1VFDA

Human lactoferrin, n-terminal lobe mutant with arg 121 replaced by glu (r121e)
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
321
structure length
321
Chain Sequence
SVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRRVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRETAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Iron transport
molecule keywords LACTOFERRIN
publication title Mutation of arginine 121 in lactoferrin destabilizes iron binding by disruption of anion binding: crystal structures of R121S and R121E mutants.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 321
sequence length 321
ec nomenclature
pdb deposition date 1996-10-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1vfdA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1vfdA02
4N07A 3SKPA 3MVWA 4OXVA 4DCXA 1SW4A 4MBPA 4F3PA 3BFTA 1LB9A 4OMBA 3FD3A 3KJTA 4I1DA 4PP0A 4BDLA 4YMBA 3RGYA 1B46A 3TTNA 1LGBC 2V25A 1OVBA 4C1UA 4ZEIA 3O6IA 5I59A 5JK4A 3LSLA 4RY1A 4KD5A 3MWBA 1Z7ME 2DVCA 3M3FA 1DMBA 1MG1A 2GFEA 2DE4A 3IOWA 4G68A 5H8NB 1JW5A 2D5WA 3TFLA 1B3LA 1MH3A 4FEDA 4GXAA 3RTWB 4IO2A 1BIYA 3FVNA 3O97A 3ZKLA 1IXIA 1H43A 3EPEA 2X26A 2O51A 4JWYA 4I8CA 3H03A 3FVKA 4KYEA 4KI0E 3VE1B 1BLFA 1ZIUA 3TKDA 1MQGA 5AA3A 4PFUA 3DP6A 4WEDA 4ZE9A 4U22A 3VFJA 2A5SA 2O68A 4L17A 1S50A 3FJ7A 3PMVA 3VLUA 3DP4A 1MXXA 2O84X 1IUDA 3OEKA 4G8NA 1OQHA 4IGTA 4YKPA 2GHAA 2HQ0A 4R74A 3L6HA 3MC2A 3MPKA 2DE2A 4EQ7A 4YKIA 1UIUA 4LVQA 5IKBA 2RCBA 1P1QA 2Y7RA 1FTKA 1RKMA 3G3FA 3ZKKA 1WVJA 1P1WA 2XX7A 3DELB 2DS9A 2GRVA 2Q9TA 1EU8A 4NTLA 1AOVA 2P0SA 1DPPA 1S7YA 3IJOB 3KSXA 1YPNA 4F18A 1EZ9A 3U94A 2AL5A 2ZNSA 4X9TA 5EHSA 3IB0A 4FECA 5AA4A 2ESNA 4F31B 1BTJA 2XX8A 1A8EA 2O1MA 1B0HA 4GL8A 2I3WA 3KN7A 3FIRA 2VHAA 1MDQA 4GFRA 3QK6A 5I84A 1XOCA 4QFNA 3UGWA 3T93B 2UXAA 1H76A 1TT1A 1IXHA 3CG3A 3LBSA 1B7ZA 2P2AA 5I57A 2X7QA 2W7YA 3MBPA 3QSLA 2O7UA 4I62A 4H67A 4ZEFA 4E0XA 2RF1A 4OYVA 1ZKBA 1R9QA 3CRBA 2DSFA 4U1OA 4GWOA 3THIA 5LOMA 4MFIA 3HCQA 3CSBA 1Q35A 3T22A 3EHSA 3VXBA 2AIXA 3VXCA 3C31A 3C33A 2UVHA 2M8CA 4DZ1A 4NWDA 2E1SA 4OWDA 1JETA 1EZOA 1CB6A 3H4ZA 3TAJA 4GIZA 4ELPA 2F5XA 2QS1A 5HPQA 3C34A 4DXCA 5JEIA 2O7IA 2IA4A 3MP6A 4O3CA 1MH4A 4KPTA 1LSTA 2UYEA 1AL3A 3PPOA 2ZXTA 4NF8B 2UVGA 1M5EA 3TODA 4LONB 1ZJLA 4BDNA 1QUIA 4H0WA 2CMOA 1H45A 4H8JA 1PB8A 3LR1A 2ZYMA 3N6UA 3CG1A 4I9DA 3R7XA 3SEWA 3O28A 1US5A 2ALUA 2A5TA 1VFDA 5JTYA 5AA2A 3O9PA 1URSA 4NF4A 4XKRA 2XXXA 3KSJA 2I0BA 2NXOA 2ANJA 5CMMA 4POWA 5DEXB 1B5JA 4IGRA 5A5XA 2ZYKA 3SESA 3ECRA 1MPBA 3O2AA 4LZ5A 1MXZA 4LQ2A 3TCGA 4UA8A 3CFLA 5FHMA 2XXVA 3N94A 4QSCA 2F97A 1N3XA 1QKBA 2V84A 3U92A 1B3GA 1KWHA 2F6GA 2Q2CA 2X7PA 4NE4A 2Q88A 1NNTA 4G2ZA 4EDPA 3CIJA 4IB2A 5BWJA 2QPQA 2QL3A 1Y9UA 2OCUA 1D9VA 2Z8FA 3FXRA 5F7VA 3O66A 3GZGA 1Y4CA 1FW0A 2FNCA 2QS4A 3UORA 4N13A 5H8NA 5ITOA 2Q89A 2F35A 2I49A 2XXUA 2F7CA 4DDDA 4YMAA 1SBPA 3JYRA 2O1LA 3C4MA 1YCJA 1A8FA 4OZ9A 1NNPA 4ND9A 1US4A 4DE8A 3S9LC 1B7UA 5H8FB 4ELQA 1GV8A 3KFMA 1B2HA 5TU0A 2I0CA 3CSGA 1Y1MA 1TXFA 1MY0A 1M5BA 1OMPA 3KN8A 3S4UA 4Q5TA 1SI0A 3UP9A 1SDXA 4FORA 3B6TA 1B0LA 1A54A 5CI5A 4X48A 2D21A 4GVOA 5K2YA 3PUZE 2XD2A 3KGCA 3T9XB 1F9BA 3FXQA 3IB1A 3UA8A 2ONKE 1WDNA 4Q30B 1UTHB 4ECFA 2B65A 3G3KA 4UACA 3E3KA 4ELOA 3QXMA 1B3EA 3FV1A 3SETA 3FJMA 3DLNA 4YB5A 1H44A 3Q26A 5CMKA 2V3QA 3IK6B 4MF3A 1LAXA 1FQBA 3MP1A 1URDA 1JEVA 4ZS9A 4POXA 2I3VA 1UTBB 2REJA 1B5HA 1R9LA 3IOTA 3OO9A 3O29A 4OERA 3SEUA 1QUKA 4KR5A 2REGA 4EQBA 1A7LA 1AMFA 1MY2A 4R6HA 3MP8A 5CM6A 4YU0A 5AE4A 2Z23A 3OO6A 3TELA 3OENA 4WXJA 1OVTA 3TUSA 4G8HA 3MUQA 2VGQA 1WODA 3RQTA 2P1SA 4F39A 3T9VA 3N26A 4R9GA 1LFIA 3GXAA 1AIVA 2ZYNA 1LFGA 3IJXB 2AYSA 5CRYA 3KOSA 3RUMA 2ONRA 4YAHX 4KCCA 4EXKA 2NUVA 3IR1A 3G3JA 2NOOA 1B4ZA 4RPNA 2XXPA 3E9XA 4RJZA 3VVFA 4F1UA 3KOTA 3PD9A 3TTRA 1ZBMA 1B5IA 4U4SA 1PEBA 1FQFA 2ZNUA 4FEBA 4NF8A 2OBGA 4JB7A 3MJNA 3K01A 2XHDA 2H25A 3GLBA 3UIFA 4QRZA 1MXVA 3E4RA 5DVFA 5I58B 2KLFA 1VFEA 2I58A 2O69A 4JWOA 4RYAA 3FVOA 5K2XA 4KYSA 5ISUA 1M5CA 3USDA 5EYFA 3I5OA 1EZPA 3N6TA 3W15C 4XKPA 4NF6B 4M4GA 2F78A 3MAMA 3FZVA 3C36A 3S2VA 4R2BA 3PPRA 5DEXA 1NH8A 3RLFE 4F29A 4PFYA 3I6VA 3SEVA 1MQJA 3H6TA 2Y7PA 1LCFA 4E0WA 1I6BA 1IEJA 2H5YA 2ZYOA 1B58A 3HSTA 4ZDMA 3WAEA 1II5A 3OELA 1XC1A 5TPAB 4U1ZA 2Y7IA 3O6GA 4G68C 3MW0A 2XXHA 3DP8A 4M1VA 4U21A 3ILTB 2HZLA 2R9JA 3TEPA 4JWXA 3FVGA 4GD5A 4EQ9A 2V93A 4GLIA 2XXRA 2NVUB 3DM0A 3EN3A 1RYXA 3Q25A 4GXSB 4OHNA 4ZZEA 3MVXA 3CR9A 1FQEA 5H8FA 3TPAA 1GGGA 1DTZA 1QW0A 3PPNA 1PBQA 2PT1A 2ZMBA 2DXRA 2RC7A 3PV0E 3TMGA 3K2DA 3RPWA 2F34A 2GHBA 4DLDA 4AQ4A 3I3VA 4RXLA 2QJEA 2IEEA 3EF7A 4JXIA 4OVJA 2DYXA 3ZSFA 3OXNA 3CI8A 4H65A 3V89B 3HV1A 3T9HB 1M5FA 3EHUA 1MPDA 1FTLA 3K02A 4GQOA 3OSRA 1UTHA 4LQ5A 4PE5B 4FIMA 1I6AA 3TZAA 4P0GA 2ONSA 4FE8A 3K6WA 3LSFB 3G3HA 4IO6A 3VDFA 2G29A 3MPLA 4XIGQ 1MQDA 1UIVA 3A09A 2QMWA 2F36A 2FYIA 1JVYA 2DWIA 4F22A 1PB7A 3H7MA 2R71A 2PBWA 3PPQA 4G8MA 3PUYE 1UTBA 1RYOA 3TTLA 3GBBA 3JZJA 2OLBA 5ITPA 4NWCA 2QS2A 4QSDA 1B6HA 1J1NA 1Y1ZA 4MH5A 1NNFA 3SEXA 4OFJA 2V3UA 3L6GA 4Z7EA 2ZNTA 3N5LA 5I2KB 1Y4TA 2B3FA 5H8HB 4U4XA 4QSEA 1NMUA 3Q29A 1SW1A 3RN8A 1QUJA 4OFOA 3H6VA 2Y84A 4FAJA 4THIA 5FHNA 3VLWA 3H6WA 3OD7A 5L9MA 5DTBA 3T9UA 4RNSA 1Y3PA 2YPNA 2NWJA 1NL5A 3G7WA 1Q1KA 4QHQA 1MPCA 4ZE8A 3T96B 1B9JA 5FTHA 2HFBA 2E0SA 1L5TA 3LSWA 5L9SA 3IOVA 1O7TA 4YICA 5I2NB 3MVZA 4GRKA 1MY4A 3CFZA 3SERA 3QAXA 4P11A 2D3IA 5EHMA 1JW1A 5CBRA 3OO7A 4IO7A 3B6QA 3IB2A 2BJJX 5ICQA 1MY3A 1SW5A 2UYFA 1MM7A 2PYYA 5I58A 4QFOA 4TOZA 4F3GA 3K4UA 4H6DA 2DVZA 1MY1A 1XHYA 2V3TA 2OJTA 1ATGA 1QJMA 3KZGA 3UN6A 1TFDA 3SEYA 4NF6A 4N6PA 4JSOA 4MLVA 1Y3QA 4C1TA 5H8QB 2H9BA 5M2VA 1FTMA 1IITA 3E13X 1OQGA 2OWTA 5TP9B 3PMWA 5ICTA 1PDAA 5AA1A 2DE3A 4PFWA 4HCWA 3ZS6A 4ZZAA 3G3IA 3MQ9A 3S9NC 3KEIA 2XD3A 2PMSA 1BKAA 4G4PA 3BFUA 2FA7A 3FGSA 1OLCA 1FCKA 5DYHA 1POY1 1MS7A 4GF8A 4IY6A 5TPAA 3TQLA 3B6WA 4R2FA 1B32A 2I48A 1I69A 4YB6A 1VR5A 1FTOA 2Q8JA 1QULA 3FJGA 5FTIA 4F3SA 3IORA 4R6YA 3BKIB 2QMXA 5F1QA 4ELRA 1XS5A 2UVJA 5AA2D 3KJ7A 4IO3A 3TCHA 1HSEA 4H5GA 1ELJA 3TYHA 3TTMA 3ODBA 2PT2A 1B1XA 3SDFA 3EQ1A 2WKYA 1MQIA 5KDTB 4O3BA 4OTEA 3PMXA 1QVSA 4X1BA 1XVXA 5IAIA 4Z0IA 4LUBA 2QRYA 5B7DA 3JV9A 4OESA 1P1OA 1FTJA 1USYE 2Q2AA 5I56B 3ONMA 4JDFA 3M8UA 2H99A 1B40A 1M5DA 1URGA 1B3HA 2H4IA 1A99A 2Z22A 3FV2A 1FQAA 4BLAA 1SD3A 4ZEDA 1FQDA 1B7HA 1PC3A 3PUXE 4RK2A 1TWYA 1N7XA 1OIBA 3OSQA 1UQWA 1SQYA 1LCTA 1MXWA 2HZKA 4RPOA 1DPEA 4LZ8A 1VE4A 1IZ1A 4ESWA 1QKAA 3V8XB 2F8DA 1CE2A 1ZTYA 1XVYA 1VSOA 2O6AA 4MLQA 1LAGE 4OEUA 4GL0A 3P7IA 5DT6A 2VP1A 3IO6A 2F6PA 1GTKA 4WEPA 2PX1A 2I4CA 4C0RA 2I4BA 4OEVA 2RINA 1MXUA 1SW2A 1P99A 4BDMA 1EH3A 5I2KA 2PVUA 1IXCA 2YLNA 3MZ1A 3LSXA 5H8HA 4H8IA 1O64A 4NEDA 4NF5B 3V5AA 1A40A 1BP5A 1JEUA 3HHGA 2H98A 4KFQA 2B3BA 4U23A 1JQFA 1MDP1 4DIGA 3FUZA 4LATA 2XXQA 4LZ7A 1IIWA 5DVJA 4QF9A 4F3BA 1DSNA 5KCJB 3S9EA 3D4CA 1O63A 1MQHA 3RNNA 4R73A 5HM4B 4EF1A 1HSLA 3QIMA 1JNFA 3LUYA 4F19A 1OLAA 4BDQA 5I2NA 3RT6B 2VD3A 3FASA 4O3AA 1ZMGA 2VOZA 1IXGA 4X1DA 4F1YA 2QSXA 1TFAA 4K3FA 4KQPA 4OENA 1YAEA 4JSDA 5L9OA 3U93A 1B4HA 3H06B 1N84A 2QS3A 5B70A 3PGFA 3PUWE 3C32A 1LBBA 3KN3A 3H6UA 3ILUB 4PETA 2AL4A 4YKJA 1SYHA 1ZU0A 4YZZA 2HAUA 3VLVA 3TDJA 4F2OA 2HEUA 1Y3NA 3R26A 4IY5A 2G93A 1JW4A 4QFLA 3R6UA 1SI1A 3OEMA 3OOAA 3TQWA 1NFTA 4LA9A 5H8QA 3UK4A 4QFPA 5TP9A 4FJPA 4KCDA 4FATA 4XKNA 3K1MA 1POTA 5I59B 1B51A 3FATA 3BBRA 3HO7A 1SYIA 3M3KA 4ZECA 1SVXB 3Q27A 1S9TA 4EF2A 4YB7A 4PFTA 3VVDA 3K1PA 3K1NA 5H8SA 4PQJA 4QFKA 3K00A 4G68B 1MXYA 2F7AA 3K6VA 4U2RA 3PD8A 3RT8A 3PUVE 1H3DA 3OMBA 4XKQA 2OZZA 4ONYA 4OFLA 3U8QA 4EUOA 3T66A 3QUFA 5CMCA 3CVGA 2YJPA 1D4NA 3C9HA 1LLSA 5DVIA 4AB5A 2DXYA 4H1XA 3W9VA 1ZLQA 2HXWA 4HS7A 3A3UA 1N76A 1JVXA 2DWJA 1B52A 5CBSA 1GR2A 2HAVA 4DXUA 5KDTA 1R1NA 3MVYA 4R72A 4Q8RA 5CMBA 5BUUA 2DWHA 4OQOA 1HSJA 2OK2A 3M3LA 4JBZA 4NMYA 5I56A 4R9FA 3RY3A 4EXLA 3QUJA 1MM6A 3K6UA 2THIA 1N7WA 3HN0A 1ANFA 5FHOA 2Z8EA 4G77A 5L8DA 3PU5A 2R6GE 4F1VA 2ABHA 4IO5A 3TTKA 4ISUA 2HCAA 5J1DA 1LFHA 1B3FA 1LAFE 4Q0CA 3HPIA 4TLLB 3H3GA 3WAFA 1P1UA 3MZBA 4LP2B 3O6HA 3GBAA 1I6QA 3U72A 3Q28A 3W9WA 2XXYA 3IOUA 2OWSA 5AA4B 3RTFB 2DP8A 3OO8A 1N3WA 1FQCA 3MZ9A 4BDOA 1AH5A 4BDRA 2XXTA 3IAZA 3LC8A 2I6EA 1MRPA 3TCFA 4OETA 1IQ7A 2RKMA 1LB8A 4R75A 2DOJA 2RCAA 4WKMA 5I57B 1NKXA 1B05A 2Y7WA 3K0VA 1A55A 1R6ZA 3VV5A 4NF5A 1PBPA 3V83A 1LAHE 4ZEKA 3K6XA 3KG2A 1D3KA 3G3GA 3KBRA 3IX1A 3U1OA 4F2QA 4P0IA 3CFXA 1Y20A 4H5FA 1B1HA 4RK9A 1D9YA 1GVCA 5ELVA 4DCYA 2Y7KA 1T0KA 1PB9A 1YTVA 1NNKA 5CC2A 3IL1B 3IO4A 5KCJA 1XT8A 1Z7NE 2CZLA 4XXUA 4HCYA 2VD2A 2RC8A 1NH7A 5KZTA 2XXWA 4IO4A 1USYH 2RC9A 1DTGA 1LBCA 3EHTA 3VVEA 1P1NA 2GH9A 2UVIA 4ZEBA 4HTGA 4KHZE 4DXBA 4TQUQ 2F7BA 3S9MC 3PPPA 3QYTA 4R6KA 3HHFA 4RA1A 4XTCQ 4YKKA 4TLMB 3D4GA 3C35A 3B7DA 2A5TB 3A3CA 2DQVA 3F11A 5JTYB 5AA2B 1N04A 2LAOA 4NF4B 3AXFA 3FXUA 4GOTA 1N0TA 2DWAA 2Z8DA 2XX9A 5HBCA 4AB6A 4KYDA 4HW8A 1DOTA 2XXIA 4ESXA 5A5XB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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