4G8HA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with licofelone at 1.88 a resolution
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal structure of C-lobe of bovine lactoferrin complexed with licofelone at 1.88 A resolution
rcsb
molecule tags Hydrolase
total genus 112
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2012-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g8hA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4g8hA02
4OENA 3UIFA 3N94A 3AXFA 4IB2A 2OBGA 1YTVA 3WAFA 4NE4A 5CRYA 4QFOA 1MY0A 2OWTA 4L17A 1J1NA 2QSXA 4KHZE 1PB8A 3OD7A 1SVXB 2I48A 4KFQA 1URSA 2O6AA 2ZYMA 1LCTA 2R9JA 1B7HA 3PGFA 3TMGA 1NNFA 3GBBA 3H6TA 4NF6A 2VD2A 4H8IA 4H65A 2R71A 4R2FA 5BUUA 2O68A 2B3BA 3SEXA 3RQTA 1OLAA 1A40A 4JWXA 4P0IA 4RPNA 1Y1ZA 1AL3A 4FECA 3FGSA 4LQ2A 2NWJA 3TPAA 2XXRA 1VE4A 3RTFB 2QPQA 3DP8A 2F6GA 2ONSA 3TZAA 1LBCA 4RNSA 3PU5A 1OIBA 2H25A 3M3KA 4PFTA 1Y4CA 4P0GA 4ZECA 3ZKLA 4OFOA 3MAMA 1H76A 3OMBA 5EHSA 1FQFA 1N76A 1FTOA 5DVIA 5FHOA 4MLVA 2REGA 2QL3A 4YKKA 3F11A 2V3UA 4ZEIA 5AA4B 3VXBA 1WVJA 4BDRA 2QJEA 4G8NA 4OXVA 3O66A 3IL1B 3S9NC 4KR5A 3R7XA 2ABHA 1LFGA 3DM0A 3BFTA 4IGTA 2HAVA 3WAEA 1DPPA 1LB9A 3K6UA 1MQHA 3FVKA 3V5AA 4O3CA 1IUDA 3CFZA 1QKBA 4PP0A 4EQBA 1VFEA 5FTHA 3G3KA 3H4ZA 3FVOA 2G93A 4RK9A 3N5LA 5FHMA 4DXUA 4R2BA 4P11A 4XKQA 4H5FA 1SW5A 3O6HA 1UIVA 3OELA 3G3IA 3O28A 5H8NB 1UTBA 2NOOA 3BFUA 3KZGA 2UVHA 1WDNA 2NXOA 2KLFA 5I57B 1JW5A 5F1QA 5TPAB 4F19A 1AMFA 2VOZA 3UGWA 2DXYA 4G77A 1MXVA 1OQHA 1JVYA 3MP1A 3TTNA 5JTYA 2I0BA 2I0CA 1D4NA 1MS7A 2DOJA 4H5GA 1JW1A 1I6QA 2O1LA 3Q25A 2Z8FA 4ISUA 2GRVA 1F9BA 2GHBA 3IJOB 3HHFA 1A8EA 4ZE8A 3KJTA 4WEPA 1MY4A 5KDTA 2I6EA 4MF3A 1AIVA 1MXYA 1JEVA 3T9XB 4F3SA 3C33A 4JBZA 4FAJA 1ZJLA 4AQ4A 3S9MC 3PUXE 3RUMA 5DVFA 1FQEA 5DYHA 1LGBC 2P2AA 3V89B 2Y7IA 5DVJA 4QFKA 4GLIA 3B6QA 4NF5B 4GIZA 1D9VA 4F22A 4Z0IA 3TQWA 5LOMA 4HW8A 4MH5A 3ECRA 1OQGA 3QUJA 2FA7A 2RKMA 3QYTA 4ZS9A 2QS4A 4TLLB 3MVYA 3MVZA 3OSRA 5K2YA 3PD9A 1D3KA 3HCQA 2ZNTA 3A09A 2O1MA 4R74A 2XHDA 4RPOA 3TAJA 3K1NA 4ZEKA 4QFPA 2PX1A 1USYH 4NEDA 3QXMA 2ZNSA 2F34A 5CMCA 1M5EA 1NNTA 3MZ1A 3N6UA 3S9EA 3PPPA 3RN8A 3DELB 4DZ1A 5H8FB 1TT1A 4IY6A 4IGRA 4NWDA 2F35A 4ZEFA 4DCYA 4QHQA 1B32A 5TP9A 4JWOA 2DXRA 3IR1A 4KYDA 4EF2A 2H98A 5AE4A 3TTLA 1P99A 3H03A 2V93A 5B7DA 1PC3A 2E1SA 3N6TA 3JYRA 2ESNA 4N13A 3OO6A 1NL5A 1TFAA 4EXLA 4TQUQ 5I59A 3JV9A 1H3DA 1B3LA 3W9WA 2NVUB 1DMBA 3IOVA 4JXIA 3L6HA 4R9FA 2O69A 3UP9A 1NNKA 4GXAA 4I8CA 1BP5A 5EYFA 1OVTA 3C32A 1FTKA 4U1OA 1D9YA 4ZE9A 3PV0E 1XVXA 1RKMA 3FVNA 1FCKA 2UXAA 4H8JA 1O7TA 3Q29A 3Q27A 3LSXA 4G8HA 4N6PA 5AA1A 5H8QA 4JB7A 1FQAA 3SETA 3T66A 5AA2D 4NF8B 3CSBA 2B3FA 3W9VA 3DP4A 2DWAA 4MBPA 2B65A 4QFNA 4OVJA 5I2KB 1ZU0A 2OWSA 1OVBA 3VFJA 3E13X 1ZTYA 1UTHA 4DLDA 3UA8A 1GTKA 5KZTA 3RY3A 3K2DA 4IO6A 1B0HA 3IB0A 3OO8A 1ANFA 4MFIA 4BDLA 2IA4A 1MXXA 3SESA 2HZLA 2PT2A 4IO7A 3VLWA 2V3TA 2GH9A 5CMBA 2XXHA 2Z8DA 5AA3A 3IOTA 4ELPA 4OFLA 1R9LA 4JDFA 3O6IA 1YPNA 3TFLA 3VLUA 1URDA 3UN6A 4G68A 4XTCQ 1SW2A 2Y7PA 4QSCA 2PT1A 3H7MA 1DTGA 5I58B 3HHGA 4LZ5A 1GGGA 1B05A 1P1UA 1ZMGA 1VFDA 2XXXA 4HCWA 4ESWA 1MPDA 4NTLA 4YZZA 4I62A 1B46A 4Z7EA 2AL4A 3ILTB 5CM6A 4EDPA 2ONKE 1JNFA 1A99A 4LA9A 3KGCA 2ZYKA 3HN0A 4YMAA 4EXKA 3G3GA 4IY5A 3T9HB 3IB1A 3VLVA 1S7YA 2UYEA 2O7UA 3OSQA 4WEDA 3W15C 3DLNA 2GHAA 1MQGA 3MP6A 3HO7A 4KI0E 4XIGQ 4C0RA 4NF6B 3FZVA 3FJGA 2GFEA 4KPTA 4F3BA 4JSOA 4QF9A 2HAUA 4R75A 4DXBA 3I3VA 2VP1A 3TCGA 4O3AA 3KN8A 3PUVE 3CIJA 3T96B 3B6TA 3IAZA 2O7IA 2QS1A 1TXFA 5J1DA 2Q2CA 3S9LC 3MWBA 3MZBA 4RJZA 2XXUA 2UVGA 2OK2A 3QSLA 4IO2A 1ZIUA 2I49A 1XHYA 1B1HA 3MPKA 2W7YA 1Y3PA 1NKXA 4YKPA 1HSEA 3CFLA 3FV1A 2DVZA 2P0SA 1NFTA 2HQ0A 3TYHA 2RC8A 2XX7A 3CI8A 1B1XA 2VD3A 2DE2A 3OOAA 3T93B 1JEUA 2DP8A 4GF8A 4RK2A 4IO3A 3THIA 3KOTA 4ZDMA 4F1YA 1YAEA 5FTIA 2RC7A 4GRKA 4R9GA 1QUIA 2RC9A 4OYVA 1NMUA 4OEVA 4OQOA 2Q88A 3E3KA 1UTBB 3MVWA 4RXLA 3G3JA 3PPNA 1PB7A 2OZZA 3SKPA 3TQLA 4F1VA 5L9OA 3U1OA 5KCJA 3CR9A 1WODA 4NMYA 1SYIA 3PPQA 3K1MA 2XXVA 1ZKBA 1B9JA 2I4BA 3QUFA 1NH7A 1Z7ME 1KWHA 4JWYA 3RTWB 2REJA 3KEIA 2F78A 4LZ7A 3FJ7A 3EF7A 4F1UA 4KCDA 3C31A 1FQDA 3H6WA 3H6VA 4HCYA 1XS5A 3FJMA 4RA1A 2AL5A 5CMMA 1Y3NA 4E0XA 1IEJA 4I1DA 1MY3A 1H44A 3B7DA 5H8NA 1Y3QA 3D4GA 3CFXA 2F8DA 5I57A 5ELVA 5A5XB 5TPAA 4NF4A 3VXCA 3IJXB 3OO7A 1AOVA 1LAHE 4GFRA 3B6WA 1SW1A 2RINA 4GL0A 1DSNA 4LATA 3TTKA 1MDQA 4FEDA 5CBSA 2VHAA 1LAFE 4YMBA 4OETA 1N3XA 4Q8RA 4LQ5A 3IOWA 2QS2A 3ZS6A 4HTGA 2D21A 4QFLA 1GR2A 2O84X 1AH5A 5AA2B 1SW4A 2BJJX 1MH4A 1JW4A 4FATA 3LR1A 1A8FA 3R26A 2XXQA 3TCHA 4POXA 3FASA 5H8HB 3EHSA 1II5A 1GVCA 2YLNA 3EQ1A 2I3WA 5ICQA 2Y7RA 3K0VA 1L5TA 3O29A 4YAHX 4UACA 4ZZAA 3MW0A 1MY2A 2QMWA 2UVIA 1JETA 3KSJA 5DEXA 1SBPA 1IXGA 1P1NA 4PFUA 2DWJA 1IQ7A 3G7WA 1I69A 2OLBA 2CMOA 3VDFA 3TODA 4IO5A 3IORA 4FJPA 1VR5A 1XC1A 2ZYNA 1B7UA 1LBBA 4XKRA 4BLAA 4BDMA 4LVQA 5JEIA 3TTRA 1MXWA 3TCFA 3OO9A 3G3FA 3V83A 3MC2A 5B70A 3LSLA 4Q5TA 1B3EA 2DWHA 2Z22A 4C1TA 1CB6A 2OJTA 2XXPA 1FTJA 3TDJA 3RLFE 4ONYA 3I5OA 1O64A 3RT6B 4I9DA 1QKAA 5I2NA 4LUBA 1IXHA 5EHMA 3OENA 2QRYA 1OMPA 4XKPA 1EU8A 3ODBA 1SI1A 3K02A 1POTA 4IO4A 3SEUA 2F7CA 5H8QB 5IAIA 4RYAA 4OTEA 4ZZEA 1FQBA 2F7BA 4X1DA 3DP6A 2M8CA 3D4CA 4Q0CA 4QSEA 4BDNA 3UK4A 2I4CA 5HPQA 2UVJA 1PB9A 1B3HA 1XT8A 1S9TA 2PMSA 3SEWA 1UTHB 4NWCA 4U1ZA 4BDQA 1EZ9A 3PUZE 3KG2A 1IZ1A 3EN3A 1HSLA 4F2QA 1ATGA 2O51A 1UQWA 4NF8A 5IKBA 1N7WA 3K4UA 1BIYA 3FD3A 4AB6A 1OLCA 5I56B 5I2KA 4G2ZA 1QVSA 3M3FA 1H43A 4FE8A 3C4MA 5CC2A 3A3CA 1P1OA 1UIUA 5HBCA 2P1SA 3GXAA 4X1BA 1A7LA 3E4RA 2X7QA 3RT8A 2RCBA 1MQIA 2PBWA 4F3GA 1P1QA 2A5TA 2E0SA 1SYHA 5HM4B 5DTBA 5M2VA 2PYYA 1M5DA 3EHUA 1FTMA 2YJPA 4RY1A 3PD8A 4GOTA 4EQ7A 3IB2A 5DT6A 3C34A 3K01A 3LUYA 4WXJA 3RPWA 4GWOA 3VV5A 4YB7A 4O3BA 4OMBA 4DIGA 3HSTA 3E9XA 1B58A 1LFHA 4KYSA 4M1VA 4GXSB 1I6AA 1XVYA 3FXRA 1B4ZA 2RF1A 3S4UA 3TKDA 2H5YA 2ZXTA 2XXWA 2XXYA 1NNPA 1CE2A 1Y1MA 4G4PA 1US5A 2NUVA 3MVXA 4DCXA 3KSXA 2H9BA 4LP2B 5L9SA 1DOTA 1B5HA 1N0TA 3K6VA 3EHTA 4Q30B 3SEYA 4DE8A 1HSJA 1RYXA 2D5WA 2XXTA 3RGYA 2AIXA 3KBRA 4G68C 3CVGA 1USYE 3IX1A 3O9PA 3QIMA 1NH8A 4F29A 2HCAA 3OEKA 1FW0A 4KQPA 2ONRA 4K3FA 4YB5A 2OCUA 4KYEA 4XKNA 2X7PA 3IOUA 3O6GA 3HV1A 1B5JA 2XX8A 3U93A 2V25A 2RCAA 1Y9UA 3MP8A 3V8XB 4ZEBA 5ICTA 4QSDA 1JQFA 3N26A 1LSTA 5CBRA 4ZEDA 1R1NA 1IXIA 1FTLA 2V84A 1LAGE 3QAXA 3SDFA 1MXZA 1IXCA 1MM7A 2IEEA 5AA4A 1BTJA 5JK4A 3ILUB 4OFJA 1T0KA 1TFDA 4H6DA 4U23A 4PE5B 4F39A 4GD5A 4OERA 1MQDA 2I3VA 2VGQA 1VSOA 4H67A 4YKJA 5BWJA 5CI5A 5KCJB 4ELQA 1DTZA 3KN7A 4E0WA 2H99A 3O2AA 3K6WA 1PDAA 3VVDA 1BLFA 1MQJA 2DVCA 1SQYA 2H4IA 2Q2AA 3QK6A 3K1PA 1O63A 4PQJA 3TUSA 3IO6A 3U92A 2DS9A 5JTYB 1N84A 1B40A 3USDA 1B3FA 1EH3A 4GQOA 1P1WA 4FORA 3RNNA 4ND9A 1RYOA 4U22A 5K2XA 4ELRA 4NF4B 3VE1B 4LONB 1LFIA 2FYIA 4R6YA 4YICA 5KDTB 3H3GA 2XX9A 1M5FA 4U4SA 2F97A 4WKMA 4GVOA 3CG1A 1B2HA 2YPNA 2HEUA 1MDP1 4R6HA 5FHNA 1MRPA 1MG1A 5ITOA 3IK6B 1Z7NE 1LCFA 1N7XA 4PFWA 1ELJA 3M8UA 2DE3A 3TEPA 3H6UA 1B3GA 2R6GE 3UORA 4OZ9A 4EUOA 4KD5A 5A5XA 3GBAA 4OEUA 1PEBA 2ZYOA 1B0LA 3IO4A 2ZNUA 1B6HA 5ITPA 2Y84A 1US4A 4U21A 3FXQA 1LB8A 1Q1KA 2I58A 2Q9TA 2CZLA 4JSDA 3MBPA 3LSWA 2DE4A 2Q89A 4ELOA 1JVXA 1I6BA 4C1UA 4FEBA 1R6ZA 2QMXA 2HZKA 5DEXB 3MJNA 4NF5A 1GV8A 1EZPA 5AA2A 3PPRA 3PUYE 1ZBMA 1B7ZA 2F7AA 2WKYA 3O97A 1URGA 3JZJA 1QULA 1ZLQA 4TLMB 4F2OA 3MUQA 1SD3A 5H8HA 4QRZA 1POY1 3FIRA 3FUZA 4F18A 5L8DA 3T22A 1B5IA 3BKIB 3OEMA 4FIMA 3CSGA 5TP9B 1Y4TA 1H45A 1B51A 1IIWA 1FQCA 1MH3A 5CMKA 3K6XA 3SEVA 2Y7KA 2A5SA 3VVFA 1M5BA 5I59B 4THIA 3KJ7A 5ISUA 3FATA 3Q26A 5H8FA 4YU0A 1A54A 3KN3A 4ECFA 5I2NB 1S50A 5L9MA 2THIA 3GLBA 3LBSA 4N07A 2F36A 3L6GA 4R6KA 3C35A 3OXNA 3K00A 5F7VA 1LAXA 1MXUA 3PUWE 3P7IA 1XOCA 2ZMBA 3SERA 2HXWA 4R73A 4H0WA 3PMXA 4UA8A 3BBRA 4KCCA 1DPEA 4U4XA 3FXUA 4X48A 2Z23A 3T9VA 2G29A 1N04A 4XXUA 2HFBA 1QUKA 1LLSA 1QW0A 3PPOA 1PBPA 4YB6A 3LC8A 3TELA 1R9QA 3M3LA 2LAOA 2F5XA 2V3QA 3HPIA 3U72A 2QS3A 4MLQA 4POWA 4H1XA 1IITA 3ZKKA 3MZ9A 2XD3A 3KOSA 3A3UA 4F3PA 1B4HA 1Y20A 4R72A 4F31B 4HS7A 1QUJA 3ZSFA 1SDXA 1Q35A 4ESXA 3I6VA 2DWIA 4PFYA 4EF1A 1BKAA 1M5CA 2XXIA 3S2VA 4OWDA 4G8MA 4OHNA 3PMVA 1PBQA 2AYSA 4LZ8A 1MY1A 2DSFA 4M4GA 3T9UA 3Q28A 3PMWA 4U2RA 1QJMA 2DQVA 4AB5A 4G68B 3VVEA 1A55A 2A5TB 3TTMA 2PVUA 2Q8JA 1TWYA 4DXCA 3CRBA 2D3IA 3MQ9A 3R6UA 4OESA 5I56A 3CG3A 5H8SA 1MPBA 4GL8A 4BDOA 2ALUA 2Z8EA 2ANJA 3EPEA 3GZGA 1B52A 3U8QA 4PETA 3FV2A 2DYXA 3G3HA 1MPCA 2FNCA 3FVGA 4X9TA 2F6PA 1MM6A 2Y7WA 1EZOA 4TOZA 4YKIA 1YCJA 5TU0A 3U94A 3ONMA 5I84A 1N3WA 5I58A 2UYFA 3LSFB 4DDDA 3C9HA 2XD2A 2X26A 4EQ9A 3C36A 3MPLA 3KFMA 3H06B 1SI0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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3OELA 3G3IA 4O8MA 3O28A 5H8NB 1UTBA 2NOOA 3BFUA 3KZGA 2UVHA 1WDNA 2NXOA 2KLFA 4GWUA 5I57B 1JW5A 1XI6A 4PDHA 5F1QA 5TPAB 4F19A 1IMCA 1AMFA 1KA0A 2VOZA 3UGWA 2DXYA 4G77A 1MXVA 4PAKA 1OQHA 1JVYA 3MP1A 3TTNA 5JTYA 2I0BA 2I0CA 1D4NA 1MS7A 2DOJA 4H5GA 1JW1A 1I6QA 2O1LA 3Q25A 2Z8FA 4ISUA 2GRVA 1F9BA 2GHBA 3IJOB 1DCUA 3HHFA 5ET6A 1A8EA 4ZE8A 3KJTA 4WEPA 1MY4A 5KDTA 2I6EA 4MF3A 1AIVA 5ET7A 1MXYA 1JEVA 3T9XB 4PTKA 4F3SA 3C33A 4PFIA 4JBZA 4FAJA 1FPEA 1ZJLA 4AQ4A 3S9MC 3PUXE 3RUMA 5DVFA 1FQEA 1KZ8A 5DYHA 1LGBC 2P2AA 3V89B 2Y7IA 5DVJA 4QFKA 4GLIA 3B6QA 4NF5B 4GIZA 1D9VA 4F22A 4Z0IA 3TQWA 5LOMA 4HW8A 4MH5A 3ECRA 1OQGA 3QUJA 2FA7A 2RKMA 3QYTA 4ZS9A 2QS4A 4TLLB 3MVYA 3MVZA 3OSRA 5K2YA 3PD9A 1D3KA 4FBPA 3HCQA 2ZNTA 3A09A 2O1MA 4R74A 2XHDA 4RPOA 3TAJA 3K1NA 4ZEKA 4QFPA 2PX1A 1USYH 4NEDA 3QXMA 2ZNSA 2F34A 5CMCA 1M5EA 1NNTA 1LEVA 3MZ1A 3N6UA 3S9EA 3PPPA 3RN8A 3DELB 4DZ1A 1AWBA 4I3YA 5H8FB 1TT1A 4IY6A 4NWDA 4IGRA 2F35A 4ZEFA 4DCYA 4QHQA 1B32A 5TP9A 4JWOA 2DXRA 3IR1A 4KYDA 4EF2A 2H98A 5AE4A 1FJ9A 3TTLA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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