4O3CA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain in complex with l-aspartate at 1.50 a resolution
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein/agonist
source organism Rattus norvegicus
publication title L-Asp is a useful tool in the purification of the ionotropic glutamate receptor A2 ligand-binding domain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 89
structure length 262
sequence length 262
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4o3cA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4o3cA02
3PU5A 5CI5A 2I4BA 1M5EA 3H06B 5H8NA 3C9HA 4P11A 1MRPA 4HCYA 4YICA 4JSOA 1NNTA 3VLWA 3RNNA 3VXCA 1ZJLA 4GF8A 1XC1A 4F29A 4NEDA 3PUYE 3FV1A 4OMBA 3KJ7A 2P2AA 3LSFB 3IORA 2I0CA 4F1YA 2I49A 4U21A 1II5A 4G8HA 4TOZA 1H3DA 1P1WA 1URDA 4HCWA 3SEVA 2F8DA 3M3LA 3MQ9A 3G3IA 1URGA 2ZNUA 1FQCA 3OO7A 5H8QB 4QSCA 1PDAA 1SYIA 2O1MA 3C34A 2DP8A 1A55A 1EZPA 4IGRA 4UACA 2HAVA 4LZ8A 3OD7A 1PB7A 1YTVA 2V25A 2PT1A 1MXUA 3OOAA 2F35A 1B5HA 2W7YA 1XS5A 2Y7KA 2VD3A 3IB2A 1FTKA 4I1DA 1N76A 5DVFA 2V3QA 1IUDA 1OMPA 2OWTA 4H8IA 2D5WA 2DWAA 5AA4B 3H3GA 1OLAA 4OYVA 3CRBA 2B3BA 4EQ7A 3LR1A 4ELRA 3PMWA 2Z22A 1JVYA 2I58A 3SEWA 2DE3A 2GFEA 4QFLA 3SEYA 3VLVA 4KI0E 1A7LA 3RTWB 2UVIA 4NMYA 4YB5A 1SW5A 1MDP1 1MXZA 4HW8A 4P0IA 1MPBA 1Y4TA 1LAGE 3H6UA 1MQJA 5EHSA 3PPOA 4OXVA 4KCDA 1TT1A 2XX8A 5JTYA 3IO6A 2QJEA 4DZ1A 4XXUA 5DVIA 1VFEA 2DSFA 3DELB 1ELJA 4KYEA 3C36A 1UIUA 4X9TA 1B9JA 2QS2A 1I69A 1SYHA 1B46A 1BP5A 5DTBA 4PP0A 2DXYA 4DXUA 4LQ2A 2Z23A 4R74A 3W9WA 1SVXB 4NTLA 5H8QA 3FJMA 2PBWA 3H6TA 5ELVA 2R9JA 3EF7A 4U2RA 4ESXA 4GQOA 4ISUA 5ICTA 4NF5B 3KSJA 3WAFA 2H98A 1A8FA 4O3AA 3HSTA 4YMAA 3C35A 2XXVA 5H8FB 4ZECA 2XXHA 4LA9A 3R26A 1SQYA 5TU0A 3SERA 3R6UA 3QXMA 1POY1 1M5FA 4G77A 2CMOA 3VVEA 3ZSFA 4NWCA 1PBPA 2YLNA 3JV9A 4U1ZA 4H5GA 2GHAA 4FAJA 2RC8A 2ALUA 3S9LC 5AA4A 2I48A 4UA8A 3I6VA 4XIGQ 3KBRA 1QUJA 4OWDA 1B3FA 1FTMA 4YKKA 3EHSA 2AL5A 2VGQA 4GRKA 3QUFA 4QSDA 4KD5A 3CFLA 3OEKA 3N6UA 4R9FA 1B05A 1QKAA 3BBRA 2GHBA 2OBGA 3PMVA 4FEBA 3C4MA 1YPNA 2V3UA 3OENA 4G68C 4YKJA 3DP4A 4QSEA 1ZMGA 2HZKA 2UVGA 3HHGA 1JW4A 4RK2A 4EQBA 2O1LA 1A99A 4AB5A 1B3GA 5J1DA 2V3TA 3TYHA 4OENA 1P1OA 1NKXA 4ECFA 2QS3A 1ZBMA 3MWBA 4P0GA 5I59B 1B7HA 2GRVA 5TP9B 2XHDA 1SI1A 1Y3NA 2I3VA 1POTA 4ELOA 1PB8A 2OZZA 4FECA 4RPOA 2F78A 1Z7ME 3V8XB 4KHZE 4IO7A 5B7DA 1MM7A 3IR1A 4DE8A 2UYEA 1FQAA 1B2HA 4FE8A 3Q28A 3H4ZA 3HPIA 4R2BA 4FEDA 1H43A 2ZMBA 4NF8B 4NF5A 1B4ZA 2X26A 3JYRA 4IB2A 3C32A 3SEXA 5I2NA 3UORA 1QW0A 1H45A 1Y4CA 2CZLA 5H8FA 1USYH 4F3PA 2QRYA 1JVXA 4PFWA 3PUVE 4C0RA 3FATA 4IO6A 1P1NA 1FQDA 1P1QA 4QFKA 4FIMA 4ZEIA 3IK6B 3RPWA 1PB9A 3N6TA 2H5YA 4IO2A 3E9XA 3CG3A 3TCFA 1MY1A 1DTGA 1FW0A 3GXAA 3K4UA 3ECRA 4YAHX 4MLVA 3V83A 3ZKKA 4EUOA 4G68B 5DEXA 2A5TB 3IOWA 1B7ZA 5ICQA 1WVJA 3UN6A 2PMSA 3FV2A 4LVQA 1SW2A 1D9YA 1TFDA 5AA3A 2UYFA 1OLCA 5L9SA 5CM6A 1IEJA 4C1UA 3D4GA 5BWJA 4ZDMA 5KCJA 1YCJA 3GLBA 4PFYA 3TQLA 1Y3QA 4DDDA 1GTKA 1MDQA 4X1DA 3TCHA 3O29A 3Q29A 5EYFA 3OEMA 4OTEA 3FZVA 3DLNA 2F7AA 3TKDA 1BKAA 3L6GA 1LB9A 2RC9A 4DCYA 1Y3PA 4G2ZA 1Q35A 4FORA 3TTRA 4L17A 4MBPA 2PX1A 1UTHB 2HAUA 4OEUA 1RYOA 2R6GE 1IXIA 4OFOA 4EXLA 3U93A 3RQTA 3BKIB 4R73A 3CFXA 2OLBA 5FHOA 4IO4A 3CFZA 3W9VA 2O7UA 1CE2A 1Y9UA 4NF8A 4R6HA 2QMWA 2Q88A 4F3GA 1MPDA 2UVHA 4EF1A 3LBSA 4R72A 3PD9A 3W15C 1GV8A 4Q8RA 4TLLB 1B1XA 3KN8A 5A5XB 1AH5A 2F5XA 1LBBA 2KLFA 3T9XB 4LQ5A 2H9BA 3CSGA 3K1MA 1MQHA 1B3EA 2DWJA 4GXAA 3O6HA 1BLFA 4I9DA 3GZGA 3H7MA 4THIA 3TFLA 4OHNA 1JEVA 4OZ9A 5FTIA 3MVXA 3K2DA 4XKQA 2IA4A 4ND9A 4PFTA 1JEUA 3H03A 4G68A 4M4GA 3G7WA 1OQHA 2A5TA 1SDXA 4XKNA 1LLSA 3MAMA 4LZ7A 3KEIA 3F11A 3T9HB 3RUMA 1MY4A 1Y1ZA 1B6HA 1MXWA 4KQPA 1DSNA 2NXOA 3BFTA 3MZBA 4G8NA 2ONSA 1US5A 2DWHA 3O66A 1N7WA 4KYDA 2Z8EA 2Y84A 2QL3A 1Z7NE 2XXWA 4ZEKA 5KZTA 4F1UA 4F39A 4NF4B 4PFUA 5BUUA 1XT8A 2QSXA 1NNPA 1FCKA 5TPAB 2NWJA 1MM6A 4HTGA 4RA1A 1BTJA 1IXGA 3OSQA 4GD5A 1UTHA 4F18A 1QUKA 3THIA 1B3HA 3IB1A 5AA2A 3PPRA 2XXXA 3HCQA 4E0WA 3ONMA 4LZ5A 3UIFA 4JXIA 3RT6B 3JZJA 4GOTA 1B58A 1JQFA 3AXFA 3LSWA 3G3GA 4RPNA 2XD3A 1B51A 3I3VA 3HV1A 3MP1A 1OIBA 2F6PA 2QPQA 4MFIA 4N6PA 4JWYA 2E1SA 3M3FA 2ESNA 3PPQA 1IITA 4YKPA 2REGA 4QFOA 4RK9A 1MQGA 5DYHA 4NE4A 1B0LA 2ABHA 4YB7A 1NFTA 1A54A 3VXBA 3MJNA 1LSTA 1P1UA 1SD3A 3RN8A 5CC2A 2Y7WA 3IOTA 3KGCA 5H8SA 1M5BA 1RYXA 3T22A 4POWA 2VHAA 1I6BA 3K1PA 2REJA 4JBZA 4ZZAA 4U4SA 1H44A 1WODA 4ZEBA 2RCBA 4WXJA 2XX9A 4YKIA 5IKBA 2XXIA 1B32A 1B0HA 3FJ7A 3UK4A 3RTFB 2AIXA 3TQWA 5B70A 4ZEFA 5AE4A 3FXQA 4I62A 3QSLA 2WKYA 4QFNA 1AOVA 4DXCA 2VP1A 3CG1A 3MPKA 1XVYA 2O69A 2XD2A 3FVGA 3HHFA 2QMXA 3H6VA 2P1SA 4NF4A 2NOOA 1XOCA 2UXAA 4IGTA 4DCXA 1TFAA 3CI8A 1XHYA 1MQIA 3HO7A 3M8UA 2Y7IA 3TCGA 1LBCA 2QS4A 4PETA 3EPEA 2XXTA 1S7YA 1USYE 4QRZA 3CVGA 2PT2A 5JK4A 2XXPA 3SEUA 2NVUB 3OO9A 2ANJA 4KCCA 2ZYNA 1LAFE 3ILTB 5CMCA 1DOTA 2ONRA 1TXFA 3B6WA 4GLIA 3WAEA 1EH3A 2DWIA 4M1VA 3MPLA 4ZZEA 1R9QA 3OO6A 1S50A 3FVNA 1ZTYA 2DXRA 1OVTA 4RNSA 4YU0A 3M3KA 2YPNA 3G3HA 2DQVA 4H65A 4F1VA 4F3BA 3IJOB 4OEVA 5K2YA 3MW0A 4R2FA 1Y20A 2RKMA 2BJJX 4H0WA 3TTLA 2LAOA 3TELA 4R75A 1IZ1A 1QUIA 3PUWE 3QYTA 3O9PA 1PBQA 3T93B 1LFIA 2ZYKA 4QHQA 4DIGA 4JSDA 3SESA 1OQGA 1M5DA 3IJXB 4BDLA 2DVZA 3LSXA 3PV0E 3O2AA 3KN7A 2I6EA 3VVFA 4XTCQ 4U1OA 1A40A 3MVWA 3TODA 1SW4A 1NH7A 3C31A 3Q25A 3FIRA 4EQ9A 2Z8FA 3FUZA 4BDRA 2UVJA 1DPPA 1HSLA 2I4CA 4FJPA 1O64A 4Z7EA 4GWOA 3UA8A 4C1TA 3KSXA 3VV5A 4NF6B 4O3BA 3A3UA 3EHTA 4PQJA 1XVXA 2D3IA 4WEPA 4OFLA 1PC3A 1HSEA 3GBBA 3V5AA 2F34A 3EN3A 5FHMA 3SKPA 1URSA 3B7DA 1IXCA 2RF1A 3IOVA 3FVOA 1T0KA 4AB6A 3P7IA 3BFUA 4N07A 4X48A 2HCAA 1LB8A 4H8JA 1KWHA 4MF3A 2DVCA 1D3KA 3DP8A 3KJTA 4OVJA 3TAJA 3LC8A 2PYYA 2Q8JA 5HBCA 1L5TA 5CMMA 3KOSA 4I8CA 4JWXA 4WEDA 4ZE8A 5I59A 3K00A 3MVYA 1US4A 3O28A 5TP9A 3KOTA 4GL0A 1DPEA 3UP9A 1UIVA 4Q0CA 1B40A 2H99A 2H4IA 3U94A 1SBPA 2THIA 3PUXE 1QJMA 4H5FA 2FA7A 3TPAA 4GIZA 3O6GA 1FQFA 4R6YA 3G3JA 4ELQA 4BDMA 1ZIUA 4KPTA 1VE4A 3ILUB 5M2VA 1B3LA 5I57B 1AMFA 1VR5A 1N84A 4BLAA 4E0XA 1SI0A 2RCAA 1SW1A 3RGYA 5ITOA 1P99A 2DE2A 1HSJA 5JTYB 1EU8A 4OQOA 3ODBA 3IAZA 4ONYA 3RLFE 3OO8A 2XX7A 1YAEA 1GGGA 3LUYA 3KN3A 3TUSA 2AYSA 3PUZE 1MXXA 1RKMA 1ZU0A 3MP6A 4EXKA 2F7CA 2H25A 1ZLQA 4BDOA 4NF6A 1F9BA 4QF9A 3OXNA 5KDTB 5H8HB 3A3CA 3K6XA 3CR9A 3LSLA 2P0SA 3T9UA 3U1OA 1B7UA 1N04A 5ITPA 1IXHA 4Q30B 1B1HA 3KZGA 3O6IA 4YZZA 3G3FA 3N5LA 1I6QA 1MH4A 4F2OA 3U92A 2R71A 3VE1B 4R9GA 2Q89A 1D4NA 5CBRA 1JETA 2VD2A 4PE5B 2OK2A 4GL8A 4OFJA 3MVZA 3FXUA 5I2KB 4KR5A 3RT8A 3C33A 2D21A 4IY6A 3TMGA 2ZXTA 4MLQA 1I6AA 4HS7A 2O6AA 5DT6A 5EHMA 4O3CA 3MC2A 5AA2D 3QUJA 1Y1MA 2O7IA 3GBAA 3IX1A 4F19A 3S4UA 3V89B 4F3SA 1PEBA 1MXYA 2V84A 3E4RA 1N3WA 3S9EA 4OETA 3L6HA 1N7XA 2F6GA 4ZS9A 3MP8A 3MZ1A 3KG2A 3TEPA 1JW5A 2ZYOA 1FTLA 3EHUA 5I57A 1BIYA 2HFBA 2O84X 1OVBA 1VSOA 5HM4B 4R6KA 1GVCA 1MQDA 4KYSA 2GH9A 1MS7A 3FASA 1LCTA 3DP6A 5A5XA 4OERA 3PPNA 4ELPA 1LGBC 2QS1A 2FNCA 4Z0IA 5CMKA 4KFQA 3QIMA 1AIVA 1A8EA 4F31B 5L9OA 3TTNA 3PD8A 3ZS6A 5F7VA 3TTKA 3EQ1A 2F7BA 4GVOA 3U72A 3QK6A 4IY5A 1NH8A 3FVKA 5LOMA 3N94A 1AL3A 3T96B 3MUQA 5KDTA 5H8HA 2F97A 4U23A 4XKRA 4RY1A 1B52A 3B6TA 1B4HA 1LCFA 2F36A 1MXVA 2HXWA 1IIWA 3CIJA 5I2NB 5I56B 2X7QA 4DXBA 3SETA 4TQUQ 2HEUA 2I0BA 4ZE9A 3FJGA 1NMUA 3E3KA 3T66A 2AL4A 5L9MA 4QFPA 5I84A 3OELA 4JWOA 4WKMA 2Y7RA 5CBSA 4XKPA 2VOZA 2ZNSA 3RY3A 1LFHA 5CMBA 1JW1A 5FHNA 5FTHA 5I2KA 2OCUA 5TPAA 1B5IA 3ZKLA 1UQWA 2OJTA 1S9TA 5ISUA 2XXYA 3Q27A 3K0VA 4OESA 4EF2A 3KFMA 3PMXA 3USDA 2Z8DA 3FXRA 1LFGA 5DEXB 3MBPA 3PPPA 2RC7A 2DS9A 3VDFA 1MG1A 4G4PA 1R1NA 4TLMB 1MY2A 1M5CA 1VFDA 1ZKBA 4RYAA 4H6DA 2A5SA 5CRYA 1FQEA 3TZAA 3TDJA 5KCJB 2XXRA 1WDNA 2O51A 3HN0A 5DVJA 3I5OA 5HPQA 3K6VA 3MZ9A 5I58B 3IB0A 3R7XA 4LUBA 4LONB 3SDFA 1JNFA 1N3XA 3VLUA 1D9VA 2Y7PA 1O7TA 2ZYMA 3K6UA 1FTJA 4BDNA 2B65A 2V93A 1MY0A 3IOUA 3K01A 2OWSA 3OMBA 1NL5A 2X7PA 2B3FA 2NUVA 4GXSB 3QAXA 1O63A 5L8DA 2G93A 2Q2AA 4N13A 2DOJA 2O68A 2Q2CA 4RJZA 1Q1KA 1QVSA 4H67A 2ZNTA 3G3KA 3FD3A 1UTBB 3B6QA 1DTZA 4X1BA 4G8MA 4RXLA 2RINA 1N0TA 5H8NB 4F22A 2HQ0A 2I3WA 1MPCA 5AA1A 1GR2A 5I56A 1QKBA 3S9NC 3IL1B 3IO4A 3N26A 1LAHE 4H1XA 4ESWA 1NNFA 2DE4A 4YMBA 1LAXA 1CB6A 3TTMA 3FGSA 3K6WA 4IO5A 2G29A 3OSRA 4F2QA 1TWYA 4U4XA 5IAIA 3D4CA 4IO3A 3T9VA 3O97A 1J1NA 5F1QA 1EZOA 3DM0A 3S2VA 1R9LA 1ANFA 2FYIA 4BDQA 2DYXA 3VFJA 1B5JA 3A09A 1MH3A 4EDPA 4GFRA 3K1NA 4K3FA 4MH5A 1NNKA 4DLDA 5I58A 4NWDA 2XXQA 1FTOA 4LATA 2ONKE 3E13X 1H76A 5K2XA 3UGWA 3Q26A 1MY3A 1FQBA 4FATA 1IQ7A 4LP2B 1ATGA 2YJPA 2HZLA 4U22A 2IEEA 2XXUA 3CSBA 1QULA 1DMBA 3H6WA 4JB7A 3S9MC 1R6ZA 2M8CA 4JDFA 2Q9TA 4Q5TA 5AA2B 4ZEDA 3PGFA 2E0SA 4YB6A 5JEIA 2PVUA 3K02A 4AQ4A 4POXA 3U8QA 1EZ9A 3VVDA 1UTBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3PU5A 5CI5A 2I4BA 1M5EA 3H06B 5H8NA 3C9HA 4P11A 1MRPA 4HCYA 4YICA 4JSOA 1NNTA 3VLWA 3RNNA 3VXCA 1ZJLA 4NX1A 4GF8A 1XC1A 1LBZA 4F29A 4NEDA 3PUYE 1FJ6A 3FV1A 4N6KA 3LV0A 4X04A 4OMBA 3KJ7A 2P2AA 3LSFB 3IORA 2I0CA 4F1YA 2I49A 4U21A 2QVRA 1II5A 4G8HA 4P1EA 4TOZA 1H3DA 1P1WA 1URDA 4HCWA 4PE3A 3SEVA 2F8DA 3M3LA 3MQ9A 3G3IA 1URGA 2ZNUA 1FPDA 4OVSA 1FQCA 3OO7A 5H8QB 4QSCA 1PDAA 1SYIA 2O1MA 3C34A 2DP8A 4O7IA 1A55A 1EZPA 4IGRA 4UACA 2HAVA 4LZ8A 3OD7A 4O94A 3SZPA 1PB7A 1YTVA 2V25A 2PT1A 1MXUA 2OWZA 3OOAA 2F35A 1B5HA 2W7YA 4MNIA 4GX4A 4MCOA 1XS5A 2Y7KA 2VD3A 3IB2A 1FTKA 1NV5A 4I1DA 1N76A 1FRPA 5DVFA 2V3QA 1IUDA 1OMPA 2OWTA 5IZ3B 2Q74A 4H8IA 2D5WA 2DWAA 4N15A 5AA4B 3H3GA 1OLAA 1VDWA 4OYVA 3CRBA 2B3BA 4EQ7A 3LR1A 4ELRA 3PMWA 2Z22A 1JVYA 2I58A 1RDYA 3CHGA 3SEWA 2DE3A 2GFEA 4QFLA 3SEYA 2P3NA 3VLVA 4KI0E 1A7LA 3RTWB 2UVIA 4NMYA 4YB5A 1IMFA 1SW5A 1MDP1 1MXZA 4HW8A 4P0IA 1MPBA 2FIXA 1Y4TA 1LAGE 3H6UA 1MQJA 5EHSA 3PPOA 4OXVA 1SPIA 4KCDA 1NV3A 1TT1A 2XX8A 5JTYA 3IO6A 2QJEA 4DZ1A 4XXUA 2KR0A 5DVIA 1VFEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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