2V3TA

Structure of the ligand-binding core of the ionotropic glutamate receptor-like glurdelta2 in the apo form
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
262
structure length
244
Chain Sequence
GVVLRVVTVLEEPFVMVSENVLGKPKKYQGFSIDVLDALSNYLGFNYEIYVAPDHKYGSPTWNGLVGELVFKRADIGISALTITPDRENVVDFTTRYMDYSVGVLLRRSIQSLQDLSKQTDIPYGTVLDSAVYQHVRMKGLNPSMYSQMWRMINNNVLESQAGIQKVKYGNYAFVWDAAVLEYVAINDPDCSFYTVTVADRGYGIALQHGSPYRDVFSQRILELQQSGDMDILKHKWWPKNGQC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Receptor
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR DELTA-2 SUBUNIT SYNONYM GLURDELTA2, GLUR
publication title Ionotropic Glutamate-Like Receptor {Delta}2 Binds D-Serine and Glycine.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 65
structure length 244
sequence length 262
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-06-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2v3tA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2v3tA02
3PUXE 2Z8DA 3PUWE 2XXHA 1NNFA 1O7TA 1MG1A 3DM0A 4ISUA 2YJPA 4R6HA 3T9VA 1OVTA 2H9BA 2I0BA 4ZEKA 5I56B 2ONRA 3VLUA 5H8NB 1SBPA 2XXWA 4H65A 2H4IA 4U22A 4U23A 3H6VA 2GFEA 1IQ7A 1Y1MA 4KCCA 1R6ZA 2ESNA 2I49A 3L6GA 4F3BA 3D4CA 1B0HA 4C1UA 3DP6A 3IK6B 4OTEA 3ECRA 3K01A 1UTHB 3IJXB 4K3FA 5B7DA 1MH3A 1LCFA 3TKDA 4JDFA 4LZ5A 2RCAA 2H25A 3FXQA 3HSTA 4YICA 1HSLA 5ELVA 3IR1A 4NE4A 5CI5A 2XX9A 3HCQA 4JWYA 1H43A 3PPPA 5L9OA 1L5TA 4EXLA 4F39A 2B3BA 3IO4A 4KFQA 4LQ2A 3MP1A 2D21A 2A5SA 3LSFB 4ZEBA 3CFZA 5H8FB 3KZGA 3DLNA 1I6AA 2O6AA 2F5XA 4FATA 3G3IA 3PMVA 3G7WA 3K1PA 2RC8A 5IKBA 1OQHA 4RK9A 4KPTA 5BWJA 4Q0CA 2F8DA 3S4UA 5DEXA 1NFTA 4FORA 2QS1A 1MQDA 2Y84A 1ZBMA 4L17A 1NH7A 4P11A 3MW0A 2D5WA 5AA4A 1R9LA 3UP9A 3K1NA 4DIGA 2V84A 2H99A 3R7XA 1D3KA 1B7HA 2Z8FA 4IO2A 3U93A 3HHFA 1SVXB 3KSJA 1GTKA 1MY4A 1Z7NE 3VXBA 1Q35A 1B40A 4TLMB 2XXYA 1NMUA 4LQ5A 5DTBA 3CSBA 5I56A 4DCYA 4OZ9A 1WODA 1MRPA 1MH4A 4GOTA 4LUBA 3N26A 1B4ZA 3EF7A 2E1SA 1B46A 2AL4A 1VFDA 4EQ9A 3QK6A 4WEPA 4YB6A 3ILUB 4JBZA 2DWAA 4ZZEA 5DT6A 1UTHA 3UIFA 1B5JA 2RF1A 4KQPA 4G77A 3KG2A 3FIRA 4YKJA 1BIYA 4YB7A 2FYIA 3CI8A 1BP5A 1SW5A 3Q27A 5EHSA 4ND9A 1B9JA 1IIWA 3MZ1A 2WKYA 2ZXTA 1LFGA 1B4HA 5FTIA 3OMBA 1DOTA 1UQWA 1N04A 1R1NA 3IOUA 1FQCA 5H8FA 1M5FA 1LAGE 4MFIA 3LUYA 2X7PA 3T9UA 2Y7RA 1NNPA 3MAMA 2O1MA 3F11A 3K4UA 3MVWA 4NMYA 4BLAA 3A09A 1OMPA 2R6GE 2QSXA 1JVYA 3SEVA 1I6QA 2Q88A 3FVKA 1Q1KA 2F7BA 3FJMA 1IXCA 3G3JA 4LZ8A 3MPKA 2REJA 2PBWA 1N0TA 2OK2A 4YZZA 3MVZA 2QS3A 1N76A 2GHBA 5ICTA 1XC1A 1LB8A 2V3QA 2O7UA 1H76A 1QUKA 1ZTYA 4ELOA 1JVXA 1DPEA 4HCYA 1ZKBA 3O6GA 4H1XA 2PT1A 4OVJA 4IO4A 3LC8A 5I59B 1MY3A 1TT1A 1QULA 4DDDA 1S7YA 1D4NA 5I2KB 4F1YA 4TQUQ 1JW4A 1M5BA 3FVNA 4GL8A 4EQBA 2AL5A 1AIVA 1MPDA 1JW5A 4G68B 3R6UA 5ICQA 4BDMA 5KDTB 4N07A 3IL1B 2UVJA 1IITA 2AIXA 1NNTA 3QAXA 2Z23A 4PFUA 1JNFA 1VE4A 2Y7IA 4Z0IA 1Y3NA 1O63A 3IOWA 4GQOA 3K0VA 4DXUA 3SETA 3Q29A 4ELPA 2D3IA 4MLVA 1QKBA 4NWDA 4QRZA 2H5YA 4U2RA 3C36A 5K2YA 3U8QA 3OXNA 1QW0A 3SEYA 3T9HB 2DWJA 3SDFA 3K1MA 2A5TA 4OERA 4XKNA 3T96B 4XTCQ 4O3BA 2UVHA 2VOZA 4QSEA 2RKMA 4NF5B 4IO7A 2PVUA 1FTMA 4LONB 2XD2A 3U92A 3FV2A 1JEVA 4Q30B 5JTYB 4DZ1A 3FJ7A 2ABHA 2YLNA 2M8CA 4EXKA 2DE4A 2F7AA 4XKRA 3SEWA 1NNKA 4UA8A 2QS2A 1HSEA 5CBSA 3KEIA 3TTMA 4IO5A 3VXCA 1SYHA 1PBPA 3D4GA 3N5LA 1QJMA 4X48A 3HV1A 4TOZA 5AA2B 1NL5A 2GHAA 2VD2A 1FTOA 4GD5A 4ESWA 1B2HA 1IXIA 3C34A 3HO7A 5H8HB 1P99A 3FVGA 4RNSA 1MXYA 5FHNA 3MWBA 4AQ4A 3PPOA 3L6HA 3LR1A 1BKAA 2QL3A 1NKXA 3ODBA 1AOVA 2O1LA 4R9GA 2ZYKA 1WVJA 4IY6A 3M3LA 2OZZA 3CR9A 3PPNA 2RC9A 4RK2A 4TLLB 4EDPA 4OHNA 2NVUB 3IORA 3S9MC 5I59A 3TAJA 4FJPA 3W9VA 1GGGA 1LAHE 4M1VA 2CMOA 4POWA 5I2KA 3Q26A 1OQGA 3GBAA 1JW1A 2NXOA 3R26A 1LLSA 2I4BA 1M5CA 4YU0A 3W15C 4JXIA 3TQLA 3PMXA 4E0XA 3OO8A 4EF1A 5KDTA 1B5HA 3B7DA 4OENA 4ZEDA 2HZKA 5TPAB 2B3FA 2F7CA 5DVJA 1SYIA 2DE3A 3PV0E 3K6VA 2DVZA 3TYHA 3H3GA 4NWCA 2DSFA 3T93B 3T22A 3RT6B 1LSTA 4HW8A 5AA2D 2VHAA 1FQBA 1GR2A 3C31A 4QFLA 1EH3A 3N6UA 1FQFA 1H3DA 4RA1A 4OMBA 4WXJA 3B6TA 3N94A 4NF5A 4F2OA 4AB6A 5DYHA 4PFWA 1ZLQA 5HPQA 4XIGQ 1PBQA 3RNNA 2DOJA 1SW2A 3EPEA 1VSOA 1VFEA 3G3FA 2DQVA 1YTVA 3S2VA 3ZSFA 4NF8A 3KOTA 4KI0E 1N3WA 3PD8A 3VLWA 4G4PA 4NF4A 4JWXA 3QIMA 3RTWB 2LAOA 3QUJA 4R6YA 2F78A 1MQHA 1B58A 5CMBA 3W9WA 4OEVA 4YMAA 1QUJA 1MDP1 3KN3A 5AA2A 4F2QA 1B7UA 1MXXA 3QUFA 4ZE9A 1B05A 4OYVA 3LSLA 1FTKA 3OO9A 3KJ7A 1B32A 1OVBA 5H8QB 2ZNUA 3FV1A 5JK4A 1Y1ZA 1JETA 1DSNA 5CBRA 1MY1A 1EZOA 1MS7A 3FATA 4MBPA 3G3HA 3IB0A 4G68C 2HAUA 1UIUA 4OWDA 2XXIA 3S9LC 3MZ9A 3B6QA 1FW0A 2XXVA 5F7VA 3K00A 4RPOA 4H5FA 2O84X 3VE1B 4BDQA 4QF9A 2F6PA 2F6GA 3MZBA 4AB5A 3KOSA 3HN0A 3LSXA 3O6HA 4ZECA 4ESXA 3QSLA 3V5AA 4BDRA 5H8SA 3FUZA 4KHZE 2F34A 2I0CA 4DXBA 2HXWA 2X26A 3S9NC 1IUDA 3OO7A 5TPAA 5DVIA 4LP2B 3H7MA 1FQAA 1XHYA 5H8NA 3TCHA 4FE8A 4GVOA 3K02A 1IEJA 2XXUA 3PUZE 3MC2A 3I3VA 4KD5A 3G3GA 3IJOB 1O64A 3I5OA 2XXRA 1QVSA 4GIZA 5L9MA 4Q5TA 4ZS9A 2PYYA 3G3KA 2DVCA 2O69A 2PMSA 3TUSA 2GRVA 4U1ZA 1S9TA 4FEBA 4OQOA 5EYFA 5I58B 5L8DA 4P0GA 1SI0A 4PETA 4M4GA 1EZPA 3FZVA 1ZJLA 1D9YA 1B6HA 1UTBB 4MH5A 3DELB 4O3CA 1KWHA 1LBCA 4OFOA 3O97A 2V3TA 2DYXA 3KN7A 3THIA 4F22A 5CMCA 1RYXA 5AA3A 3IB1A 4PFTA 4GRKA 5CRYA 2UYFA 2HFBA 2IEEA 4JB7A 5H8QA 3MPLA 1DPPA 2VGQA 2O68A 1CE2A 2G93A 1II5A 3UORA 5AA1A 3EHUA 1Y4CA 1SQYA 4F3PA 1LBBA 1IXGA 2XXXA 4I1DA 5JEIA 2Q89A 3TMGA 4G8NA 1YAEA 1YPNA 2ZYMA 4GFRA 1B51A 1ZMGA 3VVFA 4BDOA 2REGA 4H6DA 5TU0A 1MDQA 3C9HA 2CZLA 1P1UA 2OWTA 3SEXA 1RYOA 2XXPA 3JZJA 4KCDA 4X9TA 1QKAA 1R9QA 4ZEFA 4U1OA 3V83A 3T66A 3O66A 1B3LA 1N7XA 4YKKA 1MXZA 1B3GA 1PDAA 4R6KA 4H5GA 3DP4A 3CG1A 3VV5A 4IO3A 1MM7A 4O3AA 1LAFE 3N6TA 3E9XA 2Q9TA 3C33A 1MQGA 4G2ZA 1JEUA 4OFJA 5AE4A 3OSRA 3GZGA 2NWJA 3RY3A 3MP6A 5KZTA 1USYH 3C32A 3RQTA 3VLVA 3IO6A 3Q28A 1IZ1A 3GLBA 2DS9A 2P0SA 3MJNA 3TPAA 1B1XA 3CIJA 4BDNA 2KLFA 5K2XA 5HM4B 4ONYA 5B70A 4GXAA 2DE2A 3IOTA 4RPNA 5I58A 3RLFE 4DE8A 2PT2A 1XT8A 3QYTA 5KCJB 3SESA 1FCKA 1UTBA 1SDXA 1MQJA 1URDA 2XHDA 3IAZA 5HBCA 4HTGA 3RTFB 1SD3A 4BDLA 1FQEA 3MQ9A 4ECFA 3MP8A 5I57B 3CRBA 4XXUA 4ZE8A 2ANJA 3EQ1A 3FXUA 4EF2A 3OOAA 5CC2A 1JQFA 4RYAA 4KYSA 4XKPA 1EU8A 1AH5A 3KN8A 3ZKKA 4G8MA 4H0WA 4GXSB 4EUOA 3U94A 4XKQA 2THIA 1B0LA 3USDA 3U72A 2Z22A 4ZDMA 1LGBC 4FAJA 2OCUA 1WDNA 4U4SA 4OETA 1Y3QA 1Y20A 1PB9A 4DXCA 3TTKA 4DCXA 4E0WA 3RGYA 4R9FA 2XX7A 3FXRA 2Q2CA 1N7WA 1PEBA 4ELQA 4Z7EA 2QJEA 1OIBA 5BUUA 3CG3A 1D9VA 4I62A 4FIMA 4U4XA 4G68A 4Q8RA 1A8EA 1J1NA 3OELA 3FVOA 1TFDA 4POXA 4H67A 2I58A 1FTLA 4F29A 2QMWA 3EHTA 2VD3A 1PB8A 2FNCA 1B1HA 4QFKA 1GVCA 3PPRA 3SERA 1Y3PA 1PB7A 1XOCA 1EZ9A 2IA4A 4F3SA 3TFLA 1DMBA 3Q25A 1PC3A 1XVXA 4F1UA 4NTLA 1US5A 2OWSA 4HS7A 4OXVA 3CFXA 3B6WA 3VVEA 4FECA 2XXTA 5KCJA 5JTYA 1RKMA 4WEDA 5FHOA 1MY0A 1NH8A 3MUQA 3WAFA 2GH9A 3OENA 2QRYA 4OEUA 1Y9UA 3RN8A 1A55A 1TXFA 3T9XB 2I48A 3VDFA 3KSXA 4F31B 4F1VA 1VR5A 3IB2A 2R9JA 1N84A 1POTA 5I57A 5ITOA 3M8UA 3K6WA 1OLCA 2F36A 5H8HA 2XD3A 4R2FA 1CB6A 3IOVA 2DWHA 1A40A 2Q8JA 4QFNA 4GLIA 3P7IA 3TEPA 4NF6B 3M3FA 3VVDA 3A3CA 2V93A 4X1DA 4LZ7A 2E0SA 5EHMA 3SKPA 1M5DA 3RUMA 2ONSA 1LFHA 3MBPA 1T0KA 1B7ZA 1P1WA 1TFAA 3M3KA 2RCBA 4PQJA 4PFYA 3AXFA 1SW1A 4IO6A 1MPBA 2UYEA 2BJJX 1MQIA 2XX8A 4F18A 2ZNTA 1MXVA 2ZNSA 2Y7PA 1Z7ME 1A8FA 2DP8A 5DVFA 2ONKE 3HPIA 2HQ0A 2X7QA 4THIA 3OD7A 3BKIB 4R73A 2F35A 1BLFA 2H98A 5LOMA 4R2BA 2Q2AA 3DP8A 5A5XB 1LAXA 2B65A 4C0RA 3UK4A 5M2VA 1ZIUA 3C4MA 3ZS6A 1OLAA 3K6XA 2DXRA 3TDJA 2G29A 3WAEA 1URGA 3OSQA 4N6PA 2ZYOA 1Y4TA 1F9BA 4H8JA 1H44A 3GXAA 4UACA 3H03A 5CM6A 2UVGA 1I69A 2P2AA 3CVGA 1USYE 3FASA 2FA7A 2V25A 4IGRA 3ONMA 3UA8A 1BTJA 2HCAA 3CFLA 3TZAA 3H6TA 3TTLA 3UN6A 5ITPA 3U1OA 1B3EA 3O6IA 1B5IA 3IX1A 2DXYA 2Y7WA 3TELA 5FHMA 3JYRA 5FTHA 4R72A 1P1NA 2A5TB 5CMKA 2YPNA 4C1TA 4KR5A 2QS4A 2OJTA 4ZEIA 3E13X 4GF8A 3I6VA 3RPWA 4N13A 2V3UA 3TTRA 1MXUA 1YCJA 3FD3A 3CSGA 5CMMA 5L9SA 4PP0A 5I2NB 4RY1A 4MF3A 4F19A 4OFLA 3K2DA 1GV8A 4HCWA 2NOOA 3H6WA 4NF6A 2QPQA 4RJZA 1I6BA 1POY1 3QXMA 1URSA 1P1QA 3H4ZA 3A3UA 1XS5A 1B52A 2HAVA 1MXWA 1UIVA 1A7LA 3MVYA 2RC7A 4KYDA 2ZYNA 5ISUA 4I8CA 3O29A 2HEUA 4WKMA 3RT8A 4LVQA 3ZKLA 1DTZA 1TWYA 3MVXA 4QSCA 1H45A 4QFPA 1P1OA 3PD9A 1AL3A 3O2AA 3UGWA 3ILTB 4QSDA 4P0IA 1M5EA 5TP9B 3KJTA 3OO6A 3FJGA 3PUYE 2OBGA 3PMWA 5A5XA 4NEDA 2P1SA 2ZMBA 2I3WA 1HSJA 3EHSA 3C35A 1A54A 1ATGA 1FQDA 4YAHX 1ANFA 4R75A 2Y7KA 1LFIA 3TCGA 3HHGA 3LBSA 4H8IA 4YKIA 4JSOA 1XVYA 5F1QA 4MLQA 3TQWA 1LCTA 2HZLA 4QHQA 5I84A 3O9PA 1DTGA 3PPQA 2XXQA 3PUVE 4GWOA 2UVIA 1ZU0A 4YKPA 2R71A 3K6UA 4LATA 4IB2A 1N3XA 1IXHA 2RINA 4DLDA 3PU5A 3TODA 2F97A 4QFOA 2I4CA 2I3VA 2W7YA 2Z8EA 4YMBA 3JV9A 4YB5A 2O51A 3PGFA 3O28A 3V89B 1ELJA 2DWIA 2I6EA 3TCFA 3E3KA 1B3FA 3KGCA 4KYEA 3S9EA 5I2NA 3BBRA 3KBRA 3OEKA 4NF8B 4GL0A 4NF4B 4FEDA 4IGTA 3H6UA 2OLBA 3H06B 1SW4A 1FTJA 1QUIA 1US4A 3TTNA 4F3GA 3V8XB 2ALUA 2PX1A 4R74A 4G8HA 3KFMA 2O7IA 4ZZAA 3BFUA 1AMFA 3VFJA 1S50A 1MY2A 3OEMA 4EQ7A 5DEXB 2QMXA 3BFTA 2AYSA 3SEUA 3EN3A 4JWOA 4ELRA 1LB9A 2UXAA 4U21A 5TP9A 2VP1A 5IAIA 4X1BA 4I9DA 3E4RA 4OESA 3GBBA 4PE5B 3LSWA 5AA4B 1A99A 3FGSA 1MPCA 4RXLA 4JSDA 5J1DA 1MM6A 4LA9A 1SI1A 1B3HA 4IY5A 2NUVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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