3ISPA

Crystal structure of argp from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
292
structure length
290
Chain Sequence
QLDGPQLAALAAVVELGSFDAAAERLHVTPSAVSQRIKSLEQQVGQVLVVREKPCRATTAGIPLLRLAAQTALLESEALAEMGASLKRTRITIAVNADSMATWFSAVFDGLGDVLLDVRIEDQDHSARLLREGVAMGAVTTERNPVPGCRVHPLGEMRYLPVASRPFVQRHLSDGFTAAAAAKAPSLAWNRDDGLQDMLVRKAFRRAITRPTHFVPTTEGFTAAARAGLGWGMFPEKLAASPLADGSFVRVCDIHLDVPLYWQCWKLDSPIIARITDTVRAAASGLYRGQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal Structure of ArgP from Mycobacterium tuberculosis Confirms Two Distinct Conformations of Full-length LysR Transcriptional Regulators and Reveals Its Function in DNA Binding and Transcriptional Regulation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HTH-type transcriptional regulator Rv1985c/MT2039
molecule tags Transcription
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 74
structure length 290
sequence length 292
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3ispA01
3.40.190.290 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 3ispA02
1J59A 2V1DA 4IVNA 3KZZA 5D5WB 5E17F 1QBJA 2HS5A 3R60A 5JFRA 2QWWA 1QPMA 3WG9A 2W85A 1ZGJA 4N9IA 1PUEE 5L3GA 2DO7A 2V6CA 3HOSA 2O8XA 2WWYA 4XLNF 1L0OC 2EK5A 1KU9A 4ENJA 2P5LC 4MTEA 1CGPA 1P4XA 5E8IA 2QLZA 3B02A 2DK8A 1ODDA 5E1XA 3LFKA 4M74A 3HFUA 1MGTA 5CVVA 1U2WA 4OOIA 1OKRA 4GGGA 4R79A 2VOPA 4JQFA 4OMZA 1U8RA 3HTSB 4PCQA 2J5PA 5LEKA 3D5LA 5A2QZ 4O5VA 2P6TA 1ZYRF 2WTEA 2K86A 2F5EA 1P92A 3GWZA 2STWA 3REOA 3CTAA 2O6GE 1W5SA 3RKWA 5FGMA 4HW0A 4IXAA 3DPLC 3QU6A 3HRTA 3MEXA 4EJUA 1TW3A 1Z9CA 1MKMA 2ZXJA 4HBLA 4BYYA 2OU2A 3LA2A 5DDGA 3GFIA 5H6QA 1IN6A 2GXBA 4JVCA 4ZZDA 3AAFA 2X0LA 3JTHA 5HLIA 6PAXA 1BI3A 5E18F 4KFCA 1D8JA 3WTWC 3K1NA 4MNUA 3RYPA 2QVOA 3G3ZA 5FO5A 1JGSA 4BXUA 2UXNA 2H6CA 2EFPA 4HOBA 1STZA 2HOEA 4Z2YA 2FBKA 4P55A 4G8XA 1U5TC 3LSTA 4HX7A 4A2UA 4GYGA 1F1ZA 3Q5FA 2PFBA 4KIGA 2MBFA 4A6DA 4L0ZB 1ZG5A 4HLXA 2XAJA 1CF7B 2L01A 3FZVA 3GW2A 1IF1A 3WTUC 1K78A 2H6BA 4L9VA 2BE5F 3MAJA 5LGTA 1R36A 3ML6A 3HIFA 3FXQA 3HTUA 3LA3A 4BAYA 2FRHA 1QQIA 4EM2A 5AIPA 3EYIA 1FT9A 2OQGA 3BJAA 4HAMA 4EJTA 1X3UA 2XAFA 5ICEA 3BJ6A 4ZYGA 1XGOA 2DPDA 4HF2A 3HRMA 4G7OF 2VBXA 1FP2A 4A6EA 4H0EA 3T8RA 2ADUA 1W4MA 4BQAA 3F23A 5HLGA 3MZHA 4LK1F 5K5QA 2YSRA 1B9NA 5BS6A 1W7PB 5FLXK 4LMYA 2B0LA 1DUXC 2VT2A 4L9NA 2CQKA 2E7XA 1USSA 2H94A 1HW2A 2EFNA 3WE2A 3CUQB 2Q2EA 3LA7A 2JZYA 5H6RA 5L3FA 2HYGD 2TDXA 1F5TA 3DXJF 3WGGA 1QNTA 3QP6A 4M6XA 1BIAA 2RNJA 1ZGAA 2KJBA 5FFXA 4HF1A 2MLGA 1Z91A 2MC3A 2ZBKA 3F8CA 4WX9A 2Z5UA 1FLIA 4OIPF 2RKHA 4ESBA 3CUOA 1KQ9A 2FBHA 2DFIA 4KICA 1KQ8A 5D8LB 1P4WA 3P9CA 2CFXA 3P9KA 4M73A 2A07F 2A61A 2GZWA 4UVBA 5KVRA 3T0YA 3KETA 4PZJA 1ZRDA 1XD7A 4MGRA 3E5QA 2NAZA 5ICGA 2GWRA 1ON1A 2FNPA 4BNCA 4GYIA 5K1YA 4UV8A 2M30A 2VBYA 3Q9SA 2L4MA 1Z6RA 1R23A 5D5VB 3I4PA 2XIGA 1O3QA 1WI9A 2RVCA 2ZJ2A 2XUBA 1LVAA 2DI3A 1ZARA 2UXXA 3FMQA 1SMTA 2HFHA 3CO7C 3K2ZA 3W6KB 5FLXZ 1XMKA 2L54A 3EYYA 2LKPA 1XCBA 3LQQA 4A5NA 1J75A 5D8KB 1R22A 5LHGA 4A0ZA 3I59B 3WODF 2EV0A 4UXNA 1I1GA 3TO7A 1IRGA 1XGMA 3SFZA 1FX7A 3QP5A 5L3DA 1CF7A 1XSDA 1SMYF 1O57A 2GA2A 2JRTA 1TNSA 2EV5A 2VT3A 2HKXA 4P96A 2ISZA 4A12A 2FXAA 3HHGA 1FBUA 1YLFA 3F3XA 3MWMA 3H3UA 4EM0B 1FYKA 3QAHA 4LB6B 4LG0B 1KU7A 2ZNYA 5TRDA 1TQMA 3C3WA 2NNNA 4Q47A 4YFXF 5BOXA 1KYWA 3K1PA 1R58A 4L9TA 1ZG3A 4MQVA 1ON2A 1LB2A 1V3FA 5ILVA 2A6EF 3I54A 1W7PA 1IZ1A 2KKOA 3DEUA 4LK0F 5DV5A 2O3FA 1KGSA 1GXPA 1XMAA 3CUQA 4HZFA 2Z9OA 2QM3A 1FC3A 3ZMVA 1USTA 4P9FA 1T0FA 1C0WA 4RB1A 3S2WA 3R4KA 3JW4A 3V7RA 5CVRA 5CYVA 3J7AO 3F8FA 5J6XA 3FMRA 5F1RA 3N4MA 1D5VA 3TQNA 3U2RA 2G7UA 3D0SA 3FWEA 1TQPA 1OPCA 2E1NA 2COMA 3F72A 1D8KA 4HLYA 3V8LA 3J81K 3IHUA 1T98A 3SHFA 5J8FA 4G6DA 4LD5A 4KIFA 2A68F 1S29A 2Q8KA 5LRSA 4G9YA 1HSTA 2P5KA 3NEUA 3GFLA 3HUGA 1IAWA 1R1UA 1HSJA 4RB0A 2KJCA 3IL2A 3R0AA 2ESHA 3LWFA 1XSXA 4PGHA 5D4RA 3M8EA 4I02A 5DD4A 2PEXA 1TQIA 3ABUA 3E97A 4B8XA 1ZREA 1KYZA 3ECOA 1G3WA 4WXDA 1EH7A 2M8EA 1ZAOA 2OAZA 3J80K 4CHUA 4YFNF 3I59A 4EJOA 2V1UA 1B6AA 3IRQA 1HKQA 2CYYA 3IKVA 2Y75A 2QENA 1BI0A 3KEQA 4GXOA 5D5UB 1R1VA 3O2PE 1B9MA 4RGUA 3RPUA 4WWCA 1FYMA 2P4WA 2ESNA 2GQQA 5JVTA 3PQKA 1SFUA 5DEQA 4WCGA 2HZTA 2ETHA 1DDNA 4LG0A 3HSFA 1FYLA 2VE8A 2KIMA 4RS8A 4ESJA 1K7AA 5F6FA 5IT9Z 2JT1A 3GFJA 4HDVA 2QUFA 2LDUA 2PQ8A 1R7JA 1XDSA 2MA3A 4HX8A 4RAYA 3GYHX 4LJZF 1XSVA 4Q5SF 4XBFA 2D1VA 3ZP5A 4KMUX 3HRUA 5DUIA 3KP4A 3BJOA 3K9TA 4IRHA 1B1BA 1G3YA 3U1DA 3ZMUA 2JSCA 2E7WA 2ZMEB 5FB2A 3ZMSA 3L7WA 4XLPF 1E17A 2QQ9A 1QGPA 5AIQA 4QLCU 3WTSC 2Z99A 1J7KA 2H27A 1QZYA 3DFGA 5LRRA 2FA5A 4EMSA 4OIOF 5K5RA 1SD4A 3F21A 2M45A 2BEOA 2L3DA 2CG4A 4U0YA 1LNWA 2JTVA 4U7BA 4Q4ZF 4KDPA 1YO5C 5HDKA 4RGXA 1F4KA 1G3SA 2MD5A 3ZMDA 3ULQB 1BN5A 1IN4A 3EUHA 4MQ9F 4HX4A 2RC4A 3K69A 3F22A 4CZZA 4CDGA 2VONA 5D6FA 1UFMA 3CLOA 3VFZA 1LEBA 3DQVC 5K5OA 3V8KA 1WWXA 4L5IA 4KYWA 2FU4A 5ICCA 2FBIA 2CGPA 2NS0A 4OMYA 1HXDA 4HF0A 1OYYA 4QWQA 1YW8A 3CUQC 1QZZA 1NHAA 2FMLA 3HHHA 2UZKA 5LBQA 1DP7P 2RQPA 4ENNA 4IJAA 2XAHA 1GHCA 2D45A 2K4JA 4EQQA 3ZMTA 3VODA 2BYVE 3I64A 5ILSA 2ELHA 2IRFG 1I27A 2EJRA 3FM3A 5CVJA 1V4RA 3TKYA 1K79A 3TOBA 5BMZA 3FF5A 5BPIA 4HV6A 2IA1A 3ABTA 1O3SA 2K27A 4O3MA 4CYDA 3IRRA 3EDPA 4IRGA 4I09A 1O3TA 1YW7A 3MZYA 3BOQA 2FEZA 3RTRA 3ZMZA 2QBYB 2RV8A 3GO5A 3ZN0A 4U0WA 2HWVA 4UVCA 3BY6A 3V7SA 2D2WA 4L0YB 2Y48A 1ZRCA 2VOOA 4U88A 4IHSA 2L4AA 4P5OA 2V79A 1MD0A 5ED4A 1BC8C 1YW9A 2W24A 3U9GA 3FX3A 2ZMEA 1MDMB 1FBSA 2K02A 4FX4A 4MEXF 2PLYA 4LLGF 3HOTA 1R5HA 1I6XA 3WU0A 3GLXA 1G6NA 1LDKB 5DD8A 3TO6A 3GZ6A 3T1BA 4EJWA 1FOKA 2KRFA 4UVAA 3ZQ7A 2YX4A 1RZ4A 3KZYA 1Y0UA 3V7CA 2BBYA 2ZFWA 1BI2A 1EH6A 2FMYA 5CLSA 2EV6A 1SAXA 5HDGA 4U7DA 3F8MA 1R1TA 3MCZA 3K1MA 2PJPA 3KEOA 2ACJA 4CO8A 1YS7A 4KN7X 2P6SA 5E1WA 5EEHA 2OQRA 3FXUA 3M7GA 3E6BA 4HV5A 5AONA 3RJPA 2E1CA 5JHUA 1P6RA 4A0XA 1JXSA 4AIHA 1T39A 3KCCA 4HDUA 3DPTA 1YTYA 2VODA 2P5VA 3F6VA 3QRFF 4ON0A 3E6CC 4WF2A 4I0AA 3BPXA 2JPBA 1IN8A 3GEZA 4Y15A 1HQCA 2EA2A 5F64A 3VB2A 5L3BA 2KIFA 3WE3A 3WTVC 1D3YA 4JVIA 4ETSA 2XAGA 2M1BA 1KU2A 3QPHA 1TBXA 3K0LA 3RI4A 5CVIA 3WTYC 2HR3A 4RAZA 4E70A 3FXRA 3H92A 1ULYA 2XHKA 4QBAA 2GIVA 2EFOA 5EEGA 2G7HA 4HYEA 4JVDA 2M87A 3QPTA 3GZ5A 4FX0A 4M71A 1LDDA 4NB5A 2F5DA 3E5XA 2V1XA 2W84A 3E6MA 3HSRA 4PGGA 3H3ZA 4L9JA 3VOEA 2F2EA 5LHHA 1ZLKA 1P4AA 2OD5A 1U6GA 2QBYA 1IXRC 3WGHA 4FHTA 3RDIA 2FOKA 3SZTA 2QQAA 2QQBA 1EH8A 1FSEA 1SD7A 2EFQA 4N9HA 2A6HF 2UWMA 4M9XA 1O7LA 3OV8A 3KE2A 3V4GA 5LLQA 2ISYA 5HS7A 4LLNA 1ZG1A 1XGNA 1MDMA 3GFMA 3M8FA 3L00A 5HS8A 1RNLA 1FPQA 4DNCA 2ZCWA 3BDDA 2IP2A 2L02A 4CICA 2HKOA 3KP6A 4D0PA 3NRVA 4PDKA 2GAUA 1FSHA 1BBYA 5L3CA 4XSZF 2P7CB 2WC2A 2GA1A 4G94A 1I1SA 4AIKA 1ZLJA 1SD5A 1S7AA 1KA8A 1LJ9A 2HQRA 5HS9A 3ZN1A 4AD9A 4L18B 4OIRF 4LGWA 1GXQA 3CDHA 1Q1HA 4WK8F 1XDUA 2VC1A 1Z05A 4EVIA 4RB3C 3WGIA 1ZHFA 2FQ3A 5D5XB 3I71A 1HKTA 4OIQF 2JPCA 1BJAA 5A2QK 1OMIA 3SZPA 1K6OA 1XCVA 4ENKA 2EA4A 4MTDA 3GUDA 2RDPA 4KIBA 3C7JA 3DKWA 1BC7C 1T38A 3KLNA 1AOYA 4M9ZA 5HOOA 3B73A 3HSEA 2XV4S 4AIJA 1LDJA 5D6EA 4UNOA 1IRFA 2OBPA 2XGXA 3O3KA 4XSXF 4NQWA 3KFWX 2G9WA 3WTZA 2A69F 1RIOH 2LF7A 2AXLA 3PFIA 5DYMA 2CSOA 1OR7A 3GXOA 2D1HA 1XB4A 2CWEA 1SFEA 4HQMA 2F5FA 3L9FA 2X4HA 3L09A 2J5OA 3F8NA 3J81Z 4YIFA 3FMSA 3KLOA 2DT5A 5L3EA 2IJLA 1HBXG 2VN2A 3W6JB 2W57A 2HEOA 4IPAA 2RGVA 2PN6A 2R7FA 3GF2A 3CJNA 5DUKA 2WV0A 3ERED 2QZ8A 3GVAA 3COAC 1PP7U 2Q0OA 3KP7A 4L5JA 5CVUA 1SFXA 2W25A 3R6SA 2YPRA 1H9TA 2RN7A 2C6YA 1DPUA 3TDZC 4GCVA 1BI1A 2HQNA 2MLKA 4M72A 3C18A 4RGSA 4AVPA 3IC7A 4TV7A 1HW1A 2STTA 2DLLA 1IXSB 5CJ9A 2HTSA 3J80Z 1GVJA 2MH2A 1HW5A 2NNYA 4ENMA 5FD5A 1I5ZA 4O6JA 4FT8A 1DPRA 3EETA 2YR2A 4F7ZA 4P9UA 1O3RA 2DPUA 2DTRA 4BH9A 3E6DA 3IKTA 3PQJA 4Y13A 4CGZA 1TNTA 2OZ6A 4U0VA 1IN5A 1YIOA 3N97A 3RIRA 3M1EA 1TTYA 3BWGA 4A0YA 4HQEA 3F8BA 2M5WA 1WQ2A 1S6LA 4LFUA 5BQTA 1ZRFA 2ZO4A 3TO9A 2IW5A 1JE8A 4EM1A 2ZNZA 1BIBA 5LEJA 2PMUA 2NYXA 2QYOA 1R5GA 5DCFA 4R1HA 1J9IA 1RI7A 1G3TA 2HXRA 1EV7A 1B4AA 2PI0A 3RKYA 2DQLA 1O7FA 2YX7A 4BHCA 2R3SA 1FNNA 3I53A 1E2XA 2DK5A 4MEYF 1HKSA 1WKMA 1Z1DA 5LGNA 4K2EA 4GO1A 4MHGA 1XN7A 2IT0A 3TDUC 3QU3A 3WTTC 1FBQA 3JSPA 1L3LA 1J2XA 3MQ0A 1ZH5A 1R00A 1LEAA 2DBBA 3TOAA 2LNBA 5ILUA 3NQOA 4OU0A 4YFKF 1MJBA 3JAMK 3C1DA 1ZN2A 3DP7A 1QO0D 4UHTA 1UHWA 2BV6A 2XAQA 4YG2F 5E8GA 1AWCA 2AS5F 3IWFA 5KK1A 3FM5A 1U5TB 2Z3YA 5HDNA 4ASNA 5FFZA 3OOPA 3SQNA 3BROA 4CXFA 1W5TA 3M9AA 1RUOA 3WTXC 3T8TA 4IF4A 3ZPLA 2OA4A 1Z7UA 2IA0A 1B59A 1OYIA 3BZ6A 1PDNC 4EJVA 5E20A 2R7DA 2HDCA 5ERIA 4KA4A 3LAPA 3ECHA 1KU3A 3HYIA 4UV9A 2O61A 1MJ9A 2EFWA 3F6OA 5JI6A 3RPQA 1J0RA 3SXYA 4KT5C 5DCMB 4Q48A 5LGUA 2EWNA 1IW7F 1FP1D 4Y17A 1U3EM 2XKOA 5E1ZB 2MH9A 4DQ2A 2VE9A 1YFHA 2HTJA 3E3VA 4B09A 2K4BA 3BPVA 1YG2A 4I01A 1YYVA 2VXZA 4JBAA 2XROA 3ROUA 3LQRA 4KUMA 4ESFA 1MZBA 1ONVA 2F5CA 4G7ZF 2K7LA 4G7HF 1REPC 2O03A 1UCRA 2P8TA 3JAMZ 3HRSA 5TJJA 1P2FA 3P7NA 2DW4A 2FF4A 2HGCA 2A5YB 1S3JA 5BPDA 2PG4A 3FHZA 3WU1B 5IT3A 4LLLA 2CW0F 3P9IA 4ZZLA 3E5UA 1Z6TA 2V9VA 2CO5A 3R0JA 1IN7A 3R61A 1G4DA 2H09A 4EV0A 3G73A 1RUNA 2ZKZA 3BP8A 4G6QA 3ELKA 4I98B 4I0BA 3CO6C 4HA8A 2A3SA 1BOAA 2HYFA 2IA2A 1TLHB 1TW2A 3IWZA 5J8CA 1XGSA 1BM9A 4RB2C 4NHJA 3QOPA 2EB7A 3V8JA 5H20A 1T6SA 2KIUA 3KP3A 3VEPA 2DQRA 3JSOA 1S8NA 2LSOA 4ZYDA 3O6BB 2YU3A 1FZPB 3I5UA 2BGCA 1F9NA 4YIIA 1OYWA 2DAOA 3TGNA 2FNAA 1SD6A 4UUVA 4S04A 1U5TA 2FSWA 1FWZA 2IPQX 4M6YA 3I0TA 4ZYHA 5ICFA 3I58A 4N0BA 1A04A 1MJAA 3MFKA 1S7OA 2Z33A 4AWXB 2LF8A 4S05A 1H9GA 3ISPA 2GXGA 4WXCA 2VBWA 4R8HA 5HVQC 1VTNC 1IUYA 3DF8A 3RYRA 4IRIA 1WRJA 4JK1X 3L2CA 1U78A 2XASA 3Q9VA 2IVMA 2VC0A 1T2KA 4LB5A 1UHMA 1YS6A 4RGRA 4BHPA 1J5YA 5DCMA 5FD6A 2FE3A 4I2OA 4OINF 4ZH4F 5LHIA 5HLHA 2PMHA 4KNYA 1UB9A 3KP2A 5IT9K 4I7HA 1JHHA 3KP5A 1KQ0A 4ZYEA 3DV8A 5JR3A 3LAJA 2PBIA 4BHBA 4KMFA 1JHFA 4IHTA 4XRFA 3JTGA 1LQ1A 3RKXA 2DU9A 2NRAC 5D4SA 2Y0MA 4WXHA 4A5MA 2OZUA 2XVCA 2VBZA 1YQAA 1W7PD 1H0MA 3EQLF 1WSUA 3GX4X 2XKPA 4EGZA 4EGYA 1PP8F 2P7VB 2O0YA 1IXCA 2XRNA 4M9SA 1K78B 4KN4X 3T5XA 1FY7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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