3RY3A

Putative solute-binding protein from yersinia pestis.
Total Genus 148
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
148
sequence length
492
structure length
489
Chain Sequence
TLQLAIGDEGFDPMLGWSHGSYLLLHSPLLKQNEDFSWDSLLLSQYQPSDDGKTWLLTLKPDLKFSDGSPLTAKDVAFTYNNAAASGGKVDMGNFLSAEVIDPLNVRIHLKAPQSTFVNVLGSLGIVSADKYNAKTYAQKPIGAGPYRLVSFQPGQQMIVEANPYYAGNKNDFDKLIFVFLDEDSAFAAAQSGQLGVVRIPPSMAVGSVNNMKLWVRPSVENRGIVFPTTPAGKKDAHGYPIGNDVTADVAIRRAINYAINRQLLADQIMEGHAIPAYTGVQGLPWNNPDSAIKDGDIDKAKQILEQAGWQLNSQGTREKNGLPAKITLWYTSGDTTRRDLAQALRSMLKPIGIDVDLKSGSWETVERNMHANPTLFGWGSLDPMELYHHYSSNAAGVEYYNPGYYKNPMVDKHLQQALDAPTWQQAVPFWQQVDWDGTTGAGIRGDAAWAWLLNIQHTYLANNCVDLGKGTPEIHGSWSLLNSIDSWK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
source organism Yersinia pestis
publication title Putative solute-binding protein from Yersinia pestis.
rcsb
molecule keywords Putative solute-binding protein
total genus 148
structure length 489
sequence length 492
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-05-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.105.10 Alpha Beta Roll Dipeptide-binding Protein; domain 3 Dipeptide-binding Protein; Domain 3 3ry3A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ry3A01
5J1DA 5L9OA 3MUQA 2XXIA 5HPQA 4QSDA 1A8EA 3I6VA 3DRJA 3DLNA 4YICA 1MY3A 2YJPA 4GD5A 1VR5A 2DWJA 1J1NA 2R6GE 1TWYA 5I59B 1JETA 1MQDA 1ZKBA 5H8FB 4OYVA 4FATA 3IK6B 3IOVA 2VOZA 1LB8A 4NF5B 3H6WA 3A09A 2IA4A 1MXUA 3OXNA 1LCFA 3E3KA 4LZ7A 3DRFA 1EU8A 4EXLA 2AIXA 3ONMA 4NE4A 3GBBA 3IJOB 4PFTA 2D21A 3MP6A 4ONYA 3S9LC 4DZ1A 4H5FA 2OCUA 1UTHA 4H65A 5H8NA 4DXUA 3MQ9A 4ESXA 1JVYA 1P1UA 2WKYA 4KR5A 4G8MA 3IOUA 3LUYA 2QS3A 1IIWA 3CFZA 1MXZA 3VFJA 4XTCQ 1PBPA 1UTHB 4IGTA 2F6GA 5H8NB 3G3HA 3RT8A 4F3BA 3TTLA 3MVXA 1MH4A 2Y7KA 3RGYA 1B6HA 1B3FA 1B4ZA 1YPNA 4DIGA 2Y7RA 2VD2A 3ZKKA 4LUBA 5FTIA 2HQ0A 2ONSA 5H8HB 3GXAA 3IJXB 2DWIA 3MC2A 5CM6A 4IB2A 2XD3A 3SESA 3O97A 4N07A 5EHSA 1LAGE 3TTNA 1POTA 1QVSA 3Q26A 3HO7A 1B7ZA 2OLBA 4YU0A 4ZDMA 4UACA 3T9HB 4ESWA 3KJTA 1AIVA 3KOTA 2PX1A 5AA4B 2ESNA 3U1OA 2XXRA 5K2YA 2F34A 2V84A 4RYAA 5DEXA 3O9PA 1H44A 5ITPA 3CG1A 2RC9A 2DQVA 1EH3A 4KD5A 2V25A 2V93A 3S2VA 2F6PA 2NWJA 1LLSA 4NWDA 5TPAA 2E0SA 1FQAA 2OK2A 4GF8A 3CR9A 3PMWA 5DTBA 1B58A 1N04A 5HM4B 3K02A 2I4CA 3K1PA 2VD3A 1ANFA 4QFLA 1QJMA 2PVUA 4OWDA 1Y3NA 4HCYA 2O7IA 5F7VA 3G3IA 5CBSA 1Y1MA 1YAEA 3IO4A 1I6QA 4HCWA 5TPAB 4I8CA 3DRHA 1TT1A 1OVBA 1FTJA 2X26A 1DPEA 1B5IA 3IR1A 3ILUB 3OD7A 3IB0A 1WODA 1FTKA 3RUMA 3OELA 2DXRA 3LSFB 4ELRA 2RINA 3H03A 1SQYA 5I84A 3H6VA 2QL3A 4G8HA 1S50A 3MBPA 2REGA 5I56B 3H6TA 3M3LA 4AB5A 4Q5TA 1B51A 5EYFA 3K01A 1LGBC 1ZJLA 1IXCA 4YKJA 1JEVA 3U8QA 4N13A 2OWSA 2WOLA 3DM0A 1MY4A 4XXUA 3UGWA 1XVXA 4LP2B 4R73A 3VLWA 3C4MA 2NXOA 2F7BA 5FHNA 5AE4A 2ZNTA 3U93A 3EHTA 4GL8A 2VGQA 5IKBA 1AOVA 4G68A 5KDTA 3HPIA 4F22A 4NF4B 4GL0A 3C9HA 3CI8A 1T0KA 4R6HA 3TPAA 4IO7A 4RXLA 4F31B 3CHGA 3MJNA 2Q8JA 4FEDA 4LA9A 1CE2A 5KZTA 5JK4A 1SI1A 3K4UA 2XXTA 1I6BA 1FTMA 3OENA 4RPOA 4WXJA 4TOZA 4ZE9A 1URGA 2ZYOA 2O84X 3UK4A 4OFJA 4F3PA 4JSDA 2GRVA 3IOWA 1MXXA 3ODBA 4OXVA 3K6XA 1SYHA 2ZYNA 1Y9UA 1FTLA 1XHYA 2XXVA 2UVJA 3CRBA 3SKPA 1RYOA 2DXYA 3TTMA 1F9BA 3O66A 4LVQA 3PUZE 1YCJA 4H0WA 1I6AA 4IO4A 5A5XA 3ZS6A 5CBRA 3D4CA 4NMYA 4F1YA 1NKXA 5JEIA 1SD3A 2HXWA 1FQFA 4JDFA 4FECA 1N3WA 1SDXA 1PBQA 1ATGA 5DT6A 4XKQA 3FV1A 3KBRA 4EDPA 3TCGA 2HAUA 1MQJA 3PPOA 3TUSA 1LB9A 2GHAA 3H7MA 4RY1A 1P1WA 4UA8A 3W15C 4ZECA 2V3QA 4G2ZA 3CFXA 3Q29A 3LSWA 1UTBA 4F1UA 2RCAA 5TP9A 1OVTA 1A54A 2F35A 3KSXA 3Q28A 3ZKLA 1SI0A 3BFTA 1LAFE 3IX1A 4Z0IA 5DVJA 2OBGA 1R9QA 4MBPA 4GQOA 4O3AA 4MFIA 4R74A 2F78A 1VFEA 2I49A 2ZMBA 2GH9A 1UTBB 3JZJA 3ZSFA 3MZBA 3O6GA 3T96B 2O1MA 3UA8A 4AB6A 4R9FA 1LBCA 3B6QA 3GLBA 1NMUA 1B32A 1UIUA 1IZ1A 4ZEKA 3LSXA 4IY5A 3KEIA 1NL5A 2O68A 2CZLA 1JW1A 5CMCA 5I59A 2OZZA 5H8FA 1NNPA 4NF5A 3KN3A 3JV9A 4X1DA 4R2FA 2NVUB 1BP5A 1O63A 3VLVA 4BDOA 2XHDA 3C33A 3T9UA 4P0IA 1HSLA 1FW0A 1US5A 3E9XA 5H8SA 1O7TA 4IO2A 4TLLB 3FUZA 2DE4A 1PB8A 5BWJA 2Y7PA 5I57B 4XKNA 2G29A 2XXXA 4G77A 2PT1A 3TDJA 3U94A 4LZ5A 3CIJA 3P7IA 1LFIA 4Z7EA 1LAXA 4JWOA 3N5LA 1MY1A 1P99A 2O69A 4RJZA 2YLNA 1XC1A 1GVCA 1AL3A 3MVYA 3MPLA 2ANJA 1QW0A 4EQ9A 1B0HA 3KN8A 4GWOA 4F29A 2F7AA 2Q89A 3FD3A 1M5FA 1MQHA 3V83A 2XX8A 3UN6A 4KFQA 3KJ7A 4XKRA 1B1XA 2DE2A 1XT8A 5H8HA 2RF1A 3G3KA 4RPNA 3SEWA 4ZZAA 4NF6B 1B7UA 2GFEA 2I6EA 1L5TA 3PD8A 1JEUA 3TCHA 2ZYMA 4BDLA 3THIA 1PB7A 1MM6A 5AA4A 2ONRA 1B5HA 3S9NC 4F3SA 4KYSA 3K6WA 3TODA 3R7XA 4KCDA 1P1OA 3RYAA 3T66A 3PUXE 4Q0CA 2QS2A 2A5TB 2ZYKA 4HW8A 4FIMA 1DPPA 3TELA 3DP6A 3U72A 4PP0A 4U1OA 3B6WA 2PBWA 4H6DA 1OQGA 1B3EA 3ILTB 5CMKA 2O1LA 5ELVA 3K00A 1IXGA 3PV0E 5B70A 2PMSA 5BUUA 2I0BA 4M4GA 3BBRA 1M5EA 3O29A 3CG3A 3N94A 2THIA 2XXHA 1PEBA 3ECRA 2ZNSA 3CSBA 2VHAA 1URDA 1XS5A 5K2XA 3K6VA 3QK6A 3G7WA 3G3GA 1B2HA 5CC2A 4ZEFA 4OVJA 2G93A 3RPWA 5LOMA 3O2AA 3FTOA 1MPBA 4NF8B 2IEEA 1OLCA 4DXBA 1N76A 1IUDA 5I56A 2O51A 4PFUA 4F2OA 5H8QB 3OEKA 5CMBA 4GIZA 4KQPA 3C35A 2ZNUA 1ZLQA 4TLMB 2XXUA 2RC7A 2UVHA 2I0CA 3FATA 3O6HA 3UP9A 4GVOA 1OQHA 1D9VA 2QMWA 3OO9A 2OJTA 3O6IA 1B4HA 2E1SA 2RC8A 4OTEA 4WKMA 1ELJA 3DRIA 5I2NB 3Q27A 4OEUA 2PYYA 2Q2CA 4JXIA 4U4XA 3QXMA 3MAMA 4X1BA 4C1UA 3K1NA 2Y7IA 3BFUA 4I62A 1KWHA 1MDP1 4R2BA 3H06B 3B7DA 3DP8A 4RK9A 4NF4A 2AYSA 2RCBA 3PMXA 1BTJA 1ZMGA 3AXFA 4YB5A 4DDDA 5I58B 2HFBA 3IB2A 5TU0A 2DYXA 4QFPA 4LQ2A 2DWAA 3IOTA 4YMBA 4GXAA 2CMOA 2O7UA 3R26A 4G8NA 2F8DA 4PQJA 4HTGA 1VSOA 4DCXA 4F1VA 1OIBA 1B7HA 2Z22A 1Q35A 1B0LA 1FTOA 3K0VA 2XXPA 5DYHA 1BIYA 3I5OA 1SW5A 2GHBA 5L9SA 5CRYA 4R9GA 3S4UA 4F19A 5AA2B 3KSJA 1EZ9A 1TFDA 1JQFA 3W9VA 1D3KA 2F97A 1MS7A 3RTFB 3EHUA 3HHGA 4THIA 1JW5A 1MPDA 5JTYB 1II5A 3UIFA 3TYHA 2ABHA 5AA2D 3V8XB 4ZEDA 4LQ5A 3QUJA 4X9TA 4BDQA 2Q9TA 4DLDA 3MZ9A 3FJGA 1GV8A 1Y3PA 3C32A 3USDA 1AH5A 3VXCA 3DRGA 5F1QA 4TQUQ 1NNTA 2DS9A 4RK2A 1FQBA 4YKPA 3GZGA 2QMXA 4GXSB 3FVKA 1ZBMA 1QKBA 3TTKA 1URSA 4EF2A 3B6TA 3JYRA 3PPPA 4C0RA 3S9EA 2B3BA 3VE1B 1MY0A 4OFLA 3SDFA 3IO6A 1SW4A 1M5CA 4QFOA 3A3CA 1FQEA 4BDNA 4GOTA 3TKDA 1NH7A 2ALUA 3FJ7A 4NWCA 2DWHA 3FV2A 1N84A 3MZ1A 4OENA 1SW1A 4PFYA 4NTLA 3WAEA 4ELOA 3FXRA 4QFNA 3O6PA 1A99A 1HSJA 3FVGA 2QS1A 5DVIA 1M5BA 1AMFA 3LSLA 2H99A 3MW0A 4F3GA 3IAZA 3M3FA 4QF9A 2BJJX 3UORA 2VP1A 2HZLA 3RLFE 2Q2AA 1MM7A 3TQLA 3KN7A 2DVCA 5KCJB 2FYIA 1LFGA 3PUYE 1XOCA 3MVWA 3FGSA 1IEJA 4LONB 5DVFA 4H1XA 3SETA 4L17A 1WVJA 3DRKA 3H3GA 2Z8EA 2NOOA 5FHMA 3A3UA 2QPQA 3OO6A 3IB1A 4PE5B 3GBAA 3H6UA 4I1DA 3FASA 4F18A 3OSRA 2B4MA 5I57A 5L8DA 3PPRA 2V3TA 2YPNA 2A5SA 3T22A 1IXIA 1QKAA 1B52A 1Y4TA 3K2DA 1B46A 4QSEA 3OOAA 2ZXTA 4BDMA 2F5XA 1Y4CA 1DTZA 1MRPA 4JSOA 2DSFA 3I3VA 2WOPA 4U21A 4PETA 1R1NA 2QRYA 1MDQA 2I58A 1H43A 3VLUA 4F2QA 3V5AA 5B7DA 4IY6A 4EQ7A 2XX9A 1Y3QA 1MXWA 4ND9A 2D5WA 1QUKA 2PT2A 4IO3A 3VVDA 1MY2A 2H4IA 1B1HA 4NF6A 3DELB 3TFLA 3EF7A 4WEPA 1Z7NE 3VDFA 1LBBA 3EN3A 1JNFA 1N7XA 4YB7A 1QUIA 1VFDA 4WEDA 2I4BA 3QUFA 4KI0E 4R72A 5ICTA 3TTRA 4OFOA 1B3GA 4EXKA 2DVZA 3HSTA 4N6PA 4IO6A 2A5TA 3D4GA 1PDAA 2ONKE 3OO8A 5AA3A 2Z8DA 2FNCA 2F36A 1LCTA 2KLFA 5ITOA 4MLQA 2Y7WA 2B4LA 2M8CA 2B3FA 3HN0A 1B05A 1EZPA 2XX7A 3FXQA 3MPKA 3H4ZA 4KYEA 4MLVA 2Z8FA 3PD9A 5IAIA 3LC8A 3LR1A 1OMPA 3T93B 2WOKA 3FJMA 5FHOA 4G68C 3RQTA 3HV1A 1M5DA 4U22A 1HSEA 4P0GA 3VVFA 2XD2A 4OESA 3EQ1A 1BLFA 1CB6A 4K3FA 4ELPA 3M8UA 5EHMA 1DMBA 2QJEA 2X7PA 3MP1A 4NF8A 5HBCA 4ECFA 4DXCA 2HEUA 4BLAA 1XVYA 4POXA 3RT6B 1MQIA 1FQDA 1B3HA 2OWTA 1A55A 4OETA 3F11A 4R6YA 5H8QA 2HZKA 1Q1KA 4FAJA 5CI5A 3RY3A 3TZAA 4PFWA 2P2AA 1VE4A 2LAOA 1DOTA 4YKIA 4OERA 1TFAA 4DCYA 3U92A 1I69A 2XXYA 2B65A 3FXUA 4YB6A 2NUVA 1IITA 1JW4A 1JVXA 2R71A 4KHZE 5I2NA 1FQCA 2Q88A 1IXHA 4G4PA 3DP4A 1EZOA 3TQWA 5DEXB 1WDNA 1ZTYA 4LZ8A 3SEUA 1H76A 1PC3A 2UVGA 3TAJA 4R75A 1DSNA 5AA1A 4EUOA 3Q25A 5I58A 4YKKA 3FVNA 3K1MA 1R6ZA 3CFLA 3IL1B 4Q30B 4OHNA 2D3IA 4IGRA 3M3KA 4XIGQ 2H98A 1MH3A 3PAMA 4Q8RA 3VXBA 1NFTA 3PUVE 4AQ4A 3RN8A 4GRKA 3LBSA 3N6UA 3SERA 3VV5A 3N6TA 1GGGA 3KG2A 1US4A 4JB7A 4BDRA 4FE8A 3BKIB 5AA2A 1GR2A 4HS7A 4IO5A 1RYXA 2H5YA 3E4RA 4QRZA 3RNNA 4KPTA 1YTVA 2V3UA 2P0SA 4FEBA 5JTYA 1SBPA 4EF1A 2P1SA 1D9YA 1QULA 2AL5A 3PPQA 1FCKA 1B9JA 1S9TA 3KOSA 3HHFA 4YAHX 3MVZA 1NNFA 3TCFA 4E0XA 4ISUA 5L9MA 4ZEBA 3MWBA 2I3WA 1Y20A 3SEXA 1O64A 1B40A 3KGCA 4O3CA 4YZZA 1USYE 4GLIA 5CMMA 2DOJA 2W7YA 1B3LA 1H45A 4JBZA 1RKMA 4OZ9A 3PPNA 2DP8A 1SVXB 3V89B 2REJA 4EQBA 2H25A 3HCQA 4U4SA 2HAVA 3QYTA 3T9XB 4R6KA 3G3JA 4H5GA 1A40A 2F7CA 3PGFA 4U23A 4G68B 1N7WA 3QAXA 3QSLA 5KDTB 4FORA 1GTKA 1LFHA 1NNKA 4RNSA 3WAFA 1P1QA 2AL4A 3OMBA 3CSGA 3CVGA 3PMVA 4ZZEA 1MQGA 1LAHE 5ISUA 2R9JA 4QHQA 4F39A 1Z7ME 4M1VA 3FVOA 4ZE8A 3VVEA 3SEYA 2Z23A 3FIRA 3KZGA 1UIVA 1NH8A 3QIMA 1SYIA 5M2VA 3C31A 3C36A 4DE8A 3IORA 2UYEA 3TEPA 1A8FA 1LSTA 2XXQA 1MPCA 1TXFA 3PU5A 4KCCA 1D4NA 1ZIUA 4ZEIA 1BKAA 2UXAA 3SEVA 4NEDA 3MP8A 3L6HA 2QSXA 1PB9A 4MH5A 1POY1 4KYDA 1A7LA 2I3VA 1B5JA 5A5XB 3S9MC 3L6GA 5KCJA 1USYH 3EPEA 1MXYA 2RKMA 5ICQA 4POWA 4MF3A 3E13X 4QSCA 1Y1ZA 4ZS9A 4H67A 1QUJA 3FZVA 3PUWE 3RTWB 4X48A 3C34A 3RYBA 4LATA 1IQ7A 4XKPA 4JWXA 3OO7A 1OLAA 5I2KA 4C1TA 1ZU0A 2O6AA 2DE3A 2Y84A 4QFKA 2X7QA 4OEVA 2HCAA 4P11A 2UYFA 1UQWA 1N3XA 3TMGA 4OQOA 3LVUA 3OEMA 5FTHA 4OMBA 4YMAA 1H3DA 1R9LA 3KFMA 2XXWA 3G3FA 5TP9B 3EHSA 1DTGA 3K6UA 2I48A 4I9DA 4E0WA 1MG1A 1P1NA 4GFRA 5I2KB 4H8JA 2FA7A 3N26A 1SW2A 1S7YA 3W9WA 4O3BA 3T9VA 2UVIA 4H8IA 4U2RA 4ELQA 4U1ZA 2H9BA 2QS4A 3O28A 3R6UA 4JWYA 1N0TA 4FJPA 3OSQA 4RA1A 1MXVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2FIXA 5J1DA 2OX3A 5L9OA 3MUQA 2XXIA 5HPQA 4MMPA 4QSDA 1A8EA 3I6VA 4P56A 3DRJA 3DLNA 4N6DA 4YICA 1MY3A 2YJPA 4GD5A 4XEQA 1VR5A 2DWJA 1J1NA 2R6GE 3PTYA 1TWYA 5I59B 1JETA 1MQDA 1ZKBA 5H8FB 4OYVA 4FATA 3IK6B 3IOVA 2VOZA 1LB8A 4NF5B 3H6WA 3A09A 2IA4A 1MXUA 3OXNA 1LCFA 3E3KA 4LZ7A 1DBZA 4MCOA 4LN5A 1NV5A 3DRFA 1EU8A 4EXLA 2AIXA 3ONMA 4NE4A 3GBBA 1DK4A 4P1EA 3IJOB 4PFTA 2D21A 3MP6A 4ONYA 3S9LC 4DZ1A 4H5FA 2OCUA 1UTHA 4H65A 2ZZWA 5H8NA 4DXUA 3MQ9A 1FPFA 4ESXA 1JVYA 1P1UA 2WKYA 4KR5A 4G8MA 3IOUA 3LUYA 2QS3A 1IIWA 3CFZA 1MXZA 3VFJA 4XTCQ 1PBPA 1UTHB 4P1LA 4IGTA 2F6GA 5H8NB 3G3HA 3FXBA 3RT8A 4F3BA 3MSTA 3TTLA 3MVXA 1MH4A 2Y7KA 3RGYA 1B6HA 1B3FA 1B4ZA 1YPNA 4PDHA 4DIGA 2Y7RA 2VD2A 3ZKKA 4LUBA 5FTIA 2HQ0A 2ONSA 5H8HB 5ET8A 3GXAA 3IJXB 2DWIA 3MC2A 5CM6A 4IB2A 2XD3A 3SESA 3O97A 2Q74A 4N07A 5EHSA 1LAGE 3TTNA 1POTA 1QVSA 3Q26A 3HO7A 1B7ZA 4DI4B 2OLBA 1IMFA 4YU0A 4ZDMA 4UACA 3T9HB 4ESWA 3KJTA 4O7MA 1AIVA 3KOTA 2PX1A 5AA4B 2ESNA 3U1OA 2XXRA 5K2YA 3KBZA 2F34A 2V84A 4RYAA 5DEXA 3O9PA 4N17A 1H44A 2Y5LA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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