3C35A

Crystal structure of glur5 ligand-binding core in complex with cesium at 1.97 angstrom resolution
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
publication title Molecular basis of kainate receptor modulation by sodium.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 79
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c35A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c35A02
2Y84A 2ALUA 1MDQA 4C1TA 4R73A 3Q28A 3H7MA 4OQOA 5DT6A 4P0GA 2HCAA 3T9HB 3S2VA 3CRBA 3JYRA 5A5XA 3L6GA 1FQFA 5TPAB 1A40A 4GRKA 1HSJA 2V3QA 4O3CA 1LAFE 1POY1 3PGFA 1P1QA 3TPAA 4KYEA 1LBCA 3C31A 3RLFE 2PVUA 2ZYMA 2DYXA 4IGTA 1S7YA 3GBAA 1B3HA 5BWJA 1MXUA 5ICTA 3VFJA 3TKDA 3K2DA 5H8FB 4OENA 5I56B 4F1YA 3TFLA 4G8NA 3FVKA 1D9VA 4ZS9A 2I4CA 4JWOA 2YPNA 3UK4A 4PETA 1FTJA 3KOSA 4YB5A 3SESA 2ZMBA 1JNFA 2UYFA 3KZGA 5I57A 4F18A 1TFDA 4LUBA 1B6HA 1LB8A 5KCJB 1B32A 1D9YA 1Y3PA 3K6VA 3FASA 3E4RA 2PX1A 2DVCA 2UVHA 5B70A 1PB9A 3U92A 2QJEA 1MH4A 5H8QB 4P11A 2YLNA 2O84X 2F6GA 4G8MA 3K00A 3UIFA 5F7VA 1FQAA 2H4IA 1XT8A 1ZKBA 3P7IA 1YCJA 2DOJA 2GRVA 4GVOA 3OO7A 3CR9A 4IO4A 2F78A 1O64A 2X26A 1H45A 2G29A 1IXCA 3O2AA 2OCUA 3C35A 4JSDA 1MY2A 4LQ5A 4ECFA 3CVGA 4F3BA 1LFHA 4RPOA 1FTKA 3OSRA 1BIYA 1LFIA 1UIVA 1R9LA 1I69A 3T9VA 4N13A 3EHUA 1A99A 3EF7A 3VXCA 2BJJX 4R74A 5L9SA 1D3KA 2PBWA 4MBPA 1SYHA 1MQDA 3IR1A 1QUIA 4IO2A 3MP6A 5TPAA 3C33A 1IXGA 2B3FA 2F36A 3OMBA 4KCDA 2RF1A 3PV0E 1B1HA 1ZTYA 3VDFA 4OYVA 3FJGA 3RTWB 1Y4CA 1B3EA 5FTIA 1LAGE 1S50A 4U21A 2F7CA 2HEUA 4KR5A 4Q5TA 3SEUA 3EPEA 1Y4TA 3IJXB 1B3FA 4G2ZA 2UYEA 3KSJA 2F5XA 4UACA 4Q30B 3FD3A 3A3CA 5I56A 2HZLA 4M1VA 4G4PA 1POTA 4QSEA 3RUMA 3K4UA 1A8FA 1AIVA 3B6QA 2ONRA 4YU0A 3EHSA 1JW1A 2ZYKA 5L8DA 1B0LA 1B4HA 4I9DA 4YB6A 3V5AA 1UTHB 4F31B 3MPKA 3MJNA 4ZE9A 5KCJA 4YKJA 1DPEA 1D4NA 2ABHA 4POXA 4QFOA 4FEDA 3FVGA 3DP6A 4JWXA 1MXVA 4HS7A 4FAJA 3SEXA 4ND9A 1SVXB 5H8HB 1MPCA 5AA2D 3B7DA 3ODBA 4X1BA 5L9MA 4F3GA 2A5TB 2Q89A 1M5BA 4IO7A 4AB6A 5I2NB 2VP1A 3C36A 4ZE8A 3ZKLA 3TMGA 3PPRA 1PBPA 2GFEA 1MM7A 2F7AA 1PB8A 1ZJLA 5CMCA 1P99A 4EXKA 1OLCA 1A7LA 1S9TA 4Z7EA 3K01A 3K6XA 1OMPA 1QKBA 5I59B 3PMXA 4E0XA 1GTKA 4ISUA 2OJTA 3PMWA 4FE8A 2P2AA 5M2VA 4I1DA 1IIWA 4X48A 2V84A 1M5FA 4H67A 2FA7A 2XX9A 1NNPA 3EQ1A 1OVTA 4N6PA 3ONMA 1PBQA 3S9MC 3L6HA 1T0KA 3MVZA 4ZEBA 2AYSA 3RT6B 4DZ1A 2Y7RA 3BBRA 4DE8A 5KZTA 3ILTB 3DLNA 4RK2A 3OELA 3MVXA 3SEWA 1H76A 3LSWA 2XD2A 5EHMA 1IEJA 3PUVE 3USDA 4IY5A 2W7YA 4NTLA 1BP5A 2R9JA 5TP9A 5K2XA 1LCFA 1B3LA 4U1ZA 1Y1MA 2X7PA 1DPPA 3PD8A 3S9EA 5H8HA 3R26A 1B5JA 4O3AA 2QMWA 3G7WA 1USYE 3U8QA 1OQHA 4YB7A 4THIA 2QL3A 4HW8A 3TCGA 4DCYA 1YAEA 4R2BA 1UQWA 2A5TA 1SDXA 3M3KA 1NL5A 4GXAA 3D4GA 4JWYA 3PUZE 1SI0A 1SYIA 5AA3A 3VVDA 4EF1A 2RC7A 3FV1A 1I6QA 4IB2A 4P0IA 4X1DA 3ZKKA 4OEUA 2ESNA 4N07A 3B6TA 2H98A 5J1DA 3V8XB 4OFLA 4PE5B 4H1XA 4F1UA 3M8UA 3G3GA 3UGWA 1MY4A 4L17A 3QIMA 4C0RA 1WODA 1MQIA 3HO7A 1B1XA 5I59A 2XX7A 1JEVA 1ATGA 4AQ4A 3OO9A 3ZSFA 4XIGQ 3IAZA 2F8DA 4LZ7A 1TWYA 5DVIA 2RC9A 2Y7PA 1N0TA 4ELQA 1EZPA 1RKMA 4FECA 3VLWA 3OOAA 3TYHA 2O51A 4AB5A 3K1PA 4EQ9A 3KEIA 1HSEA 3JZJA 3A09A 4WEDA 3F11A 4LQ2A 4NMYA 1FW0A 5CBSA 2B65A 2CZLA 2XHDA 2Y7KA 2V25A 1SBPA 2HZKA 3C34A 3ECRA 4YKIA 1JW5A 4PFWA 3T96B 3AXFA 5DTBA 1IZ1A 2V93A 1IXIA 1OQGA 1UTBB 4RXLA 1Y20A 1XHYA 3G3IA 1A54A 3CSGA 3CIJA 1P1UA 4U2RA 1GGGA 2GHBA 1B7UA 3S9LC 1XS5A 4NE4A 4X9TA 3TCHA 1LSTA 4IY6A 4K3FA 1LBBA 4R75A 3W9WA 1WVJA 1LAXA 1N3WA 1QUKA 3GXAA 2DWIA 2AL4A 4F19A 3VV5A 4GIZA 4ELPA 4IO5A 3TODA 3HN0A 3CFLA 4KD5A 2WKYA 4OTEA 3CSBA 3OSQA 3RNNA 1RYOA 4PFYA 1B4ZA 2NVUB 5KDTB 2ONSA 5ITPA 4HCYA 2HXWA 4DDDA 4LONB 2RCBA 4C1UA 1N3XA 1FCKA 3VVEA 3N5LA 5K2YA 2V3TA 2THIA 3TUSA 4DXCA 3FV2A 3K6WA 5IAIA 3N6TA 4WEPA 3RPWA 4PFUA 1AOVA 4G8HA 3VVFA 4JSOA 3KBRA 3T9XB 2R6GE 1NNKA 4M4GA 2QPQA 3EHTA 3ILUB 5FHMA 4TOZA 1SQYA 1MQGA 1M5CA 1B7HA 2A5SA 1JVYA 4OFJA 3MAMA 4IO3A 2IA4A 2ANJA 3BKIB 4NF4B 1UTBA 2O1LA 4KPTA 3VE1B 4BLAA 2O1MA 5AA1A 5CBRA 4QHQA 1Y9UA 3K1NA 4NWCA 3TELA 1MG1A 4NEDA 3MQ9A 2NOOA 2ZNSA 1DTGA 1VR5A 3IL1B 1P1OA 1B0HA 4QSCA 2I48A 1URDA 1QKAA 1FTOA 2PT1A 3FZVA 3TQLA 1LAHE 3HV1A 4GD5A 1L5TA 4XXUA 2HFBA 2F35A 1VFEA 3BFTA 1FTLA 1ZMGA 2ZXTA 1TT1A 1I6BA 3MWBA 2KLFA 4I62A 5AA4B 4Q0CA 4R6YA 3N94A 3CG3A 1MPBA 5TP9B 3FXUA 2UVGA 1P1WA 3Q27A 4POWA 3OXNA 5JTYB 5KDTA 3M3FA 4ZDMA 3TCFA 1J1NA 2DSFA 3MPLA 4BDLA 1R6ZA 2VGQA 4IGRA 2Q2CA 3IX1A 2QS3A 3FJMA 2QS4A 5ELVA 4FIMA 3H6TA 4YMAA 2NXOA 2O7UA 1BTJA 3SEVA 1MXXA 2UVIA 2F7BA 1N84A 5BUUA 3V83A 4YZZA 2DE4A 2GH9A 3MUQA 4JDFA 1LCTA 1N76A 4H6DA 4DCXA 4GWOA 3THIA 4ONYA 3DELB 4F1VA 2FNCA 3O66A 2OWTA 4NF4A 5I84A 4RJZA 1MXWA 3SERA 4QFLA 2DWAA 3O6HA 2PT2A 4OXVA 1DMBA 4E0WA 1R9QA 3SETA 3GLBA 4OFOA 3QXMA 3IB2A 3OO8A 4YICA 4LATA 2HAVA 3D4CA 4DXBA 4GQOA 1PDAA 3Q26A 2LAOA 5IKBA 1MQJA 1Y1ZA 4NF5B 3W15C 3SKPA 4F3PA 3UA8A 1H3DA 2PYYA 1LFGA 1URSA 3TTKA 2O69A 5AA2B 1Z7NE 4G68C 1IUDA 3MZ9A 2Y7WA 1FQDA 1NMUA 3OO6A 5AA4A 4H8IA 1VE4A 5AE4A 5H8NB 3KN7A 4U1OA 2Q88A 5DEXA 3G3FA 3FXRA 3LUYA 3TZAA 4EDPA 3UP9A 1JETA 5JTYA 2QRYA 4NF6A 2IEEA 1MDP1 3KJTA 2NWJA 1ANFA 5EHSA 3RQTA 1DTZA 4EQBA 1KWHA 1NH8A 3E9XA 4GXSB 3KGCA 3PUWE 5JK4A 4ESWA 3IB1A 2M8CA 1P1NA 3T22A 4FJPA 3GBBA 5I2KB 1M5DA 2DE2A 2X7QA 2XXVA 4BDNA 1VFDA 4OESA 2D5WA 1A8EA 1IQ7A 2XXWA 2D21A 2I0BA 1XVYA 1ZLQA 2O68A 4OETA 4F39A 3R6UA 3QAXA 3CFZA 3IJOB 3IOTA 2P0SA 1B7ZA 1OVBA 1FQCA 3MP1A 1NFTA 3A3UA 3V89B 3RGYA 4MLVA 4H8JA 3KFMA 3FUZA 2DQVA 2DWHA 1Y3QA 2D3IA 2XXIA 4MLQA 4GFRA 2FYIA 3SEYA 3T66A 1GVCA 5DVJA 2DXRA 4RPNA 4NF8B 3FATA 3MBPA 3UORA 4OHNA 2XXYA 3E3KA 1A55A 3IOVA 4H65A 5L9OA 1EU8A 3I5OA 1B40A 1N04A 3O6GA 5HM4B 2AL5A 2G93A 3W9VA 5ISUA 4JB7A 2Z22A 3E13X 3O6IA 1URGA 1QVSA 3K0VA 1B46A 2Q9TA 3T93B 4R9GA 1MRPA 3OEKA 4NF5A 3T9UA 4DIGA 4R9FA 3H6VA 2RKMA 4ELRA 3HHFA 4R6KA 1MY1A 5AA2A 2AIXA 1Y3NA 1H43A 3TTNA 3FJ7A 1AH5A 3N6UA 2DXYA 2ZNUA 4F3SA 1MXYA 1XOCA 5H8NA 2XXTA 2XXXA 3G3JA 3O28A 2O7IA 3LBSA 3MC2A 3HHGA 3MVYA 3RN8A 3LSLA 3HPIA 3Q29A 2I0CA 5EYFA 1FTMA 2CMOA 2O6AA 3WAEA 4ZEKA 3IOWA 3R7XA 1MY3A 4FEBA 2XXRA 5I2KA 3C4MA 3C9HA 5ITOA 1M5EA 3TTMA 1B52A 3QSLA 2R71A 4EF2A 2DP8A 3O97A 2REGA 3CG1A 4MFIA 4U23A 3ZS6A 1DSNA 1FQEA 4TLLB 4TQUQ 4YKKA 3HCQA 3SDFA 4OZ9A 4LA9A 3KG2A 2DS9A 4OWDA 5HPQA 3IK6B 4LP2B 3K02A 3RTFB 3DM0A 4YKPA 1N7WA 3G3HA 4WXJA 5I58B 4NF8A 2F97A 3KJ7A 4U4XA 4BDMA 1B2HA 1O7TA 3MZBA 2I6EA 3PPPA 1MS7A 3FIRA 1I6AA 2RINA 3PPQA 2I3VA 2XD3A 5DVFA 3EN3A 1TFAA 1ZBMA 4R2FA 1EZOA 4KCCA 4U4SA 4H0WA 2E0SA 4LZ8A 1HSLA 5HBCA 5CMKA 4RA1A 2ZYOA 2QSXA 1WDNA 4JBZA 2DE3A 4OEVA 5F1QA 2HQ0A 4BDQA 2RCAA 4XKPA 5CRYA 3OENA 4G77A 2H9BA 3C32A 1BKAA 1ZU0A 1NNFA 4XKRA 2I3WA 3H06B 1B5IA 1IXHA 3MZ1A 1CB6A 2Y7IA 3BFUA 4GF8A 4EXLA 1NNTA 1US4A 1YTVA 2OZZA 4KYSA 3CFXA 5JEIA 1SW4A 4FATA 1ZIUA 4KI0E 4KHZE 1MH3A 2H5YA 2HAUA 4PFTA 4QFKA 4JXIA 5LOMA 3TDJA 1SW2A 4ZEDA 3HSTA 4ESXA 1Q1KA 3Q25A 4G68B 3PUYE 3KOTA 3MP8A 3KN3A 5CMMA 4GOTA 3QUFA 1N7XA 1QULA 5H8FA 1XVXA 3GZGA 4LVQA 4QSDA 1B58A 4OVJA 2Q2AA 3CI8A 2GHAA 4KYDA 4LZ5A 4QF9A 2OLBA 3S9NC 4F22A 2ZNTA 2E1SA 1AMFA 2REJA 3LSXA 4BDOA 3IB0A 1B5HA 4RYAA 5DEXB 1R1NA 3DP4A 4NF6B 4ZEFA 3TAJA 2UXAA 1Z7ME 4QFNA 1JW4A 1CE2A 4YAHX 1B05A 3QUJA 4GL0A 1NH7A 2Z8DA 2VD2A 5I58A 3WAFA 4H5FA 1MXZA 5H8QA 1EH3A 1TXFA 4MH5A 1EZ9A 4F2QA 3IO6A 4O3BA 3QYTA 2NUVA 4R72A 2I49A 4RY1A 1YPNA 2QS2A 2H25A 4KQPA 3IORA 4Q8RA 1ELJA 1QW0A 3B6WA 3FVNA 1PEBA 3H4ZA 1F9BA 3KSXA 3IO4A 2B3BA 2VHAA 2P1SA 3O9PA 4RK9A 4ZEIA 3VLVA 2OK2A 3H6UA 3RY3A 4BDRA 3U94A 4GLIA 4YMBA 3H6WA 3PU5A 4ZZEA 4HTGA 2XXHA 1GR2A 1JVXA 3FXQA 2DVZA 4KFQA 1O63A 3VXBA 1B9JA 1NKXA 3PMVA 3U1OA 5CMBA 1B3GA 3PPOA 3QK6A 2H99A 2XX8A 1Q35A 3LR1A 3TTRA 1FQBA 1B51A 2ZYNA 1MPDA 2ONKE 4H5GA 2DWJA 1XC1A 1OIBA 3U93A 1USYH 2VOZA 3RT8A 1MQHA 3MW0A 5CC2A 4G68A 4MF3A 3OD7A 2OBGA 4UA8A 1PC3A 4QRZA 2XXQA 3K1MA 4QFPA 1LB9A 2V3UA 4PP0A 4EUOA 3PPNA 4HCWA 5DYHA 4ELOA 1DOTA 4I8CA 1OLAA 1VSOA 4F29A 3TEPA 1US5A 4F2OA 1QJMA 5A5XB 3UN6A 5FHNA 4U22A 4FORA 4OMBA 4PQJA 3TQWA 5TU0A 1H44A 2XXPA 1UTHA 4WKMA 1MM6A 1SI1A 5CI5A 4XTCQ 1SW5A 3U72A 4RNSA 3OEMA 3KN8A 1UIUA 2Q8JA 2OWSA 1PB7A 3I3VA 3JV9A 3N26A 3O29A 1MY0A 1BLFA 3PD9A 1JEUA 3S4UA 4TLMB 1LLSA 4EQ7A 2I58A 3DP8A 1QUJA 3G3KA 3IOUA 5ICQA 5I2NA 3VLUA 3K6UA 3PUXE 3M3LA 1IITA 3H3GA 5I57B 4GL8A 1RYXA 2QS1A 1SD3A 5B7DA 1II5A 4ZZAA 5FTHA 4NWDA 3TTLA 2Z23A 3MVWA 4R6HA 3FVOA 3LC8A 2I4BA 2Z8EA 1LGBC 5FHOA 2PMSA 4XKQA 4Z0IA 4ZECA 3LSFB 2Z8FA 1GV8A 2F6PA 1SW1A 2XXUA 1AL3A 2RC8A 4DXUA 2F34A 4DLDA 2YJPA 3H03A 4OERA 2VD3A 3FGSA 4IO6A 5H8SA 3I6VA 4XKNA 2QMXA 2UVJA 5CM6A 1JQFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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