4IGTA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j) in complex with the agonist za302 at 1.24a resolution
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
263
structure length
263
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Chemoenzymatic synthesis of new 2,4-syn-functionalized (S)-glutamate analogues and structure-activity relationship studies at ionotropic glutamate receptors and excitatory amino acid transporters.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 85
structure length 263
sequence length 263
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4igtA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4igtA02
2V84A 3PPPA 4OFLA 2V25A 1ZU0A 3H03A 2DE2A 4LVQA 4OHNA 4ZE8A 3T9UA 1DPEA 1B9JA 2XXHA 2HCAA 1H76A 2AL5A 3MC2A 5BUUA 1DSNA 3OSQA 3FIRA 3H3GA 3MUQA 1NNFA 1A55A 1UIVA 3OO9A 4NF6B 2ZMBA 2G29A 4XIGQ 3U93A 1IIWA 5HM4B 1EU8A 1PBQA 3PUYE 5FHMA 3HV1A 3MQ9A 5K2YA 3SETA 1YPNA 3EQ1A 4KCCA 1FTKA 2GH9A 2O1MA 4F22A 1FQBA 3K2DA 4DCXA 1LSTA 2H25A 4G4PA 3TTNA 1MQHA 2FA7A 4R75A 3VLWA 4GL8A 3MZ9A 4LQ5A 2AL4A 1US4A 3ONMA 3PD9A 4QFKA 1FTMA 1ATGA 1D9YA 1MDP1 2XXVA 3DP8A 3EHTA 2DVZA 1Y1MA 3K6UA 3LUYA 3N94A 1B51A 2ESNA 2OK2A 3KFMA 5F7VA 5AA2A 3LSFB 4OVJA 1QUJA 4GF8A 2YPNA 3TKDA 3AXFA 1B46A 2QSXA 4LA9A 2HZKA 1OMPA 2DXYA 2VD3A 3N26A 2Y84A 3PPQA 4KR5A 2WKYA 4N6PA 4YKJA 3A09A 3LBSA 4C1TA 5CBRA 4F39A 3TUSA 4U1OA 3VFJA 3B6TA 4GVOA 3TAJA 3KEIA 4BDQA 4YAHX 1UTBB 1LB8A 3IB1A 3OSRA 3FATA 2XD2A 4WKMA 3ILTB 4GLIA 5CI5A 1A8EA 1ELJA 1FQCA 3RTFB 3QAXA 4Q0CA 1XT8A 4FJPA 2UVGA 1Y20A 4QRZA 3RLFE 1IUDA 3VV5A 1UTBA 1PDAA 4PQJA 1NMUA 2YLNA 3PUXE 2GFEA 1P1NA 1QJMA 4MF3A 4NF5A 3WAEA 4DXUA 3OXNA 3L6HA 1MPCA 3I5OA 4E0XA 1YAEA 1AL3A 5I59B 2Y7RA 2Q89A 3DLNA 3ILUB 1GVCA 3T96B 1N7XA 1QW0A 3K6XA 1B3HA 2F6PA 3TYHA 1MQIA 1B5IA 1H43A 1NNKA 3OMBA 4LP2B 4EQ9A 4ZE9A 4F3BA 5FHOA 4PFTA 3UORA 3PPOA 3IJXB 1QKBA 4TQUQ 4JSOA 4UACA 1M5FA 1XC1A 5AA4A 5TU0A 3L6GA 1FQFA 4GIZA 3SEVA 1JW1A 2HXWA 3H6UA 1POY1 4OMBA 4G8MA 3S4UA 5I2KA 3LSWA 4LONB 2O51A 4OWDA 4RY1A 1MY2A 3N6UA 4G68A 2XXXA 3O6HA 3RUMA 3VLVA 5I57A 3OEMA 3RQTA 3K01A 2A5SA 4OEUA 5TP9A 3GBBA 3OOAA 2XXIA 4NWCA 2RINA 4QFPA 4KPTA 4EDPA 1B1HA 4NF8B 4WEPA 5AE4A 2PT2A 2QPQA 3OELA 2Z8DA 3FJ7A 4G77A 2Q9TA 2Z8FA 3C35A 1S50A 2P2AA 3MVYA 3QUJA 4ELRA 1SW4A 4U22A 5B7DA 5CM6A 2F35A 2DQVA 3TTKA 3MZBA 5CMCA 1OLCA 1Y1ZA 3IB2A 4FE8A 1ZLQA 1MPDA 5CC2A 2QS4A 2Y7KA 4QFLA 4YMBA 4R73A 4H5FA 1MY3A 2Q88A 3FVOA 3PUVE 3N6TA 4L17A 2D21A 4TOZA 4R6KA 4U4XA 1PB7A 2HZLA 4LZ7A 3T66A 5AA4B 4Z0IA 3CVGA 3C36A 5JEIA 1BIYA 1PB8A 3TTRA 3CR9A 3S9MC 1CE2A 1MY0A 2AIXA 1D3KA 2LAOA 1MH4A 3E4RA 3PPNA 2R9JA 1QUIA 2CMOA 1I6BA 2E0SA 2RC8A 2RKMA 3EHSA 1B3GA 1UQWA 3MVWA 2GRVA 3QSLA 3R26A 4GOTA 4IY6A 4NF4A 3IJOB 1B05A 3DP4A 4IB2A 4ELPA 1H3DA 4KCDA 4F3GA 3HN0A 3RTWB 1URDA 1FQEA 1JEVA 4GFRA 3K6WA 1B40A 3VVFA 1DTZA 2VOZA 1LBBA 1MQJA 4IO6A 3T22A 3O9PA 4OFJA 5CRYA 5KZTA 2W7YA 5CBSA 1I6AA 1SVXB 4QSCA 2G93A 5F1QA 1M5BA 4JBZA 4X1DA 1M5CA 3MVXA 5H8NB 4TLLB 1VSOA 3ECRA 2HQ0A 2ABHA 3A3UA 1MXWA 3G3KA 2VP1A 3USDA 3FVKA 2QMXA 2XX9A 2XXYA 1IQ7A 1TFDA 3G3FA 3H4ZA 2F34A 2GHBA 3MVZA 1Y4CA 3CFXA 3JYRA 1QULA 2D3IA 3KN7A 4ZZAA 3UP9A 2GHAA 3C33A 4ZDMA 3R7XA 3QYTA 3PGFA 3K00A 3I3VA 4RXLA 2V93A 4AB5A 3H7MA 3C9HA 4FAJA 1LAFE 2R71A 4F2QA 3K02A 3I6VA 1UTHB 2OBGA 4R6YA 1BP5A 1OVBA 2F6GA 1MS7A 1NL5A 2REJA 2QS1A 2DP8A 3EN3A 3FZVA 4LQ2A 4MLVA 5L9MA 4F1VA 5LOMA 2O6AA 2V3UA 5ICQA 1M5DA 1LCFA 3FD3A 4DE8A 4YMAA 3K0VA 4RPOA 1USYH 4R2BA 3ZKLA 1JW4A 5IAIA 1CB6A 1MM6A 1QKAA 3UIFA 3TFLA 1PB9A 3Q27A 2UXAA 2RCAA 2X26A 5DEXB 5JTYB 1MXYA 4ELOA 3CFZA 4H65A 2RCBA 3KZGA 3OO7A 2ZYMA 3PV0E 3VDFA 2D5WA 5I2NB 2DS9A 4Q30B 5B70A 4X9TA 1O63A 2I0BA 3CSBA 2V3QA 3T9XB 4XXUA 5KDTA 1FTLA 2O7UA 1B7HA 1N3WA 3IORA 3PMXA 3KG2A 2I0CA 4BDRA 1P99A 4FECA 4NF5B 5EHMA 1NH8A 4MBPA 4OESA 5I56B 3EHUA 4POXA 3GXAA 3KN3A 3FXQA 1JQFA 4I9DA 4QFNA 2IA4A 1M5EA 4TLMB 2I4CA 2DWAA 3MPKA 1II5A 3P7IA 3MZ1A 4BDOA 2HAVA 2QJEA 3JZJA 5ELVA 3LSLA 3MJNA 3BKIB 1AH5A 4ISUA 1B5HA 1JVXA 5I59A 2P1SA 3HSTA 1N84A 4XKRA 3KJ7A 3HHGA 2XXWA 1Y3NA 1P1OA 2DOJA 3QIMA 3W9WA 3FJGA 2ZNSA 3V83A 1WDNA 4M4GA 4RA1A 4C1UA 1T0KA 1B3LA 5FTIA 1MQDA 3O28A 3CG1A 1SI0A 2I4BA 4R9GA 2E1SA 5M2VA 4OERA 4IGRA 2A5TA 2B3FA 5DVIA 4ZEFA 1XVXA 2F36A 1L5TA 3K1MA 2Y7IA 3RPWA 3THIA 1GR2A 1MQGA 3VLUA 4F3PA 2B65A 3SEUA 3V89B 5AA2B 1RYXA 1LAGE 1VFEA 1PC3A 4G2ZA 4IO7A 3PUWE 1VR5A 3SERA 1H44A 2M8CA 1IEJA 1QUKA 2H98A 3KOSA 4MFIA 3SEWA 4EF1A 3R6UA 1LLSA 4H8IA 3B6QA 4PFWA 4YB7A 4OEVA 3CG3A 1ZMGA 3TPAA 3B7DA 3M8UA 3CIJA 2F78A 3M3KA 2UVJA 2F97A 2H9BA 2PT1A 4RJZA 1MPBA 5I2KB 4ZEKA 3OO8A 3V5AA 4XTCQ 1IXIA 2HEUA 3KN8A 2Y7WA 3FUZA 3KSJA 5KDTB 5H8FA 3G7WA 1FW0A 4H67A 4IO4A 1S7YA 4N07A 4HS7A 3KBRA 1BKAA 1Y3QA 3IOUA 4R72A 4YICA 1NNPA 1GTKA 3O6IA 4F1UA 4KYEA 1FQDA 2NVUB 3VE1B 5AA2D 2UVIA 3K6VA 4Z7EA 1R9LA 3U94A 4BLAA 1XVYA 2QS3A 2ZNTA 1R1NA 3QXMA 4YB5A 4AQ4A 4HCYA 2I48A 4GQOA 1OQGA 2PVUA 1JW5A 1OQHA 4PFUA 5DTBA 4ZS9A 1WVJA 3M3LA 5ITPA 4G68C 2O1LA 4EQBA 5I57B 4RPNA 1GGGA 4R2FA 4FORA 3KSXA 2Q2AA 4BDMA 3RY3A 2XXQA 3E9XA 3FV2A 1YTVA 1B3EA 1A99A 1USYE 2OJTA 1FTOA 3EF7A 5ICTA 1AMFA 1O7TA 1Y4TA 5J1DA 4DIGA 1A40A 1MM7A 3MW0A 2DWIA 2ZYKA 3B6WA 3TQWA 4ECFA 4JWXA 2OWTA 2F7CA 3MWBA 2XX7A 4AB6A 1SYHA 2UYEA 1SW5A 4X48A 3TEPA 2F7BA 1B0LA 1VFDA 1B5JA 5L9OA 4ESXA 1J1NA 1MG1A 2VGQA 3U72A 2I3WA 3BFUA 3IK6B 3K1NA 4FIMA 4JWOA 4OETA 1ZIUA 3H6VA 3FXRA 4F19A 3RT8A 5I2NA 1TWYA 4XKNA 3GBAA 2Q8JA 3TTLA 1KWHA 2F7AA 4ZECA 3S9EA 1I6QA 1B2HA 1US5A 3O2AA 1SW2A 1MDQA 3OO6A 4ZZEA 1SDXA 1IITA 3OEKA 2H5YA 3VVDA 4NTLA 1EH3A 2OCUA 1XS5A 4BDLA 1IZ1A 5HPQA 3CFLA 4NF6A 1Y9UA 5HBCA 3SESA 4QSEA 3CSGA 5JK4A 5H8FB 2XXTA 4KYDA 1NH7A 5H8QB 2DE3A 1ZBMA 3PU5A 1B6HA 3W9VA 4OTEA 3M3FA 4YB6A 1SD3A 5DVFA 2THIA 1ZKBA 1D4NA 3FV1A 3GLBA 4FEDA 4HCWA 4ZEIA 3IB0A 1HSLA 3RT6B 4FATA 4RYAA 4R6HA 5KCJA 3GZGA 4P0IA 3FVGA 3K4UA 3UK4A 5H8HA 1A7LA 2O7IA 1IXGA 4PFYA 1EZPA 2I3VA 1Q35A 2RC9A 2VD2A 2ZNUA 3Q28A 3ZKKA 2XXRA 4WEDA 3IL1B 2HFBA 1XOCA 4OQOA 4E0WA 4DDDA 4H6DA 1OIBA 1OLAA 2OWSA 4QSDA 4JDFA 1LAXA 3FGSA 4RK9A 2KLFA 1MXUA 1EZ9A 3D4CA 3N5LA 4IO3A 4O3BA 4IO2A 4NF4B 1OVTA 5A5XA 1EZOA 5H8HB 4QFOA 1QVSA 4GWOA 4WXJA 4EXKA 2XXPA 2UYFA 3IO6A 1TT1A 1LFHA 3C34A 4NEDA 4UA8A 1SBPA 1DMBA 1MXXA 3TELA 4GL0A 4DXBA 1JNFA 1MY4A 4F18A 3IOWA 5ITOA 1TFAA 2I58A 4YKIA 4KHZE 2DXRA 3W15C 1FCKA 4GXAA 2AYSA 1MXZA 4MH5A 4H0WA 1FQAA 1NKXA 2DYXA 2ONRA 4YU0A 1B7ZA 4LUBA 5DT6A 3RN8A 2FYIA 1N04A 1FTJA 1WODA 1Z7ME 1ZJLA 2OZZA 3MAMA 4QF9A 4DZ1A 5A5XB 3MP6A 4JXIA 1TXFA 4M1VA 3ZSFA 4F29A 5I84A 4LATA 4OENA 3JV9A 2F5XA 2NOOA 2PMSA 1MRPA 2X7QA 2ONSA 2XXUA 4RK2A 5EYFA 3T9VA 1SYIA 3Q29A 1POTA 2DVCA 3LSXA 4MLQA 3O66A 2PYYA 4PP0A 3PPRA 3U92A 4GD5A 4G68B 2P0SA 4Q5TA 2X7PA 4XKQA 3UA8A 1JETA 5I56A 1SW1A 2QS2A 3TMGA 2VHAA 2V3TA 4HTGA 1B3FA 4U4SA 5ISUA 5CMMA 4RNSA 4U1ZA 4EQ7A 1N3XA 3IAZA 1N7WA 4PETA 4YKPA 3OD7A 3IX1A 2UVHA 4PE5B 2DWHA 1LCTA 3QUFA 1PBPA 1URSA 1B1XA 3S2VA 4EXLA 2H4IA 4KQPA 1LAHE 5TPAA 2ONKE 3SEXA 5AA3A 5JTYA 4FEBA 3KJTA 3MBPA 2CZLA 5H8QA 3WAFA 3MPLA 1YCJA 2PX1A 3O97A 3VXCA 3LR1A 1O64A 1DTGA 4OYVA 4G8HA 5DVJA 4C0RA 5I58B 4KYSA 5I58A 3TCHA 2BJJX 3TTMA 1JVYA 4HW8A 1R9QA 3TODA 3C32A 3V8XB 2O69A 1B4ZA 4KI0E 2RF1A 3IOTA 3OENA 4LZ5A 3SEYA 3RNNA 3TCGA 3E13X 4I62A 1HSEA 3SDFA 3Q25A 3VVEA 2DWJA 3C4MA 3H6WA 4LZ8A 1LBCA 1N76A 2Y7PA 4U21A 1DPPA 2ANJA 1VE4A 3DP6A 4EF2A 1D9VA 2ZXTA 3IOVA 3EPEA 2HAUA 1BLFA 4POWA 3KGCA 3TCFA 3ZS6A 4I8CA 1H45A 2FNCA 4JB7A 2NUVA 2NWJA 2PBWA 4K3FA 3U8QA 4THIA 4JSDA 4NMYA 3S9LC 5DYHA 3G3HA 2Z8EA 4Q8RA 3F11A 3HO7A 3PMWA 2IEEA 3G3IA 1Z7NE 3G3JA 3O6GA 4G8NA 3IR1A 4GRKA 4GXSB 4R74A 5DEXA 3U1OA 3S9NC 1P1UA 3TDJA 4DXCA 1LFGA 1B4HA 1JEUA 2XX8A 5H8NA 3UGWA 4QHQA 1R6ZA 2XHDA 3TQLA 2RC7A 1A54A 2ZYNA 3LC8A 5L9SA 3T9HB 4IO5A 5H8SA 2B3BA 3E3KA 3SKPA 5CMKA 1NFTA 3C31A 4H5GA 3IO4A 4OXVA 3CI8A 4IGTA 4ONYA 4N13A 3VXBA 1IXCA 2QL3A 2YJPA 1URGA 2F8DA 2ZYOA 1PEBA 4X1BA 4EUOA 4F2OA 4JWYA 4ZEDA 1MXVA 3FJMA 4ZEBA 3QK6A 1MY1A 2O84X 1MH3A 4H8JA 4F3SA 1HSJA 2I49A 3K1PA 3ODBA 3PMVA 1SQYA 1Y3PA 5EHSA 3HHFA 3CRBA 4O3CA 4O3AA 4F1YA 3HCQA 4U23A 4IY5A 1UTHA 3MP8A 4H1XA 2NXOA 4OZ9A 4DLDA 3D4GA 4YZZA 4R9FA 2DSFA 1N0TA 2Z23A 2QMWA 4KFQA 4U2RA 3BFTA 5AA1A 4F31B 1GV8A 1A8FA 3DM0A 1P1QA 2QRYA 4YKKA 1LGBC 3H6TA 4BDNA 4ELQA 1BTJA 5TPAB 1SI1A 2H99A 3HPIA 4I1DA 5FTHA 4P0GA 2Q2CA 3FVNA 3PD8A 3Q26A 3PUZE 4NE4A 4OFOA 1F9BA 3G3GA 2REGA 3BBRA 3MP1A 4NF8A 1LB9A 1ANFA 5FHNA 3RGYA 5IKBA 4ESWA 3TZAA 5CMBA 5K2XA 4NWDA 1B0HA 1B58A 5TP9B 1B52A 1S9TA 4P11A 4XKPA 3A3CA 5KCJB 2O68A 1DOTA 1P1WA 1IXHA 2R6GE 3H06B 3T93B 3FXUA 3UN6A 4KD5A 5L8DA 1B32A 2OLBA 1B7UA 1I69A 2A5TB 3O29A 1ZTYA 2DE4A 2I6EA 4DCYA 1XHYA 3DELB 1UIUA 2Z22A 3KOTA 4ND9A 1AOVA 1RKMA 1LFIA 1NNTA 1Q1KA 1RYOA 2ALUA 1AIVA 2XD3A 5BWJA 3FASA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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