4KHZE

Crystal structure of the maltose-binding protein/maltose transporter complex in an pre-translocation conformation bound to maltoheptaose
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Maltose-binding periplasmic protein
publication title Structural basis for substrate specificity in the Escherichia coli maltose transport system.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Transport protein
total genus 119
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4khzE02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4khzE01
3MZ1A 3CSBA 3H7MA 5DT6A 4LATA 2V25A 3UK4A 4OVJA 3MW0A 3JZJA 3AXFA 1JW1A 1H45A 4C0RA 2F36A 2B3BA 4G8MA 3IB1A 3PUXE 2H98A 1A40A 4DCXA 3TCHA 2Z8FA 1Y4TA 3BFUA 4X1BA 3S2VA 3OD7A 1NL5A 4WEPA 5K2XA 4PETA 1I6QA 2XX8A 4G8NA 1B6HA 3U94A 4O3AA 2XD2A 3KGCA 4XKQA 3FGSA 1SBPA 3PU5A 1B3FA 1Y1ZA 4C1TA 4XKNA 3Q25A 3O28A 4YB6A 1SW2A 3IL1B 1Y3NA 1UTBA 3FZVA 1URGA 1EZ9A 3MZ9A 4MFIA 1IXCA 4RK2A 4KPTA 1LB9A 4ZE9A 1FQAA 4ZS9A 1ZKBA 1IEJA 1YPNA 2XXWA 2UVGA 3LR1A 4H0WA 2X7PA 3HPIA 4ELQA 4LQ5A 4DZ1A 1IITA 1MQDA 1FQBA 4JWOA 1DTZA 4JDFA 5TP9B 1H3DA 3CFXA 2ZYMA 4YB5A 4ESWA 2IEEA 4NWCA 1QW0A 3OEMA 3A3UA 2O84X 3I6VA 1JNFA 1BLFA 4LZ8A 2H25A 1O63A 3UGWA 2ONSA 4BDNA 3C34A 3FD3A 1MDQA 2PMSA 4KHZE 3MQ9A 1LGBC 5I58B 3DP4A 5HM4B 4OETA 4ELRA 3MVXA 1EZPA 3OO7A 3UORA 3U72A 5IAIA 2QSXA 3IB0A 5DEXB 4XXUA 1OIBA 1SYIA 2V3QA 1N3XA 2RC8A 3M8UA 1L5TA 5FHOA 2D21A 3GXAA 5I58A 1JW4A 5H8HB 1MXXA 1YCJA 3F11A 1LLSA 3PMWA 1N7WA 3LUYA 5I2NB 5FHNA 3OENA 4ECFA 5L9OA 4EF1A 1ZTYA 3ONMA 1XS5A 5HPQA 5DEXA 3D4CA 4JSDA 2QL3A 5I2KA 1WODA 3JYRA 3VE1B 1XT8A 3EF7A 4TOZA 4F2OA 3H6VA 2QS3A 5ITOA 4F1YA 1NMUA 1SI1A 1A7LA 4M1VA 4JXIA 4DE8A 4U4SA 3UIFA 1LFIA 3KSXA 3S9EA 3N26A 2OWTA 4ISUA 3K1NA 3PPRA 3IORA 1IIWA 3I3VA 3LSLA 4U21A 3TTRA 1B7ZA 4TLMB 1N3WA 4ESXA 2XHDA 4G68C 4R2BA 3HN0A 3OMBA 4GVOA 2RCBA 2I49A 1CE2A 1Y3QA 3EPEA 2Z22A 4LP2B 2RF1A 3CR9A 1YTVA 3N94A 4OENA 3QUJA 2AL4A 3TQWA 2Y7RA 1N0TA 4GIZA 1LAXA 1WVJA 2D5WA 2VD3A 3Q26A 4FE8A 1Z7NE 2BJJX 4Q0CA 3FXQA 1H43A 1B5IA 4Q30B 5TU0A 4QFLA 1SW4A 3MVZA 2Y7WA 2Z8DA 3TZAA 2GFEA 3TDJA 1RYXA 3SEWA 3PUZE 3VVEA 1O64A 4U22A 3MPKA 5CBSA 1FTMA 1Y9UA 1SD3A 3KBRA 3O9PA 4QSCA 4BDLA 1POY1 4OQOA 5ICQA 4F3PA 3GBBA 1DPPA 2XX7A 4WXJA 4NEDA 1TXFA 4OFOA 3FIRA 3U92A 4R6HA 5IKBA 4DDDA 4F3BA 1MQGA 1B3GA 2DS9A 4OZ9A 2I6EA 3PPQA 3OO8A 1MPDA 1SYHA 4NF6A 1DMBA 3C33A 3HV1A 3T66A 1VFDA 4NTLA 1B3HA 1NKXA 3CRBA 2I3WA 4EQBA 3R6UA 3IB2A 1B1XA 4XIGQ 5EYFA 2PVUA 3TQLA 4YKIA 5FTHA 1JW5A 2FYIA 3KN7A 4GOTA 5DYHA 3BFTA 2V3UA 2KLFA 2GH9A 3LBSA 1B0HA 1P1WA 3M3LA 4QHQA 4I8CA 4DCYA 3K0VA 3RLFE 3BKIB 1HSLA 2B3FA 3CFZA 2FNCA 1B9JA 3HHGA 2Y7KA 3N6TA 3ZSFA 2ZYOA 3ZKKA 3H03A 2ZNSA 3CIJA 1Y4CA 2XXHA 3DM0A 4OERA 3Q28A 2A5SA 1LSTA 4QFKA 5DVJA 4F29A 3U1OA 5H8FB 2P2AA 4IO4A 4ZDMA 3PPOA 3QSLA 4RK9A 2A5TB 4H65A 5L9MA 4JWXA 1ANFA 1DSNA 2H99A 2Y84A 4JSOA 4PP0A 3H6UA 4YU0A 1B46A 4F2QA 3HSTA 2ALUA 3KZGA 4ZEIA 4KYEA 4OEVA 3PMVA 1MPCA 1ZJLA 3PUVE 4KR5A 2I48A 3O2AA 3K2DA 1S7YA 4TQUQ 1CB6A 4FORA 4GD5A 1JETA 2DE4A 5KCJB 3V89B 4PFWA 4K3FA 5AA3A 1B4ZA 2DXRA 3FVOA 3MUQA 5M2VA 2VOZA 4F3SA 5HBCA 4IY6A 1B4HA 4FAJA 4R73A 3SEXA 2ZNTA 1D4NA 2F6GA 3K01A 3SDFA 1LBBA 3GZGA 4R74A 4RJZA 1MQIA 3LC8A 5EHMA 2HQ0A 5DVIA 4OYVA 4UACA 5KCJA 3RQTA 4DIGA 1ZBMA 2NOOA 2DXYA 4EUOA 3TTKA 3IJOB 4L17A 2UVJA 1A8FA 3O6HA 2HEUA 3USDA 1PC3A 4THIA 1AIVA 1VFEA 4BDOA 2HXWA 4FJPA 4HCWA 4F3GA 4NWDA 4YMBA 1NH8A 3THIA 2ZYKA 4GF8A 2XXPA 5CM6A 3OOAA 1AMFA 5I57B 1JVXA 4RXLA 3K6XA 2R6GE 1R1NA 1NFTA 2XXIA 3C36A 5BWJA 3I5OA 1LCFA 3O6GA 1IQ7A 4ZEDA 4Q8RA 4EQ9A 2X7QA 1NNTA 3T93B 5CMCA 3KSJA 3WAEA 5JEIA 1Y3PA 2Z23A 3HHFA 2RCAA 3SEVA 3PD9A 1I6AA 1FTJA 1B7HA 3MWBA 2VHAA 1KWHA 3FVNA 3UN6A 2NXOA 5F7VA 2NWJA 2F35A 2NVUB 3VXBA 1DPEA 4ZZEA 3MP8A 4OFJA 4RPOA 4F18A 3SKPA 2P1SA 3FJMA 2F7AA 1XC1A 1OLCA 4U1OA 2Q2AA 5TP9A 3C4MA 1BP5A 3TFLA 5CMBA 4G8HA 1GTKA 1IUDA 1MM7A 4KD5A 4H5GA 2Q9TA 4R9FA 1USYE 4IO2A 3RY3A 2GHBA 4F1VA 2PBWA 1MQJA 2LAOA 2PX1A 1H76A 1Y20A 2E0SA 4Z7EA 4JB7A 3ZKLA 1BIYA 2I58A 5H8NB 3KOSA 4QFNA 2YJPA 1SDXA 1HSEA 3KFMA 4QF9A 3FV2A 4YMAA 4KI0E 4AQ4A 1AL3A 3RGYA 4N6PA 1SW1A 2DWIA 4UA8A 1UTHB 4O3BA 1ELJA 1DOTA 4BLAA 1B3EA 4POXA 2Y7PA 5EHSA 4ELOA 4IO3A 2HZKA 1MH4A 5H8NA 3PUYE 1IXIA 3LSXA 1TT1A 5H8HA 3QK6A 3TKDA 3PV0E 4BDMA 3PGFA 2F5XA 3KEIA 5L8DA 3QAXA 2D3IA 2GRVA 5LOMA 1N04A 1VR5A 2O68A 3TODA 1B3LA 1AOVA 5I2NA 5DTBA 4G68B 4GLIA 2I0BA 5ICTA 1UTHA 2XX9A 3PPPA 1XVYA 2I3VA 2XD3A 4N07A 1N7XA 3QXMA 3RPWA 4ZZAA 1O7TA 3IO4A 1N84A 4H8JA 4POWA 2QRYA 2HFBA 4H1XA 5K2YA 2DSFA 4RY1A 3C31A 1IXGA 2G29A 4JWYA 3L6HA 4G2ZA 3H4ZA 4G68A 5JTYB 2Z8EA 3T9XB 4EQ7A 3EN3A 2F7BA 2P0SA 3E13X 3JV9A 4H6DA 1P1NA 1MDP1 1Q35A 3KN3A 3H6WA 4HW8A 1POTA 3VLWA 5A5XB 4IO6A 2XXUA 4EXKA 4LA9A 3L6GA 2O1LA 4X48A 3B6QA 4ELPA 1SQYA 4I62A 2Q2CA 4N13A 1QVSA 4WEDA 3RTFB 1MH3A 2I0CA 3MBPA 4OMBA 3IAZA 4YICA 4GFRA 3TCGA 1UIVA 1SI0A 5A5XA 4HTGA 3IX1A 1I6BA 5CI5A 1N76A 3FXUA 2VGQA 4GQOA 1LFHA 2Q89A 3LSWA 1H44A 1B51A 2WKYA 3DLNA 3V5AA 3TPAA 3G3JA 4XKRA 1US4A 4NE4A 2OCUA 4QSDA 4Z0IA 1P1QA 2XXTA 1ZIUA 1ZMGA 5TPAB 1XVXA 2IA4A 1PB8A 3MVWA 3SERA 4EDPA 3RT8A 3MJNA 2O69A 4P0GA 3LSFB 3Q29A 3O97A 5H8QB 2XXRA 4P0IA 2UVIA 3K4UA 1S9TA 1AH5A 5TPAA 2DE2A 4ZEFA 3PPNA 2ZYNA 4NF5B 4LUBA 2ZNUA 3W9WA 2THIA 4AB5A 3CG1A 4OESA 1QKBA 4ZE8A 2W7YA 1R6ZA 3CFLA 2F7CA 2DWJA 4LQ2A 3IOWA 1BKAA 4FATA 1XHYA 3KJTA 4NF4B 2F34A 4OFLA 4R2FA 3N5LA 4ZEBA 4RYAA 3K1PA 4NF5A 1M5DA 1PB9A 3E3KA 5CBRA 5CC2A 1MPBA 3TYHA 2DQVA 5FHMA 3DELB 3GBAA 3EHTA 3ZS6A 2OZZA 1JEVA 4KFQA 3G7WA 1EU8A 4GXSB 2H9BA 4QFPA 3TUSA 3FJ7A 4QFOA 3PD8A 3EQ1A 1J1NA 3OSRA 5H8FA 1RKMA 3TTNA 4JBZA 3S4UA 4XTCQ 4YB7A 5J1DA 1M5EA 1T0KA 2ANJA 3RN8A 4EXLA 1QKAA 4MBPA 3IOTA 4IY5A 3E4RA 2A5TA 4GWOA 3VFJA 2ONKE 3K02A 3TTMA 2REGA 5JK4A 3TTLA 2G93A 3O29A 2OJTA 4PFUA 3FATA 2FA7A 1FQFA 5AA4B 1QUIA 2XXQA 1YAEA 1MXVA 2Q8JA 1OLAA 3C9HA 3S9MC 3K6VA 4WKMA 4G4PA 1B32A 4RNSA 1LCTA 4PFYA 1ZLQA 3KJ7A 5H8SA 1QUKA 1USYH 1SVXB 3ILTB 3N6UA 2GHAA 2V84A 1QULA 2ONRA 1A55A 2H5YA 4KYSA 2DYXA 1MXUA 4ZEKA 3FVKA 5AA4A 2AL5A 2VP1A 2DVCA 4OXVA 1FTOA 1JQFA 2F8DA 2QJEA 4HCYA 2F6PA 1UTBB 3OXNA 4GL0A 3SESA 4DLDA 3OO6A 4GXAA 1FTKA 4KYDA 2QPQA 1OQHA 3C32A 1OQGA 5AA1A 4YKJA 2UXAA 1LB8A 3ECRA 1B40A 2HAVA 3T9UA 4F19A 3SEYA 4KQPA 3G3FA 4LZ7A 1URDA 3B6TA 2H4IA 5CMMA 1M5FA 3IR1A 4IO7A 4O3CA 4U4XA 4R75A 3IO6A 1MY2A 3O6IA 2AIXA 4YKPA 1FQDA 3K6UA 2Y7IA 4P11A 4FECA 1MY0A 5I57A 2V93A 3OO9A 3TCFA 5ITPA 1PEBA 1HSJA 2NUVA 3U8QA 1MQHA 2UYFA 2OK2A 2F97A 3QUFA 3FXRA 3H06B 1S50A 1F9BA 4MH5A 3CG3A 3MPLA 2B65A 2YLNA 1QJMA 2R9JA 2RC9A 1TWYA 4R72A 3CI8A 2RKMA 4H8IA 2DP8A 3QIMA 3VVFA 4X1DA 3DP8A 4XKPA 4TLLB 4BDRA 3OEKA 3D4GA 3G3GA 3R7XA 3IK6B 1OVBA 4PE5B 4F1UA 4DXBA 1JVYA 1B2HA 5CRYA 1II5A 4ND9A 5BUUA 4E0XA 2OWSA 4RA1A 3TELA 1PBQA 4PQJA 3G3IA 3T96B 4QRZA 2RC7A 2O1MA 2VD2A 4MF3A 3FVGA 2XXXA 1TFAA 1EH3A 1P1OA 1B5HA 2O7UA 2REJA 2OLBA 3V8XB 1Y1MA 3KOTA 5B7DA 4KCDA 2ZXTA 1LAHE 3MVYA 5KZTA 4HS7A 5I2KB 3W15C 1PDAA 2M8CA 4R6KA 1MG1A 3O66A 1MM6A 1B7UA 3ODBA 1NNFA 4H5FA 1TFDA 4DXCA 3TMGA 1P99A 3MP6A 2QMXA 1FQEA 4OWDA 3RUMA 4I9DA 4MLQA 1Z7ME 3K1MA 3R26A 4FEDA 2ABHA 5B70A 2PT2A 5KDTB 2DVZA 3M3KA 3IJXB 4MLVA 1SW5A 5I56B 3EHSA 3ILUB 1B5JA 4AB6A 2UYEA 1OVTA 4U1ZA 1D3KA 5AA2B 3K6WA 3G3KA 2Q88A 2RINA 1A8EA 3DP6A 2I4CA 1MXYA 3UA8A 4OEUA 1IZ1A 3H6TA 1VSOA 1VE4A 3E9XA 1OMPA 1NH7A 3VVDA 4E0WA 5FTIA 4NF8B 5KDTA 5I59B 4R6YA 5I56A 2PYYA 3IOUA 1R9QA 3SETA 5AA2D 4C1UA 5AA2A 3A3CA 1D9VA 5CMKA 4GRKA 2F78A 3MAMA 2XXYA 3P7IA 3HCQA 1D9YA 4PFTA 5JTYA 3HO7A 4U2RA 4DXUA 3OELA 4NF8A 5ELVA 4H67A 5I59A 2CMOA 3CVGA 4LZ5A 4I1DA 3TAJA 1Q1KA 2AYSA 3RT6B 3VXCA 3IOVA 2YPNA 4M4GA 2QS2A 2DWHA 1B1HA 2DE3A 2HCAA 3B6WA 3VLUA 1FTLA 3UP9A 1GR2A 1MY4A 1M5CA 4FEBA 1WDNA 4X9TA 3K00A 3PUWE 2DOJA 1MY3A 2CZLA 2V3TA 5DVFA 2O51A 2QMWA 2R71A 4NF6B 3T9HB 2OBGA 3TEPA 1JEUA 1LAFE 1NNKA 4YZZA 3Q27A 4LVQA 4IB2A 2O6AA 1MXZA 4IGRA 2HAUA 4OTEA 1XOCA 4OHNA 4YAHX 2QS1A 3T22A 3VLVA 3VV5A 1EZOA 3MC2A 3V83A 5L9SA 1A99A 2ESNA 3EHUA 1IXHA 3T9VA 4R9GA 3FV1A 5ISUA 3S9LC 1FQCA 1B05A 3VDFA 4G77A 3H3GA 2E1SA 1ATGA 2X26A 2DWAA 4FIMA 2HZLA 5AE4A 5H8QA 2PT1A 3RNNA 1UIUA 1BTJA 1PB7A 4F39A 1P1UA 3FASA 3RTWB 1ZU0A 4IGTA 1B58A 4RPNA 3B7DA 3FJGA 3PMXA 4KCCA 3WAFA 2O7IA 3OSQA 2QS4A 3GLBA 1LFGA 1DTGA 1A54A 4F31B 4NMYA 3G3HA 3FUZA 4EF2A 2I4BA 4BDQA 4QSEA 3MZBA 4NF4A 3KN8A 1LBCA 3QYTA 2UVHA 3C35A 1FCKA 3MP1A 4U23A 1MRPA 4F22A 1B0LA 4ZECA 3KG2A 1URSA 1B52A 4GL8A 1US5A 4IO5A 1M5BA 3W9VA 1QUJA 1NNPA 1MY1A 4YKKA 1FW0A 1GV8A 2ZMBA 4Q5TA 1GGGA 3M3FA 3U93A 3CSGA 1MXWA 1UQWA 4LONB 1PBPA 3BBRA 1R9LA 5F1QA 5I84A 1LAGE 3A09A 1MS7A 3S9NC 3SEUA 2XXVA 1GVCA 4ONYA 1RYOA 1I69A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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