5AA1A

Crystal structure of mltf from pseudomonas aeruginosa in complex with nag-anhnam-pentapeptide
Total Genus 137
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
137
sequence length
418
structure length
418
Chain Sequence
EGVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFTQHLQQRLPRYESHFKQSGKQKDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Pseudomonas aeruginosa
publication title Activation by Allostery in Cell-Wall Remodeling by a Modular Membrane-Bound Lytic Transglycosylase from Pseudomonas aeruginosa.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE F
total genus 137
structure length 418
sequence length 418
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2015-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa1A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa1A02
2H9BA 1PEBA 4G8MA 5IAIA 1SQYA 5I84A 1N7XA 1LAXA 4H5FA 3UIFA 3U72A 2VD3A 1MY4A 2H98A 5I2NB 3DELB 2GFEA 2DXYA 4FEBA 1J1NA 4LP2B 2O69A 4FIMA 5AA2A 1D9VA 1LGBC 2X7PA 4X9TA 1JEUA 1H44A 3CFZA 4RY1A 1QUKA 2DWHA 4THIA 5FTIA 1US4A 1P1QA 4BLAA 1YCJA 3I3VA 3PUWE 3K1MA 1IQ7A 4G4PA 5ICQA 4U1ZA 2F97A 4G68C 2OLBA 4FECA 3LC8A 2V3QA 5I2NA 4X48A 2HZLA 1L5TA 3LSXA 5TU0A 3T93B 4GF8A 4BDMA 4ZDMA 5FHMA 3UN6A 3EPEA 3T66A 4XXUA 2F6PA 3IOUA 3OENA 4FORA 4JWOA 1MY1A 4R6KA 3FJMA 4OVJA 1NL5A 4FAJA 1MXZA 3QYTA 3IJXB 2M8CA 1NNKA 3TAJA 4XKNA 1UIUA 1O63A 2IA4A 1QUIA 4LZ8A 1MXUA 4PFTA 4PFWA 1RKMA 2FNCA 5DT6A 4ONYA 1ZKBA 4WXJA 4XTCQ 2NWJA 3SERA 4KPTA 2PYYA 1B58A 3PPRA 3LSFB 4E0XA 2O6AA 1EZ9A 3P7IA 1MDP1 5ISUA 3M8UA 3OD7A 3N26A 4JWYA 4KI0E 1A54A 4H8IA 2XX7A 1UTBB 3TQLA 3OO6A 3RNNA 4HW8A 3KN3A 1TXFA 4DE8A 5TP9A 4LA9A 4NF8B 3MW0A 4AB6A 2QPQA 1NNPA 4ZZAA 2IEEA 1OLCA 2Z23A 3K0VA 4ZS9A 2PT2A 1CE2A 1AMFA 1ANFA 1MY3A 3BKIB 1BKAA 3MVYA 4X1BA 2X26A 5DVFA 4MH5A 3K1NA 4GXAA 4H5GA 4IO2A 1URDA 4NMYA 1FTMA 2UYFA 1Z7NE 4P0IA 4YICA 4NF8A 2I4BA 1Y3PA 4DCXA 4BDNA 4YMAA 2ONSA 2HEUA 1BTJA 3RPWA 1I6AA 2Z8EA 4ELPA 3U1OA 1B4HA 3CRBA 4C0RA 3PMXA 1B5IA 5I2KB 4YB5A 3PD8A 4LQ2A 3IOVA 3MC2A 3DP4A 4NF5A 3VLVA 4KD5A 1SD3A 4LZ7A 3O29A 4QHQA 2O7UA 4M4GA 2ONRA 3L6HA 3IB2A 1UTHB 4KCDA 3UA8A 4KFQA 5L8DA 3V83A 3V8XB 4YAHX 1WVJA 3ODBA 5I2KA 1FTLA 3QSLA 3CSGA 3GZGA 3CVGA 2I48A 5CMBA 3CSBA 2WKYA 1Y3NA 4IO6A 4IO7A 5I57A 1NH8A 1ZIUA 2PBWA 1JW4A 1MQHA 1SYHA 3TODA 4GVOA 1TT1A 3QAXA 4NF6B 3SEWA 1B51A 4F3BA 4QRZA 1B6HA 3PPNA 2OWTA 1B05A 1B4ZA 2H4IA 5H8SA 3K6WA 3WAEA 1OQGA 1H45A 4HCYA 1MDQA 3UK4A 1N3XA 3VE1B 3TUSA 1GGGA 3ZSFA 3LSLA 3Q29A 5HM4B 1TFAA 5ITPA 5ICTA 3TFLA 1B1XA 1FQBA 3CFXA 3T96B 3TELA 4K3FA 3OELA 4DCYA 4IO5A 5A5XB 1OQHA 2H5YA 3GLBA 3USDA 4IGRA 5IKBA 3EHTA 4KYEA 1DTZA 4G68B 3TTNA 3U94A 1B7UA 2Z22A 3H6WA 1A8FA 5HPQA 4XIGQ 5KDTB 3O6HA 3VV5A 2P0SA 4O3BA 2DWAA 4H8JA 1XC1A 5EHMA 2P2AA 3KOSA 1HSLA 5I58B 3FJ7A 1SYIA 2O1MA 5ELVA 5A5XA 2I3WA 1H3DA 3MP6A 4Q30B 3HV1A 3OO9A 3F11A 4EQ9A 2XXWA 5DYHA 3IL1B 3VVEA 1HSJA 5AA4A 4G68A 4GWOA 2I0BA 3BBRA 2FYIA 4F3SA 4KHZE 1LFGA 2XD3A 4EQ7A 1IIWA 2ZYKA 4AB5A 3RTWB 5KDTA 4JXIA 4TLMB 1EU8A 3MZ1A 2RC8A 4QFKA 1MQJA 2XXIA 2NUVA 4QSCA 2UVGA 3TCHA 2GRVA 3OEKA 3W9VA 3JZJA 1PBQA 2Q8JA 4Q0CA 3THIA 3A3UA 3RT8A 4OXVA 3R7XA 4RXLA 1OIBA 1DMBA 1H76A 5DVIA 5BWJA 5K2YA 1QULA 2QSXA 4U4XA 3TEPA 4QFNA 4ESWA 4H1XA 1AH5A 1UQWA 1FQCA 1OVTA 2CZLA 4MLVA 3MVXA 5CMMA 1B1HA 4ZEIA 3VXCA 1D9YA 2DXRA 3PMVA 3C35A 5H8HA 3PUXE 1Y4CA 3H7MA 2DVZA 4ZEBA 2QJEA 3JV9A 3FXQA 3K6VA 2HCAA 3S9EA 1B2HA 2F5XA 4TLLB 5I56B 4ELQA 1N0TA 2Z8FA 3R6UA 3Q26A 5AA2B 1VR5A 1JEVA 4N6PA 1GTKA 3HHGA 3MWBA 3HHFA 4ZEFA 3C31A 4LUBA 3H06B 1Y9UA 1VSOA 1R9QA 4RK9A 4F1VA 1FTKA 3VLUA 4N07A 2DE3A 3QXMA 1NH7A 1M5FA 1SI0A 4DDDA 1TWYA 1S50A 1Q1KA 3ZKKA 4LQ5A 5I56A 1F9BA 1FQEA 1QKBA 4O3CA 3IX1A 1N7WA 4U21A 3OXNA 1ZJLA 1MPDA 4OWDA 2AL5A 2XXTA 1D3KA 1T0KA 1FQAA 3OMBA 3FVKA 3B7DA 4Z7EA 3ZKLA 1B0LA 3FD3A 2QS3A 3E13X 3KSXA 4R6HA 2F78A 4QSEA 4U4SA 2HXWA 5F7VA 3SETA 1PBPA 4E0WA 4OESA 3T9UA 4KQPA 2OCUA 2XXHA 5FTHA 4YKIA 4PFUA 1QVSA 2I3VA 4WEPA 2UVIA 4F1UA 4GFRA 4PQJA 4C1TA 5H8FA 1FW0A 1O64A 1A7LA 2YPNA 5I59B 4WEDA 4BDOA 4FATA 3WAFA 1MQIA 1NNFA 3OEMA 4H65A 4KCCA 1DSNA 4MFIA 5HBCA 4Q8RA 2QL3A 5TP9B 2YLNA 4FJPA 2Q2CA 3ILTB 2I49A 4RPOA 2XXXA 3N6UA 1MS7A 4KYDA 3MZ9A 3FIRA 2OK2A 2I4CA 2ZMBA 3MUQA 4G8HA 2V3TA 2F8DA 2BJJX 1O7TA 4F19A 2ZNTA 5H8QA 3KN7A 4F39A 3HSTA 5I59A 2ANJA 4L17A 2Q2AA 1OMPA 1H43A 4JWXA 2UVHA 1A55A 1LAGE 1B3LA 4GL8A 4OEVA 2PMSA 3IOTA 3MJNA 2DP8A 4RPNA 3SEXA 3O9PA 1B7ZA 1IXHA 2O84X 4IY5A 3G3GA 3MZBA 3Q27A 4EF1A 3H3GA 2Q89A 3FVOA 3SEUA 4NF5B 2R9JA 2RCBA 2O1LA 1SW5A 4JB7A 2LAOA 4OFJA 1PB9A 1N76A 1XS5A 4MF3A 1QKAA 4FE8A 1PDAA 1US5A 4PE5B 3HO7A 3KEIA 3A3CA 5CMKA 1N3WA 2VD2A 2G93A 3VFJA 1B9JA 2QMWA 3H6VA 1XVYA 4NEDA 3OSQA 4I1DA 3T9HB 4RNSA 2KLFA 4F3PA 3TCGA 4GXSB 2YJPA 3K2DA 4LONB 3SDFA 5I57B 1MXVA 1MH3A 3RTFB 3N6TA 1MG1A 2ZYNA 3KBRA 4NWCA 3CIJA 4F31B 2Y7KA 1B40A 4ZECA 1UIVA 3CG1A 3PU5A 3TQWA 4EDPA 3TZAA 4ELOA 3GBAA 5EYFA 1B46A 2Y84A 3G3KA 4GL0A 4BDRA 3OO7A 5KZTA 3V89B 2DWIA 3VVDA 3S4UA 1P99A 2Q88A 3BFTA 3RGYA 4QF9A 3IOWA 3FGSA 3I6VA 4OYVA 4TQUQ 5JTYA 4KR5A 3CFLA 4F2OA 1N84A 4BDLA 5L9MA 1FQDA 1BIYA 2DWJA 1YTVA 3GBBA 2W7YA 3KOTA 3DLNA 2NXOA 5CI5A 2FA7A 2O7IA 3W15C 1B5HA 5CBSA 2XXRA 1ZBMA 2A5SA 2NOOA 2VOZA 3E4RA 4RK2A 2HQ0A 5B70A 2Q9TA 1MY0A 2XXUA 1VFEA 4LVQA 4EXKA 2HAVA 1B3HA 3A09A 5AA4B 1IUDA 3C34A 2RC9A 5CRYA 1B3FA 1R9LA 3EF7A 1QJMA 1ZU0A 3E9XA 2QS4A 4YKPA 5CM6A 4U22A 2O68A 4JBZA 3VDFA 4I9DA 5B7DA 2PT1A 4EUOA 3CR9A 4Q5TA 3FV1A 5F1QA 1N04A 3OSRA 1KWHA 4G2ZA 3FATA 1EH3A 3KGCA 3MPKA 3DM0A 3TTMA 2ESNA 4R9FA 1SBPA 4DZ1A 2ONKE 1JW1A 3TPAA 1VFDA 4OQOA 4QFLA 3TDJA 3U92A 1URGA 1NMUA 3SKPA 3FV2A 4HS7A 1AIVA 5TPAA 4R2BA 1WODA 1PC3A 5AA2D 4JSOA 5DVJA 3RLFE 2VGQA 3TTLA 3K4UA 3RUMA 1OVBA 3FASA 4YB7A 5KCJA 3IO6A 5H8HB 1NKXA 4NF4B 4OHNA 4IO4A 3BFUA 4OMBA 3I5OA 2DQVA 4F22A 2QRYA 3MP1A 2I0CA 1IZ1A 2ZNUA 2V25A 1LCFA 5CMCA 4FEDA 4BDQA 2F6GA 4RA1A 1AL3A 2F7BA 3PUYE 4OEUA 3TCFA 4OETA 4P11A 1HSEA 4GIZA 4RYAA 2G29A 4X1DA 3QIMA 3G3FA 3EHSA 4DIGA 2Z8DA 4JDFA 3N5LA 2R71A 4POXA 4NF4A 3IORA 3OO8A 4ECFA 1M5EA 1LAFE 3PUVE 3FVNA 2F7CA 2PX1A 3IO4A 1DOTA 4QFPA 3V5AA 1LCTA 1NFTA 3PV0E 1IEJA 2D5WA 1URSA 3KZGA 4DXUA 5EHSA 3B6WA 4QFOA 1GV8A 2DS9A 1LB8A 1GVCA 2ZNSA 3AXFA 3KG2A 3ONMA 2D3IA 3MAMA 1DPEA 2O51A 1YPNA 3FJGA 4R9GA 3MPLA 2UVJA 4R75A 1I6BA 2A5TA 4AQ4A 1Z7ME 3O28A 3IB0A 1DTGA 2RKMA 3KJTA 2VHAA 1ZLQA 5FHOA 4DXBA 4GD5A 3M3KA 2ZYOA 2THIA 1I69A 1RYOA 1LLSA 3Q25A 3CG3A 1M5BA 1ELJA 4OZ9A 2XX8A 3QUFA 5CBRA 4NTLA 1USYH 1A8EA 3DP8A 4NE4A 3MVWA 3UP9A 1XHYA 5AA3A 1Q35A 5J1DA 3K01A 4UACA 5H8FB 4YKJA 2UXAA 4YZZA 4OERA 3PGFA 1QUJA 3PMWA 4PFYA 4F3GA 3FVGA 3D4CA 2QMXA 1MPCA 2OWSA 3FXRA 5L9OA 4XKQA 3IAZA 2RF1A 5JK4A 1QW0A 3S9LC 1Y1MA 2Y7RA 3N94A 4LATA 5ITOA 3O6IA 4EXLA 3PPPA 4ZEKA 1B3GA 1PB8A 3K00A 1MY2A 3B6TA 5L9SA 2XD2A 3TTRA 4IO3A 4F1YA 3C36A 4R6YA 2D21A 1JVXA 5H8QB 2QS2A 3L6GA 1MRPA 3G7WA 4YMBA 5JEIA 3D4GA 4G77A 1P1NA 5FHNA 1XOCA 4WKMA 1IITA 2DSFA 4GRKA 1SW2A 2OBGA 1LSTA 4R74A 2B65A 4ELRA 3TYHA 5LOMA 3PPQA 4YU0A 4PP0A 3O66A 1JETA 1SW4A 3HPIA 4R2FA 1P1UA 2DOJA 5K2XA 4POWA 1IXGA 4H0WA 4IGTA 1IXIA 4R73A 4KYSA 4MBPA 1M5DA 2Y7WA 3S2VA 2AL4A 3LUYA 2AYSA 4GLIA 3U8QA 4IY6A 3MQ9A 4M1VA 2XX9A 3RQTA 2GH9A 1SVXB 2QS1A 3T22A 3EQ1A 2B3FA 3K1PA 4R72A 1NNTA 3OOAA 4P0GA 1D4NA 5AA1A 2XXVA 4OTEA 4GOTA 1MPBA 1ATGA 3U93A 5DEXB 2H25A 1IXCA 3IK6B 1PB7A 4YKKA 2V84A 3FXUA 3S9MC 2AIXA 4OENA 2RINA 2VP1A 1FTJA 2UYEA 3MVZA 4O3AA 1I6QA 1MQDA 4RJZA 1FTOA 3C32A 3Q28A 4C1UA 3IJOB 3LSWA 1UTBA 1B5JA 4ESXA 1LBCA 3FZVA 2CMOA 3EN3A 3G3HA 2E1SA 3K6UA 5DEXA 4EF2A 3KJ7A 2H99A 4OFLA 3IR1A 3KN8A 1B3EA 3VLWA 4TOZA 5DTBA 3H03A 3M3LA 4ZE9A 1M5CA 2F7AA 3UORA 2HZKA 3QUJA 1YAEA 1JW5A 4F2QA 4XKPA 1XT8A 5JTYB 2HFBA 2PVUA 4I62A 2P1SA 3RT6B 3MBPA 1BLFA 1II5A 1XVXA 2REJA 3MP8A 1B32A 5H8NB 2I58A 3RN8A 4H67A 5CC2A 4ZZEA 1CB6A 2B3BA 2RC7A 1MH4A 3G3IA 3O6GA 2HAUA 2ZXTA 3PUZE 3HN0A 4U23A 3GXAA 3SEYA 4LZ5A 3H4ZA 5H8NA 1Y20A 1EZPA 3K02A 1P1OA 1JVYA 1R1NA 3FUZA 1UTHA 2NVUB 1S7YA 1POTA 3VVFA 3HCQA 1B7HA 3KSJA 4MLQA 1A40A 3C9HA 1S9TA 1Y4TA 1MXYA 2DYXA 1WDNA 1GR2A 1MQGA 1Y1ZA 3PPOA 1VE4A 4HTGA 1ZMGA 4G8NA 3G3JA 2ZYMA 4N13A 3S9NC 3C33A 2F34A 4NF6A 5TPAB 3TKDA 1LB9A 3W9WA 1ZTYA 2DVCA 1FQFA 2ABHA 3LBSA 2XHDA 3K6XA 2OJTA 2E0SA 5KCJB 3H6UA 3O97A 3O2AA 4OFOA 1EZOA 3JYRA 1SW1A 4YB6A 3SEVA 1OLAA 4UA8A 1MXXA 1BP5A 3R26A 4XKRA 4ND9A 2DE4A 3B6QA 4DXCA 5BUUA 1LAHE 4F18A 3KFMA 1LFHA 1JQFA 2RCAA 3PD9A 1TFDA 2Y7PA 1Y3QA 4U1OA 2OZZA 3T9VA 1A99A 1R6ZA 4ISUA 5I58A 1SDXA 4ZE8A 1MM6A 4JSDA 3QK6A 4HCWA 4DLDA 4ZEDA 2F36A 3ECRA 2V93A 3VXBA 3UGWA 4NWDA 3E3KA 2ALUA 4EQBA 3C4MA 3DP6A 1SI1A 4IB2A 3LR1A 2F35A 2R6GE 2REGA 1MM7A 2A5TB 2DE2A 4U2RA 1JNFA 1RYXA 3SESA 3EHUA 1B0HA 1USYE 2Y7IA 2X7QA 4H6DA 3RY3A 1DPPA 4PETA 1FCKA 2V3UA 5M2VA 3ZS6A 1POY1 2GHBA 2XXQA 3H6TA 3M3FA 2XXPA 1LFIA 4F29A 2GHAA 3T9XB 3TMGA 1B52A 1P1WA 1LBBA 2XXYA 1MXWA 4Z0IA 3ILUB 4I8CA 1AOVA 4GQOA 3TTKA 3IB1A 4QSDA 3CI8A 2I6EA 5AE4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2H9BA 1PEBA 4G8MA 5IAIA 1SQYA 5I84A 1N7XA 1LAXA 4H5FA 3UIFA 3U72A 4NAPA 2VD3A 1MY4A 2H98A 5I2NB 3DELB 2GFEA 2DXYA 4FEBA 1J1NA 4LP2B 2O69A 4FIMA 5AA2A 1D9VA 1LGBC 2X7PA 3T0JA 4X9TA 1JEUA 1H44A 3CFZA 4RY1A 1QUKA 2DWHA 4THIA 4JVDA 5FTIA 1US4A 1P1QA 4BLAA 1YCJA 3I3VA 3PUWE 4PF6A 3K1MA 1IQ7A 4G4PA 5ICQA 4U1ZA 4N8GA 2F97A 4G68C 2B4LA 2OLBA 4FECA 3LC8A 5IM2A 2V3QA 5I2NA 4X48A 2HZLA 1L5TA 3LSXA 5TU0A 4PC9A 3T93B 4GF8A 4BDMA 4ZDMA 5FHMA 3UN6A 4N8YA 3EPEA 4GWZA 3T66A 4XXUA 2F6PA 3IOUA 3OENA 4PAKA 4FORA 4JWOA 1MY1A 4R6KA 1RDZA 3FJMA 1D9QA 4OVJA 1NL5A 4FAJA 1MXZA 3QYTA 3IJXB 2M8CA 1NNKA 3TAJA 4XKNA 1UIUA 1O63A 2IA4A 4XFEA 1QUIA 4LZ8A 1MXUA 4PFTA 4PFWA 1RKMA 2FNCA 5DT6A 4ONYA 1ZKBA 4WXJA 4XTCQ 4OVPA 2NWJA 3SERA 4KPTA 2PYYA 1B58A 3PPRA 3LSFB 4E0XA 2O6AA 1EZ9A 3P7IA 1MDP1 5ISUA 1FBHA 3M8UA 3OD7A 3N26A 4JWYA 4KI0E 1A54A 4H8IA 2XX7A 1UTBB 3TQLA 3OO6A 3RNNA 1YYZA 4HW8A 3KN3A 1TXFA 4DE8A 5TP9A 4LA9A 4NF8B 3MW0A 4AB6A 2QPQA 1NNPA 4ZZAA 2IEEA 1OLCA 2Z23A 3K0VA 4ZS9A 2PT2A 1CE2A 1AMFA 1NV3A 1ANFA 4QBAA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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