3VVEA

Crystal structure of ttc0807 complexed with lysine
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
241
structure length
241
Chain Sequence
GGSEFQVRSFEEIKRSGEIRIGTEGAFPPFNYFDERNQLTGFEVDLGNAIAERLGLKPRWIAQSFDTLLIQLNQGRFDFVIASHGITEERARAVDFTNPHYCTGGVIVSRKGGPRTAKDLQGKVVGVQVGTTYMEAAQKIPGIKEVRTYQRDPDALQDLLAGRIDTWITDRFVAKEAIKERKLENTLQVGELVFQERVAMAVAKGNKSLLDALNRALAELMQDGTYARISQKWFGEDVRCK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Thermus thermophilus
publication title Two ATP-Binding Cassette Transporters Involved in (S)-2-Aminoethyl-Cysteine Uptake in Thermus thermophilus
pubmed doi rcsb
molecule keywords Amino acid ABC transporter, binding protein
total genus 88
structure length 241
sequence length 241
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3vveA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3vveA02
2ESNA 1JNFA 1WODA 3BKIB 1Y3NA 1ZKBA 4R2FA 1Y20A 3VVDA 5CC2A 1PC3A 4PE5B 4ZEDA 2Y84A 3EHTA 1US5A 3UGWA 4F2QA 4QRZA 3FUZA 4IO6A 1JETA 1EH3A 2XXRA 4QF9A 3KBRA 4OVJA 1N7XA 4NTLA 5ITPA 4QFOA 4PETA 1SVXB 5CMCA 4U22A 4DCYA 3OO6A 2QMWA 4NF6B 3RT6B 4ONYA 2F34A 3O9PA 5CBRA 5DT6A 4EUOA 2OBGA 4KR5A 3KJTA 4XKPA 1B0HA 5DYHA 1B52A 1Y9UA 1SI0A 2V3QA 5K2XA 1H44A 2QMXA 2Q8JA 3C34A 4RA1A 1PB9A 4FEDA 3OENA 2RC8A 4HS7A 1OIBA 5LOMA 2OLBA 2R6GE 5AE4A 1A8EA 4I8CA 2YPNA 4F39A 2Y7IA 4GWOA 2QL3A 2V3UA 5CI5A 1JW5A 2I0BA 1P1NA 2HCAA 3T9VA 4QSDA 5EHSA 1VFDA 1MG1A 1DTGA 4Q0CA 3C9HA 4JXIA 3SESA 4R9GA 3UK4A 3TCFA 2ZMBA 3USDA 2B3FA 4M1VA 1QUKA 2QS4A 1UTHA 1UIVA 1SBPA 2XX7A 4ZEIA 3EPEA 5H8NA 1B40A 1LAFE 4GVOA 1MY1A 3IB0A 2I0CA 2V93A 2I49A 4IO3A 4H5GA 3C4MA 3DELB 3MVWA 4R74A 4G68B 1B0LA 1MPBA 3IK6B 1JW4A 3C33A 1N04A 1BTJA 3WAEA 5B70A 3TAJA 2DE4A 4POWA 5M2VA 1SD3A 1OQGA 2NXOA 4LUBA 1PEBA 4BDRA 4XTCQ 3PPQA 3MJNA 3PPRA 3G3HA 2XXPA 1NNKA 3RNNA 2RCAA 1NFTA 5H8NB 2X7PA 4YICA 2HZLA 1MXXA 3CFXA 3MUQA 3GLBA 4LZ5A 3E3KA 2XD2A 4OMBA 1DSNA 5TP9A 4YMBA 3PMWA 3Q28A 5IKBA 4EQ7A 5KCJA 1Y1ZA 4NWDA 3TDJA 1AMFA 5H8QB 3S9MC 3EF7A 4U1OA 4PFUA 4RK9A 3E9XA 4KCCA 2I4BA 5A5XA 4ZEKA 3CRBA 2G29A 3OO9A 3PUZE 2UYFA 3K6WA 1AL3A 4G2ZA 3PU5A 1OQHA 4IO4A 3TTLA 4O3AA 1P1QA 3HV1A 2XX9A 3TMGA 1LB8A 2P1SA 3T66A 1CE2A 3B7DA 2AIXA 1Y1MA 1IZ1A 5DEXA 2ZYMA 5H8SA 2D5WA 4OFLA 1PBPA 3MAMA 3S4UA 3W9VA 3PUXE 3FD3A 1A54A 4R9FA 5I2KB 2OCUA 3UP9A 1LLSA 3I6VA 3FXRA 3RQTA 2Z8EA 3K01A 2PT1A 3FXQA 2P2AA 2O1MA 2GRVA 1AOVA 3K2DA 4WKMA 4OERA 1SQYA 1N76A 1XOCA 3LBSA 5L9SA 1I6AA 3KN7A 2O69A 4YB5A 4O3BA 4R6HA 3A3UA 1LFIA 4FECA 3PMXA 3ZSFA 2UVIA 1USYH 1JVXA 5ITOA 3FIRA 1MXVA 4DCXA 1B6HA 3P7IA 4JWYA 4C0RA 3W9WA 2A5TB 2I6EA 3GBBA 4DZ1A 4FE8A 3G3JA 3IL1B 1USYE 1HSJA 3MZBA 1PB7A 1PBQA 4PFTA 4TQUQ 1D3KA 1SW5A 1POY1 3DP6A 3MP8A 2BJJX 5TPAA 3RTFB 3FVOA 2B65A 2DS9A 1WVJA 1QKBA 1I69A 4KCDA 4KYEA 2F78A 1S50A 3PPNA 1JW1A 4PQJA 4DXCA 3RLFE 1NNFA 4HCYA 2IEEA 3S9NC 4OHNA 2RC9A 3R6UA 4NE4A 3PD8A 3O66A 1R9LA 4R73A 5DVIA 2V25A 3T93B 1B9JA 3O2AA 4AB6A 4GL0A 4ZEBA 4H67A 4OYVA 4U23A 5I57B 1S7YA 3M3FA 3E13X 2M8CA 4JBZA 3K4UA 1POTA 2HXWA 1FQEA 1FTKA 4F1UA 1AIVA 2ZNTA 1YTVA 2I48A 2QSXA 4ZZEA 5I59A 4KFQA 5L9OA 2P0SA 3M3KA 2ANJA 3QSLA 3JZJA 1II5A 2UVGA 4U4SA 1H45A 1I6QA 5AA3A 1GR2A 3K1NA 3VDFA 3BBRA 3OEKA 4NF5A 1NMUA 3U94A 4OFJA 3IB1A 4ELPA 4GQOA 2R9JA 3OSRA 4POXA 1NKXA 2XX8A 4Q5TA 4RK2A 3ZKKA 2DWJA 5KDTA 4ESWA 1TWYA 4NF4A 4DLDA 3LSXA 3SEYA 2DXRA 2OJTA 2ZYOA 3FXUA 4C1TA 1GVCA 3FJ7A 3MP6A 1IIWA 4KI0E 3THIA 2XXXA 4Z7EA 1P1OA 3FVNA 1MRPA 3Q25A 4QFKA 3HPIA 1L5TA 3OELA 2XXTA 1SI1A 3VV5A 3H6TA 4F3PA 4GF8A 1MM7A 1MY0A 4IO2A 3MZ1A 1O64A 2QPQA 4LZ8A 3M8UA 3FV2A 4ZECA 5ISUA 3T9UA 1GTKA 5FHMA 5I56B 3DLNA 2B3BA 1B58A 1MDP1 3K00A 4AB5A 4Q8RA 1BP5A 2RKMA 3T9XB 2Y7PA 2KLFA 4ELOA 1OVTA 3IJOB 4OETA 1LSTA 3VXCA 2REJA 1IQ7A 3U8QA 1MXUA 1OMPA 3KN3A 1OVBA 3LSLA 3RT8A 2D21A 2HZKA 1N84A 1MS7A 4LZ7A 1IEJA 4YZZA 3FV1A 3PPPA 3RY3A 3T22A 2THIA 1UQWA 3OD7A 4OWDA 2Q9TA 4YMAA 5JEIA 5H8FB 3SERA 1R6ZA 4ESXA 4PP0A 1N0TA 3TEPA 2O68A 3VLWA 2AL4A 4OTEA 4U4XA 4ZDMA 4WXJA 1IXIA 1ZU0A 2H4IA 4RPNA 5HBCA 4F1YA 2H99A 3GBAA 3ILUB 5CBSA 1Y4CA 1IXCA 4F22A 1J1NA 4XIGQ 5I84A 1DOTA 2F7AA 5DVFA 2HQ0A 3HN0A 3RGYA 1MY3A 1EZ9A 2VD3A 5ELVA 3OO8A 3DP4A 1JQFA 4FIMA 1Z7ME 1BIYA 4EF2A 3V83A 4IY5A 5FHOA 4F3GA 1R1NA 5BUUA 4E0XA 1SYHA 4IO5A 1B46A 1ATGA 4THIA 2I3VA 2Z8DA 4LA9A 3U72A 2AL5A 4DE8A 4XKNA 4R6YA 1SW1A 3AXFA 3SETA 3FVKA 3MZ9A 1B3LA 4BDOA 3QXMA 3H06B 5J1DA 1SW4A 1Y3PA 2OWTA 2RF1A 3UIFA 4P0GA 3TODA 1A7LA 4G8HA 4ECFA 3LSFB 1D9YA 4F1VA 1ZIUA 4KQPA 3V5AA 3CSGA 3OO7A 1UTHB 4EF1A 3IOWA 1NH8A 3H6WA 4H8JA 1LAHE 3IR1A 1HSEA 3IJXB 1B51A 4M4GA 1IITA 4ISUA 4XKRA 1ANFA 3ECRA 3H4ZA 1A55A 1FCKA 4Q30B 4F3BA 3U1OA 2HFBA 2HAUA 5I58A 4H6DA 1O7TA 1MQDA 4ELQA 2WKYA 2DSFA 2VOZA 3CVGA 4EDPA 3G3KA 5ICTA 3Q29A 4KD5A 1VE4A 2HEUA 5F7VA 5L8DA 5F1QA 1ZJLA 2ZYNA 3VLVA 3GZGA 5H8FA 3QK6A 1BKAA 1FTLA 3TTMA 3CFZA 2O1LA 3TQLA 5I2NA 2NUVA 2UVHA 1VFEA 2FYIA 3K6XA 4KYDA 3V89B 4PFWA 3G7WA 4R2BA 3SEWA 4P11A 2I3WA 2VP1A 3TTRA 3TUSA 1EZPA 1LBCA 1FQFA 3V8XB 5TP9B 4G4PA 4ND9A 4EXLA 1B3EA 2O6AA 3TELA 5KCJB 1FQAA 5AA4A 1Q1KA 1ZTYA 4YKKA 3LUYA 5A5XB 1UTBA 1FQDA 2H9BA 1MDQA 3MQ9A 2NOOA 2VHAA 4LQ5A 1Y3QA 1MQJA 1Y4TA 4NF8A 1MY2A 2F36A 3PPOA 2H98A 3H6VA 5DEXB 4YB6A 1ZMGA 3H6UA 3O29A 2NWJA 1JVYA 2F7CA 3KSJA 4G8MA 3HO7A 3KOSA 2XXYA 3FATA 2O51A 3Q26A 2I58A 5JTYA 2X7QA 4XXUA 4GL8A 4DXUA 1KWHA 1LFHA 4RJZA 3O6IA 1N3XA 2G93A 3KFMA 2OZZA 5KZTA 1F9BA 2Z22A 4H1XA 1QUJA 1YAEA 1URGA 1LB9A 2HAVA 1SYIA 4YKPA 2Q89A 2Z23A 3RPWA 1MM6A 2ONSA 2GH9A 1YPNA 2Q2AA 4GXSB 1ZBMA 3ZKLA 4TOZA 5H8HA 4NF8B 4I62A 3RTWB 3T96B 3TFLA 3PUWE 1URDA 4DDDA 3MBPA 5DTBA 2O7IA 4BDNA 4DXBA 3A3CA 4ZE9A 1LFGA 2XD3A 4L17A 5TPAB 3BFTA 3VFJA 1B05A 1LAGE 4AQ4A 3S2VA 1TFAA 1MPDA 1FTOA 4X48A 2AYSA 2F6PA 5AA2A 4MF3A 2YLNA 1D9VA 1A8FA 1B5HA 4GFRA 5HM4B 3K1MA 3B6TA 4JSDA 4O3CA 1YCJA 3W15C 3F11A 2NVUB 2GHAA 4JWOA 3MW0A 3CIJA 3N26A 4QFPA 4C1UA 1DPPA 2ABHA 2XXWA 4H8IA 4KPTA 4BDLA 4OEVA 4JSOA 1N3WA 5I59B 4GOTA 4NF6A 2DWIA 3U92A 3TQWA 3FJGA 2VGQA 3L6HA 5CM6A 3OEMA 1M5FA 4HTGA 4K3FA 3MC2A 4H65A 4HCWA 4YKJA 1I6BA 3H7MA 2Y7WA 2X26A 1UIUA 3OOAA 3M3LA 3MWBA 2ONRA 4NMYA 4NF5B 1QVSA 3D4CA 1LBBA 3MPLA 4BLAA 4HW8A 3KGCA 3FVGA 3IORA 3MVZA 1FQBA 1LCTA 4GIZA 4WEDA 5KDTB 5TU0A 3IOVA 4NF4B 5ICQA 2UXAA 4N6PA 4RYAA 4GD5A 5JK4A 3N6TA 1US4A 3PGFA 1MPCA 3LR1A 3S9EA 1Q35A 4IY6A 4RY1A 4MLQA 4QFNA 1B7HA 2XHDA 2E1SA 4PFYA 2PX1A 5CMBA 1MQHA 4JDFA 3HHGA 1M5EA 3LC8A 3K1PA 1XC1A 3QUJA 2DOJA 2E0SA 1PB8A 4FORA 3KG2A 5AA1A 1RYOA 1HSLA 2OK2A 4EQBA 1TFDA 2DWHA 3FASA 4OXVA 4RXLA 2XXUA 3TKDA 4EQ9A 2PVUA 2OWSA 3RN8A 3PUYE 5FTHA 4BDQA 4BDMA 4G68A 1M5CA 5AA2D 4F18A 5FTIA 5EHMA 3HHFA 5CRYA 1IUDA 1M5DA 1DTZA 1IXGA 5FHNA 5B7DA 3IX1A 1XS5A 3CI8A 4FAJA 3KJ7A 1LAXA 1NNTA 1WDNA 2CMOA 2CZLA 2ONKE 1B1HA 2D3IA 2Z8FA 3TCHA 4F3SA 3PD9A 1MXZA 2V3TA 3Q27A 3H3GA 1S9TA 2O7UA 4I1DA 1TT1A 3G3FA 4LQ2A 5DVJA 3QAXA 3EHSA 2F5XA 3JYRA 4X9TA 1OLCA 3ILTB 3C35A 4R72A 1P99A 4IB2A 5CMMA 2DXYA 3O97A 1QW0A 4LONB 2F97A 3QIMA 3K6UA 1BLFA 3R26A 3CFLA 3ONMA 3K0VA 3TYHA 2ZXTA 2DVCA 5H8QA 2XXHA 3KSXA 2Y7RA 4QHQA 1SW2A 3MVXA 4U1ZA 3KN8A 3FGSA 3IAZA 3EN3A 2I4CA 4U2RA 3CG3A 1SDXA 2ZNSA 3UORA 1MXYA 3UN6A 4QSCA 1MQIA 1JEUA 4ZZAA 1MH3A 5IAIA 4NEDA 4F19A 1QULA 3I3VA 1B7UA 2RINA 1B5JA 4UACA 2O84X 3D4GA 1URSA 3KZGA 1B4HA 1A99A 3HSTA 3IOTA 1VSOA 1JEVA 4IO7A 3JV9A 2REGA 3MVYA 3IOUA 2QRYA 3SDFA 2PMSA 4TLLB 1MXWA 4P0IA 3IO6A 3CR9A 5I2KA 4F31B 4R6KA 3DP8A 4G68C 3H03A 2GFEA 3BFUA 4XKQA 3QUFA 4YB7A 2DYXA 2DVZA 4E0WA 4ZS9A 2UVJA 4RPOA 4OFOA 1LGBC 4EXKA 4U21A 1B3GA 1O63A 3CSBA 3S9LC 4QSEA 4F2OA 1EU8A 1TXFA 4RNSA 2V84A 1DMBA 4TLMB 1IXHA 4KYSA 4F29A 2GHBA 2QJEA 2PBWA 2A5TA 3G3IA 2DE2A 4H0WA 2F35A 4X1DA 3TTNA 2RC7A 4YU0A 3O6GA 3SEXA 3K02A 1QKAA 5EYFA 3OSQA 1FQCA 5I58B 2Q2CA 1A40A 3UA8A 2FA7A 4OEUA 3R7XA 3N5LA 1VR5A 4FJPA 2DQVA 2QS1A 1B1XA 4G8NA 2RCBA 1B4ZA 5L9MA 3PV0E 4Z0IA 4LVQA 4FATA 4IGTA 1FW0A 3CG1A 3C32A 4ZEFA 3TZAA 1B3HA 1R9QA 1B5IA 3B6QA 4UA8A 4OENA 2DP8A 3EQ1A 1XHYA 3B6WA 5I2NB 1DPEA 4MBPA 4I9DA 5I57A 4N13A 3L6GA 3A09A 5CMKA 1H3DA 3N94A 4YKIA 3FJMA 1QUIA 1PDAA 1B3FA 3TCGA 5AA4B 4FEBA 1FTMA 2VD2A 4NWCA 4N07A 4OQOA 1UTBB 3OXNA 2R71A 4GLIA 2LAOA 3KOTA 2H5YA 1MY4A 1LCFA 3VVEA 1ZLQA 2QS3A 1H76A 1NNPA 3MP1A 3TPAA 2W7YA 4G77A 2ZNUA 2XXQA 1T0KA 4QFLA 3IO4A 1B32A 2Q88A 3KEIA 3OMBA 1D4NA 1FTJA 3N6UA 1MQGA 3IB2A 1N7WA 4GXAA 1QJMA 3DM0A 3ZS6A 1EZOA 4MLVA 4LATA 3HCQA 3GXAA 4KHZE 4OZ9A 5JTYB 3O6HA 1CB6A 2XXIA 2DWAA 3SEVA 1M5BA 2IA4A 3E4RA 5HPQA 3T9HB 3TTKA 2PYYA 2Y7KA 4MFIA 4JWXA 5BWJA 4IGRA 1Z7NE 1AH5A 4H5FA 4JB7A 2XXVA 5K2YA 1GV8A 3SEUA 1MH4A 3VVFA 4DIGA 2F6GA 3O28A 3G3GA 5H8HB 1B7ZA 1NL5A 2F8DA 1XVYA 5I56A 4X1BA 4LP2B 2ZYKA 1NH7A 3RUMA 1XVXA 2UYEA 3C31A 1RKMA 3VXBA 4OESA 3MPKA 1P1UA 3EHUA 3VE1B 3PUVE 3PMVA 1P1WA 1ELJA 3VLUA 2DE3A 1OLAA 3U93A 1GGGA 2PT2A 4MH5A 1B2HA 3I5OA 4ELRA 4ZE8A 4GRKA 2FNCA 2F7BA 2YJPA 2A5SA 1RYXA 3LSWA 3C36A 5AA2B 4R75A 3SKPA 3FZVA 4WEPA 2H25A 3K6VA 3QYTA 2ALUA 4YAHX 3ODBA 1XT8A 1H43A 2QS2A 3WAFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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