2V3TA

Structure of the ligand-binding core of the ionotropic glutamate receptor-like glurdelta2 in the apo form
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
262
structure length
244
Chain Sequence
b'GVVLRVVTVLEEPFVMVSENVLGKPKKYQGFSIDVLDALSNYLGFNYEIYVAPDHKYGSPTWNGLVGELVFKRADIGISALTITPDRENVVDFTTRYMDYSVGVLLRRSIQSLQDLSKQTDIPYGTVLDSAVYQHVRMKGLNPSMYSQMWRMINNNVLESQAGIQKVKYGNYAFVWDAAVLEYVAINDPDCSFYTVTVADRGYGIALQHGSPYRDVFSQRILELQQSGDMDILKHKWWPKNGQC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR DELTA-2 SUBUNIT SYNONYM GLURDELTA2, GLUR
publication title Ionotropic Glutamate-Like Receptor {Delta}2 Binds D-Serine and Glycine.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Receptor
total genus 65
structure length 244
sequence length 262
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-06-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2v3tA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2v3tA02
1JEVA 5JEIA 2ZMBA 4IB2A 1N0TA 3O9PA 5CMBA 5I58A 2VD2A 3T9VA 4U4SA 4U1OA 4EQ7A 3LSLA 3LBSA 3UK4A 3TZAA 3MP8A 2ZNUA 1MH3A 4QFPA 3U1OA 1PBPA 4YB5A 4F2OA 1PEBA 4G8MA 2DP8A 3BFTA 1MG1A 4AQ4A 3HV1A 2O7UA 5AA4B 1FTMA 3N6UA 4LZ8A 3CIJA 3VLUA 1PBQA 3G7WA 2V93A 4WEPA 4PFUA 1H45A 5KZTA 3N6TA 1XT8A 4H6DA 3LR1A 4BDNA 5A5XB 4KD5A 3RT6B 2DQVA 4M4GA 4ZEBA 1M5CA 4NF6B 1MS7A 4RY1A 3UN6A 5M2VA 1UTHB 1SVXB 1TXFA 1MQDA 4N6PA 4F22A 5TP9B 3PPNA 1MDP1 1N7XA 3Q27A 2XX7A 1VFEA 3VLVA 4ZEKA 4R9FA 1B5JA 2UYEA 3OO9A 1USYH 3H4ZA 2A5TB 3TDJA 2CMOA 3KBRA 5DVFA 3N94A 4ZEFA 3IO6A 2B3FA 1POTA 1CB6A 2H5YA 3EHSA 3AXFA 3H6VA 2LAOA 1QUJA 3FV2A 1S7YA 2P2AA 2H98A 2HEUA 4NWCA 2PYYA 3FV1A 1MM6A 3MZ9A 3T9HB 5FHNA 1JW4A 2Z8DA 1POY1 1B32A 3D4CA 2F97A 4FECA 4EF1A 3HO7A 2R9JA 5ELVA 4XKPA 3PUWE 4F39A 5AA2A 2DSFA 1URGA 3G3KA 1Z7ME 1Y4TA 4FEBA 1B6HA 4X1DA 4RPOA 1N3WA 1GVCA 3VFJA 3CSGA 3E3KA 2Q88A 3KN7A 1SYHA 3SKPA 5H8NA 1Y3NA 5FHMA 2UYFA 4H65A 1AH5A 1B3GA 3MW0A 2OJTA 4G8HA 4HCYA 3FATA 3Q29A 4Z0IA 2F7AA 4F31B 3E9XA 3MBPA 3ECRA 5F7VA 2Q9TA 1SW1A 3IJXB 4NF4A 1OLAA 1NNKA 2ZYKA 2D21A 2V3QA 1YAEA 5I59B 1OLCA 2HAUA 1B1HA 3UGWA 1EZPA 4WKMA 1MY4A 4F19A 1QUKA 2QJEA 3TPAA 4QHQA 1Y1MA 2FYIA 3KN8A 3A09A 3IR1A 3WAFA 1JW1A 3CFLA 3KGCA 3V5AA 1B7ZA 4PFTA 4H8JA 5AA3A 3K6UA 3W9VA 3FVOA 4FE8A 4YAHX 2ZXTA 1H44A 3S9LC 1NNPA 4GLIA 1A54A 2QL3A 2HCAA 1BKAA 5H8HA 4NE4A 2PVUA 1LB8A 3MC2A 4F3SA 3G3HA 2XXYA 1FQBA 3UIFA 2F35A 2PT2A 3H03A 3K01A 4TQUQ 4R9GA 2ALUA 5I2NB 2DYXA 3USDA 2DWAA 1N7WA 1US4A 4LUBA 1MQIA 4ESXA 3RT8A 1UIVA 2HXWA 3H7MA 3EPEA 4R74A 3ILTB 3OXNA 4QFKA 3VLWA 4YZZA 3DP6A 2F36A 3SESA 4YB7A 2H9BA 4I1DA 2VGQA 4ELQA 4OHNA 5ITOA 2WKYA 3RGYA 4I8CA 1UTBB 4OETA 1QKAA 3GLBA 3RLFE 3ODBA 4G8NA 1MY0A 3IOWA 3QUJA 2CZLA 1LGBC 3C32A 1FQFA 1LAXA 1TWYA 3FUZA 5H8FA 3G3GA 5IKBA 1M5EA 1JVXA 4OZ9A 2FNCA 4NF5A 1MPCA 2UXAA 3FZVA 3QUFA 5ITPA 3H06B 4F18A 4GF8A 3EN3A 2ZYMA 3PPRA 5CBSA 1JVYA 1I6QA 4JWXA 1MXYA 2W7YA 2NVUB 2Y7PA 1LFHA 4R6KA 2RKMA 3GBBA 3FJGA 3Q26A 3FGSA 2QMXA 4NTLA 1US5A 2XXTA 2XXVA 4TOZA 3QXMA 4FEDA 1NKXA 3P7IA 2DXYA 4GL0A 1OIBA 1P1NA 4O3BA 1NNTA 3RQTA 5K2XA 2DOJA 2RCAA 5KCJA 4R75A 3TTMA 1XVYA 4ZEIA 3TFLA 4R2FA 3KOTA 3TCFA 2AIXA 3O6GA 3OOAA 1IZ1A 1RYOA 1MQJA 2I4CA 3O28A 4KYDA 1P1UA 5IAIA 1XVXA 2I0BA 2DE3A 3UORA 4LZ7A 1WVJA 3QK6A 3MZ1A 4HCWA 1B3FA 3RPWA 2GRVA 2O7IA 3OMBA 2OLBA 1D3KA 1LCFA 1GGGA 3TMGA 4F3BA 2RF1A 5L9MA 3QIMA 3QYTA 4BDLA 2X7QA 4ND9A 5I56A 5DT6A 1FQCA 3MAMA 1Y4CA 3MPLA 4ZS9A 4OQOA 3LUYA 5CMKA 4YKKA 4KCCA 2O69A 1NL5A 3K00A 5JTYB 2VP1A 3TTLA 3V83A 4OVJA 1Y1ZA 2XX8A 1NH7A 3O29A 1JNFA 1PB9A 1ELJA 1FTKA 1IXGA 3MJNA 5AA1A 3K0VA 2REJA 3L6GA 3T9UA 3VXBA 4NEDA 3TELA 1NMUA 1URDA 3KJTA 4H5FA 4P0IA 4YKIA 2XD2A 3I5OA 5EYFA 3T93B 3KOSA 4NF8B 4H1XA 5KDTA 5A5XA 4F29A 3PU5A 2I48A 5I84A 4GL8A 4EXKA 3ZSFA 2DXRA 1IXIA 4NF6A 4GQOA 3PUXE 3SEXA 2F5XA 4PQJA 4JSOA 3S9NC 3SDFA 4RK9A 5DVIA 4XKQA 3MVZA 1QUIA 4U23A 3F11A 3TKDA 1HSJA 2QS2A 2PX1A 2ONKE 4OFJA 1AL3A 3C31A 2O51A 2OWTA 3HSTA 5F1QA 1B3HA 3PUZE 2Y84A 3H6TA 5TP9A 4X48A 4PE5B 5CM6A 4IO3A 2DVCA 3OD7A 1MY2A 3RN8A 3KZGA 3RTWB 4H8IA 3HPIA 3TYHA 3K1NA 2DWJA 4RA1A 1IUDA 1MXUA 2RC8A 2I58A 1D4NA 2PT1A 3C4MA 2DWHA 2UVIA 1L5TA 1MM7A 2B3BA 3VVFA 2I4BA 2VHAA 4BLAA 1GV8A 3FVNA 4GIZA 4ZEDA 1FQEA 3U72A 2HAVA 4I62A 1PC3A 4OMBA 5DEXB 3W15C 3CFZA 3FD3A 5CBRA 3FXQA 4IO2A 2OCUA 3U93A 4IGTA 2XXXA 1B4HA 1LBCA 5DTBA 4HTGA 2VOZA 2F6PA 2YPNA 3OELA 3KEIA 2UVGA 5I58B 5H8QA 1LB9A 4C1UA 3CG1A 1O63A 2GHAA 3MUQA 1B52A 4R73A 4F3PA 1A7LA 2O84X 3K4UA 2F34A 3C33A 5HBCA 2A5SA 3U8QA 1LAGE 3K1MA 2QS3A 5TPAA 1R9QA 3DLNA 3OO8A 1DTGA 2HFBA 1QJMA 2Y7WA 5EHSA 4XIGQ 3FXUA 1FCKA 3CG3A 2XXUA 3KJ7A 4LQ2A 2NUVA 3EF7A 3S9MC 3G3IA 4LATA 3Q25A 1LAHE 2GFEA 1B51A 4QFLA 3OEKA 4QRZA 3MVWA 5I2KA 4YICA 4F2QA 1XS5A 3LC8A 1QVSA 3HHFA 3PD9A 3C36A 4DXCA 3JYRA 2E0SA 1OVBA 1A8FA 2HZLA 3IOUA 3FJMA 2VD3A 3QSLA 3DELB 1SW2A 2ZNTA 3KSJA 3PUVE 2GHBA 1LFIA 4OESA 1B5HA 1O7TA 5ISUA 4DE8A 1CE2A 4DXBA 1Y3QA 2V3UA 2NXOA 4ELOA 1F9BA 4O3CA 3PD8A 4BDQA 3ZKLA 3N26A 1PB7A 2DE2A 3IL1B 2D3IA 3U94A 2OK2A 2NOOA 3O66A 1A40A 4OTEA 5JK4A 1GTKA 1UIUA 2OZZA 1FTOA 3O97A 2ANJA 5BUUA 3OSQA 1BTJA 2RINA 5FTHA 2ONSA 1ZIUA 5I2NA 4X9TA 4YKJA 3ILUB 2R6GE 2IEEA 5H8NB 1SI1A 4GWOA 1ZTYA 2Q89A 1DPPA 4YB6A 5HPQA 1XOCA 1H43A 2QS4A 1ZJLA 4HW8A 1IITA 4PFYA 5DYHA 1M5BA 3EHTA 3W9WA 2ZYOA 3IB2A 1OQGA 5L8DA 3FIRA 4NF4B 1QKBA 4IO7A 3BFUA 4NMYA 5TU0A 4PFWA 2XX9A 3C9HA 3EQ1A 3UP9A 5I57A 4GFRA 4ISUA 3G3JA 1B5IA 3RNNA 2HQ0A 4KHZE 2O1LA 2RCBA 2XXRA 1FW0A 1IXCA 3RUMA 3B6QA 4RK2A 2Q8JA 1DTZA 1B0HA 1II5A 4DXUA 4DZ1A 1ATGA 2F6GA 2Q2AA 1VSOA 3M3FA 2AL5A 1Y3PA 4I9DA 4O3AA 4OFOA 1EZOA 4K3FA 2UVJA 4XKRA 3S2VA 4POXA 3K2DA 3OSRA 3TTRA 3K6WA 4FORA 3T9XB 5ICTA 3VDFA 3H3GA 4U4XA 4IO4A 4MF3A 3IO4A 3CSBA 1FQAA 4H67A 5CRYA 3A3CA 4ONYA 4LQ5A 1NFTA 1MY3A 4GXAA 3V8XB 4ESWA 1IIWA 2REGA 1B58A 3FVGA 2V3TA 3DM0A 4WEDA 3OEMA 1J1NA 4G68B 2THIA 1MRPA 2ZYNA 2B65A 1AOVA 3TUSA 1SBPA 4OXVA 1RYXA 4NF5B 5LOMA 3H6UA 4EDPA 3K6XA 4JWOA 3RY3A 1OVTA 4ELPA 1MXVA 3FVKA 4HS7A 3CVGA 2DE4A 4RNSA 3TCHA 5K2YA 1ZBMA 1AIVA 4YMBA 1B3LA 4KR5A 3BBRA 1XC1A 4ZDMA 1NH8A 3PMWA 2ZNSA 2QSXA 3KG2A 1N76A 3DP4A 4U1ZA 4E0WA 5HM4B 3K1PA 1YPNA 5KCJB 2ONRA 1MY1A 3FXRA 4LA9A 4DLDA 1SD3A 3IB1A 2F78A 3GZGA 4Q0CA 4EQ9A 1MXZA 4E0XA 2XXPA 5CMMA 3ONMA 1B3EA 1I6AA 4OWDA 1A55A 4JBZA 1Q1KA 3T66A 4DCXA 5AA4A 1H3DA 2I3WA 4P11A 1GR2A 4LVQA 3IB0A 4RYAA 3E4RA 2IA4A 1JW5A 1YTVA 4F1UA 1USYE 2XHDA 3KSXA 1SW5A 4OEUA 2YLNA 5L9OA 4F1YA 1PDAA 4ZZAA 3WAEA 2XXWA 1UTHA 2DWIA 3ZS6A 4POWA 3LSWA 1DSNA 1TFDA 3O6HA 4MLQA 3TQWA 2XXHA 4JWYA 3VXCA 4X1BA 2QPQA 4LP2B 4DCYA 1Y20A 4UA8A 4QSDA 1T0KA 3PPPA 1MH4A 1N84A 4ECFA 1EU8A 2A5TA 3B6WA 3PGFA 1I69A 3C34A 3DP8A 1ANFA 4FAJA 5B7DA 2HZKA 3TAJA 4RJZA 1IQ7A 5J1DA 1M5FA 1DPEA 2Z23A 4QSCA 4FATA 4Z7EA 1B7HA 3E13X 4EF2A 4RPNA 4LZ5A 5CMCA 5KDTB 1M5DA 1UQWA 2DVZA 3C35A 3BKIB 3CRBA 5H8SA 1ZLQA 4IY6A 5DVJA 1ZKBA 3Q28A 4NWDA 3D4GA 4EUOA 3CR9A 4IO6A 4AB5A 4TLLB 3QAXA 5BWJA 2I3VA 3PUYE 3B7DA 2QS1A 4GOTA 3R26A 1P1WA 4IGRA 3IOTA 3THIA 1B2HA 3UA8A 1IEJA 2I49A 4DDDA 2XXIA 1EH3A 4ZE8A 3T22A 3CFXA 4QFOA 1VFDA 5CI5A 2H99A 5ICQA 3IJOB 3K02A 5L9SA 4PETA 1ZMGA 4U21A 2O6AA 3B6TA 3MVXA 4OYVA 1MQHA 3HN0A 2V84A 2E1SA 4GVOA 2P1SA 5I59A 1YCJA 5FTIA 2F8DA 4GD5A 3HHGA 4XTCQ 1B9JA 3S4UA 2X26A 3GBAA 4KYSA 4GRKA 4XXUA 3U92A 2AYSA 1BLFA 3TTNA 1WDNA 1I6BA 1P1QA 4KYEA 3T96B 3M3KA 1TT1A 3KFMA 5H8QB 3VVDA 2KLFA 2DS9A 2O68A 3TODA 1FTJA 4BDRA 3MVYA 1URSA 4FJPA 3PMXA 2R71A 1SYIA 2PBWA 3A3UA 1B05A 1P1OA 5TPAB 4N13A 3VVEA 1SQYA 3GXAA 4QFNA 3MP6A 3TEPA 3IAZA 1MXWA 1S50A 2F7CA 5FHOA 1O64A 1DMBA 4YKPA 2NWJA 3SETA 5AA2B 2Y7RA 2Z8FA 1OQHA 4C0RA 4EQBA 3O6IA 5I2KB 2I0CA 4MFIA 4OEVA 3SEUA 1OMPA 4U2RA 1DOTA 4F3GA 1JETA 4OFLA 4GXSB 2D5WA 1MPBA 3OO7A 4P0GA 1MPDA 1Q35A 2BJJX 4BDMA 1UTBA 1B40A 2AL4A 4G2ZA 3N5LA 4R6HA 2OBGA 3SEVA 4Q8RA 2Z8EA 4OERA 5EHMA 3CI8A 3I6VA 1A99A 2Z22A 4QF9A 4ZECA 1R9LA 2GH9A 1HSLA 1PB8A 1LCTA 4THIA 3IOVA 2H4IA 4YMAA 4Q5TA 1LFGA 1B0LA 1LAFE 3JV9A 1QW0A 1R6ZA 3TTKA 1MDQA 2FA7A 3H6WA 4G77A 4KFQA 1VE4A 2RC7A 3MWBA 4MBPA 1HSEA 3OENA 1S9TA 4ELRA 1XHYA 1SW4A 2XXQA 1JEUA 2V25A 1N3XA 1P99A 3IK6B 3EHUA 3G3FA 5H8HB 2QMWA 2PMSA 3L6HA 2Q2CA 4JB7A 4QSEA 1QULA 4G68A 2OWSA 4JDFA 1LBBA 3S9EA 4JXIA 1B1XA 3M3LA 2QRYA 3RTFB 3KN3A 3R7XA 1B7UA 3SEWA 4JSDA 1Z7NE 4N07A 5I57B 4R2BA 4IY5A 1FQDA 3HCQA 3VE1B 4EXLA 4U22A 2M8CA 3PV0E 3LSXA 2G93A 1BP5A 3PPOA 1VR5A 4Q30B 2P0SA 2Y7IA 4KI0E 4IO5A 2RC9A 1WODA 5AA2D 5H8FB 2Y7KA 4ZE9A 1MQGA 3FJ7A 5JTYA 1BIYA 4RXLA 2ESNA 1ZU0A 4G68C 3MQ9A 4G4PA 1TFAA 4R6YA 4XKNA 1R1NA 2F7BA 1KWHA 1D9VA 4PP0A 4M1VA 1EZ9A 3MP1A 4OENA 4MH5A 3V89B 1IXHA 4L17A 1H76A 1NNFA 4H0WA 1FTLA 2YJPA 4KPTA 5CC2A 3OO6A 5B70A 4NF8A 3MZBA 3VV5A 4BDOA 2G29A 3K6VA 3SERA 4ZZEA 4UACA 3SEYA 4TLMB 1N04A 1AMFA 4AB6A 1A8EA 4WXJA 1RKMA 4C1TA 3FASA 1JQFA 3IORA 4KCDA 1D9YA 2O1MA 3MPKA 3IX1A 4H5GA 1SI0A 3M8UA 1Y9UA 2X7PA 4FIMA 4LONB 2ABHA 4R72A 3PPQA 3ZKKA 4DIGA 1B4ZA 3LSFB 1SDXA 4KQPA 3TCGA 1LSTA 2XD3A 2H25A 1LLSA 4F1VA 5I56B 2I6EA 1B46A 5DEXA 5AE4A 2UVHA 3PMVA 1MXXA 4MLVA 3TQLA 3R6UA 3JZJA 3O2AA 3I3VA 4YU0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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