5ICTA

Crystal structure of the drosophila glur1a ligand binding domain y792t mutant complex with glutamate
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
266
structure length
266
Chain Sequence
GSYDRNHTYIVSSLLEEPYLSLKQYTYGESLVGNDRFEGYCKDLADMLAAQLGIKYEIRLVQDGNYGAENQYAPGGWDGMVGELIRKEADIAISAMTITAERERVIDFSKPFMTLGISIMIKKGTPIKTPEDLTMQTDVNYGTLLYGSTWEFFRRSQIGLHNKMWEYMNANQHHSVHTTDEGIRRVRQSKGKYALLVESPKNEYVNARPPCDTMKVGRNIDTKGFGVATPIGSPLRKRLNEAVLTLKENGELLRIRNKWWFDKTEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Drosophila melanogaster
publication title Novel Functional Properties of Drosophila CNS Glutamate Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 1
total genus 85
structure length 266
sequence length 266
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5ictA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5ictA02
1H3DA 3MP6A 3DELB 4OQOA 4HCYA 3EF7A 3N94A 2CZLA 1T0KA 5I2NB 4KYSA 4ELRA 4IY6A 1B5HA 2GFEA 1FTMA 2XD3A 3VLUA 5I57A 4OESA 2RC7A 2H25A 4OHNA 4OENA 5CMBA 2XXXA 3WAEA 1QULA 4OZ9A 3S2VA 4F18A 1IXCA 3GZGA 1SDXA 4H5FA 1WVJA 1VE4A 2F8DA 2PBWA 4PETA 4QSEA 2CMOA 4DCXA 3K0VA 1ELJA 1USYH 1SI0A 2H9BA 1B46A 2I58A 1N3XA 1IXGA 5AA4A 2I0BA 4THIA 4KHZE 1B3EA 4GIZA 4F39A 1ZKBA 4NF5A 3U8QA 1ZU0A 3SESA 3KGCA 3K02A 3K2DA 2QJEA 4RA1A 1UIUA 1LSTA 3N26A 1B3FA 3TYHA 1N04A 1MH4A 2F36A 3SERA 3H06B 1XOCA 4R75A 4QFKA 2GH9A 4LZ7A 3C36A 3HPIA 5HBCA 4EUOA 4R6YA 5CM6A 4EF2A 1PC3A 3O97A 1AMFA 3FUZA 3N6TA 4X1DA 4JWYA 5ICQA 4JSDA 3FATA 1H44A 1Y20A 1MQIA 5BUUA 1D4NA 3O28A 1B7ZA 2F6GA 4XKQA 3KN8A 3TUSA 3S4UA 1FTOA 5I59B 3IK6B 3ONMA 1SQYA 5CI5A 3OEKA 3IJXB 1LFGA 4HS7A 2WKYA 3UIFA 3FJ7A 4TQUQ 3T66A 1MXYA 1A8FA 5H8FA 1B9JA 3FGSA 2XHDA 2PVUA 3VFJA 4BDRA 4NF6A 2UYEA 4PFWA 1NH8A 4KCCA 3O29A 3VE1B 2G93A 2H5YA 3EQ1A 3G3KA 3JV9A 4YB7A 2E1SA 1H43A 4IY5A 4MLVA 1MXZA 3FJMA 2H4IA 2GHBA 4I1DA 3M8UA 2XXWA 1MQGA 4ISUA 5I2NA 5KDTB 1XVXA 3OSRA 5DYHA 3SKPA 5B70A 4XTCQ 4WKMA 1SYHA 1QKBA 2E0SA 4FORA 3RUMA 3K1PA 4GWOA 3IX1A 2DE3A 3PV0E 2DWJA 5FTIA 3H6TA 4KQPA 2QS4A 3DM0A 2ONRA 1XS5A 3E9XA 4R72A 3MP1A 3Q29A 4ZEFA 3O6IA 2O69A 3H6UA 2DVCA 4DZ1A 3AXFA 4IO7A 2Z8EA 4GRKA 3EHUA 3TQWA 1RYXA 3O2AA 5I56B 2Y7WA 4QRZA 3S9MC 3FVNA 4GQOA 3IORA 5H8HB 1A54A 4E0XA 1O64A 1LFHA 3VVEA 3KN7A 3WAFA 3LSWA 4KCDA 2IEEA 2NOOA 3RQTA 3UK4A 5DEXB 1DSNA 1JVYA 2FA7A 2OWTA 5AA1A 3MUQA 3B7DA 1FQFA 3KN3A 4GF8A 2RF1A 4DXCA 1AOVA 2M8CA 1Y1MA 4LUBA 3PU5A 3VLVA 4R9GA 2V93A 3SEVA 2QSXA 3CFXA 4NF4B 1HSJA 3HN0A 5I59A 3IL1B 1I6BA 4ZZEA 3TMGA 4F3BA 4IO5A 2DE2A 1IITA 3S9EA 2F35A 1MM6A 1OLAA 1CE2A 1B0LA 2Q2CA 4RJZA 1LAGE 2I6EA 3ZSFA 3ZKKA 4P0GA 2AL5A 3FVGA 2I49A 3KEIA 3IOWA 3PGFA 1R9LA 1N76A 1LCFA 3IO4A 4NWDA 2QRYA 4K3FA 3G3IA 1TT1A 1NFTA 2I48A 4XKPA 2QMXA 4AB5A 4EQ9A 3DLNA 4Q0CA 1A40A 2XX9A 2DS9A 1N0TA 4YKIA 5L9MA 3K6UA 4RPNA 1IQ7A 3QYTA 3T9UA 3U72A 3OD7A 2ABHA 3SETA 3OMBA 2REJA 4DDDA 1L5TA 4BDNA 4F1UA 3RNNA 2VP1A 3PMVA 3C9HA 4XKNA 1LBCA 2G29A 3LBSA 1ZBMA 1NNPA 2Q89A 3TCGA 2KLFA 3G3FA 4GD5A 3CG3A 5HM4B 4FECA 1SVXB 3JZJA 3RLFE 4OETA 4H0WA 2PT1A 5K2YA 2QPQA 4ESXA 3GBAA 2Z22A 3QSLA 5I56A 2DP8A 5ELVA 1NH7A 3K6VA 3UP9A 1A55A 3T9XB 5H8HA 4YB6A 4H67A 4GOTA 5CBSA 3PUXE 3MVWA 1PDAA 3VDFA 5DEXA 2OJTA 5TU0A 4ZEKA 2Q9TA 5AA3A 1DTZA 4RNSA 1Y1ZA 1FQEA 4NMYA 5B7DA 4FJPA 3RTWB 4H8IA 2B65A 3PD9A 2XXQA 4HTGA 1OLCA 1R1NA 3PPQA 2UXAA 4NF4A 1B1HA 4H65A 1JW4A 2HCAA 4KYDA 1OQHA 1MY3A 3KZGA 3QUFA 3ECRA 4QSDA 4R9FA 1PB8A 4BDQA 3THIA 2Y7PA 5H8NB 1N84A 3CSBA 4F3GA 4QSCA 2D21A 3N6UA 4U4XA 2X7PA 1B5IA 2VD3A 2AL4A 2QS3A 1ZTYA 2REGA 4OERA 1B4HA 2R9JA 3H4ZA 4F22A 2ZXTA 5JTYB 3GXAA 1SW5A 2DQVA 1ZJLA 4FATA 3OELA 2YJPA 1N7WA 4F3PA 1MXXA 3MVZA 5TP9B 3DP4A 5ITOA 3Q26A 4ELPA 1MY4A 4N13A 3T9HB 5CMMA 4RPOA 4TOZA 2ESNA 4OEVA 4P0IA 3GLBA 3T22A 4G4PA 1F9BA 2DWAA 2XD2A 3IAZA 3FIRA 3K1MA 1MXWA 5CMCA 1HSEA 3JYRA 4OTEA 4MFIA 2OBGA 2DOJA 1JW5A 3N5LA 4AQ4A 5CMKA 3LC8A 4F29A 5HPQA 2PX1A 4GL8A 1TFDA 1SW1A 2PYYA 2QL3A 5K2XA 1MDP1 1JEVA 3E3KA 1NNFA 3K00A 2DE4A 2NUVA 1NNTA 4PQJA 4Z7EA 1OQGA 4NWCA 2OZZA 1DPEA 3M3LA 3HSTA 4JDFA 5FHMA 5F1QA 3OO8A 2VD2A 1POY1 3U93A 2Q8JA 4F1VA 5FHNA 3MAMA 4UACA 3UN6A 4NF8B 5F7VA 2QS2A 1II5A 1WODA 3FV2A 4KR5A 4ZDMA 1MPDA 1SW4A 2NVUB 2PMSA 1EZPA 2RC9A 1SD3A 4OFOA 3W9VA 3UORA 2UVIA 1LGBC 4G68B 3PPRA 5JEIA 5KCJB 5KZTA 3FVKA 3HV1A 5H8NA 3IB1A 4F2QA 4O3AA 2ZYKA 1JETA 4I8CA 1BLFA 3A09A 5CRYA 1S50A 1B3LA 1BKAA 1ZMGA 2HXWA 2V3QA 4FIMA 5JTYA 3VXBA 3I6VA 2Q88A 5DVJA 4YKPA 2ZNTA 1IEJA 3G3GA 4LQ5A 4EXLA 5TP9A 3CR9A 4RY1A 3OXNA 1H45A 3DP6A 3VLWA 3TTRA 5EHSA 1XVYA 1UTHB 4FEBA 4GLIA 4IGRA 1M5BA 2GHAA 5BWJA 3KOSA 3K6XA 3EPEA 1EU8A 3T9VA 3V8XB 4EXKA 2Y7RA 4U23A 2YPNA 3A3UA 4QFNA 5ICTA 1B5JA 4OMBA 5L9SA 1LAHE 3IR1A 4I9DA 4KYEA 1XHYA 2A5SA 3T93B 3K01A 4EDPA 2O84X 3MBPA 2YLNA 2XXTA 2F78A 4E0WA 1J1NA 2Q2AA 3PUZE 1KWHA 1QUKA 3K6WA 2XX7A 3FJGA 2D5WA 2A5TB 1MY1A 2RC8A 4LQ2A 3C33A 4DE8A 1OIBA 3MZ9A 2ANJA 3HO7A 1POTA 3V83A 3MJNA 3U1OA 3IO6A 1B3HA 4IO4A 5AA2B 3ILTB 4YMAA 3CFZA 3RY3A 3RT6B 1B4ZA 4MBPA 3IOUA 4KFQA 3PUVE 3MW0A 1VR5A 4NF8A 4BDLA 3TZAA 1I6QA 1H76A 1D9YA 3H03A 4N6PA 3LSXA 5LOMA 4RK9A 2F7AA 2I3WA 1Q35A 4R2FA 4DXUA 3HCQA 3TCHA 5JK4A 3DP8A 4F19A 3E4RA 4TLLB 1SI1A 2UYFA 5FTHA 4G68A 3H6WA 1FQDA 1USYE 5KCJA 1NL5A 1QJMA 1URDA 3MP8A 3TEPA 3EHSA 3B6WA 2ONSA 1PBPA 1M5DA 1Y4CA 3IB0A 4GXSB 3TFLA 3BFTA 3W15C 3PUWE 3MVYA 1XC1A 4ESWA 1NMUA 1US4A 3FXQA 4ZEDA 1GTKA 2R71A 4ZE8A 3TTMA 3S9LC 1AIVA 3QUJA 5KDTA 2V3TA 2GRVA 4UA8A 1QVSA 4GVOA 4C1UA 4R73A 3E13X 2NXOA 4X9TA 4C0RA 2THIA 1YCJA 3I3VA 4QFLA 4R6KA 1N7XA 1A8EA 1UTHA 3RT8A 1GR2A 3TAJA 4ELQA 3UGWA 1O7TA 1S7YA 2O1LA 1IXHA 4XKRA 2DXYA 2V84A 4IO6A 1GGGA 3K1NA 1ZLQA 3SEYA 3CRBA 3C31A 2QS1A 3VXCA 1VSOA 1P1WA 1NKXA 3G3JA 3BBRA 5DVFA 4EQBA 2HQ0A 4AB6A 1LLSA 2DYXA 3R6UA 3M3FA 5TPAB 2AIXA 1QW0A 3O66A 4YZZA 3A3CA 3G7WA 3OSQA 3U92A 2ALUA 4KI0E 4F31B 2UVJA 3SEWA 3FV1A 3P7IA 5I2KB 1FCKA 3CIJA 3OO9A 4Q30B 4LATA 3KJ7A 4PFUA 2A5TA 1A7LA 1PB7A 4OFJA 4U21A 1AH5A 1FTJA 1MXVA 1P1QA 4JB7A 4WXJA 3C4MA 1BTJA 5AA2A 1Y3NA 1MS7A 3B6QA 4LVQA 1SYIA 1M5FA 3C35A 3IJOB 3M3KA 1P1OA 2PT2A 4NE4A 1IZ1A 4KD5A 4BLAA 1R9QA 1JVXA 4M4GA 1Y3PA 1A99A 1S9TA 4ZEBA 2Y7KA 2Y84A 4DCYA 4IGTA 2B3FA 1YPNA 3FZVA 5H8QB 1VFEA 1LBBA 4JWXA 4FE8A 3CI8A 3OO7A 4YKKA 1JQFA 3TODA 5L9OA 4WEPA 2IA4A 3TELA 2DVZA 2DXRA 2P1SA 1EZOA 5ITPA 4PE5B 1B05A 2DWIA 3TKDA 4GXAA 3O6HA 3S9NC 3EHTA 1MQDA 4YKJA 3BKIB 2F6PA 4F1YA 1TFAA 3FASA 4N07A 4YMBA 4X48A 4XXUA 1EH3A 1LAXA 1VFDA 5IAIA 4RK2A 4U2RA 1M5CA 3CVGA 3CSGA 5AE4A 3KBRA 3LR1A 3B6TA 4H8JA 1B58A 2RCAA 5DVIA 4ONYA 1MY0A 2O7UA 3O9PA 1P1UA 2F34A 2VOZA 3SDFA 1FQAA 1HSLA 3LSLA 5DTBA 2W7YA 3LUYA 4NTLA 5CBRA 3D4GA 1QUJA 1PBQA 1MPCA 1OMPA 5TPAA 3TPAA 3TDJA 4JSOA 4QFPA 2XXIA 3OENA 3QXMA 5H8SA 4G8HA 5I2KA 4LA9A 1DMBA 1TWYA 3QIMA 3Q27A 3T96B 3SEUA 4OVJA 4ELOA 1ATGA 1B7HA 2HFBA 2RCBA 2Z8DA 3OEMA 1MG1A 4PP0A 3TTNA 2F5XA 4DLDA 4PFYA 1MY2A 3CG1A 3EN3A 4G2ZA 4DXBA 3V89B 3PUYE 3UA8A 4YB5A 2XXPA 2R6GE 4U1ZA 2DSFA 4C1TA 1B32A 4G68C 3VVFA 5ISUA 2NWJA 3G3HA 3KJTA 4Z0IA 5EHMA 1BP5A 1N3WA 4JBZA 1UTBB 2QMWA 4H5GA 1OVBA 2I4BA 5H8QA 2FNCA 2VHAA 2ZNSA 4MH5A 3BFUA 1ZIUA 4Q8RA 2F97A 2Z23A 1DTGA 3RGYA 1BIYA 1D9VA 3TCFA 3PD8A 3H7MA 4EQ7A 3PPNA 3QAXA 4O3CA 3Q28A 4F2OA 4X1BA 3TTLA 1MQJA 4LZ8A 1IUDA 4LZ5A 3C32A 1IXIA 1GVCA 2X7QA 1WDNA 1URGA 3FXRA 1FQBA 4BDMA 2I4CA 2I0CA 4POXA 3LSFB 2XXHA 1FQCA 2ZMBA 1YAEA 2O7IA 1I69A 4LP2B 3H6VA 4QF9A 4ZECA 3KOTA 1URSA 1B1XA 1YTVA 3O6GA 1P1NA 3USDA 1MXUA 2O68A 1XT8A 5I58B 3MVXA 4IB2A 4JXIA 4DIGA 5CC2A 4WEDA 1B51A 2V3UA 2AYSA 5I84A 3MZ1A 3KSXA 4KPTA 1SBPA 2HEUA 3ILUB 3C34A 2XXYA 2F7BA 1MDQA 2ONKE 3PMWA 2LAOA 4XIGQ 1DPPA 3VVDA 4R74A 2P2AA 3H3GA 1B0HA 3OO6A 4YICA 4G8NA 1RYOA 3FD3A 4RYAA 2OCUA 4O3BA 4ZS9A 1B2HA 3L6HA 1MQHA 4G8MA 1Y3QA 4F3SA 1LFIA 3TQLA 1FTLA 1FTKA 1MRPA 5A5XB 1CB6A 1NNKA 5DT6A 4RXLA 1D3KA 3HHGA 3KFMA 3RTFB 1AL3A 4ZE9A 4JWOA 1O63A 5EYFA 3ZS6A 1R6ZA 2OLBA 3W9WA 3MWBA 2B3BA 1UTBA 4IO3A 1Y4TA 2OK2A 1ANFA 2ZYNA 2DWHA 1RKMA 4OXVA 3MPLA 1I6AA 2ZNUA 4L17A 4P11A 1JW1A 4H6DA 2H99A 4U4SA 2XXVA 4Q5TA 2D3IA 4U22A 1B6HA 3MC2A 4NEDA 4IO2A 1Y9UA 1JEUA 4OFLA 3TTKA 5IKBA 2I3VA 3R26A 2UVHA 4OWDA 3CFLA 1GV8A 4OYVA 4YAHX 4ND9A 4R6HA 2Y7IA 4I62A 2XXUA 2RINA 1LB8A 1SW2A 2HZKA 3PMXA 2VGQA 1US5A 3ZKLA 2UVGA 3PPOA 1PB9A 1MH3A 1B52A 5I57B 2O1MA 1B7UA 2FYIA 3L6GA 1B3GA 3HHFA 2HZLA 3GBBA 4QHQA 4MLQA 3R7XA 3KSJA 4LONB 5J1DA 5I58A 4EF1A 3U94A 3VV5A 1TXFA 2O51A 1EZ9A 2X26A 5L8DA 4FEDA 1Z7ME 5AA4B 2HAUA 1QKAA 3Q25A 2RKMA 4NF5B 4ECFA 3I5OA 4M1VA 3V5AA 3SEXA 1QUIA 2ZYMA 4H1XA 4MF3A 3ODBA 4G77A 4ZZAA 2BJJX 4ZEIA 4GL0A 3D4CA 5FHOA 2F7CA 4U1OA 3FVOA 1Z7NE 3FXUA 2XXRA 1PEBA 2O6AA 4TLMB 4FAJA 3KG2A 2ZYOA 3IOTA 3QK6A 1LAFE 3F11A 5A5XA 3PPPA 1UIVA 3MPKA 1OVTA 1P99A 1B40A 4BDOA 3RN8A 3OOAA 2P0SA 1DOTA 2Z8FA 1MPBA 1JNFA 1Q1KA 4R2BA 3IOVA 2V25A 3K4UA 4HW8A 4OEUA 1FW0A 2OWSA 4POWA 4GFRA 4PFTA 5AA2D 4YU0A 1UQWA 3MZBA 4QFOA 1LB9A 2HAVA 1IIWA 5M2VA 3IB2A 5H8FB 3MQ9A 2XX8A 2H98A 1MM7A 4HCWA 1M5EA 4NF6B 3RPWA 1LCTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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