3FVNA

Crystal structure of the human glutamate receptor, glur5, ligand-binding core in complex with 9-deoxy-neodysiherbaine a in space group p1
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
ANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
publication title Binding and Selectivity of the Marine Toxin Neodysiherbaine A and Its Synthetic Analogues to GluK1 and GluK2 Kainate Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Membrane protein
total genus 82
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fvnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fvnA02
4U4SA 4BDRA 2DWHA 1B05A 5ELVA 3PGFA 2DE3A 4R6KA 4LA9A 3K1NA 4IY6A 5KZTA 5HBCA 4YMBA 1QW0A 1JVYA 3EPEA 2XXIA 2I49A 3IOVA 1FCKA 4ELPA 1UTBB 3IJOB 1B1HA 1FQEA 2G93A 1NNKA 5JTYB 3SETA 4PFWA 4C0RA 5EHSA 4YAHX 3IX1A 3TTMA 4JWOA 1DTZA 4RY1A 1SW4A 4F1VA 2UYFA 5DTBA 4GXSB 4R2FA 1A8FA 4ZDMA 4PFTA 3BBRA 4GRKA 3E9XA 1MM6A 1VSOA 4F2QA 1Y3PA 1ZU0A 3FVKA 4U1ZA 4M1VA 4GXAA 1DPEA 4DCYA 1CE2A 1QVSA 3IJXB 1H45A 1N3XA 1Y4TA 4PFUA 4GQOA 2Z23A 5I56A 1OMPA 1IEJA 1UQWA 1ELJA 4R6HA 4F3SA 2ZNTA 4BDQA 3HN0A 1O64A 2O7UA 1MXWA 5LOMA 3N26A 4IO2A 1WDNA 4KHZE 5TP9B 1I6QA 1WODA 4E0XA 4NWCA 2V25A 1EZ9A 5I58A 4IGRA 1LB9A 1B51A 4DLDA 2DE4A 2HAUA 5J1DA 3MZ9A 3LR1A 3K01A 3GBBA 4GIZA 1I6AA 3KBRA 5KDTA 3FJGA 4JDFA 4R75A 4EXKA 4WEDA 4YB7A 3FZVA 4GD5A 3FASA 2B3BA 3H6VA 1S7YA 2RINA 3OO8A 4R74A 3G3HA 3U1OA 2E1SA 1QUIA 4F29A 2FYIA 1MH4A 2I58A 1B3FA 4KFQA 3Q25A 1MXVA 4KYDA 4JXIA 3TEPA 4G4PA 3OENA 4DZ1A 4U22A 2OK2A 3A3CA 4JWXA 2H4IA 3ONMA 1EH3A 1SYIA 1YTVA 4MH5A 3MVXA 3DP4A 2B3FA 1B3EA 3S9EA 4YICA 1B5HA 3C4MA 3RN8A 4OTEA 4ZEKA 4RA1A 4H8IA 1TT1A 5AE4A 2O68A 4ESWA 5I2NA 3D4GA 3IL1B 1USYE 4NEDA 1MS7A 3H6WA 2Y7WA 4IO4A 2I4CA 2DWJA 1LCTA 3B7DA 2ZYMA 5BUUA 1NL5A 3RNNA 2VHAA 2DSFA 3TKDA 2Z8DA 3MZBA 5F7VA 3H7MA 3A09A 2OWSA 4ELRA 5I56B 3TCHA 3DP8A 4U2RA 2O7IA 2GHBA 3I3VA 1POY1 1XS5A 1RYOA 1B46A 1A99A 3IOTA 4H8JA 4H5GA 1MQIA 3FXUA 5FTHA 4UACA 1B40A 1QKAA 5ITPA 4EF1A 3HHFA 5H8QA 1VFEA 5H8NB 3QYTA 4DXUA 3S4UA 3CRBA 2XXUA 2P2AA 5CRYA 2Q9TA 4WEPA 1FQDA 3QUJA 2QS2A 1SDXA 2Z22A 1XHYA 3W15C 1PDAA 4PFYA 3OO9A 3FV2A 3UIFA 4ZE9A 3OEKA 1QUKA 4F39A 2GHAA 2F6GA 4Z7EA 1BLFA 1MXXA 4RJZA 4AB5A 1PBQA 3BFTA 4POWA 1XOCA 3RTWB 2DXRA 1A55A 5AA1A 5H8HA 1LFGA 1SI1A 2VGQA 3M3LA 2FA7A 3MC2A 4F18A 5AA4A 3ODBA 4TLMB 3O6GA 1ZJLA 2V3QA 3OEMA 4OERA 2XD3A 3L6HA 1MXUA 2I6EA 2I4BA 1WVJA 4ECFA 4HW8A 4TQUQ 3U92A 5I2NB 3O9PA 4IY5A 3FJMA 1BKAA 2IEEA 4NF6A 4QFKA 2HQ0A 2ZYOA 4U1OA 3RQTA 1P1OA 1MM7A 1JNFA 4UA8A 3CSBA 3PMVA 3UORA 1DOTA 2F8DA 4IO7A 4ZS9A 5CBRA 1M5CA 1LAFE 4LZ8A 1IXHA 2B65A 1MQHA 1AMFA 1HSJA 3ZKLA 3PMWA 3TMGA 5F1QA 2ABHA 3VXCA 4QFPA 3K1MA 4YKJA 3IB0A 4QRZA 1M5EA 2F5XA 4OETA 1IZ1A 2QRYA 3U93A 4EQ9A 3IO4A 3K2DA 3IO6A 2Y7PA 3VFJA 1QULA 1Y4CA 1US4A 4PP0A 3PUVE 5BWJA 3D4CA 3HPIA 5KCJA 2ANJA 2DS9A 5H8QB 3AXFA 3G3IA 4TOZA 3SKPA 3PUZE 5DEXA 1J1NA 3VE1B 1PEBA 1YAEA 2GRVA 2RKMA 2VD2A 3I6VA 4XKNA 3JV9A 5TPAB 4NF4A 4DE8A 3GBAA 4H5FA 1B4ZA 3TFLA 4FE8A 1B7HA 2F35A 3MPLA 3PUXE 4R2BA 3T96B 1MY1A 3M3KA 1SBPA 2OWTA 4E0WA 2P0SA 3O66A 1FQAA 2AL5A 3O6IA 4RK2A 3T9UA 5JEIA 4GF8A 4DDDA 3K6XA 1II5A 1XVYA 4LATA 1I69A 1LAHE 3G3KA 2YJPA 4AB6A 1MY3A 4MLVA 5ICQA 2DYXA 4G8HA 4FIMA 1FTOA 5AA4B 2DVCA 2V3UA 2UYEA 2DXYA 4O3BA 2DP8A 3VVFA 2A5SA 3MZ1A 5JK4A 1VFDA 4JSOA 3W9VA 1R6ZA 3U94A 4ELQA 3WAFA 1USYH 3KOSA 4P0GA 1QKBA 4KCCA 4QFLA 2REJA 4F3GA 4ZZEA 4NF6B 3FVNA 2YPNA 3OOAA 4RPNA 4N6PA 1B1XA 3S9MC 3T66A 4MBPA 3H06B 2X26A 1PC3A 5A5XA 5ISUA 1MPBA 3CG1A 2D21A 4ND9A 4NMYA 1I6BA 5K2XA 2BJJX 1LLSA 1N3WA 3UP9A 2LAOA 4KI0E 1OLAA 1B5IA 1ZLQA 4G77A 1P99A 2XXPA 2F6PA 2I3WA 1MG1A 1B7ZA 1Y1ZA 4AQ4A 4GL8A 2PYYA 3TQLA 2Q88A 2ESNA 5B7DA 3FGSA 3UN6A 2UXAA 3KOTA 1SVXB 4WKMA 2O1MA 3T9HB 3SEYA 3B6TA 2UVIA 1H44A 1M5BA 3MPKA 4OHNA 5KCJB 2I0BA 3M3FA 2XX9A 5DEXB 3C31A 3QK6A 2Q2AA 1MDQA 1SW5A 4NF4B 1ZBMA 1IXCA 4F1UA 1LAGE 5CBSA 1B52A 1A7LA 3T93B 1ZKBA 2O51A 2X7QA 4QFNA 1LFHA 3MWBA 5ICTA 2WKYA 4XKQA 3IOUA 3SEWA 3FIRA 2PVUA 2O1LA 2I3VA 2ONSA 2VD3A 3H3GA 4IO5A 1LAXA 4R72A 3TZAA 1YCJA 2XXYA 4NTLA 2XHDA 3VV5A 3N5LA 2HAVA 3C33A 4RXLA 2XX7A 2RC8A 4LONB 5AA3A 1URGA 4GVOA 2UVGA 3MVYA 3TODA 4IGTA 3MP6A 4N07A 3VLVA 1FQCA 5DYHA 2V93A 3KG2A 3DP6A 5AA2D 4LQ5A 1RYXA 1QUJA 1OLCA 1IIWA 2PT1A 3F11A 5A5XB 3VVDA 2H25A 3KEIA 3CFZA 5CM6A 1NNPA 3P7IA 3TQWA 1TXFA 3PU5A 3ZS6A 1BTJA 3OELA 3E4RA 2DWAA 1MXZA 3R7XA 1IUDA 5DVFA 2QPQA 3S2VA 4LZ5A 3DELB 2CZLA 1Y3QA 2ONKE 2REGA 3U8QA 3TCGA 3THIA 4C1TA 4KCDA 1Y1MA 1MDP1 1AIVA 3CR9A 5I58B 3QAXA 3QSLA 1OVTA 4POXA 1N7XA 1D9VA 1SD3A 1FTKA 5CMKA 1GR2A 1N0TA 3IB2A 4ZECA 3T22A 4U4XA 3K4UA 1YPNA 4YKPA 3Q28A 2AL4A 1NH8A 1Y20A 4NF8A 1DTGA 1OIBA 2H5YA 3VDFA 5KDTB 3CFXA 2OLBA 3TDJA 5I57A 4BDNA 3CIJA 4EUOA 1L5TA 2THIA 3GLBA 1S50A 2DVZA 1EZPA 3DLNA 3LSLA 4MF3A 2PX1A 3GZGA 4EQ7A 5FTIA 2Y7IA 3K1PA 2A5TA 3PPOA 3IOWA 1ZIUA 3RT8A 4ONYA 4EF2A 1SW1A 4GWOA 4FATA 4OZ9A 2Y7RA 1N7WA 4YZZA 4H6DA 3Q26A 2ONRA 4ZEDA 1B32A 3EN3A 4DIGA 4QHQA 2AYSA 4ISUA 2ZXTA 3N94A 4OFOA 4K3FA 3QUFA 3SESA 4LZ7A 3UA8A 1GTKA 4U21A 4G2ZA 2HEUA 5CMMA 1P1UA 3B6WA 2RF1A 3V89B 2RC7A 3H4ZA 5H8FA 1NH7A 3LSWA 1T0KA 1Q1KA 3MVWA 4X1BA 1FTMA 2OZZA 2H99A 4NF5A 3PD9A 5DT6A 3KN8A 5JTYA 3LSXA 5HM4B 3OMBA 2Y84A 4OEUA 5ITOA 1MQJA 3G7WA 3B6QA 4G68A 1DPPA 3FVOA 3OSRA 1OQGA 3N6UA 3H6TA 3MP1A 3Q27A 5FHMA 5CMCA 3SEVA 4FECA 3TTKA 4XXUA 1IXGA 1GV8A 3O97A 3RTFB 3PPRA 4OXVA 4X48A 1PB7A 4RK9A 2F97A 4KR5A 1UIVA 4NF8B 1MRPA 3HV1A 4X1DA 3N6TA 1B58A 5I2KA 1TWYA 4Q30B 1ATGA 1D3KA 4F1YA 1B0LA 2R71A 4H65A 2HZKA 4JBZA 1B6HA 1JEUA 5I57B 3HO7A 1SQYA 4OYVA 4G68C 2VOZA 1TFAA 2XXXA 4KD5A 4OMBA 3MUQA 3KSJA 3FV1A 4H1XA 3PV0E 2X7PA 1M5DA 3DM0A 3K6UA 1PB8A 4QFOA 4BLAA 5L9SA 2NUVA 1Y9UA 4YMAA 3W9WA 1URSA 4L17A 3TPAA 4O3AA 5H8HB 3V5AA 1RKMA 2A5TB 3CI8A 2ZNUA 1LBBA 3G3FA 2DWIA 4ZEFA 1MH3A 1Y3NA 4R9GA 1M5FA 4BDMA 4M4GA 2Q89A 4IB2A 1P1QA 2O6AA 2H9BA 1Z7NE 4RNSA 1XC1A 3MW0A 1B3GA 2O84X 3H03A 4P11A 3MAMA 2NOOA 3U72A 2PBWA 5I59A 1O63A 1ANFA 3PPPA 2XXVA 2XXRA 2F7CA 4C1UA 4OFJA 5H8FB 2FNCA 4FORA 3C36A 4BDOA 1AOVA 3ILUB 2R6GE 3SERA 3IAZA 3A3UA 4NF5B 1NMUA 2OCUA 4XKRA 4G68B 4THIA 1VR5A 4OVJA 3T9VA 1LFIA 4F3BA 4RPOA 5EHMA 3K0VA 3C32A 2YLNA 4N13A 3MJNA 1QJMA 3GXAA 3KSXA 2PT2A 1B4HA 4OWDA 3R6UA 4TLLB 4PE5B 3MQ9A 2QJEA 1EU8A 3IR1A 3LBSA 4YKIA 4FAJA 2I48A 4LUBA 2NVUB 3ECRA 3FD3A 2NXOA 3KJ7A 1VE4A 3ILTB 2XD2A 1ZMGA 5AA2A 2I0CA 1JQFA 5HPQA 3CVGA 4JWYA 4R9FA 5I2KB 2ZYNA 1URDA 3JYRA 3HSTA 3TTNA 4H0WA 2V3TA 2HFBA 4KYEA 3E3KA 1PBPA 4QSCA 3FVGA 3TYHA 1LGBC 1GGGA 5L9MA 1H76A 3RPWA 2QSXA 3LC8A 4YU0A 4DXCA 4QF9A 5FHOA 4BDLA 5H8NA 4P0IA 1MY0A 4EQBA 3RLFE 3TTLA 5B70A 1B5JA 2NWJA 2XXWA 1H3DA 1IQ7A 1F9BA 2XXQA 3MP8A 3OO6A 4FEDA 3RY3A 2QS4A 3FATA 2QMXA 4LVQA 4R6YA 1IITA 3PUYE 3O29A 3FXQA 1JW4A 1UTHA 1B7UA 1IXIA 1R9QA 4DXBA 5L8DA 3EHSA 4LP2B 3OSQA 3E13X 3Q29A 2CMOA 3CFLA 4ZZAA 4KPTA 4DCXA 3SDFA 1OQHA 3OD7A 3I5OA 3PD8A 3TCFA 4F2OA 1JW5A 4IO6A 1B0HA 4GFRA 1NKXA 3TAJA 4HS7A 1N04A 2P1SA 4F31B 2R9JA 3K00A 5I59B 1MQDA 1EZOA 2F78A 1MY2A 5I84A 3G3GA 2OJTA 1JVXA 3USDA 2D3IA 1A54A 1JETA 4HCWA 2RCBA 3S9LC 2Z8EA 2F7BA 3C9HA 2XXHA 4MFIA 2PMSA 3EHTA 1MPCA 5IAIA 2F34A 4Z0IA 3SEUA 4OFLA 3L6GA 4H67A 3K6VA 3KZGA 5TU0A 2E0SA 4F3PA 3QIMA 3RGYA 1NNTA 3K6WA 3MBPA 2D5WA 3H6UA 4MLQA 4ZE8A 3LUYA 1LBCA 1FQFA 1UIUA 4HTGA 3CSGA 5M2VA 3UGWA 2XX8A 2Q2CA 3KN3A 1D4NA 4JB7A 4YKKA 4I62A 4GOTA 2DOJA 4JSDA 5AA2B 4YB6A 4Q5TA 3PPQA 1MPDA 4G8MA 1POTA 3SEXA 2IA4A 3FUZA 4Q8RA 1NFTA 4ZEIA 3K02A 3R26A 2QS3A 3VLWA 1CB6A 1US5A 1GVCA 1SYHA 2DE2A 3VXBA 3JZJA 2ALUA 4NWDA 4XTCQ 5TPAA 3V8XB 2Y7KA 1MQGA 1XVXA 1N84A 1DMBA 1MXYA 3HHGA 5H8SA 3UK4A 1HSLA 2G29A 1LCFA 1FQBA 1A8EA 3IK6B 3HCQA 3VVEA 1UTHB 3C34A 2HCAA 3EQ1A 1LSTA 2V84A 1O7TA 1HSEA 2KLFA 1P1NA 3TELA 4GLIA 2GH9A 3TUSA 1PB9A 4I9DA 1D9YA 1XT8A 5IKBA 3KN7A 2Q8JA 3M8UA 1KWHA 1FTLA 1MY4A 1TFDA 4R73A 2XXTA 4QSDA 5K2YA 3PMXA 5FHNA 2F36A 2ZYKA 3LSFB 4OENA 2HZLA 2ZMBA 3V83A 2RC9A 3T9XB 3BFUA 5CC2A 4F19A 1UTBA 4I8CA 4ESXA 1P1WA 3EHUA 4OESA 4PETA 3O6HA 2AIXA 3PPNA 4YB5A 4EXLA 1B3LA 2QS1A 4G8NA 4X9TA 3PUWE 1SI0A 1B9JA 3IORA 3ZSFA 3KJTA 3MVZA 1R1NA 4KQPA 1OVBA 4ELOA 4KYSA 2Z8FA 4HCYA 3G3JA 1B2HA 2QL3A 5CMBA 1LB8A 2GFEA 4QSEA 2OBGA 4I1DA 1AH5A 1ZTYA 4GL0A 4XIGQ 1H43A 3VLUA 2QMWA 3WAEA 4O3CA 1BP5A 2H98A 3QXMA 2UVHA 3KFMA 1S9TA 3BKIB 4LQ2A 2M8CA 4NE4A 2ZNSA 4IO3A 3FJ7A 4PQJA 2DQVA 4F22A 5TP9A 1A40A 3KGCA 3TTRA 4FEBA 4RYAA 1N76A 3OXNA 4OEVA 3S9NC 1FW0A 4OQOA 3EF7A 4XKPA 1B3HA 2UVJA 3RT6B 3O28A 3CG3A 2HXWA 3RUMA 2F7AA 1AL3A 5DVIA 2W7YA 5L9OA 1R9LA 1FTJA 2O69A 1Z7ME 1NNFA 4U23A 2RCAA 4EDPA 4FJPA 5CI5A 3FXRA 1JW1A 1JEVA 3OO7A 4Q0CA 1Q35A 4ZEBA 1DSNA 1BIYA 2VP1A 4WXJA 3IB1A 3O2AA 5EYFA 1SW2A 3ZKKA 3C35A 5DVJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4U4SA 4BDRA 2DWHA 1B05A 5ELVA 3PGFA 2DE3A 4R6KA 4LA9A 3K1NA 4IY6A 5KZTA 5HBCA 4YMBA 1QW0A 1JVYA 1FPBA 5EQ7A 3EPEA 2XXIA 4GWWA 2I49A 3IOVA 1FCKA 4ELPA 1UTBB 3IJOB 1LBWA 1B1HA 5J16A 1FQEA 2G93A 1NNKA 5JTYB 3SETA 4PFWA 4C0RA 5EHSA 4YAHX 3IX1A 3TTMA 4JWOA 1KA0A 1DTZA 4RY1A 3HFUA 1SW4A 4F1VA 2UYFA 5DTBA 4GXSB 3SZPA 4R2FA 1A8FA 4ZDMA 4PFTA 3BBRA 4GRKA 3E9XA 1MM6A 1VSOA 4F2QA 3FXBA 1Y3PA 1ZU0A 3FVKA 4U1ZA 2Q8MA 4M1VA 1NUWA 4GXAA 1DPEA 4DCYA 4MNPA 1RDZA 1CE2A 1QVSA 3IJXB 2Q74A 2HPGA 1H45A 1N3XA 1Y4TA 4PFUA 5DW8A 4GQOA 4PTKA 2Z23A 5I56A 1OMPA 5A5LA 1IEJA 1UQWA 1ELJA 1IMDA 2QFLA 4R6HA 4F3SA 2ZNTA 4BDQA 3HN0A 1O64A 2O7UA 1MXWA 4JVCA 5LOMA 3N26A 3IFAA 4IO2A 1WDNA 4KHZE 5TP9B 1I6QA 1WODA 4E0XA 4NWCA 2V25A 1EZ9A 5I58A 5ET8A 4IGRA 1FBHA 1LB9A 1B51A 4DLDA 2DE4A 5LDZA 4NN3A 2HAUA 5J1DA 5IZZA 3MZ9A 3LR1A 3K01A 3GBBA 4GIZA 1I6AA 1IMCA 3KBRA 3A29A 5KDTA 3FJGA 4JDFA 4R75A 4EXKA 4WEDA 4YB7A 3FZVA 4GD5A 3FASA 3LUZA 2B3BA 3H6VA 1S7YA 2RINA 2XXKA 3OO8A 4R74A 3G3HA 3U1OA 2E1SA 1QUIA 4F29A 5EYHA 2FYIA 1MH4A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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