1PC3A

Crystal structure of the extracellular phosphate abc transport receptor (psts-1) and immunodominant antigen of m. tuberculosis.
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
333
structure length
333
Chain Sequence
b'VATTPASSPVTLAETGSTLLYPLFNLWGPAFHERYPNVTITAQGTGSGAGIAQAAAGTVNIGASDAYLSEGDMAAHKGLMNIALAISAQQVNYNLPGVSEHLKLNGKVLAAMYQGTIKTWDDPQIAALNPGVNLPGTAVVPLHRSDGSGDTFLFTQYLSKQDPEGWGKSPGFGTTVDFPAVPGALGENGNGGMVTGCAETPGCVAYIGISFLDQASQRGLGEAQLGNSSGNFLLPDAQSIQAAAAGFASKTPANQAISMIDGPAPDGYPIINYEYAIVNNRQKDAATAQTLQAFLHWAITDGNKASFLDQVHFQPLPPAVVKLSDALIATISS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of M tuberculosis ABC phosphate transport receptor: specificity and charge compensation dominated by ion-dipole interactions.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Phosphate-binding protein 1
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule tags Transport protein
total genus 118
structure length 333
sequence length 333
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1pc3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1pc3A02
4F2OA 3LSLA 2THIA 3OSQA 3KGCA 3LBSA 3GBBA 1FQEA 1BLFA 4NF6B 4RPOA 3TMGA 3E3KA 3TYHA 1NNFA 1B51A 1USYH 1SI0A 1UIVA 4ZECA 4GVOA 2XD2A 2XXYA 3FD3A 5JTYB 3PPQA 4XXUA 4WXJA 2OLBA 1B7ZA 1Y1ZA 3KFMA 3H6TA 4IO6A 4ND9A 2BJJX 3TODA 4NMYA 4U4SA 2HAUA 5LOMA 1EZOA 3R26A 3L6GA 4GF8A 2ZYNA 1MXWA 3U94A 1N3WA 2Q89A 2Y7IA 3VFJA 3HCQA 1I6BA 5IKBA 1QUJA 2PMSA 2OK2A 4H65A 3OELA 2A5TA 1B3LA 1NH8A 3JV9A 3EN3A 3CG1A 2QL3A 3H6UA 1S50A 2F7CA 5TPAB 4Z0IA 4KCCA 3MVWA 1B0LA 2XXHA 1I6AA 4GIZA 4YB7A 4EF2A 3U72A 3KSJA 3K6WA 1SDXA 4KPTA 4LUBA 4P0IA 5L8DA 4RJZA 3AXFA 2PT1A 2ZNTA 1B9JA 1Q1KA 1QUIA 5H8SA 1PB7A 4YKKA 3K6UA 2VOZA 3K6XA 2ANJA 2R9JA 2VP1A 2OBGA 2H98A 2PT2A 3P7IA 3S4UA 3IOTA 4JWXA 1N7WA 1JW5A 2QMWA 3Q27A 4MH5A 2WKYA 4OFJA 4G2ZA 1QW0A 5H8HB 3HHGA 4BDQA 3QUJA 3IOVA 4ZZAA 2ZMBA 3G3JA 1MPBA 3V8XB 3DP8A 3S9LC 4HS7A 4F3GA 3K4UA 2XX8A 1VE4A 4LATA 1ATGA 3VLVA 4GXSB 4ZZEA 3TCGA 5TP9A 1J1NA 1AL3A 5KZTA 4YKPA 1JETA 1N76A 3SERA 3PU5A 4OESA 1IXIA 1YPNA 4OEUA 2XD3A 1AOVA 2UYFA 4UA8A 4OYVA 1GGGA 1OLAA 5ICQA 1QUKA 4LZ8A 3USDA 4THIA 2DQVA 3OOAA 5I57A 1PC3A 1FW0A 3QUFA 4KFQA 1LFIA 3FATA 3CIJA 1MPDA 1NNTA 2G29A 1M5DA 4JSDA 3EPEA 1MXXA 2I58A 4LP2B 1B3FA 5KCJB 2RC9A 5A5XB 2AL4A 3I6VA 5H8FB 3IX1A 3OXNA 5KDTB 4H67A 3WAEA 1LAHE 3RQTA 3MVXA 5FTHA 3RGYA 2QRYA 5I2KB 4YZZA 2Y7KA 1MQIA 4YMBA 3SDFA 4LQ5A 4FAJA 1T0KA 2OCUA 5DT6A 1PB8A 3U92A 1BKAA 1PEBA 1ZBMA 4IO3A 2RF1A 3EHTA 3PUYE 3L6HA 5CM6A 1WODA 1ELJA 4M1VA 5AA2B 3T93B 2XXIA 1DTZA 5H8NA 1SW5A 2Z8DA 1H76A 5IAIA 1DTGA 1ZTYA 4G8HA 5AA1A 4G77A 3PGFA 1MXYA 5CRYA 1B1HA 4X1BA 1SVXB 4O3AA 1M5BA 5DTBA 5DVFA 3EHSA 1S9TA 3N5LA 4KQPA 1I6QA 1EH3A 4PFWA 2XXTA 2AIXA 3QAXA 2YPNA 2ZYOA 3SEVA 1YTVA 1LBCA 1LGBC 5AA4B 1PBQA 1UTHB 2HAVA 1RKMA 1FTOA 2I49A 3QYTA 3SEXA 4QSCA 3Q28A 1CB6A 3K1PA 2IEEA 1N0TA 3LUYA 1ZMGA 4E0XA 4KR5A 4JDFA 3B7DA 4G8MA 2V25A 1AH5A 2Q88A 1A99A 2I48A 2O51A 3KN3A 3D4GA 4ESWA 5M2VA 1QJMA 3FJMA 1NNPA 5EHMA 3TPAA 4DCXA 3KBRA 3C36A 4UACA 2I4BA 2G93A 2Z22A 1B05A 1XOCA 2AYSA 3SESA 4P11A 2H4IA 1MY3A 3DLNA 1XVXA 3A09A 3EHUA 4KHZE 5I84A 4OENA 2ZNUA 1MQHA 4TLMB 2Q2CA 2Q9TA 4F18A 1FQDA 3K00A 3UK4A 4TLLB 4ZE8A 1Y1MA 1QKAA 4AB5A 3W9WA 3U93A 4JSOA 1OLCA 4ZEFA 1SW1A 1N04A 4WEPA 3DELB 1P1UA 1LB9A 1MY0A 4H1XA 4EQBA 1MY1A 4G68C 3PUZE 3O9PA 2XXPA 3CSGA 1MM7A 4R9FA 3FV1A 3TTMA 2XXVA 3O29A 1XC1A 2DWHA 1P99A 3B6WA 3PPPA 3O66A 4ZEKA 2F35A 4KI0E 3MQ9A 5TU0A 4NF8B 1FTMA 1EZ9A 4X1DA 3GZGA 2Z8EA 1ANFA 2V3TA 4LQ2A 2X7QA 1UTBA 1DSNA 5B70A 1POY1 4DCYA 4IO4A 4I8CA 4ZEIA 4N07A 4Q5TA 1B0HA 3OSRA 1B3GA 2FNCA 5ITOA 3PUWE 4LA9A 1H3DA 1A7LA 4NF4A 4AQ4A 3FGSA 3TAJA 2PBWA 3KJ7A 4DXUA 3TTKA 1VSOA 4RK9A 1LLSA 3K6VA 3T9HB 3GLBA 3VLWA 3MPLA 1LCFA 1VFEA 4RXLA 4FIMA 3IB2A 1Y3QA 1IEJA 4GOTA 1IUDA 3KG2A 1OQGA 3H6WA 4R6KA 4EF1A 4Z7EA 4U1ZA 3G3HA 1HSEA 1Y3PA 4R75A 3ZSFA 2E0SA 5I59B 1OQHA 4I9DA 1GTKA 4OZ9A 3U1OA 3MWBA 4MF3A 2ONSA 2F8DA 1B3EA 1M5CA 1MPCA 3KN8A 4NF6A 2DS9A 4HCYA 2H25A 1A8FA 3CFZA 1BIYA 3R6UA 3FVGA 3TTLA 2DXRA 2YJPA 4OEVA 1M5FA 4G68B 2HZKA 1IZ1A 3PMWA 3IK6B 3I3VA 4NE4A 4C1UA 4MBPA 3V89B 4EUOA 1LB8A 3S9EA 3IR1A 3PPRA 4E0WA 2I0CA 3G3IA 2I3VA 4IB2A 5HPQA 1LCTA 2F78A 4BDLA 4IY5A 3E9XA 3FUZA 1URDA 1SBPA 5EYFA 1JVYA 3H4ZA 2ALUA 4QFNA 3T9VA 5L9OA 5BWJA 4F1UA 3R7XA 4I62A 1B4ZA 2HZLA 3PPOA 4QFOA 4EXKA 5ELVA 2VD3A 1B58A 2RCBA 4RK2A 2F7BA 1MH3A 1QULA 3O28A 1NKXA 1XVYA 2OWTA 5AA3A 1FTLA 2D21A 1ZJLA 3CRBA 3GBAA 1SD3A 4RYAA 1XT8A 4C1TA 3O6HA 4F29A 4QSDA 3IJXB 4IGTA 1QVSA 1IXCA 4X48A 3G7WA 4U21A 2X26A 3PUXE 5ITPA 1FTKA 2W7YA 4H8JA 2R71A 4FORA 4NWDA 5DYHA 5K2YA 3CFXA 2Z23A 2UVIA 3EF7A 5HM4B 3TUSA 1JQFA 2A5SA 3MVZA 2XXRA 4F3BA 5CMKA 4PETA 2DE3A 3K1NA 5DEXB 5H8HA 3TCHA 1XS5A 2ZYMA 4F3SA 4FEDA 3C33A 5CBSA 1S7YA 4OMBA 4BDMA 1MG1A 3Q29A 2YLNA 4ECFA 1LFGA 3PD9A 1Y4TA 1NFTA 3VXBA 4XKQA 1A40A 4WKMA 2H9BA 4MLVA 3K01A 2LAOA 1I69A 3RLFE 4GL8A 2O7UA 4DDDA 3O6GA 5F1QA 5CI5A 3H6VA 5I2NA 1HSLA 5H8NB 1H43A 4YKJA 3N26A 1HSJA 1NNKA 3MP1A 3MP6A 4RPNA 1SYHA 1TXFA 2VHAA 4Q30B 4R73A 4F1VA 1B40A 4H8IA 4ELRA 5KCJA 2GHBA 5A5XA 4KYDA 3WAFA 5H8FA 2ZYKA 3KOSA 4QSEA 5KDTA 2RINA 3E4RA 2QS4A 4U22A 3N94A 3IO6A 1JNFA 4ZE9A 5I2KA 1R9LA 4HTGA 1DPEA 1MRPA 1IXGA 1VR5A 1SI1A 3BBRA 1AIVA 5AA2A 2KLFA 5BUUA 5H8QA 4TOZA 1MDQA 2GH9A 3K0VA 4POXA 3LC8A 2UVGA 2B3FA 4YICA 2F5XA 3MZ9A 3W9VA 1Y20A 3UA8A 2ZNSA 4QFKA 3MZBA 4OWDA 4GWOA 1OVTA 3SEUA 3T66A 1B7UA 2Q8JA 5AE4A 2I0BA 3QIMA 5I56B 2NOOA 2PVUA 4G4PA 4R9GA 2OZZA 2P0SA 3CI8A 4Q8RA 1UQWA 3B6QA 1NH7A 2D3IA 1GR2A 1D9YA 3IB0A 4N6PA 1IQ7A 4GFRA 3C9HA 4PP0A 3ILUB 2XXQA 4GXAA 4M4GA 2DE4A 1B5HA 1SW2A 3DP4A 3H3GA 1OVBA 3OENA 1B7HA 3HV1A 4QRZA 3VE1B 4TQUQ 3VVEA 4JXIA 2RCAA 4R2FA 4X9TA 1WVJA 2B65A 1TFAA 3QSLA 1SW4A 4YKIA 3PD8A 5AA2D 2X7PA 1N3XA 3SEWA 1EZPA 2DWJA 1FTJA 4PFTA 4OTEA 2QS3A 2B3BA 4FECA 2F6GA 4F2QA 2OJTA 1TFDA 4POWA 2E1SA 3M3KA 3I5OA 4GD5A 3Q25A 2F36A 2ZXTA 1B32A 2XHDA 3CR9A 1UTBB 5FHOA 4U4XA 2O1LA 2DP8A 3JZJA 3OO8A 4U23A 3K1MA 4XIGQ 3IOUA 3ODBA 4DLDA 3DM0A 1US4A 1MXVA 1B5IA 1LAFE 4NF4B 1VFDA 4R72A 3MAMA 4LVQA 1POTA 4YB5A 5I58A 2F97A 2O84X 2Z8FA 3FJGA 1USYE 4FEBA 4ZDMA 1L5TA 3H7MA 5K2XA 4OETA 3TFLA 1XHYA 1JW1A 2R6GE 1M5EA 3RPWA 4IO5A 1B3HA 4NF5A 1II5A 4NEDA 3F11A 2NUVA 1BTJA 1F9BA 4O3CA 5CBRA 1IITA 3IORA 3ZKLA 1MS7A 2H99A 4GQOA 4DZ1A 2M8CA 4F39A 4ISUA 1PDAA 3SKPA 2HEUA 4IGRA 4NTLA 3UP9A 4H6DA 1H45A 1LAXA 4I1DA 1FCKA 4KYSA 2DE2A 1BP5A 4ESXA 4HCWA 2DVZA 2F34A 3KOTA 1IIWA 1LFHA 4MFIA 4YMAA 1D9VA 2REJA 3V83A 3MC2A 3FJ7A 2V93A 3RNNA 1MXUA 3OMBA 3VXCA 4FE8A 1US5A 1ZU0A 1NL5A 4JB7A 4YB6A 3BFTA 5B7DA 2A5TB 4JWYA 4HW8A 1AMFA 5CMBA 2HXWA 2UVJA 5JTYA 4DE8A 2ABHA 4RNSA 3TEPA 4OHNA 2DXYA 3RY3A 5I59A 3OO6A 1NMUA 1P1QA 3QK6A 4DXCA 1MQJA 3H06B 1D4NA 5FHNA 3TQLA 1DPPA 3ILTB 1TWYA 4G68A 2QS1A 5HBCA 1B6HA 4OVJA 1JW4A 3C32A 3MUQA 3N6UA 5DVIA 1H44A 1TT1A 3O6IA 4RY1A 2O7IA 1PB9A 5ICTA 2I3WA 3RTWB 3V5AA 3TQWA 3TCFA 1URGA 3CFLA 4ZEBA 3HPIA 4F3PA 3BFUA 2DOJA 2RC7A 5TPAA 2HCAA 1JVXA 3ECRA 1Y3NA 3VV5A 3GXAA 3EQ1A 1IXHA 1Y4CA 3UORA 4N13A 3PMVA 3H03A 2XXWA 2CMOA 5TP9B 3FV2A 4BDRA 2GHAA 2FYIA 4F1YA 4PFUA 2NXOA 3TDJA 4BDOA 2XXXA 4U2RA 2REGA 3OEMA 2Q2AA 4OFOA 1R6ZA 1O64A 2RKMA 1B52A 3K02A 2ESNA 4FJPA 3QXMA 4R6HA 5J1DA 4PQJA 1FQCA 3OO9A 4KYEA 3S2VA 3TTNA 5I57B 1P1WA 1B46A 2QJEA 3RN8A 3B6TA 4F31B 1DOTA 1B4HA 4H0WA 4PFYA 4OQOA 1LBBA 2Y7WA 3O97A 2DWIA 3E13X 4EQ7A 5ISUA 4QFPA 4RA1A 4XKNA 3T9UA 1OIBA 3M3LA 3FVOA 3U8QA 1N7XA 4P0GA 5I2NB 4QFLA 2UVHA 4MLQA 2I6EA 2UXAA 2QMXA 3KEIA 2Y7RA 1WDNA 3FVNA 1JEVA 5DEXA 1P1OA 4BLAA 2D5WA 2IA4A 5L9MA 2F7AA 3FXRA 3HO7A 1D3KA 3G3GA 3UIFA 3VVFA 2GRVA 3OD7A 4IO2A 1JEUA 3IL1B 1FQBA 1UIUA 1B1XA 1ZIUA 3VLUA 1B2HA 5CMCA 3OEKA 1R9QA 1R1NA 5JK4A 5JEIA 3C31A 3KSXA 3T96B 4LONB 5FTIA 3RT8A 2QPQA 5DVJA 1MDP1 2I4CA 4QHQA 1SQYA 3A3CA 3PPNA 2O6AA 3PUVE 3M8UA 4Q0CA 5H8QB 1A54A 1Y9UA 1Q35A 3JYRA 1EU8A 1MM6A 3Q26A 5CMMA 1FQAA 2AL5A 2XX9A 3K2DA 4XKPA 3MPKA 1URSA 3ZS6A 5CC2A 2OWSA 1DMBA 2HFBA 3VDFA 3ZKKA 3T22A 2VD2A 3BKIB 3KZGA 2O1MA 1PBPA 3UN6A 2O68A 1P1NA 3TTRA 4XKRA 1B5JA 2DSFA 4DXBA 1LSTA 2P2AA 3O2AA 4ELQA 3IJOB 2RC8A 2XXUA 1N84A 5EHSA 2V3UA 2F6PA 3IB1A 1MQGA 4GL0A 4OXVA 5FHMA 4EXLA 5AA4A 3T9XB 5L9SA 1UTHA 2QSXA 2P1SA 3SETA 3MBPA 3HSTA 3CSBA 4F22A 2DWAA 3LSFB 1FQFA 2UYEA 4FATA 4O3BA 2H5YA 4BDNA 3W15C 3PMXA 3FVKA 3CG3A 2GFEA 4YU0A 3RTFB 4IY6A 1GV8A 2V84A 4C0RA 3G3FA 5F7VA 1CE2A 4EDPA 1Z7NE 2FA7A 5I56A 2NVUB 4R74A 1ZLQA 3UGWA 3FIRA 3C4MA 4GLIA 1O7TA 4LZ5A 3FXUA 4WEDA 3LR1A 2PYYA 4R2BA 4KD5A 1ZKBA 4QF9A 2ONKE 3TZAA 3HN0A 4L17A 1Z7ME 2NWJA 3G3KA 1YCJA 3ONMA 3N6TA 3OO7A 4YAHX 3TELA 1O63A 2PX1A 3MW0A 4U1OA 4ELOA 4GRKA 1MY4A 4K3FA 1A8EA 3MVYA 3FASA 4H5FA 3IOWA 1MH4A 3HHFA 1RYXA 2CZLA 1QKBA 2VGQA 3FZVA 4JBZA 1A55A 1KWHA 2Y7PA 4DIGA 3IO4A 4R6YA 3FXQA 1YAEA 5I58B 4LZ7A 3VVDA 3PV0E 3S9NC 2XX7A 1MY2A 3C35A 2Y84A 4EQ9A 2HQ0A 4ONYA 3RUMA 4PE5B 3S9MC 2ONRA 4NF5B 2QS2A 3SEYA 4AB6A 3A3UA 3MZ1A 1SYIA 3RT6B 4H5GA 4XTCQ 4IO7A 1OMPA 3MJNA 3KJTA 4NF8A 3TKDA 3IAZA 4G8NA 3KN7A 4NWCA 1GVCA 1MQDA 1LAGE 3LSWA 3DP6A 4ELPA 3MP8A 3LSXA 4ZS9A 4F19A 3C34A 1MXZA 4OERA 3D4CA 3THIA 2V3QA 3CVGA 4KCDA 4JWOA 2O69A 4ZEDA 2DYXA 3M3FA 1RYOA 4OFLA 2DVCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3BIHA 4F2OA 3LSLA 2THIA 4AS4A 3OSQA 3KGCA 3LBSA 4O94A 3GBBA 1FQEA 1BLFA 4NF6B 1DK4A 4GWYA 4RPOA 3TMGA 1INPA 4P1EA 3E3KA 3TYHA 4PF6A 1NNFA 1B51A 1USYH 1SI0A 3E78A 1UIVA 4ZECA 2WYKA 4GVOA 1LBYA 2XD2A 2BJIA 2XXYA 3FD3A 4NHBA 5JTYB 3PPQA 4XXUA 4WXJA 2OLBA 1B7ZA 1IMFA 1Y1ZA 3KFMA 3H6TA 4IO6A 4ND9A 2BJJX 3TODA 4NMYA 1LBVA 4U4SA 2HAUA 5LOMA 1EZOA 3R26A 4NG7A 3L6GA 4GF8A 2ZYNA 1MXWA 3U94A 1N3WA 4I3EA 1FSAA 2Q89A 1QGXA 2Y7IA 5LDZA 3VFJA 5F24A 3HCQA 1I6BA 5IKBA 1QUJA 1FBHA 2PMSA 2OK2A 4H65A 2WX9A 3OELA 3T1BA 5IGAA 2A5TA 1B3LA 3KC1A 3ISPA 1NH8A 3JV9A 3EN3A 3CG1A 2QL3A 3H6UA 2ZZWA 4N17A 1S50A 2F7CA 5TPAB 4Z0IA 4KCCA 3MVWA 1B0LA 2XXHA 1I6AA 4GIZA 4YB7A 4EF2A 3U72A 3KSJA 3K6WA 1SDXA 4KPTA 4LUBA 4P0IA 5L8DA 4RJZA 3AXFA 2PT1A 2ZNTA 1B9JA 1Q1KA 1QUIA 5H8SA 1PB7A 1LBZA 4YKKA 4JVCA 3K6UA 2VOZA 3K6XA 2ANJA 2R9JA 4MAGA 2VP1A 2OBGA 2H98A 1FPBA 2PT2A 1FBDA 3P7IA 4MJOA 3S4UA 3IOTA 2CEYA 4JWXA 1N7WA 1JW5A 2QMWA 3Q27A 4MH5A 2HXRA 2WKYA 4OFJA 4G2ZA 1QW0A 5H8HB 3HHGA 4BDQA 1DBZA 3IOVA 3QUJA 4ZZAA 2ZMBA 3G3JA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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