4G8HA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with licofelone at 1.88 a resolution
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal structure of C-lobe of bovine lactoferrin complexed with licofelone at 1.88 A resolution
rcsb
total genus 112
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2012-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g8hA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g8hA02
5H8QA 2F34A 3FASA 4G4PA 3H7MA 5AA2B 4F1VA 2BJJX 3CG3A 3Q26A 3TTKA 3TQLA 1ZLQA 4RXLA 2ZYMA 4QFPA 3KJ7A 2V84A 4QFLA 1HSJA 1SW4A 2ALUA 2UXAA 1OMPA 4MF3A 1LGBC 1IXIA 3JZJA 1MXVA 3G3KA 5AA4A 5CM6A 4YAHX 1B3FA 5BWJA 2UVHA 2QMXA 2O1MA 2V3TA 5DVIA 3LR1A 2P0SA 1VR5A 1N0TA 4G68C 5I2KA 2RCAA 3N6UA 1CB6A 3A09A 1SVXB 3QAXA 4OEVA 3ECRA 1OLAA 1OQHA 3M8UA 2V3UA 4YB5A 4G68A 1Y4TA 3VLUA 4GXSB 4BDQA 4X48A 4PP0A 4KPTA 1SBPA 1I6AA 4HCYA 4NF5B 5H8QB 4GFRA 5H8HA 4QSEA 4ESXA 3M3FA 1Y9UA 3IK6B 4YMAA 3VXCA 2OJTA 3B7DA 3T22A 1P1UA 1IQ7A 3T9UA 1Y1MA 4LZ8A 4P0IA 1A99A 2RC7A 2YLNA 1NKXA 4I62A 4JBZA 4OENA 1FTOA 4JDFA 1WVJA 4MH5A 3U8QA 3PD9A 4R6KA 4EXKA 4QF9A 5AA4B 4Z7EA 3G7WA 4RNSA 5DYHA 1B6HA 4GOTA 3FGSA 2XXWA 3PMVA 1OVTA 5EHMA 5I2KB 3U93A 3S4UA 2E0SA 1VSOA 4N6PA 3V89B 3QIMA 2XXUA 5ITOA 1DSNA 4ELRA 3OSQA 2OWTA 2OK2A 2Q88A 3SKPA 4G68B 1H45A 4NE4A 2GHAA 4OEUA 4H1XA 1PBPA 2GFEA 1XVYA 2DQVA 3FVGA 3RUMA 4H6DA 5H8HB 1OVBA 3O29A 1LCTA 4NTLA 1QKAA 2H98A 1N7WA 3T9VA 1SYIA 1BLFA 4OWDA 3O9PA 2DE4A 2F78A 4F3BA 2ZXTA 2DWAA 3LSXA 5ITPA 3HHFA 4OQOA 3WAEA 2DVCA 3VVDA 3OO6A 3IR1A 3G3JA 2NOOA 1B0HA 1PB8A 4IGRA 4EF2A 1MQJA 2H25A 3MP6A 2F7CA 5EHSA 1LAGE 3H3GA 3UORA 4Q8RA 3FD3A 4C1UA 3I6VA 1SYHA 4R6YA 1FQEA 2HZLA 1MY0A 1MXZA 4PETA 3TKDA 2XXTA 1A8FA 1URSA 4XKNA 4U1OA 3GXAA 2DWIA 4POWA 3UIFA 3K2DA 3MQ9A 3ILUB 1B3EA 3P7IA 2O7IA 2HEUA 3QUJA 4GRKA 3KG2A 1JW4A 1HSLA 1OIBA 4ISUA 3S9EA 1MS7A 3SESA 1MDQA 1EZOA 5TPAB 3FXRA 1NL5A 1POTA 4DXUA 3T93B 2NVUB 5DVFA 1ATGA 1XT8A 1H44A 5L9MA 5I58A 1B05A 1MM6A 3VVEA 3HPIA 1QUJA 2XXQA 1SD3A 3F11A 1P99A 5AA2D 4F22A 3M3KA 4R74A 3O2AA 2DE3A 4KYEA 1BP5A 4NF4A 1CE2A 4Q5TA 4QHQA 1NMUA 4G77A 1Z7NE 2ONSA 3CVGA 3TCHA 3PV0E 3KJTA 5DEXB 2OZZA 4OVJA 4ZECA 4DZ1A 3MAMA 2ONRA 3O28A 1B1HA 5ELVA 4I8CA 2VGQA 3M3LA 4FECA 5KCJA 4OYVA 1DOTA 2I3WA 4H5FA 3UN6A 4ZEBA 1Y4CA 4EUOA 1B52A 1URGA 2HAUA 1MQIA 3KEIA 1A40A 2DXRA 4R2BA 3KZGA 1AIVA 3OEKA 3QXMA 5FHNA 2XXXA 3O66A 1PB7A 3TTNA 4JSOA 2Y7WA 4PFUA 4YB7A 3K01A 3MBPA 2E1SA 3KOSA 1DTGA 3PMWA 5I58B 2DXYA 5ICTA 4IO2A 5JTYB 5K2YA 4FATA 1DTZA 1JW5A 2P2AA 3IL1B 2O51A 4RY1A 4RYAA 1FTKA 3OEMA 4NF4B 4FEDA 3TELA 1GGGA 1GVCA 2XXPA 1P1NA 5HBCA 2DS9A 5FTHA 3RN8A 3H4ZA 2R9JA 3KOTA 3B6QA 1SQYA 1M5CA 3GBAA 4Z0IA 3KSXA 4OFJA 4ZE8A 4QFKA 1PEBA 3IOVA 3T9HB 4EF1A 3PUZE 5LOMA 5KCJB 3K1MA 5TP9A 1FW0A 2XX9A 2VD2A 1MQDA 2CZLA 3PMXA 3VLVA 1QUIA 2ONKE 4KYDA 3SETA 1UQWA 5L9SA 2DSFA 3IOUA 3H6WA 5CMMA 2D3IA 3IB0A 1Y3NA 1R9LA 3H6UA 4ND9A 2RC9A 4GWOA 1MXYA 4F39A 4U4XA 4ZEIA 3QK6A 3RLFE 1AH5A 4H8IA 5KZTA 1ZIUA 4G8HA 5FHOA 3S9NC 4BDMA 2VD3A 4IB2A 5DTBA 5FHMA 3IJXB 2DYXA 2V93A 4I1DA 3MPKA 1BTJA 1IZ1A 3IB1A 4PFYA 3E3KA 3K6VA 5IAIA 4H5GA 3CR9A 2Z23A 3K6UA 3IAZA 2Q8JA 1USYE 1RYXA 2RCBA 3FV2A 3Q27A 2AL4A 4Q0CA 4FE8A 4OTEA 4DXCA 4DCYA 3K6XA 2PVUA 4AB5A 3DLNA 2F6GA 1VE4A 2RKMA 1I6QA 1KWHA 1QVSA 3SEXA 3OELA 1LLSA 5EYFA 4U4SA 1IUDA 1GTKA 2UVIA 4R6HA 2ZMBA 5TP9B 1WDNA 4YKPA 3K0VA 4WXJA 1YCJA 1OQGA 4JSDA 4IO4A 1MM7A 1A7LA 3CRBA 1JEUA 3D4CA 3K1NA 2DVZA 3VFJA 4ZEDA 5ICQA 2XXIA 3E13X 2YPNA 1J1NA 1EH3A 3S2VA 3PUWE 3O6IA 5I84A 1IITA 1XS5A 3IOTA 4ECFA 4YICA 1EU8A 4X1DA 4XIGQ 3MUQA 3PU5A 4PE5B 3TTRA 4KCDA 1FQAA 2DP8A 3VXBA 4GVOA 2Q2AA 3C9HA 5I57A 2QS2A 1HSEA 1DPEA 5AE4A 3I3VA 1JW1A 2XXYA 4R75A 3IOWA 3UK4A 3GZGA 1N3WA 3EHUA 3G3FA 1B40A 2UVGA 3Q29A 3B6TA 2VHAA 1DPPA 2F7BA 4JWOA 2CMOA 3N6TA 4PQJA 3GBBA 3OOAA 4GLIA 2B3BA 2QL3A 1S7YA 2PT2A 4OZ9A 2OWSA 5F1QA 2FYIA 1PDAA 1R6ZA 5H8NA 5HM4B 2HAVA 4DDDA 1M5EA 4E0XA 2R71A 3U92A 4OERA 4QRZA 1IEJA 3FJ7A 4KHZE 3C34A 3KSJA 2G93A 3PGFA 3L6GA 3K1PA 1RKMA 2F8DA 1JVXA 3E4RA 2HFBA 5I57B 1UTHA 4U23A 4RK2A 4XKQA 4LQ2A 3ZKLA 3H6VA 4LZ5A 4O3AA 4GL8A 4YB6A 1EZ9A 4R9GA 5TPAA 1TXFA 3OO9A 4ZZEA 4F2QA 3TDJA 1MQHA 3KN7A 2GH9A 2H9BA 1US4A 4RPNA 2ABHA 3Q28A 1B4ZA 2LAOA 3HN0A 5I2NA 2ZYKA 1YAEA 3LC8A 4F18A 3B6WA 1FTLA 1H43A 1XC1A 1LCFA 4NF8A 3C4MA 3LBSA 5H8NB 2A5SA 1SW2A 4GF8A 5DEXA 1MY3A 1FTMA 2Z22A 1GV8A 1TWYA 4EDPA 4PFTA 3O6HA 1B3HA 3EF7A 1NNTA 1TFDA 1MY1A 1XVXA 1QUKA 5CI5A 4ZS9A 1LBCA 1B46A 4ESWA 1MXXA 3G3IA 1PBQA 1UTHB 2D21A 4EXLA 2PT1A 3MVXA 3TUSA 2I48A 2B65A 1N04A 5IKBA 3MWBA 3TTMA 4TLMB 3W9WA 2ZNTA 2UYEA 3DP4A 4FIMA 3FXQA 3UGWA 3TODA 3DM0A 1MH4A 2VOZA 2O68A 3W15C 4KQPA 4BDNA 1OLCA 1N3XA 4BDLA 4H8JA 5AA3A 2ZYNA 5JTYA 2IA4A 1MG1A 3TCGA 4IO7A 4FEBA 5I2NB 3MVZA 3CSGA 2O1LA 1LAXA 4F2OA 5L9OA 1NH7A 1H3DA 3LUYA 2RINA 1B7UA 4DXBA 3CFZA 5CMKA 4NF8B 4KYSA 1WODA 4YKIA 1B5HA 2QSXA 2GRVA 3MC2A 3DELB 3DP8A 1MXUA 4XTCQ 3TYHA 3IORA 4OFOA 4AQ4A 1LSTA 3WAFA 5I56A 4HS7A 5TU0A 3DP6A 4F1UA 2NXOA 5I59A 3VE1B 2F97A 4ZZAA 2X26A 1D4NA 4O3BA 1UIUA 1O7TA 2Y7RA 2NWJA 2O84X 1Y1ZA 3TFLA 1NNFA 3QUFA 3TTLA 2OBGA 1ZJLA 2R6GE 5CBSA 5H8FA 1P1QA 2PX1A 3QYTA 5K2XA 3RPWA 3PUVE 4DCXA 1T0KA 3OENA 1S50A 4IY6A 1N84A 1SI1A 1MPCA 3HHGA 2AIXA 4XKRA 4YU0A 2G29A 3K4UA 4JB7A 1MPBA 1R1NA 4X1BA 4ZEFA 2ESNA 1JEVA 1SDXA 5HPQA 2HQ0A 2HCAA 2H5YA 3MVYA 2F7AA 3U94A 3IX1A 1M5DA 3PPRA 1AMFA 3HSTA 2NUVA 4GIZA 3ODBA 4U2RA 4XKPA 2A5TA 2ANJA 5I56B 3OO7A 3PPPA 1B7ZA 3C35A 3RTWB 2I58A 3IJOB 5I59B 3SEWA 3MP1A 1SW1A 3W9VA 4RJZA 3CFLA 4NF6A 2Y7KA 5H8FB 4YMBA 4TOZA 4HTGA 3MP8A 3D4GA 2AYSA 3UA8A 2PMSA 4I9DA 2HZKA 4F29A 5JEIA 1B2HA 1B32A 2XXHA 3RT8A 4DIGA 4BDRA 3VLWA 4K3FA 3V8XB 2QS3A 1EZPA 3H6TA 3LSFB 2REGA 3MZ9A 4OETA 3CIJA 4P0GA 1S9TA 3IB2A 1RYOA 1QKBA 1USYH 3RT6B 4OMBA 4EQ7A 1ZTYA 1NNPA 4F3SA 2OCUA 4M1VA 3VVFA 4E0WA 3FZVA 1D9YA 1FCKA 1FQDA 4WEDA 3HCQA 2A5TB 4QSDA 3TZAA 3FVOA 1QULA 2I0CA 2Z8EA 4G8NA 4KI0E 4M4GA 3H03A 4LA9A 2M8CA 3FATA 4FORA 4AB6A 5B7DA 4NMYA 5M2VA 2F5XA 4QSCA 4NF6B 4H65A 3IO6A 1B58A 3FV1A 2QPQA 4HW8A 5A5XA 1MQGA 4JXIA 1Q35A 4F1YA 3TEPA 5CMCA 3K02A 2Y7IA 1QJMA 3MW0A 1YTVA 1O64A 4C0RA 1DMBA 3RGYA 2DWJA 1NFTA 5CC2A 3KFMA 4P11A 3A3CA 3V5AA 5JK4A 3CSBA 1ZBMA 1M5FA 3S9MC 1LFIA 3N26A 5CRYA 2XHDA 1BKAA 4LATA 5B70A 1B5JA 3N94A 3OXNA 4MBPA 1SI0A 4ZE9A 3C36A 3MJNA 4F3PA 1TFAA 4ELQA 4IO3A 4U21A 1LB9A 5KDTA 4BDOA 1GR2A 3FIRA 3FVNA 1QW0A 4OFLA 4GD5A 3VV5A 3EHSA 5FTIA 4ELOA 2XD3A 5F7VA 4G8MA 4FAJA 4YZZA 2HXWA 4UA8A 1L5TA 3MZ1A 1LFGA 2YJPA 1LAHE 4R9FA 3TMGA 4F19A 1URDA 4H0WA 1IXHA 1JVYA 1H76A 3AXFA 3TPAA 2FNCA 2RF1A 4PFWA 3LSWA 2Q9TA 3N5LA 3MZBA 1B5IA 3THIA 1MXWA 3LSLA 4R73A 4G2ZA 5A5XB 3SDFA 4OXVA 3SEUA 4F31B 2ZNUA 4N13A 3SEYA 1JNFA 5AA1A 2F6PA 2QRYA 4RA1A 1XOCA 2THIA 2KLFA 2UYFA 3RNNA 1Y20A 1B7HA 1FQFA 1UIVA 2DE2A 3H06B 4GXAA 3PUYE 1JQFA 3HV1A 4IO6A 5KDTB 1UTBA 4TQUQ 3C32A 3JYRA 4TLLB 3RY3A 4UACA 4F3GA 2DWHA 2W7YA 2Z8DA 3K00A 2PBWA 4OESA 1SW5A 4LQ5A 2B3FA 1F9BA 2H99A 2Y7PA 1Q1KA 3KGCA 2ZYOA 1IXGA 1FTJA 2ZNSA 2X7PA 1NNKA 3FJGA 1ZU0A 1I69A 4U1ZA 3SERA 1P1OA 1Z7ME 1MPDA 1FQCA 1O63A 3SEVA 3KBRA 2I4BA 2FA7A 4JWXA 3ONMA 1B9JA 4THIA 3I5OA 1PC3A 2XX8A 3FUZA 4H67A 2RC8A 4EQBA 1B3LA 2IEEA 3K6WA 1II5A 2Q2CA 1B4HA 4LVQA 1LAFE 2F36A 3PPQA 4R72A 3Q25A 3BBRA 1B3GA 3OMBA 1XHYA 1LB8A 3EQ1A 1MH3A 2Q89A 3RTFB 2AL5A 3PPNA 1AL3A 3R6UA 2XD2A 1UTBB 2I3VA 3CG1A 3G3HA 2XX7A 5CBRA 1BIYA 3T9XB 4KFQA 3A3UA 4MFIA 2Z8FA 1TT1A 4Q30B 3ZSFA 2V25A 3MPLA 4MLQA 4OHNA 1I6BA 3L6HA 5DVJA 4QFNA 2DOJA 2QS4A 4KR5A 4O3CA 4LONB 3ZS6A 4N07A 1LFHA 4ZEKA 4IY5A 4IGTA 2F35A 1D3KA 1P1WA 1R9QA 3PPOA 3EHTA 4GQOA 5DT6A 2P1SA 4R2FA 1VFDA 3RQTA 2I4CA 3TQWA 1M5BA 2VP1A 3USDA 5L8DA 3V83A 1JETA 4DLDA 4LUBA 3ZKKA 2QMWA 1MY2A 3IO4A 3CFXA 3C31A 2Y84A 1Y3QA 2D5WA 3UP9A 1FQBA 3BKIB 4YKJA 1VFEA 3KN8A 3CI8A 4LP2B 3ILTB 1A8EA 3EPEA 4JWYA 4YKKA 3G3GA 3FXUA 4EQ9A 4QFOA 4RPOA 4L17A 4MLVA 4LZ7A 3HO7A 4ZDMA 3TCFA 4C1TA 3U1OA 2XXVA 1Y3PA 3PD8A 4GL0A 1POY1 1A55A 1ELJA 1D9VA 2H4IA 4DE8A 4XXUA 3KN3A 1AOVA 2O7UA 4NWCA 5BUUA 2REJA 2V3QA 1ZKBA 1N7XA 3T66A 1N76A 4X9TA 4KD5A 1YPNA 3T96B 4U22A 2QS1A 3PUXE 4WEPA 2WKYA 5J1DA 5AA2A 3QSLA 3OSRA 4WKMA 1LBBA 4RK9A 3U72A 3MVWA 2O6AA 3S9LC 1ZMGA 4NEDA 3E9XA 3BFTA 1B0LA 2GHBA 1NH8A 4ELPA 4FJPA 3JV9A 4IO5A 1ANFA 3FJMA 1IIWA 3O6GA 1IXCA 2UVJA 3OO8A 3TAJA 1MRPA 3R7XA 3EN3A 4NWDA 3R26A 3FVKA 2QJEA 1MDP1 3C33A 2I0BA 4POXA 2I49A 4ONYA 3GLBA 1B51A 3VDFA 1A54A 1MY4A 2OLBA 2PYYA 1PB9A 3O97A 4KCCA 1B1XA 2X7QA 3OD7A 2O69A 5H8SA 1US5A 4HCWA 2XXRA 5CMBA 4BLAA 4NF5A 5ISUA 2I6EA 3BFUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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