2RC8A

Crystal structure of the nr3a ligand binding core complex with d-serine at 1.45 angstrom resolution
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
284
structure length
284
Chain Sequence
KLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAGQLCLDPMTNDSSMLDRLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEQLAEDMNFDFDLYIVGDGKYGAWKNGHWTGLVGDLLSGTANMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGILVRTRGTELSGIHDPKLHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQSFPEMHEYMRRYNVPATPDGVQYLKNDPEKLDAFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTSNISELISQYKSHGFMDVLHDKWY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Molecular mechanism of ligand recognition by NR3 subtype glutamate receptors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate [NMDA] receptor subunit 3A
total genus 100
structure length 284
sequence length 284
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10613 Lig_chan-Glu_bd Ligated ion channel L-glutamate- and glycine-binding site
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2rc8A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2rc8A02
3FV2A 2CMOA 4MFIA 4X1BA 3A3UA 3HO7A 2PYYA 4BDOA 1VFEA 5H8NB 4F1UA 3DP4A 4NTLA 4JWYA 4YZZA 4U2RA 4JDFA 4GFRA 2QMXA 4ELOA 3KBRA 1D9VA 3FXRA 3RUMA 1AOVA 3VLUA 3BFTA 3KOTA 4G77A 3IB2A 5KCJB 3RPWA 1PDAA 3N5LA 5TP9A 1RYOA 1MH4A 2RCBA 5CMBA 1NNTA 3H03A 2XD3A 2Z8FA 1B5IA 1TXFA 1R1NA 2FA7A 1TT1A 4OQOA 2OK2A 4LVQA 4E0WA 3C35A 5F7VA 3FD3A 2FYIA 3CFLA 4N07A 5AA2B 4KYEA 5JTYA 1FTMA 5JK4A 3KEIA 5ICQA 1LCFA 1Y9UA 4R72A 1QUIA 3G3GA 2I3VA 3HSTA 3FZVA 1IXIA 2F6GA 3R6UA 4N13A 3PPQA 1QULA 3Q27A 3VVEA 2I48A 3CRBA 4PQJA 4G68B 1GR2A 2DQVA 1UQWA 2ABHA 3PV0E 4DXUA 5EHMA 1N3XA 3VFJA 4QFPA 3SEVA 1IEJA 1MH3A 2RCAA 1P1UA 3LC8A 4H65A 3FVGA 3IL1B 1SBPA 3TZAA 3UP9A 2DYXA 4R6HA 3ZSFA 1MDP1 1H76A 1QUJA 1Y4TA 1LAHE 4ELPA 4LP2B 5EYFA 1D3KA 1I6AA 3U72A 3GBAA 2O1MA 3W9WA 2V3QA 1NKXA 4HCYA 2DWHA 1DPPA 4TLLB 3MVXA 1MQJA 4FATA 4LQ2A 3CI8A 2H25A 2VD3A 4PFUA 2HAVA 5I2KB 4IO2A 4JXIA 3MBPA 1MXUA 4F1VA 3H6UA 2V93A 1EZOA 4XKRA 2GHBA 1LFHA 2Y84A 4NWCA 4XKQA 1GVCA 2PX1A 2DE4A 1ZBMA 3T9HB 3K6XA 2Z23A 3KGCA 2P1SA 3H4ZA 4OERA 3QUFA 2ZXTA 3O6HA 3TTRA 2Z8EA 1B3FA 1OVTA 1SW4A 4RXLA 5I57B 1RYXA 3IOUA 5M2VA 1N7WA 4KHZE 3FV1A 1IXCA 4UACA 4DXCA 4UA8A 3MP8A 5I56B 3OO7A 2QRYA 3C36A 4FIMA 5JEIA 1FQFA 1TFAA 4IB2A 5FHNA 5DVJA 3H06B 5TU0A 1USYH 3I5OA 2YPNA 1URGA 3L6HA 2DWJA 5FTHA 4GXSB 5B7DA 1XT8A 2A5TA 1FTJA 3EHSA 1POTA 2H9BA 3G7WA 4NEDA 1UTHB 4U4XA 5H8FA 1MY1A 2XXWA 4C1UA 3T9XB 4MBPA 1MPDA 1B3LA 3U92A 1B1HA 1FW0A 3T9UA 1SQYA 1P1OA 2F5XA 1ZIUA 4MLVA 4QSDA 4KYDA 2I4CA 3M3FA 3HV1A 3QAXA 1NNKA 3THIA 4QRZA 2UXAA 3LBSA 5I84A 3DP8A 2F7AA 2ESNA 5DEXA 2R71A 4YKJA 5H8QA 3U94A 4NF4B 3C9HA 3PD8A 3SEXA 2Y7RA 1M5CA 1MDQA 4G2ZA 2B3BA 4F18A 1LFIA 3U93A 4GWOA 2H98A 1US5A 3SDFA 2V84A 1AL3A 4JSOA 4R9FA 2ZYMA 1IIWA 4TLMB 1MRPA 3RTFB 2ALUA 2WKYA 2W7YA 3TUSA 3K01A 3PU5A 2I3WA 3FJ7A 3MZBA 1D9YA 1B2HA 1NFTA 4QFKA 1I6QA 2X26A 2CZLA 4XTCQ 1MXXA 3CG3A 1FQCA 1USYE 2OWSA 1MQGA 5CMMA 1MY0A 1B3HA 4ZEFA 2XXYA 3AXFA 4R74A 4OFOA 3O2AA 2ONSA 1R9LA 1RKMA 1QJMA 4I9DA 2REJA 1SW1A 1AIVA 3WAFA 2VD2A 1A8EA 1XVYA 4MH5A 1PB9A 3FVNA 1Q35A 1SI1A 5I2NA 4RPOA 2QS3A 5A5XB 1FQEA 5CBSA 5DYHA 4K3FA 3QIMA 3WAEA 1ZKBA 2V25A 1II5A 3C33A 2O7UA 1PEBA 3PUWE 1LB9A 3O28A 3QK6A 2V3TA 1US4A 4ECFA 2XX7A 4U1OA 2DS9A 4U22A 2Z22A 4PFYA 4FJPA 3E4RA 3MZ1A 3S9NC 4IGTA 3N6UA 3ZKLA 3PUVE 1N7XA 2XXPA 1SYHA 3PUXE 3O6GA 3PGFA 1Y3NA 4DIGA 1MQDA 3KJ7A 4PFTA 1T0KA 3TPAA 4BLAA 3M3KA 4QFLA 4ELRA 1IQ7A 2HQ0A 1B52A 4NE4A 4WEPA 1B4ZA 5EHSA 3QXMA 4OESA 1EU8A 3O66A 4NF5B 4NF8A 4X9TA 3RGYA 3FXQA 4PFWA 1O63A 3T22A 2D5WA 5KDTB 5ELVA 4ESXA 2OBGA 2Z8DA 4OWDA 1OIBA 4R73A 2VP1A 1MM6A 4YKIA 1B3GA 2ZYKA 4AQ4A 4NMYA 3FJGA 3UA8A 4FE8A 4OETA 5K2XA 1KWHA 2XX8A 4GD5A 2V3UA 4WXJA 1URSA 2HZLA 1B6HA 3A09A 3IOTA 2QL3A 3OSQA 4IY5A 2O6AA 3K0VA 1Y3QA 3KG2A 1TWYA 1IITA 1VSOA 3KN3A 4I8CA 3SETA 4OVJA 3IR1A 3BKIB 4ZEBA 3TMGA 1NH8A 4YMBA 4C1TA 1B46A 4G4PA 4NF6A 3D4GA 5DVIA 3T96B 1OQGA 4F3SA 4R75A 3S4UA 3CFZA 1PBQA 1CB6A 3JZJA 2HZKA 5ICTA 3TCGA 2DVCA 1EH3A 1NMUA 4U1ZA 2VHAA 1BTJA 1L5TA 3C4MA 4G8MA 4BDMA 1B4HA 3RY3A 1PB8A 4EQBA 5HM4B 3H3GA 1IXGA 1H43A 2ANJA 3ZKKA 3IX1A 1M5FA 2DOJA 3N26A 2R9JA 1WDNA 3K1PA 3MJNA 4ZE9A 3IORA 4JWOA 3ILUB 3LSLA 3M3LA 3H6TA 4U21A 4ND9A 3TDJA 1IXHA 2P0SA 3UN6A 2O84X 2GH9A 3UORA 2I4BA 3EN3A 5I58B 3F11A 1ZMGA 5AA4A 4F19A 1JVYA 1OQHA 5ITPA 1B7UA 3K02A 5CC2A 1MXYA 1F9BA 1QUKA 2E1SA 2ONRA 4QFNA 3KZGA 1MY2A 4WEDA 4M4GA 4ZEDA 1N3WA 1BIYA 1UTBB 3PMWA 2F8DA 1NNPA 4IY6A 4O3BA 5K2YA 4MF3A 3LR1A 4LZ7A 5L9OA 5KCJA 3W15C 3UGWA 4F3BA 2H4IA 5H8QB 3V5AA 3CSGA 1SD3A 3U8QA 4QHQA 4GF8A 1LBBA 4GQOA 4BDNA 2F6PA 2ZMBA 1B0HA 2NXOA 1MXWA 3DM0A 1ZTYA 5LOMA 2RC7A 4RPNA 3EF7A 4EXLA 3MP6A 3S9EA 3OELA 1VFDA 4OXVA 4X48A 1QKBA 2O7IA 5AA2A 2LAOA 3OO9A 3M8UA 1Z7ME 3U1OA 1JETA 3Q26A 3KN8A 4OTEA 1Q1KA 2UYFA 1D4NA 5IAIA 4OMBA 5B70A 3SESA 3SKPA 3ILTB 5TPAB 4R6KA 4XXUA 2G93A 4G68A 4YKPA 3KFMA 1A54A 4I62A 4Z7EA 2XXHA 2ZNTA 3QYTA 3OEKA 2PT1A 5FHOA 4F31B 2NWJA 3FVKA 2F36A 1YAEA 3DP6A 1LBCA 3B6QA 3SEWA 3E3KA 2RC8A 1B9JA 3MP1A 3SEUA 3KSJA 3MPKA 5I2NB 2GHAA 4FORA 4ZS9A 1BKAA 1LB8A 3TTNA 3OD7A 3A3CA 4KFQA 3MW0A 4H67A 4GRKA 4LONB 3ZS6A 2OZZA 3T66A 2Y7KA 4RK9A 1LCTA 1OLCA 1ZU0A 3O9PA 3CVGA 2XXRA 1PB7A 5BUUA 2O68A 1LAXA 3DLNA 3PPOA 3MVWA 4ESWA 5I2KA 3GXAA 4HW8A 3FUZA 3LSXA 1M5BA 2RKMA 3PUZE 2HAUA 3OSRA 1ZJLA 5H8HA 3JV9A 3RNNA 1P1WA 4EQ7A 4QSCA 2DXRA 4KCDA 3IB1A 2I6EA 2XX9A 3RLFE 3K6WA 4Q30B 3RTWB 1LFGA 3FGSA 1B7ZA 3PMVA 3TQLA 4DDDA 5CMKA 1MQHA 4H6DA 3VVFA 4KYSA 3ODBA 2UVHA 2DP8A 4NF8B 1B51A 5I57A 4Q8RA 4DE8A 1CE2A 2B65A 3SEYA 1M5DA 1A55A 1QKAA 3CR9A 5I56A 5I59A 3HPIA 1JW4A 3QSLA 4MLQA 4EUOA 2R6GE 1XHYA 3OMBA 3MVZA 1H44A 3T9VA 4F22A 5BWJA 3LUYA 2Y7IA 3R26A 4G68C 2Q8JA 1LGBC 1QVSA 1FCKA 3QUJA 3FVOA 4ZZEA 2I49A 2Q2CA 1UTHA 4YKKA 4C0RA 3HCQA 5TP9B 2G29A 1HSEA 2I58A 3MC2A 1B5HA 1FQBA 1XC1A 1BP5A 5J1DA 4F2OA 3FIRA 1B32A 3G3FA 1XS5A 2FNCA 4KD5A 3IOVA 1OVBA 1YCJA 4EXKA 4F39A 2DWIA 1LAGE 1JW1A 1MM7A 4F1YA 2RC9A 1XOCA 4H0WA 3I6VA 4LUBA 5CM6A 5JTYB 1O64A 5AA3A 3TTLA 4P0GA 4YU0A 4GXAA 2PBWA 4IO7A 1A7LA 2ZNSA 3D4CA 5DVFA 3K2DA 1Y1MA 1FTOA 3S9MC 4RK2A 1N76A 2QS4A 1LLSA 1SYIA 2AL5A 5AA1A 2Q88A 3JYRA 3VLWA 4BDQA 4G8HA 3S2VA 3L6GA 4NF4A 4DZ1A 1LAFE 2XHDA 3O97A 3K6VA 1ATGA 3V89B 2HEUA 4N6PA 4PP0A 2F7BA 3IK6B 3RQTA 1EZ9A 4LA9A 2GFEA 3KSXA 1SW5A 1MY3A 5DT6A 5AA4B 2UVGA 4DCYA 1MY4A 4IGRA 2HXWA 1P99A 2H5YA 3TTMA 4OHNA 3TCFA 4FECA 1FTKA 3MAMA 3FJMA 1NL5A 4OFLA 1DTGA 4DCXA 5KZTA 3EHUA 2VOZA 3N6TA 3B6TA 3VXCA 2Q9TA 1BLFA 2D21A 3K1MA 2PT2A 3VV5A 3TELA 2O69A 3MWBA 4OFJA 3PPRA 3IOWA 3CSBA 3G3JA 2F34A 3VE1B 1MPCA 3K1NA 3S9LC 1B5JA 2I0CA 5FHMA 4XIGQ 3MQ9A 4THIA 1SDXA 1R6ZA 1H3DA 2UYEA 1NNFA 2YLNA 2AIXA 3C32A 3TCHA 3H6WA 4F2QA 3TFLA 1MS7A 5L9MA 5A5XA 2PVUA 4HTGA 1OLAA 4P11A 3KJTA 4ISUA 3VLVA 2I0BA 3VVDA 1JNFA 2O1LA 1MXVA 3EQ1A 3MPLA 4RYAA 4DLDA 4YB5A 4OEUA 3IJXB 4O3AA 3RN8A 1VR5A 1SW2A 1H45A 3MUQA 3LSWA 3IO6A 1YTVA 4DXBA 3O29A 4F29A 2F78A 3IJOB 4GVOA 3IB0A 4OEVA 3ECRA 3RT8A 2XXVA 1A40A 2Q89A 3K6UA 4YICA 4OENA 2RF1A 3EPEA 1EZPA 2OLBA 4OZ9A 1JEUA 1Y4CA 2A5TB 2F35A 3VXBA 1XVXA 4GOTA 3Q25A 3H6VA 4ZZAA 5H8FB 3G3IA 1P1QA 3TAJA 1M5EA 2E0SA 1MG1A 1HSJA 2ZYOA 1JQFA 2X7PA 3TKDA 2P2AA 3SERA 2NVUB 4Q0CA 4JWXA 1IUDA 1DSNA 2A5SA 4IO6A 2VGQA 4NF5A 3V83A 1Z7NE 3MVYA 4IO5A 5H8NA 5CRYA 2X7QA 5KDTA 4ZEKA 1Y3PA 4H8IA 2QS1A 4WKMA 4ELQA 4POXA 2ZNUA 3IO4A 1NH7A 4KCCA 3OEMA 5HBCA 1B40A 2D3IA 3E9XA 1JW5A 2HCAA 2HFBA 1O7TA 1ANFA 4EQ9A 3HHGA 4ZEIA 3UK4A 5DEXB 3PPNA 4GL0A 3CG1A 4U4SA 4YAHX 2XXTA 3CIJA 3O6IA 1AMFA 2H99A 4IO4A 1YPNA 5H8HB 2Q2AA 4P0IA 2REGA 3K4UA 1GTKA 4O3CA 3N94A 4RA1A 1ZLQA 4H5FA 3P7IA 2QJEA 3TEPA 3MZ9A 1WVJA 1VE4A 4H8JA 2OWTA 1DPEA 3Q28A 1B05A 3K00A 1I69A 3V8XB 4BDRA 3G3KA 3FASA 4EF1A 1IZ1A 3TTKA 3TODA 1MQIA 4FEDA 4ONYA 3Q29A 3DELB 3GZGA 4KQPA 1AH5A 5I59B 3TYHA 4Q5TA 2XXIA 3RT6B 4AB5A 3B7DA 4HS7A 2B3FA 2NOOA 4POWA 4IO3A 3USDA 5L9SA 3R7XA 2ZYNA 3B6WA 3HHFA 3EHTA 4TQUQ 2RINA 2NUVA 4FAJA 4OYVA 2Y7WA 5I58A 4JB7A 2DE3A 4YMAA 4R2BA 3VDFA 2GRVA 2DXYA 1Y1ZA 4XKNA 2QS2A 4R9GA 4U23A 4KR5A 1OMPA 2F7CA 3GLBA 4TOZA 3OO8A 4GLIA 2KLFA 3TQWA 1P1NA 1S50A 5DTBA 1FTLA 2QPQA 4NWDA 2XXXA 2F97A 1UTBA 1B58A 5FTIA 1I6BA 4G8NA 4L17A 2THIA 1DMBA 1A99A 4RJZA 4X1DA 4FEBA 3KOSA 3LSFB 2OJTA 3T93B 2UVJA 1FQAA 2DWAA 4I1DA 1UIUA 3C31A 1PC3A 1B3EA 3UIFA 2YJPA 3E13X 3OXNA 1ELJA 3IAZA 3BBRA 1JVXA 3CFXA 2AL4A 4RY1A 3OENA 5CMCA 1URDA 1UIVA 4LZ8A 1GGGA 2BJJX 4Z0IA 4RNSA 3I3VA 4QFOA 5F1QA 4YB6A 2AYSA 3G3HA 1FQDA 4PETA 5TPAA 5HPQA 1SI0A 5AA2D 1Y20A 4F3GA 1TFDA 1WODA 1DTZA 3FXUA 4GL8A 2XXQA 4KI0E 3H7MA 4BDLA 3ONMA 1MPBA 4XKPA 2QMWA 3KN7A 3W9VA 2XXUA 1N04A 3PUYE 1N84A 4M1VA 2OCUA 4EDPA 1DOTA 4YB7A 4EF2A 1QW0A 5H8SA 4LATA 1S7YA 4H5GA 4ZDMA 4AB6A 1POY1 2IEEA 4H1XA 1J1NA 1HSLA 2ONKE 5ITOA 5L8DA 5CI5A 4PE5B 4E0XA 2PMSA 1N0TA 5AE4A 1LSTA 2DVZA 1JEVA 4NF6B 4JBZA 3PMXA 4HCWA 4QF9A 4R2FA 4KPTA 3FATA 4R6YA 1B7HA 1B1XA 5IKBA 4F3PA 4ZE8A 3BFUA 1B0LA 1SVXB 2IA4A 3PD9A 3OO6A 1S9TA 2O51A 5ISUA 4JSDA 2DSFA 5CBRA 1PBPA 4LZ5A 2QSXA 4LQ5A 2UVIA 3OOAA 1A8FA 3PPPA 2XD2A 1MXZA 3C34A 4ZECA 2DE2A 1R9QA 4GIZA 2M8CA 3HN0A 2Y7PA 1GV8A 4QSEA 3GBBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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