1YZ0A

R-state amp complex reveals initial steps of the quaternary transition of fructose-1,6-bisphosphatase
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
NIVTLTRFVMEEGRKARGTGEMTQLLNSLCTAVKAISTAVRKAGILHLYGIAGSTNVTGDQVKKLDVLSNDLVINVLKSSFATCVLVSEEDKNAIIVEPEKRGKYVVCFDPLDGSSNIDCLVSIGTIFGIYRKNSTDEPSEKDALQPGRNLVAAGYALYGSATMLVLAMVNGVNCFMLDPAIGEFILVDRDVKIKKKGSIYSINEGYAKEFDPAITEYIQRKKFPPDNSAPYGARYVGSMVADVHRTLVYGGIFMYPANKKSPKGKLRLLYECNPMAYVMEKAGGLATTGKEAVLDIVPTDIHQRAPIILGSPEDVTELLEIYQKHAAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title R-state AMP complex reveals initial steps of the quaternary transition of fructose-1,6-bisphosphatase.
pubmed doi rcsb
source organism Sus scrofa
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Fructose-1,6-bisphosphatase
total genus 101
structure length 329
sequence length 329
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.3.11: Fructose-bisphosphatase.
pdb deposition date 2005-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00316 FBPase Fructose-1-6-bisphosphatase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.540.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Fructose-1,6-Bisphosphatase; Chain A, domain 1 Fructose-1,6-Bisphosphatase, subunit A, domain 1 1yz0A01
3.40.190.80 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 1yz0A02
1EYJA 5EQ9A 2Q8MA 1NV6A 1FPDA 1NV1A 4GWYA 2P3VA 4GBWA 1FBCA 2FHYA 2CZHA 1NUYA 4GWZA 4GX6A 4HE2A 4I3EA 1FPKA 4GWUA 5T3JA 2QFLA 3ROJA 1IMCA 1FBPA 5A5LA 3RPLA 5EQAA 1FPLA 1FRPA 1NV4A 5DW8A 1IMFA 2CZKA 2OX3A 2VT5A 1FBGA 1DK4A 1FPIA 1RDXA 1NI9A 1NV2A 1FPFA 2FIEA 1DBZA 1EYKA 1YXIA 1FTAA 5IZ3A 4HXVA 2FBPA 1NUWA 4GX4A 5ESYA 1DCUA 1Q9DA 1FBHA 5ET5A 5FBPA 2QVRA 2HHMA 1IMAA 2Y5LA 4PTKA 4IR8A 1NV0A 1NUZA 2DDKA 1BK4A 1NV5A 2Y5KA 1CNQA 1LBXA 1FBEA 4GWSA 5EQ7A 4AS4A 3B8BA 3KBZA 4GWXA 5ET6A 2F3DA 1LEVA 1RDYA 1FPJA 2QVUA 5EQ8A 5LDZA 1IMBA 3LUZA 1D9QA 5ET7A 5IZ3B 1FPBA 1NUXA 2WBDA 5EYGA 2GQ1A 3IFAA 4MJOA 4I3YA 1FBFA 1LBVA 1LBYA 3IFCA 5I3SA 2Q74A 2F3BA 1IMDA 1LBZA 3RYDA 4GWWA 5J16A 5ET8A 2WBBA 1KA0A 2WEFA 1JP4A 3BIGA 1YYZA 1AWBA 1NV3A 4G61A 2JJKA 1KZ8A 4GBVA 2PCRA 4H45A 3D1RA 1G0IA 1NV7A 1FJ6A 1FBDA 1SPIA 2P3NA 1QGXA 4HE0A 5F24A 1K9ZA 1YZ0A 4I40A 2FVZA 3RPLB 1KA1A 4GX3A 1LBWA 4AS5A 5IZ1A 3T0JA 1INPA 3KC0A 3QMFA 1IMEA 4QXDA 2OWZA 3A29A 5EYHA 1RDZA 2FIXA 1K9YA 1FJ9A 1VDWA 3LV0A 1EYIA 3KC1A 4O7IA 2QVVA 4KXPA 1FPEA 4FBPA 4HE1A 4H46A 1FPGA 2R8TA 1XI6A 2BJIA 2CZIA 4N81A 3BIHA 1FSAA 3FBPA 1G0HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3EF7A 4EXLA 3MP8A 4GBWA 3TUSA 4PAKA 4F2OA 5A5LA 4JWXA 1FPLA 5TP9B 1Q35A 1IMFA 5K2XA 2PT1A 4OFLA 2OJTA 3H06B 4DZ1A 2HAUA 3TFLA 2O1MA 1DCUA 3OO7A 3PMWA 4L17A 1B9JA 4QF9A 1O7TA 2P2AA 4OFOA 3O28A 2WX9A 2R9JA 1AIVA 4WKMA 3MC2A 1N7WA 3RTWB 3SDFA 1Y4CA 2PFYA 1IMBA 3E3KA 5ET7A 4BDOA 3KN8A 3TTNA 2WBDA 1B2HA 4JVIA 3EN3A 3PPQA 4I3YA 4NMYA 2XWVA 1VSOA 4F3GA 2XWKA 4DCXA 4OEVA 3FJMA 4LATA 4IY5A 1MXZA 3AXFA 4N15A 1B52A 4PETA 1B4HA 1MY0A 3TTMA 1PC3A 1QGXA 3KFMA 2YJPA 4G8HA 3N5LA 2V3TA 3PPNA 4NWCA 3FJ7A 4IB2A 4WXJA 5KCJB 5CM6A 4NF5A 4Q5TA 5ITOA 1B05A 3ILUB 3IK6B 4BDLA 5CI5A 3S9EA 3FBPA 1IXIA 2DYXA 1TXFA 3BFUA 4PBHA 2O51A 2XXTA 1SVXB 2FA7A 3GBAA 2O68A 3VLVA 4AQ4A 4LQ2A 1YXIA 2UXAA 3E13X 2G93A 2GHAA 3LUYA 1JNFA 5KZTA 2FBPA 5DVJA 1B3HA 5ESYA 3QAXA 4BDRA 5I56A 1YPNA 4H6DA 1Y3PA 4RJZA 4PF8A 2KR0A 1NV5A 3FZVA 3N26A 4MX6A 1NKXA 1NNFA 4LZ7A 3E79A 4QRZA 1JEUA 1SQYA 1FPJA 3PD9A 4F22A 3KG2A 1NUXA 2XXHA 1Y1ZA 3QSLA 1A7LA 3OO6A 2QPQA 5I58A 5IKBA 2DQVA 1LFGA 2WBBA 5FTHA 3BIGA 2DE2A 3OXNA 1YYZA 1AWBA 1FQBA 1DMBA 4ZDMA 4U4SA 4G61A 3FVNA 1FTOA 3R6UA 2PCRA 4JSDA 1MQJA 4AB5A 2FVZA 3DELB 1SW1A 4NN3A 3T0JA 4FORA 1USYH 2OWZA 2RC9A 4Q0CA 5A5XB 1B5IA 3NOHA 3B6WA 4G2ZA 1WDNA 2Q8JA 4H46A 1URSA 3K2DA 3VV5A 3S9NC 2I6EA 4DIGA 5IAIA 2HFBA 2Z8EA 4I62A 1FBCA 1GTKA 4ISUA 4GF8A 3M3FA 2F8DA 1GVCA 3MZBA 5FTIA 3C32A 1O64A 3KBRA 3N6UA 3MZ9A 4KD5A 1XHYA 4PE5B 3ONMA 3IX1A 4P0GA 1BP5A 2AL5A 4MIJA 3RGYA 1FQAA 4AS4A 2I48A 3DP4A 4O94A 5L8DA 5LDZA 1N84A 2P1SA 3A3UA 1B46A 1FQDA 3HN0A 3PPOA 3FGSA 1LAFE 4ECFA 3ZSFA 3F11A 2LAOA 4NTLA 3U92A 3SKPA 4F19A 5AA2D 3CHGA 3EHUA 3ZS6A 2O84X 4ZEKA 4PFBA 4OESA 1LBZA 3B6QA 5ELVA 3PGFA 2OWSA 1JW5A 2XD3A 3A09A 2HEUA 1MY2A 4NF6A 4NGUA 3KC0A 1PB9A 4NAPA 3A29A 5J1DA 3D4CA 3UGWA 1B3LA 3DP6A 3M3KA 4XXUA 3A3CA 3TCFA 1FPDA 1T0KA 4I3EA 4GWZA 1MY4A 1FBPA 4PFWA 2F36A 3G3GA 4I8CA 4X1BA 2MKZA 4PE3A 3TCGA 2NXOA 4LONB 4GX4A 4RK9A 4NF8B 4LP2B 3BFTA 3BKIB 3UA8A 1P99A 4H8JA 4M4GA 4JSOA 3W15C 1B40A 3LC8A 3RLFE 3T9HB 5AA1A 4IO6A 1LFHA 4X8RA 3TQLA 2F34A 4BDQA 3OSRA 3VXBA 3SZPA 2RINA 3DP8A 2PYYA 2ZXTA 5I56B 1MS7A 5I3SA 3MQ9A 3PUXE 2THIA 4F2QA 5J16A 5ET8A 1VFDA 4EQ7A 1LCFA 2HXRA 1Y3NA 2NOOA 1QULA 1G0IA 2HZKA 4HE0A 1YZ0A 1MPCA 5I2NA 5FHOA 2DSFA 4DXUA 1JEVA 3HHFA 1IMEA 2XD2A 3MP6A 3FVKA 2B4MA 4QFNA 1MRPA 1NNTA 1K9YA 3W9VA 1GGGA 4P1EA 1FPEA 4O3AA 4ZECA 2HZLA 2BJIA 2F78A 2X7PA 3HO7A 4F31B 4YU0A 1EYJA 3E4RA 3I3VA 5H8NB 2I0CA 2QSXA 3ROJA 3KSXA 4I9DA 4PF6A 1LCTA 4G8NA 5DW8A 5I84A 5JTYA 2X26A 1FPFA 4N17A 4U22A 3H6VA 1BTJA 2RC7A 5LOMA 1MY1A 1FBHA 4GVOA 5L9OA 3KN7A 2DDKA 3ISPA 2GRVA 2UVJA 4C1UA 5IM2A 1QW0A 2V93A 3ZKKA 3GLBA 4JB7A 3G3FA 4PFRA 3RQTA 4GWXA 1I6QA 2ONKE 4Q8RA 4XEQA 1XVYA 1NNPA 3OEMA 1MXUA 3CSGA 4H65A 1Y1MA 3UK4A 4TLLB 2GQ1A 1CE2A 2ANJA 4P9KA 4KI0E 1P1NA 4FECA 1EZPA 3TZAA 1FBFA 4OVQA 3WAEA 2H25A 3OEKA 2AIXA 2ZYNA 2XXXA 3I6VA 3SESA 4ELQA 5DEXA 4PAFA 1UQWA 1FTMA 1PB7A 4X1DA 1PEBA 3MP1A 3TMGA 4LQ5A 3OELA 2DVCA 3D1RA 4QHQA 1SYHA 1QKBA 1MH3A 3IB2A 3PUWE 4H1XA 4AS5A 5IZ1A 1N3XA 4DI3D 2Q88A 4X9TA 3W9WA 4NF8A 3H6TA 2HCAA 4MHFA 3E78A 4C0RA 3KC1A 2QVVA 2DE4A 4PQJA 1IEJA 2PX1A 3IO4A 4ZEDA 1N7XA 4XKRA 1M5DA 4N91A 4H67A 3R7XA 2RCAA 2REJA 1NUYA 5T3JA 3IJXB 2QFLA 1IMCA 2V3QA 2QS2A 1B3GA 2XWOA 2PMSA 4EF2A 4IO4A 4FJPA 4ZZAA 4XIGQ 4OETA 2OZZA 5AA2B 4UA8A 2H9BA 3QYTA 4KCCA 1US4A 5ET5A 1OLAA 1M5EA 2XXWA 1Y20A 4OA4A 4BDMA 4MAGA 4RXLA 4U1OA 3RT6B 5ET6A 2F3DA 3G7WA 1AMFA 1JVXA 4N07A 5TP9A 3HFUA 2KLFA 3LUZA 4YAHX 5IZ3B 2V4CA 5I2NB 5I57A 3CVGA 2OWTA 3CRBA 3IOVA 3U93A 3MAMA 2ZMBA 3CFZA 3G3JA 3VVDA 3LSXA 2IA4A 1ZIUA 1JP4A 2DWAA 4JBZA 4EQBA 3EHSA 4MNCA 3IO6A 5H8NA 2VP1A 4QFPA 3FV2A 1KA1A 3SETA 4RNSA 3GXAA 1XVXA 4QFOA 2Q9TA 2ABHA 3FATA 4XFEA 3TEPA 2DOJA 5H8SA 4GWUA 3SERA 1POTA 3S9MC 3O9PA 4OVSA 2OX3A 2F7AA 3FJGA 1DBZA 4YKKA 5KCJA 3DM0A 4I1DA 4MCOA 3S9LC 2R6GE 5HBCA 3H4ZA 2QVRA 3PTYA 3B6TA 4F1UA 4MLQA 4OFJA 1D3KA 2UYEA 3MVZA 3DLNA 3WAFA 4ZZEA 5EQ7A 3PD8A 3V8XB 3CG3A 3KBZA 1FQEA 1SDXA 3QIMA 4N6KA 2QVUA 3UP9A 3KSJA 2QS4A 3IB1A 2VGQA 5M2VA 4NF4B 4MJOA 2P0SA 3O6IA 1QUKA 2F3BA 1IMDA 2XXVA 3MWBA 1LLSA 2XXKA 1SD3A 2CMOA 3CSBA 1FQCA 1PBQA 1S50A 4FEDA 2OK2A 3RPLB 1EZ9A 2H4IA 4X48A 1IXCA 4R9FA 4JXIA 3VFJA 2DXYA 3K4UA 3C35A 5LTCA 2FYIA 1NFTA 1VDWA 1EYIA 4KXPA 5I58B 5DEXB 3ECRA 1VR5A 1FSAA 1II5A 3HSTA 3HPIA 4C1TA 5H8FA 4GX6A 1SBPA 1YAEA 4N6DA 4IGRA 1IQ7A 1Z7NE 4FAJA 1HSJA 4JVDA 1POY1 1FBGA 5TU0A 1B7HA 4G4PA 3CR9A 5IZ3A 1NI9A 4O8MA 2I4BA 3CI8A 1AH5A 4P47A 1MPBA 3FXRA 4P56A 1P1QA 1NH8A 1ZU0A 3OD7A 1Y4TA 1ZBMA 1PB8A 3VXCA 3KJTA 3QUFA 2DWJA 1JW1A 4UACA 2F7BA 1FTJA 2UVIA 4R2FA 3EHTA 3TAJA 1FQFA 1ATGA 1EZOA 1SW4A 5AA2A 4PC9A 4OENA 3FXQA 4TQUQ 4OVJA 3U1OA 4G8MA 1TWYA 3RNNA 3TTKA 5CBSA 1Q1KA 3O66A 2VPNA 4GLIA 4KYEA 4GWWA 4PP0A 2I49A 1NV3A 1B6HA 1MY3A 2ZYKA 3KZGA 5F24A 4DDDA 2V25A 2CEYA 4NF0A 3O6GA 3OMBA 3FVGA 4GX3A 4YMAA 4YMBA 3T9VA 2L5VA 5IGAA 5JEIA 5I5PA 4XKNA 5AE4A 2QMWA 3B7DA 4XTCQ 1MPDA 2B3BA 3SEYA 5L9SA 5CMKA 1G0HA 1MG1A 2Z8DA 4H8IA 2Q8MA 3VVEA 3C33A 3GZGA 1A8EA 4NX1A 3TELA 2RCBA 4XKPA 4IO2A 1MM6A 3M8UA 5CMBA 5HPQA 1Y3QA 2DE3A 4GIZA 4XKQA 1Y9UA 1Q9DA 2XWIA 5EHSA 1MQIA 4PTKA 4EUOA 2AYSA 3FXUA 3K6XA 1A55A 1MH4A 2QS3A 2F6PA 1RDYA 3RT8A 1AOVA 4IO5A 4ELOA 3FV1A 4ND9A 4OZ9A 4Z0IA 1IIWA 3IFAA 2BJJX 2O7IA 2Q74A 4DCYA 2A5TA 4QFLA 3RYDA 2CEXA 1TT1A 5I7IA 1R6ZA 1KA0A 4MEVA 4KHZE 3D4GA 5H8FB 4H0WA 4GBVA 4UABA 4F3BA 1SPIA 4OVPA 5ICQA 5H8QB 4NF4A 3CFLA 4DXCA 3JV9A 3FASA 1I6BA 1RDZA 1IXHA 2GHBA 3O29A 3LV0A 2XXIA 2Y7RA 1PBPA 2WYKA 2O7UA 5KDTA 2V3UA 2FNCA 2Y84A 4R2BA 3IB0A 2Y7KA 3H3GA 4OANA 5FHNA 4KYDA 1NV1A 1ELJA 1MQHA 1XOCA 2FHYA 2Z22A 2XX9A 3CIJA 1DSNA 3IL1B 2DXRA 2F7CA 4PGPA 2ONRA 4LZ8A 3RPLA 5EQAA 4HS7A 2I3WA 4U2RA 3LR1A 1BIYA 3OENA 4R73A 4YZZA 4GL0A 4DI4B 1RDXA 4GXSB 4R72A 2VD2A 2E1SA 3MSTA 1MXXA 4F1YA 3P7IA 1UIUA 4P1LA 4PDHA 3SEUA 1OVTA 1LAXA 2Y5LA 2ONSA 4GRKA 4IR8A 1LBBA 4F3PA 1I6AA 3T96B 3E9XA 1FBEA 5JK4A 1A8FA 1PDAA 1H44A 2D21A 5DYHA 2VPOA 2O69A 3TDJA 5EQ8A 3JZJA 3S2VA 5I2KB 1D9QA 5EYFA 1IXGA 4BDNA 4GOTA 1BKAA 5BUUA 4JWYA 3TTRA 2XXUA 3N94A 4ZEFA 3MPLA 1P1WA 4HTGA 2F6GA 1SI1A 1H3DA 4GWOA 2XA5A 2B65A 3HV1A 3EKIA 4OERA 3TYHA 3FUZA 1JETA 1D4NA 4LN5A 1FBDA 5DVFA 4MH5A 4N8YA 4QSDA 4GQOA 4QSEA 2UVHA 3Q26A 1FTLA 5H8HA 4QFKA 4OVTA 3RPWA 4DXBA 2Q2CA 2GH9A 2FIXA 4P3LA 3SEWA 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3IOWA 4NE4A 4F39A 1D9YA 2ZNSA 1VFEA 2ZZVA 1JQFA 4N8GA 1WODA 2UVGA 1B3FA 3H6UA 2P3NA 2XX7A 4MNPA 1A40A 5TPAA 3T9UA 3PMVA 1MXWA 1INPA 1DTGA 4EDPA 4PFIA 3EQ1A 1Z7ME 2XXYA 2A5SA 2E0SA 1DOTA 4R74A 1LAHE 2YLNA 3FD3A 1M5BA 3KN3A 1QUJA 1L5TA 4JVCA 1XI6A 3IAZA 1QJMA 2ZYOA 4O3BA 1LGBC 3MVXA 3OO9A 4RYAA 4N6PA 3IJOB 1NNKA 4MF3A 2X7QA 4U1ZA 4Q30B 4YB6A 4ELRA 1MXVA 3O6HA 3QK6A 2D3IA 3QUJA 1NV2A 1EYKA 2Z23A 2ZZWA 1B5HA 3V83A 4TOZA 3TODA 4E0WA 4ZE8A 2XX8A 1H43A 3R26A 5DVIA 4P8BA 2Q2AA 4DLDA 4F3SA 1LBXA 3SEXA 3H03A 3K0VA 4MNIA 1DTZA 1YCJA 1IUDA 1B1HA 2UYFA 2ZYMA 2ALUA 4PFUA 1J1NA 3FIRA 2WKYA 3KOSA 4U21A 4NWDA 4KQPA 1ZLQA 4QBAA 1D9VA 2VHAA 3VLWA 3Q25A 4ELPA 1MDP1 3PV0E 3H7MA 3TKDA 1XS5A 2IEEA 1UTHA 3KGCA 4U23A 1S9TA 4JDFA 3GBBA 5AA4A 2F97A 4MBPA 4QXDA 5EYHA 1HSEA 1OQHA 2VD3A 4RK2A 2AL4A 1GR2A 4G68B 1EH3A 3UIFA 4HE1A 3O97A 4IO3A 1M5FA 1OIBA 1HSLA 3EPEA 3GYYA 2P3VA 1B7ZA 1R1NA 4PFTA 5ISUA 1URGA 1B3EA 2RC8A 3MYUA 1B7UA 2Q89A 4ZEIA 2I3VA 1SW2A 1FRPA 2CZKA 3PUVE 1MM7A 2DP8A 4HXVA 4H5FA 1NUWA 3T93B 2PT2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3EF7 A;  4EXL A;  3MP8 A;  4GBW A;  3TUS A;  4PAK A;  4F2O A;  5A5L A;  4JWX A;  1FPL A;  5TP9 B;  1Q35 A;  1IMF A;  5K2X A;  2PT1 A;  4OFL A;  2OJT A;  3H06 B;  4DZ1 A;  2HAU A;  3TFL A;  2O1M A;  1DCU A;  3OO7 A;  3PMW A;  4L17 A;  1B9J A;  4QF9 A;  1O7T A;  2P2A A;  4OFO A;  3O28 A;  2WX9 A;  2R9J A;  1AIV A;  4WKM A;  3MC2 A;  1N7W A;  3RTW B;  3SDF A;  1Y4C A;  2PFY A;  1IMB A;  3E3K A;  5ET7 A;  4BDO A;  3KN8 A;  3TTN A;  2WBD A;  1B2H A;  4JVI A;  3EN3 A;  3PPQ A;  4I3Y A;  4NMY A;  2XWV A;  1VSO A;  4F3G A;  2XWK A;  4DCX A;  4OEV A;  3FJM A;  4LAT A;  4IY5 A;  1MXZ A;  3AXF A;  4N15 A;  1B52 A;  4PET A;  1B4H A;  1MY0 A;  3TTM A;  1PC3 A;  1QGX A;  3KFM A;  2YJP A;  4G8H A;  3N5L A;  2V3T A;  3PPN A;  4NWC A;  3FJ7 A;  4IB2 A;  4WXJ A;  5KCJ B;  5CM6 A;  4NF5 A;  4Q5T A;  5ITO A;  1B05 A;  3ILU B;  3IK6 B;  4BDL A;  5CI5 A;  3S9E A;  3FBP A;  1IXI A;  2DYX A;  1TXF A;  3BFU A;  4PBH A;  2O51 A;  2XXT A;  1SVX B;  2FA7 A;  3GBA A;  2O68 A;  3VLV A;  4AQ4 A;  4LQ2 A;  1YXI A;  2UXA A; 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