4KHZE

Crystal structure of the maltose-binding protein/maltose transporter complex in an pre-translocation conformation bound to maltoheptaose
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for substrate specificity in the Escherichia coli maltose transport system.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
molecule tags Transport protein
source organism Escherichia coli
total genus 119
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4khzE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4khzE01
3CI8A 1IXCA 4IO3A 1GR2A 3WAEA 4GIZA 1O7TA 2HAUA 1Z7NE 3S9MC 4DXUA 1MQHA 3C33A 3E4RA 4NWCA 1GVCA 3G7WA 1DSNA 3ECRA 2RC8A 2HAVA 3SESA 3C4MA 5I59A 1I69A 4IGTA 5CMCA 3I6VA 2F78A 4XKNA 2PMSA 4F2OA 1KWHA 2QS4A 3PD9A 4OHNA 4L17A 4Q8RA 1P1NA 3VXBA 3K6VA 1XT8A 5KDTA 3U72A 4QSDA 3FIRA 5EHMA 1I6BA 1Y1MA 3S9LC 3VLWA 4YAHX 4THIA 4K3FA 1PB7A 2HCAA 1QUKA 2V3TA 3U93A 3RTWB 4F1YA 4YB7A 3D4GA 4Q30B 3GBAA 1NFTA 1OLCA 4UA8A 3S2VA 3MJNA 4LONB 1MXXA 2Y7WA 1LBCA 2DE3A 4HS7A 2DP8A 3KGCA 1DPPA 3TELA 2Z22A 3TPAA 4ZEFA 4OENA 4ONYA 4PETA 2PYYA 3SEWA 1FTKA 4NMYA 2GFEA 3P7IA 3VFJA 4LVQA 3EPEA 4XTCQ 4NF4A 3T9VA 2RC9A 2XX7A 2E1SA 1R1NA 3O28A 3EQ1A 3CFLA 5B70A 5ELVA 3DP6A 4XIGQ 2H9BA 5DVFA 2THIA 3T66A 5I57A 2ONSA 1MXYA 3N26A 3T9XB 3HV1A 1USYH 1P99A 5AA4A 1L5TA 2VHAA 1BKAA 4KR5A 4GRKA 3KN8A 2I3VA 3IB2A 2IEEA 3B6WA 2LAOA 3B6TA 1B5IA 2UXAA 4NF5A 2AYSA 2QPQA 2R71A 4PP0A 1SDXA 3W9WA 3O2AA 4QRZA 1B58A 3E3KA 4QSEA 3SERA 1FQFA 2DXRA 3K6XA 2ZNUA 4F1UA 5IKBA 1A8EA 1A8FA 2NUVA 2DXYA 1M5FA 3TTLA 4Z0IA 2CZLA 3CG1A 1MY3A 3RLFE 1QJMA 4XKQA 2YLNA 2I48A 5A5XB 1D9VA 4HCWA 4P0GA 4N13A 3IJXB 1RKMA 1N7WA 5DVJA 5B7DA 3RNNA 5LOMA 3CRBA 1ZKBA 1YTVA 2QMXA 1DOTA 1OMPA 1PDAA 2I0BA 5I58A 4NF6A 3IOVA 2XHDA 2D21A 5KZTA 2OBGA 4ZZAA 1FTJA 1ZU0A 4F18A 4DCXA 4JXIA 4OETA 3TTNA 2HEUA 3FV2A 3B7DA 3D4CA 2ZXTA 1VSOA 3HO7A 5I56A 2QRYA 5TP9B 4H8IA 5JEIA 1TWYA 1SW1A 3TQLA 4ECFA 1LB8A 2XXQA 2OLBA 4FJPA 3EF7A 5CC2A 2F34A 1D4NA 2VD3A 3MVXA 1R9LA 3MUQA 3UP9A 3N6UA 2O68A 3OOAA 3DP4A 1SQYA 1UQWA 3UA8A 1XVXA 3RT8A 1B3LA 2B65A 1IIWA 4MLVA 2V3QA 3K01A 4XKRA 1N04A 1SYHA 3K4UA 2X26A 1MH3A 4G4PA 4BDNA 2R9JA 3M3KA 1XOCA 3GZGA 4C1TA 2NVUB 1IXHA 1S9TA 4NF8B 2X7QA 3U94A 4FE8A 4O3BA 4Z7EA 2XXUA 2ZNTA 3FJ7A 1N3WA 3CR9A 2O84X 3IOWA 1YCJA 4DZ1A 1VR5A 3LUYA 2GRVA 3FD3A 5ITPA 1MXUA 4KHZE 1MPCA 3FV1A 1WVJA 3W15C 1XS5A 1QUJA 5DTBA 3K1MA 3N94A 3EHTA 2WKYA 3MVZA 3W9VA 4RK9A 4JWXA 1XVYA 1QVSA 1CB6A 1D9YA 1ZMGA 3TAJA 4F3BA 3EHSA 5AA2A 5FHNA 2E0SA 3MPKA 1UTBB 4IY5A 3VLUA 1LFHA 1B1XA 2OCUA 2DE2A 1PBPA 4PFWA 1MY2A 4G8NA 3O9PA 1MPDA 1GTKA 4PFYA 3U1OA 1LCFA 4XXUA 2GHAA 3G3GA 4ZE8A 2DSFA 4MBPA 5AA3A 2UYFA 2GHBA 1A55A 5L9OA 3HPIA 3M8UA 3BBRA 3OO6A 3TCGA 2I58A 4EQBA 4R6YA 1Y3QA 3RGYA 1MY4A 4OTEA 1H44A 1M5BA 1N3XA 1Q35A 2P1SA 4FECA 4GD5A 3MAMA 2PBWA 4YKKA 3TKDA 1H45A 4H1XA 3Q25A 3FGSA 1ZTYA 3MZ9A 3R6UA 4P0IA 3U8QA 4IO7A 2ZMBA 4ZDMA 3HHFA 4IB2A 5L9MA 3KZGA 3BKIB 1MXZA 2H5YA 4ZEKA 5H8HB 5ICTA 4OFOA 3IORA 3K00A 3H6TA 2I4CA 3MZ1A 2R6GE 4F31B 1HSEA 2XXVA 2O7UA 5BUUA 2F7BA 4NWDA 3F11A 3QSLA 4Q5TA 1MM6A 5H8NA 4GXSB 1CE2A 1FQAA 4EQ9A 4F19A 5CMBA 4U4SA 2A5SA 4I9DA 3MVWA 4LQ5A 3H6UA 3QYTA 4F3SA 4E0XA 1VE4A 4HW8A 2F36A 4G2ZA 1I6QA 3N6TA 4DCYA 1DTZA 1QULA 1B51A 4UACA 1SBPA 3IOTA 1B3FA 3UK4A 5I2NB 3UIFA 2O1LA 3O97A 4X1BA 4LATA 2XXYA 3OSQA 3MQ9A 1B6HA 2ESNA 2FNCA 3KSJA 4YB6A 4N6PA 1VFEA 1NMUA 4R2FA 2XXHA 5F7VA 4JB7A 4EQ7A 1OQGA 3IO4A 1J1NA 1P1WA 2F97A 2REJA 2DOJA 1SI1A 3PPRA 1O63A 3TEPA 3A3CA 2GH9A 5KCJB 2AL5A 4ZS9A 3VVFA 4YU0A 1POTA 3RPWA 3IB1A 4NE4A 4H5FA 4EXKA 5BWJA 3VXCA 5JTYB 3QAXA 1P1OA 4OEUA 4BDMA 2XX9A 4RY1A 3MP8A 1B05A 1Y9UA 3ILTB 1US5A 4POXA 4EF1A 1R9QA 3TQWA 2OWTA 1JVYA 4ZEBA 2Y7IA 4IO5A 2HZLA 1B3EA 3JYRA 3DM0A 3C36A 1Y3NA 3UORA 1AH5A 3VVEA 2AL4A 2XXRA 1B52A 2XXPA 5DT6A 1ELJA 3GXAA 1LLSA 1LAGE 2Q2CA 4MH5A 4QSCA 2PVUA 3LSLA 3FJGA 2I49A 1ZBMA 3VV5A 3RUMA 1N76A 5H8SA 4YMAA 2XXTA 1AIVA 5DYHA 4R2BA 3H4ZA 2H99A 1Q1KA 3L6GA 5A5XA 4EDPA 2DYXA 2Y7PA 2REGA 5KDTB 1M5DA 2A5TA 1RYXA 4R9GA 1MY0A 4H5GA 5IAIA 3IJOB 3TZAA 2DWAA 1A99A 4F2QA 2XD2A 3OSRA 4IO6A 4X48A 4F39A 2OZZA 3ONMA 4KQPA 3USDA 3JV9A 2P2AA 4WEDA 3ZSFA 3LC8A 4TOZA 3S4UA 2Z8DA 4H0WA 4ZEDA 1QUIA 1OVTA 3H7MA 4QF9A 4EUOA 5AA2D 3R26A 2V93A 5TPAB 5F1QA 3FVOA 1LB9A 3PU5A 5TP9A 1TFDA 4NEDA 1SW5A 3PPQA 4GVOA 3MC2A 1FTMA 3KJTA 4U23A 5DEXB 5H8QB 4QHQA 3Q28A 3B6QA 3A09A 1IQ7A 1JETA 2O51A 3T96B 1H43A 2OWSA 1S50A 3OO8A 5CMMA 4ESWA 1MDP1 5CRYA 2F7AA 4GF8A 1JQFA 4E0WA 1B46A 3THIA 4ELOA 3O29A 3FXUA 2ZNSA 3FUZA 3IK6B 3OEMA 3TCHA 4RYAA 1HSJA 4PE5B 4KFQA 5AA4B 1FQDA 3RN8A 1UTHB 2FYIA 3CSBA 4JWYA 1SYIA 2RCAA 4Q0CA 3PUZE 4RA1A 3I3VA 3OMBA 3ZKKA 4G77A 3OELA 4I8CA 4OMBA 5I2KB 3VDFA 1NNPA 1B9JA 1NNTA 4R73A 4P11A 1JEUA 4G68B 4ELQA 3VVDA 3QIMA 3HN0A 3K02A 1EZOA 4YICA 3TCFA 3CFXA 2ANJA 1LCTA 2DVZA 1UTBA 3KN3A 2XXXA 4RPNA 4AB6A 4AB5A 3TODA 4DXCA 3KJ7A 1URDA 3FJMA 4PFTA 2XXIA 3RTFB 1NNKA 5HPQA 4I1DA 3SEXA 3K2DA 3K0VA 1PB8A 4KYSA 1LSTA 3E13X 1B32A 1A7LA 5HM4B 4ISUA 1URSA 1N7XA 5I58B 3QUFA 2ZYMA 4LZ8A 1PC3A 4C1UA 1LAXA 1IEJA 4DE8A 2DQVA 3KOSA 4DXBA 1B1HA 1B0HA 4U22A 4QFKA 1Y4TA 3QUJA 1FTLA 4EXLA 1XC1A 1N84A 4U4XA 2Q9TA 1Y3PA 3ZS6A 2F6PA 1MS7A 2D5WA 2ABHA 2PX1A 5H8HA 1BIYA 1TXFA 2DVCA 4MLQA 4YZZA 2ZYKA 1DTGA 3MP1A 1SVXB 2UYEA 2HXWA 1M5CA 2DS9A 5FTIA 1USYE 3DELB 2FA7A 3Q26A 1Y1ZA 3BFTA 3GLBA 4NTLA 3PPOA 4ZECA 1MY1A 1NNFA 4O3CA 1JW5A 2NWJA 1EH3A 4ESXA 2DWIA 4PFUA 5J1DA 2YJPA 2RF1A 3PD8A 4R75A 5I2NA 4RJZA 3OD7A 4U21A 4FEDA 3BFUA 3TYHA 3OO7A 3MBPA 3QXMA 4QFNA 4FORA 1QW0A 4OXVA 3T9UA 3MVYA 5K2XA 4X1DA 2UVGA 5KCJA 5AA2B 3KN7A 4XKPA 3GBBA 1PEBA 3V8XB 2Z23A 2UVHA 3LR1A 2QS2A 4KCDA 2Q8JA 3RT6B 1FW0A 1A54A 4LZ5A 4JSOA 1XHYA 4GQOA 4R6HA 4G68C 3VLVA 1MH4A 2B3FA 5H8FB 1DPEA 1AOVA 1EU8A 3CFZA 4TLMB 3MZBA 1POY1 4OYVA 4POWA 4KD5A 3DP8A 3TTKA 4KPTA 2DE4A 4TLLB 1T0KA 4H8JA 1II5A 5I84A 3Q29A 3EHUA 3H6VA 4OEVA 3PUXE 4RK2A 4N07A 4GXAA 1NL5A 3T22A 3KG2A 4BLAA 1OLAA 3C31A 3IX1A 3C9HA 5HBCA 4H67A 2RKMA 4F22A 2F6GA 4ZZEA 4GL0A 1GV8A 1M5EA 3FXRA 3TMGA 5FTHA 4IGRA 1YPNA 4IO4A 4YKJA 4YKPA 1LAHE 1BLFA 1HSLA 3I5OA 3MWBA 2F5XA 3HHGA 1Y20A 2G93A 3H03A 4KYDA 3S9EA 2ZYOA 4O3AA 2V84A 5H8NB 4OVJA 2H25A 1SD3A 5AE4A 3TDJA 1YAEA 1F9BA 3FASA 2Q2AA 2VP1A 3K6WA 4U1OA 3SEVA 3HCQA 3C35A 1EZ9A 5TPAA 3M3FA 1JW1A 1LFGA 1D3KA 1BTJA 1FQBA 2W7YA 1PB9A 1OVBA 4OESA 5I59B 3V83A 3PMVA 1MQJA 2AIXA 1ANFA 3SEUA 4GWOA 1PBQA 4JDFA 3CSGA 3TUSA 1MXWA 2I4BA 3VE1B 3SEYA 2XD3A 5DEXA 3O6GA 1IITA 3PMWA 3K6UA 5H8QA 2UVIA 2F7CA 3KEIA 4ELPA 4OFLA 3H06B 1JVXA 2Q89A 4GLIA 1O64A 4U1ZA 3RY3A 2Z8EA 4C0RA 1B3GA 3A3UA 3V5AA 3KSXA 3PV0E 4QFLA 2Q88A 4TQUQ 2QS3A 2V3UA 1UIUA 1NKXA 2DWJA 1LAFE 4LP2B 2UVJA 2HQ0A 5CBRA 4JBZA 4I62A 1MPBA 1AMFA 3CG3A 3E9XA 1MG1A 4DDDA 1US4A 4BDLA 1UTHA 4F3PA 4KCCA 4G8HA 1A40A 3FZVA 5I2KA 4OZ9A 4F3GA 1IXIA 3M3LA 2VOZA 2OK2A 1B2HA 4G68A 4R9FA 3PUWE 4U2RA 4DLDA 5ISUA 5M2VA 2YPNA 4F1VA 1ZJLA 2QSXA 4RNSA 2ONRA 1NH7A 2HZKA 4FEBA 1I6AA 4NF4B 2M8CA 4FIMA 1P1QA 2D3IA 3PGFA 1MQIA 2O7IA 2O69A 4QFPA 1OIBA 3CVGA 2ZYNA 3EN3A 1SW2A 1B4ZA 5I57B 3IAZA 2A5TB 3FXQA 3K1NA 1JNFA 3O6IA 1OQHA 4R6KA 3PPPA 2F8DA 4NF8A 4YMBA 3MW0A 1B3HA 2Y84A 3H6WA 3T9HB 4FAJA 1N0TA 3L6HA 1MQGA 2X7PA 4JWOA 4G8MA 1TT1A 1BP5A 4BDRA 3UN6A 1B5JA 3PUVE 4NF5B 2QMWA 3CIJA 1WODA 3R7XA 1JEVA 1MRPA 4RPOA 1MQDA 2RC7A 3AXFA 4HCYA 5EYFA 1B7ZA 5DVIA 2PT1A 3SDFA 1UIVA 3G3JA 3IO6A 1IXGA 4LZ7A 1LFIA 1WDNA 4M4GA 2H98A 2Z8FA 3FVKA 4JSDA 4M1VA 4F29A 3G3IA 2XXWA 2VGQA 1IZ1A 2O6AA 3G3FA 1VFDA 1SI0A 2DWHA 3DLNA 5TU0A 1URGA 3TTRA 4OERA 1GGGA 3UGWA 3HSTA 3IB0A 2BJJX 5L9SA 2RCBA 1B7HA 3N5LA 2ALUA 4YKIA 3S9NC 4WXJA 2ONKE 3MPLA 4NF6B 2P0SA 3O66A 4OWDA 3K1PA 5FHOA 3O6HA 4LQ2A 3ZKLA 4H6DA 3KFMA 3C34A 3ODBA 3PMXA 4AQ4A 1TFAA 5CBSA 4YB5A 1FCKA 3H3GA 4RXLA 1JW4A 2Y7RA 1AL3A 3FVGA 2KLFA 1FQEA 2I3WA 5I56B 4WKMA 3ILUB 4ELRA 2O1MA 1ZLQA 1NH8A 4MF3A 5CMKA 3QK6A 4R72A 3TFLA 2G29A 2B3BA 4HTGA 4KI0E 1FQCA 2HFBA 4FATA 2QS1A 2CMOA 4IY6A 1B5HA 4EF2A 3OO9A 4ZEIA 3TTMA 3Q27A 3G3HA 2F35A 5AA1A 1QKBA 4IO2A 3OXNA 5CI5A 4MFIA 2XX8A 3MP6A 1IUDA 2VD2A 3FATA 3LSFB 3OENA 4X9TA 4QFOA 5ICQA 3FVNA 3PPNA 1Z7ME 3LSWA 2H4IA 4OFJA 2Y7KA 1RYOA 5L8DA 1B0LA 2RINA 5H8FA 1MXVA 4WEPA 2V25A 4ZE9A 3JZJA 4BDQA 1P1UA 1H76A 4PQJA 3OEKA 3RQTA 3SETA 5ITOA 4LUBA 3PUYE 3KOTA 3IL1B 1SW4A 2QJEA 4KYEA 3KBRA 4H65A 1LGBC 3T93B 3IOUA 3IR1A 2NOOA 3C32A 4GL8A 2QL3A 1DMBA 1B4HA 3LSXA 1ATGA 1QKAA 1ZIUA 4BDOA 2IA4A 3LBSA 4LA9A 1S7YA 1MM7A 5K2YA 3G3KA 5FHMA 2I6EA 4DIGA 5CM6A 3WAFA 5EHSA 4ND9A 1FTOA 1MDQA 2OJTA 4R74A 5JTYA 2NXOA 1B40A 1B7UA 4OQOA 1EZPA 2PT2A 4GFRA 1Y4CA 5JK4A 1LBBA 4GOTA 1H3DA 2I0CA 3V89B 1R6ZA 3SKPA 3U92A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CI8A 1IXCA 4IO3A 1GR2A 3WAEA 4GIZA 1O7TA 2HAUA 1Z7NE 3S9MC 4DXUA 1MQHA 3C33A 3E4RA 4NWCA 1GVCA 3G7WA 1DSNA 3ECRA 2RC8A 2HAVA 3SESA 3C4MA 2CEYA 5I59A 1I69A 4IGTA 5CMCA 3I6VA 1DBZA 2F78A 4XKNA 2PMSA 4F2OA 2WBBA 1KWHA 2QS4A 3PD9A 4OHNA 4GX6A 4L17A 4Q8RA 1P1NA 3VXBA 3K6VA 4LN5A 1XT8A 4OVRA 2WX9A 5KDTA 1KZ8A 3U72A 2QVRA 2MKZA 4QSDA 3FIRA 4O8MA 4XFEA 5EHMA 1I6BA 1Y1MA 3S9LC 3VLWA 4GX4A 4THIA 4YAHX 4K3FA 1PB7A 2HCAA 4PBQA 1QUKA 2V3TA 3U93A 3RTWB 4F1YA 4YB7A 3D4GA 4Q30B 3GBAA 1NFTA 1OLCA 1LEVA 4UA8A 3S2VA 3MJNA 4LONB 1MXXA 2Y7WA 1LBCA 2DE3A 4HS7A 5IZ1A 2DP8A 3KGCA 1BK4A 1DPPA 3TELA 2Z22A 3TPAA 4ZEFA 3KC0A 4OENA 2QFLA 4MIJA 1NUYA 4ONYA 4PETA 2PYYA 3SEWA 1FTKA 4NMYA 2GFEA 3P7IA 3VFJA 4LVQA 3EPEA 4XTCQ 4NF4A 3T9VA 2RC9A 2XX7A 2E1SA 1R1NA 3O28A 5LDZA 3EQ1A 3CFLA 5B70A 1FSAA 5ELVA 3E78A 3DP6A 4GX3A 4NHBA 4MEVA 4XIGQ 2H9BA 5DVFA 2THIA 3T66A 5I57A 2ONSA 1MXYA 3N26A 3T9XB 3HV1A 1K9ZA 2JJKA 1IMDA 1USYH 1P99A 5AA4A 1L5TA 2V4CA 2VHAA 2FBPA 1BKAA 4KR5A 4GRKA 3KN8A 2I3VA 3IB2A 5F24A 4O7IA 2IEEA 3B6WA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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