5FTIA

Crystal structure of the glua2 k738m-t744k lbd in complex with glutamate (lithium form)
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPMGSSLGKPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Signaling protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title Distinct Structural Pathways Coordinate the Activation of Ampa Receptor-Auxiliary Subunit Complexes.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 86
structure length 260
sequence length 260
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5ftiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5ftiA02
5ISUA 4U23A 4F19A 1SD3A 5I56A 1WODA 4XTCQ 1XVYA 4YKJA 4DZ1A 3M3LA 2ANJA 3WAEA 4NF4A 4YZZA 4IGTA 3E3KA 4NMYA 3QUFA 3IX1A 3OO9A 3OENA 3G3IA 1YAEA 4F2QA 4JBZA 3KOSA 2F35A 3N6TA 3ILUB 4I9DA 2F97A 2GHAA 4FJPA 3PGFA 2UVJA 4QFOA 3LSXA 3MP6A 4ELQA 4U1ZA 5JK4A 3FGSA 3AXFA 1B3HA 4GRKA 5AA2B 4QSEA 2V93A 1NNKA 4GIZA 2O84X 4KD5A 2PMSA 3V5AA 1QJMA 3QK6A 3T22A 5CMMA 2UXAA 2OZZA 1B4ZA 3CVGA 4RJZA 1HSEA 2I4BA 1Q35A 4MFIA 4F3GA 4EF1A 2DXRA 1SI1A 3MP1A 2E1SA 3KN8A 4KQPA 5M2VA 3TKDA 3FASA 2Q2CA 2P2AA 4GL8A 1LFHA 2VD2A 2I4CA 3DELB 4PETA 3KEIA 3TELA 3U1OA 3T9XB 3IJOB 1H43A 3MPKA 1MRPA 4O3AA 3RT8A 4ZEFA 1ANFA 5I56B 1N76A 3O2AA 5FHMA 3MQ9A 3R26A 1A55A 4KHZE 4NF4B 4PQJA 3S2VA 3CSBA 4LONB 1EZOA 4JDFA 2I0BA 3CFXA 3K01A 2I3WA 3N5LA 5H8SA 4ND9A 3H7MA 5CM6A 5H8NA 4YICA 1B05A 2QJEA 3TPAA 2VHAA 3IB2A 3CI8A 5L9SA 2ONKE 1B5JA 4F2OA 3OEMA 3HPIA 3S4UA 1R6ZA 3GBBA 1EZ9A 4NTLA 2ZYMA 2XXRA 3S9MC 3UK4A 3V83A 3D4GA 4OHNA 5I2KA 3FXRA 4BDOA 2F7BA 1GV8A 4IGRA 4RXLA 3LUYA 1PB9A 1R9QA 3FZVA 5CI5A 4KPTA 3TTRA 4PFUA 4GOTA 5H8HB 4OWDA 3SEXA 4C1UA 3TCHA 2F78A 3G3HA 5HBCA 1II5A 4LATA 2E0SA 4BLAA 4ZS9A 3USDA 5H8FA 1P1UA 1OMPA 2F36A 3JV9A 3IOWA 4F1VA 2UVHA 4WKMA 2YJPA 4AB5A 2H9BA 4L17A 2ONSA 4ZE8A 3ODBA 1URDA 2D21A 3HHGA 2XD3A 3RNNA 1N3XA 3E13X 2LAOA 3PPQA 1N84A 3G3JA 3SEUA 3K1NA 1MY2A 2NUVA 3VVDA 4OFLA 3QAXA 3KG2A 1PBPA 4GF8A 3S9EA 3U93A 5TP9A 2GFEA 3IB1A 2IA4A 3R6UA 3GXAA 3ZS6A 2UVGA 1B3GA 3U94A 4ZEBA 4KYSA 1MXWA 3SETA 5B7DA 5H8NB 3KN7A 1SQYA 1AMFA 3HO7A 3SDFA 5JTYB 1OVBA 1PB8A 4ELRA 1LB8A 1N7XA 1YTVA 3Q26A 5BWJA 4MF3A 4RPOA 1Q1KA 4XKRA 4KYEA 4BDRA 3EN3A 3BKIB 3DP4A 4O3BA 2PX1A 1B4HA 1IEJA 1IZ1A 5I2KB 1NNTA 4EQ9A 3G3KA 3MVYA 3U8QA 3QYTA 1MM7A 3HCQA 4LQ5A 5KCJB 2I0CA 4QFLA 4ZE9A 4QFNA 4YMBA 2Q9TA 5I59A 2DQVA 3TMGA 4F29A 3PMVA 3TCFA 1JVYA 1Y20A 5CMCA 4N13A 4F1UA 4X9TA 5H8FB 3OO6A 1NFTA 1YCJA 2F7CA 1MY4A 5IKBA 5EHMA 2QMWA 4FECA 1FQEA 2XHDA 4ZEKA 3I5OA 4R6KA 1SDXA 1SW1A 2I58A 3G3GA 1IQ7A 1MY1A 4F39A 1B7HA 5KDTB 1ZBMA 2B3BA 4XIGQ 1MH4A 3C32A 1PC3A 2AYSA 3K0VA 4P0GA 4F3BA 2RC8A 4NF5A 5LOMA 5TP9B 3T66A 4LA9A 4PFWA 4H5FA 3IR1A 1SW2A 4QSDA 1UQWA 2FYIA 4TOZA 4JWOA 3PUVE 2ZNUA 3EHUA 3T96B 3PPOA 3C34A 4RK2A 2F7AA 1Z7ME 3K1MA 4Q8RA 4YAHX 1TWYA 1DPPA 4GXAA 1DTGA 1P1WA 2Y7WA 2PT2A 5I2NA 5DVFA 3S9LC 4MH5A 1H76A 1O7TA 3IO6A 1S9TA 1IXCA 1Z7NE 2HQ0A 2GHBA 4G8NA 2RKMA 3JYRA 5CC2A 1OVTA 4F18A 1MXUA 2D3IA 1GR2A 3PUWE 3CG3A 2Y7KA 1B7UA 1MDP1 1URGA 1A54A 2XX9A 3F11A 3V89B 3O6IA 4P11A 2VP1A 2M8CA 2DE4A 4DIGA 2ESNA 5I59B 1B7ZA 1MPCA 2QS3A 1S7YA 5I84A 3CSGA 1A8EA 3TTMA 4JB7A 1NNPA 3O6GA 4R73A 3C35A 4DXBA 5L9MA 4KCDA 4KI0E 2V84A 1TFDA 2RF1A 1B2HA 3GZGA 2Z23A 1L5TA 1MH3A 1QVSA 2F34A 3PV0E 1ZIUA 3MP8A 3TEPA 1QKAA 1IUDA 3CFLA 3O66A 4GWOA 4G2ZA 2FA7A 1N0TA 2DXYA 1EH3A 1I6AA 1B52A 4NF5B 3H3GA 1OQHA 5ICQA 4IO6A 1MXYA 4PFTA 2VGQA 1FQBA 4OXVA 4QRZA 3EHTA 2NOOA 4H8IA 4EXKA 3O97A 3S9NC 2NXOA 3M8UA 2IEEA 2O69A 3A09A 2HAUA 3H6TA 1NH7A 4DCXA 4NWDA 4N6PA 4R74A 1M5CA 3UN6A 4P0IA 1B9JA 4I62A 1S50A 4N07A 5I2NB 1M5FA 1R9LA 3N6UA 3MZBA 3PUXE 2KLFA 4BDMA 1NKXA 4LQ2A 3QUJA 4H8JA 1N7WA 1FQDA 5H8HA 3W9VA 2O7UA 2Y7PA 2QL3A 2RC9A 4IO7A 4NF6A 5FHOA 2QRYA 3B6QA 4XXUA 3IB0A 3MUQA 4F3SA 1LB9A 1DSNA 2HZLA 3MZ1A 1B40A 1BKAA 2PVUA 4OFJA 4G68A 5FTHA 3VE1B 3IO4A 4ESWA 3FJMA 1ELJA 2H5YA 1P99A 2QS1A 2OBGA 4OERA 3W9WA 3SKPA 3MJNA 2XXXA 2HCAA 1LBCA 2ZXTA 2YLNA 3G3FA 1TT1A 1VE4A 3B6TA 5JTYA 3EPEA 3K6WA 1AH5A 3VLWA 1B58A 2HFBA 3KFMA 1BIYA 2DS9A 4OEUA 4GVOA 1FTLA 4IO2A 3HHFA 4GFRA 2CZLA 4TQUQ 5CMBA 1B3LA 5AA4B 4JWXA 1FW0A 3RUMA 3DM0A 2A5TA 1H3DA 1SYHA 4I1DA 2RCBA 3SEYA 4G77A 4ELPA 2AL4A 3MC2A 2F8DA 4ELOA 3TODA 5ICTA 5I57A 2R9JA 5KCJA 2AL5A 2GRVA 3O6HA 3M3FA 2QS2A 4DDDA 3H03A 4FIMA 1XVXA 4G8MA 1D9YA 1JEUA 3UIFA 3FXQA 2DWAA 2R71A 1FQAA 2YPNA 5I58B 2QS4A 4DXCA 1Y1MA 3FVKA 4NF8B 3O28A 1MXVA 3RQTA 5ELVA 1DPEA 3ZKKA 2DWIA 3VDFA 2RCAA 3SERA 4NF6B 3BFUA 3DP8A 3TQWA 1HSJA 1VFEA 3OO8A 1ZTYA 1P1QA 1H45A 2PYYA 4XKQA 1UIUA 2I48A 4Z7EA 5K2YA 3H06B 4YMAA 3SESA 4X1BA 2QSXA 5KDTA 2WKYA 1P1NA 1NL5A 1JW4A 1QUIA 4G68B 2VD3A 4HCYA 4ISUA 3OSQA 3O29A 4HCWA 5HM4B 4XKPA 4KYDA 4ESXA 3CRBA 3FUZA 4RNSA 3FV2A 3Q27A 3G7WA 4AB6A 2O51A 4KFQA 1ATGA 1JW1A 3P7IA 4AQ4A 4X48A 4Q30B 1DTZA 2F6GA 4ZDMA 4OYVA 1POY1 4OFOA 4TLLB 2XXPA 1XT8A 1IITA 1B1HA 3K6UA 2X7PA 1D3KA 3FJ7A 3I6VA 2Q8JA 4OTEA 3LC8A 2A5TB 1BLFA 4IB2A 4OMBA 2XXVA 2HXWA 4OQOA 4G68C 3FJGA 3QSLA 5I57B 4HS7A 2BJJX 4OEVA 1P1OA 5BUUA 3RN8A 1FTOA 3OEKA 3OO7A 3KBRA 4LZ7A 3U72A 3IAZA 4M4GA 4TLMB 3A3UA 4BDNA 5AA1A 1VSOA 1N3WA 2V3UA 3E9XA 4WEDA 3H6WA 2X7QA 4U22A 2OK2A 3E4RA 4ONYA 2ZNSA 1PB7A 3ECRA 2RC7A 4BDQA 1AL3A 2HZKA 2DOJA 4YB6A 3K4UA 1UIVA 3VVFA 2DE2A 1ZMGA 4H5GA 1Y1ZA 1SYIA 4YKPA 4GXSB 1JQFA 1MPDA 3KGCA 2Q89A 1N04A 3VLVA 3FXUA 2ABHA 3KN3A 4EUOA 2G93A 1MDQA 3C4MA 4QHQA 2DWJA 4R9FA 3IOVA 4YB7A 4E0XA 1MPBA 2NWJA 4YB5A 3TDJA 2Z8FA 1UTHA 4OZ9A 4QFPA 3TTLA 4RY1A 5F1QA 1QUKA 1B51A 4KCCA 2W7YA 1FQCA 3T9VA 1A8FA 2X26A 4U2RA 2G29A 3DP6A 5FTIA 1Y4TA 4OESA 2NVUB 1JVXA 2GH9A 3BBRA 4E0WA 4YKIA 5ITOA 1DOTA 4QSCA 1HSLA 3UA8A 4F1YA 2V25A 1D9VA 1LCFA 1R1NA 2DSFA 2OCUA 1MQHA 1QW0A 2R6GE 4MBPA 5DYHA 1UTBA 1MG1A 1US5A 2O6AA 3VXCA 1M5DA 3IL1B 3N94A 5F7VA 2PT1A 1B3EA 4IO3A 2ZYKA 5CMKA 5CBRA 2OJTA 4R2FA 3T9UA 3CIJA 3R7XA 4ZZEA 1LFIA 2DWHA 4C1TA 1XOCA 1MY0A 2DVZA 5DTBA 3PUYE 2I49A 5EHSA 1IIWA 5DEXA 4U21A 1XHYA 1ZKBA 4THIA 1B5HA 2Z22A 3LSLA 3PD9A 3KSXA 1H44A 1FQFA 1M5BA 1Y3QA 2H98A 3FVGA 4EDPA 2PBWA 1A7LA 4H67A 4UACA 3BFTA 4FE8A 3VVEA 3K1PA 4LUBA 1MM6A 1B46A 3LSFB 1ZLQA 3LR1A 4U4SA 3OD7A 4LZ8A 3CG1A 3MWBA 5DT6A 2AIXA 3IJXB 3MVXA 1UTHB 1WDNA 1TFAA 4H6DA 3W15C 2DP8A 3MW0A 2DYXA 1CE2A 3ILTB 1MQGA 4RPNA 2XXIA 1B3FA 4POXA 2UYFA 2DE3A 4RK9A 5AA4A 2O1LA 3FIRA 4OENA 4ECFA 3K00A 5FHNA 4QFKA 3PUZE 4DXUA 3PPPA 4DLDA 4Z0IA 1MQIA 2DVCA 5ITPA 4EQ7A 1Y3PA 1MXZA 1UTBB 4GL0A 2D5WA 5B70A 5TPAA 1KWHA 1JW5A 1Y9UA 5I58A 4GLIA 1LFGA 1A40A 1SI0A 4OETA 1B32A 1M5EA 4NF8A 3HSTA 4HW8A 4RA1A 1USYH 5A5XA 3TFLA 1BTJA 1IXGA 2A5SA 3KJTA 4H65A 3SEWA 1PEBA 5DEXB 5IAIA 4XKNA 3VLUA 1FCKA 1GVCA 3IOUA 2ZYOA 5KZTA 5JEIA 2HAVA 3FVNA 2HEUA 2OLBA 4I8CA 1XS5A 5EYFA 2B65A 1Y4CA 3U92A 1OLAA 2XXUA 1B6HA 2REGA 2UYEA 2ZMBA 1IXHA 1OLCA 2V3QA 2XXTA 1TXFA 3OOAA 3PD8A 3SEVA 4YU0A 1MY3A 1ZU0A 3GLBA 3RT6B 2H25A 3TYHA 4PFYA 3T93B 1QKBA 3TQLA 4C0RA 4MLQA 4WEPA 1BP5A 5L9OA 3Q28A 3O9PA 4R9GA 4G8HA 5CBSA 4KR5A 2XXWA 3PMWA 3C31A 3LSWA 3VV5A 3RTWB 3B7DA 3FD3A 3RGYA 3TTNA 3K6VA 3EF7A 3TTKA 3B6WA 4X1DA 4EF2A 1EU8A 5J1DA 4F3PA 3TAJA 4F31B 2I3VA 3H4ZA 3H6VA 2H4IA 1SW4A 3I3VA 3RY3A 1LCTA 5TPAB 3KOTA 5CRYA 1OQGA 3KJ7A 1GTKA 3RLFE 3VXBA 1SW5A 1B0LA 4F22A 2CMOA 2O7IA 2OWSA 3MZ9A 2QMXA 3K2DA 3IOTA 2ALUA 5A5XB 2Q88A 3L6GA 1QUJA 4JWYA 3C9HA 1JNFA 4ZZAA 1CB6A 3VFJA 5DVJA 2OWTA 3OMBA 4NEDA 1I69A 4G4PA 1B0HA 1B5IA 1OIBA 3EHSA 1IXIA 5AA3A 4FORA 2V3TA 4ZEDA 4IO4A 3MPLA 5TU0A 1VR5A 4IY5A 3V8XB 1JETA 1AOVA 4UA8A 3EQ1A 2QPQA 2ONRA 2O1MA 3CR9A 2XD2A 4H1XA 5H8QA 4ZECA 3FATA 1LAHE 1JEVA 2FNCA 3A3CA 4PP0A 3QXMA 1I6QA 2P0SA 4EXLA 2H99A 1QULA 1MQJA 3TUSA 3TZAA 3D4CA 4R75A 1LSTA 3L6HA 2XX8A 1F9BA 1YPNA 3QIMA 4K3FA 4ZEIA 4QF9A 2Z8EA 1URSA 3ONMA 2Q2AA 1PBQA 3RPWA 1RYXA 2XXHA 2XXYA 2ZYNA 4NWCA 1FTMA 3ZSFA 5L8DA 3UORA 3ZKLA 4FEBA 3PMXA 4Q0CA 3C33A 1MQDA 3WAFA 3T9HB 4YKKA 4IY6A 1RYOA 4FAJA 2F6PA 2Y7RA 1RKMA 3K6XA 1LGBC 4WXJA 2B3FA 3FV1A 3MVZA 4H0WA 2F5XA 4OVJA 3C36A 4HTGA 4R6HA 1T0KA 2Z8DA 4GQOA 1POTA 1SBPA 1GGGA 3PU5A 1LAXA 3THIA 4LP2B 1LAGE 1NH8A 3OSRA 1FTKA 1VFDA 4JSOA 2XXQA 4U1OA 3DLNA 2I6EA 2O68A 3MAMA 4R72A 2UVIA 1US4A 4DCYA 2ZNTA 3OELA 1NMUA 4PE5B 3Q25A 3CFZA 3PPNA 1MXXA 3HN0A 4JXIA 3JZJA 1O64A 5H8QB 4MLVA 1XC1A 4O3CA 1LLSA 4R2BA 3RTFB 2THIA 5K2XA 3K02A 1J1NA 4U4XA 3MVWA 3IK6B 4JSDA 1Y3NA 4R6YA 1FTJA 4Q5TA 3PPRA 3MBPA 3TCGA 4LZ5A 5AA2A 4EQBA 3UP9A 4GD5A 2P1SA 5DVIA 1WVJA 4NE4A 2XX7A 1B1XA 2VOZA 3FVOA 1AIVA 3KSJA 4DE8A 3UGWA 1LAFE 5AA2D 3H6UA 1NNFA 1A99A 1MS7A 4BDLA 1PDAA 1ZJLA 3N26A 1D4NA 2RINA 4FATA 3LBSA 1EZPA 2Y84A 2REJA 4FEDA 5AE4A 3HV1A 5HPQA 3KZGA 2Y7IA 1O63A 4M1VA 1I6BA 4LVQA 3GBAA 3IORA 3OXNA 3Q29A 1LBBA 4RYAA 1SVXB 3M3KA 4IO5A 1USYE 1DMBA 4POWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5ISUA 4U23A 4F19A 1SD3A 5I56A 1WODA 4XTCQ 1XVYA 4YKJA 4DZ1A 3M3LA 2ANJA 3WAEA 4NF4A 4YZZA 4IGTA 3E3KA 4NMYA 3QUFA 3IX1A 3OO9A 3OENA 3G3IA 1YAEA 4F2QA 4JBZA 3KOSA 2F35A 1FSAA 3IFAA 3N6TA 3ILUB 4NN3A 4I9DA 2F97A 2GHAA 4FJPA 3PGFA 2UVJA 4QFOA 3LSXA 3MP6A 4PC9A 4ELQA 4U1ZA 5JK4A 3FGSA 3AXFA 1B3HA 4GRKA 1FRPA 5AA2B 4X04A 4QSEA 2V93A 4PAKA 1NNKA 4GIZA 2O84X 4KD5A 2PMSA 3KC0A 3V5AA 1QJMA 4PFRA 4OVRA 3QK6A 3T22A 5CMMA 2UXAA 2OZZA 1B4ZA 4N6DA 3CVGA 4RJZA 1HSEA 2I4BA 4I3EA 1Q35A 2B4MA 4MFIA 4F3GA 4EF1A 2DXRA 1SI1A 3MP1A 2E1SA 4PE3A 3KN8A 4KQPA 5M2VA 5ET7A 3TKDA 2XWVA 3FASA 4N6KA 2Q2CA 2P2AA 4GWWA 4GL8A 1LFHA 2VD2A 4NF0A 2I4CA 3DELB 4PETA 3KEIA 3TELA 3U1OA 3T9XB 3IJOB 1H43A 3MPKA 1MRPA 2WYKA 2R8TA 2QFLA 4O3AA 3RT8A 4ZEFA 1ANFA 5I56B 1N76A 4P47A 3O2AA 4MAGA 5FHMA 3MQ9A 3R26A 1A55A 2HHMA 4KHZE 4NF4B 4PQJA 3S2VA 4MNIA 3CSBA 4LONB 1EZOA 4JDFA 2I0BA 3CFXA 3K01A 1FBGA 2I3WA 3BIHA 3N5LA 5H8SA 4ND9A 3H7MA 5CM6A 5H8NA 4YICA 2OX3A 1B05A 2QJEA 2CEYA 3TPAA 2VHAA 3IB2A 3CI8A 1FPJA 4GX3A 5L9SA 2ONKE 1B5JA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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