2HCAA

Crystal structure of bovine lactoferrin c-lobe liganded with glucose at 2.8 a resolution
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
publication title Crystal structure of bovine lactoferrin C-lobe liganded with Glucose at 2.8 A resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin (Lactoferrin)
total genus 102
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2006-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2hcaA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2hcaA02
2NXOA 4KYEA 4MFIA 4EF2A 4DZ1A 5DVIA 5BWJA 3PUXE 4HTGA 3M3KA 3FJMA 3Q25A 1B5JA 1SQYA 1A8FA 2Y84A 3TUSA 3TCFA 4XKNA 1MS7A 3V5AA 5M2VA 5HPQA 4Q30B 3VFJA 3RT8A 2A5TB 4ZEKA 3G3HA 2QJEA 1S7YA 4IY5A 1CB6A 1ATGA 2OJTA 2GH9A 5I56A 3KN8A 2B3BA 5I2NA 1EZ9A 3L6GA 3HN0A 5ITPA 3K6VA 4BDLA 4ND9A 4H6DA 1B7ZA 3V89B 3CSGA 3MPKA 4YKPA 5ICQA 3JZJA 1MH3A 2M8CA 3EHUA 4R72A 1B1HA 3KSXA 4P11A 4HCYA 3C33A 2DS9A 1ELJA 1N7XA 4U4SA 4KI0E 1JW1A 3CFZA 4U1OA 5DTBA 1TFAA 1VE4A 1ZJLA 1B40A 3EF7A 3LR1A 2XXVA 1FTKA 1SW4A 5L8DA 3S9MC 3R7XA 2DWAA 1JETA 3TTNA 1LFHA 2Z22A 3RGYA 5B7DA 4YZZA 3DELB 3TAJA 4MH5A 5K2XA 1MXUA 3SESA 1RYOA 4DCXA 2OZZA 2O51A 2RINA 4XIGQ 2VHAA 4L17A 1MQHA 3BBRA 1NMUA 1JEVA 3CVGA 3CFLA 1WODA 2RCAA 3H06B 3C4MA 2Z8FA 3DP8A 3TQWA 1RKMA 3ODBA 3GBBA 2HCAA 1LCFA 5H8QA 3RN8A 3SDFA 2O1LA 3QYTA 4NF4B 4GWOA 4XKPA 1DPPA 4F22A 3N6UA 2A5SA 5KDTA 1LAHE 4KR5A 4DIGA 2VOZA 1DTGA 2F78A 1DSNA 2ZYMA 3K00A 3O6IA 2V84A 3MVWA 4Z0IA 1QVSA 4H1XA 1XOCA 4GQOA 3A3UA 2YPNA 2F7CA 3MZBA 4DE8A 1DOTA 2DWJA 1I6AA 1MM7A 4ISUA 2O84X 4JWOA 3M8UA 1H45A 3T66A 2ZNSA 3K01A 3FATA 2H98A 4KFQA 4LP2B 1B2HA 2NOOA 4NF8A 5ISUA 3MBPA 3FUZA 5H8SA 4X1BA 2O68A 4ZEFA 1NKXA 1PBQA 3AXFA 2H25A 5I2KA 3V8XB 2V93A 3LSFB 1QULA 4NMYA 5I59B 4YB7A 1Y4TA 3VVFA 4WKMA 1N84A 1IXIA 2Q8JA 1AMFA 4TOZA 3DLNA 4MF3A 1MQJA 3IOVA 3MW0A 4I9DA 3TCGA 3KN3A 3IJXB 1IQ7A 1JVXA 3MWBA 3UORA 4AQ4A 3HSTA 1TFDA 4RY1A 5H8HB 2ZYKA 1USYE 3PMVA 1B3FA 3MPLA 4F3GA 2XXPA 1MXZA 1OLCA 5CRYA 2QL3A 3DP6A 1XVXA 4GOTA 4OMBA 2WKYA 4EUOA 5AA3A 4O3AA 3S9EA 1GVCA 4F29A 2XX8A 4JWXA 3H6UA 3RTFB 1B6HA 3CIJA 4LZ5A 1MPDA 2XD2A 4DCYA 3OELA 2DQVA 1S50A 4RPOA 2D5WA 3FV2A 3FVOA 3OO6A 3P7IA 3TPAA 1AIVA 3BFUA 4UA8A 4WEDA 1A99A 3RPWA 1MXWA 1TXFA 1AOVA 5CBRA 2PT2A 4LUBA 3IL1B 5DEXB 2F36A 2LAOA 1NNFA 1QUIA 4Q8RA 3GLBA 2AL5A 2QMXA 1B1XA 5I2NB 1Y20A 2D3IA 4JDFA 1XC1A 4XXUA 1N04A 3K6WA 2PVUA 4R9FA 4QRZA 4PQJA 3W9VA 2FNCA 3WAEA 1UTHB 4IO2A 4F3PA 1N7WA 4F31B 3O9PA 5AA2D 1NL5A 4ZZEA 3RY3A 2OK2A 4RK9A 4N07A 4FAJA 2DSFA 4OEUA 1MY4A 2ESNA 3O6GA 3HHGA 3PGFA 4F1YA 4G8MA 1VFEA 3S9LC 1B9JA 2HZKA 3ZSFA 1LGBC 5HBCA 2UYEA 4G68A 4MBPA 5AA4B 1SW1A 2H9BA 5EHSA 3IX1A 1Y4CA 1MG1A 2Y7PA 1WDNA 3UA8A 2I6EA 4DLDA 4R2BA 5H8FB 3G3KA 5FHMA 2G29A 2F5XA 4F3SA 2H99A 1A8EA 5KCJA 1M5CA 2OWSA 3ILUB 4PFWA 1XS5A 3T9HB 1MH4A 1N3XA 1NH8A 3FVKA 3U92A 2VP1A 1A54A 1YCJA 4PFUA 1LFGA 2R6GE 3MP8A 4PFTA 1P1OA 5H8NB 2AL4A 3HPIA 3PUWE 4EDPA 1OQHA 1LB9A 3C31A 4FIMA 5JK4A 5AA2A 4GL8A 4LQ5A 2DE3A 5JTYB 5L9MA 1UIUA 1H44A 3I6VA 4FE8A 1NH7A 2Q9TA 5F1QA 2NWJA 4F3BA 3OD7A 5FTHA 4H8IA 4FEBA 3K1PA 1EH3A 4XKRA 3PV0E 4X9TA 1Z7ME 1FTMA 1OIBA 3QAXA 3UN6A 1LBCA 2V25A 1UIVA 4N6PA 4ZEDA 4MLVA 4E0WA 5I58A 1B58A 3V83A 4IO5A 3IB1A 2UYFA 1Z7NE 3M3LA 3C35A 5I57A 3SEYA 1R6ZA 2F6GA 3R6UA 5CMCA 2HXWA 4U21A 3OO9A 4R6YA 4NF6B 1B32A 2DE2A 4GRKA 2AYSA 2PT1A 3K6UA 3TDJA 4O3CA 3RNNA 3LC8A 4H8JA 4G68C 3IOTA 3G3IA 1SBPA 2QS2A 1SW5A 1P1UA 4QSEA 1QKAA 1VSOA 3SEWA 2I48A 2HAUA 3GZGA 1QUKA 3RT6B 3RUMA 1MQDA 1B46A 1PB7A 3ILTB 2XXHA 1MY0A 2HQ0A 4RA1A 3RQTA 4NF5B 1BIYA 4IGTA 2QSXA 3U1OA 2ONRA 5K2YA 2GHBA 3H6VA 2AIXA 1B5IA 2V3TA 2YLNA 1IXCA 3MP6A 2YJPA 4EQBA 2I3VA 3ONMA 4POWA 1DPEA 3TTKA 1MPCA 2XX7A 4C1TA 3FXRA 5TP9B 3E13X 3W9WA 2O7IA 4ESWA 1ZLQA 4DXCA 3K4UA 4QSCA 4QHQA 2UVIA 3CRBA 4H5FA 4BLAA 3TTRA 2XXQA 4OHNA 2PYYA 4QFLA 5DVJA 4QF9A 4R74A 4G77A 5DT6A 2ANJA 3GBAA 3VE1B 2Q89A 1B52A 1HSEA 1IXHA 4EF1A 5DYHA 5TPAB 2Y7WA 4ZEBA 4Q0CA 3KOSA 4OFJA 5FHOA 1SYIA 4C1UA 2VD2A 3TYHA 4QFKA 1PB8A 1Y9UA 3S4UA 3WAFA 2XHDA 4RPNA 4OETA 1QKBA 1B4HA 4ONYA 1YTVA 5KZTA 2UVGA 2F7AA 4POXA 3OO7A 2E0SA 2REJA 1US5A 3T9XB 1T0KA 2THIA 3VXCA 3H7MA 3IOWA 3LSXA 4IO3A 3N26A 1IITA 4ZECA 1XHYA 2I4BA 1KWHA 2DE4A 4FORA 4RNSA 5I84A 1AH5A 1PB9A 2R9JA 4RK2A 1OMPA 3Q27A 4KPTA 3IO4A 3ECRA 1NNTA 2O6AA 1AL3A 3PUZE 5IKBA 1TT1A 3IORA 4LONB 4HCWA 3TTLA 3B7DA 1Y1ZA 2A5TA 2BJJX 4G8HA 3PUVE 4ESXA 1I6BA 4F1VA 2HAVA 3JYRA 2Z23A 2P2AA 2HEUA 3CR9A 3PPRA 2RKMA 4G2ZA 3U72A 2ABHA 3C9HA 4LVQA 4F1UA 4YKJA 4LZ8A 2QRYA 4OXVA 2REGA 3KGCA 5AE4A 5TU0A 4PETA 4JXIA 1UQWA 4BDOA 1Q1KA 3T22A 4LATA 1FTJA 3FXUA 1M5BA 3KJ7A 4KYSA 5CC2A 1MXYA 2OBGA 2ONSA 3DP4A 5J1DA 3K0VA 5CM6A 4I62A 3PUYE 4THIA 3KJTA 2OCUA 2GRVA 4GF8A 5I56B 3EHSA 3G3GA 3L6HA 2X7PA 3U94A 3VVDA 2RC7A 4IGRA 4KCCA 1H3DA 3LBSA 3UIFA 4TQUQ 4IO4A 3PPOA 4I1DA 4ELOA 4ELQA 1GR2A 3PPQA 1B05A 1R1NA 1IZ1A 3C34A 4YKIA 4PFYA 1YAEA 4R9GA 4IO7A 4OENA 3UGWA 1MDP1 1N76A 5LOMA 1JNFA 3CI8A 4KYDA 3VLWA 1JW5A 3FVNA 1ZIUA 4ECFA 4R6KA 4ZS9A 1POY1 3KBRA 3ZS6A 1O63A 3B6TA 2I58A 2UVJA 3T9UA 2I49A 4H67A 2Y7KA 4P0GA 4NTLA 4OTEA 5CBSA 3FVGA 5L9SA 2HFBA 4RYAA 3O29A 3PD9A 3HCQA 1JEUA 1SI1A 2Q2AA 3PMXA 5H8QB 3O97A 4I8CA 4PP0A 4M4GA 1EZOA 1FW0A 4YMAA 3TQLA 5KDTB 3MVXA 2ZMBA 3CG1A 3CFXA 3OENA 1Y3PA 3E9XA 3G3JA 2W7YA 4GLIA 4R2FA 4U22A 4H0WA 1NNKA 3KN7A 1MQGA 3IK6B 2XXRA 4R6HA 1LFIA 5I59A 2UXAA 2G93A 3JV9A 1MM6A 1ZTYA 4JSOA 3VV5A 4Q5TA 3TFLA 3MC2A 3QIMA 3KOTA 5ITOA 2IA4A 1LAGE 3TEPA 4KQPA 1IIWA 2DVCA 2QMWA 5L9OA 4YAHX 4GFRA 5H8HA 4Z7EA 3QUJA 4NF8B 5FHNA 1USYH 3TELA 3PPPA 3A09A 3HHFA 3KZGA 3OEKA 3PMWA 3EHTA 4OYVA 1EZPA 1B0HA 4ZE8A 2RC8A 3MVZA 5I2KB 3E4RA 3OOAA 4YB6A 1P1QA 1D3KA 3FGSA 1XT8A 1RYXA 2XXUA 1F9BA 2XXTA 3O2AA 4K3FA 3D4CA 3QXMA 1O64A 4O3BA 2DXRA 4QFOA 3OXNA 3T9VA 2PBWA 1B51A 1FQEA 4TLLB 3RTWB 3MZ1A 2F7BA 3M3FA 2F97A 2XX9A 4E0XA 3E3KA 5A5XA 3IB0A 3G7WA 1I69A 5CI5A 5EHMA 3CG3A 1FTLA 3UP9A 4BDNA 4X1DA 3SEXA 3LSWA 4X48A 1H76A 3D4GA 3H3GA 3TZAA 4IY6A 1J1NA 5DEXA 2D21A 4ELRA 2XXXA 1HSJA 3IB2A 3FZVA 2PMSA 3OO8A 5F7VA 4OEVA 4BDQA 4M1VA 4U23A 1LLSA 3MUQA 1PDAA 1UTHA 3N5LA 2DOJA 3VDFA 3S2VA 2QS1A 3ZKKA 2Z8DA 1S9TA 2ONKE 4LQ2A 1YPNA 1O7TA 2V3QA 4OESA 4JB7A 3THIA 3K1NA 1LB8A 1FCKA 5FTIA 2V3UA 4FATA 5BUUA 2H5YA 2KLFA 2Q88A 4ZDMA 1FQCA 1MXXA 2F35A 2OLBA 4ZE9A 5IAIA 2DVZA 1B0LA 3RLFE 3B6QA 1MY2A 3QUFA 1R9QA 5AA4A 1CE2A 2X7QA 1ZKBA 3Q29A 1EU8A 1LAFE 3TODA 1FQDA 3F11A 1TWYA 1P1WA 1B7UA 5H8FA 3W15C 4WEPA 2FA7A 1SD3A 4NWDA 4OQOA 5HM4B 3IOUA 2B3FA 3OSQA 3T96B 1M5FA 2F34A 2P0SA 1HSLA 4NE4A 1JW4A 3QSLA 4ZEIA 3BFTA 1LSTA 3I3VA 3PPNA 3B6WA 2DXYA 2VGQA 3KEIA 3K02A 4G68B 2NVUB 5H8NA 4OFOA 2ZXTA 4N13A 1DMBA 4FECA 1A40A 1IUDA 1BKAA 1MQIA 3U8QA 3OMBA 2Y7IA 3FV1A 4NEDA 4JWYA 4KD5A 3OSRA 5KCJB 5JTYA 1POTA 3LSLA 2O7UA 4YMBA 1GV8A 1OLAA 1Y3QA 1MRPA 4F2OA 4DXUA 4F19A 2PX1A 4EXKA 4ELPA 2DYXA 2QS4A 3QK6A 4HW8A 1N3WA 1UTBB 3TMGA 3TKDA 1UTBA 4LA9A 3C36A 3FXQA 1DTZA 1PBPA 3G3FA 1GGGA 4PE5B 3VLUA 1A7LA 5AA2B 1B3EA 4RJZA 3PD8A 3SETA 1IXGA 2Z8EA 5CMKA 2XXWA 4XKQA 2IEEA 4OZ9A 4GVOA 3SEVA 2RC9A 4R75A 3FJGA 3VLVA 4NWCA 4OWDA 1MY3A 1M5DA 3PU5A 1FQFA 2ZNTA 2I0BA 3KG2A 1B3HA 3MVYA 1B3GA 1D9YA 1NFTA 2GFEA 4EQ9A 3USDA 3VXBA 5CMBA 2F6PA 4FEDA 2E1SA 3H03A 2DWHA 1PEBA 4YICA 3TTMA 4NF6A 3H4ZA 1SW2A 4DDDA 1FQBA 2OWTA 4HS7A 2RCBA 4GXSB 1URGA 3S9NC 5DVFA 4XTCQ 4ZZAA 5A5XB 3FASA 4AB6A 2XD3A 5I58B 4JSDA 4EQ7A 1QUJA 1VFDA 1B5HA 3ZKLA 3MJNA 5I57B 1JQFA 5CMMA 2ALUA 1XVYA 4H5GA 3IO6A 3I5OA 1QW0A 4F39A 3GXAA 1BP5A 2VD3A 3R26A 4NF5A 3T93B 2CMOA 2I0CA 2I3WA 1BTJA 5AA1A 3N94A 5JEIA 1H43A 3SEUA 1LCTA 3MZ9A 3DM0A 1MXVA 3OEMA 1ZU0A 3IJOB 4GXAA 4LZ7A 1B3LA 3FIRA 1SI0A 1A55A 3Q28A 1R9LA 3HO7A 4JBZA 1VR5A 5ICTA 3K1MA 1FTOA 4G8NA 1D9VA 5TP9A 1Y1MA 4BDMA 3O6HA 4NF4A 1MPBA 1SDXA 1Q35A 3U93A 1MDQA 1II5A 1OQGA 4P0IA 3C32A 3VVEA 4GIZA 2O1MA 4OVJA 1D4NA 4QFPA 1FQAA 3TCHA 3FJ7A 4TLMB 1URSA 4GD5A 2RF1A 4F18A 1M5EA 1JVYA 4QSDA 2H4IA 4G4PA 1LAXA 1Y3NA 2ZNUA 4H65A 5TPAA 1P99A 2XXYA 4UACA 4C0RA 5ELVA 2FYIA 3CSBA 2I4CA 4KHZE 2UVHA 1OVTA 3LUYA 3KSJA 4AB5A 3EPEA 3H6TA 4YU0A 3SKPA 4OFLA 2DP8A 2QS3A 1NNPA 3FD3A 4EXLA 1IEJA 3KFMA 1B4ZA 1B7HA 2Q2CA 2F8DA 2Y7RA 2R71A 1WVJA 4MLQA 3O66A 4OERA 2XXIA 1PC3A 4IO6A 1URDA 2ZYOA 2DWIA 4FJPA 2HZLA 3MAMA 1LBBA 2P1SA 3MP1A 4GL0A 3IR1A 3Q26A 4R73A 4YB5A 2ZYNA 5B70A 1ZMGA 1ZBMA 3K6XA 4U2RA 3EQ1A 1I6QA 1QJMA 3SERA 2NUVA 4F2QA 2QPQA 3N6TA 4U4XA 2GHAA 2X26A 1OVBA 3H6WA 3EN3A 4U1ZA 2B65A 1SYHA 1US4A 3IAZA 4WXJA 2O69A 4IB2A 3K2DA 3A3CA 1P1NA 1GTKA 1BLFA 1SVXB 3HV1A 1N0TA 4DXBA 3BKIB 4QFNA 3MQ9A 1ANFA 3UK4A 1L5TA 4KCDA 1MY1A 4BDRA 2CZLA 5EYFA 4RXLA 3O28A 4YKKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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