2O1LA

Structure of a complex of c-terminal lobe of bovine lactoferrin with disaccharide at 1.97 a resolution
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Structure of a complex of C-terminal lobe of bovine lactoferrin with disaccharide at 1.97 A resolution
rcsb
total genus 111
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2006-11-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2o1lA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2o1lA02
1IXGA 4M4GA 3H06B 3B6QA 5I84A 3BFTA 4LZ5A 1UTHB 4XKPA 3KN7A 3FATA 3TCGA 4H0WA 4FAJA 4NF5B 5FHMA 2DWJA 1DTGA 5H8FB 1IQ7A 4OHNA 3QAXA 2DE4A 4KD5A 2F78A 1B4HA 4TOZA 3VXBA 4H8IA 2P0SA 3KN3A 3IR1A 3TTNA 3O97A 2AL5A 2Q2AA 1B51A 2DXRA 3IB1A 2QS3A 1WDNA 2Y7KA 4K3FA 4EUOA 1GR2A 2A5TB 2UVJA 2OWSA 5I2NB 2GFEA 3EF7A 5CMCA 1Y3NA 4JSOA 1TT1A 1P99A 1D3KA 1SD3A 1B1XA 3QYTA 1JW4A 1IXHA 3T9VA 3RY3A 2H9BA 3I3VA 1TXFA 3HN0A 3CSGA 5TPAA 2DWHA 4YB6A 1MDP1 2QJEA 3V5AA 4YKJA 1P1UA 1B0LA 3MVWA 3FJGA 1AIVA 3KN8A 4KHZE 3ZSFA 1EZOA 2Z23A 2H99A 1MS7A 4ECFA 3RPWA 3GBAA 4I1DA 1H44A 5I56A 1YAEA 2DWIA 3T9UA 1N7XA 4NTLA 4X1BA 1SW2A 4G8MA 2HZLA 1DMBA 3H03A 1B7HA 4Z0IA 2F35A 1SVXB 4G4PA 3H7MA 4PFUA 3HO7A 3TQWA 3LUYA 3C33A 1LLSA 4ZECA 3C34A 4GD5A 4DZ1A 3C35A 3B6TA 5BUUA 4ZEFA 4IO4A 1JQFA 2DQVA 2ZYOA 2QMXA 2DE2A 4RPNA 2O7UA 1ANFA 4UA8A 1URDA 4G8NA 1QVSA 1B5JA 3PUWE 3SEXA 3FZVA 4LQ5A 4EXLA 5I59A 3DLNA 3U72A 2VGQA 3OOAA 4IO5A 3T9XB 2XXPA 3GBBA 4MLVA 3UP9A 1DOTA 2I48A 3FVNA 1IIWA 2O1LA 2H25A 4O3CA 4QSDA 1TFDA 2Z22A 3IK6B 4G8HA 3PUXE 3IJXB 1NFTA 1M5BA 5I58B 3KZGA 4OMBA 3CFZA 2ANJA 4OFOA 4LVQA 2F8DA 4I8CA 1B32A 3U94A 1B9JA 3OELA 4GVOA 1FCKA 3H4ZA 1B46A 3IOTA 2ABHA 2GRVA 4GL8A 4EDPA 3QUFA 3PD9A 4F19A 4R2FA 4WEPA 1MXVA 2R6GE 5ITOA 2UXAA 4U21A 1R6ZA 3FASA 4ISUA 3OD7A 4ZE9A 4LZ7A 4JDFA 3FD3A 1US5A 5AA2B 3OEKA 3RT6B 3QIMA 1IEJA 2I6EA 1XVYA 2VOZA 1USYE 5A5XB 2DVCA 1LFIA 2RC8A 3LR1A 4HS7A 2RCBA 1Q1KA 3CFLA 1O64A 1LBCA 4EF2A 1MH4A 1MM6A 4IY5A 3IJOB 4IGTA 4OFLA 1D9VA 4PFTA 4FATA 3IO6A 2DVZA 1LSTA 3THIA 1A40A 4PP0A 1XVXA 4LATA 3TELA 1LFHA 1PC3A 4QFLA 2XXWA 2ZYMA 3MVZA 1MXYA 3Q27A 1NL5A 4NF8A 3H6UA 3O29A 4RJZA 1MXWA 1FQCA 1JNFA 5TP9A 1LCTA 3MWBA 3MZBA 1OQGA 1M5FA 4RY1A 1Z7NE 5JEIA 1N04A 4PETA 4RPOA 4F1UA 1JETA 1MY4A 1QUKA 4XXUA 4POXA 1B2HA 3MP6A 2RINA 1AMFA 4R6YA 4N07A 3WAFA 3K6WA 4QFKA 1OLAA 4QHQA 3K1PA 4FORA 5I2KB 2XXYA 2GHBA 1A55A 1Y1MA 3MPLA 4DCYA 2UYEA 3RTFB 2HZKA 3OMBA 1N84A 2E1SA 1Z7ME 3PPRA 1IITA 3SEWA 1HSEA 1ZJLA 3ODBA 2B3BA 2V93A 1Y4TA 2GH9A 4YICA 4HCWA 4LONB 5LOMA 4POWA 4DXCA 3GXAA 2Q88A 4ZEIA 2Y7WA 1NNKA 4C0RA 1VFEA 1CE2A 1FQDA 1R9QA 3A09A 5JK4A 5HPQA 3UK4A 4EQBA 3Q26A 3H6TA 4YZZA 2Y7IA 3O2AA 4OERA 5TPAB 1YTVA 3T66A 3OEMA 2PVUA 1FTLA 2H5YA 3N6TA 1MPCA 2F36A 4IY6A 3KBRA 1B6HA 1MH3A 1VSOA 5H8SA 5I56B 2PBWA 3T22A 2Z8FA 3H3GA 2Q2CA 4NWDA 5H8NA 3RTWB 3O6GA 4RNSA 4O3AA 1BTJA 1TFAA 4G77A 4NF4A 1S50A 3KGCA 4AB5A 3KSXA 5K2YA 4R75A 4OVJA 1B5IA 2O6AA 1I6QA 1OVBA 3FJ7A 2I3WA 5FHNA 3K02A 1B7ZA 2THIA 1N76A 1UQWA 3G3HA 1NH8A 3DP8A 5B70A 5JTYA 1XT8A 3O6IA 2H4IA 3UIFA 2V3TA 1H45A 1F9BA 3CG1A 3RGYA 1QW0A 5TU0A 1MXUA 4HTGA 4YKIA 1M5DA 1I6AA 3FIRA 3MZ1A 3N26A 1AL3A 3K4UA 5DYHA 1NNPA 4IO3A 1HSJA 1LAGE 2V25A 3I5OA 4GOTA 4FJPA 1LAFE 3VLVA 1MQDA 5FHOA 3FGSA 1GGGA 1OIBA 1JEVA 2M8CA 4F3GA 3TTMA 1NMUA 2O51A 2OJTA 2ESNA 2UYFA 4QF9A 5DVIA 3N5LA 4KCCA 2DE3A 4ZEBA 1GVCA 4KFQA 3RUMA 3VVDA 5KDTB 5DEXB 2IA4A 4FIMA 3N94A 3TCHA 3CVGA 4ELPA 1NNTA 3A3CA 3T9HB 4QFNA 2I58A 2ZNUA 3W9WA 3CRBA 2XX7A 3TQLA 4U23A 3I6VA 1B5HA 3EHTA 1LCFA 3HSTA 3LSFB 1VR5A 1LBBA 3S9MC 1PB8A 4PQJA 4GL0A 2OZZA 4LQ2A 1GV8A 2KLFA 1B3FA 4JSDA 1MDQA 5CMMA 5AA3A 4ELQA 3VE1B 4EF1A 1B3LA 5K2XA 3FXUA 2B65A 4FE8A 3GZGA 3KFMA 3KJ7A 1POY1 2D3IA 4ND9A 5ELVA 3EHUA 3DELB 4H5GA 4BDQA 1A8EA 2QS2A 3G3IA 3VLUA 2O68A 4KCDA 3JV9A 4N13A 4ONYA 3TUSA 1N7WA 4XKQA 2QMWA 5L8DA 3OO9A 1IZ1A 4F29A 3R7XA 4G2ZA 3S9EA 3O66A 3KOSA 2FA7A 5CI5A 4U1ZA 3M8UA 5H8QA 1WODA 1DTZA 4U4SA 5TP9B 4XIGQ 4HW8A 3IAZA 3PUVE 4FEDA 3C36A 4R9FA 1H3DA 3QUJA 1Q35A 5CMBA 3O6HA 4ZZAA 3SEUA 1O7TA 3O9PA 3TEPA 1MM7A 4F22A 1SW4A 3ZS6A 3PD8A 1LAXA 1IXIA 1B3GA 4EQ7A 4THIA 3FUZA 4NF6A 1JVXA 2UVGA 5CMKA 4G68B 5IKBA 3MJNA 4YMBA 2XHDA 3PMVA 3QSLA 3SERA 3RT8A 3KOTA 3FV1A 1UTBB 1S9TA 2F7CA 3FVGA 4F2OA 5H8HB 2UVIA 5I57A 1AOVA 1A54A 4KYDA 4QSCA 3G3KA 5ISUA 4IGRA 2V84A 1MPBA 4YU0A 4IO7A 1LFGA 4R6KA 1M5EA 3C31A 5H8FA 4ELOA 2ONRA 3ONMA 1MY0A 5EHSA 2QPQA 4QFOA 2PX1A 3IO4A 4R6HA 2XX9A 4R74A 1FTJA 3TYHA 4DDDA 3K1MA 1EZ9A 1FQEA 1O63A 5KZTA 2G93A 2Q9TA 2Y7RA 4H65A 1PB7A 3BBRA 1YCJA 1VFDA 2A5TA 2DS9A 1RKMA 4R2BA 3OO8A 4OESA 1POTA 1RYOA 4RK2A 4XKNA 5H8NB 3C4MA 2PMSA 3SESA 3PV0E 3VV5A 4TLLB 4M1VA 1B3EA 2IEEA 3VFJA 1FQFA 4IO2A 4NF4B 4X9TA 1NNFA 3ILTB 4OWDA 4H5FA 1B1HA 4F39A 2F7AA 3RLFE 4OTEA 4OFJA 4YB5A 3CG3A 3UA8A 2Q8JA 3EN3A 1MQJA 1FTMA 5B7DA 2NWJA 4LZ8A 4F1VA 1EH3A 1QULA 3FVOA 1MXXA 4YB7A 2HXWA 4U4XA 1SYIA 4ZS9A 3S9NC 3U93A 4ZEKA 2FNCA 3MUQA 5CC2A 1BLFA 3B7DA 3TKDA 4C1UA 4EXKA 5ICQA 2OCUA 5AE4A 1SI1A 2XD3A 2W7YA 4F3SA 5CM6A 5AA4B 3LSWA 4KYEA 3MP8A 1EU8A 2HQ0A 3TMGA 1OQHA 3JYRA 2VHAA 3LSXA 1GTKA 4IO6A 2DOJA 4FEBA 4X1DA 3PPOA 3OSQA 1XOCA 1FQAA 3FJMA 2D21A 2DP8A 3K1NA 1SQYA 2ZNSA 2O7IA 3E3KA 3O28A 4L17A 2O1MA 1A7LA 4PFYA 1P1QA 4Q5TA 2AIXA 3OO6A 3ECRA 2PT2A 1JW5A 4I9DA 4ZEDA 3N6UA 4KR5A 4P11A 2XXVA 3USDA 3RQTA 1CB6A 5I58A 1PBQA 1FTKA 3KJTA 2F7BA 3EQ1A 2H98A 1EZPA 3MP1A 1SI0A 3HPIA 3WAEA 4OYVA 2FYIA 4JBZA 3MZ9A 1MQHA 2RC9A 1Y3QA 1IUDA 2HCAA 2HAVA 1SYHA 1JEUA 5AA2A 2X26A 4H1XA 4I62A 3VDFA 4BDLA 4OEUA 1B52A 1ZMGA 4H6DA 2NXOA 3PPPA 3SEYA 4F3BA 4LA9A 1MY1A 1A99A 3B6WA 1ZU0A 1SDXA 3TTLA 1B0HA 3V83A 1DPPA 2XD2A 1B7UA 3PGFA 4F1YA 2BJJX 5L9SA 3VVEA 1MRPA 4KQPA 3UGWA 2ONKE 5AA1A 5I59B 3MVXA 3ZKLA 3K0VA 4ZZEA 4Z7EA 3DP6A 3KEIA 4JWXA 4NF6B 3MC2A 4C1TA 2UVHA 3PUYE 1A8FA 2QL3A 4G68C 2V3UA 4NWCA 4EQ9A 1FW0A 2PT1A 2Z8DA 4BLAA 1PB9A 2HFBA 2Y84A 1QUIA 4E0WA 3FV2A 1PBPA 5I57B 4Q30B 3W15C 1SW1A 3OSRA 2A5SA 1LB9A 1LAHE 4U22A 3G3JA 2F6GA 3U1OA 2XXHA 4KI0E 4H67A 3V89B 3TTKA 2VP1A 3HV1A 1Y20A 3SETA 4OQOA 2Z8EA 5I2KA 1L5TA 4DIGA 1KWHA 2P1SA 4RXLA 4ELRA 3Q29A 1UIUA 3CSBA 4RA1A 4MFIA 5BWJA 2RC7A 3V8XB 4WEDA 4AB6A 2DWAA 4TQUQ 4HCYA 3MW0A 4ESXA 4GXAA 4U1OA 2F34A 2P2AA 2XXRA 1TWYA 3PMXA 3OXNA 1JW1A 4OENA 5J1DA 3E9XA 1B58A 5L9MA 4BDMA 5KCJA 4PE5B 2I49A 1ZTYA 2Y7PA 2F6PA 2XXIA 1Y1ZA 4R73A 4DCXA 2O84X 1FTOA 2XXUA 1B40A 1BKAA 4RK9A 1NH7A 4YAHX 3LC8A 1Y4CA 3Q28A 5M2VA 2B3FA 4NF8B 1I6BA 1B05A 4GWOA 3JZJA 2GHAA 2VD3A 1ZLQA 2QS4A 4O3BA 2R71A 1URGA 1ZBMA 3C9HA 4H8JA 2R9JA 3W9VA 2REGA 3S9LC 1ATGA 5IAIA 1UIVA 1S7YA 1NKXA 3UN6A 4GRKA 2AYSA 3FVKA 3R6UA 4DXBA 3MPKA 5FTHA 4BDRA 2I0BA 5HBCA 2XX8A 2CMOA 1QKBA 3FXQA 2QRYA 2YPNA 2V3QA 1OLCA 1R9LA 2DXYA 4MH5A 4U2RA 4WXJA 3Q25A 1MY2A 4F2QA 3VXCA 4JWYA 5ITPA 1UTHA 1P1NA 5F1QA 1MQGA 3DM0A 1MPDA 1P1WA 4UACA 3TAJA 4NF5A 2X7QA 3BKIB 2PYYA 4LUBA 5CRYA 4P0GA 5F7VA 3D4GA 1H43A 3G3FA 4OETA 3UORA 5DT6A 2RCAA 5KDTA 4YMAA 5DEXA 1URSA 1ZIUA 4NE4A 3VVFA 3L6GA 2Q89A 4OXVA 2I4BA 2LAOA 1N3WA 3OO7A 4GFRA 4BDOA 3IL1B 3C32A 1H76A 1AH5A 4KPTA 5I2NA 3GLBA 3EHSA 3M3LA 3TCFA 3RN8A 4R9GA 3D4CA 4OEVA 2REJA 3K00A 4N6PA 1MXZA 2ONSA 1MY3A 2ZYNA 2G29A 3HHFA 3FXRA 1SW5A 4PFWA 3AXFA 3MAMA 1VE4A 1J1NA 2OLBA 4GQOA 3PUZE 2E0SA 3PMWA 3TFLA 4JWOA 2RF1A 3T93B 3OENA 2NOOA 3T96B 2ZNTA 5JTYB 1T0KA 2ZXTA 3IORA 1WVJA 1Y9UA 3HHGA 2ALUA 2OWTA 3H6WA 1QJMA 1QKAA 3SKPA 5CBSA 1YPNA 2ZMBA 4F31B 1N0TA 1XC1A 1PDAA 1LGBC 2F5XA 4E0XA 4AQ4A 1OMPA 3TZAA 3SEVA 3KG2A 1IXCA 1US4A 4P0IA 2WKYA 2VD2A 1JVYA 3DP4A 3G3GA 5ICTA 4YKKA 5L9OA 2DSFA 3LSLA 1FQBA 4DLDA 4NEDA 2NUVA 4GLIA 4G68A 3S2VA 4F18A 4ZDMA 1N3XA 1QUJA 2D5WA 2CZLA 2OBGA 3P7IA 4GF8A 3IOUA 3CIJA 3ZKKA 1UTBA 3S4UA 3LBSA 4OZ9A 4FECA 5H8HA 3M3KA 2RKMA 3K6UA 4QSEA 2HEUA 4ZE8A 5EHMA 1B3HA 4QFPA 1II5A 3TODA 3F11A 4WKMA 2DYXA 2QSXA 3HCQA 3H6VA 2ZYKA 5CBRA 3SDFA 4JXIA 1BIYA 3PPQA 1B4ZA 1MG1A 3MQ9A 3U8QA 3K2DA 4MBPA 3L6HA 3IX1A 5KCJB 5HM4B 5DVJA 3KSJA 4X48A 3IB0A 1D9YA 3TDJA 4IB2A 4MLQA 1P1OA 1ELJA 4ESWA 3K01A 3VLWA 1R1NA 3TPAA 3G7WA 1XS5A 3CFXA 1LB8A 3EPEA 1MQIA 3RNNA 4XKRA 2I4CA 5A5XA 3MVYA 1M5CA 1PEBA 2HAUA 2YLNA 5H8QB 4LP2B 4DXUA 4F3PA 3MBPA 4GIZA 3CI8A 3K6VA 3PPNA 4JB7A 4DE8A 5DVFA 1HSLA 1BP5A 2QS1A 4BDNA 4NMYA 2XXQA 3IB2A 3IOVA 1OVTA 4YKPA 4QRZA 2X7PA 4Q8RA 1DSNA 2NVUB 3E4RA 4XTCQ 2XXXA 4TLMB 3CR9A 2XXTA 3TTRA 5DTBA 3M3FA 4R72A 3QK6A 3PU5A 4MF3A 3E13X 1DPEA 3IOWA 2I3VA 5EYFA 3BFUA 2YJPA 2F97A 4GXSB 4Q0CA 5AA2D 2O69A 1RYXA 3K6XA 2AL4A 1USYH 3A3UA 3QXMA 1SBPA 1ZKBA 5AA4A 2I0CA 3R26A 3ILUB 1XHYA 1I69A 5FTIA 1Y3PA 4RYAA 2OK2A 4KYSA 1D4NA 3U92A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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