4O3CA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain in complex with l-aspartate at 1.50 a resolution
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title L-Asp is a useful tool in the purification of the ionotropic glutamate receptor A2 ligand-binding domain.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein/agonist
total genus 89
structure length 262
sequence length 262
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4o3cA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4o3cA02
4DCYA 3O28A 2ABHA 4M4GA 1TT1A 1LBBA 1B0LA 4EXKA 5H8NA 4ZZAA 1UIVA 2QSXA 4KI0E 5H8FB 5AE4A 5JEIA 1I6QA 4O3CA 1GV8A 1JEUA 2A5TA 3ZKKA 5TP9A 5L9MA 4KCCA 3WAEA 3VVDA 3RT6B 1SI0A 3C9HA 2R9JA 2THIA 3USDA 4F1YA 1QJMA 1VSOA 3O66A 2O68A 1LCFA 4AQ4A 1YCJA 1PB7A 4O3BA 1J1NA 2I3WA 5CMBA 3JZJA 3LSFB 2UVGA 3UGWA 4MBPA 3Q27A 1A8EA 4WEDA 4U1OA 4LZ8A 3H6TA 3DP4A 3RTWB 3PUVE 3KOTA 1B9JA 1B5JA 1FQDA 1D9YA 1MDQA 2ALUA 5BUUA 1MRPA 2VD3A 4R9GA 3KSJA 4LUBA 4F3SA 4YKIA 1MY1A 4RYAA 5H8QA 2O1MA 3BFUA 3DM0A 2DYXA 2IA4A 3CFZA 1Y1MA 4IO4A 4BDLA 4Q8RA 3Q26A 3UP9A 1CE2A 1UTHA 1RKMA 3IX1A 1DPPA 2X26A 4GRKA 1MS7A 5I59A 4FEBA 4YU0A 2CMOA 4XKNA 2XXUA 2XHDA 4LP2B 1JW4A 1XC1A 3CSGA 3Q25A 3QK6A 4HS7A 4ZEFA 3TCHA 4JBZA 1EZPA 4MLQA 1A7LA 4H1XA 1IXCA 4G8NA 2F6PA 3PV0E 3FD3A 3PPRA 1F9BA 1FQAA 3S9MC 2I49A 4IO2A 3HN0A 2DXRA 4FATA 3K6WA 4QSCA 3O97A 5KCJA 1ZIUA 5LOMA 3FJGA 5A5XB 1B58A 2F8DA 5BWJA 3RY3A 1N0TA 2B3BA 5DYHA 3H7MA 2Z8FA 1OQHA 4YB5A 4IO5A 2DP8A 2VP1A 3HHFA 3OELA 3D4GA 4R6YA 5HBCA 4ZDMA 3KG2A 1PB8A 2F78A 3K6UA 2F97A 4LATA 3VLWA 3H06B 3EF7A 5JTYB 1S9TA 4OQOA 1URSA 1VFDA 3CFXA 1B3GA 1EZ9A 2I0CA 3K00A 3C32A 3TMGA 2V84A 2E1SA 1XVXA 4IO7A 2QMWA 1MY4A 3FXUA 3M8UA 1B46A 2F34A 3KOSA 5AA3A 1S50A 4F39A 4DXBA 1M5FA 1B7HA 4QRZA 1FQCA 3CSBA 1AIVA 4KHZE 2P1SA 3LSWA 2OCUA 3F11A 4I9DA 3GXAA 2VOZA 1JVXA 3L6HA 1DTZA 3FVGA 3TEPA 2R71A 4R72A 3E3KA 2PX1A 1R6ZA 5TP9B 2GFEA 3O6IA 4R2BA 4OESA 4GIZA 3EHTA 3LUYA 3U1OA 4OEUA 2NXOA 3IOVA 3HV1A 3IL1B 1RYOA 1WODA 3PD8A 1FTMA 3T9UA 2OWTA 2ZXTA 2XXHA 2DVCA 4EDPA 4NF8A 4MFIA 5KZTA 4C0RA 2UYEA 4R6HA 1OLCA 4JWOA 4ELOA 1WVJA 3FV2A 1NFTA 1ZJLA 2AYSA 4G4PA 1POY1 3A3UA 1ZBMA 2HCAA 2QS3A 4K3FA 3OO8A 4DE8A 3UK4A 2XXTA 3LR1A 4X48A 3EN3A 3B6TA 1H44A 2ZMBA 4X1DA 4EXLA 3BBRA 1PBQA 3SDFA 4R74A 1UTHB 3TPAA 1XS5A 5HM4B 4ZECA 3T9XB 1SW4A 5FTHA 5AA1A 4KCDA 3KJTA 1OMPA 3H6VA 3ECRA 2RCAA 3N26A 2VGQA 2X7QA 3MPKA 5AA4A 5KDTB 1I6BA 3S9NC 2KLFA 3HPIA 3B7DA 4H6DA 3HSTA 5AA2B 4XXUA 2NWJA 4R75A 4OETA 3R26A 3IJOB 1M5BA 3BKIB 1A99A 4MF3A 4YKKA 3MP1A 1TXFA 1OVTA 5I57A 1UTBA 5J1DA 1LCTA 5K2XA 1POTA 3Q29A 4NMYA 4XIGQ 5KCJB 3SERA 5FTIA 2B65A 2QS4A 4QFNA 1XVYA 5H8SA 3K1MA 2YPNA 4H5FA 1JVYA 2DWAA 3FASA 4P11A 5I2KA 4XTCQ 3CI8A 1BTJA 1AL3A 2HZLA 2HAUA 3W15C 4PE5B 3TTRA 3PU5A 1OIBA 3MVXA 3N94A 3U92A 2ZYKA 4ND9A 3OXNA 3H6WA 4TLLB 1LAFE 3K6XA 4ESWA 2H9BA 2Y7PA 3LSLA 5DEXB 4IO3A 4OYVA 2Y7KA 4NWCA 4TOZA 2XD2A 5TPAA 4H5GA 3I6VA 4KR5A 4RXLA 4DXCA 3HO7A 3KFMA 4ZEIA 3O6HA 2DOJA 2Z22A 3DLNA 3SETA 4I62A 3ZSFA 1NL5A 2AL4A 2ZNUA 3IB2A 3V8XB 4AB5A 3K4UA 4G77A 3MBPA 1MXXA 1N3WA 3W9VA 4JWYA 5FHMA 3G3HA 4LA9A 4F1UA 1PBPA 3W9WA 4QSEA 3IOUA 3PMWA 3DP6A 1FCKA 1B05A 3U94A 2RF1A 2PVUA 3N6TA 2Y7IA 1Y9UA 2UYFA 4O3AA 3QUJA 4WKMA 3OSRA 1ZKBA 4JB7A 1EZOA 3UIFA 4GF8A 4RK9A 1B3FA 4GXSB 2Q89A 5ICQA 4N07A 1N7XA 5EYFA 1JEVA 5B7DA 2XXVA 4OHNA 2YLNA 5L8DA 3SEWA 3MVYA 2Q2AA 4H8IA 2XXXA 3MJNA 4KPTA 3C4MA 2OWSA 3C31A 3G3FA 2XXQA 2BJJX 4P0GA 2XXRA 3LSXA 3TKDA 3PMVA 2XD3A 5ELVA 5CM6A 3JYRA 1MQGA 5AA4B 4KYDA 1MH4A 5I56A 3OOAA 1D3KA 3FGSA 4WEPA 3OO9A 1OLAA 4EQ9A 3O29A 4RK2A 1B3HA 3GBBA 1B6HA 1H3DA 1MPDA 1B1XA 1QKBA 5I2NA 4THIA 1AOVA 4HCYA 3SEUA 1NNKA 5CMMA 2Q2CA 2D21A 2F7AA 2PT1A 1B32A 4PFTA 4RA1A 4KYEA 1Y4TA 2O69A 4DXUA 2UVIA 2I0BA 4BDNA 1N04A 3GBAA 4YICA 5FHNA 1JW1A 3MW0A 2IEEA 2DSFA 1MY0A 2O6AA 4BDMA 3IB0A 3GZGA 3WAFA 1B1HA 1B52A 4L17A 3PMXA 4U4SA 4F2QA 4OVJA 1H45A 2H5YA 1O7TA 1RYXA 2GH9A 1MXWA 3KJ7A 2I4CA 2LAOA 3K0VA 4Z0IA 1L5TA 2O84X 4G68C 1Y4CA 4AB6A 4IGTA 3M3KA 1HSJA 3QAXA 5CRYA 1MXZA 3IOTA 1VE4A 2ESNA 3MAMA 4POXA 3G7WA 4UA8A 4DCXA 2UVJA 3TTLA 3VDFA 3FJ7A 1Y3PA 1B4HA 5TPAB 3PUYE 1DOTA 3QUFA 2AL5A 1NH8A 3KSXA 4C1UA 4GLIA 3V5AA 5L9SA 1B5IA 5ITPA 2G93A 4RY1A 4G8HA 4C1TA 4BLAA 1SYHA 4BDOA 3CVGA 3IK6B 1P1UA 1P1NA 3EPEA 4ISUA 2Y7WA 4OFOA 3RN8A 1QVSA 4MH5A 5H8NB 4NF5A 4QFLA 3U93A 3HCQA 2ZYNA 3KZGA 1QKAA 2ONSA 3KN8A 1O64A 1D4NA 4ONYA 3PUXE 1M5EA 4ZS9A 3MZ1A 1Q35A 4FECA 2A5TB 5DTBA 1R9LA 3MPLA 4HTGA 4TQUQ 2A5SA 2ANJA 3TELA 3TFLA 3GLBA 4U23A 4EQ7A 3M3FA 4FIMA 4GD5A 1B2HA 1EH3A 1I69A 3O2AA 3FJMA 2VHAA 1Y20A 4YZZA 2FNCA 4OFLA 4PFYA 3PPQA 4H8JA 4LVQA 3IOWA 4FE8A 1HSEA 4R9FA 2OBGA 3U8QA 1SW1A 3K1PA 2CZLA 1GVCA 3MQ9A 1SW5A 3SEYA 4DLDA 1B3EA 1NNTA 2HQ0A 2F5XA 3T9HB 2QMXA 2Q9TA 2RKMA 3IR1A 1ANFA 2I48A 5H8FA 4QSDA 3RPWA 3I5OA 4Z7EA 4IGRA 3TODA 1Z7NE 4ELQA 3EHUA 3ZS6A 5H8QB 3QSLA 1SQYA 3S2VA 1LFGA 3H3GA 4E0WA 3TQWA 3CRBA 1R9QA 4H65A 5I2NB 1AH5A 2RCBA 1US4A 2V93A 5HPQA 5I59B 3K6VA 5L9OA 1QUIA 2G29A 2F6GA 3O9PA 4EF1A 4IO6A 1B4ZA 2O7IA 2PBWA 2F35A 4YKJA 3E9XA 4ZZEA 3CG1A 1A8FA 3M3LA 3TUSA 1QULA 1UIUA 4OWDA 4EQBA 4ELPA 2FYIA 1HSLA 4JXIA 4F1VA 4XKRA 1CB6A 3VE1B 3VXCA 4NEDA 5EHSA 3TTMA 2UXAA 4NF4A 1PDAA 3RTFB 4LZ7A 3FIRA 3T22A 1IXHA 4OMBA 3TDJA 2DS9A 1FTKA 1I6AA 1JNFA 1FW0A 4ZEKA 4GWOA 4KYSA 2HAVA 4OZ9A 3O6GA 2DE3A 2HZKA 3TCGA 2O1LA 3PUWE 4G68A 4RPNA 4GOTA 4HW8A 3ODBA 3S9EA 3C36A 2D5WA 4NWDA 1M5DA 3FV1A 3S9LC 3N5LA 2DWIA 5CC2A 4ESXA 2H98A 2DQVA 4FORA 3AXFA 2DE4A 4RJZA 2V25A 3PPOA 4R6KA 1FTLA 2V3QA 4FEDA 3H4ZA 2I6EA 4OENA 3SESA 4TLMB 4GFRA 2XXIA 1MPCA 3SKPA 3R6UA 3OENA 1SI1A 3MUQA 4RNSA 1BKAA 3KGCA 3TTNA 3QYTA 2ONRA 3BFTA 1DTGA 3PPNA 5A5XA 4GQOA 3TQLA 2P0SA 3IAZA 3SEVA 5DVFA 3VVEA 4PFWA 1URGA 4U1ZA 3CG3A 1USYH 3G3KA 5CBSA 2F36A 4U21A 2OZZA 1TWYA 2OK2A 4U22A 5I58A 2ZYMA 4QFPA 5H8HA 2FA7A 3T66A 4G8MA 4OXVA 4JSDA 1SW2A 5ISUA 4NTLA 4YB7A 5CI5A 4F22A 1MQDA 2DWHA 1TFDA 2DE2A 4QFOA 4KQPA 1XT8A 4HCWA 3VLUA 4NF8B 3JV9A 2PYYA 2D3IA 4WXJA 2O7UA 1YAEA 1B5HA 3EQ1A 4X1BA 2ZNTA 2Q8JA 1IUDA 2QPQA 3MC2A 1MQHA 5M2VA 2H99A 2Y84A 3HHGA 5F7VA 1JW5A 3I3VA 3MVZA 5ITOA 4PETA 4ELRA 4OTEA 2DVZA 2Z23A 1R1NA 3OO7A 4IY5A 3VXBA 3V89B 3OO6A 4UACA 3MZBA 3D4CA 4H67A 2I3VA 3ZKLA 4X9TA 1Q1KA 2RC8A 1Z7ME 4YAHX 1URDA 2Z8EA 3MWBA 1B3LA 1JQFA 3N6UA 4IY6A 2P2AA 3K02A 1IQ7A 1AMFA 1IXIA 3MP6A 2Q88A 1N76A 1XOCA 3SEXA 3UORA 4YKPA 1SDXA 4NF4B 2OLBA 4DZ1A 4ZE9A 5I57B 1UTBB 5EHMA 4RPOA 4POWA 4DDDA 5K2YA 1Y3QA 5CBRA 3B6WA 5TU0A 3OEKA 4I8CA 3RQTA 1EU8A 1LAHE 5I2KB 4F19A 2QS1A 4F3PA 4NF6A 4G68B 4H0WA 1DPEA 2GHBA 5KDTA 4ZEBA 3FXRA 3T93B 1D9VA 4KD5A 4IB2A 4YMAA 1LFHA 1FQEA 2XX8A 3IB1A 4FJPA 1XHYA 3RUMA 4JWXA 1USYE 5AA2A 1ATGA 4F29A 4KFQA 3KEIA 5CMKA 3C35A 1GR2A 4U4XA 4QFKA 4LQ5A 3LC8A 5DT6A 3V83A 1PEBA 3B6QA 2I58A 3C33A 2ONKE 3VVFA 1SBPA 2XXWA 3E13X 5B70A 3KBRA 2NOOA 3PPPA 3FVKA 2QJEA 5IAIA 3RT8A 1FTOA 3OMBA 4BDQA 1GGGA 1VFEA 1OVBA 1KWHA 3THIA 1P1QA 5JK4A 4LONB 1N7WA 1WDNA 5FHOA 5I58B 2XX9A 1MY3A 2E0SA 1ZU0A 5H8HB 4F2OA 1DSNA 4Q5TA 3E4RA 2VD2A 3ILUB 4U2RA 2H4IA 4ZEDA 1TFAA 4GXAA 2ZYOA 3A3CA 1MY2A 4N6PA 1O63A 2REGA 4QF9A 1LAGE 4YMBA 1VR5A 4ZE8A 1LB8A 1DMBA 5DEXA 3MP8A 1FQBA 1YTVA 3FVNA 3T96B 1ZMGA 4G2ZA 4F31B 2QRYA 2Z8DA 1SYIA 1UQWA 1LGBC 4F3BA 1Y1ZA 3VFJA 4OEVA 3TZAA 1SVXB 2XXYA 4LQ2A 4BDRA 1MXUA 1PC3A 3RGYA 3CFLA 4LZ5A 1IZ1A 3G3GA 5F1QA 3UA8A 2V3UA 3KN7A 3K1NA 3VV5A 2OJTA 1A54A 3PUZE 4PQJA 3DELB 1S7YA 2W7YA 1NKXA 3TTKA 1LFIA 3IJXB 2DWJA 2UVHA 1A40A 3KN3A 2O51A 4JSOA 3R7XA 3QIMA 2ZNSA 3ONMA 1SD3A 1H76A 3IO4A 1A55A 2F7CA 2B3FA 4I1DA 1OQGA 3IO6A 3P7IA 5I56B 2HEUA 2HFBA 4MLVA 1T0KA 1YPNA 3CIJA 5DVIA 1N3XA 2PT2A 4ECFA 3T9VA 2DXYA 4XKPA 1LBCA 1B0HA 2YJPA 3TYHA 3L6GA 1MH3A 2HXWA 2NUVA 2XX7A 4EF2A 4Q30B 3G3JA 2QL3A 2AIXA 1MPBA 1IIWA 2Y7RA 4XKQA 3UN6A 2H25A 3OD7A 4FAJA 1FTJA 1NMUA 3FXQA 3PD9A 3MZ9A 3K2DA 4NF6B 2I4BA 4N13A 3EHSA 1B7UA 1MM7A 1BP5A 1JETA 1FQFA 1MM6A 4GL8A 1BLFA 1NNFA 5ICTA 1MQJA 1QUJA 1LAXA 3OSQA 4OFJA 1LB9A 2M8CA 4DIGA 3FVOA 3QXMA 3FATA 1MQIA 1NNPA 4QHQA 4OERA 1BIYA 1P1WA 2RINA 2QS2A 3A09A 1IEJA 4R2FA 4Q0CA 2V3TA 2WKYA 3VLVA 2REJA 1B7ZA 3RLFE 2PMSA 3FZVA 1QW0A 2GRVA 2R6GE 1ELJA 3LBSA 3K01A 3CR9A 3C34A 3TCFA 4GVOA 1MXVA 4YB6A 1P1OA 1P99A 3PGFA 1QUKA 2XXPA 1B40A 4NE4A 1B51A 1II5A 3OEMA 3Q28A 2RC9A 1MDP1 4M1VA 3H03A 4F3GA 1M5CA 4JDFA 4P0IA 1IITA 1PB9A 1US5A 4NF5B 1N84A 1MG1A 5IKBA 1Y3NA 5AA2D 1ZTYA 3DP8A 5DVJA 3MVWA 3ILTB 3TAJA 1GTKA 1IXGA 2GHAA 2F7BA 1LSTA 4R73A 3RNNA 1LLSA 4EUOA 4PP0A 1NH7A 2X7PA 3U72A 4PFUA 3IORA 1MXYA 1H43A 5JTYA 1ZLQA 2RC7A 3H6UA 2NVUB 5CMCA 4F18A 4GL0A 3FUZA 4E0XA 3S4UA 3G3IA 5I84A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DCYA 3O28A 4GBWA 4MAGA 2ABHA 4M4GA 2Y5LA 1TT1A 1LBBA 1B0LA 4P56A 4EXKA 5H8NA 4ZZAA 1UIVA 2QSXA 4KI0E 4XFEA 5H8FB 5AE4A 5JEIA 1I6QA 4O3CA 1GV8A 1JEUA 4OVRA 2A5TA 3ZKKA 5TP9A 5L9MA 4KCCA 3WAEA 3VVDA 3RT6B 1SI0A 3C9HA 2R9JA 2THIA 3USDA 4F1YA 1QJMA 1VSOA 3O66A 2O68A 1LCFA 4AQ4A 1YCJA 1PB7A 4O3BA 1J1NA 2I3WA 5CMBA 1RDXA 3JZJA 3LSFB 5F24A 2UVGA 1EYIA 4OVQA 3UGWA 4MBPA 3Q27A 1A8EA 4WEDA 1FBDA 2FBPA 4JVCA 4U1OA 4LZ8A 3H6TA 1RDZA 3DP4A 3RTWB 3PUVE 3KOTA 3GYYA 1B9JA 1BK4A 2HXRA 1B5JA 1FQDA 2V4CA 1D9YA 4PF6A 1FBGA 1MDQA 2ALUA 5BUUA 1LBZA 1MRPA 2VD3A 4R9GA 3KSJA 4LUBA 4F3SA 4YKIA 1MY1A 4RYAA 5H8QA 2O1MA 3BFUA 3DM0A 2DYXA 2IA4A 3CFZA 1Y1MA 4IO4A 4BDLA 4Q8RA 3Q26A 3UP9A 2CEYA 4N91A 1CE2A 1UTHA 1RKMA 4P1EA 3IX1A 1DPPA 2X26A 4GRKA 1MS7A 5I59A 4X8RA 4FEBA 4YU0A 2CMOA 4I3YA 4XKNA 2XXUA 2XHDA 4NGUA 4LP2B 1JW4A 1XC1A 3IFCA 4GWWA 3CSGA 1FBCA 3Q25A 3QK6A 4HS7A 4ZEFA 1FPGA 3TCHA 4JBZA 4JVIA 4MLQA 1EZPA 1A7LA 4H1XA 1IXCA 3PTYA 4G8NA 2F6PA 3PV0E 3FD3A 3PPRA 4FBPA 1F9BA 1FQAA 3S9MC 2KR0A 2I49A 4IO2A 3HN0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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