2RC8A

Crystal structure of the nr3a ligand binding core complex with d-serine at 1.45 angstrom resolution
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
284
structure length
284
Chain Sequence
KLHLRVVTLIEHPFVFTREVDDEGLCPAGQLCLDPMTNDSSMLDRLFSSLHSSNDTVPIKFKKCCYGYCIDLLEQLAEDMNFDFDLYIVGDGKYGAWKNGHWTGLVGDLLSGTANMAVTSFSINTARSQVIDFTSPFFSTSLGILVRTRGTELSGIHDPKLHHPSQGFRFGTVRESSAEDYVRQSFPEMHEYMRRYNVPATPDGVQYLKNDPEKLDAFIMDKALLDYEVSIDADCKLLTVGKPFAIEGYGIGLPPNSPLTSNISELISQYKSHGFMDVLHDKWY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Glutamate [NMDA] receptor subunit 3A
publication title Molecular mechanism of ligand recognition by NR3 subtype glutamate receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 100
structure length 284
sequence length 284
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10613 Lig_chan-Glu_bd Ligated ion channel L-glutamate- and glycine-binding site
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2rc8A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2rc8A02
1B4ZA 3K2DA 4BDQA 4RK9A 3S9MC 5BUUA 4PP0A 3K1NA 1PB7A 5L9SA 4EXLA 3FASA 3ZKLA 1UTBA 2X7PA 2B3BA 4PFYA 4YMAA 2NUVA 1IXIA 1FQCA 4NF8A 1B46A 1BP5A 2RF1A 4FORA 1TT1A 1LB9A 2HAUA 2UVGA 3DP8A 2H4IA 4QSEA 4GD5A 2GFEA 2DXRA 2Y7KA 1PEBA 1BKAA 5CMBA 1LAFE 5CMMA 3TYHA 3SESA 1B3LA 4R6HA 4QFKA 1JVYA 3G3IA 4QF9A 5AA4A 4HCYA 3OO7A 3H6TA 1ZJLA 3CG1A 4R75A 2ONRA 3CI8A 5H8FB 1A99A 3TMGA 2Z8FA 3CSBA 1P99A 2VD2A 4WXJA 4RYAA 4ELOA 5DVFA 1XVYA 3TZAA 1N7WA 4F18A 2RINA 4R6YA 1NMUA 3IL1B 1P1NA 1I6QA 2FA7A 1B32A 5EHSA 1VFDA 4RXLA 2QS4A 4XIGQ 1MY1A 2OWTA 3PPOA 4H5FA 1N76A 1UIUA 2KLFA 4DXUA 3GBAA 4I9DA 4POXA 4YU0A 4EF2A 1Q35A 3IO6A 3IB2A 3C9HA 2F97A 4IY6A 1O7TA 5A5XA 2P0SA 3PU5A 5H8QB 2Q2CA 1Y4CA 5AA2B 1BTJA 2V93A 4NWDA 3FUZA 2R71A 4YZZA 3HSTA 4F22A 1N84A 3HHFA 4GQOA 3TQLA 2OZZA 3RLFE 5I58A 3W9WA 3BFTA 3AXFA 3TDJA 2F34A 1OVBA 4GL0A 3M3FA 4OWDA 4KFQA 2F35A 1VFEA 4F39A 3FXUA 1MM6A 1MQHA 2UVIA 3U94A 2I4BA 5JEIA 2XXVA 5ISUA 3ONMA 1D9VA 3H6WA 5FHNA 4YKIA 2AYSA 2V3TA 1SW1A 1JQFA 3KJ7A 3EHUA 3T9HB 4RPNA 3OELA 3CG3A 3RTFB 1QUKA 2F36A 1M5FA 4F3SA 3IB1A 4NF6A 4N6PA 3PPPA 3TTMA 1FTOA 3T9UA 1B4HA 2ZXTA 3O66A 3UP9A 1WDNA 1TFDA 2DQVA 1H43A 4IGTA 3VXBA 4DXCA 4DDDA 3G7WA 1P1WA 4DIGA 4OYVA 1QULA 1MQIA 1FW0A 3CFXA 1O64A 3G3JA 3T93B 4WEPA 1B2HA 1US5A 2DVCA 4QSCA 5HM4B 3A09A 1PBQA 1LAHE 3CFZA 2XXXA 1A8EA 3Q26A 4OESA 5L9MA 4ONYA 4KHZE 4IO4A 3C35A 1JW1A 1AOVA 1DSNA 2I49A 3SEYA 3KOTA 2ZNSA 3VE1B 3MP8A 4MF3A 4G8MA 2OJTA 4R73A 2O1LA 2RC9A 4QFOA 3EF7A 4KPTA 1B3HA 4YAHX 3K1PA 5I2NB 4MFIA 4FATA 4U4XA 1DTGA 1RKMA 3OSQA 3R26A 4ZS9A 3S9EA 1IZ1A 1NNPA 3H6UA 4EQ7A 1B0HA 4H6DA 2QMXA 5DEXB 4OEUA 2Q2AA 3K02A 3OEMA 5ITOA 3O2AA 4DXBA 3V8XB 1MXUA 3QXMA 4M4GA 4GRKA 5I57B 3MZ9A 1RYXA 2O6AA 3H06B 3MZBA 5CBRA 2D3IA 3M8UA 1B0LA 2VHAA 1Y9UA 4OFOA 3CIJA 2P1SA 5TU0A 1USYE 3RT6B 5B70A 2ZMBA 3S9NC 4IO5A 2O1MA 1POY1 2F5XA 4QSDA 4H67A 4E0WA 1MS7A 4LZ7A 2G29A 1URSA 4TOZA 3VVDA 1MY2A 4EQBA 4LONB 3MVXA 2DXYA 2PX1A 1XHYA 1LBCA 3EQ1A 2QS3A 1R6ZA 4F2OA 3SDFA 3VVFA 2O51A 3ILUB 1SDXA 4GXSB 4Q8RA 4H8JA 1PDAA 2Y7IA 1PB9A 2AL5A 4N13A 4EDPA 2PYYA 2V3QA 3TFLA 5L9OA 3O9PA 4ELRA 1MXYA 2H99A 2Y84A 3ILTB 3JV9A 4RNSA 1DPEA 1B7HA 4YB5A 3LSFB 1SW2A 4F3GA 1PC3A 1XOCA 3E4RA 3DP4A 1SBPA 3T22A 4ZE9A 3T9VA 2DWHA 1I6AA 4GL8A 3T9XB 3FVKA 3U1OA 5F7VA 3KFMA 3OO9A 5DTBA 3IORA 3RY3A 3GLBA 1YAEA 3RNNA 1Y3QA 2VD3A 2DSFA 4ESWA 5ELVA 4OETA 3BKIB 4Q30B 5I84A 4YICA 3C33A 2XD2A 1I6BA 5ICQA 3U92A 1LAGE 3MPKA 3OO6A 2H25A 3KSJA 1TFAA 3TELA 1NH7A 1Y3PA 3S9LC 4RA1A 5H8NB 5CMKA 4PFWA 4KYSA 3IX1A 4GFRA 5KDTB 3FXQA 3D4CA 3KN3A 3RGYA 4G77A 5AA3A 3R6UA 3FIRA 3LSLA 3UGWA 4DLDA 3U8QA 4LZ5A 4MBPA 4ISUA 2REGA 3K4UA 4G4PA 3W15C 1ZTYA 1LLSA 1MQJA 1AL3A 4U22A 2A5TA 3DM0A 2R6GE 5DVJA 4UA8A 1H45A 2BJJX 1QKAA 4O3CA 1MQGA 5I59B 3MBPA 4DE8A 4P0IA 1MH3A 4NEDA 4BLAA 1QUJA 1B5JA 5H8HB 4H1XA 4EXKA 4XKNA 4GLIA 3K6WA 2Z22A 3THIA 2FYIA 4IO7A 3OEKA 4GF8A 1AMFA 2QJEA 4P11A 1WVJA 4NE4A 2PMSA 2DE2A 2HAVA 1IXHA 5AA1A 1IUDA 1EZPA 1ANFA 3N6TA 3BBRA 2O7UA 4GXAA 1Q1KA 4HCWA 2OBGA 3TQWA 3C34A 4LATA 4JBZA 2DWJA 2PT2A 1R1NA 5EYFA 1M5DA 5I2KA 3B6TA 4TQUQ 3LSXA 3C4MA 2G93A 2ZYKA 3I3VA 3DLNA 4I62A 4PETA 1R9QA 4KD5A 4M1VA 1NH8A 3PPRA 1CE2A 2H9BA 1N0TA 3FJ7A 3E13X 1P1QA 3E9XA 1A55A 4XKQA 3Q29A 1UQWA 2Q89A 2HXWA 4P0GA 4OFJA 3G3GA 5DEXA 3S4UA 3TTLA 1VE4A 2B3FA 3FVOA 4IGRA 1Y20A 4TLMB 1SYHA 1HSEA 2GH9A 4MLQA 1FTLA 4KYEA 4NF4B 3OOAA 2NWJA 5TP9A 2XHDA 5I57A 4YKJA 3FJGA 4Z0IA 4OENA 3E3KA 4F3PA 1OVTA 4LZ8A 4U1ZA 1USYH 3KN8A 2Y7RA 2XX9A 3ZKKA 1IXCA 3K1MA 3TCGA 4U1OA 5IKBA 1Z7NE 2X26A 2XXWA 4RJZA 1H76A 3PUWE 4QFPA 1PBPA 5FTHA 4YKKA 1Y1ZA 2Z8EA 2RCBA 3A3UA 3OXNA 4R9GA 3HCQA 4KCDA 1VSOA 5JTYB 4X48A 4HS7A 4F19A 2D21A 4C1UA 5AE4A 1J1NA 1ZLQA 4O3BA 4PFUA 1QUIA 2XXHA 3GXAA 4PQJA 2FNCA 4KCCA 2DVZA 3K0VA 1B05A 3PPQA 2DE3A 4MLVA 3G3KA 1B5HA 3L6GA 1EU8A 2GRVA 4NMYA 3QSLA 3ODBA 1POTA 1MXVA 2PVUA 1N3WA 1B3FA 2ONKE 4AB6A 3SEUA 1UTHA 2VGQA 3UN6A 1B3EA 4LQ5A 1H44A 4FE8A 2YJPA 3USDA 3O29A 3WAFA 3KJTA 1NNFA 3FATA 2F78A 3PUXE 1DPPA 1BLFA 1A54A 2UXAA 4EUOA 5B7DA 4IO3A 2GHAA 5TPAB 1MH4A 3ECRA 3TTRA 2F6GA 1GVCA 2X7QA 1GGGA 1UTBB 2XX8A 3TTKA 3EHTA 1LFGA 1D4NA 3LSWA 3WAEA 4NF8B 1US4A 4G8HA 2PBWA 3DELB 3HHGA 4R2FA 2ESNA 4ELQA 2XD3A 3N26A 3D4GA 4WEDA 1EH3A 3O6HA 2UYEA 3H4ZA 2I0CA 1UIVA 3FZVA 3IJOB 2QPQA 2Z8DA 5AA4B 3MW0A 3QUJA 3VFJA 1YPNA 4KQPA 2I6EA 4ZEBA 3PGFA 2RC8A 3PUZE 5CC2A 4PFTA 4I8CA 1A8FA 1GV8A 1QVSA 2NXOA 4XKPA 2VOZA 5EHMA 1MXWA 3KZGA 1ZKBA 3GBBA 3I5OA 1PB8A 1MXXA 1QJMA 3HPIA 3B7DA 4WKMA 3FD3A 3Q27A 1ZMGA 3LR1A 5H8HA 1ELJA 3H3GA 4ZDMA 4XXUA 3O97A 1WODA 1JEUA 1MY3A 4OVJA 3A3CA 3MP6A 5JK4A 1EZ9A 3SEXA 4X1BA 4KR5A 5FHMA 4O3AA 2OLBA 2QMWA 2I3WA 1TXFA 2THIA 2Q9TA 1FQDA 2XXYA 3K6UA 5DYHA 4YMBA 4LA9A 2RCAA 2P2AA 4N07A 5H8FA 1MM7A 3EN3A 1B7ZA 4NWCA 4FJPA 5CMCA 3TUSA 4OXVA 4KI0E 4DCYA 2O7IA 4G68B 3MVYA 4Q0CA 1IITA 1FTJA 1URDA 1FCKA 4G2ZA 2V3UA 3MWBA 1SW5A 3MQ9A 1M5CA 4ECFA 4HW8A 3MVWA 2DOJA 4X9TA 3TKDA 4JSOA 3KSXA 3OD7A 1JVXA 1MY4A 4OMBA 4F3BA 1FQFA 1S7YA 4POWA 4OERA 4C0RA 4NF6B 1OQHA 4BDNA 1Y1MA 2V84A 1LBBA 4F2QA 5H8QA 4BDLA 5AA2A 1N3XA 2H98A 3OMBA 3H03A 1FQEA 3UA8A 3UORA 3JZJA 4GWOA 3RTWB 4F1VA 3JYRA 1LCTA 3CR9A 4FEBA 3MC2A 4LQ2A 3GZGA 3HV1A 4F29A 5I56B 4BDOA 1F9BA 1LCFA 3L6HA 3CVGA 5L8DA 3N6UA 4G68C 1XS5A 4JWOA 3LC8A 4OTEA 4XKRA 1N04A 4OFLA 2REJA 1L5TA 4OHNA 3FV2A 1OQGA 3RQTA 3H7MA 2Q88A 5J1DA 3RUMA 4YB6A 2I48A 2O84X 2E1SA 1SI0A 4JXIA 4R72A 4C1TA 4ESXA 2ABHA 2CMOA 4OQOA 1BIYA 4JB7A 3SETA 1N7XA 3H6VA 2A5SA 3R7XA 4GIZA 3ZS6A 3PD8A 3KGCA 2HZKA 5H8SA 2QL3A 3IK6B 2ONSA 1CB6A 1NFTA 3Q28A 1OMPA 2D5WA 4NF5B 4LP2B 2ALUA 4KYDA 5IAIA 1YTVA 3N5LA 2OK2A 1MQDA 1O63A 2W7YA 5TPAA 1P1UA 3IJXB 4DZ1A 3SKPA 3IOWA 1NKXA 2I3VA 3C36A 4MH5A 5CRYA 1B51A 1D3KA 3ZSFA 2CZLA 4RPOA 3FXRA 3T66A 4F1UA 1H3DA 3W9VA 1S9TA 2QS1A 3MVZA 2RKMA 1JW4A 1NNKA 4K3FA 3PD9A 2DE4A 2F7CA 2HZLA 3PUVE 1D9YA 3FVNA 4R6KA 2IEEA 5FTIA 2QS2A 5I2NA 3VLVA 4F31B 2HQ0A 3K6VA 1FTMA 4R2BA 3PMVA 5BWJA 4E0XA 3V5AA 4ZE8A 3SEVA 2DWIA 2Y7PA 3QAXA 2PT1A 3VDFA 4U2RA 1B9JA 3DP6A 1MY0A 1MG1A 3V89B 4L17A 3VV5A 3OO8A 4UACA 3EHSA 1LAXA 2M8CA 4GVOA 4F1YA 4ND9A 2LAOA 3OENA 4QRZA 3M3LA 2RC7A 3QYTA 3C31A 3M3KA 3K6XA 2HCAA 3LUYA 3N94A 4QFNA 5CM6A 5KCJB 1T0KA 2DWAA 3P7IA 2F8DA 3PMWA 1IXGA 4RK2A 3VLWA 1AH5A 2I4CA 4H8IA 1A40A 4ZZEA 1JW5A 3MJNA 3TCFA 2B65A 1OLAA 2YPNA 1IQ7A 1URGA 2IA4A 1LGBC 1R9LA 3FGSA 4IB2A 3IOTA 2XXPA 2HFBA 4ZEFA 1HSLA 1JEVA 1ATGA 4G68A 2DP8A 1II5A 1B1HA 3OSRA 4R74A 1B7UA 1RYOA 3IR1A 4FECA 2DYXA 1M5BA 1I69A 4THIA 3KG2A 5HBCA 2UVJA 3KN7A 1DOTA 5K2XA 4IO6A 5AA2D 1ZBMA 1NL5A 2E0SA 2XX7A 1SVXB 3Q25A 3G3FA 3TPAA 1HSJA 2A5TB 2Z23A 2ZNUA 5F1QA 1MPBA 2ZNTA 4X1DA 4Q5TA 1QW0A 3MAMA 2UYFA 1B3GA 1XVXA 1B52A 3PMXA 4EF1A 3U72A 3TTNA 3HN0A 2HEUA 2ANJA 3MPLA 1B6HA 2I0BA 2H5YA 3PPNA 4ZEIA 3QIMA 3UK4A 3VXCA 3TCHA 2OWSA 4IO2A 5H8NA 5I56A 2XXIA 1OIBA 5LOMA 3MUQA 3KBRA 3G3HA 5KDTA 4EQ9A 4R9FA 3B6WA 2F7BA 3MZ1A 3SEWA 3RN8A 1LFIA 5DVIA 4ZZAA 1SYIA 2I58A 5I2KB 4U21A 5CBSA 4AB5A 4JWXA 4I1DA 2UVHA 4JDFA 3RT8A 2ZYMA 3VVEA 1S50A 3S2VA 4G8NA 1MXZA 1NNTA 3K01A 4ELPA 2GHBA 2V25A 5HPQA 3HO7A 3TODA 4QHQA 4ZEDA 2Q8JA 1ZIUA 5I59A 1ZU0A 1GR2A 4U23A 3CFLA 1KWHA 4NF5A 1SQYA 4HTGA 3FJMA 4DCXA 3FVGA 3U93A 1XT8A 4YKPA 4ZECA 4XTCQ 3PV0E 5CI5A 1MDQA 1FQAA 5TP9B 4IY5A 3BFUA 2XXUA 1A7LA 5A5XB 3K00A 1MPDA 5KZTA 5K2YA 3IOUA 3RPWA 3MP1A 4FEDA 3IAZA 1MDP1 3O28A 1TWYA 3UIFA 4LVQA 5I58B 3V83A 2QSXA 2XXRA 4AQ4A 1B58A 1LB8A 4H0WA 1OLCA 3FV1A 1GTKA 4Z7EA 4PE5B 1B40A 3SERA 4TLLB 3TEPA 5DT6A 4FIMA 3KEIA 2O69A 1SI1A 4BDRA 1Y3NA 1JNFA 1AIVA 1MPCA 2AIXA 1DTZA 4NF4A 4BDMA 1IIWA 3C32A 1SW4A 1DMBA 1B5IA 3I6VA 1SD3A 2XXQA 1UTHB 1FQBA 1Z7ME 2R9JA 2NOOA 3IO4A 2O68A 3KOSA 3CRBA 2VP1A 5KCJA 1LFHA 1EZOA 4FAJA 4U4SA 2WKYA 2NVUB 3O6IA 3O6GA 2ZYNA 1VR5A 2AL4A 5M2VA 2F6PA 4H5GA 1M5EA 1Y4TA 3T96B 3LBSA 5FHOA 3IB0A 3IOVA 5JTYA 5ITPA 4NTLA 3CSGA 2YLNA 4ZEKA 1QKBA 4JWYA 4JSDA 4QFLA 1XC1A 3PUYE 3QUFA 1MRPA 4RY1A 3TAJA 3QK6A 4OEVA 2F7AA 1P1OA 2DS9A 4LUBA 2ZYOA 3EPEA 1IEJA 4OZ9A 2XXTA 1YCJA 1JETA 5ICTA 1LSTA 2OCUA 1FTKA 4YB7A 3F11A 3VLUA 1B1XA 2QRYA 3B6QA 4GOTA 4H65A 2Y7WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1B4ZA 3K2DA 4BDQA 4RK9A 3S9MC 5BUUA 4PP0A 3K1NA 1PB7A 5L9SA 4EXLA 3FASA 3ZKLA 1UTBA 2X7PA 2B3BA 4PFYA 4YMAA 2NUVA 1IXIA 1FQCA 4NF8A 1B46A 1BP5A 1K9ZA 2RF1A 4FORA 1TT1A 1LB9A 2HAUA 2UVGA 1YYZA 3DP8A 2H4IA 4QSEA 4GD5A 2GFEA 2DXRA 2Y7KA 4PFBA 1PEBA 4NQ8A 1BKAA 5CMBA 1LAFE 4PAFA 5CMMA 3TYHA 3SESA 1B3LA 4R6HA 4QFKA 1JVYA 3G3IA 4I3EA 4O7IA 4QF9A 5AA4A 4HCYA 3OO7A 3H6TA 1ZJLA 3CG1A 4R75A 2ONRA 3CI8A 5H8FB 1A99A 3TMGA 2Z8FA 3CSBA 1P99A 2VD2A 4WXJA 4RYAA 4ELOA 5DVFA 1XVYA 1FPFA 3TZAA 1N7WA 4F18A 2RINA 4R6YA 1NMUA 3IL1B 1P1NA 1I6QA 2FA7A 1B32A 5EHSA 1VFDA 4RXLA 2QS4A 2B4LA 4XIGQ 1MY1A 2OWTA 3PPOA 4OANA 4H5FA 1N76A 1UIUA 2KLFA 4DXUA 3GBAA 4I9DA 4POXA 4YU0A 4EF2A 1Q35A 3IO6A 1RDYA 3IB2A 3C9HA 2F97A 4IY6A 5EQAA 1O7TA 1NUWA 5A5XA 2P0SA 3PU5A 5H8QB 2Q2CA 1Y4CA 5AA2B 4PTKA 1BTJA 2V93A 4NWDA 3FUZA 2R71A 4YZZA 4GX3A 4P47A 3HSTA 4F22A 1N84A 3HHFA 4GQOA 3TQLA 2OZZA 3RLFE 5I58A 3W9WA 3BFTA 3AXFA 3TDJA 2F34A 1OVBA 4GL0A 3M3FA 3MSTA 4MIJA 4OWDA 4KFQA 2F35A 1VFEA 4F39A 1FBGA 3FXUA 3BIGA 1MM6A 3E79A 1MQHA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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