3ISPA

Crystal structure of argp from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
292
structure length
290
Chain Sequence
QLDGPQLAALAAVVELGSFDAAAERLHVTPSAVSQRIKSLEQQVGQVLVVREKPCRATTAGIPLLRLAAQTALLESEALAEMGASLKRTRITIAVNADSMATWFSAVFDGLGDVLLDVRIEDQDHSARLLREGVAMGAVTTERNPVPGCRVHPLGEMRYLPVASRPFVQRHLSDGFTAAAAAKAPSLAWNRDDGLQDMLVRKAFRRAITRPTHFVPTTEGFTAAARAGLGWGMFPEKLAASPLADGSFVRVCDIHLDVPLYWQCWKLDSPIIARITDTVRAAASGLYRGQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription
molecule keywords HTH-type transcriptional regulator Rv1985c/MT2039
publication title Crystal Structure of ArgP from Mycobacterium tuberculosis Confirms Two Distinct Conformations of Full-length LysR Transcriptional Regulators and Reveals Its Function in DNA Binding and Transcriptional Regulation.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 74
structure length 290
sequence length 292
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3ispA01
3.40.190.290 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 3ispA02
3R0AA 2XROA 3HRMA 3M1EA 3HUGA 4O6JA 3P9KA 5FO5A 4LB6B 3V8KA 3LAJA 3GFJA 2HQNA 2RDPA 5FFXA 4OIPF 4IHTA 4N0BA 1RUOA 1IXRC 3R60A 3QU6A 4B09A 5EEGA 1XDSA 5CVUA 3TOAA 4ZYEA 1OMIA 2A07F 3KZZA 1H9GA 4AWXB 1I6XA 1FY7A 1SD6A 4CO8A 3F21A 2R7FA 3S2WA 4WXCA 1CF7A 2F2EA 1XSDA 1FBUA 4YIFA 1F1ZA 1ZG5A 1CGPA 2H94A 4G94A 1P4AA 3IKVA 2JPCA 3GUDA 4MGRA 1BI0A 2QENA 3QRFF 1ZG3A 3QP6A 5DEQA 4ZZDA 1U8RA 4KIBA 4JQFA 3WU0A 2M87A 4L9JA 3FZVA 2W24A 2ADUA 3I59B 1G3TA 3K2ZA 2FF4A 2FBHA 4LK0F 2FRHA 2ZMEB 3QPTA 4I98B 2AS5F 3V7CA 4MEYF 3V8JA 3V8LA 4A0XA 2EA4A 1IN7A 3QOPA 3K1MA 1STZA 4ESJA 3I58A 1O3RA 1TW2A 3MZHA 1R1TA 3R61A 3L2CA 3FXQA 2IA0A 1UFMA 3LWFA 4KNYA 2GWRA 1YW9A 3SQNA 1EV7A 1BI3A 1RZ4A 3N4MA 2FU4A 5EEHA 5ICGA 1SAXA 3K69A 3QPHA 5D5XB 5HVQC 5FLXZ 1W7PD 2XAFA 2MBFA 3J81K 5CVJA 3Q5FA 3GFMA 1I5ZA 4Y17A 1K78B 4ESBA 4JK1X 1KGSA 1U2WA 2GA1A 3HSFA 4PGGA 1J0RA 3VODA 2DQRA 1Z7UA 3J80K 2JTVA 3CUQB 4FT8A 2NYXA 5D8KB 2W25A 2PMUA 2STWA 3HRSA 5D8LB 5DD8A 2CFXA 4KMUX 4ON0A 3FHZA 3JAMZ 1SFUA 1LDDA 1HW2A 4UNOA 2AXLA 3HHHA 1R5GA 3GXOA 1ZARA 2HYFA 5E1XA 1B59A 2BYVE 2JSCA 1H0MA 3E5UA 1REPC 1BIBA 4MTEA 3EETA 5CJ9A 2NRAC 1DUXC 1DDNA 4P5OA 1UB9A 4RGRA 3T1BA 1JE8A 4HQMA 4O5VA 5HDNA 3KP4A 2XGXA 3VFZA 4Y15A 2A68F 2ZXJA 1R22A 2PJPA 1P2FA 2EFQA 1B4AA 4G7HF 3L7WA 1XGSA 2BBYA 4ZYHA 2Z33A 2RGVA 2C6YA 3WG9A 2PI0A 2XIGA 3GW2A 3D5LA 2DBBA 1ONVA 1R00A 4EJWA 3I71A 5K5QA 1YLFA 5LGTA 1T38A 1G3WA 2HR3A 3RKWA 1GHCA 3O3KA 5JI6A 4HV6A 2QUFA 4ENNA 1Z9CA 2A61A 2IP2A 3JTGA 2L54A 1R23A 4MQ9F 4I01A 3BZ6A 1IF1A 2UZKA 3COAC 3TO6A 4HLYA 1NHAA 2M5WA 3F72A 2P5KA 4DNCA 4XSXF 5DCFA 1KQ0A 1I27A 1DPRA 3QU3A 2P4WA 5D6EA 2M1BA 5A2QZ 2PMHA 5FFZA 3R4KA 5JVTA 3CJNA 1XMAA 2VE9A 1D5VA 1TBXA 1X3UA 4RS8A 3WGHA 4Q48A 2VOOA 4LD5A 3SHFA 1YW8A 4L9VA 4MHGA 3TQNA 1S6LA 1HW1A 3AAFA 5ILSA 3VEPA 1F5TA 2FQ3A 4ZYDA 1IRGA 4EM1A 1KU9A 3L00A 2QWWA 3Q9SA 1QQIA 1S29A 4A12A 4LG0A 2DTRA 2KIMA 3ZN1A 1LQ1A 4DQ2A 4BHPA 4A5NA 2QYOA 2D45A 4EMSA 1ZHFA 1JHFA 4D0PA 2DI3A 3ZN0A 2MA3A 2P8TA 3ZPLA 2Z3YA 3BPXA 2L3DA 1IW7F 1S7OA 4BHCA 4WK8F 1ZAOA 1JGSA 2XKOA 4LLGF 3IWFA 3RIRA 4OMYA 4WF2A 4KMFA 3ELKA 2FBKA 1TNSA 3RJPA 2YPRA 3LA3A 5H6QA 4LJZF 4EJOA 2CW0F 1JXSA 3ZMDA 4EV0A 2GZWA 5DCMA 4KICA 4HX8A 2YU3A 4AVPA 3KP2A 4HAMA 4P96A 3GFIA 3HOTA 3HRTA 1O3SA 2DW4A 2K86A 3LFKA 5D6FA 2BGCA 4HX7A 2DLLA 2RQPA 3VOEA 3ZMSA 2VXZA 1DP7P 1D8KA 2JT1A 1ZLKA 5L3BA 4OINF 5FB2A 3ABUA 4A0YA 4I02A 4RGSA 3GO5A 1IAWA 1IUYA 2GIVA 1RUNA 5E20A 3RYRA 2V6CA 2A6EF 1IN5A 2L01A 1U6GA 4Z2YA 2BV6A 2QBYA 4S05A 4U0YA 1XSVA 1ZGAA 1Z6TA 4I0BA 5HLGA 3E5QA 4RAYA 2Q0OA 4HLXA 3TO9A 4LGWA 1MDMA 4OIRF 5HLHA 5ERIA 1R58A 2XRNA 2STTA 1XD7A 3BOQA 2G7UA 3MEXA 4UHTA 4BYYA 1MD0A 2HEOA 4M71A 4ENMA 2ELHA 4ETSA 4PGHA 1Z05A 5HDGA 4U88A 1AWCA 3SFZA 5E18F 2ZCWA 3W6JB 4I2OA 3J81Z 4GYIA 5ICFA 1ZRCA 4I7HA 1WQ2A 3I53A 3GEZA 1E2XA 2CO5A 3EUHA 3HTUA 2GXGA 5D5WB 4NQWA 2EFOA 3TDZC 3J80Z 2MC3A 4Y13A 2GA2A 4G6DA 1FSEA 4AIHA 1B9NA 4GYGA 1E17A 4PZJA 5F1RA 5L3FA 2PN6A 4BNCA 5CYVA 4N9HA 1ZH5A 3E6DA 2DO7A 4UVCA 5HS9A 2ETHA 4YFNF 3CUQC 1WRJA 3MQ0A 2G9WA 1WKMA 3T8TA 1O57A 3T0YA 2M8EA 4M6YA 4HF1A 3TGNA 1ODDA 2XKPA 1YFHA 1H9TA 3BROA 1TLHB 4M73A 2XAJA 2IT0A 2Z5UA 3F8FA 3NEUA 4XBFA 2JPBA 3ISPA 4HQEA 5BS6A 2EV0A 3GZ6A 3RI4A 3L9FA 2E1CA 1TQMA 4P55A 5J8FA 2PLYA 4ENKA 2O3FA 4HDVA 4A6EA 5K5RA 4HOBA 4CYDA 1BC8C 2IA2A 1BI1A 5LEJA 2V9VA 1LVAA 1U5TA 1FOKA 1EH6A 1ZREA 1SD7A 4IVNA 3IWZA 2G7HA 3DEUA 1OR7A 1ZLJA 1QZZA 3Q9VA 2VC0A 1L0OC 5HDKA 2WTEA 2W85A 1QZYA 3HRUA 3F3XA 1OYWA 2R7DA 4YIIA 1BN5A 2EA2A 3I4PA 1FNNA 4JVIA 1V4RA 2RNJA 5DYMA 4A0ZA 3M9AA 3H3ZA 2QLZA 3WTVC 2O8XA 3BY6A 3IKTA 1FC3A 1YW7A 3FXRA 1C0WA 4G8XA 4FX4A 5ICCA 4YFXF 3E97A 3I64A 4KN4X 1HSJA 4ZH4F 3TOBA 1RNLA 3SXYA 2EB7A 4R79A 4MTDA 3K9TA 2P7VB 1B6AA 1Q1HA 1PUEE 1GXPA 3ECHA 4AIKA 2R3SA 2F5DA 5E1ZB 3ZQ7A 1FLIA 3VB2A 4MNUA 5LLQA 2CSOA 5HS7A 3I0TA 3FMRA 2GAUA 2NAZA 2KIUA 1S3JA 1BIAA 1LDJA 1QBJA 1GVJA 2XVCA 4HZFA 1KQ8A 3T8RA 3BJ6A 1L3LA 3KP6A 2COMA 4QLCU 4BAYA 3MCZA 3K1PA 2FE3A 3E3VA 2OAZA 3DP7A 1QNTA 1ZN2A 3ZMVA 4OOIA 4WWCA 4HX4A 3CO6C 1KYZA 1YG2A 2HTJA 1HKQA 4XLNF 2WV0A 3C7JA 4M72A 4F7ZA 1S8NA 1KA8A 3JSPA 2UXNA 1HKSA 2XAGA 1QPMA 2FXAA 4Q4ZF 3LSTA 2HDCA 3QAHA 5E8IA 4L0YB 3EQLF 5HS8A 4U7DA 3DXJF 1LNWA 3F22A 2K27A 2EFNA 2EWNA 2XV4S 2VBXA 3I54A 1YTYA 5ILVA 4N9IA 3DKWA 2V79A 3IRRA 4BHBA 2DK5A 2LF7A 4A6DA 2HS5A 2HQRA 4CDGA 4A5MA 5D4SA 2F5EA 1OKRA 3V7RA 3U1DA 2VE8A 1XCVA 4CXFA 3F6OA 1J59A 2RVCA 4CHUA 3MWMA 2A3SA 3BPVA 1XGNA 3E6MA 3WTXC 1LEBA 1OYIA 1WSUA 5IT3A 3F8NA 1HSTA 3WTUC 4EGZA 1F4KA 1T6SA 3LA2A 1OPCA 3GZ5A 4RGXA 2VT2A 3KFWX 4U0WA 2EK5A 5LHIA 4RAZA 4AIJA 4IJAA 4I09A 2H27A 2UWMA 3D0SA 2K4BA 4GGGA 2Q8KA 2FOKA 4NHJA 1HW5A 1XSXA 3I5UA 4R8HA 1ZRFA 4UV9A 2PBIA 2LSOA 1K79A 4LG0B 4IPAA 4HV5A 3FWEA 3F23A 3JAMK 4L9TA 2VBWA 5TJJA 1YO5C 4CZZA 1FYKA 2QQBA 3H92A 1YIOA 5AIQA 1J9IA 3K0LA 3ZP5A 4Q47A 1SFXA 2HKOA 2EFPA 1K6OA 3SZPA 2F5FA 2OBPA 4UVBA 3DV8A 3F6VA 5HOOA 5DUIA 3WTZA 1LDKB 3GWZA 1B9MA 4OIOF 1OYYA 1G3YA 3BP8A 5JFRA 4L9NA 2XAHA 3FM3A 1U3EM 5JHUA 1RIOH 2D2WA 1GXQA 2YX4A 4M9ZA 2XHKA 1RI7A 1TNTA 2VBYA 3FM5A 3HFUA 4LB5A 4EJUA 5DCMB 1YQAA 1JHHA 2Y75A 1XCBA 3F8MA 1TQPA 2A5YB 4KUMA 4UV8A 4WXDA 1KQ9A 1MKMA 4G6QA 3W6KB 2Q2EA 1VTNC 3P9CA 5L3CA 3GF2A 2QVOA 2B0LA 1FBSA 2IJLA 4IF4A 2P5LC 1LEAA 3NRVA 3WE3A 5JR3A 4YG2F 2P7CB 1W7PA 3ZMTA 2O6GE 1BI2A 5LEKA 4G7ZF 3R0JA 5KK1A 5K5OA 1XGOA 3RYPA 2XUBA 4CGZA 1G6NA 4OIQF 2KIFA 3O2PE 1Z6RA 2ISZA 2BE5F 5ED4A 1EH8A 2QBYB 2PEXA 3RKXA 3WTTC 1Z91A 4ENJA 2H6BA 4GXOA 4M9SA 1FPQA 2D1VA 1QO0D 3WGGA 2HFHA 3BDDA 4RB0A 2RN7A 1MDMB 5L3DA 5F6FA 1TQIA 4KIGA 4HW0A 3WTYC 2FNPA 2JZYA 2QQ9A 1A04A 3PQJA 5E17F 1PDNC 4BH9A 1HXDA 3KCCA 3U9GA 3ML6A 5DD4A 3CUOA 2FNAA 3RPQA 3FMQA 4PCQA 1MJBA 5CLSA 1HKTA 2DT5A 1UCRA 2P5VA 1ON1A 3CLOA 4LLNA 1IXCA 2ZNYA 1IN8A 3V4GA 1R7JA 3LAPA 3BJOA 4M9XA 1T2KA 4HDUA 3KP3A 3WGIA 3FF5A 1TW3A 1O3QA 5FGMA 3HOSA 2L02A 3C3WA 2DPUA 3DF8A 3JSOA 1ZGJA 3EDPA 3K1NA 5E1WA 4KT5C 1HBXG 4R1HA 4XRFA 4YFKF 1P92A 3MZYA 1CF7B 2FMLA 5FD6A 2LF8A 3H3UA 1O7FA 3GX4X 3E6CC 3DQVC 2EV5A 2O0YA 3P9IA 3BWGA 1ZG1A 4FHTA 1W5TA 2GQQA 1P4XA 2LNBA 5LRRA 4KN7X 5ICEA 2K4JA 3JTHA 3REOA 2A69F 3G3ZA 2XAQA 4ZZLA 4KYWA 4LMYA 1FYLA 1K7AA 2JRTA 1SD5A 2Z99A 2OQRA 2KJBA 4ASNA 1IXSB 2P6TA 3ECOA 4A2UA 5ILUA 4UUVA 3OOPA 2W84A 4IRIA 3HSEA 2DK8A 5H20A 3GYHX 1PP8F 3ABTA 1D8JA 3DFGA 2QM3A 4H0EA 2L4MA 5HLIA 3KEOA 5BQTA 1O7LA 1U5TB 3I59A 4LK1F 1F9NA 5BPDA 4L18B 2ZMEA 2F5CA 1W5SA 1SD4A 1V3FA 4M6XA 2DAOA 2Y48A 3MFKA 4U7BA 1G4DA 3RDIA 2IA1A 3HIFA 3LA7A 1MJAA 2FSWA 3RPUA 3IRQA 1TTYA 5IT9K 1XMKA 2M45A 1FZPB 2V1UA 3GLXA 1R36A 1Y0UA 1FSHA 5AIPA 3HTSB 3FX3A 2VC1A 5LGUA 4M74A 1D3YA 3ROUA 2ESNA 1J5YA 3L09A 2E7WA 2CWEA 1USTA 3ZMZA 1FT9A 2H6CA 1MZBA 1P4WA 3N97A 1T39A 3LQRA 2P6SA 2HZTA 3M8EA 4I0AA 1SMYF 5J8CA 5D4RA 2FBIA 1LJ9A 1K78A 2MH9A 3KP5A 3MAJA 3B02A 4FX0A 2MH2A 3G73A 1HQCA 3PFIA 5E8GA 2EJRA 4L5JA 3HHGA 2D1HA 4EQQA 3CUQA 6PAXA 3B73A 2DFIA 2CQKA 4L5IA 1XDUA 2VONA 3TO7A 3PQKA 2WWYA 4XSZF 2MD5A 2ZBKA 4OMZA 1XGMA 3WE2A 1O3TA 2PFBA 3GFLA 3J7AO 3ULQB 2RKHA 2OZ6A 3JW4A 3HSRA 2A6HF 3E5XA 3SZTA 4WXHA 2H09A 2ZFWA 1MJ9A 1FP2A 3GVAA 3DPTA 1W4MA 2V1XA 2CGPA 5BPIA 2DQLA 2IPQX 2RV8A 2W57A 4ZYGA 4L0ZB 4KDPA 4JBAA 2ESHA 1ZYRF 1FBQA 1KYWA 2VBZA 4BXUA 1BJAA 3EYIA 3WTSC 2VT3A 2RC4A 4Q5SF 4ESFA 1T0FA 2NNNA 4RB1A 5FD5A 4LFUA 2L4AA 3LQQA 2IRFG 4HF0A 4P9FA 1FYMA 1J7KA 4EJTA 1BOAA 1ON2A 1SMTA 3IC7A 4EJVA 1YS6A 2MLGA 4IHSA 2OD5A 1IN4A 5LHHA 3RTRA 5TRDA 1KU3A 3KP7A 3F8CA 2VOPA 5D5VB 4RB3C 3KETA 3RKYA 2J5PA 1XN7A 2MLKA 3BJAA 3M7GA 2V1DA 4O3MA 2X0LA 5J6XA 5LBQA 5F64A 2FA5A 1FP1D 5CVRA 4RGUA 4QBAA 4WX9A 4UVAA 5FLXK 2PG4A 4JVDA 2TDXA 4CICA 3C18A 1QGPA 2FMYA 2HXRA 4KA4A 3KLNA 1DPUA 2OQGA 1ULYA 2CYYA 4P9UA 2ZO4A 1PP7U 1S7AA 2ZKZA 2HWVA 2O61A 1J2XA 1YYVA 5KVRA 2FEZA 4E70A 3TDUC 2HTSA 3IL2A 1BBYA 2IW5A 4QWQA 4LLLA 1P6RA 4EM2A 1SFEA 3WU1B 2DPDA 5BOXA 1EH7A 4GCVA 1IZ1A 5DV5A 3WODF 4BQAA 2QZ8A 2CG4A 1G3SA 1R1UA 4G7OF 3V7SA 1B1BA 4IXAA 5CVVA 3CTAA 4WCGA 4EGYA 3E6BA 2O03A 2PQ8A 4TV7A 1AOYA 2OZUA 4GO1A 2X4HA 2YR2A 4G9YA 4AD9A 4U0VA 1J75A 1I1SA 4MEXF 4HF2A 5K1YA 4B8XA 2YSRA 2K02A 5BMZA 3T5XA 1KU2A 2ZJ2A 4K2EA 2BEOA 2J5OA 2HGCA 1UHMA 2YX7A 3HYIA 1WI9A 2ACJA 4S04A 2HOEA 2OU2A 2GXBA 3F8BA 1BC7C 3QP5A 1XB4A 2NNYA 5DDGA 3P7NA 4KFCA 2LDUA 2E7XA 1USSA 2OA4A 2Y0MA 4NB5A 3KE2A 3KLOA 1W7PB 1T98A 1Z1DA 2ISYA 5CVIA 4IRHA 1WWXA 2M30A 1IRFA 2WC2A 2XASA 1BM9A 1ZRDA 4EM0B 3NQOA 1LB2A 2EFWA 3KEQA 4IRGA 1U78A 1FX7A 2KJCA 2HYGD 2ZNZA 3R6SA 2UXXA 4PDKA 2VN2A 2VODA 5LRSA 4JVCA 1UHWA 2DU9A 2E1NA 3IHUA 1FWZA 5LHGA 4HA8A 1I1GA 5A2QK 3OV8A 2EV6A 3KZYA 4RB2C 2HKXA 4OU0A 1R5HA 3FMSA 4HYEA 3ERED 3CDHA 3ZMUA 1MGTA 3FXUA 3M8FA 2IVMA 5L3EA 4HBLA 4UXNA 4MQVA 3C1DA 5L3GA 1U5TC 5AONA 2K7LA 4EVIA 1YS7A 4XLPF 5IT9Z 2KRFA 5D5UB 2NS0A 5DUKA 5H6RA 3WTWC 1KU7A 3EYYA 1R1VA 2QQAA 3CO7C 3U2RA 2LKPA 5LGNA 2KKOA 1IN6A 2Z9OA 4KIFA 3TKYA 3DPLC 3O6BB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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