1MH3A

Maltose binding-a1 homeodomain protein chimera, crystal form i
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
421
structure length
421
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTAAAAAISPQARAFLEQVFRRKQSLNSKEKEEVAKKCGITPLQVRVWFINKRMRSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into binding cooperativity of MATa1/MATalpha2 from the crystal structure of a MATa1 homeodomain-maltose binding protein chimera
pubmed doi rcsb
molecule keywords maltose binding-a1 homeodomain protein chimera
molecule tags Sugar binding, dna binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 144
structure length 421
sequence length 421
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF00046 Homeodomain Homeodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.60 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Homeodomain-like 1mh3A03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh3A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh3A01
2HZLA 4ZDMA 3HN0A 1RKMA 4B4CA 2VUMJ 3A03A 4M3GA 4C1TA 2YLNA 5AA2D 3CI8A 1JW4A 3GTGJ 1BL0A 1H44A 1FQFA 4MFEA 1WI3A 1POTA 4PFWA 2R9JA 1NTCA 5K7FA 4WXJA 3TW6A 3VLVA 1UG2A 3T22A 4CYCB 4QRZA 1P7IA 2ONSA 2ZNTA 4ZEFA 4F18A 5H8HB 3HV1A 5FJ8J 3B7DA 3Q0UA 1P1UA 3JRDA 4R74A 1ZIUA 1JTXA 5CMBA 2QJEA 3IH4A 4LQ5A 3TEPA 1GTKA 4E0WA 1GVDA 2ECCA 4RPNA 2QPQA 3IO6A 3HOXJ 4G2ZA 2GBYA 2F7CA 2Z8FA 2EZIA 2HXIA 1MSFC 3GTJJ 3MKLA 4OMBA 3ZQHA 1P1NA 1PUFB 3EHUA 3TP3A 4GF8A 1NK2P 1P1QA 5F08A 4EXKA 1SW5A 2I3WA 3OO6A 1I6HJ 3QSLA 2XX7A 3BG3A 3MQ9A 2P81A 1R9QA 5H8NB 1POGA 3TEDA 4ZE9A 1VI0A 3S1NJ 4AB6A 3VDFA 1EZPA 1A8EA 4X9TA 4THIA 5FKKA 3LNQA 4IHXA 2HEUA 1XC1A 5L9MA 2B3BA 3VE1B 4NF8B 1DTGA 1N0TA 4YMAA 4ZZEA 3DEWA 2VHAA 5EGOB 5TP9A 3O8HA 4S0HB 4LOCA 4H5FA 4IO3A 4F1UA 2DWHA 4DYRA 2HOSA 2UYEA 2VD3A 1LFUP 1URDA 5J1YA 5C3EJ 5ITPA 1VFCA 4G68C 2ZMBA 4K3FA 4Y7NJ 3FD3A 3OELA 2Z8EA 1H89C 4YU0A 3MZBA 1T56A 2M9HA 2K9QA 4A3IJ 4JSDA 1B0HA 2DA3A 1Y4TA 1AOVA 1SFOJ 4FEDA 4A3BJ 1NFTA 1UIUA 4GL0A 1JT6A 4FEBA 4ZEKA 3BR3A 2XXTA 1ZKBA 4PQJA 3Q0VA 4XICA 3PPOA 1H8AC 3OD7A 2ZYMA 4B1RA 1TT1A 3DP4A 2OJTA 4R9FA 1ANFA 2F34A 3CMYA 3PUYE 4YB6A 4MLVA 1B5JA 3PUWE 5I59A 3IOVA 4AYBN 3K7AJ 5I57A 4DXCA 2KT0A 2G93A 2THIA 3FJGA 2YS9A 2QSXA 2O1MA 4BDOA 4GXSB 1SD3A 2NUVA 1N76A 5JTYB 1US4A 3DLNA 2AIXA 4YMBA 2M2EA 4H0WA 1OLCA 2R0QC 3O6GA 2COBA 5DVJA 3G3GA 1S7EA 1BJZA 1IGNA 3JR9A 3RTFB 5F1JA 2Y31A 1NL5A 1B51A 2L7MP 1NNKA 1K61A 4M6VA 2V3TA 2Q88A 2PYYA 3C36A 4PFUA 3RQIA 2ESNA 4QSCA 2GRVA 1PB9A 3SESA 3GZGA 4QF9A 1VNDA 3HGYA 3FKIJ 4M3BA 4DCXA 3BTJA 1IDZA 3UGWA 1MBFA 4A3CJ 4H5GA 1ITYA 1XVYA 3TQLA 4ZEDA 2H8RA 3KG2A 5M5WJ 2OPTA 3HDDA 1NH8A 4FIMA 3LBSA 4BDQA 1MBEA 1N7XA 4ELPA 1G2HA 2X9DA 2AO9A 2EH3A 2XB0X 1VR5A 5HM4B 1GR2A 2RKMA 4ELOA 1YCJA 3O6IA 4C3IJ 4JWOA 3BR0A 2O7UA 3BFTA 1IIWA 3OOAA 1Q1VA 1RYOA 4JX4A 3GTPJ 3GTLJ 2RCAA 4X1BA 4AUXA 1B8IA 2E19A 1X58A 1B52A 1I50J 2CUFA 3O2AA 4Q5TA 2Y7IA 2PVUA 1B7ZA 3L6HA 1II5A 1Y9UA 3RLFE 4R2BA 1XT8A 1B4HA 2DA4A 4KCDA 9ANTA 1PB7A 4NF5A 4AQ4A 1ELJA 3LSFB 2I3VA 4I62A 5AA2B 1SQYA 1FTMA 3QPSA 3RZOJ 4NF4A 5JEIA 3FVNA 4DE8A 1B7HA 2F6PA 1XOCA 1BTJA 3GBBA 2XXQA 1P1WA 4U1ZA 1O7TA 4A93J 1HCRA 3O6HA 2Q2CA 3Q0WA 2E2JJ 3UORA 2VOZA 4QFNA 4XRSA 3G1LA 1QVUA 1PBPA 1ZU0A 3CFZA 4GXAA 5FLVA 2L0KA 5JK4A 4RK2A 2K40A 1FIAA 1D9VA 4G12A 3HOUJ 3O9PA 1B3LA 2NVQJ 3F0CA 4NWCA 3SKPA 1AL3A 3V5AA 1NNTA 1TWAJ 3W15C 4GL8A 4GFRA 4KYDA 1LFHA 1I3QJ 1CE2A 3TODA 3FGSA 3FJMA 5IKBA 2ZNSA 3M3LA 2ZYOA 3E9XA 4OYVA 5HBCA 2ONRA 1B58A 4JWXA 4W97A 4DW6A 4LZ5A 1YAEA 3HOWJ 1WH7A 1H76A 3FASA 4F3SA 2XPWA 4Y52J 4ESXA 3O28A 1B2HA 1ETQA 4F22A 1US5A 2K9SA 3H7MA 2LLKA 1IZ1A 4GRKA 4F2OA 3PUZE 4KR5A 1IC8A 4KFQA 3HGGA 3S1RJ 2O69A 3C35A 4YICA 4X48A 5H8FA 5M3FJ 4IGTA 2A5TA 1JNFA 1ZK8A 2Y9YA 1VFDA 2F7AA 4FE8A 3FVOA 3MJNA 1QULA 1SI0A 2EZLA 3LR1A 3ZQFA 1ZR4A 5I58B 2JA5J 4BDRA 4TQUQ 5JLWA 3TZAA 3D4GA 3DP8A 2EBIA 4UUSA 3A01B 2GHAA 4DCYA 1YPNA 2HAUA 3K1MA 5CMMA 3G1OA 4XKQA 3LSRA 5IYCJ 2O6AA 4GQOA 4FECA 5TPAA 1IITA 1ETOA 1JEVA 5EEAA 4ZECA 3CFLA 5I56B 2IAIA 1Y3PA 3MWBA 1JJ8C 3PPQA 3RY3A 3H6VA 5IYDJ 3VFJA 4M3FA 1XC5A 5I2KA 4DXUA 2Y7WA 4G77A 3QUFA 4RNSA 3CVGA 3H6WA 1JUMA 2WV1A 3C2BA 2EQRA 4BDNA 3U8QA 3N6UA 4HNVA 4RA1A 1LFGA 2GLOA 3Q28A 1LGBC 3QXMA 5IP6A 4KHZE 4H67A 1DSNA 2E2HJ 5E3OA 3N94A 1ZGWA 2F36A 1LSTA 2Q9TA 3R26A 3VXBA 2OCUA 1WCMJ 1FQAA 3T9HB 4KD5A 5ICQA 4IHVA 2XXXA 1R9LA 4ZEIA 3GXAA 2DMUA 4BKXA 2OWSA 2QF7A 3K6VA 3SJMA 5BNGA 1O4XA 5F27A 1JTYA 4YKIA 2REGA 2HXOA 1JEUA 3CSBA 1D3KA 4G68B 4LZ8A 4XTCQ 2HQ0A 1OQGA 2XXRA 5A5XA 2PMZN 4BBRJ 5IOYA 3Q26A 4OEVA 1RR7A 1W0UA 1H88C 1MBGA 3FV2A 1OVTA 4NF6B 3E3KA 1XS9A 5IYBJ 3QYTA 1UMQA 4DZJA 4GFBA 2GM4A 1LCFA 2Z8DA 1ETYA 1B9JA 2Z22A 3K00A 3TUSA 1URGA 1B5IA 4WEPA 2F5XA 1A54A 5H8QA 5DTDA 3BT9A 2FYIA 5EDNA 2CQQA 1DPEA 1YRNA 4YB7A 4Q8RA 4A3EJ 1NMUA 2A5SA 3TCFA 3MVYA 3MP8A 4QSHA 4RK9A 1WGXA 4RXLA 3MVZA 3BQZA 1LFIA 1QVTA 1JUPA 4IGRA 5C4JJ 3RPWA 3S9NC 4GD5A 1PBQA 4F1YA 4RYAA 3VVDA 3Q29A 2XGCA 4EF1A 1P1OA 1JKPC 4U4SA 2DA5A 2DWIA 1B1HA 1QUKA 3PM1A 3E13X 3KJ7A 4E0XA 5E3NA 4OTEA 1UTHA 2MGQA 3PMWA 5CRYA 3OSRA 1AU7A 3BTLA 4OETA 3IL1B 4KI0E 4LONB 1ZR2A 2CMOA 3SEVA 4PFTA 2DXYA 3PGFA 2LTPA 4HW8A 1JJ6C 3IK6B 3BR2A 5KCJB 4BDMA 1LCTA 4DIGA 4DYQA 1XG1A 5ICTA 4KPTA 2DA6A 2ZNUA 1MNMC 3IB0A 2JK3A 1EH3A 2DE2A 4QSDA 3TTKA 2QMWA 2O68A 1A6IA 2FNCA 1BP5A 2IEEA 2H5YA 3KJTA 4EF2A 4JX6A 3O8GA 5CI5A 5EHSA 3MUQA 4EUOA 3G7WA 1MM7A 2DJNA 3SEYA 1HSLA 4A3LJ 3FVKA 3UN6A 1B72A 3ONMA 4M3EA 5FTIA 4IEJA 5KDTA 2DVCA 1LBBA 2X48A 5J3LA 4RDUA 1SW2A 4O3BA 3B6WA 1MY4A 5IP9J 2H25A 3ZKKA 2Y7PA 3KN7A 4FTHA 1MS7A 3U72A 1DMBA 3FJ7A 3EN3A 1ETVA 2H99A 3S4UA 1SYHA 3BR1A 4A3MJ 4YKJA 3OXNA 3TKDA 2L7FP 3H0GJ 2CUEA 3FIWA 4XK4A 2Q89A 4PP0A 3VPRA 1MRPA 5KZTA 3DCFA 4HTGA 1OLAA 1D9YA 3TCHA 2H1KA 2VKVA 1XHYA 2DYXA 4XKPA 3K6XA 2I48A 2ONKE 3KOTA 3ZSFA 4F3BA 4FORA 1M5CA 4C1UA 4G8HA 1MPCA 4A3GJ 1W0TA 2GFEA 2DMNA 4R6YA 3OO9A 3CRBA 2XXUA 5EG0A 1ZTRA 1M5BA 1BW6A 1TC3C 4CYCA 2V3QA 1OCPA 4XRMA 2X6OA 3T96B 2M8GX 2E1OA 5M5YJ 3H6TA 1ZLQA 1MSEC 4ISUA 1U9OA 3Q27A 1APLC 5AA1A 3LSXA 1JKRC 4Q0CA 3LSWA 4ND9A 1OCTC 3A02A 2X7PA 3S17J 3ZQIA 4Z0IA 2CU7A 3WAFA 4IHWA 3IORA 3KSJA 1HF0A 1CB6A 3I6VA 4A3FJ 3LSGA 1PUFA 1O64A 1MXYA 3HBLA 2W7YA 2PT1A 3BG5A 2O84X 3RTWB 1UTBB 5H8NA 1QPIA 4H65A 3U1OA 3KZGA 4A3JJ 3EPEA 1IV6A 3S15J 3IH2A 4XIGQ 4OWDA 3ZQGA 1EZ9A 1B7UA 4BDLA 3RNNA 4NF8A 2X7QA 2E1SA 3TMGA 2DSFA 4R6KA 1U78A 2Y9ZA 5EGOA 2LY9A 1N3XA 3G3JA 4U4XA 2FD5A 4EQ9A 4R72A 1NK3P 1R1NA 2R5ZB 2XHDA 2FJ1A 2QS4A 3SFIA 3IOUA 3RGYA 1JVYA 3S1MJ 1QJMA 1LB9A 1Y3QA 4IY6A 3T93B 4GVOA 1USYH 5EF6A 3FATA 4LVQA 2DXRA 2Y7KA 3KOSA 1U9NA 2FA7A 2DA7A 5L8DA 1A99A 1MXWA 3T9XB 1WDNA 2PX1A 3W9WA 4D5CA 3DP6A 4EEFG 3G1MA 4NMYA 2HQ5A 4OHNA 1R9TJ 1PC3A 1M5FA 4OFLA 1B4ZA 3KN3A 2I49A 4XIDA 1BA5A 1VF9A 2HYJA 2ECBA 4P0IA 3CDLA 3THIA 1EZOA 5F1QA 4F29A 1NH7A 3S9MC 4HS7A 1IDYA 2AYSA 1FQDA 4I8CA 1USYE 1LAGE 2RAEA 5E3LA 3O29A 2CQXA 1U8BA 3G3IA 2N8GA 3K1NA 2JA7J 2UVGA 3WHBA 2QL3A 3IOWA 3MW0A 2FQ4A 4TLLB 3NAUA 2F7BA 1VSOA 3HHFA 4H6DA 1A55A 2DWAA 1S7YA 2DMTA 1MM6A 4PFYA 2UVIA 2Y2ZA 1ETXA 1TWYA 3C33A 4OFOA 3S14J 4IO5A 4Z7EA 4BXXJ 4L17A 4V2FA 2XX8A 4X6AJ 1JW5A 4DDDA 1IQ7A 3CIJA 3I4NJ 4UA8A 1K83J 1MXUA 3OMBA 5M5XJ 1B40A 3FZVA 1P99A 3K01A 4LP2B 1B3GA 5FKNA 1D4NA 3PUXE 5DT6A 2ID6A 1B3FA 4GLIA 2VKEA 3T9VA 3E4RA 1TWCJ 3S1QJ 5I2KB 3LC8A 4OERA 1WVJA 3SEUA 3ZKLA 3JRHA 4IO4A 2VPRA 4FJPA 2IA4A 1Y1VJ 2NOGA 3TYHA 4ZE8A 2F8DA 4D7NA 5M3MJ 1XVXA 2V25A 1FIPA 5F0FA 4NTLA 2HDDA 2XD2A 1QUIA 3MVWA 1UHSA 3OIOA 2Y7RA 4N13A 2QS2A 4JB7A 2XXVA 2M0CA 4F31B 4UUTA 2GH9A 1A40A 2L7ZA 1URSA 1I69A 3FK6A 1MPDA 5CMKA 3JRBA 1BLFA 2OF7A 1Y1MA 3K2DA 1TWFJ 1FTJA 4RPOA 3TFLA 4QFKA 2G0EA 3MPKA 3HCQA 5FTHA 1QKAA 1AKHB 1ATGA 4EQBA 3IB1A 5HODA 2HOTA 1Y4CA 1SW1A 4QSEA 3FISA 2UVJA 1HOMA 1EU8A 3CG3A 2IBDA 2YU9J 1Y1WJ 2RC8A 5AA2A 4DZPA 4QHQA 4FCYA 2W48A 1QRYA 3KGCA 4OZ9A 1SYIA 1OQHA 3BKIB 1IXCA 3EHTA 4EDPA 1X2MA 1A7LA 5AA4B 1IXGA 4OFJA 4U22A 1PEBA 1WODA 3Q3SA 3TCGA 2JJ7A 3OEKA 1SVXB 1NKXA 3H06B 3TDJA 2UYFA 2LK2A 2I58A 2NVUB 2WAQN 4O3AA 4J19A 5TU0A 1MXVA 2OLBA 3BTCA 4A69C 3HSTA 3QPLA 1GUUA 2XPUA 1VE4A 5DYHA 2O8KA 1HLVA 5K7ZA 4AB5A 1S9TA 3FIRA 1B6HA 3P7IA 1DU0A 2ZB9A 1H43A 4MH5A 1SW4A 4QFOA 2M8CA 5DVIA 2L9RA 3TTNA 4R9GA 1GV8A 3MAMA 3TELA 5IAIA 2ALUA 2H4IA 1MH3A 3T9UA 1RYXA 4B3AA 4OENA 2LVSA 2JA6J 4IO6A 1EF4A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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