1PC3A

Crystal structure of the extracellular phosphate abc transport receptor (psts-1) and immunodominant antigen of m. tuberculosis.
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
333
structure length
333
Chain Sequence
VATTPASSPVTLAETGSTLLYPLFNLWGPAFHERYPNVTITAQGTGSGAGIAQAAAGTVNIGASDAYLSEGDMAAHKGLMNIALAISAQQVNYNLPGVSEHLKLNGKVLAAMYQGTIKTWDDPQIAALNPGVNLPGTAVVPLHRSDGSGDTFLFTQYLSKQDPEGWGKSPGFGTTVDFPAVPGALGENGNGGMVTGCAETPGCVAYIGISFLDQASQRGLGEAQLGNSSGNFLLPDAQSIQAAAAGFASKTPANQAISMIDGPAPDGYPIINYEYAIVNNRQKDAATAQTLQAFLHWAITDGNKASFLDQVHFQPLPPAVVKLSDALIATISS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of M tuberculosis ABC phosphate transport receptor: specificity and charge compensation dominated by ion-dipole interactions.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transport protein
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule keywords Phosphate-binding protein 1
total genus 118
structure length 333
sequence length 333
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1pc3A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1pc3A02
4P0IA 1WVJA 5FTHA 3G3HA 2X26A 3MW0A 4U21A 1B40A 5DVFA 1D3KA 3U1OA 3OEKA 1SW5A 4TLLB 4BDRA 4GWOA 3I3VA 4YU0A 1B3LA 3C34A 2E0SA 3TTMA 3Q25A 4OVJA 3V8XB 1EU8A 2THIA 5AE4A 2PVUA 1NMUA 4OQOA 1P1WA 2DWHA 4H0WA 4EF2A 1JEUA 2DQVA 3IL1B 4EDPA 1SW4A 3C35A 3TFLA 2YLNA 5DEXB 3PPQA 2I4CA 4ZZAA 1I6AA 1MQDA 1ZTYA 4QFPA 1OMPA 2Q9TA 1MY4A 1NNTA 4NF8A 4GD5A 1AOVA 4I1DA 3K6VA 1O64A 4E0WA 3R7XA 3KN7A 1FTKA 2M8CA 3TDJA 1M5CA 3TPAA 1SI0A 2ONKE 1Q1KA 4QSCA 3RT8A 1B05A 3PMWA 2PYYA 4NE4A 4KYDA 3TTLA 2GFEA 3QIMA 1GGGA 4FEBA 1BKAA 3R26A 1ZJLA 3RT6B 3H6VA 3BFTA 4QFKA 1GV8A 2I0BA 2VHAA 4OTEA 5AA2A 2Q88A 1JETA 3ZKKA 3PPRA 5I58B 1LBCA 3C32A 4YAHX 2AL4A 4M4GA 5KDTA 1B4HA 3KZGA 3U72A 5IAIA 3VVDA 4ELQA 1TFDA 3TAJA 3MZ1A 4RPNA 3CI8A 3UORA 4N6PA 5EHSA 2B3FA 1SI1A 4U23A 5DVJA 3VE1B 5H8QB 1S9TA 4U4SA 4BDMA 1OQGA 1Z7NE 3CVGA 1AIVA 1LSTA 1QUKA 3OOAA 1B7UA 2Q8JA 2HCAA 4OFLA 1H45A 3M3KA 1WODA 2DE3A 2QPQA 4GOTA 3MP6A 2XX8A 3MZBA 4THIA 3ZSFA 3W9WA 3EPEA 1B58A 3B7DA 4Q0CA 5ICTA 2HXWA 5L9MA 2O68A 1YAEA 4LQ2A 1JEVA 2Y7RA 2QMXA 1PB8A 3PUVE 3T9UA 1TWYA 3MVXA 3RTWB 3O6HA 5A5XB 3HHFA 4XXUA 4WEPA 2GRVA 2ZXTA 3VLVA 2AIXA 2I49A 1AH5A 4RK9A 5DEXA 3P7IA 2DVCA 3O6GA 1P1QA 4ECFA 5JK4A 2H4IA 2NXOA 1N3XA 3DP4A 4NTLA 4P11A 5K2YA 2HZLA 3SEVA 2O7IA 1IZ1A 4QFOA 4ND9A 5FTIA 4IGTA 4KYSA 4XKRA 4O3BA 1XC1A 3FXQA 4BLAA 3HN0A 3G7WA 3MC2A 4IO3A 2Z8DA 1FTOA 4QFLA 2B3BA 3QYTA 4GF8A 1TT1A 4JB7A 1WDNA 4TLMB 3U93A 1POY1 4GRKA 4R75A 3K6WA 2DWIA 1MXYA 2XXUA 3H06B 1ZBMA 2FYIA 3TELA 5B70A 5I58A 2F36A 3KEIA 3MUQA 3FJ7A 4NF4B 1H44A 1XT8A 4TQUQ 4IB2A 4C1UA 3CR9A 3E3KA 5TP9B 2XXTA 3TYHA 5DT6A 2Z23A 3KOSA 4MLQA 1LCFA 4ONYA 4Z7EA 1JW1A 4ZEBA 3GBBA 4DCYA 4DCXA 2PBWA 3O97A 4F19A 4OESA 1FTMA 2DOJA 5TU0A 4KYEA 3S9MC 2VD3A 1GTKA 1MPDA 4U22A 1R1NA 5H8QA 4DXCA 2IA4A 2RKMA 1A55A 3OD7A 1QKAA 1A99A 3CG3A 2XXVA 3TCGA 4WEDA 2O84X 1OLCA 5CMCA 4G68B 2QS1A 3U8QA 2XXXA 1N7WA 5HBCA 2Z22A 1LAGE 4YMBA 1CB6A 2ALUA 4G8MA 1OQHA 3K4UA 4X48A 3T96B 4OXVA 3I5OA 4R2BA 1P99A 5H8FB 5K2XA 1HSLA 1MPBA 4R6YA 4OENA 4DXBA 5L9SA 4ISUA 3Q28A 1B0HA 4NF5B 5F1QA 1MY0A 1LFHA 5IKBA 3TZAA 3OENA 3KGCA 5CBSA 3QK6A 3CFZA 2ESNA 3C36A 3BFUA 4OEVA 4E0XA 3MJNA 2Y84A 3TODA 4IO4A 5CBRA 4MF3A 1FQDA 1FCKA 1POTA 3TQWA 1L5TA 1BIYA 3Q29A 4EQ9A 1D9VA 3EHSA 4XKPA 3DP6A 2F7AA 3ONMA 3PUYE 1NNFA 2PX1A 2PT2A 1B6HA 2ZMBA 4GFRA 3FZVA 1MQIA 1OVTA 3RY3A 3JYRA 3OXNA 4Q5TA 2I4BA 4JBZA 4EUOA 3VLUA 4MLVA 2UXAA 3TEPA 1B5JA 2V3QA 4LP2B 2HEUA 3SEXA 4OFOA 3UK4A 1UQWA 3S2VA 4BDNA 1LAXA 4QSDA 3FV2A 2XXHA 1JVYA 3IAZA 2I6EA 2H5YA 4DZ1A 1SBPA 2DS9A 4IO6A 3KBRA 3OO8A 1MQGA 4NF4A 1SDXA 2F8DA 4MBPA 3WAFA 5TP9A 4ELRA 4PE5B 4XTCQ 2XXWA 5CI5A 3MVWA 2O6AA 1URSA 3MVZA 1EZ9A 1NNPA 4IGRA 2REGA 3DELB 5ELVA 3LBSA 1B52A 3PUXE 4YMAA 3HV1A 4FAJA 1ZIUA 3VLWA 2ONSA 3O6IA 1Y3NA 3FIRA 4F3GA 4AB6A 2DP8A 4F31B 4LZ8A 1DOTA 2X7PA 4LATA 4YB5A 1H3DA 3BBRA 4KQPA 4F22A 4ELPA 2OJTA 3IO6A 4BDOA 1B32A 1R9LA 3L6GA 4FATA 4Z0IA 2VOZA 5H8FA 4GXAA 3HSTA 5I2KB 4LONB 1RYXA 2OZZA 1Y3QA 2ONRA 4NWDA 3TQLA 1YPNA 3MAMA 4NF5A 1IEJA 1IITA 3V89B 3VV5A 4LUBA 2XXPA 2H98A 2Y7PA 1B1HA 2F78A 4ZE9A 3JV9A 5TPAA 1S7YA 3O28A 2FNCA 2F6GA 1KWHA 3IOUA 1NH7A 3B6QA 5J1DA 1B1XA 1A40A 1HSEA 3UP9A 2UYEA 2A5TB 3FUZA 4GXSB 1MH4A 3LSXA 4M1VA 4R6KA 5CM6A 2IEEA 3Q26A 3N6TA 5ISUA 4OEUA 4OYVA 1QW0A 1LAHE 4JSOA 4PP0A 4OFJA 4ZEDA 3E13X 3K6XA 3T93B 3PD8A 1IXGA 2AYSA 2D3IA 2HQ0A 3IO4A 3U94A 3QAXA 4Q8RA 1Y3PA 5AA4B 5H8HB 1UTHB 3SEUA 4Q30B 3O29A 4F3BA 2OK2A 3UN6A 3CG1A 2ZYOA 1LB8A 5I56B 4PFTA 4F39A 4FE8A 1NFTA 3ILUB 1OVBA 4OWDA 1FQFA 1IXIA 3IJOB 3FXUA 1ANFA 2UYFA 1CE2A 1UTBB 4N07A 4YKIA 3C4MA 1J1NA 4JWOA 4RXLA 3OSQA 5KCJB 5L9OA 1DMBA 1N0TA 3Q27A 4RK2A 4G2ZA 1OLAA 1ZU0A 1D9YA 2ZNSA 1MXZA 2H9BA 2WKYA 3L6HA 4DIGA 1B3HA 3PU5A 3G3GA 1QJMA 1BP5A 2OLBA 3MPKA 2QSXA 3I6VA 3PPOA 3DM0A 3TTRA 3RPWA 3H6UA 3OMBA 4H8JA 3E9XA 4ZZEA 1LFGA 3IK6B 2W7YA 3OEMA 3VXCA 5FHOA 2Q2AA 4JXIA 1XOCA 3PV0E 4X1BA 3O9PA 1MXVA 1A7LA 3VVEA 3B6WA 4FIMA 2ZNTA 4H5GA 3GBAA 3M3LA 3LR1A 4GIZA 1EH3A 4BDQA 4DXUA 2DE2A 2F6PA 3E4RA 3KN8A 3K2DA 3QUFA 3D4CA 5CC2A 1Y4TA 4YICA 2CZLA 3TTNA 2GH9A 4R2FA 3LSWA 4KFQA 1QULA 1EZPA 2RF1A 3KSXA 3MPLA 3ECRA 2H25A 2DWJA 1H43A 4ZE8A 3HCQA 5CMBA 2D21A 5HPQA 2R9JA 4YZZA 1SYIA 1Q35A 1QVSA 3T9VA 4IO5A 3K1MA 2I3VA 1US5A 1MM7A 1B3GA 2A5TA 4H1XA 2QMWA 1N84A 5I84A 1USYH 5M2VA 5DTBA 3EQ1A 4QFNA 5CMMA 4EQ7A 1R6ZA 1UIUA 4R73A 1DTZA 3T9XB 5I2NB 4MH5A 3HO7A 5H8NB 3G3KA 3GLBA 5AA4A 2Y7IA 4IO2A 2PT1A 1UTHA 3FV1A 2RINA 1ZLQA 4R6HA 1B7HA 4ELOA 1FQBA 1MS7A 3H7MA 2CMOA 1VR5A 1JNFA 2V3TA 4PETA 5I56A 1PDAA 4EXLA 2DWAA 2XX7A 1VFEA 4EF1A 1UTBA 4L17A 4PFYA 4R72A 1SVXB 1MQJA 1N76A 2ZYKA 3FVOA 1XVXA 3EHTA 2XX9A 3K1NA 3FXRA 2HAUA 4F3PA 4C1TA 4TOZA 1TFAA 3UA8A 1MY2A 3C31A 4NEDA 1LCTA 4QSEA 1GR2A 1MG1A 1A54A 2NOOA 4RA1A 3R6UA 2XXQA 3THIA 4O3CA 3GZGA 3N94A 1DTGA 2PMSA 2V93A 1LB9A 1FQEA 1XS5A 3K0VA 4HCYA 4I8CA 4NF6B 3FATA 2I0CA 2F34A 3KFMA 3A3CA 4F2QA 4OETA 2R71A 1FTLA 4JSDA 5A5XA 2NVUB 5HM4B 1LLSA 2OBGA 4RY1A 2NWJA 5EYFA 5DVIA 3MWBA 1SW1A 3G3FA 1B51A 3MP1A 1Y4CA 5EHMA 1A8FA 2VD2A 1SYHA 1B3FA 1B46A 4KPTA 2RCAA 2QJEA 3RQTA 1B7ZA 4YKKA 2FA7A 3TUSA 3RUMA 2AL5A 2QS3A 3IB1A 1F9BA 4F29A 3IB2A 4H8IA 1MH3A 3UIFA 3PPPA 3D4GA 3MBPA 4BDLA 1P1OA 1NNKA 5KDTB 3RTFB 3N26A 1MM6A 5I2NA 5H8NA 2VGQA 4JWXA 2ZYMA 3S9NC 3SETA 4F18A 2ANJA 4U4XA 4EQBA 1B2HA 1MDP1 3TCFA 3IOWA 1RKMA 1M5FA 4XKQA 2REJA 3FVGA 2F35A 1JQFA 2F7BA 3K02A 4G4PA 2XXRA 1GVCA 4XIGQ 3SDFA 3TMGA 1PB9A 1BTJA 1Z7ME 2F97A 4O3AA 3C9HA 4G8NA 2UVHA 1NH8A 1MRPA 5LOMA 5KZTA 4U2RA 3CRBA 1URDA 3IR1A 2YPNA 1XHYA 4G68A 4KCDA 3H3GA 4ZS9A 4NWCA 3TCHA 3IOTA 3CFLA 3CFXA 4KHZE 4F3SA 1AMFA 4F1VA 3M8UA 4AB5A 3IJXB 2DE4A 2F5XA 1A8EA 3K01A 1RYOA 1MY3A 1B0LA 2P2AA 1IXCA 4ESWA 3GXAA 4N13A 1OIBA 2RC9A 3DLNA 3FVNA 1MQHA 1O7TA 2NUVA 4NF6A 4X9TA 3DP8A 1N7XA 2QRYA 3W9VA 4QHQA 2O1LA 4POWA 5I57B 3MZ9A 2H99A 3ILTB 1LFIA 5F7VA 4PFUA 1HSJA 2GHAA 2QS2A 1QKBA 3M3FA 1PBQA 4MFIA 4G8HA 4PQJA 4HCWA 4IY6A 3FGSA 3VVFA 1Y1ZA 1EZOA 4LVQA 3KSJA 3RN8A 1N3WA 1P1NA 3U92A 3H4ZA 3MP8A 3RLFE 2P0SA 3OO7A 3PPNA 1S50A 4R9FA 4R74A 2ZNUA 4DDDA 4FECA 2E1SA 2RC7A 4GL8A 3PD9A 2DYXA 4KD5A 2RC8A 5FHNA 5L8DA 2KLFA 1FQCA 3H6TA 1B5IA 3K00A 1PB7A 2O51A 1MXWA 1VFDA 2XXIA 5JTYB 3LC8A 5BUUA 3FVKA 1I6QA 3IOVA 4YB7A 4OERA 3PGFA 3LSFB 3HHGA 2UVJA 3EHUA 3PMVA 4WKMA 4HW8A 4ESXA 2B65A 2HFBA 3WAEA 2BJJX 3K1PA 4LZ5A 5CMKA 3IB0A 1SW2A 4RPOA 1II5A 2OWSA 5DYHA 3C33A 2R6GE 1YTVA 3PMXA 3A09A 2Z8EA 3K6UA 3T66A 1MXUA 4DLDA 4ZECA 1URGA 2G29A 1BLFA 1NL5A 4DE8A 4WXJA 2GHBA 1ATGA 3OO6A 5I59B 2UVGA 4RNSA 4ZEKA 2OWTA 2ABHA 3V83A 4UACA 3FASA 3QUJA 1MXXA 5I2KA 2V3UA 2ZYNA 1PC3A 5AA3A 4H67A 4RJZA 2RCBA 3SEYA 2I58A 2Y7WA 1YCJA 2I3WA 3PUZE 3MVYA 4G68C 1US4A 4H5FA 3IORA 2O1MA 4IY5A 5I57A 4ZEIA 4POXA 1P1UA 4X1DA 2LAOA 1USYE 3N5LA 2X7QA 3JZJA 3T22A 1M5BA 5H8SA 3H6WA 1IQ7A 4KCCA 3SKPA 3EN3A 1LAFE 4H6DA 4OZ9A 5ITOA 3VFJA 3BKIB 1ELJA 4F1UA 2DSFA 3USDA 1PBPA 4IO7A 5H8HA 5AA2D 1XVYA 4ZDMA 3ZKLA 1Y9UA 4YKJA 3F11A 3OO9A 2UVIA 5BWJA 2O69A 3OSRA 2DXYA 4FORA 1D4NA 1FTJA 4K3FA 4G77A 4UA8A 1T0KA 1Y20A 2XD3A 1IXHA 2XHDA 3VXBA 1B5HA 1SD3A 1UIVA 1QUJA 1ZKBA 4GL0A 2D5WA 1LBBA 5JTYA 3CSBA 4C0RA 3ODBA 2Y7KA 3KJ7A 5KCJA 4ZEFA 2V25A 1JW4A 3G3JA 3FJGA 5AA1A 1PEBA 2QL3A 1I69A 4OHNA 1I6BA 3N6UA 1M5EA 4R9GA 5ICQA 4LZ7A 3OELA 4GVOA 4XKNA 2OCUA 4I62A 3LSLA 2XXYA 1LGBC 1VE4A 2V84A 2VP1A 3CIJA 1B9JA 1QUIA 4GQOA 3AXFA 1IIWA 1B4ZA 2HZKA 3KN3A 4JWYA 4HS7A 2DVZA 4FEDA 4HTGA 4NF8B 2QS4A 4YB6A 5I59A 3RNNA 2Z8FA 5TPAB 3FD3A 5B7DA 3QXMA 2HAVA 1JW5A 1DSNA 2Q2CA 4QRZA 1MDQA 1FQAA 1Y1MA 2P1SA 1O63A 1M5DA 3W15C 1SQYA 3G3IA 4LA9A 4EXKA 1AL3A 4AQ4A 2I48A 4PFWA 3H03A 3S9LC 3HPIA 3PUWE 4LQ5A 4OMBA 1R9QA 3SERA 4KI0E 3KG2A 2YJPA 4YKPA 1DPPA 2XD2A 5CRYA 5AA2B 2Q89A 3VDFA 4NMYA 1NKXA 3S4UA 3EF7A 1N04A 3B6TA 2A5SA 3TTKA 3O2AA 3MQ9A 1TXFA 3FJMA 3UGWA 5JEIA 1DPEA 3QSLA 3RGYA 3SEWA 5FHMA 1MY1A 3TKDA 4RYAA 4F2OA 1ZMGA 4QF9A 3CSGA 1MPCA 3V5AA 2F7CA 4KR5A 3SESA 3T9HB 4P0GA 4JDFA 2O7UA 3KJTA 1B3EA 1FW0A 3ZS6A 1JVXA 2DXRA 4F1YA 3S9EA 3A3UA 5ITPA 4U1ZA 1H76A 4U1OA 2G93A 4H65A 3LUYA 4I9DA 3IX1A 4GLIA 3KOTA 4FJPA 1VSOA 3O66A 1IUDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4P0IA 1WVJA 4QXDA 5FTHA 3G3HA 2X26A 3MW0A 4U21A 4P3LA 1B40A 5DVFA 1D3KA 3U1OA 3OEKA 1SW5A 4TLLB 3B8BA 4BDRA 2XA5A 4GWOA 4AS5A 3I3VA 4OA4A 4YU0A 1B3LA 2ZZWA 3C34A 2E0SA 3TTMA 3Q25A 4OVJA 4P9KA 4MHFA 3V8XB 1EU8A 2THIA 5AE4A 2PVUA 1NMUA 2PFYA 4OQOA 1P1WA 2DWHA 4H0WA 4EF2A 1JEUA 2DQVA 3IL1B 4EDPA 1SW4A 3C35A 3TFLA 2QVRA 2YLNA 4MNPA 2Q74A 5DEXB 3PPQA 2I4CA 4ZZAA 1I6AA 1MQDA 1ZTYA 4QFPA 1OMPA 2Q9TA 1MY4A 1NNTA 4NF8A 4GD5A 1AOVA 4I1DA 1LBWA 4GWUA 3K6VA 1VDWA 1O64A 4E0WA 3R7XA 3KN7A 5EQAA 4N91A 3RPLB 1FTKA 2M8CA 3TDJA 1M5CA 3TPAA 1SI0A 2ONKE 4P47A 1Q1KA 4QSCA 3RT8A 1B05A 3PMWA 2PYYA 4NE4A 4KYDA 4MX6A 3TTLA 2GFEA 3QIMA 4N15A 1GGGA 4FEBA 1BKAA 4PBQA 3R26A 1ZJLA 3RT6B 3H6VA 3BFTA 4QFKA 1GV8A 4DI3D 2I0BA 2VHAA 4OTEA 5AA2A 2Q88A 1JETA 2FVZA 3ZKKA 1D9QA 1EYKA 3PPRA 5EYGA 5I58B 1LBCA 3C32A 3E79A 4PCDA 4YAHX 1K9YA 2AL4A 4M4GA 5EQ9A 5KDTA 1B4HA 3KZGA 3U72A 4PF8A 5IAIA 3VVDA 2ZZXA 4X8RA 4ELQA 1TFDA 3TAJA 3MZ1A 4RPNA 3CI8A 3UORA 4PC9A 4PGPA 4N6PA 5I7IA 5EHSA 2B3FA 1SI1A 4PF6A 4U23A 5DVJA 3VE1B 5H8QB 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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