3KN3A

Crystal structure of lysr substrate binding domain (25-263) of putative periplasmic protein from wolinella succinogenes
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
237
structure length
237
Chain Sequence
AAELRMATTTSTDNTGLLDVLAPAYKKDTGVDLKWVAVGTGNALKLGENCDVDVVFVHAPKVELEYVEKGFGIDRTPVMYNDFVIIGNPSFKQKFTGMSVAEAFKLIEKEQVKFVSRGDKSGTHSKEREVWKEALGKIPEKESWYIEAGQGMLATINIAEEQKGLTLTDRGTFIKYESNHKGKPPMVIVLEGDNTLKNFYSIMAVNPKRCEKADYKGAKQFIDWIVSEKMQAEIANF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords PUTATIVE PERIPLASMIC PROTEIN
publication title Crystal Structure of LysR Substrate Binding Domain from Wolinella succinogenes
rcsb
source organism Wolinella succinogenes
molecule tags Transcription
total genus 79
structure length 237
sequence length 237
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-11
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kn3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kn3A02
1B7HA 3S9EA 2O1MA 2XXWA 4KYEA 3FVGA 4ZEBA 2I48A 4KPTA 5H8SA 1ZLQA 3MW0A 3W9VA 4L17A 2F6GA 3LSWA 4R9FA 2PT2A 3K2DA 1FTKA 3TCFA 4MFIA 4AB5A 4IO2A 3FJ7A 5HPQA 3CG1A 1ZBMA 4Q0CA 5L9SA 1B3EA 1QULA 1CB6A 3IOWA 4KHZE 4N13A 4EUOA 1SDXA 3LSXA 2QMXA 5DVIA 4RPNA 3BFTA 1T0KA 4FECA 2RCBA 3MBPA 4R6YA 1LAXA 1H44A 4KFQA 2DE3A 5M2VA 4IGTA 3RLFE 1B3GA 4OFLA 1SBPA 1ZKBA 5JK4A 1B9JA 5HBCA 4XIGQ 1UIVA 1JQFA 4OQOA 4KCCA 5I59A 5AA2A 3IL1B 3EHUA 1NNFA 3BFUA 5FHOA 4UACA 4GF8A 3G7WA 4TOZA 2RINA 3VLVA 4LVQA 4EF2A 5KDTB 1NKXA 1BP5A 2DWJA 3CRBA 4YMBA 1RKMA 3U93A 1B4ZA 1ZMGA 3KN7A 3IORA 3LBSA 3PPOA 4M4GA 4LP2B 4XKNA 1JW1A 2F5XA 2I49A 2Q89A 4RNSA 2F36A 1B3LA 3K6XA 3L6GA 3FVNA 1D4NA 2VOZA 1I69A 4H6DA 3HN0A 3H03A 2HQ0A 1JVYA 4QF9A 4PQJA 4H8IA 4LQ2A 1GR2A 4YU0A 3CG3A 4DCXA 4JWOA 2W7YA 4E0WA 4KI0E 4FEBA 5I57A 3OD7A 4G77A 5EHSA 5B70A 3CVGA 2Z8DA 4ZEIA 5TP9A 2QS1A 3QYTA 3U92A 1MH3A 1D9VA 4YICA 3VV5A 2HXWA 3UK4A 3H6TA 3MPKA 4YAHX 2I3VA 1TXFA 4POXA 3T9XB 1IIWA 4GL0A 1R9LA 3PD9A 3CSBA 4U23A 1Y4TA 3OO9A 3QIMA 1FW0A 1S9TA 1A54A 3TTLA 5I58A 5H8NB 3H6UA 3O6HA 2YLNA 3T22A 5AA1A 1S7YA 2Y84A 3RNNA 2O84X 2ONSA 2XXHA 1Y9UA 3I6VA 3I5OA 3M3FA 1QKBA 3LSFB 2F34A 2F6PA 2G29A 4C1UA 2OWSA 1QUKA 3R6UA 1PDAA 1PBQA 2RC8A 4QSEA 5FHMA 2QS2A 2F7BA 4LZ8A 2VGQA 2THIA 5I2NB 1N3XA 4OVJA 5I56A 3OEMA 1MH4A 4IO7A 4U2RA 1IXHA 1XOCA 1DMBA 4EQ9A 4NF5B 4DLDA 3SESA 1P1UA 1ZJLA 5I84A 1LCFA 3T66A 3P7IA 2Q2CA 5AA3A 3IJOB 3C32A 3TTRA 5L9MA 3RTWB 3MP1A 1SW2A 5FHNA 2O7UA 2REJA 5KDTA 4U4SA 3K1MA 4TLLB 1LAFE 4MLQA 3N5LA 4PETA 4KCDA 1XC1A 3ONMA 2F7CA 3H6VA 2YJPA 2R71A 3FJMA 5A5XB 1RYOA 3GXAA 4X1DA 2AL4A 2F97A 4FATA 2OLBA 2ABHA 4GIZA 4BDOA 1LAGE 3UIFA 4GQOA 2UYEA 1Y4CA 3O6GA 3T9HB 1US5A 3K02A 4PFYA 4ESWA 2FYIA 2QS4A 3MQ9A 4GOTA 3IAZA 4R73A 4R74A 4MBPA 4DE8A 3PPNA 5DTBA 3GBAA 2XX7A 2Z8EA 1P1OA 3DP6A 2FNCA 4U1ZA 2QMWA 4ESXA 3K00A 4LA9A 5KCJB 4GFRA 4ZDMA 4AB6A 2ZYNA 3S9NC 2I58A 3HCQA 3MJNA 4OHNA 3N26A 3QUJA 1PBPA 2UXAA 1I6AA 4FIMA 3DM0A 3PPRA 2Q9TA 4Z7EA 2KLFA 1SW4A 3FXQA 1NH7A 2REGA 5H8NA 2AYSA 3CFLA 2XX8A 5HM4B 2CMOA 3PPPA 1FQFA 5CMCA 3V5AA 3TTNA 3UP9A 3QSLA 2ANJA 1JEUA 1LBCA 1EZ9A 4DXCA 1IITA 3PMXA 5I2NA 4RK9A 3VFJA 1SI0A 4EDPA 3QUFA 3FGSA 3TCGA 3FATA 3WAEA 4FAJA 5BUUA 2RCAA 3G3HA 4ELQA 3T96B 2OCUA 2XXPA 2I4BA 4G2ZA 3B7DA 4NTLA 3PUZE 2E1SA 4NF8B 1P1QA 1MG1A 4C1TA 3VVEA 4F2QA 3CFXA 3GLBA 1SW1A 3V83A 2R6GE 3H06B 2O51A 5AA2D 1WDNA 2G93A 4HCYA 4TQUQ 4YB6A 3IR1A 1B58A 2ALUA 1JVXA 4GWOA 3T9VA 2P0SA 3D4GA 2OK2A 3MC2A 4R72A 1B3FA 2PT1A 2O1LA 2P1SA 3B6WA 1N84A 4IO3A 4BDLA 5L8DA 2DS9A 3KSJA 3ECRA 1LGBC 1OLAA 5ISUA 2A5TA 4H65A 2AIXA 2H99A 3ZSFA 1GVCA 5AE4A 3K0VA 3KN3A 4O3BA 3RT6B 3ZKKA 3K6UA 4P0IA 3HV1A 2LAOA 4ELOA 1US4A 3FASA 1ANFA 4ELPA 2IEEA 3EQ1A 3PUYE 3FXRA 4OENA 4BDRA 3M3KA 5H8HB 3IB2A 3MZBA 4X1BA 4YB7A 3IX1A 2DP8A 5KCJA 5CBRA 4NMYA 2ZMBA 3MZ9A 2QJEA 2V93A 4WKMA 1J1NA 5FTIA 1NNTA 3H3GA 1YAEA 1AH5A 4OETA 4OFOA 4ZS9A 2D5WA 2PMSA 3C36A 2XX9A 4WEPA 2UYFA 1UTHA 1MRPA 2XXIA 5CMKA 1Q35A 1II5A 1B0HA 3FVKA 1MY1A 4PP0A 3IB0A 1MXYA 1FQBA 1SYIA 4NF6B 4PE5B 4F3GA 3E13X 4F3BA 3MVXA 4IO6A 1XVXA 1QUIA 4PFWA 5EHMA 2CZLA 1B5JA 1FTOA 3DP8A 3TUSA 2O7IA 3FV1A 3PPQA 1AL3A 1SVXB 2RKMA 4EQ7A 2ONKE 2F35A 4I8CA 3SETA 1UTBA 3TQLA 4R9GA 4OZ9A 1MQJA 3MUQA 4OXVA 3A09A 4NF8A 1B2HA 2HFBA 3R26A 3RTFB 1B7UA 4QFLA 4F39A 3UGWA 1O7TA 4LQ5A 5CMMA 4NEDA 1IEJA 1NH8A 2GHAA 2XXYA 3B6TA 3K01A 4NF4B 3OO6A 2XXRA 1HSJA 2H9BA 5DEXB 3MAMA 2I0CA 4G68B 3FUZA 2B65A 3OELA 3MP6A 1N0TA 3G3JA 3OSRA 4KYDA 1R9QA 5CI5A 1B5IA 1LBBA 3TELA 4AQ4A 4LZ7A 3IO6A 3MVYA 4N07A 1N04A 1BLFA 2RF1A 1M5BA 3ZKLA 2OZZA 1A40A 4YKIA 3TYHA 2Y7IA 3KEIA 3SEXA 1MM6A 3VE1B 4F29A 3TPAA 4HCWA 2F78A 5EYFA 1N76A 3PGFA 3F11A 3E9XA 2ZNTA 2Y7WA 3H6WA 1L5TA 3HO7A 3QK6A 4ZEDA 3KOTA 4C0RA 2Y7KA 3OO8A 3Q29A 1P1WA 3GBBA 3BBRA 4FORA 4DDDA 1MY0A 3KG2A 2I4CA 3O29A 5FTHA 1HSLA 3O6IA 1Y1MA 4LONB 4R6KA 4RA1A 1B4HA 1WODA 3U72A 5AA4B 1GGGA 3I3VA 4H8JA 1DPEA 1Y3PA 4P0GA 3MZ1A 2D21A 4YKPA 5TPAB 2ZXTA 1MXUA 3K4UA 4GL8A 2NOOA 5DVJA 4NWCA 3O66A 3TCHA 2XXXA 1PB9A 3KJ7A 3OEKA 1VR5A 2GRVA 5H8FB 1MDQA 3UN6A 3IB1A 5I2KB 5CM6A 3IOVA 4YZZA 3DP4A 3VVFA 1I6BA 3OO7A 2X7QA 3IO4A 2DVZA 3TFLA 1QJMA 1IQ7A 2GHBA 1MY3A 3G3FA 4Q8RA 3C9HA 1MY4A 4XKPA 3JYRA 3H4ZA 1URDA 1USYH 1SYHA 5JTYB 1LFIA 4H1XA 3MWBA 5F7VA 1QKAA 3VDFA 3G3KA 3DELB 1P99A 1Y3QA 2RC9A 3SKPA 4U4XA 4NF4A 1FTMA 1DPPA 2DXRA 2OWTA 3HPIA 1UQWA 3PV0E 2UVHA 2Y7RA 1ZTYA 1DTZA 1S50A 3O9PA 1TWYA 1KWHA 3T93B 1Z7NE 1JW4A 4BDMA 1AMFA 3KFMA 1B32A 1QVSA 4OMBA 3FVOA 3LUYA 2A5SA 1RYXA 4GXAA 2GH9A 1NMUA 1OLCA 4QSCA 1MQGA 4K3FA 4DZ1A 1MS7A 1Y20A 4WEDA 3SERA 1IXCA 2ZYOA 4QRZA 3EHTA 1H43A 1B1HA 1D9YA 3ODBA 4ZZAA 3TQWA 1ELJA 4G8MA 1BKAA 2H4IA 1NNKA 4ZECA 1A7LA 5DT6A 4H5FA 3TEPA 1MQIA 2UVIA 4F2OA 3U1OA 2M8CA 2H25A 3FD3A 4NWDA 1LFHA 4OESA 3KBRA 2QSXA 5AA4A 1MXVA 2GFEA 2H5YA 4IGRA 2DE2A 2HZKA 4OWDA 1JNFA 1F9BA 2P2AA 3OXNA 1M5EA 3TAJA 5TPAA 4FE8A 4JB7A 2ESNA 5I59B 1PB8A 5AA2B 1IZ1A 1FQEA 3DLNA 1VFDA 4F3PA 3RQTA 4NF5A 1MXWA 4JXIA 3VXCA 3G3GA 3EPEA 4GVOA 2I6EA 1SI1A 2X7PA 4QFPA 4DCYA 1N3WA 4F18A 4H0WA 5DYHA 1FQCA 4JWXA 2Z22A 3TODA 1IXGA 2VP1A 3MVWA 4XTCQ 4TLMB 4PFTA 4H5GA 3KJTA 4YKKA 1OQHA 3THIA 1IXIA 3D4CA 2NWJA 1DOTA 3RGYA 2D3IA 1TT1A 5A5XA 3KZGA 2I0BA 2IA4A 2OJTA 3AXFA 4LUBA 5JTYA 3C35A 1NNPA 2V84A 3EN3A 1AOVA 1TFDA 2XHDA 3B6QA 4FJPA 3SEWA 1OMPA 2E0SA 3C31A 4Z0IA 4OERA 5ELVA 4LZ5A 3FIRA 4HW8A 4O3AA 2O68A 3O2AA 4RJZA 2ZYMA 3RUMA 5I57B 3SEUA 1USYE 2DOJA 1H76A 5IAIA 3CFZA 3L6HA 5TP9B 2NXOA 1POY1 3RT8A 4OEUA 4G4PA 1B0LA 2VHAA 1OIBA 3IOTA 4QFOA 1ZU0A 4QFNA 2Y7PA 3N6TA 3VVDA 1QUJA 2XXVA 1ATGA 3TTKA 4R2FA 4M1VA 2O69A 4ND9A 1B6HA 4IO5A 5I58B 3W9WA 3C34A 3Q25A 3Q28A 2PYYA 1O64A 2H98A 1SW5A 4KQPA 3S9LC 2DWHA 1N7WA 3KOSA 3CSGA 4U1OA 2DWIA 2VD3A 3TTMA 4F1VA 1EH3A 4O3CA 4MH5A 3SEVA 1MXXA 2DSFA 2DWAA 1B46A 5CMBA 3N6UA 1PB7A 4BDNA 4F19A 3EF7A 4BLAA 1OVBA 2V3TA 4QHQA 5CBSA 3PUVE 5I56B 5ITPA 3JZJA 2FA7A 3UORA 4U22A 4G8NA 1MQHA 4NE4A 5ICTA 3CIJA 1LCTA 4GD5A 3ILTB 1O63A 2UVGA 1A99A 4U21A 2I3WA 4OYVA 3RPWA 2F7AA 1MM7A 4F3SA 1XHYA 1BIYA 1VFEA 4JDFA 3QXMA 2XXQA 4G8HA 2DVCA 1Y1ZA 2RC7A 2NUVA 1NL5A 1VE4A 3H7MA 4Q30B 2HAVA 4ZEFA 3VLUA 4I9DA 1A55A 3SDFA 2QS3A 4IY6A 2Q2AA 4HS7A 3TZAA 1PEBA 1D3KA 3IJXB 4QFKA 1B1XA 4UA8A 3LR1A 4F22A 4GRKA 1SQYA 1POTA 4OFJA 3V89B 4F1YA 4RXLA 4JWYA 2Z8FA 4THIA 3K6WA 5DVFA 1IUDA 3RY3A 2AL5A 2WKYA 4YKJA 3R7XA 3TDJA 3OMBA 1YPNA 1NFTA 4BDQA 4P11A 1URGA 4F31B 1AIVA 5H8HA 3HHFA 3K1PA 3PU5A 1EZPA 4R2BA 5CC2A 5KZTA 1MY2A 2PX1A 3E4RA 3O97A 1JW5A 3ILUB 2ONRA 3PD8A 4H67A 3OENA 2V25A 3FV2A 4DXBA 1LFGA 1LB9A 1PC3A 4I62A 2O6AA 1YCJA 1LB8A 2DE4A 1URSA 3JV9A 4HTGA 2ZNSA 5F1QA 4R6HA 2ZNUA 2DXYA 4GLIA 1B7ZA 1GV8A 4KR5A 1FQDA 4FEDA 2VD2A 4NF6A 3S4UA 3M8UA 1FCKA 1DSNA 2XD3A 4G68C 1HSEA 3MP8A 1I6QA 5H8QB 4ELRA 3IOUA 1MXZA 4KYSA 4MF3A 1WVJA 4EQBA 1LAHE 4DIGA 1BTJA 1A8FA 4F1UA 3K1NA 3OOAA 4Q5TA 1FQAA 2NVUB 3Q27A 4OEVA 4RYAA 3IK6B 3FJGA 1M5FA 4JSDA 4IB2A 4RK2A 3FXUA 3MVZA 4ZEKA 1B3HA 4R75A 1QW0A 2PVUA 4ZE9A 4E0XA 5JEIA 3KSXA 5IKBA 2X26A 2HEUA 1MQDA 3HSTA 2Q8JA 4I1DA 5DEXA 1CE2A 4G68A 1MPBA 1YTVA 1ZIUA 4ZZEA 2A5TB 3CI8A 2HCAA 3A3UA 1FTLA 2XXTA 2ZYKA 1M5CA 3PMWA 5BWJA 1N7XA 4JBZA 3S2VA 3FZVA 4X9TA 1B5HA 1R6ZA 1Q1KA 2R9JA 4XXUA 4JSOA 1LSTA 1XT8A 3RN8A 1B40A 3N94A 3VLWA 3HHGA 3LSLA 5B7DA 3U8QA 2Z23A 1GTKA 4LATA 4QSDA 4OTEA 2XXUA 1LLSA 4EXLA 1Z7ME 2BJJX 1B05A 3M3LA 2B3FA 4POWA 4IO4A 3CR9A 5L9OA 5ITOA 3K6VA 1SD3A 1MPDA 3PUWE 1EZOA 2DYXA 2Q88A 3SEYA 1DTGA 3TMGA 4RPOA 3KN8A 1UTHB 2PBWA 2QRYA 2QPQA 3KGCA 4ISUA 1M5DA 2HAUA 3WAFA 1R1NA 5J1DA 2XD2A 1H3DA 5CRYA 3V8XB 2HZLA 3Q26A 4GXSB 1XVYA 3G3IA 3C33A 4N6PA 4KD5A 1JETA 3GZGA 3OSQA 4IY5A 2YPNA 1H45A 3LC8A 5H8FA 3VXBA 3BKIB 3QAXA 3S9MC 5I2KA 1JEVA 3E3KA 3O28A 1TFAA 4ECFA 4YB5A 1MPCA 1P1NA 2UVJA 5H8QA 4MLVA 2V3UA 3C4MA 4DXUA 1UIUA 3ZS6A 4WXJA 1UTBB 3W15C 3PMVA 3UA8A 4PFUA 2DQVA 5K2XA 1B52A 4EXKA 3U94A 2F8DA 2OBGA 2V3QA 2QL3A 5K2YA 5TU0A 1MDP1 2B3BA 3MPLA 3T9UA 4EF1A 1FTJA 1A8EA 3PUXE 1B51A 5ICQA 1VSOA 4ONYA 5LOMA 3TKDA 1OQGA 4XKQA 1Y3NA 1OVTA 4XKRA 4X48A 1XS5A 3USDA 4ZE8A 1EU8A 3A3CA 3EHSA 4RY1A 4YMAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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