3KN3A

Crystal structure of lysr substrate binding domain (25-263) of putative periplasmic protein from wolinella succinogenes
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
237
structure length
237
Chain Sequence
AAELRMATTTSTDNTGLLDVLAPAYKKDTGVDLKWVAVGTGNALKLGENCDVDVVFVHAPKVELEYVEKGFGIDRTPVMYNDFVIIGNPSFKQKFTGMSVAEAFKLIEKEQVKFVSRGDKSGTHSKEREVWKEALGKIPEKESWYIEAGQGMLATINIAEEQKGLTLTDRGTFIKYESNHKGKPPMVIVLEGDNTLKNFYSIMAVNPKRCEKADYKGAKQFIDWIVSEKMQAEIANF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords PUTATIVE PERIPLASMIC PROTEIN
publication title Crystal Structure of LysR Substrate Binding Domain from Wolinella succinogenes
rcsb
source organism Wolinella succinogenes
molecule tags Transcription
total genus 79
structure length 237
sequence length 237
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-11
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kn3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3kn3A02
1A8EA 2PVUA 2AIXA 2P2AA 2QPQA 4XIGQ 2RCAA 5DVIA 3E13X 2IEEA 3MPLA 3QK6A 5L9MA 3KFMA 1LFHA 3C9HA 1QUJA 3CRBA 3FJMA 4G68C 3MWBA 1YPNA 1QUKA 1WVJA 1UIUA 1QKBA 1JW5A 2ZNTA 3SETA 3RNNA 3GXAA 5AA3A 2QRYA 4Q0CA 3V83A 1MM7A 4X48A 4JB7A 1URGA 3IK6B 3MZ9A 1SYIA 4OENA 1XS5A 4OFLA 3T66A 3C33A 2Q88A 3FZVA 2UYEA 3R26A 3W9WA 1Y1ZA 4O3BA 5JTYB 4NWCA 5J1DA 3VXBA 1LBBA 2Z8EA 4GD5A 1N0TA 1Y4TA 2O6AA 3S2VA 4C0RA 2I4CA 3KN3A 4ELQA 3OMBA 4I1DA 3LBSA 4IGRA 4DIGA 3IORA 4RYAA 3D4CA 4PFUA 2BJJX 5I2KB 4QHQA 3KSJA 3CG1A 1OQHA 2NXOA 1NFTA 2AL5A 3M3FA 1S50A 4ZE8A 4BDQA 4NTLA 3DLNA 4WKMA 1FTKA 1B40A 3T9VA 4H67A 4HS7A 1LGBC 3MVZA 5FHNA 2O68A 4GLIA 3C36A 4RPNA 4NF8A 1MY2A 3TCGA 3C32A 4LP2B 4YKPA 4ZZAA 2ESNA 4PQJA 2I48A 1B51A 2WKYA 3USDA 3R7XA 1H44A 2A5TA 2OWSA 3G3HA 1OLAA 3LSFB 2XXQA 4NF5B 1DOTA 4YB6A 4EF1A 3KOTA 4H5FA 4BLAA 5DVFA 4YZZA 5FTIA 3G3KA 4OQOA 3EHTA 4OEUA 3TTRA 4F1UA 2H25A 3MPKA 2RC8A 1JEVA 3PPOA 1PDAA 2F78A 4RJZA 1JNFA 1B46A 4NWDA 4HCYA 1FQDA 4EXLA 4ZEKA 3S9NC 3VVEA 2CMOA 3QIMA 2XXYA 1QULA 2P1SA 3PGFA 1WODA 1UQWA 4P11A 4O3CA 3LC8A 2Z8DA 1JW1A 1R9LA 3V5AA 4DE8A 2ZNSA 3PUVE 2UVIA 3UORA 3OSQA 1SW2A 3OXNA 3EN3A 5AA1A 1IXGA 1GV8A 5IAIA 1ZMGA 1OLCA 1QW0A 2DSFA 2Y7PA 5F7VA 2OK2A 1I6BA 3FVOA 3SKPA 3EQ1A 3TODA 3EHUA 3C4MA 5H8SA 3PV0E 4LQ2A 4F19A 1A40A 4OVJA 5F1QA 1B32A 4F31B 4QFLA 2LAOA 2OJTA 1EZPA 3O6GA 2GHAA 3MVXA 3OO6A 4ND9A 4KFQA 3TTNA 4KYDA 5ELVA 4XKNA 2DP8A 3O6HA 4F3SA 4H6DA 3KOSA 4YMAA 3IOTA 5L8DA 1IQ7A 3SDFA 3VFJA 5TPAB 2ABHA 1MRPA 5L9OA 2QS1A 1Y3PA 3H6UA 2B3BA 4QFPA 1N04A 4NF8B 1B4HA 3WAEA 3RPWA 2A5TB 4TLLB 4YKJA 2DE4A 3H6TA 2RKMA 2A5SA 3N5LA 4R6YA 1LAFE 3U94A 4ESXA 1DMBA 5I57A 4UACA 2ZYOA 5CC2A 3H6WA 3U8QA 1B0LA 2V3QA 4EQBA 3PPPA 1AIVA 1LAHE 1B4ZA 4O3AA 5BWJA 3ODBA 4LA9A 3ZS6A 3B6TA 3FJGA 1ZJLA 3T9HB 1SDXA 2R71A 4GOTA 3S9LC 2AL4A 3RLFE 1UIVA 4LONB 4R9FA 1POTA 4KYEA 1QVSA 1OQGA 4XXUA 1SQYA 4E0WA 1D3KA 1XVXA 2QS2A 3QAXA 3TZAA 3OENA 4RY1A 4OWDA 1A99A 2HAUA 3N6UA 3IX1A 1R6ZA 3PU5A 3DELB 4OTEA 2F35A 4U22A 3T22A 3M3LA 4BDNA 5FHOA 3THIA 2QMWA 4BDLA 1PC3A 4OHNA 4OETA 2ALUA 1N76A 1MY3A 1MPDA 3GBBA 3IL1B 2XX9A 4JXIA 4LATA 4ZDMA 3IOUA 1FQEA 4H0WA 4ONYA 1MXUA 2XXVA 1MXWA 3O2AA 4QFNA 1UTHA 1SW5A 2HZKA 3T93B 3M8UA 5TU0A 5JEIA 1NNPA 3I3VA 1R9QA 1VFEA 3CI8A 2DWHA 1LB8A 4GVOA 1NL5A 5CBRA 3VLVA 3VVDA 1UTBA 5H8QB 3CFLA 1MQHA 1QJMA 4IO4A 4LQ5A 2F34A 3IOWA 2OZZA 4YKIA 4R72A 1MDQA 2VGQA 4AQ4A 4RK2A 3UIFA 3HHGA 5IKBA 1XHYA 1LLSA 3TCFA 3VE1B 1Q1KA 1FTOA 4F3GA 5I57B 2FA7A 4M1VA 3R6UA 5K2XA 1USYE 3O9PA 3D4GA 1MQJA 5EHSA 1B5JA 3MBPA 1IXCA 2H99A 2CZLA 3PPQA 1ZBMA 2O1MA 5DEXB 4MH5A 3TDJA 5L9SA 1S9TA 3CVGA 4YICA 4F1YA 2M8CA 3K2DA 4C1UA 1A7LA 4KCCA 3W9VA 1LFGA 3CFXA 2I58A 1SVXB 2VP1A 3ECRA 2XXRA 3CR9A 4X9TA 2V3TA 1JEUA 4IO6A 5CBSA 3UP9A 3H7MA 4U4SA 4K3FA 3E9XA 1O63A 1ZIUA 1B58A 3CSGA 4X1DA 2VD3A 2XXHA 3B6QA 1MH3A 1GGGA 1URSA 1N7WA 2F8DA 1YAEA 4NMYA 1LSTA 2D21A 3PUYE 3ONMA 3CG3A 3MJNA 1N7XA 3A3UA 1MPBA 4L17A 2QSXA 3K6WA 4YKKA 4PE5B 1ANFA 1ZTYA 2Q2CA 5B7DA 2UYFA 1NMUA 4WEDA 4HTGA 4XKPA 1UTHB 3LUYA 3OD7A 1RYXA 1VR5A 1B9JA 4TOZA 3ILTB 2X7QA 4G68B 2H5YA 1H43A 2H9BA 2RC7A 3DP4A 3G7WA 3IJOB 3FD3A 2PT2A 3BKIB 1UTBB 5H8FB 2H98A 2ZYKA 2DXRA 1FQAA 2O7IA 3A3CA 1B3GA 5HPQA 4FORA 3U72A 2I6EA 4PETA 2RC9A 1JETA 2O51A 1MS7A 2ONSA 3FV2A 5M2VA 5ITOA 1B7HA 4U4XA 5HM4B 1SYHA 2Y7KA 3TTMA 2XD3A 3FV1A 4NF4A 3IJXB 3GZGA 1MM6A 5AE4A 2Y7WA 4QF9A 2XD2A 4NEDA 3VXCA 1SI0A 4ISUA 2VHAA 3FXQA 1TFAA 3MQ9A 5CI5A 5A5XB 1D4NA 2DWJA 1N3WA 1FTMA 1JVXA 4JWOA 1O7TA 3IAZA 4KPTA 1B1HA 1OMPA 3TTKA 4IO2A 4F1VA 1MH4A 4RXLA 3HSTA 2V25A 3RT8A 1PEBA 2XXUA 3N94A 1ZU0A 4JSOA 2YLNA 1B2HA 3S9MC 4QSCA 3H6VA 5AA4A 2F6GA 1BIYA 4KHZE 2ZNUA 3PPNA 3DM0A 1JW4A 3LSXA 3Q26A 3QUJA 3TQWA 3C31A 3MC2A 3HN0A 2Y7RA 4ZEDA 4IO7A 2Y7IA 3LSWA 4U23A 4EXKA 4OFJA 1EZOA 3KG2A 1IXHA 5I59A 3PMWA 4BDRA 1IUDA 4FEBA 3EHSA 1XOCA 3O6IA 4ZE9A 4WEPA 4EUOA 1EZ9A 4RPOA 2GHBA 1ZKBA 1I6QA 3Q25A 4OXVA 2XXWA 3KJTA 4PFWA 4U21A 5HBCA 1PB8A 1FQBA 2DWIA 3P7IA 2FYIA 1Y20A 3SEUA 1D9VA 3A09A 3TUSA 2R9JA 3DP6A 4R9GA 4G2ZA 4NF4B 3CIJA 3SESA 4U1OA 2X26A 4F3BA 1HSLA 3G3GA 1MY4A 4ECFA 5ITPA 3G3FA 3IB0A 1A55A 4IGTA 1TFDA 3FATA 3PD8A 3K1PA 3TFLA 2XXXA 3OO9A 4ZEBA 4THIA 4GF8A 3L6HA 4XKQA 3FUZA 2PYYA 3O28A 1LAGE 3L6GA 4POWA 1LB9A 5DT6A 2VOZA 3HO7A 4FATA 3TCHA 1OIBA 4YB5A 2W7YA 1B7ZA 2O69A 4JSDA 4Q8RA 1O64A 2F7AA 3JZJA 4QRZA 1CB6A 4JBZA 3BFTA 1JQFA 4ZECA 3LSLA 4IY6A 3QYTA 4R2BA 4U2RA 4N6PA 1LCTA 5I2NA 2E1SA 4TQUQ 4OFOA 2O84X 1GR2A 4BDMA 4YB7A 4LVQA 3OSRA 1SBPA 2UVJA 4WXJA 1MQGA 2Q2AA 4FECA 4H8IA 3T9XB 3TTLA 2DOJA 1QKAA 4F18A 2XXTA 3T9UA 4FEDA 5CRYA 4G8NA 1MQIA 1P1NA 1Y9UA 5I59B 1SI1A 4IO3A 2UVHA 5KZTA 3SEVA 3KJ7A 3TAJA 2I3WA 1B3FA 1ATGA 4Q5TA 4KCDA 4GQOA 1N3XA 3LR1A 5K2YA 5I56A 1OVBA 4BDOA 4GWOA 3EPEA 3KGCA 4R2FA 1WDNA 3HHFA 4OEVA 2PBWA 3KZGA 3SEWA 2PT1A 1POY1 1P1OA 3FVNA 2I49A 4LZ8A 5CMCA 3KN7A 3Q27A 4EQ9A 1P1WA 4DDDA 4MF3A 1HSEA 4Q30B 4EQ7A 3K1MA 2D3IA 5I58A 2IA4A 1H3DA 4GL0A 1SD3A 3MVWA 3VLWA 1USYH 1B3EA 3U1OA 3MP1A 2PMSA 2E0SA 2F7CA 1Y4CA 2DYXA 1IEJA 3VVFA 5JK4A 4QFKA 1KWHA 2ONKE 5H8NA 2DWAA 1NNFA 3K01A 2NWJA 4TLMB 1NH8A 4QSEA 1BTJA 2F7BA 3RGYA 4GXSB 3OOAA 5CMBA 2I4BA 2F5XA 1VE4A 3GBAA 1B5IA 3MZBA 1J1NA 4ESWA 3K6XA 3H3GA 4DXUA 3PUZE 4RK9A 3M3KA 3PD9A 3H03A 3E4RA 4C1TA 2OLBA 1XVYA 2Q8JA 2R6GE 3HCQA 1ELJA 4X1BA 1T0KA 4N07A 3TQLA 1YCJA 4QFOA 3IO4A 2ONRA 5ISUA 1ZLQA 4ELOA 3PPRA 1URDA 1YTVA 3MZ1A 3PMXA 2O1LA 2THIA 3QXMA 5FTHA 5KDTA 1R1NA 4F22A 4G8HA 4F29A 4FJPA 1B52A 1BLFA 3RQTA 3N26A 3W15C 1EU8A 4H5GA 2AYSA 4IO5A 5I56B 1MXZA 1GVCA 1Y3NA 3I6VA 2HCAA 1IXIA 3JYRA 4H8JA 4H65A 4NE4A 3BFUA 1FTLA 1FQCA 2HAVA 4KI0E 5CMMA 2XHDA 5I58B 3TMGA 1LCFA 4OMBA 5I84A 4AB5A 1XC1A 3FASA 3O29A 2RINA 4GRKA 3SERA 3UK4A 1I69A 1TWYA 2XXPA 1Q35A 3BBRA 1QUIA 3DP8A 3C35A 4POXA 1IITA 3MAMA 3UN6A 1RKMA 2ANJA 4R6HA 4DZ1A 2DVCA 4GIZA 2QS4A 5H8NB 1MG1A 2Z23A 3RT6B 4XKRA 1B6HA 2NOOA 1CE2A 2GRVA 4H1XA 4PP0A 2DS9A 3IR1A 2YJPA 4IY5A 1D9YA 4OYVA 4N13A 3HV1A 1IZ1A 1M5BA 1LBCA 1B7UA 3RY3A 3WAFA 3CSBA 1Z7NE 1M5FA 1JVYA 2V3UA 4JWXA 1IIWA 1US4A 2HEUA 1MY0A 2Q89A 2RF1A 1F9BA 5TPAA 3IOVA 1MY1A 2REJA 1H45A 3HPIA 4YU0A 4F2OA 4IB2A 4YAHX 1MXVA 4GXAA 3T96B 3GLBA 1M5CA 5KDTB 1DPEA 5FHMA 4HW8A 4LUBA 4DCYA 4DXBA 4ELPA 3S4UA 3G3JA 4P0IA 2HFBA 1OVTA 1B3LA 2RCBA 3K6VA 2V84A 2OCUA 4I9DA 4MLQA 1LAXA 2G29A 4HCWA 2X7PA 4OESA 4KYSA 1MPCA 4KQPA 5EYFA 4ZS9A 3S9EA 4LZ5A 3Q29A 5H8HA 3VLUA 1P1QA 1VFDA 4DLDA 2FNCA 3MVYA 3JV9A 4P0GA 2OWTA 4R73A 2V93A 3OO7A 3K1NA 2XX8A 3U92A 5LOMA 3B7DA 5AA2A 4R75A 3KEIA 1DTGA 3ZSFA 1NNKA 4NF6A 3EF7A 2F97A 1DTZA 1FQFA 2Y84A 1FTJA 4PFYA 2REGA 3B6WA 1M5EA 1GTKA 3ZKLA 3N6TA 5AA2D 1DSNA 3SEYA 1H76A 4EDPA 1FCKA 4LZ7A 1US5A 3TELA 3TKDA 1Y1MA 3CFZA 1B3HA 1PBPA 3RTWB 3E3KA 3MP6A 3V8XB 2P0SA 1MXXA 2KLFA 1MDP1 1SW4A 4M4GA 2I3VA 2XX7A 3KSXA 1NKXA 3VDFA 2UVGA 5B70A 1BKAA 5H8QA 1NH7A 3O66A 4GFRA 2I0CA 2PX1A 3U93A 2HXWA 1PB7A 2HQ0A 2GH9A 4G8MA 5CM6A 3FXUA 4ZZEA 2O7UA 2ZYNA 4ZEIA 4I62A 4KR5A 2F6PA 3IB1A 5DYHA 1II5A 4FIMA 3K4UA 2VD2A 5AA4B 3MW0A 5DVJA 1A54A 1TT1A 3FVGA 1B05A 2D5WA 5DEXA 3K02A 2HZLA 3H06B 5TP9A 3O97A 4QSDA 1B0HA 1DPPA 2NVUB 1LFIA 1Y3QA 1BP5A 3FGSA 4U1ZA 1I6AA 2ZXTA 2DE3A 3PMVA 5H8HB 3K6UA 3MP8A 4G4PA 1Z7ME 3IB2A 4ZEFA 1L5TA 4FE8A 4DXCA 2QMXA 2H4IA 4MFIA 4RNSA 2Q9TA 2QS3A 4FAJA 5KCJA 5BUUA 2GFEA 5AA2B 3G3IA 3FVKA 5EHMA 1XT8A 3UGWA 2F36A 3QUFA 4OERA 4YMBA 4NF6B 1N84A 4XTCQ 2ZYMA 2DE2A 4MBPA 2DVZA 4PFTA 4RA1A 1AL3A 2UXAA 5ICTA 2YPNA 2Z8FA 3KN8A 1MXYA 4Z7EA 4EF2A 1SW1A 3TEPA 2QL3A 4G68A 1VSOA 3TPAA 4F2QA 1AH5A 1RYOA 3K0VA 4G77A 3IO6A 2B65A 3Q28A 1AOVA 1B1XA 3I5OA 1MQDA 5H8FA 4Z0IA 5JTYA 4JWYA 5DTBA 3FJ7A 1P99A 3K00A 4KD5A 4OZ9A 3VV5A 3FIRA 1M5DA 4E0XA 2DXYA 4UA8A 1EH3A 3QSLA 4R6KA 3RN8A 2DQVA 3V89B 4AB6A 2ZMBA 5I2KA 3MUQA 3RUMA 2G93A 2NUVA 1NNTA 3AXFA 4F39A 4MLVA 4R74A 5CMKA 2B3FA 3F11A 1FW0A 1PB9A 5I2NB 5TP9B 3OO8A 1TXFA 3OEKA 5ICQA 3PUXE 5A5XA 1B5HA 3TYHA 1P1UA 1A8FA 1HSJA 3H4ZA 3OEMA 1AMFA 4I8CA 4ELRA 2XXIA 4NF5A 3SEXA 3UA8A 2QJEA 3PUWE 4JDFA 4F3PA 4GL8A 3RTFB 1S7YA 3C34A 3OELA 2OBGA 1PBQA 3ZKKA 5KCJB 2Z22A 3ILUB 2I0BA 3KBRA 3FXRA 4DCXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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