4O3CA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain in complex with l-aspartate at 1.50 a resolution
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein/agonist
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title L-Asp is a useful tool in the purification of the ionotropic glutamate receptor A2 ligand-binding domain.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 89
structure length 262
sequence length 262
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4o3cA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4o3cA02
1JEVA 3TMGA 1FTOA 1MRPA 1IXGA 4MLQA 3IOUA 4M4GA 5EHSA 1PBPA 2NXOA 4ZDMA 3U8QA 2I4BA 2DE4A 4H6DA 2GHAA 1S50A 4QF9A 3QSLA 3FVNA 5IAIA 1ATGA 1OQHA 3V83A 1UIVA 1LLSA 4MBPA 3H3GA 1MXWA 1B58A 3V89B 2I49A 1FTJA 3ZKLA 1Q35A 3G7WA 2IA4A 3K2DA 2QJEA 4R6YA 3R26A 1LAHE 4JSDA 1JQFA 2E1SA 3MJNA 3KGCA 2ALUA 1GGGA 3OEMA 3PMXA 3EHSA 3MC2A 4ZEIA 1S9TA 1OVBA 3TELA 3N5LA 1MPCA 4GWOA 2R71A 1SW5A 1DTGA 2I48A 1AIVA 5FHOA 3PU5A 1B3FA 3O6IA 3FXQA 4FJPA 1N7XA 2DXRA 3T9XB 1PB7A 4PFTA 3DELB 3T93B 4XKPA 4P11A 4O3CA 1ZMGA 2QS3A 3RUMA 1A40A 4NWCA 1P1WA 4GOTA 4H67A 3MBPA 1FQEA 2QRYA 3T9HB 3IR1A 3TTLA 2NWJA 2Z8EA 4QHQA 1FTKA 3C33A 3R6UA 3VFJA 1XC1A 4POWA 4JWXA 4JSOA 5JTYB 4X1BA 1S7YA 3LSWA 2IEEA 2WKYA 2PMSA 4R74A 1B3GA 3M3FA 3VXBA 2GRVA 1XS5A 3TODA 2DYXA 1TFAA 3E4RA 4IGRA 4YB5A 3K02A 1TT1A 1MXZA 4GD5A 1P1QA 3QK6A 1OIBA 2XXYA 1JW4A 1URGA 1XVYA 2Q89A 3MZBA 5A5XB 4UA8A 3VE1B 1H45A 2F5XA 1MQIA 1SBPA 2Z8DA 3EN3A 5TPAA 2AIXA 2DWJA 4JXIA 4F2OA 2DWIA 1FQAA 5ISUA 1Y20A 4NF8A 3O28A 5I59B 3PPNA 4R2BA 4YMBA 3H03A 2RCAA 2XXPA 4JWOA 1M5EA 3OXNA 4DZ1A 2VP1A 3QUJA 1GVCA 2V93A 4IO6A 2D3IA 4F18A 4NMYA 1HSEA 3ONMA 2QS4A 2GH9A 4XKRA 4QRZA 3OENA 3SERA 4FEBA 2F78A 3TPAA 3OO6A 1LCFA 3T66A 3HHGA 2DQVA 2E0SA 5L8DA 3RTWB 4LQ2A 3RLFE 3EQ1A 3FUZA 1MH4A 5KZTA 4Z7EA 4U21A 4EF2A 3O2AA 1ZLQA 1EU8A 1LAXA 3FJGA 3OO8A 4KHZE 1IXCA 1POTA 3H6UA 1VSOA 3K6UA 5H8FA 2V3UA 2O69A 1I6AA 1PDAA 1PB9A 4X9TA 4YZZA 3UORA 3U92A 2AL4A 2X26A 5KCJB 4BDNA 1LB9A 1B7HA 3SESA 1UTBB 4IO3A 2ESNA 1IEJA 1QVSA 3OMBA 1AMFA 1B0LA 4EXLA 3MVXA 5I58B 2XXTA 4L17A 3G3JA 5ITOA 5DVJA 1A7LA 3Q27A 4LZ5A 1MDP1 4EXKA 1B05A 1SDXA 3KG2A 5CMCA 2P1SA 3P7IA 1B4ZA 1R6ZA 3RTFB 5FHMA 4GL0A 5ICQA 3IO6A 3BFUA 1SI0A 1UTHA 3IK6B 2YLNA 4PQJA 1FTMA 2OBGA 1N84A 5I56B 1N76A 2P2AA 1JW1A 3ECRA 4PP0A 2DXYA 4QFPA 3D4CA 2VD2A 3QAXA 4ECFA 2VOZA 4PFUA 1JVYA 4OEVA 3KN7A 1D3KA 4TLLB 2XHDA 4YKPA 5HPQA 1IXHA 1FQDA 4U23A 4NF5B 1TXFA 1FTLA 3MQ9A 2F7CA 4P0IA 2REJA 4G8HA 4JB7A 3MP8A 4MLVA 3SEWA 3CFXA 1RYXA 3WAFA 2B65A 3VVEA 3C34A 4U4XA 3B6QA 3SEUA 1DSNA 2KLFA 1ZBMA 3TZAA 3N6UA 1Y9UA 2F7AA 3B6TA 2W7YA 1SI1A 2PYYA 2UYEA 4NE4A 3PPOA 1NH7A 4ZE9A 3W9WA 1QUKA 3FASA 5JK4A 3O6HA 3MPKA 5ICTA 4YKKA 4LZ7A 3S2VA 2O51A 2V3QA 2Y7RA 1OQGA 2XXXA 5EHMA 5I57A 2XD3A 1OLCA 2ONRA 4ZZEA 1SW2A 2I4CA 3UP9A 3N94A 2GFEA 1T0KA 4F3BA 2ZNTA 3I3VA 3T9VA 1MH3A 3M8UA 2PVUA 5H8SA 1MY2A 2THIA 4LVQA 1QKBA 3G3FA 4GVOA 4XIGQ 1IIWA 5I2NB 2Q88A 2ZXTA 4PETA 4RXLA 5H8QB 4E0WA 3FJMA 4DE8A 2A5TA 3OO7A 2F36A 4AQ4A 3K00A 2HAVA 4DXCA 1B5HA 3VVFA 4G8NA 1IQ7A 1BIYA 1MY3A 2YJPA 3G3GA 2XX9A 2QPQA 3CSBA 5TP9B 2OWTA 3MPLA 2QS1A 3S4UA 3FGSA 4IO2A 3GZGA 5CMBA 5FHNA 3DP4A 1D4NA 2PX1A 1NFTA 3OSRA 5B70A 3CG1A 3MWBA 2PBWA 3GBBA 4R6KA 4F3PA 1MY0A 5JTYA 2XXRA 1VFEA 2DS9A 4U1OA 3G3HA 1RKMA 2DVCA 3O66A 4HTGA 1H76A 1B5JA 4ISUA 1B40A 4MFIA 1B0HA 2QS2A 5L9SA 3W9VA 3H6WA 1CE2A 4C1UA 1SQYA 2PT2A 5AA1A 5H8NB 2XXQA 4FE8A 5A5XA 4JDFA 4OETA 3UA8A 3V5AA 4HS7A 2ZYNA 3KFMA 3EF7A 3IOWA 5AE4A 3PUZE 5DT6A 4H0WA 3M3LA 2YPNA 2AYSA 1HSLA 2R6GE 4M1VA 3LC8A 1A8FA 1DTZA 5I59A 3TYHA 1LFHA 1LAGE 2Y7KA 1DOTA 3K6WA 5I2KB 1Y1MA 3SDFA 3PUXE 4ELPA 4HW8A 5AA4B 3GLBA 4DCYA 4KYDA 2ONSA 2UXAA 3Q26A 4WEDA 3TCHA 3FVOA 3C35A 1Y3QA 4XKNA 3RPWA 3HSTA 1Y1ZA 1ZJLA 4FATA 3BFTA 5H8HB 2I6EA 3S9EA 4ZECA 1A55A 1MXUA 4GLIA 2A5SA 3U72A 4G4PA 4KYEA 3U94A 3E3KA 2H99A 4KFQA 4NEDA 4GRKA 3V8XB 5K2XA 1USYH 1LFGA 3AXFA 1UIUA 3IO4A 3E13X 2F35A 4DLDA 1B3LA 1B46A 1MXYA 3CFZA 4DCXA 3TFLA 2O1MA 1JEUA 4WEPA 1B4HA 2REGA 3H06B 1O64A 1A99A 3UK4A 4Q30B 1R9LA 4XXUA 3K1MA 1QKAA 4F1VA 3CFLA 4OFOA 2Y7IA 5KCJA 3IOTA 2XXUA 3SKPA 3MUQA 1UTBA 3MP6A 3RY3A 5LOMA 3H6TA 1QW0A 3HHFA 1LB8A 2V3TA 2HEUA 4G68B 4DXBA 5I58A 4RY1A 4G8MA 4Z0IA 4ELQA 4KPTA 1MPBA 1TWYA 3Q29A 4QSDA 5AA3A 4F19A 4IGTA 2DWAA 3RGYA 1IXIA 3KOSA 3PGFA 1URSA 1B1HA 1VR5A 1Y3PA 3F11A 2ZMBA 1B2HA 5I56A 2DWHA 3OSQA 4ZEDA 1ANFA 3CSGA 3N6TA 3MVZA 4H65A 5L9OA 4U22A 3IAZA 4GXSB 2Q2CA 4BDOA 5AA2B 1BTJA 4G2ZA 1NKXA 3MAMA 3IJXB 3TQLA 4NF5A 5DVIA 3IL1B 1BLFA 3PD9A 3K0VA 3VVDA 4R2FA 1H43A 3KOTA 4RNSA 3A3CA 1J1NA 3KBRA 3PV0E 3EPEA 1NH8A 3KZGA 1LBBA 1MY4A 4JWYA 5F7VA 3K01A 2ANJA 1Q1KA 3KN3A 1AH5A 4TLMB 4OMBA 4H5GA 1QUIA 3FIRA 1PC3A 1DPEA 3TTMA 3C32A 4WKMA 1QUJA 4FECA 4C0RA 1JVXA 2D5WA 4ZEFA 1LAFE 3BKIB 2R9JA 4R72A 4OWDA 3KN8A 3TCFA 4R6HA 2NUVA 4WXJA 3K6VA 1NNFA 4KCDA 3SEXA 3UGWA 1MG1A 3B7DA 4IO5A 5I2NA 1Y4CA 3O6GA 1XHYA 5H8QA 3H7MA 3G3IA 4ELOA 4K3FA 4F3GA 2DSFA 3O9PA 2NOOA 1DMBA 3I5OA 2HFBA 4FAJA 5ELVA 5TP9A 4IO4A 4N13A 2OLBA 1TFDA 5FTIA 2ABHA 3S9LC 4HCYA 1GV8A 2ZNSA 4IO7A 4NWDA 4BDMA 3TTKA 3LSLA 3QUFA 2DE3A 1US5A 4YMAA 1WVJA 1LGBC 2F7BA 3ZSFA 4R75A 2O7UA 4I8CA 5K2YA 4OFLA 3BBRA 2I3VA 4ND9A 4PFWA 4GFRA 2RF1A 5DEXB 4I62A 3TQWA 1B3HA 2VGQA 4ZZAA 2HAUA 5H8NA 4NF8B 2M8CA 2H98A 2Q8JA 3W15C 2I0BA 2Q9TA 1OLAA 3MZ9A 5DYHA 5CBRA 3RNNA 4RPNA 3MW0A 1II5A 2NVUB 3TAJA 3PPQA 4YU0A 5HBCA 3JV9A 5B7DA 1IITA 3O29A 3CI8A 3PPPA 4NF6B 1B9JA 4IY5A 1H3DA 4GIZA 3PD8A 5I2KA 4BDLA 4NTLA 3FXRA 5AA4A 1YPNA 3RT6B 3OOAA 3GXAA 3L6HA 2ZYMA 1GR2A 5AA2D 5H8HA 2RC9A 1MQGA 4PFYA 4QFOA 2RKMA 1ZIUA 1R9QA 5H8FB 1I6BA 3RT8A 2QSXA 3T96B 4RK9A 1FW0A 4LUBA 1B7ZA 2XXIA 4YB6A 4I9DA 2B3FA 4EQ9A 4QSCA 3KEIA 1JETA 5HM4B 4F2QA 2HZKA 5FTHA 3OD7A 5CC2A 4IY6A 3ODBA 4OFJA 1MPDA 1US4A 4E0XA 3FATA 1SD3A 4F3SA 2DP8A 2FYIA 5L9MA 1URDA 1I6QA 2HQ0A 2Y7PA 2B3BA 3PUYE 1FQBA 1MS7A 1NNKA 1IZ1A 3LUYA 4POXA 3TTNA 4G68A 2Y7WA 1RYOA 3VDFA 3RQTA 4OERA 3RN8A 1N0TA 4THIA 3R7XA 4YICA 1HSJA 4GQOA 2HXWA 3LSFB 5KDTB 2XXWA 4R73A 4HCWA 3KJ7A 5F1QA 4XTCQ 1EZOA 3K6XA 5DTBA 1O7TA 4F1UA 3LR1A 1POY1 4LA9A 3CIJA 3C31A 2OCUA 3HO7A 1JNFA 4C1TA 4XKQA 2CMOA 5J1DA 5ITPA 1P1NA 4RPOA 2DOJA 4H5FA 2Z22A 1CB6A 1D9YA 3G3KA 1MM7A 5CI5A 1Z7ME 4QSEA 4BDQA 3D4GA 4ZS9A 4U1ZA 3IB0A 5AA2A 4KD5A 4AB6A 1EH3A 2F34A 3LBSA 1USYE 3EHTA 3H4ZA 4EDPA 5BWJA 1OVTA 4N07A 2I3WA 4OENA 4OQOA 3JZJA 4NF4B 3DP8A 2F6GA 3C4MA 1MQJA 3PPRA 1VE4A 1Y3NA 2Y84A 2ZYOA 5I84A 2UVJA 1B3EA 5I57B 3JYRA 3ILTB 5DVFA 2G93A 4YKJA 2QMWA 1OMPA 2F97A 3VV5A 2FNCA 1PEBA 1LCTA 4U2RA 1BP5A 3GBAA 4Q5TA 1MQHA 4GF8A 2BJJX 5CMMA 3N26A 2XX8A 2RINA 4ZEBA 3FVGA 3FXUA 1I69A 4KR5A 5CM6A 4Q8RA 2HZLA 2A5TB 3MZ1A 1B51A 1KWHA 1SW1A 2VHAA 4R9FA 3THIA 3SETA 1N7WA 1FQFA 1FCKA 1R1NA 3FVKA 2UVGA 4U4SA 4X48A 4OXVA 3OELA 3L6GA 5EYFA 3A09A 2XXVA 1EZ9A 2AL5A 3SEYA 4F1YA 1GTKA 3U1OA 3CR9A 1XVXA 4EQBA 1B52A 1MM6A 1P1OA 3OO9A 3UIFA 1M5BA 2GHBA 1JW5A 2Z8FA 3PMVA 3CRBA 2D21A 2CZLA 4QFLA 1N3XA 3VLUA 1P1UA 2OZZA 1LSTA 3B6WA 4O3AA 1DPPA 2Q2AA 4GXAA 4P0GA 1WDNA 4X1DA 3FZVA 2I0CA 1A54A 5IKBA 4KCCA 2XX7A 4H8IA 3K1PA 1UQWA 3QYTA 4ZEKA 2LAOA 4H8JA 2O68A 4MH5A 4BLAA 1WODA 2UYFA 4KI0E 4DXUA 2ZNUA 2UVIA 3IJOB 1D9VA 3IOVA 5JEIA 1B5IA 5DEXA 3T9UA 4LQ5A 3M3KA 4MF3A 2P0SA 2VD3A 2RC8A 3K4UA 3LSXA 3T22A 3KSJA 3E9XA 5TU0A 5CMKA 1FQCA 3S9MC 2H5YA 3C9HA 3UN6A 2O1LA 2O7IA 2OK2A 1PB8A 4NF6A 2G29A 4ZE8A 4F39A 4OTEA 4LONB 1IUDA 1N3WA 2O6AA 2H4IA 2XD2A 3TDJA 3TCGA 1F9BA 4PE5B 4N6PA 4TQUQ 4DIGA 2OWSA 3DM0A 3HN0A 3TTRA 1LBCA 3Q25A 1EZPA 3TKDA 1QULA 3MVWA 4LP2B 4G68C 2O84X 3TUSA 1M5FA 4FORA 4RJZA 1MY1A 1YAEA 3QIMA 2OJTA 4EF1A 1MXVA 1P99A 3Q28A 3MP1A 4GL8A 3VLVA 3VXCA 2QL3A 4RYAA 3FJ7A 4OESA 2RC7A 1BKAA 3CVGA 4G77A 1SYHA 2V25A 3K1NA 1ZKBA 3CG3A 1AOVA 3ILUB 1M5CA 1NMUA 3IB1A 3DP6A 5TPAB 1SW4A 4O3BA 4F22A 5KDTA 1ELJA 1YCJA 3I6VA 3FD3A 1A8EA 2HCAA 3WAEA 4QFKA 4LATA 5BUUA 3HCQA 4UACA 3VLWA 3PUWE 2ONKE 3MVYA 1B6HA 4F31B 3OEKA 4FIMA 4I1DA 2QMXA 1LFIA 2F6PA 2X7PA 4Q0CA 1B7UA 4JBZA 4TOZA 2H25A 1YTVA 3U93A 1MDQA 3TEPA 3EHUA 2XXHA 4RA1A 1ZTYA 1M5DA 4OZ9A 1Y4TA 4AB5A 2H9BA 1B1XA 5M2VA 4NF4A 3IX1A 2Z23A 3USDA 2RCBA 3HV1A 1Z7NE 3PMWA 5CBSA 4BDRA 4YAHX 4EQ7A 1SVXB 3SEVA 4DDDA 3DLNA 3FV2A 2DE2A 4R9GA 1XT8A 2PT1A 1L5TA 1AL3A 2V84A 1NNTA 3HPIA 1H44A 4YKIA 4YB7A 4QFNA 3KSXA 4KQPA 1N04A 1MXXA 4FEDA 3C36A 2FA7A 3IORA 3PUVE 4ELRA 4OHNA 1B32A 1QJMA 3ZKKA 1O63A 3KJTA 4OVJA 4ESWA 1MQDA 1XOCA 2UVHA 4F29A 3IB2A 2I58A 3H6VA 4RK2A 1SYIA 4H1XA 4ESXA 1ZU0A 3A3UA 2DVZA 2X7QA 3QXMA 3FV1A 4OYVA 2ZYKA 3O97A 3S9NC 3ZS6A 4ONYA 1VFDA 4OEUA 5CRYA 4IB2A 1NL5A 1PBQA 2F8DA 4EUOA 4KYSA 1NNPA 1UTHB 4LZ8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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