2V3TA

Structure of the ligand-binding core of the ionotropic glutamate receptor-like glurdelta2 in the apo form
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
262
structure length
244
Chain Sequence
GVVLRVVTVLEEPFVMVSENVLGKPKKYQGFSIDVLDALSNYLGFNYEIYVAPDHKYGSPTWNGLVGELVFKRADIGISALTITPDRENVVDFTTRYMDYSVGVLLRRSIQSLQDLSKQTDIPYGTVLDSAVYQHVRMKGLNPSMYSQMWRMINNNVLESQAGIQKVKYGNYAFVWDAAVLEYVAINDPDCSFYTVTVADRGYGIALQHGSPYRDVFSQRILELQQSGDMDILKHKWWPKNGQC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR DELTA-2 SUBUNIT SYNONYM GLURDELTA2, GLUR
publication title Ionotropic Glutamate-Like Receptor {Delta}2 Binds D-Serine and Glycine.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Receptor
total genus 65
structure length 244
sequence length 262
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-06-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2v3tA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2v3tA02
2UYEA 1AMFA 4EF1A 5F7VA 4EXKA 2QRYA 2UVHA 4R6KA 3A3UA 1IQ7A 2HQ0A 3S9NC 4NF6A 4LUBA 1LFIA 5EYFA 3U8QA 1WODA 2Y84A 4OVJA 3GZGA 1I6AA 1PDAA 4BDNA 1N7XA 2X26A 3IO4A 2VP1A 1B3GA 1QULA 1B3LA 4OTEA 3QK6A 1MH4A 3S9EA 1P1OA 4G77A 1SDXA 3OXNA 4O3AA 4K3FA 1H43A 2DWJA 3S4UA 4JDFA 2Z8FA 3QIMA 4GLIA 1D4NA 4IO4A 1HSEA 2DE3A 3N6TA 2V25A 2RF1A 2Y7WA 1R1NA 3ECRA 2O7UA 1I6QA 2DXRA 5KZTA 3RQTA 3C9HA 4F2QA 3ZS6A 1QUJA 3V8XB 1YAEA 3H06B 3PUZE 1SW1A 1NNTA 3VE1B 2VD2A 3T93B 1VE4A 4OZ9A 5I56B 2D3IA 1UIVA 3EF7A 4UA8A 3IOWA 3T9VA 2DQVA 4IO7A 2VHAA 3CSGA 3LBSA 5I2NB 1YPNA 2NUVA 2HZKA 3K1PA 4ZECA 3O2AA 4OHNA 5KDTA 3ODBA 1RYOA 3MP6A 5H8NA 2NWJA 3PPOA 4YICA 3G3FA 4WXJA 4DXCA 1MH3A 3TCFA 2QPQA 2PBWA 1DSNA 4YKJA 3EHUA 4JSOA 1BLFA 1Y3QA 1N76A 2QS2A 2KLFA 3QYTA 2RKMA 3GXAA 4ESWA 3U94A 3K0VA 1B3FA 1UTBA 3MZ1A 4OYVA 3N5LA 3JZJA 4KCCA 3W9WA 1NMUA 2A5TB 4BDOA 3LUYA 3FV2A 2WKYA 2RCBA 3RTFB 4GD5A 4GL8A 4LQ2A 2F35A 2DWAA 1VSOA 5J1DA 3O6HA 3H3GA 3T22A 4YKPA 1ZKBA 4U22A 4OEUA 1B4ZA 4ZE9A 4JSDA 1MQIA 5FTHA 2XD3A 3OO8A 1FQDA 5K2YA 1IZ1A 1B7UA 3ZKLA 4F3PA 4GIZA 4OMBA 2O68A 3C36A 4TLMB 4LATA 5IAIA 3H6TA 5H8SA 4F3SA 5CMBA 3THIA 1MPDA 1ZTYA 2XXUA 4RY1A 3KGCA 3QAXA 1DTGA 3I6VA 3U72A 5AA2D 1B4HA 4F22A 4PQJA 2ABHA 5JEIA 2Z8EA 5DYHA 3KOTA 4OFJA 4EDPA 1VR5A 3O6GA 3MVXA 1OQGA 2ONKE 3BFTA 3FVKA 2O7IA 2V93A 1SQYA 3LSWA 2QSXA 1FW0A 1N3XA 3Q28A 3TZAA 1OIBA 2Y7RA 1H44A 3FIRA 3DELB 2I58A 1SYIA 1JVXA 1T0KA 2O1LA 2XXIA 4IO3A 1DTZA 3IR1A 1B7HA 2DWHA 3H6WA 2F6GA 5I58B 4KQPA 2RC7A 4PFUA 4ND9A 4X1DA 4AB5A 4ZEBA 3T9UA 1II5A 2XXVA 3G3IA 3CFXA 1IXCA 2B65A 2GH9A 4GRKA 1XVXA 3ILUB 3K1MA 5CI5A 2V3QA 2O51A 3WAFA 3M8UA 4ELQA 3CG3A 3PPPA 3PMVA 1GTKA 1PB7A 1SW2A 3FASA 4R2FA 5H8HA 1M5FA 4I8CA 4Q8RA 1MXUA 2PX1A 1BIYA 4P0IA 1N3WA 3O9PA 3CFLA 4M4GA 2OJTA 4XKQA 4EQ9A 4DDDA 2AL4A 3TPAA 1OVTA 3TQLA 1BTJA 3Q27A 4X1BA 2QMXA 1OVBA 2DE4A 2LAOA 2ZYKA 4LZ8A 4ZEKA 1FQBA 4GQOA 3DM0A 2I3VA 3MAMA 3OENA 2F5XA 3K4UA 3IO6A 4OESA 5I2KA 2O1MA 3TFLA 3UIFA 3W9VA 1POY1 4FORA 1JQFA 3SETA 4G2ZA 3TYHA 2M8CA 3HV1A 3IK6B 1DOTA 3MVWA 5AA3A 2P0SA 1O7TA 2FYIA 1A8FA 1I69A 1B7ZA 2ZMBA 1Z7NE 4OETA 4QFLA 1JEUA 4JXIA 3IB2A 2OWTA 3Q29A 1AIVA 1MRPA 3JYRA 2O6AA 2Q8JA 3O29A 2OBGA 3TUSA 3IORA 2HZLA 3CIJA 5B70A 2Q2AA 1VFDA 4ZZAA 4NE4A 5TPAA 3AXFA 5JK4A 3ZKKA 4U4SA 5DEXB 4FECA 3KOSA 4FJPA 4IY6A 1YTVA 4JB7A 1SI0A 4ZS9A 3CRBA 1GVCA 4DE8A 3VVFA 1PBPA 1TWYA 4YZZA 3PGFA 1OLCA 4Q0CA 3UP9A 2XX7A 2GHAA 1MS7A 1ZMGA 3MWBA 2E0SA 4E0WA 1P99A 5I57B 1LBBA 5HBCA 5DTBA 4ECFA 3O6IA 3RUMA 4KD5A 3TELA 3VDFA 4NF5B 2DE2A 4R6YA 4ZEFA 5FTIA 3V5AA 5ITOA 5CC2A 2VGQA 4U2RA 4QFOA 5FHOA 1B46A 2YLNA 4U4XA 3ZSFA 1HSJA 1LFGA 4H65A 1Y9UA 5I59A 4QSDA 1SBPA 1Y4TA 3RY3A 3H03A 4H67A 2D21A 3O28A 3IAZA 3TODA 2V3TA 1BKAA 2ESNA 1MXZA 4RJZA 3VFJA 1XC1A 5H8HB 2H9BA 3CR9A 3K1NA 1P1WA 3CG1A 1UTHA 5KCJA 4U1OA 2XHDA 2XXHA 2FA7A 3IJOB 5FHMA 2E1SA 2RINA 3EPEA 1QW0A 4BDLA 4F2OA 3B6WA 2HXWA 2Z8DA 3RPWA 1EZPA 1Y4CA 1ZU0A 2B3BA 2DSFA 2I4CA 3A3CA 2DYXA 3GLBA 4IO5A 3EN3A 5TP9A 2DVZA 2PT1A 4GVOA 3OSQA 1P1NA 1A99A 3UN6A 1LFHA 2F97A 4QRZA 3IL1B 4FIMA 5CMKA 4G8HA 3UGWA 1URGA 2OWSA 5ISUA 3PMWA 4EF2A 2DVCA 1RYXA 4H8IA 1H45A 4R75A 1B3HA 4RK2A 4ZDMA 4H8JA 3K6XA 4Q30B 1FTLA 1DPPA 1FTOA 4H5FA 4POXA 5LOMA 3K6WA 3SERA 3IB1A 4N6PA 3KBRA 1NKXA 4QSEA 5H8FA 2XXQA 5DVIA 4TQUQ 1NL5A 4R6HA 4QSCA 4ZE8A 1NFTA 4FAJA 2X7QA 4MFIA 4ESXA 4H0WA 1TT1A 4KYEA 3PPQA 2F7BA 4DLDA 1NNKA 1FTKA 1MQHA 1QUKA 5K2XA 1CE2A 4H6DA 2REJA 1SD3A 4F1VA 3T66A 3VXBA 5BWJA 4NF4B 1MXXA 3HCQA 3T9HB 5B7DA 3KEIA 1M5EA 4RA1A 1IXIA 1B52A 4KPTA 1M5DA 4MLVA 1N04A 3A09A 4FE8A 4HS7A 4AB6A 1M5CA 4DCXA 2UVGA 4PFYA 3MP8A 5DVFA 3VLVA 3K6VA 3MQ9A 4ZEIA 2HCAA 1LAGE 1B2HA 5ITPA 4R73A 4OENA 1Q1KA 3K01A 4YMAA 5L9MA 4NF6B 3L6HA 2DS9A 1S7YA 4THIA 4XKRA 3C34A 5I59B 4HCWA 1MXWA 4G8NA 1ATGA 2QS1A 4LZ7A 2XXPA 4KFQA 3FXRA 3KG2A 1URDA 1MM6A 3N6UA 4IB2A 1ZLQA 3HO7A 4TLLB 4DCYA 4OXVA 4F29A 4IGTA 2FNCA 2AYSA 3FV1A 2I4BA 4WKMA 2UXAA 4NMYA 3IJXB 3U1OA 4LONB 2O84X 4BDQA 2OZZA 3GBAA 1FTMA 4U1ZA 2G93A 1N7WA 4G68A 3OO9A 5AA4A 3QXMA 4QF9A 3KZGA 1POTA 1P1UA 3KN3A 4F31B 3B7DA 4AQ4A 4HTGA 1ANFA 5ICTA 1GR2A 1XS5A 2Q2CA 3FD3A 2DP8A 3ILTB 1A7LA 4XKNA 3QUJA 1PB9A 2HFBA 1SW4A 4IY5A 1JETA 1TFAA 1MXVA 3PUYE 3HSTA 1FQAA 3BBRA 2GRVA 5KDTB 1ZJLA 5H8NB 4POWA 1MPCA 4PP0A 1GGGA 3I3VA 3OEKA 5BUUA 3IB0A 3M3KA 1Y3PA 1IEJA 2OLBA 4BDRA 3O97A 4PFTA 3EHTA 4GOTA 3MW0A 1J1NA 3LSXA 4F1YA 1FQCA 3H6UA 4U23A 1QKAA 1UTBB 1EZOA 2THIA 2Q89A 2H98A 3RNNA 3OOAA 5L8DA 2XD2A 2F34A 4JWOA 4RXLA 3RLFE 1PEBA 1JEVA 1LAXA 3KSJA 4QHQA 3R6UA 2RC8A 4OERA 1TFDA 1DMBA 3FXQA 2AL5A 4LQ5A 1B0HA 2XXTA 4EQ7A 1URSA 3TTRA 3SDFA 5IKBA 3MP1A 1CB6A 3HHGA 4N13A 1UQWA 2Y7KA 1LB9A 4GXAA 2BJJX 4H5GA 4OWDA 3MVZA 3HN0A 4O3BA 4FATA 2D5WA 3G3GA 3L6GA 1SW5A 4YKKA 3RT8A 1IUDA 3DLNA 1AL3A 3C33A 3IOVA 3PUWE 1WVJA 3G7WA 4F1UA 1B3EA 2V3UA 3OD7A 1DPEA 4C1TA 2ALUA 2ZNSA 4KCDA 1MM7A 5HM4B 3K00A 2ZYOA 2QL3A 3SESA 3O66A 1B9JA 4DXUA 5I2NA 2REGA 3B6TA 1B40A 1RKMA 3MZ9A 3TEPA 4GF8A 3FVNA 3PPNA 1JW4A 3C32A 3SEXA 4MF3A 3TKDA 2I0CA 4OEVA 4BLAA 3FVGA 4R72A 3HPIA 3OO6A 5HPQA 1F9BA 1WDNA 4ZZEA 3SKPA 2HEUA 1LSTA 3BFUA 4Z0IA 1N0TA 2O69A 4RK9A 1H76A 1ZIUA 4I9DA 2HAVA 4JBZA 4EQBA 1IXGA 3QSLA 4WEPA 3D4GA 4MLQA 4YB5A 3VVDA 2A5TA 1IITA 1B32A 4QFPA 3E3KA 5AA2A 3LSFB 4LVQA 1OQHA 2RC9A 1AOVA 4H1XA 1SVXB 3IOUA 4X9TA 3TCGA 1MY2A 4M1VA 1LBCA 5I84A 5H8QA 3FVOA 4RPNA 4DIGA 1IIWA 3I5OA 1R6ZA 4XIGQ 1NH8A 3QUFA 1D9VA 2DWIA 1XT8A 1MY0A 1LLSA 3G3HA 3PUVE 3GBBA 3KN8A 3MZBA 5DVJA 3S9LC 4L17A 2XX8A 2V84A 4XKPA 2AIXA 2I3WA 1QKBA 4MBPA 3E13X 1LB8A 4RYAA 3E9XA 1LCTA 1Q35A 3RN8A 4C1UA 3PD9A 2Z22A 4XTCQ 2B3FA 2XXRA 2I49A 3MBPA 3B6QA 2X7PA 2UVIA 2VOZA 2ZNUA 2PT2A 4HCYA 4F3GA 4RPOA 3T9XB 4U21A 5I2KB 3LR1A 3CSBA 1MY3A 2W7YA 3P7IA 5DT6A 2QMWA 5CBSA 2IEEA 2Y7IA 3D4CA 5M2VA 4R9FA 4QFKA 3MVYA 2OCUA 4YB7A 5ELVA 2YJPA 1B5JA 4F19A 3FJ7A 4NF8A 3MPLA 5AA1A 1S50A 1EZ9A 1B5IA 2ZYMA 1FQFA 1P1QA 3PD8A 5TPAB 1Y1ZA 1B6HA 1R9QA 4P11A 1SYHA 3TAJA 5CMMA 1GV8A 5I58A 2A5SA 1FTJA 1USYH 2XXWA 2GHBA 3FJGA 2GFEA 3WAEA 5FHNA 2ZXTA 3TTNA 3ONMA 2I0BA 3S2VA 1B0LA 3RGYA 1MY1A 2OK2A 3G3KA 4GXSB 3TTKA 3UA8A 3OEMA 2RCAA 3U93A 3SEUA 1NH7A 1D9YA 2H5YA 4E0XA 1LAFE 4KI0E 4X48A 1JW1A 5ICQA 2ZYNA 1MQGA 2DOJA 4QFNA 3FGSA 2R9JA 2F7CA 1XOCA 2QJEA 1B1XA 4PETA 1S9TA 2QS3A 3Q26A 1HSLA 2Z23A 2ZNTA 4I1DA 4I62A 5CM6A 1YCJA 4R74A 4PE5B 5A5XA 2PVUA 4R2BA 5AA2B 1A54A 3LC8A 4GWOA 3FUZA 3CI8A 4NWDA 3OMBA 3M3LA 3C4MA 1LGBC 1B1HA 3PMXA 1ELJA 2I6EA 4R9GA 5H8QB 1O63A 4KYSA 4ELPA 4GFRA 1UTHB 5AE4A 5KCJB 3R26A 3DP4A 1LCFA 1MG1A 1M5BA 4PFWA 5L9OA 3FZVA 3SEYA 2NXOA 2R71A 3DP8A 4JWYA 4KYDA 4YMBA 2I48A 2H99A 3LSLA 4EUOA 1D3KA 2VD3A 2Q88A 1JVYA 4G4PA 4F39A 2H25A 5TP9B 2F7AA 4YB6A 1XHYA 4BDMA 4HW8A 4EXLA 4Q5TA 2IA4A 1MY4A 3MPKA 3TTMA 2F36A 4OQOA 2HAUA 1Z7ME 5JTYA 5DEXA 3VXCA 1N84A 1AH5A 3EQ1A 3TCHA 4YAHX 4NF8B 1PC3A 1FCKA 1MXYA 3H6VA 4C0RA 3PPRA 1MDP1 2XXXA 2XXYA 3U92A 5H8FB 2P2AA 3MC2A 4MH5A 3C31A 3RT6B 3VLWA 5I57A 3E4RA 1PB8A 4ZEDA 4F18A 5F1QA 4TOZA 4O3CA 1QUIA 4ONYA 3MJNA 1LAHE 4NF5A 1MQDA 2NVUB 2F6PA 1B51A 4IO2A 1SI1A 1B5HA 3R7XA 2CMOA 3DP6A 3KSXA 4NWCA 4FEBA 3FXUA 5CRYA 3H4ZA 3K2DA 4ELOA 3N94A 3FATA 3F11A 4GL0A 3PUXE 3OELA 3TTLA 3SEVA 3TDJA 1US4A 3CVGA 1ZBMA 1USYE 4Z7EA 4DZ1A 3USDA 3TMGA 4OFOA 1A8EA 2PMSA 4UACA 2H4IA 4FEDA 1Y1MA 3IOTA 1MPBA 3C35A 4YU0A 3UK4A 3PV0E 3RTWB 5CBRA 5A5XB 4YKIA 2ONSA 2DXYA 3EHSA 3HHFA 4G8MA 4JWXA 3N26A 3KJTA 2R6GE 2Y7PA 5CMCA 1UIUA 3KJ7A 2NOOA 3VV5A 2ANJA 2G29A 2UVJA 1XVYA 1IXHA 3BKIB 4N07A 3MUQA 3H7MA 5EHSA 5EHMA 1JW5A 1O64A 1A40A 3OSRA 3KN7A 3VVEA 1BP5A 1QVSA 1Y3NA 3S9MC 5I56A 1QJMA 3T96B 3V89B 1OLAA 3CFZA 4LA9A 4OFLA 3K6UA 3V83A 2UYFA 4ELRA 4NTLA 1MQJA 3K02A 2PYYA 2YPNA 4KHZE 1OMPA 4ISUA 1EH3A 4G68B 2F8DA 3Q25A 3W15C 4P0GA 3G3JA 4KR5A 1NNFA 5AA4B 1PBQA 1TXFA 4NEDA 4G68C 5L9SA 3PU5A 1A55A 3VLUA 2F78A 3M3FA 1B58A 5JTYB 4DXBA 1VFEA 1Y20A 4RNSA 1NNPA 2CZLA 2XX9A 1I6BA 4LZ5A 4F3BA 3UORA 3JV9A 1B05A 4XXUA 4LP2B 3FJMA 1KWHA 1L5TA 1H3DA 3TQWA 4WEDA 1EU8A 3IX1A 3KFMA 4NF4A 2P1SA 1JNFA 1MDQA 3SEWA 1US5A 2Q9TA 3OO7A 4IGRA 2QS4A 4IO6A 1R9LA 1FQEA 2ONRA 5TU0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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