4IGTA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j) in complex with the agonist za302 at 1.24a resolution
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
263
structure length
263
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Chemoenzymatic synthesis of new 2,4-syn-functionalized (S)-glutamate analogues and structure-activity relationship studies at ionotropic glutamate receptors and excitatory amino acid transporters.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 85
structure length 263
sequence length 263
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4igtA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4igtA02
3G3JA 3A3CA 5AA1A 3GXAA 4H67A 3EN3A 1EH3A 2DP8A 2DWHA 1B7UA 3MW0A 3O29A 2AL5A 4OTEA 2F7BA 4YB6A 3VVDA 3SERA 2PT2A 4TOZA 2ZNTA 4BDOA 4OFOA 4U1OA 4YICA 2Z22A 4TLLB 2DXYA 3OMBA 1EZPA 4NMYA 3W15C 1LAFE 5ITPA 4OQOA 4H0WA 5I57A 3EPEA 2D3IA 1DTGA 1IZ1A 1A7LA 2VOZA 4JWXA 1PDAA 3T66A 4NF4B 3MP6A 4OEVA 1UQWA 3KG2A 3V89B 1GTKA 3DM0A 1US4A 3HCQA 1AL3A 3VE1B 4UA8A 4Z0IA 4AB6A 2DOJA 2V3TA 2ZNUA 1HSJA 1SI1A 4LZ5A 4KR5A 4GL8A 1B7HA 1I6AA 3LSFB 5IKBA 3VVEA 3UORA 4PFUA 1B6HA 2RCAA 3B6TA 2ZXTA 1R9QA 5ICTA 3OEKA 4QRZA 3N5LA 1H44A 1IXGA 2FA7A 2M8CA 5L9MA 4ELQA 4F19A 1VFDA 3KFMA 3V8XB 2GFEA 3ZS6A 1N7WA 3CR9A 2HAUA 3C4MA 2PT1A 4LQ5A 3VLVA 4NF6A 4F1VA 1B3GA 3ODBA 3MVYA 3R6UA 3KOTA 3IR1A 2I3WA 4O3AA 3KN7A 5ITOA 3OSRA 4F22A 3O97A 1D9VA 3LUYA 3VLUA 1URDA 2F6GA 4GIZA 5JK4A 5EYFA 3HHGA 4JWOA 2ABHA 2OZZA 3HPIA 4R2BA 4EF2A 4R6KA 4YKPA 4I62A 1SBPA 1Y4CA 3OO6A 2ALUA 1B1HA 3IJXB 2XXQA 5L9OA 2O6AA 1ANFA 3DLNA 3ECRA 2R6GE 3SKPA 3MZBA 4RPOA 3SEUA 1MY0A 5JTYA 1B52A 3KN3A 2RC8A 4OXVA 2H99A 1N76A 1GVCA 4RYAA 1TFDA 1MXUA 3BFTA 1SVXB 5CMBA 2XHDA 4EQ9A 3IOVA 2XD2A 2F97A 3PPRA 3W9WA 1LGBC 1NFTA 1UTBA 1RKMA 5DVJA 5HM4B 2XXYA 2HXWA 1S9TA 3Q28A 3IO4A 3K6XA 4BDRA 3PUWE 2HFBA 3IX1A 3FUZA 4IY5A 1DTZA 4LUBA 3UGWA 3H4ZA 4NF5B 1ZU0A 1UTBB 4OHNA 1UIUA 4BDMA 1O64A 3T93B 4YMAA 3PUZE 3E4RA 1P1WA 4RA1A 4RY1A 4HS7A 1B5HA 1JEVA 1JVYA 3HSTA 3MUQA 3UA8A 5FTHA 3D4CA 3ZKKA 1M5FA 3C33A 2RCBA 4MF3A 3Q27A 4N6PA 4H6DA 2V93A 1Y1MA 3TDJA 4OZ9A 2DWJA 4YU0A 5H8FA 4ZEDA 1PBPA 4YKIA 4U1ZA 2BJJX 3N94A 1LCFA 3G3IA 1Y3NA 1HSEA 4JXIA 4I9DA 2W7YA 5CM6A 1B5IA 1B58A 4FECA 1B51A 1FQEA 5H8FB 3RPWA 2R71A 1DOTA 3BBRA 3VXBA 3PD9A 2VGQA 2LAOA 4ONYA 2QSXA 5CC2A 1TWYA 2REGA 4P0GA 2NWJA 3KSJA 1JETA 4KCCA 4PP0A 4DE8A 3FJ7A 3FVKA 4PE5B 3FVNA 4XKQA 1QUJA 3RTWB 5H8QB 4IO3A 4EXLA 4IO5A 3C9HA 4E0WA 1FTJA 3JZJA 4Q8RA 1LFHA 2XXIA 4LQ2A 3VFJA 3KOSA 2DVCA 3PPPA 3GLBA 4F1UA 3OOAA 3RN8A 4ZEFA 2YJPA 2DYXA 1DSNA 2H5YA 5I56A 3TKDA 3VVFA 3K1NA 3HV1A 4Q30B 1EZOA 4E0XA 1MQGA 3K6WA 5B7DA 2XX9A 1BP5A 2E0SA 4WEPA 3GBBA 4DXUA 2F5XA 3T9HB 2XXUA 3FVGA 2Q89A 5I56B 4QSCA 3K1MA 5TU0A 5I2NA 2V25A 1N04A 1NNFA 2UYFA 4F1YA 1B5JA 1USYH 3K0VA 4THIA 1H43A 3CRBA 5FHOA 3IB1A 2G29A 3QSLA 1UTHA 3IO6A 3TTLA 4XIGQ 1N0TA 3G7WA 4JSDA 1O63A 4POXA 4AQ4A 2O7IA 3QIMA 5K2XA 4H65A 1A99A 5DTBA 3MPLA 5L9SA 5I2NB 4FE8A 4R9FA 1VE4A 1M5CA 2I3VA 1WVJA 1XVXA 1IQ7A 1AMFA 4P11A 4RXLA 1BKAA 4GQOA 3ILUB 1GGGA 4H8JA 3ZKLA 1B2HA 4IB2A 2B3BA 3BKIB 3S4UA 1Z7ME 5A5XA 4FEBA 3KSXA 2QS3A 3DP8A 3RT6B 3PPQA 5KDTA 2OBGA 4R75A 2ZYMA 3S9LC 1MY2A 3Q25A 1MM6A 4F3BA 4ELPA 2NUVA 3IORA 4P0IA 3H6UA 5A5XB 4GOTA 3U72A 1D3KA 1URSA 1EU8A 3MQ9A 1Y4TA 3O2AA 5KDTB 4DIGA 4G8MA 4IO6A 1MQIA 2HZLA 2OK2A 5CMKA 1A54A 1MM7A 1UIVA 4NF4A 1XHYA 2Z8DA 1SW1A 2DWIA 1FQFA 1L5TA 3HN0A 3H3GA 2Z23A 4Q5TA 1MY3A 3QXMA 1A8EA 4DCXA 3KEIA 1MXWA 3FV1A 5DVFA 1US5A 4G8NA 4XXUA 3ZSFA 1B9JA 3G3KA 2QRYA 3TFLA 1MXZA 2O51A 4EF1A 1OIBA 4TQUQ 2H25A 5J1DA 3SEVA 1MY1A 2V84A 4IO7A 3TEPA 1P1OA 4NEDA 2B3FA 4LVQA 3N6UA 3U93A 3QYTA 1NNTA 4WEDA 2GHAA 1BTJA 1ZIUA 4IGRA 1ZMGA 4FORA 4OYVA 1Q35A 3MWBA 1B4ZA 1FTOA 3CI8A 2F35A 2QS2A 2GRVA 3PGFA 2Y7PA 2WKYA 4JSOA 2XXVA 4MLQA 1H3DA 5H8NA 5CBSA 3L6GA 2O1LA 1JW1A 1LLSA 3UIFA 3GBAA 4IO2A 4EQBA 1R1NA 3WAEA 1ZKBA 3OD7A 2F36A 4OFJA 5B70A 4QFPA 2DVZA 4GD5A 4G8HA 2OWTA 4ELOA 4U4SA 3LSLA 3G3FA 2A5TB 5H8NB 4YZZA 3CVGA 5CMCA 1JW4A 1FTMA 3F11A 3FV2A 2XX7A 1B0HA 4JWYA 2IA4A 1YCJA 3K1PA 3QAXA 1B3HA 5CBRA 4ZEBA 1O7TA 4ZZAA 1B40A 3K02A 3K6VA 3KN8A 2XXTA 2HCAA 5I84A 2H98A 1H45A 2F6PA 2UVIA 4ZEIA 3E3KA 2UVGA 5AA4A 1PC3A 1B4HA 5H8HB 1RYXA 3MJNA 2OJTA 1A55A 3FGSA 3LSWA 4U21A 4G77A 2F7CA 4R74A 3CFLA 1SI0A 2NVUB 3FIRA 1B32A 2XXRA 4OETA 1DPPA 4ZS9A 4Z7EA 2P0SA 5K2YA 5AA4B 4KHZE 2REJA 1HSLA 3KJ7A 2UYEA 4N13A 3JYRA 2P2AA 5IAIA 1H76A 1JEUA 3MVWA 4NF5A 3IOWA 4ECFA 5TPAB 3DP4A 4GLIA 1Y1ZA 4BDLA 3TCFA 1M5DA 4LATA 1OLAA 3PU5A 1MXVA 4XTCQ 4K3FA 5HPQA 1FQCA 3N6TA 4OESA 4QFOA 4QFNA 1AIVA 1D9YA 4H8IA 1FTKA 5ELVA 1XOCA 5F1QA 3LR1A 5BWJA 4XKNA 5EHSA 1XC1A 4ZDMA 2PBWA 4POWA 4O3BA 3CSGA 3O6IA 5H8SA 3MVXA 2PYYA 4U2RA 2AIXA 3I6VA 2VD3A 4O3CA 3TMGA 5KCJA 3I3VA 2QMXA 4MBPA 2VHAA 2PMSA 2I58A 3MAMA 1OVTA 2QMWA 3EQ1A 3RY3A 3Q29A 1LB8A 3IAZA 4Q0CA 3LSXA 5AA2D 1IIWA 2H4IA 4OFLA 4OVJA 4AB5A 4RK9A 5KCJB 5M2VA 2XXPA 4I8CA 3HHFA 3IB0A 3O66A 3KJTA 5I59A 1YPNA 1R9LA 2AL4A 2UVHA 3HO7A 2P1SA 3TELA 3T9VA 4LONB 4LZ8A 3H6WA 5H8QA 1QKBA 2RC9A 3KGCA 3SESA 1BLFA 1ATGA 4C1UA 5DEXB 1I6QA 1LSTA 3LBSA 4NF8B 5I59B 1OMPA 5CI5A 1B3LA 1SW4A 4EUOA 2I6EA 3CSBA 4R6YA 3S9EA 4XKPA 2Q88A 5HBCA 3R7XA 2DE4A 1OQGA 4LZ7A 4ELRA 4G68C 1FTLA 1B1XA 2ONKE 4FIMA 3IJOB 3C35A 5DVIA 4GL0A 4DXCA 2PX1A 3MPKA 4M4GA 1OLCA 4ZE9A 1LAGE 1SW5A 1B05A 5ICQA 1I6BA 2I48A 4FJPA 2OLBA 3CG1A 4RJZA 1Y20A 4QSDA 1AH5A 1Q1KA 2I49A 1XS5A 4DZ1A 4GFRA 3B6QA 3FJMA 3IL1B 4GXAA 3T22A 1IITA 1A8FA 3E9XA 3USDA 3S2VA 1GR2A 3O9PA 4KD5A 2XXWA 4OERA 1VR5A 1N7XA 2X7PA 4TLMB 3LC8A 1MQDA 5AA2A 2XXXA 1MDQA 3OSQA 3FD3A 3P7IA 3RUMA 4DXBA 1S50A 1FW0A 1TXFA 5EHMA 2XD3A 1MPDA 3SEWA 3DELB 4QHQA 3M3LA 4IGTA 4ND9A 3PD8A 1OVBA 5AA2B 1Y9UA 1WDNA 3IOUA 1MXYA 5AA3A 3TPAA 2Q8JA 3K01A 3K6UA 5TP9A 2CZLA 2ZNSA 1CE2A 3VXCA 4RNSA 4PETA 4KI0E 3OEMA 4H1XA 3T9XB 2DE2A 2RKMA 2HZKA 2DSFA 3FATA 1LAHE 3C32A 4HCYA 4YKKA 3ILTB 4IY6A 4C0RA 4R9GA 4PQJA 5TP9B 3H6VA 1B46A 2F8DA 3OO9A 1KWHA 3TZAA 3UN6A 3V5AA 3C36A 1S7YA 2QS4A 1SD3A 2QL3A 4X1DA 5KZTA 2G93A 4OEUA 3TQLA 2V3QA 3W9VA 3UP9A 4DCYA 3FJGA 1MH4A 1JVXA 2OCUA 2RINA 2O1MA 1LB9A 4OWDA 3RQTA 4F39A 3T9UA 3CIJA 5AE4A 4GWOA 1ZTYA 2ONSA 4F3PA 3FXRA 2YLNA 1MRPA 1CB6A 1I69A 1A40A 3IB2A 5BUUA 4YB5A 4OMBA 1FQBA 2R9JA 5DYHA 3TCHA 4NE4A 3V83A 1DMBA 1N3WA 4F3GA 2VD2A 2O7UA 1LFGA 3KZGA 3MZ1A 4RK2A 3K4UA 2HQ0A 1N3XA 1II5A 3TTKA 1TFAA 3OELA 2Q2AA 2RC7A 2I4BA 4HTGA 4GVOA 2Q9TA 1M5EA 4R72A 2PVUA 1PB8A 1QVSA 1QW0A 3UK4A 4F2OA 1LBBA 3OENA 3PV0E 2CMOA 1JNFA 3U8QA 2YPNA 3S9NC 2THIA 5I57B 2NXOA 2ONRA 5CRYA 4F29A 2V3UA 3VLWA 2A5TA 1MPBA 2DS9A 1SYHA 1SYIA 2B65A 3GZGA 3IOTA 5DT6A 4BDNA 2UVJA 3EHUA 3JV9A 4KYSA 1NL5A 2D21A 4PFWA 2DE3A 1FCKA 4LA9A 3TODA 3PMXA 3TTNA 3U1OA 4FATA 4KPTA 1ELJA 1FQDA 2ZMBA 1RYOA 2E1SA 2X7QA 4JDFA 1OQHA 2I0BA 1MS7A 4RPNA 4EDPA 1P99A 2FNCA 1PEBA 2A5SA 3PMWA 3SETA 1SW2A 1IEJA 1MXXA 2DQVA 3KBRA 1PB7A 5H8HA 4UACA 1P1UA 4L17A 4KYDA 3B6WA 1B0LA 1T0KA 4FEDA 4NF6B 4BDQA 5CMMA 2AYSA 3RTFB 2OWSA 3PUVE 4R6HA 1MDP1 4QSEA 1XT8A 3H06B 1Y3QA 3WAFA 5L8DA 3THIA 1MY4A 3PMVA 3PPNA 3RT8A 1YTVA 5FHNA 1N84A 4G2ZA 1PBQA 3MP8A 3MZ9A 3K00A 3TTMA 1POTA 5TPAA 3PUXE 3M3FA 1Y3PA 3ONMA 1M5BA 3H6TA 4EXKA 2KLFA 4YKJA 3SDFA 3MVZA 4KQPA 1URGA 2QJEA 2ZYNA 4M1VA 3QUJA 1LBCA 3OO8A 3I5OA 2O68A 4GF8A 3CFZA 2VP1A 4ESWA 4YAHX 3TTRA 3QK6A 2DWAA 1MQJA 1NNKA 5JTYB 1LCTA 1QULA 2Y7KA 4F2QA 4KYEA 2DXRA 4JB7A 1Z7NE 1MPCA 4WXJA 4NWDA 3O6HA 3D4GA 1VSOA 1P1NA 3TCGA 3Q26A 4H5FA 2Q2CA 3EHSA 5I58A 4R2FA 2Y7WA 1NH8A 1VFEA 4PFTA 3B7DA 2ZYOA 3M8UA 4PFYA 2D5WA 4DDDA 4OENA 1QJMA 1F9BA 4F31B 4ZZEA 5DEXA 2Z8EA 4GRKA 2I4CA 3DP6A 4NF8A 4MLVA 5I58B 3O6GA 1PB9A 4YB7A 3FVOA 3MC2A 3RGYA 3R26A 3T96B 1QKAA 3O28A 2I0CA 3IK6B 4ZECA 4H5GA 4QFLA 1QUIA 1MG1A 2RF1A 3FXUA 3VV5A 3MBPA 3QUFA 4BLAA 4ZE8A 3K2DA 4LP2B 2O69A 3VDFA 3OXNA 3C31A 2IEEA 2NOOA 1NKXA 4X9TA 1YAEA 1ZLQA 3L6HA 1MH3A 3G3HA 3N26A 3CG3A 5I2KA 1IXIA 1B3EA 4I1DA 3CFXA 1MQHA 2FYIA 2UXAA 3S9MC 4U22A 2F78A 4IO4A 4ISUA 1DPEA 3AXFA 4MFIA 1TT1A 4R73A 4U23A 1WODA 3TUSA 5I2KB 1B7ZA 4FAJA 4MH5A 4N07A 3H03A 1B3FA 3BFUA 3RNNA 3TAJA 3SEYA 2ANJA 1R6ZA 4HCWA 3A09A 4QFKA 3U92A 3H7MA 1ZBMA 4F3SA 4F18A 1ZJLA 2XX8A 4NTLA 5LOMA 3PUYE 1FQAA 3FASA 4GXSB 2X26A 1NH7A 4NWCA 2Y7IA 1AOVA 2F34A 2H9BA 1SDXA 3M3KA 4G4PA 5FTIA 2ZYKA 3SEXA 4DLDA 4EQ7A 3TYHA 1QUKA 3G3GA 1JQFA 4C1TA 1IXCA 1JW5A 5JEIA 1EZ9A 4KCDA 3FZVA 2QS1A 3FXQA 3PPOA 2XXHA 2Y84A 1LFIA 2QPQA 1J1NA 1P1QA 5ISUA 1USYE 4ZEKA 4JBZA 2GHBA 2HEUA 2Z8FA 4ESXA 3TQWA 1XVYA 4G68A 1IUDA 1LAXA 1SQYA 2GH9A 1UTHB 1IXHA 1D4NA 2O84X 1NMUA 4YMBA 2Y7RA 3C34A 4U4XA 4KFQA 4X48A 3E13X 4G68B 3MP1A 3RLFE 1BIYA 4WKMA 1POY1 1GV8A 2ESNA 3EHTA 3U94A 4XKRA 2HAVA 4HW8A 3EF7A 5F7VA 2F7AA 4QF9A 3A3UA 3OO7A 1NNPA 5FHMA 4X1BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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