5H8SA

Structure of the human glua2 lbd in complex with gne3419
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8sA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8sA02
4ZEDA 2ZYMA 3DP8A 4RY1A 4M4GA 2G29A 3KOTA 4Q8RA 1Q35A 1UTHA 2A5SA 3U92A 1POY1 4FECA 1SD3A 4RK9A 3LSLA 3UIFA 3MVXA 1B40A 1UTHB 2VHAA 3G3IA 3VV5A 1LSTA 1MY4A 4PP0A 4P0GA 3FUZA 4LATA 2V84A 5M2VA 4OVJA 2DP8A 1AL3A 2ZNUA 4OHNA 3PMXA 1RYOA 4ZEKA 3E9XA 4KYDA 2GRVA 3VLWA 1URSA 1B5JA 3ECRA 3BKIB 1LCTA 2HQ0A 1A99A 1PB7A 3PPQA 4GQOA 3IL1B 1MDP1 3DM0A 2ONKE 1HSEA 5EHMA 2AL5A 1JNFA 3MAMA 2RINA 3OEKA 1DPPA 1TFAA 4X9TA 4OERA 1P99A 4EXKA 4EXLA 4LZ7A 4H8JA 3H6UA 4F1VA 4YICA 3N5LA 4OQOA 4KQPA 1R9QA 3H06B 3IK6B 1BIYA 3DP6A 5A5XA 3V8XB 4BDOA 3HHGA 2H9BA 2DS9A 3IO4A 1B4HA 1LBBA 3QK6A 1MXYA 4LA9A 5A5XB 3K0VA 2Q8JA 1DPEA 1F9BA 3MJNA 3MZBA 2M8CA 4C1UA 2YJPA 4U4SA 4GL8A 3OXNA 1GR2A 5I57B 5EHSA 5H8NA 4TLLB 3S4UA 5I59B 3IAZA 2XX7A 4G8HA 4P11A 4YB6A 3IJOB 4TOZA 1Y4TA 1VE4A 4F29A 2P2AA 5FHMA 2Q9TA 4XXUA 2QMWA 3TEPA 1BP5A 3QAXA 2D21A 4X1BA 4ELRA 4ELQA 3TQWA 1A7LA 2UVJA 4G77A 1FCKA 4BDMA 5K2YA 5CBSA 2OBGA 2OLBA 3K02A 1B0HA 5KZTA 5AA4A 1I6AA 1DMBA 2F6GA 3KEIA 5JEIA 2QS4A 3ZS6A 1B1HA 4NF4A 2H98A 4OXVA 1Z7NE 1LGBC 1O63A 5AA4B 3PPNA 3OEMA 4BLAA 4ZEFA 2P0SA 4OYVA 5CI5A 1OLAA 3FASA 4N07A 3IX1A 1B3EA 4YAHX 3EHUA 2UVHA 1SBPA 4G68A 1S7YA 1RKMA 4E0XA 2IEEA 2NOOA 3CI8A 4F2OA 2QMXA 1FQAA 5ICTA 4U2RA 4OFOA 3ILUB 3RLFE 4G68B 3LSXA 1L5TA 4DXUA 2HAUA 1MG1A 3IOUA 2FYIA 4IO2A 3FXUA 4ZEBA 3OELA 4IO3A 5K2XA 1MQIA 3D4CA 4R9FA 1O64A 1SW4A 3O28A 1JQFA 3I6VA 3FVNA 1LLSA 1VSOA 2FNCA 3F11A 2XXQA 3H7MA 3RTWB 3C33A 4OETA 2X26A 5AA2D 4P0IA 3MVYA 3TTMA 1MY0A 2I49A 1QW0A 2QSXA 3A3UA 3HCQA 3BBRA 1IUDA 1OVTA 1R1NA 2UXAA 1YTVA 4HW8A 2H5YA 2DE2A 4RNSA 2F36A 1MH4A 4FORA 3OENA 5J1DA 3EQ1A 3E4RA 1TT1A 4H5FA 1NH8A 4GIZA 3C36A 3MPLA 4Q0CA 3CG3A 3RY3A 4GRKA 1AH5A 5CC2A 1VFDA 3WAEA 4QFLA 1Y1MA 4YMBA 3D4GA 1MXZA 2ABHA 1OVBA 1A54A 1HSJA 3MUQA 3G3KA 3PPRA 4GWOA 3USDA 2LAOA 4ZZAA 3IB0A 1IXIA 4GXAA 1MDQA 1OLCA 1D4NA 2F35A 3QXMA 1MM7A 3T66A 4POWA 3OSRA 4ECFA 3T9HB 4O3AA 3SERA 2I6EA 1MS7A 3P7IA 3MC2A 2XD3A 3A09A 4YU0A 5KDTA 3S9LC 1LFIA 3N6UA 1ZU0A 3V83A 3IOVA 1USYH 1I69A 2I3WA 3C32A 3SEWA 2D3IA 4QSDA 3IB2A 4R74A 3K00A 4M1VA 1IXGA 4PFTA 2GHAA 3MWBA 4LP2B 2A5TA 3HHFA 1M5BA 1SVXB 1EH3A 1MQJA 5B70A 4NF6A 4EQBA 5CMCA 2RF1A 2THIA 5DEXB 5TPAA 1IEJA 1B3HA 2A5TB 4G68C 2H4IA 3I3VA 1SYIA 3C31A 4C1TA 3C9HA 1MH3A 1LB9A 4NF6B 2I4BA 3PUZE 4AB5A 3M3FA 5TPAB 1QJMA 3CR9A 1KWHA 1NNFA 1Y4CA 2ZNSA 2H25A 1R9LA 4QSEA 5AE4A 3TMGA 1A8FA 3RNNA 4F2QA 1UIUA 2ZYKA 1JEVA 5H8QA 1P1QA 2HEUA 4NWDA 4NE4A 4LVQA 1GVCA 2RC8A 4ESWA 2F6PA 1BKAA 4R75A 3T9VA 2QS2A 3O29A 4OFLA 3M3LA 1ZJLA 3KG2A 4QF9A 2OWTA 5I56A 2DXRA 3UA8A 2AL4A 1B6HA 4XKRA 2NUVA 3SKPA 3VXCA 1JW5A 5FTHA 3FGSA 3K1NA 1CB6A 5I56B 3H3GA 1TWYA 3TCFA 3PU5A 4IGTA 1PBQA 2O7IA 3PPPA 1FQDA 1YPNA 4G2ZA 1OQHA 2V25A 3U94A 3FJMA 4R2BA 1H3DA 1EZ9A 2PVUA 3OMBA 4O3CA 4KYEA 2AYSA 1LB8A 2V3QA 5CMBA 1B1XA 2HXWA 1QUJA 4U4XA 4GVOA 3TCHA 3KFMA 4QSCA 1US4A 1FQEA 1A55A 1DTZA 3LC8A 3QSLA 2Q89A 4F18A 3KOSA 4NF5B 1NFTA 1MXUA 4NF8A 4PE5B 4IO4A 4EF2A 4G4PA 3RGYA 3KZGA 1JEUA 3SEVA 3KSXA 1S9TA 2R6GE 2H99A 4OENA 2F34A 4NF8B 4LQ2A 2V3UA 5HPQA 2OWSA 1MQDA 3TFLA 3KN3A 3PD8A 4DZ1A 4FIMA 3MVWA 1XVYA 2QPQA 1PDAA 3C35A 4RYAA 4I62A 1II5A 4PQJA 4AQ4A 4LZ5A 1FTKA 4IO7A 3ODBA 1AOVA 4TQUQ 3VVDA 4WEPA 2FA7A 2E0SA 3GXAA 2RC9A 3FV1A 1ZMGA 3OSQA 5I57A 1O7TA 3SEXA 4G8NA 2WKYA 2Y84A 4KR5A 3L6HA 1FQBA 5I59A 4QRZA 4HS7A 2DVZA 4KI0E 4EUOA 3IO6A 1WODA 4F39A 3OO7A 1UTBB 3MP1A 4TLMB 4OZ9A 1URGA 1B0LA 4Z7EA 3TODA 4U21A 4XIGQ 3MZ1A 1SQYA 3U8QA 3MP8A 4IGRA 2ZNTA 3L6GA 1GV8A 3EPEA 3CIJA 1B05A 4IY6A 4ZZEA 3LUYA 2PBWA 3UK4A 4RPNA 3Q28A 2ANJA 4GL0A 4EDPA 5ISUA 4I8CA 1B3FA 2I0CA 5CMMA 1QUKA 1ZTYA 3Q29A 2O7UA 5KCJB 1TFDA 1H45A 1MY1A 2GFEA 5HBCA 3K6XA 3VDFA 1H76A 1US5A 3OD7A 4FJPA 1QVSA 3K6WA 3PMVA 4BDLA 5I58A 2V93A 3B7DA 3GBBA 2O51A 1IXHA 3SDFA 1JVYA 3K1PA 4YZZA 2HZLA 2E1SA 1QKAA 5I58B 5I2KA 2DQVA 4IO6A 1JVXA 3EF7A 4WEDA 5I2NB 3FXRA 2DYXA 4HCYA 4JBZA 5I2KB 2ZMBA 1GGGA 2DWHA 3VE1B 5IKBA 3RN8A 3TDJA 4BDQA 3G3GA 3UN6A 4C0RA 3Q26A 2XXVA 1JETA 3VXBA 4MH5A 1NH7A 2ESNA 2F7BA 4KHZE 4NMYA 4GD5A 3JZJA 4XTCQ 2BJJX 3VLUA 4F3PA 4LZ8A 4KCDA 4DDDA 3H6WA 3TYHA 1B4ZA 2UVIA 4PETA 3T93B 2PT1A 3BFTA 1H43A 3TTNA 1PBPA 3SEUA 3G7WA 2I3VA 3MPKA 3W9VA 3PUXE 4POXA 1LBCA 3O2AA 3N26A 1EZOA 4DIGA 2IA4A 2W7YA 3JV9A 3FD3A 2XXTA 1PEBA 4DE8A 4F1UA 4GXSB 3RT6B 2NVUB 4YKIA 4ZEIA 1DSNA 4IO5A 4NTLA 2Y7PA 5AA2A 3CVGA 4R6KA 3QIMA 4HTGA 4PFWA 3E13X 1WDNA 4JWOA 4R2FA 1NL5A 5AA2B 1B3LA 3OO6A 4N6PA 3TQLA 1NNKA 5CBRA 5L8DA 1NMUA 3DP4A 3FZVA 2UVGA 3FVKA 4ZECA 4PFUA 5JK4A 2Y7RA 4YKJA 3RUMA 2D5WA 4RJZA 1Y3QA 2Y7WA 4I9DA 4QFOA 2B3FA 1LAFE 1SI1A 1Q1KA 4OTEA 4OMBA 2DXYA 3HN0A 3RTFB 1R6ZA 4HCWA 4DXCA 3C4MA 4ZE9A 2DE4A 2F78A 3QUJA 3ZKLA 2Z23A 1DOTA 3S2VA 3H6TA 2QJEA 1RYXA 3A3CA 3VVEA 1FQCA 3PUWE 3VLVA 1MXXA 4ZS9A 3PMWA 1N7XA 2XXYA 4F3BA 3TZAA 1B3GA 3MW0A 3RT8A 1USYE 3O6HA 2O1MA 2OK2A 2VOZA 5DEXA 1XS5A 2Z8EA 2XXXA 3TELA 4ESXA 5HM4B 1SYHA 4JXIA 3LR1A 2DSFA 4GFRA 3G3FA 2HCAA 1AMFA 4U22A 3FATA 4PFYA 4RPOA 1IXCA 1B52A 4YKPA 3ZKKA 2ZYNA 2ZXTA 1SW1A 4H0WA 1MPCA 1MQHA 2Z22A 2Z8FA 4DXBA 4UACA 4EQ7A 2UYFA 2B65A 1PB9A 3SESA 4O3BA 4X1DA 3T9UA 1MQGA 3AXFA 2ONSA 1YAEA 1HSLA 5AA1A 2F7AA 1Y3NA 3FVOA 2F7CA 1ZKBA 1ZBMA 3CRBA 3PD9A 3SEYA 2Y7KA 4H65A 4GF8A 3B6QA 2O1LA 1FQFA 3HSTA 1IIWA 4ONYA 5LOMA 1UQWA 2HFBA 3KN7A 4F3GA 4F3SA 3TCGA 1I6QA 3CFZA 2RCBA 5FHOA 2XXPA 3QUFA 1JW1A 5F7VA 4LQ5A 4RXLA 3K6VA 3HO7A 3FJGA 3KBRA 1B51A 5DTBA 2PX1A 2XX9A 3B6WA 5BUUA 3E3KA 4U1OA 1ANFA 3T96B 1FTOA 4QFNA 1SDXA 3KGCA 4Q30B 3GBAA 1D3KA 3KN8A 4JDFA 4NF5A 1N3WA 4H8IA 2DWIA 5DYHA 3IORA 5JTYA 3RQTA 3DLNA 3Q27A 1VR5A 2V3TA 3R7XA 4H5GA 1N84A 4AB6A 5FTIA 2NWJA 5JTYB 4H67A 3THIA 2RCAA 4EF1A 5CMKA 1ELJA 1Y20A 4DLDA 3QYTA 4MLVA 1QULA 1FTMA 3ONMA 2XXUA 4R6HA 3FVGA 4NEDA 4BDNA 2REJA 4FEBA 2VGQA 1XHYA 2DVCA 3DELB 2O69A 4K3FA 3TTLA 4YKKA 1B5HA 5FHNA 3K6UA 2GH9A 3S9NC 1XT8A 5ITOA 1MY2A 1OMPA 1MPDA 2R71A 1NNPA 3MZ9A 2XXHA 4IY5A 2VD3A 1H44A 1UTBA 1LAHE 1B46A 4R72A 5B7DA 3MQ9A 5L9MA 3ZSFA 4XKNA 3VVFA 4MF3A 4MFIA 3HPIA 3IOWA 4WXJA 1EU8A 3KJ7A 2Q2CA 1Y3PA 1LFHA 2Z8DA 1Y9UA 3K01A 4F22A 3IJXB 3IOTA 4JWYA 1TXFA 3EHTA 4G8MA 2DWAA 5DVFA 2F97A 2RKMA 4R6YA 5KCJA 4KD5A 4ZDMA 5BWJA 3N6TA 1YCJA 1N76A 4JSDA 3CG1A 5H8NB 3TPAA 1LCFA 3CFLA 4OWDA 3S9MC 4JSOA 2QS3A 3W15C 1ATGA 3HV1A 3FXQA 1T0KA 4RA1A 4LUBA 4EQ9A 4MLQA 4MBPA 5AA3A 5H8HA 2GHBA 2XD2A 3LSWA 3FIRA 5DT6A 3V5AA 5H8HB 1B7ZA 3CSBA 4F1YA 1ZIUA 1P1OA 2B3BA 5I2NA 2AIXA 1B7UA 5DVJA 1MY3A 3MVZA 4DCYA 3O66A 1B5IA 3O6IA 5CRYA 3GZGA 1P1UA 1POTA 1XC1A 4H6DA 4LONB 4Q5TA 1BLFA 4QFKA 3WAFA 4OESA 4XKPA 4NF4B 3RPWA 2PYYA 3LBSA 2ONRA 1LAGE 3OOAA 2I58A 1M5CA 4OEVA 5EYFA 1I6BA 2CZLA 2F5XA 4KCCA 1MXWA 3R26A 1Z7ME 2X7QA 1NKXA 3K2DA 3IB1A 5DVIA 1N3XA 3M3KA 4THIA 4WKMA 2HZKA 2O84X 4E0WA 2DOJA 1WVJA 3PGFA 2QRYA 3UP9A 3PUYE 3VFJA 4U23A 1AIVA 4ND9A 3PV0E 4YMAA 5L9OA 1QUIA 1EZPA 1B2HA 3H6VA 3U72A 1IQ7A 3KJTA 2XHDA 2RC7A 4Z0IA 2DE3A 5ITPA 2R9JA 3R6UA 2XXWA 1N7WA 3SETA 3OO9A 3TUSA 2ZYOA 1P1WA 2XXIA 3TTRA 3K4UA 5ICQA 4FE8A 1PC3A 1MXVA 5F1QA 5H8FA 3Q25A 1SW5A 2UYEA 3S9EA 4KYSA 1D9YA 3TAJA 2HAVA 1CE2A 3PUVE 3FJ7A 1URDA 1B7HA 5H8FB 2OJTA 4ZE8A 2Q2AA 2O6AA 3O9PA 1IITA 4ELPA 1LFGA 2YPNA 2REGA 1GTKA 2XXRA 2I48A 3W9WA 3N94A 2I4CA 3PPOA 1PB8A 2ALUA 5IAIA 4KFQA 3CFXA 3UORA 1FW0A 5I84A 2OCUA 5H8SA 2NXOA 2I0BA 1ZLQA 4U1ZA 4H1XA 3MBPA 1B32A 3ILTB 4F19A 4IB2A 1LAXA 2KLFA 1SW2A 5TU0A 2XX8A 2DWJA 4OFJA 1OQGA 2VD2A 3IR1A 4L17A 4YB5A 2PT2A 4R9GA 4NWCA 2O68A 3CSGA 3FV2A 2PMSA 3V89B 1IZ1A 3T9XB 1D9VA 1P1NA 4BDRA 1M5EA 3U1OA 2Q88A 1A40A 1M5FA 1UIVA 3MP6A 3H4ZA 2F8DA 3OO8A 1VFEA 4YB7A 2YLNA 1OIBA 4QFPA 3H03A 2P1SA 4GOTA 5KDTB 4X48A 3G3JA 4RK2A 3O6GA 4F31B 1Y1ZA 2QL3A 2QS1A 5TP9A 4ELOA 1QKBA 3GLBA 3EHSA 1J1NA 4UA8A 3UGWA 3C34A 3T22A 1B58A 1S50A 1DTGA 5TP9B 1B9JA 5L9SA 3TTKA 1N04A 5ELVA 3O97A 1MPBA 4ISUA 3EN3A 1JW4A 4JWXA 1FTLA 3G3HA 3B6TA 4JB7A 1FTJA 3K1MA 2G93A 1XVXA 1SI0A 4N13A 3LSFB 4OEUA 1M5DA 1BTJA 1MM6A 4FAJA 4FATA 3U93A 4XKQA 4QHQA 1MRPA 3KSJA 1N0TA 2Y7IA 1A8EA 1XOCA 3JYRA 3I5OA 4DCXA 4FEDA 4KPTA 4I1DA 2VP1A 2X7PA 5H8QB 2OZZA 3TKDA 2CMOA 3BFUA 1NNTA 5CM6A 4R73A 4GLIA 3M8UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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