5I57B

Glutamate- and glycine-bound glun1/glun2a agonist binding domains
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
278
structure length
277
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein, receptor
total genus 79
structure length 277
sequence length 278
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i57B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i57B02
2UVGA 4WEDA 2HQ0A 5L9MA 4MLQA 5IAIA 3WAEA 1QUJA 4OZ9A 3A09A 3MC2A 4HTGA 3C32A 3CR9A 4ZEIA 2YPNA 3O6IA 4QFPA 1SQYA 1JQFA 4NWDA 2DYXA 3OSRA 5DVFA 1EZOA 3W9WA 4ELQA 1LAHE 3FIRA 1MQIA 4FEBA 5K2YA 2E1SA 1MXZA 4Q0CA 5HBCA 1B7HA 4LONB 5JTYB 3K4UA 3OO6A 2B3BA 4ZS9A 3T93B 1Y1ZA 4H8JA 4BDRA 2QS1A 3PPPA 4YICA 1L5TA 1Y3PA 4DXBA 1Z7NE 5AA1A 4NF5A 3IO6A 2G29A 1SDXA 2DE3A 4M1VA 4G8MA 3G3HA 3FVGA 1P99A 5H8FA 2GH9A 3F11A 4X1BA 4F29A 4EF2A 3FXRA 3G3GA 3S9NC 2QPQA 1BLFA 4NF6B 1B32A 4R6YA 3DM0A 1Y3QA 4L17A 1MDP1 5I59A 4HCWA 1GVCA 3DELB 1JVXA 3MPKA 4OQOA 4GXSB 3G3IA 1NNFA 4DXCA 3QSLA 2H5YA 2DXRA 1MH4A 1MM6A 4YKJA 4RXLA 3FXQA 2GFEA 1IITA 3HHGA 3FJGA 3TCHA 4LVQA 3OO7A 3O97A 4JB7A 3GBBA 3CG3A 1NL5A 4LATA 1MXYA 4ZEBA 1FQAA 1IQ7A 3SETA 1OIBA 1JEVA 1II5A 2OZZA 2QL3A 4DCXA 4ELRA 4OEVA 4GVOA 3MAMA 3FJ7A 4OXVA 2UYEA 4H65A 2XXIA 4U23A 3I6VA 1NH7A 3ZSFA 3A3UA 1YPNA 3GLBA 2Y7RA 1LAFE 4TLLB 2HXWA 2V3UA 1P1WA 3KSJA 3OEKA 2CMOA 5TPAB 3CSBA 4H8IA 3OEMA 3HO7A 1ZMGA 4ZEKA 2PX1A 4H0WA 1MXVA 2H25A 1SD3A 4AB5A 3CI8A 4RPNA 2DXYA 4ELOA 1Z7ME 3SERA 1WODA 4RNSA 3LSWA 4QFKA 2DS9A 4WEPA 2XD2A 4KD5A 4TLMB 3IK6B 1J1NA 3VDFA 2VD3A 1B3EA 2ZXTA 2I0BA 2HZKA 2O69A 4LP2B 1LAXA 4U4XA 3H6TA 4IGTA 1XHYA 3KFMA 3ILTB 4BLAA 1DMBA 4GL0A 5AA2B 1PB9A 3IAZA 5JEIA 1IXHA 4EQBA 1TXFA 3HPIA 5J1DA 1EZPA 2XXWA 5I58B 4H1XA 3O66A 2HAUA 2XXRA 3CG1A 5TP9B 4N07A 1OVTA 4THIA 4G77A 3TTLA 2O84X 4OERA 1BIYA 5DTBA 2UYFA 4AQ4A 2O7UA 4P0GA 4KYDA 3EHSA 4NF4B 1I6BA 4NF8B 1EZ9A 4GFRA 3MZ1A 4H67A 4OFOA 1QUIA 3TYHA 3TTKA 1CE2A 3DP6A 1MG1A 4IO6A 1IZ1A 3C9HA 5TU0A 2UVHA 4XKNA 2ONSA 4QHQA 3FV1A 3UA8A 4AB6A 1OMPA 1PEBA 3M3LA 4GWOA 3VVEA 2Z23A 2DWJA 3TEPA 5CRYA 1LAGE 3RN8A 1QKBA 5KDTA 4BDLA 3TQLA 1SW1A 1H44A 3KJ7A 3GXAA 3K6UA 2OCUA 3G7WA 2XXXA 2ANJA 4U2RA 4PQJA 2NUVA 3TAJA 4EF1A 1NKXA 3H6WA 4LZ8A 3V5AA 5I56B 1UTBB 1MH3A 1WDNA 4YMBA 1D9YA 4Q30B 3U92A 2R71A 3DLNA 3EHUA 1RYOA 1P1NA 1ZLQA 3OO9A 4U1OA 4IY5A 2OWTA 4GQOA 4YKKA 4FIMA 4G68B 1ATGA 2DVCA 3TZAA 5KZTA 4F3PA 2NXOA 1PDAA 3ZS6A 1P1UA 3BBRA 1R9QA 1XOCA 3QAXA 2Z22A 2XX8A 4YB6A 4PFWA 4R2BA 5TPAA 2PVUA 1B1HA 1SW2A 5I2KB 3SEVA 1Y4TA 2F5XA 2X7PA 3I3VA 1Q1KA 4JWOA 4ZE9A 5AA4B 5CC2A 1SI0A 3B6TA 3PUXE 4OTEA 4MF3A 1VR5A 3O6HA 3H4ZA 4RJZA 1A8EA 4G4PA 4I9DA 1JW1A 5CMBA 5ISUA 3MWBA 1XVYA 2QS3A 3PMVA 2Y7KA 2A5SA 1FW0A 3MVYA 1SBPA 1RYXA 4KI0E 3N94A 4JWYA 1B52A 4GD5A 1DPPA 4R9FA 3H7MA 5AA2A 3VLUA 5HPQA 3OELA 1XT8A 1N84A 1MXWA 1POY1 3JZJA 2BJJX 2FA7A 3E13X 4PE5B 3OXNA 1ZIUA 3KJTA 5TP9A 4FORA 3CVGA 2F35A 1LCTA 1Y20A 1LFIA 1MDQA 3MPLA 2RCAA 2O1MA 3PPOA 4NF8A 1TT1A 4YKPA 3N6UA 4ZZEA 3IR1A 2H4IA 1URGA 3PMWA 2OJTA 4UA8A 1MXUA 1QUKA 4ZE8A 2F97A 3UP9A 4C1TA 4KYSA 2UVJA 1HSEA 4U4SA 1MY1A 3PMXA 4LQ2A 5H8HB 5IKBA 2QJEA 3RLFE 2F78A 2WKYA 3MBPA 1HSJA 1A54A 1QULA 3R7XA 1ANFA 3QYTA 1S7YA 1IEJA 4KQPA 4KCDA 1QKAA 2OK2A 1DOTA 3U94A 1SI1A 4G8NA 5H8QA 4R73A 5ITPA 2DQVA 1ZKBA 3TUSA 3VV5A 2QS2A 4LA9A 4U21A 1LFHA 3E3KA 1UTBA 1AOVA 4P0IA 2H99A 3RQTA 5ICQA 3GZGA 1AH5A 2ALUA 4BDNA 3M8UA 5A5XB 4N13A 1AL3A 2OWSA 3PUVE 1OQHA 1P1OA 4OFLA 4G68A 5H8NA 1B3FA 3W15C 1LLSA 3KSXA 1DSNA 4EQ7A 4XKRA 1PC3A 4IO7A 3EPEA 1FQFA 1CB6A 1O64A 3TODA 3U72A 1IUDA 4QSDA 3A3CA 2XXHA 4JSDA 1NFTA 2YJPA 1XC1A 3E9XA 2D3IA 3S9EA 2X7QA 4NEDA 1US4A 2F6PA 3K6WA 1M5BA 2F7CA 4G68C 1MM7A 2QSXA 1UQWA 3OO8A 2E0SA 3FGSA 4MLVA 1YCJA 3RUMA 1B5HA 1YAEA 1AMFA 4OVJA 3EN3A 4YB7A 4ZDMA 2VGQA 2M8CA 2I3WA 1B5JA 4O3AA 4QFLA 4R6HA 5L9SA 5EYFA 2Y84A 3SEXA 3UGWA 2R6GE 2A5TB 5FHOA 1NNTA 3MP1A 1TFAA 3PPQA 2DE4A 3USDA 4YU0A 2I4CA 1PBQA 3B7DA 1S9TA 4IO5A 1LB8A 3R6UA 4XKPA 2DWAA 3TTRA 2F36A 3IJOB 2Y7WA 3CSGA 4U22A 1IXGA 1GGGA 3DP4A 3IB0A 4JWXA 4RA1A 4BDQA 1R6ZA 4LZ7A 2F8DA 1MY4A 3RT8A 3VXCA 3Q25A 3S9LC 2G93A 1LCFA 1NNKA 3RT6B 2QS4A 5I84A 2RF1A 1N0TA 4OWDA 5H8HA 2O7IA 3UIFA 1M5FA 3QK6A 4FECA 2V3TA 2RC7A 4BDOA 3O2AA 1B2HA 3IOTA 3H6VA 3PUYE 2I0CA 3MP8A 1M5CA 3C36A 3LC8A 1FQDA 4F2OA 1MPDA 3N6TA 5FTHA 2FNCA 3JV9A 4PP0A 2RINA 4F2QA 3O29A 4F31B 3FASA 1B7UA 3K1PA 4GF8A 4C0RA 4F1YA 2V25A 2PBWA 1H76A 4Q8RA 1FTMA 1USYH 1B5IA 3IO4A 3IOVA 1JETA 1OLCA 2ZMBA 1FQBA 2ZYKA 1T0KA 4XTCQ 4NTLA 2F34A 4XIGQ 3L6GA 4Q5TA 3BKIB 3ONMA 4R74A 1I69A 5CMKA 5JTYA 2IEEA 1MQGA 3FJMA 3HN0A 5DEXB 3SEYA 4I62A 3VLVA 5M2VA 3K6XA 1BKAA 1FQEA 1QW0A 4R72A 1A99A 1SW5A 2UXAA 1B51A 3O6GA 1IXCA 2RCBA 4WXJA 5CM6A 3K0VA 2HFBA 5KCJB 2AL4A 1LSTA 3QXMA 5ITOA 4NF6A 2P0SA 5L9OA 1B3HA 1B9JA 1O7TA 1B7ZA 4R2FA 3KG2A 3UN6A 2ABHA 1QVSA 1Y4CA 5DT6A 4QFOA 2X26A 5AA2D 2CZLA 3D4GA 4F3BA 1A8FA 3FD3A 5JK4A 3KEIA 1EU8A 2RC9A 4ZEDA 4FAJA 2P1SA 1URSA 3LUYA 3E4RA 1MPBA 5DYHA 3ILUB 3L6HA 2ESNA 4E0XA 4OMBA 3N5LA 4IB2A 4OYVA 2DWHA 3PD9A 4POWA 2HAVA 3PPNA 1UIVA 1B6HA 3IL1B 4ISUA 1H3DA 2XXTA 2PT2A 1N04A 2I48A 2DE2A 2GHBA 3OD7A 4JDFA 1IXIA 1IIWA 2XX7A 2I58A 1H45A 3QUFA 3FV2A 3IJXB 5F7VA 3RTWB 4PFYA 3K01A 1URDA 4EQ9A 4IGRA 5CMMA 2XXUA 4UACA 5F1QA 3TFLA 2PMSA 4U1ZA 3W9VA 3H06B 4OETA 1N3WA 3C33A 1FCKA 1PBPA 4NF5B 4QSEA 4HS7A 2DVZA 2V3QA 4XXUA 3HCQA 1US5A 2GHAA 4KCCA 1KWHA 3JYRA 2DOJA 4Z7EA 1FTJA 1B3LA 2VHAA 4O3CA 1BP5A 4MBPA 4GIZA 1P1QA 3HSTA 1VE4A 3RY3A 1H43A 3CRBA 1OQGA 3CFZA 2Z8FA 1A7LA 3G3KA 4LQ5A 3Q26A 5DEXA 5I58A 3VFJA 4XKQA 3T9XB 3PD8A 4QSCA 1A55A 4M4GA 4OEUA 3DP8A 4ECFA 2HCAA 3EF7A 5ICTA 4NF4A 4K3FA 3ECRA 3LBSA 2Z8DA 5KCJA 5I57B 2Y7IA 1R9LA 1GTKA 3SDFA 5FHMA 5EHSA 1MRPA 4PFUA 1R1NA 1RKMA 3M3FA 3S9MC 4LZ5A 1B0HA 3B6QA 1MY3A 3K02A 1D4NA 3FVOA 2VP1A 5I2NB 3KGCA 4N6PA 4BDMA 3C4MA 1D9VA 4KYEA 2I4BA 4G2ZA 3P7IA 1EH3A 3EHTA 4H5GA 1MQDA 3T22A 2F7BA 1WVJA 2NVUB 2XXPA 3FVNA 4OESA 3PUWE 5ELVA 3C31A 2UVIA 2YLNA 1GR2A 3IORA 4DXUA 1NNPA 4EXKA 3TKDA 1Y9UA 3N26A 3Q27A 2V93A 4DDDA 5I56A 2R9JA 3U1OA 4DCYA 2Y7PA 4OHNA 3QUJA 1XVXA 4YMAA 4YB5A 2XXQA 4OENA 2V84A 5B70A 5CBRA 2AL5A 4ONYA 4MH5A 3U93A 1PB7A 3RTFB 1Q35A 3HV1A 1A40A 2IA4A 4NMYA 5CBSA 2XHDA 1FQCA 3Q29A 1LBCA 1B40A 2B65A 3MZ9A 5I2KA 1XS5A 3V8XB 3BFUA 1LGBC 2KLFA 1OLAA 1DPEA 2NWJA 5AA4A 1POTA 4F1UA 1ZJLA 5LOMA 4OFJA 3I5OA 5AE4A 3MQ9A 2PYYA 1JVYA 3IOUA 1OVBA 4IO2A 5AA3A 1ZU0A 4FE8A 2O51A 2Q2AA 1JNFA 1SVXB 1VFEA 3RGYA 1I6AA 3VLWA 5EHMA 3TTNA 5BUUA 1YTVA 3T96B 4ZZAA 1NH8A 4JSOA 4E0WA 1LB9A 3SEWA 1B58A 3SESA 4GL8A 2REJA 5KDTB 2QMWA 2ZNTA 3TCGA 3KN7A 2REGA 3ZKLA 2XXVA 2FYIA 4DE8A 4X1DA 1FTKA 2AYSA 2I49A 1M5DA 5I57A 1S50A 2O1LA 2H9BA 1N7WA 3K2DA 1B1XA 3LSLA 3LSXA 4WKMA 2ZYMA 4IO3A 4F39A 3SKPA 3T9UA 4FATA 3VXBA 2ZNUA 2QRYA 2F7AA 2B3FA 3KN3A 2XD3A 3MVWA 5BWJA 1VFDA 4ND9A 4X9TA 4R9GA 3TDJA 3H03A 5I2NA 2ONRA 2F6GA 4P11A 3TCFA 5CMCA 2I6EA 4GXAA 1TFDA 4ZEFA 3H3GA 4IY6A 4GRKA 3ZKKA 3TTMA 3CFLA 4QFNA 1SW4A 1Y1MA 4NWCA 3V83A 3LR1A 4EUOA 4EXLA 5A5XA 3FATA 3RPWA 3FZVA 4F19A 1ZBMA 4QF9A 2Q8JA 2ZYNA 1MY0A 3MUQA 3IOWA 3EQ1A 4DIGA 1USYE 3VE1B 1B46A 3VVDA 3U8QA 4ELPA 3IB2A 3M3KA 1QJMA 4F18A 3TMGA 3Q28A 1NMUA 1I6QA 2DP8A 1MQJA 3UORA 4GLIA 3R26A 3B6WA 4F22A 4JBZA 1UIUA 5DVIA 4F3SA 4R75A 2ZNSA 3PUZE 1O63A 3O9PA 2ZYOA 3S2VA 2DSFA 4MFIA 3FUZA 4ESWA 4POXA 3LSFB 4KPTA 3OSQA 3MVZA 1B05A 3D4CA 3TQWA 4KR5A 3FXUA 3O28A 4DZ1A 1LFGA 2THIA 3AXFA 1VSOA 1JW4A 2O6AA 4Z0IA 3SEUA 4JXIA 4TQUQ 2RC8A 4X48A 3FVKA 2P2AA 1BTJA 2XXYA 2A5TA 1HSLA 3THIA 4KHZE 3HHFA 4PETA 2RKMA 4YZZA 1UTHB 3KOTA 3PU5A 2OLBA 4I8CA 5H8QB 1SYIA 3K1MA 3WAFA 4DLDA 4RK9A 3PPRA 4ZECA 2HEUA 3RNNA 4H5FA 4RPOA 4R6KA 3QIMA 3BFTA 1GV8A 4ESXA 2Q9TA 2QMXA 4HW8A 1MS7A 1FTOA 2Z8EA 2Q2CA 4YKIA 1N7XA 1DTZA 2D21A 4GOTA 4QRZA 5H8NB 3T66A 3C34A 2Q89A 4C1UA 2OBGA 2ONKE 1F9BA 4RK2A 1Y3NA 3H6UA 4F1VA 4FEDA 3MVXA 3VVFA 3T9HB 3CIJA 4O3BA 5H8FB 3TPAA 1JW5A 3MP6A 3UK4A 2H98A 3C35A 1LBBA 1ELJA 1N3XA 3S4UA 4FJPA 4F3GA 1FTLA 4YAHX 2AIXA 2PT1A 5I59B 3OENA 4LUBA 4PFTA 3MJNA 3K6VA 1MY2A 4I1DA 3PV0E 1B3GA 5H8SA 3IB1A 3KN8A 3MW0A 1JEUA 2LAOA 3ODBA 1DTGA 3G3FA 5HM4B 1B0LA 4NE4A 2O68A 2DWIA 3OOAA 3T9VA 5FTIA 3MZBA 3K1NA 1M5EA 1B4ZA 3OMBA 1MPCA 1MXXA 4EDPA 4TOZA 4KFQA 1TWYA 3V89B 3CFXA 2VD2A 3KBRA 2W7YA 4RYAA 1B4HA 5CI5A 4HCYA 5FHNA 2D5WA 1AIVA 4H6DA 1PB8A 3KOSA 3PGFA 5DVJA 2GRVA 1SYHA 2VOZA 3G3JA 5L8DA 5K2XA 1MQHA 1N76A 1ZTYA 5B7DA 2Q88A 3GBAA 4IO4A 2XX9A 2HZLA 3IX1A 3TELA 4RY1A 3KZGA 4G8HA 3K00A 2I3VA 2NOOA 1UTHA 1D3KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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