2O1LA

Structure of a complex of c-terminal lobe of bovine lactoferrin with disaccharide at 1.97 a resolution
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Structure of a complex of C-terminal lobe of bovine lactoferrin with disaccharide at 1.97 A resolution
rcsb
molecule tags Hydrolase
total genus 111
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2006-11-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2o1lA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2o1lA02
1FTJA 4X48A 2Z23A 5HBCA 4IGTA 1IEJA 3F11A 4F3PA 1OLCA 3PMWA 2YPNA 4KYSA 1Y3NA 3KG2A 1VR5A 1XOCA 2D3IA 1ATGA 4ND9A 3T9HB 4R6YA 5I57A 3DP8A 3OMBA 2W7YA 4ZZAA 2RCAA 4GVOA 2B65A 4IY6A 2NXOA 3E9XA 1IXGA 3MJNA 3MZBA 4EUOA 2E0SA 4G4PA 4NF5A 3TFLA 3OXNA 4X9TA 4OVJA 2RCBA 4EQ7A 3RLFE 4RXLA 3H7MA 4ZS9A 2UYEA 2UVJA 1US4A 5JK4A 3K6UA 1FTOA 1M5EA 2I6EA 5J1DA 3VXBA 3RPWA 1B4ZA 1Y3PA 2M8CA 4G2ZA 3E3KA 3PU5A 3HPIA 1MQGA 1P1UA 2ZMBA 3IOTA 1MQDA 3FVKA 2UYFA 4DIGA 1LB8A 3IB2A 1MY1A 3KJTA 4GF8A 3KN3A 4ESXA 2OCUA 4QF9A 2V3QA 1IZ1A 3KN7A 4EXKA 3PPRA 4QSCA 1QKAA 1B0HA 1B2HA 1N3WA 3N5LA 4R6KA 5I58A 4WXJA 3CI8A 3SEXA 3DM0A 1POTA 4XTCQ 3VVEA 4NF6B 1R9LA 2DS9A 3U94A 3I6VA 2REJA 4OYVA 4YZZA 1AIVA 4YICA 3T66A 4ESWA 5ITPA 4DCYA 4HCYA 5B7DA 4BDNA 3SESA 3T9XB 1MY0A 4F29A 5KZTA 1PDAA 1ELJA 1IXCA 2VGQA 1MPDA 1RKMA 3R6UA 1GTKA 4KHZE 1OVTA 4EXLA 3DELB 4ELQA 2X7PA 1TT1A 1R9QA 4LUBA 1B1HA 2HAUA 3Q28A 4Q5TA 3S2VA 2XD2A 1VFEA 3PUXE 2F7CA 4F3SA 4Q30B 3ZS6A 4JWXA 5AA1A 2Y84A 3PV0E 2NOOA 1FQBA 2DOJA 5ITOA 1RYOA 3MWBA 4Q0CA 2V93A 3KBRA 1NNPA 3PUYE 1QKBA 3TDJA 1P1OA 3MAMA 2QPQA 3LSLA 3O9PA 3TEPA 3T9UA 3MUQA 3CSBA 4I62A 1Y1ZA 3PGFA 3N6TA 3C35A 5I56B 4OXVA 3TODA 4KD5A 4PFUA 1MXWA 2XXPA 4HS7A 3RNNA 4XXUA 4H8IA 4RJZA 4NTLA 1TFDA 4PFWA 3Q26A 4KCCA 4GD5A 1D4NA 1H45A 4N07A 1JETA 1YAEA 3ODBA 2R6GE 2B3FA 2ONKE 4O3CA 2ZNSA 2HQ0A 2IA4A 2WKYA 4NEDA 2I58A 2QS4A 2D5WA 1USYE 3OEKA 2F8DA 4ZZEA 1LCFA 2XXYA 2ZNTA 2ONRA 4I9DA 4RA1A 3DP6A 2Y7KA 3IO4A 3MBPA 3VDFA 2YJPA 2F7AA 4RK9A 4RNSA 1SVXB 2DWJA 1T0KA 2ANJA 5FTIA 3LBSA 3RQTA 4PFYA 1MQHA 1H76A 3S9MC 4Q8RA 3K6WA 3CVGA 1OQHA 3KOSA 1OVBA 3AXFA 5BUUA 2DE2A 3ZSFA 3KEIA 1LB9A 1XC1A 2F5XA 2DXRA 5TPAB 1SI1A 4POWA 4NF6A 5KDTB 1M5DA 3G3GA 3V8XB 2E1SA 1A7LA 4Z0IA 1HSLA 4WEDA 5FHMA 2UVGA 2Z8DA 4C1UA 3C34A 1FTMA 3PPPA 3W15C 1XHYA 3W9VA 1JW1A 2Y7RA 2UXAA 2QL3A 4UACA 2F7BA 3KFMA 5I57B 4YB6A 1B58A 4ZEKA 2HZLA 1GR2A 4R74A 1QUKA 2Q89A 4FIMA 3CSGA 3K1PA 5ELVA 3OO6A 4R2FA 4YB7A 2P2AA 1SW2A 4NF5B 4DXCA 4U4XA 3K1MA 4R9GA 4L17A 4ELRA 4YU0A 3O66A 3T96B 4YMBA 3KZGA 4GL8A 5EHSA 2HAVA 4YB5A 1YTVA 2CMOA 1MQJA 3Q27A 4KYDA 1R1NA 3K4UA 1JW5A 2O6AA 4BLAA 3CIJA 3WAEA 2Y7PA 5JTYA 3BFUA 1A99A 1VSOA 3UN6A 3THIA 1WODA 3TTRA 3VLUA 4OETA 1I69A 4ZECA 4QFPA 2FYIA 5H8HA 4N13A 3A3UA 1B9JA 5ICQA 4YMAA 3N26A 1IITA 2F36A 2RKMA 4O3BA 4TOZA 4ZE9A 4GXAA 2NWJA 4DE8A 5H8QA 4ELPA 5I58B 1FQAA 1FQDA 4MLQA 4P11A 3TCFA 2O69A 4DXUA 3FXUA 4JWOA 3TZAA 4R75A 1JVXA 4I1DA 1B7ZA 3GBBA 1N84A 4OTEA 3OEMA 1N7WA 4OMBA 1B3HA 5I59A 3LR1A 3VV5A 1LBBA 2PVUA 3ILTB 3SEUA 2O68A 1P1NA 4YKPA 5AA2A 4IO4A 3S9NC 3SEWA 3MQ9A 1DTZA 1D9VA 2VOZA 5B70A 4F1YA 4N6PA 2IEEA 3MVYA 4H67A 2UVIA 3G3IA 1B7UA 1US5A 4R6HA 4EF2A 1NNTA 1PC3A 4I8CA 4ZE8A 3MC2A 4QFKA 2LAOA 1DTGA 2GH9A 1NNFA 4PETA 3WAFA 4G68C 2PT1A 3QIMA 5DVJA 4OFJA 3O97A 4OQOA 4RPNA 1DMBA 2XX9A 2OJTA 2O84X 4M1VA 1ZTYA 4F22A 1TXFA 4FATA 3EPEA 4OEVA 3RTFB 4FJPA 1S50A 1EH3A 3MP8A 4AB6A 1AMFA 4QFOA 4LONB 3C32A 1OLAA 3SKPA 4QSEA 3TQLA 5LOMA 2H25A 3D4GA 2DE3A 3S9LC 3IOUA 4WKMA 3QUJA 1BTJA 1DOTA 3KSJA 3EN3A 4LZ7A 5ICTA 1FQCA 5CBSA 5EHMA 2Z22A 3PMVA 1PEBA 4G8HA 4KYEA 1AH5A 5CI5A 3TTNA 4PE5B 4TQUQ 2AL4A 2FNCA 4F3BA 1M5FA 3IK6B 2DSFA 2HCAA 3FJGA 1NMUA 2QS2A 4JB7A 5FHOA 2DE4A 4GRKA 5L8DA 4NF8A 4EDPA 5CC2A 4G8NA 4DZ1A 5DVFA 5TP9A 1JEVA 1B0LA 2PYYA 1WVJA 1A8EA 4PP0A 2HXWA 1URDA 3PPOA 1SDXA 2HFBA 2O7UA 3MW0A 2ALUA 1N04A 5CMCA 1FQEA 4R73A 3B6WA 4XKRA 3CG1A 4AQ4A 3BKIB 3TPAA 4JXIA 1GV8A 3TYHA 2ZYNA 4HCWA 4F1UA 1O7TA 1Q1KA 1URGA 2Z8EA 3MPKA 3U92A 3CFZA 1ZJLA 4GIZA 1LAXA 5H8NA 1URSA 2F35A 3M3LA 1XT8A 1Z7NE 3FGSA 3EHTA 1SW4A 4EQBA 3QAXA 1TWYA 1NH7A 4IO6A 3OO7A 2QMWA 5CBRA 4POXA 3FATA 4TLMB 1PB7A 1MRPA 4NWDA 4GXSB 4JDFA 5JTYB 1DSNA 4OESA 4THIA 3HN0A 5HPQA 1DPPA 3O6IA 1B3EA 3I5OA 3RUMA 3DLNA 3IB0A 1SD3A 1Y20A 1LBCA 3GXAA 4MF3A 5H8HB 1HSEA 3VXCA 1EU8A 3OELA 1XVYA 1QJMA 2DWAA 1NNKA 2OWSA 4H6DA 2HZKA 5H8QB 5DVIA 3EF7A 1ZLQA 2I3VA 2A5TA 3CG3A 4UA8A 3V83A 4JSDA 2O7IA 3C31A 3FXRA 5KCJA 4QFLA 4MFIA 3S9EA 2Y7WA 2X7QA 3U72A 4RPOA 1S9TA 2ESNA 5I59B 4LQ2A 3TKDA 3A3CA 4OENA 3IL1B 2G29A 3MZ9A 1M5BA 1IXHA 3B6TA 4ZEFA 3EQ1A 1FTKA 2F6GA 5AA2B 3KOTA 4ECFA 4R2BA 3ECRA 1VE4A 2ONSA 1O64A 1N7XA 3VVDA 3FD3A 2OLBA 3FIRA 5DTBA 3T93B 2D21A 2PBWA 1MXYA 3H6WA 3K0VA 3A09A 2FA7A 3EHSA 5AE4A 4H5FA 3CRBA 3OOAA 5DEXA 5M2VA 4U1ZA 3G7WA 3QSLA 1EZPA 2I3WA 4WEPA 5H8FA 1MY4A 3CFLA 1QVSA 4H65A 3JYRA 3VLWA 3BBRA 1DPEA 4HTGA 2P0SA 5TU0A 1Z7ME 3H03A 4IO5A 1Q35A 1MS7A 1B5HA 3K00A 2V3UA 3VLVA 5ISUA 3PUWE 4DXBA 1D3KA 3H6UA 1P1WA 3C9HA 2REGA 2XXTA 2XD3A 4KPTA 4AB5A 1GVCA 4P0GA 5A5XA 3FV1A 3KGCA 3LSFB 4F2OA 1RYXA 2XXXA 4U4SA 2XX7A 3TAJA 3G3FA 5CMKA 3ONMA 1MY3A 1LAGE 2AYSA 1A55A 5K2YA 3OO8A 4X1DA 2XXQA 5I2KA 1B5JA 4OWDA 1ZU0A 1MH4A 3L6HA 4GLIA 3TCHA 1B7HA 2XXUA 1BLFA 3V5AA 5L9OA 1Y4TA 5I2NA 2DWIA 1I6AA 1IUDA 3VVFA 1SYHA 2Q8JA 4GOTA 2O1LA 4YAHX 1FQFA 4KQPA 1N0TA 1B4HA 1SW1A 3PPQA 1BP5A 4NF8B 2QS3A 1ZKBA 3OSQA 3I3VA 5TP9B 4BDLA 3MVXA 3RT8A 3G3HA 4TLLB 3MPLA 3VFJA 1QUJA 2QMXA 1R6ZA 3PD9A 4ISUA 2VD3A 3Q25A 1SW5A 1QUIA 1BKAA 1ZIUA 4BDOA 4F18A 3FJ7A 4DLDA 4FEDA 1MXVA 3LUYA 3TCGA 3G3JA 2DQVA 2RF1A 1UTHA 4DDDA 4F19A 1CB6A 4IO2A 1IIWA 1SBPA 1H3DA 2DWHA 1A8FA 2F78A 2HEUA 4OZ9A 3CR9A 2NUVA 3M3FA 1SYIA 1BIYA 2YLNA 2GFEA 5H8NB 3HO7A 3B6QA 1FW0A 3D4CA 2OZZA 3IX1A 1MH3A 3R26A 4YKJA 3O28A 2I48A 3HHFA 4OERA 3FVOA 1O63A 3TTKA 4XKQA 4P0IA 4KI0E 2RC7A 3E4RA 2ZXTA 3RY3A 4IB2A 1JNFA 2VD2A 5CM6A 4FECA 3TELA 1Y1MA 3H6TA 3P7IA 1JQFA 1UIUA 1MXXA 4NF4A 1IXIA 4MBPA 2R9JA 1H44A 3MP6A 2DYXA 1M5CA 2XXRA 3K1NA 3FV2A 2DVZA 1HSJA 3MVWA 2Q2AA 3FASA 3C36A 4JWYA 4O3AA 1PB8A 2G93A 4PFTA 4BDQA 3FVNA 2V25A 3TTMA 1MG1A 3RT6B 1P1QA 3QYTA 3PD8A 5FTHA 3C4MA 5AA4A 4OFLA 4QSDA 2A5TB 3CFXA 4G68A 2A5SA 5KCJB 3MVZA 3UP9A 1B5IA 1PBPA 1B51A 4OHNA 2THIA 1JW4A 1B32A 4ONYA 2H9BA 4M4GA 4DCXA 3H6VA 3MZ1A 3U1OA 2Q9TA 4YKIA 5L9MA 2RINA 1PB9A 2O1MA 1F9BA 2GRVA 2RC9A 4F1VA 1LSTA 1MM7A 1EZOA 4MH5A 3EHUA 3G3KA 1UTBA 1B05A 2V84A 1B3LA 2RC8A 5CMBA 1I6QA 3HCQA 3O29A 3UA8A 1LFIA 5DEXB 3IB1A 4F39A 3Q29A 1P99A 3SDFA 4KFQA 1II5A 1Y3QA 2V3TA 4NE4A 4FAJA 4H1XA 5H8FB 2Z8FA 1AOVA 3BFTA 2NVUB 5DT6A 2ZYKA 3TQWA 1IQ7A 5H8SA 1B1XA 1OIBA 3IOWA 2QS1A 1CE2A 4IO7A 3UIFA 1QW0A 3T22A 4E0XA 3GBAA 3FXQA 4IO3A 5A5XB 3K02A 4BDRA 3O6GA 2PX1A 3PMXA 4IGRA 3L6GA 4GWOA 1N76A 2BJJX 3IJXB 3GZGA 3K6XA 5K2XA 1POY1 1LAFE 3V89B 2KLFA 4QRZA 3GLBA 4LATA 3H3GA 3HV1A 5I2KB 3TMGA 3SEVA 5DYHA 5AA2D 4H8JA 1XVXA 3K2DA 4BDMA 5JEIA 2ZNUA 5AA3A 1OMPA 3UORA 2XHDA 4GL0A 3DP4A 5I2NB 2VP1A 2QRYA 4EF1A 3W9WA 1NH8A 3KJ7A 3IOVA 3N6UA 3N94A 4ELOA 1MPCA 3LSXA 2VHAA 4C0RA 3KSXA 2GHBA 1NKXA 1Y4CA 1MXUA 1A40A 1USYH 3VE1B 3USDA 1ANFA 1LGBC 4MLVA 2AIXA 4FEBA 1LCTA 3M3KA 3TUSA 3FVGA 4OFOA 3T9VA 1UTHB 5L9SA 1H43A 2XXVA 5F1QA 4RY1A 4LQ5A 4GFRA 1YCJA 1GGGA 2OBGA 2P1SA 1EZ9A 3IO6A 3RTWB 2F6PA 2I0BA 3PUVE 4OEUA 4LZ8A 3OSRA 4LZ5A 1LAHE 3JZJA 3IJOB 1S7YA 5IAIA 1B6HA 2O51A 2I4CA 4NMYA 5CRYA 4JBZA 2Q2CA 1XS5A 1SQYA 4Z7EA 2GHAA 2Y7IA 4ZEIA 1OQGA 4U22A 4C1TA 3B7DA 3FZVA 1D9YA 4QHQA 1MY2A 3HHGA 4QFNA 4XKPA 1LFGA 4F2QA 5CMMA 4NF4B 3S4UA 3ZKKA 2XX8A 1PBQA 3K01A 3SEYA 4FORA 4GQOA 4R72A 1WDNA 4G77A 1B3GA 3HSTA 4YKKA 2PMSA 4FE8A 1UIVA 1NL5A 3IORA 3MP1A 2XXWA 4ZDMA 3RGYA 3SETA 1B40A 3K6VA 1LLSA 4ZEBA 4U2RA 1MQIA 4LP2B 1B52A 3U8QA 4PQJA 5AA4B 3H06B 4KR5A 4G68B 1MPBA 2B3BA 2AL5A 2DXYA 2F34A 1AL3A 2UVHA 2I49A 4XIGQ 4HW8A 1MDQA 4F31B 5I84A 2I0CA 2H98A 1JVYA 3U93A 2XXIA 4U21A 3ZKLA 2H4IA 5IKBA 4RK2A 4E0WA 3C33A 2R71A 4XKNA 3SERA 5EYFA 2CZLA 3IR1A 4RYAA 4LVQA 1YPNA 5FHNA 1TFAA 3RN8A 3OD7A 3M8UA 4KCDA 1VFDA 1SI0A 3TTLA 4G8MA 5I56A 2XXHA 2QSXA 1J1NA 2OWTA 1UTBB 1QULA 2X26A 4IY5A 3UK4A 1ZBMA 4H5GA 1JEUA 1MXZA 3QXMA 4ZEDA 4U23A 3KN8A 1L5TA 1N3XA 2I4BA 3O6HA 5BWJA 4H0WA 4U1OA 1UQWA 2ZYMA 4F3GA 1Y9UA 3PUZE 3PPNA 3UGWA 5F7VA 4R9FA 5HM4B 2H99A 3LC8A 2ZYOA 4K3FA 1MM6A 3O2AA 2DP8A 3OENA 3E13X 3LSWA 3OO9A 1FCKA 4X1BA 3IAZA 2PT2A 2OK2A 4LA9A 1NFTA 2F97A 3FJMA 3R7XA 3ILUB 1I6BA 2H5YA 2ABHA 4NWCA 4EQ9A 4JSOA 2QJEA 1ZMGA 1MDP1 3QK6A 3JV9A 1FTLA 2DVCA 1B3FA 3FUZA 1A54A 3H4ZA 1B46A 5TPAA 1LFHA 2Q88A 5KDTA 1KWHA 3QUFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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1TT1A 1R9QA 4LUBA 1B1HA 2HAUA 3Q28A 4Q5TA 3S2VA 2XD2A 1VFEA 1NV1A 3PUXE 2F7CA 3IFCA 4F3SA 4Q30B 3ZS6A 4JWXA 4KXPA 5AA1A 2Y84A 3PV0E 2NOOA 1FQBA 2DOJA 5ITOA 1RYOA 3MWBA 4Q0CA 2V93A 3KBRA 1NNPA 3PUYE 1QKBA 3TDJA 1P1OA 3MAMA 2QPQA 2Y5KA 3LSLA 2GQ1A 3O9PA 4MJOA 3TEPA 3T9UA 3MUQA 3CSBA 3BIGA 4I62A 1Y1ZA 3PGFA 3N6TA 5J16A 3C35A 5I56B 4OXVA 3TODA 4KD5A 4PFUA 1MXWA 2VPNA 2XXPA 4HS7A 3RNNA 4PTKA 4XXUA 4H8IA 4RJZA 2HXRA 4NTLA 1TFDA 4PFWA 5DW8A 3Q26A 4KCCA 4GD5A 1D4NA 3FXBA 1H45A 2P3NA 4N07A 1JETA 1YAEA 3ODBA 2MKZA 2R6GE 2B3FA 2ONKE 4O3CA 2ZNSA 2HQ0A 2IA4A 4NEDA 2WKYA 2I58A 2QS4A 2D5WA 2QFLA 1USYE 3OEKA 2F8DA 4ZZEA 1LCFA 2XXYA 2ZNTA 2ONRA 4I9DA 4RA1A 3DP6A 2Y7KA 3IO4A 3MBPA 3VDFA 2YJPA 2F7AA 4RK9A 4RNSA 1SVXB 2DWJA 1T0KA 2ANJA 5FTIA 3LBSA 3RQTA 4N15A 4PFYA 1MQHA 1H76A 3S9MC 4Q8RA 3K6WA 3RYDA 3CVGA 3RPLB 1OQHA 3KOSA 4PFBA 1OVBA 3AXFA 5BUUA 2DE2A 3ZSFA 3KEIA 1LB9A 1XC1A 2F5XA 2DXRA 2WBDA 5TPAB 1SI1A 4POWA 4NF6A 5KDTB 1M5DA 3G3GA 3V8XB 2E1SA 1A7LA 4Z0IA 1HSLA 4WEDA 5FHMA 2UVGA 2Z8DA 4C1UA 3C34A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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