1MM7A

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with quisqualate in a zinc crystal form at 1.65 angstroms resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title Mechanism of Activation and Selectivity in a Ligand-Gated Ion Channel: Structural and Functional Studies of GluR2 and Quisqualate
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mm7A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mm7A01
3FV2A 1IEJA 4IB2A 4QFPA 1UIVA 4NEDA 1XVXA 4GRKA 4MF3A 2VGQA 5CMBA 4F3PA 4RY1A 3CR9A 5J1DA 5LOMA 1Y3QA 3O6GA 3UN6A 4EUOA 2Y84A 4U4XA 4FIMA 3OSQA 2Q89A 4U1ZA 4AB5A 1M5EA 5L8DA 4G77A 1FQAA 4F2QA 3PU5A 1OQHA 2RC7A 2Z23A 4C1UA 2QMWA 1NH8A 1H45A 3MP1A 2V3QA 2DP8A 4OFOA 3K0VA 3PUXE 1US5A 5M2VA 2XHDA 4QHQA 3O29A 5AA4B 3VLWA 3PUWE 2BJJX 3C32A 4G68A 2O84X 3K2DA 1ZMGA 3G3IA 1I6QA 3V83A 2HAUA 1PC3A 1ANFA 4RK2A 2F36A 3K1MA 1HSEA 1P1NA 2DQVA 3IO4A 5DTBA 1B51A 3OEKA 3CFXA 3C9HA 3MWBA 4QFKA 4I62A 5FHNA 3RGYA 3K6WA 4EXLA 4OFLA 3UA8A 3THIA 3PUVE 2HZKA 3LR1A 5B7DA 4GD5A 2F7CA 5FHOA 2QPQA 3ONMA 1B32A 4GXAA 4XKQA 4H67A 2REGA 3T22A 3IOWA 3V8XB 3FASA 3KGCA 1PDAA 2ESNA 3IJXB 1FW0A 3HSTA 3QK6A 2OCUA 3O9PA 1CE2A 5JTYA 3IJOB 4ELOA 3T96B 3CSGA 1MG1A 3KJTA 1N04A 4LUBA 4H6DA 3KOSA 2AIXA 2DYXA 1IIWA 1GV8A 3IOVA 1SD3A 1H43A 3KN3A 3I5OA 3MW0A 3GZGA 2QS2A 1OVTA 3FD3A 3FXRA 1JNFA 1LSTA 1LAGE 1NNTA 2P1SA 1B3EA 4FEBA 1LGBC 2RCAA 3V89B 5I2NA 2X7PA 2I0BA 1NFTA 2DXRA 4BDOA 1TFDA 3RY3A 2DE3A 3SEVA 3K00A 1LBCA 3CI8A 1DSNA 4F39A 1B40A 1WVJA 3PPNA 3R6UA 4LVQA 2I4CA 4NF5B 1VFDA 4DXCA 4JWXA 4PE5B 3RNNA 2V84A 4LONB 1B3GA 3OEMA 1B9JA 3FVKA 3OO6A 3PPQA 4NF8B 1A99A 2ZYMA 1N3WA 1I6BA 1US4A 1MY1A 3IAZA 4UA8A 2DWIA 1O64A 1B1HA 2G93A 3F11A 4FECA 3G7WA 2HCAA 3ODBA 1UTBB 2V93A 3TMGA 2OJTA 4ZS9A 5DVIA 2B3BA 4YB5A 4GL8A 4PP0A 3T9XB 4OHNA 1Y4CA 5CBRA 2F5XA 1UIUA 4NE4A 3OMBA 4ZZAA 3EHSA 2UYFA 4OWDA 3MVXA 1Y1MA 4TOZA 5AA4A 2W7YA 3MJNA 4F2OA 1JEVA 3LUYA 4NMYA 2HQ0A 1SW1A 4F3SA 1ZLQA 1M5BA 4H0WA 1P1QA 1IXGA 1FTLA 5KZTA 3TTKA 4I8CA 4R9FA 2IA4A 3P7IA 3JV9A 3IOUA 4WEDA 3MUQA 2QSXA 4M1VA 1JVXA 1SI0A 1IZ1A 1SW5A 5H8HB 2YPNA 4YB7A 4UACA 4N13A 1S9TA 1YCJA 4F22A 2UVIA 2GRVA 2FNCA 3IOTA 3BKIB 4ZEFA 4YAHX 1POTA 4H5GA 2GH9A 5L9OA 4KHZE 1B58A 2XXHA 3DM0A 2H25A 3QXMA 1II5A 2OWSA 1USYH 2XX8A 2THIA 1OQGA 3SKPA 5BUUA 3PD8A 5I59A 1OLAA 5ITPA 2XXYA 1BKAA 1SBPA 1DTGA 1B7UA 3E13X 4FEDA 4F19A 1MXXA 5CRYA 4NWCA 1AH5A 1MQDA 3QSLA 3TYHA 1IITA 1VR5A 1EZ9A 3AXFA 1TWYA 4G68B 1ZBMA 2LAOA 5CC2A 4MLQA 3VXBA 3IB2A 4F1UA 3MVZA 2DOJA 4XKPA 2QL3A 3MBPA 3D4CA 5IAIA 2Q2AA 4GL0A 1LB8A 4JBZA 4X1DA 4G8NA 4N07A 2VHAA 4OZ9A 3PPPA 4IO6A 4MLVA 1B7HA 1FTOA 1UTHB 3N5LA 3U1OA 3E4RA 4EDPA 4E0XA 4LZ5A 3TELA 3M8UA 3K4UA 3UGWA 3MZ1A 4OENA 4GQOA 4DIGA 4NF8A 1SYHA 2B65A 2I58A 1R9QA 5F7VA 1JW5A 3MPKA 1B3HA 5HM4B 4R2FA 4RPOA 5L9MA 3FGSA 2ZYOA 5JTYB 3U8QA 3A09A 4F3BA 1MXVA 1D9VA 4DXBA 3Q27A 4OTEA 4IGTA 3TPAA 2O7UA 1FQBA 3KSJA 2QMXA 4FORA 1N7WA 5AA3A 2FA7A 1N0TA 2ABHA 4IY5A 1B4HA 2PVUA 4JSDA 3N6UA 2HFBA 2QS4A 3H4ZA 5H8FB 2B3FA 2R9JA 3VVEA 3KBRA 2Z8EA 5I2KA 2Y7IA 5I2NB 2HAVA 1BLFA 3IL1B 3MVWA 1MPBA 2NOOA 3RPWA 2O7IA 5CBSA 3RT6B 1B05A 2XXUA 5K2YA 3EN3A 2X7QA 2XXTA 5H8HA 3RLFE 3LSFB 4KYDA 1TFAA 3O66A 1H44A 2V3UA 3LC8A 3CSBA 4RK9A 4MBPA 1Y3NA 3BBRA 2VOZA 4X48A 3KFMA 3CFZA 3R7XA 3U92A 3ZKLA 1FTJA 3Q25A 3PPOA 3OENA 3UORA 1URDA 3GLBA 2QJEA 4RA1A 1MY0A 3U94A 3BFTA 3TQWA 4YKKA 3C31A 1MH4A 2NVUB 1JEUA 1Y9UA 2A5SA 2Q9TA 3ILTB 1ZKBA 3IK6B 1LAXA 1VSOA 3KZGA 2AYSA 1ZJLA 4ZE8A 3TCFA 4RYAA 1LFHA 5KCJB 4OFJA 3GBBA 2AL4A 2F34A 4GVOA 2XXRA 3Q29A 3GXAA 1EU8A 2ZNUA 3N94A 3M3LA 3E3KA 3MVYA 1MPDA 4QFLA 2XX9A 4C1TA 4PFTA 1B52A 3FUZA 3T66A 1A40A 1MXWA 1Z7ME 3O6HA 1QJMA 1UTHA 4EQ7A 5FHMA 1A54A 1P1WA 1EZPA 2XX7A 3U93A 4P0GA 1N3XA 4U4SA 1XC1A 3TDJA 4M4GA 1Y1ZA 2DVZA 1LCFA 1S50A 3B7DA 5ELVA 3I6VA 4Z0IA 1Y20A 3FJMA 3OO8A 5I59B 3D4GA 4R74A 1MY2A 4MFIA 4P0IA 1QW0A 4PFUA 2X26A 3UP9A 4L17A 2XXQA 1VFEA 3FVGA 5EYFA 5TU0A 2F7AA 4EF1A 1OLCA 1LB9A 5H8FA 5ICTA 1VE4A 3G3GA 3OOAA 1OVBA 2DWAA 3IR1A 3FJGA 3QAXA 1QUJA 2ZYKA 1JW4A 2F35A 3H03A 2CZLA 3KEIA 4YB6A 1AMFA 1B46A 4BDQA 4QFOA 3Q28A 3RTFB 3M3KA 3W9VA 2E1SA 2DWJA 3PMWA 1AL3A 3G3FA 1PB7A 5H8QB 4OYVA 3MZBA 3TODA 1NNKA 3S9NC 1LCTA 4LZ8A 2OWTA 2Y7WA 4ZZEA 1GGGA 3DLNA 4XXUA 4KI0E 1KWHA 4QSDA 1SDXA 4PFYA 2RKMA 2A5TB 1RYOA 4NTLA 1Z7NE 4HCYA 1O7TA 4YKIA 3K6VA 3R26A 4R72A 4ZEIA 3HHFA 3IO6A 4ZDMA 1GR2A 2H98A 3EQ1A 5KCJA 1LFIA 4R73A 3T9VA 3JYRA 4QFNA 1ZIUA 4LP2B 3DP4A 3EHUA 5CMCA 3CG3A 1YPNA 5I2KB 3MP6A 4GLIA 3VXCA 3TZAA 1N84A 1NMUA 1PB9A 4IY6A 2HZLA 2Y7RA 1FTMA 1HSLA 3MC2A 4F1YA 1NKXA 1AIVA 1IXIA 1ELJA 4F1VA 4NF6B 2H5YA 3FXQA 2O68A 5CMMA 5I84A 1MH3A 4ONYA 4GFRA 1PB8A 3VE1B 2NXOA 3IORA 2RCBA 4QF9A 5DVJA 1IXCA 3M3FA 3TTNA 1D3KA 1N76A 1B5HA 1QULA 3RTWB 2D21A 1JETA 1RKMA 4O3BA 2DE4A 4BDRA 4I1DA 4DE8A 5HPQA 2XXIA 3HO7A 1YTVA 4Z7EA 3S4UA 1USYE 2UVJA 1FQFA 2XD2A 2OK2A 2ONRA 5A5XB 1SI1A 3USDA 4IO2A 1MY3A 2ZNTA 3S9MC 2DWHA 4NWDA 4GIZA 2UVGA 4G68C 3WAFA 3EPEA 4O3CA 4R6KA 3QUFA 1B3FA 2XXXA 4F18A 1GVCA 3O6IA 1F9BA 2UVHA 1I69A 1EZOA 3MZ9A 3H6WA 3MPLA 1A55A 2WKYA 3S9LC 1WDNA 2F6PA 1MXYA 4GXSB 3K01A 3OELA 3E9XA 1JVYA 2OLBA 5H8QA 2DXYA 4O3AA 3VLVA 1DTZA 2AL5A 4FE8A 4P11A 2ZYNA 5CI5A 3KJ7A 1LAFE 5B70A 1JQFA 3ZS6A 1POY1 3K1NA 1M5FA 4NF4A 3HCQA 3SESA 4FATA 4H5FA 4FJPA 4LQ2A 3RN8A 3KOTA 2UXAA 2DSFA 1Q1KA 2ONKE 2A5TA 4JSOA 3CVGA 2I49A 1MM6A 1JW1A 3A3CA 4OEVA 3PMXA 3HHGA 2QRYA 2M8CA 1H76A 3IB0A 4KD5A 3FJ7A 1MDQA 4U2RA 5IKBA 2GHBA 1R9LA 2DS9A 4IO5A 1MPCA 4JB7A 1MDP1 3KG2A 1LLSA 3ILUB 1PEBA 2KLFA 3KN8A 2O1MA 5AE4A 5H8NA 4N6PA 4R6YA 4G8HA 1OMPA 2ONSA 4H8JA 3TTMA 4ELPA 3Q26A 4NF6A 4OXVA 4OETA 2ALUA 3H7MA 1J1NA 5BWJA 5I58A 3VV5A 1B3LA 3TTLA 4GOTA 1QVSA 2V3TA 1BIYA 4Q0CA 2D5WA 3PUZE 1UQWA 1B2HA 1QUKA 4G8MA 1N7XA 5ITOA 1SQYA 4H65A 1B0LA 1QUIA 1Q35A 2PT1A 3G3HA 1SW4A 3TCHA 4H1XA 1PBPA 2OZZA 2HXWA 4OERA 1M5CA 2F7BA 4KFQA 1FQCA 3O2AA 4QSCA 5A5XA 4QRZA 4OMBA 1XT8A 1T0KA 4X9TA 4MH5A 4PFWA 4XIGQ 5TPAB 1IQ7A 5AA2A 3GBAA 1MQJA 3FVOA 4WEPA 2I0CA 4ELQA 1XS5A 4EF2A 4OESA 2DVCA 4R75A 4GWOA 4G2ZA 2NUVA 3B6TA 2Z8DA 1SVXB 4FAJA 4Q30B 2P0SA 4AB6A 1SYIA 2I48A 2Q88A 3QIMA 4G4PA 5I56B 1IUDA 2XXWA 2REJA 4HTGA 5DEXB 2PYYA 4U1OA 1DOTA 3DP6A 1SW2A 2H99A 1PBQA 1MQGA 2RF1A 4KYEA 3OXNA 2Y7PA 5I57A 3LSXA 4DDDA 3TQLA 2I4BA 4OEUA 5KDTA 4R9GA 4QSEA 3ZSFA 3FVNA 5AA1A 3L6GA 4KPTA 2VD2A 4AQ4A 1NL5A 3O97A 4U22A 4IO7A 5FTIA 5L9SA 2R71A 1MXZA 5AA2D 3O28A 3S9EA 4TQUQ 3FZVA 1Y3PA 1R1NA 1B6HA 3MP8A 1FTKA 5DYHA 1TT1A 1M5DA 2PT2A 4IO4A 4R2BA 3I3VA 4DCYA 3TEPA 4WXJA 1TXFA 3K1PA 2ZNSA 3VDFA 1NH7A 2Y7KA 5TP9A 3SETA 2DE2A 3VLUA 4HW8A 3UIFA 1B0HA 3SEUA 4YMBA 3H06B 2QS1A 3G3KA 5H8SA 4ZECA 3T93B 2O6AA 3OSRA 4POXA 3K6XA 2P2AA 3EF7A 3CG1A 3VVDA 5DVFA 3DELB 2Z8FA 1O63A 1CB6A 3W9WA 4ELRA 1R6ZA 1L5TA 4IO3A 4YZZA 3LSWA 4HCWA 4WKMA 1A8EA 4LQ5A 3B6QA 2RC9A 4ESWA 4NF4B 3MAMA 1B5IA 3PUYE 1P1OA 1URGA 3U72A 3H6UA 4OQOA 4KQPA 4LZ7A 3PPRA 1B4ZA 1AOVA 2NWJA 1Y4TA 1DPPA 4LA9A 2I6EA 2VD3A 3TUSA 1D4NA 3PGFA 2PX1A 4RJZA 1MQIA 4K3FA 3TTRA 3K6UA 4RPNA 3QUJA 2OBGA 4JWOA 5EHSA 3OO7A 5F1QA 5TPAA 3SDFA 3SEWA 1MS7A 1XVYA 4TLLB 3A3UA 3V5AA 4YICA 3HPIA 3KSXA 1S7YA 2Q2CA 3IB1A 3BFUA 2QS3A 4JDFA 1WODA 1MM7A 2XD3A 4ZEDA 2IEEA 3C35A 4GF8A 2G29A 5H8NB 3TCGA 3VFJA 4F29A 3C33A 2HEUA 3S2VA 5I56A 5CMKA 2F78A 5ICQA 5DEXA 4XKNA 1DPEA 1MXUA 4DXUA 4POWA 3FIRA 4XKRA 4YKJA 5I58B 3L6HA 2Z22A 4DZ1A 1B5JA 4U21A 2I3WA 4JWYA 4KYSA 3G3JA 3ZKKA 3SEYA 1RYXA 2F6GA 3PD9A 3ECRA 4THIA 3UK4A 4TLMB 4R6HA 1OIBA 4BLAA 2D3IA 1A8FA 2H9BA 3T9HB 2YLNA 4HS7A 4LATA 4EXKA 5CM6A 2YJPA 4BDMA 4KR5A 2ZXTA 1B1XA 3RQTA 2E0SA 4BDNA 1QKAA 4OVJA 3LSLA 1URSA 3PMVA 3C36A 5FTHA 4KCDA 2F8DA 3MQ9A 3OO9A 5AA2B 3EHTA 4Q8RA 3RT8A 4DCXA 3H6TA 1B7ZA 3FV1A 3SERA 2O51A 3IX1A 1I6AA 2PBWA 1BP5A 1H3DA 3HN0A 1NNFA 2O1LA 1LFGA 1MRPA 4ZEKA 2H4IA 1LAHE 2CMOA 3WAEA 4H8IA 3CIJA 3T9UA 3N6TA 2Q8JA 1ATGA 3SEXA 2I3VA 4F3GA 5I57B 3FATA 2GHAA 1HSJA 2F97A 1XHYA 4NF5A 4YKPA 5KDTB 2GFEA 3TFLA 4YMAA 1FQEA 3VVFA 1FCKA 3HV1A 4KCCA 4IGRA 5K2XA 3QYTA 2PMSA 2VP1A 1LBBA 1GTKA 4E0WA 3C34A 1P99A 4EQBA 5ISUA 1ZTYA 2FYIA 4XTCQ 4YU0A 1UTBA 5HBCA 1QKBA 3OD7A 3RUMA 2RINA 3FXUA 4DLDA 1ZU0A 2XXVA 3LBSA 4ZEBA 4C0RA 1MY4A 4ESXA 2ZMBA 2R6GE 5EHMA 4U23A 4EQ9A 5TP9B 1D9YA 1A7LA 3JZJA 4F31B 4I9DA 2ANJA 3TAJA 3C4MA 3B6WA 1FQDA 3TKDA 5JK4A 1NNPA 2V25A 3N26A 4RXLA 3H3GA 3CFLA 1YAEA 2UYEA 3KN7A 4PETA 5JEIA 4X1BA 4PQJA 4BDLA 3K02A 3H6VA 4RNSA 1MQHA 2O69A 1XOCA 4JXIA 2RC8A 3CRBA 4ECFA 3DP8A 1IXHA 4ISUA 1BTJA 4ZE9A 4ND9A 3W15C 4Q5TA 1P1UA 2XXPA 5DT6A 1EH3A 3PV0E 1DMBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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