1SW4A

Crystal structure of prox from archeoglobus fulgidus in complex with trimethyl ammonium
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
270
structure length
270
Chain Sequence
ERVVIGSKPFNEQYILANMIAILLEENGYKAEVKEGLGGTLVNYEALKRNDIQLYVEYTGTAYNVILRKQPPELWDQQYIFDEVKKGLLEADGVVVAAKLGFRDDYALAVRADWAEENGVEKISDLAEFADQLVFGSDPEFASRPDGLPQIKKVYGFEFKEVKQMEPTLMYEAIKNKQVDVIPAYTTDSRVDLFNLKILEDDKGALPPYDAIIIVNGNTAKDEKLISVLKLLEDRIDTDTMRALNYQYDVEKKDAREIAMSFLKEQGLVK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for the binding of compatible solutes by ProX from the hyperthermophilic archaeon Archaeoglobus fulgidus.
pubmed doi rcsb
molecule keywords osmoprotection protein (proX)
molecule tags Protein binding
source organism Archaeoglobus fulgidus
total genus 99
structure length 270
sequence length 270
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04069 OpuAC Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1sw4A01
3.40.190.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Osmoprotection protein (prox); domain 2 1sw4A02
2HXWA 2UYEA 2HFBA 2PYYA 4F1UA 4ZE9A 3EHTA 3W9WA 5AA2B 2AL5A 1FW0A 4RJZA 4QFOA 3G3GA 3TELA 3TZAA 1MG1A 2H4IA 1D9VA 3OSRA 3IB0A 2OBGA 2DWIA 3H6VA 3U72A 4OEVA 3IOVA 3PUZE 2H25A 3HV1A 1N76A 1MPCA 1ZBMA 5B70A 5ICTA 3H6WA 1PB9A 1P99A 4QFNA 4JWOA 4XXUA 1H3DA 2FNCA 2R9JA 1ZJLA 3L6HA 3C4MA 3VXBA 1Y9UA 1LAFE 1IXGA 1LB8A 5H8NA 4H65A 2FA7A 3MP8A 3GXAA 3ZS6A 1M5BA 5L8DA 3KZGA 1R1NA 1UIUA 5I57B 2DE4A 1HSLA 4E0XA 1JW1A 2O69A 1UTHA 1US5A 3K2DA 3MVZA 2V84A 5KDTB 1OQHA 5I84A 1UTBA 5I2NA 1AMFA 2Q2CA 3QSLA 1MS7A 4ELPA 3RGYA 2QSXA 4IO6A 1TT1A 1IUDA 5FTHA 5TU0A 3BBRA 3O28A 4WEPA 4NF5A 3SKPA 5HM4B 2VD2A 3N6UA 3K02A 1R9QA 4POXA 4H0WA 1OVBA 1H44A 4YKKA 2UXAA 1IXCA 4JSDA 4QFLA 3VVFA 3H03A 2OK2A 1JQFA 3IJOB 3CFZA 4NEDA 3PD9A 4NF8A 4OZ9A 1Y4TA 4X1BA 4F22A 4DCXA 3UORA 4I8CA 1A8FA 2O7IA 3QUJA 1MQGA 1FCKA 1VFDA 3E3KA 1QKBA 1NNKA 2RKMA 4ZEKA 3O6GA 3S2VA 4FECA 3S4UA 4F3SA 4R6YA 4KYEA 5M2VA 4H5GA 1LCTA 1SW2A 1LCFA 2A5TA 1BTJA 2V3UA 5L9SA 2UYFA 1POTA 3M3KA 2DS9A 3KN7A 1JVYA 3PU5A 3FIRA 3PPOA 2OCUA 4YB6A 3V83A 1MDP1 5DT6A 1YTVA 3B6QA 2ZXTA 2V93A 2OWSA 3S9LC 3I3VA 3FVNA 2UVIA 3IOTA 1SYIA 3HHGA 4LQ5A 1MXZA 2CMOA 4O3CA 5H8NB 3R6UA 2V25A 4Z7EA 2HQ0A 3TYHA 3RPWA 2OLBA 4U21A 4GQOA 3T22A 2XXUA 2ZYOA 3KGCA 1IITA 3FXRA 3UK4A 1Y1ZA 1VR5A 2XXVA 1YAEA 2ONRA 1JEUA 4ELQA 3LSFB 4R9GA 1UTHB 1P1QA 3N5LA 3O66A 4N6PA 1PB7A 3MBPA 4ZS9A 1PBPA 3ECRA 2I6EA 5CI5A 4RK2A 4KFQA 3K6WA 1HSJA 1LAGE 1LLSA 1FTOA 1Y4CA 1B3EA 1UTBB 4F19A 5I2NB 1GVCA 1NH8A 5ELVA 5LOMA 3H3GA 3IOWA 3MP6A 3FV1A 2RC9A 1MPDA 4HW8A 2ZNSA 4GL8A 4RK9A 3IB2A 3RY3A 2H98A 5HPQA 2F36A 3PMVA 1EU8A 3B6TA 4Q8RA 2DWHA 4H5FA 4KYDA 3T96B 4WXJA 3UP9A 2Q89A 2ALUA 1OIBA 5CRYA 4LZ5A 3JYRA 3K6XA 1MXYA 4NF8B 1PEBA 4JB7A 4YMBA 3C34A 3TAJA 3QYTA 1VSOA 1ZIUA 2Y7KA 1ZMGA 3WAEA 3OENA 2AIXA 1TFAA 5TPAA 2G93A 4EQ9A 3S9EA 3OSQA 1Y20A 3FATA 5J1DA 3FZVA 2A5TB 3RT6B 1POY1 3KFMA 3FUZA 3UIFA 4GLIA 1MXWA 1FQDA 2DSFA 4O3BA 1UQWA 4QFPA 4ZEIA 4I62A 4GF8A 4GXSB 2ESNA 3U8QA 3T93B 4QFKA 2QS2A 3BFUA 3MVXA 3CVGA 1B58A 4C1UA 2Y84A 3UN6A 5EYFA 2O1MA 1Z7NE 4KD5A 3VVEA 2Z8EA 3KJ7A 3MP1A 3CG1A 1XS5A 4JBZA 1NMUA 4OYVA 4ZZEA 4P0GA 1MXXA 5K2XA 3W15C 3TKDA 1FQCA 2A5SA 4R75A 5CBRA 3G3IA 1D9YA 4JWYA 2R6GE 4U22A 1B4HA 2OWTA 3C33A 4HS7A 1NNFA 4OFOA 1AOVA 2QS1A 5ICQA 2D21A 2XXXA 1S9TA 3V5AA 2DE2A 1B7ZA 4HCWA 5AA3A 5DTBA 4X1DA 1JNFA 3HPIA 4RPNA 2E0SA 3FASA 3LBSA 1YPNA 1OLCA 4FEBA 1B5JA 1B40A 3LSWA 1URSA 2B3FA 2XXPA 1II5A 1N3WA 4JWXA 2I3WA 2HEUA 4BLAA 2O1LA 3N94A 3D4CA 1SI1A 2ZYMA 3RUMA 1RKMA 4DDDA 5JTYA 4K3FA 2VHAA 2ZYKA 4ND9A 4Q30B 3H4ZA 3MQ9A 4THIA 2DWJA 4G68A 4IO4A 3ZKLA 1VFEA 4LZ8A 2LAOA 3G3HA 3HO7A 2GHBA 2XX9A 1B46A 3KOTA 4G77A 4YB5A 3TQLA 1SDXA 4OERA 2F8DA 4JSOA 1RYXA 4BDOA 1B6HA 4C0RA 4ECFA 1Y1MA 3N26A 1I6QA 5TPAB 4EF2A 1WDNA 3IORA 2CZLA 3MAMA 2PMSA 2XXRA 4AQ4A 4G4PA 1B52A 4RNSA 3ODBA 4OFLA 4FEDA 2QMXA 4DIGA 2D5WA 3K00A 2QS3A 5I56B 4QSEA 2DQVA 3A09A 4H1XA 4H67A 1NNPA 5I59B 1MPBA 2Z8FA 4F2QA 2DXRA 3TDJA 4KCCA 1A40A 3IO6A 1N84A 1URGA 1Y3NA 4G8MA 2PX1A 4OENA 3G3JA 1OQGA 2KLFA 5DVFA 3SEWA 1MQJA 1M5DA 1VE4A 4U4SA 4LQ2A 3JZJA 1DSNA 3SEYA 4MLQA 4OESA 4U1OA 3QUFA 1FQFA 4RYAA 1B51A 5AA4A 4DXUA 2Y7PA 4YAHX 4FAJA 1BKAA 1ZU0A 1IIWA 4P11A 3DLNA 3O2AA 4HTGA 1SW4A 4F39A 1PC3A 3M8UA 4LP2B 3CSGA 3HSTA 3CRBA 2I3VA 3DP4A 3KN3A 1WVJA 3DM0A 3K1PA 3RQTA 1AH5A 1T0KA 3EF7A 3H6UA 4LZ7A 1SW5A 2DOJA 4MFIA 1PDAA 3M3FA 4PQJA 4BDMA 5A5XA 3DELB 2XX7A 1LFIA 3H06B 1BP5A 1N7WA 2XX8A 5JTYB 4DE8A 4FIMA 3TTNA 3GBAA 1NL5A 1N3XA 4NWDA 1ZLQA 2QRYA 4OHNA 4G68B 3OO7A 2D3IA 3USDA 1Y3PA 2Y7RA 3AXFA 1FTKA 3RTFB 1EH3A 4F3GA 1CB6A 4G2ZA 3U93A 3LSXA 4OMBA 3HHFA 2PBWA 3FJGA 2P2AA 4YB7A 3TTRA 2QL3A 2I48A 3MUQA 3TQWA 2QPQA 3CFLA 4C1TA 1TFDA 3B7DA 5FHNA 4ESWA 3MC2A 1USYE 1LBBA 3ZKKA 3A3UA 5AA1A 1H43A 2O51A 3B6WA 1LAXA 1H45A 4F29A 4GD5A 4JXIA 3V89B 2Q88A 4YKJA 4GFRA 1B3GA 2X7QA 3TTMA 3GLBA 2RCBA 1AL3A 2Q2AA 4EXKA 4GIZA 3VFJA 2I58A 4OFJA 1JVXA 4ISUA 3FVGA 3GZGA 3T9HB 1MH4A 1FTLA 2F6PA 2P0SA 5I2KA 1MM7A 4XTCQ 4TQUQ 5CBSA 2RC8A 4IO2A 1CE2A 1MH3A 4KCDA 3MW0A 4IO3A 4G8NA 1I6BA 3G7WA 2XXQA 3K6UA 4OETA 2Z23A 3Q27A 1FQBA 4O3AA 2XHDA 2F35A 2F5XA 1QUIA 1P1OA 3FVKA 4QSCA 3UGWA 3PMXA 3T9UA 5L9OA 1PBQA 3E4RA 2P1SA 1UIVA 3KSXA 1N04A 3E13X 2HZKA 1QVSA 1LBCA 4PFUA 1ANFA 5AA4B 5CMMA 2RC7A 4WEDA 5EHSA 4F31B 1IQ7A 3H6TA 4U2RA 1DOTA 1J1NA 3LR1A 2DE3A 3LUYA 3QIMA 4AB5A 3C36A 5ITOA 1XT8A 4QF9A 4NF5B 3CSBA 4NTLA 3TCGA 1L5TA 1OVTA 3OO6A 4IO5A 3O9PA 5A5XB 2VGQA 2RF1A 4RXLA 3PUYE 4R9FA 4EXLA 3K0VA 4LUBA 1B0LA 1B5IA 4F3PA 5CMKA 3ILUB 1D4NA 3IX1A 2XXTA 4GXAA 3KBRA 2F78A 3OXNA 4YU0A 2Y7IA 3MPLA 3PMWA 1QJMA 2O68A 3PGFA 3GBBA 3R7XA 3K6VA 3HN0A 1LSTA 3BFTA 4PFTA 2H9BA 5I58A 1XVXA 5BUUA 4XKQA 1JW4A 1MY4A 1JW5A 3R26A 2OJTA 2AYSA 1BIYA 4H6DA 3TMGA 2OZZA 1O64A 2DWAA 4UACA 4XKPA 3E9XA 3QAXA 4RA1A 1RYOA 4KR5A 2XXIA 4U1ZA 3O29A 1LFGA 2F34A 1Q1KA 2W7YA 4F18A 4ELRA 5B7DA 1I69A 4BDRA 1SBPA 1USYH 3RNNA 3EQ1A 5F1QA 1EZ9A 4YKIA 3O6HA 1GTKA 1B1HA 2PVUA 4BDNA 1B7UA 1QKAA 1ZKBA 4OXVA 3IJXB 2F7BA 1IXIA 4EQBA 1GGGA 1MY0A 4FJPA 4GRKA 3H7MA 1WODA 3TCHA 1B5HA 5F7VA 3L6GA 4RY1A 4GOTA 5DEXA 1JETA 5KDTA 3VXCA 4LVQA 3IAZA 3PPPA 4DCYA 3DP8A 1Y3QA 4TOZA 1FQEA 1O7TA 1PB8A 2NXOA 1B3LA 4KPTA 1I6AA 5DVIA 2Q9TA 1FTMA 2I0CA 3TTKA 3OELA 3MZBA 3U94A 4GVOA 2REJA 2PT2A 3HCQA 3MWBA 3OO9A 1BLFA 3TODA 4ZEDA 5TP9A 3KSJA 3Q28A 5EHMA 3KEIA 1ATGA 1YCJA 1B7HA 3OD7A 3V8XB 4BDLA 3M3LA 4EDPA 2YLNA 2HCAA 3D4GA 3FGSA 2VOZA 4R72A 4IY5A 3TUSA 2YPNA 1R9LA 4IGRA 3C9HA 3FXQA 5H8QA 4YKPA 2DXYA 1DPEA 4FORA 2F97A 4NWCA 2QMWA 1OMPA 3IB1A 3PPQA 3ILTB 3VVDA 3UA8A 1M5CA 4E0WA 3I5OA 1MY2A 4ZDMA 5I58B 1SI0A 2NUVA 2NWJA 4JDFA 3MJNA 3IL1B 1IXHA 2NOOA 1SW1A 5AA2D 1H76A 1QUKA 2X7PA 1A55A 3C35A 3K01A 4DXBA 2ZYNA 5KZTA 2QJEA 2ABHA 4I1DA 4L17A 1Z7ME 2THIA 2B65A 1LAHE 3OO8A 4NF6A 3QK6A 1QULA 3O97A 2IA4A 1N7XA 2RINA 3A3CA 3IO4A 3QXMA 4POWA 1MQIA 4ZZAA 2DVCA 3SESA 4LATA 3RLFE 1B3HA 4X48A 1ELJA 4M4GA 4AB6A 4F1VA 3P7IA 2DYXA 2YJPA 3SERA 3N6TA 3CG3A 5DEXB 1US4A 3PUXE 2B3BA 1IEJA 1EZOA 2QS4A 1P1UA 4OVJA 3FJ7A 2ONSA 3FD3A 4H8JA 3FV2A 2GHAA 1KWHA 3W9VA 4GWOA 2H5YA 2R71A 3DP6A 2XXHA 2IEEA 4Q0CA 1DMBA 1LFHA 1OLAA 3FXUA 4OQOA 3O6IA 2O7UA 2ZMBA 2E1SA 2I4CA 1AIVA 4U23A 5TP9B 4YZZA 1R6ZA 4R73A 3ONMA 1IZ1A 4DLDA 2VD3A 4KQPA 4PETA 1DPPA 3VE1B 3THIA 4IO7A 1MXVA 3MVYA 4F3BA 2VP1A 2ANJA 5H8QB 4LONB 4ONYA 5H8HA 1URDA 4PE5B 3CR9A 1DTGA 1MY3A 4R6HA 3CI8A 1NFTA 2ZNUA 3SEXA 3WAFA 5H8FA 3MZ9A 3KN8A 2REGA 3OMBA 4OTEA 2GFEA 5H8SA 4MBPA 3C31A 5CMCA 4YMAA 2RCAA 3C32A 2F7AA 2I49A 4TLLB 1B3FA 2DP8A 4WKMA 4PP0A 3LSLA 2NVUB 4DXCA 1SYHA 3JV9A 2V3QA 4N07A 4U4XA 1DTZA 3EHSA 4KYSA 3T66A 4ZEFA 3CIJA 3PUVE 4F2OA 4R6KA 2Y7WA 4QRZA 3K1NA 3SEVA 1MY1A 3T9VA 4NF4A 2HZLA 2XXWA 1A7LA 4H8IA 4QHQA 2G29A 4MLVA 4NF6B 4XIGQ 3T9XB 4Z0IA 4ESXA 4KI0E 4G8HA 2FYIA 3TFLA 1MRPA 3VDFA 1O63A 2UVJA 3SEUA 2M8CA 3OOAA 2WKYA 3RT8A 3RTWB 4R2BA 4NE4A 4GL0A 3U1OA 4QSDA 1GR2A 4XKNA 3TCFA 3TTLA 1NKXA 4FATA 1M5FA 3IK6B 4KHZE 2H99A 4EQ7A 4UA8A 4P0IA 4N13A 5KCJA 3IR1A 3Q26A 4LA9A 3I6VA 1A54A 1LGBC 1A99A 3BKIB 4Q5TA 3SDFA 2O84X 2DVZA 1TXFA 4DZ1A 1MDQA 2Z8DA 3MVWA 1GV8A 4MF3A 4R2FA 1S50A 5JEIA 3KJTA 3KG2A 2F6GA 2XD3A 2XXYA 3Q29A 3TEPA 4IY6A 3IOUA 3TPAA 2GRVA 3VV5A 1SVXB 1B05A 3U92A 3VLWA 2HAVA 4I9DA 4IB2A 3VLVA 5AA2A 3Q25A 1B32A 1P1WA 1NNTA 1QUJA 4F1YA 5H8HB 5DVJA 2AL4A 2HAUA 3KOSA 1LB9A 5FHOA 3VLUA 3FVOA 3MZ1A 5H8FB 4IGTA 2I4BA 4OWDA 4M1VA 5CC2A 1XHYA 2F7CA 5JK4A 1N0TA 3RN8A 3PV0E 5I56A 3G3KA 3MPKA 3CFXA 1FTJA 2UVHA 5CM6A 1XOCA 4PFYA 5I59A 3K4UA 1B4ZA 4FE8A 4X9TA 1F9BA 4ZECA 2Z22A 2V3TA 5I2KB 3EN3A 5I57A 3S9MC 3S9NC 1M5EA 4NF4B 5ISUA 1D3KA 4ZE8A 2UVGA 3ZSFA 4EUOA 4RPOA 3G3FA 5K2YA 4EF1A 2O6AA 1TWYA 5L9MA 3PD8A 3PUWE 5AE4A 1NH7A 1SD3A 1MQDA 3PPNA 3OEMA 1P1NA 2Q8JA 5IAIA 2XD2A 3SETA 1HSEA 1XVYA 2PT1A 5CMBA 4ZEBA 3OEKA 5BWJA 4BDQA 4R74A 3EPEA 1ZTYA 4HCYA 1JEVA 1SQYA 5FTIA 4OEUA 4TLMB 5KCJB 3FJMA 2BJJX 2ZNTA 1MXUA 3K1MA 3EHUA 1FQAA 1MM6A 4G68C 1B0HA 4YICA 5FHMA 1B1XA 5DYHA 1QW0A 3F11A 2X26A 1A8EA 4MH5A 1XC1A 1Q35A 5HBCA 1EZPA 2I0BA 1MQHA 4ELOA 5IKBA 2ONKE 3LC8A 1B2HA 1S7YA 2GH9A 3PPRA 1B9JA 4XKRA 4PFWA 4NMYA 5ITPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2HXWA 2UYEA 1FJ6A 2HFBA 2PYYA 4F1UA 4ZE9A 3EHTA 3QMFA 3W9WA 2Q74A 5AA2B 2AL5A 1FW0A 4RJZA 4QFOA 3G3GA 3TELA 3TZAA 1MG1A 2H4IA 1D9VA 3OSRA 3IB0A 2OBGA 3EKIA 2JJKA 2DWIA 3H6VA 3U72A 4OEVA 3IOVA 3PUZE 2OWZA 2H25A 3HV1A 1N76A 1MPCA 1ZBMA 5B70A 5ICTA 3H6WA 1PB9A 1P99A 4QFNA 4JWOA 4XXUA 1H3DA 2FNCA 2R9JA 1ZJLA 3L6HA 3MYUA 4NHBA 3C4MA 3VXBA 1Y9UA 4N81A 4I3YA 1LAFE 1IXGA 3NOHA 1LB8A 5H8NA 5I7IA 4H65A 2FA7A 3MP8A 3GXAA 4MX6A 1FPEA 4OVPA 3ZS6A 1M5BA 5L8DA 3KZGA 2F3DA 1R1NA 1UIUA 5I57B 2DE4A 5EQ7A 1HSLA 3RPLA 3LUZA 4E0XA 1JW1A 4MMPA 2O69A 1FSAA 1UTHA 1US5A 2BJIA 1D9QA 3K2DA 3MVZA 2V84A 4UABA 5KDTB 1OQHA 5I84A 2CZHA 1QGXA 1UTBA 5I2NA 1AMFA 2Q2CA 3QSLA 1MS7A 4ELPA 3RGYA 2QSXA 4IO6A 1TT1A 1IUDA 5FTHA 5TU0A 3BBRA 3O28A 4WEPA 4NF5A 3SKPA 5HM4B 2VD2A 3N6UA 3K02A 1R9QA 4POXA 4H0WA 1OVBA 1H44A 4YKKA 2UXAA 1IXCA 4JSDA 4QFLA 4GX6A 3H03A 3VVFA 2OK2A 1JQFA 3IJOB 3CFZA 4NEDA 3PD9A 4AS5A 4NF8A 4OZ9A 1Y4TA 4O8MA 4X1BA 4DCXA 4F22A 3UORA 4I8CA 1A8FA 2O7IA 3QUJA 1MQGA 1FCKA 1VFDA 3E3KA 1QKBA 1NNKA 2RKMA 2FIEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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