5I57B

Glutamate- and glycine-bound glun1/glun2a agonist binding domains
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
278
structure length
277
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, receptor
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 79
structure length 277
sequence length 278
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i57B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i57B02
3K6UA 4ELRA 3MVYA 4TOZA 3KN8A 2F7CA 2DE4A 2ZYOA 4GXAA 4F18A 3CFXA 3Q29A 4QSCA 1MY0A 1OQHA 1MXXA 5ITPA 1DOTA 4EXLA 3IAZA 4NF8A 3SETA 4PFTA 3TZAA 2Z23A 4QFLA 4KR5A 2DSFA 2XXVA 5I2NA 3H6VA 3IL1B 3PPPA 3KOTA 3MWBA 1SDXA 1IQ7A 4U21A 5CMBA 1EZPA 2Y7WA 2ZNUA 1XVYA 1LFHA 2LAOA 4LVQA 2DWAA 5I59B 4MLQA 4NWCA 4X48A 3H4ZA 4PQJA 4RXLA 3PPOA 3Q27A 2O1MA 4PE5B 4FEDA 1Y3QA 1IZ1A 3MVXA 3H7MA 3KZGA 4F2OA 1F9BA 3G7WA 3V83A 2RC8A 1JW5A 4IB2A 3B6QA 3RTFB 4JWXA 2A5TA 4F22A 5CMKA 2XD2A 1NNFA 2RCAA 2UXAA 1N76A 4F39A 1A55A 3KN7A 1B5JA 1PBPA 2E0SA 4NF4A 3QYTA 1Z7ME 1QUIA 1MPBA 3MZ9A 5HBCA 3HPIA 4H0WA 1DPEA 4F1VA 4ESWA 3KGCA 1PEBA 3RUMA 1Y4CA 4ZZEA 1B3HA 3LR1A 1PB7A 3FVGA 5FTHA 2XX8A 4G68B 3RGYA 2DP8A 2OLBA 3HCQA 4OVJA 1Y3PA 3ODBA 1TFDA 2I49A 5I56B 3TTNA 1VE4A 3TTMA 3TDJA 1S7YA 3SESA 4KYDA 4BDRA 3CVGA 4DE8A 5H8QB 1FW0A 3Q26A 3QK6A 2HAVA 4H8IA 4EQ9A 1D4NA 2D3IA 3TPAA 4JWOA 1UTHB 3PUYE 4U4SA 5K2YA 2ANJA 2H5YA 2D21A 2OK2A 4HCYA 3H6UA 1N7XA 4I1DA 3A3CA 3QXMA 4P0GA 1D3KA 4IY5A 3IJXB 1B05A 1QUJA 1LFGA 3SEUA 3TEPA 3A09A 1LBCA 4UACA 3MP1A 1MM6A 1H44A 3ZKLA 2A5SA 1B3FA 2DWIA 3IO6A 1NMUA 4EQBA 1J1NA 5AA1A 3T22A 4G68C 3VLWA 3FVNA 3KN3A 3VLVA 3TCGA 1SYHA 4IO4A 1HSLA 3H6WA 1TFAA 2WKYA 3QSLA 3TAJA 1H76A 4JSOA 4LUBA 1WDNA 2YJPA 5CMMA 3G3JA 1ZTYA 1R9QA 3VV5A 5KCJA 4YZZA 2PMSA 4WEDA 4YKIA 1SW1A 2V93A 3MVZA 3ECRA 2V25A 3VXCA 1A99A 1IXHA 1YPNA 2VD3A 1VFDA 1PBQA 5TPAB 4FEBA 4YB6A 3ZS6A 1B5IA 1USYE 4ZEKA 4QF9A 3T9XB 4R74A 3U93A 2YPNA 1D9YA 1LAGE 3IB1A 1N0TA 2X7PA 2Q2AA 1KWHA 4R72A 4ZDMA 2V84A 3G3IA 3RQTA 2HQ0A 3U94A 2DWJA 4YKPA 2B3BA 4P0IA 1JQFA 2OWSA 3TTLA 4QFPA 1LCFA 2HXWA 1FTLA 1US4A 3DELB 3FXUA 3R6UA 3UGWA 1RKMA 3JZJA 4H1XA 4EUOA 3C32A 2F35A 1MY4A 2ZXTA 1I69A 2I4CA 5CI5A 4C1TA 2O6AA 4UA8A 4EF2A 1NFTA 1Z7NE 5H8FA 3FXQA 4BDNA 4R6HA 3OSRA 2O84X 3G3GA 1M5DA 2O7IA 2Y7KA 3FGSA 3PMXA 4GXSB 4IO6A 4H6DA 3O2AA 3N94A 4XKQA 3MVWA 1P99A 2YLNA 4O3BA 4DXUA 1NH8A 3KFMA 4KI0E 1B1HA 4H5GA 1N04A 3A3UA 4HCWA 2DWHA 4ELPA 1MH4A 2P0SA 2XXWA 5ICQA 4RPNA 1AIVA 4GIZA 3PUZE 2I0BA 3FUZA 2ZYMA 4FATA 4GRKA 4PFYA 4K3FA 2G29A 2QS1A 1FTMA 3GXAA 4E0WA 4EDPA 3B6WA 3CFLA 1II5A 4QFKA 2O51A 2REJA 2XXXA 4KFQA 2QL3A 5TP9A 2I3VA 5CC2A 4EXKA 2PX1A 2AL4A 3UORA 1P1OA 2DYXA 1M5EA 2R71A 2FYIA 4GL0A 5AA3A 2BJJX 1B32A 3VFJA 3U1OA 4LQ2A 5FHNA 3PUXE 4RA1A 3QUFA 1ZIUA 2OCUA 4OEVA 2DVZA 3K1NA 1OVBA 4YB7A 1DTGA 3FJGA 4MF3A 2X7QA 1OLAA 3C4MA 3TODA 4TLLB 1URDA 2R9JA 3RN8A 4IGTA 5I57B 1FQFA 3K4UA 2UYFA 3PGFA 3S9LC 1YCJA 4YMBA 4DDDA 3LSFB 3MAMA 4R73A 3LSXA 2AIXA 2ESNA 4ECFA 3TKDA 3PPRA 2UVHA 4FECA 2HEUA 4R2BA 5H8HB 1SW2A 4RY1A 1MPDA 3OD7A 3GBAA 4NF5B 1XHYA 3TQWA 1ZU0A 2VP1A 1ELJA 1NH7A 3OENA 4GWOA 3TCFA 4DXBA 5DEXA 3H03A 4ZE9A 2NXOA 3T96B 4OEUA 4H65A 3LSLA 1JVXA 2XXHA 2XXTA 4BLAA 3P7IA 1JW1A 1B5HA 1XT8A 4BDMA 2DS9A 3O97A 4G8NA 1B6HA 5DVFA 4DLDA 2F7AA 3VVEA 3PMWA 4ELQA 4G4PA 3E13X 2VHAA 1PB9A 1UQWA 1B51A 2HFBA 4XTCQ 3S9EA 1XOCA 3OO6A 3KSJA 5F1QA 1LBBA 1SI1A 1B9JA 3OOAA 4GOTA 4G8MA 3VLUA 4X9TA 4RYAA 1TXFA 1EZ9A 1MDQA 1UTBA 1OVTA 3D4GA 2GHAA 1TWYA 4AB6A 5J1DA 1FTJA 3VE1B 1S50A 2RKMA 2Z8FA 4Z0IA 4M1VA 1QKBA 3IB2A 4JBZA 1P1UA 3OO9A 1FTKA 3F11A 3PMVA 4LONB 5AA2B 5A5XB 3DM0A 3GBBA 1H3DA 1WVJA 4IGRA 2Z22A 3CFZA 1FQBA 2Y7PA 1B0HA 3OMBA 2VD2A 2HZKA 1B40A 1B3LA 3I5OA 2IEEA 1VSOA 3IOVA 4GVOA 1MDP1 4HW8A 4PETA 3L6HA 4OERA 5AA4A 4ZEDA 2E1SA 2THIA 2QS2A 1YAEA 3LSWA 5BWJA 2Z8EA 1R6ZA 2PVUA 1A40A 1A8EA 3UA8A 5I58A 3CRBA 5H8NA 1MXUA 3QAXA 3TELA 5IAIA 2RCBA 1XS5A 4GFRA 2I48A 4OWDA 2PT2A 4KPTA 2NWJA 3G3HA 3KBRA 3RTWB 2XXUA 1B2HA 2XX9A 4U22A 1P1QA 2NVUB 4TQUQ 5I2KA 5KDTB 1R9LA 1ANFA 3TTKA 1ZLQA 3Q25A 2DQVA 4MLVA 2I6EA 3OO8A 3LBSA 1B46A 3KOSA 2GH9A 3MP8A 2DOJA 1A8FA 4OFOA 4KYEA 3EN3A 1QUKA 3USDA 5DEXB 1B0LA 3MJNA 2Q88A 2QRYA 4BDQA 2ZMBA 3DP8A 2O7UA 3B7DA 2OZZA 4L17A 1PC3A 2G93A 3SEYA 4Q30B 1MRPA 3V5AA 3H06B 5FHOA 4OFLA 1Y20A 3IR1A 4JDFA 3U92A 4X1BA 3PD8A 1ZJLA 3TUSA 4DCYA 5FHMA 3GLBA 4MFIA 4R6YA 4MH5A 3BKIB 1DSNA 4NF8B 4YMAA 3MW0A 4F1YA 4FJPA 3PU5A 5H8SA 3MUQA 4YKJA 5CBSA 3JV9A 1A54A 1DPPA 1B7HA 1SYIA 4FORA 4F1UA 5I2NB 1LSTA 4RK2A 2Q2CA 1N3XA 3E9XA 4KYSA 3T93B 3CG1A 3PPQA 3FV1A 4XXUA 3T9UA 1VR5A 2M8CA 4F3BA 3K0VA 3HO7A 4LP2B 3CIJA 5K2XA 3K6WA 1BTJA 1H43A 2XHDA 3LUYA 3EHTA 1MQIA 4I62A 1O7TA 1MXWA 1D9VA 5AA2D 5CM6A 3QIMA 4LZ8A 1NNKA 2F36A 4POXA 3K02A 1B52A 3SDFA 1PDAA 4P11A 4AB5A 4WEPA 3TFLA 1B3GA 1MY3A 3C35A 4U4XA 1URGA 2ZYNA 4E0XA 2KLFA 4GLIA 2A5TB 3FD3A 3K1MA 2H4IA 1MY2A 1T0KA 3CG3A 2B3FA 1M5FA 2GRVA 3IB0A 3MQ9A 4I9DA 1USYH 5AA4B 1JW4A 4OTEA 1FQAA 4NF4B 3CSBA 4POWA 1IUDA 4M4GA 1POY1 4KHZE 4RJZA 4U2RA 2RF1A 2F8DA 4LA9A 1MQDA 3O6GA 4KQPA 1I6AA 1LB8A 3O9PA 3S9NC 4U1OA 3PV0E 1M5BA 3G3KA 1LCTA 4F19A 1CB6A 3I6VA 4EQ7A 4JSDA 4FIMA 2XXYA 1MY1A 2PYYA 3O6IA 3MP6A 3I3VA 1Y9UA 2UVGA 5I2KB 5L8DA 5TU0A 1MPCA 3DP4A 2P1SA 2I58A 3FV2A 4Q5TA 1N3WA 3FXRA 2W7YA 3K2DA 2F78A 3ILUB 4ZEFA 3UN6A 5EHMA 1N84A 1Q1KA 5I84A 2F97A 1IXIA 2HAUA 4YB5A 1MQJA 3EPEA 2V3QA 4LATA 2Q8JA 2FNCA 1Q35A 5JTYA 3IOWA 2UYEA 4G8HA 4NMYA 4U23A 1I6QA 1VFEA 1MXYA 1SQYA 2ZYKA 4LZ7A 3U72A 1O64A 3ZKKA 1Y1ZA 4ISUA 4F3GA 3AXFA 3FVOA 4ZZAA 4X1DA 5DTBA 1UIUA 3MPLA 3RT8A 1IXCA 4G68A 2DXYA 4XKPA 1YTVA 4R75A 1I6BA 4F31B 5KCJB 1Y1MA 4KCDA 5I56A 3SEVA 2I0CA 3FVKA 1FCKA 1B58A 5KZTA 2D5WA 1SBPA 1FTOA 1ZMGA 3ILTB 4WKMA 2I3WA 4C1UA 1OLCA 4XIGQ 1UTHA 2XD3A 4GL8A 2RC9A 3KJ7A 2OJTA 1BP5A 2CMOA 1GGGA 1EU8A 1NKXA 4GD5A 3OO7A 4RNSA 2AL5A 3RLFE 3PPNA 3GZGA 3T9VA 2CZLA 3EF7A 1AOVA 2V3TA 4PFWA 1B7UA 1R1NA 3FATA 4OZ9A 3PUVE 2F34A 1NNTA 3C36A 3O28A 4H5FA 1ZBMA 4OENA 5BUUA 3RPWA 1JVYA 4DIGA 5ITOA 5H8FB 1US5A 2OWTA 4TLMB 3G3FA 1GVCA 1B4ZA 3MC2A 2Q89A 1DTZA 4AQ4A 4IO2A 2DVCA 3HV1A 5FTIA 2HZLA 3E4RA 3FZVA 5JEIA 3W15C 4YICA 1JEUA 2FA7A 4NF6A 4LQ5A 2AYSA 1AMFA 1UIVA 4IO3A 3RY3A 5TPAA 3K6VA 2IA4A 2PT1A 3W9VA 5DYHA 3SEWA 3THIA 3M8UA 2F5XA 4F3PA 1MXZA 4YAHX 4QRZA 3R7XA 3M3LA 4DCXA 2DE2A 5EHSA 1DMBA 3O29A 3ZSFA 3WAFA 1JETA 4R2FA 3BFTA 3K01A 4O3CA 5TP9B 1XC1A 4WXJA 4R9GA 3IOTA 2DE3A 4IY6A 3TYHA 5AE4A 2OBGA 1P1NA 1L5TA 5CRYA 1OMPA 2UVIA 4ZEIA 1B1XA 5B70A 4R9FA 1FQCA 1BIYA 5JTYB 4QHQA 2XXRA 3D4CA 4JXIA 3B6TA 3FJ7A 1CE2A 2O68A 4OQOA 1B4HA 4NTLA 4XKNA 4KD5A 3S2VA 2ONKE 3TQLA 1LAFE 4YKKA 1MM7A 1SD3A 1FQEA 1QJMA 3EHSA 4FAJA 3N26A 3L6GA 4ONYA 3MZ1A 4KCCA 1N7WA 4JB7A 5M2VA 4MBPA 3H3GA 3K00A 1AH5A 2H25A 2PBWA 4ESXA 3T66A 1NL5A 2NOOA 1O63A 1MG1A 2O1LA 1MQGA 4YU0A 5IKBA 2XXIA 2QSXA 1SVXB 1GTKA 2DXRA 4Z7EA 4N13A 1QW0A 4O3AA 2ONRA 4QFOA 2QPQA 3HHFA 1MXVA 4BDLA 1MS7A 1B7ZA 5DVIA 3OEMA 4EF1A 2B65A 4GQOA 1SW4A 3N6TA 3WAEA 3FASA 2XX7A 4H67A 5DVJA 3ONMA 2ZNSA 5I57A 3KEIA 2R6GE 3C31A 5HPQA 2ALUA 4G77A 1QVSA 2ABHA 1PB8A 2H9BA 2VGQA 5CBRA 4ZE8A 1EH3A 3TCHA 2RC7A 4ND9A 1UTBB 3KG2A 2O69A 4HS7A 4ZECA 3R26A 2I4BA 5H8HA 3TTRA 2HCAA 2QJEA 1A7LA 3FJMA 2RINA 3N6UA 4NF5A 4LZ5A 4NF6B 1Y3NA 1OQGA 1LLSA 3MBPA 3O66A 4RPOA 1RYOA 2F6GA 4THIA 3TMGA 3IX1A 3VVFA 1IITA 3CI8A 2GHBA 3CR9A 4DZ1A 1URSA 1JEVA 4H8JA 1JNFA 4DXCA 1LB9A 1M5CA 2X26A 3H6TA 5L9MA 3RNNA 4NEDA 2F7BA 1HSEA 4R6KA 4G2ZA 5EYFA 3T9HB 3IOUA 4F3SA 3MPKA 4GF8A 3IJOB 3IK6B 2QS3A 3HHGA 2Y7IA 4Q8RA 1ATGA 1HSJA 3OXNA 3HSTA 3M3FA 3SEXA 3JYRA 5JK4A 4RK9A 1AL3A 5I58B 5H8NB 1BLFA 3KJTA 1Y4TA 5ELVA 1XVXA 3O6HA 3V8XB 1EZOA 2V3UA 5I59A 1LAHE 2GFEA 4OYVA 3C9HA 3DP6A 4ZEBA 1IEJA 3LC8A 5L9SA 1B3EA 3KSXA 4I8CA 1QULA 3BBRA 5AA2A 5A5XA 3VVDA 1MQHA 4QSDA 4C0RA 3CSGA 4NWDA 3HN0A 2Z8DA 4FE8A 2Y84A 1OIBA 3M3KA 3W9WA 3PUWE 3S9MC 3OELA 3C34A 1GV8A 4QFNA 1LAXA 3U8QA 1ZKBA 5DT6A 4OMBA 3RT6B 1TT1A 3FIRA 2H98A 3UIFA 5F7VA 1NNPA 2QS4A 2XXPA 1H45A 3UK4A 2P2AA 4OFJA 1SI0A 4OESA 4N07A 4ELOA 4NE4A 1FQDA 2F6PA 4OETA 4HTGA 5ICTA 1RYXA 3VDFA 2ZNTA 4F29A 1POTA 5L9OA 1GR2A 1IXGA 3EQ1A 4PP0A 3C33A 3SKPA 1P1WA 1LFIA 3VXBA 3E3KA 3DLNA 2XXQA 3K6XA 3QUJA 5LOMA 3EHUA 2UVJA 3MZBA 4JWYA 2H99A 1MH3A 3PD9A 3OEKA 5KDTA 1IIWA 2NUVA 4Q0CA 5H8QA 4ZS9A 3K1PA 2REGA 4OXVA 4XKRA 3UP9A 4OHNA 4BDOA 3Q28A 3BFUA 4IO7A 5HM4B 3IO4A 3N5LA 4U1ZA 3IORA 2Y7RA 2VOZA 2ONSA 2QMWA 1QKAA 3OSQA 3V89B 5CMCA 1SW5A 5ISUA 5B7DA 1BKAA 1LGBC 4N6PA 4QSEA 4PFUA 3S4UA 1S9TA 4IO5A 2Q9TA 1WODA 3SERA 2QMXA 4F2QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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