3U92A

Crystal structure of the gluk3 ligand binding domain complex with kainate and zinc: p2221 form
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
NRSLIVTTLLEEPFVMFRKSDRTLYGNDRFEGYCIDLLKELAHILGFSYEIRLVEDGKYGAQDDKGQWNGMVKELIDHKADLAVAPLTITHVREKAIDFSKPFMTLGVSILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVKDGATMTFFKKSKISTFEKMWAFMSSKPSALVKNNEEGIQRTLTADYALLMESTTIEYITQRNCNLTQIGGLIDSKGYGIGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEDKLHIMKEKWWRGSGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Zinc Potentiates GluK3 Glutamate Receptor Function by Stabilizing the Ligand Binding Domain Dimer Interface.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 3
total genus 77
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u92A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u92A02
3UP9A 3PMVA 5AA1A 3W9VA 2OCUA 2I4CA 2F97A 3O97A 1MXVA 3TCHA 4RA1A 3I5OA 1FQFA 1DSNA 3GLBA 1UQWA 1LFIA 3OEKA 1POTA 3DELB 3KFMA 4AQ4A 2OBGA 4LA9A 4F2OA 4R2FA 4ECFA 1UTHB 2UVIA 3T22A 1P1WA 1IUDA 4H67A 3CSGA 1A54A 1TT1A 2DVCA 2XXWA 1RYXA 3I3VA 2Z8FA 3E13X 3V89B 4DZ1A 1ZMGA 5F1QA 3TQWA 2XXXA 3H03A 3E3KA 1F9BA 3JV9A 1JEVA 1Y3NA 3PPQA 2QSXA 3BFTA 5I57B 3IO4A 5FTIA 1B05A 3K6UA 4DXUA 4IO2A 1LBBA 4H5GA 4EF2A 3C4MA 4QSDA 2Q8JA 1SDXA 2OWSA 3A09A 4NWCA 1PB7A 2DQVA 3LSFB 5FTHA 2D5WA 3TTLA 1WVJA 5I2KB 3G3HA 2F35A 1VSOA 5DEXB 5H8QB 2I4BA 3USDA 2O84X 1B7UA 3DM0A 4DCXA 2Y7WA 1IXHA 3G3JA 4MBPA 3FJ7A 2ZYKA 4P0IA 1IXGA 3MVWA 4FEBA 5I59A 2ESNA 4U4XA 4YB5A 2A5TA 4MLQA 1B0LA 1L5TA 5CMKA 2XXVA 2Y7RA 3T9UA 3FJMA 4OEVA 3U93A 3Q25A 2GRVA 1M5FA 4FECA 1H44A 2XXYA 3PMWA 3U72A 1Y1ZA 2RF1A 1B9JA 3CFZA 3TODA 2NOOA 3MZ1A 2F7CA 1Y9UA 4PE5B 3D4CA 1URGA 2UYFA 2XX8A 3N94A 3F11A 3CVGA 3IO6A 1YAEA 4BLAA 4YKJA 1B4HA 3U8QA 1LFGA 5ELVA 3G3FA 2THIA 2DE2A 1IEJA 4Z0IA 3OO6A 4H65A 4PQJA 5K2XA 4EQ9A 1PBPA 2XXTA 5H8NB 4EQBA 1MY0A 4IY5A 2AL5A 4WXJA 3SEUA 3FZVA 1DMBA 3QUJA 1LCFA 1H3DA 4ZS9A 1M5DA 3FGSA 3PUWE 5TP9A 3IK6B 4ZEKA 3BKIB 4UA8A 4F31B 5CMBA 4WKMA 4GWOA 3G3KA 5M2VA 3GXAA 3IOWA 4NMYA 4OVJA 2YLNA 2E1SA 2RKMA 2NUVA 3MWBA 1IQ7A 5A5XB 3B6WA 2Q2AA 2XHDA 3LSWA 4IO5A 4RY1A 1SI1A 4FJPA 3MUQA 3KG2A 3VVEA 4HCWA 1LSTA 2QRYA 4XKNA 1H45A 4E0WA 2YPNA 4X48A 4Q0CA 3K4UA 1I6QA 2PT1A 2QS2A 3K6WA 2X26A 4KQPA 1FTJA 2IA4A 2F7AA 5L9MA 2QS4A 1DTZA 1S7YA 3VDFA 2RINA 1N0TA 2XX7A 3C35A 4OMBA 5HPQA 3TTRA 3JYRA 4G8HA 3QSLA 4O3BA 5L8DA 2F6PA 2H99A 1UIVA 4DXCA 2HAVA 2HZLA 3ZS6A 4R2BA 1SBPA 1N04A 1MQDA 4EUOA 4OERA 4ISUA 4H5FA 4G8MA 3LBSA 3FJGA 3O66A 3IB1A 2ABHA 2Q89A 2DE4A 3TEPA 2F7BA 4U22A 3SERA 3FVOA 1H43A 5H8FA 1MDQA 5ICTA 1VE4A 1JW5A 1FQAA 4BDQA 1BKAA 1SYHA 4R73A 1MXXA 2ALUA 4LQ2A 4ZECA 3DP8A 3HHGA 3OO7A 4F19A 1B2HA 1OQHA 1VFDA 3ODBA 2F6GA 2NXOA 1ZTYA 1SD3A 4QFPA 3RNNA 3RQTA 3O2AA 2X7PA 1QJMA 2O7UA 3HN0A 4Q5TA 2X7QA 3CFLA 5JTYB 3KSJA 4F3PA 4R75A 1R9LA 4XKQA 4G68C 4ONYA 5I56B 1N76A 1BTJA 1AIVA 1Z7NE 3RY3A 5I58A 5FHMA 2QL3A 1JEUA 1MH3A 1P99A 1B58A 3C9HA 1P1QA 4DE8A 3R26A 4H0WA 2R71A 4H6DA 1B4ZA 5I2NA 4NF4A 2BJJX 1FTLA 2H5YA 1KWHA 2VD3A 4TOZA 3RTWB 2V3UA 1PB9A 4KYDA 1POY1 5KCJB 4LZ7A 4GXAA 3KJTA 2ZNUA 1MPDA 2XXHA 4JWXA 4RPOA 3PD8A 3UK4A 3V83A 1QUIA 1P1OA 4OWDA 1HSJA 3C34A 3MJNA 5AA4A 3OELA 3IX1A 1J1NA 1MY4A 3RPWA 2NWJA 4PFTA 2Z8DA 2I6EA 1MXYA 2VP1A 3EN3A 4NF8B 5JEIA 3DLNA 3PPRA 1Y4CA 2HEUA 4F2QA 4M4GA 3MZBA 4X9TA 4JDFA 2ZMBA 5ICQA 4N6PA 4EDPA 2I49A 1GV8A 4JSOA 3QUFA 1SW5A 2QJEA 1DOTA 3T96B 1UTBB 5BUUA 1OMPA 4OXVA 1B32A 1GVCA 4QHQA 1WODA 2P0SA 1USYE 2WKYA 3HO7A 2UVJA 3T93B 2G29A 1GTKA 4BDLA 3RGYA 1JVXA 2DWJA 4G4PA 3KN8A 4LP2B 2F34A 1YPNA 1IZ1A 2V93A 5I84A 3SETA 1LAXA 3OO9A 4LZ5A 1FTKA 2XXPA 1B51A 1NL5A 1NNTA 1QUKA 1LFHA 1LB8A 4POWA 4QF9A 3VXCA 2HCAA 1NH7A 1Q35A 1FQEA 4YKPA 1R6ZA 4NF5A 2HAUA 3G3GA 1ELJA 1PBQA 2VGQA 1MQGA 1IXIA 2H25A 1A99A 4G2ZA 3IB2A 3N26A 2XXIA 4IO3A 1ZU0A 2Y7PA 3VXBA 3ONMA 3MP6A 4LZ8A 2V3TA 3M8UA 5ITOA 3UN6A 4PFWA 2ONSA 2VHAA 1TWYA 4BDMA 1GGGA 4PETA 2ZNSA 4GLIA 4GRKA 4U4SA 1ZIUA 4YB7A 3VLWA 3N6UA 5DT6A 3QXMA 4AB5A 1B3LA 1NKXA 4OHNA 3A3UA 4FEDA 2DYXA 3ZKLA 2DE3A 3PUZE 1SW4A 4G68A 2DXRA 1TFDA 1II5A 1Y3PA 3EPEA 3PPPA 3N5LA 4GFRA 4JB7A 3RTFB 2I48A 2XX9A 2ONKE 1MPBA 3SDFA 1BIYA 4ELPA 4BDNA 1AOVA 1EZPA 3TMGA 3K0VA 1ZBMA 2V3QA 3VLUA 4L17A 4FE8A 2DS9A 4QFLA 4BDRA 3PGFA 4OFJA 3JZJA 3LUYA 1JVYA 3TCFA 3EF7A 4AB6A 4H1XA 1M5BA 1SYIA 1LAHE 1SI0A 3CRBA 3M3LA 3SEWA 3GBAA 4OTEA 1B3EA 4YICA 2DWAA 3HSTA 3RUMA 4LVQA 4RK9A 3K6XA 4OZ9A 1UTHA 3MW0A 3E4RA 5FHOA 2HQ0A 4YKIA 4TQUQ 1B5HA 3HHFA 4GOTA 3IOTA 4IO7A 2D21A 1QW0A 1NMUA 2PMSA 4PP0A 1MY2A 3TZAA 3PUXE 4QSCA 1XVXA 4XXUA 5I57A 1PDAA 1HSLA 1XOCA 4JXIA 5CC2A 4NF6B 1LB9A 2GHBA 2P2AA 1OLAA 3PUYE 5H8HB 3IR1A 1Y4TA 3DP6A 4KHZE 2O1MA 2HXWA 1DPPA 2Q88A 5I2KA 5JK4A 2UXAA 3RT6B 5DEXA 5H8QA 4EXKA 3VV5A 3LR1A 2Y7IA 4R9GA 2D3IA 4U1ZA 1B1HA 1NH8A 2H9BA 2Y7KA 1QUJA 2ANJA 2HZKA 3OMBA 2V84A 2DSFA 3MVZA 5AA2B 5F7VA 4YMBA 3OOAA 3N6TA 4WEPA 3HPIA 3OEMA 3R7XA 4I9DA 4R9FA 2XXRA 1MQHA 5DVJA 2OWTA 4K3FA 2UYEA 3VFJA 2KLFA 5ISUA 1MM7A 4ELRA 1VFEA 3FATA 2QPQA 3W9WA 2CZLA 3W15C 1B0HA 4NWDA 2PX1A 2OK2A 4QRZA 4DDDA 1M5CA 4F18A 4IY6A 1ZLQA 1NNKA 3FIRA 2O69A 2HFBA 1R1NA 3TTMA 3B6TA 5H8NA 2ZNTA 4PFYA 3UIFA 3K1NA 1A40A 3WAEA 2B3BA 4RXLA 3V5AA 3FUZA 5J1DA 1BP5A 3EQ1A 3A3CA 1B7ZA 3KOTA 5KDTB 4R72A 3LSLA 1FW0A 4C1UA 5A5XA 1MDP1 1MPCA 5TPAB 3FVNA 1MRPA 4U23A 3H4ZA 2ONRA 3FASA 4GL8A 3OSRA 2B3FA 2UVHA 5BWJA 4GL0A 4JWOA 1PB8A 4KPTA 4XIGQ 2RCBA 3O6HA 3FVGA 4R6KA 4ZDMA 2OJTA 4RJZA 3IAZA 1D9YA 3SESA 2QS1A 5CI5A 1YTVA 4YZZA 3KOSA 2FYIA 3O6GA 3TFLA 3K2DA 4WEDA 3FV2A 1D3KA 1JW1A 2VD2A 1URDA 3ILTB 4I1DA 3RT8A 1OLCA 2LAOA 1TXFA 2O6AA 4OFOA 4FATA 5IKBA 2ZYMA 2VOZA 1OIBA 3QIMA 4X1BA 2ZYNA 3KEIA 1R9QA 4H8JA 1AMFA 3S2VA 3QAXA 3LC8A 3U92A 3ILUB 2REGA 3K00A 4XKRA 1QKBA 5CMCA 2O51A 3AXFA 4EXLA 3Q29A 1JW4A 3E9XA 4O3AA 3S9MC 4OQOA 5CBRA 4UACA 5AE4A 2GHAA 3H3GA 1B5JA 5B70A 3C36A 4G68B 1EZOA 3HCQA 3OSQA 5I59B 3CG3A 3MQ9A 4BDOA 1B46A 2FNCA 3H06B 2A5TB 4P0GA 3IJXB 4LONB 3PPNA 1FCKA 1LBCA 1UIUA 3H6VA 1JQFA 4E0XA 4G77A 1Y3QA 2NVUB 4G8NA 3THIA 2REJA 4I8CA 1B7HA 4EF1A 5JTYA 4OENA 1FQDA 1D4NA 4IGTA 1IITA 3EHTA 3MPLA 4OYVA 1N7XA 3Q26A 1VR5A 2YJPA 5I56A 3KN3A 4GQOA 4KCCA 1P1UA 1MY1A 4DXBA 3MP1A 3O28A 3L6HA 5EHSA 1FTOA 1US5A 5FHNA 1SW2A 4FORA 4MFIA 1USYH 1B52A 1XT8A 5KZTA 1O64A 2XXUA 3K01A 3O9PA 4OEUA 4GIZA 4RPNA 4P11A 2RCAA 2O68A 3CR9A 4N07A 5TP9B 4F3GA 3PU5A 4F39A 4GF8A 1PC3A 4C0RA 2R9JA 1QKAA 2DXYA 1FTMA 1SQYA 4THIA 4F22A 5KCJA 1XHYA 3TELA 4KCDA 4HCYA 2H98A 1B3GA 2XXQA 5LOMA 2V25A 3OO8A 1RKMA 2Q2CA 3MAMA 1ANFA 2I0BA 3K02A 4KD5A 2Z23A 5TU0A 4QFOA 5CBSA 3IB0A 1LLSA 3K6VA 1AL3A 2F78A 3BFUA 1IIWA 1B5IA 4Q8RA 2DWHA 3H6TA 3TCGA 1Q1KA 5HBCA 1YCJA 3S9NC 4F29A 3IL1B 3QYTA 3PV0E 4ZE8A 4NF8A 5EHMA 2PT2A 2GFEA 3U1OA 4MF3A 4U2RA 3OENA 5DTBA 5AA2D 2M8CA 3O6IA 1MXUA 1DPEA 4HTGA 1UTBA 4RNSA 3SKPA 3CIJA 1QVSA 4M1VA 2Z22A 1QULA 3IOVA 4EQ7A 4H8IA 2G93A 2E0SA 4OFLA 3LSXA 2Z8EA 5AA3A 4Q30B 1N3WA 1FQCA 1JNFA 2DOJA 3T9XB 5CM6A 1Y1MA 3R6UA 3H7MA 3KBRA 1XVYA 2B65A 3EHSA 5H8FB 4JWYA 2QMXA 2PBWA 1MS7A 4LQ5A 3KJ7A 3MPKA 2I58A 3L6GA 2H4IA 3FXQA 1CE2A 4FIMA 3S4UA 3C33A 4DCYA 1IXCA 4GXSB 2QMWA 4NE4A 4YAHX 4ESWA 1URSA 1O7TA 1I6AA 3TTNA 4ZE9A 4ELOA 3RLFE 4R6YA 3T9HB 4DLDA 4HW8A 3D4GA 3TYHA 2F36A 4GD5A 1MXZA 4TLLB 1LCTA 1LAFE 5L9OA 2A5SA 3V8XB 1OVTA 3CFXA 2AL4A 2AYSA 2QS3A 5DVFA 1ZJLA 4Z7EA 3GBBA 3RN8A 2F5XA 4OESA 2ZYOA 2XD3A 3OXNA 1OVBA 2O7IA 3UGWA 4HS7A 3DP4A 1XC1A 5DYHA 3T9VA 1EU8A 2Q9TA 3ZKKA 4ZEFA 3GZGA 1I69A 2RC9A 5I58B 1RYOA 1EZ9A 3TTKA 1H76A 3MBPA 3M3FA 3IORA 3MVXA 3C32A 3OD7A 4XKPA 1HSEA 4IB2A 1Z7ME 3B6QA 1DTGA 2I3WA 3VVDA 5H8SA 3PPOA 2OZZA 1SVXB 3SEYA 4ZEIA 2RC8A 5I2NB 4NF4B 2DWIA 1OQGA 2P1SA 4JSDA 1LGBC 4X1DA 3UA8A 2GH9A 2DP8A 2DVZA 3G7WA 3TQLA 2FA7A 3FXRA 3FV1A 3VE1B 4YB6A 4ESXA 1T0KA 1LAGE 5CRYA 4R6HA 1B6HA 3K1PA 4IO4A 3CSBA 1MQJA 5AA4B 4F1VA 4KI0E 1D9VA 4ELQA 2PYYA 1NNPA 2RC7A 4U1OA 1A8EA 3FD3A 1B1XA 1O63A 4PFUA 1US4A 4ND9A 1BLFA 2IEEA 4IO6A 2R6GE 1MG1A 4LATA 1N7WA 3HV1A 3TAJA 1M5EA 1GR2A 4DIGA 4KFQA 1S9TA 5DVIA 1A8FA 4POXA 3KN7A 4KR5A 3PUVE 3Q27A 3M3KA 3H6WA 1MQIA 3MVYA 4NF6A 3ECRA 2F8DA 4IGRA 1XS5A 4OETA 5H8HA 5HM4B 3S9LC 2OLBA 4NEDA 2I3VA 5L9SA 3S9EA 4RYAA 3KGCA 4RK2A 1MH4A 3CG1A 4ZZEA 4MH5A 3SEVA 5CMMA 3SEXA 3P7IA 5ITPA 4GVOA 4YMAA 1S50A 2PVUA 3H6UA 4R74A 1AH5A 2AIXA 3FXUA 1A7LA 4O3CA 1B3FA 1JETA 3Q28A 5AA2A 5K2YA 3CI8A 2W7YA 3IJOB 4NF5B 4F3BA 1A55A 4QSEA 3O29A 3KSXA 4YKKA 3MP8A 4JBZA 3C31A 3VVFA 3B7DA 1MXWA 4F3SA 2I0CA 4QFKA 4F1YA 2Y84A 4N13A 4ZEDA 3WAFA 4TLMB 4XTCQ 1MY3A 1FQBA 4U21A 3T66A 4ZZAA 3EHUA 1N84A 1NFTA 1N3XA 1MM6A 1TFAA 3PD9A 4FAJA 1PEBA 1P1NA 3KZGA 3TUSA 3TKDA 1B40A 1CB6A 3MC2A 2ZXTA 4ZEBA 3K1MA 2UVGA 3UORA 2XD2A 4YU0A 3ZSFA 3MZ9A 3IOUA 4NTLA 1NNFA 4KYEA 3VLVA 4QFNA 3FVKA 3TDJA 4LUBA 4C1TA 4KYSA 1ATGA 1WDNA 3QK6A 1Y20A 5KDTA 2O1LA 4I62A 3PMXA 2CMOA 1B3HA 3G3IA 3BBRA 4F1UA 1EH3A 3I6VA 4MLVA 5TPAA 1ZKBA 3U94A 1SW1A 3TPAA 1I6BA 5B7DA 5EYFA 5IAIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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