3FVNA

Crystal structure of the human glutamate receptor, glur5, ligand-binding core in complex with 9-deoxy-neodysiherbaine a in space group p1
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
b'ANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
publication title Binding and Selectivity of the Marine Toxin Neodysiherbaine A and Its Synthetic Analogues to GluK1 and GluK2 Kainate Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Membrane protein
total genus 82
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fvnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fvnA02
1MH3A 1S9TA 3OO7A 5AA4A 1OLAA 1B7HA 3IOTA 3MVYA 3W15C 5ELVA 3DELB 1M5DA 4KD5A 1P1UA 3KZGA 1IUDA 2VD2A 1A54A 3ILUB 1D4NA 4R74A 4JWYA 3TELA 2A5TA 3DP6A 4Q5TA 4U4SA 3JV9A 3B6QA 2V3UA 4JSOA 3K6VA 4THIA 4C0RA 4R2FA 1US4A 4R6HA 1TFAA 3S2VA 3QAXA 4MLQA 1DPPA 1M5EA 2QS4A 3KOTA 1N0TA 3N5LA 2O84X 4FECA 2O1MA 3TZAA 2DVZA 2UXAA 3PPRA 4XXUA 2O7UA 3U8QA 1LBCA 1N76A 4QSCA 5TP9B 1XS5A 3GLBA 3FV1A 2ALUA 1SD3A 2HAUA 5I2KA 2DVCA 3SEWA 1B2HA 4KR5A 4ELPA 2F36A 2XXYA 4IO2A 4DE8A 4QFNA 1HSLA 4I9DA 2HAVA 4IGRA 1SW4A 3HO7A 5K2XA 1N04A 3LBSA 5I57A 4OTEA 2ABHA 3BFTA 1B7UA 4KYDA 1PEBA 3S9NC 3GBBA 3TAJA 2O6AA 3UA8A 1HSEA 1SW5A 3FZVA 5KCJA 3OD7A 2F6PA 4YB5A 3O28A 1GVCA 4GQOA 2B3BA 3K4UA 2QPQA 2FNCA 3TCFA 4FEBA 2XXPA 3IO4A 4QRZA 4ECFA 4KFQA 4E0WA 3VVDA 1LBBA 3IR1A 5CM6A 3LR1A 4ELRA 4JDFA 5JEIA 2PMSA 3CVGA 3G3HA 1I6AA 4U1ZA 4FAJA 2Q8JA 3KSJA 5AA2D 4GD5A 1B3HA 4G8HA 1JEVA 4I1DA 4YB7A 2H98A 4H5FA 1O7TA 3TPAA 5L9SA 2D21A 1P1OA 1P1WA 3FVKA 1H3DA 4EF1A 1XVYA 1URSA 3CIJA 5JTYA 3LSWA 5DEXB 4H5GA 3H7MA 3U92A 4PFWA 3WAFA 2XXVA 4LQ2A 4ESWA 1OLCA 4FATA 3IX1A 3KEIA 3T9HB 1I6BA 1BLFA 3A3UA 3MZ1A 4N13A 4OEUA 4RXLA 4LONB 4EQ9A 3W9VA 2DE4A 2VOZA 3MP1A 3HV1A 1POY1 2DOJA 1MQDA 3K6UA 2UVGA 3QYTA 4U23A 4GLIA 1LAHE 2PT1A 1PDAA 4M1VA 2I0CA 2Z22A 5H8HA 3TTRA 2VHAA 2H5YA 3KBRA 3C9HA 1PB9A 3ZS6A 3VLWA 3FUZA 3ILTB 3H6TA 4GOTA 4YKPA 3RT8A 2ZMBA 5CMBA 1SI0A 4XTCQ 5EYFA 2ONKE 1B3GA 4YMBA 1B4HA 3MQ9A 2R6GE 1AH5A 4C1TA 3MZBA 2RC9A 3T93B 1A99A 3I6VA 1QVSA 4AQ4A 5I59A 1SVXB 2HZKA 3MC2A 2O51A 4O3AA 2YLNA 3Q27A 5I56B 3UIFA 3VLVA 2RKMA 3TYHA 2Y7RA 2QS2A 3FV2A 3DP4A 1MXVA 3BFUA 4HS7A 1B05A 1JVXA 3U72A 4FIMA 3ONMA 2R9JA 5B7DA 2ONRA 4ZEBA 2RF1A 2O68A 3P7IA 1FTKA 1B5IA 3E9XA 5H8NB 3CG3A 1S50A 1P1QA 3L6HA 4R73A 3MPKA 4U22A 3UGWA 3I3VA 4X9TA 3VE1B 1XHYA 3CFLA 3OELA 1JNFA 3CSBA 3O6GA 3B7DA 3G3JA 3TEPA 5I2NA 1NFTA 1TT1A 4U4XA 4TLLB 2F34A 4EXLA 1B7ZA 2F7BA 4NF6B 1LFGA 3MPLA 1N3WA 4F22A 4ONYA 3TFLA 1USYH 3KG2A 3LSFB 2CMOA 2OCUA 4MH5A 2W7YA 4OHNA 3CFZA 2OBGA 1FQCA 2DS9A 2DWIA 2O1LA 1MDP1 3C4MA 4IY6A 2AYSA 2Y7PA 1SBPA 3G3IA 4NWCA 4F3PA 2QJEA 3Q28A 1MXYA 3SEVA 1MS7A 1SYIA 2R71A 2DYXA 4F1VA 4G2ZA 2DSFA 2XX9A 4IO7A 3JZJA 2ZNTA 2XD3A 3EQ1A 2AIXA 3KJ7A 3KN8A 1ZU0A 3D4CA 2V25A 1MXXA 3HPIA 4F3SA 1A40A 1IXCA 5TP9A 1PB8A 1Y3NA 3K1NA 2XX8A 1N7WA 3FXUA 5FTHA 1LFIA 2XD2A 2VD3A 3ECRA 1QUKA 3VVEA 3OEMA 1Y9UA 3VVFA 1USYE 3S9EA 3SESA 2I3WA 4EQ7A 1AL3A 3O9PA 3SEXA 3CFXA 4ZE9A 3SKPA 5KDTA 4F29A 2YPNA 1LFHA 4RYAA 4FE8A 4BDRA 5IAIA 3RTWB 3RPWA 3K02A 5CRYA 4G68B 3FXRA 2CZLA 1R1NA 1Q1KA 3A09A 1XVXA 1FCKA 3TKDA 3O29A 4E0XA 2F7CA 4XIGQ 4O3CA 1MG1A 3TTMA 3IAZA 5AA2B 2GHAA 3M3FA 1LSTA 1Y1MA 2ZYOA 4OFLA 4XKRA 1LAFE 1GR2A 1Y4CA 3C31A 1P99A 1MY0A 5A5XB 5DTBA 3VXBA 1MY2A 3N6TA 3AXFA 4U1OA 1H44A 3FJGA 4WKMA 1Z7NE 4DIGA 3Q29A 4H8JA 3FJMA 1ZJLA 4ELOA 1VSOA 1JVYA 4QFLA 3DM0A 4IY5A 1JW5A 3TQLA 4X48A 5TPAA 4GIZA 3TTNA 4QHQA 5L8DA 1MQGA 2DWJA 4RK9A 3OXNA 1SQYA 1YTVA 4DCYA 5DEXA 3FJ7A 4ZEKA 3PPOA 3RLFE 3IORA 1FQDA 1JW1A 3HHGA 5H8FA 3RUMA 3S9MC 3IB0A 3ZKKA 1D9YA 2Y7IA 3LSXA 4F2QA 3IOVA 1M5FA 2NXOA 4K3FA 3EHSA 3C32A 1JW4A 1DSNA 3H06B 3CG1A 1B1HA 1FTLA 2V93A 1EU8A 4NF8A 1JETA 3K6WA 2PT2A 2D3IA 3Q26A 4Q30B 1B5JA 3I5OA 4TQUQ 4FJPA 4OMBA 1ZIUA 1URGA 1WDNA 1Y3QA 2DWAA 3GXAA 3MVXA 3O6IA 3TTLA 3EHUA 3IOUA 1B51A 3K1MA 4P0GA 5LOMA 4PFUA 5ISUA 5H8QB 3V89B 1B3EA 3PD9A 1NNFA 2H9BA 4OFJA 5J1DA 1B4ZA 1SDXA 4IO3A 1DTGA 1MM7A 4YMAA 3FVNA 4LP2B 3DLNA 3VXCA 2KLFA 4OENA 4ZEFA 3O2AA 1ZMGA 1M5CA 4GXAA 2XXXA 3KSXA 3HN0A 4GL8A 4BLAA 1ATGA 1FW0A 1OMPA 5BWJA 2HZLA 1MM6A 4F31B 3RGYA 2REGA 4R6KA 4RA1A 1SI1A 3PMWA 1WODA 3H6WA 4RK2A 2F97A 3C34A 1EZPA 4YICA 1LAGE 2HQ0A 4YKKA 1B40A 2X7PA 3R26A 5H8SA 3VV5A 4Q0CA 5B70A 1MPCA 3TUSA 2DQVA 3T22A 2A5SA 3T9VA 3QUFA 4F3BA 1FTMA 4LATA 4NF6A 3Q25A 2NOOA 4R6YA 3G7WA 4QFKA 3SDFA 4POXA 5L9OA 2I58A 3QUJA 4LQ5A 4P11A 2I3VA 2OZZA 1EZOA 2F7AA 4MF3A 5FHNA 3H03A 1GGGA 5BUUA 1LAXA 2DP8A 3T96B 4JSDA 5ICQA 1MQJA 5I2KB 1J1NA 2OWSA 1MXZA 3O66A 1UIVA 4H8IA 4FEDA 4PQJA 5CMKA 2YJPA 3FGSA 3FIRA 4LA9A 1H45A 3G3KA 4NE4A 3SEUA 1II5A 4NF5A 4EXKA 5I57B 4QFOA 2GH9A 1TXFA 3OMBA 1ZBMA 1LLSA 4XKPA 1O63A 2OJTA 1IXGA 1L5TA 1N3XA 2XXWA 5KCJB 1MPDA 2RINA 4PE5B 5TU0A 1HSJA 1D9VA 4MFIA 4F18A 1IXIA 2HEUA 3U94A 2I49A 4OETA 4OVJA 3O6HA 2GHBA 1MQHA 4QFPA 4TOZA 2ESNA 2Y84A 3S9LC 3H6VA 3BKIB 5CBRA 4N6PA 4NMYA 4YZZA 5I84A 1B0LA 3RQTA 4DCXA 2UVHA 3IO6A 3U1OA 2VGQA 5ITOA 3OSQA 2E0SA 2OLBA 3MW0A 4DXBA 1MQIA 4NTLA 1DPEA 4AB5A 4F1UA 5EHSA 2V84A 1AMFA 1NNKA 5FHMA 3IJOB 4NEDA 1DMBA 3FD3A 3QK6A 2DXYA 4QF9A 2OWTA 1MY3A 4R72A 3UK4A 2NVUB 4DDDA 2Q2CA 1BP5A 2XXIA 2XXRA 1A8EA 3KN7A 5AA2A 1PBQA 4PFTA 1US5A 3DP8A 4GF8A 3EPEA 3UP9A 4F1YA 1B58A 4AB6A 4EF2A 1MXWA 2UVIA 1Q35A 5A5XA 2VP1A 3VLUA 4F39A 4WXJA 1SW1A 2ZXTA 3KOSA 4HCWA 1Y20A 2F35A 2G93A 2XHDA 2XXTA 5EHMA 1XOCA 2G29A 1CB6A 1IEJA 3FVOA 1VFDA 1RYXA 4QSEA 5I58B 3MP6A 4ZS9A 1SYHA 4C1UA 4JWOA 3SETA 1AOVA 3QSLA 5DYHA 4XKNA 4OZ9A 3RNNA 3M3KA 4LZ7A 4F2OA 1PC3A 1R9QA 4EQBA 2HXWA 3MAMA 4EUOA 4OXVA 1ZKBA 1URDA 1B32A 5FHOA 4RPNA 5DT6A 5ITPA 4PETA 3ZSFA 1Y3PA 4GVOA 2ZYMA 4DXUA 1MH4A 3O97A 1WVJA 2QMXA 3K6XA 1LB8A 4OERA 4BDQA 1B5HA 3ZKLA 3N6UA 3EN3A 2F5XA 4KQPA 1R9LA 4TLMB 3VFJA 1YAEA 4U21A 4ELQA 4F3GA 5I59B 1R6ZA 4ISUA 1A7LA 1BIYA 4R75A 3PGFA 2Z8EA 5ICTA 2H99A 1I69A 3IL1B 4O3BA 3TTKA 4R2BA 4GWOA 3GBAA 4N07A 4ZE8A 4DXCA 1RKMA 1JEUA 4Q8RA 5M2VA 2RC8A 4YKJA 1MPBA 3TQWA 2HCAA 4H0WA 5H8QA 3N94A 1BKAA 1N84A 1Z7ME 4JXIA 4JBZA 1UTHB 1O64A 1OVTA 3M3LA 1PBPA 2ZYNA 3EHTA 1B52A 3PV0E 4IO6A 3V5AA 4IO5A 5I2NB 1YCJA 4GFRA 1LGBC 1Y1ZA 2WKYA 4YU0A 3B6TA 2ZYKA 3QIMA 4PP0A 3PU5A 2P1SA 1IZ1A 2UYFA 1OIBA 1MRPA 3FVGA 4UACA 5F7VA 1H76A 5IKBA 3CSGA 4OFOA 1YPNA 4PFYA 4DLDA 1XT8A 2QRYA 2RCBA 1NNPA 5CC2A 2B65A 4ZECA 4GRKA 1BTJA 3MJNA 2Q88A 4RPOA 1POTA 1ELJA 2X26A 3V8XB 3JYRA 2QL3A 3MBPA 3R6UA 3E13X 3C35A 5KZTA 3MZ9A 3USDA 4BDLA 1S7YA 1MY1A 4LUBA 3OO8A 2P0SA 3K0VA 5HPQA 4ZZEA 1QUIA 4NF4B 4ZDMA 3V83A 1N7XA 1OQHA 4GL0A 3LC8A 4KI0E 4WEDA 1SW2A 1ZLQA 3PPNA 1TWYA 3THIA 2REJA 1EZ9A 4EDPA 4ZEDA 1QKBA 5AA3A 2F8DA 4UA8A 3OO9A 2FA7A 3F11A 2PYYA 2UVJA 2ZNSA 1MY4A 1FTJA 2NUVA 1LB9A 4RJZA 1B3LA 3W9WA 1FQFA 1T0KA 4KHZE 4BDNA 4HW8A 5KDTB 3OO6A 5HM4B 1OQGA 1UTBB 4YB6A 4X1DA 2XX7A 4RY1A 2H25A 1A55A 5AA1A 4H67A 3TMGA 1QKAA 4I8CA 1NH7A 2QS1A 3HSTA 4BDMA 1OVBA 1IIWA 3K2DA 2Y7WA 1B9JA 2DE3A 2B3FA 4WEPA 3LUYA 4HCYA 4MLVA 1VFEA 2H4IA 1CE2A 3IJXB 5CMMA 4G8NA 5I56A 5AA4B 2QMWA 2PBWA 3BBRA 1ZTYA 2THIA 1B0HA 1B46A 2XXUA 1EH3A 5DVFA 2XXQA 1XC1A 3PPQA 2E1SA 2QSXA 4RNSA 4IGTA 5H8NA 2XXHA 2A5TB 3VDFA 1DTZA 2Z23A 3T9UA 2UYEA 2DE2A 4POWA 3K01A 2O69A 1B3FA 5DVIA 2Q2AA 5CI5A 3TCHA 2DWHA 4IO4A 5TPAB 3MUQA 3R7XA 3UN6A 3FATA 1QJMA 2I0BA 2D5WA 1JQFA 1P1NA 3RY3A 3KGCA 1FQEA 4KYSA 1H43A 4IB2A 3OEKA 4H1XA 1FQAA 3HHFA 4R9GA 2I6EA 3OOAA 5H8FB 2ANJA 3IB1A 4LZ5A 5HBCA 1QUJA 2F78A 2I4BA 4GXSB 3GZGA 4OESA 4ND9A 5F1QA 4F19A 3KJTA 4NF8B 5CBSA 1FQBA 2Y7KA 3CR9A 5I58A 3ODBA 1QULA 4BDOA 3C36A 3TCGA 3E3KA 2X7QA 3SEYA 1DOTA 4Z0IA 4G4PA 4KCCA 3KN3A 2P2AA 1IITA 1RYOA 3S4UA 2IA4A 3G3FA 3PUVE 1FTOA 4MBPA 3HCQA 3TDJA 3MWBA 4JB7A 2V3QA 2OK2A 4YAHX 3IK6B 1I6QA 3N26A 3K00A 3MP8A 2ONSA 1KWHA 4R9FA 3D4GA 2NWJA 5AE4A 5CMCA 1NMUA 2F6GA 4OYVA 4KPTA 2Q89A 2RCAA 3G3GA 3CI8A 2Q9TA 2GRVA 3WAEA 3T9XB 2AL5A 4G68A 4ESXA 3PUWE 1VE4A 3H3GA 1UTHA 4G77A 4Z7EA 4P0IA 1B6HA 4KYEA 1QW0A 5JTYB 3RN8A 3PUZE 3KFMA 3B6WA 4M4GA 1F9BA 4ZEIA 4OWDA 3PPPA 4H65A 2LAOA 3PUYE 3K1PA 3T66A 1D3KA 2I4CA 4NWDA 4G68C 5L9MA 2QS3A 1UQWA 4XKQA 1GTKA 5H8HB 3PD8A 1TFDA 1GV8A 3MVZA 3SERA 4U2RA 2BJJX 4KCDA 2PVUA 3PMVA 4NF5B 3LSLA 3RTFB 2PX1A 4JWXA 4ZZAA 5FTIA 4NF4A 5DVJA 3FASA 2GFEA 1PB7A 2AL4A 1LCFA 1AIVA 1A8FA 4QSDA 4LZ8A 3RT6B 4I62A 4G8MA 1NNTA 4OEVA 4OQOA 3C33A 1IQ7A 4HTGA 3UORA 4DZ1A 4LVQA 1IXHA 4YKIA 2IEEA 3H4ZA 2HFBA 4L17A 1MXUA 2Z8DA 2Z8FA 1Y4TA 2I48A 3CRBA 5JK4A 1M5BA 3A3CA 2DXRA 4H6DA 3IB2A 1UIUA 3M8UA 1NKXA 3H6UA 1B1XA 2V3TA 3E4RA 3PMXA 4X1BA 3L6GA 2ZNUA 3EF7A 1NH8A 5K2YA 1LCTA 1UTBA 2RC7A 1MDQA 3QXMA 3OENA 1VR5A 3OSRA 2M8CA 3TODA 1ANFA 3IOWA 2FYIA 4FORA 3U93A 3PUXE 1NL5A 3FXQA 2O7IA 3MVWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4PFRA 1MH3A 1S9TA 3OO7A 5AA4A 4PAKA 1OLAA 1B7HA 1FPBA 3IOTA 3MVYA 3W15C 5ELVA 3DELB 1M5DA 4KD5A 1P1UA 3KZGA 1IUDA 2VD2A 1A54A 3ILUB 1D4NA 3E78A 4R74A 5ET7A 1FBEA 4JWYA 3SZPA 3TELA 2A5TA 2XWKA 3DP6A 4Q5TA 4U4SA 3JV9A 2F3BA 3B6QA 2V3UA 4JSOA 3K6VA 4THIA 4C0RA 4R2FA 1US4A 4R6HA 4N6KA 4N81A 1TFAA 3S2VA 3QAXA 4MLQA 1FPDA 1DPPA 1M5EA 2QS4A 3KOTA 1N0TA 3N5LA 1FBDA 5LTCA 2O84X 4FECA 1FJ6A 2O1MA 3TZAA 2DVZA 2ZZXA 4N8GA 2UXAA 1FBFA 3PPRA 2HHMA 4XXUA 2O7UA 3U8QA 1LBCA 1N76A 4QSCA 5TP9B 1XS5A 3GLBA 3FV1A 2ALUA 1SD3A 4MCOA 2HAUA 5I2KA 2DVCA 4PF6A 3SEWA 1B2HA 4KR5A 4ELPA 2F36A 4PFBA 2XXYA 4IO2A 4DE8A 4QFNA 1HSLA 4I9DA 2HAVA 4IGRA 1SW4A 3HO7A 5K2XA 2QFLA 4O8MA 1N04A 3LBSA 5I57A 4OTEA 2ABHA 3BFTA 4PAFA 1B7UA 1IMFA 4KYDA 3A29A 1PEBA 4GX6A 3S9NC 3GBBA 3TAJA 1YYZA 2O6AA 3UA8A 1HSEA 1SW5A 3FZVA 5KCJA 3OD7A 2F6PA 1AWBA 2Y5KA 4OVPA 4YB5A 3O28A 1GVCA 4GQOA 2B3BA 3K4UA 3HFUA 4GX4A 2QPQA 2FNCA 3TCFA 4FEBA 2XXPA 3IO4A 4QRZA 4ECFA 4KFQA 4E0WA 3VVDA 1LBBA 3IR1A 5CM6A 3LR1A 4ELRA 4JDFA 5JEIA 2PMSA 3CVGA 3G3HA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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