5KCJB

Structure of the human glun1/glun2a lbd in complex with gne6901
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
283
structure length
280
Chain Sequence
TRLKIVTIHQEPFVYVKPTLSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A
publication title Positive Allosteric Modulators of GluN2A-Containing NMDARs with Distinct Modes of Action and Impacts on Circuit Function.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transport protein
total genus 82
structure length 280
sequence length 283
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-06-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kcjB01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5kcjB02
3E9XA 2XX8A 4EXKA 2DYXA 2ZYOA 3R7XA 3I6VA 1QW0A 3R26A 4KYDA 1XOCA 3AXFA 5FTIA 2PMSA 5KDTA 2UVGA 4LUBA 2NUVA 4YB6A 4FJPA 2YPNA 3V83A 3E4RA 1JNFA 1MPBA 1F9BA 1A54A 5FHNA 4BDOA 1YCJA 5IKBA 3SEVA 3UP9A 1SW5A 1QULA 4IO2A 2O6AA 3FD3A 4GWOA 3BBRA 1TT1A 1B7UA 2R6GE 1MQGA 4OQOA 4H0WA 4DXBA 1ZBMA 1UIVA 1Q1KA 3K6UA 3TTRA 2DXYA 1FQCA 2HCAA 1B0LA 4KYEA 4H1XA 2P2AA 1M5BA 3W9VA 3N94A 4IO6A 3RY3A 5CMBA 1FTJA 4BDNA 4ZEDA 1B9JA 1FQAA 2QS2A 4EUOA 1EZOA 2O84X 3T93B 3T9UA 1O63A 2NOOA 3WAEA 2WKYA 2ZNTA 1Y4TA 4RNSA 3K0VA 1OLAA 3PPNA 2HQ0A 5L9MA 5ICQA 4ZDMA 3FJGA 2I4BA 5EHMA 1ANFA 2I49A 4PFUA 4OETA 1XHYA 4OWDA 3IAZA 3K6XA 1A40A 2XXTA 2F7CA 1EZ9A 4F1UA 2P0SA 4DXCA 1DOTA 3C36A 3I3VA 3PMVA 1LGBC 3Q26A 2OJTA 3A3UA 4GFRA 3KOTA 4TLMB 1PBPA 3K1NA 1I69A 3MBPA 4NWDA 2I0BA 3RTWB 4IY6A 3S2VA 3MPLA 3TKDA 2O1LA 4U1ZA 4H67A 1POY1 1US4A 4MF3A 3OO9A 2NVUB 1SYHA 1NKXA 2XD3A 4XKNA 3ODBA 4LQ5A 3TQWA 4N13A 2ANJA 1IEJA 3FVOA 4F18A 1XVYA 2I3VA 4U2RA 2Y7PA 3MPKA 2RCAA 4H5FA 3OSQA 3UIFA 1RYXA 1R9LA 1OVTA 4GXAA 4KPTA 3VE1B 3RT8A 3S4UA 4RY1A 1RYOA 4EF2A 4QF9A 3OO6A 3K4UA 1AH5A 1XS5A 2XXVA 4IO4A 3T66A 2H4IA 3IR1A 4LQ2A 2F35A 5DVIA 1B6HA 3K6WA 1NH8A 1YAEA 2Q9TA 2I58A 4DXUA 3TAJA 3LR1A 3RGYA 4GRKA 4FIMA 4ZEBA 1L5TA 2V84A 4R6HA 3RUMA 3KJ7A 4YZZA 4N6PA 1PBQA 4F22A 1CB6A 3EHUA 3B6QA 4G2ZA 2GRVA 5HBCA 4PETA 2A5TA 3MVWA 2Y7RA 3N6TA 1JQFA 2QSXA 1DPPA 2DWIA 4BLAA 1PEBA 1JW5A 3TUSA 2AYSA 4ELPA 3IK6B 4FECA 3JYRA 1XC1A 5TPAB 1ZMGA 4NF6B 3A09A 4R6KA 5LOMA 1RKMA 3FVKA 2THIA 5FHMA 3SKPA 3MC2A 3FXRA 5TPAA 4EF1A 1N0TA 5CMKA 1FW0A 3QUJA 3IOVA 4YB7A 2UXAA 4QSDA 3B6WA 4NF4A 4R9FA 2QS1A 5H8FB 1M5EA 3K2DA 1UTBB 1ZLQA 1B5IA 3VLVA 4JWYA 4QFKA 4RJZA 4GL8A 5KZTA 1Y3QA 4NF5A 5H8NB 2QL3A 4ND9A 4F31B 1UTBA 2ZNSA 4EQ7A 2CZLA 1QUJA 1D3KA 3G7WA 4F29A 4DDDA 3T9XB 1TXFA 2A5SA 5EHSA 2OBGA 2RC7A 4GOTA 5H8NA 1P1UA 5I57B 1IXHA 3U1OA 2E1SA 1J1NA 3PUZE 3FUZA 3SEUA 1N76A 1IZ1A 3IOTA 2Q2AA 2ZXTA 5I57A 2I4CA 5AA4B 1S50A 1LB8A 1JVYA 2M8CA 3S9EA 3S9MC 5ITOA 1SD3A 4G8HA 3PPPA 4KCCA 2XXXA 2XXPA 2Z8DA 5AA4A 2H25A 2DVZA 3K01A 2I3WA 3PV0E 4FEBA 3TQLA 3MVXA 4R75A 1SBPA 4GXSB 4X9TA 3O28A 4E0XA 2F6GA 3GBAA 3FATA 3IOUA 3OXNA 1B5JA 3H6UA 3W9WA 4LATA 1VE4A 3KSXA 4N07A 2OWTA 5DTBA 3C34A 3CG1A 1FQBA 3DP6A 2XX7A 3BFUA 5JEIA 2QPQA 5AA2B 1FTLA 3VLUA 2LAOA 3C4MA 1XVXA 3G3HA 1BIYA 2ZYNA 3N5LA 1LB9A 4RXLA 3MP8A 3E13X 3EHSA 3VFJA 1WVJA 3Q28A 3A3CA 1O7TA 2Q89A 3JZJA 4C0RA 4RPNA 1ZIUA 2HZLA 1B1XA 2CMOA 3UK4A 3G3IA 2DWJA 2I6EA 4OESA 1B5HA 1URSA 3OD7A 1MXZA 1HSLA 2F97A 3THIA 4JWOA 1ZKBA 1LFGA 4R9GA 3IO4A 1D4NA 4I62A 4YKKA 4POXA 4GF8A 4KR5A 3CFXA 3JV9A 1MXXA 3O6GA 3C31A 1BP5A 4ZEKA 4LVQA 3MJNA 3LC8A 4Z0IA 4QRZA 5B70A 4M4GA 4NMYA 1POTA 1MXYA 4F2QA 4XKRA 1H76A 4FE8A 2VGQA 5TU0A 3TTNA 1Y9UA 2PBWA 2ABHA 1MG1A 3OEMA 2REJA 4GVOA 4IB2A 3MW0A 2Y7WA 3EN3A 1GGGA 3FZVA 4JSDA 3S9NC 1OMPA 1LBBA 1P1QA 1MY2A 4U1OA 3KG2A 3TELA 5H8QB 3PMWA 3F11A 4NF8B 2VHAA 2FYIA 3HO7A 3T22A 3IJOB 1A55A 3EHTA 4UA8A 1VFDA 2ZMBA 4XTCQ 5AA1A 5H8QA 3M8UA 4WEPA 3QSLA 3QIMA 3LBSA 3G3GA 3I5OA 3OSRA 1D9VA 4K3FA 2F78A 2NXOA 4R73A 3QUFA 1B3FA 1XT8A 3ECRA 1MQHA 3CVGA 3LSLA 1QUKA 4Q30B 3B7DA 3Q27A 4DCYA 2QMXA 4WKMA 1P99A 4YKPA 4TOZA 4HCWA 1IXIA 3VVDA 3MP1A 2W7YA 1Y4CA 2YJPA 5DVJA 1MS7A 4ELQA 1MXUA 4H8IA 5DYHA 1FTMA 3KSJA 3RN8A 1IUDA 4GD5A 3TCGA 3FJ7A 2X7PA 1PB9A 1IXCA 3TTLA 1N3XA 1BTJA 1OIBA 4IGRA 1EU8A 3HV1A 1JVXA 4M1VA 4DCXA 4JSOA 4MBPA 2DE2A 3O2AA 4EQBA 4MLQA 4I1DA 1MY3A 4OYVA 2V93A 1LCTA 4ESWA 1BKAA 4Q0CA 5K2YA 1B58A 4XXUA 4G8MA 5HPQA 2R71A 3ZS6A 4U21A 4QFLA 5CBRA 2REGA 3M3FA 1MDP1 3LSXA 3MZBA 4LZ8A 5CBSA 3FXUA 2XD2A 4TLLB 1IIWA 1TFDA 2GHAA 3TEPA 3IORA 2UVJA 1B3GA 1OVBA 1GV8A 1PDAA 4OERA 1UTHB 4ZZAA 3VLWA 2QJEA 4MLVA 4DE8A 3T9VA 2HXWA 3UORA 3H3GA 5B7DA 3V5AA 4F1YA 1S7YA 3WAFA 2NWJA 3GXAA 3MUQA 3N6UA 3ILUB 2UYEA 2Y7KA 2IA4A 1B3LA 2F8DA 1B4HA 1SW4A 2RF1A 3H4ZA 4YICA 1MY1A 2XXYA 3H06B 1N04A 3KBRA 1I6AA 4P11A 4HS7A 3SEYA 3VV5A 4GL0A 3VXBA 3D4GA 4ECFA 2Q8JA 4NEDA 1FQDA 1EZPA 2XXIA 1FQEA 4EDPA 3MZ9A 5TP9B 3CIJA 5A5XB 3IJXB 3PPOA 2F5XA 1MY0A 3G3FA 4MH5A 1N84A 4H6DA 3KOSA 1MXWA 2AL5A 4U23A 4PFTA 2XXRA 1TWYA 5CMMA 2XXHA 4AQ4A 2F34A 2Z23A 3IB0A 4OXVA 4TQUQ 5A5XA 2GH9A 2DOJA 3MWBA 3QXMA 2FA7A 4OEUA 4C1UA 4OFOA 4NWCA 3ILTB 3TTMA 1QVSA 1PB7A 2V3TA 1B3HA 1H43A 3U93A 1KWHA 2B65A 2OZZA 1Y1ZA 4NF6A 4IO3A 4OTEA 2QS3A 2OCUA 4PFWA 3FASA 4O3AA 4OZ9A 1GTKA 4GQOA 2HFBA 3V8XB 1I6BA 1A8EA 1GR2A 1B40A 1NNPA 1Y20A 1NNTA 1EH3A 5L9OA 3K1MA 2DE4A 5H8FA 3KEIA 5L9SA 3H6TA 3FXQA 3OO8A 4P0IA 5I56B 4BDMA 4LP2B 2ZNUA 3OO7A 3BKIB 4F3BA 4C1TA 2O7IA 3TDJA 2VOZA 4BDLA 2HZKA 3KN8A 2DSFA 2F7AA 3C9HA 3ZSFA 4QHQA 4KYSA 3HCQA 1MH4A 4R72A 3VDFA 4U22A 1SW1A 3BFTA 1AOVA 4G77A 4KD5A 3TTKA 3C33A 4Q8RA 2UYFA 1B7ZA 2G93A 3USDA 1MXVA 4O3BA 1USYH 2ALUA 1MY4A 3MAMA 4F19A 2B3FA 3PD8A 3MVZA 3W15C 4OVJA 4JB7A 4DLDA 4X48A 2F6PA 4F1VA 1B52A 1MQJA 1USYE 4JBZA 2D3IA 4QFOA 4ISUA 2OLBA 5HM4B 1MPCA 3PD9A 3MZ1A 5DEXB 3V89B 4ZE9A 4PQJA 5CRYA 4L17A 2IEEA 2X7QA 3U72A 3CSBA 3ONMA 3DELB 3FJMA 1MQDA 5CI5A 3T96B 1CE2A 1B51A 5DEXA 5AA2A 2R9JA 4OFJA 2VD2A 5J1DA 2DXRA 2O1MA 4QFNA 2DQVA 2DP8A 1PC3A 4G68C 1II5A 1Q35A 4Q5TA 5I2NB 3IB2A 4RPOA 1R6ZA 3OEKA 1FTOA 1LCFA 3G3KA 3E3KA 3DM0A 4OFLA 5H8HB 4OHNA 1Y1MA 4KHZE 3M3KA 2OK2A 4QFPA 3S9LC 4KQPA 1WDNA 3HHGA 5M2VA 4KCDA 5H8HA 4BDRA 3GBBA 1IQ7A 1OQGA 5ICTA 3DP8A 5I2KB 1M5FA 2ONSA 3U8QA 4H5GA 1LAXA 4ZEIA 4R2BA 5EYFA 4P0GA 1URDA 4ELOA 3RLFE 3IB1A 3K1PA 3P7IA 3SEWA 3OENA 4BDQA 1VFEA 2V25A 5KDTB 1UIUA 3FV2A 3ZKLA 3H6VA 1GVCA 4JWXA 1QJMA 1ZU0A 3B6TA 3U94A 4YAHX 3MVYA 1QKBA 2PT2A 2VD3A 4PFYA 3HPIA 1P1WA 4ZE8A 4KFQA 3Q29A 2B3BA 3CI8A 2I0CA 2XXUA 3HSTA 2QRYA 3OELA 4NF8A 2F36A 2XXQA 3U92A 3ZKKA 3QYTA 1H45A 1DSNA 4XIGQ 2GFEA 2Y84A 5BUUA 2UVHA 2D5WA 4R6YA 1ATGA 3FIRA 1FQFA 4JDFA 5JTYB 4NTLA 3C32A 1VR5A 2Z22A 1TFAA 3KJTA 3FV1A 5CMCA 1B1HA 3FVGA 1MM7A 4R2FA 5K2XA 5JTYA 1QUIA 2RCBA 3DP4A 4I8CA 1N3WA 2O51A 3PPRA 4X1BA 1R1NA 2ZYKA 3KGCA 4LZ7A 3TFLA 4ELRA 3SESA 3VVEA 3TPAA 1B7HA 3CRBA 2H5YA 1SVXB 1YPNA 1SQYA 1AMFA 1A8FA 4NE4A 5F7VA 2ONRA 3CSGA 4YKIA 3TODA 3T9HB 3MP6A 3QAXA 1A7LA 4F2OA 1LFIA 3IO6A 3IOWA 4YMAA 3RQTA 2V3QA 3GLBA 2H9BA 1DMBA 4AB6A 1B05A 1MRPA 4O3CA 4WEDA 4I9DA 1DTZA 4ZEFA 4ONYA 4ZZEA 1QKAA 3Q25A 1H44A 5I84A 1JW1A 1LLSA 3LSWA 2O7UA 5DT6A 4Z7EA 1SDXA 2ONKE 4IY5A 4IGTA 4POWA 5ITPA 2YLNA 3UA8A 3OMBA 1B0HA 1SI1A 3H7MA 1B32A 4OEVA 1LAGE 4XKPA 2FNCA 3O97A 4PE5B 4E0WA 3PGFA 4FORA 1R9QA 5CC2A 1UTHA 4EXLA 5CM6A 5L8DA 2AL4A 2AIXA 2XHDA 3FGSA 3L6GA 1AIVA 3K00A 2QMWA 4HTGA 4AB5A 1FTKA 5AA3A 4G8NA 1ELJA 1SW2A 5H8SA 2PYYA 3HN0A 4HCYA 2DS9A 1JW4A 4KI0E 3MQ9A 2DVCA 4DZ1A 4X1DA 1BLFA 4YU0A 4R74A 2Z8FA 4GLIA 1I6QA 5FTHA 2ZYMA 4MFIA 2F7BA 1YTVA 1IXGA 2H99A 1WODA 3PUVE 3CR9A 5KCJB 3CFZA 4OENA 2DE3A 1P1OA 2A5TB 3H03A 4YMBA 5TP9A 1B2HA 3CFLA 3PUWE 3D4CA 5KCJA 1M5CA 2PVUA 1DPEA 2RC9A 2HAVA 4XKQA 3SERA 2O69A 3HHFA 2QS4A 2RC8A 3O66A 3KN7A 3RNNA 1SYIA 3GZGA 3PU5A 1N7WA 1NMUA 4RK9A 4F39A 4F3GA 1Y3PA 4JXIA 5ISUA 3PMXA 3TMGA 1MH3A 2HAUA 1FCKA 3VXCA 1A99A 3PUYE 4PP0A 2DWHA 1LBCA 4NF4B 2Z8EA 3O6HA 1B3EA 2DWAA 4F3PA 1JETA 2XXWA 5AE4A 5FHOA 2E0SA 4NF5B 3EPEA 2HEUA 4LONB 3PPQA 1B4ZA 3TZAA 1HSJA 5AA2D 2RKMA 3R6UA 4LA9A 1H3DA 2BJJX 4EQ9A 3CG3A 3SEXA 1UQWA 3SETA 3QK6A 3RT6B 2X26A 4U4SA 4OMBA 3KZGA 5I56A 3OOAA 3FVNA 1NNFA 1US5A 2I48A 3K6VA 1N7XA 4YB5A 2OWSA 2PT1A 4ZECA 2KLFA 3EQ1A 5I58B 4F3SA 3EF7A 4UACA 1DTGA 2D21A 4WXJA 4IO7A 4RA1A 1NNKA 4FATA 2PX1A 4QSCA 3UGWA 1LFHA 1JEVA 1O64A 1M5DA 1SI0A 3H6WA 3O29A 5I58A 3SDFA 1Y3NA 4FEDA 4YKJA 2GHBA 3RTFB 3KFMA 1NL5A 5F1QA 3PUXE 1ZJLA 1LSTA 4HW8A 4G68B 1P1NA 3VVFA 5I59B 1JEUA 1MDQA 2ESNA 4RK2A 1NH7A 3IL1B 1MM6A 2G29A 5JK4A 3M3LA 2XX9A 5BWJA 3G3JA 4G68A 4QSEA 2RINA 4LZ5A 3N26A 5I59A 4ZS9A 3TCFA 5IAIA 2UVIA 3K02A 1B46A 3L6HA 1AL3A 1NFTA 5ELVA 1IITA 4G4PA 2P1SA 2Y7IA 1PB8A 4H65A 4DIGA 4U4XA 2O68A 1OQHA 2V3UA 3LUYA 4H8JA 5DVFA 4THIA 1T0KA 1LAHE 2Q2CA 2Q88A 5I2NA 3RPWA 1URGA 3C35A 3O9PA 4RYAA 1MPDA 1VSOA 4FAJA 3DLNA 3TCHA 4ESXA 3UN6A 3O6IA 1S9TA 4IO5A 1Z7ME 2VP1A 3KN3A 3LSFB 1Z7NE 4GIZA 1D9YA 1LAFE 5I2KA 2H98A 3TYHA 1OLCA 3IX1A 1ZTYA 1HSEA 1MQIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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