3U92A

Crystal structure of the gluk3 ligand binding domain complex with kainate and zinc: p2221 form
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
NRSLIVTTLLEEPFVMFRKSDRTLYGNDRFEGYCIDLLKELAHILGFSYEIRLVEDGKYGAQDDKGQWNGMVKELIDHKADLAVAPLTITHVREKAIDFSKPFMTLGVSILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVKDGATMTFFKKSKISTFEKMWAFMSSKPSALVKNNEEGIQRTLTADYALLMESTTIEYITQRNCNLTQIGGLIDSKGYGIGTPMGSPYRDKITIAILQLQEEDKLHIMKEKWWRGSGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 3
publication title Zinc Potentiates GluK3 Glutamate Receptor Function by Stabilizing the Ligand Binding Domain Dimer Interface.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 77
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-10-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u92A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3u92A02
5I2KB 1BLFA 2XXVA 2P0SA 2DYXA 4OFOA 1JEVA 1DSNA 1P1QA 1N3XA 3IL1B 3R7XA 1UIUA 4OHNA 5CMBA 4YKKA 2ZMBA 2V3UA 5DVJA 2Y84A 3KOSA 2X26A 3MW0A 3L6HA 4R2BA 2F8DA 2DWAA 2AIXA 3FXQA 2I49A 4IB2A 2Z23A 2I4CA 4NWDA 3FD3A 4PFYA 5F1QA 4RY1A 3H6VA 1LB9A 1IXGA 1ZMGA 3E9XA 3JZJA 2PBWA 2I48A 1NKXA 4OESA 3DLNA 2XXTA 4XKQA 1A55A 3MZBA 3HSTA 1MY4A 1Y1ZA 3P7IA 4TLMB 1UIVA 2Q2AA 3C9HA 4ECFA 1MPBA 3SEXA 3PPQA 1LAGE 4RPNA 4EXLA 2RC7A 3LUYA 4LZ8A 4PFWA 1NMUA 3D4CA 3VFJA 3OMBA 5IAIA 1LB8A 5KDTA 3IB0A 2QS2A 3FUZA 1SI0A 3WAEA 3K1NA 2F78A 3UA8A 1CB6A 4LATA 4M1VA 3MPKA 4MH5A 3IO4A 5CC2A 3PUWE 4RA1A 5A5XB 4JWXA 2O69A 3IJOB 5H8HA 3TTRA 1B3LA 4G8HA 3HV1A 2UVJA 4U22A 1TFDA 1P1OA 5I59A 2DE2A 2B3FA 3H4ZA 2Y7PA 3PV0E 4F19A 4G68B 4KYSA 3TCFA 4O3CA 3FVKA 2OZZA 4AB6A 3O2AA 5I84A 1ZKBA 4EF2A 3K6XA 3I3VA 2O51A 4PFTA 4TLLB 5DEXA 3BBRA 4OXVA 1WODA 3VLWA 1MY3A 2OLBA 1MH3A 3MAMA 4BDQA 4YKJA 3IOTA 3O6GA 4YMBA 4R9GA 3MP8A 4GIZA 2XXUA 2XD3A 1XT8A 3K4UA 5TU0A 3MBPA 1B3HA 3RNNA 4LQ2A 3UP9A 1UTBA 4PETA 5H8SA 1LCTA 4C0RA 1GVCA 3ZKLA 1POY1 3IX1A 3K6VA 5EHMA 4Q8RA 1KWHA 2O1MA 3I6VA 2Z8DA 2R71A 2ONSA 4R6KA 5I56A 2QMXA 3OXNA 5FHMA 4LZ7A 4QRZA 4ZZEA 5AA4B 4R6YA 2XX8A 1XHYA 5FHOA 2VP1A 3HHGA 3C31A 1MQDA 1QW0A 4ZE8A 2R6GE 3FXRA 2D3IA 1NNTA 2HAUA 2DSFA 3BFTA 4F29A 3PD9A 4E0XA 2VHAA 1AOVA 3RUMA 3KN7A 3TFLA 3A3CA 3IR1A 1FW0A 3KZGA 1DPPA 3VVDA 4R72A 4GLIA 1SBPA 2DQVA 2O1LA 2QS1A 3A3UA 2GH9A 5BUUA 1AH5A 3K1PA 2XXRA 4OVJA 3U92A 4F3SA 1VFEA 2IA4A 5K2XA 2AL4A 3TQWA 1VSOA 4EF1A 4AB5A 3IB1A 3TDJA 4H67A 2OBGA 3IAZA 5DYHA 1IEJA 1IITA 5H8HB 4L17A 2Q9TA 3TYHA 4EQBA 4YMAA 2FA7A 4U1OA 3CSBA 4DE8A 2P2AA 5I59B 1PB9A 3GBAA 3VVEA 4EDPA 1OLAA 3FJMA 1MQIA 3G3JA 1D4NA 3O6HA 1MQGA 1SD3A 1QKBA 1I6BA 1MG1A 4ZDMA 1EH3A 5DEXB 4NF4B 1B1XA 3IOUA 3HPIA 2V93A 5TPAA 4LP2B 4QF9A 2REGA 1FCKA 4WKMA 5ELVA 2HZLA 3SEYA 4NF8A 1B5IA 4RJZA 2V25A 3TUSA 2W7YA 4Z7EA 3QYTA 3K1MA 4C1UA 4KFQA 1LAHE 2PT2A 3FJGA 1UQWA 2WKYA 4GXSB 1XOCA 2FNCA 2DWJA 4F31B 1EU8A 4KQPA 3D4GA 1TWYA 3CFZA 3PPNA 2H99A 2RINA 3FJ7A 3K2DA 1R1NA 5I56B 2HCAA 1YCJA 3HO7A 5M2VA 1HSEA 4MLQA 2UVHA 1FQAA 2ALUA 4X48A 3O66A 3HN0A 1OQHA 4C1TA 4ZEIA 4HCYA 3M3KA 3SETA 2I58A 2PX1A 5H8QB 3B6TA 3OEMA 3PMWA 3UK4A 1B9JA 5ITPA 1LFGA 3PMVA 3CSGA 3FASA 3PMXA 1IIWA 3V89B 1EZ9A 1UTHA 1B3GA 2DVZA 4OYVA 2I6EA 1OLCA 3S9LC 3TPAA 4ZS9A 2F6PA 1QKAA 2HXWA 3S9EA 3K00A 3RT6B 3MVXA 5H8NA 3PUZE 4FAJA 3IOVA 4NF6B 2V3QA 2FYIA 3PPOA 2G29A 4X9TA 1M5EA 5DVFA 4KCDA 4HCWA 4KYDA 1M5DA 3O29A 3TODA 3VXCA 3LR1A 2H98A 2DP8A 2D5WA 3TTKA 1O63A 4R73A 1DTZA 4OETA 1PB8A 1I6QA 2KLFA 3QSLA 1Y20A 3BFUA 3TMGA 1B7UA 1IZ1A 3TQLA 1B4HA 1O7TA 2Y7KA 3EQ1A 1SW2A 2UYFA 2QS3A 4G8MA 3SEWA 5TPAB 1URDA 4KD5A 4ISUA 2AL5A 3MJNA 2B3BA 1NFTA 1FQCA 4NF8B 1PBQA 4F3GA 1YTVA 1Q35A 3TEPA 3T9UA 2V84A 3OSRA 2Y7WA 3T22A 4KCCA 2I4BA 5K2YA 4GL8A 5HM4B 1AMFA 1B0LA 4O3BA 3C33A 2I3VA 4NEDA 3EN3A 3E13X 2RC8A 3CVGA 2E0SA 4HTGA 3QK6A 1CE2A 3B6WA 1IXIA 1D9YA 3OO6A 1RYOA 1SYHA 3KBRA 2QMWA 4U4SA 4FECA 1VR5A 2R9JA 2AYSA 3TELA 4LUBA 2QRYA 5CMKA 4N6PA 4G2ZA 4XTCQ 1IXCA 5DVIA 1R6ZA 1LCFA 4POXA 4ZEKA 1PC3A 1MDP1 3SERA 1F9BA 4RK9A 3PUXE 3N5LA 1BIYA 1P1WA 2LAOA 1QUIA 3MWBA 3K01A 4EQ7A 3CIJA 4FORA 1JVXA 2H5YA 2E1SA 3SDFA 1SQYA 4UACA 1LFHA 3H03A 4WEDA 2THIA 3RT8A 1H76A 1XC1A 3PPPA 4X1DA 2ZNSA 2F34A 4R74A 2HQ0A 1B46A 1B7HA 3H6TA 1ZLQA 1URGA 3Q29A 4YAHX 3CRBA 4F3BA 3KSXA 4DDDA 4NTLA 1B5JA 2NUVA 2HAVA 2P1SA 4F2OA 4TQUQ 2F7CA 2M8CA 1M5FA 3Q26A 3UN6A 3TTMA 1MY1A 4O3AA 3V8XB 3VDFA 1IUDA 3S9NC 2O84X 2NVUB 3DELB 3HCQA 1SYIA 4ZEBA 4F2QA 1Y3PA 2X7QA 1FTLA 2DWIA 3VXBA 4KYEA 4RYAA 3S2VA 1OIBA 4DCYA 4MF3A 3IORA 2OK2A 2XD2A 4HS7A 3UIFA 1PEBA 2VOZA 3U94A 1B0HA 4JSDA 3MC2A 2ZYKA 5FTHA 5CM6A 2ZNUA 3O97A 1MQJA 3SESA 2Q2CA 4KI0E 4DZ1A 3R26A 3T9HB 4JWYA 4MFIA 4H5FA 3GLBA 4QFLA 3MZ1A 2DXYA 1XVYA 2F36A 3G3GA 2O7UA 2DE3A 5I57A 5FHNA 3Q25A 3PUYE 4ELQA 2YLNA 4U4XA 3S4UA 1SW5A 1USYE 2ZNTA 3FVOA 2F7BA 2I0CA 2XX7A 1M5CA 4BDLA 5CI5A 5EHSA 2F7AA 2UVGA 4QSCA 4BDOA 1P1NA 4UA8A 1R9QA 2OJTA 1H43A 4OERA 2DVCA 1SW1A 1RKMA 3T93B 2F35A 1H3DA 3H06B 1A40A 4IO4A 3QAXA 1GTKA 5L9SA 1WVJA 2X7PA 1N76A 2DE4A 1JW1A 2O6AA 3C35A 2OCUA 5KDTB 3R6UA 1VFDA 4NE4A 4F22A 2H9BA 3H6WA 2PYYA 4BDRA 4GF8A 4E0WA 1B52A 1FQEA 3QUJA 1TT1A 3FV1A 3CG3A 1S50A 3B7DA 1B05A 1XS5A 4KR5A 5ITOA 2A5TA 4ELRA 4IO6A 4IO3A 3E4RA 3LSLA 4F1YA 2REJA 1B6HA 4YICA 4LA9A 1LGBC 2OWSA 3W9VA 2OWTA 2O7IA 1OVTA 1LBBA 2ABHA 3F11A 4F1VA 1JW5A 2ZYOA 4QFOA 4LQ5A 4MBPA 4YKPA 4DXBA 1SDXA 5LOMA 4U2RA 3GBBA 2GHAA 5JTYA 3FGSA 4YB7A 2XXWA 3KFMA 5I2NA 3OSQA 3H3GA 4FJPA 1DMBA 3UGWA 3W9WA 3T9VA 1FQBA 5EYFA 3PUVE 2B65A 4THIA 3LSWA 4LVQA 3G3IA 4P0GA 4U21A 1S7YA 4ZECA 3TKDA 4H6DA 4KPTA 1UTBB 3EHSA 3V5AA 3G3HA 4OWDA 1LSTA 1HSJA 3I5OA 4OEVA 4IO2A 3KN8A 1IXHA 3MPLA 1NNKA 3SKPA 4QFKA 2RCBA 5B70A 1N7XA 1MH4A 1MPDA 3KOTA 3QXMA 4IO5A 1QJMA 3U1OA 3ODBA 1LAFE 3E3KA 3G7WA 4P0IA 4BDMA 4ESWA 3N26A 4Q0CA 4IO7A 2XXIA 4ZZAA 5AA3A 1QUJA 3MVWA 5L9OA 4H1XA 2Q89A 1B40A 1NL5A 4H5GA 1OVBA 5IKBA 1YPNA 4KHZE 3H6UA 4R6HA 3N6TA 3THIA 1B32A 4DLDA 2ESNA 4JB7A 2QSXA 4R75A 5DT6A 3VV5A 4F39A 2XXHA 4JXIA 2NXOA 3RQTA 1XVXA 3LSFB 4HW8A 1POTA 5A5XA 3VLUA 4N07A 3OO8A 1MXVA 4I9DA 1NH7A 1B5HA 5L8DA 3EHUA 4DXUA 3HHFA 1MS7A 2A5SA 5DTBA 1I69A 4AQ4A 4IGTA 2BJJX 2PT1A 1A7LA 2XX9A 2Z8EA 4FATA 1D9VA 2CMOA 1BTJA 4FEDA 3GZGA 5AE4A 1OMPA 1FQFA 3M3FA 1B3FA 1ZBMA 5CMCA 4ELOA 2Z8FA 1SI1A 3TTLA 4G4PA 4BDNA 1WDNA 3LSXA 3C32A 1URSA 5JTYB 3KJTA 3FV2A 5I2NB 5AA1A 4TOZA 5CMMA 4OENA 5AA2D 1PB7A 3PPRA 3TAJA 3O9PA 4OFJA 4PFUA 3B6QA 1A8FA 2DOJA 1QVSA 3Q27A 3C36A 3MVZA 5HBCA 2RKMA 2Q8JA 1Y4TA 1P99A 3CI8A 4ESXA 4GWOA 1B2HA 3KN3A 3USDA 4G77A 1BP5A 4LONB 3MP6A 5H8FA 3TCHA 2IEEA 2V3TA 1SW4A 5CBRA 4OZ9A 1FTKA 1FQDA 4OTEA 3DP4A 1NH8A 5AA4A 3VVFA 4GVOA 1GV8A 3ZKKA 3KEIA 1DOTA 2DWHA 1JNFA 1Y9UA 3FATA 1N3WA 3BKIB 3OELA 4GQOA 4YKIA 3ZS6A 4MLVA 3RGYA 1S9TA 3IJXB 1ZJLA 1PDAA 3DP8A 4QFNA 1UTHB 1DTGA 4DCXA 2D21A 4POWA 1DPEA 1JETA 5HPQA 1I6AA 2HEUA 3T9XB 4XKPA 3RTWB 1N0TA 4R9FA 3EF7A 2F5XA 1D3KA 5H8NB 3T66A 3KJ7A 1NNPA 4H8IA 3TZAA 4DXCA 4ZEFA 1MY0A 4H0WA 5TP9A 1MRPA 5CRYA 2ONRA 2XXYA 4G68C 2DXRA 1ZIUA 2QS4A 3FVGA 1ELJA 4GFRA 3PD8A 4R2FA 3U8QA 4H65A 2NWJA 3L6GA 5ISUA 3PGFA 2I3WA 4RK2A 5J1DA 3KSJA 3FZVA 1Z7NE 3FVNA 3MZ9A 1RYXA 4NF4A 4Z0IA 1T0KA 3EPEA 3RY3A 5AA2A 3JV9A 1MY2A 2HFBA 2Q88A 3ZSFA 4IGRA 3S9MC 1VE4A 2H25A 1N7WA 2RCAA 1US4A 3MUQA 3Q28A 2QPQA 1LBCA 2F97A 1B51A 2ONKE 5JK4A 1EZPA 4GOTA 3UORA 4DIGA 3KGCA 4PP0A 1JVYA 1B4ZA 4M4GA 3CFLA 5JEIA 1MXWA 4QSEA 1Q1KA 3QUFA 4N13A 3OOAA 4NMYA 1LLSA 5ICQA 4RNSA 3U93A 4ND9A 5H8FB 2VD3A 4EQ9A 1FTOA 4NF5A 1AL3A 3ILTB 4FE8A 1A99A 4F3PA 1MDQA 3G3KA 3EHTA 2PVUA 3K02A 3CFXA 5H8QA 4PE5B 3FIRA 3PU5A 1YAEA 4XKNA 1Y4CA 1GGGA 2DS9A 1MXUA 4H8JA 1JQFA 4YB6A 3RTFB 5I58A 1ATGA 4YU0A 1B7ZA 4GXAA 1B3EA 4LZ5A 3A09A 5FTIA 3OO9A 3M3LA 1A54A 1PBPA 1HSLA 2VD2A 1TXFA 1MQHA 4U1ZA 1B58A 2UXAA 2GRVA 4OEUA 2UYEA 3N94A 2QJEA 5KCJA 2GFEA 4F18A 4NF6A 1LFIA 4RXLA 1Y3NA 2PMSA 1EZOA 2G93A 5TP9B 5B7DA 3AXFA 3IB2A 2XHDA 3H7MA 4I1DA 2O68A 1FTJA 3OO7A 3FXUA 4RPOA 1OQGA 3GXAA 5I2KA 3K6WA 2F6GA 2I0BA 4ZEDA 2XXQA 2ZYMA 2QL3A 4PQJA 1ANFA 4GL0A 1FTMA 2UVIA 3ONMA 4XIGQ 5L9MA 3RLFE 3K0VA 3G3FA 4I8CA 1JW4A 4QHQA 5ICTA 4BLAA 4ONYA 4G8NA 1MM6A 2XXXA 1BKAA 3VLVA 1QULA 4XKRA 1L5TA 5F7VA 3K6UA 1MM7A 5AA2B 3C34A 4FEBA 3TCGA 3IK6B 4P11A 4Q30B 3O28A 4JBZA 3VE1B 3JYRA 1P1UA 2ZYNA 3C4MA 3T96B 4QSDA 3SEVA 3WAFA 1J1NA 2ZXTA 3LC8A 4YB5A 2Y7RA 5CBSA 1JEUA 2YPNA 4JSOA 4ELPA 2ANJA 5I57B 3ILUB 1N84A 1US5A 1MXYA 4GD5A 3O6IA 1MXZA 4OFLA 3MQ9A 4X1BA 3ECRA 1USYH 4JWOA 4F1UA 2VGQA 4NWCA 4OMBA 4Q5TA 3KG2A 1Y3QA 3QIMA 3LBSA 4NF5B 4WEPA 3IO6A 4ZE9A 3MP1A 3W15C 1O64A 1A8EA 3CR9A 4EUOA 1GR2A 2XXPA 3DM0A 1MPCA 1TFAA 4XXUA 3SEUA 2YJPA 1H45A 1ZTYA 1SVXB 2H4IA 1MXXA 4U23A 1QUKA 2HZKA 4YZZA 3V83A 5KZTA 4I62A 2NOOA 4FIMA 4QFPA 3RN8A 3RPWA 1B1HA 5I58B 1IQ7A 3TTNA 5BWJA 4IY6A 1Z7ME 1Y1MA 1M5BA 1II5A 1R9LA 4OQOA 3N6UA 3OENA 2Y7IA 3DP6A 4WXJA 2Z22A 2A5TB 3M8UA 3U72A 2CZLA 1AIVA 2GHBA 3OEKA 4G68A 4K3FA 1NNFA 4JDFA 5KCJB 1LAXA 3CG1A 3IOWA 3MVYA 1N04A 2RC9A 4EXKA 1ZU0A 4IY5A 2RF1A 3OD7A 4GRKA 1H44A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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