5H8FA

Structure of the apo human glun1/glun2a lbd
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
278
structure length
274
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTKFNQKGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
total genus 81
structure length 274
sequence length 278
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8fA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8fA02
1WVJA 2I0BA 1DPPA 2UVHA 3QIMA 4R6YA 1B2HA 1LLSA 1XVYA 2D3IA 2I0CA 1QKBA 3FJGA 1F9BA 2ANJA 2UVJA 2NWJA 4YMAA 2UVGA 3C32A 5IAIA 3C31A 2HFBA 4YU0A 1B05A 1OLCA 1QW0A 4QFKA 2M8CA 3K1MA 4QFNA 4GRKA 1MPDA 4ZEDA 4YKIA 3V89B 1M5EA 2V3QA 2V3UA 3FIRA 2B65A 4ELQA 2F8DA 2H99A 4ISUA 4NE4A 1LBBA 4F2QA 1UQWA 2Y7PA 3T9XB 3H03A 3Q25A 1DOTA 2QJEA 1MH4A 5HPQA 3SEYA 4OQOA 3KG2A 1MG1A 2OBGA 1B3FA 2RF1A 5JEIA 1L5TA 4XKPA 4X48A 3T66A 3I5OA 4TOZA 4EUOA 5AA4B 4JXIA 1S7YA 4MF3A 4M4GA 3CR9A 2P1SA 1HSEA 1ATGA 1B3EA 4F18A 4F29A 3SEUA 3RY3A 2PVUA 5H8HB 3C36A 3EQ1A 3MQ9A 1LBCA 3TTMA 4JSOA 2F97A 2OWTA 1I6BA 3ZKKA 2GH9A 3UP9A 5LOMA 2HXWA 2DWJA 2XXYA 3OENA 2XXQA 3MZBA 1B1HA 4UACA 1CB6A 3VLWA 4H1XA 4OVJA 1MXYA 4RPOA 3B7DA 1JW5A 4H6DA 3VVEA 4IY5A 3PUYE 1O63A 1JEVA 4ELRA 3G3GA 3MC2A 1S9TA 3OOAA 3FASA 1H76A 4RY1A 4MLQA 1OMPA 3KN7A 4BDLA 3T93B 1CE2A 3IL1B 2R6GE 3OSRA 4DDDA 3TCFA 2O7IA 1GVCA 5FTIA 2ONRA 4GXSB 1IITA 1MS7A 2Y84A 1BIYA 2UYFA 1URGA 1XHYA 5JTYB 3TAJA 4XTCQ 3E4RA 5I56B 5TP9B 4IB2A 3G3JA 4GL8A 4NTLA 2B3BA 3K01A 4PETA 4G77A 3O6HA 1UIUA 2YLNA 3FV1A 3S9EA 2ESNA 2FNCA 2DE4A 3BKIB 1XS5A 2ZYMA 3EHTA 4ONYA 2P0SA 4NEDA 3CSBA 4FEDA 3IOVA 3LSLA 1LGBC 4KQPA 4LONB 1URDA 3CFLA 4FE8A 4OYVA 2G93A 4JWOA 1TT1A 3TQLA 1B40A 4YZZA 4LUBA 1D4NA 1IXGA 1POY1 2Y7RA 4Q5TA 4QSEA 2W7YA 1A8FA 3C4MA 4FJPA 1Y4CA 2I3WA 5B70A 1FTMA 2XXXA 3E9XA 1B0LA 1MXVA 1GV8A 4F3BA 2QS2A 2NUVA 1IXIA 5KCJB 2I49A 1N84A 3TTKA 2QS3A 1B4HA 3OEMA 2QS1A 4DXUA 4ESXA 3TYHA 3HSTA 4FIMA 1MDP1 1N3WA 1LAXA 3DP4A 2ZNUA 5A5XA 5KDTB 3QSLA 4KYEA 3THIA 2VD3A 3BFTA 3FXUA 3RLFE 4FORA 4LZ5A 2RCBA 2ZYNA 5H8QB 3RN8A 3FVKA 3CG1A 3O28A 1EZOA 4U21A 2DP8A 1UTHB 3H6WA 3OO6A 5EHMA 4LA9A 5DVFA 2I48A 2X26A 2Q2CA 4OETA 3PMXA 1IUDA 4RJZA 1JW1A 3OO8A 2HZLA 4WEDA 4NF6B 2REGA 3FGSA 4IO6A 3VXCA 2FYIA 2Z8EA 1MY1A 3QUFA 4DZ1A 1XC1A 1AL3A 4PFWA 4H8JA 3F11A 4RA1A 5ITPA 1QVSA 1Y20A 1M5DA 1B3LA 3RPWA 4EXLA 5I59A 2XXHA 5AA1A 4HW8A 4LP2B 1QUIA 4OEUA 4YB6A 1I6AA 3FUZA 1ZBMA 2AL4A 4EQBA 3KGCA 2LAOA 5FHMA 4F1UA 3PPQA 1SYIA 4OTEA 5I57A 3QK6A 3UGWA 4HS7A 1OLAA 4MLVA 3C9HA 3ZSFA 1MQGA 4ZEKA 4I8CA 3I3VA 1B5HA 4F3SA 4ZDMA 3W9VA 2Q8JA 4THIA 1BKAA 1N0TA 1XT8A 3KZGA 2ZNSA 4LZ7A 3SESA 3GZGA 4R2BA 2UVIA 2F5XA 3T9UA 3PPPA 3N5LA 2AL5A 4QRZA 1UTBB 3UORA 1NFTA 3MZ1A 3TZAA 2R9JA 4BDRA 1MY4A 3Q29A 4Z0IA 2A5SA 2DXYA 2QRYA 1MH3A 5TPAA 1BLFA 1Y1ZA 4HCWA 3K2DA 3KBRA 4IO7A 2CMOA 3MP6A 1OIBA 1MXWA 4TQUQ 1A99A 3Q27A 1LB9A 4U4SA 5I84A 1B3HA 4EF2A 5K2XA 1Q1KA 3MP8A 3C34A 3JZJA 3TODA 1IIWA 2DS9A 1Y3PA 1RYXA 4Z7EA 3KOTA 1NNTA 3PMWA 1B52A 3K6VA 1A7LA 2VOZA 1USYE 3KJTA 4NWDA 3RT8A 3FZVA 1TFAA 4XXUA 1B51A 3HPIA 2XXIA 1IXCA 3LSFB 4AQ4A 2RCAA 1B9JA 1MXUA 5CM6A 4ZEFA 3DLNA 3KSXA 3EHUA 3LR1A 1POTA 1IXHA 4C1TA 3CSGA 4RPNA 3SKPA 3IJOB 4YB5A 2AIXA 5L9OA 1FQBA 3MPLA 1R9LA 4R9GA 3CRBA 3MP1A 3CFXA 2I58A 3S9LC 2H5YA 4R72A 2DQVA 1OQHA 3VFJA 1EZPA 1B6HA 3H6TA 4PE5B 3C35A 4KCDA 1M5FA 5CMCA 3T9HB 4MFIA 1DPEA 4QFLA 3MJNA 1URSA 3W15C 5HM4B 4F22A 3FXQA 1II5A 3IORA 5I2NA 5CMKA 3O6GA 4QFOA 1ZMGA 1N04A 3RQTA 5F7VA 3D4CA 1FCKA 3S9MC 3FD3A 3K00A 3SEWA 4ESWA 2ZYOA 4P11A 3S9NC 3ILTB 1ZIUA 1VFEA 4XKNA 5J1DA 3B6QA 3CG3A 4NF4A 1YCJA 3PU5A 3PD9A 3EPEA 3IOWA 3JV9A 1MQDA 1Y3NA 2NXOA 1ZU0A 3M3KA 1ZTYA 3G7WA 5FHNA 5H8SA 3U1OA 1JVXA 3RGYA 4BDMA 4IO3A 3TELA 3WAEA 5DVIA 2NVUB 4F19A 5ICTA 2Z23A 1SW5A 4TLLB 3T96B 2VGQA 2PT1A 5CMMA 4LQ2A 3T22A 2GHBA 1TWYA 3W9WA 3MVYA 3IB2A 3CFZA 1DMBA 3E3KA 4I9DA 3G3KA 3LBSA 3O66A 3KJ7A 4BDNA 4RK2A 1IEJA 1JEUA 4WEPA 4NWCA 5TU0A 4ND9A 3UA8A 2Z8FA 3IK6B 1DTGA 3PPOA 2ZMBA 5FTHA 2GRVA 1N7XA 3OEKA 5FHOA 1NL5A 4E0WA 1Y3QA 4IO4A 1NNKA 3JYRA 1A54A 3QUJA 1SYHA 4GL0A 4OESA 1P1UA 3SETA 3PUZE 4DCXA 2GFEA 1PC3A 4PFUA 3H4ZA 3EF7A 1P1WA 2QS4A 2D21A 4KYSA 4QSCA 1MXZA 1MDQA 3PPNA 3VLUA 4EF1A 3O29A 1NH7A 1H44A 2E0SA 2CZLA 3V5AA 2ABHA 4TLMB 2I4CA 3RT6B 5H8NB 2O6AA 1US4A 4YKPA 2O68A 3I6VA 3KN8A 5DTBA 5H8NA 4AB6A 2Y7IA 1LFHA 4ECFA 2VHAA 2V25A 4OFOA 4IGTA 4QHQA 1PDAA 5ELVA 3UIFA 2ZXTA 1BP5A 3KN3A 4N13A 4OHNA 4G8NA 3TCHA 3WAFA 4HTGA 3KFMA 4FECA 2PX1A 5CC2A 4ZS9A 3VVDA 2X7QA 4AB5A 2RKMA 2ALUA 3H6VA 1B32A 1D9VA 5DEXA 1EZ9A 5DVJA 3VDFA 5A5XB 2Q9TA 4KI0E 4KPTA 3T9VA 4GIZA 1VSOA 4ZZAA 2KLFA 2F7CA 4X9TA 2DYXA 2HQ0A 1OVBA 3FVOA 4KCCA 1B0HA 1N7WA 1AH5A 3MVXA 3M8UA 3S2VA 3PGFA 4NF5A 2H4IA 2XXTA 3M3FA 1SDXA 3VV5A 4EXKA 3N6UA 3CVGA 3IX1A 3KOSA 3G3IA 2H98A 1I69A 2DWAA 4HCYA 1FTOA 4P0GA 3PUWE 2O51A 3A3CA 3MZ9A 1KWHA 3DM0A 1ZLQA 1B7UA 2R71A 4U1OA 2QSXA 3MUQA 3QAXA 4R73A 2HZKA 5L8DA 2H25A 1I6QA 5I59B 3IOTA 1US5A 4F1VA 4U1ZA 3FVNA 3H3GA 4ZZEA 5F1QA 3B6TA 1HSLA 4GLIA 2ZNTA 1XVXA 5I57B 2XX8A 4OFJA 3FV2A 3C33A 3TEPA 5CBSA 4OMBA 3OSQA 5AA2B 1YAEA 4R9FA 4GQOA 4H5FA 4F39A 5CRYA 3K1NA 3TTNA 3EHSA 2F6GA 5AA2A 1TXFA 3FXRA 3MVZA 1NMUA 5I58A 1NNPA 2FA7A 2F35A 4H5GA 1FQFA 4N07A 2ONSA 4O3AA 4EQ9A 4F3PA 2ZYKA 4RYAA 1QUJA 1FTLA 4YKKA 1MRPA 1OQGA 4ZEIA 1AOVA 1UIVA 2X7PA 5TPAB 4U2RA 2XX9A 4FAJA 1N3XA 1MY0A 1FQDA 1H3DA 1EU8A 2DWHA 4QSDA 3IB0A 3ILUB 1MQJA 4G2ZA 4IY6A 1NKXA 2QMXA 4ZEBA 5AA2D 3RTWB 3N26A 1N76A 2O1LA 1NNFA 3VXBA 3B6WA 4PFTA 2DXRA 3OMBA 2GHAA 3SEVA 1FTKA 3G3HA 3KEIA 1GTKA 1LFGA 2RINA 4EQ7A 4F31B 4H65A 4N6PA 2Y7WA 2WKYA 3Q28A 1B4ZA 1MQIA 3HHGA 4OEVA 2A5TA 4X1DA 4R6KA 3GBAA 4POWA 3ZS6A 4R6HA 3N94A 2Q89A 3LSWA 1VR5A 2OWSA 2QL3A 3K0VA 4ZE8A 2XXVA 3USDA 2YJPA 2YPNA 1GR2A 4OXVA 2XD3A 3GBBA 3TDJA 1R6ZA 3O6IA 3IOUA 4GOTA 5IKBA 4H0WA 5I2KB 4BLAA 4KHZE 2B3FA 3DP8A 3PMVA 2REJA 4NF8A 1J1NA 3TKDA 5I2KA 3FJMA 1AMFA 1JETA 1SD3A 4EDPA 4XKRA 4DXCA 3RTFB 4NMYA 5DYHA 5AE4A 4DE8A 1SBPA 4XKQA 1SQYA 2VD2A 1ZKBA 1SW4A 3CI8A 1DTZA 3M3LA 4IO2A 3OO9A 4JDFA 5CI5A 3FATA 5CBRA 3PV0E 5I2NB 3O97A 2P2AA 1MPBA 2PYYA 4U23A 5EYFA 4GXAA 1LB8A 2XXUA 2UYEA 4G8HA 4O3BA 4PFYA 4FATA 3U8QA 4NF4B 4F3GA 4RK9A 5KZTA 4Q0CA 4YICA 3LSXA 1SI0A 1ANFA 3VE1B 1P1NA 3MVWA 3OELA 5AA3A 3K6WA 1LCFA 4OWDA 2H9BA 3ECRA 3UN6A 3OD7A 5AA4A 4YAHX 3IAZA 3PUVE 1USYH 5JK4A 4U22A 4MH5A 1ELJA 2NOOA 3RUMA 4GFRA 1FW0A 5H8HA 4Q8RA 2OZZA 1BTJA 4OFLA 4UA8A 2Z22A 2DVZA 1Z7NE 4PP0A 3K6XA 1PB8A 3R6UA 1FQEA 3BFUA 3TCGA 4R75A 4X1BA 3SEXA 1O64A 3R26A 5ITOA 1MQHA 1B58A 5DT6A 4F1YA 1SW2A 3O9PA 1Z7ME 1MY2A 3DELB 3O2AA 4KR5A 4L17A 1M5BA 1PB7A 2DVCA 1Y4TA 3K4UA 1JW4A 1VE4A 4PQJA 2D5WA 2PMSA 3TTRA 3U94A 1OVTA 1LAFE 3A3UA 4JWYA 3GXAA 1B5JA 2V84A 3HHFA 1MM7A 4GVOA 4MBPA 3L6HA 3U92A 2I6EA 2O7UA 4I62A 2E1SA 4KD5A 3TFLA 3V83A 1B1XA 4U4XA 1H45A 5JTYA 2IA4A 3BBRA 4OERA 1H43A 2XXPA 5I56A 5TP9A 3QXMA 4K3FA 3MPKA 3LC8A 5B7DA 3L6GA 4F2OA 3ODBA 4LATA 2HEUA 3G3FA 4JWXA 2QPQA 2HCAA 2UXAA 4H8IA 4DIGA 3K6UA 2RC9A 1PBPA 4LQ5A 1P99A 3GLBA 2ONKE 2BJJX 4P0IA 1Y9UA 1LFIA 3VLVA 5L9SA 5DEXB 5ICQA 2I3VA 5K2YA 1PEBA 4G8MA 4YB7A 4ELPA 1QULA 1HSJA 1GGGA 1MXXA 1B7ZA 2Y7KA 4XIGQ 1FTJA 1LCTA 1PBQA 1VFDA 4E0XA 1DSNA 3S4UA 4R74A 1Y1MA 3AXFA 2OCUA 4WXJA 1Q35A 4NF5B 5KCJA 3HN0A 4DCYA 2I4BA 1RYOA 2F36A 5ISUA 4Q30B 1A40A 1MY3A 3IB1A 3LUYA 4QF9A 1RKMA 3Q26A 4GD5A 2AYSA 4ELOA 5KDTA 2Z8DA 2XXWA 3IR1A 2XXRA 1SI1A 1WDNA 2O69A 1D9YA 5H8QA 1NH8A 1FQAA 2OK2A 1UTHA 1B3GA 2DOJA 2HAUA 3TMGA 3K1PA 1R9QA 2F78A 2DWIA 3FJ7A 3N6TA 3OO7A 1XOCA 3TUSA 3D4GA 4LZ8A 4ZECA 3R7XA 1JVYA 4LVQA 4NF6A 4JBZA 4IO5A 3PPRA 4JSDA 2OJTA 2G29A 3PD8A 4DXBA 5BUUA 3P7IA 1LSTA 5H8FB 4BDOA 1D3KA 1M5CA 3H7MA 3FVGA 4WKMA 1P1OA 3IO4A 1ZJLA 3HV1A 2RC7A 3HO7A 5H8FA 4R2FA 5CMBA 4G4PA 1YTVA 5M2VA 4ZE9A 2PT2A 3U93A 2XD2A 1YPNA 2V3TA 1O7TA 3UK4A 5I58B 1AIVA 4G68B 2QMWA 4G68C 2F34A 3IO6A 4C1UA 3SERA 4KYDA 2V93A 3DP6A 1SW1A 1T0KA 4G68A 1QKAA 2XX7A 3IJXB 3H06B 1LAHE 4RXLA 1WODA 1JNFA 2IEEA 3MAMA 4FEBA 2PBWA 1MM6A 1QUKA 3TTLA 4KFQA 4I1DA 1IZ1A 2RC8A 2O1MA 1B5IA 4IGRA 3ONMA 1PB9A 1B46A 3MW0A 4QFPA 2F6PA 5HBCA 3A09A 3CIJA 1SVXB 3MWBA 4C0RA 4YMBA 4JB7A 4DLDA 1UTBA 1S50A 1EH3A 3RNNA 1R1NA 2THIA 4OZ9A 3VVFA 3ZKLA 4M1VA 3EN3A 2HAVA 2O84X 4O3CA 4RNSA 4YKJA 5L9MA 4GWOA 2A5TB 1JQFA 2DE3A 3SDFA 1A8EA 2Q2AA 3V8XB 1IQ7A 1P1QA 3TQWA 4OENA 1FQCA 4POXA 1MPCA 1LAGE 2DSFA 3MBPA 1A55A 4H67A 4BDQA 3H6UA 3E13X 5BWJA 2OLBA 2VP1A 2DE2A 3QYTA 5EHSA 3TPAA 2XHDA 1B7HA 3OXNA 3U72A 1TFDA 4GF8A 2Q88A 3HCQA 3KSJA 4NF8B 2F7BA 3PUXE 2F7AA 1QJMA 3K02A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WVJA 2I0BA 4N4UA 1DPPA 2UVHA 3QIMA 4R6YA 1B2HA 1LLSA 1XVYA 2D3IA 2I0CA 1QKBA 3FJGA 1F9BA 2ANJA 4I3YA 2UVJA 2NWJA 4YMAA 2UVGA 3C32A 5IAIA 1IMBA 3C31A 2HFBA 4YU0A 1B05A 1OLCA 1QW0A 4QFKA 2M8CA 3K1MA 4QFNA 4GRKA 1MPDA 4ZEDA 1KA1A 4YKIA 2PCRA 2PFYA 3V89B 1M5EA 2V3QA 2V3UA 3FIRA 2B65A 5EQAA 4ELQA 2F8DA 2H99A 4ISUA 4NE4A 1LBBA 4F2QA 1UQWA 2Y7PA 3T9XB 3H03A 4OVQA 1EYKA 3Q25A 5ET7A 1DOTA 2QJEA 1MH4A 5HPQA 2WEFA 3SEYA 2Q8MA 4MNCA 4OQOA 3KG2A 1MG1A 4N6DA 2OBGA 1B3FA 2RF1A 5JEIA 1L5TA 4XKPA 4X48A 3T66A 3I5OA 4GX3A 4TOZA 4EUOA 5AA4B 4JXIA 1S7YA 4MF3A 4M4GA 3CR9A 2P1SA 1HSEA 1ATGA 1B3EA 4F18A 4F29A 3SEUA 2QVRA 3RY3A 2PVUA 5H8HB 3C36A 3EQ1A 3MQ9A 4P56A 1LBCA 3TTMA 4JSOA 2F97A 2OWTA 2B4MA 1EYJA 1I6BA 3ZKKA 2GH9A 3UP9A 3KC1A 5LOMA 2HXWA 4MNIA 4N15A 2DWJA 2XXYA 4PF6A 3OENA 2XXQA 4GWUA 3MZBA 1B1HA 4UACA 4P3LA 1CB6A 5T3JA 3VLWA 4H1XA 4OVJA 1MXYA 4RPOA 3B7DA 1JW5A 4H6DA 3VVEA 4IY5A 3PUYE 1O63A 1JEVA 4ELRA 3G3GA 3MC2A 1S9TA 3ISPA 3OOAA 3FASA 1H76A 2F3BA 4RY1A 4MLQA 1OMPA 3KN7A 4BDLA 3T93B 1FPDA 1CE2A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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