3FVNA

Crystal structure of the human glutamate receptor, glur5, ligand-binding core in complex with 9-deoxy-neodysiherbaine a in space group p1
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
ANRTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFIYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQTALVRNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
publication title Binding and Selectivity of the Marine Toxin Neodysiherbaine A and Its Synthetic Analogues to GluK1 and GluK2 Kainate Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Membrane protein
total genus 82
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fvnA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3fvnA02
3HHFA 1S7YA 1A8FA 4XKQA 3RTFB 4GF8A 5H8NA 1IEJA 1EZPA 2AL4A 1DPEA 2D5WA 3H03A 3T66A 1P1QA 4KFQA 2CMOA 3HV1A 3C33A 4Q8RA 5I2NB 1MY3A 2THIA 4U1ZA 1D3KA 2DSFA 3C36A 1SDXA 4OENA 1A99A 1US4A 3K1NA 4POXA 3MZ1A 3UGWA 4PP0A 3KZGA 3V5AA 4F1UA 5CM6A 1O63A 2A5TB 3N94A 2Y84A 1FTMA 2XXIA 5AA4A 5ICTA 4AB5A 3FZVA 4JXIA 4JSDA 3OOAA 3M8UA 4G8NA 2XD2A 5CC2A 2O7IA 2V3UA 1DSNA 4GOTA 4JWXA 2HAUA 1AMFA 4G8MA 4EDPA 2H25A 3SEVA 2R71A 3R26A 2H4IA 1UQWA 1PEBA 3SEXA 2QPQA 4L17A 3CFLA 4F2OA 1LCFA 3QAXA 1B51A 1XHYA 3CFXA 4IO5A 4WEDA 1Y20A 2XXTA 2HCAA 2OK2A 3OO8A 1DTGA 3S9LC 2FYIA 4QHQA 4R2BA 4ZS9A 1A40A 3A3UA 2XXPA 5I58B 1OQGA 4GVOA 1URSA 4NWDA 1BIYA 4RXLA 3DP8A 1QVSA 3KG2A 2Q89A 4QFKA 5TPAA 1DTZA 1N7WA 2Z8DA 3RUMA 3IORA 3TODA 3PD9A 2REJA 4U2RA 2I0CA 4LONB 4IO4A 4NF6A 2QL3A 1M5CA 4GL0A 5EYFA 2Z23A 5I84A 4POWA 2NUVA 4NEDA 5H8HB 4FIMA 2OWTA 2I4CA 4MF3A 5I56A 4KYDA 4ESWA 3MJNA 3C4MA 4Q30B 4C1TA 3Q29A 3KGCA 4XKRA 1Z7ME 3FJ7A 3LC8A 2DXRA 4H5FA 5DEXB 3BFTA 1NNPA 3LSWA 2F35A 2CZLA 2O1MA 4WXJA 3ECRA 4OESA 5FTHA 4LQ5A 4KCCA 3VE1B 4PQJA 3T96B 4HCWA 4GLIA 4JWYA 4OWDA 4YB5A 5DT6A 4HCYA 1IQ7A 4I1DA 1CB6A 1NFTA 5B70A 3KBRA 2DXYA 1PB7A 4TLLB 3U72A 4R6HA 3T93B 3KN8A 3DELB 3KFMA 2A5SA 1IZ1A 4O3CA 3SERA 2QMWA 1FQAA 3CSGA 4WKMA 4ZE8A 1QUJA 3RT6B 1JVXA 3KEIA 3B7DA 3MVWA 3PV0E 1B4ZA 4OEVA 1OVBA 3EN3A 1TT1A 2ZYMA 3N6UA 4H8IA 3VXCA 2FNCA 4GRKA 3TAJA 1SW4A 1VR5A 3PGFA 1JW1A 4GQOA 1QJMA 1H44A 4BDNA 4YMBA 2F78A 1YAEA 5I59A 4NE4A 1QKAA 4K3FA 3T22A 2V3TA 3U1OA 4ELQA 5DTBA 3WAEA 2NOOA 4QSCA 4DXCA 4LA9A 4R74A 2QMXA 3OO6A 2UYFA 4QF9A 3V8XB 5KCJA 1TWYA 1B9JA 3RN8A 1B7HA 4OQOA 4LZ5A 4KPTA 1USYH 3SEUA 2B65A 4OFLA 2QS3A 4YKKA 1NNTA 1ZJLA 3FJGA 3FV1A 2DOJA 1XVYA 3TTKA 3DP4A 3KOTA 4LZ8A 4LVQA 3FUZA 1B5HA 4G68B 4JWOA 2QS1A 4XTCQ 1LFGA 3IL1B 3OD7A 4PFWA 4GXAA 4NF4A 1JETA 3QUJA 2YJPA 2DYXA 2ABHA 3MUQA 4M1VA 1ATGA 3FASA 1JEUA 3R6UA 3VLUA 3CRBA 3D4GA 3SDFA 4YICA 2HZLA 1A54A 3I3VA 4C0RA 3TQLA 5L9SA 2F34A 5CMCA 3C34A 3TCGA 4AB6A 1RYOA 1SD3A 5H8SA 4OXVA 4Q0CA 3BKIB 3OELA 3G3FA 3IOWA 3TEPA 4DCYA 3GBAA 1ZBMA 2F36A 3MC2A 1UTHB 4H0WA 2OBGA 1S9TA 1I6AA 1LB9A 3V83A 3OSQA 1USYE 3UA8A 3FXQA 2XXWA 4NF5B 5IKBA 1XT8A 4HS7A 3MP8A 5ICQA 3VVEA 1XOCA 2H98A 2V84A 2ZXTA 2DQVA 4OYVA 4XKNA 1AOVA 4I8CA 2V3QA 5AA1A 3PPOA 1FQBA 3H4ZA 2AL5A 4OFJA 1LSTA 1Y3NA 4O3BA 4R6KA 5AA2B 1MS7A 1LAHE 1ZTYA 4KR5A 3RQTA 2DE2A 4YKPA 5I57B 4UA8A 3RGYA 4OHNA 1AL3A 4ELPA 2XX9A 4ZEIA 3RPWA 1FQFA 1IUDA 3ODBA 2UVIA 3TPAA 2LAOA 3CVGA 5HPQA 3ONMA 3THIA 1M5FA 4BDMA 1B0HA 5TU0A 3TMGA 2F7BA 1MDQA 2F6PA 2GHBA 2AIXA 3MP1A 3IK6B 1Y1MA 2ONKE 2OCUA 4G2ZA 4RYAA 4FE8A 1LFHA 3OEMA 4FORA 1R1NA 3QIMA 2QS4A 4H67A 3OXNA 5DVFA 4ZEDA 2IA4A 2DWJA 3UP9A 4ZE9A 5B7DA 4F19A 1Y3QA 3WAFA 4ELRA 3KOSA 3QUFA 1L5TA 3HCQA 1LBCA 2Z22A 2B3BA 4F18A 2XXRA 5CBRA 2QSXA 4OVJA 2XD3A 4G8HA 4IGTA 4BLAA 1LB8A 2VP1A 2RC7A 1LAGE 4U23A 3G3IA 3Q28A 4GD5A 3O2AA 5ITOA 2XXXA 1N3WA 3MZ9A 2O6AA 3E4RA 3KN7A 3K02A 1P99A 4GL8A 3ZSFA 2I4BA 4I62A 4DE8A 1SW5A 4F22A 4ONYA 1GV8A 2G93A 4MBPA 3A3CA 2F7CA 2O84X 2I6EA 4RA1A 1SI1A 5I2NA 2XXVA 4QRZA 3QK6A 3T9VA 2HQ0A 2PT2A 3K4UA 3VVFA 3TUSA 2E1SA 1IIWA 2ZYNA 5TP9B 4R9GA 4ZEBA 4N07A 1MXXA 1FQDA 2Q9TA 2A5TA 3FVOA 1A8EA 3H6TA 3EQ1A 3GXAA 1MRPA 1XC1A 3M3KA 4EQBA 1B5JA 1POY1 4OETA 5JK4A 4JB7A 3VDFA 5J1DA 1Q1KA 2Q2CA 1N76A 3K00A 1OMPA 2HAVA 5FTIA 1N3XA 4YKJA 1GR2A 2F6GA 1ZIUA 2GFEA 4FAJA 4ISUA 4GXSB 4MLVA 5DVJA 2PBWA 4PETA 3TFLA 3MPKA 1QUKA 4GWOA 5ISUA 3Q25A 1ZLQA 1AIVA 5FHMA 4MH5A 1VSOA 2O69A 1EZ9A 4EQ7A 3IJXB 2ZNUA 3FV2A 5I58A 2RC9A 2X7PA 1PB9A 3C35A 1MPBA 2F5XA 1MXWA 3U93A 3H6UA 1SVXB 3K6UA 3H6VA 3E13X 1RKMA 1MQGA 3TTRA 1J1NA 3FIRA 1JW4A 4ESXA 4Q5TA 3VV5A 4OERA 4IO6A 4JBZA 1SBPA 4FEDA 3UK4A 3E9XA 1FQCA 4QSDA 5H8HA 3QYTA 3IB0A 4OTEA 4ELOA 4F29A 3O29A 1LAFE 4EXLA 3B6TA 2PMSA 4C1UA 1DPPA 3PMVA 2ZNSA 3RLFE 1P1OA 5ELVA 3I5OA 5DEXA 3G7WA 3U8QA 1B5IA 3JZJA 5JTYB 3FGSA 1DOTA 3MP6A 3MVZA 5A5XB 2Y7RA 5I2KB 3C9HA 3DP6A 2H9BA 5EHMA 5F1QA 3IB2A 3SESA 1OLAA 1Z7NE 1MXUA 1UTBB 1I6BA 1P1WA 2P2AA 3PD8A 5F7VA 2PT1A 1MQIA 2P1SA 3G3KA 3EF7A 2UVJA 4IO3A 4EXKA 4KYEA 1B58A 1PBQA 1MPDA 4H6DA 3H7MA 4YB7A 4BDRA 1WODA 1Y9UA 4OMBA 5H8QB 3TELA 4DIGA 2OWSA 5AA3A 2QS2A 4F39A 2FA7A 2X7QA 1IXGA 3N6TA 1EU8A 4E0WA 3Q26A 1MXZA 3MZBA 4ZDMA 3W15C 4RPOA 2QRYA 3E3KA 4N6PA 1B0LA 1B52A 4THIA 2VOZA 3PPQA 3TCFA 1A7LA 1MM7A 3G3HA 4OZ9A 5KDTB 3M3FA 3V89B 3ZS6A 3K1PA 4GIZA 1JW5A 3TCHA 1CE2A 3ZKLA 1LGBC 3VFJA 2F97A 4OEUA 3BBRA 4IO7A 1DMBA 3MVXA 2XXQA 2PX1A 4FJPA 4ZEKA 2DP8A 1D9YA 1US5A 1B1XA 2ALUA 3T9UA 1SYIA 3S9EA 1NNKA 2OZZA 3LR1A 5DVIA 1Y3PA 3USDA 2ESNA 4RY1A 2DE4A 1FTJA 4DCXA 4F3SA 2R9JA 3MWBA 1LLSA 4KI0E 2RCBA 4P11A 2B3FA 3HO7A 3PMXA 4G68A 1BKAA 4P0IA 4DLDA 5L9OA 4IY5A 4F1VA 5DYHA 1QULA 2Z8FA 5HM4B 3K6WA 2GHAA 3GBBA 3PUWE 1VFEA 1EZOA 1NNFA 3QSLA 2HXWA 1AH5A 2QJEA 4KD5A 2NXOA 1NL5A 4NF8B 2UYEA 4MFIA 3HPIA 2I58A 1PDAA 3PPPA 3KSXA 1LFIA 4F3GA 3ILUB 1POTA 4YMAA 5FHNA 1MQDA 3FVKA 5AE4A 3EHSA 3CIJA 3K2DA 1SW1A 3CSBA 3OEKA 5ITPA 3K1MA 4N13A 1URGA 3U92A 2X26A 4WEPA 1UTHA 1JEVA 2G29A 1ZKBA 3N5LA 3S9NC 3TTLA 2XXYA 1MQJA 1B32A 1NH8A 4NF5A 5H8FB 3DM0A 4DXBA 3RT8A 4TQUQ 3T9XB 3FVGA 1B7ZA 4LUBA 3O28A 2I3WA 4KCDA 1F9BA 2YLNA 1MH3A 1MM6A 1I69A 4IGRA 4R2FA 2DVCA 3LSXA 2O1LA 4LATA 5AA2A 2I3VA 3RTWB 3PUXE 1MXVA 3PMWA 4H1XA 4LP2B 5I57A 1VFDA 4R72A 1MY4A 2VGQA 2V25A 2DVZA 3VXBA 5H8NB 2ONRA 5L9MA 1GVCA 2NVUB 2VHAA 3L6HA 4RJZA 3IOVA 4U21A 3VLVA 4F1YA 1P1UA 5IAIA 2RC8A 4IY6A 3K0VA 1TFDA 1KWHA 3IO4A 3LBSA 4BDLA 1VE4A 3IOTA 4YB6A 3HSTA 1LBBA 4G77A 2R6GE 1Y4TA 4Z7EA 3IO6A 1B3EA 3K01A 2UVHA 1WVJA 5AA4B 2RKMA 3HN0A 4YZZA 4X1BA 1QUIA 1UIUA 1D9VA 3IX1A 3I6VA 5JEIA 3VLWA 2NWJA 1B7UA 4I9DA 1IXIA 4ZECA 2PVUA 3W9WA 2F8DA 4EQ9A 1B1HA 3EHTA 4JDFA 3KJ7A 1MDP1 4JSOA 4ECFA 2P0SA 4RK2A 1OQHA 1FCKA 1FTLA 2XXHA 4R9FA 2W7YA 4U1OA 1IITA 2HEUA 5CMKA 1B46A 1URDA 2O51A 2Z8EA 4QFPA 3D4CA 1MXYA 4H65A 3CG1A 3TQWA 3G3GA 1JNFA 4BDQA 1NKXA 4KYSA 4KHZE 4E0XA 3H3GA 3EHUA 4DXUA 2VD2A 4R6YA 3QXMA 4F3PA 5TPAB 2Q2AA 3DLNA 3C32A 1OLCA 2DWIA 3OENA 1H3DA 4NMYA 1JQFA 4U4SA 2V93A 3L6GA 4TOZA 1IXCA 2D3IA 1M5EA 5CMBA 4YKIA 4NF6B 5CRYA 5TP9A 3CI8A 3S4UA 3W9VA 2XX7A 2OJTA 5BWJA 2H5YA 1N84A 1B3LA 3OMBA 3R7XA 1B2HA 3PPNA 5I56B 3TDJA 4ZZEA 4O3AA 1O64A 1SI0A 4H8JA 4PE5B 5FHOA 1R6ZA 4ZZAA 3UIFA 3RNNA 3KN3A 5HBCA 1A55A 4NWCA 2Q8JA 3K6VA 1NH7A 3K6XA 1Q35A 1R9QA 2Y7IA 1N7XA 1YPNA 4RK9A 1TFAA 3MW0A 3Q27A 3JYRA 1XVXA 4RNSA 4AQ4A 5KZTA 3OO7A 1UIVA 3TKDA 3SEYA 4FATA 2REGA 3EPEA 4F2QA 3T9HB 1FW0A 1M5BA 2GH9A 1N04A 2OLBA 4TLMB 3KJTA 1H76A 3TTMA 1BLFA 2KLFA 4R75A 3VVDA 1H45A 4QFLA 3UN6A 4FECA 4F3BA 1FTKA 1HSLA 4PFUA 1FQEA 3IR1A 3O66A 1PC3A 2D21A 2O68A 3LUYA 3MPLA 4IB2A 4LQ2A 1MPCA 1BP5A 3O6HA 1OIBA 2H99A 5I59B 3RY3A 1N0TA 1Y4CA 1B05A 2Y7KA 3FJMA 4P0GA 3GZGA 2PYYA 4YU0A 4M4GA 4U4XA 2IEEA 5EHSA 5CBSA 4NTLA 1GTKA 1FTOA 4IO2A 2DWHA 1YCJA 2DWAA 1QKBA 5JTYA 5KCJB 2E0SA 2I48A 3ZKKA 5CMMA 3FXUA 3A09A 2M8CA 2ZYOA 4LZ7A 3JV9A 5A5XA 2ZNTA 3TYHA 5I2KA 1MY1A 3P7IA 2BJJX 4DZ1A 1PBPA 1UTBA 2HFBA 4X1DA 3HHGA 3TTNA 2Y7PA 1P1NA 1B40A 2HZKA 2DS9A 3FVNA 4XXUA 2YPNA 5AA2D 3B6QA 2XXUA 1HSEA 4HW8A 1IXHA 1M5DA 3U94A 4KQPA 3LSFB 3MBPA 3SEWA 2F7AA 4HTGA 3O9PA 5BUUA 3O6GA 5H8QA 3CG3A 4NF4B 1GGGA 3CR9A 4U22A 3MQ9A 5L8DA 4X48A 2GRVA 3O6IA 3S2VA 3PU5A 4QFOA 4EUOA 3O97A 4BDOA 1SYHA 1BTJA 3IOUA 1Y1ZA 3MVYA 4DDDA 3PUZE 4PFTA 4H5GA 3GLBA 2XHDA 3KSJA 3N26A 4RPNA 1JVYA 4QFNA 5KDTA 3PPRA 1B4HA 2AYSA 4FEBA 1TXFA 4YAHX 3AXFA 3BFUA 2RF1A 2ANJA 1O7TA 3H6WA 4MLQA 4ZEFA 3C31A 2XX8A 4PFYA 1LAXA 2DE3A 4XKPA 4R73A 3M3LA 3FATA 5M2VA 1QW0A 2Q88A 4GFRA 4Z0IA 3MAMA 2I0BA 1PB8A 4X9TA 2ONSA 4XIGQ 3S9MC 1T0KA 3SKPA 1D4NA 1NMUA 1XS5A 3OSRA 3F11A 1ELJA 3FD3A 1ZU0A 1YTVA 3IJOB 4G4PA 1EH3A 2ZYKA 2VD3A 3ILTB 1ANFA 1SW2A 4QSEA 1II5A 4ND9A 1WDNA 5LOMA 3OO9A 1MG1A 1MQHA 4G68C 5K2YA 2ZMBA 5K2XA 3IAZA 4OFOA 2UXAA 4NF8A 1RYXA 3IB1A 2O7UA 4EF1A 3SETA 1B3HA 1R9LA 1B3FA 1H43A 2Y7WA 3LSLA 1MY2A 1ZMGA 1I6QA 1B3GA 1SQYA 3UORA 3FXRA 3PUYE 3CFZA 2I49A 1OVTA 4F31B 5H8FA 3H06B 2UVGA 1S50A 2WKYA 2RCAA 3B6WA 3G3JA 1B6HA 1HSJA 1MY0A 3TZAA 4UACA 2RINA 3PUVE 1MH4A 5CI5A 4EF2A 1LCTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GWXA 3HHFA 1S7YA 1A8FA 4XKQA 3RTFB 4GF8A 5H8NA 3ROJA 1IEJA 1EZPA 4PF6A 2AL4A 1DPEA 2D5WA 1FJ6A 4MCOA 3H03A 3T66A 3IFAA 1P1QA 4KFQA 2CMOA 5LDZA 3HV1A 4NHBA 3C33A 4Q8RA 5I2NB 1MY3A 2THIA 4U1ZA 1D3KA 1IMDA 1FBCA 2DSFA 3C36A 1SDXA 4OENA 3SZPA 1A99A 1US4A 3K1NA 4POXA 3MZ1A 1RDYA 3UGWA 1EYJA 4PP0A 2MKZA 4PFBA 3KZGA 3V5AA 4F1UA 4O7IA 2FVZA 5CM6A 1O63A 2A5TB 3N94A 2Y84A 1FTMA 2XXIA 4NAPA 5AA4A 5ICTA 1EYIA 4AB5A 3FZVA 4JXIA 3KBZA 4GWSA 1FBGA 4JSDA 3OOAA 3M8UA 4G8NA 2XD2A 5CC2A 2O7IA 2V3UA 1YXIA 1DSNA 4GOTA 4JWXA 1NV3A 4OVTA 2HAUA 1AMFA 4G8MA 4NQ8A 4PC9A 4EDPA 2H25A 1JP4A 3SEVA 2R71A 3R26A 2H4IA 1DK4A 1UQWA 1PEBA 3SEXA 2CZKA 2QPQA 4L17A 3CFLA 4F2OA 5LTCA 1LCFA 3QAXA 1B51A 1XHYA 3CFXA 4IO5A 4WEDA 1Y20A 2XXTA 2HCAA 2OK2A 3OO8A 1DTGA 3S9LC 2FYIA 4QHQA 4NF0A 4R2BA 4ZS9A 1A40A 3A3UA 2XXPA 5I58B 1XI6A 1OQGA 4GVOA 1URSA 4NWDA 2QVUA 1BIYA 2B4MA 4RXLA 1DBZA 3DP8A 1QVSA 3KG2A 2Q89A 4QFKA 5TPAA 1DTZA 1N7WA 2P3VA 2Z8DA 3RUMA 2WYPA 3FBPA 3IORA 3TODA 3PD9A 2REJA 4U2RA 2I0CA 4LONB 4MJOA 1NV5A 4IO4A 4NF6A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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