3OEMA

Crystal structure of glun2d ligand-binding core in complex with n-methyl-d-aspartate
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
281
structure length
268
Chain Sequence
QHLTVATLEERPFVIVEPADPISGTCIRDSVPCRSQLNKRCCKGFCIDILKRLAHTIGFSYDLYLVTNGKHGKKIDGVWNGMIGEVFYQRADMAIGSLTINEERSEIVDFSVPFVETGISVMVARGTTVSGLSDRKFQRPQEQYPPLKFGTVPNGSTEKNIRSNYPDMHSYMVRYNQPRVEEALTQLKAGKLDAFIYDAAVLNYMARKDEGCKLVTIGSGKVFATTGYGIALHKGSRWKRPIDLALLQFLGDDEIEMLERLWLSGICH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Ligand-specific deactivation time course of GluN1/GluN2D NMDA receptors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate [NMDA] receptor subunit epsilon-4
total genus 86
structure length 268
sequence length 281
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-08-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oemA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3oemA02
4X1DA 4JSDA 2GHAA 3ZKLA 3KGCA 4DCXA 5H8NB 3MVYA 3OSRA 3AXFA 4YKKA 4NF8B 1SDXA 3I5OA 4QFLA 3B6WA 2QPQA 4QSEA 2DE3A 4MH5A 3L6HA 2V84A 2V3TA 1EZ9A 1P1OA 1MS7A 2NXOA 3LC8A 1B52A 3QAXA 2DQVA 3QUJA 4F3PA 5I58A 5ICQA 5ICTA 1MG1A 1PDAA 4GXAA 4OWDA 5FHOA 4MF3A 3G7WA 3S9NC 3EN3A 1LGBC 1TXFA 1I6QA 4R2BA 2ZNSA 5BUUA 2HCAA 1FTLA 4FEDA 1LFIA 3CRBA 1ZTYA 4GRKA 2R9JA 2ESNA 3FIRA 3K6VA 1USYH 2QRYA 2G93A 3FV1A 5I58B 4H6DA 1B3HA 4OEVA 2PT2A 2QSXA 2QJEA 4OFJA 2REJA 3LSFB 3U92A 3QYTA 4FEBA 4FATA 4GOTA 2RC8A 1WDNA 1Y4TA 1MDP1 1FQBA 3N5LA 4R9GA 2RKMA 1IXIA 4QFKA 3R26A 2Y7RA 4Q30B 4TQUQ 3LUYA 4E0XA 2XD3A 5TU0A 2HAUA 3UA8A 3S9EA 2PMSA 2P0SA 3BFTA 2OJTA 4ONYA 2XXUA 5K2YA 5FTIA 4I9DA 5CMBA 1MY3A 5DVJA 4XIGQ 2AL4A 2XXPA 4RJZA 3Q26A 1M5DA 4ELOA 1RKMA 1LCTA 4U21A 2AL5A 3OELA 2OBGA 3IB2A 3CIJA 3FATA 4ZEFA 1A55A 3TTNA 3N94A 4FECA 1R1NA 3FD3A 1I6BA 3ZKKA 3MZBA 1DPPA 1MQJA 3UK4A 2UXAA 2HQ0A 3T9VA 2F35A 4P11A 2X7QA 3TQLA 5AA2A 3D4GA 1MQHA 4HCYA 4ECFA 3PU5A 4JDFA 2F34A 4ZS9A 1T0KA 3V8XB 1TWYA 3KSJA 2O68A 4H5FA 2PVUA 1GR2A 1S7YA 3IOVA 1QKAA 4OETA 1B58A 3O97A 5ITPA 3OENA 3QIMA 4JXIA 3S9MC 4EF1A 4OESA 4UACA 1R9QA 4G68C 3OO6A 3PPOA 4E0WA 3PV0E 5AA2B 3N6UA 1LFHA 4IO6A 2HFBA 2XX7A 1FTMA 3JZJA 1DMBA 4NWDA 4BDNA 3SESA 5L8DA 3OD7A 4H5GA 5FTHA 3T96B 4ZZAA 4O3CA 2VHAA 1D9YA 3IJOB 4R6YA 4BDRA 3RY3A 2X7PA 3RLFE 4DCYA 4U1OA 3TZAA 4HS7A 2DOJA 4OHNA 1B0HA 2XHDA 3IB0A 4ZE9A 3MVWA 4KFQA 3DM0A 3KG2A 3TELA 2A5TA 4R6KA 5CM6A 2GFEA 4MLQA 2QMXA 4F19A 4F1UA 1SYHA 1B7HA 4AB5A 1IEJA 2IA4A 1JQFA 5H8FA 1LAXA 4RK2A 4U1ZA 1GTKA 3K4UA 3W9WA 2X26A 4FE8A 2ZNUA 4YAHX 3FJ7A 4ZEBA 3IO4A 2F7CA 3N26A 3VVEA 3MC2A 1XVXA 4OMBA 1M5FA 3QK6A 1QUIA 1PB9A 4BLAA 3S4UA 1PEBA 4IGTA 1Y1MA 3U93A 1B3GA 1IZ1A 1Y1ZA 2QMWA 2RC7A 1P1WA 3HCQA 1MXVA 4H1XA 4NWCA 2A5TB 4HW8A 2Y7PA 4GL0A 1SBPA 1H44A 5ELVA 1B4ZA 3M8UA 4N6PA 3LSLA 1B32A 4LQ5A 4ELRA 4TOZA 2O7IA 4G8MA 1MXXA 3TCFA 1EZPA 3N6TA 1JW4A 3SKPA 1AOVA 5IAIA 2B3FA 3PPQA 3U1OA 5HM4B 2KLFA 2B65A 3UIFA 5CC2A 5LOMA 1MXYA 5AA4A 4Q8RA 4GQOA 3MWBA 4PETA 3TUSA 2D21A 4XTCQ 4PFWA 1IIWA 2V93A 2O51A 2IEEA 1MH4A 4ND9A 1OVBA 2DE4A 2I6EA 4R74A 3MBPA 1Y20A 2DXYA 1N76A 1ATGA 5H8HA 1USYE 3TFLA 3UP9A 4TLMB 2THIA 3PPNA 3V5AA 3Q25A 3K6XA 5B7DA 4UA8A 2BJJX 1JEUA 4RYAA 3W15C 4EXKA 3IJXB 3A3UA 2D3IA 1GGGA 5H8SA 3CG1A 5EHMA 3RGYA 2Q8JA 4M4GA 2I3WA 4G8NA 4R73A 3K6UA 4KD5A 2ONKE 4U23A 3H3GA 1DSNA 1M5BA 1QJMA 1URSA 3TCGA 2DS9A 4MBPA 3VLWA 1CB6A 1JNFA 3K02A 3VDFA 3KN3A 4XKNA 2E0SA 1B0LA 3C34A 4OEUA 2NUVA 2VD2A 3B6TA 1UTBA 1FTOA 3PUWE 3GZGA 3IL1B 4KQPA 3CSGA 4FAJA 4O3AA 4NTLA 3MP8A 4YB6A 3ZS6A 5KDTB 4THIA 4NF4B 3PUZE 1SW1A 3BFUA 4WKMA 1SQYA 3CI8A 3K00A 4LQ2A 4Q0CA 1UTBB 3FXRA 2XXIA 2GHBA 1QVSA 4FJPA 1N7XA 1UIVA 3O6GA 1MY2A 2DWAA 2ZXTA 1FQDA 2UVGA 5FHNA 4KCDA 3C31A 4P0GA 3DP8A 2DVZA 4KYEA 4XXUA 2XX8A 1P99A 4LZ5A 1OVTA 3L6GA 3OO8A 1MPBA 4DIGA 1I69A 2VGQA 4C1TA 1N0TA 3I3VA 1MM6A 1B1HA 3IR1A 3MPKA 1IXHA 1PB7A 1O7TA 3FVGA 3OSQA 5TPAB 3A09A 2P1SA 1PC3A 2I0CA 3VFJA 4G8HA 2REGA 1VSOA 4PFUA 1F9BA 1FW0A 2FNCA 3LR1A 4GVOA 2NWJA 3EF7A 2A5SA 4H65A 4F1VA 3UN6A 3EQ1A 3PD9A 3HHFA 3H6TA 4OYVA 2Q89A 4QSCA 1EH3A 1US5A 2I49A 3OEKA 3HO7A 1B51A 3TODA 1AIVA 5EHSA 4X9TA 4RK9A 2DWJA 1CE2A 3FUZA 2Z22A 5AE4A 4F1YA 5DYHA 3RTWB 3MQ9A 1N84A 1Y4CA 2I4CA 2Q2CA 3Q27A 4R9FA 2XX9A 3MW0A 5I2NA 5I2KA 3UORA 4RPOA 1XVYA 3E3KA 3G3FA 1M5EA 1IUDA 4RNSA 1UQWA 2HAVA 4XKPA 2UVJA 1WODA 1QUKA 1DOTA 4IY6A 2ZYMA 3MVXA 1JVYA 4WEDA 3K2DA 3RT6B 4QRZA 3TYHA 3WAEA 1MXUA 2RCBA 1A8EA 4QFPA 2AIXA 5H8QA 4ZEKA 3OOAA 1BLFA 1R6ZA 4G4PA 2NOOA 1TFAA 3QUFA 4F18A 5I2NB 5I2KB 2ONSA 5CBRA 5I84A 4RY1A 3TPAA 4JWOA 1S50A 3M3FA 1ZKBA 4OTEA 5TP9A 4RXLA 2LAOA 1NNKA 3TTRA 1I6AA 3U72A 4X1BA 2O6AA 4IO7A 2OK2A 4P0IA 4POXA 2XXRA 3HN0A 3Q29A 1NKXA 5H8QB 3TMGA 1MQDA 4NMYA 1Y3PA 4F2QA 4I62A 4ZDMA 5M2VA 3Q28A 1NNTA 4Q5TA 1JW1A 5JK4A 3IAZA 2Q9TA 1XS5A 4R72A 1TFDA 2OLBA 3KN7A 2O69A 5TP9B 3WAFA 2Z8EA 4EQBA 1MQGA 3TAJA 1AH5A 1B5IA 1TT1A 3K0VA 1J1NA 5I59A 2PYYA 1LSTA 1WVJA 2XXTA 4BDLA 3PUYE 2QL3A 3JYRA 4YU0A 1PB8A 1P1NA 1NNPA 1JVXA 1II5A 3LSWA 2OWTA 1OIBA 3EHTA 2RINA 3K01A 5F7VA 4H8JA 1MQIA 1B4HA 3KOSA 4YMAA 3HV1A 4KHZE 1Z7ME 5I59B 3TCHA 1BIYA 1P1QA 1SW2A 4DXCA 3SEYA 4U2RA 4GFRA 3G3GA 1FCKA 4EDPA 2DXRA 5F1QA 3VE1B 3KSXA 1UTHB 4GL8A 4YB7A 4EXLA 4LA9A 4K3FA 4WEPA 4OENA 1DTZA 2GH9A 4ZEDA 3TTLA 2H25A 2VD3A 4F3GA 2ALUA 4M1VA 3CVGA 4GF8A 3C32A 1MPDA 3MZ1A 2I0BA 1EZOA 2F36A 1SD3A 1N04A 3K1NA 5DEXB 4OXVA 3DLNA 5IKBA 2F7AA 2PX1A 2I58A 1MDQA 4QF9A 3S9LC 3CR9A 1BTJA 3H6WA 2AYSA 1D3KA 3H6VA 1P1UA 3CFLA 4C0RA 2ZYOA 2CMOA 1AMFA 4U4SA 2HZKA 1SW4A 3C36A 3O66A 3PD8A 4ELPA 3O2AA 2E1SA 1YCJA 1B46A 3T22A 4NF6B 3VV5A 4KYDA 4GIZA 1A99A 3MZ9A 1B05A 5ITOA 3RTFB 5EYFA 2QS1A 2Q2AA 3P7IA 4U22A 4BDOA 4IO3A 3RPWA 1IXGA 1FQAA 1IITA 1Y9UA 3TQWA 3EHSA 5KZTA 3EPEA 5L9MA 1SVXB 3SEWA 4F22A 3TKDA 2RF1A 3O29A 4IO2A 4QFOA 2ZNTA 1IXCA 4QFNA 4NF5B 4PE5B 2VP1A 4NE4A 2XXWA 1YTVA 4OFLA 3KZGA 1SYIA 4DXBA 5B70A 2DVCA 4KCCA 3C9HA 4GLIA 2O1MA 1HSJA 3FJGA 3FZVA 1ZIUA 1NNFA 4F29A 4YZZA 2FA7A 1Q1KA 4G68A 3SERA 3KJ7A 1FQEA 2XXVA 5KDTA 4NF4A 3OMBA 3VXCA 1A54A 1LAFE 2D5WA 3H03A 2Z8FA 5HPQA 5K2XA 3MPLA 1MXZA 1HSLA 4RPNA 3KOTA 3PMWA 3IOTA 3R7XA 4YMBA 5DTBA 4G68B 3ONMA 5DT6A 3S2VA 3O28A 1ZU0A 2Y7WA 1LBCA 4ESWA 4ZEIA 1RYOA 1D4NA 3PPRA 1YAEA 4LZ8A 4ELQA 1URDA 3VLVA 1B9JA 3ECRA 3H6UA 4X48A 2R6GE 4JBZA 4KPTA 3HHGA 5BWJA 4BDQA 3MP1A 1NH8A 3I6VA 4I1DA 4N13A 5TPAA 2XXXA 4YB5A 4O3BA 3SEXA 3THIA 1XOCA 1PBQA 3DP4A 2DP8A 4KR5A 2H5YA 5A5XB 3OEMA 3USDA 4OERA 3GBBA 2OCUA 5CRYA 2B3BA 3TTMA 1S9TA 1VE4A 3T9HB 3PUXE 3KJTA 3UGWA 2O84X 3TTKA 3OO9A 4LUBA 4PP0A 1VFDA 2I48A 1FTKA 4DLDA 2Q88A 1LFGA 2I3VA 3U94A 2QS4A 4EF2A 3R6UA 1NL5A 4PQJA 1QW0A 2Y7IA 4LATA 2M8CA 4F31B 3CFXA 3RN8A 3KN8A 4XKRA 1H76A 1KWHA 2UYEA 2UYFA 1ANFA 3RUMA 3IOWA 3IK6B 3G3KA 1LB8A 4MFIA 3T9XB 2XXHA 5DVFA 2Z8DA 1PBPA 3CG3A 3MUQA 2F78A 3GXAA 1O64A 2WKYA 3KFMA 3FXUA 3IB1A 4OZ9A 3SEUA 3BBRA 5I56A 3K1MA 3PPPA 1B5JA 1Z7NE 1ELJA 5I57A 2V3QA 3T93B 4LVQA 2F8DA 1H3DA 1IQ7A 1HSEA 2DWHA 4KYSA 2DE2A 1POY1 4H67A 4YICA 5CI5A 4IO4A 2PBWA 1SI0A 1OMPA 3QSLA 1ZLQA 3OO7A 3E9XA 5CBSA 4N07A 2R71A 1B7ZA 3JV9A 3O9PA 2HEUA 5I56B 3H06B 5L9SA 3E13X 4GXSB 5I57B 1Q35A 4G2ZA 3D4CA 1A7LA 3H4ZA 4DDDA 3ILUB 4AQ4A 1ZBMA 4HTGA 1B2HA 4F3SA 1MXWA 1M5CA 4OQOA 3GLBA 4IO5A 3V83A 1OLAA 3TDJA 3HPIA 3QXMA 3U8QA 3IORA 3ZSFA 2Y7KA 1LB9A 3OXNA 4TLLB 2QS2A 1ZJLA 4H0WA 1GVCA 3VLUA 4JB7A 3T66A 1US4A 2YLNA 4GWOA 4I8CA 1FQFA 1QULA 2F5XA 3M3KA 1B1XA 4F3BA 4F2OA 1DPEA 3G3JA 2DSFA 2XXQA 4QHQA 3C4MA 2XD2A 4F39A 4JSOA 4G77A 3O6IA 4YKIA 1AL3A 2ABHA 1SI1A 4PFTA 1N7WA 2O7UA 3H7MA 1XHYA 1QUJA 1OQHA 3CSBA 1LBBA 1FTJA 2Z23A 1MY0A 2CZLA 2ZYNA 4R2FA 4AB6A 3GBAA 4HCWA 1OLCA 1MPCA 3PGFA 5FHMA 1UIUA 1RYXA 1MM7A 3SETA 1POTA 5JTYA 3ODBA 3PMXA 1O63A 1B7UA 1ZMGA 4BDMA 4FIMA 2OZZA 4YKJA 2H99A 5KCJA 3HSTA 1UTHA 5CMKA 3MAMA 5AA3A 1H45A 1B6HA 4JWXA 4FORA 4LONB 1XC1A 1JW5A 2W7YA 2RCAA 3K1PA 2F7BA 2PT1A 2XXYA 2F6PA 1NMUA 3EHUA 1BP5A 3RQTA 1H43A 2H4IA 1B3FA 3IOUA 3DELB 1Y3NA 1LCFA 4H8IA 5JTYB 3FGSA 5DEXA 3TEPA 2QS3A 1OQGA 4Z7EA 4QSDA 3FXQA 3M3LA 1D9VA 1FQCA 4EUOA 4EQ7A 3V89B 5KCJB 4DZ1A 4MLVA 5CMCA 4Z0IA 4NEDA 4IB2A 1N3XA 2FYIA 3VXBA 1NH7A 3G3HA 1GV8A 3MP6A 1VR5A 4NF6A 2OWSA 1R9LA 1B3LA 2I4BA 1N3WA 3SDFA 4IY5A 2V3UA 2V25A 3ILTB 4L17A 2GRVA 4ESXA 5H8FB 5L9OA 3CFZA 3VVFA 4DXUA 3FVNA 2NVUB 3VVDA 5J1DA 1DTGA 4NF5A 1A40A 3C33A 2P2AA 4WXJA 2O1LA 1LAHE 1Y3QA 4JWYA 3IX1A 3FV2A 2HZLA 5ISUA 2YPNA 3LBSA 4LP2B 3FJMA 1LLSA 3FVKA 3BKIB 2ZMBA 4ZE8A 2ANJA 3SEVA 1JETA 4OFOA 1B40A 3T9UA 2F6GA 2H98A 3G3IA 2G29A 2DWIA 2RC9A 3E4RA 4OVJA 1MY4A 2UVIA 1QKBA 1BKAA 1MH3A 3RNNA 2HXWA 5AA4B 2Y84A 4YKPA 3LSXA 3F11A 3W9VA 4C1UA 3K6WA 3PUVE 2ZYKA 1B3EA 3PMVA 4POWA 4ZECA 5CMMA 2YJPA 2VOZA 2F97A 4IGRA 2H9BA 5DVIA 4RA1A 1MRPA 5H8HB 3FASA 3KBRA 4U4XA 3MVZA 3O6HA 3RT8A 1VFEA 1B5HA 2UVHA 4EQ9A 4GD5A 1L5TA 3FVOA 2DYXA 1A8FA 3B7DA 1YPNA 3B6QA 5H8NA 3IO6A 1EU8A 3C35A 1URGA 5JEIA 3DP6A 1JEVA 4NF8A 1MY1A 4LZ7A 5A5XA 5AA1A 1XT8A 3MJNA 4R6HA 4ISUA 3KEIA 1LAGE 5HBCA 2ONRA 4PFYA 1SW5A 4DE8A 3A3CA 4KI0E 4R75A 1NFTA 4XKQA 4ZZEA 5AA2D
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4X1DA 4JSDA 2GHAA 3ZKLA 3KGCA 4DCXA 5H8NB 3MVYA 4GWSA 3NOHA 3OSRA 3AXFA 2FHYA 4YKKA 4NF8B 1SDXA 3I5OA 4QFLA 3B6WA 2QPQA 4QSEA 2DE3A 4MH5A 3L6HA 2V84A 2V3TA 1EZ9A 1P1OA 1MS7A 2NXOA 3LC8A 1B52A 4XFEA 4N91A 2Q74A 3QAXA 2DQVA 3QUJA 4O7MA 4F3PA 5I58A 5ICQA 5ICTA 1MG1A 2ZZXA 1PDAA 4PFRA 4GXAA 4OWDA 3A29A 5FHOA 5I5PA 4MF3A 3G7WA 2VT5A 3S9NC 3EN3A 1LGBC 3BIHA 1TXFA 4MEVA 1I6QA 2QVRA 4R2BA 2ZNSA 5BUUA 2HCAA 1FTLA 4FEDA 4O7IA 1LFIA 3CRBA 1ZTYA 2BJIA 2R9JA 4GRKA 2ESNA 3FIRA 1FPJA 3K6VA 1USYH 2QRYA 2G93A 3FV1A 5I58B 4P3LA 4H6DA 1B3HA 4OEVA 2PT2A 2QSXA 2QJEA 4OFJA 2REJA 3LSFB 3U92A 3QYTA 4FEBA 4FATA 4GOTA 2RC8A 2ZZVA 1WDNA 1Y4TA 5EQ9A 1MDP1 1FQBA 3N5LA 4R9GA 2RKMA 1IXIA 4QFKA 3R26A 2Y7RA 4Q30B 4TQUQ 4UABA 3LUYA 4E0XA 2XD3A 5TU0A 2HAUA 3UA8A 3E78A 1NUZA 3S9EA 2PMSA 2P0SA 3BFTA 1FPFA 2OJTA 4ONYA 2XXUA 5K2YA 5FTIA 4I9DA 5CMBA 1MY3A 5DVJA 4XIGQ 2AL4A 2XXPA 5IZZA 4RJZA 3Q26A 1M5DA 4ELOA 1RKMA 1LCTA 4U21A 2AL5A 3OELA 5EYGA 2OBGA 3IB2A 3LUZA 3CIJA 3KC1A 3FATA 4ZEFA 1A55A 3TTNA 3N94A 4FECA 1R1NA 3FD3A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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