2HCAA

Crystal structure of bovine lactoferrin c-lobe liganded with glucose at 2.8 a resolution
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords Lactotransferrin (Lactoferrin)
publication title Crystal structure of bovine lactoferrin C-lobe liganded with Glucose at 2.8 A resolution
rcsb
molecule tags Hydrolase
total genus 102
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2006-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2hcaA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2hcaA02
5I2NB 1EZOA 4THIA 4H8IA 3G3GA 3HHGA 1I69A 5AE4A 4WEDA 3V8XB 2GRVA 5H8FA 5A5XB 3KN3A 1B5JA 5TPAA 4PFUA 3JZJA 1I6BA 3DELB 1D3KA 2THIA 2I3VA 1MH4A 1B4ZA 2ZNUA 4Z0IA 4RJZA 3VDFA 3OEMA 2UVIA 1NFTA 3KSXA 3GXAA 1OQHA 1MQGA 1NNPA 3QK6A 2Y7KA 4YB7A 2F8DA 3OO6A 3K02A 5FHMA 4NTLA 1T0KA 4EF2A 2ZNTA 5KCJB 4WXJA 1SI0A 1Y3NA 2QMWA 3FIRA 4PFWA 4H0WA 2XHDA 5KZTA 2WKYA 4IO2A 3MZ1A 4G2ZA 1ZKBA 3O66A 3WAEA 4UACA 2Z8EA 3D4CA 4YU0A 3M8UA 2Q9TA 3K6VA 4F39A 4R6KA 5ELVA 2X7QA 4ZDMA 1GTKA 5H8FB 2DVCA 2XXXA 3BFUA 3IB1A 5TPAB 4F1YA 1IQ7A 1USYE 4DCYA 3T22A 4N07A 5I56B 3OXNA 4EQ7A 3C34A 4U2RA 1MDP1 3OMBA 4F1VA 2XXRA 4G4PA 3QXMA 4QFKA 3U94A 1N3XA 2R6GE 1MQIA 2DVZA 2PX1A 4TQUQ 1H3DA 1D4NA 4YB5A 3FASA 4OTEA 2YPNA 3W9WA 1SW1A 3PPPA 3FV2A 3FVKA 2NWJA 4HCYA 4MLVA 3SEVA 5BWJA 1ZJLA 5H8NA 4G77A 2DE4A 4RY1A 4HTGA 3RT8A 1WDNA 2OCUA 4NF5A 2ZYMA 1PBPA 5L8DA 4LUBA 3N5LA 2Q8JA 4GQOA 5H8HA 3FJGA 2O1LA 1Y4CA 3VVDA 2ABHA 4WKMA 1MDQA 3GLBA 3QUFA 2REGA 4QFPA 1EU8A 3R6UA 2H9BA 3BBRA 1YPNA 3TTLA 4GLIA 1USYH 1N84A 4AB6A 2P0SA 3H6VA 4MLQA 1Q35A 4OETA 3WAFA 4YAHX 1IITA 4FAJA 1F9BA 3CFZA 4FECA 1MXZA 4G8HA 4I1DA 3IO6A 4MFIA 3CG3A 2DSFA 2G29A 5H8NB 1R6ZA 3SEWA 1LBCA 4QRZA 2DYXA 3RN8A 4TOZA 2XD3A 3HN0A 1OIBA 1NNFA 4LZ5A 3CR9A 3MPLA 3ODBA 4U1ZA 4NF5B 1MPBA 4M1VA 2NXOA 2RC7A 1H76A 2QS3A 3I3VA 5IKBA 5F1QA 4O3CA 5H8HB 4H5GA 4BDRA 1AH5A 1B3LA 1FCKA 1M5BA 2ALUA 3I5OA 4F2QA 3FVNA 1JW5A 1B7UA 3LSWA 5I57A 4IY5A 1VSOA 4Q5TA 1AMFA 4KQPA 3H6UA 4F3BA 1MPCA 4XKNA 4M4GA 1MG1A 1SDXA 4RK9A 3IX1A 1QVSA 5CMMA 1PB7A 5AA2A 3PUWE 5CM6A 1LAFE 1R9LA 4JBZA 3PPNA 2Q89A 1LAHE 3USDA 2QS2A 4ELOA 4DCXA 4QFNA 2F34A 2OBGA 2H99A 4EXLA 5B70A 4MBPA 4H8JA 2RC9A 3PD8A 4YICA 3TCFA 3ZS6A 2GFEA 3MJNA 4FATA 2DXYA 4IO6A 5FHNA 2XXHA 1ZBMA 4MF3A 2F5XA 2HZLA 1MM7A 3MP8A 3V89B 4EQBA 3KOSA 3RLFE 4F2OA 1I6AA 1LCFA 4LP2B 3DP6A 4NF4A 4H6DA 5I57B 3SEYA 2IEEA 4G68C 1XVYA 1II5A 3HO7A 5I84A 5CMCA 1US4A 4EXKA 1MQDA 5I59A 2DE2A 3TQWA 2XXUA 4NE4A 3DP8A 3FZVA 5AA2B 4NF6A 4O3AA 2V84A 2VHAA 2A5TA 3TUSA 2E1SA 4OVJA 4GRKA 4JWXA 1WODA 4P11A 4TLMB 4HCWA 3ECRA 4IGTA 1BLFA 3B7DA 3LUYA 3PD9A 3PUXE 1FQFA 3QSLA 5JTYA 2OLBA 4EQ9A 1A54A 5A5XA 5L9SA 4XKRA 3TCHA 4YMAA 4OESA 1ZLQA 5FTHA 3S9NC 2A5SA 3VVEA 3PMVA 1BKAA 3CRBA 4F22A 1H45A 3K6WA 2ZNSA 4QSDA 4NF4B 4QFOA 3RTFB 1TFAA 4KI0E 4JB7A 3Q29A 1P1OA 3MP1A 4GOTA 4C0RA 1B6HA 1NL5A 3QYTA 4E0XA 4QHQA 3A09A 3EF7A 3K1MA 3HSTA 3FJ7A 5ICTA 4NF6B 1LGBC 4R2BA 5KDTA 2VD2A 3B6WA 2A5TB 3T9VA 4BDNA 4KR5A 3MW0A 1A55A 3VVFA 3SEXA 4LZ8A 1IXHA 4FEDA 3A3UA 3OEKA 3VE1B 3JYRA 1WVJA 1MY1A 1SW4A 4OQOA 3CFLA 4ZECA 2H98A 1UIUA 2R9JA 1IXIA 5JTYB 3IB2A 3OSRA 1NNTA 1SYHA 1MXXA 2QS1A 1FQAA 5I56A 1GV8A 2PBWA 4XXUA 2OK2A 1SI1A 2VGQA 1A8FA 4R72A 2CZLA 4R9FA 3SDFA 1P99A 2XXWA 2ONSA 1P1UA 4ELRA 4KHZE 2V3UA 1FW0A 4GWOA 3UN6A 4ZZAA 5AA4A 4E0WA 4GF8A 3TMGA 3O6GA 3TEPA 4KCDA 3IL1B 3B6QA 3FV1A 5KDTB 4XIGQ 2HEUA 1TT1A 4DE8A 1AOVA 1N0TA 2Y84A 4KD5A 3I6VA 3RNNA 1M5DA 3FVGA 2O6AA 3C9HA 4K3FA 3IR1A 3HCQA 1MXWA 1RKMA 3EQ1A 3KJTA 4GIZA 1UIVA 4R9GA 4PETA 2PMSA 4DZ1A 1DTZA 1B3FA 4FORA 4RPOA 1QKAA 2OJTA 4OWDA 2RC8A 4ECFA 3H3GA 3K0VA 1LFHA 1IEJA 2XXQA 4OFOA 3SERA 2V25A 4Q0CA 3HHFA 3PUZE 1MXVA 3PMWA 3U72A 3RPWA 4ZZEA 2R71A 3MVZA 4LVQA 2VP1A 3K1NA 5AA4B 3IOVA 3TDJA 1SD3A 4BDOA 3EPEA 1PB8A 3FXRA 3TCGA 4H5FA 2DP8A 5CRYA 4YKPA 1P1QA 3BFTA 3MBPA 3M3KA 3FVOA 3MVYA 3CI8A 5DEXA 2DE3A 4KCCA 1S9TA 3CSGA 4QSEA 3VFJA 5H8QA 1XVXA 2B3BA 1TWYA 4JWOA 3VLUA 1S50A 1PEBA 1POY1 1MQJA 3RQTA 4R6YA 3PPOA 3EHUA 1US5A 3PMXA 2DWIA 2W7YA 1A99A 3FXQA 3IJOB 4PFYA 4FIMA 5I58A 3TAJA 4RA1A 5CI5A 3G7WA 2Q88A 4Z7EA 2XXYA 4IB2A 3VLWA 3HV1A 3FGSA 3N6TA 1XC1A 4LZ7A 3K6XA 1D9YA 3TFLA 1JNFA 3OO9A 1LCTA 2DS9A 1XHYA 3KEIA 1FQDA 2AYSA 2O51A 2ZYNA 4MH5A 3K6UA 3O9PA 3UA8A 1UTBA 4ELQA 1MY4A 1LAGE 2I58A 3C4MA 5DEXB 1YCJA 3ZKLA 2Z22A 4RNSA 3T93B 1XT8A 2UVJA 3P7IA 3C36A 1JW4A 4IO5A 3OD7A 3Q27A 5H8QB 1Y1ZA 1M5EA 2XX9A 1AL3A 3CFXA 1PBQA 1O64A 1PC3A 3KGCA 1HSEA 1ELJA 2FNCA 1XS5A 3N6UA 3U8QA 1Y1MA 2F6PA 4XTCQ 4YKIA 4BDQA 5I58B 3ONMA 5ITPA 5JK4A 1A8EA 5CC2A 2O69A 3K2DA 2DXRA 3TTRA 1GVCA 3IOTA 1OLCA 1B3EA 3R7XA 2QMXA 2RCBA 2ZYKA 1I6QA 2H5YA 2XXVA 4N13A 4IO4A 4NEDA 1CB6A 4F3PA 4P0IA 4NWCA 1P1NA 4KFQA 3E3KA 3RTWB 2ANJA 1J1NA 5ICQA 2O7IA 1S7YA 3OOAA 4H1XA 1Y4TA 1UTBB 4DXUA 4U21A 2PT1A 1O7TA 3MP6A 1B58A 3MVWA 3IJXB 1BP5A 1B32A 4IY6A 2ONRA 2I48A 3H03A 4LQ2A 2KLFA 3G3HA 3KFMA 4LONB 2IA4A 4DIGA 5EHSA 4GVOA 1ANFA 2H4IA 1P1WA 4IO3A 3KSJA 4GFRA 4XKQA 5L9MA 4ZEIA 4ZE8A 4TLLB 3K4UA 1Z7ME 1LB8A 2D21A 3IAZA 4JSDA 4WEPA 2HAUA 4U22A 1TXFA 1RYXA 3OO7A 3R26A 2X26A 2Y7PA 3E4RA 4YZZA 1EZPA 1FTMA 2Z23A 3QIMA 1YTVA 3O29A 4NWDA 2Y7IA 2P1SA 4XKPA 1AIVA 1NKXA 4F29A 4ZS9A 1QW0A 4ZEDA 1FQEA 3Q28A 4H65A 4NF8A 3V83A 3N26A 3T96B 2AL4A 1VE4A 4R74A 2OZZA 1MRPA 3CSBA 1SW5A 2G93A 1PB9A 2F78A 4U23A 4F3GA 1MXYA 5JEIA 3DP4A 2F7AA 1NH8A 1DPEA 4RK2A 4R73A 1DOTA 1H43A 1VFDA 3KBRA 4F19A 1FTJA 1QUIA 4G8NA 3QAXA 2DOJA 1OVBA 1SBPA 1VFEA 1NMUA 3S9MC 3L6HA 4ESWA 2QSXA 2V3QA 1B2HA 3JV9A 1JEUA 1LBBA 4F1UA 3FUZA 4RYAA 1B1HA 2I49A 2I0CA 4QF9A 3PU5A 3K00A 4NF8B 2NVUB 3PUVE 2PVUA 1N3WA 4F31B 3TTMA 4GD5A 1B40A 1QKBA 1OLAA 2ZMBA 3H6WA 4R2FA 2UYFA 3W15C 2PT2A 3KZGA 5DVFA 1FQBA 4X1BA 4FEBA 5K2YA 1IZ1A 3VLVA 3IK6B 1ZTYA 1MY0A 4EDPA 1M5FA 1KWHA 4RXLA 4PFTA 3U1OA 1N04A 4KPTA 4IGRA 2F6GA 2YJPA 2OWSA 4BDLA 2UXAA 4JSOA 2XX7A 3S9EA 1MQHA 2AL5A 3OENA 2D5WA 2F7CA 3KG2A 4OHNA 1L5TA 3PPQA 1N7XA 5CBSA 5HPQA 1B05A 1IUDA 3MC2A 1URGA 4QSCA 4FE8A 3CIJA 3H7MA 3T9HB 5I2KA 3LSXA 2HFBA 4I62A 3QUJA 2XXPA 3O28A 2B65A 3MZBA 2GH9A 4R75A 3MWBA 3RT6B 3SETA 2CMOA 2E0SA 2RKMA 1B0HA 3LSFB 2LAOA 1Y9UA 1JW1A 4C1UA 4DDDA 3EHTA 4KYEA 3RY3A 1RYOA 2GHBA 2VOZA 3G3FA 3LC8A 3OELA 4DXCA 3E9XA 2XX8A 2DQVA 2ESNA 4U1OA 1QUKA 2VD3A 3C32A 2Q2CA 4RPNA 4ZEFA 3C31A 5EYFA 1ATGA 2X7PA 3PUYE 3BKIB 3TKDA 3RGYA 5ISUA 1UTHA 1YAEA 3LBSA 2F35A 4UA8A 3EHSA 3H6TA 1DMBA 1POTA 3DLNA 4U4XA 3O97A 1JETA 1Z7NE 3B6TA 4I8CA 4POXA 3D4GA 3H4ZA 1BTJA 3G3IA 3KOTA 4F3SA 3S9LC 1SVXB 2O84X 2D3IA 1CE2A 1HSLA 4ESXA 2XXIA 5I2KB 2Y7WA 2ONKE 2NUVA 1SYIA 4JXIA 4G68A 3K01A 2I0BA 1B52A 1B5HA 4PE5B 2RINA 4NMYA 3FJMA 1GR2A 3VV5A 3GBBA 4FJPA 3FATA 1JQFA 1FQCA 4OERA 5AA1A 2Y7RA 3T9XB 2OWTA 3OSQA 3O6IA 1SQYA 1JEVA 3SKPA 3G3KA 4OXVA 2I3WA 2DWHA 3LSLA 3GZGA 4HS7A 3TYHA 3S4UA 1LSTA 1UTHB 5CBRA 1NNKA 1UQWA 3MZ9A 2Q2AA 3HPIA 5TP9A 3UK4A 4GXSB 1MXUA 2XD2A 1QUJA 5LOMA 1DPPA 5FHOA 1FTOA 2QPQA 2AIXA 1Y3PA 2ZYOA 1B7HA 2I6EA 1Y20A 4L17A 4QFLA 3UORA 5M2VA 4ONYA 3EN3A 1D9VA 2V93A 1B46A 4R6HA 4OFLA 3W9VA 2FA7A 2HQ0A 3TZAA 4AQ4A 4YKJA 5F7VA 4YKKA 4G68B 4JWYA 1B51A 1B3GA 1LFIA 3Q26A 4POWA 3IORA 5TU0A 3FD3A 3T66A 2O68A 4BLAA 2F7BA 4BDMA 1OMPA 1A40A 1ZU0A 4EF1A 1LAXA 1N76A 1FTLA 4G8MA 2PYYA 1IXGA 3M3LA 2O1MA 3LR1A 2Z8DA 3G3JA 3E13X 3FXUA 1URDA 1JVXA 4Q30B 5DVIA 3MAMA 1DSNA 2YLNA 2UVGA 5TP9B 3AXFA 4OENA 3SESA 1PDAA 2I4BA 1URSA 4N6PA 2UYEA 3H06B 4X48A 3KN8A 1SW2A 2DWJA 1IIWA 3PPRA 1OVTA 2P2AA 4GL0A 5ITOA 3O6HA 4OMBA 2HAVA 5CMBA 5CMKA 2QJEA 1QJMA 5BUUA 2RCAA 2QRYA 3PGFA 1B0LA 1LFGA 3KJ7A 4OEVA 1XOCA 3IB0A 4F18A 2B3FA 4OZ9A 3UP9A 2I4CA 3MPKA 1HSJA 5FTIA 1B3HA 2QS4A 5HBCA 5EHMA 1GGGA 2HCAA 3TTNA 2ZXTA 3N94A 1ZMGA 4X1DA 2HXWA 3MQ9A 1MY2A 5H8SA 1B5IA 4PP0A 3O2AA 4I9DA 1B1XA 4ND9A 4LA9A 4H67A 4DXBA 3A3CA 2DWAA 3OO8A 4YMBA 2H25A 4EUOA 3ZKKA 5IAIA 1MPDA 4IO7A 5B7DA 1DTGA 5L9OA 3GBAA 2XXTA 2RF1A 5AA3A 2FYIA 1IXCA 3T9UA 4AB5A 3UIFA 4OFJA 3C33A 4U4SA 1JVYA 3IOWA 4ZEKA 4PQJA 3DM0A 1LLSA 1TFDA 3U93A 1H44A 3L6GA 5DYHA 1B7ZA 1B9JA 3CG1A 2M8CA 3IO4A 3MUQA 3TODA 2F36A 1Q1KA 5AA2D 4P0GA 1FTKA 3KN7A 1ZIUA 4KYSA 5K2XA 4ZEBA 3U92A 3RUMA 4GXAA 1BIYA 4X9TA 4KYDA 1MY3A 1A7LA 4JDFA 3C35A 3Q25A 2Z8FA 1LB9A 5DTBA 4O3BA 5I2NA 3THIA 1R1NA 2HZKA 3S2VA 3TPAA 1MH3A 4LQ5A 3MVXA 3K1PA 5DVJA 1VR5A 2GHAA 1EH3A 3ILTB 1R9QA 1B4HA 4OYVA 3VXCA 4YB6A 3CVGA 4ZE9A 4HW8A 1MS7A 3SEUA 5HM4B 3TQLA 4ELPA 2QL3A 2O7UA 2UVHA 5J1DA 4Q8RA 1Y3QA 4LATA 1N7WA 2F97A 3F11A 3ZSFA 1O63A 3UGWA 3M3FA 3IOUA 4ISUA 1MM6A 5KCJA 2NOOA 5I59B 2REJA 4OEUA 1M5CA 4GL8A 2V3TA 3TELA 2BJJX 3V5AA 4DLDA 3TTKA 1EZ9A 3VXBA 1QULA 5DT6A 4C1TA 3ILUB 3PV0E 1NH7A 1OQGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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