1IXGA

Phosphate-binding protein mutant with thr 141 replaced by asp (t141d), complexed with phospate
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
321
structure length
321
Chain Sequence
EASLTGAGATFPAPVYAKWADTYQKETGNKVNYQGIGSSGGVKQIIANTVDFGASDAPLSDEKLAQEGLFQFPTVIGGVVLAVNIPGLKSGELVLDGKTLGDIYLGKIKKWDDEAIAKLNPGLKLPSQNIAVVRRADGSGDSFVFTSYLAKVNEEWKNNVGTGSTVKWPIGLGGKGNDGIAAFVQRLPGAIGYVEYAYAKQNNLAYTKLISADGKPVSPTEENFANAAKGADWSKTFAQDLTNQKGEDAWPITSTTFILIHKDQKKPEQGTEVLKFFDWAYKTGAKQANDLDYASLPDSVVEQVRAAWKTNIKDSSGKPLY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A low energy short hydrogen bond in very high resolution structures of protein receptor--phosphate complexes.
pubmed doi rcsb
molecule tags Phosphate transport
source organism Escherichia coli
molecule keywords PHOSPHATE-BINDING PROTEIN
total genus 107
structure length 321
sequence length 321
ec nomenclature
pdb deposition date 1996-08-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ixgA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ixgA02
2Q88A 4OXVA 3O66A 3K1NA 1Q35A 1OQGA 1QULA 3MZ1A 4NF8B 2O51A 1B58A 1B32A 4F2OA 2VD3A 4H8JA 3EHTA 3ZKLA 3PUZE 4X1BA 1I69A 3VV5A 5BWJA 3QAXA 4RK2A 3FXUA 1MXYA 2I48A 3OSRA 5TP9A 4K3FA 2PYYA 5AA3A 1TWYA 2BJJX 3MBPA 3EF7A 4NF6A 3V5AA 1MQDA 4YKJA 4H1XA 3FJ7A 1AIVA 3MUQA 4OYVA 4F1UA 1P99A 1IXIA 3OEKA 1NH7A 2HZLA 3K2DA 3CFZA 4JXIA 3TTKA 1ANFA 1QW0A 4FEBA 5I59B 3K6XA 4E0XA 4YB5A 2OZZA 2AYSA 3IB2A 2F7AA 2XXHA 4BDRA 2I4CA 3CVGA 3SERA 5L9MA 1IXGA 3RUMA 2GH9A 1Y20A 3MP6A 1MY2A 4DIGA 4XXUA 2E0SA 1OLAA 2DXYA 3S9LC 4JBZA 5ICQA 4OTEA 3O9PA 3E9XA 3O2AA 4FATA 4HCWA 2E1SA 4N07A 3TTLA 1MY0A 1SI1A 3S4UA 3VXBA 4FORA 4MFIA 2P0SA 1MM6A 4HS7A 4LZ7A 5IKBA 2Y7RA 4U22A 2DS9A 4EF2A 5I84A 5B70A 1EZOA 2X26A 3IB1A 2DVCA 3T22A 3G3HA 2OLBA 4G68B 5EHSA 1WVJA 4XTCQ 3RTWB 5K2YA 3GLBA 3PPOA 3GZGA 3S2VA 1MQJA 3QUFA 4XKPA 3I6VA 1YCJA 5DT6A 1B5JA 2ZYKA 3CSBA 3C4MA 4BLAA 3PV0E 4R74A 2O7UA 3HPIA 3CRBA 4PFTA 2H25A 3RTFB 1HSLA 2DXRA 4EXLA 2R6GE 3MPLA 4NWCA 3MZBA 3KN8A 2XXIA 1FQDA 3DP8A 4NF4B 2ZNSA 2DP8A 5KCJA 3EHSA 4XKRA 1JQFA 2F34A 3FVOA 1TFAA 4WEDA 1R6ZA 2YLNA 4U2RA 4ELPA 3VFJA 4F22A 3F11A 5FHNA 3KG2A 4ZEDA 1CB6A 1PBPA 3KJTA 5JTYB 2HCAA 3R6UA 4OQOA 3FASA 3MC2A 5H8FA 5L9OA 3TPAA 1B2HA 1JW5A 4ZE8A 4EQ7A 2ZYNA 1OLCA 1QUJA 1B52A 4NE4A 2M8CA 3E4RA 2PBWA 1VFEA 2QSXA 2ANJA 4OHNA 4JWOA 1LCTA 2QMXA 3FJGA 4NF5B 5DVFA 1A8FA 2O84X 3TQWA 2Y7KA 1MXXA 1OIBA 4RPOA 5AA2D 1MY3A 3JV9A 3VXCA 4EXKA 1S50A 5DVJA 5AA4B 2D3IA 5JEIA 2XHDA 3MPKA 2I0BA 1NH8A 1O64A 4H8IA 3K0VA 3USDA 4ONYA 2AL5A 2A5TB 3OOAA 5H8SA 3PPNA 4RPNA 4O3AA 4PFWA 2DE2A 4TLMB 3G3GA 4POXA 4DLDA 1PB9A 3PUWE 4R6HA 3HO7A 3TYHA 3K1MA 4OENA 3W9VA 5I57B 3OD7A 3KBRA 2Z8FA 3TCGA 3TDJA 3JYRA 4H6DA 2XXYA 1DPPA 4OESA 1IIWA 3PGFA 4IO4A 3GBBA 2IA4A 3LSWA 3Q29A 3D4CA 3CSGA 1YPNA 3G3FA 3P7IA 2XXUA 5A5XB 5H8QB 1N3XA 3TKDA 1ATGA 2H98A 1YTVA 4GOTA 3B6WA 3MP8A 2V84A 4RYAA 5F1QA 3W9WA 4NEDA 3N6TA 4IY6A 2B3FA 4F29A 4FJPA 1JW1A 4RJZA 4M4GA 5HBCA 4QFPA 1IXCA 2XXQA 1SI0A 4IGTA 3FIRA 2GHAA 3IORA 2RC9A 1MXUA 5JK4A 3A09A 4RXLA 4MF3A 4H65A 3IB0A 1FTLA 4NF8A 3RPWA 5I2NA 1VSOA 5EHMA 2ZYMA 1B1HA 2DWJA 3TQLA 4LQ5A 3V8XB 4WKMA 1GR2A 3LC8A 1MQGA 5DEXB 2OWSA 3KOSA 1MPCA 4YB6A 1MXWA 2VP1A 4OEVA 3RNNA 2GFEA 2RCBA 1JETA 4F3PA 2A5SA 4MLQA 4KCCA 3KN7A 4PQJA 3TMGA 1B3EA 2Z8DA 3DELB 3SEUA 3TFLA 3TTMA 4ESXA 4BDMA 2O7IA 5I56A 1H43A 4IO3A 3VVDA 3SEXA 3U1OA 4LONB 4PP0A 1VFDA 4H67A 4YMBA 1NNPA 3K6VA 4C1UA 1XVXA 2VHAA 1B6HA 4NMYA 1GV8A 4ZE9A 2F35A 5AA2B 1LAXA 3DM0A 4RA1A 3PUXE 4M1VA 1LAHE 4U21A 3LUYA 4UA8A 3TELA 4OEUA 2NVUB 1SW4A 1I6AA 1F9BA 2FA7A 2ONSA 1DSNA 1UIUA 4PETA 2DWHA 2F7CA 4P0GA 4GXAA 1LGBC 3IAZA 1RKMA 2XX8A 5FTIA 2ZXTA 3H6UA 4G68A 2F78A 1DPEA 3MZ9A 2RF1A 4L17A 1N7WA 4KYDA 2ZYOA 5TPAB 3S9MC 1EU8A 2ZNUA 4GRKA 4ND9A 2PT2A 1OVTA 1MQHA 3SKPA 5LOMA 4DE8A 1B05A 1B1XA 1B3HA 1WODA 3HSTA 4QHQA 1B5IA 2VOZA 4U1OA 4GVOA 3MVZA 4NF4A 3QUJA 3DP4A 3FGSA 3A3CA 2ONKE 3VLVA 1A40A 3UP9A 1DTGA 4OETA 3B6QA 1P1WA 3ZKKA 4LZ5A 2GHBA 1SVXB 3PMWA 4IY5A 3K01A 4U4XA 2G29A 3S9EA 1JW4A 5JTYA 3Q27A 4IO5A 1ZBMA 3B7DA 4X9TA 1Y9UA 2Z8EA 3BBRA 3K02A 5TU0A 1AMFA 2RCAA 4X48A 4KYEA 1IXHA 2NWJA 3M8UA 1XC1A 3R7XA 4TQUQ 5ICTA 3C32A 4EQBA 5ELVA 2I3WA 2B65A 2H4IA 3W15C 2IEEA 2YJPA 3UORA 4ELRA 1BLFA 1B7HA 4KCDA 4YU0A 3TTRA 4JSOA 1QUKA 5DVIA 4JB7A 3T9XB 1ELJA 5AA4A 2QS3A 4R75A 3ONMA 2XXTA 4I9DA 1M5FA 4G8NA 2XD3A 4U4SA 1D4NA 5I2KB 3IO4A 3TTNA 4OFOA 3PUVE 3PUYE 3OXNA 1PEBA 2FYIA 1D9VA 4GL8A 1URGA 4MLVA 1MS7A 1Y1ZA 4IO2A 1B3FA 3BFUA 2NUVA 2V93A 1UTHB 2B3BA 4FE8A 5FTHA 4G4PA 1JNFA 1MH3A 3ZS6A 5CMBA 5H8HB 1FTMA 1Y3PA 2UVHA 3EHUA 4ZEFA 3UN6A 2CZLA 3K6UA 1MPBA 3U94A 1R1NA 5L8DA 2OCUA 2UYEA 1B46A 5KZTA 2O6AA 4WEPA 3RN8A 4F18A 4R73A 3MP1A 3FXQA 3N5LA 2I4BA 2RC8A 3C36A 3G3IA 4ZDMA 5KDTB 3IOTA 2GRVA 4DZ1A 3IL1B 1N0TA 3T9HB 1S7YA 2I0CA 4Q5TA 1J1NA 4ZZEA 4F19A 5CBRA 1ZIUA 3M3LA 3H6TA 4KYSA 3TEPA 5L9SA 3FJMA 3JZJA 2F5XA 4GF8A 3N6UA 5CMKA 3TCFA 3O29A 3IOWA 5H8NA 1PDAA 4F2QA 1N7XA 4HW8A 4DDDA 4GD5A 5EYFA 1LSTA 3FV2A 4YKPA 1US5A 1GVCA 2ALUA 1B40A 1B9JA 1NL5A 2O1MA 3LSFB 3HV1A 3E13X 4NTLA 1PB8A 3H6WA 1FW0A 2Y7IA 1TXFA 2QS2A 3GXAA 4ELQA 1QUIA 1FQAA 3FATA 1HSEA 1B3GA 5CRYA 3I3VA 3B6TA 4POWA 4DCYA 4JWYA 4R9GA 1B7ZA 4GFRA 3KSXA 3M3KA 3C35A 3TODA 3U92A 2QRYA 4LQ2A 2XD2A 5CM6A 3MWBA 4YZZA 1UQWA 4GWOA 5IAIA 1P1QA 1MQIA 4QSDA 3MVXA 1D9YA 1ZKBA 1AL3A 3Q25A 2F36A 2REGA 1OMPA 4XIGQ 1NNKA 1BKAA 4GXSB 2Y7WA 1B5HA 1URDA 4LUBA 1B4ZA 3PD8A 3OELA 1LFHA 5K2XA 3T9VA 4BDLA 1LBCA 3ILUB 3H03A 3GBAA 3VDFA 5I58A 4G8MA 2O68A 4KHZE 3Q28A 3CFLA 4ISUA 1N3WA 3SETA 2VGQA 3G3JA 1A7LA 4QRZA 4MBPA 1BTJA 1EH3A 1A54A 2AIXA 3QIMA 5KCJB 4FEDA 4THIA 4QSCA 4NWDA 3L6HA 2XXWA 2F8DA 4PFUA 3N26A 2Q8JA 2XX7A 4BDOA 2H9BA 1Q1KA 1MY4A 4F3GA 5FHOA 4O3CA 5H8FB 3EQ1A 1Y4CA 3LR1A 1FQFA 4QF9A 1ZTYA 4IO7A 3PMVA 3BKIB 5M2VA 2HAUA 1H44A 5ITOA 1FTJA 3C31A 1QKAA 3T93B 3U72A 1PBQA 1XS5A 3R26A 2HZKA 4QFNA 3PPPA 1ZU0A 1L5TA 1VR5A 4Q8RA 5I59A 4TLLB 3N94A 4OVJA 3KN3A 2OBGA 3SESA 3TCHA 2D5WA 4FAJA 1USYE 4DXUA 4RY1A 3KFMA 1D3KA 2XXPA 4KFQA 3TAJA 2QJEA 3THIA 1ZLQA 4TOZA 2DYXA 1Y3NA 3LBSA 4IGRA 4GQOA 3EPEA 3VE1B 1UTBB 1SW5A 2F97A 2Y7PA 3OO8A 1P1UA 4KQPA 4ELOA 4FECA 4JDFA 1ZJLA 3CG3A 4AB6A 3ZSFA 2PT1A 3FVKA 3FVGA 2RINA 3O6IA 4X1DA 3SEWA 4GIZA 1Z7ME 2PVUA 4G77A 3K1PA 1B3LA 3MVWA 3TUSA 4U23A 4F3SA 3LSLA 4ZZAA 3MAMA 1DTZA 4N6PA 3WAFA 1UIVA 3CI8A 1SD3A 1M5DA 4E0WA 2X7QA 4O3BA 4OFLA 1XOCA 3KGCA 2Z23A 1Y4TA 1LB9A 3O97A 1I6BA 4P0IA 4IB2A 4OFJA 4RK9A 4HTGA 1RYXA 3IK6B 3QSLA 1LFIA 3OO6A 2Q2AA 1XVYA 1R9LA 5B7DA 2DWIA 2VD2A 3OEMA 1N04A 1YAEA 3FXRA 1FCKA 3U8QA 3HCQA 3ODBA 3FUZA 1IQ7A 5CMCA 4KD5A 1USYH 5ISUA 3QXMA 4ZEKA 5AA1A 3FV1A 5I2NB 2WKYA 1N76A 2KLFA 3U93A 2ABHA 1B51A 3FD3A 5J1DA 4ZEIA 1R9QA 1OVBA 2DE4A 2P1SA 3M3FA 3QYTA 3HHGA 1B7UA 2F6PA 1XT8A 1WDNA 4ZECA 1MXVA 4F1YA 1JVXA 1O63A 4NF5A 3C9HA 4QFLA 1NMUA 2ONRA 3KSJA 3RT6B 4R6KA 5CBSA 2THIA 3OMBA 1LB8A 1MDP1 1US4A 4Q0CA 5CMMA 1TT1A 5I56B 4ECFA 1VE4A 1URSA 3O6HA 2R9JA 2REJA 4ZS9A 4OZ9A 4QFKA 2I6EA 3PU5A 1GTKA 3Q26A 1GGGA 4BDNA 4H5FA 1MH4A 3PD9A 2A5TA 2F6GA 5ITPA 1Z7NE 3QK6A 3SEVA 3FZVA 4AB5A 1LBBA 3KOTA 4YMAA 3H3GA 4DXCA 2P2AA 5I57A 5BUUA 3KEIA 1O7TA 1KWHA 4UACA 3TZAA 2HXWA 2AL4A 4U1ZA 1QKBA 4YKIA 2UYFA 4R6YA 4I62A 1OQHA 1POY1 2YPNA 2V3UA 2Z22A 2FNCA 4I1DA 1HSJA 3OENA 3WAEA 3MVYA 3HN0A 4F3BA 1B0LA 3K00A 5A5XA 5H8QA 1M5BA 4R2BA 4G2ZA 2ZMBA 3UIFA 3VVFA 3MQ9A 2Y84A 2O1LA 3OO9A 1A55A 1MRPA 4I8CA 5HPQA 3PPQA 4Z7EA 4IO6A 1IZ1A 1MPDA 1NKXA 2Q2CA 2UVJA 1P1OA 4KI0E 3HHFA 1EZPA 1H3DA 4JSDA 4LP2B 4R72A 3G7WA 3T66A 4F1VA 1LAGE 2NXOA 3OO7A 4C0RA 3C34A 5TP9B 3IOVA 2OK2A 4NF6B 1N84A 2HEUA 2RKMA 3V83A 4GL0A 5DTBA 5DEXA 4KPTA 4EF1A 2QS4A 1SW1A 2UXAA 2Q89A 4OERA 2I58A 2R71A 1PB7A 2UVIA 3RGYA 2ESNA 3V89B 3H4ZA 4OWDA 5CC2A 3PPRA 2XXRA 2XXXA 4XKNA 2QMWA 4DCXA 4JWXA 4LZ8A 4G68C 1T0KA 1DOTA 4QFOA 4EQ9A 3K4UA 4YICA 1SDXA 4YB7A 1H76A 2I3VA 2H99A 2G93A 5DYHA 1POTA 2H5YA 2X7PA 4H0WA 1FQCA 2QL3A 3A3UA 3S9NC 4XKQA 4G8HA 1FQEA 1MXZA 4WXJA 1UTBA 1PC3A 2O69A 1Y3QA 5AA2A 1FTOA 3UA8A 4EUOA 2DVZA 5CI5A 3UK4A 1FTKA 3VVEA 1EZ9A 1AOVA 2DOJA 4EDPA 3OSQA 1I6QA 4F31B 1JEUA 2V25A 3FVNA 3LSXA 4ESWA 3H7MA 3E3KA 1MM7A 2XX9A 1SBPA 1CE2A 1IITA 1BIYA 2W7YA 3RQTA 1SW2A 4YKKA 1QVSA 5FHMA 1SYIA 3MJNA 2OWTA 3EN3A 1SYHA 2Q9TA 3BFTA 4R9FA 3CG1A 2PMSA 3VLWA 4QSEA 3K6WA 5TPAA 3H6VA 2I49A 4Z0IA 1MY1A 1A99A 3ILTB 2DE3A 5HM4B 1A8EA 2NOOA 1IUDA 3O28A 4OMBA 4F39A 4H5GA 3CFXA 4N13A 3IOUA 2QS1A 3PMXA 1NFTA 3C33A 4KR5A 1XHYA 5AE4A 3IR1A 4PE5B 1H45A 3SEYA 2DWAA 5H8NB 1B4HA 3RT8A 2CMOA 1DMBA 3L6GA 1BP5A 3DP6A 2D21A 2XXVA 3G3KA 4DXBA 3H06B 1JVYA 2ZNTA 1B0HA 1M5CA 3DLNA 2HFBA 4FIMA 4PFYA 1RYOA 4YAHX 4RNSA 3MW0A 3D4GA 1P1NA 3KZGA 2HAVA 2LAOA 4LATA 1TFDA 1LCFA 2OJTA 4LVQA 3CIJA 4Q30B 4HCYA 3O6GA 4GLIA 1ZMGA 1JEVA 3ECRA 3AXFA 1IEJA 3UGWA 5I2KA 2HQ0A 1M5EA 2F7BA 1AH5A 1QJMA 3RY3A 4BDQA 1SQYA 3CR9A 3VLUA 4R2FA 1MG1A 2UVGA 1UTHA 1LAFE 1S9TA 4C1TA 3RLFE 4AQ4A 3T9UA 1LLSA 1NNFA 4P11A 3T96B 3I5OA 4LA9A 5H8HA 4MH5A 1MDQA 2RC7A 3IX1A 4ZEBA 3IJOB 5I58B 1Y1MA 3IO6A 3IJXB 3SDFA 2DSFA 3KJ7A 2V3TA 2QPQA 1NNTA 2PX1A 1FQBA 5KDTA 1LFGA 2V3QA 2DQVA 5F7VA 1II5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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