2XXYA

Crystal structure of the gluk2 (glur6) d776k lbd dimer in complex with kainate
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
248
structure length
248
Chain Sequence
SLIVTTILEEPYVLFKKSDKPLYGNDRFEGYCIDLLRELSTILGFTYEIRLVEDGKYGAQDDVNGQWNGMVRELIDHKADLAVAPLAITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVEDGATMTFFKKSKISTYDKMWAFMSSRRQSVLVKSNEEGIQRVLTSDYAFLMESTTIEFVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPMGSPYRKKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWW
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 2
publication title Conformational Flexibility of the Ligand-Binding Domain Dimer in Kainate Receptor Gating and Desensitization
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein
total genus 80
structure length 248
sequence length 248
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-11-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xxyA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2xxyA02
1PB7A 3CSGA 1DTZA 2QRYA 1NH7A 4MLQA 4RPOA 3IJXB 2DYXA 4RK9A 3K4UA 1QUKA 4U1OA 4QFLA 5F7VA 4LZ8A 1II5A 1LGBC 3K01A 4I9DA 2VD2A 4PFYA 3BFUA 1R6ZA 4EXLA 3T96B 3C32A 1SDXA 4GXAA 3FVGA 3SEYA 3OELA 1QW0A 3GBBA 3CFLA 3RUMA 1R9QA 3Q26A 1XVYA 3O66A 2XXIA 3LSFB 2F78A 3FUZA 3RPWA 1NL5A 3VLVA 1MY3A 1CB6A 1A54A 1M5CA 2O68A 3MP1A 2V25A 1DPEA 5ICTA 4F3BA 4K3FA 1N0TA 1MPCA 4GD5A 3RGYA 4QFPA 2O84X 3HO7A 2UVGA 3O97A 3RQTA 1B51A 2R9JA 2H25A 3CG3A 2XD2A 1FCKA 2DE2A 5I2KA 3Q28A 3H6VA 1N3WA 3U94A 2NWJA 5CBSA 2P1SA 2E1SA 1ZLQA 4G8NA 4IGRA 5KDTB 5IKBA 1SW1A 4LQ2A 2XXQA 1B5JA 4R9FA 3T9HB 4DCXA 4O3BA 1OVTA 4MFIA 3TQWA 4RYAA 1TT1A 5FHMA 1B3HA 2PT2A 1DOTA 3SESA 4F22A 4ESXA 3N6TA 5CMBA 2CMOA 4LQ5A 3VXBA 2DVCA 1N3XA 1Q1KA 2UYEA 2Z8EA 3FVNA 2Y84A 3TTNA 4XIGQ 3K00A 1SVXB 2A5SA 3TODA 1MPDA 2O7IA 1D9YA 2M8CA 2ONSA 5TPAB 3G7WA 1IZ1A 2GH9A 4Q0CA 3E13X 4NEDA 2ZNUA 2REGA 4QSEA 1A40A 2GHBA 3TUSA 3TFLA 4GXSB 4FATA 1M5BA 2CZLA 4ECFA 4C1UA 1D4NA 5DTBA 1Z7ME 2DE4A 2Q88A 1ZTYA 4JBZA 4QFKA 1PB8A 2X26A 4G77A 2DWJA 3CFXA 2ONRA 1MQHA 2QMWA 2KLFA 1JQFA 1N7XA 2F6PA 1IXHA 1IXIA 3S4UA 4TOZA 3IORA 2RC8A 1XS5A 3QSLA 3SEWA 3KOTA 2PYYA 2B65A 5J1DA 4OMBA 5JEIA 3UK4A 1OMPA 1ELJA 3FXQA 1SW5A 1SI0A 5I59B 5H8QA 4PFTA 4LUBA 3O6HA 3CVGA 4QSDA 3VE1B 3MVZA 4OYVA 5CMCA 4P0GA 1LBBA 3V8XB 2P2AA 4H0WA 1B2HA 2D5WA 2F8DA 4EQ9A 4ZEBA 4OERA 1HSJA 3N6UA 3TPAA 1LB8A 5DT6A 4KYDA 2E0SA 1A7LA 3VFJA 3EPEA 4EQBA 5F1QA 2I0CA 5I59A 4QRZA 1Y3NA 2ONKE 3U72A 1ZKBA 4XKPA 3OSRA 1Y3QA 3VVFA 3RLFE 1FQCA 4BDQA 4N13A 2LAOA 4FEDA 1JVXA 4PP0A 3ZKLA 1LLSA 3C34A 3TDJA 3IOWA 3TTKA 1T0KA 3I5OA 4Q30B 1FTKA 3EF7A 4BDLA 2Y7RA 3G3HA 3IOUA 1NH8A 5I56B 1MM7A 2HQ0A 4OFJA 2I49A 4FIMA 5HM4B 3LSLA 3PD9A 2DSFA 1OLAA 3KBRA 3DM0A 5ITPA 1MXYA 4KHZE 1IQ7A 3TTMA 4FECA 5HPQA 2RINA 4N07A 4O3CA 1B3LA 2QS3A 3H4ZA 4RJZA 3MP8A 5DVFA 3FIRA 1Y9UA 1B5IA 1QKAA 4R6KA 3PPRA 1ZU0A 2QMXA 4H5GA 3O28A 3T9XB 1EH3A 3TKDA 4YMAA 5K2XA 4OVJA 3UN6A 1EZPA 4WEPA 2OBGA 2QSXA 1B05A 3C9HA 3IK6B 4KCDA 5CI5A 4ELPA 4AB5A 3PPQA 4F19A 3B7DA 3G3KA 5DVJA 3CFZA 1FTJA 4TLMB 4MH5A 2OK2A 1JW4A 1BLFA 3SETA 4JXIA 5CM6A 3K6UA 3G3JA 2F6GA 3R26A 4DZ1A 1AL3A 2VGQA 4FORA 1ZBMA 2F7CA 1D3KA 4HW8A 3QK6A 1VFEA 4QFOA 3MJNA 2F7AA 1B3GA 4F29A 2XXYA 1MXZA 3H6WA 3AXFA 3KFMA 1FQEA 5L9OA 1AMFA 3K0VA 1SYIA 1URDA 1MRPA 3FJ7A 4YB6A 2DWAA 3K1PA 3CR9A 4F3SA 4L17A 3KSXA 3MAMA 3IO4A 3U1OA 1MY0A 2ZYMA 3MP6A 1I6BA 2DWHA 1UTHA 3N94A 4MBPA 1H3DA 4QFNA 4F3GA 1B6HA 4F18A 5AE4A 1DSNA 1PBQA 4POWA 3VVEA 3RT8A 4QHQA 3VLWA 4KFQA 1PB9A 4IB2A 3EQ1A 1D9VA 2BJJX 5AA3A 2RCAA 3VLUA 3C33A 3M3FA 2G29A 3HN0A 3V5AA 5FHNA 1B46A 4OXVA 5DYHA 2Q2AA 4H67A 3DP4A 4KR5A 4GL8A 1Y3PA 2H98A 3K6WA 3OSQA 3IOVA 3IR1A 4BLAA 3T66A 4ZZAA 3A09A 3PPNA 4H65A 4I1DA 3CIJA 5I2KB 3UA8A 2OJTA 5L9MA 1P1QA 3PMVA 1B7UA 1ANFA 2IEEA 2RKMA 3IB0A 1NMUA 2O1MA 3MVXA 3MZBA 3JV9A 3RTFB 5H8NA 1MXXA 1H76A 4DXCA 4EXKA 2OLBA 2VHAA 3KZGA 3S2VA 1TFAA 2ZYNA 2ZMBA 2DXRA 4KQPA 5B7DA 4YU0A 5LOMA 3KN7A 4U4SA 4OEVA 1URSA 5A5XB 4QF9A 2HAUA 1Y4CA 3GZGA 2DWIA 2GFEA 1SW2A 1MQJA 3W9WA 1SI1A 3MPKA 1ZJLA 3OXNA 1MQGA 5B70A 3FV2A 4YZZA 1H43A 1NFTA 3KGCA 3PV0E 5H8FB 1USYH 1UTBB 1QUIA 2REJA 1R9LA 5AA1A 3MVYA 1HSEA 1HSLA 1MDP1 1Y1MA 1LCFA 2YLNA 3IAZA 4OFLA 5ICQA 4F2OA 4QSCA 1GGGA 3T93B 5JTYB 3M3LA 3HV1A 4RK2A 3C31A 4YKPA 1B9JA 3BFTA 1O63A 3HHFA 3QUFA 4JSDA 4RPNA 3PPOA 3O29A 1VFDA 1POTA 3PD8A 5A5XA 1GR2A 3M8UA 2V84A 3OOAA 2XX9A 4P11A 3TEPA 4NWDA 5FHOA 3SERA 5KCJA 1JNFA 5H8FA 1UTBA 3TYHA 1B4ZA 2ZYOA 3E3KA 5M2VA 4ZEDA 1MG1A 1PDAA 4X48A 3H6TA 4P0IA 4U2RA 5JTYA 1BIYA 1Z7NE 3IOTA 1RYOA 3IB1A 2H4IA 3UGWA 1YCJA 3USDA 3TTLA 1S9TA 3KN8A 4H8IA 4OENA 2Y7IA 4Z0IA 3IO6A 3QUJA 3LBSA 5BUUA 2Q89A 5H8QB 5ELVA 4EF2A 3JYRA 1XVXA 3U92A 2NVUB 3R6UA 4ELRA 2Z23A 3PMXA 4ZEKA 4NWCA 4NF8B 4G68A 5I2NA 2F35A 2YPNA 4OETA 4M4GA 2QPQA 1QULA 4ESWA 2ABHA 1B58A 3OENA 1SYHA 4FEBA 1MH3A 3MQ9A 1DPPA 2O7UA 3H7MA 4NF6B 3C35A 3ZSFA 3SEVA 3PPPA 1JEUA 2QJEA 5I57B 1IXGA 3ONMA 2OZZA 2HZLA 1OQHA 2O69A 2YJPA 3TTRA 2PX1A 3CG1A 1LBCA 1Y4TA 4X1DA 4ND9A 4YMBA 4DE8A 3MZ9A 2F34A 1L5TA 5CMKA 3PU5A 4NF8A 3QIMA 1UIVA 3RT6B 4R75A 1NNTA 2F36A 4GF8A 4PE5B 4AB6A 4F31B 2DXYA 1SQYA 4FJPA 4G8MA 1B4HA 1LAXA 2O1LA 3K1MA 4NF6A 3I6VA 3ECRA 4RY1A 1USYE 5I57A 2VOZA 1MXUA 4ZEIA 1AH5A 3W15C 4LVQA 3TCGA 1VE4A 2VD3A 2VP1A 4U4XA 3HHGA 1YPNA 4I8CA 1QUJA 1LAGE 3LSXA 3L6HA 4KPTA 1DTGA 4C1TA 2W7YA 3K6XA 2V93A 4E0XA 3TCFA 4HCWA 4GFRA 3LUYA 1N76A 4GOTA 3PUWE 4GRKA 4R9GA 1MQDA 1RYXA 4EUOA 3Q27A 4YAHX 3Q29A 4KYEA 5TP9B 1FTLA 3TELA 1CE2A 3ILTB 3FVKA 4KD5A 2QS1A 1ATGA 1JW5A 3KJ7A 4BDRA 4H8JA 4U21A 2Z8FA 4NE4A 2QS2A 4WXJA 3EHUA 4IY6A 3C4MA 1DMBA 4E0WA 2B3FA 4IY5A 2OWTA 2XXTA 1N04A 4N6PA 1TWYA 2F7BA 4OEUA 5BWJA 5CBRA 1KWHA 4LZ5A 1IXCA 4F39A 1XHYA 1A8EA 3I3VA 1OIBA 3K6VA 3IJOB 4NF4A 1US5A 3THIA 2UYFA 5TP9A 3KN3A 1UTHB 3FJGA 3B6WA 2ZNSA 4ZDMA 4EF1A 4LATA 1SD3A 4NF5B 3GLBA 4DXUA 2V3QA 5AA2B 3E4RA 4ONYA 5IAIA 4FE8A 4HTGA 4LP2B 2WKYA 3O6IA 4RXLA 1JETA 1QJMA 3MPLA 3OO8A 2UXAA 4ZEFA 2O51A 4ZE9A 4G68C 1LAHE 4M1VA 2A5TA 4HCYA 3WAFA 4PETA 1YAEA 1UIUA 3U93A 2Q8JA 1MPBA 2RC7A 3OO6A 4TLLB 1TFDA 4F1VA 5H8NB 1POY1 2XXPA 4WEDA 3QYTA 3KOSA 2HEUA 1LFHA 3H06B 2DVZA 4NF5A 2R6GE 2FYIA 3SEXA 3Q25A 3QAXA 4DCYA 3SDFA 5AA2A 4Z7EA 1O64A 4GVOA 1PEBA 1ZIUA 3LC8A 4NTLA 3S9LC 2OWSA 2XXVA 4G2ZA 2D21A 2QS4A 4XXUA 3O9PA 2XXXA 3VDFA 1A99A 1EZ9A 1R1NA 2D3IA 4BDNA 4XKNA 2ZYKA 4OTEA 1AIVA 4U23A 4FAJA 3PUZE 3ODBA 3C36A 4Q5TA 4R6HA 5L8DA 2XHDA 2DP8A 3OEMA 4XKQA 1FW0A 2Y7WA 1MY2A 2AIXA 4RA1A 4Q8RA 3OMBA 3UP9A 3HSTA 3EHTA 1B0HA 2UVHA 3MBPA 1BKAA 1US4A 3IX1A 3D4CA 2RCBA 1H45A 5EHMA 2GHAA 1WDNA 1PBPA 2Q9TA 1J1NA 2H5YA 1M5FA 1FTMA 4R2BA 2HXWA 4PFWA 3FASA 2Z22A 3EN3A 1XT8A 3F11A 1QVSA 1Q35A 3GXAA 3DP8A 1FQAA 1N84A 3ZKKA 3CRBA 3N5LA 5JK4A 5ISUA 3T9UA 4NMYA 4OWDA 3H6UA 3S9MC 1MY1A 3FZVA 4WKMA 3N26A 5KCJB 4R73A 2DOJA 4G8HA 1LAFE 2I4BA 4AQ4A 4GIZA 2THIA 1M5DA 1I6QA 4IO7A 3SEUA 3DP6A 2I0BA 4ELQA 3LSWA 4XTCQ 4U1ZA 3MZ1A 1LFGA 1MY4A 3VVDA 3ILUB 3RY3A 1GV8A 1FTOA 1LB9A 2FNCA 4YKJA 2HCAA 3MC2A 3CSBA 3M3KA 3VV5A 5HBCA 1NNPA 3BKIB 1VR5A 1I69A 1MS7A 2DE3A 1B0LA 1I6AA 3FVOA 4G68B 5I2NB 4MLVA 1A8FA 3TZAA 1P1WA 4OFOA 1WODA 1MXWA 1MXVA 1IEJA 3PUYE 3G3GA 4JDFA 3IB2A 4KI0E 4X9TA 2UVJA 2ZNTA 2XX8A 4H5FA 1B1HA 3G3FA 1Y1ZA 4OQOA 5K2YA 1A55A 3EHSA 3K02A 2UVIA 2RC9A 1B52A 5TU0A 2NOOA 3LR1A 3SKPA 5KDTA 2XXWA 5CMMA 1QKBA 4POXA 5CC2A 3H03A 3RNNA 2H99A 3RTWB 1B3EA 1FQDA 4UA8A 3IL1B 1URGA 1M5EA 3K2DA 4YKKA 1IIWA 4IO3A 3DELB 1OQGA 4ISUA 5L9SA 4THIA 4OESA 3OEKA 2AL4A 3FJMA 3OO7A 1NKXA 1B40A 2ZXTA 2O6AA 4JB7A 5DEXB 1OLCA 4JSOA 1B7HA 4YB5A 3O2AA 1P99A 1B32A 2I58A 4EQ7A 2Y7KA 5AA2D 3MUQA 3PMWA 2Q2CA 1RKMA 1LSTA 2GRVA 5TPAA 4PQJA 4IGTA 1FQFA 3FGSA 1IUDA 1FQBA 5I84A 1EU8A 5KZTA 3B6QA 2PT1A 4PFUA 4KYSA 4O3AA 3TMGA 2HAVA 5AA4B 3RN8A 3S9EA 1P1NA 2XX7A 3TAJA 4BDMA 3PUVE 5H8HB 2DQVA 4ZS9A 1MQIA 1NNKA 4EDPA 2DS9A 4UACA 2R71A 3P7IA 5DEXA 1P1UA 1JVYA 4YICA 3H3GA 2OCUA 4DLDA 2AL5A 5EHSA 3UIFA 3KG2A 2PMSA 1AOVA 1BP5A 4DDDA 3T22A 2V3TA 1B1XA 4H1XA 4IO5A 3A3UA 5DVIA 3HCQA 2F5XA 2H9BA 2HZKA 1Y20A 2I6EA 2I3VA 4HS7A 2RF1A 2XXUA 2PBWA 1S7YA 1YTVA 1O7TA 4IO6A 3U8QA 4JWOA 1LFIA 3O6GA 3FXUA 4H6DA 4F1YA 2HFBA 2PVUA 5AA4A 5EYFA 3ZS6A 1NNFA 2V3UA 3MWBA 2FA7A 3DLNA 3TCHA 2X7PA 4LZ7A 5H8HA 3PGFA 2XXHA 3R7XA 1B5HA 1GVCA 2I48A 4NF4B 2ESNA 4MF3A 1LCTA 1VSOA 3GBAA 3WAEA 4R6YA 5CRYA 2AYSA 4G4PA 4KCCA 4ZZEA 2NUVA 1IITA 2G93A 4JWYA 2X7QA 4OZ9A 4IO2A 4U22A 1OVBA 2Y7PA 1WVJA 3G3IA 4I62A 1H44A 4ELOA 1XOCA 4GLIA 3MVWA 3FATA 4GWOA 2ALUA 3FV1A 3JZJA 3KSJA 4GQOA 1PC3A 4GL0A 1EZOA 3PUXE 3T9VA 1UQWA 2ANJA 1SW4A 2NXOA 2I3WA 2XD3A 2A5TB 3B6TA 1B3FA 5I58B 2I4CA 5I56A 1JEVA 1XC1A 4DIGA 4ZE8A 4TQUQ 4C0RA 1MDQA 3A3CA 3V83A 1F9BA 1TXFA 1P1OA 4IO4A 3V89B 3OD7A 1GTKA 5FTIA 1B7ZA 3QXMA 4BDOA 3KJTA 3S9NC 3MW0A 4ZECA 4XKRA 4R72A 1MM6A 1JW1A 3VXCA 2B3BA 5H8SA 4R2FA 4JWXA 3W9VA 1BTJA 4LONB 4F2QA 4X1BA 3CI8A 3OO9A 3HPIA 3K1NA 3FXRA 2Z8DA 4RNSA 5I58A 4F1UA 3BBRA 4LA9A 3E9XA 5FTHA 4OHNA 2F97A 4R74A 1SBPA 3L6GA 1ZMGA 3KEIA 1N7WA 3UORA 4YB7A 2QL3A 2P0SA 3D4GA 1MH4A 4YKIA 1S50A 2IA4A 3TQLA 4DXBA 5ITOA 3FD3A 4F3PA 2XXRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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