1SW4A

Crystal structure of prox from archeoglobus fulgidus in complex with trimethyl ammonium
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
270
structure length
270
Chain Sequence
ERVVIGSKPFNEQYILANMIAILLEENGYKAEVKEGLGGTLVNYEALKRNDIQLYVEYTGTAYNVILRKQPPELWDQQYIFDEVKKGLLEADGVVVAAKLGFRDDYALAVRADWAEENGVEKISDLAEFADQLVFGSDPEFASRPDGLPQIKKVYGFEFKEVKQMEPTLMYEAIKNKQVDVIPAYTTDSRVDLFNLKILEDDKGALPPYDAIIIVNGNTAKDEKLISVLKLLEDRIDTDTMRALNYQYDVEKKDAREIAMSFLKEQGLVK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords osmoprotection protein (proX)
publication title Structural basis for the binding of compatible solutes by ProX from the hyperthermophilic archaeon Archaeoglobus fulgidus.
pubmed doi rcsb
source organism Archaeoglobus fulgidus
molecule tags Protein binding
total genus 99
structure length 270
sequence length 270
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04069 OpuAC Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1sw4A01
3.40.190.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Osmoprotection protein (prox); domain 2 1sw4A02
1MY3A 1Z7NE 1B0LA 3LR1A 4XTCQ 3DP6A 4JSOA 4M4GA 1IZ1A 2H5YA 2GRVA 3C9HA 1LAXA 3C34A 3ILUB 3G3GA 3RT6B 2AIXA 1UQWA 4XKPA 1ZLQA 4BDOA 4IGTA 5I2NA 2X7QA 3LBSA 3OO6A 1I69A 3JYRA 3TAJA 3BFTA 1SI1A 1US5A 2QPQA 3HN0A 5AA4B 3TTRA 3KN7A 3VLVA 5H8NA 2R9JA 4BDRA 2ONSA 5KDTA 4U1ZA 5B70A 3ZKKA 4QFKA 1LAFE 1LB8A 1ZJLA 2WKYA 1PB7A 1SW1A 4FAJA 1PB9A 2XXUA 1JQFA 4PFUA 4XXUA 4F3SA 4U22A 4G68B 4LUBA 3RNNA 1FQDA 4Z7EA 4OXVA 4KCDA 1A55A 4ZEDA 4QF9A 1B7HA 4ZZEA 2AL4A 2A5TA 4EQ9A 3DP8A 2ALUA 3FVNA 5I2KB 4NF6A 5KCJB 3H6WA 2QS3A 3IOTA 1P1QA 4AB5A 3T9UA 2HFBA 1GTKA 4X48A 3G3JA 5JK4A 2PX1A 2F5XA 1FW0A 5TU0A 3C36A 3T96B 3H6UA 3R6UA 5BWJA 2O6AA 2F97A 1UTBA 4FEBA 1OVTA 3KGCA 3K2DA 1EU8A 3V83A 4HS7A 5I2NB 3N94A 2PMSA 2HZLA 1IQ7A 2XXWA 3MC2A 2XXPA 3OEMA 1MQHA 1N04A 1DPPA 3OD7A 2PT1A 5I59A 5H8SA 3PD9A 3HCQA 1MM7A 3IOUA 3KJTA 3FJGA 1AH5A 4PFWA 4IO6A 5L9MA 4KD5A 5ITPA 3QYTA 4JWYA 3VE1B 2QSXA 3FZVA 3IO6A 5ICQA 5DVIA 4I9DA 1ANFA 3O6HA 4GL0A 4NF8A 1Y3PA 3FVOA 1J1NA 3S9MC 4ZE9A 3Q26A 5IKBA 2BJJX 4P0GA 3PPQA 4JDFA 2DVCA 3TZAA 2CMOA 5H8QB 1MXUA 3EHUA 3V8XB 2A5TB 4OESA 2R6GE 4R6YA 3RUMA 4DLDA 2I3VA 4YB5A 4NMYA 3B6WA 4ZEIA 3C4MA 4ZZAA 4QRZA 4R2BA 4NF6B 1IXHA 3D4CA 4GWOA 1R6ZA 2OJTA 1WODA 4ELOA 5AE4A 4WXJA 1JW4A 3MWBA 4HCYA 1LAHE 4GD5A 5FHOA 2I48A 1IIWA 3GXAA 4G68C 1Y1MA 1UTBB 1LFGA 4RNSA 4E0WA 2XXTA 3EF7A 4EXKA 3TYHA 3MJNA 1NKXA 2QS1A 1ZBMA 4F3BA 4LATA 4YKKA 4Z0IA 3EHSA 4RK9A 4PETA 4GIZA 2FYIA 3S9LC 1NL5A 3CVGA 3IJXB 5FTIA 4RA1A 2GFEA 3FATA 3HO7A 5H8HA 2XX9A 3PMWA 1MXWA 1UIVA 1Q1KA 3IO4A 4O3CA 1NNKA 1YPNA 4RYAA 2F7AA 4GXAA 3R26A 2LAOA 2XD3A 2FNCA 2F6PA 3T93B 2DWAA 4QFLA 2HZKA 2XXQA 1B1HA 4O3AA 4G8NA 3K1PA 1FQBA 2M8CA 4ZDMA 2VP1A 4U4SA 4FATA 1LBBA 1O63A 4XKQA 2Y7KA 4JXIA 2Y84A 1USYH 4OENA 3HHFA 4ZEBA 5HBCA 2REJA 3O6IA 2DXYA 3IJOB 3G7WA 4KPTA 1B7ZA 2P1SA 1I6AA 4OVJA 1SVXB 1M5EA 1FTOA 3FXUA 2OWSA 2KLFA 4F2OA 2F36A 4G4PA 3UIFA 4H1XA 4R72A 4K3FA 4POXA 2FA7A 2F8DA 1B46A 4NF5B 2THIA 3TMGA 3DP4A 3B7DA 4R9FA 3PUVE 3FD3A 3T22A 1URGA 3JZJA 3MPLA 3G3KA 3K4UA 2VGQA 2V3UA 2QL3A 1BKAA 4ZS9A 4N6PA 1BLFA 4RJZA 1FTLA 4NWDA 3PPNA 3L6GA 5CMBA 3LUYA 1Y4CA 2NXOA 3PMXA 5K2YA 1KWHA 4X9TA 1JVYA 5ICTA 3T9HB 3SETA 1B3EA 3IK6B 2ABHA 1QULA 3G3IA 4EF1A 2V25A 3U92A 3O9PA 2DS9A 4R9GA 4C1TA 2HAUA 4JWXA 3FASA 3E3KA 1FTJA 2DYXA 1LFIA 5AA4A 5I58B 2Q2CA 3MPKA 3W9VA 4OHNA 5H8FB 2O84X 3B6QA 1B0HA 4F3PA 2ZXTA 1MS7A 2O51A 4DCYA 2UXAA 3T9XB 3CR9A 1MH4A 3DELB 2HXWA 2NVUB 2QMWA 1B51A 3OXNA 1Y3NA 2D3IA 3FJMA 1S50A 3IORA 1JVXA 4G68A 4QSEA 2UYEA 5I84A 3KBRA 3OOAA 1QKAA 4NTLA 4F1VA 5AA3A 1HSLA 3FV1A 1FQCA 4YKJA 1GV8A 2ZYNA 3MQ9A 4EQBA 4LQ2A 4MLVA 4YICA 1OQHA 5KCJA 1IXIA 5DVFA 3RY3A 3GBBA 2DXRA 4OZ9A 2B65A 4BDMA 1OQGA 3H03A 1FCKA 3TEPA 4C1UA 2Q88A 4KYSA 3PPRA 4EDPA 1M5CA 1Y4TA 3SEVA 1H43A 4JB7A 4DXBA 3K6VA 4WKMA 3PMVA 1SQYA 1ZIUA 5A5XB 1L5TA 1LGBC 3A3UA 4X1DA 1DTZA 1XC1A 1PBPA 1B40A 5CBRA 3C32A 1FQEA 5CBSA 2XHDA 3H3GA 4ZEKA 4BDLA 4G77A 2VOZA 1N3XA 3TQWA 2Y7IA 4KHZE 4OETA 3ODBA 2ONKE 3MP6A 2XX8A 1QUIA 4YKPA 5AA2D 4THIA 3PU5A 4HCWA 3CFLA 2GHAA 1IITA 3BBRA 2I0BA 3OENA 2O7UA 1JNFA 1MQIA 2Y7PA 4R6HA 3U93A 1DMBA 5H8QA 3H4ZA 1O64A 4OWDA 1ZTYA 2G93A 4ND9A 2OLBA 3TCGA 1US4A 2B3BA 1B5JA 4ESWA 4G8HA 4U1OA 4EQ7A 1A40A 3TCFA 3LC8A 2DOJA 4LZ8A 2HQ0A 1HSJA 2DP8A 1NNPA 4JBZA 3K0VA 4LZ7A 2H9BA 3PV0E 1JW1A 1MRPA 2I4BA 2ZNTA 1SW5A 4I1DA 2V93A 1NH7A 4H5GA 3SEXA 4AB6A 1UIUA 3CG1A 2E1SA 2PVUA 4YU0A 4DIGA 3IB1A 3S2VA 3I5OA 2RC9A 2VD3A 2XXRA 4KI0E 2ZYKA 3TTLA 4WEDA 1TXFA 5LOMA 3RLFE 4OMBA 2F6GA 1XVYA 5ELVA 3E4RA 4H65A 2V3QA 4GXSB 3N6UA 5L9SA 4C0RA 1IEJA 3U1OA 5ISUA 2O1MA 4L17A 1N76A 3TODA 2UYFA 1H44A 3QIMA 3W15C 4PQJA 1R1NA 1B3HA 3ZSFA 2UVHA 5I56B 5HPQA 4H0WA 1BIYA 3H6TA 2Q2AA 4OFLA 4IO5A 3A09A 4FEDA 2P2AA 4QHQA 4Q30B 1LAGE 4OEVA 3K02A 3CRBA 1MY2A 5CRYA 3ONMA 1R9QA 1B9JA 3SERA 1LFHA 1B5IA 3O28A 4ONYA 3MP8A 1M5DA 1DSNA 2V84A 2Z23A 2DSFA 4GFRA 4EUOA 3KEIA 2PT2A 5AA2A 2A5SA 5ITOA 1QKBA 4JWOA 3UGWA 4F1YA 3V5AA 4F29A 1USYE 4Q8RA 4P11A 4NF5A 3FVGA 4U2RA 5M2VA 3S9NC 4MBPA 3PPPA 2HEUA 2G29A 2DWJA 2OBGA 3LSXA 3FXQA 2QS2A 1POY1 2Z8FA 1A8FA 1IUDA 4R73A 3RPWA 3AXFA 2RC8A 1B6HA 1LCFA 1B2HA 3PD8A 3T66A 3G3FA 3KSXA 1MXXA 1N3WA 4RPOA 1A99A 1Y20A 3OO9A 4PFYA 2ZYOA 2R71A 3GBAA 2H99A 3SEYA 5CMKA 4R74A 1QJMA 2QMXA 1JW5A 3C31A 3EHTA 1AOVA 2UVIA 1B3LA 4TOZA 5I58A 3H6VA 2I58A 3PUYE 4IO4A 1XVXA 5H8FA 1O7TA 3RTWB 1SYHA 3BFUA 1N84A 5TP9A 4YAHX 2HCAA 1S9TA 1N0TA 1F9BA 1NMUA 2XXYA 3D4GA 2ZNSA 1SW2A 4BDNA 4KR5A 3ILTB 5AA2B 1MH3A 1NNFA 2GH9A 2AYSA 3PUXE 2OCUA 3MVYA 1AIVA 3RTFB 1XS5A 3U8QA 1ZKBA 1II5A 3OSRA 4QFOA 1QUJA 1ATGA 2OWTA 2ONRA 1JEVA 1EH3A 3M3KA 3ZS6A 1SBPA 1PBQA 1VE4A 1MXYA 4F19A 2Z8DA 4ELQA 5I57A 3SKPA 2W7YA 1Q35A 3RQTA 2O7IA 3TUSA 1MDP1 3PUZE 1BP5A 1VFDA 1YTVA 4QFPA 2PYYA 4DCXA 3M3FA 4OFOA 4YB7A 5DT6A 1SW4A 5A5XA 4KFQA 2I6EA 2D5WA 3IB2A 3I6VA 4U4XA 4IO2A 4MH5A 5CMMA 1N7WA 2RCAA 2QS4A 1LLSA 1IXGA 3CFZA 5TP9B 2DE3A 4I62A 2IEEA 5IAIA 2Y7WA 3TTKA 2Z22A 4R75A 2GHBA 3G3HA 3O66A 4H6DA 5KZTA 2H98A 1WDNA 3E9XA 1VSOA 3N26A 3W9WA 1M5BA 2O68A 1MQGA 4QSDA 3WAEA 1URSA 5FTHA 1P1UA 2AL5A 5JEIA 2O69A 4ZEFA 2D21A 1B52A 2H25A 1NFTA 1SDXA 3M8UA 1A54A 2P0SA 3F11A 4KCCA 3Q28A 4H5FA 3HV1A 2DWHA 3K1NA 3KN8A 2DVZA 4XKRA 3MVXA 4QFNA 3RGYA 3CSBA 2RINA 3MAMA 4IB2A 1MY1A 3OO7A 5I57B 3PPOA 3LSFB 1CB6A 4HTGA 4RK2A 3O6GA 3CSGA 4LP2B 4M1VA 3L6HA 3ECRA 2Q89A 3VLUA 3USDA 3MZ1A 1FTMA 3HPIA 3P7IA 2Y7RA 3E13X 3UA8A 3KFMA 2F78A 3QK6A 1P1WA 4IO3A 4NEDA 1H76A 4Q5TA 1XOCA 3RT8A 5B7DA 1H3DA 2E0SA 3QXMA 1H45A 1EZOA 2RF1A 4PFTA 5HM4B 1TWYA 3FV2A 2ZMBA 4FJPA 1QUKA 1HSEA 1TT1A 4ZECA 1B4ZA 4BLAA 1B3FA 5BUUA 3U72A 4YZZA 2XXHA 4FECA 4EF2A 2ANJA 1Y9UA 2ZYMA 3K6UA 1R9LA 2VD2A 3UP9A 2DQVA 3GLBA 1UTHA 3VVDA 2HAVA 5I56A 3GZGA 3A3CA 4AQ4A 2RC7A 1RKMA 4N07A 4LA9A 5AA1A 5F1QA 2NOOA 1TFAA 4OTEA 5CMCA 3VFJA 4UACA 1D9VA 3IR1A 1MPBA 5DEXB 1VR5A 3UN6A 1FQFA 1NNTA 3UK4A 3ZKLA 3PGFA 1P99A 1ELJA 4MFIA 4MF3A 1XT8A 2F7CA 1MPDA 3THIA 2UVJA 5F7VA 1YCJA 1JEUA 1B1XA 1OVBA 4JSDA 3IB0A 1PC3A 4DXCA 2DE4A 4H8IA 4OYVA 1EZPA 1XHYA 3S4UA 3CG3A 3UORA 4BDQA 3MBPA 2YPNA 4F3GA 5K2XA 1M5FA 4R6KA 3DM0A 4U23A 2F34A 1PEBA 3FXRA 4NF4A 4DDDA 4KYDA 3MP1A 1WVJA 1D9YA 5H8NB 3IOVA 1YAEA 3IOWA 3VVEA 3CFXA 3OMBA 3C33A 3FUZA 1MXVA 3MVWA 5KDTB 3EPEA 1MQDA 3K1MA 1MPCA 4IO7A 4RXLA 1UTHB 3VXCA 1OLAA 4GQOA 5EHSA 4TLMB 3Q27A 1P1NA 3JV9A 4RPNA 4DZ1A 3QAXA 4ECFA 4G2ZA 2X26A 4OEUA 3O97A 3SESA 2YJPA 1Y3QA 4OERA 3TKDA 1QVSA 3IX1A 4ELPA 1RYXA 4ELRA 1A7LA 1QW0A 3R7XA 3OSQA 3MZBA 1GGGA 3VVFA 5CC2A 3OELA 1MG1A 3MVZA 3VLWA 4I8CA 4PE5B 3WAFA 1TFDA 4F22A 2I49A 4H8JA 4P0IA 2OZZA 4NWCA 3MUQA 3SEUA 2OK2A 2QRYA 3KJ7A 2REGA 4NE4A 4WEPA 4IGRA 2Q9TA 1OLCA 3O29A 4FIMA 4YKIA 5DTBA 3B6TA 5FHNA 1P1OA 4IY6A 4GRKA 5CM6A 3K6WA 4G8MA 2NWJA 2IA4A 4HW8A 3S9EA 1IXCA 2XXVA 2O1LA 4F18A 4OFJA 5EYFA 3K00A 3C35A 1EZ9A 4NF4B 1SD3A 3LSLA 3K6XA 2PBWA 1I6BA 3OEKA 4XKNA 1MM6A 4YB6A 5I59B 2ESNA 3OO8A 4IY5A 4ZE8A 1B3GA 3TELA 3V89B 3T9VA 1LBCA 5JTYA 3DLNA 3QUJA 4GVOA 1DTGA 1Y1ZA 1VFEA 1B5HA 3TDJA 4ESXA 1AL3A 2DE2A 1PB8A 4NF8B 3TQLA 3O2AA 2I0CA 3MZ9A 3TPAA 1DPEA 5TPAA 3SDFA 3CIJA 1B7UA 1LSTA 2F35A 3H06B 3FJ7A 2RCBA 2XXXA 1I6QA 4ISUA 1ZU0A 4GL8A 4YMAA 3HSTA 3QSLA 3H7MA 2Q8JA 4O3BA 1NH8A 4TQUQ 4LQ5A 3MW0A 3TFLA 3CI8A 3KG2A 2I4CA 2H4IA 2V3TA 3K01A 4E0XA 4F1UA 4U21A 3M3LA 4OQOA 5DVJA 4EXLA 2NUVA 1FTKA 3VDFA 4GOTA 3N5LA 4UA8A 4X1BA 5EHMA 1LCTA 4RY1A 4PP0A 1D3KA 3EQ1A 4TLLB 2F7BA 1OMPA 5H8HB 4DXUA 1MY0A 1MDQA 3RN8A 2XD2A 4XIGQ 4FE8A 5JTYB 4KYEA 3KSJA 1LB9A 4R2FA 3KN3A 3QUFA 3KOSA 1B58A 1B05A 2XX7A 2YLNA 3N6TA 2I3WA 2DWIA 3KOTA 2UVGA 1RYOA 4LZ5A 3TTMA 2CZLA 4F39A 3IL1B 5TPAB 4KQPA 1SYIA 3Q25A 4YMBA 2RKMA 4GF8A 5FHMA 1B32A 4H67A 2B3FA 3TCHA 1MXZA 3EN3A 4QSCA 4F2QA 4FORA 4DE8A 3PUWE 3VXBA 2XXIA 4LONB 1D4NA 4GLIA 5DYHA 5L8DA 1PDAA 3HHGA 3SEWA 4POWA 2X7PA 1DOTA 4Q0CA 1N7XA 3FGSA 1GVCA 1OIBA 1POTA 1CE2A 1URDA 2Z8EA 5J1DA 3BKIB 3U94A 4MLQA 1AMFA 2VHAA 3Q29A 4F31B 1MQJA 5CI5A 1S7YA 2ZNUA 1MY4A 1A8EA 5DEXA 1FQAA 1T0KA 3VV5A 3LSWA 3I3VA 2QJEA 3TTNA 3FVKA 4LVQA 1SI0A 1JETA 1B4HA 1BTJA 4N13A 5I2KA 5L9OA 1GR2A 3KZGA 1ZMGA 3FIRA 3IAZA 1Z7ME
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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