3C35A

Crystal structure of glur5 ligand-binding core in complex with cesium at 1.97 angstrom resolution
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
RTLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQNDKGEWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSRQQSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNGCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR, IONOTROPIC KAINATE 1
publication title Molecular basis of kainate receptor modulation by sodium.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 79
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-27
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c35A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3c35A02
4LQ5A 5FHNA 2UXAA 4LUBA 3VLWA 2PVUA 2H5YA 3ILUB 1PBPA 1MXXA 1ZLQA 4YICA 4GF8A 2DS9A 3VXCA 5CMBA 1USYH 2Q9TA 4RXLA 1SD3A 3RLFE 1DMBA 1ZU0A 4YB5A 1B3FA 3ZSFA 5DEXA 1MS7A 3OEKA 2DWAA 2ONSA 4H8IA 4FATA 5DEXB 3QUFA 1A40A 5ITOA 2DWJA 1B46A 3KBRA 5IKBA 2XXYA 1SYHA 4U4XA 3EHTA 2F34A 2ZNTA 1D9YA 1N04A 3C32A 4F19A 3RY3A 4XXUA 3CFZA 2XD3A 4K3FA 4THIA 2ZYMA 5M2VA 4G8HA 4H6DA 1Y3QA 3FVGA 1DSNA 4XKNA 5H8QA 3T9VA 2W7YA 1B5JA 3H7MA 3I5OA 4RJZA 1M5FA 4ZEBA 2REJA 3HHFA 5KCJA 3OSQA 1B7HA 4U4SA 2F35A 4GXAA 3K1NA 2P2AA 4YKJA 3FV1A 2XXUA 3FJMA 3SEWA 4AQ4A 1LB8A 3VXBA 1WODA 2A5TA 1WDNA 3SEVA 3HCQA 3TKDA 2Y7IA 4U21A 1I6QA 1JW5A 1EZ9A 4OWDA 5KDTA 4M4GA 3R7XA 2A5TB 2O68A 1RKMA 1PEBA 1ANFA 1P1UA 3C34A 5I56B 4O3CA 2PT2A 1NNFA 5DT6A 1MY4A 3MP8A 5AA4A 4QFNA 3O66A 4BDNA 1M5CA 3SESA 5KDTB 1Q35A 3IL1B 4R6KA 5EHMA 3PGFA 2RCBA 3TDJA 2O84X 3O9PA 3RUMA 1B4ZA 2HAUA 1VFEA 3Q25A 5HPQA 5AA4B 3TCFA 3KG2A 3PPOA 1A7LA 2PBWA 2XXIA 1B52A 4FORA 2B3FA 1D9VA 4PP0A 2QS4A 4RA1A 1LBBA 1MM6A 2RCAA 1MY0A 3A3CA 1US5A 3U72A 4DLDA 2DVCA 1KWHA 2ONKE 1MDP1 4MBPA 4QRZA 5ELVA 4NF4A 1R9QA 3PUXE 2HEUA 1AIVA 4UACA 4P11A 3O29A 3PD8A 1NKXA 3O2AA 4U1OA 3DELB 4NF4B 5ICTA 1B4HA 4PFTA 2RINA 2RC8A 3RPWA 3MUQA 4HCWA 5JTYA 2HQ0A 1BLFA 1MH4A 1Z7ME 2H99A 4G8MA 1IEJA 2ABHA 2FA7A 4LP2B 5DVIA 3TCGA 2DWIA 3UORA 3OO8A 3DLNA 5JTYB 3ZS6A 3VLUA 2YPNA 3CG1A 3AXFA 4NTLA 2VD3A 2VOZA 3E4RA 2QPQA 3LC8A 1OLCA 1PB9A 5AA2B 3RT6B 1TFAA 2WKYA 3VE1B 2D21A 4OXVA 4F3SA 3G3FA 3KOSA 4RY1A 1GGGA 3QXMA 4G68C 1B6HA 4GLIA 4MLQA 2RC7A 3FXRA 1NNKA 3V8XB 4X1BA 2Q88A 1QULA 4BDOA 2X7PA 2ALUA 4OESA 4FIMA 1TFDA 3A3UA 1Y9UA 2XXVA 3H03A 1B3LA 3G3GA 1VSOA 3LUYA 1GV8A 2FYIA 2VHAA 2O7UA 4X9TA 2Q2CA 1POTA 3GXAA 3IK6B 1PB8A 1FQBA 4H5FA 4N6PA 4F2QA 1ZIUA 3T22A 3OSRA 4FEBA 1EZPA 1IXCA 3T66A 4R73A 4LATA 2Y84A 4OFOA 1Y4TA 1LAFE 3EQ1A 1WVJA 4IO3A 3O28A 3FUZA 3S9MC 1DTGA 4GVOA 1DPEA 1CB6A 3KEIA 1IITA 3L6HA 2DYXA 2O51A 4QHQA 2ZXTA 2Y7WA 1FTLA 3K01A 4R2BA 2ANJA 4OTEA 3K2DA 5I2KA 1SDXA 4XKRA 3G3JA 5I58A 2F78A 4ND9A 4HCYA 4JWOA 4KD5A 1DPPA 2UVHA 2V84A 4H0WA 2F6GA 3U1OA 3PPNA 1HSLA 5I2KB 3QIMA 1A8EA 5L9SA 5I58B 3OO7A 2P0SA 4LQ2A 4YKIA 4YKKA 4I62A 3BFUA 4ZE8A 1B5IA 2ZYOA 1GR2A 1NH7A 3PUZE 1Y1ZA 2OCUA 1ZBMA 2F97A 5TP9A 3OELA 1H3DA 3PUVE 1SW2A 5HBCA 1A8FA 3W9VA 2OJTA 3MP1A 1VE4A 1LFGA 4F3GA 2Z22A 5J1DA 3FASA 5TP9B 4EF2A 4YMBA 3LSFB 3TQWA 2QMWA 1LCTA 4ELQA 4H5GA 2XX7A 3PPPA 1Y1MA 1LFHA 4DXCA 1VFDA 1P1QA 3CFLA 1BTJA 2QJEA 3BBRA 1FTMA 3B6WA 5FHOA 3KJ7A 3KSJA 4GQOA 3SERA 1I6BA 4IGTA 3D4CA 2X26A 4RPOA 1P1OA 3HV1A 1LBCA 2PX1A 1XT8A 4WKMA 4JDFA 1XS5A 1B3GA 4H8JA 3PMWA 2OLBA 3JZJA 3ZKLA 4YB6A 2UVJA 4Q0CA 4IO6A 2Q8JA 5AA3A 1ZKBA 2QMXA 1AOVA 2UYFA 3Q27A 4IGRA 1YPNA 5ICQA 1MDQA 3DP4A 1HSEA 4R74A 3K6XA 2NXOA 4BDQA 3PD9A 1R1NA 3VVEA 5BWJA 1QJMA 4GOTA 4OVJA 4FECA 2E1SA 1H44A 3W9WA 3M3FA 4DCXA 1PC3A 3K0VA 3K6VA 4IO2A 2AL5A 2PT1A 4ZEIA 2NOOA 5AA2D 3G3HA 1B3EA 4GD5A 1B7ZA 4YMAA 4QFPA 1SVXB 3TTMA 3OEMA 2O6AA 1MQJA 2XD2A 2O1MA 4QFOA 2F7CA 1N76A 3KZGA 4NWDA 3SEYA 4U1ZA 4F1VA 3CSBA 3MVXA 4IB2A 1I69A 3MZBA 3IORA 3A09A 3MWBA 3HHGA 5H8QB 1IQ7A 4IY6A 3CSGA 2Z8DA 4QSDA 4EUOA 3UGWA 1D4NA 3MBPA 3V83A 3H3GA 5KCJB 2BJJX 1MXUA 2NWJA 4G2ZA 3IOWA 1SI0A 2XXRA 2FNCA 4R9GA 2XXPA 5CRYA 1MRPA 3PUWE 2HAVA 2M8CA 1MH3A 3CG3A 3MPLA 2XX9A 1MM7A 4GL8A 1VR5A 2YLNA 4O3BA 2QRYA 2XXHA 1NNTA 3MQ9A 3R26A 4GFRA 4RPNA 4F3PA 2O69A 2DVZA 1XVYA 5CBSA 1QW0A 3LSLA 3FGSA 3RNNA 3Q29A 4MLVA 3CRBA 1UIVA 1OMPA 5I84A 4I9DA 3EF7A 3ZKKA 1TWYA 5CBRA 3QK6A 2XX8A 1IXHA 4XTCQ 1AMFA 3S9LC 2V93A 4G8NA 3CVGA 3QSLA 5AE4A 1IUDA 3THIA 2XXQA 1YCJA 4HS7A 1ZMGA 2I4CA 3G7WA 4ZEKA 5H8NA 1XC1A 1IXGA 4Z0IA 1B3HA 3PPRA 2V3UA 3MAMA 3LR1A 2R71A 1QKBA 5TU0A 3EHSA 3TPAA 3EN3A 2I3VA 3E9XA 1SBPA 2XXXA 3MVZA 5H8NB 1RYOA 3KFMA 4FE8A 1JETA 2QS2A 2Z8EA 5ITPA 4BDLA 2DWHA 3U94A 4TLMB 4KYSA 3TZAA 3O6IA 4LA9A 4WEDA 1BKAA 3T96B 3M3KA 1P99A 3WAEA 3FJGA 2AIXA 1Y20A 3TMGA 2H98A 4KPTA 5AA1A 3H06B 4TLLB 4GL0A 3VVFA 3LSWA 1OIBA 3UIFA 3VDFA 4H65A 1JW4A 1I6AA 4LVQA 3CI8A 4RK2A 3I6VA 3K6UA 3C31A 3HN0A 3B6QA 3OD7A 1FQEA 4DZ1A 2DOJA 2IEEA 5F7VA 2RF1A 1LAXA 1DTZA 3IB1A 4YKPA 2I0CA 4DIGA 2X7QA 1O63A 1T0KA 4ELOA 2GHAA 2CZLA 1OVBA 4DE8A 4ZE9A 1LFIA 2I58A 4R9FA 3TTLA 1MY3A 1MQIA 2AL4A 2DXYA 4OERA 3PPQA 4BDMA 3E13X 3LBSA 4JWXA 1LSTA 1URGA 2I6EA 3WAFA 3M8UA 1B2HA 4HW8A 1JVYA 2ESNA 2GH9A 1URDA 3FIRA 4PETA 1IZ1A 3O6HA 3SDFA 1GVCA 4IO7A 5FHMA 2D3IA 5I2NA 1LAGE 4MFIA 4EQ7A 1L5TA 5CMCA 3MZ9A 3ONMA 1B0HA 3MP6A 1FQDA 3LSXA 4ZZAA 2I49A 3VFJA 1R9LA 3B6TA 4PFWA 1MXZA 4OHNA 1S50A 3C9HA 4POXA 2DSFA 5FTHA 4R2FA 4F1YA 4DDDA 2HXWA 2OZZA 1JEVA 4KR5A 4GIZA 4FJPA 4MF3A 4AB5A 2AYSA 2Q2AA 1ZJLA 1LB9A 1N3XA 1UIUA 4O3AA 1SI1A 4KFQA 3JYRA 3H6VA 3TAJA 4BDRA 3PUYE 3FXQA 3FV2A 1A55A 5CMMA 2O1LA 3OMBA 1LLSA 1H76A 3T9XB 2F7BA 4TQUQ 3SEXA 3RTWB 4TOZA 1Y3PA 1NNPA 4ZEDA 2E0SA 1DOTA 3IJOB 3IO4A 3VVDA 3IJXB 4JSOA 5A5XA 2OWTA 3UP9A 1M5DA 1MQHA 3TQLA 1URSA 3N26A 2ZYKA 3C33A 1S9TA 4H67A 3O97A 3V5AA 4EQ9A 5A5XB 4E0XA 3IB0A 3QUJA 3MZ1A 1IIWA 4JWYA 5L9OA 4XKPA 3FZVA 3DP8A 1MXWA 2H4IA 2DQVA 4RYAA 4F1UA 2HFBA 3RTFB 1ATGA 1M5BA 3TUSA 2F7AA 3FD3A 3N5LA 2I0BA 4DXBA 1R6ZA 4L17A 1EU8A 2RKMA 3KGCA 4OYVA 1N7WA 2F6PA 2NVUB 1JVXA 4OENA 4ONYA 1PBQA 2I3WA 3RQTA 4PQJA 4E0WA 4KI0E 3O6GA 1B5HA 4OETA 2PMSA 3SEUA 4ZS9A 1FCKA 2QS3A 4JB7A 4OEUA 3T93B 1S7YA 1SQYA 3D4GA 3KN3A 3OOAA 1Q1KA 3KOTA 1MXYA 2Q89A 1YAEA 3FVOA 4QSEA 4YU0A 3H6UA 1Z7NE 1FQCA 3CFXA 2ONRA 3N94A 2DE2A 2YJPA 3DM0A 1NH8A 4DCYA 4JBZA 1FQFA 3OO6A 4EQBA 3ODBA 2PYYA 2R9JA 3FVKA 2H25A 4XKQA 3OXNA 5CM6A 3N6TA 1D3KA 4N07A 4ISUA 2GRVA 2F8DA 2OBGA 2G29A 4F29A 3TEPA 4EDPA 1B1HA 3MJNA 4KCCA 5B70A 1USYE 5I59A 4M1VA 3BKIB 3C4MA 5FTIA 2B3BA 3KN7A 1A99A 3K4UA 2R6GE 3IX1A 4C1TA 3FATA 3TTKA 1B0LA 4QSCA 3MC2A 1II5A 5I59B 1OVTA 5F1QA 5H8FA 4I1DA 5LOMA 4LZ7A 2OWSA 1YTVA 3T9HB 4GXSB 1P1NA 1NMUA 3RGYA 2QL3A 3QAXA 2ZYNA 4EXLA 2GHBA 1P1WA 1HSJA 5H8FB 2DXRA 2A5SA 2B65A 4KCDA 3IB2A 4U23A 2Y7PA 1SW5A 1JQFA 4PFUA 1MXVA 1Y3NA 4QF9A 4RNSA 3S2VA 3TCHA 5I56A 4Q5TA 2HZLA 1N84A 4UA8A 4ELRA 4JXIA 2P1SA 4X1DA 1QUJA 2UVIA 1MQGA 3MVWA 3SETA 2F5XA 1B05A 4EF1A 4GRKA 3N6UA 2V3TA 1A54A 2QSXA 3U93A 1MPCA 2ZMBA 1FQAA 3TODA 1UTBA 2CMOA 4P0IA 1H45A 2Z8FA 4U2RA 2VD2A 1XVXA 3K1PA 3EPEA 1B32A 3Q28A 1RYXA 5BUUA 3RN8A 4LZ8A 1OQHA 1TT1A 1AL3A 5EHSA 2Y7RA 4OFJA 1M5EA 3IOUA 1UTBB 3SKPA 4R6YA 4MH5A 3GZGA 2RC9A 4Q30B 4ZECA 2VGQA 1MY2A 1US4A 2H9BA 3UA8A 5H8HA 4GWOA 1MG1A 1FTJA 3IOTA 5DTBA 3PU5A 4G77A 3PMXA 1AH5A 4F39A 4IO5A 4DXUA 1QVSA 3Q26A 5H8HB 3S4UA 4NEDA 2ZNUA 3G3IA 4U22A 1FW0A 4NF8A 4C0RA 1B40A 2ZNSA 1B7UA 3TFLA 4JSDA 1B9JA 1BIYA 4WXJA 1FTOA 1XOCA 4H1XA 5TPAA 3FXUA 5L9MA 2G93A 4KYDA 4NF8B 2NUVA 4ZZEA 4OFLA 5K2YA 4LZ5A 5AA2A 1J1NA 5JEIA 3UN6A 1H43A 5TPAB 3TELA 1BP5A 3ILTB 5EYFA 4F22A 2V3QA 1FTKA 2F36A 4AB6A 3S9EA 4OQOA 2IA4A 2LAOA 1ELJA 1B51A 4LONB 4OMBA 1UTHA 4R75A 5DVFA 1UQWA 3U92A 1GTKA 1NL5A 1QUIA 3K1MA 3GLBA 1MY1A 5DVJA 1UTHB 4ECFA 4ELPA 2REGA 3KJTA 4NF6A 2I4BA 1JNFA 4F18A 3TYHA 1Y4CA 5CMKA 4OZ9A 2VP1A 4G4PA 4NMYA 4PE5B 3IR1A 5DYHA 1QUKA 3CIJA 3CR9A 2XHDA 1B58A 5HM4B 1LGBC 3USDA 3BFTA 2O7IA 4NF6B 4YZZA 2Y7KA 4F31B 3IO6A 2OK2A 1PDAA 4HTGA 5B7DA 2I48A 3F11A 3IAZA 4NF5A 4BLAA 3E3KA 4OEVA 4QFKA 1B1XA 5I2NB 3H6TA 5CI5A 3V89B 1EH3A 4RK9A 2HZKA 1IXIA 1OQGA 1MPBA 3IOVA 3TTNA 3K02A 3W15C 3VV5A 3FJ7A 4NF5B 4I8CA 4F2OA 3C36A 1POY1 5I57A 3ECRA 1JW1A 1O64A 4WEPA 3U8QA 2KLFA 2THIA 1SYIA 3R6UA 2XXTA 5I57B 1QKAA 4QFLA 4ZEFA 3PV0E 3K00A 2DE3A 2GFEA 1NFTA 2V25A 1TXFA 3G3KA 3B7DA 2DE4A 1OLAA 1SW4A 4Z7EA 3HSTA 4Q8RA 4FAJA 4C1UA 2DP8A 2UYEA 3EHUA 4KYEA 4FEDA 4IO4A 3C35A 3MW0A 1MQDA 4X48A 4R6HA 3GBAA 4ESXA 5L8DA 2QS1A 3H6WA 4KQPA 2Z23A 4POWA 1CE2A 3T9UA 2XXWA 4F3BA 3DP6A 3KSXA 1MPDA 4NWCA 3HO7A 3OENA 3FVNA 3VLVA 1O7TA 1F9BA 3H4ZA 5KZTA 4YB7A 3KN8A 3OO9A 3MPKA 1XHYA 3GBBA 4KHZE 2HCAA 3TTRA 5K2XA 4ESWA 3I3VA 3K6WA 4PFYA 2UVGA 3L6GA 1N3WA 2D5WA 5H8SA 1LCFA 1N7XA 5ISUA 3P7IA 4R72A 4G68A 3RT8A 3JV9A 3HPIA 4N13A 3QYTA 3MVYA 5IAIA 3S9NC 4P0GA 4IY5A 1PB7A 1ZTYA 5CC2A 1LAHE 4EXKA 4XIGQ 1SW1A 1JEUA 4G68B 1N0TA 3PMVA 4NE4A 1EZOA 4ZDMA 5JK4A 3M3LA 4YAHX 3UK4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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