4G8HA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with licofelone at 1.88 a resolution
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
b'YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal structure of C-lobe of bovine lactoferrin complexed with licofelone at 1.88 A resolution
rcsb
molecule tags Hydrolase
total genus 112
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2012-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g8hA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g8hA02
4RK2A 2ZNSA 2XXHA 2QL3A 4PE5B 1UTBB 3T9XB 3IK6B 4F29A 2B3BA 2ZYMA 4G68C 4U23A 4FIMA 3EN3A 4KI0E 5H8FB 4KFQA 4ZEBA 1MPDA 2XXYA 1JW4A 1IEJA 3SEUA 4R6YA 3FVGA 4F18A 3E13X 4DXBA 2Z23A 1UTHA 1M5DA 4JWOA 1FQBA 3OO8A 2VD3A 4F1VA 5AA2A 4MFIA 1TFAA 3ODBA 4OTEA 5DVJA 2V25A 3CI8A 1MH4A 4H0WA 1B52A 2H99A 2AL4A 4BDRA 1Z7ME 5A5XA 1IXGA 1TXFA 3VLWA 2DWAA 3G3FA 3EPEA 3UIFA 1UQWA 1ZBMA 1OIBA 4M4GA 1QULA 3MPLA 1USYE 3TELA 1R9QA 3PUXE 2ZYNA 2V84A 3FD3A 4JB7A 3TFLA 1URSA 1OQGA 2VP1A 1NKXA 5JTYA 3OMBA 3H6VA 1MXXA 2Q2AA 2YJPA 5ITPA 4YMAA 5K2YA 3QXMA 4JWXA 4X9TA 3PMWA 1N76A 3C34A 3V89B 5I56B 1MY2A 4XKQA 3S9LC 3RT6B 3DP4A 1S7YA 4NF6A 3VLUA 1II5A 4OMBA 1M5FA 3BBRA 4GL8A 1ZIUA 3CFXA 2QS1A 3I5OA 3I3VA 4X1BA 3VV5A 2F34A 2ZMBA 2ABHA 3G3KA 3H6UA 3MWBA 1B3EA 3U92A 5AA4B 3IORA 1A8FA 4ZZEA 1ELJA 1JVXA 1FTJA 3MVZA 2ZXTA 3EHTA 1LB8A 1AOVA 3HHFA 1DTZA 5CBRA 3KN7A 4ZE8A 3LBSA 4G77A 1LBCA 2F78A 5ICTA 5AA1A 2F7BA 1HSEA 3EQ1A 4AB5A 2F7CA 4U4XA 5DT6A 4RNSA 4QSCA 3JV9A 2XX8A 3DP8A 1ANFA 4DDDA 2OWTA 2QS4A 1LAGE 4U4SA 4H5GA 3IB2A 5H8NA 5I57B 2XXVA 1NNKA 3FZVA 2DWHA 1JETA 2HZLA 5EHSA 3EHSA 4H67A 1MQDA 4YMBA 2R9JA 1A8EA 2V93A 3HO7A 2XX7A 1USYH 4OETA 4YB7A 3DLNA 3TPAA 3C4MA 1LBBA 2Q88A 3KOSA 1B1XA 1ZU0A 4ONYA 3R26A 3VVFA 4IGRA 1VSOA 2DWJA 3WAFA 4F1UA 2XXWA 4WEPA 4MLVA 5ICQA 3TTLA 4LUBA 3MZ1A 3OEMA 1B4HA 1PB7A 3CFLA 3GBAA 1MDQA 2O6AA 3FV2A 3T96B 1SDXA 1T0KA 3QK6A 1HSLA 5I2NA 4L17A 3PUYE 3T93B 2FNCA 2ONSA 3E4RA 1MY1A 4MF3A 2DOJA 4NF5B 3A09A 3MUQA 3O2AA 4P0IA 4OERA 3LUYA 2HZKA 3MQ9A 2ANJA 4R74A 1B7HA 2O7IA 2X7PA 1AL3A 4R9FA 3SESA 4MBPA 4F3BA 4NF4A 1NNTA 5IKBA 5DYHA 2QS2A 2HXWA 4LZ8A 4Z0IA 1PC3A 3RPWA 3RQTA 3B6WA 3VE1B 3PPQA 1SW4A 3PV0E 2RKMA 1SW5A 3ILTB 4YKJA 4EUOA 4WXJA 1LGBC 4QRZA 1EZPA 1IXHA 1AIVA 2I49A 2P2AA 4GVOA 3MBPA 4BDQA 1FTKA 1JVYA 4R2FA 3OELA 3SDFA 4OYVA 1URGA 4EF1A 2RCBA 4PFYA 4EF2A 4UACA 3VVEA 5ELVA 1SVXB 5I59A 4MLQA 3IOUA 3RY3A 2I0CA 3IOWA 2Z8EA 5KCJA 3H7MA 4GWOA 4LATA 4PETA 4H8JA 1MXZA 3FASA 1B5IA 3PUVE 4EQ7A 4LZ5A 1DPEA 1B9JA 1JW5A 4ZEKA 4FORA 2OK2A 2KLFA 4OZ9A 3M3KA 2Y84A 1I69A 1MY0A 3R6UA 2X7QA 3N94A 4MH5A 2A5TB 3TMGA 4YB5A 4HTGA 2Z22A 4N13A 4KPTA 1NNPA 2Y7RA 3K02A 5EHMA 1RYOA 3OO6A 5I58A 3O6IA 1LB9A 2Z8FA 4O3AA 1BP5A 3FJMA 3MZ9A 2HCAA 4XKPA 1Y1ZA 4Q30B 1OMPA 1POTA 3CRBA 2F5XA 2XXPA 3VXBA 5HBCA 1OLCA 3RNNA 3ILUB 5BUUA 3TODA 4FEBA 4ISUA 4BLAA 3GXAA 1P1QA 3MAMA 1OVBA 4DCYA 4KYEA 1H43A 3G3HA 5CRYA 2X26A 3SKPA 2F6GA 2OCUA 3OXNA 3SEXA 4ZEDA 3PPPA 1B2HA 3D4GA 2QMWA 1B1HA 3IO6A 4DIGA 2I6EA 4U22A 1QUIA 3W15C 3I6VA 1NMUA 4DZ1A 1PBPA 4F31B 1N84A 1BIYA 1US4A 2ZNUA 3M8UA 1B46A 3N6TA 1BLFA 1CB6A 4IO3A 4RPNA 4U1ZA 4LZ7A 4ND9A 1FTLA 1A7LA 4FECA 2BJJX 4QHQA 2DXRA 4EXLA 1N3WA 3K1NA 3ECRA 2LAOA 3TYHA 3TZAA 2QPQA 2F8DA 1I6QA 3MJNA 1IZ1A 5CMMA 3T66A 4NWDA 2DVZA 1A99A 1TT1A 2Q89A 3Q28A 3DELB 2PT1A 4ZDMA 1Y3QA 2Y7PA 2R71A 5FTIA 5I56A 1TWYA 1JNFA 4GIZA 2CZLA 1BKAA 3CIJA 2D3IA 3TQWA 4R72A 3HHGA 4TLLB 1FCKA 4BDNA 1MDP1 4I1DA 2CMOA 3L6GA 3TUSA 4JBZA 5AA4A 2UVGA 4R73A 5LOMA 3TAJA 1OVTA 4QFKA 3K0VA 4IY6A 2VHAA 1B0LA 1GR2A 3B7DA 3WAEA 3Q25A 1O7TA 1B3GA 1HSJA 3K00A 4POWA 3RT8A 2F7AA 3K01A 2GHBA 1KWHA 4OWDA 1O63A 2P0SA 1GV8A 1N04A 3Q29A 2QRYA 2PT2A 1P1OA 3VXCA 1CE2A 4E0WA 2ALUA 3LSLA 3E3KA 2REJA 4NWCA 1NH8A 4F3SA 1PB8A 4C1UA 4XXUA 3MZBA 2AL5A 3K6WA 4QFNA 4R9GA 3KG2A 3LSFB 5JEIA 1JEUA 3B6QA 1P1WA 2FA7A 2O1MA 4IGTA 2UVJA 2GH9A 3KZGA 4ZS9A 2H5YA 1NH7A 1P99A 5TPAA 3EHUA 1MQJA 2DP8A 3SEWA 4X48A 1DMBA 4U21A 2O69A 4TQUQ 1MXVA 4QSEA 2O1LA 1FTMA 4ZEFA 2NUVA 1MPBA 2HAVA 1LSTA 1ZKBA 3D4CA 4OENA 3S4UA 3V8XB 1SW2A 2RC7A 3PUZE 4JWYA 2Z8DA 5A5XB 4YKIA 4TOZA 5IAIA 1Y1MA 2H25A 1IXCA 4F1YA 1DTGA 1POY1 3RTWB 3IJXB 1LAHE 4Z7EA 1PEBA 4I8CA 5EYFA 4R75A 1QW0A 1WVJA 3DM0A 3QYTA 1SYIA 2DSFA 2RC8A 3TTKA 4N6PA 4K3FA 5DEXA 4O3BA 2AYSA 1JW1A 5JTYB 1R6ZA 3TTRA 1Y4TA 1B3LA 4IY5A 4OFJA 2DQVA 2DE4A 4G4PA 4ELRA 2Y7KA 1EH3A 2I4CA 3G7WA 2IEEA 4RXLA 4I9DA 3GBBA 1Y4CA 3C35A 2DWIA 3HN0A 3FUZA 4NF6B 2QMXA 4G68A 3TDJA 1MM6A 4H65A 3EF7A 4I62A 2HEUA 3MVYA 4IO2A 2IA4A 1PDAA 4G8MA 4YU0A 2GRVA 3P7IA 5L9MA 3MW0A 2VD2A 3FXUA 4XKRA 1EZ9A 1B58A 5TP9A 4YAHX 2XXQA 5ITOA 1MH3A 4HW8A 1R9LA 4QFOA 2E1SA 2DYXA 1YCJA 2G93A 3FXQA 5AE4A 3FVKA 4OEUA 1SBPA 4NF8A 2ONRA 2REGA 5H8NB 1B3HA 3UGWA 4YICA 2UVHA 3H06B 1IIWA 4ELOA 1LFHA 4KYSA 3PD9A 4ESWA 2XHDA 1Q35A 3N5LA 3QUJA 2I0BA 1MS7A 2F97A 4H1XA 3CR9A 3PMVA 3A3CA 1O64A 4YZZA 3LC8A 3SERA 4LA9A 4QFLA 4OVJA 3LR1A 2F35A 1US5A 2HQ0A 1VR5A 3IJOB 3FGSA 1PB9A 1P1NA 3T9HB 4LQ5A 3O29A 4BDLA 1XVYA 3UP9A 5DVIA 5I84A 3O9PA 3CVGA 4RPOA 1XVXA 4RY1A 4F19A 1LCFA 4Q8RA 1H76A 4X1DA 1QVSA 4OFOA 3OO7A 5CMKA 1LFIA 4G8HA 4F22A 4F2QA 2V3QA 4OEVA 5I2NB 1N7WA 1I6BA 3ZS6A 1B7UA 2NVUB 5H8HA 4JSOA 1MQGA 3KN8A 4G8NA 1MY3A 3RGYA 3KSXA 4YKKA 3JZJA 3IOTA 3O6HA 1M5EA 1WDNA 4OESA 3IL1B 1GVCA 4LQ2A 4NF4B 1A54A 1FW0A 4JXIA 2XD2A 3TKDA 1XC1A 4OFLA 5KDTA 2QJEA 3JYRA 3OO9A 3MP1A 3O28A 1B05A 5HPQA 2ZYKA 3IAZA 2Y7IA 3OD7A 3FXRA 1FQFA 2PMSA 1XT8A 3H4ZA 1SW1A 3KN3A 1UTBA 1H44A 3KOTA 1LCTA 3QIMA 2E0SA 1B6HA 3SEVA 2UYFA 4QFPA 3W9WA 2ZYOA 5H8FA 3K1PA 3RN8A 3A3UA 2XXXA 3FJ7A 3TCGA 4KCDA 4ZE9A 5I59B 4HS7A 3LSWA 3QAXA 5KCJB 4RA1A 3V83A 2PVUA 1M5CA 1B0HA 1QKAA 4GQOA 4N07A 4C1TA 2ONKE 3FJGA 4OQOA 2YLNA 3C36A 4IO5A 1MQIA 2RCAA 1UIVA 1QUKA 5ISUA 3VLVA 4FEDA 3K4UA 5I2KB 4HCWA 5B70A 3SETA 1FTOA 4O3CA 4FATA 3IO4A 4P11A 4PQJA 1WODA 3FIRA 5F7VA 4DE8A 4KD5A 3ONMA 5I58B 3N6UA 2Y7WA 2A5SA 5M2VA 1B4ZA 1MY4A 3C32A 1LFGA 3U8QA 4PFUA 1MQHA 3USDA 1VFEA 1MM7A 4QF9A 3KEIA 3Q27A 1QUJA 2NOOA 3S9NC 2O7UA 4RJZA 2B65A 1SQYA 3G3GA 2UXAA 1IQ7A 3K6UA 1N0TA 1OQHA 4H5FA 1B32A 3MVXA 2OWSA 3PPNA 4GRKA 4YKPA 4EXKA 2VOZA 2F6PA 3K6VA 3V5AA 4ELPA 1A55A 1URDA 3MP8A 1IUDA 2GFEA 2F36A 3M3FA 2THIA 3THIA 3IB0A 4EDPA 3TTNA 5FTHA 1Y3PA 5TU0A 4ELQA 5K2XA 3UN6A 2I48A 2DS9A 3KGCA 3H6WA 3QSLA 1S9TA 2O68A 2XXUA 4AQ4A 5CM6A 1MPCA 3ZSFA 2RC9A 1B7ZA 3CG3A 5H8QB 4KHZE 5H8SA 1N3XA 1A40A 4GL0A 5I57A 1VFDA 5AA3A 3PUWE 4LVQA 3S9MC 1FQAA 3PGFA 4ZEIA 4ESXA 1XHYA 5DTBA 4KYDA 2XXIA 3FVNA 4WEDA 3BFTA 4Q0CA 4F2OA 2VGQA 1VE4A 3PD8A 3K1MA 3MVWA 1F9BA 1AMFA 3FV1A 3UK4A 1AH5A 4R2BA 5JK4A 3IOVA 2V3UA 1SI1A 1LAXA 1UTHB 1Z7NE 3ZKLA 5AA2B 2ZNTA 1TFDA 3U72A 1EU8A 3OSQA 4FE8A 3B6TA 1B3FA 2I3VA 5CI5A 1FQCA 3VVDA 1NNFA 1J1NA 4DCXA 1RKMA 2O84X 1DSNA 4TLMB 4KQPA 4M1VA 4JDFA 4DXCA 1Y9UA 4OHNA 4PFTA 4E0XA 4NF5A 5L8DA 4ECFA 2M8CA 1P1UA 4XTCQ 1M5BA 3BFUA 3SEYA 4IO4A 1FQDA 4ZECA 1NL5A 3O6GA 4JSDA 5J1DA 4F3GA 4R6HA 3TCFA 4NMYA 2P1SA 4G2ZA 5FHMA 1B5JA 2AIXA 2NXOA 1B40A 4NTLA 5FHNA 3F11A 4FAJA 3CSBA 3H6TA 1UIUA 5HM4B 1PBQA 1XOCA 3HSTA 3RTFB 3KJ7A 2OBGA 1ZLQA 3GLBA 3T9VA 2PX1A 4XKNA 4H6DA 3OOAA 2V3TA 1MXWA 3AXFA 3C33A 3HCQA 3T22A 4FJPA 3U1OA 5TPAB 4LONB 1JEVA 2G29A 4GOTA 2QSXA 1D9VA 3PPRA 4R6KA 1MG1A 3MC2A 3S9EA 3IB1A 3IX1A 1IITA 1D3KA 4KCCA 5CMBA 5DVFA 2A5TA 3BKIB 3TEPA 1YPNA 5CMCA 2H98A 3PU5A 4PP0A 4RK9A 3L6HA 2RF1A 4POXA 1I6AA 4YB6A 2R6GE 5DEXB 4KR5A 3IR1A 2XX9A 1YAEA 4DLDA 2YPNA 3TCHA 3ZKKA 3OEKA 1MXUA 1FQEA 1SD3A 5CBSA 2Q9TA 4OXVA 4G68B 1SYHA 2RINA 3G3JA 1ZMGA 2D5WA 3HPIA 5KZTA 1IXIA 4UA8A 4GFRA 2NWJA 2I4BA 2UYEA 2OJTA 2B3FA 3R7XA 4QSDA 4AB6A 2WKYA 3W9VA 3FVOA 3DP6A 1DOTA 3S2VA 2GHAA 1DPPA 1RYXA 3M3LA 4EQBA 1L5TA 2PBWA 4NEDA 2XXTA 5I2KA 3MP6A 1Y20A 1MXYA 5TP9B 1D4NA 5CC2A 4P0GA 3U93A 3RUMA 3PPOA 5FHOA 4EQ9A 1XS5A 2H9BA 2W7YA 4Q5TA 2OZZA 1S50A 1JQFA 4NF8B 2O51A 2H4IA 1SI0A 4WKMA 4U2RA 2Q2CA 3UORA 1GTKA 2OLBA 4PFWA 2I3WA 3O97A 4IO7A 2I58A 4IO6A 3E9XA 3Q26A 2ESNA 3K6XA 4U1OA 4GD5A 1OLAA 3N26A 2UVIA 3O66A 1N7XA 4H8IA 2DE3A 1EZOA 3K2DA 2XD3A 2QS3A 3U94A 5AA2D 4DXUA 1QJMA 4GXAA 3CG1A 1B51A 3RLFE 5B7DA 3H03A 1NFTA 3UA8A 3HV1A 4GXSB 5F1QA 1ZJLA 3TQLA 5BWJA 4BDMA 2D21A 2PYYA 3T9UA 1ZTYA 5L9OA 3CSGA 1BTJA 1R1NA 1LLSA 3CFZA 1LAFE 2HFBA 3VDFA 4NE4A 4F39A 5H8HB 1YTVA 3MPKA 4IB2A 3C9HA 1H45A 3LSXA 2FYIA 3FATA 3KSJA 1H3DA 3VFJA 1QKBA 3OSRA 2DVCA 4ZZAA 3KBRA 5L9SA 1GGGA 3GZGA 1MRPA 4XIGQ 3H3GA 1Y3NA 4F3PA 1ATGA 1D9YA 3PMXA 1Q1KA 4HCYA 2DXYA 5H8QA 2Q8JA 5KDTB 4C0RA 2XXRA 4RYAA 4LP2B 3QUFA 4GLIA 4BDOA 4GF8A 3TTMA 3OENA 3KJTA 2DE2A 3KFMA 1B5HA 2HAUA 4THIA 3G3IA 3C31A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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