4KHZE

Crystal structure of the maltose-binding protein/maltose transporter complex in an pre-translocation conformation bound to maltoheptaose
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
publication title Structural basis for substrate specificity in the Escherichia coli maltose transport system.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 119
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4khzE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4khzE01
2I6EA 4U22A 2E0SA 5AE4A 4OYVA 1H76A 4E0WA 1MXUA 4KHZE 3MZBA 4N13A 1I6AA 1LAHE 3DP6A 3CR9A 4WKMA 3OEKA 5ICTA 4GXSB 4OETA 4OESA 1N3WA 2XD2A 4JWOA 4F3GA 4Z0IA 4OWDA 1PB7A 3LC8A 1TFDA 1Y1ZA 3OSQA 3C31A 4H67A 2XXWA 2VGQA 3OELA 1LFGA 4C0RA 3E3KA 1EZOA 1B0HA 4NF4A 3QIMA 3RY3A 4PFUA 2Q2AA 3KSXA 1PBPA 4GF8A 5H8QA 3ZKKA 1US5A 4OFJA 4G8MA 1N84A 3FJ7A 4HW8A 3OXNA 1H3DA 4KD5A 4H5GA 1MM6A 4LONB 4RNSA 2P1SA 3W9WA 4QFPA 1Q1KA 1B6HA 3C4MA 3S9NC 2OCUA 1B5HA 1B7HA 4ONYA 3K1NA 5DEXA 2XXIA 2XXQA 1PB8A 3K6VA 1MQJA 3KFMA 1HSJA 3K6UA 1SW2A 4QHQA 5I59B 2W7YA 3FJGA 2F8DA 1B1XA 2CZLA 4JWYA 3HO7A 1SQYA 2ZYKA 3ILTB 1MPBA 4ELPA 2O84X 5KCJB 1LB8A 3BFTA 4R6HA 3PUZE 3U72A 4X1BA 4GL8A 2OWSA 1LFIA 2I4CA 4JB7A 4YKPA 1FTLA 2RF1A 5DVIA 4LP2B 3B6TA 1MQHA 1Z7NE 4RY1A 3I5OA 5I84A 3CG1A 2V3QA 4R73A 3TKDA 5H8NB 3G3HA 2X7PA 3S9EA 3THIA 4LUBA 4P0GA 1OLCA 2UXAA 2OLBA 4EF1A 2H5YA 3PPPA 4F3SA 2PMSA 3T96B 2NWJA 2R71A 3E4RA 4OVJA 5I57A 5I56B 1Y20A 2YJPA 4OEUA 4R74A 3PPNA 2X7QA 1XHYA 1IUDA 2AIXA 1QUJA 1DTZA 1AMFA 4NF6A 3QXMA 1M5EA 4MLVA 1MXYA 2AL5A 2XX9A 4U1ZA 2GRVA 2RINA 1Y4TA 3UN6A 3MQ9A 1B4HA 1NFTA 4F19A 4BLAA 1NH7A 3VVDA 4HCWA 3MVWA 4MF3A 4H5FA 5CRYA 4C1UA 4Q8RA 4LA9A 4GD5A 1UTBA 1AIVA 1ELJA 1A99A 2V3TA 3GBBA 4UACA 3TTMA 3T9HB 1NNKA 1LBCA 5JEIA 2B65A 4GWOA 3IB0A 4YB7A 2DE4A 2XHDA 4ZEBA 1QJMA 1ZLQA 4EXLA 3RGYA 2R6GE 2Q88A 1NNPA 5DVJA 3T9XB 2RC8A 5J1DA 3N94A 3MVYA 3IB1A 2DE3A 4LQ5A 2AL4A 1Q35A 5ITOA 3H3GA 1B40A 3MVXA 4OEVA 4F3BA 4ZEKA 1F9BA 1GGGA 3FUZA 1B7ZA 4PP0A 1DPEA 3QK6A 2ZNUA 4NF5A 2DVCA 1NKXA 1EZPA 3KBRA 2A5SA 4IY5A 4RPNA 4TLMB 1FCKA 4LZ5A 3MWBA 3TTNA 3C36A 3VE1B 1US4A 3OSRA 4U21A 3PD8A 1A54A 3RUMA 3SETA 3G7WA 1RKMA 3HN0A 1JW4A 3MPKA 3MP6A 5AA4B 2I3VA 2H25A 1T0KA 3RLFE 1MY3A 4XIGQ 4JWXA 4DZ1A 2G29A 4AQ4A 3PMWA 1B2HA 3KG2A 3C35A 3VVFA 1BTJA 3P7IA 1M5FA 2R9JA 3TTLA 1LCTA 4AB6A 3W9VA 1TFAA 3B6WA 4GLIA 4OZ9A 1M5CA 3ILUB 3S4UA 1FQAA 1EH3A 3TYHA 5KDTB 3FV2A 4ZZEA 4NEDA 5FTIA 1LLSA 4EQ7A 2B3FA 3CFZA 5AA2B 1NNFA 2I0CA 1B5IA 3FXUA 4DXUA 4ZDMA 1LBBA 3CVGA 4H8IA 1ANFA 2HXWA 3TTRA 4GQOA 5DVFA 3ZS6A 2B3BA 2A5TB 2DYXA 1LB9A 4DXCA 1B51A 3K6WA 2I3WA 1BP5A 3OO7A 1GTKA 4DXBA 4HCYA 2HAVA 5FHMA 3VVEA 4YKKA 1I69A 1MXWA 4EUOA 3N6UA 1N04A 2UVGA 1OMPA 2QPQA 4IO2A 1J1NA 4OFLA 3IJXB 1VSOA 3MZ1A 1II5A 4RPOA 3UP9A 4ZZAA 1XS5A 3EHTA 3QUFA 3EHSA 1XC1A 4PQJA 2F7AA 1UIVA 3U92A 3O6HA 4BDNA 4L17A 1P1OA 1R6ZA 5I59A 1PEBA 4KQPA 4Q30B 4ELRA 2XX8A 3PPOA 4O3CA 1P99A 1JEUA 4H1XA 2F35A 2XD3A 4U4SA 1ZTYA 4C1TA 3TFLA 5KCJA 2XXXA 1SVXB 1FQFA 4YU0A 1IXHA 3ZKLA 3D4CA 3O29A 1BIYA 2DWJA 1MH4A 1FQBA 1H45A 3PUYE 1B9JA 3DLNA 4MLQA 1QW0A 2RC9A 4QSCA 3F11A 5BUUA 2XX7A 3SDFA 3FD3A 4QRZA 3H6VA 5H8NA 1QUKA 4FE8A 5IAIA 1R1NA 1URSA 1VFEA 3E9XA 3JYRA 2V25A 5I56A 1IXIA 3TQWA 1N7WA 3MP1A 4EDPA 4F2QA 4YKJA 3B6QA 3TCFA 4R75A 1IXGA 3VXBA 3SESA 4KPTA 1WDNA 3LSLA 3UGWA 3FVOA 1N0TA 1OIBA 4FECA 4GOTA 2GHBA 3U8QA 4EXKA 3VXCA 3I6VA 3S9MC 2QL3A 4OMBA 3CI8A 4LZ8A 1QVSA 3G3GA 2F34A 1FTKA 5HPQA 1SYIA 2H9BA 3IX1A 1S50A 5I2NA 1A7LA 4IGTA 4RXLA 1PDAA 1D9YA 4OHNA 1BKAA 3TODA 2F78A 1GVCA 2GFEA 4XKNA 2F7CA 2Q89A 2IEEA 1MY2A 3C9HA 3FGSA 4LVQA 3U1OA 4KR5A 1MQIA 1I6BA 5TP9B 4JBZA 5CMCA 2I49A 2GH9A 1N76A 3K4UA 3Q25A 1IZ1A 4BDOA 3IO6A 1DTGA 1MS7A 1JEVA 3SEVA 3HCQA 3VV5A 1DSNA 3K1MA 4KFQA 3I3VA 3H7MA 2QSXA 2Z8EA 4P11A 4FIMA 5CI5A 3MC2A 1JW5A 4Z7EA 1IQ7A 4UA8A 3IO4A 4ZE9A 2DSFA 2DXYA 1HSLA 4FATA 1Y4CA 5K2XA 3USDA 1B58A 5AA4A 3AXFA 3IORA 2ONRA 4YKIA 1ZKBA 3LR1A 4BDMA 1QUIA 2YLNA 4BDLA 1B46A 3TAJA 3R7XA 3MPLA 2VP1A 2UYEA 3EHUA 4QSEA 4N6PA 1UIUA 3V5AA 3GBAA 3LBSA 3D4GA 4EQBA 3RN8A 1P1WA 1UTHB 1YTVA 5TU0A 2DP8A 2PX1A 5F1QA 1USYH 4GXAA 4OQOA 1A40A 5KDTA 4QFLA 3MAMA 1POY1 1DPPA 2THIA 3KN3A 3PV0E 5ICQA 4H65A 5AA2A 3KEIA 4FJPA 5A5XB 3T66A 1MH3A 4NWDA 4H0WA 4QSDA 2DWIA 4NWCA 3TCHA 2ZXTA 3HPIA 4TLLB 2XXYA 4POWA 3TEPA 1QKAA 1VR5A 4RJZA 1FQCA 2A5TA 2QS3A 3E13X 2Q8JA 2P2AA 1AH5A 1ATGA 4IO7A 4OERA 3A3CA 3K01A 1YCJA 1QULA 1DOTA 3A09A 3OENA 2UYFA 1MDP1 3PPRA 3HV1A 4K3FA 1URGA 4F29A 5HM4B 3KOSA 3VLWA 2O68A 4JXIA 4U2RA 1EZ9A 4F3PA 3IOVA 1URDA 3KN7A 5I2NB 1A8EA 4RYAA 1VFDA 3EPEA 1SBPA 1SI1A 3LSXA 3PMXA 1IIWA 1MDQA 2DWAA 3G3FA 3KJTA 2PVUA 5IKBA 1B7UA 1XVYA 3QYTA 5AA3A 2UVJA 3PMVA 1B3LA 2Q2CA 4IB2A 2XXTA 4G8NA 2ESNA 2Z22A 3MZ9A 4G68C 1JNFA 3L6HA 3TPAA 3SEUA 1D3KA 3VDFA 1B3FA 2M8CA 3QSLA 3W15C 4OFOA 3TMGA 1QKBA 2ZYNA 2O7IA 3RQTA 4N07A 4ZS9A 1B1HA 2OK2A 1Y1MA 2QS2A 3RT6B 3FV1A 4R6YA 1RYXA 4XKPA 2Y7PA 1YAEA 4X48A 4PFTA 5EYFA 4DCXA 1KWHA 4G8HA 2OJTA 2Y84A 3UK4A 4AB5A 4I8CA 4U4XA 5CMKA 3IAZA 1MRPA 3IOWA 3T9VA 1XT8A 1FTOA 4M4GA 5AA2D 2P0SA 4I9DA 4OTEA 4OXVA 4G2ZA 4TOZA 1CB6A 2ONSA 2OWTA 2HFBA 5F7VA 3IL1B 2H4IA 2OBGA 5TPAB 1B0LA 2REGA 3K0VA 3H06B 4IO3A 3O6IA 4F22A 3CFXA 4YMAA 4KYEA 2G93A 1S9TA 5ITPA 3DP4A 4YB5A 3OOAA 1LCFA 3HHFA 3N26A 1MQDA 4LZ7A 2KLFA 3RNNA 3M3FA 3FXQA 5AA1A 5TP9A 3O97A 4YB6A 4H8JA 3O28A 4KCCA 2OZZA 1NNTA 2VOZA 4KI0E 2HQ0A 5CBRA 3JV9A 1LFHA 2NVUB 5LOMA 2FNCA 4IY6A 4XKQA 1NL5A 4YZZA 1D4NA 3N6TA 4YMBA 1LGBC 2F97A 3HHGA 3OO9A 4U1OA 3H6UA 4NF8B 1IEJA 3C34A 5B7DA 5KZTA 1O63A 1NH8A 3FJMA 3KOTA 1OVTA 1PB9A 1AOVA 4WXJA 4R2FA 5I58B 3HSTA 3U94A 2PBWA 3TDJA 3CG3A 1Y3QA 3ECRA 3O6GA 2QS1A 1Y9UA 3SEWA 3SEYA 3G3JA 3CFLA 1UTHA 3ZSFA 2QRYA 1SD3A 3U93A 3OD7A 3FVKA 3M3KA 2AYSA 2I4BA 3M3LA 2RCAA 1HSEA 1MPCA 1LAGE 3KGCA 1Y3NA 2O1LA 4JDFA 2F36A 1B3EA 5A5XA 3LSFB 3BFUA 3PUWE 2O69A 3B7DA 2H99A 3CRBA 1ZMGA 3UORA 4HTGA 1P1NA 2Z23A 1MY1A 3T22A 2CMOA 5DT6A 3PUXE 1S7YA 2I0BA 1PBQA 2F7BA 1BLFA 4KYDA 4GVOA 1H44A 3PPQA 2ABHA 3FXRA 1Y3PA 1MG1A 2PT1A 2FA7A 2DE2A 4Q0CA 2Q9TA 1FTJA 4F39A 1M5DA 4OENA 1MQGA 1LAXA 3EQ1A 4FEBA 4POXA 5HBCA 3FVGA 5CMMA 5DTBA 4QF9A 3OEMA 1JQFA 4GIZA 2BJJX 3IOTA 2XXVA 2Z8DA 3V83A 2YPNA 1LSTA 3T93B 1SW5A 4R6KA 5L9MA 3TCGA 2O7UA 2ZNSA 5H8FB 2DWHA 3K6XA 4ESXA 1MPDA 4NTLA 3L6GA 4I1DA 3TELA 3O2AA 3FASA 2QMWA 3PUVE 2DXRA 3C33A 1EU8A 3KSJA 1POTA 3SERA 2DQVA 1XOCA 2QMXA 3SKPA 1UQWA 1TT1A 4FEDA 3BBRA 1TWYA 2E1SA 3Q28A 1YPNA 1RYOA 4GRKA 1H43A 2DS9A 4QFNA 4WEDA 5BWJA 5CBSA 1MY4A 1WODA 4X1DA 4JSOA 2ALUA 1A8FA 4PFWA 2D5WA 2I58A 1B5JA 1P1QA 1IXCA 2Z8FA 1MXXA 3JZJA 3N5LA 5FHOA 2HEUA 1TXFA 1MY0A 2V84A 3VLUA 3BKIB 2HCAA 1B3GA 2HAUA 5I2KB 3KZGA 5TPAA 1MXZA 1FQDA 1ZU0A 2QJEA 3O66A 2O1MA 1B52A 1ZBMA 2XXPA 1JETA 2NOOA 3EN3A 3FZVA 2NXOA 3K02A 3MP8A 3H03A 4IO4A 4EQ9A 4QFOA 4KYSA 3K00A 2XXHA 4KCDA 2V93A 4O3AA 2PYYA 1N3XA 4THIA 5H8HB 5ELVA 3ODBA 4F1YA 2NUVA 2RCBA 4F18A 4I62A 1MXVA 4IGRA 5L9SA 3K1PA 1P1UA 4X9TA 1D9VA 5JTYB 4F1VA 5L9OA 5JK4A 3IOUA 3OMBA 2Y7KA 4IO5A 4P0IA 1IITA 4GL0A 1FW0A 3C32A 3DELB 3TUSA 4ESWA 1O7TA 2I48A 4NF8A 4G68A 1WVJA 5CMBA 1N7XA 3S2VA 2O6AA 3IR1A 4O3BA 1B05A 3MVZA 2DOJA 3VLVA 1SI0A 3VFJA 2ZYMA 3TTKA 1ZIUA 5I58A 5CC2A 4R9GA 3OO8A 4BDRA 4NMYA 5M2VA 2ANJA 1B4ZA 1PC3A 3EF7A 1AL3A 4PFYA 4G77A 4NF4B 1I6QA 4XTCQ 4ZECA 3QAXA 5H8QB 1OQGA 3CSBA 3DP8A 1FTMA 5K2YA 3KN8A 2GHAA 2ZNTA 2HZKA 1GV8A 3SEXA 4H6DA 2LAOA 2H98A 4RK9A 3UIFA 4RK2A 4MFIA 4F1UA 1R9LA 2F5XA 1OVBA 5DEXB 5L8DA 4U23A 3G3KA 3S9LC 3T9UA 4ZE8A 1NMUA 3Q26A 2V3UA 2DVZA 4EF2A 3V8XB 4R72A 3KJ7A 4ECFA 4YICA 2FYIA 1L5TA 3K2DA 4FAJA 2QS4A 2PT2A 3ONMA 3M8UA 3H6WA 1USYE 4TQUQ 2HZLA 3LUYA 2X26A 4ND9A 4JSDA 1MM7A 3V89B 3PU5A 5H8FA 5H8SA 3GZGA 1SW4A 1GR2A 5ISUA 3Q27A 2VD2A 2XXUA 1JVYA 4ELQA 3TQLA 3O9PA 4E0XA 5I57B 2Y7WA 4NE4A 4G4PA 3R6UA 4Q5TA 5EHMA 1M5BA 3WAEA 3QUJA 2RC7A 3WAFA 4ELOA 1SYHA 1VE4A 4LQ2A 2WKYA 3FATA 4DDDA 4F31B 2IA4A 4NF6B 3IK6B 4R2BA 3MW0A 4F2OA 2VD3A 1XVXA 3Q29A 1B3HA 3CIJA 4G68B 3FIRA 4RA1A 1CE2A 5FTHA 4XXUA 4PETA 3G3IA 3PD9A 1SDXA 2D21A 2RKMA 1UTBB 3RTWB 2UVHA 4LATA 4MH5A 3A3UA 3IJOB 4XKRA 1A55A 5DYHA 1SW1A 3IB2A 1LAFE 2ZYOA 4ZEDA 2Y7IA 5B70A 2F6GA 5I2KA 4DLDA 4ISUA 4MBPA 4QFKA 4ZEFA 1O64A 2VHAA 4DIGA 2F6PA 2ZMBA 3GXAA 1OQHA 4YAHX 1Z7ME 5CM6A 4NF5B 1OLAA 4FORA 3RT8A 2Y7RA 2REJA 3CSGA 1DMBA 4M1VA 2XXRA 4GFRA 3RTFB 1FQEA 4R9FA 4WEPA 3TZAA 2D3IA 2ONKE 3DM0A 4IO6A 3MJNA 1JVXA 4ZEIA 5EHSA 3MUQA 5H8HA 4HS7A 1ZJLA 4BDQA 3H4ZA 1R9QA 4DE8A 5FHNA 3R26A 3GLBA 3PGFA 3UA8A 1B32A 3FVNA 4PE5B 2O51A 4DCYA 3OO6A 2UVIA 3LSWA 3RPWA 5JTYA 1JW1A 3H6TA 3MBPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2I6EA 4U22A 2E0SA 2WEFA 5AE4A 4OYVA 4PDDA 1H76A 4E0WA 1MXUA 4X8RA 4KHZE 3MZBA 4N13A 1I6AA 1LAHE 3DP6A 3CR9A 4WKMA 3OEKA 5ICTA 4GXSB 4OETA 4OESA 1NUWA 4GWXA 1N3WA 2XD2A 4JWOA 4F3GA 4Z0IA 3HFUA 4OWDA 1PB7A 3LC8A 1TFDA 1Y1ZA 3OSQA 3C31A 4H67A 1KA1A 2XXWA 2VGQA 3OELA 1LFGA 4C0RA 3E3KA 1EZOA 1B0HA 4P8BA 4NF4A 3QIMA 3RY3A 4PFUA 2Q2AA 3KSXA 1PBPA 4GF8A 5H8QA 3ZKKA 1US5A 4OFJA 1NV1A 4G8MA 1N84A 3FJ7A 4HW8A 3OXNA 4DI3D 1H3DA 4P9KA 4KD5A 3A29A 4H5GA 3GYYA 1MM6A 4LONB 4RNSA 2P1SA 3W9WA 1IMDA 4XFEA 4QFPA 4N81A 1Q1KA 1B6HA 3C4MA 3S9NC 2OCUA 5I3SA 1B5HA 1B7HA 4ONYA 4XEQA 1RDZA 3K1NA 5DEXA 2XXIA 2XXQA 1PB8A 3K6VA 4PAKA 1MQJA 3KFMA 1HSJA 3K6UA 1SW2A 4QHQA 4MEVA 1JP4A 5I59B 2W7YA 3FJGA 2F8DA 1B1XA 2CZLA 4JWYA 4GX4A 3HO7A 2KQZA 1FRPA 1SQYA 2ZYKA 3ILTB 4HE1A 1MPBA 2B4LA 4ELPA 2O84X 5I7IA 1LB8A 5KCJB 5ESYA 3BFTA 4R6HA 3KC0A 5A5LA 3PUZE 5LTCA 3U72A 4X1BA 4GL8A 2OWSA 1LFIA 2I4CA 4FBPA 1NV7A 4JB7A 4YKPA 1FTLA 2B4MA 2RF1A 4GBWA 2XWIA 5DVIA 4LP2B 3B6TA 1MQHA 1Z7NE 4RY1A 3I5OA 5I84A 1FPDA 3CG1A 2V3QA 4R73A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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