5H8FA

Structure of the apo human glun1/glun2a lbd
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
278
structure length
274
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 274
sequence length 278
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8fA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8fA02
4YKPA 5CC2A 3UP9A 4XKRA 1N0TA 4GXAA 4F3SA 1B32A 2ZNTA 1MRPA 1UTBA 4YKJA 1B4HA 1MM6A 3C33A 4IY6A 1N3XA 1Y3QA 1ZIUA 1FTOA 1SI0A 4OFLA 2V25A 2DXYA 2GFEA 4XXUA 3HO7A 3RN8A 1MXVA 3LSLA 1VR5A 2H98A 4QFOA 4F31B 4KD5A 4OYVA 1SBPA 4G4PA 3ZSFA 2AIXA 2Y7IA 3K6XA 2Y7PA 3C36A 3CSBA 1CB6A 3MWBA 5ICQA 3OEMA 4F1YA 3IORA 4F19A 4NWCA 1IITA 1B51A 1N84A 3T9HB 3G3JA 3H7MA 3R26A 1MS7A 3T96B 1UIVA 4QF9A 3H6UA 5L8DA 1B0LA 1D3KA 1QULA 3UK4A 1ANFA 2DP8A 1P99A 3MVWA 3SEVA 1ZU0A 1LAHE 5I84A 4FIMA 4MBPA 4QSCA 3PMVA 3MVZA 4FEDA 4P0IA 3H6VA 2UVJA 1WVJA 2HAVA 2Q8JA 4NF6B 1IXHA 2QL3A 4KR5A 1JVYA 4N13A 1AH5A 4DXUA 1PB8A 3IAZA 2R71A 3MZ1A 3N6UA 1XVYA 2F7AA 4R9GA 2P2AA 3SESA 4ZEFA 1QUJA 3ONMA 2OWSA 4MLQA 4NWDA 4KHZE 3TTMA 5IAIA 2B3FA 3KJ7A 4OENA 3O6GA 3QAXA 1DPPA 2O69A 3JV9A 3U1OA 4F39A 3FJ7A 1JEVA 1IIWA 1IXIA 4C1UA 2DQVA 5KDTA 3PU5A 4UACA 1FQDA 4F1UA 1O63A 4WEDA 3EQ1A 3FVNA 5DEXB 3R6UA 1OMPA 3U94A 1B7UA 3FXUA 4L17A 4DIGA 4IGRA 3VDFA 1ZKBA 4R74A 4OVJA 3MVXA 5BUUA 3DLNA 2VP1A 1M5DA 1VFDA 3MAMA 3BKIB 4U2RA 3Q28A 5HM4B 4LATA 1DPEA 4ELRA 1IXGA 5I56B 4OXVA 4ZECA 2ZYOA 5CBSA 3VLVA 3TDJA 2DVCA 3MVYA 5TP9A 4ND9A 3OD7A 1DTZA 1ELJA 2ESNA 4ISUA 3O2AA 5I2NB 1LB9A 1LAGE 3OOAA 3MJNA 4F29A 4F3BA 3T93B 3CRBA 2O84X 4TOZA 4TLMB 1QUKA 3MZBA 4BDOA 4Q8RA 1B6HA 3K1NA 5I59A 1AMFA 4Q30B 2DS9A 1AOVA 3USDA 1MQDA 3HCQA 4G8HA 3PPNA 3FV1A 5F7VA 3KZGA 2PVUA 3RPWA 1FQEA 1IQ7A 4YMBA 1PB9A 3OSQA 5I57A 3IJXB 1SYHA 3SEWA 4I8CA 2CZLA 1NNTA 5I2KA 3I6VA 2X7QA 5JEIA 3Q25A 4JWOA 4X9TA 4NF8B 1URSA 3RT8A 4XTCQ 2I3WA 1OQHA 4MLVA 5L9OA 4G68B 5FHNA 5FTHA 2DE2A 1POY1 1PC3A 5CMCA 1LFHA 5H8FA 5JTYA 3IJOB 3VXCA 4IO7A 3K1MA 3BFUA 2QS1A 4DCYA 5JK4A 4DE8A 4KYEA 3GBAA 1FQCA 1UQWA 3TZAA 4RY1A 3M3FA 1GTKA 3S9LC 1S7YA 2QJEA 3FV2A 4NE4A 2F36A 2PMSA 3IK6B 1FQFA 4DLDA 3PGFA 3KFMA 1UTHB 4R6KA 1LFGA 1B3GA 2D21A 3DELB 3IOUA 3P7IA 3UGWA 1FTJA 1N7XA 1D9VA 3H03A 2X26A 1MY4A 4JWXA 4U4SA 4G8MA 1USYH 2F8DA 3K2DA 1ZBMA 1DOTA 4F22A 3K01A 1BP5A 3ILUB 4FATA 3CSGA 4IY5A 1MDP1 4OZ9A 5B7DA 3SEYA 3TCHA 2IA4A 2GRVA 4NTLA 1OIBA 3B7DA 3FGSA 2OK2A 1URGA 3L6GA 3OSRA 4DZ1A 4NF5B 1DSNA 3G3IA 4RK2A 3TTLA 4LZ8A 1YAEA 1NMUA 1PDAA 5M2VA 1ZJLA 2FNCA 1SVXB 2I48A 4IB2A 1YCJA 4GLIA 2ABHA 3QUJA 2UVIA 1B2HA 1AL3A 2ZNSA 3ODBA 1B3EA 2VD2A 3JYRA 5A5XA 1VFEA 1RKMA 1B3LA 4YB7A 2A5SA 2B3BA 4EF2A 3CFLA 1JW4A 2Y7KA 2Y7RA 5ICTA 1HSJA 3TCFA 3OEKA 4RA1A 1QUIA 4BDLA 3O66A 3VFJA 4RK9A 2XXVA 2I0BA 4EQBA 2DVZA 3QYTA 4PE5B 5TPAB 1H3DA 4NMYA 3M3KA 2XXYA 1USYE 3OO7A 3K6UA 4QFKA 1S50A 3OXNA 3S9NC 1B58A 1MPBA 5HBCA 2YJPA 3QIMA 1EZPA 3W9WA 5KCJB 1A54A 3WAEA 4FAJA 1P1WA 4BDRA 4ZDMA 1XS5A 4KCCA 1A8EA 2RC9A 2V3TA 2ZYNA 2I4BA 5CRYA 1QKBA 4LA9A 2XXRA 2R6GE 1JETA 3SDFA 4H8IA 1D9YA 3BBRA 1SQYA 1OLAA 1US4A 4JDFA 2V93A 2ALUA 3RLFE 1MQJA 3DP4A 4Z7EA 1BIYA 2ONSA 4I1DA 3KN7A 3SERA 1GGGA 2ZNUA 2O1MA 1MH3A 5B70A 2A5TA 3G3GA 4OFOA 5I58B 2Q2CA 3O6IA 1N04A 1F9BA 1Z7NE 1Q1KA 5AA2D 3WAFA 3MPKA 4R6HA 4AB5A 3TTNA 1LBBA 1UTBB 1MXWA 4R2BA 1MDQA 3H6TA 2QPQA 3TPAA 2ZMBA 1PEBA 1NKXA 2VOZA 1ZLQA 1MXZA 1MY1A 4FE8A 5TU0A 4EDPA 2RF1A 1VE4A 2H25A 2NXOA 3KJTA 1B05A 5AA1A 2HQ0A 3Q26A 1B7ZA 2PT2A 4H6DA 4EUOA 2GH9A 2UYFA 1XHYA 2R9JA 4YAHX 2I49A 2QSXA 3OO9A 4LQ2A 4PFWA 1POTA 2F35A 3CG1A 3KOTA 3MQ9A 1SW1A 4F2OA 4P11A 1KWHA 4OEUA 2DXRA 1O64A 4R73A 2HZLA 3O9PA 3PUZE 5CMKA 1VSOA 3OELA 4Q5TA 5AA3A 2PBWA 2YLNA 3Q29A 3K4UA 3O97A 1DMBA 3TUSA 5H8NA 3KBRA 3U93A 1B1XA 4THIA 3UA8A 3IB0A 4OETA 4G77A 4R9FA 4QRZA 2QS3A 1Y3PA 1B1HA 1Y4CA 4PFTA 3TYHA 1DTGA 4ECFA 4FEBA 4QSEA 3MP1A 2ONRA 4GIZA 4BDQA 3K1PA 1QW0A 4ZS9A 4ZZEA 3Q27A 1GVCA 1EZOA 1RYOA 3FUZA 2RCBA 3CG3A 3L6HA 3B6TA 1I6BA 3V8XB 3AXFA 4POXA 4U1ZA 2Q9TA 1ZTYA 1LAFE 4GXSB 5KDTB 4K3FA 3N6TA 4N07A 4RXLA 4POWA 1XT8A 4HCYA 2DE4A 4FJPA 3N94A 5HPQA 4WEPA 4XIGQ 4QSDA 1IXCA 3HHGA 3K02A 4IO6A 4JBZA 2REGA 3TEPA 1M5BA 1TXFA 3VXBA 1TFAA 3O28A 1QVSA 1Y9UA 1HSLA 5L9MA 3OO8A 2I6EA 1I69A 2OLBA 5EHSA 3S4UA 4OFJA 2Z23A 3T66A 3T9VA 3K6WA 4ZEKA 2DWHA 4R2FA 2OJTA 1YTVA 5TP9B 3T9UA 3KEIA 1J1NA 3TMGA 3F11A 4YU0A 3FD3A 2RC7A 4G8NA 4JXIA 3C34A 4MFIA 3FATA 3K00A 4YMAA 5H8QA 1XOCA 4HCWA 4QFPA 1FTMA 2Z8EA 2HZKA 2Q89A 4F3PA 3PMWA 3H06B 3E3KA 1B52A 4HTGA 1JVXA 3IB1A 5I59B 1MQGA 2FYIA 1LCTA 1XC1A 5ELVA 2UYEA 1JNFA 2OZZA 4NF4A 4LZ7A 4RPOA 4QHQA 2UXAA 1LBCA 2H9BA 3MBPA 3FZVA 4AB6A 1P1UA 3RUMA 3O6HA 2QRYA 4OMBA 3IO4A 1FQAA 5I57B 5K2YA 2I0CA 3B6QA 4E0WA 3E4RA 1OLCA 3PPRA 5I2KB 3CFXA 4IGTA 2RINA 5H8HA 2HCAA 4ELOA 1BTJA 4O3AA 3O29A 4JB7A 4NEDA 3IOWA 3CR9A 4YKIA 1NH8A 2DOJA 3S2VA 4G2ZA 3PV0E 5H8FB 5JTYB 4H67A 3PUXE 1URDA 5IKBA 2XX8A 3TTRA 4OWDA 4RJZA 3SKPA 2HFBA 1NL5A 4PP0A 2F7BA 3TODA 3LSFB 4PQJA 1Y1MA 3KOSA 1OVBA 3W9VA 5ITPA 2F34A 2QMXA 1H76A 3A3UA 1LSTA 4O3CA 3G3FA 3MW0A 1TWYA 4MF3A 1A99A 1LGBC 3HN0A 1NNKA 1OQGA 4KYSA 3IO6A 4ZEBA 3H3GA 2M8CA 3G7WA 2H5YA 2O7IA 3VLWA 1D4NA 2ZYKA 3QUFA 1LFIA 4U21A 3FIRA 4RNSA 1WODA 3GBBA 2F97A 5AA4A 1B46A 5ITOA 1MQHA 3CIJA 3W15C 5AA2A 3HSTA 4F18A 1NH7A 4KCDA 4R72A 2QS2A 3PUYE 4OERA 2HEUA 3U8QA 1MXYA 4OTEA 4ZZAA 1Y3NA 4WKMA 2HXWA 5FHOA 4LUBA 2AYSA 4E0XA 3EN3A 2XD3A 2AL4A 1MH4A 1B5HA 3V5AA 2XXIA 3A3CA 3UN6A 1MM7A 3H6WA 3S9EA 4LZ5A 4N6PA 3DP6A 2VD3A 4KYDA 1JEUA 2OCUA 2PT1A 3OMBA 3KSJA 3LSXA 3LR1A 2NVUB 2OBGA 4ELQA 5A5XB 5DVIA 4GVOA 2D3IA 3I3VA 5FTIA 1L5TA 1FQBA 1US5A 1GV8A 4EQ9A 1IUDA 3FJGA 2H99A 1P1QA 3IB2A 3S9MC 5L9SA 1N76A 2XXXA 3M3LA 2NWJA 2DSFA 3M8UA 1II5A 3E13X 3PPOA 4DXCA 4PFYA 2RC8A 4KFQA 4C1TA 2O6AA 5DYHA 1QJMA 3LUYA 1Q35A 4EQ7A 4DDDA 3TFLA 3PPPA 3K0VA 2LAOA 2F6PA 1NFTA 3K6VA 1SW4A 4O3BA 4I62A 1BKAA 3RQTA 1QKAA 3TCGA 1P1NA 1TT1A 1B40A 2G29A 4RYAA 4U22A 3JZJA 2KLFA 2O7UA 2QMWA 1CE2A 3FVOA 2THIA 4LVQA 2DYXA 3MP8A 2FA7A 1YPNA 3KG2A 3MZ9A 4DXBA 1SYIA 5EYFA 4YZZA 2DWJA 4GD5A 4LONB 4XKPA 4IO3A 4AQ4A 3SEUA 2UVGA 4NF6A 1M5EA 4U1OA 2PX1A 1SDXA 4F1VA 4F3GA 2XXTA 4OESA 4GL8A 2A5TB 1MY0A 2REJA 4QFLA 2Z8FA 1B0HA 3TQWA 4X48A 4U23A 4H65A 3GZGA 3MUQA 4YICA 1EH3A 3PUWE 1T0KA 4FORA 3LSWA 3PUVE 4RPNA 3TAJA 3G3KA 3QXMA 2QS4A 5EHMA 1SW2A 4LP2B 2HAUA 1H45A 2XXPA 4JSDA 3SEXA 5DEXA 3EHSA 2IEEA 3EHTA 1IEJA 4TQUQ 3GXAA 3MC2A 4KPTA 4PETA 4HW8A 3OENA 3DM0A 3HHFA 4M1VA 1JW1A 1B9JA 4Q0CA 2E1SA 4ELPA 4MH5A 5I56A 3IOTA 3IOVA 2NOOA 2O51A 3FXQA 1I6QA 1IZ1A 1BLFA 4M4GA 4EXKA 5J1DA 3C35A 4Z0IA 1MPDA 4GOTA 2Y84A 5I2NA 1N7WA 2F6GA 3SETA 4EXLA 4YKKA 1HSEA 1WDNA 4ZEIA 4DCXA 3MP6A 1R6ZA 5H8NB 5F1QA 4GL0A 4KI0E 1FTLA 2BJJX 4LQ5A 5CBRA 3LBSA 3ZKLA 2VHAA 4BDMA 1P1OA 2RCAA 3V89B 4OHNA 3PMXA 4R75A 3G3HA 3N26A 3ILTB 1R1NA 2XX7A 3B6WA 3KSXA 5DVJA 3EHUA 1EU8A 4ESWA 3QK6A 2DWAA 3EF7A 2GHAA 1RYXA 4PFUA 3ZKKA 3U92A 2XXHA 4H1XA 1MXXA 4GFRA 3FJMA 3RNNA 1I6AA 4IO2A 4XKQA 3FASA 4KQPA 3HPIA 4X1BA 4UA8A 5DVFA 3V83A 3KN8A 2UVHA 5BWJA 4NF8A 4ZE8A 3RTFB 2I4CA 5AE4A 4G68A 2H4IA 2PYYA 2Z8DA 4YB5A 2Q88A 1Z7ME 4GF8A 3TQLA 4P0GA 1B3FA 2I58A 4BDNA 1B4ZA 2DWIA 2WKYA 5LOMA 4G68C 1JW5A 2I3VA 3D4GA 4ONYA 2GHBA 5ISUA 3BFTA 3OO6A 2XXQA 4X1DA 2XX9A 5FHMA 4ZE9A 1B5JA 2G93A 3QSLA 3TKDA 1A7LA 1JQFA 3C9HA 1M5CA 4BLAA 2V3UA 3CFZA 3KGCA 2F5XA 3RTWB 4I9DA 4ZEDA 2P0SA 1ZMGA 3IL1B 2V3QA 2Z22A 1S9TA 5DTBA 1AIVA 2ANJA 3E9XA 1UTHA 4FECA 3TELA 3CI8A 5H8QB 1LB8A 4XKNA 2XXWA 2O1LA 2D5WA 1H44A 4IO5A 3R7XA 1FCKA 2V84A 1MG1A 2ZXTA 4H0WA 1SW5A 3H4ZA 4TLLB 3TTKA 1MPCA 1LAXA 1A8FA 4NF4B 2NUVA 1TFDA 1NNPA 2X7PA 1B3HA 2ONKE 3C4MA 4EF1A 3VVFA 4GWOA 3UORA 3C31A 4R6YA 4H5FA 4H8JA 2E0SA 1PBPA 4NF5A 4JSOA 5CMMA 3HV1A 3EPEA 1MQIA 4GQOA 1O7TA 2Y7WA 4H5GA 3FVGA 5H8HB 1LCFA 1B7HA 4ESXA 1R9LA 1MY3A 3FVKA 3T22A 3LC8A 1R9QA 1SI1A 2VGQA 3ECRA 4QFNA 4OEVA 3PD8A 1M5FA 3GLBA 1EZ9A 4HS7A 1H43A 2DE3A 5H8SA 3VLUA 3A09A 4F2QA 2RKMA 3DP8A 2ZYMA 4IO4A 1MXUA 4YB6A 3I5OA 3N5LA 4WXJA 1XVXA 3VV5A 1FW0A 5CM6A 1A40A 1PBQA 2XXUA 5TPAA 3VE1B 2Q2AA 1Y20A 5KZTA 2P1SA 3U72A 5CMBA 2O68A 2XHDA 1N3WA 3VVEA 2W7YA 2B65A 1FTKA 1ATGA 1MY2A 3VVDA 1Y4TA 3IX1A 2OWTA 4U4XA 5KCJA 3RY3A 1GR2A 1UIUA 5AA4B 3PPQA 3UIFA 2F78A 2AL5A 5AA2B 2CMOA 1SD3A 3PD9A 3THIA 1A55A 3FXRA 2YPNA 5CI5A 5DT6A 1B5IA 2XD2A 3MPLA 4JWYA 3RT6B 1NNFA 1OVTA 4GRKA 3ZS6A 3C32A 3D4CA 2F7CA 1PB7A 5K2XA 3RGYA 4C0RA 3CVGA 1Y1ZA 3IR1A 3KN3A 4OQOA 3T9XB 1LLSA 5I58A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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