4IGTA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j) in complex with the agonist za302 at 1.24a resolution
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
263
structure length
263
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Chemoenzymatic synthesis of new 2,4-syn-functionalized (S)-glutamate analogues and structure-activity relationship studies at ionotropic glutamate receptors and excitatory amino acid transporters.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 85
structure length 263
sequence length 263
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-12-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4igtA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4igtA02
1A8FA 4F31B 4RK2A 1URGA 5H8QB 5AA1A 1PB7A 4KD5A 4YAHX 1H3DA 4IY5A 4OWDA 1O63A 4GXSB 1NH8A 3QUFA 5DTBA 1VSOA 4OMBA 4AB6A 1LGBC 4JB7A 3FZVA 2ZNUA 5I2KB 2F78A 3PPRA 1UIUA 4KR5A 1H44A 5FTHA 2QS4A 3C36A 5KDTA 1MXWA 3ILUB 3TZAA 1Y4CA 3MVYA 3T22A 2ZMBA 3FVGA 3UA8A 2O84X 3KZGA 3G3KA 3B7DA 4LVQA 2F6PA 2CZLA 3QIMA 3RT8A 1PC3A 1VR5A 3IO6A 3CIJA 5DEXA 5I58A 3H3GA 4BLAA 1LAHE 1MM7A 2YJPA 1LFGA 4H5FA 3ZKLA 1YPNA 2O7IA 3IB1A 1I6AA 1IXIA 1SDXA 1I69A 3E3KA 2NOOA 2ANJA 4ZE9A 2CMOA 1Y1ZA 4OEUA 3IAZA 1Y3PA 3G3FA 4F1UA 1FW0A 3G7WA 1AL3A 3PD9A 4UA8A 4U1ZA 3U93A 1A40A 1M5CA 3IR1A 1YAEA 4JWXA 4YKIA 1S7YA 2XXUA 3C33A 5DVIA 4K3FA 3D4GA 3K6XA 2V3QA 4EF2A 1MH4A 1Y4TA 1NH7A 1FTMA 3K1PA 1SQYA 1LBBA 3FXQA 5EHMA 1MY2A 2ZYOA 4I8CA 3R6UA 2Q2CA 4F1VA 2VD2A 3JZJA 4IO5A 2NXOA 3C35A 5H8HB 2ZYNA 3CFXA 1IITA 2YPNA 1LFHA 4XKQA 5L8DA 3M3LA 4XKNA 3LUYA 1FTOA 2XX9A 3K01A 2PYYA 4F3BA 4OTEA 3SEWA 2OK2A 4QFLA 3OEMA 4U2RA 1O64A 3ILTB 3SKPA 3RPWA 1UTBA 3TCGA 2F35A 1MXVA 1SW5A 1ELJA 4H65A 4NTLA 4OFOA 2Z8FA 1QUKA 3PPOA 3EF7A 3M3KA 4NF8B 1FTKA 3C9HA 3UK4A 1XVYA 4EQ7A 1TWYA 4H6DA 3HHGA 5FHMA 1GTKA 1Y9UA 2XXVA 1HSLA 1B0LA 2ONKE 1VE4A 4RYAA 1MQGA 2XD3A 4BDRA 3VVEA 2ONSA 5TPAB 3IOWA 4F39A 2F36A 3HHFA 1D4NA 1VFDA 5EYFA 3MZBA 5H8FB 3H7MA 4FATA 4RA1A 2I4BA 3RTFB 3LSXA 5I57A 4OXVA 2THIA 4YU0A 3GZGA 3H6WA 4PFTA 4Z7EA 3TODA 1ZJLA 3KJ7A 1SBPA 4P11A 1B46A 3DP8A 1N7XA 4HCWA 1LB8A 1DMBA 2GFEA 4YZZA 1WODA 3IOTA 3RUMA 3FD3A 4TLMB 4WKMA 5AA4B 5B7DA 4Q30B 1B7HA 4ELPA 2AYSA 2Q88A 3UN6A 1DSNA 1QJMA 1SW4A 2OZZA 4E0XA 1P1OA 4O3CA 1M5EA 2Q8JA 2PT1A 3PUYE 1XC1A 3QSLA 1ZMGA 2DS9A 2F97A 1EZPA 2I0CA 3H6TA 4F2QA 3C32A 4R75A 4KQPA 3DP6A 1IIWA 1IXGA 1KWHA 3PGFA 1NL5A 4PFUA 2O1MA 1OQHA 3PUVE 1BLFA 1P1UA 3CRBA 3LSFB 3THIA 1TT1A 4F29A 4EXLA 5HBCA 2V25A 2PMSA 1FQBA 1ZKBA 4OFJA 4RK9A 3TQWA 1WDNA 2H99A 2I49A 4WEPA 3OO9A 2I48A 3A3CA 4QFOA 4NF6A 5H8NB 2R71A 3PV0E 5DT6A 3EPEA 2VOZA 1SVXB 2ZNTA 4MBPA 5ICTA 4RY1A 1OQGA 1LBCA 4ZE8A 5I59B 4NWDA 2GRVA 1MDQA 1NKXA 3K6VA 3TTMA 3BBRA 3VDFA 5B70A 3KGCA 4YMBA 4N6PA 1POTA 4X48A 4KI0E 5AA2A 1B6HA 1QKAA 2DE3A 3TDJA 1QUIA 3FV2A 2F8DA 2GHBA 2F7CA 2XX7A 1Y20A 4ELQA 1P1QA 3N94A 5KCJA 1NNTA 1JW1A 4GRKA 5KDTB 2DQVA 3JV9A 1S50A 2NVUB 3FVNA 2R6GE 3MPKA 4WEDA 1VFEA 3T96B 3KN3A 4GFRA 3TPAA 3EN3A 5F1QA 2UVIA 2UVHA 1H45A 1PEBA 2HZLA 3VVFA 4FE8A 3MP6A 4DLDA 4R2BA 1MXUA 1B1XA 1CB6A 1BIYA 4H5GA 1ZU0A 2XXHA 3I5OA 2ONRA 1D9VA 5FHNA 5K2YA 5F7VA 3H03A 2P2AA 1MPBA 1OMPA 3K00A 2RINA 3IL1B 1BKAA 3OENA 3EHSA 3V8XB 1B9JA 1MH3A 1B3HA 1SYIA 3OXNA 1JQFA 3PUWE 3U92A 4EQBA 2OCUA 3RT6B 2FA7A 2LAOA 4DCXA 4Q8RA 2PVUA 4JWOA 3GBBA 2X7QA 3TTNA 3OMBA 1N0TA 4LATA 4BDQA 2P0SA 4GOTA 3RY3A 5TP9A 1LFIA 3OO7A 4JSOA 3RN8A 4PETA 3SDFA 2XXQA 2QS1A 3OO8A 3S2VA 4MFIA 4DXBA 4YKPA 1JETA 2AL4A 1AIVA 1HSEA 1IEJA 4U1OA 1FCKA 1IXCA 5A5XB 3KOTA 4R9FA 3PUXE 4GL0A 4ZEDA 4F18A 2NUVA 3FASA 3I6VA 4GIZA 4PFYA 1DPEA 4EDPA 5I2NA 3IJOB 1AMFA 4DXCA 1RYOA 4PQJA 4QSEA 4NMYA 4PP0A 3G3HA 4NF5A 2FNCA 4YICA 4ZS9A 4G2ZA 2Y84A 4DXUA 2RCAA 4ZEKA 4ZZEA 3FUZA 1S9TA 4C1TA 1BP5A 2IA4A 1SW1A 4KPTA 2RC8A 3FVKA 3RNNA 1JVYA 1EH3A 3DELB 2B3FA 2I58A 3MVXA 2F5XA 4I9DA 5JTYA 1NNFA 2FYIA 2Q9TA 4F3GA 1P1WA 3U94A 3HCQA 1A55A 3U1OA 2HEUA 1Q35A 4U21A 3SESA 1JEVA 4YB6A 4ESXA 4G68A 2Z23A 5ELVA 3N26A 3FIRA 1FTLA 4IGTA 3I3VA 3CSGA 3KSJA 2RC9A 1XT8A 3TKDA 3SERA 3UP9A 3MQ9A 3Q25A 4AQ4A 4M4GA 4IO7A 3L6HA 3FJGA 4G8NA 4WXJA 4YB7A 3A3UA 4BDLA 3SETA 3W9VA 3OSQA 1IZ1A 4UACA 1L5TA 4LZ7A 3UIFA 4EUOA 3TCHA 1USYH 1Q1KA 3C31A 4I62A 3O28A 3VVDA 2O51A 1FQDA 1N3WA 3O9PA 1B2HA 1LAGE 3MAMA 1MDP1 1OIBA 2XXTA 1PDAA 2O68A 3N6TA 4G8HA 1QW0A 5CI5A 4JDFA 1A8EA 3HO7A 4KYEA 4FECA 3CSBA 2H5YA 2DVZA 2PX1A 1MY1A 2O1LA 5AA2B 3IK6B 4F3SA 4YKKA 2O7UA 2QL3A 2HQ0A 1TFDA 4OENA 4FIMA 1UTHB 5H8QA 3K6UA 4O3AA 1ZIUA 1R6ZA 3JYRA 3D4CA 1YCJA 4ZZAA 3FV1A 3RQTA 4ESWA 3ZKKA 2Y7KA 4OFLA 3PPQA 1LCFA 3MP1A 3E9XA 2F7BA 3EHUA 4R2FA 3MWBA 2ZYKA 4RXLA 3HPIA 4RNSA 4ECFA 3FJ7A 4Q5TA 4NF4B 3UGWA 3U8QA 3SEVA 3Q28A 1XVXA 1QUJA 4IO4A 2RKMA 3PPPA 3T66A 3O2AA 4QFKA 2XX8A 4XKPA 4F2OA 4KHZE 3CFLA 4NWCA 2XXIA 1GVCA 1FQAA 3VLWA 1N3XA 2V84A 5FHOA 3TTKA 3VV5A 4JWYA 3KBRA 2V3UA 3ZS6A 1GV8A 4R6YA 1B7UA 4RJZA 1SI1A 1PB9A 1I6BA 4E0WA 2I3VA 3WAEA 1MQHA 1OVBA 2DSFA 2Z8DA 4F3PA 2G93A 2XXPA 1O7TA 3SEYA 1FTJA 5AE4A 4H8JA 1DTZA 2A5TB 3AXFA 5BUUA 3BFTA 4F1YA 2YLNA 2DWJA 3S9MC 1GGGA 2REGA 2E0SA 1MM6A 3O6HA 1OLAA 4ZDMA 2RF1A 4AB5A 5CMMA 2Z22A 5L9OA 2XXXA 2I0BA 1MXXA 2GH9A 4NE4A 4IY6A 1RYXA 1JNFA 3MZ1A 2I6EA 1MRPA 4IB2A 1M5BA 5H8HA 4XKRA 5CM6A 4QFPA 4O3BA 1US5A 4H67A 5IKBA 4X1BA 4BDNA 3W15C 1P1NA 3PMXA 2QMXA 1QKBA 4I1DA 4EQ9A 4JBZA 2RC7A 1TXFA 4DDDA 1II5A 3BFUA 1DPPA 3DM0A 3PU5A 3FXRA 3M8UA 3WAFA 4OESA 2GHAA 2XXRA 3H6UA 1IUDA 4LP2B 3KN8A 3CI8A 2F34A 1UQWA 3B6WA 3IJXB 3ONMA 3TTLA 4DZ1A 1B05A 3RTWB 1CE2A 2XD2A 3O6IA 1N7WA 3SEUA 5DEXB 5I58B 4R73A 4ELOA 1LSTA 4OZ9A 2DWIA 3LR1A 5TPAA 4GXAA 4MLQA 3DLNA 4OEVA 3TELA 4H0WA 3QYTA 4IO3A 5TU0A 1B4HA 2RCBA 5HPQA 3KFMA 4YKJA 2DXYA 4ONYA 1B32A 1ZTYA 1LAXA 1MY0A 1B4ZA 3QUJA 2VD3A 4KYSA 3OSRA 3VE1B 5JEIA 1FQFA 3K1NA 4X1DA 4DIGA 1PB8A 2Y7PA 5CMCA 3A09A 4JSDA 1FQCA 4ISUA 2AL5A 3E4RA 1ZBMA 3OD7A 2H9BA 3N5LA 1OVTA 1F9BA 3IO4A 1AH5A 3OOAA 3K2DA 2E1SA 1USYE 2V93A 5L9SA 3MJNA 3KJTA 4TQUQ 1QVSA 2A5SA 2V3TA 2DWAA 1UTBB 2KLFA 1B3FA 3M3FA 1PBQA 4KYDA 1N04A 2WKYA 2F7AA 4PE5B 1IQ7A 1LAFE 1MQDA 4Q0CA 4G4PA 1SD3A 1J1NA 4GLIA 2Y7RA 3Q29A 4YB5A 1NNPA 1US4A 3K0VA 3Q26A 2ESNA 5ICQA 3T9UA 2PBWA 5H8NA 3RLFE 2I3WA 4GD5A 5L9MA 4R9GA 3OELA 4R6HA 5I59A 4HS7A 4F19A 5CMBA 3TTRA 3TEPA 3H6VA 1B52A 3E13X 3IX1A 3CVGA 2XXYA 1XHYA 2DWHA 3PPNA 2AIXA 4LZ5A 5I57B 4ND9A 4ZECA 4KCCA 4LZ8A 1JW5A 1POY1 2OJTA 3KG2A 5M2VA 2OWSA 3LSWA 1OLCA 1B1HA 3PMWA 5H8SA 2Z8EA 3HSTA 3VXCA 4JXIA 4G8MA 3T93B 3K6WA 4QSDA 3V83A 3Q27A 1HSJA 3MC2A 2UVGA 2O69A 4THIA 1URSA 4DCYA 1Y3NA 1WVJA 3G3GA 5CRYA 3F11A 4FEBA 2XXWA 2QMWA 3FVOA 3KN7A 3TQLA 1MS7A 4U22A 4P0IA 3KEIA 2UYEA 4FJPA 4ELRA 1MG1A 2QS2A 1FQEA 2VHAA 1DOTA 3MBPA 2UYFA 2F6GA 5ITPA 3G3IA 3OO6A 3B6QA 3L6GA 4N13A 3MP8A 2X7PA 3VXBA 1EZOA 5I56A 1LLSA 2QPQA 2H25A 4GVOA 1B51A 5JK4A 5BWJA 5CMKA 2OLBA 2DP8A 1A99A 3MVWA 3SEXA 3BKIB 4HW8A 4NF6B 1B5HA 3TMGA 1B5JA 1Z7ME 1ATGA 2OBGA 1YTVA 3FATA 4GL8A 1Y3QA 2HZKA 1MQIA 1ZLQA 5A5XA 1P99A 3HV1A 4LQ5A 3LBSA 2G29A 1NMUA 4OVJA 3S9EA 2DE4A 4EXKA 3DP4A 1MXYA 1QULA 4M1VA 4ZEFA 4EF1A 1EZ9A 1H76A 4F22A 5KCJB 4GF8A 3FJMA 4H1XA 1A54A 2REJA 1B3LA 1R9QA 4FORA 3T9VA 1M5FA 4OETA 2UXAA 3O97A 4KFQA 3FXUA 4XXUA 2HXWA 3C4MA 2OWTA 3HN0A 4G68C 1T0KA 5I2KA 4XIGQ 4LUBA 3S9NC 3MPLA 4U23A 3N6UA 1BTJA 2HFBA 1R1NA 1MY3A 3GXAA 1TFAA 5ITOA 4QRZA 2VGQA 2H4IA 3IORA 3U72A 2DOJA 3MZ9A 3ECRA 2XHDA 4LONB 4QSCA 3IB2A 4IO6A 1ANFA 5DVJA 5CBRA 1JVXA 4OERA 1B0HA 3QAXA 4U4XA 4GWOA 1M5DA 4MLVA 4MF3A 4R74A 4QHQA 5EHSA 4XTCQ 2Y7WA 3GLBA 2O6AA 1Y1MA 4TOZA 2ABHA 4IO2A 1PBPA 3PMVA 3KSXA 1SYHA 4P0GA 1JW4A 5TP9B 2M8CA 1XOCA 2BJJX 3VFJA 3S4UA 3CFZA 1MPCA 1MQJA 4TLLB 4FAJA 1Z7NE 4DE8A 4BDOA 4GQOA 5FTIA 3T9XB 5DYHA 4OQOA 4OYVA 3LC8A 2HAUA 2D5WA 5LOMA 3K1MA 4ZEIA 3VLVA 2ZYMA 3FGSA 2QRYA 3TFLA 5I2NB 3EHTA 2PT2A 1MY4A 5CC2A 4PFWA 2DYXA 4POXA 3KOSA 3V89B 3LSLA 4NF5B 2R9JA 4RPOA 3G3JA 4IGRA 2ZXTA 1DTGA 4FEDA 3IOVA 4H8IA 3H4ZA 4R72A 1B3GA 2HCAA 2D3IA 2Q89A 4NF8A 3VLUA 3EQ1A 3B6TA 2I4CA 3TCFA 2VP1A 2Q2AA 1SI0A 4OHNA 5AA2D 3TYHA 1EU8A 1XS5A 1MPDA 4LQ2A 3IOUA 2B3BA 2UVJA 3CG3A 5J1DA 1URDA 4QFNA 2ZNSA 4KCDA 4Z0IA 4BDMA 1UTHA 5CBSA 1B3EA 3CR9A 5JTYB 3TAJA 3OEKA 5KZTA 2D21A 4L17A 1D9YA 2QJEA 5I84A 3C34A 1JEUA 5DVFA 4G77A 4YMAA 3K02A 3O66A 5H8FA 2DVCA 2QS3A 2X26A 3PUZE 3IB0A 1I6QA 3R26A 2NWJA 3S9LC 2B65A 5IAIA 4N07A 4NF4A 4G68B 3O6GA 2W7YA 3ZSFA 3ODBA 4LA9A 3MW0A 1NNKA 1IXHA 4HTGA 1LCTA 1D3KA 1N76A 4R6KA 3RGYA 4POWA 1A7LA 2DE2A 1SW2A 3R7XA 4X9TA 5AA3A 4QF9A 3H06B 3QK6A 5AA4A 3USDA 4NEDA 3T9HB 5ISUA 4C1UA 5I56B 1MXZA 1B40A 2IEEA 1NFTA 3K4UA 1RKMA 4RPNA 4C0RA 1GR2A 1B58A 3W9WA 1LB9A 2DXRA 2ALUA 3UORA 5K2XA 3O29A 3MVZA 1UIVA 2H98A 2A5TA 4U4SA 1AOVA 1B7ZA 2P1SA 2HAVA 5HM4B 4MH5A 1N84A 3CG1A 3PD8A 3QXMA 2QSXA 1R9LA 3TUSA 2Y7IA 4HCYA 3MUQA 3GBAA 1H43A 4ZEBA 1B5IA 3P7IA 3V5AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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