3RY3A

Putative solute-binding protein from yersinia pestis.
Total Genus 148
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
148
sequence length
492
structure length
489
Chain Sequence
TLQLAIGDEGFDPMLGWSHGSYLLLHSPLLKQNEDFSWDSLLLSQYQPSDDGKTWLLTLKPDLKFSDGSPLTAKDVAFTYNNAAASGGKVDMGNFLSAEVIDPLNVRIHLKAPQSTFVNVLGSLGIVSADKYNAKTYAQKPIGAGPYRLVSFQPGQQMIVEANPYYAGNKNDFDKLIFVFLDEDSAFAAAQSGQLGVVRIPPSMAVGSVNNMKLWVRPSVENRGIVFPTTPAGKKDAHGYPIGNDVTADVAIRRAINYAINRQLLADQIMEGHAIPAYTGVQGLPWNNPDSAIKDGDIDKAKQILEQAGWQLNSQGTREKNGLPAKITLWYTSGDTTRRDLAQALRSMLKPIGIDVDLKSGSWETVERNMHANPTLFGWGSLDPMELYHHYSSNAAGVEYYNPGYYKNPMVDKHLQQALDAPTWQQAVPFWQQVDWDGTTGAGIRGDAAWAWLLNIQHTYLANNCVDLGKGTPEIHGSWSLLNSIDSWK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
molecule keywords Putative solute-binding protein
publication title Putative solute-binding protein from Yersinia pestis.
rcsb
source organism Yersinia pestis
total genus 148
structure length 489
sequence length 492
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-05-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.105.10 Alpha Beta Roll Dipeptide-binding Protein; domain 3 Dipeptide-binding Protein; Domain 3 3ry3A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ry3A01
4N07A 4OXVA 2XXUA 3A3UA 1LFGA 3K6XA 4KCCA 3GLBA 3KSXA 5KCJA 3CFZA 4G77A 4YB5A 2V25A 4F3BA 4BDMA 2DVZA 4YKKA 4N13A 3ONMA 5H8FB 2O68A 3QSLA 3O9PA 3VLVA 3OSQA 1MY2A 1JQFA 2O1MA 1HSEA 3U8QA 4F31B 2Y7KA 2XXHA 3EQ1A 2X7QA 2QS4A 3O6PA 5TU0A 4EQ9A 2OJTA 1EZOA 4IY6A 1B0HA 3B6TA 1FQFA 2REJA 3O29A 1N0TA 1POTA 2UYFA 4ZDMA 4R74A 3PPPA 4G68C 2D5WA 5DTBA 3FD3A 3PUZE 5ISUA 2ONKE 4NF4B 4FEBA 3K2DA 3DRFA 1FQCA 3CG1A 4MLVA 4PQJA 3K4UA 2GHAA 1HSJA 2RINA 4KR5A 3GXAA 4RYAA 3OENA 3T93B 3Q27A 4HCWA 4NWCA 4E0WA 3TAJA 1JEVA 3H06B 3QIMA 3KFMA 4FORA 2NXOA 4RPOA 2GH9A 1B4ZA 3ZS6A 4UACA 5H8NA 3G3FA 1LB9A 4NF5B 1TXFA 4ECFA 2VP1A 4QFKA 3L6HA 2QS3A 2QSXA 3QAXA 2AL4A 3QUJA 3DRKA 5IKBA 1FTOA 1Z7NE 4OFOA 4OTEA 4C1UA 3CG3A 1SYHA 1AIVA 1MY0A 4GLIA 4XTCQ 3PPNA 1J1NA 1P1WA 3HCQA 5DVFA 4ZEDA 4F29A 5AA4B 1MXZA 3S9LC 1SD3A 4KCDA 3LVUA 1SW1A 4OMBA 1ELJA 2F35A 3H03A 3O2AA 5EHSA 1M5CA 3CRBA 1FQEA 4F1YA 4G8NA 1Y20A 4DDDA 4X1DA 1S50A 3VDFA 3VFJA 5I57B 1B1XA 2O1LA 3Q26A 3PUYE 4H67A 2VGQA 2Q8JA 3C31A 3LSXA 5F1QA 3RQTA 5AA3A 4X9TA 5CBRA 4F1VA 4JWOA 4QSEA 5H8HA 4ZZEA 2OK2A 1A7LA 4OEVA 4G8HA 1B7HA 1US5A 3MPKA 3D4GA 1OMPA 5ELVA 1FW0A 4ESXA 1OLAA 3ZKKA 3IO4A 3B7DA 4RA1A 3FASA 3S4UA 4EXKA 1GR2A 2V93A 3PPQA 3T9XB 5B70A 1URDA 1ZBMA 4EF1A 4R6HA 3UA8A 3G3IA 2ZNTA 3UGWA 3MC2A 4R73A 2F7BA 5CMBA 1Y3PA 5FTIA 4U23A 2YPNA 1FTKA 4NF6A 1MQDA 1II5A 3FJ7A 4XIGQ 1DPPA 1URGA 1OIBA 1LSTA 4YU0A 4F39A 2I0BA 1B1HA 4P0IA 3RLFE 3KSJA 3EPEA 1LLSA 1B3EA 3FATA 1DPEA 4I62A 3DLNA 2P2AA 2HZKA 1LAHE 3N6UA 2B3FA 2R6GE 2OBGA 5TPAA 5AE4A 1R9LA 3LUYA 2Z22A 4I9DA 3ILTB 2P1SA 3RNNA 4OERA 4RK9A 5AA2A 2UVHA 4TQUQ 3IB1A 4ONYA 1ZKBA 2Y84A 2I3VA 2O7UA 3KBRA 1D3KA 4KQPA 2F97A 3IB2A 3OXNA 5I58A 3EHTA 4R6KA 3T22A 4GXSB 3H7MA 2PT1A 3G3GA 2OCUA 3FJMA 5CC2A 3MVYA 3U94A 2HFBA 1QJMA 4GL0A 1O64A 2ONRA 3IO6A 4OZ9A 3PAMA 1RYOA 2G93A 4E0XA 5I56B 3CR9A 1RKMA 2KLFA 2O7IA 4ZZAA 3MW0A 1JW4A 2Q9TA 3IOWA 5K2XA 5CI5A 3RPWA 3PMVA 3SDFA 3HO7A 4FECA 3CSGA 3VVFA 4F2QA 4JBZA 4TLMB 4KYSA 5L9SA 2D21A 2ZYNA 4H5FA 4ND9A 2XHDA 1QUJA 4KHZE 1HSLA 1AMFA 1NNFA 1LCTA 3TTKA 2UYEA 1S9TA 4XKRA 3RTFB 3EHSA 2ZNUA 3DM0A 4PE5B 1XT8A 3VE1B 2F7AA 5I2NA 4NF8A 3FZVA 4GF8A 5TP9A 1JVXA 2RC8A 4LQ2A 3DRGA 1VR5A 3Q28A 1OQGA 1B4HA 3OMBA 3TCHA 3QYTA 1B05A 3BFUA 1MM6A 3OEMA 1PBQA 3K6WA 2ZYKA 2ZMBA 3IOUA 3PPRA 4U1ZA 1SYIA 3EN3A 2I6EA 5HBCA 4QSCA 4C1TA 1N04A 1IXHA 4IO2A 3RN8A 3DRIA 1MY4A 3K1PA 5A5XB 4G68B 4ZEFA 3H3GA 3EHUA 2H9BA 3N94A 4ELOA 3IJOB 1SW2A 3I3VA 3O6HA 1M5DA 5DT6A 1ATGA 3BFTA 4ESWA 4IO5A 3HHFA 3MJNA 1IEJA 3TQLA 5FHMA 3MVWA 4H1XA 4IGRA 4POWA 1P1OA 3MZBA 3TCFA 4H5GA 4LZ7A 1NL5A 3OO7A 5KCJB 1WDNA 3CFXA 3FV2A 2PX1A 4JWXA 2QJEA 1WODA 2ZNSA 3HN0A 3P7IA 3C34A 2OWSA 4LA9A 3UORA 3FGSA 3SEVA 1Q35A 3TQWA 3V8XB 3RT6B 3TELA 4H0WA 4OYVA 1MQJA 3TEPA 3UN6A 4HW8A 4M4GA 1B3GA 2FNCA 3C36A 1GVCA 5FTHA 4QHQA 3MPLA 5H8QA 2Y7RA 1PC3A 3IB0A 4U2RA 2HXWA 3KZGA 2XXQA 4JSOA 2ZYMA 4DCYA 4OEUA 1N7XA 1XHYA 1ANFA 2DWIA 1FTMA 3UP9A 4XKQA 3PUXE 3RT8A 4NTLA 1R1NA 3TTMA 1R9QA 4GOTA 4JDFA 1SQYA 1B5HA 4DXCA 1ZMGA 4PFTA 1MH3A 2YLNA 4G2ZA 3TCGA 5M2VA 3TFLA 2M8CA 1MXXA 4GQOA 2DOJA 2NUVA 1YCJA 1ZJLA 3IX1A 1AH5A 4GFRA 3PMXA 3DP4A 4U21A 3K00A 2UVIA 5DEXB 2R71A 1O7TA 3PD8A 2WOKA 2XXYA 3RY3A 1MXUA 3GBBA 4BDLA 5BUUA 4KI0E 2Y7PA 2E0SA 4R6YA 4JB7A 2ALUA 3KJ7A 2F6PA 4HCYA 3CHGA 3A3CA 1BLFA 4M1VA 2DE4A 2B3BA 4FATA 4C0RA 4MLQA 5ITOA 5AA1A 3MP6A 4EQBA 2R9JA 4ZECA 4BDRA 3PPOA 3MZ9A 4EUOA 1RYXA 3TPAA 1TFDA 4G8MA 3K1MA 4NF4A 4U4SA 4THIA 3MAMA 4TOZA 4XKNA 2PT2A 2WOPA 4IO4A 1OLCA 1MDP1 2Q2AA 3UIFA 4YZZA 1JNFA 1N84A 4QFPA 2H25A 3QK6A 1DOTA 3LBSA 1LFIA 2IA4A 1A54A 1N76A 1QKBA 2VD2A 3IAZA 3SESA 1N3XA 3D4CA 2DQVA 4P0GA 3GBAA 1P1UA 1UQWA 1H45A 1LGBC 2RF1A 4KYDA 1QW0A 1PB9A 4NF5A 3QXMA 3SETA 1PBPA 3VXCA 1B40A 2G29A 1MXWA 5JTYB 2X7PA 2AIXA 3H4ZA 4DXBA 5I84A 2UVJA 3MP8A 1DTZA 3PUWE 1B7ZA 2DXRA 3KN8A 5AA4A 1UTBB 3K6VA 3FVNA 1L5TA 4LATA 2XXXA 1QULA 3T9HB 2ESNA 4U1OA 4PFUA 1B6HA 2A5TB 4YKPA 2V3TA 2V3UA 3M3LA 2Z23A 2XXPA 2DWJA 5KDTB 1TT1A 1F9BA 3CFLA 4R9GA 5I57A 3THIA 1GGGA 1EH3A 3OO6A 4GIZA 2GHBA 2Z8DA 4OFLA 3EF7A 3FXUA 3ZKLA 2I4BA 1PDAA 1Q1KA 5KZTA 1A8EA 3ZSFA 3V83A 5I2KB 1B5IA 3Q25A 3VLUA 4YB6A 2RKMA 1MQHA 3U93A 1LCFA 2NWJA 1NMUA 3M3FA 2XXWA 4R2FA 5B7DA 1EU8A 3SKPA 1QKAA 1BIYA 3BKIB 3G3KA 2OLBA 1FCKA 2O69A 3FUZA 2I3WA 1QVSA 2GFEA 2LAOA 4OWDA 1TFAA 1WVJA 1Z7ME 2O51A 4R72A 3R7XA 1B3FA 1XC1A 1MRPA 4LONB 4ZS9A 4RNSA 3RTWB 3M3KA 5FHNA 3CVGA 4R2BA 4QF9A 4EXLA 4HTGA 1IXCA 2OZZA 4O3AA 2H98A 2AL5A 1Y4CA 3O28A 4TLLB 2B65A 1H76A 5CM6A 1N7WA 1SVXB 1UTHB 5JK4A 1QUKA 3IORA 3VV5A 3ECRA 1GTKA 1D4NA 2CMOA 3FTOA 3T9UA 2UXAA 1JETA 3T66A 3CSBA 2PBWA 4U4XA 1Y9UA 3K6UA 4OHNA 3O97A 2HCAA 1MQIA 1H43A 1MS7A 5HM4B 4XXUA 3MVZA 1ZLQA 4BDOA 3G3JA 1XVYA 4RPNA 1P1QA 2BJJX 2DWAA 3USDA 3KOTA 4ZEBA 3IOTA 3ODBA 2W7YA 1LAFE 5I56A 1I69A 1OQHA 3MP1A 2UVGA 5CMCA 3TTRA 3DRJA 1IQ7A 3TKDA 3LSFB 3JV9A 2VD3A 4AB6A 2ABHA 2RC7A 4KD5A 3V89B 4F19A 3MVXA 3A09A 1YPNA 3IK6B 4R9FA 1SBPA 1SW4A 5IAIA 3GZGA 2Q89A 2B4MA 3LR1A 4O3CA 5K2YA 2QMXA 4IO3A 1MXVA 3U1OA 5J1DA 4BLAA 3VVEA 3T96B 1NH8A 2PMSA 4KPTA 4LQ5A 5I59B 2F78A 2A5SA 1MY3A 1A55A 3WAEA 3PV0E 3C35A 4N6PA 4IGTA 1AOVA 3VLWA 4LZ8A 3IR1A 4FE8A 3S9EA 3PUVE 4BDNA 4XKPA 3PMWA 1T0KA 2DWHA 3DRHA 4RXLA 2Y7IA 2QPQA 3DELB 3FVKA 5ITPA 1VFDA 1D9YA 5A5XA 2XD2A 4G68A 1NNPA 3LSLA 2NVUB 2O84X 4RK2A 3R26A 1H3DA 1JW5A 4ZE8A 4ELQA 4DXUA 1BTJA 2XX9A 1OVTA 3TODA 3SEUA 3TYHA 1VFEA 1XOCA 2DVCA 3FXRA 1IXGA 5EHMA 1MM7A 1UIUA 2CZLA 3KN7A 3K01A 3CI8A 3N26A 4YMAA 1B32A 4LVQA 1DMBA 3FXQA 3T9VA 3ILUB 4DE8A 4JWYA 4KFQA 1MQGA 3JZJA 3N6TA 2IEEA 4FAJA 3QUFA 2QRYA 1PB8A 3N5LA 3HSTA 2PVUA 4Z7EA 2DS9A 1Y4TA 3O6GA 3G3HA 4Q0CA 3TUSA 1SW5A 4WKMA 2O6AA 2E1SA 3CIJA 3MWBA 1MY1A 4F3GA 4JXIA 3KG2A 1IITA 5H8NB 4PETA 1A8FA 4WEPA 5H8FA 2RCAA 4ELRA 1NNKA 3TZAA 3LC8A 4IO7A 5L9MA 1NNTA 4POXA 2OWTA 3FJGA 1D9VA 2HEUA 1UIVA 2XXRA 4YB7A 2Z8EA 3G7WA 2F34A 1LFHA 2F8DA 2FYIA 3MQ9A 4NWDA 1Y1ZA 5H8SA 2DP8A 1R6ZA 4OENA 3WAFA 1VE4A 4Q8RA 1Y3QA 1URSA 4PP0A 2I58A 4EQ7A 3OOAA 1MPBA 1MDQA 3BBRA 5EYFA 3L6GA 5DEXA 4QRZA 1P99A 2FA7A 3I5OA 2P0SA 3HPIA 2RC9A 1FTJA 3B6WA 3MBPA 1B3HA 2Q2CA 5H8HB 1I6AA 1KWHA 3F11A 2XX8A 5CRYA 1YTVA 4IB2A 4FIMA 2NOOA 1IIWA 2H5YA 3E3KA 4LUBA 4DCXA 2WOLA 2PYYA 4GXAA 3OO8A 4IO6A 1IZ1A 4H8JA 1USYH 3C9HA 1H44A 4YKJA 4QSDA 1LB8A 3OSRA 3TMGA 3UK4A 5ICQA 5L8DA 3S9NC 2H99A 4QFOA 2DYXA 1ZIUA 3VVDA 1B46A 5F7VA 3C32A 4MFIA 1POY1 1USYE 1YAEA 3Q29A 4P11A 2HAUA 4FEDA 4F1UA 1MH4A 5DYHA 4NF6B 3E13X 4I8CA 2ONSA 4G4PA 2QL3A 4NEDA 4OVJA 4RY1A 3TTLA 3OELA 3E9XA 4JSDA 1I6BA 4H8IA 1LBCA 3SERA 3S9MC 4OETA 4Z0IA 3KEIA 4DZ1A 5CMKA 1Y3NA 3JYRA 3SEXA 1MPDA 4AQ4A 1PEBA 3KOSA 4H6DA 2REGA 1IUDA 4OQOA 5JTYA 3C4MA 2XXTA 3PU5A 5LOMA 2ZYOA 5TPAB 3O6IA 5CMMA 1DSNA 1CB6A 1AL3A 3HV1A 4I1DA 3TDJA 4YKIA 5AA2B 2I48A 1M5BA 5AA2D 3FV1A 1UTBA 3U72A 4FJPA 1B2HA 3DP8A 1NH7A 2F7CA 1JW1A 4F18A 1A40A 3H6WA 2A5TA 5I58B 4ZEKA 4IY5A 4WXJA 4X48A 5KDTA 1FQAA 3V5AA 4OESA 3FVGA 1GV8A 4BDQA 1VSOA 1XVXA 3MZ1A 3O66A 2V84A 5CBSA 1B9JA 1M5FA 1B58A 4KYEA 1ZTYA 2D3IA 5JEIA 2I4CA 1JEUA 4MBPA 3K02A 4H65A 5I2KA 2ZXTA 4LP2B 4F2OA 4QFNA 2XD3A 3KGCA 3E4RA 1IXIA 1B52A 2F5XA 2HZLA 1M5EA 4QFLA 4GRKA 1BKAA 3RGYA 2QMWA 2XX7A 2H4IA 3H6TA 3K1NA 4RJZA 3S2VA 2HQ0A 4EF2A 1B0LA 1XS5A 2DE3A 1N3WA 1S7YA 5I2NB 4NF8B 3W9WA 1NFTA 1O63A 5TP9B 3OO9A 3K0VA 4HS7A 1EZ9A 2X26A 3W15C 4F22A 2I0CA 3M8UA 1FQDA 5ICTA 5BWJA 1P1NA 2Z8FA 1MPCA 1B51A 1SDXA 2V3QA 4AB5A 4X1BA 3RYAA 4F3PA 2DSFA 1I6QA 4WEDA 4U22A 4Q30B 2THIA 4YMBA 3IL1B 4R75A 4PFYA 1A99A 1NKXA 3B6QA 2DE2A 4NE4A 2F36A 2RCBA 4PFWA 4MF3A 3HHGA 1ZU0A 2YJPA 1TWYA 4ZEIA 2VOZA 4DIGA 3FVOA 4LZ5A 1JVYA 2GRVA 3OEKA 3TTNA 2AYSA 1UTHA 3PGFA 3SEYA 4MH5A 4YICA 1CE2A 1QUIA 2QS1A 2XXVA 2I49A 2HAVA 3IOVA 3VXBA 1LAGE 4GD5A 3H6UA 1BP5A 3H6VA 4GL8A 3SEWA 4Q5TA 5DVIA 3FIRA 3AXFA 4ISUA 3PD9A 1MXYA 4L17A 1B3LA 3U92A 3RUMA 3R6UA 2Q88A 1US4A 3W9VA 1EZPA 1SI1A 5FHOA 2F6GA 3KJTA 1LAXA 5L9OA 1OVBA 4ZE9A 3IJXB 2XXIA 2B4LA 4UA8A 1DTGA 3LSWA 2WKYA 3C33A 4ELPA 4K3FA 2DXYA 5DVJA 5H8QB 1FQBA 1Y1MA 1LBBA 4DLDA 4NMYA 4YAHX 3OD7A 3KN3A 3RYBA 4O3BA 3I6VA 3MUQA 4EDPA 1MG1A 4GWOA 2QS2A 3DP6A 2ANJA 4GVOA 5I59A 2Y7WA 1B7UA 2VHAA 1PB7A 1SI0A 4OFJA 1FTLA 1B5JA 4F3SA 5HPQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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