3VVEA

Crystal structure of ttc0807 complexed with lysine
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
241
structure length
241
Chain Sequence
GGSEFQVRSFEEIKRSGEIRIGTEGAFPPFNYFDERNQLTGFEVDLGNAIAERLGLKPRWIAQSFDTLLIQLNQGRFDFVIASHGITEERARAVDFTNPHYCTGGVIVSRKGGPRTAKDLQGKVVGVQVGTTYMEAAQKIPGIKEVRTYQRDPDALQDLLAGRIDTWITDRFVAKEAIKERKLENTLQVGELVFQERVAMAVAKGNKSLLDALNRALAELMQDGTYARISQKWFGEDVRCK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Amino acid ABC transporter, binding protein
publication title Two ATP-Binding Cassette Transporters Involved in (S)-2-Aminoethyl-Cysteine Uptake in Thermus thermophilus
pubmed doi rcsb
source organism Thermus thermophilus
molecule tags Transport protein
total genus 88
structure length 241
sequence length 241
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3vveA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3vveA02
1JW1A 4G68C 4YU0A 4UACA 3O28A 4DZ1A 1FQEA 5AA2A 1YCJA 4KYDA 4NF6B 5ITPA 2OWSA 1SD3A 1FTLA 1MXUA 1NMUA 1EZPA 3DP4A 2RCBA 2WKYA 2UXAA 4FJPA 5TPAB 4DDDA 4NWDA 4KCDA 1I69A 2I49A 3DLNA 5IAIA 2I4BA 3C34A 1BLFA 3IOTA 2OZZA 4GL8A 5F1QA 4IO3A 4GD5A 2HFBA 1XVYA 4EXLA 5EHSA 3TCHA 1GTKA 1ZTYA 4X9TA 1AOVA 2XD2A 2H4IA 4RK2A 1FW0A 2NOOA 4MLQA 5I59B 4GXAA 4M1VA 3ONMA 4G8NA 2NUVA 3MVWA 1NFTA 2B3BA 2GHBA 1IXCA 1IITA 2VP1A 4FATA 5DEXA 3TYHA 2VD3A 4C1UA 4RJZA 4OYVA 4FE8A 1MPCA 5H8FB 4QFKA 3TUSA 2XXRA 3VFJA 3ILTB 1I6QA 2F8DA 3FASA 1YAEA 4YKIA 4E0XA 3K6WA 2P1SA 3K6UA 4PFWA 2DWJA 3G3GA 1QUIA 5DVFA 3S9NC 5AA3A 4EQBA 2ZNUA 2Z23A 5KCJB 4HCYA 5I57B 4GQOA 5AA4B 2REGA 2ZNSA 4LA9A 1URSA 2RC8A 3TQWA 1AL3A 2Y7WA 1ZLQA 4Z0IA 2HEUA 1SI1A 3P7IA 3MZ9A 3R7XA 4FORA 3CG3A 2XXVA 3PV0E 3T93B 4XXUA 1R9QA 1LB8A 4ESWA 4R75A 5TP9B 4PFUA 2RF1A 3LC8A 2I58A 4LVQA 1EZOA 3VVFA 3N26A 1Q35A 1USYE 3RT6B 3FVKA 4XKQA 1R6ZA 5I56B 3LSWA 3ZKKA 1N76A 3HPIA 2DVZA 3MQ9A 1P1OA 1OVTA 3G3IA 3IX1A 3FXQA 2Y7PA 2V84A 1MH4A 4IGTA 3QUFA 1IIWA 1LLSA 1Q1KA 3L6HA 1B3FA 1A8FA 1FQCA 3FXUA 2I6EA 3IAZA 3W9WA 4QF9A 4QSEA 1II5A 4ZEKA 2LAOA 1A40A 3MWBA 3EN3A 3TPAA 3G3JA 4P0IA 3OEMA 3SDFA 2R6GE 4RNSA 4OQOA 3Q29A 3PUWE 4F3BA 3KZGA 2XXYA 3PD8A 3TTRA 1TFDA 5H8HB 2O69A 4EF1A 1R9LA 3FIRA 2ZYOA 5HPQA 4NF6A 4I62A 2F35A 3A09A 3D4GA 1OQHA 4KFQA 4OEUA 4F3GA 2XHDA 3MPLA 2VOZA 3RTFB 4X48A 2UYEA 3ODBA 5AE4A 1ZJLA 1SW2A 4G8HA 1MQDA 1B32A 1P1QA 3ILUB 4NF8B 1Y3NA 4H65A 2PMSA 5TU0A 3DP6A 3TFLA 3S2VA 3IOVA 1SI0A 4G8MA 3CR9A 4GWOA 3CIJA 1MXWA 2ESNA 3TTMA 3SEUA 3MP8A 4LATA 2ABHA 3H06B 1Y4TA 1NH7A 3C9HA 3HV1A 5I59A 1ZU0A 3PPPA 4Q8RA 2H98A 4OVJA 1N0TA 3SEWA 3K2DA 4F1UA 1MDP1 3MZBA 1LCTA 5K2XA 3H6UA 4ZS9A 2QS4A 1IXIA 4JDFA 2QJEA 2F34A 1EZ9A 4GVOA 5H8FA 2GH9A 2DS9A 3UP9A 3T22A 4F1YA 3H3GA 1DMBA 1SW1A 3Q28A 2OWTA 1QJMA 3RGYA 3OO8A 5H8NB 1B58A 1FTJA 4GIZA 3EF7A 2V25A 3HHGA 4ELPA 5FTIA 1B3LA 5KCJA 3OD7A 4JB7A 4MF3A 2F36A 5I57A 1P1WA 3B7DA 4MLVA 3VVDA 4HCWA 5AA4A 2O7IA 4PQJA 4DXBA 2O1LA 4DXUA 1D3KA 3RUMA 3K01A 3MP1A 3ZKLA 4JWOA 2Q2AA 5DYHA 2XXQA 5H8SA 5CMBA 1XS5A 5M2VA 3IOUA 1H45A 3FATA 4I1DA 3VE1B 3M3KA 3LUYA 5TP9A 1VSOA 2CZLA 5CBSA 2R71A 2RC7A 4O3AA 3O2AA 2OCUA 4QFLA 3THIA 3U1OA 1JVYA 5I56A 5KDTB 5KZTA 5DVJA 1MXZA 1B51A 4X1DA 4YICA 4R73A 1M5BA 2HQ0A 3RT8A 4ELRA 3QYTA 3N5LA 4QRZA 3K4UA 3D4CA 2Y7KA 4QHQA 2I0CA 1PBPA 4N6PA 4XKPA 3JV9A 1MM6A 1NNFA 2PYYA 2A5SA 1ANFA 3H4ZA 3LSFB 1SW5A 4O3CA 1N7WA 3MVZA 4KYSA 3GXAA 3V83A 1XHYA 4N07A 3TAJA 1M5FA 1FCKA 1Y3PA 3A3UA 1LAGE 3H6WA 1AIVA 3Q26A 5BWJA 4AB5A 4RA1A 3RTWB 3V5AA 1AMFA 3LSXA 5H8HA 5ICQA 5CMMA 1JEUA 2Q9TA 3EQ1A 3CVGA 3U8QA 5DT6A 5ICTA 3K00A 5EYFA 3K1NA 3C4MA 3OXNA 4WEDA 5JTYA 1RYOA 4NF8A 1O64A 2UVIA 3N6UA 4LP2B 3M3LA 3O66A 3TMGA 3TTLA 1QUJA 2UVGA 3FJ7A 3MPKA 4H5GA 2VHAA 3MC2A 4NE4A 4ISUA 2ZYNA 1MQHA 3PMXA 4F1VA 4Q5TA 5CBRA 2D5WA 2V3QA 1QUKA 4U22A 1B0HA 4YKJA 5DTBA 1MM7A 4L17A 3V89B 2Q2CA 1S9TA 2E0SA 2FNCA 4YKKA 1HSEA 3C36A 4KHZE 3TELA 1URDA 2D21A 1A55A 4PE5B 4ZZAA 4GF8A 3G7WA 5L8DA 2XXWA 3SEVA 3RPWA 5H8NA 4F19A 3UIFA 1IZ1A 2ZXTA 4OFJA 1YPNA 4DLDA 1USYH 4OWDA 1PB8A 2B65A 1TT1A 2GRVA 2UVJA 3CSBA 3K1MA 4ZE9A 2YPNA 2DE3A 2QS1A 3RLFE 4XTCQ 4KPTA 4FIMA 4DCYA 1OIBA 1MRPA 3IB1A 4LQ5A 4I8CA 1UIUA 4YMAA 4JSDA 4KYEA 4IO7A 3KJTA 2P0SA 1MXVA 2B3FA 3O9PA 1US4A 1H76A 1CB6A 4F2OA 3MVYA 2I3WA 1PDAA 4F18A 3FVGA 3IORA 3U94A 4R9GA 2I4CA 2Z8EA 4TQUQ 3FXRA 1WVJA 4OEVA 2XX8A 3BKIB 3FUZA 5EHMA 1IEJA 5I2NA 1IXHA 4U4XA 3E3KA 5KDTA 3TTNA 3EHUA 1WODA 1B40A 1NKXA 3KBRA 3UORA 4GLIA 1LCFA 1LAFE 5JEIA 4DE8A 5ELVA 2DE4A 3K6VA 2Y7IA 2GFEA 3U93A 3PUVE 5LOMA 4G4PA 5FHMA 2X26A 1LB9A 1LFIA 1QULA 1A8EA 4ONYA 1MY3A 3S4UA 3GLBA 3UK4A 1OLAA 3E9XA 1US5A 2QRYA 3FJGA 3RNNA 5L9OA 4ZEDA 4DCXA 4THIA 3I6VA 5DVIA 4IGRA 4OENA 4G77A 2CMOA 2HAVA 2DWHA 2F7BA 1UTHB 4FAJA 3M8UA 4LZ7A 5H8QA 2XXXA 3VXCA 4R72A 1B3HA 3PUZE 4ZEFA 2QMXA 1DOTA 4ECFA 3CFZA 4R6KA 1A7LA 5I58B 2ONRA 4X1BA 4IY5A 4MBPA 2O84X 3FJMA 3GZGA 1N04A 3TEPA 1PBQA 5HM4B 2VGQA 1NL5A 5CMCA 3RY3A 4EDPA 1KWHA 1PEBA 3FZVA 2FA7A 4ZZEA 3PPRA 3WAFA 1UTBB 2FYIA 3BFUA 5TPAA 4F2QA 1Z7ME 2NVUB 3OMBA 3DM0A 1GR2A 1LSTA 3IJOB 5CI5A 5F7VA 3WAEA 2HXWA 2DYXA 1L5TA 1MG1A 2GHAA 4IO5A 1HSLA 5ISUA 5FHOA 3IOWA 4XKNA 3MJNA 3OO6A 3B6QA 4EXKA 3G3KA 2DWIA 4U21A 1BP5A 1LGBC 3B6TA 2F78A 3FVOA 3K1PA 5I84A 1SYHA 3OO7A 5AA2D 1OMPA 5HBCA 5B7DA 1HSJA 3HHFA 3N6TA 3G3HA 1POTA 2KLFA 3FVNA 4YAHX 3CRBA 1MY2A 3O6GA 4BDQA 1B4ZA 1CE2A 1ZMGA 4KQPA 4H8IA 1B5IA 1TXFA 1H43A 2Z8FA 2O51A 1LFGA 4P11A 1A54A 3K6XA 1S50A 1XVXA 2QS3A 4OXVA 4OFLA 3KJ7A 1GVCA 3O6HA 4N13A 1XC1A 1B7HA 1YTVA 2F7AA 2DXYA 3QUJA 1MY1A 1TWYA 5FHNA 2PBWA 3TTKA 3E4RA 3I3VA 4QFNA 1N3WA 4YB7A 1GGGA 4R9FA 1H44A 2H99A 4YZZA 3QXMA 4KI0E 4R6YA 3TZAA 1ZKBA 3CSGA 4YB5A 1J1NA 2BJJX 1N7XA 4EQ7A 1FTKA 3BBRA 3W9VA 3K02A 2PT2A 2XXUA 4G2ZA 1QVSA 1B52A 1FQAA 3SETA 3A3CA 4FEBA 3IJXB 2XD3A 3LR1A 3TODA 3GBAA 2HAUA 2DXRA 4OERA 3L6GA 4GXSB 1VFEA 4K3FA 2QMWA 4PFTA 4HS7A 1QKAA 1MPDA 2XX9A 3SERA 3ECRA 1JQFA 3JZJA 2F7CA 3VLUA 1OVBA 4NF4B 1DTGA 3QAXA 2H25A 1MXYA 3JYRA 1UTHA 1XT8A 4GOTA 4XKRA 5CM6A 3ZSFA 3HCQA 3MAMA 4IY6A 3H7MA 1B6HA 2NWJA 1MY0A 5I58A 2D3IA 2Q8JA 3G3FA 5FTHA 3PPOA 3QIMA 4F31B 2Y84A 1M5EA 3SEXA 4AQ4A 4RPNA 3LSLA 3CG1A 1SYIA 3SKPA 3OSRA 4R2FA 4U2RA 1MDQA 1NH8A 3KOTA 1IXGA 1S7YA 4OFOA 2A5TB 2F5XA 2DQVA 3M3FA 4PFYA 1Y4CA 3O29A 1B3GA 3FGSA 4IO4A 3DELB 3PMVA 5ITOA 1Y20A 1BTJA 1FQDA 3IB0A 3TCGA 3HSTA 3V8XB 1VE4A 2X7PA 2OBGA 1NNKA 4BDOA 2H5YA 5A5XB 3UA8A 1SDXA 2Z8DA 1OLCA 2DOJA 4H1XA 2DE2A 3VDFA 1SBPA 2DP8A 4R6HA 2X7QA 5K2YA 1B3EA 1R1NA 1MQJA 4F3SA 1POY1 1M5CA 4JXIA 3H03A 2HZKA 1Z7NE 2NXOA 1B9JA 1UIVA 3T9VA 3IK6B 4KCCA 1MQGA 4H67A 4NTLA 4G68B 4C0RA 4BDMA 3TDJA 4RPOA 4RY1A 1MQIA 1BKAA 4M4GA 2UVHA 3FV1A 4KR5A 1Y3QA 2IA4A 4F29A 1DSNA 4ND9A 4OESA 2ZYKA 4BDRA 1B5HA 1URGA 1XOCA 4JWXA 1ZBMA 4ZDMA 3UN6A 3CFXA 4EQ9A 1I6BA 3OO9A 4YMBA 2PT1A 3PPNA 1GV8A 1JEVA 1ZIUA 2XXTA 2W7YA 2AL5A 4R74A 2P2AA 3Q27A 1D9VA 2I3VA 3H6VA 4UA8A 4YB6A 4IO6A 4QSCA 5L9SA 4H0WA 2G29A 1FTMA 1P1UA 1VFDA 3IR1A 4EUOA 3RQTA 4OTEA 3S9MC 4WKMA 3MVXA 3TCFA 3OEKA 4IB2A 4U1OA 2OK2A 1FTOA 2HZLA 1O7TA 1P99A 1MXXA 1SW4A 3KN8A 4NF4A 1WDNA 4RXLA 4U4SA 4RK9A 4OHNA 2V3UA 3PPQA 3T9HB 1H3DA 5I2KB 4PETA 1P1NA 2QS2A 4NMYA 4FECA 4P0GA 5JK4A 3T66A 3C33A 1D9YA 1B5JA 4BDNA 4HTGA 1JW5A 3LBSA 4ZEBA 3RN8A 3IB2A 2ZNTA 4QFOA 2F6GA 3MZ1A 1B7UA 1PB9A 1AH5A 2QPQA 1MH3A 1B2HA 1ELJA 4JBZA 3AXFA 3PUXE 4JWYA 5CMKA 5AA1A 4LZ8A 2IEEA 2ONKE 3OENA 5IKBA 4BDLA 4QFPA 2I0BA 1F9BA 1DPPA 2F97A 4H8JA 4FEDA 4LUBA 1MPBA 4HW8A 3MP6A 4LONB 2A5TA 2QL3A 4ESXA 2DWAA 2I48A 4GFRA 4R2BA 3OOAA 1M5DA 2ZMBA 4NF5B 4GL0A 3SEYA 2XXPA 4LQ2A 1LBCA 2DVCA 1NNTA 4I9DA 2Z22A 1B05A 4F3PA 3C32A 3MUQA 2YJPA 1I6AA 3S9EA 4YKPA 3IO4A 4KD5A 1JVXA 4RYAA 1LBBA 5A5XA 1SVXB 4TLMB 3MW0A 1NNPA 5JTYB 1RYXA 3DP8A 5AA2B 1ATGA 3IL1B 1Y9UA 1SQYA 5CRYA 2REJA 4WEPA 3T9UA 2YLNA 3KGCA 4G68A 3F11A 3N94A 3E13X 3PUYE 4XIGQ 3USDA 2Q88A 4NEDA 3ZS6A 4Q30B 3KG2A 2DSFA 2ALUA 2OJTA 4IO2A 4POXA 1QW0A 3IO6A 2M8CA 3HO7A 4LZ5A 1B7ZA 4WXJA 3K0VA 1B1HA 1IUDA 3TQLA 2R9JA 2E1SA 4ZE8A 4JSOA 3QK6A 4O3BA 1JETA 1EH3A 3O6IA 1OQGA 2OLBA 2AL4A 4OETA 2RC9A 4DIGA 4E0WA 1MY4A 4POWA 3CI8A 4U23A 1TFAA 3OSQA 5DEXB 1UQWA 1N3XA 3R26A 1B4HA 3VXBA 3H6TA 3MBPA 3FV2A 1LAHE 1EU8A 2G93A 3PD9A 3O97A 2ZYMA 1D4NA 3VV5A 3PGFA 3KFMA 3R6UA 2O1MA 1Y1MA 1LFHA 3C31A 2XXHA 5CC2A 3Q25A 1N84A 1FQFA 3EPEA 2O6AA 2ONSA 3KSXA 4ZEIA 3KEIA 4QSDA 1FQBA 4OMBA 3T96B 3UGWA 2RINA 1DPEA 2UYFA 5L9MA 2PX1A 3BFTA 5I2KA 2O68A 2XX7A 3VVEA 2ANJA 3W15C 1QKBA 5B70A 5I2NB 4MFIA 5J1DA 1JW4A 4Z7EA 1O63A 1B46A 1BIYA 1IQ7A 4H5FA 2XXIA 2AYSA 3T9XB 4EF2A 3OELA 1MS7A 3B6WA 3S9LC 4OZ9A 1B0LA 2HCAA 2THIA 4MH5A 1Y1ZA 1JNFA 4AB6A 3HN0A 3KSJA 3EHSA 5BUUA 4GRKA 3SESA 3PMWA 4F22A 3KN3A 2QSXA 2V93A 3U92A 1VR5A 3VLVA 4C1TA 2V3TA 1RKMA 1PB7A 2H9BA 3FD3A 4NWCA 3C35A 1A99A 3VLWA 2O7UA 2RCAA 4H6DA 4PP0A 3GBBA 3U72A 4NF5A 4U1ZA 3I5OA 2F6PA 4TOZA 1UTBA 4F39A 4ELOA 2RKMA 4ZECA 4BLAA 1B1XA 5H8QB 3EHTA 1PC3A 3QSLA 4DXCA 3KOSA 2VD2A 2AIXA 3TKDA 3KN7A 3PU5A 4Q0CA 2Q89A 4ELQA 1T0KA 2PVUA 2Y7RA 4TLLB 3CFLA 1DTZA 1LAXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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