CA 4GRKA 1A99A 1MDP1 1R9QA 4IO7A 1ZU0A 4U1OA 3SKPA 1Y3PA 4OXVA 3M8UA 2I0BA 1QULA 2PX1A 4MLQA 3TTRA 1IUDA 5DVIA 1Y3NA 4ZDMA 2GFEA 4NWCA 5I58B 3PPQA 2Q2AA 4HTGA 1UIVA 3IOVA 4TLLB 3JZJA 1PBPA 3DLNA 2OZZA 4XKPA 3GLBA 4H1XA 1QUIA 3CRBA 3KN3A 4O3CA 2F5XA 1MXVA 4KCCA 1LB9A 3MVZA 3MBPA 1FW0A 1MY4A 3K1NA 3LUYA 2XXUA 3QUFA 1Y4CA 3ZSFA 2H25A 3TTNA 5DYHA 2UXAA 2QMWA 2D21A 4QFNA 5FTIA 4ESWA 3BKIB 3GXAA 4QSDA 2ZNUA 1Y4TA 4ONYA 2F34A 5J1DA 1QVSA 1JEUA 3SEXA 3KSXA 2X26A 1HSJA 2H5YA 4KR5A 2Q88A 3TMGA 1OLAA 2ZNSA 2ONKE 4BDMA 4GQOA 1POTA 1S7YA 2A5SA 5JEIA 3VVFA 1JETA 3HHFA 1GTKA 2NOOA 3MC2A 1B51A 2PVUA 1MPDA 3DP6A 1ZBMA 4ND9A 3OENA 5HM4B 2R9JA 1SVXB 1QKBA 4X48A 1POY1 3QK6A 3USDA 2M8CA 3FXRA 3TQLA 1P1UA 4EDPA 4LONB 1MQDA 4BDRA 3TTKA 1EU8A 4H8JA 3E13X 3RN8A 1B9JA 2X7QA 1ZLQA 1MY1A 3FJMA 1ZKBA 4BDOA 3ODBA 1ZMGA 5I57A 5DEXA 3MVXA 1PB7A 1B32A 2REJA 3LBSA 4JWOA 2HQ0A 5L9SA 3Q25A 3FXUA 2Y7IA 1NNFA 1LBCA 3SEYA 4GXAA 5K2YA 3KFMA 1II5A 1SD3A 2PMSA 3O66A 4G68C 4DE8A 2XHDA 1SYIA 4C0RA 4KHZE 4BDLA 4N6PA 4P0IA 4ZE9A 2FYIA 4E0WA 1H43A 4Q30B 3G7WA 1QW0A 4IY5A 2XXIA 4QSCA 5TPAA 5FHNA 2AL5A 4G8MA 4EQ7A 4GXSB 4WEPA 3TODA 1B1XA 1MXXA 4NF8A 3LSXA 1M5FA 3OSQA 2G29A 3FZVA 3WAEA 4F1UA 1MM7A 5JTYA 1T0KA 3VV5A 4I9DA 1XC1A 4FORA 3OO9A 4FEDA 3U72A 3IK6B 1BP5A 5I84A 4FE8A 3TKDA 2HAUA 4L17A 1I6BA 4ZEDA 1S50A 1M5DA 1LSTA 1FTKA 2D3IA 3SESA 4E0XA 1D9VA 1B0HA 4Z0IA 1FCKA 2B65A 3OO6A 1QJMA 1LAHE 1GVCA 3C31A 4OERA 2F35A 2DE4A 2QRYA 3RQTA 1FQAA 3O2AA 5HPQA 4F22A 1YAEA 3IOUA 3FGSA 3C4MA 2QPQA 1H76A 3V83A 3OEMA 5FTHA 5A5XA 1F9BA 3N6TA 3E4RA 3Q28A 2CZLA 4JSDA 3K02A 1B3GA 4DCXA 3V89B 1Y1MA 3EN3A 3H6TA 1XVXA 2ZMBA 1N04A 1VFEA 1FQFA 3M3KA 3DELB 5TPAB 3H3GA 4IB2A 4DXCA 1FQDA 2FNCA 3PD8A 1AIVA 1EZPA 3T9VA 4NF8B 3PUVE 1B2HA 5I56A 4LZ5A 4DDDA 1A8FA 2H9BA 3VLVA 1IXGA 3RGYA 2QS3A 2F6GA 3KJ7A 5ISUA 1ZJLA 2VOZA 4P0GA 3IB0A 2O7IA 3QUJA 2GHBA 3PU5A 5EHSA 4AQ4A 4THIA 4QRZA 3MUQA 5CMCA 3B6QA 3G3IA 4HCWA 2AIXA 3KG2A 3DM0A 2F6PA 1OMPA 2GHAA 2RCAA 1URSA 4KD5A 3FUZA 1BLFA 4NF4A 1ANFA 3VVDA 3KJTA 5L8DA 1JQFA 3C34A 3TQWA 4BLAA 1P99A 5A5XB 3FASA 3IR1A 2XX9A 4PQJA 1B40A 3I5OA 3ZKKA 3SEWA 1B3FA 4IO5A 4P11A 3OMBA 1MPBA 2F97A 3RLFE 3T22A 1SI1A 2P0SA 2F8DA 4ZZAA 2XX7A 2LAOA 4QHQA 3FATA 3VVEA 2ONRA 1BTJA 4I8CA 4GL0A 2F7CA 3VLWA 2RC8A 3G3KA 1D3KA 1DSNA 4I62A 3UK4A 3O97A 1N7XA 5I2NB 3K2DA 2H99A 5AA2D 4QF9A 1MXUA 3RY3A 1NNTA 1JVXA 1Z7ME 1QUJA 4IO6A 1VFDA 2XXTA 3T9XB 4F3GA 4OETA 2ABHA 4DXUA 3CG3A 3HN0A 4OENA 5I59A 1R1NA 3EHTA 4RK9A 1EZ9A 3MAMA 3B6WA 2Y7KA 5CMMA 1VSOA 3H03A 3TELA 1MXYA 4H67A 4N13A 3ONMA 4RJZA 2A5TA 3CIJA 1B0LA 2O7UA 1A40A 4F3PA 1OLCA 3O6GA 2XXXA 4NTLA 2XXHA 1IEJA 2V93A 4ZS9A 1RYXA 4YB7A 2QSXA 4DZ1A 2I3WA 5AA4A 1N7WA 1DTGA 4I1DA 3K6UA 1H45A 2RINA 2V84A 4F18A 1QUKA 2DOJA 1MY2A 4OYVA 1BKAA 3HSTA 3G3GA 1O64A 1DMBA 2QMXA 4JWYA 1M5BA 2OWSA 3PMWA 1MQGA 4O3AA 4F3BA 1PB8A 3GZGA 1NNPA 2I48A 1FTJA 5I2KB 2Q2CA 4F29A 4WXJA 2HZKA 1XVYA 5I59B 2OLBA 3HO7A 2DWIA 4OFLA 3LSLA 5H8SA 1SDXA 3MWBA 4OFOA 3UA8A 5AA2B 1JVYA 2XXRA 1P1OA 2DVZA 4H5GA 1CB6A 4EQ9A 2HEUA 4GLIA 1USYH 3JV9A 3RT6B 4X1BA 4RNSA 4RY1A 3OSRA 3TEPA 3PMXA 3K01A 1J1NA 5AA4B 3ZKLA 5DTBA 3MP1A 4IO2A 1NNKA 3O9PA 4C1UA 3Q26A 1MQJA 4WEDA 1JW5A 1TFAA 3RTWB 4HS7A 1O63A 3D4GA 2REGA 2DWAA 4Q8RA 3PUXE 3TDJA 4PFUA 5M2VA 3MP8A 1SI0A 1RKMA 1B52A 1LBBA 2RKMA 5BWJA 2Z8FA 1CE2A 5B7DA 1S9TA 4G77A 4EXKA 3F11A 1MH3A 1GR2A 3B6TA 3K1PA 3C35A 5H8QA 4KFQA 5CMBA 1TFDA 1US5A 1EZOA 3TUSA 2NUVA 2P2AA 1UQWA 4QSEA 3MW0A 2HZLA 4FATA 5CBSA 1NL5A 2Z23A 1TXFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1B4HA 2WKYA 5CM6A 2XX8A 3RUMA 4OA4A 1LFHA 5EYFA 4YZZA 2V3TA 3QXMA 4PP0A 4EQBA 4R2FA 2RF1A 4PETA 4PC9A 1Z7NE 4EF1A 5H8NA 2UVJA 4MF3A 4R6YA 4TQUQ 1DCUA 1FPBA 1KWHA 2QJEA 2RC9A 4XIGQ 2D5WA 4F19A 1FSAA 3CVGA 2FBPA 2F3BA 3LC8A 2AL4A 2QVRA 2XWOA 3FBPA 1IITA 5ELVA 4GWWA 5EHMA 4XEQA 3FD3A 3B50A 4N4UA 4MX6A 3VFJA 1PEBA 1Q1KA 4U1ZA 3TPAA 1B3EA 1YZ0A 3ROJA 1INPA 3MP6A 3L6HA 2Y7WA 1PDAA 4GWXA 4R6HA 4R6KA 4LP2B 1KA0A 1I69A 1MY3A 1DTZA 3Q29A 3SEVA 4PE5B 3CFZA 2DXRA 2GRVA 1MXWA 3W9VA 1FPFA 2O6AA 3RPWA 1FPDA 4KCDA 3I3VA 4FECA 3FJ7A 1DOTA 3FVGA 2DP8A 2WBDA 4JXIA 2VGQA 1A7LA 3TTLA 3PPPA 1IMFA 3KBRA 4OMBA 3HFUA 4C1TA 2NVUB 5CBRA 4PFYA 3EF7A 5I57B 4KYEA 2H4IA 3U1OA 3WAFA 1PBQA 5DEXB 1B58A 4OVSA 3K1MA 1JNFA 2DVCA 2UYFA 3H4ZA 3IFCA 1URGA 1B3HA 1M5CA 2ZZVA 4G4PA 4OZ9A 4LZ8A 1LCFA 2QS4A 4AB5A 1D9QA 4BDQA 2PBWA 5CC2A 5H8NB 4YU0A 1UTBA 1Y3QA 3K0VA 2VD3A 1Y20A 3OELA 3CFLA 4QFKA 4G68A 1XT8A 4F3SA 1IQ7A 4H8IA 2L5VA 4ZEFA 4JB7A 1XS5A 1MG1A 1FJ6A 1OQGA 1AMFA 4H45A 1OVTA 5BUUA 4PBQA 2FHYA 1XHYA 1SBPA 4M4GA 4GF8A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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