5AA1A

Crystal structure of mltf from pseudomonas aeruginosa in complex with nag-anhnam-pentapeptide
Total Genus 137
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
137
sequence length
418
structure length
418
Chain Sequence
EGVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFTQHLQQRLPRYESHFKQSGKQKDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Activation by Allostery in Cell-Wall Remodeling by a Modular Membrane-Bound Lytic Transglycosylase from Pseudomonas aeruginosa.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE F
molecule tags Lyase
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 137
structure length 418
sequence length 418
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2015-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa1A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa1A02
1VR5A 3KOSA 2Y7IA 1MXWA 4R6YA 4GVOA 4POXA 4DXCA 1MXXA 3USDA 4RJZA 2UVHA 4OEUA 3U72A 4DCYA 5L9OA 2E1SA 4U4SA 1IXHA 1Y20A 3PV0E 3FXQA 3OENA 3K2DA 1PDAA 4U22A 5I59B 5CBRA 4IO4A 3L6GA 3QAXA 4R73A 1ZKBA 4OWDA 2Z8FA 1M5FA 1A55A 4F31B 3D4GA 3Q26A 1QUIA 3B6TA 3CSBA 1FQBA 4FATA 1FQDA 3SETA 4EXKA 1MQGA 3K00A 1ZBMA 4PE5B 1YTVA 1OQGA 1ZLQA 1MXZA 4I8CA 1MY4A 3TTRA 4ECFA 5IKBA 3VV5A 5I58A 1XVXA 3HO7A 1OLAA 3FJ7A 3F11A 4NMYA 2QSXA 4PFWA 3SEUA 4YU0A 2O51A 3PPRA 4ISUA 1EZOA 3KJTA 2DVZA 1B40A 4LA9A 1GR2A 2OJTA 4EQ9A 4F3SA 4ONYA 2FNCA 1NFTA 5ICQA 3OD7A 3HPIA 1L5TA 4NF5B 3JYRA 2GH9A 1MY2A 4YKKA 2NVUB 2UXAA 3PUVE 2GHAA 3MUQA 3WAEA 4FAJA 5ICTA 3H7MA 4YZZA 3WAFA 1B7UA 4BDLA 1MH4A 3FV1A 2QMWA 3KZGA 3A3CA 3T9VA 4K3FA 4QFOA 4OYVA 1MPDA 3HN0A 1HSLA 4N13A 1LAGE 2IEEA 2Y7WA 4OFJA 3TELA 1P1UA 3TMGA 3ZKKA 4TQUQ 2ZXTA 3H06B 4P11A 2ZYNA 5F1QA 2H9BA 3Q29A 5HM4B 1TT1A 3C36A 5CMCA 3VLWA 4NTLA 3LC8A 4RY1A 5K2YA 1MQDA 1LAXA 1NL5A 4GWOA 4ZZAA 3A3UA 3H6WA 1P99A 3MC2A 3TZAA 4EUOA 5ITOA 4NE4A 2D21A 3M3FA 3GXAA 1B3FA 4R9GA 4GQOA 1PB9A 2O68A 4O3CA 4C0RA 1I69A 2F7BA 4DDDA 3CG3A 4X1BA 1RYXA 1SBPA 2GFEA 1R9LA 3QK6A 4WEDA 3CR9A 4F3GA 4P0IA 4GRKA 1LB8A 3FATA 3QXMA 4ESXA 4JWOA 2O7IA 5CI5A 2Z23A 4EQ7A 3EHSA 1PBPA 3Q28A 4RK2A 3A09A 2VP1A 4IO2A 5H8NB 2R6GE 1VFDA 2V25A 3ILTB 3IO4A 2O1LA 1IITA 3KN7A 4RK9A 4XIGQ 3B6QA 5TP9B 4GF8A 3PMXA 3ILUB 2BJJX 3CFZA 4UACA 3U93A 1ZMGA 1JQFA 1LFIA 4I1DA 5H8SA 3PUYE 4IO7A 3TTMA 4MLQA 1S7YA 3P7IA 4YMBA 3LSWA 1XS5A 3W9VA 4U2RA 1OMPA 3V5AA 3C33A 2XXYA 4JWXA 3R7XA 1DSNA 2XXUA 2XX8A 4LUBA 4DXBA 4ZS9A 4QHQA 2F35A 3DP6A 3W9WA 4HTGA 3MPLA 5FTIA 5BWJA 4XKRA 2XXPA 3O6GA 2XX9A 3T66A 4C1TA 1O63A 3C35A 3ONMA 2G29A 4QRZA 4N07A 1IXCA 3FV2A 3MQ9A 4G2ZA 5I2KA 3DLNA 5FTHA 3CFXA 3PPPA 3VVDA 1JW5A 3MVZA 4FORA 1BIYA 3KSJA 4X1DA 3K02A 5CRYA 1NMUA 2NOOA 4Q0CA 5L8DA 1P1NA 3K6XA 4X9TA 4F18A 3RY3A 1LGBC 3LSLA 1FTOA 4OMBA 3AXFA 5AA1A 3SEVA 4YB5A 4H0WA 5AA2B 2Q88A 4ZE8A 1BKAA 2QRYA 2REGA 4YB6A 4ZEIA 3EHTA 5TPAA 3PMVA 1B4ZA 3FUZA 4G4PA 4ELOA 3TPAA 4WEPA 4R2BA 3DM0A 3IJXB 2Q9TA 4I62A 1XOCA 3IAZA 2QS4A 5A5XB 1O7TA 1Y3PA 1P1OA 2HXWA 5I84A 3SERA 4FJPA 4NF6B 2V3QA 4JBZA 1Y9UA 4P0GA 3JV9A 4KI0E 4R2FA 2DOJA 2D5WA 4JXIA 2I0BA 1SW5A 1SW1A 5FHOA 3TCHA 4OENA 4FECA 5KCJA 2ONSA 3N26A 3TTKA 1CE2A 4JWYA 2DWHA 2RC8A 2F36A 1PB7A 3MZ1A 3HCQA 1FQCA 1SW2A 3UP9A 1TXFA 4PFYA 4Q5TA 1O64A 3FVNA 2B65A 2WKYA 1DPEA 3OO8A 4UA8A 3M3KA 1B51A 1IQ7A 1CB6A 3TQWA 3ODBA 3KN8A 2P2AA 4U4XA 3EN3A 1WODA 4ZDMA 3VXCA 3K1NA 3S9MC 3O9PA 1T0KA 3KOTA 4F3PA 1WDNA 2A5TB 2DWAA 1ELJA 1ATGA 1ZU0A 2HQ0A 3EF7A 5IAIA 2REJA 3L6HA 1US5A 2DSFA 5EHMA 2I58A 5HBCA 2RC9A 1LCFA 3E3KA 1PEBA 4QFNA 2AL5A 2ANJA 3O29A 2O69A 3O66A 4KCDA 4IB2A 1Z7ME 2DWIA 4R72A 3E13X 3IOWA 3W15C 1FTJA 3LSXA 1NH8A 4JDFA 4ZE9A 4NF4B 5JTYB 1R6ZA 4NF6A 3HSTA 2DXRA 5TU0A 2QS1A 5I57B 3RPWA 2F5XA 4PFUA 1NH7A 4MFIA 3PPQA 4FE8A 1DOTA 1RKMA 1B0HA 2G93A 4H1XA 2DXYA 5H8QA 4OFLA 4G68A 1SVXB 5FHNA 1QKBA 3GZGA 4C1UA 1B5HA 2UVJA 4G8MA 1UTBB 5DEXA 2DYXA 2XXVA 1SDXA 4F1VA 3G3FA 4R6HA 5H8FA 5EYFA 3TDJA 3C32A 3SDFA 2PBWA 2DQVA 2ONRA 3ECRA 3MAMA 3TKDA 1IZ1A 1SYHA 3MPKA 4QFPA 2FA7A 4TLLB 1B7ZA 3KJ7A 3RLFE 1LFHA 3TYHA 1POY1 2Z8EA 2OZZA 4DIGA 5JEIA 3VVFA 4OZ9A 1URDA 3MBPA 2A5TA 3IX1A 4QSEA 1UTHB 1P1WA 3TUSA 1YCJA 3PU5A 3EQ1A 5CC2A 2Y7RA 1LAFE 4ZEBA 3RQTA 2XXQA 4IO5A 1OVTA 4YICA 1M5DA 1EU8A 1FQFA 5I59A 4THIA 3Q27A 1LFGA 1JETA 5ELVA 4NF4A 5M2VA 4GL0A 2I3VA 3U8QA 2Y84A 4EDPA 1BP5A 4ZEFA 4PETA 3O97A 1VE4A 3MJNA 3EPEA 5I57A 1MDP1 2RKMA 4OFOA 4OEVA 4YKIA 3RN8A 4G8NA 1YPNA 2ZNUA 3PUZE 2HCAA 4KYDA 1B3EA 2NXOA 1MS7A 1N3WA 4XTCQ 3LBSA 4ZEKA 1P1QA 2UYEA 2VGQA 4YKPA 2QJEA 2W7YA 3G7WA 2M8CA 2HEUA 1NNKA 2ZNTA 1N84A 1SI0A 1ZJLA 1AH5A 1SI1A 2A5SA 3TEPA 2OLBA 3QUJA 4LVQA 4BDNA 1YAEA 3FGSA 5AA4B 4OESA 3TCGA 4GXAA 3IK6B 2UVIA 3FJMA 4F39A 1QUJA 1B5JA 3N94A 2HZKA 4NF5A 4LQ5A 3CI8A 2O1MA 1EH3A 2OWSA 4KR5A 4JSOA 1SQYA 2XD3A 1D3KA 2VHAA 3Q25A 5DVFA 1A54A 3SEWA 1PC3A 2CZLA 3H6VA 1USYH 1QKAA 3PGFA 4ELRA 3MVYA 4AB6A 1HSEA 4IGTA 2HZLA 5KDTB 4QFKA 3TQLA 4OQOA 3UN6A 1MY1A 2OWTA 1VSOA 3OO7A 4E0WA 1B52A 1OQHA 2V3TA 4MF3A 1FCKA 3CIJA 4PFTA 4RA1A 1ZTYA 1D4NA 2XHDA 4F29A 2PMSA 3GBBA 3RNNA 3DELB 4IO6A 1DTZA 5L9SA 1MQJA 3C9HA 3K0VA 2F7AA 4RNSA 4LQ2A 1TFDA 3PPNA 1A7LA 1IXIA 1Y4TA 2QMXA 4XKQA 4XKPA 4H65A 3JZJA 2NUVA 1QVSA 2Y7KA 2O7UA 3UK4A 1US4A 4LATA 4X48A 5CMBA 1LBBA 3FXRA 2XX7A 1GGGA 2GHBA 2O84X 4IGRA 2V93A 4HS7A 5AA3A 1ZIUA 3KBRA 2RCAA 5HPQA 4NWDA 3HHGA 1JNFA 4M4GA 1FW0A 5H8NA 3MW0A 4GL8A 3OSQA 1MPBA 4O3AA 2ONKE 4DZ1A 5TP9A 2HFBA 1M5BA 1QW0A 5KDTA 2QPQA 4NF8B 3TODA 4GLIA 3PD9A 4F2QA 1UIUA 2OCUA 1R1NA 1B4HA 1IEJA 2XXHA 3I3VA 3K4UA 1GV8A 3T9XB 5F7VA 3ZSFA 1OLCA 4BDRA 4H5GA 1N7WA 5I2NB 4QFLA 1MRPA 4LZ8A 3TFLA 3OEMA 4I9DA 1B58A 2OK2A 3FXUA 2F6PA 1M5CA 2ABHA 4GOTA 1S9TA 4U1OA 3CRBA 4RXLA 3VDFA 5J1DA 5ITPA 1MG1A 3OSRA 3FVKA 3VLVA 3CG1A 3PD8A 1B6HA 3FJGA 4KPTA 4L17A 1Q1KA 3S4UA 1XC1A 5CM6A 1MH3A 4DXUA 2PX1A 4AB5A 2I49A 3RT6B 4KQPA 1DTGA 4N6PA 4OHNA 4FEBA 3K1MA 3N6TA 4BDMA 1F9BA 3S2VA 2D3IA 2Q2AA 3OO9A 1AL3A 1N0TA 3MZBA 2PT1A 5EHSA 3IJOB 4ESWA 4DLDA 3R6UA 4POWA 3IR1A 4GIZA 4IO3A 1QUKA 2DE2A 5AA2A 5CMKA 1FTLA 2HAUA 5H8HB 4Z0IA 2I3WA 3G3IA 3VFJA 1JVXA 3GBAA 4EQBA 3T9UA 1UQWA 3H6UA 3H3GA 4Z7EA 1GVCA 3QSLA 4GFRA 1MDQA 3I5OA 2DE4A 1M5EA 1MM7A 2QS2A 2IA4A 4YKJA 2I4CA 5JK4A 4TLMB 3UIFA 5K2XA 3O2AA 4QSCA 2ZYOA 3U1OA 3OO6A 3H6TA 3GLBA 1IXGA 4G8HA 3TTLA 5A5XA 1LBCA 1GTKA 3UGWA 3PUXE 4KYSA 1BTJA 2VOZA 1B5IA 2H98A 2I6EA 3OXNA 3SKPA 4ZECA 2CMOA 1A40A 1N04A 1II5A 4KFQA 4ZZEA 2NWJA 4G77A 4IY5A 2DWJA 1MXVA 4R6KA 3TCFA 3KEIA 5CMMA 1HSJA 1B9JA 2P1SA 2PT2A 3IL1B 2QS3A 4F22A 4DCXA 1A99A 2X7QA 3MVXA 3MP8A 3T9HB 3PUWE 1R9QA 2RINA 5H8HA 4R9FA 2F7CA 3S9EA 1NKXA 3K6VA 5FHMA 1MXYA 1POTA 5DVJA 2DS9A 4XXUA 2V3UA 2GRVA 4BDOA 3QYTA 2DP8A 1MY3A 2XD2A 3K6UA 4U23A 2F34A 2Q2CA 4MBPA 2Q8JA 1I6AA 2F6GA 3LR1A 4ZEDA 3O6HA 3I6VA 4OXVA 2R71A 5B70A 1PBQA 1JVYA 1Y1ZA 4EF1A 3V83A 3K01A 3IOUA 4F19A 4LP2B 1S50A 2QL3A 1JEVA 5JTYA 3IB1A 3T93B 1OIBA 4U21A 3N5LA 4QSDA 3S9NC 3RTWB 3V8XB 1MXUA 2I48A 3E4RA 4JSDA 4H67A 3CFLA 1USYE 1NNTA 4OERA 1URGA 4EF2A 1B46A 3O6IA 3RT8A 1UTBA 2B3BA 3BFTA 4Q8RA 5KZTA 4KYEA 2YPNA 2X26A 2AL4A 3MVWA 1B1HA 3OMBA 4MH5A 2OBGA 4F3BA 5I56B 3FZVA 1DPPA 1LCTA 2XXIA 4OETA 1SD3A 3OOAA 2RC7A 1JW4A 4NEDA 5I2KB 1QULA 3HV1A 5CBSA 2AYSA 3VLUA 3KSXA 1H76A 3UA8A 3QIMA 2H5YA 3OELA 1UTHA 1H3DA 1FQAA 4RPOA 1ANFA 5B7DA 1B7HA 1MPCA 3BKIB 2YLNA 3S9LC 1QJMA 4AQ4A 3LSFB 4DE8A 3PMWA 1WVJA 1H45A 2LAOA 2FYIA 4WKMA 3TTNA 3T22A 2THIA 4MLVA 5DTBA 1AMFA 2ZNSA 5DT6A 2KLFA 3LUYA 1FTMA 4G68C 3FASA 1EZ9A 2Q89A 3H4ZA 1FTKA 4F2OA 3BFUA 4PP0A 3DP8A 3M3LA 1B1XA 1Z7NE 3FIRA 2PVUA 3RTFB 4TOZA 1XHYA 1B3HA 2O6AA 2ZYKA 1XVYA 1N3XA 1AOVA 2VD3A 5TPAB 1MQIA 3SEXA 3UORA 4OVJA 1UIVA 1A8FA 2XXTA 3BBRA 3D4CA 4FIMA 1N76A 3PPOA 4NWCA 1EZPA 4LONB 1VFEA 3C34A 1Y3QA 2Z8DA 4Q30B 3EHUA 1Y3NA 3VVEA 5AA4A 3KFMA 2HAVA 4YMAA 3KN3A 3V89B 5I56A 4EXLA 3SESA 4KCCA 1A8EA 4E0XA 1TFAA 3KGCA 3IOTA 3HHFA 1OVBA 4F1UA 1B0LA 1I6QA 3G3KA 3ZKLA 5DVIA 3CVGA 3FD3A 1D9YA 4HCWA 1B3LA 5ISUA 2R9JA 5KCJB 3IO6A 1NNPA 1LSTA 1PB8A 4YB7A 3B6WA 4XKNA 2YJPA 4R75A 3THIA 2B3FA 3M8UA 3G3JA 3IB0A 1B3GA 5L9MA 4JB7A 1JW1A 2DE3A 3TAJA 3U94A 2RCBA 3SEYA 4ELPA 2H99A 4R74A 1IUDA 2XXXA 2AIXA 3C31A 3RGYA 5DYHA 1Q35A 3O28A 3MP1A 4GD5A 3OEKA 4KD5A 1H44A 3U92A 5AA2D 2E0SA 1BLFA 1LAHE 1J1NA 3H03A 3CSGA 4PQJA 4LZ5A 2ESNA 1FQEA 1IIWA 1NNFA 2VD2A 2XXRA 3FVGA 4KHZE 4O3BA 2I4BA 3VXBA 1H43A 2DVCA 5LOMA 2X7PA 1I6BA 1TWYA 5AE4A 1MY0A 1MQHA 2ALUA 2UVGA 4LZ7A 2Z22A 2H4IA 5BUUA 3FVOA 4YAHX 2F97A 2I0CA 1URSA 1XT8A 1D9VA 4FEDA 3E9XA 1Y4CA 3K6WA 4HCYA 3T96B 2RF1A 3QUFA 1DMBA 2P0SA 4H8JA 4RYAA 4H6DA 2V84A 2H25A 2XXWA 3C4MA 2PYYA 3B7DA 1RYOA 2ZMBA 1AIVA 4HW8A 4BLAA 4GXSB 1LLSA 1B2HA 4QF9A 3VE1B 2ZYMA 1N7XA 3MP6A 3IOVA 2F78A 4RPNA 5I58B 3N6UA 5H8QB 4G68B 4M1VA 3IORA 3RUMA 4BDQA 3DP4A 1LB9A 2F8DA 4NF8A 4OTEA 5DEXB 3KG2A 4H8IA 1Y1MA 2UYFA 2Y7PA 1KWHA 4ND9A 3MWBA 5H8FB 4F1YA 3G3GA 1B32A 1JEUA 4ELQA 3MZ9A 3K1PA 1SYIA 4IY6A 3R26A 5I2NA 4H5FA 3IB2A 1B05A 4WXJA 3G3HA 4U1ZA 1SW4A 1MM6A 3ZS6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1VR5A 3T0JA 3KOSA 2Y7IA 1MXWA 4R6YA 4UABA 2Q8MA 4GVOA 4POXA 4DXCA 1MXXA 3USDA 4RJZA 2UVHA 4OEUA 3U72A 4DCYA 5L9OA 2E1SA 4U4SA 1IXHA 1Y20A 3PV0E 3FXQA 3OENA 3K2DA 1PDAA 4U22A 5I59B 5CBRA 4IO4A 3L6GA 3QAXA 4R73A 1ZKBA 4MIJA 1FBCA 2FBPA 4OWDA 2Z8FA 1M5FA 1A55A 4F31B 3D4GA 3Q26A 1QUIA 3B6TA 3CSBA 1FQBA 4FATA 1FJ6A 1FQDA 3SETA 4EXKA 1MQGA 3K00A 1ZBMA 4PE5B 1YTVA 1OQGA 1ZLQA 1MXZA 4PFIA 1CNQA 4I8CA 1MY4A 3TTRA 4ECFA 3QMFA 3PTYA 4NG7A 5IKBA 3VV5A 5I58A 4GBWA 1XVXA 3HO7A 1OLAA 2Y5LA 3FJ7A 3RYDA 3F11A 3B50A 4NMYA 2QSXA 4PFWA 5EQ7A 3SEUA 4YU0A 2O51A 3PPRA 2CZHA 4ISUA 1EZOA 3KJTA 2DVZA 4PDDA 1B40A 4LA9A 1GR2A 2OJTA 4EQ9A 3RPLA 3U65A 4F3SA 4ONYA 1D9QA 2FNCA 1NFTA 5ICQA 3OD7A 3HPIA 1L5TA 4NF5B 3JYRA 2GH9A 1MY2A 4YKKA 2NVUB 2UXAA 3PUVE 1DK4A 2GHAA 3MUQA 3WAEA 4FAJA 5ESYA 5ICTA 3H7MA 4YZZA 3WAFA 4JVCA 2CZKA 1B7UA 4BDLA 1MH4A 3FV1A 2QMWA 3KZGA 3A3CA 3T9VA 4K3FA 4QFOA 1IMCA 4OYVA 1MPDA 3HN0A 1HSLA 4N13A 1LAGE 1YXIA 1IMFA 2IEEA 2Y7WA 4OFJA 3TELA 1P1UA 3TMGA 3ZKKA 4TQUQ 2ZXTA 3H06B 4P11A 2ZYNA 5F1QA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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