5AA1A

Crystal structure of mltf from pseudomonas aeruginosa in complex with nag-anhnam-pentapeptide
Total Genus 137
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
137
sequence length
418
structure length
418
Chain Sequence
EGVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFTQHLQQRLPRYESHFKQSGKQKDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Activation by Allostery in Cell-Wall Remodeling by a Modular Membrane-Bound Lytic Transglycosylase from Pseudomonas aeruginosa.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule tags Lyase
molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE F
total genus 137
structure length 418
sequence length 418
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2015-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa1A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa1A02
2Q8JA 2IEEA 3OXNA 1FQBA 3GXAA 2DE4A 3S9MC 2I4BA 3IOWA 1ZTYA 3EN3A 3OEKA 4PE5B 5I2KB 3VXCA 4EUOA 1N84A 1QUKA 1A99A 3IOTA 4QFLA 1WDNA 1PB8A 1Y4TA 3KFMA 3LBSA 1JETA 3PMWA 1FTOA 4EQ7A 2GH9A 3K0VA 5L9MA 5I59B 2ZYOA 5H8QB 1HSLA 1DSNA 1XHYA 2GRVA 3IAZA 5ITPA 3C4MA 3VVEA 3BFUA 4XKNA 3K6UA 4NWCA 3M3KA 4R75A 4X48A 2OBGA 1B7HA 2Q2CA 1R9LA 3R6UA 3PUZE 1JVYA 1R1NA 3KGCA 2O6AA 3Q28A 4G68B 3K6XA 3OD7A 5TP9B 3UK4A 3ZSFA 1BKAA 1NL5A 1ANFA 3BKIB 1USYE 3CSBA 4NTLA 3EQ1A 4G2ZA 4R6KA 1MXVA 1OMPA 1LGBC 2I0CA 4YKKA 4PP0A 1SW1A 3RGYA 3SERA 5HPQA 5ISUA 2ZYNA 1S7YA 4BDLA 4KYDA 4XTCQ 5I2NA 4U4XA 3CFZA 2DE3A 1QJMA 1O7TA 1BTJA 4FIMA 5A5XB 3IL1B 1A55A 2B3FA 1H3DA 1PBQA 1Y20A 2HEUA 2DYXA 4YU0A 3ZKKA 3U93A 3ECRA 4G4PA 5FHNA 3G3JA 1LB8A 3T66A 4F1UA 3T22A 3D4CA 1TFDA 2E0SA 4GF8A 3W15C 2Y84A 3VDFA 3Q29A 3LC8A 3IB1A 5AA1A 4POWA 1B3EA 1WODA 2B3BA 1LCTA 3O6HA 5I2NB 1FTLA 4IO7A 3U94A 4G68C 3FIRA 4EQBA 1OVBA 5B7DA 1ZKBA 2DWIA 2ONSA 2QSXA 2A5TB 3VLUA 1MPBA 3LSWA 3ODBA 4F1YA 3KBRA 2OZZA 2F6PA 1M5FA 1O63A 3FXQA 3MVZA 1B3HA 3VXBA 5EYFA 4PFWA 5I2KA 3TTMA 3TQLA 2V93A 3IO4A 5CM6A 3SESA 3FJ7A 1M5DA 4I9DA 1B1XA 4PFYA 2RC9A 2VD2A 1YPNA 4P11A 2UVHA 3O6GA 4ZEBA 1YTVA 3Q26A 3SEVA 3OO8A 5I56B 2F6GA 3QUFA 5H8SA 4C0RA 4RYAA 5H8FA 1N7XA 1DMBA 4LQ2A 1Y4CA 1F9BA 1URGA 5JK4A 1P99A 1NNPA 1UIVA 2YPNA 4Q0CA 4WEPA 1LAGE 5ICTA 3IOVA 1N3XA 1M5EA 4H5GA 5H8HA 3M3LA 5KZTA 1EZOA 3I6VA 1I6AA 2QMXA 3QSLA 3K00A 4N13A 5AA3A 4RA1A 3BBRA 3U1OA 3D4GA 5IKBA 2OJTA 3IK6B 2HFBA 5TU0A 4U21A 5I58B 4NF4B 3K02A 2H25A 1LFGA 1XOCA 2VHAA 3DELB 4F31B 3UIFA 4ZDMA 4NF6A 2XXTA 3FVKA 3VV5A 4LP2B 1A54A 2V3TA 3FASA 4U1ZA 3MPLA 1PC3A 5H8QA 1B5HA 1GVCA 2NWJA 3RT6B 3N94A 3QYTA 4ZS9A 1EH3A 3MWBA 3O28A 4YKPA 2XX8A 3TFLA 3DP8A 3TCGA 5AA2B 5IAIA 1AL3A 5AA4A 2F34A 2DE2A 2XXXA 1I6QA 1POY1 3USDA 2AL5A 3FVGA 3DM0A 3EPEA 5DTBA 1MQHA 3HCQA 4YZZA 4N07A 3PGFA 3V83A 4NF5B 2AL4A 4NF8A 5CMCA 5I57A 4UA8A 4N6PA 2AYSA 1A40A 5ELVA 4ZZEA 3U8QA 1JQFA 1H45A 4ESWA 2DXRA 5CMBA 1P1OA 4ZEIA 4OWDA 3PPNA 4QSCA 5M2VA 3FATA 1OQGA 4OFLA 4RJZA 1DPPA 5HM4B 3G3HA 1S9TA 5KCJA 2X7PA 3QUJA 3FVOA 3RQTA 2E1SA 3RY3A 3GBAA 3JV9A 3O66A 4R6HA 3THIA 3UA8A 3HO7A 1FTMA 2O68A 4IGTA 5JTYB 2PT2A 3ZS6A 4QF9A 3VFJA 1NMUA 1OLCA 4GIZA 4H8IA 3VVDA 2NUVA 4I8CA 4QFOA 4GL0A 1VSOA 2PBWA 2QMWA 3E3KA 3MZBA 1UTHA 2XXRA 3OO6A 4MBPA 4QRZA 1P1NA 3H06B 4Z0IA 4BDMA 5BUUA 2D5WA 1WVJA 1Y1ZA 1JW5A 3FXRA 4ZEDA 3WAFA 4F1VA 3U72A 3OELA 1CB6A 2VP1A 3S4UA 4OEUA 1HSEA 1SYIA 2O7IA 4PETA 1LSTA 3MW0A 4LZ8A 4YB7A 5EHMA 5H8NA 4HCWA 4GXAA 4F3GA 3UORA 1MXWA 3AXFA 2DVCA 3W9VA 1R9QA 1QKAA 1TXFA 2HZLA 3MPKA 4U22A 1GV8A 4FATA 4EDPA 3S9NC 4KD5A 4IB2A 2O51A 4F39A 3G3GA 3O29A 3EHUA 2DWAA 1XS5A 1Y3NA 3CG1A 4NMYA 3T9HB 3KN7A 3L6HA 1PDAA 4WKMA 3ZKLA 1N7WA 1B2HA 2FA7A 4LZ7A 3F11A 4KCCA 3RN8A 2V3QA 2ESNA 3MQ9A 2H4IA 3TPAA 3CFLA 4X9TA 5DYHA 3IX1A 3B7DA 3VVFA 2I3WA 3K1MA 4GFRA 4JSOA 3MUQA 1AOVA 1NH7A 5AA4B 1FTJA 4MH5A 3BFTA 5CC2A 4RK9A 4OHNA 1URSA 1B52A 3OO7A 2I58A 4R9GA 3UP9A 3I3VA 4NEDA 3K1PA 1MH3A 5I84A 1ZJLA 3C32A 3PV0E 2XXIA 3K01A 5I57B 1SD3A 1NH8A 4MFIA 5K2YA 2DWJA 2ONKE 4Z7EA 5ICQA 4G8MA 5I58A 3TEPA 3CVGA 1N3WA 4I1DA 4I62A 4WEDA 3ILTB 1XVYA 3TAJA 1LFHA 1B1HA 5CRYA 2RCAA 1Y9UA 2O1MA 1QKBA 3A3CA 1B6HA 3QXMA 2X7QA 1SDXA 3KZGA 4KCDA 2UVJA 1MQJA 1JEVA 3CI8A 3R26A 1ZU0A 1B32A 3LR1A 1JEUA 3HV1A 3PPPA 1UTHB 3TYHA 4QFKA 2Y7IA 3RNNA 2XX7A 3SETA 1B7UA 3MJNA 5B70A 2DXYA 1AMFA 3Q25A 2OWSA 4TLMB 4F3BA 5DVIA 1MPDA 1IXGA 4NF8B 3VLVA 4ECFA 2UVIA 1B40A 5JTYA 2XD3A 4NF4A 1JNFA 4YB5A 4R9FA 3FJGA 1UQWA 1JW1A 4GD5A 3SDFA 1IXIA 1JVXA 1SQYA 3KSXA 2XXPA 1FQDA 2VOZA 4HTGA 1MH4A 5CMKA 1BIYA 3FXUA 1EZ9A 1Y3PA 1OVTA 4HW8A 4YB6A 4THIA 1O64A 2XX9A 3T96B 2RCBA 2Z22A 5F7VA 2A5TA 1M5BA 1D9VA 1QULA 2RINA 1P1UA 3KSJA 3LSLA 4FEBA 1PB7A 3IOUA 2LAOA 4YICA 3EHTA 3T9VA 3HSTA 1FCKA 4L17A 3MZ1A 3PUYE 3OOAA 2I0BA 3MP1A 4IO3A 4MF3A 1IIWA 4NF5A 2D3IA 2FYIA 3H03A 2X26A 1FQFA 2XXWA 3QK6A 2W7YA 5KDTB 1B58A 1EU8A 4XKQA 1US5A 4FECA 3FV1A 4RNSA 1QUJA 3TQWA 1M5CA 1UIUA 2Q9TA 4BDOA 1LAFE 4Q30B 4X1DA 3GLBA 5A5XA 3FZVA 4DXCA 4POXA 2Z8DA 1VFEA 2G29A 1HSJA 2XXHA 3EF7A 4R73A 4U23A 3GBBA 3RPWA 3H6WA 5AA2A 3C35A 3G3IA 3KOTA 1SI0A 4QFNA 4DZ1A 3S9LC 5H8FB 4DCXA 2GHAA 1NNKA 3CR9A 2I49A 1SBPA 3IB2A 1B0LA 1N0TA 2F97A 2Q89A 3A3UA 3ONMA 4NWDA 1IUDA 1IEJA 2P0SA 1RKMA 3O6IA 4G68A 1LB9A 3KN3A 4NE4A 3IJOB 4ZEFA 5TP9A 3HPIA 3TDJA 4ZECA 1VR5A 1B3LA 1DTZA 3TUSA 1A8EA 4O3CA 4QFPA 4H0WA 4Q8RA 2RC7A 4OFJA 4XKRA 5AA2D 3H3GA 1TFAA 3E13X 4BDQA 4F3PA 3V5AA 4JBZA 1SW4A 4RY1A 4FAJA 2HQ0A 4YMAA 4LQ5A 3MVXA 1MRPA 3ILUB 3LSFB 3CIJA 4OMBA 4EXKA 2I48A 3TTLA 1RYOA 3Q27A 4PFUA 5FHMA 1MY3A 3N26A 4AQ4A 2D21A 2ZYMA 3MP6A 4KPTA 1D9YA 3K1NA 2UVGA 1Q1KA 3MAMA 1MQDA 4JWYA 2OCUA 1A7LA 1D3KA 3FV2A 4ISUA 4RPOA 4R2FA 4TQUQ 1MY4A 1PEBA 2HXWA 5ITOA 1NNFA 1US4A 3T93B 2V84A 4KYSA 4OETA 3TTKA 4ONYA 3B6WA 4AB6A 2ZNTA 4JB7A 2XXQA 2F36A 3DP4A 3HHGA 5FTIA 2OWTA 3TCHA 4YMBA 5I59A 1MG1A 4HCYA 2IA4A 2YLNA 1H43A 2DSFA 3TKDA 4DXUA 3IO6A 1GGGA 2REJA 4DDDA 1LCFA 2ANJA 4MLQA 1J1NA 1VE4A 3GZGA 1I6BA 1SYHA 4GQOA 4GVOA 3MC2A 3C9HA 1P1QA 2BJJX 3C33A 1B46A 2XHDA 3TCFA 1TT1A 2NXOA 2R6GE 2R9JA 3MVYA 1SVXB 3LSXA 3P7IA 1YCJA 3PD9A 3K6WA 1S50A 1PBPA 1Z7NE 2O69A 4OQOA 4Q5TA 5HBCA 4EF1A 3PU5A 3M8UA 4IY6A 3W9WA 1MY0A 2F35A 2QPQA 2B65A 3UGWA 2ZYKA 4AB5A 2DS9A 1ZIUA 1IQ7A 2QRYA 3KG2A 4DE8A 1ELJA 2PMSA 3TODA 3KOSA 3OSRA 3TTNA 3G3KA 4GWOA 4OERA 2ZNUA 1MQIA 4YAHX 1EZPA 4ESXA 1LBCA 4JDFA 1D4NA 2YJPA 2Y7PA 1XVXA 3RUMA 4DLDA 3RTFB 5KDTA 4ELRA 1B4ZA 1QUIA 2XD2A 1LAXA 3VE1B 4EF2A 1FQEA 4F2OA 1GR2A 4LUBA 3H6UA 5LOMA 2F5XA 2F8DA 5BWJA 4FE8A 4KFQA 4TLLB 5CMMA 5DEXA 2CMOA 2O1LA 3H6VA 4IO4A 4QSDA 4R74A 2H98A 4R2BA 2NOOA 2REGA 1KWHA 3K2DA 4RXLA 5FHOA 4C1UA 1N04A 2RF1A 4R72A 3CG3A 4YKIA 4F29A 2DVZA 3OMBA 2QS2A 2Y7KA 1DTGA 3TTRA 3JYRA 4XIGQ 4IO2A 4ZZAA 3OENA 4KQPA 3R7XA 4F19A 1B7ZA 4H6DA 4RK2A 1B51A 4LATA 2VD3A 3O97A 1LBBA 2GFEA 1N76A 4FORA 4R6YA 1CE2A 4BDNA 1T0KA 2P2AA 1QVSA 4KYEA 2H99A 4LZ5A 1NFTA 3SEXA 2NVUB 4QHQA 3RLFE 1UTBA 3PUWE 3IORA 4DIGA 3G7WA 1LLSA 1ZMGA 1VFDA 2QS3A 1IZ1A 4OENA 5J1DA 3S2VA 5CBSA 2V3UA 3FUZA 4O3BA 3K4UA 3QIMA 1POTA 1IXCA 4H8JA 3WAEA 3S9EA 1B5JA 2RC8A 2UXAA 4P0IA 4X1BA 5JEIA 3LUYA 3OO9A 1AH5A 2XXUA 1B3FA 3PD8A 4O3AA 1FTKA 4KR5A 4U4SA 1H76A 3N6UA 3OEMA 3H6TA 3N5LA 1B0HA 1XT8A 1YAEA 3C36A 4JWXA 4ND9A 2DP8A 1JW4A 4OEVA 1FW0A 4H67A 2H9BA 3MP8A 1NNTA 3C34A 4BDRA 2PX1A 2F7AA 4OZ9A 4H1XA 4G8HA 1URDA 4F18A 2HAUA 1Z7ME 3FD3A 3T9XB 1R6ZA 3KEIA 3SEWA 1H44A 4ELOA 2ZNSA 3I5OA 3UN6A 3JZJA 3B6QA 3CFXA 5DT6A 5CBRA 3K6VA 2OK2A 2UYFA 3MZ9A 4IY5A 2F7CA 1IXHA 1DPEA 1DOTA 1OLAA 2DWHA 3PUVE 3QAXA 5DVJA 3TZAA 4F22A 2Z8FA 2I4CA 5CI5A 3HHFA 1ZLQA 1MXYA 1SW5A 3PPOA 1MDQA 2ONRA 4MLVA 3HN0A 3FGSA 1MY1A 2R71A 5KCJB 4C1TA 1PB9A 2CZLA 3H4ZA 3O2AA 3A09A 1BP5A 3CRBA 3SEUA 2HAVA 2HZKA 4QSEA 1B9JA 2A5SA 4IO5A 3T9UA 2KLFA 4XXUA 1MS7A 1MPCA 2Y7WA 3O9PA 1QW0A 3DLNA 3IJXB 2F7BA 1OIBA 4U1OA 4DXBA 3FVNA 1NKXA 4P0GA 1UTBB 1LAHE 1MM6A 2RKMA 3PMXA 3OSQA 1SW2A 2PVUA 3KN8A 1B3GA 2DOJA 2Q2AA 1P1WA 4OESA 1I69A 4YKJA 2FNCA 2I6EA 5DVFA 5FTHA 4HS7A 2G93A 4FJPA 4IGRA 1ZBMA 4LONB 4M4GA 3IR1A 5TPAB 1OQHA 2QS1A 1L5TA 5TPAA 3RT8A 2XXYA 2OLBA 4PFTA 4ELPA 1MXXA 4K3FA 3H7MA 4OFOA 4H65A 5L9SA 4DCYA 5K2XA 3PPQA 2THIA 4LA9A 2VGQA 4E0WA 4F3SA 1MM7A 1TWYA 4ZE9A 5H8NB 2ABHA 3TMGA 4EQ9A 1RYXA 2O84X 1MY2A 3B6TA 1LFIA 2P1SA 3FJMA 4G77A 4UACA 2M8CA 2QJEA 2XXVA 5DEXB 1B05A 4ELQA 1AIVA 4KHZE 1MQGA 2Q88A 2V25A 3VLWA 2ZMBA 3C31A 1Q35A 5AE4A 1MDP1 4JWOA 4WXJA 2Z8EA 4FEDA 3MVWA 4TOZA 5F1QA 5H8HB 3U92A 3V8XB 3EHSA 4JXIA 3KJTA 5L8DA 4OXVA 4BLAA 4G8NA 4U2RA 5L9OA 2ZXTA 2GHBA 2H5YA 1USYH 1MXZA 2QL3A 2QS4A 2I3VA 3IB0A 1II5A 4OVJA 4GXSB 4ZEKA 2AIXA 3N6TA 3PPRA 4KI0E 3E4RA 1FQCA 4GLIA 2O7UA 2F78A 3KJ7A 4JSDA 2UYEA 3PMVA 3RTWB 1SI1A 3SKPA 2PT1A 4F2QA 2Y7RA 2WKYA 2DQVA 3L6GA 4GL8A 4M1VA 4OYVA 3DP6A 1A8FA 1BLFA 3G3FA 1FQAA 4XKPA 3CSGA 1MXUA 2ALUA 3V89B 4IO6A 4EXLA 4GRKA 1Y1MA 1ATGA 4E0XA 2PYYA 1IITA 3TELA 3M3FA 1Y3QA 1GTKA 2Z23A 1XC1A 4OTEA 5I56A 2HCAA 1B4HA 4H5FA 4GOTA 3PUXE 4LVQA 3E9XA 4RPNA 3SEYA 4NF6B 1B5IA 3MBPA 4ZE8A 5EHSA 4PQJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1FQBA 2I4BA 4PE5B 4EUOA 3IOTA 3LUZA 4QFLA 1WDNA 1PB8A 5EQ9A 1XHYA 2GRVA 4MIJA 3K6UA 3M3KA 2Q2CA 1FBHA 1JVYA 3KGCA 4X8RA 5EYHA 1ANFA 3BKIB 2I0CA 3RGYA 1SW1A 5ISUA 1S7YA 4KYDA 2DE3A 1QJMA 1O7TA 2HEUA 4GWWA 4DI4B 1Y20A 1FPFA 2ZZWA 1LB8A 4GF8A 2E0SA 2Y84A 3Q29A 4POWA 5I2NB 3U94A 5B7DA 2DWIA 2QSXA 2A5TB 3FXQA 3VXBA 5EYFA 3SESA 4GWZA 4OVRA 1M5DA 1FBPA 2UVHA 3ROJA 2F3BA 3OO8A 2F6GA 3QUFA 4C0RA 1Y4CA 1NNPA 5ICTA 4H5GA 1N3XA 3M3LA 4N8GA 1I6AA 3K00A 4N13A 3D4GA 2HFBA 4NF4B 2F3DA 4F31B 1FPLA 4NF6A 1A54A 4U1ZA 3FASA 2NWJA 3TFLA 3TCGA 3FVGA 4P1EA 1LBZA 3PTYA 2DXRA 3PPNA 4G61A 4XEQA 1OQGA 4MHFA 3G3HA 5KCJA 2X7PA 3QUJA 2PT2A 1LBXA 4GIZA 4QFOA 4GL0A 1VSOA 2QMWA 4NEDA 1UTHA 2XXRA 4BDMA 4Z0IA 2D5WA 1Y1ZA 3FXRA 4N8YA 1LSTA 2VT5A 1R9QA 1QKAA 4IR8A 4FATA 1K9YA 4I3EA 3EHUA 1Y3NA 3CG1A 3F11A 3CFLA 4X9TA 3IX1A 2XWKA 4MH5A 5CC2A 1URSA 1B52A 3UP9A 1LEVA 3PV0E 1SD3A 1FPBA 4I62A 5IGAA 3ILTB 1LFHA 2RCAA 4HE0A 3CI8A 3TYHA 3RNNA 1AMFA 1MPDA 1IXGA 4NF8B 5JTYA 1DK4A 4NF4A 2WEFA 1NUYA 1JVXA 4HTGA 2VOZA 1BIYA 1EZ9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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