2ANJA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j-y450w) mutant in complex with the partial agonist kainic acid at 2.1 a resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
262
structure length
262
Chain Sequence
GANKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKWGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title A Binding Site Tyrosine Shapes Desensitization Kinetics and Agonist Potency at GluR2: a mutagenic, kinetic, and crystallographic study
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 83
structure length 262
sequence length 262
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-08-11
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2anjA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2anjA02
3A09A 3H6WA 5FTHA 2R6GE 4AB5A 3HPIA 3MZBA 3QIMA 1MXXA 2Q9TA 3N5LA 3TPAA 3EF7A 3S9LC 1LCTA 5L8DA 3FV2A 3O29A 4NF4B 1LFHA 4DLDA 4NF6B 3TAJA 3CRBA 3U92A 3MVXA 2GH9A 1MM6A 4RK2A 4IO3A 2ESNA 3UIFA 2XXTA 4G8MA 3WAEA 5DT6A 5FTIA 2Q88A 2DP8A 3N6TA 4PE5B 3Q27A 4DXUA 5I2NA 1O64A 1QVSA 1QKAA 1B4HA 2VD3A 4BLAA 3UN6A 4Q5TA 1MXYA 2FA7A 3ONMA 2RC9A 4GXSB 4NF8A 3ZS6A 3FZVA 4DCYA 1I6AA 4M4GA 1M5CA 4RNSA 5L9MA 3TCFA 4TLMB 5A5XA 2Z8EA 4R75A 1QJMA 4XXUA 1GGGA 4JDFA 1EZ9A 4PFUA 3VXBA 1FCKA 2HZLA 4ZDMA 4EQ9A 5H8QB 2DYXA 4R73A 3KJ7A 1EU8A 4G8HA 2QS3A 3K6UA 1LBBA 3DP8A 1XHYA 3N6UA 2Q8JA 1NFTA 3A3CA 3SESA 5TP9A 3FVNA 1CE2A 3OO7A 3S9EA 2I4CA 3MAMA 1ELJA 1JW1A 4NMYA 4EUOA 1Y9UA 1MQIA 4F1YA 4IGRA 2DE4A 4TOZA 3S9NC 4P0GA 2OWTA 2Y7KA 4I62A 1POTA 1LAGE 3H7MA 3VE1B 5I2NB 4P11A 3MVZA 4IGTA 1Y3NA 1PC3A 4QF9A 1B40A 3Q25A 1I6BA 2F7CA 3RUMA 1TFAA 2NOOA 4NWDA 4DIGA 2RKMA 1USYE 2RCAA 4YKJA 2WKYA 1BKAA 2R9JA 3SKPA 1SW2A 2I3WA 3KEIA 3CFZA 3LUYA 3RGYA 1B3HA 4OEUA 3O2AA 1B5JA 1M5DA 5FHMA 1NH8A 4JB7A 5EHSA 3HV1A 4PFWA 3DLNA 3LR1A 1N84A 1MDQA 3GZGA 4ZEIA 1XT8A 1BP5A 4GF8A 1GV8A 3VDFA 4FIMA 3VV5A 1IZ1A 3H4ZA 5CRYA 5H8HB 2NWJA 3WAFA 1A54A 3TUSA 1J1NA 4HCWA 4MF3A 3OXNA 4M1VA 2HFBA 4G77A 5TP9B 3MPKA 1VR5A 2R71A 3S9MC 1MXZA 4JSDA 3AXFA 1AL3A 4KQPA 1RKMA 2HAVA 1OQGA 4JWYA 2OCUA 2ZYMA 2PT2A 3H6VA 3KN7A 1POY1 4KFQA 4XKQA 4N13A 3RTFB 3PPNA 1Q1KA 4H6DA 3C32A 3IO4A 3QUFA 1O7TA 1FTMA 3PUVE 5AE4A 2NXOA 4QFKA 1A8EA 1D3KA 4JBZA 3HHGA 5ELVA 4BDMA 3PPQA 4H67A 2XXQA 2PX1A 1EZOA 1JETA 1Y20A 4LP2B 4EF2A 3G3IA 3MW0A 5F1QA 4ND9A 1P1OA 4KYSA 2VP1A 3IB2A 3CG3A 4DCXA 3ILUB 3MQ9A 2VGQA 1N3XA 1VSOA 5ITPA 2G93A 2ZNTA 3SEWA 2H9BA 1LB8A 3PPRA 3HHFA 3I3VA 1N7WA 3GBBA 1B1HA 3C33A 4HCYA 4HTGA 4Q8RA 1BLFA 5I2KA 5I56B 3KSJA 5ICTA 1O63A 3QYTA 3MPLA 2F35A 3T22A 5AA4A 1JQFA 2F5XA 3K02A 2QJEA 2ABHA 4OFLA 4H65A 1R9LA 5B7DA 3EPEA 4WKMA 4ZE9A 3OEKA 2DE3A 4ZZEA 3D4CA 4KHZE 3GXAA 4FATA 4R72A 2H99A 2V3UA 4FECA 4R74A 3ECRA 2DVZA 1US5A 1WDNA 1LAHE 3CFXA 3IOWA 1AMFA 2Y7RA 3QUJA 4XKPA 3DP4A 1US4A 3K0VA 5DYHA 4F31B 5KDTA 1R9QA 1JEVA 2B65A 3TTRA 3H6UA 2E0SA 1H44A 2Y7WA 1ZKBA 4UA8A 1UTHA 4G8NA 2B3FA 2OWSA 1P1QA 1HSLA 3VFJA 3DELB 2DWJA 2NUVA 4NF5B 3OSQA 4C1TA 2O1MA 5IAIA 2DXYA 2A5SA 4YB6A 5JK4A 3OO8A 2G29A 1ZTYA 4K3FA 5JEIA 3O6HA 3FATA 3KOSA 1JVXA 3S2VA 4ZECA 3PD8A 3MVYA 4LONB 3KG2A 2E1SA 4G68C 2B3BA 2UVHA 3M3FA 3EHUA 5J1DA 2XD3A 3O9PA 2HAUA 3FJ7A 2F36A 2AYSA 4MBPA 3V83A 1YTVA 1ZJLA 1URDA 4WXJA 3KSXA 1LB9A 3U1OA 4BDQA 4OTEA 2ONRA 3HO7A 2P1SA 1ZU0A 1QUJA 4OWDA 4Z7EA 1JEUA 2OLBA 2O68A 2I0BA 3MZ1A 1XOCA 5M2VA 1Z7ME 2AL4A 2ZYOA 1F9BA 1B2HA 1B46A 4KI0E 3RNNA 3OO9A 5F7VA 4TQUQ 4EXLA 3CVGA 4JWXA 3PUZE 4ELOA 4KYEA 1VFDA 2DXRA 4TLLB 4R2BA 4X1BA 2D21A 2QL3A 3H06B 4XKNA 3M3LA 1SW5A 3I5OA 5TU0A 4BDNA 4PFYA 4QSCA 5FHOA 3VXCA 2Q2AA 3Q28A 3PMXA 1B3LA 3EHSA 2DOJA 1ATGA 4GFRA 3VVEA 1P1UA 1SDXA 2Y7IA 3ODBA 3KJTA 4H8JA 4OXVA 3IK6B 4H8IA 2F34A 2XXVA 1DTZA 2OBGA 4YKKA 1MXUA 3USDA 1UQWA 1MY0A 4GD5A 3W9WA 3TZAA 1I69A 5H8FB 2REJA 4GIZA 4C1UA 1MY3A 3B6WA 3V5AA 4OETA 4PP0A 4QRZA 2GHAA 4IO5A 2O84X 1IIWA 2ONKE 1B0HA 3PPPA 1Y1MA 4O3CA 4FE8A 3FGSA 3FUZA 4LQ5A 1ANFA 3T93B 5AA2D 1URSA 4GLIA 3ZKKA 3K6WA 3OOAA 3R7XA 2THIA 4QFPA 1SYIA 3HCQA 1P1WA 5DEXA 1R1NA 3C36A 2F97A 2I0CA 2OZZA 4H5GA 1JW4A 3TQWA 5JTYA 3MUQA 1DSNA 3N94A 3LBSA 1YAEA 1KWHA 4U22A 1S7YA 3RTWB 2RF1A 4POWA 1ZMGA 1Q35A 1UIVA 4ESXA 3RN8A 3TTLA 2PYYA 4LZ8A 3MC2A 3E4RA 4I8CA 1LFGA 2QSXA 5EHMA 2F6GA 4DDDA 1Y1ZA 3U8QA 1M5EA 3CSGA 5I59A 4AQ4A 4BDLA 4PFTA 3PU5A 3C35A 4QFOA 3PD9A 3W9VA 5CMBA 4LZ7A 2ZYNA 3QSLA 3BFTA 1YPNA 2IA4A 4WEPA 5CMCA 4NF8B 4X1DA 2Z8DA 3IORA 1MPCA 3MP6A 3PUWE 3RQTA 2ZYKA 3IJOB 3SERA 5A5XB 5DVIA 3N26A 4FEDA 1P99A 5CM6A 3TTNA 3V89B 4OESA 4OHNA 4U1ZA 3TCHA 1Z7NE 4KD5A 1VFEA 1SVXB 5DEXB 3CIJA 1TFDA 4F3PA 1MXWA 3Q29A 2W7YA 2I49A 3T96B 5JTYB 2Z8FA 2ALUA 1FQBA 2X26A 2QS1A 3IR1A 2F7BA 1FTKA 2ZNUA 2F6PA 1LAFE 4F3SA 4H1XA 2A5TA 3KBRA 1B52A 1II5A 4POXA 4DE8A 1FTLA 1FTJA 3MP1A 3HSTA 3K1NA 3CSBA 1Y4TA 5CI5A 1MY2A 4F2OA 3OELA 2O69A 3ILTB 4WEDA 4F22A 4YKIA 4LVQA 4N07A 3G3JA 1N76A 1L5TA 5ITOA 1YCJA 1DTGA 2XXYA 1B5HA 3DP6A 3I6VA 4QSDA 3EQ1A 4IY5A 1B3GA 1NKXA 2ONSA 3VVDA 4HS7A 1B05A 1LCFA 2RCBA 4RPOA 5KCJA 4I9DA 4QHQA 3FIRA 3G7WA 1B51A 1MQHA 4RYAA 2ZXTA 1PDAA 3SEUA 1D9YA 3E3KA 4GVOA 2XXPA 2X7QA 3PPOA 2I6EA 5I58A 4NEDA 4KPTA 3EHTA 4GWOA 3O97A 3OMBA 2A5TB 4PQJA 4GXAA 3F11A 4FAJA 3OO6A 1FTOA 1D4NA 3IB0A 1MXVA 4X9TA 1PBPA 1B6HA 1PBQA 1OVBA 3UA8A 1OMPA 1PEBA 2XX9A 4GRKA 1B4ZA 5H8SA 3G3HA 3K6VA 4ELQA 3U72A 1BTJA 5BWJA 4Z0IA 2UYEA 5K2XA 2OJTA 3B6TA 3KGCA 1SW1A 3KN3A 2O1LA 4F39A 4LATA 2KLFA 3K1PA 1H43A 3K6XA 3TDJA 3T9UA 1MS7A 5FHNA 1GTKA 1SBPA 5KCJB 1ZLQA 3OEMA 1OLAA 3LSXA 1MPBA 3T66A 3D4GA 5HBCA 3FD3A 2REGA 4EF1A 3BBRA 3FVOA 5TPAA 4ECFA 4F2QA 3P7IA 3GBAA 4ZEKA 1IITA 3B7DA 3VLUA 3G3GA 3IJXB 4ELPA 3M8UA 5IKBA 2RC7A 3IOVA 4ZS9A 1MRPA 2XXRA 5I2KB 1A55A 3RY3A 4LUBA 3MWBA 4C0RA 3C4MA 4RK9A 1R6ZA 1S50A 3ZSFA 5AA4B 4XKRA 3ZKLA 4ISUA 3LSLA 4F29A 1XC1A 4OEVA 4QFLA 4NF4A 3SEXA 4RY1A 5BUUA 4NF6A 5I84A 1QUKA 3QK6A 3PUYE 3BKIB 2F78A 2XXWA 3JV9A 1M5BA 1FQEA 4QFNA 4ELRA 4EXKA 1NH7A 1AOVA 4ZE8A 1Y3QA 2M8CA 3EN3A 2PVUA 4EQ7A 4GL0A 3DM0A 4OERA 4OQOA 5KDTB 2I3VA 4ZZAA 1A7LA 2O7UA 3RLFE 1B58A 2F7AA 4IB2A 1H3DA 1PB8A 3KFMA 1SW4A 1TWYA 3K2DA 1SI0A 1UTHB 1MH4A 2XX7A 2QPQA 4R6KA 3O6GA 3IX1A 1LGBC 3K01A 1N3WA 4OFOA 3OSRA 1A40A 4AB6A 4YAHX 1NNFA 4O3BA 2QMWA 3THIA 4DZ1A 3L6HA 2DSFA 3C31A 5H8QA 1SQYA 3VLVA 3KOTA 3IOTA 3UORA 4OMBA 1I6QA 2UVJA 3PGFA 2Y84A 4YMBA 4R9FA 2I4BA 4ONYA 3TKDA 3TYHA 1FQDA 3FVGA 1MDP1 2GHBA 2LAOA 1M5FA 4R2FA 1IQ7A 2V3TA 1TXFA 3TMGA 4R9GA 3MJNA 2F8DA 4LA9A 4Q30B 4G2ZA 4LZ5A 4ESWA 1DMBA 1B9JA 4IO6A 1B0LA 5L9OA 1NNPA 2Y7PA 3JYRA 3Q26A 1TT1A 1P1NA 1LAXA 1OIBA 1WODA 1RYXA 2Z22A 1H45A 3E9XA 3O66A 3T9HB 1S9TA 3BFUA 2H5YA 2O7IA 2XXXA 2XXUA 4RA1A 3CFLA 3U94A 3C9HA 1GR2A 2QS2A 3R26A 3IAZA 2AL5A 3UP9A 3UGWA 2PT1A 2RINA 4EDPA 1FQCA 4YB7A 3LSFB 1N0TA 3K4UA 4NTLA 2DS9A 1MY4A 1MM7A 5H8NA 4ZEFA 2P0SA 4U2RA 4QSEA 4I1DA 1B7HA 2GFEA 1SI1A 5B70A 1H76A 1USYH 3VLWA 5I57A 5H8HA 1PB9A 2OK2A 1FQFA 1IXCA 2D3IA 4YU0A 3T9VA 2UVGA 3QXMA 2HEUA 2PMSA 4N6PA 1LSTA 3A3UA 1LLSA 4P0IA 1N7XA 3FXRA 4KCDA 4F19A 3TCGA 1UTBA 3H6TA 2V93A 2HQ0A 1IXIA 1NMUA 5HM4B 1MG1A 3O6IA 2UYFA 2IEEA 2RC8A 4G4PA 4JXIA 3GLBA 1XVYA 1QKBA 1IEJA 3PV0E 4KCCA 3O28A 2GRVA 1AIVA 3SEVA 2XXIA 2I48A 3K00A 1IXHA 2NVUB 4IY6A 1DOTA 2FYIA 4U23A 5ISUA 4FJPA 1PB7A 4E0WA 1B5IA 1DPPA 1B7ZA 4BDOA 3E13X 1N04A 4XTCQ 2VOZA 3TTMA 2H98A 4OFJA 4E0XA 4U4XA 4U21A 1XVXA 4H0WA 4R6YA 3C34A 5H8NB 3SETA 2UVIA 3QAXA 4G68A 5I57B 4THIA 4MFIA 3SDFA 4MLQA 4KYDA 4XIGQ 3OD7A 2O6AA 4F3BA 2DWIA 1LFIA 2YPNA 4JSOA 5I59B 3FXQA 3MZ9A 5I56A 3B6QA 1UTBB 4NE4A 5DTBA 4YKPA 4ZEBA 5LOMA 4FEBA 2CMOA 3KZGA 3MVWA 2DE2A 2I58A 1T0KA 5CMKA 4L17A 1MH3A 1NNTA 1UIUA 3FV1A 5AA2A 3S4UA 3PUXE 5CBSA 2BJJX 3MP8A 5DVJA 4BDRA 1JW5A 1QULA 2DVCA 4R6HA 5KZTA 3IB1A 3VVFA 4RXLA 1EZPA 3R6UA 4RPNA 3IO6A 1MQGA 2FNCA 3LC8A 5CC2A 3PMWA 3KN8A 1CB6A 1MQJA 5EYFA 1HSEA 3G3FA 1FW0A 4RJZA 4G68B 1NNKA 3FXUA 4UACA 4NF5A 4IO2A 3W15C 3RT6B 1MPDA 1GVCA 2XD2A 4IO7A 2Q89A 4KR5A 4LQ2A 3H3GA 4ZEDA 3CR9A 1URGA 1B32A 3TQLA 5DVFA 2DWHA 4DXBA 3RT8A 3CG1A 4U1OA 1Y3PA 3U93A 2Q2CA 1B3EA 2QRYA 2V3QA 2AIXA 1FQAA 2P2AA 2X7PA 1SYHA 2QMXA 4MH5A 5AA2B 4F18A 5HPQA 2H4IA 4MLVA 2V25A 3UK4A 1HSJA 4YMAA 3TEPA 1DPEA 3TELA 1MQDA 3H03A 3IOUA 4EQBA 4YICA 2XXHA 4H5FA 4F1UA 1JNFA 2VHAA 4IO4A 3K1MA 1VE4A 2CZLA 2YJPA 1QW0A 5I58B 4NWCA 4X48A 4JWOA 3RPWA 1RYOA 3TTKA 2QS4A 1SD3A 1B1XA 1B3FA 2HZKA 1OVTA 4OYVA 4F1VA 2ZMBA 1A8FA 1XS5A 3SEYA 2DWAA 2ZNSA 3TODA 2XHDA 4F3GA 4OVJA 4Q0CA 4HW8A 1IXGA 5CBRA 5ICQA 1EH3A 2PBWA 3V8XB 2VD2A 4FORA 3FJMA 1WVJA 2YLNA 4GOTA 1B7UA 1Y4CA 1JVYA 2HXWA 2ANJA 1ZBMA 3OENA 1IUDA 4U4SA 4OZ9A 1AH5A 3FVKA 1OQHA 2Z23A 5AA3A 1MY1A 2DQVA 2XX8A 1ZIUA 2D5WA 1A99A 2H25A 3PMVA 3L6GA 5H8FA 5L9SA 4GL8A 2HCAA 4GQOA 1BIYA 3CI8A 1NL5A 3HN0A 3TFLA 3FJGA 3LSWA 2V84A 5K2YA 4YZZA 1LBCA 3IL1B 4YB5A 5AA1A 1D9VA 4DXCA 4PETA 5TPAB 3JZJA 4OENA 1QUIA 3T9XB 3MBPA 3FASA 2UXAA 2O51A 5CMMA 3M3KA 3G3KA 1OLCA 4O3AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3A09A 3H6WA 5FTHA 1IMFA 2R6GE 1FBGA 4AB5A 3HPIA 3MZBA 1NV6A 3QIMA 1DK4A 1MXXA 2Q9TA 3N5LA 3TPAA 4HE1A 3EF7A 3S9LC 3HFUA 1LCTA 5L8DA 3FV2A 3O29A 1NI9A 2XWKA 4NF4B 1LFHA 4DLDA 4NF6B 3TAJA 3CRBA 3IFAA 3U92A 3MVXA 2GH9A 1MM6A 4RK2A 3BIHA 4IO3A 2ESNA 3UIFA 2XXTA 4OA4A 4G8MA 3WAEA 5DT6A 5FTIA 2Q88A 2DP8A 3N6TA 3BIGA 4PE5B 3Q27A 4DXUA 5I2NA 1O64A 1QVSA 1QKAA 2WYKA 1B4HA 1D9QA 2VD3A 4BLAA 3UN6A 4Q5TA 1MXYA 2FA7A 3ONMA 2RC9A 4GXSB 4NF8A 3ZS6A 3FZVA 4DCYA 1I6AA 4M4GA 1M5CA 4RNSA 5L9MA 3TCFA 4TLMB 5A5XA 2Z8EA 3RYDA 4R75A 1QJMA 4MJOA 4XXUA 4MX6A 1GGGA 4G61A 4JDFA 1EZ9A 4PFUA 2VPNA 3VXBA 1FCKA 2HZLA 5LDZA 4ZDMA 4MAGA 4EQ9A 5H8QB 4OVQA 2DYXA 4R73A 3KJ7A 1EU8A 4G8HA 2QS3A 3K6UA 1LBBA 3DP8A 1XHYA 3N6UA 2Q8JA 1NFTA 3A3CA 3SESA 1FJ9A 5TP9A 3FVNA 1CE2A 3OO7A 3S9EA 2I4CA 2XA5A 2XWOA 1EYJA 3MAMA 4I3YA 1ELJA 1JW1A 3FBPA 4NMYA 4N8GA 4EUOA 1Y9UA 1MQIA 4F1YA 4IGRA 2DE4A 4TOZA 3S9NC 4P0GA 5J16A 2OWTA 2VT5A 4PFIA 2Y7KA 4I62A 1EYKA 1POTA 2OX3A 4N4UA 1LAGE 3H7MA 3VE1B 5I2NB 4JVIA 4P11A 3MVZA 4IGTA 1Y3NA 1PC3A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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