1MH3A

Maltose binding-a1 homeodomain protein chimera, crystal form i
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
421
structure length
421
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTAAAAAISPQARAFLEQVFRRKQSLNSKEKEEVAKKCGITPLQVRVWFINKRMRSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into binding cooperativity of MATa1/MATalpha2 from the crystal structure of a MATa1 homeodomain-maltose binding protein chimera
pubmed doi rcsb
molecule keywords maltose binding-a1 homeodomain protein chimera
molecule tags Sugar binding, dna binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 144
structure length 421
sequence length 421
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF00046 Homeodomain Homeodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.60 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Homeodomain-like 1mh3A03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh3A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh3A01
3ONMA 2XXIA 4UACA 5IKBA 1NK3P 2I4CA 4N6PA 1B52A 1POGA 5EHMA 2FD5A 1B7ZA 2DMQA 4IO6A 1GVCA 2THIA 3T9XB 2X6OA 5GPCA 3IB2A 5I2KB 1U78A 2AL4A 2QS4A 1LFHA 4H1XA 2XD3A 4DYRA 4MO7A 3O6IA 3VVDA 4RDUA 4THIA 4QHQA 2X7QA 3EHTA 1NNFA 1XVYA 2F34A 4I1DA 3GTKJ 3TQLA 4NEDA 3CCYA 2JMWA 4FAJA 4KQPA 2O51A 5CM6A 1NH8A 1YRNA 1MQDA 3U72A 1Y3QA 1XT8A 1I69A 3TYHA 3HB9A 4X1DA 3ZS6A 2UXAA 2LR8A 1P1UA 4DIGA 2YJPA 3K1NA 3ZQCA 5H8QB 3TEDA 3JZJA 1JUMA 1DPEA 2A5TA 2Q2CA 2HAVA 3T22A 2HI3A 5I2NB 1U9OA 2JA8J 1F9BA 5IP6A 1GV2A 3K2AA 5DTDA 2DA2A 5L9OA 4U1OA 1ATGA 3A01A 5ISUA 3G3JA 2I49A 4FJPA 1ZU0A 5DVIA 3Q29A 3FXQA 2NVQJ 3DP8A 4R9FA 3ZKLA 3OOAA 1H3DA 1MXYA 4GF8A 1YPNA 2M0CA 3V89B 3VFJA 1A99A 3S1RJ 5DTBA 3T9VA 2R9JA 1MG1A 2AIXA 3O9PA 4YKPA 2ABHA 4ABZA 2CJJA 4BDOA 4QSCA 3SEYA 3HPIA 2P2AA 4QFNA 1OCTC 4IO3A 3BTLA 2XXTA 3PO3J 3KOTA 2R5YB 4EF1A 5K2XA 4DZJA 4GL0A 1TC3C 4G8HA 3RN8A 2E0SA 3H4ZA 2DE3A 4LUBA 1PUFA 4D7MA 3K6WA 2OLBA 4H65A 3QAXA 2ESNA 3LNQA 3I4NJ 4NMYA 2G0EA 2QCOA 1B9JA 3FVKA 2O9LA 1CQTA 1YTVA 3I5OA 4LONB 5EHSA 2NVXJ 1R6ZA 2XD2A 4E0WA 1JUSA 1AL3A 3HKZN 2F7CA 2F6PA 3O6HA 1NFTA 3RLFE 2EQRA 4KFQA 3FK7A 3Q3SA 1POY1 1JVXA 5M3MJ 4OXVA 1HSJA 1BL0A 2KDZA 2ECCA 3GTGJ 3FASA 2RKMA 2Y31A 4JYKA 3Q0VA 4UUSB 2ECBA 5GP9A 3CSBA 4F22A 1IXIA 5C3EJ 4ESXA 4NWCA 1P7JA 5TP9A 2JJ7A 3PMVA 2DE2A 1SW4A 4OESA 3MN2A 3OSQA 3S17J 5AA4A 1MRPA 4IHXA 1UG2A 3CR9A 2Y7WA 3JRGA 4FISA 4LA9A 2VI6A 2LVSA 2OWSA 1DSNA 5JLXA 1N3XA 4XIDA 1FQDA 2CQQA 4FEDA 2Y0SN 1BJZA 3TDJA 4DXUA 3RUMA 2ZYNA 1Q1KA 4FTHA 4ZDMA 1HSEA 3PMXA 1DU0A 3A09A 3B6WA 3MVYA 2I4BA 3UP9A 1FQBA 2OBGA 4NF6A 4ELPA 2O1MA 4H8IA 3S9NC 4F3SA 4F3PA 3TZAA 2GFEA 1VSOA 2ZNTA 1LFBA 2RCAA 2ME6A 3HGYA 4QRZA 3W6VA 2PYYA 1IUDA 4NTLA 1SW2A 3JR9A 1GT0C 1W0TA 2E1OA 1SFOJ 1BLFA 2LAOA 4HCYA 3Q0WA 4DE8A 3JRDA 1A40A 3BR2A 3HHFA 4QSDA 3BR5A 1URGA 1ZMGA 5FKNA 3TPAA 1X2NA 2K40A 4RA1A 4KD5A 2AHQA 3LR1A 1RKWA 4Q5TA 3HOZJ 3TTLA 1DMBA 3LSWA 5H8QA 4M4GA 4YZZA 3BTIA 2HFBA 2V3TA 4A3BJ 4AUXA 1MQHA 5I2NA 4YB5A 1Y3NA 1JETA 3QSLA 1XC1A 3H0GJ 2E2IJ 4YKJA 3FXUA 5C44J 4L17A 2Q9TA 4A69C 2P81A 4NF8A 3ZSFA 4ZEBA 3GBGA 1M5DA 1SQYA 4KPTA 3OEKA 1ETXA 1LLSA 1MS7A 1IDZA 2AYSA 2DWJA 5TPAB 5JK4A 4FE4A 3JREA 1IEJA 5ITPA 4JBZA 4YB6A 3S9LC 4RK9A 3RNNA 4U23A 2NS7A 1MBHA 5H8NB 3JRAA 2QMWA 4FE8A 5DYHA 1UTBB 4BY7J 2Z8FA 2JA5J 1FTJA 2Y7KA 4R73A 1JT6A 2Y84A 2F5XA 2F97A 4F1YA 4EDPA 5AE4A 1Y9UA 4A3KJ 1BKAA 1UTHB 3TP0A 1B58A 4GIZA 1DOTA 3KZGA 1BW6A 1ZLQA 1VFEA 3R26A 3K00A 4GXAA 4RK2A 4G12A 3HHGA 1HF0A 5FJ8J 2VD2A 2B63J 3PUXE 3MUQA 1IG7A 4XXUA 3TQWA 4RNSA 1PEBA 2DN0A 3UGWA 4OZ9A 1SANA 3ZKKA 3VLVA 4ND9A 3L1PA 3KSXA 3MP1A 1XG1A 2DMTA 4LQ2A 4I8CA 2B3BA 2ID6A 1BA5A 4A3FJ 1S50A 3E3KA 1P99A 3ZQLA 1AOVA 3JRCA 4H6DA 1B8IB 3S14J 5FKLA 1H89C 3ILTB 2WKYA 5E3LA 1P1NA 2PX1A 3KFMA 1HLVA 4IO7A 1OQHA 1PC3A 5CMKA 4JB7A 5EZHA 1IGNA 3Q25A 1VFDA 3GTMJ 3M3YJ 3I6VA 4C2MJ 3VXCA 4POXA 3H3GA 3LSJA 2YPNA 2QS1A 3PUYE 1Y1VJ 1LAFE 3SERA 2Y9ZA 5M5YJ 3HOYJ 1F43A 4X48A 1NTCA 2F6GA 3M3LA 2XHDA 4FECA 4W1UA 5EYFA 2CUEA 3IJOB 1OCPA 3F0CA 5IAIA 3HO7A 2REJA 1K83J 5AA2B 1U9NA 2R71A 2JA7J 1IQ7A 1UMQA 4D5CA 4M3FA 3HV1A 1N7WA 4D7NA 5A5XA 1UHSA 4ZECA 3IOTA 4BDRA 2HOSA 2WAQN 3BR6A 4PFTA 5H8FB 4LP2B 3R7XA 3SDGA 1FEXA 3U1OA 1MQGA 3TCHA 4RY1A 2MGQA 2MG4A 3H3VK 3GTPJ 4AYBN 4A3CJ 4LVQA 3T96B 4NWDA 4G2ZA 1FQAA 5I84A 4U1ZA 1P1QA 4BBSJ 4C1UA 1LFGA 4Q30B 2Q8JA 1ZTRA 3GBBA 5I57B 1GDTA 1B3GA 3O6GA 1ETQA 4QSEA 2P0SA 3TW6A 3FD3A 2RINA 1Q1VA 2M8CA 1WI3A 2PVUA 4NF5B 2Z8EA 3IB1A 5FLVA 3VV5A 5KCJB 3UKGA 5L9MA 1JTXA 1SYIA 1PB9A 3WAEA 3O97A 2PMSA 2CQXA 2M34A 1JKOC 4GL8A 4IB2A 4I76A 1I3QJ 4XRSA 1VFCA 1R9LA 3K6VA 4G68B 5TPAA 1URDA 4PFUA 2K9NA 1WH7A 3KN8A 1QJMA 1OLAA 2H1KA 4JSDA 4EQ7A 3KEIA 3TTRA 1R9QA 3QIMA 3RKQA 5DVJA 5H8NA 3DP4A 1UTBA 1MY3A 1JJ6C 2RC7A 3MJNA 2I0BA 2EZKA 4I62A 1L5TA 3S1NJ 1GV5A 3CG3A 1JKPC 1FTMA 1MXZA 1EZPA 5HODA 5HPQA 3PD9A 3S2DJ 1TFAA 2ONKE 3PMWA 1UTHA 4P0GA 3F11A 1QPIA 1NK2P 1ETOA 5EYRA 1F36A 1M5CA 3SEVA 4XKNA 3EPEA 3EF7A 1TWGJ 1B6HA 3ECRA 3UA8A 1APLC 2VKVA 3RTFB 3U8QA 2H99A 4ELRA 5CMBA 1BW5A 4ELQA 2XB5A 1NNTA 2TCTA 1LFIA 2OK2A 1US4A 2W7YA 3MVZA 1MBFA 1JEUA 3U94A 3OSFA 3U92A 2MW8A 1ZIUA 3CSGA 3EHUA 3DP6A 2A5SA 3HSTA 4IY5A 2GHAA 3D4CA 2DA5A 3C9HA 4RYAA 1ZKBA 4U4XA 3S4UA 2L7ZA 3K2DA 4U4SA 2ID3A 2M2EA 1NNKA 3BR3A 3IORA 4O3BA 1B8IA 1ZBMA 3MAMA 4BY1J 4HTGA 4C3HJ 2LY9A 3THIA 3T9UA 3TKDA 2WB1N 1O4XA 1ENHA 3UN6A 3QPSA 2G93A 3SFIA 5EGOB 1VR5A 2H8RA 2V3QA 1QULA 4PP0A 2L7FP 3FGSA 3PM1A 4ZE9A 4GWOA 3CDLA 4H5FA 4YB7A 5M3FJ 3RTWB 3IR1A 2D3IA 4M3BA 1PBQA 2V3UA 5JTYB 3CQZJ 1Z7ME 2E2HJ 1OJLA 3BG5A 3FVOA 4KHZE 3MZ1A 1Y20A 4FE7A 4FEBA 1QW0A 1MY0A 1I6AA 3IJXB 3B6QA 1FQFA 5FHMA 2HYJA 3N26A 5F1JA 2OZZA 4XICA 4EQ9A 1IRZA 4JWOA 4OVJA 2ZYKA 2GRVA 3GZGA 1ORKA 3A02A 5DT6A 5AA2A 1LAGE 1ETVA 4XRSG 3RQIA 4R2FA 2XPUA 1D3KA 4HS7A 2CZLA 2HZKA 4DZ1A 1MH3A 2DP8A 1GTKA 2XB0X 3CFLA 5ICTA 2DA1A 2I6EA 1TWYA 4OWDA 1B5JA 1UQWA 2H25A 5F27A 1N76A 5H8FA 3RZDJ 1ANFA 3TW7A 2X9DA 2ZNSA 1EH3A 2O8KA 3Q27A 3HDDA 2V93A 3K0VA 3BG9A 3E9XA 1RPWA 3BG3A 1T56A 1A54A 4DW6A 2LD5A 1JKQC 1MQIA 1OQGA 2BJJX 3N6UA 1MH4A 5CRYA 2X48A 1B46A 1WGXA 4LQ5A 3LSGA 1LCFA 2EZHA 4AB5A 3O8GA 1IV6A 1MBJA 5JLWA 1B5HA 4A3LJ 4IGRA 3BR1A 1HDDC 1Z77A 1AKHB 2NVYJ 4NF5A 3QYTA 2PT2A 1ETKA 3BBRA 9ANTA 1IXGA 3MBPA 5FHNA 3WHCA 3TMGA 4XRMA 1WCMJ 4GFBA 3DM0A 2PT1A 3EHSA 1R9TJ 4J19A 3T93B 3G7WA 4G68A 4FCYA 1OLCA 4R6HA 1A5JA 1US5A 4OYVA 1LBBA 1B1XA 1B7HA 3CMYA 1P1WA 5DS9A 3ZQHA 2V25A 5CBRA 5IYCJ 1A6IA 3G3KA 5IYBJ 2DS9A 4GFRA 4DZPA 4MIMA 2HZLA 3TEPA 4AB6A 2O7OA 1PB8A 3PU5A 4U2RA 4F1UA 1Z7NE 4E0XA 1RKMA 3NARA 2VKEA 4RBOA 3TP3A 2JN6A 1IUFA 4H0WA 3SESA 2ZNUA 3FV2A 4QSHA 4ZZAA 4MLQA 3D1NI 5ELVA 4LZ5A 5I2KA 4IO5A 2HDDA 2F36A 1M5BA 3TFLA 2GLOA 1B3FA 4XIGQ 1B4ZA 2O7IA 1ITYA 2QJEA 3USDA 5AA1A 4Z7EA 3PPPA 1HSLA 3S1QJ 3K6UA 4BDLA 4YMBA 3C34A 2NWJA 4ZEDA 3KOSA 1HCRA 3V83A 2I48A 2ZYOA 3W15C 1AU7A 2ZMBA 5AA2D 3E4RA 4MFDA 2R93J 3AXFA 3OXNA 1TWCJ 2IEEA 4F2OA 3KJTA 4BBRJ 1SW5A 3PO2J 5DEXB 3PV0E 2LTPA 4F3BA 3DCFA 3H6TA 3CVGA 5J1DA 3MVWA 3EN3A 4WEPA 2VPRA 4GRKA 4IHVA 2X26A 5L8DA 1H45A 1TWFJ 2CRGA 3IX1A 1ZK8A 2DVCA 3BR0A 4X1BA 1GGGA 2VHAA 5EGOA 3ZQIA 1DU6A 4F3GA 2IA4A 1E3OC 4MF3A 3PPQA 3RT8A 3HN0A 2Q2AA 5JTYA 2XXUA 3NAUA 1WODA 3QUFA 4JDFA 4EEFG 4CYCB 4Y52J 5HBCA 3VPRA 5CBSA 2L9RA 1B4HA 3IB0A 2H4IA 4KCDA 2GM4A 3K1MA 5GPAA 4S0HB 3BQYA 1ELJA 1TWAJ 3G1OA 5K7FA 1CB6A 3LSLA 2IAIA 1JVYA 1PDAA 3VDFA 3FK6A 1MM7A 1LFUP 2DWAA 2NXOA 2MSYA 1B0LA 4LZ8A 3HOUJ 2R5YA 2UYEA 3G3HA 4M1VA 1WPKA 3N6TA 3OEMA 1X2MA 3LUYA 3QK6A 3DEWA 1N3WA 4OETA 3UK4A 1IZ1A 1AMFA 3JRFA 2F7AA 1Y4CA 4QIWN 2EZIA 5F04A 4R9GA 1UIUA 4AQ4A 1S7EA 3VXBA 1K61A 2R6GE 3IO4A 3N94A 4H67A 4A3GJ 2XX8A 4TOZA 1RKTA 1DPPA 3MPKA 4A3MJ 2B3FA 2IBDA 3JYRA 1MBEA 3G1LA 4AC0A 4EXLA 4KYSA 3KJ7A 2P1SA 4B4CA 3QUJA 3SEXA 1RESA 4ZZEA 3MQ9A 4C3JJ 2D5VA 1USYH 3VVEA 1WVJA 1FQCA 5L9SA 4OTEA 1SVXB 1VE4A 3DELB 1POTA 3H03A 5E3MA 4UUSA 3SEWA 3A3UA 1OMPA 1AKHA 1B40A 1QUKA 3S9MC 2Y9YA 5EG0B 3GTOJ 4YMAA 3HOXJ 1SI1A 3LSRA 3ILUB 2COBA 2O6AA 4NF4B 2R92J 3CFXA 3ZQFA 2Y7IA 4OEVA 1X58A 1XS5A 2OCUA 3LSFB 1Y4TA 1P1OA 4DXCA 1LB8A 1B0HA 3GTQJ 3HM5A 4M6VA 3K6XA 1MDP1 2OJTA 4IO2A 3H6UA 1B1HA 1SI0A 3OO8A 1JGGA 1FJLA 2VGQA 2I10A 5FTIA 3FJGA 4OFJA 3LC8A 5CC2A 1GV8A 1ETWA 3O66A 1FTKA 3GLBA 4XKRA 3KN3A 2NOOA 4YU0A 1NKXA 2LP0A 3QPLA 2OWTA 3TTMA 2RC8A 4I9DA 4DLDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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