2V3TA

Structure of the ligand-binding core of the ionotropic glutamate receptor-like glurdelta2 in the apo form
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
262
structure length
244
Chain Sequence
GVVLRVVTVLEEPFVMVSENVLGKPKKYQGFSIDVLDALSNYLGFNYEIYVAPDHKYGSPTWNGLVGELVFKRADIGISALTITPDRENVVDFTTRYMDYSVGVLLRRSIQSLQDLSKQTDIPYGTVLDSAVYQHVRMKGLNPSMYSQMWRMINNNVLESQAGIQKVKYGNYAFVWDAAVLEYVAINDPDCSFYTVTVADRGYGIALQHGSPYRDVFSQRILELQQSGDMDILKHKWWPKNGQC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Receptor
source organism Rattus norvegicus
publication title Ionotropic Glutamate-Like Receptor {Delta}2 Binds D-Serine and Glycine.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR DELTA-2 SUBUNIT SYNONYM GLURDELTA2, GLUR
total genus 65
structure length 244
sequence length 262
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-06-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2v3tA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2v3tA02
1O7TA 2OJTA 4EF2A 5I2NA 3C33A 3C35A 1FQFA 4WXJA 1Y3QA 3TTLA 4DXBA 1DPPA 5AA1A 1NNTA 4ND9A 3G3FA 4U4XA 1IXHA 1NMUA 2W7YA 2R9JA 2PX1A 3ECRA 3Q27A 1B3EA 1OLCA 3PU5A 3CG3A 2PYYA 1EZPA 2ONRA 3ZKLA 1LAXA 4NWCA 1B40A 3MJNA 1ZBMA 2I3VA 3TYHA 3MVYA 4OZ9A 3O66A 1QUJA 3EHTA 1SVXB 2QRYA 3UP9A 5CMKA 4G8NA 3UGWA 2Z8DA 2BJJX 3KN8A 2XD3A 4L17A 3FVOA 4JDFA 1URGA 4EDPA 3FGSA 4WEDA 4FEBA 1N3WA 3JV9A 2RC9A 3K0VA 2XX7A 2YPNA 4R6YA 3CIJA 4GF8A 2QSXA 1WODA 2R71A 4QFPA 3S9LC 4XKQA 1OLAA 1IEJA 1MH4A 3O2AA 4ESWA 5H8NB 4R2FA 3KFMA 3VVFA 1ELJA 3KGCA 1PC3A 4ZEBA 3D4GA 5EYFA 4U21A 2G29A 4OVJA 1RYOA 4G68B 3HV1A 2Q2AA 2M8CA 4G68A 5AA2A 1N3XA 3UIFA 2RKMA 1P1WA 4H65A 3IOVA 3LSFB 4LP2B 3LC8A 1NL5A 1B0LA 3UK4A 1FW0A 3L6GA 1JEUA 4F39A 4R72A 1UIVA 2GFEA 1QUKA 2GRVA 4QFKA 1TXFA 4TQUQ 4IB2A 2HAUA 2XXVA 5TU0A 4QF9A 3SEUA 1B7ZA 5DTBA 1LBBA 4GXAA 1GGGA 2OBGA 3B6QA 3CI8A 4X9TA 2AIXA 3M3LA 4H0WA 4PFWA 2Y7IA 1D4NA 1OMPA 1OQGA 4F29A 3KN3A 1R9QA 1PB9A 4IO5A 4FIMA 3S2VA 3BFTA 4ISUA 5HPQA 3B6WA 3VE1B 1M5FA 2E1SA 4LATA 1MXVA 3O6GA 4BDQA 2V84A 4ECFA 1TFAA 4P11A 2F7BA 4GOTA 4FEDA 3B6TA 3CRBA 2O68A 3ILUB 3BKIB 4TLLB 3K6UA 3T9VA 3FIRA 4OQOA 1NNFA 3KBRA 4KYEA 1H43A 3Q25A 1MXWA 3IL1B 2CZLA 4R73A 3UA8A 2Y7KA 1LAGE 4HCWA 3TTRA 3IX1A 4U23A 3O97A 4JSDA 3W9VA 1B3FA 3SEXA 1P1NA 3R7XA 2B3BA 1QUIA 1UTHB 1Z7ME 4OEUA 1UTHA 2UVHA 2ABHA 5DYHA 3FV1A 4MLVA 4G4PA 5KDTB 3MQ9A 4OXVA 3MWBA 4G2ZA 5KDTA 2F36A 5FHNA 4F3BA 5M2VA 5TP9B 3H6WA 3T9UA 2D21A 3A3UA 4NF5B 3G3HA 5H8FB 4NF5A 3QK6A 3PMXA 2OWSA 4GFRA 4JXIA 4E0WA 3V5AA 3PD9A 3QXMA 4ZEKA 1Y3PA 1CE2A 5FHMA 3T9HB 2O84X 2GH9A 3IOWA 3WAEA 1JETA 3SDFA 4I62A 1SYHA 4F22A 3MZ1A 3A3CA 3GZGA 2PVUA 5HM4B 2O1MA 2QS4A 3W9WA 4HW8A 5ICTA 1US4A 1Q35A 1D3KA 4PFTA 3S4UA 2XXPA 4F2QA 4I1DA 4IO4A 2RCAA 4IO6A 3K02A 4ZEFA 5A5XB 1UTBB 1B52A 4R9GA 5A5XA 4QSDA 1UTBA 2HQ0A 4C1UA 3OO9A 3QSLA 4KYDA 2O69A 4YKIA 2I4BA 4IO3A 4R9FA 2I49A 1Y9UA 1MQJA 3CR9A 4ZECA 1NH7A 1VFEA 3IO4A 2V3TA 4IY6A 3VXCA 3TCGA 1R1NA 2RC8A 5L9MA 1VE4A 4F19A 3FVNA 3BBRA 4LZ5A 1EZOA 5B70A 1SD3A 2HZLA 4NTLA 5I59B 3SEYA 2LAOA 1XC1A 5I59A 4ZEDA 5I56B 3G3KA 4BLAA 5DT6A 5I56A 3KZGA 3N6TA 4U1OA 5AA4B 1B3GA 2DWAA 1QULA 3M8UA 3RNNA 5AA4A 1B0HA 1LAFE 1ZJLA 2I6EA 4ELOA 3LSLA 4GL8A 1P1OA 4DCXA 3HPIA 4KYSA 2P0SA 5CMCA 4F31B 1MDQA 2X7QA 4XKPA 2F78A 3OO7A 1DPEA 4ZZEA 3THIA 2DOJA 4FATA 4H5FA 1SI0A 3U94A 3HSTA 4XKNA 3IB2A 1MQIA 4NEDA 1BTJA 4YKPA 1PB7A 4DXCA 3KEIA 1MY3A 3RTWB 2H9BA 4KHZE 5CBSA 1QKBA 4NF4B 4OFOA 3O6IA 1DMBA 3K4UA 4Q0CA 4QFOA 4M1VA 3ODBA 5IAIA 3KOTA 1USYE 3VVEA 1EH3A 2XXTA 3H06B 4GL0A 1SDXA 5IKBA 1B1XA 2DXRA 4U2RA 4GIZA 5K2YA 4POXA 2ZYOA 3C31A 1FQDA 5CRYA 5CM6A 1JW1A 1HSLA 2QMXA 4H67A 4UACA 5HBCA 2NXOA 1WVJA 2ZYMA 3H3GA 3T93B 3R26A 4AB5A 1LB9A 1SBPA 4PETA 2DSFA 1A40A 3MP6A 5F1QA 2XHDA 3PD8A 4QFLA 3S9MC 1B3LA 4F1VA 4DXUA 4BDRA 3VLWA 1B2HA 3WAFA 5H8SA 3FV2A 2ZYKA 3PUYE 3H6TA 1MY1A 1XVXA 4GVOA 4ELPA 1I69A 1N76A 1MQHA 3AXFA 4GRKA 3SKPA 4KPTA 3VFJA 3PUXE 3I5OA 1JVXA 3GBAA 2V3UA 2XXWA 3RUMA 4R2BA 2DWHA 2IA4A 1F9BA 2Q8JA 4EUOA 1MXYA 5EHSA 5FTIA 2ZYNA 5DVFA 3U93A 1OQHA 2DYXA 5JTYB 1LFGA 3K6VA 3UORA 3TEPA 5JTYA 1JQFA 2HCAA 3VDFA 3PPNA 2ONKE 3EHUA 4ZEIA 1ZTYA 3QUFA 3MVZA 4MFIA 1B5IA 4XIGQ 5H8NA 1ANFA 3DLNA 2I48A 3ZSFA 1URSA 2ZMBA 3I3VA 4ELRA 3N26A 2YJPA 5DVIA 1B7UA 4LA9A 2XXQA 1N7WA 2GHBA 2XXIA 4F1YA 1NNKA 3PPOA 4H8JA 2FNCA 3S9NC 1FQBA 1S50A 3DM0A 1AMFA 4C0RA 4BDNA 1SI1A 1ZKBA 5F7VA 4PFUA 3E4RA 2OCUA 4N13A 1EU8A 4U4SA 1B51A 3CFXA 3VV5A 1MPCA 1O64A 2REGA 3E3KA 4YB6A 4POWA 3UN6A 4PFYA 3B7DA 1YAEA 3PMVA 2ALUA 3RPWA 4NWDA 3D4CA 1JVYA 4JWYA 1HSJA 4OESA 3LBSA 2OWTA 3OMBA 2NUVA 5JEIA 1Y1ZA 5I58B 4MLQA 1TFDA 3T96B 3QIMA 5I58A 4QRZA 4DLDA 4G8MA 4Q5TA 2AL4A 3RN8A 3PGFA 4LONB 2HFBA 2ANJA 4F18A 5FTHA 2QL3A 4YMAA 2D5WA 1S9TA 2UXAA 2Q88A 4LUBA 3G3GA 3G7WA 1EZ9A 5AA3A 1L5TA 3CVGA 2F6PA 2DVCA 4OETA 3FZVA 1MDP1 4F3GA 2ESNA 3TCFA 3USDA 3IJXB 2AYSA 3KSJA 5B7DA 1FQAA 1KWHA 1ZMGA 3TTKA 4OTEA 3JYRA 3FASA 1AL3A 2YLNA 2XXRA 3CG1A 1MM6A 1DSNA 1BKAA 4JWXA 4I9DA 3OO8A 4OMBA 4WKMA 3ZS6A 5ELVA 5LOMA 1IQ7A 1A54A 5L8DA 1AOVA 2V3QA 1POY1 4RJZA 4RXLA 1BP5A 4KI0E 3FVGA 3HO7A 4MF3A 3IB0A 2QPQA 1N0TA 4YB5A 4YKJA 2A5TB 3T22A 3IAZA 3TQLA 3K6WA 2Y7WA 1LGBC 2Q9TA 4R6KA 3E9XA 3EQ1A 4E0XA 3E13X 4JWOA 1B7HA 3VLUA 4U22A 5TP9A 4NF6B 5I57B 3QYTA 2FA7A 5JK4A 4NF6A 5H8FA 1MY4A 3KG2A 2UVIA 5I57A 4UA8A 4QSEA 1XOCA 3FUZA 1OVBA 1PDAA 1QJMA 3JZJA 3IK6B 1MXXA 5ICQA 2QJEA 4IY5A 3OEMA 1P99A 4PQJA 1LBCA 3PUWE 3OD7A 5AA2D 1AIVA 1B5HA 2VD2A 1B5JA 3K01A 5BWJA 2OZZA 3TDJA 4Z7EA 3CFZA 3OXNA 3EN3A 1MQGA 3FXQA 2RF1A 2B65A 1POTA 1RYXA 1A55A 1BLFA 3OOAA 2O6AA 1US5A 2QS1A 3KJ7A 4FAJA 1B9JA 4GWOA 3GBBA 2I0BA 4NE4A 2DE4A 4YU0A 4ELQA 3VLVA 4IO7A 4M4GA 1NKXA 5H8HB 4LZ8A 1GV8A 5H8HA 1B46A 1JW5A 3OEKA 3PUVE 3KSXA 4EQ7A 3LSXA 4BDOA 4ZZAA 1NH8A 1MY2A 5BUUA 3HHFA 1MRPA 3OELA 1Y4CA 1M5DA 2H5YA 1FTOA 3MC2A 4YMBA 1XHYA 2V93A 4ESXA 2KLFA 5CMBA 3QAXA 4KFQA 4Q30B 4GD5A 5L9OA 3DELB 1IITA 3F11A 4OFJA 3FD3A 1B1HA 1MM7A 1FCKA 3RT8A 3PPRA 1USYH 4DZ1A 1Y20A 4GXSB 4OYVA 2RC7A 1A99A 1LCFA 2HXWA 3FJGA 4RK2A 3K6XA 1VFDA 3IB1A 4KCDA 3IORA 3U72A 3IOUA 2AL5A 2X7PA 3MAMA 4LVQA 4LQ2A 2NOOA 1ZU0A 2H25A 3FATA 1MH3A 4IGRA 4R74A 3KJTA 3U8QA 1MXUA 4O3AA 2UYEA 3CSBA 3K00A 1FTKA 1AH5A 1VR5A 3IO6A 2O7IA 5FHOA 4NF4A 5DVJA 4FE8A 1M5EA 2NWJA 2DQVA 3RTFB 3TFLA 1B6HA 2GHAA 2F6GA 3TUSA 3MBPA 4RY1A 3H03A 3N5LA 3IJOB 3V89B 3TELA 4YICA 2Y84A 2F97A 4R6HA 5I2KB 2DE2A 2DVZA 4F3SA 3MZ9A 5I2KA 1JW4A 1IIWA 4OEVA 1I6AA 3OSQA 4THIA 1CB6A 1B4HA 3BFUA 4Q8RA 1MPBA 4KR5A 2G93A 3GXAA 3HCQA 1B4ZA 2OK2A 3RLFE 3MP8A 4LZ7A 2VGQA 2R6GE 2DWIA 5I84A 1N7XA 3TZAA 1Q1KA 1TWYA 2WKYA 2Z22A 2QS2A 3Q26A 4P0IA 3M3FA 3VVDA 4QHQA 1FTLA 2O1LA 4MH5A 4QFNA 3TTNA 1P1UA 1YCJA 2UVGA 4O3CA 4JB7A 1JEVA 3M3KA 2D3IA 4N07A 3H4ZA 2HAVA 4DCYA 2F8DA 2VP1A 2F7CA 3C9HA 1I6QA 4PE5B 4YZZA 4JBZA 2XXUA 1DTZA 4R75A 2ZNUA 1H45A 4RK9A 3PV0E 3KOSA 3TTMA 2DWJA 1GTKA 2REJA 3ONMA 2I0CA 1UQWA 4O3BA 4YAHX 4AB6A 3MP1A 1JNFA 4KD5A 4HS7A 4I8CA 3O29A 3O9PA 1URDA 2UVJA 1A8FA 1QW0A 3U92A 1MQDA 1O63A 2DS9A 3MW0A 5CC2A 2QMWA 2NVUB 4DE8A 3N94A 2VOZA 3TAJA 1N04A 1PBQA 3C36A 2P1SA 3MVXA 4RA1A 4AQ4A 4OENA 2RCBA 2XD2A 5AA2B 3OENA 1IXCA 3TMGA 4LQ5A 2F7AA 3OO6A 2HEUA 1NFTA 1LSTA 1SW1A 4WEPA 1RKMA 4EQBA 1H3DA 1TT1A 3T66A 2PBWA 4G68C 3CSGA 2E0SA 1MG1A 1B3HA 4FORA 5CBRA 4XKRA 1UIUA 1FTJA 3TCHA 4H1XA 2PMSA 2DE3A 3W15C 4EXKA 4NF8B 1SW4A 4Z0IA 4NF8A 1OVTA 3FJMA 1HSEA 2DP8A 4OHNA 3ILTB 4YKKA 3L6HA 2I3WA 2XX8A 2UYFA 4ONYA 3K1PA 4IGTA 2Q2CA 3MUQA 1XVYA 4OERA 1M5BA 4HTGA 4OFLA 1XS5A 3MZBA 5ITPA 1PBPA 3V83A 3OSRA 3A09A 1Y3NA 4KQPA 4ZDMA 3PMWA 3C32A 4RYAA 2PT1A 3EF7A 3EHSA 2O7UA 1ATGA 2Y7PA 3C4MA 3RY3A 4BDLA 3P7IA 1YPNA 2H4IA 3R6UA 2XXXA 1MY0A 4F3PA 3FXRA 2V25A 3MVWA 1I6BA 4YB7A 1ZIUA 3K1NA 1A7LA 1ZLQA 5KCJB 2A5TA 2DXYA 4EF1A 4GQOA 5KCJA 1M5CA 1PEBA 3TQWA 1Z7NE 3K1MA 4C1TA 1QKAA 2ZNSA 4X48A 5ITOA 3DP8A 3IOTA 3H7MA 3SETA 3FXUA 4H6DA 3HN0A 3I6VA 4ZE9A 3QUJA 4F2OA 3RT6B 1H44A 4XXUA 1SQYA 3PUZE 5EHMA 3MPKA 4OWDA 1LFHA 3EPEA 1LAHE 2I4CA 3RGYA 4QSCA 2H99A 2F35A 2ONSA 2Z23A 3H6VA 4H5GA 4ZE8A 3SEWA 4X1DA 4PP0A 3DP6A 1N84A 1GVCA 1J1NA 1P1QA 2RINA 3IR1A 1NNPA 1B32A 1FTMA 3C34A 4TOZA 2Y7RA 4IO2A 5TPAB 5TPAA 5CI5A 1D9YA 1MXZA 2F5XA 1Y1MA 3FVKA 3KN7A 5ISUA 2VHAA 3Q28A 2B3FA 2H98A 4NMYA 3N6UA 1FQEA 2XXHA 1SW5A 4EQ9A 2HZKA 3O6HA 4G77A 4P0GA 3H6UA 4MBPA 4DDDA 3SEVA 2FYIA 1Y4TA 5K2XA 3PPQA 5AE4A 3LSWA 4FJPA 3V8XB 1FQCA 3TODA 1R9LA 3FJ7A 5CMMA 2X26A 3S9EA 4K3FA 5L9SA 1WDNA 1S7YA 3U1OA 3LUYA 3TKDA 4HCYA 2IEEA 4U1ZA 2PT2A 3K2DA 2I58A 5KZTA 2ZXTA 4G8HA 3G3IA 5J1DA 1LFIA 3PPPA 4N6PA 1BIYA 2XXYA 1H76A 1MS7A 5DEXB 1PB8A 1II5A 1OIBA 5DEXA 1QVSA 4RPNA 4RPOA 1MPDA 2VD3A 3G3JA 3TPAA 2Z8FA 1IUDA 4KCCA 2P2AA 2ZNTA 1R6ZA 3ZKKA 2THIA 3Q29A 1DOTA 1D9VA 1SW2A 3MPLA 3RQTA 3SESA 4JSOA 4GLIA 4TLMB 3O28A 1GR2A 4H8IA 2QS3A 3HHGA 5H8QB 3LR1A 1IXGA 4EXLA 4RNSA 5H8QA 1IXIA 2XX9A 2Q89A 4F1UA 1B05A 2OLBA 2F34A 3DP4A 1SYIA 4FECA 2A5SA 4BDMA 4DIGA 2O51A 2Z8EA 3VXBA 1DTGA 3GLBA 1IZ1A 1LLSA 1XT8A 3CFLA 1VSOA 1A8EA 3SERA 1T0KA 4X1BA 1B58A 2CMOA 1LB8A 4XTCQ 1YTVA 4ZS9A 1LCTA 5I2NB 3T9XB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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