1MM7A

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with quisqualate in a zinc crystal form at 1.65 angstroms resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanism of Activation and Selectivity in a Ligand-Gated Ion Channel: Structural and Functional Studies of GluR2 and Quisqualate
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mm7A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mm7A01
2BJJX 2ZNSA 4NF8B 1BP5A 1I69A 3VLVA 3TEPA 3FXRA 3H03A 1TT1A 3A09A 4BDOA 1SD3A 2PVUA 2GFEA 2RC7A 2I3WA 1JETA 4U22A 2ZNUA 4OYVA 4LONB 1FQBA 1Q35A 2Z8EA 3OO8A 5JTYB 4F2OA 1B52A 2V3TA 3OO6A 4XKNA 4F31B 1CE2A 4FEBA 4ESXA 1H44A 1OQGA 3ZKLA 2QSXA 3S9EA 5I58B 4G68C 5I59B 3KEIA 4GOTA 1NL5A 1IXHA 1QJMA 1LAXA 3K02A 4U23A 3CVGA 3OSQA 3HHFA 1LSTA 1JVYA 5I57A 1QKAA 4KPTA 4M1VA 2O69A 4OFOA 5KCJB 2R6GE 4DCYA 1XT8A 2P1SA 3Q26A 4YICA 1QVSA 4GXSB 4ZEDA 1ZKBA 5HPQA 1MXVA 2F7BA 5ELVA 3EF7A 2F36A 3V8XB 1DOTA 4F3PA 2F8DA 2KLFA 4MH5A 3U93A 1N76A 3U94A 5H8HB 4YB7A 1IXIA 3TODA 4NE4A 2O7IA 3LSFB 1ATGA 3QIMA 4PFYA 1XVXA 4YKIA 1XVYA 4YKJA 3W15C 4EQBA 1CB6A 4LUBA 3QUFA 1NNTA 4OTEA 3D4GA 3QUJA 1VR5A 1DPEA 1WVJA 3TTMA 4GQOA 5DYHA 4N6PA 3IAZA 3I3VA 1Y3NA 2VOZA 3UN6A 5AA2D 1BIYA 4HCWA 4IB2A 5FTIA 3OSRA 2I0CA 5AA3A 4F1VA 3KFMA 1AL3A 2ZXTA 2O51A 2I4CA 4F29A 1MG1A 3C4MA 3GBBA 1MQJA 2ANJA 1PDAA 2XXTA 3LUYA 4E0XA 3G3IA 1OVBA 3KN8A 5DVIA 1IXCA 2B3FA 4YB5A 1OLAA 4IGTA 4NMYA 4G2ZA 1Z7ME 2X7QA 3QK6A 4F1UA 5I56A 4X9TA 2XXPA 4QRZA 1B1XA 1UTBB 2O68A 4QHQA 3EQ1A 1US4A 2I58A 1R9LA 2OBGA 4OFJA 3DLNA 4OFLA 3TPAA 1UTHA 2IEEA 5I84A 3IL1B 3OEKA 1WDNA 3IJOB 4LA9A 1MPBA 3PUZE 1DTZA 4UA8A 3ILUB 2V3QA 2XXQA 2XD2A 4HW8A 3EHSA 1FQDA 3CIJA 2UVGA 3HV1A 2REJA 5AA4B 2NXOA 3IB0A 2AYSA 5B70A 2DOJA 1M5BA 3T9VA 1LCFA 3MP1A 3VVEA 4GD5A 5AA1A 3LSLA 1O63A 3CFXA 3C31A 1MY3A 4BDNA 1LAHE 4POWA 1GR2A 4ECFA 1JQFA 1NFTA 5TP9A 1M5CA 3B6QA 1RYXA 4XKRA 1HSEA 4H67A 4IO3A 4DXBA 4ZE8A 1MQHA 1H43A 3UIFA 5FHNA 3MP6A 3U8QA 1XS5A 2Y7IA 4EXLA 2X7PA 4F18A 4Z0IA 2DS9A 3O97A 3OELA 1TFAA 1NH8A 4U2RA 1A40A 3H6TA 1O64A 1SBPA 4PQJA 4ZECA 4ELPA 3EPEA 2F5XA 5TPAB 4AB6A 4Q8RA 1SVXB 3PD8A 1B46A 2DVZA 1LAFE 4U1OA 3VLUA 1BTJA 2F7CA 2FNCA 5DVFA 4KI0E 2GHAA 3R7XA 3IORA 3M3FA 1PB9A 3GXAA 4RXLA 4MBPA 1B32A 1JNFA 1S7YA 2XX8A 3HN0A 3H3GA 1DPPA 1LB8A 2Y7WA 2X26A 2P2AA 3W9VA 1LAGE 1POY1 3T9UA 3T9HB 2UYFA 2H9BA 2DQVA 3O6GA 4H8JA 2XD3A 2FA7A 2H98A 1MY0A 2Q2CA 1FQEA 1FQAA 4JXIA 4WXJA 4GL8A 4KHZE 5I2NB 4BDRA 1IZ1A 3I6VA 2DVCA 4NWCA 1SW2A 1B7HA 1ELJA 1JEUA 2PX1A 2UYEA 1POTA 3MZ1A 1NH7A 4XTCQ 2QRYA 3IB2A 3IOVA 1MDP1 3FVOA 4K3FA 4KYSA 3TTKA 3Q29A 4NTLA 3CSGA 4FECA 3V89B 4OXVA 2Y84A 4YB6A 3K1PA 2I4BA 1Y20A 1NNFA 3K6XA 1H3DA 1P1QA 3IO4A 4NEDA 5M2VA 4KFQA 1MH3A 2QJEA 4NF4A 1I6BA 3CFLA 2HFBA 4G77A 4OVJA 1MS7A 4JWYA 4QFOA 4IO4A 3MC2A 5J1DA 3D4CA 3LSWA 2RINA 1YAEA 3M3LA 3FJ7A 2A5TB 4TLMB 3FV1A 2D21A 3Q25A 3O29A 3RNNA 4Q5TA 4IO2A 1HSLA 1UIUA 3IJXB 1VFEA 3EHTA 4IO6A 4ZZEA 4DXCA 3OXNA 1A55A 3QAXA 1SI0A 3R26A 3PPOA 1B1HA 2F6PA 4L17A 1D3KA 3LBSA 4ISUA 1LB9A 1H45A 4THIA 1LGBC 4DCXA 3CI8A 1L5TA 1XOCA 4MF3A 2DXYA 3C9HA 1IEJA 3CG3A 3TTLA 4R75A 2G93A 3FVGA 3VVDA 1YTVA 5H8QB 4EUOA 3IOWA 2V93A 2Q89A 5ICQA 1OVTA 1Y3PA 5KDTB 3O6HA 3C34A 4XKPA 1MXXA 4RPOA 4C1TA 4GF8A 3TZAA 2D3IA 1UQWA 2XXWA 4GFRA 4NF5A 4PFTA 2F6GA 3KOSA 3H7MA 4XIGQ 5K2XA 5H8FB 2V84A 3MQ9A 3L6GA 4EF1A 3KBRA 2YJPA 1GGGA 4YKPA 1LFHA 4QFNA 3SKPA 2CZLA 2I6EA 4XXUA 2R71A 3TCHA 3S9LC 4WEDA 3KGCA 3PPNA 1P99A 4PETA 1A7LA 2NUVA 3H4ZA 3WAFA 5IKBA 5B7DA 2F7AA 1Y4CA 4R6YA 1YPNA 3E13X 4GVOA 2HXWA 3FGSA 4X1DA 4F1YA 4U1ZA 4GL0A 3TELA 4O3BA 3RQTA 3G3HA 1RYOA 4POXA 2H4IA 2VP1A 4N13A 4RNSA 1P1OA 1I6AA 1LBBA 4KCDA 3G3KA 4N07A 2F97A 4ONYA 3UGWA 1Y9UA 2ABHA 5DEXA 2DWHA 5H8NB 4PP0A 3TTRA 4NF6B 2VGQA 4DXUA 1N0TA 1BLFA 5I2KA 3RT8A 3E9XA 2XXRA 2QMXA 2XXHA 3TMGA 5AA2A 4GIZA 3L6HA 1MY1A 3PUWE 1MPDA 1J1NA 5I56B 2E1SA 3IOTA 2GH9A 4U4SA 1VSOA 1ZJLA 3C35A 3IO6A 4JB7A 3VLWA 1A8EA 3ONMA 2YPNA 4F22A 4H0WA 1UTHB 5FHOA 3O66A 1N3XA 1IITA 4MLVA 2Z23A 5JTYA 4BDQA 1IIWA 2IA4A 2ZMBA 2ZYNA 3KJ7A 3MPLA 3K4UA 3OOAA 3G3GA 5JK4A 4TOZA 3TCGA 2O6AA 3ZSFA 5I58A 1MH4A 1GV8A 1B51A 2A5SA 4F19A 1SQYA 1B3LA 4QF9A 2D5WA 3O9PA 4G68B 4I8CA 5KCJA 4ZE9A 4OEUA 4AB5A 2W7YA 3O2AA 3PUVE 4KR5A 4I9DA 1PB8A 4F39A 4F2QA 3K0VA 4ELQA 3CFZA 1MXUA 4JSOA 1M5DA 5H8HA 3T66A 5KZTA 3JV9A 1YCJA 3RTFB 4ND9A 1FW0A 3H6VA 4OERA 1JW5A 4ZEBA 4ESWA 1B3HA 2HZLA 1B4ZA 3TFLA 4GWOA 3E3KA 3RGYA 1SW1A 4LQ2A 2AIXA 1B9JA 2UVIA 1MXZA 3K01A 3HCQA 3PPPA 4U4XA 3FJGA 2WKYA 2I49A 1PB7A 3FXQA 1B6HA 4DIGA 3EHUA 4QSDA 5DVJA 1VE4A 3C33A 1AH5A 3TUSA 1MQGA 3FASA 3OEMA 3USDA 3BKIB 5ITPA 3PMWA 4DE8A 1LBCA 4OMBA 3H6WA 1B0HA 3OD7A 4G8NA 4H5GA 4IGRA 1UTBA 4X48A 2PYYA 3DP8A 1MRPA 3LC8A 1A8FA 5DTBA 3RN8A 4EQ9A 4R9FA 3K2DA 3U92A 2G29A 4IO5A 1JEVA 3ZKKA 1TXFA 3Q28A 1A54A 3SDFA 1NNPA 1PEBA 3LSXA 1SW4A 3E4RA 4OWDA 5CMBA 2B65A 1EZPA 3EN3A 3MZ9A 5AA4A 4HCYA 3MVZA 3MPKA 3MVXA 1GTKA 4F3GA 5BUUA 2VHAA 3FATA 1N84A 4BDLA 5H8SA 1LCTA 4YKKA 5EHMA 1II5A 1Q1KA 3N6TA 2P0SA 3RT6B 2NVUB 2OZZA 2DYXA 4U21A 1P1WA 1IQ7A 3W9WA 3Q27A 4H5FA 3MBPA 2RCAA 2RCBA 3IX1A 1NKXA 2ONRA 3AXFA 2DE2A 1URDA 3G3FA 4YMAA 1H76A 3MJNA 5TPAA 3FJMA 3WAEA 1B7ZA 2DWIA 4G8MA 2HEUA 1B3FA 2NOOA 5CI5A 3JZJA 3C32A 3C36A 2QMWA 4FJPA 3MAMA 4G8HA 3FVKA 3RPWA 1DMBA 1N7XA 4I1DA 4R74A 4LATA 3MVWA 1PBQA 3M3KA 4DLDA 3T96B 3MUQA 3PU5A 4R73A 5L9SA 3VDFA 3VFJA 3N94A 2Q88A 5EYFA 3KN7A 3OO7A 1LLSA 5K2YA 1N3WA 4EF2A 3GZGA 1O7TA 3SERA 4FAJA 1QUKA 4RK2A 1Y1ZA 1MM7A 1Y1MA 1FTJA 5I2NA 1FCKA 3VE1B 2HZKA 5IAIA 4NWDA 4LVQA 1F9BA 5JEIA 4EQ7A 3TAJA 4OQOA 4IO7A 1OIBA 2LAOA 2XXIA 2PBWA 2DE4A 1WODA 4E0WA 2XX9A 3K1NA 4WKMA 5A5XA 3DM0A 1ZTYA 4JBZA 3GBAA 1USYE 4OENA 1QKBA 2Q9TA 3PUXE 4R72A 2O1MA 2FYIA 1Y3QA 3O28A 3HPIA 1FQFA 3MZBA 3HHGA 3KZGA 4I62A 3S9NC 1NNKA 1ANFA 4R2BA 2V3UA 2QL3A 5I57B 1EU8A 2VD2A 4IY6A 3UA8A 1BKAA 1OQHA 4WEPA 3R6UA 1MXWA 5HBCA 1ZMGA 2Y7PA 5CBRA 1ZU0A 5AA2B 3PV0E 3KJTA 1MM6A 2F78A 4LQ5A 1GVCA 1A99A 4XKQA 4ZDMA 3BFUA 4ZS9A 3IOUA 3T93B 2AL5A 2R9JA 2ZYOA 4PE5B 4ELRA 3P7IA 2ZNTA 2RC9A 4G4PA 3PPRA 2Y7KA 4JDFA 2I0BA 1ZLQA 2ONSA 5CM6A 5HM4B 3CRBA 2HQ0A 3QSLA 3QYTA 5ICTA 2F35A 2RF1A 5CBSA 5H8QA 2QS2A 2DXRA 3N5LA 1B4HA 1B0LA 5KDTA 1FTOA 2HAVA 1B5HA 4LZ8A 1SDXA 2Z22A 4AQ4A 3FUZA 2XXVA 1AMFA 2B3BA 3QXMA 1DSNA 4C0RA 3SEWA 3DP4A 2REGA 3ILTB 5F1QA 1Y4TA 2O84X 1USYH 2OWTA 2I3VA 4NF8A 4GXAA 2YLNA 2M8CA 3K6VA 4LP2B 3SESA 5H8FA 2PT1A 3K1MA 1I6QA 4MFIA 4KD5A 3KSJA 1AOVA 4PFUA 1XC1A 1JVXA 3IB1A 2QS1A 3MW0A 1D9YA 1T0KA 1FTMA 2DWJA 4YAHX 3CSBA 2DWAA 1EZ9A 4P11A 4YU0A 3PD9A 5L9OA 1D9VA 2DP8A 4RK9A 1M5EA 1B3GA 3FZVA 2DE3A 5I59A 3A3CA 4Q30B 3VV5A 4O3CA 4ZEFA 3BFTA 3PMXA 1R6ZA 3H06B 4H1XA 4OZ9A 5CMMA 4FORA 1ZBMA 1DTGA 2XXXA 3FV2A 4R2FA 5TP9B 2GRVA 1MPCA 4H6DA 1B5IA 1IUDA 5H8NA 5DT6A 1SYIA 2XXUA 4NF6A 3FVNA 3THIA 3B7DA 4DZ1A 2XXYA 4R6HA 2THIA 1SW5A 4R6KA 4YMBA 3UK4A 3I5OA 3B6TA 2DSFA 2OLBA 3VXBA 4OEVA 2NWJA 4RYAA 3ECRA 3SEYA 3HO7A 4IY5A 4F3SA 5CC2A 2H25A 1JW4A 4GLIA 1OLCA 3FXUA 3TQWA 3S2VA 4QFPA 2ZYMA 3DELB 3V5AA 4BLAA 2Y7RA 2ZYKA 2Z8FA 1XHYA 4LZ5A 3TCFA 4FIMA 3TYHA 4QFLA 1SI1A 1Z7NE 3B6WA 1MXYA 2Z8DA 4P0GA 4PFWA 3KSXA 1P1UA 1HSJA 2ONKE 5BWJA 1R9QA 4G68A 4R9GA 2XX7A 2V25A 1NMUA 1OMPA 1JW1A 4KYEA 2ALUA 3MVYA 4QSCA 1M5FA 3HSTA 3TQLA 4MLQA 2PT2A 2Q8JA 3H6UA 1B58A 3PPQA 3T9XB 1LFIA 1QW0A 4EXKA 3IR1A 3MP8A 3V83A 1LFGA 4DDDA 4RPNA 2H5YA 1QUIA 3SEXA 3K6UA 4JSDA 3IK6B 3UORA 3DP6A 1B3EA 1B5JA 2I48A 1D4NA 3TKDA 4NF4B 2OK2A 4TQUQ 1UIVA 2QS3A 5CRYA 2QPQA 4RA1A 3TDJA 4JWXA 4O3AA 4HS7A 1PBPA 3N6UA 1FTLA 1B2HA 2XHDA 3PUYE 5LOMA 3JYRA 3OO9A 3RTWB 2OWSA 4Q0CA 4TLLB 4M4GA 3OMBA 4ZEKA 5TU0A 2UVJA 3U1OA 4LZ7A 1ZIUA 2OCUA 1EZOA 2H99A 3ODBA 2E0SA 5F7VA 3CG1A 1URGA 3A3UA 4H8IA 3G7WA 3FD3A 4UACA 3S4UA 3LR1A 2RKMA 4HTGA 4QFKA 3K00A 3N26A 3RLFE 4QSEA 5ITOA 1VFDA 4BDMA 4H65A 1MY2A 3TTNA 1SYHA 4JWOA 1KWHA 3F11A 3KG2A 1N04A 4OETA 5A5XB 1R1NA 4KQPA 1B7UA 1RKMA 2O7UA 1QULA 4RJZA 1URSA 3GLBA 2RC8A 5L9MA 3VVFA 4OESA 3O6IA 4ZEIA 5FTHA 3OENA 4C1UA 3VXCA 2AL4A 1FQCA 2F34A 3M8UA 1MDQA 2GHBA 3U72A 1QUJA 4NF5B 4EDPA 5AE4A 1US5A 1EH3A 1PC3A 3K6WA 3BBRA 2UXAA 3KN3A 4P0IA 5CMKA 1MY4A 5EHSA 4OHNA 3ZS6A 4X1BA 3MWBA 2VD3A 1FTKA 4FATA 3S9MC 3KOTA 4KCCA 5ISUA 2Q2AA 1B05A 2HAUA 1MQIA 1P1NA 4KYDA 3SEUA 2PMSA 1IXGA 2O1LA 4GRKA 4F3BA 5L8DA 4Z7EA 2ESNA 3CR9A 3RUMA 3PMVA 1S50A 1AIVA 4ELOA 5FHMA 2HCAA 2UVHA 1TFDA 4FE8A 3SEVA 1TWYA 2CMOA 4FEDA 4RY1A 1S9TA 4ZZAA 5CMCA 5DEXB 3RY3A 1N7WA 3T22A 2QS4A 4YZZA 2A5TA 3SETA 1MQDA 1B40A 2OJTA 3G3JA 3PGFA 5I2KB 3UP9A 3FIRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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