5AA1A

Crystal structure of mltf from pseudomonas aeruginosa in complex with nag-anhnam-pentapeptide
Total Genus 137
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
137
sequence length
418
structure length
418
Chain Sequence
EGVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFTQHLQQRLPRYESHFKQSGKQKDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Activation by Allostery in Cell-Wall Remodeling by a Modular Membrane-Bound Lytic Transglycosylase from Pseudomonas aeruginosa.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule tags Lyase
molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE F
total genus 137
structure length 418
sequence length 418
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2015-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa1A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa1A02
3KEIA 5FHNA 4DLDA 2DWAA 3CFXA 3OO6A 4U2RA 3ZKKA 3S9LC 2WKYA 2OK2A 3TQWA 3TPAA 1DTGA 3FV1A 3PPRA 2RF1A 3IOWA 4I62A 3FVNA 2QSXA 1PBPA 2YLNA 5EHSA 1P1NA 4F1UA 4LP2B 3R6UA 4PETA 4GXAA 4IO3A 5CM6A 1HSLA 4YB5A 1S7YA 2H98A 3TMGA 3PPPA 2AL4A 2F36A 1N0TA 3QUFA 4ZEIA 3UP9A 4LA9A 4IGTA 4IO2A 1QKAA 2OZZA 1L5TA 4GL0A 2OJTA 1BKAA 4P11A 3RT6B 1M5DA 4OVJA 1EU8A 3C35A 5K2YA 3TCHA 3UA8A 2YJPA 4GWOA 1JQFA 5HBCA 1UQWA 4ELOA 3UN6A 4F3BA 4WEPA 4QFKA 2ZMBA 4RA1A 5I56B 1MQHA 2A5SA 2DS9A 3S2VA 5AA2D 1TT1A 3FJGA 2IA4A 3BFUA 2UYFA 3HV1A 3T9VA 3D4CA 1B52A 1O63A 1SI0A 3FXUA 1SW2A 3FATA 2HQ0A 3MAMA 1GVCA 2XXHA 2F7CA 3ECRA 4YAHX 1SYHA 3GBBA 3IK6B 4WKMA 3T93B 1H45A 4BDOA 2GFEA 1FTOA 2X7PA 3FUZA 4OENA 1Y3NA 3PPQA 4F3PA 5EYFA 1B3GA 1GR2A 5ICQA 3F11A 5CMMA 1NL5A 2X7QA 1P1UA 1IUDA 2CZLA 3OXNA 5A5XA 2HEUA 3SKPA 2YPNA 4EDPA 2HAVA 2Z8FA 4HTGA 2LAOA 4YKIA 3N26A 3U8QA 4ESXA 2O6AA 4F2QA 5JEIA 3R26A 2P1SA 4M1VA 1MDQA 4G68C 4ONYA 3UK4A 2FA7A 4NF5A 4H8IA 3FVGA 1UTHA 4JWYA 3PUZE 3TTMA 4DXBA 4MLQA 4F31B 2OWTA 2ZNTA 1IIWA 1FQCA 1MQJA 3KSXA 1IZ1A 3O29A 4IY6A 1T0KA 2P0SA 3C9HA 1XS5A 4GF8A 1Q1KA 1XC1A 1IQ7A 3E3KA 3QK6A 4ISUA 3M8UA 5TP9A 2ZYNA 3TTRA 4DZ1A 2I48A 2R6GE 4Z7EA 5I2NB 5ISUA 3OMBA 1Q35A 2DOJA 3LSFB 2OWSA 2DWIA 1B58A 2XXRA 1CB6A 1PB7A 4OETA 3QSLA 3V5AA 4BDRA 3FV2A 1USYH 5AA1A 1B1HA 3WAEA 5AA2A 5KCJA 2GHBA 2O51A 3MVWA 5EHMA 5H8SA 4BDNA 3T9HB 1Y1ZA 4F22A 3TQLA 3VLVA 3TUSA 4MFIA 3VV5A 1P99A 3IOVA 4O3AA 1H3DA 3CI8A 2DWJA 2A5TB 3ODBA 1IXGA 3T9UA 4QFLA 3TODA 3BBRA 1US5A 1A8FA 4LATA 4NF6A 3H6WA 1PDAA 1OLAA 5CC2A 1WVJA 2I4BA 4ZZAA 2D21A 1FW0A 2H9BA 3CRBA 3PU5A 4OFLA 5H8QA 4EQ7A 4OYVA 1USYE 3FIRA 3SDFA 2RCBA 3HPIA 3L6HA 2HCAA 2B65A 2DWHA 3JYRA 4FEDA 2DQVA 2B3BA 3BKIB 3ILTB 3N5LA 5CMCA 3MP8A 1N84A 2VP1A 4G8HA 1XVYA 4HW8A 2NWJA 5JK4A 3IOTA 1XVXA 3QIMA 3OOAA 4JDFA 1IXCA 2I6EA 4U21A 4EXKA 5M2VA 1H76A 2RKMA 3TTLA 1VE4A 3B6QA 3MPLA 4NF4B 1AL3A 2Q8JA 4F1VA 3TCGA 2D3IA 2XXVA 1TXFA 2AIXA 1LFHA 4QFOA 3C31A 1MPBA 1P1WA 2HXWA 1GGGA 3EHSA 3W9WA 4DXUA 5DEXA 3H6UA 1A8EA 4QSDA 3KZGA 3D4GA 3K1MA 3Q26A 4BLAA 3Q28A 3CSBA 3MPKA 3SESA 2Z8EA 4IO6A 4XKQA 2PVUA 5CBRA 4U4XA 3MZBA 1I69A 4BDLA 2F97A 1URGA 2HAUA 2XD2A 4P0IA 3VE1B 1RYOA 2VGQA 2V3QA 3N94A 1XHYA 4G4PA 4PE5B 2I3VA 3V8XB 1PC3A 2F7AA 4LZ8A 2UYEA 3H03A 4OEUA 4ZEBA 5CMKA 1FTMA 3O6GA 4XTCQ 1B46A 5I57B 4LQ2A 2ZYOA 3IJXB 5DEXB 4KYEA 3VLUA 3CSGA 3G3FA 2O69A 2G29A 2NUVA 2REJA 3SERA 1Y1MA 4KR5A 1MXYA 3H3GA 3M3LA 3IR1A 4UA8A 5DYHA 4FEBA 5F1QA 4N6PA 2B3FA 1POTA 2XX9A 1TFAA 3MVXA 1P1OA 1HSEA 4HS7A 4KPTA 1B5IA 5I56A 2XXQA 3CFLA 4XXUA 3KJ7A 3UORA 2XXPA 3E4RA 2R9JA 2XXYA 4G68B 3OD7A 1B3EA 5L9OA 4PP0A 3C4MA 1SBPA 2V25A 1S50A 4NF8A 2FYIA 3H4ZA 4ZS9A 1GV8A 4AB5A 1JEUA 1TWYA 1MH4A 1PEBA 1FCKA 2Q2AA 1MQGA 2XX8A 3C36A 2IEEA 2UVGA 1M5BA 3EN3A 4GVOA 4NMYA 1N3XA 2ONKE 1NNFA 1O64A 3FXRA 1B9JA 1JW4A 3G7WA 3G3JA 3KG2A 5KDTA 4M4GA 3TKDA 2OLBA 4FORA 3VVEA 1QW0A 3MVYA 3PV0E 1LB9A 1R9LA 1ZMGA 3FJ7A 1R6ZA 3C33A 3IB0A 1B3FA 5CMBA 5L8DA 1B0HA 2I4CA 3K00A 3MBPA 2GRVA 3LSXA 4KCCA 4PQJA 5DTBA 3KN7A 1MPDA 4PFYA 3ONMA 4YB6A 1LFGA 1A99A 1BLFA 1M5EA 1D4NA 1SDXA 2ZYKA 4NE4A 4OWDA 3SEVA 1POY1 4I8CA 4R9FA 1ZU0A 3OEMA 4ZE8A 5ICTA 1LAXA 3KGCA 5I59B 1LSTA 2KLFA 3OO9A 4NWCA 2O84X 2H5YA 4Q8RA 3MP1A 5DVIA 1SW5A 3K6UA 1B7ZA 1LB8A 1EH3A 1GTKA 1JEVA 1B2HA 3HHFA 1AMFA 1SYIA 4KYSA 4YMBA 4RK2A 3B7DA 4G8NA 3FXQA 2Q9TA 1B32A 1S9TA 2P2AA 2UVIA 3QYTA 4QSCA 2DE4A 1SQYA 2PMSA 5I2KB 3K2DA 5FHMA 5H8FA 2UXAA 4LQ5A 5AA2B 4GD5A 4E0XA 1OVTA 3MZ9A 1VSOA 1DPEA 3CIJA 2I3WA 3G3KA 3K1PA 1YCJA 1JVYA 3KOTA 3PGFA 1VFDA 4ELRA 5I58B 5I59A 5HPQA 3FASA 3RT8A 4F3GA 4QRZA 4ZEKA 5ITPA 4H8JA 1YTVA 2XHDA 4KQPA 2Z23A 2DXRA 4YKPA 2F35A 3TTNA 4OERA 2D5WA 5H8NB 2FNCA 2Y7IA 1Y3PA 4U4SA 3S4UA 1FQFA 1B6HA 2VD3A 3TCFA 1URDA 1MH3A 3E13X 3FJMA 3O6IA 1LFIA 4IO4A 1MY0A 3K6WA 3PMXA 4G2ZA 3RNNA 4R75A 1EZOA 3LSWA 3HHGA 2THIA 1ZKBA 4JB7A 2GH9A 1MXWA 1ZTYA 4YICA 3QUJA 4JBZA 2O1LA 4DIGA 5DVFA 2HFBA 1SI1A 3TDJA 1P1QA 2F8DA 3MP6A 2DP8A 3RUMA 3KN3A 4FIMA 4DCYA 4R9GA 1NNKA 2ESNA 1FQDA 2DVCA 3IL1B 1SD3A 3G3IA 2QRYA 1I6AA 4EQ9A 4ESWA 3W15C 4R2FA 4GIZA 3QXMA 1OLCA 5H8HA 4ZEFA 2OCUA 2O1MA 3I5OA 1I6QA 1H44A 4KCDA 4R2BA 3U94A 1KWHA 3PPOA 3C32A 5AA3A 3G3GA 3KFMA 4U23A 3IJOB 3O9PA 1SW1A 4F18A 3N6TA 3CR9A 2XD3A 4OZ9A 2PT2A 2O7UA 1JETA 4NF5B 2Y7RA 5L9SA 4PFUA 4ECFA 1QUJA 4RJZA 1UTHB 2RCAA 1ATGA 3DLNA 4YZZA 3SEWA 3KOSA 4I9DA 4F1YA 2BJJX 1US4A 3CFZA 5I57A 2XXIA 4QFNA 5H8HB 1D9VA 3T22A 5IAIA 3K02A 3OO8A 4ZEDA 1BP5A 3GXAA 2O7IA 4OQOA 4FE8A 2F6PA 3O97A 1EZ9A 1PB9A 2DXYA 2NVUB 3MWBA 1ZBMA 1OVBA 2H25A 1B3LA 2GHAA 4GFRA 3S9NC 1MY4A 1B7HA 4X1BA 1QULA 1CE2A 4C1TA 1UTBB 1I6BA 1LAHE 3KBRA 4KI0E 4PFWA 2I49A 3PMVA 2QMWA 1YPNA 2ZNUA 4GXSB 4N07A 3H06B 3N6UA 2CMOA 1LLSA 3EPEA 3QAXA 5K2XA 1DOTA 1NNTA 3Q29A 3RQTA 1VFEA 1NFTA 3ZS6A 2E1SA 3TAJA 3S9EA 4JSDA 4THIA 3TFLA 1B5JA 3LSLA 1F9BA 1FTJA 2QMXA 4MLVA 1MM6A 1MY2A 2Y7WA 4Z0IA 3IB1A 3O28A 1B0LA 4N13A 5L9MA 3IX1A 1LBCA 1OQHA 4LZ7A 3HN0A 1JVXA 1MPCA 3TELA 2NXOA 3AXFA 2I0BA 1MDP1 1H43A 2DVZA 4U1ZA 2Z8DA 5ITOA 3RTWB 1A40A 2F6GA 3T9XB 4JWOA 2RC9A 2XXWA 3RLFE 3MZ1A 4QHQA 3OSQA 2X26A 4TQUQ 4WEDA 2F5XA 3OEKA 4NWDA 3U93A 1J1NA 4Q5TA 4F2OA 5I84A 4DE8A 2PT1A 2ZYMA 1EZPA 4TLLB 2RC7A 4IY5A 5KZTA 4HCWA 4FECA 1MY3A 1M5CA 3OELA 4EUOA 1NMUA 3LC8A 5J1DA 3FZVA 1ANFA 3TZAA 4O3BA 3O66A 4U22A 4F29A 4H1XA 1XOCA 5CI5A 4ZZEA 4I1DA 4OFOA 1FQAA 3SEUA 1B5HA 1DMBA 4HCYA 3SEXA 4YU0A 2I58A 4H6DA 4EF1A 3USDA 4NEDA 4R6KA 4IB2A 4POWA 1MQDA 3S9MC 2DE2A 1O7TA 3P7IA 1AH5A 3K4UA 4Q0CA 4RXLA 3W9VA 4BDQA 2H99A 5AA4B 2ONRA 4H65A 2ABHA 1LCTA 4JWXA 4EF2A 3PD8A 4GL8A 4ZECA 2AL5A 5KDTB 1OQGA 3H7MA 3RY3A 5CRYA 1SVXB 1MXVA 2Y7KA 3EHTA 3MQ9A 2UVHA 1MQIA 2ALUA 4RK9A 3TEPA 1JW5A 1RKMA 2I0CA 4RPNA 3MUQA 1IXHA 4QFPA 3M3KA 2Q88A 3PMWA 4EXLA 4NTLA 2G93A 3EF7A 3EQ1A 3U92A 3VVDA 3FD3A 1N04A 3HO7A 3RN8A 4H5GA 3K6VA 4ZDMA 2R71A 4AB6A 4YKJA 5AA4A 1SW4A 3PUWE 4IO7A 1ZJLA 4JXIA 1M5FA 3LUYA 4R74A 1B51A 4ZE9A 1N7WA 3A3CA 4OXVA 4OTEA 4XKPA 2RINA 3K1NA 4YKKA 1Y4CA 2ONSA 1AOVA 2VOZA 1MM7A 4U1OA 3K0VA 4E0WA 2F78A 4GRKA 2A5TA 3Q27A 3SEYA 1NH7A 4YB7A 3VVFA 3V89B 2DSFA 3KSJA 4X48A 5DVJA 4ND9A 3G3HA 2O68A 3R7XA 2H4IA 5IKBA 4GQOA 3KJTA 3MVZA 1B40A 1Y4TA 2XXTA 4AQ4A 4DCXA 4C0RA 1QJMA 3L6GA 5BUUA 4KYDA 2DYXA 3IOUA 4OHNA 4RPOA 3RPWA 3UIFA 5I58A 4G8MA 4ELQA 3HSTA 4GOTA 5CBSA 5FTHA 5I2NA 4OESA 1XT8A 2F7BA 1QUIA 4H5FA 5LOMA 3I6VA 1Z7NE 1TFDA 4OMBA 1NNPA 1D3KA 5H8NA 4EQBA 3MJNA 2QS3A 3K6XA 1R9QA 1Y9UA 3RTFB 3FGSA 4OEVA 2Z22A 3M3FA 4R73A 2HZKA 4H0WA 2VD2A 3VFJA 3T66A 3U1OA 3UGWA 4BDMA 1UIUA 1LAFE 2W7YA 1WDNA 4XKNA 1FTKA 5TPAB 1IITA 1R1NA 1VR5A 2V84A 4FJPA 4MH5A 4RNSA 5A5XB 3ZKLA 1D9YA 1LGBC 1OMPA 3H6VA 4MF3A 4JSOA 3LR1A 4R6HA 4XIGQ 2HZLA 1ZLQA 2XXUA 2XX7A 4KD5A 3HCQA 1N7XA 5B70A 1BIYA 2VHAA 1ELJA 2QS4A 3OENA 1ZIUA 3FVKA 3SETA 3PD9A 4XKRA 2E0SA 1UTBA 1DPPA 2V93A 4NF6B 1N76A 1N3WA 2V3UA 3CG3A 4LZ5A 5H8FB 4GLIA 4LUBA 3DM0A 4QSEA 3RGYA 5H8QB 3TYHA 5BWJA 3LBSA 3I3VA 3MW0A 4PFTA 2Q89A 1B05A 5TPAA 4MBPA 4F3SA 4Q30B 1Y20A 2Y84A 3A09A 5TP9B 3JZJA 2QL3A 3PUYE 3PPNA 3JV9A 3B6TA 3IAZA 4QF9A 4DDDA 3GLBA 2ANJA 3VXBA 3B6WA 1PBQA 3KN8A 1LBBA 1MRPA 1NH8A 2ZNSA 3IO4A 3GBAA 1JNFA 1MS7A 3DP6A 3OSRA 4L17A 3TTKA 3H6TA 1B1XA 1B4ZA 4KFQA 4F19A 2XXXA 2PYYA 5KCJB 3V83A 2QS2A 5JTYB 1B7UA 1MG1A 1OIBA 3IB2A 3O2AA 2QS1A 4RY1A 4TOZA 1LAGE 3CG1A 1MXZA 3GZGA 3ILUB 4LVQA 2V3TA 1IEJA 4NF8B 3O6HA 2M8CA 4R6YA 3DELB 3ZSFA 4O3CA 1DSNA 2Y7PA 1WODA 1A54A 4H67A 4FATA 1QVSA 1PB8A 4G77A 3VXCA 2AYSA 3PUXE 1UIVA 5FHOA 2QJEA 4IO5A 3CVGA 4RYAA 4YMAA 3DP4A 1AIVA 1B3HA 3PUVE 1BTJA 1NKXA 3IO6A 1QKBA 5TU0A 5F7VA 4C1UA 4TLMB 4ELPA 2QPQA 5AE4A 5JTYA 1JW1A 2ZXTA 4X9TA 5ELVA 4WXJA 3WAFA 4DXCA 1YAEA 3K01A 1Y3QA 1MXXA 3BFTA 3E9XA 1HSJA 2DE3A 3EHUA 1B4HA 1MY1A 1MXUA 3T96B 3A3UA 1A55A 2NOOA 5DT6A 3VLWA 5B7DA 4P0GA 1RYXA 4FAJA 4LONB 3DP8A 5HM4B 4NF4A 1URSA 2OBGA 1DTZA 4K3FA 1FQBA 3VDFA 4F39A 3MC2A 4X1DA 3FVOA 3IORA 1A7LA 1FQEA 3OO7A 4R72A 2F34A 3U72A 4IGRA 3C34A 1FTLA 4G68A 2PX1A 2Q2CA 3Q25A 4KHZE 1Z7ME 2PBWA 1II5A 1QUKA 2RC8A 4POXA 5FTIA 3THIA 2UVJA 1LCFA 4UACA 1IXIA 4OFJA 5I2KA 2REGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZKKA 3TPAA 1DTGA 1G0IA 4LP2B 3R6UA 1HSLA 5I3SA 3LUZA 2OZZA 1L5TA 4P1EA 2OJTA 4P11A 3C35A 5HBCA 3UN6A 4QFKA 1FBDA 3S2VA 5AA2D 2HQ0A 3T93B 4OENA 1FTOA 3FBPA 1Y3NA 1NL5A 2X7QA 3OXNA 4PDDA 3SKPA 4GWXA 2HAVA 4P56A 4HTGA 3N26A 2F3DA 5JEIA 4MHFA 1MDQA 1FTAA 2ZZWA 1G0HA 3KSXA 2QVVA 4GWSA 3C9HA 1Q1KA 3E3KA 2ZYNA 5ISUA 3OMBA 2DOJA 1CB6A 3ROJA 1NUXA 5AA1A 5EHMA 2ZZXA 5H8SA 4O8MA 4OA4A 4O3AA 3IOVA 2DWJA 1JP4A 3BBRA 4PGPA 1NUYA 1WVJA 2D21A 3PU5A 3CRBA 5H8QA 1USYE 3FIRA 3SDFA 2HCAA 2DQVA 1N84A 2VP1A 3OOAA 1IXCA 5M2VA 3TTLA 1VE4A 3MPLA 5IZ1A 2HXWA 4QSDA 3Q28A 4MJOA 3MPKA 2Z8EA 5CBRA 2PVUA 1I69A 4G4PA 1FPGA 4IR8A 4OEUA 4LZ8A 4ZEBA 4XTCQ 5I57B 3SERA 4KR5A 1MXYA 3H3GA 4FEBA 2B3FA 2XX9A 1P1OA 4HS7A 3CFLA 1EYIA 2XXPA 4G68B 4NF8A 1S50A 2Q2AA 1QGXA 1MQGA 2XX8A 2UVGA 3EN3A 4FATA 1N3XA 1B9JA 4M4GA 3TKDA 3VVEA 3PV0E 1LB9A 1ZMGA 5L8DA 1B0HA 2I4CA 3LSXA 1M5EA 3SEVA 1SDXA 1FSAA 1ZU0A 3OEMA 1LAXA 3KGCA 2H5YA 1B7ZA 1JEVA 1SYIA 1FPEA 4HE1A 3QYTA 5I2KB 4QSCA 1SQYA 4LQ5A 5AA2B 3K1PA 1DPEA 3CIJA 3G3KA 3PGFA 3KOTA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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