5H8SA

Structure of the human glua2 lbd in complex with gne3419
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein
source organism Homo sapiens
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
total genus 82
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8sA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5h8sA02
2P2AA 4FIMA 4FEDA 4F22A 4MLQA 4IGRA 4ZEFA 1OMPA 3OO7A 3UIFA 3H6TA 3M3FA 1JW1A 3RPWA 2I58A 1MQHA 4R73A 3ILTB 3MBPA 2PBWA 4R9GA 2VD2A 5HPQA 2Q2AA 4YKIA 1ELJA 1B2HA 4YB5A 1I69A 3TTLA 1LGBC 4PFTA 1FW0A 2M8CA 4LZ8A 1B0HA 1MQJA 3SKPA 4P11A 4ZE9A 2QPQA 3RY3A 1MH4A 2OBGA 3C33A 5K2YA 1B1HA 1EZOA 4R75A 1SQYA 1SW1A 3UK4A 1DOTA 4H65A 3HSTA 1TFDA 2GH9A 1UIVA 3OSQA 1PC3A 3G3JA 4O3BA 3W15C 3TTNA 3RLFE 1H43A 3UGWA 2UVJA 1NMUA 1HSJA 3H6WA 4YB6A 4MH5A 2A5SA 4POWA 3FV2A 1MPBA 1MY2A 3OELA 1A54A 5CBSA 2I49A 4GXSB 3IAZA 5HM4B 1LB9A 3RT8A 3CG1A 2HCAA 3DP6A 3PPPA 4FJPA 2O1LA 2F7AA 3QK6A 3PUVE 4IO4A 3HV1A 1JVYA 4LUBA 2O84X 3R7XA 2NUVA 4IO3A 5CBRA 2Z22A 2W7YA 2AYSA 3N6UA 2F8DA 2I4CA 3RGYA 3KN3A 3H4ZA 3EN3A 1FQCA 4OHNA 4I8CA 2IEEA 3VLWA 3VVEA 3KG2A 2B3BA 4ZE8A 2H4IA 1PBPA 2Y7PA 4K3FA 1DPPA 2XHDA 5FHOA 2F78A 2D5WA 4G68A 3HCQA 3UORA 3G3GA 2REJA 3KGCA 1R9LA 3PD9A 2F7BA 3KN8A 1YAEA 4Q0CA 3T93B 3IK6B 3OO6A 2HAUA 3OXNA 1P99A 4Q5TA 1VE4A 5K2XA 3D4CA 2PX1A 4LVQA 1OIBA 4AQ4A 4UACA 3OENA 4AB5A 4YMBA 4NF5B 5AA2A 2DWIA 4U2RA 3VLUA 4R72A 1FQDA 2GHAA 4H8IA 4R2FA 3IO6A 3DM0A 4OFOA 4H8JA 4NF6A 3O2AA 1H76A 4U1OA 4E0WA 3U94A 3PV0E 3FGSA 3VDFA 4EF2A 2Q88A 2HFBA 2G93A 5I2NB 4Q8RA 1SW2A 4NMYA 1Y3PA 4DXCA 2I0CA 2QL3A 3EPEA 4OMBA 3LSXA 5LOMA 1A7LA 2UYFA 4IY5A 3SEUA 1LAHE 3KOSA 2DS9A 3M3KA 3T9HB 3MPLA 4YICA 4ZEIA 4G77A 2FA7A 3BFUA 4NWDA 3VFJA 1P1QA 1Y4CA 3E9XA 4E0XA 3FASA 3IX1A 1M5FA 4DIGA 4OENA 3WAFA 1NNPA 3G3IA 1VR5A 1B51A 5M2VA 3CFXA 3ZKKA 3IB2A 1P1WA 1VSOA 2HZKA 2A5TB 1Y1MA 4DXUA 2I4BA 1D4NA 4YKPA 4ELRA 1ZBMA 4X1DA 1US5A 3K6WA 2ZNTA 4GFRA 4OEVA 1B3FA 1B3HA 4R9FA 4BDRA 2G29A 4PFWA 2RF1A 4HTGA 4JWYA 2XD2A 3IJXB 3IOUA 4ZEDA 3OSRA 4R6KA 3O9PA 1LBBA 1I6BA 3K6UA 3IB0A 1B6HA 4F3GA 3MVYA 3HHGA 1B5JA 1ATGA 1B4ZA 2O7UA 4KYSA 2XXIA 2V93A 1MPDA 1IITA 4ZEKA 2V3TA 3SESA 1J1NA 1QVSA 4PE5B 5J1DA 2DSFA 4QFKA 1MQIA 2DWAA 3KJ7A 1CE2A 3U93A 2X26A 2O6AA 2H5YA 3TCGA 1DSNA 4EDPA 4FAJA 4OWDA 4R6YA 2OK2A 2DXRA 3THIA 3IJOB 3I3VA 1ZLQA 1H44A 3GBAA 4Z7EA 2ONKE 4ISUA 4YMAA 3A09A 4ZZAA 3MAMA 2KLFA 3B6TA 2FYIA 1B58A 4OFLA 2F7CA 5CMMA 4G8HA 1SI0A 5DT6A 1URGA 4NEDA 3EQ1A 2O68A 3RQTA 3K01A 2RC9A 1JW5A 1JETA 1N3WA 1TXFA 2CZLA 1SVXB 1DMBA 5EHMA 4ESXA 1UQWA 1D9YA 2QS4A 2ZYMA 1I6QA 5JK4A 1NH7A 4DDDA 2I48A 1Y3QA 1FTJA 1CB6A 4GIZA 3C9HA 3SEXA 1ZJLA 4OXVA 4H1XA 3DP8A 4WKMA 5AA3A 3S2VA 1POY1 4FORA 5ISUA 4KYDA 3IOVA 3G3HA 1NKXA 1P1NA 4PETA 4KD5A 4NF4A 3JYRA 3C31A 5EHSA 2X7PA 2O7IA 4DXBA 4RY1A 2DYXA 4IB2A 2DQVA 4GQOA 3T9VA 2YLNA 3Q29A 2QS1A 5I84A 4YB7A 3MZ1A 2AL4A 1MRPA 4RPOA 1MM6A 3C4MA 2V3UA 1B46A 4ELQA 1IXIA 4JWOA 3V89B 4AB6A 4LA9A 1SW4A 3MVXA 3TUSA 3VVDA 2QMWA 3OEMA 2P0SA 4LP2B 3FVKA 3SDFA 4EQ7A 1S7YA 2PYYA 3KBRA 3QUJA 3KN7A 2Q9TA 2DVCA 3TAJA 3U8QA 5TPAA 4BDMA 1N84A 3USDA 3O6IA 1DTZA 3E3KA 4U22A 4O3AA 3K00A 1RYXA 1AH5A 1B0LA 3TZAA 2NXOA 4H67A 1A8FA 1MXUA 5KCJB 1NNFA 3QYTA 4DCYA 5KCJA 2X7QA 1MDQA 4RYAA 1M5BA 4F19A 3L6GA 3PMWA 4RA1A 2DXYA 1P1OA 3VV5A 1B05A 3K0VA 1EH3A 1O7TA 3E13X 1L5TA 2VGQA 3FJGA 4OYVA 2ZYOA 5ICTA 1UTHA 4JBZA 1AOVA 3MP8A 3LBSA 3FUZA 2Y7WA 3TTKA 4I62A 1LCTA 3SEYA 3VVFA 3LC8A 3PMXA 4QFLA 3T22A 1JW4A 4FEBA 4UA8A 1P1UA 2ABHA 1SI1A 3OEKA 1A40A 4FECA 3O6HA 2HXWA 2R6GE 4ELOA 1IQ7A 1RYOA 2UYEA 3E4RA 4U23A 1FQBA 1MPCA 5AA2D 3RUMA 3PMVA 1JVXA 3FJMA 3FJ7A 2NOOA 2XXXA 3CVGA 3GXAA 1PEBA 4I9DA 5IKBA 3PU5A 2V84A 3FD3A 1B3LA 5H8QA 3MZBA 1MXYA 3S9LC 4F3PA 3S9MC 5H8SA 2RC7A 1OLCA 3TFLA 1YTVA 3MW0A 3JZJA 1QUJA 4YZZA 3QAXA 3U92A 2ONRA 3M8UA 2DVZA 1H45A 4G68B 1XVYA 4RXLA 3H6VA 2RINA 5FTIA 1B5IA 5DEXA 1JQFA 5ICQA 1GGGA 4KYEA 3ODBA 4OEUA 4ZEBA 1N7WA 5CMCA 5I56A 1IIWA 4JWXA 3B6WA 1XVXA 4GL8A 2QMXA 1PB7A 4Q30B 1DPEA 2XX9A 4BDLA 2XD3A 4IGTA 4ECFA 5AA2B 3TCHA 4BDOA 2XX7A 3FXRA 1SDXA 1N76A 3Q27A 4NF6B 4WEPA 4M1VA 4MFIA 2IA4A 1D9VA 1SD3A 5CM6A 4ELPA 4GL0A 1BP5A 5I57B 5B70A 3IOTA 1FQAA 3LUYA 1VFDA 4H5GA 5I57A 4XXUA 4C1UA 1OQHA 3TPAA 1B40A 2Y84A 4GXAA 3H03A 2UXAA 3VLVA 3HPIA 2ZNSA 1XT8A 1FTLA 2OWSA 1Z7ME 1M5EA 2ESNA 5L8DA 5KZTA 1S9TA 3UA8A 1UTBA 5A5XA 1B3EA 2R9JA 3N5LA 3B7DA 5L9SA 2XXHA 1ZMGA 1LSTA 1OLAA 4QSEA 3D4GA 1MDP1 3DLNA 4QF9A 2I6EA 3MQ9A 5KDTA 2F6PA 3MVZA 3IB1A 4DLDA 3H6UA 4JSOA 3O97A 1POTA 4XKPA 3PGFA 1D3KA 1QKAA 5AE4A 3CR9A 4M4GA 4IY6A 3IL1B 2I3WA 3N94A 1SW5A 4POXA 1WODA 1GV8A 4X48A 4XTCQ 2F6GA 1RKMA 1B52A 1MQDA 2WKYA 4P0GA 1T0KA 2LAOA 1OVTA 1B4HA 3K6XA 4KQPA 4ND9A 1LFGA 1URSA 4GLIA 3TYHA 4U4SA 4LONB 3R26A 4JB7A 5I58A 1XC1A 2PT2A 1VFEA 4R6HA 3K2DA 1IEJA 1SYHA 1HSLA 3EHTA 1KWHA 2QRYA 2DE3A 3QIMA 3PPQA 2YJPA 3MP6A 2Q8JA 3IORA 4LQ2A 2H98A 2XXPA 4TLMB 3RN8A 4XKRA 1MXVA 3BBRA 4PFYA 4EQBA 3PPOA 3HO7A 4OQOA 2PMSA 1LBCA 4X9TA 4HW8A 3OMBA 3KFMA 3HHFA 3PUWE 1NNTA 1LFIA 1USYH 1B9JA 4F31B 4G8MA 3O6GA 2DOJA 2QJEA 5H8NB 2ANJA 4U1ZA 1XHYA 1R9QA 3C36A 5H8NA 1FQEA 1MY0A 2HZLA 4F1UA 3LSLA 4JSDA 4QSDA 1LFHA 1F9BA 1Q35A 4BLAA 3O28A 2REGA 3OO9A 3W9WA 3FATA 1LLSA 4G8NA 1MY3A 4RK2A 1BLFA 2F36A 4WXJA 1QUIA 2ONSA 5AA1A 1MXWA 4H5FA 1IXHA 3ZSFA 3IO4A 1NH8A 3WAEA 3Q26A 5I59B 3T66A 2VP1A 5I59A 3VE1B 2V3QA 2ALUA 1MXXA 4KCCA 4NE4A 2H99A 4NF4B 3KJTA 4R74A 3K1MA 1HSEA 3EF7A 2GHBA 4GRKA 5ITPA 4QHQA 2Z8EA 4G4PA 2Z23A 2DWHA 4IO2A 1B7UA 2ZYKA 1IZ1A 4YU0A 1MXZA 4RPNA 5CMKA 1YPNA 3C32A 3KSJA 4O3CA 2OWTA 4LATA 3CFLA 4U4XA 2B3FA 4IO7A 1XOCA 1TFAA 2XXWA 2RCAA 3ILUB 3GLBA 5CI5A 3S4UA 2E1SA 3TTMA 1N0TA 4P0IA 1B32A 1USYE 5TPAB 5L9OA 2DWJA 3VXCA 5IAIA 3ZKLA 2GFEA 3FVOA 3Q28A 3FV1A 1O63A 4PP0A 4F29A 2P1SA 4ESWA 3FVNA 4MLVA 3FXUA 1EZ9A 4KPTA 5TP9B 3UP9A 4F3BA 4QFPA 1NL5A 3S9EA 1LAXA 3TQWA 4YKKA 5TP9A 3EHUA 3O29A 1MM7A 1A99A 1URDA 3U72A 3R6UA 2F5XA 4ZECA 5DYHA 4KHZE 1H3DA 4DE8A 3I6VA 2PT1A 1B7HA 3G7WA 2BJJX 1UTHB 3CSGA 2YPNA 4GD5A 3KSXA 1QJMA 1QULA 3MC2A 4ZZEA 2V25A 3C35A 2F34A 3MJNA 2XXQA 1WVJA 4NWCA 1XS5A 1EU8A 4N6PA 3S9NC 4R2BA 2OJTA 2AIXA 4PFUA 2ZXTA 4N07A 1DTGA 1I6AA 1ZKBA 3A3CA 3MZ9A 3CFZA 5JEIA 1GR2A 1Y1ZA 4TLLB 3TDJA 4C0RA 3MVWA 5ELVA 2OZZA 2RC8A 1AIVA 3CRBA 5TU0A 4DCXA 1JEUA 3F11A 3HN0A 1OQGA 1OVBA 5H8QB 1Y20A 3O66A 3W9VA 1A8EA 1GTKA 1LB8A 2VOZA 3CIJA 2NVUB 3T9XB 2ZMBA 2O1MA 3TKDA 1ZU0A 2HEUA 3V83A 3M3LA 5DVJA 2I3VA 1IXGA 3A3UA 2XXUA 4LZ5A 1M5CA 3LR1A 5EYFA 3IOWA 3FIRA 2RKMA 3N26A 4QFOA 2DE4A 3TELA 2QS2A 1MY4A 4EUOA 2R71A 5FTHA 4F39A 5CRYA 3EHSA 2VHAA 3GZGA 1MS7A 5DEXB 1JNFA 1TT1A 3TQLA 1JEVA 3B6QA 3BKIB 4MBPA 4BDQA 5F7VA 3C34A 5I56B 1ANFA 1AL3A 4OERA 3G3KA 5DTBA 4C1TA 1FQFA 4F1YA 1MY1A 4JDFA 3H06B 2F35A 4THIA 3SEVA 2FNCA 4YAHX 3Q25A 5CMBA 3K6VA 1II5A 3FZVA 4OFJA 3RT6B 4JXIA 2F97A 4F2QA 2ZNUA 1WDNA 2XXVA 1FTMA 3K4UA 3FXQA 3SERA 3MP1A 4EF1A 4F2OA 2HQ0A 1N3XA 5H8HB 1B5HA 3TCFA 1B1XA 2PVUA 3QSLA 3TODA 1TWYA 2QSXA 4NF5A 5H8HA 3P7IA 3QUFA 3OOAA 1SBPA 1FCKA 4QFNA 4X1BA 2Y7RA 3KEIA 1LCFA 5L9MA 3SETA 5ITOA 4HS7A 4OVJA 4ZS9A 2B65A 5I2NA 2Y7IA 1UIUA 4F1VA 1UTBB 5A5XB 1BTJA 3LSWA 3UN6A 1NFTA 1MQGA 3G3FA 2Y7KA 4KCDA 4GF8A 2ZYNA 4OZ9A 5KDTB 3I5OA 3ZS6A 2O69A 2UVGA 2H9BA 4OTEA 1IXCA 3VXBA 4N13A 2Z8DA 3MWBA 4EQ9A 2VD3A 3IR1A 1N7XA 3PUZE 1GVCA 4GWOA 4NTLA 5FHNA 3T9UA 1PBQA 1ZTYA 3MPKA 3MUQA 3K02A 2XXRA 4GVOA 3LSFB 4NF8B 3KOTA 1Y3NA 1MG1A 2Z8FA 2E0SA 4NF8A 1N04A 3H7MA 5I58B 3GBBA 2Q89A 5DVIA 2QS3A 2D3IA 2A5TA 3JV9A 4H0WA 5H8FB 4HCYA 1R1NA 1BIYA 1SYIA 5H8FA 4OETA 4TQUQ 2OCUA 4HCWA 4XKQA 2XXYA 5BUUA 5I2KB 1R6ZA 4FATA 3DELB 5I2KA 4OESA 1YCJA 2D21A 1ZIUA 1QUKA 1NNKA 2XX8A 4U21A 3OD7A 4F3SA 1M5DA 4KFQA 5B7DA 1FTKA 4G68C 3CG3A 1AMFA 1B7ZA 1PDAA 1BKAA 2UVIA 1S50A 2CMOA 1Y9UA 4XIGQ 3RNNA 3V8XB 3K1NA 3L6HA 3SEWA 1LAGE 3QXMA 4QSCA 5HBCA 3BFTA 1PB9A 4WEDA 4QRZA 5F1QA 4GOTA 3TMGA 2Q2CA 5FHMA 3V5AA 3PPNA 1FTOA 5BWJA 2GRVA 4L17A 1Z7NE 3TEPA 3PUXE 5CC2A 2NWJA 4LZ7A 4BDNA 1Y4TA 2OLBA 2THIA 5DVFA 1MH3A 4PQJA 1IUDA 3PPRA 3CSBA 4RK9A 2H25A 4DZ1A 4ONYA 5AA4B 1LAFE 3ONMA 3ECRA 5JTYB 5AA4A 3AXFA 4FE8A 5JTYA 4TOZA 1PB8A 3OO8A 3FVGA 3K1PA 4Z0IA 4IO6A 2I0BA 3T96B 3RTWB 3PD8A 2UVHA 4KI0E 3RTFB 4RNSA 2DP8A 2RCBA 4KR5A 4IO5A 2AL5A 1A55A 3CI8A 4I1DA 2XXTA 1US4A 3TTRA 1QW0A 3H3GA 2HAVA 4LQ5A 1EZPA 4G2ZA 1Q1KA 4ZDMA 2DE2A 3PUYE 4H6DA 2O51A 1O64A 3N6TA 4MF3A 4EXKA 4XKNA 4YKJA 1B3GA 3KZGA 4RJZA 1QKBA 4F18A 4EXLA 3U1OA 3DP4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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