2O1LA

Structure of a complex of c-terminal lobe of bovine lactoferrin with disaccharide at 1.97 a resolution
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
publication title Structure of a complex of C-terminal lobe of bovine lactoferrin with disaccharide at 1.97 A resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 111
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2006-11-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2o1lA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2o1lA02
3QYTA 1H45A 3FATA 2FNCA 5CI5A 3RQTA 2QMWA 3BFUA 3RT6B 3KN3A 4Q8RA 4H6DA 4OFOA 3KBRA 1MXYA 4KFQA 3H6VA 3OO6A 2I4CA 4BDOA 4YB6A 4ESXA 1IXGA 4JWYA 1NMUA 1OIBA 3RPWA 3FIRA 4ELOA 2VP1A 3T9HB 4H65A 3A3CA 1XC1A 3TELA 4BDNA 1ZU0A 3GXAA 2QS3A 2XXQA 1LFGA 2QS2A 2O1MA 1Z7ME 3OO7A 1MY0A 2UVJA 4U22A 2THIA 5TP9B 1Q35A 4KCDA 3D4CA 4XKRA 4ZZEA 2I0CA 3B7DA 2HFBA 5AA4A 4GF8A 3K1MA 2E1SA 4U4XA 1Y4TA 3TQLA 4GL0A 3H6TA 3HPIA 2E0SA 4QFPA 2QL3A 3MVYA 1B5JA 2VHAA 4EQBA 2XXPA 4H8IA 2XX8A 3TTNA 2I6EA 3OSQA 2O51A 3MZ9A 3MP8A 5TPAB 5I2KA 3G3HA 4N6PA 1MQHA 3E9XA 3VXBA 1MRPA 2Y7KA 2UVHA 4NF4A 3ZKKA 1B3LA 1CB6A 1YAEA 3WAFA 3KJ7A 4KD5A 3MZ1A 4YU0A 4M4GA 4P0IA 5I59B 3Q29A 2DVCA 5AA1A 3TAJA 4JWOA 3MJNA 3PGFA 2X7QA 1RYOA 3ONMA 3PU5A 4THIA 5I56B 3T9XB 1I6AA 3PMWA 2DWJA 3OEMA 1EZOA 3UP9A 4QSEA 3KN8A 1ATGA 3HHGA 5KDTA 5JTYB 1ANFA 4XKQA 1WVJA 4R74A 2RKMA 5FHMA 1B3GA 3K0VA 4F3PA 1QJMA 1JQFA 1AOVA 2PX1A 1YCJA 2G93A 2I4BA 3JZJA 2IEEA 5L9SA 1N3XA 3KN7A 3B6TA 1GGGA 4WXJA 3CIJA 4X1DA 3C33A 4UA8A 4R9GA 2Z22A 5HBCA 4JB7A 3V5AA 4NF8B 3T96B 3VFJA 4TOZA 2G29A 4N13A 4G8HA 3THIA 3MVWA 4PFUA 4K3FA 3CG1A 2OK2A 1QW0A 3PPRA 4YKIA 3FJGA 1SW1A 5H8FA 1B05A 3KFMA 3PPPA 3CG3A 1Y9UA 1R9LA 3PPNA 3FASA 3O66A 3K2DA 2QJEA 2A5TB 2DSFA 3KZGA 1PB8A 1B9JA 3CFLA 4RPNA 1II5A 3GBAA 4X48A 3RT8A 3SERA 3C32A 3UORA 4FORA 3G3GA 1SYHA 2ONSA 1B3FA 4GQOA 5AA4B 1R1NA 5FHNA 2VD2A 1IQ7A 2H98A 3CFZA 3H4ZA 3H6WA 2B3FA 3M3KA 1N04A 3VLVA 3SDFA 4PFTA 4YKJA 3MWBA 3LSXA 5TU0A 1A8EA 1ZTYA 2GRVA 5I2NA 3W9WA 1IIWA 4R6YA 2H99A 2V93A 4F2OA 4PFYA 2I3VA 2REGA 4KR5A 1VFEA 4NF4B 4LZ5A 4ZE9A 3IB2A 4ZS9A 2R9JA 2XXRA 4IO7A 3EN3A 3U72A 4X9TA 1B51A 3RGYA 3FJ7A 3LUYA 3E3KA 5AA3A 1J1NA 3I3VA 3UIFA 4QFNA 1SI1A 1P99A 4KYDA 2ZNSA 1MXUA 3FZVA 1Y3PA 3KGCA 2QMXA 3MW0A 3UA8A 2GHAA 2AL4A 2QPQA 2NVUB 3VV5A 3M8UA 1QVSA 3H3GA 2RC8A 3MAMA 1EZPA 2Q88A 1HSJA 4IO6A 1EH3A 2Q89A 3OMBA 1AIVA 4LA9A 4YICA 2DE3A 4R9FA 2ZYNA 3KG2A 4ELQA 4LONB 5JEIA 1GTKA 3G3JA 1M5DA 3C4MA 3SESA 1Y3QA 4R6HA 3PV0E 1OLAA 4ECFA 2ZNUA 5JK4A 4RNSA 4GXAA 1IXIA 4OFLA 2P2AA 3FVKA 4R72A 1P1OA 4KCCA 4NF5A 3IORA 4H1XA 3IOVA 1ZJLA 2NWJA 1MDP1 3TCHA 4F1VA 1RYXA 1I6QA 3VVFA 2V25A 1LAXA 3JYRA 4QSDA 2F5XA 3R26A 3HHFA 1B58A 4G77A 1B7HA 5H8FB 4DLDA 1FQFA 2P0SA 2FYIA 3U94A 4EUOA 3F11A 4KPTA 4WEPA 4F22A 2AIXA 4ISUA 4PP0A 2XXWA 2HZLA 1LSTA 4P0GA 4G4PA 1QULA 1AL3A 1O63A 2UYEA 3EHTA 1IZ1A 2OLBA 4Z7EA 3S9LC 1NH8A 4OHNA 1N7XA 3H6UA 2UVIA 5ICTA 1A99A 4DIGA 4H5FA 3CFXA 2DWAA 3U8QA 3N5LA 1DPEA 3HCQA 5AA2A 1NNTA 4G68B 4DXBA 4LVQA 5A5XA 4DE8A 4C0RA 1I6BA 4DCYA 1FQCA 4I1DA 1M5CA 5KCJB 3B6WA 4YKKA 4ND9A 4FAJA 1LAGE 1NNFA 1LBBA 1N3WA 2RCBA 1URDA 4HS7A 4WKMA 4HW8A 4OENA 3DP6A 5CMMA 3WAEA 3D4GA 1LCTA 3LSFB 4FIMA 4DCXA 3S9EA 4OXVA 1IXCA 2KLFA 5ITOA 1BIYA 1FTOA 5I84A 3GZGA 3A3UA 4EXKA 3BKIB 4DZ1A 3OD7A 1B1XA 1OQHA 4QRZA 4ZDMA 3N6UA 4G68C 3GBBA 3ZSFA 1PEBA 2GHBA 3EQ1A 1SYIA 4NF6A 1UTHB 4EXLA 4YAHX 4NMYA 4RJZA 3K1PA 4I9DA 1DPPA 5H8NB 4UACA 4H0WA 2O68A 3MVZA 4E0XA 3MVXA 2FA7A 4PETA 4QFLA 4ZEIA 3OSRA 1H44A 1SW5A 3TTKA 3IK6B 1MS7A 3CSGA 1NL5A 1B7ZA 4ELRA 4OEVA 3N6TA 2HEUA 3ECRA 4KQPA 1UQWA 5CMBA 1SDXA 4BDMA 2DWHA 3TTRA 1M5BA 4NE4A 4M1VA 2YPNA 3K1NA 2HQ0A 2ZYOA 4LZ8A 5I57B 2VOZA 1MQJA 1PC3A 4H8JA 1WODA 3U92A 3S2VA 4NF5B 3K6VA 4L17A 3MPKA 3OEKA 4F3GA 4IO5A 1B52A 5ICQA 1A7LA 4RY1A 4YB5A 4U1ZA 3O97A 4R6KA 3IB0A 1MM6A 3FD3A 3TMGA 5DEXA 2F8DA 2HAUA 4AB5A 1P1WA 4F39A 3FV2A 2HCAA 3G3IA 1UTBA 4AB6A 2Q2CA 1FQEA 2XX7A 3O6GA 2Z8DA 5H8HA 1XVYA 1MM7A 4MF3A 3RNNA 2YJPA 3M3LA 1MXWA 4HCWA 1D9VA 2GFEA 3OXNA 2YLNA 1GVCA 4Q5TA 1PBPA 1USYE 3SEUA 4F1UA 5I58A 4PQJA 2I0BA 3EHSA 3PMXA 2IA4A 3DP8A 5H8QA 2V3UA 1LBCA 1UIVA 3PUVE 3CVGA 3FUZA 4F3SA 1MQIA 3IL1B 5CRYA 3FXUA 3IOTA 4DXCA 1POTA 4QFKA 3A09A 4RXLA 4ELPA 1QUKA 2H4IA 3RY3A 1EU8A 1MDQA 3I5OA 3C9HA 4I62A 2OWSA 3ILUB 3VE1B 4YMBA 2Y7WA 3ILTB 5CMCA 3W15C 5LOMA 3K6WA 4MBPA 4OQOA 4JXIA 3FVNA 3DP4A 1P1UA 1LFHA 1BKAA 5DVJA 2P1SA 5BWJA 1H43A 5K2YA 1FTKA 3S9NC 5FTHA 1FQAA 3B6QA 1B5HA 5M2VA 1JETA 2Q9TA 2QSXA 2I48A 1I69A 4G8NA 2ANJA 1TXFA 5K2XA 1LAFE 1OVBA 4OZ9A 2QS1A 5ELVA 3U93A 1JW5A 3TKDA 1YTVA 1LCFA 3PUWE 2XX9A 3PD9A 2VD3A 4OESA 5DVFA 4XKPA 5I2KB 2RCAA 3O29A 3RTWB 4OWDA 2PT1A 2H9BA 5ITPA 1RKMA 4ZEKA 2ALUA 3CRBA 4MLVA 1FQBA 3K02A 1IXHA 2F35A 1DMBA 1FW0A 4ESWA 2Y7RA 1CE2A 1DTGA 3K6UA 3G7WA 5L9OA 3SKPA 1LLSA 4I8CA 4GFRA 3N26A 1MXZA 2HAVA 4XIGQ 2Q2AA 4G2ZA 4F2QA 3IJXB 3EPEA 3PPQA 3VLUA 4LUBA 4NTLA 3S9MC 5TP9A 2ABHA 5KDTB 5DT6A 2XXHA 2QRYA 4F31B 1B5IA 3PUZE 3IB1A 2I49A 2O69A 4U21A 1SD3A 1JEUA 2ZYMA 1A55A 1Y3NA 4FE8A 4FATA 5F1QA 1TWYA 1GR2A 4LQ5A 4ZE8A 3O6IA 4RK9A 4FJPA 2HXWA 3V8XB 1N0TA 2V84A 5TPAA 5ISUA 2OBGA 1B0HA 1XT8A 1FQDA 4JBZA 3P7IA 2OJTA 1WDNA 1B3HA 3LC8A 3IO6A 2PMSA 3VDFA 2BJJX 5AE4A 3UK4A 2F7AA 3ZKLA 4KYSA 4MFIA 3QUFA 5I59A 2DYXA 3MZBA 2R71A 4C1TA 1QKAA 2V3TA 1NKXA 3KEIA 1D4NA 1FTLA 3HN0A 2Z8FA 4YB7A 2QS4A 1JNFA 2XXUA 3L6GA 2ONKE 2UVGA 3Q27A 4POXA 1MY1A 4O3AA 1ZKBA 3QSLA 1M5FA 5JTYA 2XXIA 3G3KA 2F34A 3MBPA 3R7XA 3DM0A 3BBRA 2RC7A 2I58A 3U1OA 2XXTA 4H5GA 4JDFA 1MH4A 1B2HA 4OVJA 2DE4A 4R2BA 4IO2A 1H3DA 3K6XA 4GRKA 1URSA 3RN8A 1MY4A 1LFIA 2CMOA 1BP5A 1ZBMA 4GLIA 3PPOA 3TCFA 1HSLA 4JSOA 1FTMA 2DE2A 4XXUA 1T0KA 2REJA 4NF8A 1P1QA 1POY1 4RPOA 4QF9A 5KZTA 3N94A 1JVYA 1MPDA 3MPLA 2XXXA 3FGSA 4RYAA 3TDJA 3SEVA 2H5YA 1MQGA 4AQ4A 4XTCQ 4LQ2A 5I2NB 1MH3A 2F7CA 2CZLA 4PE5B 1MG1A 1OMPA 1L5TA 2D21A 3IJOB 1O64A 1EZ9A 4P11A 3UN6A 4IO4A 1Y1MA 3O28A 3O6HA 4EQ7A 2O1LA 1NNKA 1N84A 1MPBA 1MPCA 3ZS6A 3QK6A 2Z23A 2A5TA 3IX1A 3TZAA 4DXUA 4OERA 2NOOA 2DOJA 5J1DA 4KI0E 3Q26A 3IOWA 5F7VA 3HSTA 1OVTA 5IKBA 2DVZA 3FV1A 4BDRA 1US4A 2Y7IA 2XXVA 2I3WA 1ZMGA 2O7IA 5B7DA 1QUIA 1B4ZA 1VR5A 3KSJA 3V83A 1B40A 3IR1A 4R73A 3OO8A 3IO4A 5H8SA 2DS9A 5HPQA 3BFTA 4EDPA 4G8MA 3TQWA 4ZZAA 1SQYA 1B4HA 1LAHE 2GH9A 1SBPA 4Q0CA 1YPNA 1TFDA 5L9MA 5AA2D 1SW4A 4EQ9A 4F29A 1N7WA 2OCUA 1Q1KA 4JWXA 2DWIA 3O2AA 1VSOA 4ONYA 3S4UA 1IEJA 5CBSA 4MLQA 3T66A 3LSWA 2B3BA 3Q28A 4OTEA 4F3BA 2RC9A 1MXXA 4NEDA 3QIMA 2XHDA 3K00A 1PDAA 2AL5A 4GVOA 3MP6A 1XVXA 1XS5A 1N76A 1FTJA 3T93B 2X7PA 3C36A 3DLNA 1R6ZA 4YKPA 3ODBA 1OLCA 3TUSA 3JV9A 4IY5A 5B70A 1JVXA 2F36A 4IO3A 3W9VA 1VFDA 4TQUQ 3DELB 2NUVA 1FCKA 4GD5A 4YMAA 3LSLA 4F19A 3RLFE 4IGRA 1S7YA 5DYHA 5FHOA 3L6HA 1NFTA 3AXFA 4IB2A 1PB9A 1XHYA 3HO7A 4NWCA 1A8FA 2ZNTA 3VVDA 3VXCA 2R6GE 5AA2B 4POWA 1TT1A 2ZXTA 5A5XB 3FXQA 3CR9A 1SW2A 3SEWA 1LB8A 1DSNA 4HCYA 2W7YA 4U23A 1Y20A 2Q8JA 1AMFA 5DTBA 1BLFA 2B65A 2PVUA 4LZ7A 2O7UA 2NXOA 4O3CA 3UGWA 2ZMBA 3RTFB 5HM4B 3USDA 4DDDA 4FEDA 4XKNA 1UIUA 3SETA 1B46A 3EF7A 1F9BA 3OOAA 3TPAA 1D9YA 1NH7A 2V3QA 4IY6A 1NNPA 1QKBA 2O6AA 2OZZA 1USYH 3GLBA 2XXYA 2LAOA 4F1YA 1ZIUA 3MQ9A 1Z7NE 1QUJA 1TFAA 1LGBC 2PBWA 1BTJA 3MC2A 4RA1A 3VVEA 1A54A 3OENA 4QFOA 1PBQA 4Z0IA 4NF6B 1IITA 1LB9A 3E13X 1S9TA 3TTMA 4U1OA 1B7UA 1O7TA 3TYHA 1B6HA 2F97A 2F78A 2AYSA 4RK2A 5CC2A 3O9PA 3K4UA 3KOSA 1P1NA 2ZYKA 4LP2B 4ZEDA 2Y84A 4OETA 3QXMA 1A40A 4G68A 3PUXE 3TFLA 5CMKA 4OFJA 1MY3A 2PYYA 4QSCA 1ELJA 3IOUA 5KCJA 1SI0A 4OMBA 1JW4A 3IAZA 3C31A 4OEUA 2A5SA 4TLLB 2D5WA 4TLMB 3T9VA 3TODA 4PFWA 1PB7A 3CI8A 3FVOA 4ZEFA 3H7MA 4JSDA 4BDLA 4N07A 5BUUA 1US5A 3MP1A 4ZECA 4X1BA 4FEBA 4GWOA 3FXRA 4LATA 5EYFA 1AH5A 3H06B 5CBRA 4MH5A 3QUJA 4BLAA 3PUYE 5DEXB 3KJTA 5EHMA 4FECA 4HTGA 4F18A 1UTHA 1HSEA 2RF1A 3E4RA 3OELA 1SVXB 1UTBB 2VGQA 4GL8A 2O84X 2H25A 2XD3A 3LBSA 5H8HB 4WEDA 1KWHA 3EHUA 3CSBA 5H8NA 4R75A 3HV1A 2Z8EA 3VLWA 1DOTA 4KHZE 3V89B 4YZZA 1B3EA 4GXSB 2F6PA 4QHQA 2Y7PA 5L8DA 3TEPA 4NWDA 3TTLA 4GOTA 3LR1A 3H03A 1Y1ZA 4OYVA 1R9QA 3T9UA 4O3BA 2ONRA 5CM6A 5I58B 3KOTA 3Q25A 2F6GA 3FVGA 3R6UA 2UXAA 2OWTA 4EF1A 5H8QB 3SEYA 4IGTA 5FTIA 3T22A 1OQGA 4H67A 3C35A 4R2FA 5I57A 3M3FA 1Y4CA 1URGA 3C34A 3SEXA 2DXRA 1M5EA 3RUMA 3OO9A 3G3FA 5I56A 1DTZA 2DQVA 3QAXA 5DVIA 2DP8A 3TCGA 3PD8A 1S50A 1JW1A 3K01A 2F7BA 1B1HA 1JEVA 2X26A 3FJMA 5IAIA 1MXVA 1VE4A 4Q30B 4ZEBA 1MQDA 1D3KA 4EF2A 4BDQA 2XD2A 2DXYA 2ESNA 2M8CA 4U2RA 3I6VA 2PT2A 1MY2A 3KSXA 1IUDA 4KYEA 2D3IA 1H76A 3PMVA 2UYFA 5EHSA 4E0WA 2RINA 4GIZA 1B32A 2HZKA 2WKYA 1B0LA 3MUQA 1ZLQA 1XOCA 1GV8A 4C1UA 4U4SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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