5I57B

Glutamate- and glycine-bound glun1/glun2a agonist binding domains
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
278
structure length
277
Chain Sequence
NHLSIVTLEEAPFVIVEDIDPTETCVRNTVPCRKFVKINNSTNEGMNVKKCCKGFCIDILKKLSRTVKFTYDLYLVTNGKHGKKVNNVWNGMIGEVVYQRAVMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFVETGISVMVSRGTQVTGLSDKKFQRPHDYSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYPYMHQYMTRFNQRGVEDALVSLKTGKLDAFIYDAAVLNYKAGRDEGCKLVTIGSGYIFATTGYGIALQKGSPWKRQIDLALLQFVGDGEMEELETLWLTGIC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1,Glutamate receptor ion
publication title Structural Basis for Negative Allosteric Modulation of GluN2A-Containing NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein, receptor
total genus 79
structure length 277
sequence length 278
ec nomenclature
pdb deposition date 2016-02-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i57B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5i57B02
4FAJA 3SERA 1UIVA 1GGGA 2H4IA 2KLFA 3SESA 3FVGA 1PBQA 3O9PA 3M8UA 4OEUA 1MY1A 4XIGQ 4R72A 3IL1B 4ZS9A 3KSJA 3FJMA 5CC2A 4M4GA 3QSLA 3IB0A 2LAOA 4NWCA 2V3QA 3FZVA 3TAJA 2XXIA 3QXMA 4MF3A 1P99A 1JEVA 3U94A 4OENA 3M3KA 2THIA 4OQOA 4I9DA 3WAEA 3TTRA 3S9LC 2Q2CA 1D9VA 1USYE 2E1SA 4YB5A 1N7WA 4HCYA 1AMFA 2UYEA 1MY4A 3ZKKA 2UVJA 3TDJA 3UORA 3KN3A 4YKIA 3C32A 1VR5A 1QKBA 4C1TA 4EUOA 3TCGA 3OO9A 2XXQA 3FIRA 1H43A 2Z22A 1Y9UA 4G68B 3RNNA 1LCTA 3MPKA 5B7DA 2WKYA 1NH8A 4XKRA 2RCAA 3CFLA 3TELA 2NXOA 1HSJA 1P1UA 3HN0A 3PMWA 2E0SA 3USDA 4ECFA 1F9BA 4U21A 5AA4B 4YKPA 2PT1A 4LZ8A 1R1NA 3E3KA 1O7TA 1MRPA 4H65A 3PV0E 2UVIA 3C4MA 3U1OA 3BFUA 2ZNTA 4QFNA 2QPQA 3MQ9A 2G93A 1MS7A 4RK9A 2H99A 1B5IA 1LLSA 3CVGA 1LAHE 2REGA 2OCUA 1FTKA 4OEVA 1M5EA 1B7HA 4ISUA 2XXVA 4ELRA 3G3GA 3D4CA 4QSEA 1NMUA 4DE8A 1JW4A 3JYRA 2D3IA 3PD9A 5CBSA 3GBAA 4ESWA 4P0IA 3OELA 1B52A 2QS2A 1OIBA 3EHTA 2F36A 4IO6A 3FXUA 1B05A 3IOVA 2Y7RA 1FQFA 1DMBA 1P1NA 2HEUA 4LQ5A 3KEIA 1B3FA 1JW5A 1O64A 2ZMBA 2DWHA 4LATA 2ONRA 3LBSA 4IO3A 4GRKA 1YAEA 4O3AA 3AXFA 3E9XA 4LZ5A 3IAZA 5ICQA 1I69A 4TLMB 4LONB 3KOSA 1VFEA 3SDFA 1A8FA 2DE4A 5B70A 1M5FA 1OMPA 1OQGA 1I6AA 4GIZA 4RA1A 3DP4A 3O97A 2F34A 3L6GA 4OMBA 1Y20A 3G3IA 1IXGA 2OWTA 4BLAA 1QKAA 2AIXA 4U4SA 2AL4A 3KOTA 4JWXA 1ZIUA 4MFIA 4Q5TA 3SEXA 1S7YA 1ZJLA 5JK4A 1FTJA 1MY3A 4WEPA 1FQCA 1UTBB 1B3EA 3N26A 1ZTYA 3EQ1A 5I56A 4NF4A 5I2KA 3MBPA 3I5OA 1GVCA 1B40A 3EPEA 1B2HA 4R9GA 3DM0A 4KFQA 4ONYA 5DYHA 1QULA 4XKQA 4GXSB 3TQWA 1DSNA 2I0CA 1TFDA 3H4ZA 1FQEA 1EH3A 3PPNA 1AH5A 3SEUA 2DE2A 3MP1A 3FJ7A 2I48A 5CBRA 1B4ZA 5AE4A 5I84A 1B1HA 1LAFE 2A5SA 2W7YA 2I6EA 3RT8A 3TCFA 1MM7A 3U92A 4R6KA 3HCQA 3B6WA 3I3VA 1GTKA 4JDFA 2VHAA 5FHMA 3T9UA 4F19A 3V8XB 3GZGA 4H6DA 3OOAA 3T9VA 3K02A 2V84A 3W15C 1OLCA 3RQTA 2Q88A 4FEBA 5JTYA 2OLBA 3HSTA 4JB7A 4U1ZA 5I2NA 1B9JA 4MLQA 2XX8A 2H9BA 1I6QA 4RY1A 4YICA 4XTCQ 3FVNA 3VFJA 1VFDA 3A09A 2R71A 3IORA 4F2QA 4XXUA 5AA1A 1I6BA 1B3HA 3A3UA 1EZ9A 3O2AA 3MP8A 1OVTA 3TTLA 1A8EA 4L17A 4WEDA 4LZ7A 5KZTA 3CSBA 3TTMA 2O69A 3FVOA 2DVCA 4F1YA 4NWDA 4QFPA 1Q35A 4G8NA 4U23A 1JW1A 3K4UA 3CFZA 3ZKLA 2QMWA 4ESXA 2ESNA 3V5AA 2F35A 4NTLA 3ZSFA 3RPWA 3EN3A 2O68A 5ELVA 1FCKA 3PMXA 3K6XA 5CI5A 3LSLA 4ZDMA 1IXHA 3K00A 4WKMA 4DZ1A 4F3SA 4GL0A 4RNSA 2FNCA 3H6WA 2Q8JA 2I4CA 3RGYA 4IB2A 3IX1A 3N6TA 4EQ7A 3H7MA 3HO7A 1PB7A 4POWA 1N7XA 3MP6A 2A5TA 2O1LA 5CMCA 5I56B 4C0RA 1SW1A 4NF4B 5I2KB 1XHYA 4F1VA 3Q26A 5AA3A 1NNKA 4OYVA 2DE3A 3QAXA 3OSQA 3N94A 4RYAA 1LB8A 1URDA 1B51A 3K6VA 4DCYA 3T22A 3C31A 2VD2A 3S9MC 2UVHA 3VVFA 1SW2A 3QK6A 3TPAA 1LBBA 5EYFA 2HZLA 3PGFA 3V83A 5ISUA 1R6ZA 1MPCA 3T96B 4JBZA 4EQBA 5TU0A 1NNTA 2DWAA 1P1OA 3KGCA 3MVYA 2XXTA 1IXCA 1DPPA 3A3CA 1ATGA 3H6TA 3T66A 4KCCA 3TKDA 2NWJA 4X1DA 1SI0A 2M8CA 1NH7A 4KYDA 3O6GA 2ZNSA 4FE8A 1UTBA 3P7IA 2Y84A 2O84X 3MUQA 2F6GA 2Z23A 3TYHA 5KDTB 1D3KA 2H98A 2CZLA 2F5XA 4PFUA 1II5A 1MPDA 1MQGA 4PE5B 1A99A 2RKMA 3KN8A 1BP5A 2P2AA 3EF7A 1O63A 4E0WA 2DOJA 5JTYB 1AL3A 4OFOA 2NVUB 5DVJA 5I2NB 2F6PA 4JWOA 5ITOA 3E4RA 3BFTA 4TQUQ 3U93A 4ND9A 3MJNA 2QS3A 2ANJA 5H8FA 4THIA 3MZBA 1UTHB 3K1NA 2PVUA 3KG2A 4ZZAA 3S2VA 3DLNA 1J1NA 2I49A 2BJJX 2HZKA 5M2VA 1POTA 2REJA 3MPLA 3OMBA 1B6HA 3PPPA 4UA8A 3UIFA 4BDRA 4BDQA 3LC8A 3MVXA 3OEKA 3QYTA 5L9SA 3H6UA 1B0HA 2NUVA 3UN6A 4KQPA 1Y3QA 4F3PA 3RLFE 4F3BA 3I6VA 3TQLA 1D4NA 4G2ZA 3SEWA 4F29A 2X7QA 5DTBA 3UA8A 1RYXA 3K6UA 2ABHA 3C34A 1JEUA 2PBWA 5DEXA 5TPAA 1LAGE 2DS9A 2V3TA 3K0VA 4R9FA 4AB5A 4OHNA 3MC2A 4HTGA 4ZEFA 4ZEIA 3O6HA 1UIUA 4H67A 3TZAA 5H8QA 4C1UA 1XVYA 2A5TB 3IB2A 5H8SA 4GFRA 4FJPA 3GLBA 2HXWA 4G77A 4BDNA 1B58A 2ZYMA 5EHSA 4I1DA 3RTWB 3RT6B 1B7UA 2XXHA 4TOZA 1A54A 3VXCA 3UGWA 4AB6A 4U1OA 3M3LA 2OJTA 3U72A 2I3WA 1LB9A 4G8HA 1IXIA 3PMVA 1PB8A 2Z8DA 1SBPA 5H8HA 3B7DA 4R2FA 1IUDA 4FORA 2I0BA 5I58A 4UACA 4X9TA 5DVFA 2HAUA 4XKNA 1QVSA 5CMMA 4DXBA 2H5YA 2D21A 1WDNA 4QSCA 4G4PA 4KPTA 4F22A 3C33A 4QHQA 4G8MA 4HS7A 5CMBA 1Y3PA 5F7VA 1TWYA 2R6GE 4MH5A 3TEPA 4G68C 5TP9A 2QL3A 4KI0E 4KR5A 4U4XA 4PP0A 1PBPA 1N3WA 3Q27A 3Q25A 1MXZA 1RYOA 2IA4A 3LR1A 3VLVA 4IY6A 4YZZA 4FATA 1H44A 3IK6B 1ZLQA 1B46A 4OERA 3RY3A 5H8FB 3B6QA 1S9TA 1BKAA 4OVJA 1B7ZA 3TUSA 3K01A 3KSXA 1LCFA 5H8NA 3ONMA 5I59A 1B32A 1LAXA 2ZYNA 2ZXTA 4NF8B 3UK4A 3S9EA 3CR9A 2YLNA 4O3CA 3FXQA 1LGBC 2UVGA 4IO7A 4QSDA 3OO6A 1MXVA 1Z7ME 1MM6A 4QRZA 2Z8EA 3N5LA 1MQDA 1DTGA 4XKPA 5J1DA 4IGRA 3OENA 1EU8A 2Q9TA 2FA7A 2XXUA 2DQVA 2RC8A 1S50A 5KDTA 3L6HA 2HCAA 2VGQA 5DEXB 5TPAB 3HPIA 4GVOA 4YKJA 4R2BA 4Q8RA 1IQ7A 1QUJA 3VLWA 1EZOA 5L9OA 4FECA 1CB6A 1NNPA 3IJOB 5EHMA 1Y3NA 5FTHA 2PYYA 1R9QA 5H8QB 2RC7A 1MXWA 1RKMA 3ILUB 2DXRA 2I58A 2V25A 1AIVA 1UTHA 3T93B 4Z7EA 5A5XA 1QUIA 3VVDA 2XD2A 3H3GA 2V93A 1FQDA 3RUMA 4EF1A 4EF2A 4LQ2A 4ZEBA 3OO8A 2Q89A 2XXWA 1XOCA 1B5HA 2XXPA 3HV1A 4U22A 4OETA 3VE1B 5HM4B 2UXAA 2HAVA 4YAHX 5H8HB 1Y1MA 2NOOA 2OWSA 2XD3A 5I58B 4LA9A 4GOTA 4NEDA 1IZ1A 5AA2B 3LSFB 3S9NC 1SQYA 1FQAA 3OO7A 4E0XA 1IEJA 4NE4A 3FJGA 1SDXA 3DELB 4FIMA 4F2OA 2DWJA 2O6AA 1P1QA 5K2YA 3T9XB 2XX7A 1N84A 1A40A 4MLVA 1DPEA 3PUWE 4O3BA 1FTOA 1M5BA 1MG1A 3IR1A 3ILTB 4EQ9A 4NMYA 5TP9B 2DWIA 3KZGA 2YPNA 3FATA 3LSWA 4ZECA 3IOTA 4NF5A 4MBPA 2VD3A 4DXUA 2B65A 5JEIA 2DXYA 2Y7KA 4GL8A 4Z0IA 1US5A 1FQBA 3C9HA 2O7UA 1NFTA 4LP2B 3G3JA 4ZZEA 1P1WA 1SYIA 3V89B 2O1MA 1QJMA 2XXYA 1N0TA 2F7CA 4F1UA 4JWYA 4F39A 1A7LA 2I3VA 1ZU0A 4BDMA 3H03A 1B5JA 5HBCA 1Q1KA 1A55A 2GH9A 3O6IA 3KBRA 4R75A 2ZYKA 4JSOA 5H8NB 4ELOA 1QW0A 3PU5A 2F7BA 4X1BA 5HPQA 5I59B 5ITPA 1POY1 3TFLA 3TTKA 1ELJA 3FVKA 2PX1A 4OFJA 4N6PA 2RINA 5DT6A 2R9JA 2AYSA 2FYIA 4FEDA 4DIGA 2I4BA 1XVXA 2QSXA 4OFLA 3KFMA 1XC1A 4H5FA 3M3FA 4EXLA 3O66A 1UQWA 1WVJA 1ZMGA 1ANFA 5AA2D 3H06B 3G3KA 2OK2A 4NF6B 4PFTA 3PUXE 4IO5A 1NNFA 2Y7PA 3R26A 1D9YA 3OEMA 4LUBA 3QIMA 1PDAA 3TMGA 2CMOA 2V3UA 4QFLA 3DP8A 4DLDA 4GXAA 2P0SA 3FD3A 3PUZE 3MW0A 4H8JA 3ZS6A 3SEVA 1URSA 4OTEA 4F31B 3C36A 3B6TA 5A5XB 1BLFA 3K1MA 3K6WA 1MDP1 4NF8A 3K1PA 1OLAA 4PFYA 2F78A 3PPQA 2F7AA 3G7WA 3MVWA 4H0WA 2Q2AA 4F18A 1R9LA 1DTZA 3IB1A 2X26A 5ICTA 2Z8FA 3FUZA 1N04A 4TLLB 3LSXA 4HCWA 3EHSA 1MXXA 2ONSA 1WODA 1MH4A 4KHZE 1NKXA 3BKIB 4N13A 3SETA 3HHGA 1VSOA 3IO4A 2RC9A 3R6UA 1CE2A 2AL5A 3KN7A 3OD7A 4OXVA 1TXFA 4H1XA 3VVEA 1MQJA 4ZE9A 2DYXA 1GV8A 3W9VA 4OWDA 1SVXB 4AQ4A 5DVIA 1FTMA 1H3DA 2YJPA 3CG1A 5FHNA 1OQHA 1N3XA 2F97A 5BUUA 1LFIA 1MXYA 1Y4CA 4K3FA 1JQFA 2Y7WA 4R6YA 1NL5A 4HW8A 4NF5B 5I57A 3G3FA 3R7XA 1TFAA 2OBGA 2QRYA 4YU0A 3IOWA 4POXA 1TT1A 5LOMA 3FV1A 1YCJA 3GXAA 1Y4TA 5L9MA 4RPOA 3TODA 4IGTA 3SEYA 2O51A 4EDPA 1JVYA 4ELQA 4OESA 2P1SA 3F11A 1BIYA 1HSEA 3VV5A 1XS5A 1URGA 4R73A 5AA2A 4YKKA 2GFEA 4GF8A 1DOTA 3QUFA 5IKBA 2OZZA 2H25A 1B4HA 2X7PA 2D5WA 2VP1A 3JZJA 3PPOA 3IJXB 4BDOA 1M5CA 1JNFA 4IY5A 1MXUA 3CFXA 4YMAA 4H5GA 3W9WA 4PQJA 5KCJA 3CG3A 4R74A 3FV2A 4DCXA 3RTFB 2F8DA 3OXNA 4I62A 3E13X 3FXRA 4LVQA 1IIWA 3JV9A 1B3GA 4QF9A 4R6HA 3CIJA 1Z7NE 2DVZA 1ZBMA 1XT8A 3O28A 4ZEKA 3VDFA 2ONKE 2XHDA 4I8CA 4GLIA 2HFBA 1LBCA 3G3HA 3BBRA 1Y1ZA 2ALUA 2PMSA 5FTIA 3KJTA 1N76A 1YPNA 4OZ9A 1H76A 3VXBA 1LFHA 4F3GA 2B3BA 5CMKA 4IO4A 3K2DA 1LSTA 3U8QA 1SYHA 3EHUA 3ODBA 4X48A 1B3LA 3FASA 4WXJA 4KYEA 1FTLA 3WAFA 1KWHA 3N6UA 4ELPA 5FHOA 1SD3A 2DP8A 1FW0A 1MQHA 3THIA 1MDQA 2G29A 3Q28A 2ZNUA 3S4UA 1GR2A 5K2XA 4BDLA 4M1VA 4GWOA 4YMBA 4GQOA 1US4A 4PETA 4KD5A 1OVBA 3PPRA 3UP9A 4NF6A 2ZYOA 1USYH 4YB6A 1LFGA 3T9HB 3DP6A 3MWBA 2O7IA 3CI8A 3IO6A 1M5DA 4G68A 2RCBA 3SKPA 3TTNA 3ECRA 4KYSA 3O29A 4EXKA 3VLUA 5CM6A 3H6VA 4RJZA 4P11A 1PEBA 1QUKA 1H45A 3CRBA 4JXIA 3PUVE 3IOUA 3HHFA 1MQIA 4IO2A 4RPNA 1B0LA 3D4GA 5IAIA 4RK2A 3MAMA 5I57B 1VE4A 3MZ9A 1MY2A 5AA4A 2GHAA 2XXXA 5BWJA 2VOZA 2QJEA 3PD8A 3Q29A 2GRVA 3PUYE 1SW5A 3KJ7A 1MY0A 4DDDA 3MVZA 4U2RA 2RF1A 2UYFA 2IEEA 1JVXA 4P0GA 4GD5A 3OSRA 2DSFA 3FGSA 4KCDA 3QUJA 4H8IA 2QS1A 1HSLA 2B3FA 1L5TA 1PC3A 2XX9A 1MPBA 1JETA 2PT2A 1EZPA 4Q30B 5F1QA 2QS4A 1SI1A 4QFOA 1AOVA 2HQ0A 1T0KA 4DXCA 4N07A 4JSDA 1YTVA 1MH3A 4QFKA 1ZKBA 3RN8A 1BTJA 2GHBA 4ZEDA 4Q0CA 4RXLA 1PB9A 3C35A 5KCJB 3LUYA 3GBBA 1B1XA 3TCHA 2XXRA 3MZ1A 4YB7A 4ZE8A 4PFWA 1IITA 2QMXA 1SW4A 3CSGA 2Y7IA 5CRYA 5L8DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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