3FVNA

Crystal structure of the human glutamate receptor, glur5, ligand-binding core in complex with 9-deoxy-neodysiherbaine a in space group p1
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
ANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
publication title Binding and Selectivity of the Marine Toxin Neodysiherbaine A and Its Synthetic Analogues to GluK1 and GluK2 Kainate Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fvnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fvnA02
2O69A 2HAVA 1RYXA 4YKPA 4IGRA 2I48A 1R6ZA 4NMYA 4R72A 2XXIA 3PMXA 1US5A 4IO7A 2RC9A 3VVFA 3VVEA 2H5YA 5EHSA 3VVDA 2VHAA 5FHMA 1QW0A 3QUJA 4IO2A 1ZU0A 1MM7A 1CB6A 3HHFA 2XXVA 3B6TA 3S9LC 5H8NB 2O84X 4OFJA 1YTVA 3H03A 2DWIA 1B3HA 1PEBA 3CFXA 2UVIA 4QRZA 1F9BA 3T9HB 1MQJA 4NWCA 3T93B 4U1ZA 2OJTA 3G3HA 2FYIA 3IK6B 2ESNA 2QSXA 2F5XA 3I3VA 5I59A 3HO7A 1T0KA 1SYHA 4TLLB 4LA9A 4F1YA 3UORA 4QFNA 4F3BA 1NH8A 2H98A 2ZMBA 4R2BA 4IO3A 1MY4A 1ZBMA 1YAEA 1B7UA 4FJPA 3MWBA 3PU5A 4U1OA 2O7UA 3S4UA 2RCBA 3TTLA 1R9LA 3HPIA 4JDFA 4LQ2A 3TMGA 1B5JA 4LONB 3ZSFA 3LR1A 3MZ1A 3TELA 3MZBA 4POWA 2W7YA 1DMBA 3N5LA 1SYIA 1R9QA 1IXHA 4Z7EA 1B4ZA 1N3XA 5K2YA 2F36A 4H1XA 3PMWA 3IR1A 5ISUA 1MXWA 1B7HA 2RINA 4EDPA 4F22A 3VV5A 1QKAA 4RXLA 1TXFA 2CZLA 2Q2AA 2HCAA 2VOZA 3DLNA 2V25A 2X7PA 2B3FA 2O1MA 2GHAA 3KFMA 4HS7A 1GVCA 3TQWA 4QFKA 4R75A 2F78A 4XKRA 2ZNSA 3VLVA 1M5EA 3VLWA 3IO4A 3FGSA 4BDNA 1I6QA 2DE3A 4P11A 1D9VA 1FCKA 1LBBA 4YU0A 1LB9A 1N76A 3DP8A 4FIMA 2ZNUA 2PMSA 2DE4A 1B52A 2DQVA 1VE4A 4QFLA 2QS3A 1H45A 4ZEFA 3EN3A 5I58A 2Z8FA 5H8QB 3LSFB 1IIWA 3P7IA 3WAEA 3JYRA 3TCHA 3H7MA 4HTGA 4YICA 4XKPA 1MXUA 4U2RA 3N6UA 2Y7KA 4YB6A 2XXQA 1UTBB 2BJJX 3CSGA 3VXBA 3EHSA 2UVGA 2V3UA 2F34A 2D5WA 3U92A 2KLFA 3LBSA 1A55A 1FQBA 4ZE8A 2V3QA 2D21A 4H8IA 4JXIA 3O6IA 3A3UA 1II5A 5CMBA 3CR9A 3W9VA 2O6AA 2P1SA 2F35A 5H8NA 3AXFA 4ZZAA 1FQFA 3G7WA 2UXAA 3B6WA 3MAMA 4RY1A 3T9XB 4Z0IA 1VSOA 1FTLA 4MLQA 2AYSA 3FXUA 4H8JA 5F7VA 2F7BA 1WDNA 4KQPA 3KN7A 1SBPA 1FQDA 1Q35A 3A3CA 5ICTA 4UA8A 1B05A 3IB1A 4KPTA 4N07A 3RQTA 4OEVA 3FV2A 3EF7A 1P1OA 4ECFA 3C32A 3VLUA 4DXBA 5ELVA 3SEWA 2RF1A 2DVCA 1MY2A 3VE1B 2B3BA 4XTCQ 4ZECA 1D3KA 2I3VA 3UK4A 3I6VA 4ESWA 4ELPA 2ZYOA 2XXUA 3SETA 4NE4A 3T66A 4RYAA 5H8HA 4JSDA 2XXXA 4ZEIA 3FUZA 3WAFA 2X7QA 4H5GA 1H43A 3Q29A 4POXA 4TOZA 5JTYA 2Z22A 2ONKE 5AA4B 1M5DA 1UTHA 1M5FA 4GFRA 1URGA 4OYVA 3IAZA 3PUVE 2GFEA 4PFUA 2Q9TA 4ZEKA 1OLCA 1Y3PA 3MVXA 3OO9A 2I4CA 3R6UA 3PUWE 1B0LA 1P1WA 4MLVA 2H99A 2AL4A 1XOCA 1O63A 3KSJA 1MH4A 1PB8A 4ZE9A 1SVXB 1JEVA 1DSNA 2NOOA 2OWSA 2AL5A 5I59B 4F31B 3GXAA 1VFEA 1IUDA 4LQ5A 1H76A 2DP8A 3U1OA 2OK2A 3HSTA 4R9FA 3QXMA 1TFDA 3TTMA 1NNTA 2D3IA 4U21A 3MVYA 1JEUA 3TCFA 1D4NA 5DT6A 5B7DA 4ONYA 5FHNA 5AA2D 4F2OA 4I1DA 3BFTA 4PP0A 2I0CA 4GWOA 1MDP1 4ESXA 2FA7A 1JVXA 3FVNA 4I9DA 3V89B 3O6HA 1BTJA 4F3GA 3TEPA 3KN3A 2XXHA 2WKYA 5IAIA 1HSEA 3TTNA 4C1UA 1UIUA 3OD7A 4TLMB 4F29A 3E4RA 2FNCA 3EHUA 3THIA 1GR2A 5KZTA 3IOVA 3DELB 3S9NC 3B6QA 3QAXA 3BKIB 1QUJA 1B3LA 2I4BA 3RUMA 3MP6A 3S2VA 1A8EA 1PBQA 2Y7RA 4KI0E 1JETA 2DYXA 3KOTA 1S7YA 1Y20A 4X9TA 2ALUA 3O66A 1FW0A 3H3GA 3V83A 4X1DA 3RPWA 2A5SA 3MP1A 4ZEDA 4LZ7A 3M3LA 1MH3A 1B9JA 4G68B 1IQ7A 3E13X 4QSCA 1LAHE 3SDFA 4RPNA 1H3DA 3FJMA 4BDOA 2RKMA 2Z8DA 4BLAA 5I58B 3LSWA 1ZJLA 3HCQA 4YKIA 1MPCA 3SESA 4IO6A 1LFHA 1VFDA 3I5OA 2QMXA 2HZKA 1MS7A 5HBCA 5DTBA 1QULA 4F3PA 3IX1A 5ITOA 4GF8A 1Y1ZA 1JW1A 1FQEA 1QUIA 4ELQA 1OVBA 3SEYA 4FAJA 3USDA 4Q5TA 3O29A 1SQYA 2DS9A 4IO5A 4JSOA 2HFBA 5CMKA 2HXWA 4WKMA 1P99A 4GLIA 4WEPA 2UVHA 1B5IA 4H0WA 2R6GE 1SW4A 1DOTA 1P1QA 4F39A 1AOVA 4FECA 4LP2B 3MW0A 2Y7WA 4GXSB 1N04A 5A5XA 2F6PA 5CM6A 1JW5A 1QUKA 1CE2A 5KCJA 1O7TA 1I69A 3PPNA 4OQOA 4EUOA 2ZNTA 2PX1A 4OVJA 1AL3A 2Y7PA 3MVZA 1JVYA 3E9XA 4EF2A 4N6PA 1POY1 5H8HB 4BDMA 4R9GA 1A8FA 4RK9A 5TPAA 1MPDA 3OEMA 1SI1A 4LUBA 3K6WA 4ZZEA 3KN8A 4Q30B 5JTYB 3K1PA 3SEXA 1OIBA 2I0BA 4YZZA 1UTHB 1IITA 3HHGA 1O64A 3K6XA 3C33A 4M1VA 1ZLQA 3IB0A 2H4IA 3G3GA 1NKXA 4KCDA 4U23A 3W9WA 4JB7A 3MPLA 4P0IA 5CMMA 4NF5A 3KSXA 1IZ1A 3C36A 4LZ5A 4EXLA 3V5AA 3MPKA 4KYDA 3D4GA 4YB7A 4H67A 1NH7A 1B40A 4R6KA 2F97A 2Q2CA 1NFTA 3GLBA 4U4SA 3RGYA 3CFZA 3QUFA 4PE5B 3FVOA 4H5FA 3PPQA 1ATGA 3TZAA 4G68A 3OSQA 3Q28A 1Y4TA 1LSTA 4NF8A 3HN0A 2AIXA 2M8CA 4FE8A 2REGA 3LSLA 3KZGA 1M5CA 1UQWA 4OMBA 3K0VA 2XHDA 3K00A 5I84A 1GGGA 3MJNA 4P0GA 3CI8A 5BUUA 3U8QA 2P2AA 5I56A 3OO8A 3M8UA 1IEJA 5L8DA 3PMVA 3IOWA 2PT1A 2HQ0A 2F8DA 3RLFE 1PBPA 1Y9UA 4O3CA 1GV8A 1HSJA 1TWYA 3S9EA 4MF3A 1MXXA 4F1UA 2I3WA 1MXZA 4DCXA 1MXVA 2THIA 3FIRA 1FTMA 5CRYA 2DVZA 2ZYMA 4PQJA 4KD5A 5H8SA 5DVJA 2ZYNA 3PGFA 1N84A 4Q0CA 5AA2A 1B7ZA 4L17A 1D9YA 4R6HA 3IJOB 3FVGA 4F1VA 4PFTA 3ILTB 2G93A 4LVQA 5DVFA 3OSRA 2NXOA 3PUXE 3T9UA 1I6AA 4RK2A 1N0TA 3CFLA 1TFAA 3FD3A 1B3GA 4KCCA 4DLDA 2E0SA 3MBPA 4JWXA 1LB8A 4GIZA 2B65A 4AQ4A 2DWJA 3OXNA 3FV1A 2NUVA 1LLSA 1URDA 3L6HA 2H25A 4DCYA 3MUQA 1BKAA 2IEEA 2I6EA 2XXWA 4LZ8A 3KOSA 4ZEBA 1S50A 1B5HA 3TFLA 3K2DA 4PFWA 4QF9A 1LBCA 3C9HA 1SDXA 2OWTA 1MY1A 1LAFE 1YCJA 3G3IA 3IO6A 4RJZA 3O6GA 3C4MA 1XHYA 3JZJA 4I8CA 3QSLA 3TKDA 2X26A 3C34A 2YPNA 1B1XA 3DP4A 3OENA 3Q26A 1MQGA 2O68A 2DSFA 1A54A 3U93A 3O97A 3EHTA 4YB5A 1I6BA 3K4UA 4MBPA 3U72A 1QVSA 4YKJA 1US4A 1B3FA 5A5XB 4TQUQ 4X48A 3KEIA 2V93A 5KCJB 4OFOA 1NMUA 5F1QA 3DP6A 4FATA 4XXUA 1MPBA 3QIMA 3MZ9A 3SERA 2QS1A 2O51A 1MRPA 4G4PA 1OQGA 5TPAB 3H6UA 3FXRA 2OCUA 1A7LA 3A09A 4H65A 4F19A 1SW1A 1IXGA 1B32A 5EYFA 2Z8EA 3T96B 3IOUA 1JW4A 1AH5A 1ANFA 1OMPA 1SD3A 4AB6A 1LFIA 4FORA 4GQOA 1MM6A 4NF5B 2G29A 4OXVA 1YPNA 4G68C 3KJ7A 4DIGA 4RA1A 4JWYA 2QS2A 3IB2A 2F7AA 1R1NA 5TP9A 3TPAA 3RTWB 1LGBC 1N7WA 2XXRA 1SW2A 1KWHA 4GXAA 2R71A 4QFPA 2DWHA 4ZS9A 4AB5A 1IXCA 1IXIA 2QPQA 2DXRA 1OQHA 1B46A 2GRVA 4WEDA 3PV0E 1FQAA 4NF8B 1MQIA 4FEDA 2DXYA 2RC8A 4OZ9A 4GVOA 4EQ7A 5M2VA 5JEIA 4OETA 2REJA 5J1DA 4RNSA 4WXJA 3OOAA 5L9OA 5I56B 3ZKLA 1BP5A 1Y4CA 2V84A 5CMCA 4XIGQ 3RN8A 2XX7A 2XX8A 3U94A 4NF6A 1HSLA 3FATA 5EHMA 1B6HA 2Y7IA 2PBWA 2GH9A 3O28A 1J1NA 5I2NB 1UIVA 5JK4A 2A5TB 4XKQA 3ONMA 3TODA 1A99A 1MY3A 5I57A 5AA2B 2Y84A 2ZYKA 1PB9A 4MH5A 3H6TA 4OWDA 5AE4A 3CRBA 3C31A 4DZ1A 4E0WA 1RYOA 4OTEA 2YLNA 2QL3A 3PPRA 2VP1A 4QFOA 1EZOA 4G8MA 1MDQA 5L9SA 3HV1A 4HCWA 3K02A 1B0HA 2E1SA 2NVUB 3CSBA 2ONSA 1JNFA 2VD2A 4DDDA 1Y1MA 4NF4A 3M3KA 1Y3NA 3JV9A 3MVWA 1SW5A 2GHBA 4XKNA 3TTKA 5I2KB 2F7CA 3LUYA 4ZDMA 1L5TA 3FZVA 3KBRA 1FTJA 3KGCA 4K3FA 3TCGA 2XD2A 1OVTA 3Q27A 1PDAA 3IORA 5CI5A 4G8HA 4HCYA 3PD8A 1EZPA 4HW8A 4FEBA 5FHOA 5IKBA 1FQCA 1WVJA 1RKMA 4NTLA 3CIJA 3T9VA 2DOJA 1Y3QA 2UYFA 4LATA 3S9MC 1MY0A 3T22A 1ZTYA 1QKBA 5B70A 2QMWA 2Q89A 2OLBA 3QK6A 3CVGA 5FTIA 2DE2A 4EQBA 3UA8A 4R74A 1B3EA 3UP9A 2OZZA 3IOTA 3E3KA 3TUSA 2XXTA 4O3BA 3DM0A 4NWDA 4OHNA 2ANJA 4F3SA 1N3WA 1AIVA 3H4ZA 1EU8A 2PT2A 3K6UA 5CBSA 4DXUA 1ZMGA 1FTKA 4PFYA 3VFJA 1OLAA 1SI0A 4EF1A 3KG2A 3OMBA 5DEXB 1MXYA 1XT8A 4GD5A 2V3TA 4U4XA 4U22A 2PYYA 3FXQA 3SEUA 5KDTB 1QJMA 1Z7NE 4G77A 3MQ9A 1PC3A 2NWJA 4KFQA 3OO7A 4BDQA 1USYH 1MQHA 5AA3A 2XD3A 4OENA 2PVUA 4G2ZA 2LAOA 1ELJA 3K1NA 3OO6A 3Q25A 4YAHX 4EQ9A 3N26A 2XX9A 4KHZE 2QS4A 4N13A 1BLFA 2I58A 4IY5A 4ELRA 4MFIA 5DVIA 1B58A 5HPQA 5I2NA 1H44A 1B2HA 1LCFA 2A5TA 5ICQA 3EPEA 3SEVA 5CC2A 4DE8A 5TP9B 4O3AA 4G8NA 3PPOA 1USYE 4OESA 3TYHA 3OELA 3GBBA 1Z7ME 5L9MA 3IJXB 1MG1A 3TAJA 2HZLA 2DWAA 1AMFA 3UGWA 3VDFA 2UYEA 3TTRA 2HEUA 4R73A 2ABHA 3K6VA 4M4GA 2UVJA 2Q8JA 4I62A 3O9PA 1LAGE 1P1NA 2RC7A 3FJ7A 4E0XA 3ECRA 1NNKA 4QHQA 3MP8A 1EH3A 3TDJA 5I2KA 1VR5A 4NEDA 1B1HA 5DYHA 2XXYA 1EZ9A 4Q8RA 4JWOA 4ELOA 4NF6B 2HAUA 3QYTA 1POTA 4IY6A 1DPEA 4JBZA 1M5BA 3PD9A 5H8FB 2OBGA 3H6VA 4BDRA 3LSXA 5CBRA 3PUZE 3RT8A 5BWJA 1XVYA 3H06B 2O1LA 2ZXTA 3CG1A 4R6YA 4DXCA 2F6GA 5I57B 3FVKA 3ZKKA 3RNNA 3N6TA 5AA1A 3PPPA 1GTKA 4H6DA 3SKPA 3GBAA 2IA4A 3UIFA 5LOMA 5FTHA 4ND9A 3ZS6A 3R7XA 4QSDA 1XVXA 2XXPA 3W15C 3H6WA 4F18A 4NF4B 3F11A 4IGTA 4X1BA 5DEXA 2R9JA 3N94A 3V8XB 3LC8A 4THIA 3RTFB 1LFGA 4KYSA 3G3FA 3K01A 1XS5A 4UACA 3FJGA 4RPOA 5KDTA 1NNPA 4GL8A 3RT6B 3KJTA 1S9TA 3D4CA 4PETA 4OERA 3L6GA 4C1TA 1DTZA 4QSEA 1Q1KA 4YMAA 5H8QA 1DTGA 1ZIUA 2QRYA 4OFLA 1BIYA 3UN6A 3R26A 4YMBA 1ZKBA 1UTBA 1P1UA 2CMOA 4R2FA 2RCAA 3EQ1A 4GRKA 3M3FA 4EXKA 1JQFA 1XC1A 3GZGA 3ILUB 5TU0A 3G3KA 4GL0A 3BFUA 5K2XA 4BDLA 3PUYE 1B4HA 3TQLA 4F2QA 1TT1A 4KR5A 1FTOA 4ISUA 4C0RA 3RY3A 2VD3A 3B7DA 1LCTA 3BBRA 1WODA 2I49A 2ONRA 1N7XA 1B51A 1URSA 3O2AA 2Z23A 3VXCA 4YKKA 3C35A 1LAXA 3G3JA 1MQDA 5ITPA 3MC2A 1NNFA 4IO4A 3K1MA 2QJEA 5HM4B 1PB7A 2H9BA 4KYEA 3OEKA 2P0SA 5H8FA 3FASA 2YJPA 1NL5A 3ODBA 2VGQA 4OEUA 1DPPA 3IL1B 4IB2A 1A40A 2Q88A 4GOTA 5AA4A 2O7IA 3CG3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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