4KHZE

Crystal structure of the maltose-binding protein/maltose transporter complex in an pre-translocation conformation bound to maltoheptaose
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for substrate specificity in the Escherichia coli maltose transport system.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
molecule tags Transport protein
source organism Escherichia coli
total genus 119
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4khzE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4khzE01
3FUZA 5KZTA 4Q8RA 3FV1A 1LCTA 3CR9A 4QFKA 1FW0A 4E0XA 3HO7A 2XXHA 5CMKA 1D9VA 4U21A 3IR1A 5CMCA 4F3BA 2F97A 1SQYA 1LGBC 4XXUA 1EU8A 3TTLA 1DSNA 4UACA 5TU0A 1DTZA 1LFGA 2AL4A 4TQUQ 2B65A 4YZZA 5J1DA 1Q35A 1OMPA 2HCAA 4MF3A 2PVUA 3FV2A 2R71A 3H6VA 2GHBA 2ALUA 2UYFA 4P11A 2VOZA 3MW0A 4YB5A 1UIUA 1MDP1 2Z23A 4H5FA 2NWJA 3ZS6A 1M5BA 4KFQA 1RKMA 3S9MC 3OMBA 4NMYA 4GD5A 3CRBA 3CG3A 1B05A 1JVYA 2Y7PA 2UVIA 3FJGA 1A7LA 4BDQA 4DDDA 3K1NA 2DVZA 4RPOA 3IL1B 2W7YA 2OJTA 3FXUA 2QS2A 3CFLA 4G68B 1ZKBA 3S9NC 3Q27A 4F2OA 3HN0A 4OEUA 4G2ZA 2HEUA 3U8QA 3SETA 4WEPA 4OYVA 4YKPA 1UTBB 1B9JA 4EUOA 2IA4A 1Y3NA 3BBRA 5I56B 3T9VA 4R6YA 4ZEBA 3R7XA 1B5IA 2D3IA 1H76A 3QIMA 1OLAA 3MVYA 2PMSA 1A8FA 1P1UA 2O1LA 3N26A 2ABHA 4MFIA 2RC7A 2I3VA 5FTHA 4TOZA 4RXLA 2VP1A 3RQTA 4IO3A 4LVQA 3SEYA 5L8DA 1WVJA 2ZYMA 1DTGA 3THIA 2DQVA 2XXVA 3O9PA 2Y7RA 4KQPA 2DXRA 4L17A 1MXZA 4RJZA 1YAEA 4U1ZA 4F31B 2Y7IA 1POTA 4F22A 4U4XA 3QSLA 5JEIA 1B1XA 1ZJLA 4OQOA 3LC8A 4R6KA 4KHZE 4NF8A 5FHOA 1FQAA 4DLDA 2P2AA 4IO6A 1M5FA 3O6GA 2DS9A 1B5HA 1JNFA 1USYE 4XKRA 5LOMA 4R6HA 3MUQA 1LB8A 2AL5A 3MPLA 3K02A 4ZZAA 2H99A 3V5AA 2G29A 2PX1A 2RKMA 1VFDA 3SDFA 4AB5A 2PT2A 4GXAA 3KFMA 1SD3A 1B0LA 2XX7A 4EF2A 4TLMB 4OETA 3MJNA 2F34A 4GFRA 3OSRA 3RTWB 2XHDA 1MXYA 3O6IA 3QUJA 5TPAB 1Y4TA 5DVFA 3PMVA 1KWHA 3W15C 3MVWA 4DE8A 3LBSA 3B6WA 4ELRA 4KYEA 3EN3A 3SEWA 1A55A 3B6TA 1MXWA 1QKAA 4G8MA 1N76A 1HSLA 4I62A 4GXSB 4YKIA 1QKBA 1UTHA 5CMBA 3P7IA 5L9OA 4C1UA 2XXYA 3U94A 3PV0E 4BDLA 2DVCA 4OVJA 4OWDA 3G3IA 1OVBA 4RNSA 3SEUA 4Z7EA 5I59A 3TPAA 3D4CA 3T9HB 2V25A 4EF1A 1P99A 3OO7A 4ZEDA 3O6HA 4ELOA 4ISUA 2V3TA 3L6HA 2Q9TA 3UK4A 2DYXA 4JDFA 1MQDA 5CBSA 5IAIA 4ESXA 2V3UA 2PYYA 4QFLA 2XXXA 5HM4B 3PPPA 2QL3A 1TWYA 3K6UA 2OCUA 3CIJA 5H8FA 3BFTA 3ILUB 3VLVA 1PDAA 2XD2A 1JETA 5ITPA 4WKMA 3MAMA 3O29A 3EHSA 3HHFA 3USDA 5FHNA 5CRYA 1P1OA 4EQ9A 3BKIB 4H6DA 1NNPA 3RTFB 3RUMA 3JZJA 1MPBA 1GVCA 1ZMGA 4NF6A 2PBWA 5H8NB 3BFUA 3QYTA 1UQWA 2O7UA 2Z8FA 2HAUA 3E3KA 1N84A 5I2KB 1FCKA 3V8XB 2UXAA 4YAHX 1B7UA 1Q1KA 1MY4A 3R6UA 3UN6A 1N04A 2CZLA 3HSTA 3G7WA 3K01A 1B4ZA 1A8EA 2F7CA 2O51A 1T0KA 2DWIA 3E9XA 1NNTA 2IEEA 2KLFA 2F8DA 1IITA 2XXIA 2CMOA 1XHYA 4QFPA 3FJ7A 4FEBA 4RA1A 3KJ7A 4ZDMA 5K2YA 1B7HA 3RLFE 1B32A 1MH3A 4GVOA 3KEIA 5KDTB 1NKXA 4R75A 4EXLA 4LZ7A 1Z7ME 1PB8A 4FORA 4R2BA 4QF9A 4LQ5A 1PBPA 2ONSA 3I5OA 4FJPA 4FIMA 2AIXA 3TCFA 4ONYA 3MZ9A 3C31A 4R73A 1US4A 3R26A 3VLWA 5CBRA 2VHAA 4THIA 3O97A 1D4NA 2HZKA 2QRYA 1BLFA 1NH7A 1D9YA 3VE1B 1BIYA 4BDOA 4OENA 3IJOB 3TCHA 1ZBMA 3O66A 4HCWA 1EH3A 3MWBA 1Y9UA 2XXUA 1GR2A 1F9BA 1UTBA 3FVGA 3T96B 3ZKLA 5I56A 4RK2A 1XC1A 2OBGA 1Y1MA 4R74A 1B3EA 1ELJA 3KG2A 3ILTB 3RNNA 5EYFA 2R9JA 4OZ9A 1B46A 3N6TA 1HSEA 2I58A 2UYEA 2NVUB 4F1YA 2ONKE 4YU0A 1LAFE 3H3GA 1R6ZA 3IOTA 2I48A 3PPNA 4F29A 4LATA 4O3BA 4BDNA 2UVHA 3IAZA 2O84X 5CC2A 3CSGA 3GXAA 1LSTA 4U23A 4OXVA 4NWCA 2QS3A 3N5LA 4RK9A 3W9WA 2F7AA 1MQIA 2V93A 4MH5A 3S4UA 1HSJA 3H03A 3C34A 4IO2A 4GQOA 4NE4A 4XIGQ 4RYAA 3OXNA 3IB2A 1NNKA 4XTCQ 1MY1A 3DP4A 2YPNA 3LUYA 4LQ2A 1ZLQA 4FEDA 1NH8A 4QSEA 4C0RA 2F35A 2DWAA 1PBQA 1URSA 4ZEFA 2I0CA 4H65A 4X1BA 4G68C 3EHUA 2ZNTA 4EXKA 2FYIA 3CI8A 3RGYA 4DCYA 2QMWA 1M5DA 2E0SA 3QK6A 1IXCA 3K1MA 3TTNA 1B4HA 4X1DA 2XXTA 1MDQA 3IOVA 5A5XB 3T66A 1IIWA 1LB9A 2I0BA 4LZ5A 3KSXA 4RPNA 3QAXA 5AA2B 4LZ8A 5H8HB 3Q26A 4I1DA 4G8HA 2R6GE 4XKNA 1MY2A 4POXA 2ZYNA 4ECFA 1MM6A 4F39A 4GOTA 1XS5A 4FECA 5AA2D 4U4SA 3FZVA 3CG1A 1MQHA 1SVXB 1ZIUA 4JSOA 4NTLA 5M2VA 3ZSFA 3PD8A 2A5TB 1CE2A 2XX8A 3T9XB 2F6GA 3K00A 3EQ1A 1H43A 3MP6A 5I2NB 1LBBA 1MQGA 1BP5A 2ZYOA 5F1QA 3OSQA 4ESWA 5BWJA 3TUSA 5CM6A 3PMXA 3F11A 4UA8A 1R9LA 3KZGA 1MXUA 4N13A 4P0GA 2QS1A 3TZAA 4WXJA 2RF1A 3VVDA 5JK4A 3N6UA 4LONB 2I6EA 4DXCA 3LR1A 5FTIA 2DWJA 3RPWA 3S9LC 3PUYE 5B70A 2O68A 1B5JA 4N6PA 2XXPA 1SI1A 4FE8A 2X7QA 5AE4A 4F2QA 3FVNA 2P0SA 3IX1A 4E0WA 5JTYA 1M5CA 4YKJA 1QUIA 4F1UA 2Y7WA 4H67A 1N7XA 3G3KA 5H8NA 4HCYA 1GV8A 1USYH 1S7YA 5H8QB 2DXYA 3OELA 5I2KA 1FQEA 1PB9A 5DEXB 1NL5A 2B3BA 4YB7A 3MP8A 3Q29A 3EF7A 5FHMA 4BDMA 4M4GA 1Z7NE 3MC2A 3DLNA 4GLIA 1DPEA 3W9VA 3C36A 3DM0A 3ZKKA 1MXXA 1VE4A 2Q88A 3RT6B 1N3WA 3OO8A 3LSLA 3L6GA 5DTBA 2F5XA 3M3LA 4PE5B 3Q25A 5DVIA 2PT1A 1MPCA 2GHAA 4PP0A 3TODA 1P1NA 2Q2AA 4LUBA 4GRKA 4KPTA 2H4IA 3TAJA 2VGQA 2XXRA 3DP8A 5KDTA 3SERA 3K4UA 3TCGA 4ZEKA 4H5GA 4PQJA 4YICA 2Q2CA 1SDXA 4IY6A 3E4RA 3FD3A 3VVFA 5AA4B 4NF4B 4IB2A 1SBPA 4KI0E 2WKYA 1FTKA 3C4MA 4PFYA 1B51A 1FTLA 4PFTA 3GBAA 1Y3QA 4F3GA 3O2AA 1XVYA 1O64A 4BDRA 3OEMA 2VD3A 3AXFA 4MBPA 2Q89A 2ZXTA 4N07A 1BTJA 1LAGE 3KN8A 4GIZA 2F7BA 3WAFA 4XKQA 1JQFA 1B7ZA 3T22A 1II5A 2UVGA 2RC9A 3RN8A 3OEKA 4FAJA 5H8SA 1B1HA 3PUWE 3OO9A 1SW4A 1LLSA 3MZBA 4OHNA 4POWA 2RCBA 3UA8A 4PETA 3IK6B 1B40A 3K6XA 3I6VA 4AB6A 5ICTA 1VFEA 1LBCA 2F36A 1IXGA 2HZLA 4GF8A 4I9DA 1H45A 1AL3A 4OTEA 2QSXA 1MXVA 2XXQA 3PUXE 4C1TA 2V3QA 3CVGA 3KOTA 3K6WA 4JBZA 1FTOA 1QVSA 4NWDA 4IO5A 5AA3A 1A40A 3SESA 3MVXA 5I57B 1B6HA 2XD3A 4HS7A 5EHSA 3A09A 1OQHA 4Q5TA 3HV1A 4ELQA 5HBCA 2DP8A 4HTGA 3KBRA 4QRZA 1JEUA 3VXBA 5K2XA 2RC8A 1I6AA 2QPQA 4GL8A 2I3WA 3GBBA 3IO6A 5L9MA 3U1OA 4G68A 5KCJB 1I6BA 1PC3A 1MY0A 2YJPA 3IOWA 1POY1 4ZS9A 1MS7A 3FXQA 1YPNA 1EZOA 2Y84A 1ZTYA 5A5XA 2FA7A 3GLBA 2Q8JA 1PEBA 3PD9A 5AA2A 5H8HA 1GTKA 3IORA 4TLLB 3S9EA 1CB6A 4DXUA 1IXHA 1B3HA 3CFZA 1N7WA 5I58B 3UORA 4NF5B 5TP9B 4JXIA 1FQDA 1Y4CA 4EQBA 4OESA 3IJXB 1IUDA 2HFBA 4H8IA 1DMBA 3K2DA 5ELVA 5HPQA 1BKAA 2GH9A 1PB7A 2A5TA 1TXFA 5I2NA 1SW2A 3HCQA 4KYDA 2THIA 1ANFA 3C9HA 4QFOA 3A3CA 3G3FA 4JWYA 1ATGA 3UP9A 3O28A 4K3FA 4AQ4A 2RCAA 2Z8DA 1M5EA 1IEJA 1SYIA 3JV9A 3M3KA 1Y20A 4H8JA 3TELA 3FXRA 3FIRA 1JW1A 1JW4A 2F78A 2AYSA 4WEDA 3TTKA 2ANJA 2OWTA 4GWOA 2G93A 3LSWA 1NFTA 4QFNA 4IY5A 1AIVA 1B58A 2NXOA 4PFWA 3OO6A 1O63A 1MY3A 2DOJA 1MRPA 3IOUA 3PMWA 2XXWA 1FQFA 2ONRA 4ZZEA 3RY3A 3KSJA 5L9SA 2D5WA 3OD7A 2YLNA 5H8QA 1MG1A 3N94A 1O7TA 2X7PA 1VSOA 1MH4A 1N3XA 5DEXA 3FATA 2B3FA 2HQ0A 5TPAA 4Q0CA 4R72A 3VLUA 1QULA 3DP6A 1A99A 5CI5A 4QSCA 3TEPA 4JWOA 1US5A 1IZ1A 3IB1A 3PPRA 3H6UA 4ZE9A 3TTMA 2NOOA 3TDJA 4X48A 3CFXA 5B7DA 1FQCA 4YMAA 4NEDA 3S2VA 1URGA 4Z0IA 2XX9A 3KOSA 2OZZA 4KCDA 2REGA 3U93A 1XVXA 3U72A 1SW1A 2O69A 2ZNUA 4ZE8A 1QJMA 3U92A 4P0IA 4KCCA 3ECRA 3VFJA 1J1NA 4G4PA 3KN7A 3MVZA 3FGSA 1NNFA 5AA4A 4NF4A 1OVTA 4EQ7A 3B6QA 5CMMA 2GRVA 4DZ1A 3GZGA 5BUUA 1WODA 3OOAA 2X26A 4KR5A 1H44A 4OMBA 1Y3PA 4R9GA 4LP2B 1B3FA 3T93B 3B7DA 1MM7A 3SKPA 1JW5A 4H1XA 1OQGA 4F1VA 1AH5A 1D3KA 3QXMA 4F3PA 5ICQA 2HXWA 2H9BA 1JEVA 1XOCA 1FQBA 3D4GA 4F19A 4G8NA 5DT6A 4IO4A 3LSXA 2BJJX 4KYSA 1GGGA 2DE3A 3VXCA 3C33A 2DSFA 3G3GA 1XT8A 3QUFA 2ZMBA 3UIFA 1Y1ZA 1B0HA 3H6TA 5EHMA 2NUVA 3I3VA 4XKPA 2H25A 3T9UA 4O3AA 2OLBA 2QJEA 3MZ1A 2Z22A 3RT8A 4DCXA 3TFLA 1EZPA 1DPPA 1A54A 3SEVA 1B52A 1YTVA 1RYOA 2QS4A 1MPDA 5AA1A 4M1VA 4F18A 2GFEA 3FJMA 4Q30B 3V89B 4EDPA 1S50A 4MLVA 1S9TA 5I57A 3M3FA 3TKDA 4U22A 3PGFA 3HHGA 4U2RA 4F3SA 4OFJA 3UGWA 1LFIA 2REJA 1FTMA 1AMFA 1H3DA 2A5SA 4DIGA 3DELB 3EPEA 3OENA 4I8CA 3ONMA 3EHTA 4NF8B 3MPKA 3KN3A 3VV5A 1N0TA 1LAXA 2H5YA 1TFAA 5KCJA 4JWXA 3PPQA 3KJTA 5ITOA 3Q28A 2QMXA 3H7MA 2I49A 4FATA 3FVOA 3IO4A 3C32A 1SI0A 1IXIA 3K0VA 1ZU0A 1WDNA 3H6WA 5DYHA 2O6AA 2I4BA 1TT1A 5JTYB 4R2FA 3TQLA 4YMBA 1LFHA 4KD5A 4ZECA 2ESNA 2H98A 5I58A 1LCFA 2O1MA 4OEVA 3H4ZA 4NF5A 5TP9A 4H0WA 4QSDA 5I84A 3TYHA 4OERA 4U1OA 1IQ7A 1MQJA 3SEXA 2DWHA 4OFLA 2VD2A 4YKKA 5F7VA 2LAOA 3G3JA 3PUZE 4GL0A 1P1QA 3TMGA 3VVEA 4PFUA 1UIVA 2V84A 1QUKA 1I69A 1EZ9A 2FNCA 4LA9A 4ND9A 3K6VA 1VR5A 1QW0A 1B3LA 3FVKA 1UTHB 1TFDA 4DXBA 4IGRA 3C35A 3LSFB 1YCJA 3MP1A 2O7IA 3G3HA 3JYRA 2D21A 1RYXA 3H06B 5I59B 1LAHE 3K1PA 2UVJA 2OK2A 1L5TA 1B2HA 1URDA 1SYHA 5DVJA 4O3CA 3TQWA 3PPOA 1JVXA 4BLAA 3E13X 1FTJA 4IO7A 1SW5A 2F6PA 2RINA 2ZYKA 3A3UA 3M8UA 3PUVE 5ISUA 1R1NA 2DE2A 1QUJA 1AOVA 4X9TA 3FASA 1I6QA 2I4CA 2Y7KA 2DE4A 3ODBA 3MBPA 4MLQA 4YB6A 3HPIA 3PU5A 2E1SA 4G77A 3V83A 4QHQA 2P1SA 5H8FB 4ZEIA 1DOTA 1NMUA 3KGCA 3WAEA 4JSDA 2M8CA 4OFOA 4R9FA 1R9QA 4RY1A 3TTRA 5IKBA 1B3GA 2Z8EA 4IGTA 4ELPA 1OLCA 2OWSA 1OIBA 1P1WA 4NF6B 3CSBA 4HW8A 3VDFA 4JB7A 2HAVA 2ZNSA 3IB0A 3MQ9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3FUZA 5KZTA 4Q8RA 3FV1A 4PBQA 1LCTA 3CR9A 4PAIA 4QFKA 1FW0A 4E0XA 3HO7A 2XXHA 5CMKA 1D9VA 4U21A 3IR1A 5CMCA 4F3BA 2F97A 3MYUA 1SQYA 1LGBC 4XXUA 2Q74A 1EU8A 3TTLA 1DSNA 4UACA 1G0IA 5TU0A 4NX1A 1DTZA 1LFGA 2AL4A 4TQUQ 2B65A 4YZZA 2CZHA 5J1DA 4NHBA 1Q35A 1OMPA 2HCAA 4MF3A 2PVUA 3FV2A 2R71A 3H6VA 2GHBA 2ALUA 2UYFA 4P11A 2VOZA 4N15A 4AS4A 3MW0A 4YB5A 3ROJA 1UIUA 1MDP1 2WBDA 2Z23A 4H5FA 2NWJA 3ZS6A 1M5BA 4KFQA 1RKMA 3S9MC 3OMBA 4NMYA 4GD5A 3CRBA 1FBDA 1DBZA 3CG3A 1B05A 1JVYA 1CNQA 2Y7PA 2UVIA 3FJGA 2MKZA 1A7LA 4BDQA 4DDDA 4UABA 4PF6A 3K1NA 2DVZA 4RPOA 3IL1B 2W7YA 1INPA 2OJTA 3FXUA 2QS2A 3CFLA 5EYGA 4G68B 1ZKBA 3S9NC 1YYZA 4HXVA 3Q27A 4F2OA 3HN0A 4OEUA 4G2ZA 2HEUA 3U8QA 3SETA 4WEPA 4OYVA 4YKPA 1UTBB 1B9JA 4EUOA 2IA4A 1Y3NA 3BBRA 5I56B 3T9VA 4R6YA 1EYKA 4ZEBA 3R7XA 1B5IA 2D3IA 1H76A 3QIMA 4H46A 4MJOA 1OLAA 3MVYA 2PMSA 1A8FA 1P1UA 2O1LA 3N26A 2ABHA 4MFIA 2RC7A 4O7MA 2I3VA 5FTHA 4TOZA 4RXLA 2CEXA 2VP1A 3RQTA 4PAKA 4IO3A 4LVQA 3SEYA 5L8DA 1WVJA 2ZYMA 1DTGA 3THIA 2DQVA 2XXVA 3O9PA 2Y7RA 4KQPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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