1MM7A

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with quisqualate in a zinc crystal form at 1.65 angstroms resolution
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanism of Activation and Selectivity in a Ligand-Gated Ion Channel: Structural and Functional Studies of GluR2 and Quisqualate
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mm7A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mm7A01
5ITOA 5H8HB 1ZTYA 3N94A 4H0WA 1MXXA 2DS9A 1US5A 2D21A 5CBRA 2DE3A 1NNTA 1RYXA 1QUJA 3TCFA 4YKJA 5AA2B 3Q27A 5B70A 3PD8A 5ICTA 4TQUQ 1PDAA 1SW4A 3D4GA 3MZBA 1MY3A 3U8QA 4JWXA 2ESNA 3PMXA 4DXBA 4DCYA 1URSA 3ILTB 5H8SA 1WDNA 1JW5A 5ITPA 4YZZA 5K2XA 3SEUA 1B7ZA 2WKYA 4LZ8A 4OVJA 3RN8A 4KQPA 3U72A 2QMXA 4OFLA 5FTHA 5I58B 4FORA 3IL1B 3S9EA 1EH3A 3ONMA 4F3PA 3HHFA 1S50A 1UTHB 2YPNA 4F19A 5TP9B 1Z7NE 4ELRA 2A5TA 3TTLA 3S9MC 1DTGA 4NF5A 4GFRA 3T22A 4EXLA 2I6EA 4KR5A 2ANJA 1EZOA 4X1BA 3FJMA 1LGBC 2OZZA 1H45A 4F3SA 2GHBA 5JK4A 2OJTA 1XOCA 1XVYA 3RTWB 3UP9A 3TELA 4RPNA 1R1NA 3UIFA 3S9LC 3ECRA 2RC7A 3FZVA 4FEDA 3K1NA 4FE8A 4F39A 3IO6A 1QVSA 4OFJA 1LBBA 2A5SA 1ATGA 3TTKA 3M8UA 4OZ9A 4G8NA 4GRKA 1KWHA 4NF4B 3OO6A 2I49A 1MDP1 3RY3A 4IO2A 1MDQA 3K6VA 3HSTA 3T66A 1MM6A 4X1DA 1II5A 2QMWA 3C33A 3IB0A 2ONRA 4ZEIA 4G8MA 3KN7A 2QSXA 1AL3A 4YMAA 3MVYA 2XXQA 1Q1KA 4LP2B 2RKMA 3TTMA 2F34A 3KOSA 1MS7A 3ILUB 2O68A 2XXHA 2AIXA 1OLCA 1B6HA 1EZ9A 2X7QA 1POY1 2THIA 4GWOA 1PB7A 1CE2A 1HSJA 3S2VA 2XXUA 3L6HA 3GBAA 4DE8A 3TEPA 4O3CA 1B3EA 2DXYA 4KCDA 4Z7EA 2VD2A 4WEDA 2Q2CA 5I2KB 3KSJA 2PT2A 1PEBA 3USDA 1OVBA 2GRVA 2I48A 3WAFA 2Q2AA 1BIYA 2VGQA 3VDFA 2F7CA 2OWSA 1B7HA 1SD3A 1SI0A 2F5XA 4KYSA 1TWYA 2XXYA 3SETA 4YU0A 2I3VA 3O28A 4KD5A 4BLAA 5I57B 1MRPA 1USYH 4H8JA 2I0CA 2Y7PA 1I69A 2W7YA 3PUYE 2Q8JA 1FQBA 3Q26A 4IGTA 4DIGA 4MF3A 3TMGA 2Z8DA 4WXJA 4AQ4A 1RKMA 3KEIA 1LAXA 2NVUB 5DT6A 1ELJA 3WAEA 3MPKA 1SQYA 1UQWA 5CI5A 5AA2A 4I1DA 4HTGA 1A99A 5JEIA 2XX9A 4GIZA 1AH5A 2ZYKA 1IQ7A 3FVOA 4U23A 1BLFA 3UGWA 3FV1A 1P1OA 4P11A 4POWA 1MPBA 3TPAA 4N07A 4I9DA 4LA9A 3FVGA 1MG1A 3T9HB 5FHOA 3UA8A 1FTLA 3SEYA 3VVEA 2GH9A 3K6WA 4R73A 3EHTA 4LONB 2FNCA 2PMSA 1B0HA 1HSLA 3MVXA 4NF6B 1NL5A 4PE5B 1O7TA 2H4IA 2ZXTA 4U4SA 1UTHA 4HW8A 4JDFA 4FECA 1MQHA 4R6YA 1R6ZA 5DEXB 4QSEA 1O63A 3KSXA 2RC9A 1IXCA 4BDRA 1IXGA 1M5DA 2XX7A 4LVQA 1NNFA 1GR2A 3EF7A 3LUYA 4QFKA 1XC1A 4GF8A 4NF8B 3IAZA 1Y3QA 3UK4A 1FCKA 3VLWA 4F1YA 2VD3A 3EHUA 3Q25A 4RNSA 2DWAA 1VFEA 5KCJB 3IORA 2UYFA 2GHAA 1FQFA 3P7IA 3IOTA 2DVCA 3E9XA 3GLBA 4IGRA 4RA1A 2Q9TA 1LLSA 4ONYA 1JW4A 1B51A 4NF4A 2RCAA 4G4PA 3MP8A 1ZLQA 4LUBA 1MXYA 4YMBA 3LR1A 2F7BA 2UVJA 1PBPA 4F1VA 4KPTA 3OSRA 2ZYMA 1Q35A 2Z23A 3DM0A 4PFUA 3T96B 1ANFA 3HV1A 2KLFA 3W9WA 3B6WA 5KDTB 1B3HA 4X9TA 2I4BA 4QFLA 5AA4B 1Y9UA 2DOJA 2Y7RA 1IEJA 3OEKA 2XD2A 3W15C 4Q8RA 4PFYA 3SERA 3RQTA 4LZ5A 3O9PA 2DWHA 1B0LA 4YB6A 3ZSFA 4YB7A 4ZECA 3K02A 1MY0A 4QSCA 4Q0CA 2REJA 5HM4B 2ZYOA 2DVZA 4OENA 2UYEA 2E1SA 4H65A 4GVOA 1LFGA 3GZGA 3K1PA 5I2KA 3G3IA 2V3QA 1XVXA 3VE1B 4QRZA 3GBBA 3Q28A 1SDXA 1IIWA 3CRBA 4WKMA 1YPNA 2XXTA 1A8EA 2P0SA 3FASA 1LB9A 3CI8A 4XXUA 2Y84A 3EN3A 2NUVA 3H03A 1Y4TA 1YAEA 3H6TA 3RNNA 1XHYA 1SVXB 1FTKA 4TLMB 3SDFA 5I57A 1JEVA 3HHGA 1JVYA 1N04A 3SESA 4BDNA 2V93A 3KJ7A 1MXVA 2Y7KA 5CMBA 3T9VA 4R9GA 2B3BA 3BBRA 3PMWA 5I56B 1LCTA 2O84X 3CFXA 1A7LA 2QS3A 4M4GA 3CFZA 2NOOA 1LAFE 1BTJA 3ZKKA 3VVDA 2F6PA 3TQWA 4ELPA 2O69A 4AB5A 3AXFA 4DXUA 1O64A 4FJPA 3G3JA 3IOVA 3IOUA 3JYRA 1UTBA 1P1QA 4I62A 2VHAA 5CMCA 4ZEFA 1FQEA 3K0VA 4R6KA 1Y1MA 4GL0A 3V89B 1MXWA 5DVJA 1GV8A 3D4CA 4NWCA 2D5WA 1B1HA 4NF6A 2HFBA 1M5CA 3OENA 5H8FB 1MPCA 2QPQA 3OMBA 4NEDA 1R9LA 5IAIA 2QS2A 1FTMA 2UVHA 1DSNA 1OVTA 5DEXA 1FTOA 4MLQA 1D9VA 1OIBA 2ONSA 1N3WA 1B5JA 3CFLA 4TLLB 4KI0E 1UIVA 3T93B 3RT8A 3GXAA 3FXUA 4UA8A 1JVXA 4QHQA 3KJTA 3BKIB 2H98A 5JTYA 3OD7A 2YLNA 4NF8A 4ELQA 1MXZA 4DDDA 1N84A 5ICQA 3M3FA 3UN6A 5KCJA 4YAHX 3K01A 4OHNA 4FATA 2DSFA 1N3XA 1B5HA 3TQLA 2G93A 5I2NB 1WODA 3K00A 1BP5A 4RXLA 2O1LA 3I6VA 1PBQA 3C34A 1Y1ZA 4MH5A 3K6XA 1TT1A 4NWDA 2YJPA 2RCBA 4M1VA 4C0RA 3HO7A 3MP6A 1VR5A 1AOVA 3TCHA 1D3KA 3MW0A 5KDTA 1PB9A 2GFEA 4ND9A 4DXCA 1L5TA 1AIVA 3U94A 2NWJA 2V3UA 3LSFB 5AA4A 2Y7WA 3FUZA 4XTCQ 1M5BA 1EZPA 1M5FA 1S7YA 5CM6A 1P1WA 3FIRA 1MY4A 1ZJLA 3KN3A 3RGYA 1N7XA 1ZU0A 1IXIA 3LSLA 4BDOA 1H43A 1VFDA 4OERA 1NKXA 3MZ9A 4R2FA 4DZ1A 3FVNA 4HCYA 3FV2A 4RJZA 3BFUA 2REGA 2B65A 1DTZA 3IJXB 1JEUA 4O3AA 4G2ZA 4JB7A 1TFDA 3C32A 1RYOA 3S9NC 2DE2A 2ONKE 2XX8A 3PD9A 3QYTA 1Z7ME 3JZJA 5H8NB 2DYXA 1B7UA 1R9QA 5H8HA 1URGA 4OESA 2O1MA 5I84A 2X7PA 3N6UA 3KG2A 4IO3A 4ZZEA 4R2BA 4GOTA 2HZLA 2XXPA 2HAUA 3N6TA 1AMFA 3PPOA 4E0WA 4NMYA 1JETA 3KN8A 1DPPA 2XXWA 1ZBMA 1QKAA 4ZEBA 4UACA 4P0IA 1H3DA 2AL4A 1IZ1A 4EQBA 1JQFA 3H6WA 4BDQA 1PB8A 2AL5A 4C1UA 4F22A 3FJGA 3LC8A 2QJEA 2QRYA 5FHMA 3C36A 4GQOA 5FHNA 1H76A 3QAXA 3TODA 2OK2A 3IJOB 3T9XB 5M2VA 5L9SA 1P1NA 3W9VA 5I58A 1QUKA 4O3BA 2OLBA 3VVFA 1QJMA 4R6HA 4G68C 1MXUA 1B58A 3IK6B 3MJNA 3G3HA 3H6VA 4Z0IA 5TP9A 2HQ0A 3I5OA 1LBCA 2PVUA 3M3KA 3LSWA 4F1UA 2ALUA 2I4CA 1QULA 3U93A 4PFTA 3MPLA 3B7DA 5H8FA 1OQGA 4R72A 4XIGQ 2UVIA 4IO5A 3VXBA 1NNKA 1B2HA 3FXRA 2PBWA 4ESXA 3RT6B 3TFLA 4MBPA 2BJJX 1ZIUA 1BKAA 2H5YA 1B05A 2XHDA 4OTEA 4EQ7A 2F35A 4YKKA 3BFTA 2UXAA 3V5AA 2PX1A 3R26A 1Y4CA 2Z8EA 3H7MA 4EF1A 5F7VA 3DP6A 1Y20A 2HXWA 4EDPA 4G68B 1YTVA 4K3FA 3UORA 3IO4A 2R71A 4P0GA 4ZEKA 1MQIA 1VE4A 3O6IA 2LAOA 3IB2A 4RK9A 5AA2D 1B3LA 2IEEA 2ZNUA 4IB2A 2ZMBA 4BDMA 3RUMA 1XS5A 1B5IA 1WVJA 2H99A 1PC3A 3OO9A 1ZKBA 5I2NA 4GD5A 4L17A 1FW0A 2B3FA 3MUQA 3I3VA 5BWJA 4R74A 3T9UA 3C9HA 3E3KA 4GL8A 2V3TA 4LQ5A 2OWTA 4QFPA 3PGFA 4U4XA 3KBRA 2Z22A 3C31A 3B6TA 4QFNA 1T0KA 4NTLA 2O7IA 1JNFA 4LATA 2F97A 3KFMA 2ZYNA 2XXVA 1I6BA 3G3FA 3O6GA 3RTFB 4OYVA 4Q5TA 1QUIA 4EF2A 4H5FA 3HPIA 1I6QA 1VSOA 4F3GA 4ZE8A 1GTKA 3FVKA 3K4UA 2DWJA 5CMMA 5IKBA 3S4UA 3LBSA 5CBSA 3CVGA 1POTA 1YCJA 1URDA 5TU0A 1B3FA 3OO8A 4ZZAA 3C4MA 5A5XB 2FYIA 2H25A 1US4A 2F8DA 3PPNA 1Y3PA 3ZS6A 2DQVA 2Q89A 2R6GE 4YKPA 3MP1A 4KFQA 1LFHA 5H8NA 3R7XA 1H44A 2DWIA 3TYHA 1NH7A 4IY6A 4ELOA 2ABHA 4OFOA 2D3IA 2X26A 3SEWA 3MVWA 1FQCA 4QSDA 4F2OA 2O6AA 4FIMA 3KOTA 2HEUA 4ZEDA 4OWDA 3MQ9A 1LCFA 5LOMA 5L8DA 3DELB 2IA4A 2OCUA 4JWYA 3QXMA 3FD3A 3V83A 2P1SA 1P99A 1SW1A 3F11A 1NNPA 2DXRA 2QS1A 5I59B 4H8IA 4H1XA 3G7WA 4RK2A 4EQ9A 2CMOA 1IITA 4BDLA 3KGCA 4XKPA 1MPDA 5ISUA 3MWBA 5H8QB 1SI1A 5AE4A 3QK6A 4H6DA 1LSTA 1N7WA 1MH4A 4OMBA 2Q88A 1GVCA 5EYFA 4E0XA 2QL3A 3TKDA 4GXAA 3H06B 1TFAA 4OETA 3FATA 4KYEA 5EHMA 1B4HA 2PYYA 5TPAB 3K1MA 1DPEA 4OEUA 1QW0A 3N26A 4PFWA 4GLIA 3Q29A 4C1TA 1DOTA 3PMVA 1OMPA 3A3CA 3M3LA 3E4RA 4KCCA 4ESWA 3OEMA 4U22A 2G29A 4KYDA 3TTRA 1LAHE 4TOZA 4R9FA 3E13X 4ISUA 3VLUA 3O97A 3SEXA 3PUZE 4G68A 3RPWA 2RC8A 5AA3A 1B1XA 4GXSB 2O7UA 3JV9A 4G77A 3O66A 2F6GA 5HPQA 3TCGA 3OO7A 5HBCA 1OQHA 5F1QA 3CR9A 4IO4A 4IO7A 4XKNA 3G3KA 1A40A 3QUFA 1JW1A 3R6UA 1B9JA 1LFIA 4U2RA 4JSDA 3H4ZA 1D4NA 4LQ2A 2Y7IA 3OOAA 3PUXE 3C35A 2VOZA 1B32A 4N6PA 5DVFA 2P2AA 3A09A 3QSLA 3PU5A 1CB6A 3VV5A 3U92A 1MY2A 3G3GA 3VLVA 1FTJA 4RYAA 2HAVA 1MY1A 1B46A 4DLDA 1HSEA 3K2DA 1XT8A 4I8CA 1B40A 4F2QA 4JWOA 4QF9A 2UVGA 2VP1A 3MBPA 5J1DA 2F7AA 3TAJA 1LAGE 1SW2A 4F18A 2DE4A 4KHZE 4OQOA 4JXIA 4WEPA 2CZLA 2V25A 3MAMA 1MH3A 4X48A 4POXA 4ZE9A 3TTNA 2OBGA 4R75A 5A5XA 3PPQA 4PETA 1USYE 1MQGA 2ZNSA 1NH8A 3DP4A 3DP8A 2Z8FA 3KZGA 1B52A 1F9BA 4F3BA 3B6QA 1A55A 4AB6A 5I56A 5EHSA 1MQJA 4YKIA 3SKPA 3OSQA 5DTBA 4THIA 4HS7A 4MLVA 3L6GA 3PPPA 3N5LA 3MZ1A 3CG1A 5AA1A 3FJ7A 2HCAA 5KZTA 3H6UA 1TXFA 3H3GA 1OLAA 2F36A 3CSBA 3HCQA 4U1OA 1UTBB 4MFIA 1J1NA 2QS4A 2PT1A 4XKQA 3EHSA 4H5GA 1MQDA 1P1UA 2A5TB 3HN0A 4NF5B 5ELVA 3MC2A 5I59A 5CC2A 4N13A 1SW5A 3DLNA 3PPRA 4XKRA 5L9MA 3O2AA 4H67A 4PP0A 1A8FA 4OXVA 3PUVE 4F31B 1SYIA 4RPOA 2AYSA 5H8QA 3O29A 1NFTA 4ZDMA 4PQJA 4Q30B 1NMUA 4NE4A 3THIA 3PUWE 3OXNA 5TPAA 2F78A 3U1OA 5JTYB 3QIMA 5BUUA 3VXCA 3EPEA 4G8HA 1M5EA 2DP8A 2M8CA 2FA7A 3O6HA 3VFJA 3ZKLA 1D9YA 4FAJA 4U1ZA 1ZMGA 2O51A 4QFOA 2NXOA 4JBZA 3FGSA 5CRYA 4YB5A 4IY5A 1FQAA 3V8XB 3PV0E 2RF1A 4LZ7A 3K6UA 1IUDA 3FXQA 1EU8A 4YICA 3IR1A 4RY1A 1GGGA 4F29A 3TZAA 3IOWA 1I6AA 2I58A 2I0BA 1LB8A 1SYHA 2E0SA 3OELA 4ZS9A 5L9OA 4OEVA 4HCWA 5B7DA 3A3UA 2R9JA 3CSGA 3IB1A 2XXIA 4DCXA 3SEVA 3EQ1A 1QKBA 3RLFE 5DVIA 1UIUA 1B3GA 5FTIA 3IX1A 2XD3A 2I3WA 5K2YA 2ZNTA 3QUJA 4EXKA 3MVZA 2HZKA 3LSXA 1SBPA 1N76A 4U21A 1IXHA 4JSOA 4ECFA 1B4ZA 4EUOA 5DYHA 1DMBA 3TUSA 2XXXA 1A54A 1FQDA 3TDJA 1S9TA 3CG3A 3ODBA 1N0TA 1Y3NA 4FEBA 5CMKA 2H9BA 3CIJA 1MM7A 2V84A 2RINA 2XXRA 4IO6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OA4A 5ITOA 5H8HB 1ZTYA 3N94A 4H0WA 2HHMA 1MXXA 2DS9A 4X8RA 1US5A 2D21A 5CBRA 1IMBA 2DE3A 1NNTA 4GWUA 1RYXA 1QUJA 2XWOA 3TCFA 4YKJA 5AA2B 3Q27A 5B70A 3PD8A 5ICTA 4TQUQ 1PDAA 1SW4A 3IFAA 3D4GA 4FBPA 4PFBA 3MZBA 1MY3A 3U8QA 4JWXA 2ESNA 3PMXA 4DXBA 4DCYA 1URSA 3ILTB 5H8SA 1WDNA 1JW5A 3CHGA 5ITPA 4YZZA 5K2XA 3SEUA 1B7ZA 2WKYA 4LZ8A 4OVJA 3RN8A 4KQPA 3U72A 2QMXA 4OFLA 5FTHA 5I58B 3B50A 4FORA 3IL1B 3S9EA 1EH3A 3ONMA 4F3PA 3HHFA 1S50A 1UTHB 2YPNA 4F19A 5TP9B 1FPIA 1Z7NE 2QVRA 4ELRA 2A5TA 3TTLA 3T1BA 3S9MC 1DTGA 4HE0A 4NF5A 4GFRA 3T22A 2CZIA 4EXLA 2I6EA 4KR5A 2ANJA 1EZOA 4X1BA 3FJMA 1LGBC 2OZZA 1H45A 4F3SA 2GHBA 2XXKA 5JK4A 2OJTA 1XOCA 1XVYA 4NF0A 5I3SA 3RTWB 3UP9A 3TELA 4RPNA 1R1NA 3UIFA 4NGUA 3S9LC 3ECRA 1LBZA 2RC7A 3FZVA 2OX3A 4FEDA 3K1NA 4FE8A 4F39A 3IO6A 1QVSA 4OFJA 1LBBA 2A5SA 1ATGA 3TTKA 3M8UA 4OZ9A 4G8NA 5T3JA 4GRKA 1KWHA 4NF4B 3OO6A 1BK4A 2I49A 1MDP1 3RY3A 5EQAA 4IO2A 1MDQA 3K6VA 4JVDA 3HSTA 3T66A 1MM6A 4X1DA 1II5A 4XF5A 2QMWA 3C33A 3NOHA 3IB0A 3KC0A 2ONRA 4ZEIA 4G8MA 3KN7A 4PC9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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