3AXFA

Perrhenate binding to a11c/r153c moda mutant
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
GKITVFAACSLTNAMQDIATQFKKEKGVDVVSSFASSSTLARQIEAGAPADLFISADQKWMDYAVDKKAIDTATRQTLLGNSLVVVAPKASVQKDFTIDSKTNWTSLLNGGRLAVGDPEHVPAGIYAKEALQKLGAWDTLSPKLAPAEDVCGALALVERNEAPLGIVYGSDAVASKGVKVVATFPEDSHKKVEYPVAVVEGHNNATVKAFYDYLKGPQAAEIFKRYGFTIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Molybdate-binding periplasmic protein
publication title Binding of ReO(4) (-) with an engineered MoO (4) (2-)-binding protein: towards a new approach in radiopharmaceutical applications.
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal binding protein
total genus 73
structure length 231
sequence length 231
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3axfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3axfA02
4G68A 3BFTA 2E0SA 2ANJA 1WODA 1MS7A 1VSOA 3MUQA 3GLBA 4OQOA 2ONKE 3SDFA 4QRZA 2CZLA 1YCJA 2B3FA 1FTMA 3KJ7A 4NF4A 2VD3A 2IA4A 3PD8A 3RUMA 1GV8A 1XC1A 3FJGA 4F1YA 4E0WA 4OEUA 1VR5A 4F18A 4ZEIA 1FTOA 3MZ1A 1RYXA 2O68A 4PFWA 4EQ7A 1USYH 3K6VA 2V93A 4O3BA 3KOSA 1PEBA 1JEUA 3PMXA 3OEMA 1FQFA 3RPWA 4BLAA 1A7LA 4N13A 4X1DA 2RC9A 5AA3A 4FAJA 2P0SA 3VXCA 2I48A 5JK4A 3TAJA 3KEIA 4GOTA 1T0KA 2R71A 2RF1A 3Q29A 1B40A 5EHSA 4GL8A 3TDJA 4JSDA 1IXHA 2V84A 1KWHA 3HV1A 2O1LA 2X7QA 4DCYA 1US5A 4Z7EA 2V25A 3G3JA 4LZ8A 1DTGA 2PT2A 3TFLA 4LA9A 1M5FA 3UA8A 4ELPA 1JETA 1B4ZA 1LBBA 3O6IA 4GQOA 1SW5A 3LSWA 3FXQA 5CRYA 3R7XA 4BDQA 4E0XA 3TODA 4F3GA 4RJZA 4OERA 4HTGA 3CFZA 3LBSA 3IOTA 2DWHA 2Z22A 2OJTA 4OVJA 2Q88A 1UTBB 2H5YA 3G3KA 3MP1A 5I56B 4ZEDA 3ODBA 3FXUA 4NF6B 1OLAA 1Q1KA 4DE8A 4QFKA 1OMPA 1ANFA 1US4A 2V3TA 5A5XA 1UTBA 3K4UA 2Y7PA 5I56A 3CG3A 1BP5A 3SKPA 2XXPA 3HPIA 3TTNA 1QW0A 3FJ7A 1NH7A 4KYSA 1D9VA 2XXQA 3VVDA 4BDNA 4NF5B 3QYTA 5DVIA 2PVUA 5DYHA 1LB8A 2ZNSA 4DXCA 1B52A 3KN3A 5FTHA 3PPRA 2DWJA 1H43A 1OVBA 2HXWA 4RPOA 4FATA 4GWOA 2P1SA 2DE4A 1SYIA 3SETA 5AA2D 3QK6A 3RY3A 3PPPA 2Q8JA 3CSBA 3FV2A 1B05A 4U4XA 1VE4A 1MQJA 2HFBA 1P99A 3CI8A 3UGWA 3C33A 1QKAA 3FVGA 4H67A 5H8QB 3W9VA 4NMYA 4ZEBA 3FV1A 3CG1A 1O63A 3TCFA 1LLSA 5H8FA 2Z8EA 3K0VA 3OSQA 4XKQA 4OENA 1MXXA 1DOTA 4IGTA 5KZTA 1Z7NE 2THIA 2QMXA 4GFRA 1MDP1 3QUJA 4I1DA 3TPAA 4KI0E 3G3FA 3K6WA 3MWBA 1PBQA 1MPDA 3H7MA 3KG2A 3PPNA 5CM6A 1IQ7A 3ILUB 5I58B 4IO2A 4ESXA 2NVUB 2DP8A 3V8XB 3FIRA 1B2HA 2X7PA 4KPTA 1IXCA 3EF7A 4H6DA 2QSXA 2YPNA 2R9JA 3Q25A 1NKXA 1JQFA 4F2OA 1IUDA 3D4CA 3CRBA 3EHSA 1H45A 3E4RA 3T9XB 1SVXB 3W15C 1HSLA 2Y84A 2VOZA 3FVNA 4EQ9A 3KZGA 3DLNA 4MLQA 3ZS6A 3WAFA 3FGSA 1R6ZA 4PFTA 2F97A 1JW4A 1MQGA 1FTJA 3LSLA 5L8DA 2DWAA 3PUZE 4OWDA 4THIA 4YKJA 3TYHA 3FD3A 2F7BA 5ISUA 1JW5A 2PMSA 3TQLA 1EZ9A 4ND9A 4NE4A 4EXLA 2RCBA 3RN8A 4G2ZA 3GBAA 1AOVA 3QIMA 2RC7A 1LAFE 2V3UA 3G3HA 1Q35A 4Z0IA 4RY1A 3K1MA 4F3BA 4OFJA 3EQ1A 4YICA 3KJTA 3VLWA 2UVGA 1Y3NA 4YKKA 2P2AA 2O69A 2VD2A 3CR9A 3IR1A 3A3CA 4R6YA 1TFAA 3MW0A 2R6GE 2A5TB 4O3AA 3UN6A 3SEYA 3MVWA 1OIBA 3RNNA 2FYIA 1A55A 1A99A 3MZ9A 2XHDA 4MF3A 2DE3A 4PP0A 1Y3QA 3LSFB 1YPNA 3I6VA 3C36A 1B7UA 4F29A 4WXJA 4EDPA 2QS1A 1IZ1A 5DTBA 4EUOA 4LQ2A 4R2FA 3TMGA 3RTFB 4IB2A 4DDDA 2HEUA 3ONMA 4ISUA 5KDTB 5FHMA 2F7AA 4M4GA 2F6PA 5TPAB 1LBCA 1ZJLA 4IO4A 4PQJA 3P7IA 5I2KB 5DEXB 1MY3A 1UIVA 5ICQA 4R75A 5H8NB 3PMVA 1DMBA 1EZOA 4Q0CA 1GVCA 4ZZEA 2GRVA 3K01A 4KHZE 3LSXA 4YB5A 3I3VA 3DP8A 2FA7A 3OMBA 1B3EA 1EH3A 1SD3A 5DEXA 3VE1B 3T9UA 3UORA 5H8NA 1PBPA 1MXZA 3C32A 1QJMA 4HW8A 2KLFA 1B0LA 4R6KA 2ZNUA 3M3KA 5ITPA 1MY4A 3OD7A 5DVJA 4F39A 2O7IA 3TELA 1AH5A 3IJXB 3U92A 1Y20A 4YKPA 1P1WA 4RK2A 4F3PA 2H98A 3RLFE 3LC8A 2DS9A 2ALUA 3Q27A 3H6WA 1MM7A 4R73A 5JTYB 1I6QA 1D4NA 3T96B 3FVOA 5B70A 3K1PA 1P1OA 4OTEA 3VVFA 3R26A 1TXFA 3C34A 4MBPA 1F9BA 2E1SA 3HCQA 4YZZA 1MY0A 1XS5A 1N3WA 1AIVA 2NXOA 5BWJA 1WDNA 3HN0A 2OWTA 1SW4A 3T9VA 2DE2A 1MY1A 3K6UA 1FQAA 3H4ZA 3TTMA 2PYYA 1R9QA 1FCKA 1LSTA 5JEIA 2VHAA 4OEVA 2Q2CA 5K2YA 4G68C 2OCUA 4BDOA 3KOTA 2OLBA 2XX8A 1M5BA 2CMOA 2XXYA 2HAVA 1L5TA 4BDLA 2QS4A 1YAEA 4FORA 3SEVA 1MRPA 1DPPA 1VFDA 2PT1A 1SW2A 3IL1B 2ZMBA 5CMBA 3K2DA 1IITA 4OMBA 4NF8B 4DCXA 2Y7KA 4XKNA 1B9JA 2O6AA 3SEWA 1XOCA 3H6TA 3JYRA 3M8UA 4R9FA 4HCYA 3ZSFA 3GXAA 4Q30B 1QKBA 2O51A 3BKIB 4ZE9A 4G8NA 4GF8A 3O2AA 4Q5TA 2AL5A 3RGYA 1URDA 2D21A 2YLNA 3IAZA 4GL0A 4U21A 2F5XA 5ICTA 3ZKKA 3U1OA 3SESA 4NEDA 1OVTA 4ELRA 2RKMA 4HCWA 5CC2A 3T66A 1PDAA 1I69A 4UACA 4F1UA 4AB5A 3PUVE 3EPEA 2ESNA 4NF6A 1CE2A 4ZEFA 4DXUA 1NNTA 3B6TA 1ZLQA 3USDA 3CIJA 1LCTA 4EXKA 4TOZA 3R6UA 1Y1ZA 1SDXA 4MLVA 4U23A 3OO8A 3G7WA 1PB9A 2QL3A 3HHFA 3JZJA 5J1DA 2OK2A 5CMMA 2I4BA 3A3UA 3K1NA 4MH5A 5K2XA 3IJOB 2ONRA 3O66A 2Q2AA 1D3KA 4TQUQ 3G3GA 1NH8A 1QUKA 4QHQA 3FATA 1LCFA 1RKMA 4NF5A 2GHAA 3S2VA 1Y4TA 1TT1A 4JWOA 4U4SA 1P1NA 1LFGA 1B0HA 1S9TA 4OESA 4N6PA 3O28A 5CI5A 3TQWA 2NWJA 4QFNA 1TWYA 1B5IA 4NTLA 4X1BA 1MY2A 1B3GA 4FJPA 3OOAA 1M5EA 3AXFA 2ZYMA 5TP9B 2A5SA 3U94A 4O3CA 2F35A 4ZEKA 1GTKA 1BTJA 5H8QA 2H4IA 3TKDA 3UP9A 2PX1A 2QS2A 3C9HA 1YTVA 5CBRA 1B1HA 1NNFA 3IB1A 4FIMA 4JB7A 4ECFA 1S50A 3PV0E 1B5HA 1PB7A 2DOJA 3TUSA 1A8EA 2REJA 4KCCA 2B3BA 4OFLA 5DVFA 4ESWA 4H5FA 4YMAA 3BBRA 4IY6A 4IY5A 2O7UA 3F11A 4Q8RA 3B6QA 1LGBC 3B6WA 3IO4A 1NFTA 4BDRA 2UYEA 1XVXA 5I58A 1XT8A 1FQCA 2HQ0A 3N26A 3E9XA 2AL4A 4ONYA 3D4GA 2DQVA 2QJEA 4KYDA 3EHUA 1DSNA 1LAXA 4XKRA 1UIUA 3MJNA 3H3GA 2XD2A 4NWDA 2Z8DA 3VV5A 1Y9UA 1MXYA 5AA2B 3W9WA 1A54A 3ECRA 4K3FA 5FHOA 3MVYA 2F34A 1CB6A 3N94A 3DP4A 1SI1A 3MBPA 1MM6A 1IXIA 1PC3A 3U8QA 1POTA 2WKYA 3PPOA 2H9BA 4FEDA 5I59B 4XKPA 2XXHA 1GGGA 4LATA 4BDMA 1MQIA 5TU0A 1MH4A 5ELVA 4POWA 4PFYA 3H6UA 1SBPA 3BFUA 1J1NA 2UVJA 2Q9TA 4OETA 4YKIA 3OEKA 5KCJB 3O6GA 1USYE 3KN8A 1MQDA 1LFIA 1QULA 3O29A 5EHMA 1S7YA 2Z23A 4KYEA 3EHTA 4H65A 4IO6A 1PB8A 1FTKA 2UVHA 4LQ5A 1QUJA 2A5TA 3GZGA 4YB7A 3V5AA 4C1UA 4WKMA 5KCJA 1RYOA 3RQTA 1MXWA 1B7HA 4IO5A 4X9TA 4XXUA 2ZYNA 4RYAA 4JWYA 4QF9A 3O97A 2BJJX 4IGRA 3IOVA 4QSEA 3S9EA 5ITOA 3ZKLA 4RPNA 4G77A 1IIWA 1N84A 3T93B 3OXNA 4QFOA 4I9DA 3KN7A 2HCAA 5KDTA 4QSCA 2DVZA 5TPAA 2UVIA 2XXWA 2G29A 2HZKA 3C31A 4G68B 5I2KA 3I5OA 2QPQA 1EU8A 1B58A 3QAXA 1LAHE 2XXTA 3LUYA 1A8FA 3VLVA 4DXBA 4GXSB 2X26A 3FVKA 3C35A 1XHYA 4NF4B 1XVYA 4YB6A 3E13X 4YMBA 3CFLA 4JDFA 2ZNTA 4MFIA 3CFXA 4DZ1A 5IKBA 3H06B 2RCAA 3TCGA 1MDQA 1N7WA 3H03A 3G3IA 3WAEA 3MVZA 5CMCA 2FNCA 4DIGA 3TEPA 4IO7A 1Z7ME 2F8DA 3VFJA 1B1XA 1FW0A 5I84A 3A09A 1NNPA 4FECA 3S9MC 4ZZAA 2M8CA 1H3DA 3RT8A 1B51A 1JVXA 3IORA 3THIA 1ZTYA 4GD5A 5JTYA 4DLDA 4JBZA 3MPLA 3OENA 3FASA 3UK4A 2UYFA 2GHBA 3HHGA 4WEDA 2I58A 3DP6A 3IO6A 5I57B 3PMWA 3KSJA 3MVXA 1ATGA 3E3KA 4GLIA 4P0IA 4LUBA 4TLMB 2QS3A 2ZYKA 3JV9A 3LR1A 4FEBA 1FTLA 1M5CA 3T22A 2D5WA 3K00A 2GH9A 4OHNA 1B3LA 3IOWA 3U93A 4KR5A 3VLUA 3FUZA 2NOOA 3EN3A 5I57A 3PUYE 3KSXA 3MC2A 1ZBMA 3KGCA 2I49A 4EQBA 3L6GA 1OQGA 1MXUA 5AA4B 3SERA 5L9SA 2GFEA 4QFLA 4QFPA 3MPKA 4H1XA 1NL5A 4ELQA 3K6XA 2Z8FA 4JWXA 4NF8A 1HSEA 3RT6B 2Y7IA 3PGFA 5FTIA 2ONSA 1ZKBA 1UQWA 1IXGA 4U2RA 3MQ9A 1IEJA 3N6UA 4POXA 2XXVA 4ZE8A 1SQYA 3TZAA 5AA4A 5F1QA 5A5XB 3CVGA 4OZ9A 4OXVA 3FJMA 1I6BA 2W7YA 4F19A 3OO9A 3MAMA 2DYXA 1B3FA 3IB2A 4RXLA 2I0BA 1P1UA 1MG1A 1JNFA 1ZIUA 3N6TA 3OO6A 4C0RA 1JW1A 3DELB 3FXRA 2REGA 1ZMGA 5B7DA 5F7VA 4KD5A 1ELJA 4I8CA 2XX7A 3S9LC 3S9NC 1SW1A 3IK6B 3IX1A 4L17A 1N0TA 2ZXTA 1P1QA 3QUFA 3CSGA 4RNSA 2NUVA 4ELOA 1FQEA 4PETA 4RK9A 2Q89A 4PFUA 1N76A 2O84X 4HS7A 2F7CA 1B7ZA 3QXMA 4P0GA 3TCHA 3PD9A 2I6EA 4U1OA 1M5DA 4X48A 2DVCA 1ZU0A 5H8FB 2G93A 1O7TA 5HBCA 3L6HA 3OSRA 4RA1A 5M2VA 1N3XA 4YU0A 4JXIA 2AYSA 2DSFA 3O6HA 4TLLB 3S4UA 5IAIA 3OO7A 4GIZA 3TTKA 2I0CA 2DXYA 4OFOA 1HSJA 3PPQA 3TTLA 1MH3A 2ZYOA 1FQBA 1OQHA 1NMUA 1EZPA 3QSLA 5TP9A 4KCDA 3KBRA 4ZDMA 1LFHA 4F2QA 3O9PA 1SI0A 2UXAA 4R74A 5H8HB 4FE8A 1FQDA 4LZ5A 4XIGQ 4U22A 3C4MA 1D9YA 1QUIA 2VP1A 4H5GA 1BLFA 4F1VA 3ILTB 4AB6A 2F6GA 3UIFA 3V83A 4EF1A 1VFEA 3T9HB 2D3IA 1Y4CA 3U72A 3VDFA 5FHNA 4OYVA 2XD3A 3TTRA 2YJPA 1MXVA 5H8HA 3H6VA 4WEPA 4LZ7A 1R9LA 1AMFA 3B7DA 1GR2A 1H44A 1N7XA 5AA1A 2I3VA 2XXRA 5LOMA 1MPBA 4LP2B 1MPCA 4XTCQ 4R72A 5I2NB 1UTHB 5HM4B 1MQHA 1NNKA 2XX9A 4C1TA 2ABHA 3KFMA 3V89B 2VGQA 3MP6A 1BIYA 3HSTA 2PBWA 2DXRA 4R6HA 3M3FA 1JVYA 3PUWE 1B32A 2V3QA 3SEXA 3DM0A 3HO7A 5AA2A 3RTWB 1AL3A 1SYHA 3PUXE 1N04A 4GRKA 1A40A 4ZECA 4KFQA 3IB0A 2O1MA 4IO3A 4UA8A 4H8IA 1I6AA 5I2NA 4PE5B 1UTHA 4R2BA 2QRYA 2DWIA 2I3WA 4G8MA 2RINA 1O64A 4KQPA 3K02A 3N5LA 4F31B 4N07A 5L9MA 2IEEA 5I59A 1LB9A 3Q28A 5DT6A 4LONB 2OBGA 1JEVA 3VVEA 2XXIA 2HAUA 1B6HA 2Y7RA 1LAGE 3FZVA 1H76A 4H0WA 4YAHX 1DPEA 2I4CA 1Y3PA 2F36A 3MZBA 1WVJA 1II5A 1Y1MA 5H8SA 5BUUA 4U1ZA 2HZLA 3M3LA 4F3SA 4GXAA 4QSDA 1R1NA 3Q26A 1BKAA 4H8JA 2AIXA 4EF2A 4M1VA 3PU5A 4P11A 2H25A 4LVQA 1POY1 5AE4A 1B3HA 1QVSA 3MP8A 1TFDA 4R9GA 4F22A 1B46A 4ZS9A 3OELA 2XXXA 5L9OA 1URGA 1B5JA 3VXBA 2XXUA 2H99A 4G4PA 4I62A 2OWSA 5EYFA 2Y7WA 3GBBA 5HPQA 2F78A 4AQ4A 2B65A 1OLCA 2RC8A 5CBSA 4G8HA 2QMWA 3IOUA 4GVOA 1DTZA 4NWCA 5CMKA 2LAOA 2OZZA 3SEUA 4JSOA 1B4HA 1URSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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