4G8HA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with licofelone at 1.88 a resolution
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
publication title Crystal structure of C-lobe of bovine lactoferrin complexed with licofelone at 1.88 A resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 112
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2012-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g8hA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g8hA02
2ESNA 3K6VA 1XC1A 5IKBA 4JXIA 2DP8A 2XXVA 2NWJA 3LC8A 3MZ1A 4LZ7A 3RNNA 3K0VA 3QSLA 3OEKA 3OEMA 1FQDA 4WKMA 4LZ5A 3O2AA 3SERA 1IZ1A 1SD3A 4QFOA 3UK4A 1UTHA 3MVXA 2VD2A 3A3CA 3FJ7A 1MXWA 1NKXA 1SW2A 3TEPA 4U4SA 4RY1A 1DMBA 4MLQA 2I3VA 2ZYOA 2QJEA 4FJPA 4ZEBA 2Y7PA 4NE4A 2XXRA 5HPQA 1B58A 1M5BA 5I56B 1TFDA 3TTKA 1O64A 1A99A 4XKPA 5H8HB 2PVUA 4EXLA 3I3VA 4N07A 1MXXA 1B3LA 5CMMA 4X9TA 4ELQA 4ZEKA 4KYEA 3LSXA 4F3BA 1GVCA 4JWXA 1IIWA 2QMWA 2ZMBA 1MY3A 4XIGQ 1MXYA 1T0KA 3MP1A 5F1QA 1WDNA 1ZMGA 2A5TA 2FYIA 3TUSA 3OD7A 1B5JA 2QS2A 1P1UA 3VVEA 4JBZA 3H3GA 4IY5A 3BBRA 3CFZA 5CC2A 1XVYA 1B32A 5H8FB 3M3LA 2ONKE 4KQPA 2I3WA 4PFYA 1B7ZA 2Q9TA 3FXUA 4WEDA 2VOZA 1USYH 3K6WA 1JEVA 2QS3A 3OENA 1QW0A 2ZXTA 3P7IA 3A09A 4DIGA 4XKNA 3ONMA 1A8EA 1XOCA 3KJ7A 3KN8A 4E0XA 2HQ0A 3MBPA 5DEXB 2Z22A 4LATA 4NF4A 1JEUA 4FECA 1OLCA 3KGCA 1MQIA 1MRPA 4OWDA 5KDTA 3KOSA 3CSBA 2PYYA 4NWCA 1TT1A 1Q35A 1S50A 3R26A 4QRZA 2XXHA 2XXQA 2H25A 2V3QA 3RGYA 1LSTA 3UA8A 2OCUA 2RC8A 1LFGA 1R1NA 3GXAA 5H8SA 2ZYKA 1PBQA 3LSLA 3JZJA 2RINA 4ZECA 3RQTA 2DOJA 4F3GA 4XXUA 3OSRA 3V8XB 1OVTA 3DLNA 1WODA 1Y9UA 4FEDA 2D5WA 3T9VA 1LFHA 4X1BA 1QJMA 2QSXA 3G3KA 5BUUA 3VLUA 2ABHA 5ICTA 5DVJA 3N6UA 4RYAA 2V25A 4MBPA 1H43A 3I5OA 3G3HA 1P1OA 4NF5A 3C34A 4LA9A 4R72A 1D4NA 2DYXA 4QFPA 1AMFA 3FUZA 3ILTB 3DP4A 5I58B 3RY3A 1MQJA 1M5DA 1B4ZA 3HHGA 1B5IA 3O6HA 4YAHX 3MZ9A 5IAIA 4GL8A 4DCXA 1FTMA 1B0LA 2Q2CA 3D4CA 1B2HA 1A40A 2XXWA 5CM6A 3ODBA 1H3DA 2DVCA 3TDJA 3O29A 2V93A 2GRVA 3EHUA 4G68C 4MLVA 1MQHA 1POTA 3TTRA 1OLAA 5L9SA 1QVSA 3DELB 1JW1A 5TPAB 3VV5A 4G4PA 1DPPA 4ZEDA 1JQFA 1M5EA 2HZKA 3HV1A 3PUWE 3QUJA 5JK4A 1JW5A 4RK2A 2HAVA 3UORA 3MWBA 1ZIUA 1UTBB 2Z8EA 3TFLA 4FORA 1MS7A 1GR2A 1MG1A 1FCKA 4RPNA 1VFEA 5AE4A 1ZU0A 3CSGA 3IOWA 5EHMA 4H0WA 3T93B 2GHBA 4C1TA 2OK2A 1IXIA 1DTZA 1MXZA 1MQGA 1F9BA 2UYEA 3TCHA 1SI1A 4BDQA 5EYFA 1A54A 2DWHA 1EH3A 4KPTA 4N6PA 1A55A 3HSTA 3BKIB 1NH8A 4OVJA 1IXGA 2DE4A 4YU0A 3DP6A 2RC9A 3N6TA 1B51A 3PD9A 3VLVA 5I56A 4GL0A 5ITOA 2Y7IA 3DP8A 3JV9A 1B40A 5H8HA 1SW1A 3CI8A 3V83A 4KR5A 5TU0A 4MFIA 1B3FA 1DOTA 5H8QB 4O3BA 2WKYA 2UXAA 3Q27A 1QUJA 4OFLA 3UGWA 4QSCA 3PUVE 4X48A 2REGA 3QYTA 2O51A 2F5XA 3V89B 1MDQA 3C33A 5AA3A 1JW4A 1URDA 3UIFA 5KCJB 4EQBA 1LBBA 1GV8A 1SW5A 5JTYB 3C36A 4F2QA 3E9XA 1EZOA 2V3TA 1M5CA 4NF6B 2HCAA 1RYXA 1D3KA 2DSFA 3FV1A 2O1LA 3E13X 1FTJA 4DXUA 1QULA 3EHSA 3T9HB 2W7YA 5H8FA 4ELPA 3DM0A 3T96B 1MH3A 3TPAA 3RUMA 4TOZA 2GHAA 1Y3NA 4RXLA 2PT2A 3TODA 3PUYE 4G8MA 2RF1A 3CG3A 2NXOA 3K2DA 2G29A 2V3UA 2E0SA 5FTIA 4OQOA 3U8QA 2RCAA 1JVYA 1XHYA 2P1SA 1JETA 1DSNA 5DEXA 2HZLA 4U21A 3RN8A 3SEVA 1SYIA 5H8NB 2AL4A 1LB9A 3ILUB 5A5XB 1R6ZA 1P1NA 4F22A 3GZGA 3CFLA 3R6UA 4H67A 2M8CA 4U1OA 4YB5A 1NNKA 4EF1A 5I2KB 2DWAA 2F78A 2O6AA 3RTFB 4OETA 3U72A 1TXFA 2HFBA 2DE3A 2DWIA 3E3KA 1HSLA 1GTKA 5HBCA 1P1QA 4YB6A 4I62A 1UQWA 4UACA 1NNFA 1MPBA 1B1HA 1ELJA 3KJTA 4RNSA 3HCQA 1PEBA 1FW0A 4EXKA 3M3KA 5L9OA 4ZDMA 3WAEA 2H98A 4Z0IA 1Y3PA 2REJA 2X7PA 1IUDA 1FQAA 5DTBA 3OO8A 4EF2A 1AH5A 3MPLA 1N7WA 5JEIA 4OERA 4RJZA 4BDLA 5AA4B 5I58A 3FVKA 3S9LC 3SEUA 3IB1A 3FVGA 2ANJA 1B05A 1ATGA 1MDP1 4QSEA 3KEIA 3RTWB 1S7YA 3FJGA 3CVGA 4U2RA 1N7XA 3LBSA 1IQ7A 2YPNA 4NTLA 3BFTA 4U23A 3ZS6A 4AQ4A 4POXA 5CBRA 3LR1A 3T22A 4XKQA 1XVXA 4OMBA 2OZZA 3OMBA 4OHNA 1B46A 1BKAA 1MY4A 4F18A 2DE2A 3K01A 1B4HA 5TPAA 2NOOA 2O84X 2DQVA 4G68B 1P1WA 1UTBA 1I6QA 2UVGA 3S9MC 2G93A 2BJJX 4GOTA 1O7TA 2B65A 1I6BA 3PPOA 2Y7RA 2XXXA 3KFMA 1B7UA 1B52A 1LCTA 4YB7A 4R74A 4F1UA 4U1ZA 4IO2A 3KZGA 2FA7A 3TMGA 1N04A 1YTVA 1Y3QA 5F7VA 4EQ9A 3UP9A 1GGGA 4F19A 1Q1KA 3PPQA 3Q28A 5FHOA 3MVZA 5I57B 5CMKA 3HPIA 3S2VA 1N84A 4ZS9A 4NWDA 1PDAA 2UVIA 5B70A 3FXRA 2QL3A 4LQ2A 2PX1A 3I6VA 2ZYMA 1LGBC 4YKPA 4OXVA 1LFIA 5H8QA 3VVFA 3SETA 1NL5A 2VHAA 4GVOA 4PP0A 1SDXA 4ONYA 2D21A 2XXYA 2I48A 1ZBMA 2ZNSA 4JSOA 5DVFA 5AA2B 3H06B 5KCJA 3Q26A 4DDDA 2OLBA 4EDPA 5JTYA 4H1XA 4C0RA 1SW4A 3MJNA 2R9JA 4G8NA 4NF6A 3KSJA 5AA2D 1Y4TA 1IEJA 2F6PA 1VSOA 3OELA 2DWJA 2GH9A 3B7DA 1VFDA 4EQ7A 3G3IA 3VLWA 3PUXE 4FAJA 4RK9A 2YJPA 4R2BA 3TQWA 1WVJA 3MW0A 1US4A 3OO6A 3QXMA 4JWYA 1ZJLA 4R75A 2NUVA 4GF8A 5ICQA 4YZZA 1R9LA 1AL3A 4P0GA 4U22A 2F7CA 3B6QA 2RKMA 4ND9A 3VXCA 4H6DA 2AYSA 4R6KA 4F31B 3M3FA 3PMVA 2Z23A 3PU5A 4NF8B 5EHSA 3ZKLA 4JWOA 4PETA 5A5XA 2B3BA 4BLAA 1SYHA 3G7WA 4MF3A 1LAHE 2THIA 4LONB 3MC2A 4G77A 2UVJA 5I2KA 3K4UA 2F36A 1MY1A 3IB0A 1SQYA 4TLLB 2Z8FA 3ZSFA 4BDMA 1ZLQA 1Z7ME 4H5GA 2Y7KA 3TZAA 4GXSB 4ZEIA 3O97A 4Z7EA 3PPNA 3PUZE 4LQ5A 3KBRA 1N3WA 2R6GE 4JDFA 4YMAA 3OOAA 2Q8JA 1B3EA 1N0TA 2F6GA 4DZ1A 2XD3A 5B7DA 4H8JA 4AB5A 1O63A 2F97A 1OMPA 1PB8A 4R9GA 5FTHA 4IO6A 3FVOA 4ZEFA 3KN7A 2I4BA 4K3FA 4GQOA 3KN3A 3S4UA 3CIJA 5AA4A 4POWA 2IEEA 1SVXB 2O68A 1XT8A 3K00A 3B6WA 1L5TA 1BP5A 3FASA 4G8HA 4GRKA 5ITPA 4HW8A 3PMWA 3FJMA 3IOVA 3LUYA 5FHMA 1RYOA 3HO7A 1IXHA 4M4GA 4I8CA 3RT8A 5L8DA 2AIXA 3JYRA 2ZNUA 3PGFA 4G68A 2O1MA 2QMXA 2I58A 4KYDA 1FQBA 2PMSA 2X7QA 4OEUA 1B3GA 3SKPA 3QAXA 1TFAA 3KOTA 1Y20A 3N26A 2P0SA 3OSQA 1Y1ZA 3Q25A 5CMBA 3PMXA 2KLFA 2XX9A 3IOTA 4R2FA 3EF7A 3KG2A 3VVDA 1OQHA 4ZZEA 4FEBA 4GXAA 4GLIA 4KD5A 5I2NB 1Z7NE 1TWYA 2XXPA 3WAFA 4IO3A 3H6TA 5AA1A 2Q88A 4DXBA 2F35A 4UA8A 2XD2A 5I57A 3TKDA 3QK6A 3C32A 2GFEA 3O9PA 3USDA 3TCFA 3MZBA 3IORA 4NEDA 4BDNA 1VR5A 1KWHA 3TELA 3TAJA 3MVYA 3CG1A 3C35A 3L6GA 3QUFA 3V5AA 4OFOA 1MM6A 1H76A 4XKRA 1B0HA 5BWJA 4IGRA 1MXVA 4LZ8A 1H44A 2O7IA 1I6AA 3K1NA 1MY0A 3VDFA 1Y1MA 5AA2A 2B3FA 4HS7A 2XX7A 2LAOA 3MP6A 1YAEA 4IO5A 1N76A 1LBCA 5FHNA 4IGTA 3U93A 1URSA 2I49A 5K2XA 1MM7A 4AB6A 1FTOA 3U92A 1DTGA 4H5FA 3C9HA 2D3IA 2R71A 5TP9B 4ESXA 3MQ9A 4EUOA 4YKJA 1URGA 3EPEA 1NMUA 4JB7A 1DPEA 3K1PA 3GBAA 4N13A 1BTJA 5CI5A 1US5A 4R73A 1ANFA 1OQGA 1PB9A 3G3JA 3FGSA 1JNFA 4XTCQ 3K6XA 4R9FA 4QFLA 2VGQA 2QPQA 4PFWA 4QSDA 4WXJA 1PB7A 1D9YA 1MY2A 2ZNTA 4ZE8A 3S9EA 3TQLA 3RPWA 2RCBA 3D4GA 3IB2A 2OBGA 3N5LA 4YKIA 1I69A 5L9MA 4IB2A 2F7AA 1MPDA 3EQ1A 4I9DA 3O6IA 3SESA 3FIRA 4BDOA 2QS4A 4NF8A 1IXCA 2RC7A 5KZTA 1B5HA 3UN6A 3ZKKA 1VE4A 4F1YA 3MPKA 4H8IA 3TTMA 1B6HA 1A7LA 4YICA 2QRYA 3IK6B 2H99A 3T9UA 2I0BA 3C31A 3TTLA 4H65A 3HHFA 3PPRA 3IOUA 3C4MA 3IL1B 1M5FA 3A3UA 3CR9A 5DVIA 1CE2A 2O69A 1NH7A 4THIA 1LAGE 4Q5TA 4ESWA 3SEYA 3THIA 3CRBA 3QIMA 1CB6A 1ZKBA 1MPCA 3FZVA 3RT6B 1JVXA 4LP2B 4JSDA 2IA4A 2NVUB 1HSJA 2YLNA 1LB8A 1SBPA 4ECFA 1QUIA 1NNPA 1PC3A 4TQUQ 1POY1 4YMBA 2UYFA 2ALUA 1SI0A 3IJOB 4ISUA 1NFTA 1P99A 4QFNA 3O66A 1LCFA 1OIBA 1USYE 5I59B 4HCWA 2UVHA 4Q0CA 4P0IA 5CRYA 2HXWA 3K1MA 4QHQA 4ELRA 3EN3A 3OO9A 4MH5A 4KI0E 1J1NA 3K02A 4F29A 1B7HA 1FQEA 4HTGA 3L6HA 4PQJA 3MP8A 4OENA 4I1DA 5K2YA 4QF9A 1IITA 2CMOA 1UTHB 2E1SA 4LVQA 4ZZAA 5ELVA 3T9XB 2H9BA 3FATA 3SDFA 1NNTA 3FD3A 1R9QA 4X1DA 3H7MA 3S9NC 2DXRA 2OJTA 4TLMB 5LOMA 3M8UA 3GLBA 1PBPA 1QUKA 1II5A 4OFJA 4OZ9A 4E0WA 5ISUA 2Y7WA 5I2NA 3IO6A 1EZ9A 4OEVA 2I4CA 3SEXA 3EHTA 1YCJA 4WEPA 1B3HA 1RKMA 3RLFE 1FTKA 2Z8DA 5H8NA 1BIYA 1S9TA 4F1VA 2A5TB 2H5YA 3O6GA 3BFUA 2OWSA 4KCDA 2DVZA 3IO4A 4HCYA 4M1VA 4RPOA 4L17A 1ZTYA 4R6HA 2O7UA 3U1OA 1FQCA 5M2VA 3W15C 2VD3A 1AOVA 4FIMA 3IAZA 2ONSA 3W9VA 3K6UA 3W9WA 3FV2A 3OXNA 2ZYNA 4G2ZA 3MUQA 2DXYA 5J1DA 4IO4A 3MAMA 1AIVA 2P2AA 1MXUA 5I84A 5TP9A 1EU8A 4GIZA 4IO7A 1H45A 4ZE9A 1YPNA 4NF4B 2QS1A 4IY6A 2PBWA 4F3PA 1XS5A 4KYSA 3R7XA 2XXUA 4F3SA 2X26A 3ECRA 3KSXA 4GD5A 5KDTB 3PV0E 4C1UA 2I6EA 1B1XA 1A8FA 4KCCA 2ONRA 2XX8A 4FE8A 3G3FA 3E4RA 3FVNA 3H6VA 3OO7A 4DXCA 4FATA 2Y84A 1QKAA 2HEUA 1OVBA 4PFTA 4F2OA 4O3AA 3PD8A 4PE5B 1FTLA 2Q89A 3MVWA 3VE1B 1MH4A 2OWTA 2F7BA 3F11A 3LSWA 3PPPA 1UIVA 1MQDA 2DS9A 4DE8A 4OESA 2PT1A 4OYVA 1Y4CA 1EZPA 3Q29A 2AL5A 1LAFE 5HM4B 3CFXA 4R6YA 3H4ZA 3HN0A 4F39A 3FXQA 4BDRA 5DT6A 3IX1A 3LSFB 2FNCA 4NF5B 3GBBA 4GFRA 4ELOA 4QFKA 3AXFA 2F34A 1B9JA 3H6UA 2H4IA 3IR1A 3G3GA 4O3CA 4P11A 3TYHA 4GWOA 4KFQA 4Q30B 1HSEA 2F8DA 1UIUA 2A5SA 4U4XA 1D9VA 3VFJA 1N3XA 4LUBA 2XHDA 2VP1A 2XXTA 5CMCA 3H03A 3U94A 4DCYA 3TTNA 4Q8RA 3B6TA 4YKKA 1BLFA 3O28A 4PFUA 3N94A 1QKBA 3VXBA 3SEWA 4DLDA 3TCGA 2CZLA 3IJXB 3T66A 1FQFA 2I0CA 5CBSA 1LAXA 5I59A 4RA1A 4KHZE 3H6WA 2Q2AA 1LLSA 5DYHA 2XXIA 4NMYA 4OTEA 2HAUA 2V84A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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4FECA 2MKZA 1OLCA 3KGCA 1MQIA 1MRPA 4OWDA 5KDTA 3KOSA 2QVRA 3CSBA 4H45A 1DCUA 2PYYA 4NWCA 1TT1A 1Q35A 1S50A 3R26A 4GBWA 4QRZA 2XA5A 2XXHA 4PGPA 2XXQA 4HXVA 2H25A 2V3QA 3RGYA 1LSTA 3UA8A 2OCUA 2RC8A 1LFGA 1R1NA 3GXAA 5H8SA 4X8RA 2ZYKA 1PBQA 1FBHA 5EQ9A 3LSLA 3JZJA 2RINA 4ZECA 3RQTA 2DOJA 4F3GA 4XXUA 3OSRA 5EYHA 2WX9A 4MNIA 3V8XB 1OVTA 5EYGA 3DLNA 1WODA 1Y9UA 4FEDA 2D5WA 3T9VA 1LFHA 4X1BA 1QJMA 2QSXA 3G3KA 5BUUA 3VLUA 1FPIA 4PCDA 2ABHA 5ICTA 5DVJA 3N6UA 4RYAA 2V25A 4MBPA 1H43A 3I5OA 3G3HA 1P1OA 4NF5A 3C34A 4LA9A 1NI9A 4R72A 1D4NA 2DYXA 4QFPA 1AMFA 2FIEA 3FUZA 3ILTB 2V4CA 3DP4A 4N4UA 5I58B 3RY3A 1MQJA 1M5DA 1B4ZA 3HHGA 1B5IA 1FBDA 3FXBA 3O6HA 4YAHX 3MZ9A 5IAIA 4GL8A 4DCXA 1FTMA 1B0LA 2Q2CA 3D4CA 5I5PA 1B2HA 1A40A 2XXWA 5CM6A 3ODBA 1H3DA 2DVCA 3TDJA 2WYKA 4DI3D 3O29A 4P3LA 2V93A 2GRVA 3EHUA 4G68C 4MLVA 2Y5LA 4NN3A 1MQHA 1POTA 3TTRA 1OLAA 4I3YA 5L9SA 1QVSA 3DELB 5ET6A 1JW1A 5TPAB 3VV5A 4PF6A 4G4PA 1DPPA 4ZEDA 1JQFA 1M5EA 2HZKA 3HV1A 3PUWE 3QUJA 5JK4A 1JW5A 4RK2A 2HAVA 3UORA 3MWBA 1ZIUA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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