4Z0IA

Crystal structure of a tetramer of glua2 ligand binding domains bound with glutamate at 1.45 angstrom resolution
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
263
structure length
263
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of the tetrameric wt GluA2 ligand-binding domain bound to glutamate at 1.45 Angstroms resolution
rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
total genus 89
structure length 263
sequence length 263
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4z0iA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4z0iA02
3FASA 1JW1A 3MW0A 2DE2A 2QL3A 5DT6A 2DXYA 4YKKA 4RK9A 3N5LA 2QS1A 4F22A 1XVYA 3V83A 3GZGA 2OZZA 3FUZA 1NMUA 1OMPA 2DE3A 3O6GA 3KN3A 1YCJA 4LQ5A 4YB7A 2IEEA 4XKPA 1N84A 4ZEDA 4GXAA 3M3KA 1ELJA 4N07A 1M5FA 4ZEBA 2YLNA 5I57A 4EF2A 3PD9A 3M3LA 3K0VA 1F9BA 1URSA 4H1XA 2O6AA 3QUJA 2DYXA 1PDAA 3U94A 1T0KA 2VD2A 1I69A 3I5OA 2ZMBA 3IORA 5B70A 3FXRA 2DE4A 3R6UA 3RNNA 1N0TA 2PMSA 5AA2A 4DXBA 4ZZAA 4K3FA 1P1OA 3ZSFA 5L8DA 1A8FA 1NNPA 4RPOA 3O2AA 4KQPA 1DPPA 1UIVA 2Y84A 5ISUA 2XXVA 3Q25A 4YKIA 1M5EA 4DCXA 1H3DA 2P1SA 4GF8A 1FTKA 3W9WA 4H65A 3PUVE 4NEDA 5M2VA 1DTGA 1OVTA 1FTOA 3JV9A 1UTHA 3C35A 1SVXB 2ZNTA 5JEIA 3OO8A 1GGGA 4OYVA 1EZOA 4NF8A 3E3KA 4HCWA 2HQ0A 1JW4A 4GIZA 4C1UA 1L5TA 3T9XB 4JXIA 4Q0CA 3V89B 5FTHA 3GXAA 4HTGA 1DSNA 3MAMA 4FECA 4LATA 4IY5A 3A3UA 4XKNA 3QAXA 2QRYA 4PE5B 2Z8EA 2HZLA 3A09A 1B32A 2OK2A 3FV1A 3H06B 4HCYA 2Y7RA 3MP1A 3G3FA 2F7BA 3U93A 1CE2A 4G8MA 1YPNA 2Q2CA 3LSXA 5ELVA 4GOTA 4DIGA 3N6UA 5DVJA 5I59B 5TU0A 2H99A 3MBPA 1MH3A 1Z7NE 1TWYA 1S7YA 1JETA 5H8NB 3IOUA 3KBRA 3VVDA 3UORA 1TXFA 1RYXA 2AL4A 3SEXA 4YMBA 4OWDA 4FEBA 3H6VA 3RTWB 1NL5A 3R26A 5CC2A 3VVEA 1DTZA 4R2FA 4UACA 2THIA 4KYDA 1SBPA 2O1LA 2G29A 4BDMA 1ANFA 3W9VA 4YB6A 3RQTA 2D21A 4OERA 1A99A 1B52A 3TMGA 4ZDMA 4ELQA 4NTLA 3ZS6A 1B51A 3KG2A 4FORA 3U1OA 1USYE 4YB5A 1S9TA 1MXVA 3FJGA 1MQHA 3S9EA 3USDA 4DLDA 4LZ7A 4ELOA 1MY1A 3TTRA 4DZ1A 3K00A 3K4UA 2XD3A 1B7UA 1P1QA 4TQUQ 2HAVA 3H6WA 4YKPA 4QFOA 3SEVA 4G2ZA 3SESA 4KCCA 1SYIA 1QUJA 1QULA 4U22A 4FIMA 1MXUA 3MJNA 3H6TA 3SDFA 5KCJA 2REGA 3IR1A 1TT1A 2NVUB 4AQ4A 3G7WA 4H5GA 3ONMA 2QJEA 2I4BA 3CFXA 4M1VA 1PB9A 3TODA 1NNKA 2NUVA 3L6GA 3B6QA 2FYIA 4DCYA 3M3FA 3TTMA 2ALUA 2ABHA 3TCHA 3HPIA 1OQGA 4PFTA 4U4SA 4BDNA 3HN0A 4EQ7A 1AIVA 5TP9A 4JWYA 4BDRA 2O69A 2OCUA 1R6ZA 2RKMA 3BBRA 1P1NA 4P0IA 3OO7A 4ZE9A 2Q8JA 4F39A 5FHMA 4IY6A 3IO6A 5BWJA 3I6VA 1VR5A 2DWHA 3GBAA 3UA8A 3CSBA 3TELA 3MWBA 4JWXA 4OEVA 4F3GA 5I2KA 3I3VA 3HV1A 1I6BA 3KOTA 1USYH 1JW5A 2F36A 2I48A 4Z0IA 5IAIA 2V84A 1B4ZA 4MFIA 1R1NA 2Y7PA 2I0CA 1P1UA 1OVBA 5ITOA 3K6VA 3FXQA 1TFDA 3C32A 3M8UA 1CB6A 1NNTA 5I58B 5DEXB 1XHYA 4RA1A 1Y1ZA 3SEUA 3D4CA 1KWHA 1JVXA 3EPEA 3U92A 3CVGA 3B6WA 4G8HA 2DOJA 4LVQA 2OJTA 4PETA 3IOTA 1D3KA 2PYYA 5KDTA 3KJ7A 5L9OA 4OZ9A 1EZPA 4NMYA 2F6PA 3E13X 4G68A 1A40A 2GHAA 2YPNA 3H3GA 3L6HA 2O7UA 1P99A 1QUKA 2E0SA 4FJPA 5H8FB 4DXUA 2NXOA 1N7WA 4QRZA 1LFIA 3KJTA 3IB0A 3QSLA 5CRYA 3BKIB 1B3GA 3CIJA 3QIMA 1B05A 4XKRA 4C0RA 4IGRA 1B2HA 2Z22A 3OEMA 5CBSA 4LUBA 4U4XA 2X26A 4OHNA 4NF6A 4EF1A 2DWJA 3IO4A 1LB9A 1Y3QA 3CR9A 4HS7A 4OVJA 2AYSA 4OENA 3UK4A 2VP1A 4N13A 2PBWA 2ONKE 3PPQA 3LSWA 3FJMA 4G77A 3E9XA 4G4PA 1XC1A 4RK2A 4ZZEA 1XS5A 5I57B 3TPAA 1GV8A 5A5XA 1HSJA 2W7YA 4U1ZA 1RKMA 1NNFA 4H8JA 4ELPA 3IB1A 1BLFA 1B5JA 3S9NC 1MXZA 3S9LC 4ESXA 4IO6A 2XXHA 4YAHX 3K1MA 1SI0A 1FQAA 1N3XA 4GWOA 3ZKLA 3MVWA 3SETA 4BDLA 3FVNA 4WKMA 3LUYA 4XTCQ 2CMOA 2RC9A 4TLLB 3KN8A 4R9GA 4N6PA 1QJMA 1JEUA 3T22A 3TUSA 3T9UA 1AOVA 3S4UA 1II5A 1XVXA 1MM7A 1DMBA 4DE8A 1O64A 1IEJA 1D9VA 5F1QA 4RYAA 4UA8A 1MXXA 5KZTA 4LQ2A 4MLQA 5K2YA 2B65A 1Z7ME 4BDOA 1LCFA 5CMMA 5TPAB 4XKQA 5AA1A 1XOCA 1NH8A 2XXYA 4NF8B 2A5TA 3MZ9A 1HSLA 2ANJA 2O1MA 3RT6B 1MRPA 1H76A 2D3IA 1IITA 3T96B 3IJXB 4H0WA 4I62A 1H44A 2M8CA 3OXNA 4F31B 3O97A 1B5HA 1IUDA 1PBQA 2GHBA 1VFEA 1ZMGA 1AL3A 4F1YA 1B0LA 1EU8A 3HSTA 2UYEA 1I6AA 1Y20A 1SQYA 3FGSA 5I84A 3GLBA 1DPEA 1IXIA 3JZJA 4M4GA 1MQGA 3IJOB 1PBPA 3LBSA 4JDFA 3MZBA 2Z8FA 3MP8A 4THIA 3SERA 3MC2A 4E0WA 2Y7WA 4GRKA 4RJZA 4IO5A 1IXHA 3FVOA 2P0SA 3U8QA 2ZNSA 4DDDA 3PMVA 4R72A 2ZYMA 4QFNA 3C36A 5L9MA 3TQLA 3OELA 3VDFA 3B6TA 1OLAA 4MH5A 5JTYB 2B3FA 3P7IA 3HHFA 3PMXA 4R75A 3VLUA 3DP6A 4ECFA 1B7ZA 3TEPA 2GFEA 1LAXA 3VLVA 3G3GA 2HEUA 1YAEA 1A55A 2VD3A 3O29A 5EHMA 1B7HA 3T9VA 4LZ5A 2XD2A 3LR1A 1PEBA 2A5SA 4F3PA 2YJPA 2Y7IA 5DVFA 3CFLA 4F2OA 4TOZA 2VOZA 2XXIA 3KN7A 5I59A 1PB7A 3F11A 2O51A 4KI0E 2XXPA 2XHDA 3UIFA 5H8HB 1IZ1A 1D4NA 3OO9A 2I58A 4EDPA 5H8NA 3D4GA 4R6YA 3IAZA 2F7AA 4ZS9A 1MY0A 2V25A 3RUMA 1POTA 2DXRA 4TLMB 1Y3NA 4H67A 1B1XA 3CI8A 4OMBA 2XX7A 1NFTA 4Q8RA 4OESA 2XX9A 3OSQA 3EHUA 5KCJB 5AA4A 3ODBA 4PFWA 2QMWA 3AXFA 1Q35A 2DP8A 3MPLA 2F97A 4I9DA 3C33A 4R6KA 4JBZA 2DVCA 3S9MC 3ECRA 3G3KA 2Q2AA 1ZIUA 4R6HA 2F5XA 2LAOA 3PPNA 4QSCA 1WDNA 2DWAA 3EHTA 2RCBA 1B40A 4EQ9A 2H4IA 2UVGA 3PPPA 1B0HA 4IO7A 3O66A 2ONRA 1GVCA 1LBCA 4KPTA 1MXYA 4QSEA 3O9PA 3TDJA 3FJ7A 3TQWA 2DS9A 3H6UA 4X1BA 4R74A 3K1PA 5I2KB 1JNFA 4P11A 1FW0A 4NWCA 1R9LA 3OEKA 1PC3A 3LSFB 3Q28A 3VXCA 4ZEKA 5FTIA 1MQDA 1JEVA 4GL8A 1MY4A 1UTBB 1FTMA 1XT8A 2ZYOA 2X7PA 2PT2A 3DLNA 4AB5A 4F19A 3LC8A 3S2VA 3QYTA 1H45A 5I2NB 3PUWE 4DXCA 2HCAA 1GR2A 3N94A 3VFJA 3GBBA 1SW1A 1NKXA 4U2RA 4ONYA 1LCTA 4NF5A 1H43A 4OFLA 3BFTA 1IQ7A 1JQFA 5HBCA 5H8QB 5I56B 4LONB 4NF4A 1M5BA 2I3VA 3W15C 1B3FA 3CG1A 4RNSA 3EQ1A 4ZEFA 2F78A 4R9FA 1WVJA 1BIYA 3SKPA 1M5CA 4JSDA 3K02A 1MS7A 1LSTA 4YICA 4KHZE 5I58A 5AA3A 2HZKA 1ZTYA 5DEXA 3K1NA 1POY1 3FVGA 1ZJLA 1I6QA 4IO4A 4EQBA 3RN8A 1AH5A 2PVUA 5DTBA 2V3TA 1A54A 3KZGA 2H5YA 1QKAA 1OQHA 3IK6B 2NOOA 5ITPA 5IKBA 3N26A 1Y9UA 2REJA 2HAUA 3LSLA 1DOTA 1S50A 1Y3PA 3KEIA 3E4RA 1VFDA 3TTKA 1SD3A 2OLBA 3IOWA 3R7XA 5HPQA 1J1NA 1BKAA 4FE8A 1B46A 2V3QA 5J1DA 2RCAA 1SYHA 2AIXA 5BUUA 1MH4A 3IOVA 3FATA 3TCGA 3UGWA 4IO3A 3K6XA 2DQVA 1FQFA 4XXUA 3CG3A 3V5AA 1N3WA 1B9JA 2QMXA 2DSFA 3RGYA 1PB8A 1SW5A 4PFUA 3RT8A 2F8DA 3BFUA 3C9HA 3PUZE 2D5WA 5AA2B 3FD3A 4ISUA 3PMWA 2PX1A 3FXUA 4JB7A 3K6UA 2FNCA 4RPNA 1LAGE 3FVKA 2H25A 4KCDA 4ZE8A 3HHGA 3MVYA 4G8NA 3DP8A 3CSGA 3THIA 3TTLA 4HW8A 2A5TB 2H9BA 4Z7EA 4GD5A 3PUXE 3QK6A 4G68C 3WAFA 3O28A 4KYSA 3DM0A 3PUYE 1UTHB 1LFHA 3SEWA 3JYRA 3G3IA 1Q1KA 1JVYA 2XX8A 4F3SA 4ZECA 5B7DA 3Q29A 3OMBA 4GVOA 5CMCA 1O7TA 2XXRA 1MXWA 1YTVA 3PGFA 4QSDA 3PPOA 1IXGA 4NWDA 4WXJA 2HFBA 5L9SA 2Z23A 4I8CA 2UYFA 3CFZA 4X9TA 3QUFA 3TTNA 4QFKA 3KGCA 1LFGA 4I1DA 2RINA 4IB2A 5TPAA 1SI1A 4LA9A 1FCKA 3KOSA 5AE4A 1LAHE 2I49A 4OFOA 3TFLA 3ZKKA 3UN6A 1QUIA 2O84X 1D9YA 2RC7A 3G3JA 4LP2B 4GXSB 5F7VA 4H6DA 4YU0A 3IX1A 3KSXA 3QXMA 5CM6A 4RY1A 1B5IA 4GQOA 3T66A 4PP0A 3MUQA 3N6TA 1MM6A 4P0GA 5LOMA 5K2XA 1B3EA 1SDXA 2I3WA 3VXBA 3T93B 4O3AA 5ICTA 1Y1MA 3OENA 3DP4A 1B1HA 5CBRA 2GRVA 2QS2A 1QW0A 3DELB 1A8EA 4JSOA 1UIUA 4KYEA 3K6WA 2O68A 4JWOA 3RPWA 2CZLA 1LB8A 4YMAA 2R9JA 5DVIA 4R73A 2H98A 1MPBA 2AL5A 5HM4B 1A7LA 1ATGA 1MY3A 1Y4TA 4OFJA 3PPRA 4O3CA 4XIGQ 3MPKA 2UXAA 3OSRA 3B7DA 2KLFA 2F7CA 3RLFE 1FTLA 1VE4A 5JTYA 1MQIA 4EXKA 5CMKA 2OWTA 1MDQA 3WAEA 4FEDA 3KSJA 5AA4B 3C34A 1OLCA 3A3CA 1MY2A 3TZAA 5ICQA 1B3LA 3HCQA 3TCFA 4PQJA 3KFMA 3O6HA 1TFAA 1NH7A 2ZYNA 2QS4A 4F1VA 3CRBA 5CI5A 2ESNA 3Q26A 1UQWA 1FQBA 4BLAA 2OBGA 3TKDA 3K01A 1US5A 5H8SA 4H5FA 5EHSA 1ZU0A 3H4ZA 4MBPA 4Q30B 1ZKBA 1RYOA 3EF7A 3G3HA 4YKJA 5H8HA 2DVZA 1IXCA 4QHQA 2XXUA 4POWA 2F34A 4EXLA 2V93A 3HO7A 2ZNUA 5TP9B 1P1WA 1SW4A 2ZYKA 4C1TA 2E1SA 1Y4CA 4GLIA 3EHSA 1FTJA 4OQOA 3H7MA 1SW2A 3VLWA 4WEPA 4MLVA 2V3UA 2RF1A 4GL0A 3IB2A 4IGTA 1N04A 4KR5A 2QPQA 3TYHA 2NWJA 2X7QA 4OXVA 2QS3A 4L17A 2GH9A 4Q5TA 1MPDA 3V8XB 5FHNA 3EN3A 1ZLQA 1LBBA 1O63A 5CMBA 3U72A 1BP5A 5AA2D 1EZ9A 4R2BA 4U1OA 2IA4A 2O7IA 2UVHA 3MQ9A 1FQCA 4BDQA 4F3BA 2UVJA 3K2DA 5FHOA 3MVZA 2Q88A 4H8IA 4KFQA 4FATA 1N7XA 1M5DA 1MPCA 2Z8DA 4NF5B 2F6GA 1OIBA 4QF9A 2XXQA 3VV5A 3MP6A 1LGBC 1BTJA 4ELRA 2Q9TA 4NF4B 3VE1B 2F35A 4POXA 1HSEA 4F18A 3IL1B 1B4HA 3OD7A 2DWIA 2Y7KA 2WKYA 2I0BA 1UTBA 4OEUA 2FA7A 2ONSA 3FV2A 5KDTB 1QVSA 1N76A 3PU5A 1R9QA 4MF3A 3OO6A 4G68B 2UVIA 4OETA 4X48A 1URGA 4GFRA 4QFPA 2BJJX 4RXLA 4OTEA 1URDA 2R71A 4AB6A 5I2NA 1EH3A 2RC8A 3FIRA 2I6EA 3PV0E 2VGQA 2ZXTA 3MZ1A 2R6GE 3FZVA 1IIWA 4F29A 1VSOA 3UP9A 4ESWA 3Q27A 4U23A 5JK4A 4U21A 1US4A 2QSXA 4F1UA 3TAJA 4O3BA 4IO2A 5H8QA 5I56A 3T9HB 3C31A 4NF6B 4FAJA 1LAFE 1FQEA 2P2AA 1WODA 4X1DA 4PFYA 1B3HA 1LLSA 1AMFA 2PT1A 3C4MA 5EYFA 5DYHA 4EUOA 1MQJA 2G93A 4ND9A 3O6IA 3RTFB 2I4CA 4NE4A 3ILUB 1FQDA 2Q89A 1MG1A 3MVXA 2XXXA 3SEYA 1MDP1 3VVFA 4F2QA 3OOAA 3RY3A 4YZZA 5H8FA 2B3BA 3H03A 5A5XB 3PD8A 2VHAA 4QFLA 4E0XA 4WEDA 2XXTA 4ZEIA 1B6HA 2XXWA 1QKBA 1ZBMA 2HXWA 1GTKA 4LZ8A 2OWSA 1B58A 4KD5A 3ILTB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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