1VFDA

Human lactoferrin, n-terminal lobe mutant with arg 121 replaced by glu (r121e)
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
321
structure length
321
Chain Sequence
SVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRRVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRETAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Iron transport
source organism Homo sapiens
publication title Mutation of arginine 121 in lactoferrin destabilizes iron binding by disruption of anion binding: crystal structures of R121S and R121E mutants.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LACTOFERRIN
total genus 81
structure length 321
sequence length 321
ec nomenclature
pdb deposition date 1996-10-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1vfdA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1vfdA02
5ITPA 3TEPA 5EHMA 4HCWA 1QKBA 1IQ7A 3ZKKA 4FECA 4FJPA 2VD2A 2YPNA 1H76A 2HFBA 5K2XA 4YMAA 1IXCA 5AA4B 1B32A 1N7XA 1Y4TA 5HBCA 1B58A 3B6QA 3B7DA 4YKIA 3SEVA 4BLAA 4OVJA 1P1QA 4QSDA 2O7IA 1JW4A 1P1OA 3VLUA 4AB5A 2HEUA 1MXWA 4H67A 3N26A 3HV1A 3H6UA 4GVOA 4G77A 5I84A 3PMXA 1ATGA 3LSXA 4M4GA 4ZDMA 3TCGA 3JZJA 2HZKA 3I3VA 2O1LA 3FXUA 1URGA 2Q89A 1GTKA 3U72A 1SW1A 2GRVA 4K3FA 3MUQA 5TP9A 2PBWA 5FHMA 1OMPA 2QJEA 3K6UA 4GFRA 3PUZE 1PC3A 4LP2B 2R9JA 4ZZAA 2ONSA 2QPQA 3M3LA 1SW5A 1LAFE 1ZJLA 3VLWA 4GOTA 1S7YA 4YKPA 1PBPA 5B7DA 3OSRA 2XXIA 3SDFA 1B51A 1SI0A 3O9PA 3HCQA 3EF7A 4ZEDA 2YLNA 2X7PA 1XVXA 1A99A 2GH9A 3DELB 4XXUA 4POXA 4GXSB 4IGTA 4YKKA 5EHSA 1AL3A 2V3QA 3FV2A 1FTJA 3U92A 1H3DA 4BDMA 4DCXA 3O6HA 4LA9A 4I1DA 1PDAA 1B7ZA 3P7IA 3SETA 1NL5A 4ESXA 3FASA 1AIVA 3K6XA 4OENA 4F3GA 2RC7A 3O2AA 4G2ZA 3MPKA 3PMVA 4Z0IA 3M3FA 3CRBA 3VFJA 4H5GA 5H8SA 4NF6B 2UVJA 2P0SA 3FATA 1MRPA 2Q2CA 5FHOA 3ILUB 3T9XB 1ELJA 2CZLA 5CC2A 1B7UA 4PFTA 3PUVE 3I6VA 3D4CA 1VFDA 4IB2A 4GLIA 1MDQA 4DDDA 1MDP1 2P1SA 5ICTA 2A5TB 3O6GA 4OEVA 1LGBC 2RF1A 3T9VA 4G68C 3VXCA 4NF5B 4FEBA 2B3BA 5KDTA 4JWXA 5A5XB 1M5DA 2ZXTA 4U2RA 4IGRA 1URSA 3MZ1A 4Q30B 4ESWA 3RQTA 3G3FA 3TODA 4IO4A 2UYFA 4LATA 1B52A 3FD3A 4N13A 4GL0A 4R74A 4OHNA 4QFNA 4EXKA 3FJ7A 1MQDA 4RYAA 4GWOA 2HAUA 4FATA 3DLNA 1MXUA 3KN3A 2F6GA 2XX8A 1Z7ME 3FXRA 4NEDA 4JSOA 2H25A 5FHNA 3MZ9A 3R7XA 4C1UA 5H8FA 1MPBA 2WKYA 5TPAA 3K4UA 1UIUA 2FNCA 2GHBA 3N94A 3RLFE 3VXBA 1MXZA 5DTBA 3CVGA 4RA1A 3CG3A 5JTYA 5L8DA 3VVEA 3S9EA 4E0WA 3IAZA 3CSBA 3DP6A 3T9UA 3Q29A 4JBZA 3G3GA 3R26A 3TPAA 1A8EA 1PEBA 4H0WA 3IK6B 3RN8A 1FW0A 5DT6A 1PBQA 3IL1B 2UVGA 1CB6A 3KSXA 4U1OA 2NOOA 4R6HA 4IO7A 4ZS9A 2ALUA 2UVIA 2AL5A 2DWHA 1B3LA 2HCAA 3IOWA 3G3HA 5I59A 4BDQA 2O68A 4TOZA 4PP0A 3FVGA 3MVYA 4ZEFA 3JYRA 1B3EA 1A54A 2DE2A 3TCFA 1LSTA 4MH5A 4GRKA 2IEEA 2DE3A 4DIGA 1NMUA 4BDRA 3O66A 4XKNA 3FVKA 4F1UA 2AL4A 3JV9A 3K1PA 2GFEA 3D4GA 5B70A 4PFUA 3IO6A 1EZPA 1WODA 2YJPA 4JDFA 3FVNA 2I4BA 3MPLA 4IO5A 3Q28A 1N3WA 2XX7A 1O7TA 3W9WA 3ILTB 5BWJA 4X48A 5I56B 3ZS6A 1WVJA 1H43A 1SD3A 2ZYKA 4H6DA 4OYVA 4ZE9A 2DXYA 3GZGA 2PVUA 3IO4A 4QHQA 1DTGA 3A09A 5CMCA 5CMMA 3O29A 3K2DA 3IJOB 2XXYA 1ZLQA 1BP5A 4U21A 4OFJA 1EZOA 3B6WA 2I4CA 4KYEA 1MXVA 3ODBA 3V89B 1JVYA 3E13X 3QYTA 3LSLA 2H99A 4PFWA 3UORA 1LAXA 1B1HA 1MY3A 4JXIA 4ELRA 1YPNA 3IR1A 4QFPA 5KCJA 1P1UA 2REJA 5TP9B 1HSEA 2IA4A 1DMBA 4OMBA 2ZMBA 2I0CA 3V5AA 4H1XA 3UGWA 1ZTYA 2PT1A 3G7WA 1FTMA 4MBPA 2E1SA 1P99A 1QUKA 3O97A 4IO3A 4F39A 4JWOA 3EQ1A 3L6HA 4F1VA 1OLAA 3RNNA 3W15C 4I9DA 1Z7NE 1NKXA 1B9JA 3WAFA 3OO8A 1BLFA 1MM6A 4HCYA 4BDLA 1B3HA 1XHYA 4IY6A 2Y7KA 3KSJA 1F9BA 4QRZA 1JW1A 1PB9A 3KJTA 1FQCA 3S4UA 2DP8A 4XKRA 2HXWA 5DVIA 2Y7IA 3PV0E 4PQJA 2VD3A 1NNKA 3K02A 4YICA 3TTMA 3N6TA 3U94A 5J1DA 1TFAA 4RJZA 3EHSA 2G93A 1UTBB 3CG1A 3K6WA 2B65A 3IB1A 3K1NA 3H6WA 2B3FA 4GQOA 3FV1A 3OOAA 1MPDA 2H4IA 5AA2A 2ESNA 1NH8A 2XXQA 3RY3A 2ONRA 4DCYA 4R9GA 2DWAA 1B40A 1UTHB 3QUJA 4EQBA 1ZIUA 2O1MA 1IXIA 5CM6A 2XD3A 3Q27A 3EHUA 1UIVA 2XXPA 3OENA 1QVSA 1NFTA 4ZEKA 2ZNUA 3TTKA 3IOTA 4WEPA 1ZKBA 1IZ1A 5H8QA 1I6QA 3S9LC 3G3JA 3H6TA 4F18A 1QW0A 1M5CA 1MXXA 3MW0A 4U22A 3SKPA 1POY1 3HSTA 5DEXA 3OO7A 5I2KB 1MG1A 2AYSA 3K00A 3OD7A 2O69A 3TZAA 3KFMA 1B5IA 4L17A 4EUOA 4TLLB 1VSOA 4OFLA 1RYOA 2QS4A 4KQPA 3PUYE 3SEWA 4JWYA 3QAXA 1MQGA 1B5HA 1Y20A 4QSEA 1PB7A 3VVFA 2I3WA 3S9MC 2XD2A 4F31B 3OELA 2F8DA 4NTLA 4QFKA 4EQ9A 1B3FA 3SEUA 1CE2A 3KN8A 2RINA 1N7WA 4MF3A 3PD8A 2ABHA 1PB8A 2OWSA 1LAGE 3OEMA 2RKMA 5FTHA 2I48A 3IJXB 4FIMA 1RKMA 2NXOA 3QUFA 5I58A 2XXHA 1O64A 3Q26A 3RT8A 1BKAA 3MP8A 1POTA 4RY1A 1YCJA 3FUZA 4YKJA 1Q1KA 1XVYA 2DVZA 3VDFA 4QSCA 2KLFA 4NE4A 3VLVA 3PUWE 3TKDA 4TQUQ 4RPNA 4YMBA 3OO6A 4YB7A 2OJTA 2Z22A 3KOSA 3PUXE 2UYEA 2F78A 2RC9A 5I2NB 2I0BA 4KCDA 1O63A 1MXYA 3MQ9A 1B6HA 2DE4A 5ITOA 2VGQA 4Q5TA 2RCBA 1MQJA 1P1WA 2OK2A 3EPEA 3PPOA 2ZYMA 1OIBA 3PPPA 2X26A 2NWJA 5EYFA 3U1OA 1LCFA 3RT6B 5H8HB 2Y7RA 2I3VA 1URDA 2FYIA 1JVXA 4N07A 4OQOA 4R6YA 1B1XA 2CMOA 2V25A 3IOVA 4KI0E 2X7QA 3RPWA 1SYHA 1Q35A 5AA2D 2F34A 4BDOA 3UK4A 1DTZA 2PMSA 1HSLA 3HN0A 5CBSA 5M2VA 3EN3A 3PMWA 4LZ7A 1H45A 1Y1MA 4ONYA 1B2HA 4NF8B 4P0GA 4GIZA 4NF6A 5ICQA 4X1DA 1N76A 1LLSA 4X9TA 1SVXB 4NWCA 1XOCA 2THIA 2M8CA 1JQFA 3OEKA 5KZTA 3GXAA 2O84X 1NNFA 2PT2A 5JEIA 1I69A 2H9BA 5BUUA 2Y7PA 2QL3A 5H8NA 4ZZEA 2F7BA 3UN6A 3QIMA 4LZ8A 1A55A 3G3KA 3ONMA 2RCAA 1FTOA 1IXHA 2A5TA 3AXFA 4G68B 4H65A 1R9QA 3PD9A 4NF5A 3MP1A 4NF4B 3H6VA 5DVFA 5A5XA 3CFXA 4F29A 2Z8DA 1FTKA 3CI8A 2V84A 4YAHX 5I57B 2OLBA 2I49A 3H06B 4U23A 3N6UA 4JSDA 5F7VA 2I6EA 2OZZA 4R2FA 1OQGA 1KWHA 4GF8A 2D21A 4OETA 1FCKA 3E3KA 2G29A 1LCTA 1SW4A 4PFYA 4ELOA 1JW5A 1QULA 3LUYA 1M5FA 3MVZA 2DOJA 1DSNA 4RK9A 2XXTA 4R6KA 4QFLA 1VE4A 2XXXA 4EXLA 3MP6A 3F11A 4P11A 2Q2AA 3G3IA 3HO7A 1GGGA 2ZNTA 4WKMA 3MBPA 4H8IA 2DYXA 2VP1A 1LB8A 1MQIA 1SQYA 4YZZA 3MZBA 1LFIA 3PU5A 3K01A 4OERA 3VVDA 1DPEA 3C9HA 1FTLA 2F6PA 1B0LA 1DPPA 3GLBA 3T9HB 4DXCA 1NH7A 3K1MA 1OVBA 3CIJA 4MLQA 4F2OA 1J1NA 1Y3PA 2V3UA 2D5WA 4OWDA 3C33A 4F22A 4HTGA 2V93A 3H3GA 4U4XA 2DSFA 3E9XA 3LBSA 3SEYA 1NNPA 1WDNA 2GHAA 1B0HA 1B7HA 3GBBA 3THIA 3IB2A 3CFLA 3TUSA 2HZLA 4KYDA 4LZ5A 2I58A 3FIRA 3RUMA 2AIXA 4F3PA 3H03A 1S50A 4DXBA 4U1ZA 4F1YA 2ONKE 1MY4A 1QUJA 2Q8JA 3V83A 4HS7A 5HM4B 5DEXB 3TYHA 3IORA 2XHDA 3QXMA 3BKIB 3MJNA 2PYYA 4KYSA 5IAIA 4ZECA 5I56A 4KPTA 4KR5A 4RXLA 4YB5A 2VOZA 3CSGA 1M5EA 2HQ0A 3A3UA 1TWYA 3RTWB 5L9SA 3HPIA 1US5A 1JEUA 4Q8RA 2Z8EA 3OO9A 4ZEIA 3TFLA 1FQDA 3C34A 1SBPA 1N0TA 2DVCA 2FA7A 4RK2A 4LONB 3S2VA 3H7MA 1YTVA 3LSFB 5HPQA 4O3BA 3BBRA 3TDJA 1B5JA 4XIGQ 4H5FA 1R6ZA 3OMBA 4AQ4A 3PPNA 1YAEA 4ECFA 5I58B 1FQEA 2Y7WA 1XT8A 1EU8A 4LVQA 2DWJA 3LC8A 5CI5A 5CMBA 3W9VA 1HSJA 2QMXA 2Q9TA 1OLCA 5AE4A 1Y3NA 1MPCA 4FAJA 3FJGA 4DE8A 4E0XA 2NUVA 4YB6A 3USDA 2O6AA 4WXJA 4F3BA 1USYE 1XC1A 3FZVA 2F7AA 4KCCA 3BFUA 5KDTB 5CMKA 3OXNA 4Z7EA 4KFQA 4EF1A 4XKPA 4WEDA 3R6UA 2QMWA 3M8UA 2H5YA 3TTRA 3CR9A 3KBRA 4ND9A 4U4SA 4ZEBA 3C35A 4OZ9A 1IEJA 4QF9A 3WAEA 4OEUA 3VV5A 3CFZA 5AA4A 3KG2A 2RC8A 3QSLA 3N5LA 3K6VA 4GL8A 2XXUA 1MQHA 4XTCQ 1I6AA 1UQWA 3HHGA 2NVUB 2OWTA 4O3AA 1D4NA 3Q25A 5AA1A 3T66A 1SYIA 3RTFB 5H8FB 4FORA 1UTBA 5TPAB 1IITA 4O3CA 3KJ7A 3TQLA 3FJMA 2DWIA 2O7UA 1VFEA 5F1QA 1GR2A 5JTYB 3FXQA 4C0RA 4DLDA 2V3TA 2W7YA 3C36A 1D3KA 2ZNSA 4QFOA 4RPOA 2XXRA 4OFOA 1M5BA 2LAOA 4NWDA 3M3KA 3SERA 1AH5A 4PE5B 2R71A 1UTHA 3PPRA 4Q0CA 4OXVA 5L9MA 4TLMB 4GD5A 1VR5A 3IX1A 5H8NB 3DP4A 4G4PA 2DS9A 1GVCA 2Y84A 5JK4A 1N3XA 1TXFA 3IOUA 4FEDA 1ANFA 4I62A 3TCHA 2P2AA 4YU0A 3DP8A 5I59B 2Z23A 1MS7A 4NMYA 4POWA 3LSWA 4LQ2A 1BIYA 4XKQA 2O51A 3K0VA 1IIWA 1AOVA 1FQBA 5AA3A 4ELPA 2HAVA 2F36A 4IY5A 4N6PA 3IB0A 4M1VA 5I2KA 2Z8FA 2ANJA 1A40A 3H4ZA 3GBAA 4MFIA 1JETA 4F19A 3PGFA 4F2QA 2E0SA 1NNTA 3UA8A 3E4RA 3MWBA 2QSXA 3U8QA 1A8FA 1D9VA 3ECRA 4R9FA 1MH3A 3UIFA 1BTJA 5DVJA 4IO6A 3ZSFA 3O6IA 1Y3QA 3T22A 1SI1A 3V8XB 5FTIA 4UACA 4LUBA 1ZBMA 2DQVA 5DYHA 1R1NA 1IUDA 3T96B 3U93A 5CBRA 2F5XA 4ISUA 5LOMA 4ELQA 5IKBA 2REGA 1I6BA 1LB9A 5ELVA 4IO2A 3TQWA 1IXGA 1N84A 3MC2A 3FVOA 1LFGA 4R2BA 4EDPA 4JB7A 2Q88A 3OSQA 4H8JA 4DXUA 4EF2A 4UA8A 2R6GE 2BJJX 1OQHA 1MY1A 2XXWA 3VE1B 4ZE8A 2F7CA 4R73A 3B6TA 4R75A 1EH3A 1S9TA 4BDNA 5KCJB 3FGSA 4THIA 4HW8A 3C31A 3EHTA 2QRYA 4R72A 2F97A 3LR1A 5I2NA 3BFTA 4LQ5A 4G8MA 3PPQA 3TMGA 1TFDA 3C4MA 5TU0A 1EZ9A 4I8CA 1B46A 1LBCA 5ISUA 5K2YA 1MH4A 1H44A 1GV8A 1ZU0A 1II5A 1Y1ZA 2ZYNA 3ZKLA 1MY0A 3S9NC 1SDXA 3I5OA 1T0KA 1MY2A 5H8HA 2OCUA 1R9LA 1B4ZA 3SEXA 1B05A 4G8HA 1AMFA 3TAJA 4F3SA 1LFHA 1RYXA 5CRYA 4FE8A 1JNFA 2VHAA 4RNSA 4AB6A 1QUIA 4EQ7A 1Y4CA 1P1NA 3KEIA 4G8NA 3MVXA 3RGYA 4MLVA 2A5SA 3TTLA 3A3CA 4NF8A 4KHZE 3TELA 1ZMGA 2XXVA 4OESA 3T93B 1JEVA 4OTEA 5L9OA 2D3IA 3L6GA 3UP9A 3HHFA 1D9YA 2QS1A 4X1BA 4KD5A 3O28A 3SESA 2OBGA 1OVTA 5AA2B 2UVHA 3QK6A 2UXAA 4P0IA 1US4A 2PX1A 2DXRA 3KN7A 2QS2A 1QJMA 4C1TA 3KZGA 4G68A 2H98A 2F35A 1FQFA 3KOTA 4GXAA 4NF4A 3MAMA 1DOTA 3DM0A 2QS3A 1A7LA 1FQAA 1MM7A 1SW2A 5H8QB 4PETA 1Y9UA 5I57A 4DZ1A 3MVWA 3TTNA 1LAHE 1B4HA 2XX9A 1L5TA 1XS5A 2ZYOA 1USYH 3KGCA 1B3GA 1LBBA 1TT1A 1N04A 3C32A 1QKAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OVRA 2XWIA 4O8MA 5ITPA 3TEPA 5EHMA 4N8GA 4HCWA 1QKBA 1IQ7A 4GBVA 3ZKKA 1G0HA 4FECA 4FJPA 2VD2A 2YPNA 1H76A 2HFBA 5K2XA 4YMAA 1IXCA 5AA4B 1B32A 2PCRA 2XWKA 1N7XA 1Y4TA 5HBCA 1B58A 4XFEA 3B6QA 3B7DA 1IMBA 4YKIA 3SEVA 4BLAA 4OVJA 1P1QA 4OVSA 4QSDA 2Q74A 2O7IA 1JW4A 1P1OA 1KA1A 3VLUA 4AB5A 2HEUA 1FJ9A 1MXWA 4H67A 3N26A 3HV1A 3H6UA 4GVOA 4G77A 4GWYA 1YYZA 5I84A 3PMXA 1ATGA 3LSXA 4M4GA 4ZDMA 3TCGA 3JZJA 5T3JA 2HZKA 3I3VA 2O1LA 3FXUA 1URGA 2CZHA 2Q89A 1GTKA 3U72A 1SW1A 2GRVA 4K3FA 3MUQA 2KQZA 5TP9A 2PBWA 4GX3A 4I3EA 5FHMA 1EYIA 1OMPA 2QJEA 3K6UA 4GFRA 3PUZE 5F24A 1PC3A 4GWUA 4LP2B 1NV5A 2R9JA 4ZZAA 2ONSA 2QPQA 3M3LA 1SW5A 3ROJA 1LAFE 1ZJLA 3VLWA 4GOTA 1S7YA 1RDZA 4YKPA 1PBPA 2R8TA 5B7DA 3OSRA 2XXIA 3SDFA 1B51A 1SI0A 3O9PA 3HCQA 3EF7A 4ZEDA 2YLNA 2X7PA 1XVXA 3RPLB 4PAFA 3KC0A 4DI3D 1A99A 2GH9A 3DELB 4H46A 4XXUA 1KA0A 4POXA 4GXSB 4IGTA 4PAIA 4YKKA 4I3YA 5EHSA 1AL3A 2V3QA 3FV2A 1FTJA 3U92A 1H3DA 4BDMA 4DCXA 3O6HA 4N8YA 4LA9A 4I1DA 1PDAA 5I3SA 1B7ZA 3P7IA 5EQ7A 3SETA 5J16A 1NL5A 4IR8A 4ESXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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