3RT6B

Fluorowillardiine bound to the ligand binding domain of glua3
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
RTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGTPVNLAVLKLSEQGILDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 3
publication title Mechanisms of Modal Activation of GluA3 Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 78
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-05-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rt6B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3rt6B02
3H03A 1PB7A 3IR1A 5DVIA 3R26A 1HSJA 5H8SA 5FHMA 5CMKA 1IXGA 3VVDA 1DPPA 1MXXA 4NEDA 2XXVA 4Q0CA 3T96B 4EQBA 4GQOA 3A09A 3VLWA 3FJGA 1NNFA 4EQ9A 4WEDA 3PPPA 3O6IA 5AA3A 2RCBA 5I56B 3Q25A 4ZDMA 4F3GA 4JBZA 3EHTA 4R2BA 2DXYA 3PUXE 4N6PA 4DXBA 2UVJA 2ABHA 4QHQA 3U1OA 4H8JA 1R9QA 1MDP1 3TEPA 5EHMA 5L8DA 1PBQA 3H6WA 5KCJB 2XHDA 1IQ7A 3FXRA 2XXPA 4R6YA 4ZE8A 4YB6A 3ECRA 3VDFA 1MG1A 1SI1A 3IJOB 3SEWA 1PBPA 1OIBA 4H1XA 3GXAA 3EHSA 4POXA 4IGTA 3E4RA 1QVSA 1US5A 1Z7NE 5TP9B 5EYFA 4KCCA 5JEIA 1DOTA 1Z7ME 1NNKA 4YB5A 2XXUA 2R9JA 3DLNA 1WDNA 4JDFA 3W15C 2Y7PA 2DWJA 3O28A 4BDOA 4OVJA 1I6QA 4OESA 5CI5A 1MXYA 5EHSA 3T9HB 2RC9A 1FTMA 2QRYA 1AOVA 3HN0A 5L9SA 4NF6B 4ZZEA 3P7IA 2XXQA 1ATGA 1LAXA 4ND9A 1Y20A 1Y4CA 3LSLA 2D5WA 2AL5A 3AXFA 2GRVA 4HW8A 1IEJA 1FTJA 3K6UA 4YMBA 2QS1A 1S7YA 3WAFA 1FQBA 1LLSA 4ECFA 3DELB 4G68A 3S9LC 2O6AA 1FQCA 1RKMA 2Y84A 4RYAA 2ONSA 3UGWA 5IAIA 2OBGA 2UYFA 3ZSFA 4QFNA 3OSRA 4ZEIA 2PX1A 4TOZA 3QAXA 1TWYA 1DSNA 4GFRA 5I2KB 4ZS9A 3DM0A 3O6GA 4DDDA 1N7WA 2XXWA 2IA4A 3RY3A 2P2AA 5ICQA 1P1UA 2Z8FA 3CSBA 4F1VA 2DWAA 4U1ZA 4R9FA 5L9MA 1Q1KA 2VD2A 3PUWE 4AQ4A 4YICA 3V5AA 3Q29A 3TFLA 3DP8A 4LQ5A 3SETA 4ELPA 3I5OA 3QSLA 1MY3A 4DZ1A 1P99A 3FZVA 2O7UA 1MPBA 4BDLA 1ZBMA 1HSLA 4ESWA 2ALUA 3TAJA 1MM7A 2Q89A 3D4CA 1B3HA 4IGRA 1URGA 2F7AA 4MLVA 3G3FA 1IXIA 3T66A 3B6TA 2OZZA 1SW5A 5DEXA 2XD2A 4WKMA 4YKPA 4MH5A 1OVTA 1MXVA 3FATA 2Y7IA 1SVXB 4XTCQ 4OZ9A 3CR9A 2I4CA 3S9EA 4OQOA 3L6GA 3MAMA 5ITOA 1O64A 4M1VA 1J1NA 3TQLA 1A8FA 3A3CA 1A55A 2F8DA 5H8NA 4U21A 1B0HA 3JZJA 3K0VA 1Y4TA 1POTA 4OWDA 4X1DA 4ZECA 4XKPA 3BKIB 1MY4A 4AB6A 1UTHA 3PV0E 3R6UA 1N0TA 1BKAA 4YZZA 4ZEKA 4FECA 1B1HA 5H8HA 3M8UA 5HM4B 4X48A 4KFQA 3OO7A 2XXRA 2I6EA 3KOSA 1Y1ZA 1HSEA 1IZ1A 4EXLA 3KZGA 3T22A 5CMCA 1WVJA 3IK6B 4F1YA 1BLFA 3TDJA 4YAHX 3I3VA 2UVIA 3TTMA 1LCTA 2XXIA 3FD3A 4JB7A 4MLQA 2Q2CA 1KWHA 3TKDA 4K3FA 4NF5B 2CMOA 1FQFA 3QYTA 1BP5A 4XKRA 5H8FA 3HSTA 3PU5A 5AA4A 3PD8A 1O63A 4MFIA 1LBBA 2V3UA 1PC3A 3U94A 2O84X 4P0GA 3FUZA 1Y3PA 4TQUQ 2Y7RA 1P1QA 5I57B 5TPAB 3VXCA 2IEEA 2RINA 1JW4A 5K2YA 3OO8A 1IIWA 1ANFA 3H6UA 3F11A 3K1MA 3V8XB 4F1UA 3KGCA 1LFGA 1B6HA 2FA7A 4GF8A 3CVGA 4TLMB 4IO5A 4FORA 3IO6A 1B2HA 5FHNA 4RA1A 3C4MA 2A5TA 3EPEA 1N3WA 1LBCA 3LC8A 1B7ZA 4NF8B 5FTIA 3HHGA 3KJTA 2UVHA 4YMAA 5CBSA 3QK6A 4POWA 3S4UA 1S9TA 3VE1B 3VXBA 3V89B 1FTKA 2VHAA 1B5HA 4U2RA 3TCHA 1XC1A 3H6VA 1XVYA 4G4PA 3ZS6A 3FGSA 3Q28A 3TCFA 1N76A 3K6XA 3MC2A 3SESA 4G8MA 3SERA 4JSDA 4DIGA 1MY1A 1URSA 2X26A 1Q35A 2AIXA 3SKPA 3IB2A 2V3TA 1B7HA 2O51A 1ZIUA 5DVFA 3T9UA 4FEBA 3LR1A 3B7DA 2O1LA 2WKYA 4GOTA 1SBPA 3QUJA 1NMUA 3LSXA 2I4BA 4H67A 5KCJA 3ZKKA 2Q9TA 3MPKA 4EF2A 2PVUA 1L5TA 4P11A 3CFZA 2QS4A 2H25A 4FIMA 2THIA 4N13A 1B3LA 2NOOA 2Q88A 1LSTA 3M3KA 3BBRA 1PDAA 4DLDA 3N94A 5TP9A 1SYIA 5DTBA 3QUFA 2ZNSA 4Z7EA 1EZ9A 3IB0A 4X9TA 1MQDA 1R1NA 5I2NA 4OETA 4KHZE 4EXKA 3CIJA 4H5GA 1TFAA 4QSDA 4H0WA 1LGBC 4GD5A 3SEUA 1GTKA 1IUDA 2F36A 1WODA 1XHYA 1GGGA 3OSQA 1D4NA 3PMXA 1MM6A 3U72A 5I58A 2YLNA 4NF4A 1JW1A 3O2AA 3MVYA 4OTEA 3IJXB 4KCDA 2I58A 3RTWB 3H6TA 3SEVA 2PT1A 1VR5A 2QPQA 2DWIA 1LFHA 2DYXA 3CG3A 3PGFA 4ELOA 1Y9UA 4PFWA 2PYYA 2RC7A 2DXRA 1D9YA 4IO7A 3O97A 2ESNA 2DSFA 3M3LA 1MY2A 2XX8A 2NWJA 1N7XA 3U92A 3VVFA 2ZYNA 3SDFA 1NFTA 2HAUA 1P1WA 3OENA 4GRKA 3LUYA 4DXUA 3MP6A 4R74A 3S9MC 3K01A 5AA2A 4IB2A 3PUZE 2VD3A 3O9PA 3RT8A 3T93B 1FQEA 3BFTA 5A5XB 1OQGA 2DS9A 1IXHA 3PMVA 2BJJX 4PFTA 4C1TA 2M8CA 1MH4A 4Q5TA 4G2ZA 3RUMA 5ICTA 4BDRA 3ILUB 4KYDA 2HZLA 3PUYE 3KBRA 5F7VA 2P0SA 3OXNA 4BDMA 2UVGA 1QJMA 3PUVE 3TODA 1GV8A 2XX9A 1USYH 2F35A 1YCJA 1UIVA 3N6TA 4LVQA 1UTBA 2QMWA 3TMGA 5KZTA 3N6UA 2I0BA 1B3GA 1LAGE 3QXMA 4RK9A 5TU0A 1SYHA 3HV1A 1QKBA 4NWCA 1JEUA 4QSEA 3K2DA 4F22A 2GHBA 3CG1A 2OJTA 5CMMA 5DT6A 3UORA 4RPOA 2HZKA 3O66A 1XOCA 4BDNA 1SD3A 1VE4A 3RGYA 4RJZA 3S9NC 2Z23A 1QULA 1MXWA 3FJ7A 3BFUA 4RXLA 1B4HA 4HS7A 3IOWA 3PPQA 1EU8A 3UN6A 2ZYOA 3CRBA 3IL1B 1DTZA 2ZXTA 4XKQA 4EQ7A 1OLCA 4JSOA 3FJMA 3K1NA 5JTYA 2NUVA 2I49A 2H5YA 1MRPA 3OMBA 4PP0A 4LATA 4NF5A 3H7MA 5DYHA 2E1SA 3C34A 1LAFE 3LSFB 3MVZA 4ZZAA 2F6GA 4OHNA 4NMYA 3FVOA 5AA1A 3RQTA 2DVZA 1NH7A 1ZU0A 2F34A 1DPEA 1N84A 1VSOA 4RNSA 2YPNA 3IORA 3TTRA 4LP2B 4FE8A 3U8QA 5I57A 3MZ1A 5H8QA 3GZGA 3CFXA 3TYHA 4G8HA 3O29A 4GL8A 1Y3NA 4R73A 5AE4A 3HPIA 5DVJA 2Q8JA 1B58A 4Q30B 4GWOA 4RK2A 4LZ5A 4BDQA 1BIYA 5HPQA 1M5CA 3MZ9A 4I8CA 4LA9A 5H8NB 1ELJA 3PPNA 2YJPA 4E0WA 4F31B 3HHFA 3FVKA 4R72A 3KN3A 2REGA 5KDTA 1FW0A 4NF8A 4R6KA 3FXQA 1TT1A 3U93A 2H9BA 4U4SA 3K6VA 4QSCA 3G3HA 1PB9A 5I59A 3CI8A 3DP4A 4Q8RA 4KYSA 3OEKA 1M5BA 4FJPA 4IY6A 4LUBA 4RPNA 1Y3QA 1ZTYA 3I6VA 3S2VA 4OENA 1NNTA 2HCAA 2VP1A 2OWSA 1H45A 3FV1A 2O7IA 3MVXA 3IO4A 2PBWA 3LBSA 2QSXA 3WAEA 1B3EA 1PB8A 4KQPA 1B5IA 3MBPA 4PETA 3OOAA 3IX1A 3UA8A 4OFJA 4H8IA 3R7XA 3RPWA 3MJNA 3USDA 3KN8A 2ZYKA 1LFIA 5B70A 4GXSB 4OXVA 3VVEA 1A7LA 1IITA 2XXTA 4PQJA 3ILTB 2OWTA 3TCGA 3KSXA 5H8FB 3KEIA 2I3VA 4IO4A 4KD5A 3C33A 4OEVA 5CRYA 5AA4B 4I9DA 3QIMA 2O69A 3A3UA 3PPRA 2D3IA 2XXYA 1NNPA 1UQWA 1MH3A 3TELA 2OLBA 4U22A 1TFDA 3RN8A 4DXCA 1LB8A 1JNFA 1PEBA 1P1NA 4O3CA 5I56A 4QFOA 1EZOA 3E3KA 2RC8A 1RYOA 3C31A 1QKAA 4QFKA 2Y7KA 3KSJA 4OMBA 1ZJLA 3IAZA 4U4XA 3E9XA 4H5FA 2F7BA 5J1DA 1B52A 2A5TB 2F78A 1A54A 4XIGQ 2CZLA 1O7TA 1N04A 1OVBA 1EH3A 1QUKA 5B7DA 3UIFA 4F3SA 4OERA 5FTHA 4LONB 1FTOA 4YU0A 1A8EA 4OEUA 1VFEA 4G68C 2FNCA 3KFMA 3KOTA 1MQIA 3FVGA 4KR5A 3C36A 2LAOA 1T0KA 4F2OA 4UACA 4GL0A 1USYE 2A5SA 2Z8EA 3C9HA 2O68A 4EF1A 1FCKA 2GFEA 2DQVA 2DE4A 4C1UA 1FTLA 3FV2A 4QRZA 4F2QA 2V84A 4G8NA 4DCXA 1B1XA 4GLIA 3E13X 4HCWA 1H44A 4PFYA 3H06B 4NE4A 3W9WA 4H6DA 5CM6A 1MQHA 3OO9A 3Q27A 1AMFA 2PT2A 2F7CA 5A5XA 4IY5A 1JETA 1AIVA 4LZ8A 4NF6A 3MUQA 1R9LA 5JK4A 1OQHA 3VFJA 4WXJA 3N5LA 1XS5A 5CC2A 4Z0IA 1R6ZA 2X7QA 2V25A 3JV9A 3PPOA 3RT6B 1B46A 3MPLA 1MQGA 2QMXA 3H3GA 2F5XA 1SW4A 3B6QA 4OFOA 1POY1 4EDPA 3FVNA 2FYIA 4LZ7A 1A99A 2AYSA 3TTLA 2DWHA 4XKNA 4C0RA 3IB1A 5I2NB 2AL4A 4ELQA 3KJ7A 4P0IA 1URDA 3FXUA 5I2KA 3RTFB 1SW2A 1YTVA 1QUJA 4M4GA 1MS7A 3GBAA 5I58B 2I0CA 2DE3A 4O3BA 4NF4B 1SQYA 1F9BA 2G93A 2NVUB 3H4ZA 4PE5B 4ESXA 4KPTA 5LOMA 4BLAA 2KLFA 4GVOA 4IO6A 2P1SA 4YKKA 2E0SA 3MP1A 2REJA 3B6WA 4WEPA 2DOJA 2ZNTA 4G77A 3MZBA 3ODBA 1JEVA 3K4UA 1RYXA 3PD9A 4ZEFA 4EUOA 1MXUA 2GHAA 4YB7A 4O3AA 2B65A 1AL3A 2X7PA 5AA2D 3C35A 3TTKA 1JVXA 1LB9A 3MW0A 3OEMA 1CB6A 1XT8A 4F19A 4PFUA 5CMBA 4IO2A 3VV5A 1YAEA 3C32A 1B32A 5AA2B 4FATA 1LAHE 3O6HA 1B7UA 1MY0A 4FEDA 5ELVA 4DCYA 2W7YA 3EN3A 2H98A 2D21A 1I69A 2G29A 2NXOA 3IOVA 1QW0A 1SW1A 5F1QA 3RLFE 4OFLA 3CFLA 2F97A 4NWDA 5HBCA 4IO3A 3EF7A 4JWOA 3M3FA 4I62A 1N3XA 2OCUA 2OK2A 3VLVA 1TXFA 1YPNA 2ZNUA 3L6HA 3T9VA 4R9GA 3K6WA 4G68B 4THIA 4H65A 1MDQA 3TZAA 2I3WA 4X1BA 2XXXA 2ONRA 1UTBB 2F6PA 1FQAA 2Y7WA 2XX7A 2DVCA 1H43A 4JWXA 1FQDA 2B3FA 3DP6A 3HO7A 4OYVA 1JQFA 2V3QA 3N26A 2QJEA 2VGQA 4GXAA 3SEXA 4F39A 2R6GE 2HEUA 3HCQA 2HXWA 1B40A 2GH9A 1SI0A 1H3DA 4JWYA 1D3KA 5BWJA 4TLLB 3FASA 1MQJA 4I1DA 1US4A 3G7WA 4R75A 3IOTA 3THIA 1MPCA 1VFDA 4F18A 2B3BA 1XVXA 4KI0E 4N07A 4AB5A 1IXCA 5K2XA 5TPAA 2DE2A 1DTGA 1MPDA 1Y1MA 4ONYA 2ANJA 2PMSA 2ZMBA 3TTNA 5DEXB 4RY1A 1DMBA 1M5EA 4FAJA 2HFBA 2VOZA 3W9VA 4UA8A 4F29A 4ZEBA 4ELRA 4ZEDA 2V93A 2XD3A 3G3GA 1OLAA 1B5JA 5JTYB 4R6HA 1GVCA 3JYRA 4MF3A 3ONMA 5L9OA 2DP8A 4U1OA 3Q26A 1B51A 2I48A 5ITPA 1ZKBA 1UTHB 2RCAA 1P1OA 3MP8A 2QL3A 1NH8A 1B3FA 4QFPA 5M2VA 4LQ2A 1B9JA 2RKMA 3ZKLA 1B0LA 1II5A 5H8HB 1ZLQA 3MVWA 3TPAA 3K00A 2H99A 1I6AA 1JVYA 3EHUA 3OO6A 2UXAA 4QFLA 3FIRA 4HCYA 1B05A 5I84A 4ZE9A 5ISUA 2RF1A 3T9XB 5H8QB 3K1PA 4KYEA 3MWBA 1QUIA 4GIZA 3CSGA 4F3PA 2QS3A 1MXZA 4MBPA 1A40A 3UP9A 3K02A 4U23A 1EZPA 4XXUA 3RNNA 2HQ0A 5FHOA 3OD7A 1ZMGA 3KG2A 1BTJA 1B4ZA 5KDTB 1NKXA 4JXIA 2R71A 3GLBA 1SDXA 1LCFA 1CE2A 1M5FA 3IOUA 5I59B 3VLUA 3EQ1A 2Z8DA 4HTGA 3LSWA 2ZYMA 1I6BA 4YKIA 1OMPA 3G3IA 3TQWA 4YKJA 4QF9A 1GR2A 2H4IA 3OELA 1NL5A 1H76A 2HAVA 4F3BA 4NTLA 4ISUA 3GBBA 5BUUA 3MQ9A 5IKBA 1S50A 4L17A 3UK4A 1JW5A 3PMWA 1D9VA 2O1MA 4DE8A 2XXHA 2Z22A 1M5DA 1UIUA 5CBRA 3V83A 3TUSA 3SEYA 3D4GA 3KN7A 2Q2AA 4E0XA 2UYEA 1AH5A 2ONKE 4R2FA 3G3JA 2QS2A 3G3KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3H03A 1PB7A 3IR1A 5DVIA 3R26A 1HSJA 5H8SA 4GX4A 5FHMA 5CMKA 2HPGA 4OVTA 1IXGA 3VVDA 1DPPA 4NN3A 1MXXA 4NEDA 2XXVA 4Q0CA 3T96B 4EQBA 4GQOA 3A09A 3VLWA 3FJGA 1NNFA 4EQ9A 4WEDA 2CEXA 3PPPA 3O6IA 1JP4A 5AA3A 2RCBA 5I56B 3Q25A 4ZDMA 4F3GA 4JBZA 4NF0A 3EHTA 4R2BA 2DXYA 3PUXE 4N6PA 1RDYA 4DXBA 1FPBA 2UVJA 2ABHA 4QBAA 2ZZXA 4QHQA 3U1OA 5IZ3A 4H8JA 1R9QA 1MDP1 3TEPA 5EHMA 5L8DA 1PBQA 3H6WA 5KCJB 3IFCA 2XHDA 1IQ7A 3FXRA 2XXPA 4R6YA 4ZE8A 4YB6A 3ECRA 3VDFA 1MG1A 1SI1A 3IJOB 3SEWA 1FBFA 1PBPA 2HHMA 1OIBA 4H1XA 3GXAA 3EHSA 1FBEA 4POXA 1NUXA 4IGTA 3E4RA 1QVSA 1US5A 1Z7NE 5TP9B 1EYKA 5EYFA 4GWXA 4PBHA 4KCCA 5JEIA 1DOTA 1Z7ME 1NNKA 1Q9DA 4YB5A 2XXUA 2R9JA 2JJKA 3DLNA 1WDNA 4JDFA 3W15C 2Y7PA 4PAFA 2DWJA 4QXDA 3O28A 4BDOA 4OVJA 5F24A 1FBHA 1I6QA 4OESA 5CI5A 1MXYA 1D9QA 5EHSA 3T9HB 2RC9A 1FTMA 3BIGA 2QRYA 5ET6A 1AOVA 3HN0A 4I40A 5L9SA 4NF6B 4ZZEA 3P7IA 2XXQA 5ET5A 1ATGA 1LAXA 1LBVA 4P56A 4ND9A 1Y20A 1FSAA 1Y4CA 5DW8A 3LSLA 2D5WA 2AL5A 3AXFA 2GRVA 4HW8A 1IEJA 1FTJA 3K6UA 4YMBA 2QS1A 1S7YA 3WAFA 1FQBA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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