3KN3A

Crystal structure of lysr substrate binding domain (25-263) of putative periplasmic protein from wolinella succinogenes
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
237
structure length
237
Chain Sequence
AAELRMATTTSTDNTGLLDVLAPAYKKDTGVDLKWVAVGTGNALKLGENCDVDVVFVHAPKVELEYVEKGFGIDRTPVMYNDFVIIGNPSFKQKFTGMSVAEAFKLIEKEQVKFVSRGDKSGTHSKEREVWKEALGKIPEKESWYIEAGQGMLATINIAEEQKGLTLTDRGTFIKYESNHKGKPPMVIVLEGDNTLKNFYSIMAVNPKRCEKADYKGAKQFIDWIVSEKMQAEIANF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription
molecule keywords PUTATIVE PERIPLASMIC PROTEIN
publication title Crystal Structure of LysR Substrate Binding Domain from Wolinella succinogenes
rcsb
source organism Wolinella succinogenes
total genus 79
structure length 237
sequence length 237
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-11
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kn3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kn3A02
2HQ0A 2Y7IA 4OMBA 4ZEDA 2XHDA 1NMUA 3PD8A 3IK6B 1US4A 3G3JA 3M3KA 1Y3QA 1EU8A 4QSEA 3MP1A 1MPCA 3Q27A 3OSQA 4PFUA 2CMOA 1B1HA 2H9BA 2RCAA 4F1UA 1NNTA 1POY1 3W9WA 1ZKBA 5AA3A 4MLVA 4I62A 3PPOA 3EHSA 1MRPA 3F11A 1JEUA 4KQPA 4KHZE 1LGBC 1MY2A 4NWCA 3M8UA 2H98A 3A3UA 2I4BA 1PEBA 3TKDA 4H5GA 2YPNA 2ZYKA 1MDQA 2RF1A 4DZ1A 3SEYA 1GR2A 4POWA 4OEUA 3T93B 2OWSA 4NTLA 3VXBA 1D3KA 4OQOA 4QF9A 4LATA 3B6WA 3FUZA 3JZJA 4EXKA 2F6GA 1DTGA 3QXMA 2I58A 4F3SA 3RPWA 1IEJA 2HAUA 1LSTA 3CSGA 2XXRA 3C4MA 3FVOA 3M3FA 4I1DA 4H0WA 4F29A 1MXUA 1TFDA 2PVUA 4OVJA 2X7QA 2F8DA 5EHMA 3OO7A 4QFPA 4YKJA 3QYTA 2NUVA 4YMAA 3K1NA 1Y3NA 3RTFB 3EHUA 3VV5A 1A54A 3CFZA 3CI8A 4PQJA 4EUOA 3OOAA 2B3FA 4F31B 1M5EA 3KG2A 1JW1A 2R71A 3PV0E 3UORA 3D4CA 4O3AA 1MQIA 1M5DA 2G93A 3KEIA 4QFNA 2H4IA 1P1UA 5TU0A 5IAIA 1PC3A 2YLNA 1ANFA 1R9LA 3B6TA 4R9GA 1OMPA 1KWHA 1B3LA 2ALUA 3HHFA 2QMXA 4Z7EA 1XT8A 1B7HA 5CBSA 2I6EA 3BBRA 4C1UA 1DTZA 3CVGA 4C1TA 4GRKA 1B3GA 5DEXA 3K4UA 1LAXA 2V84A 3SETA 1NKXA 4H6DA 3TELA 4HTGA 4ZE8A 1BLFA 5FHMA 1IIWA 5L9OA 4LVQA 1B4ZA 4DXCA 1GGGA 3T22A 1OLCA 4NF4A 4YKKA 2THIA 4OFOA 4RA1A 1QUIA 4Q8RA 5CMMA 4E0XA 1RYOA 5H8QA 1EH3A 1SBPA 3U72A 5CI5A 1JW5A 3G3IA 1US5A 1B52A 3ODBA 2XXVA 3IOWA 3VE1B 4GL0A 5J1DA 3TUSA 4JBZA 1OQHA 3B7DA 2NWJA 2P2AA 1CB6A 4DE8A 4DLDA 4ZZAA 2RKMA 2OZZA 1ZJLA 3E9XA 3ECRA 4ELRA 5JTYA 5H8FA 4ELOA 1USYH 4F19A 1EZPA 1ZIUA 2I0BA 3CG3A 4F39A 2Z8EA 3FV2A 1MXXA 1I6BA 4Q30B 5M2VA 1I69A 3Q28A 4EQ9A 3R7XA 4YKPA 4RPOA 4NMYA 2F6PA 4GLIA 4N13A 1A55A 5DTBA 3TQWA 1LBCA 2O51A 3I6VA 4PFWA 3U93A 2E0SA 1RKMA 2KLFA 2DP8A 1JETA 4LQ5A 1MDP1 1FQAA 5DEXB 4U1ZA 4OENA 3THIA 2ZXTA 3TODA 3IOVA 4H8JA 2IEEA 1SW2A 3KZGA 3N5LA 1MS7A 4NF8A 3SERA 2I48A 3K1PA 4H8IA 4GXAA 2GRVA 4P0IA 5HBCA 3ZKLA 2VHAA 5A5XA 4JSOA 4ND9A 2D5WA 4HCYA 4NF4B 3ZS6A 4DCYA 1R6ZA 3GXAA 1II5A 3TCGA 4ECFA 5H8QB 2G29A 4JXIA 5HM4B 1SW5A 5CC2A 1LAHE 5H8NA 2XD3A 3O66A 3V89B 2ONKE 1B40A 3VLVA 2HEUA 1VFDA 5EHSA 2RC8A 3E13X 1IXIA 3VVDA 1GVCA 1DSNA 3EPEA 3EF7A 1MXWA 3IB1A 1AH5A 2QJEA 4BDNA 2NOOA 3FVGA 2VGQA 3K6XA 5JTYB 3TQLA 4YAHX 5H8FB 2F7CA 1M5FA 1M5BA 4R9FA 3E3KA 4LP2B 2HZLA 3TTRA 1YPNA 3GLBA 3PGFA 4FEDA 3K01A 3M3LA 4AQ4A 2F36A 2Q2CA 4BDLA 4ZEBA 2DWIA 4ELPA 2RINA 4RJZA 2D21A 3VLUA 2DE2A 2AL5A 2DOJA 3FJGA 2QSXA 2W7YA 3R26A 2LAOA 3BFUA 3RLFE 4BDQA 2Y84A 1MM7A 3H7MA 1FTKA 5JK4A 3CR9A 2XXIA 4R2FA 3G3KA 1IITA 2XX7A 4NF8B 1P1WA 2GFEA 3MAMA 3FXUA 2DE4A 2ZNUA 3H6UA 4YB5A 3VVEA 2NXOA 3O9PA 5A5XB 4RY1A 1OQGA 3N6UA 5BUUA 4IB2A 4GFRA 3MBPA 2XX9A 1PB7A 1SQYA 1B0HA 3FGSA 1FTLA 3Q25A 2XXHA 3KSJA 3PPQA 4OXVA 5H8NB 1EZ9A 4ESWA 3FASA 1OLAA 3S9NC 3O6HA 4PP0A 1I6AA 3S9MC 1B0LA 1DPEA 4RK2A 2B65A 4ZEFA 2YJPA 3K2DA 1PBQA 3HPIA 2V25A 3WAFA 4YKIA 2REGA 1NH7A 1H45A 1H3DA 4IO5A 5CMCA 3U8QA 4FIMA 4BDMA 2Z22A 1LCTA 1SYIA 4HS7A 5FTIA 2FA7A 2DYXA 2UVGA 2QS2A 3MVXA 3FV1A 4DXBA 3V83A 2RC9A 3TDJA 4H65A 2ZNTA 3FVNA 3IORA 4JSDA 4QFKA 3H4ZA 3IJOB 1B1XA 4U2RA 3OEKA 3LSXA 4KYSA 3PPRA 5KCJB 3OENA 1T0KA 4OZ9A 3OEMA 3B6QA 3PMWA 2GH9A 1N0TA 3JYRA 1D4NA 4ZEKA 2UYEA 2F78A 1Z7ME 2AL4A 3S4UA 2DQVA 4XXUA 3TZAA 2R6GE 4Q0CA 1Y4CA 3KJTA 4L17A 4EXLA 3KOTA 2GHAA 3K00A 2PX1A 3SDFA 1FQDA 1XVYA 1A8EA 4PFTA 4ESXA 5I56A 4R2BA 3O29A 1DMBA 3H6VA 4DXUA 4XKNA 3LC8A 3D4GA 4KFQA 2ZYNA 4ZEIA 4FORA 1GTKA 1QJMA 2I3VA 4ONYA 1UTHA 4TLMB 3TMGA 2I0CA 3FXRA 4U22A 5EYFA 3C33A 3TYHA 1N76A 2DVZA 4F2QA 4M1VA 4G8HA 3VLWA 1MQHA 1AL3A 4N6PA 5ELVA 3HHGA 4H67A 1TWYA 3ZKKA 1URDA 4F3GA 4K3FA 3T66A 1DOTA 4UACA 3PUVE 2FYIA 3OO9A 4I9DA 4IY5A 2B3BA 3DELB 1YAEA 4LUBA 2QPQA 3RUMA 4EQ7A 1MPDA 2RCBA 3SEWA 2PBWA 1PB9A 1NNKA 1BKAA 1Y1MA 3L6GA 2V3UA 5CBRA 1LFGA 2D3IA 3U94A 3IL1B 2FNCA 4POXA 2I3WA 1MH4A 4BDOA 4FECA 4HCWA 1JEVA 5CMBA 1B2HA 1S50A 1XVXA 4N07A 1QKBA 4IY6A 2Z23A 1FTJA 1B3FA 1YCJA 2DWJA 2XXYA 4ZZEA 4OETA 5ITPA 4H5FA 2A5TA 2Y7PA 2DS9A 4ZE9A 3PUYE 1BTJA 3ILUB 2XX8A 3MW0A 2O1MA 4KI0E 1N3XA 2PT2A 1P1OA 4IO4A 2XXWA 3FD3A 4OESA 4U4XA 4ZS9A 3Q29A 2IA4A 1MXYA 1SI1A 1B7ZA 2V3TA 2OLBA 2E1SA 5I56B 1GV8A 4QRZA 2M8CA 4MBPA 4PETA 4JWYA 1I6QA 5I57A 2ESNA 1F9BA 3TFLA 1URGA 1UTHB 1NFTA 3TPAA 4PFYA 4X1BA 2VP1A 1CE2A 2DSFA 1XHYA 4IGTA 1XOCA 2QMWA 4KYEA 4X1DA 2O7UA 2REJA 3T9UA 4KCCA 3SKPA 1M5CA 3O2AA 1B51A 1Y20A 4YZZA 3FJMA 4JB7A 1LAFE 1O7TA 1TXFA 3UN6A 2HXWA 3TTNA 2O1LA 4NE4A 4I8CA 4F18A 3TCHA 3MPLA 3K1MA 2VOZA 3IAZA 3VFJA 4U23A 2Q89A 4QSDA 4NF5A 1D9YA 4ELQA 1JNFA 5H8HA 3HSTA 3G3FA 3L6HA 3IO4A 3T9VA 2ANJA 2F7BA 2QS3A 2I49A 3G3HA 1SW1A 5ICQA 4O3CA 1UIVA 3MQ9A 1B32A 2AIXA 3MP8A 3HCQA 1SI0A 2A5TB 3C31A 3UGWA 3K6UA 1N04A 5TPAA 1B4HA 1ZTYA 1FW0A 3P7IA 3RT8A 4RPNA 1H43A 2DWHA 1JVXA 1MQJA 4C0RA 2BJJX 3PU5A 3LSLA 1QUKA 2OJTA 4R74A 1R9QA 5CRYA 3EN3A 1B3HA 1P1NA 5I57B 3FZVA 2DVCA 3S2VA 4JWOA 3T9XB 3SEXA 3S9EA 4X48A 1B6HA 4DCXA 3TTKA 5F1QA 5L9MA 2VD3A 2ZYOA 3T96B 2DWAA 4R72A 1H44A 2V3QA 3KJ7A 3KBRA 3ONMA 4M4GA 1BP5A 1FTOA 1S9TA 3U1OA 1USYE 1TFAA 2XXXA 3QK6A 4EF2A 1TT1A 3MVYA 2XXQA 1Y1ZA 2Q2AA 4F1VA 2ABHA 4RK9A 5AA2D 1OVTA 1QVSA 4MFIA 2QS4A 5KCJA 3G3GA 4THIA 4TOZA 3CFXA 3UP9A 1DPPA 4F1YA 3H3GA 3MC2A 1A40A 4FJPA 5FHOA 5ISUA 4NF5B 2H99A 4OHNA 2XXTA 5H8HB 4O3BA 1MY1A 4DIGA 1L5TA 1XC1A 4IGRA 3W9VA 3FATA 4R6KA 1N7WA 4EF1A 4GQOA 3GBBA 3W15C 3ZSFA 5AA2A 1Y3PA 1S7YA 1IXHA 3IR1A 1WDNA 1BIYA 5I2KA 4AB5A 3RTWB 2V93A 4RXLA 1LLSA 4OYVA 5TPAB 3OSRA 4G8NA 4KPTA 1FTMA 3PUZE 4IO7A 4QSCA 1B46A 5K2YA 5LOMA 3N26A 4P11A 2VD2A 1YTVA 1O64A 4GIZA 1A99A 1P99A 4G68A 3V5AA 3WAEA 3RQTA 3KGCA 3BFTA 5AA4A 1R1NA 1IUDA 1LCFA 4TQUQ 3HV1A 1AOVA 3UK4A 3IJXB 1P1QA 3OO8A 1O63A 3IB2A 1LAGE 3C9HA 4KD5A 1QULA 1SD3A 5KDTA 1UTBA 5DVJA 2R9JA 4WXJA 5B70A 4PE5B 1LBBA 3LUYA 1LFIA 1ELJA 4LZ5A 4GL8A 4OFLA 1MM6A 4YU0A 3KN7A 4OWDA 3QUJA 3MVZA 3RY3A 3MWBA 1MPBA 1ZMGA 3LSWA 3PUWE 3PMVA 1SW4A 4BLAA 1PB8A 1FQCA 1VE4A 3H06B 1NNFA 3C32A 3JV9A 5H8SA 3PD9A 4OTEA 3MZ1A 4YMBA 3IO6A 1A7LA 5F7VA 3S9LC 4IO2A 2F35A 5AA2B 2WKYA 1XS5A 4XKPA 5I2KB 3SESA 1PDAA 2I4CA 3UA8A 3PPNA 1LFHA 3SEUA 2PT1A 5K2XA 3K0VA 4LZ8A 3A09A 1HSEA 1FQFA 2PYYA 5TP9A 2Y7WA 4LONB 2QL3A 3V8XB 1Q35A 3O6GA 4R6YA 1AIVA 1MXZA 2XXUA 1N7XA 5I59A 1B5JA 1WODA 4MLQA 1MXVA 1Z7NE 3RT6B 3N94A 2UVIA 4IO6A 3H6TA 3EQ1A 3C34A 2Q88A 3DM0A 4G68B 1ZBMA 3MJNA 1MY4A 5ICTA 3C35A 1QUJA 5AA1A 5AA4B 4X9TA 2OWTA 4FATA 1B5IA 3KFMA 1SYHA 4U21A 1QW0A 1WVJA 3FVKA 1MG1A 3KN3A 3TTMA 1HSJA 1B3EA 3MP6A 5KDTB 3CRBA 3DP4A 1UTBB 3IOUA 3QSLA 1B5HA 2GHBA 4P0GA 4XIGQ 4QHQA 1MQGA 1B05A 4OERA 4BDRA 4FE8A 1ZLQA 2DXRA 2F34A 1JW4A 3K6WA 5AE4A 5BWJA 1MY3A 2CZLA 3MZ9A 2ZMBA 1URSA 4WEPA 4ZDMA 5JEIA 4QFOA 5B7DA 4WKMA 5L8DA 4G4PA 3H6WA 1J1NA 3O97A 2QRYA 4GOTA 3U92A 3IOTA 1NL5A 2DXYA 2OBGA 4JDFA 4NF6A 4F3BA 3FIRA 4Q5TA 3VDFA 3K02A 3MPKA 1UQWA 4RNSA 4MH5A 3CFLA 4YB6A 4XKQA 4G2ZA 5TP9B 1FQBA 2PMSA 4EQBA 1LB9A 3IX1A 4AB6A 3IB0A 3HN0A 5I59B 4R75A 3TEPA 4E0WA 3SEVA 4MF3A 1H76A 3RGYA 2O68A 4EDPA 1UIUA 2HAVA 3USDA 3A3CA 4H1XA 2DE3A 3K6VA 3FJ7A 3RN8A 4WEDA 2XD2A 4GXSB 2Q9TA 3ILTB 3MVWA 2UVHA 1VSOA 3MUQA 3GBAA 3DP8A 1VR5A 5I58A 3CG1A 1ZU0A 3RNNA 4GWOA 5IKBA 1EZOA 3BKIB 1JQFA 3KOSA 1PBPA 3DLNA 3H03A 3QUFA 1SDXA 4XKRA 3E4RA 4U1OA 3TAJA 2Z8DA 1Y9UA 1IXGA 4KCDA 3TCFA 4OFJA 4IO3A 2UVJA 3PUXE 3UIFA 1SVXB 2P1SA 1Q1KA 4FEBA 1NH8A 3PPPA 2RC7A 2Q8JA 3LBSA 1IZ1A 1B9JA 3N6TA 3VXCA 3OD7A 3LR1A 3CSBA 2F7AA 4DDDA 4NF6B 4LZ7A 1NNPA 3OO6A 3I3VA 4F3PA 2ZNSA 4R73A 2QS1A 4Z0IA 3T9HB 4TLLB 2OK2A 3HO7A 5I2NA 5KZTA 2ONSA 4OEVA 2Z8FA 4FAJA 3O6IA 1VFEA 1Y4TA 4KR5A 2O6AA 4RYAA 4F2OA 5DVIA 3KN8A 4KYDA 3Q26A 3QAXA 3FXQA 1HSLA 5ITOA 1RYXA 2O84X 1FCKA 4JWXA 4GVOA 1AMFA 3MZBA 3CIJA 4G77A 2UXAA 1MY0A 1OVBA 1QKAA 4G68C 3G7WA 3O28A 1OIBA 2H25A 2X7PA 3I5OA 1IXCA 2UYFA 2P0SA 4ISUA 2X26A 5I58B 2A5SA 1MH3A 1MQDA 3EHTA 2Y7RA 5I84A 4HW8A 2HZKA 4ZECA 2F97A 5FHNA 2O69A 5DYHA 1N84A 3VVFA 3OMBA 3KSXA 3GZGA 2O7IA 2HFBA 4GF8A 4U4SA 3R6UA 4NEDA 4QFLA 2OCUA 3C36A 1FQEA 1B7UA 4UA8A 2H5YA 2XXPA 4YB7A 1D9VA 3QIMA 3AXFA 4LA9A 2NVUB 1JVYA 3OXNA 5CMKA 5FTHA 4G8MA 3DP6A 1B58A 3TTLA 3PMXA 2ONRA 1A8FA 5L9SA 1ATGA 1N3WA 3LSFB 4R6HA 4XTCQ 2Y7KA 5DVFA 3OELA 4GD5A 2F5XA 5I2NB 5DT6A 2HCAA 4NWDA 1POTA 2AYSA 4YICA 5CM6A 4F22A 2ZYMA 5HPQA 1IQ7A 1LB8A 4LQ2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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