3K01A

Crystal structures of the gach receptor of streptomyces glaucescens gla.o in the unliganded form and in complex with acarbose and an acarbose homolog. comparison with acarbose-loaded maltose binding protein of salmonella typhimurium.
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
391
structure length
391
Chain Sequence
AMVELSGTVTFWDTSNEAEKATYQALAEGFEKEHPKVDVKYVNVPFGEANAKFKNAAGGNSGAPDVMRTEVAWVADFASIGYLAPLDGTPALDDGSDHLPQAAASTRYEGKTYAVPQVIDTLALFYNKELLTKAGVEVPGSVAELKTAAAEITEKTGATGLYLRGDDPYWFLPYLYGEGGDLVDEKNKTVTVDDEAGVRAYRVIKDLVDSKAAITDASDGWNNMQNAFKSGKVAMMVNGPWAIEDVKAGARFKDAGNLGVAPVPAGSAGQGSPQGGWNLSVYAGSKNLDASYAFVKYMSSAKVQQQTTEKLSLLPTRTSVYEVPSVADNEMVKFFKPAVDKAVERPWIAEGNALFEPIRLQMANVLSGETSPDEAAANTGDAYRKLLKDYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of the Solute Receptor GacH of Streptomyces glaucescens in Complex with Acarbose and an Acarbose Homolog: Comparison with the Acarbose-Loaded Maltose-Binding Protein of Salmonella typhimurium.
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces glaucescens
molecule tags Transport protein
molecule keywords Acarbose/maltose binding protein GacH
total genus 140
structure length 391
sequence length 391
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k01A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k01A02
1VE4A 1H76A 4O3CA 4OFOA 5AA2B 3O2AA 3CFZA 1DOTA 3C9HA 4FEBA 4GWOA 4BDNA 4F29A 1DPEA 1MH4A 3UP9A 3B6QA 4U23A 1B05A 2DXRA 2QJEA 4OERA 4DCYA 1II5A 1RYOA 1ZKBA 3MP6A 4GXSB 1A99A 3IK6B 4DCXA 3W9VA 3B6TA 3KN7A 2ONSA 1Y20A 1VFDA 3TCFA 1T0KA 4I1DA 1LLSA 4AB6A 4GOTA 1JW4A 2D21A 3VDFA 3S9MC 1ZBMA 3KSXA 3R26A 3U93A 3UA8A 4PETA 5I2KA 3N26A 3ILTB 5H8NA 3G3JA 3PPRA 1LGBC 4NF5B 1NL5A 2OWTA 3MZ9A 4GLIA 3LSWA 4OFLA 3BFTA 4LA9A 4G77A 1MPDA 2UVHA 1DTGA 3KGCA 5TPAB 1AMFA 4ZEBA 4EF1A 1IIWA 2Y7WA 3SDFA 4H65A 4LQ5A 1MM7A 4FORA 3TQWA 1UTBA 4N13A 3TTMA 2PX1A 4EQ7A 3H7MA 1HSJA 1H44A 2OK2A 3MUQA 5H8SA 4IGTA 1UTHB 2Y7PA 4NEDA 2XXXA 2PMSA 3FZVA 2H9BA 3PV0E 4F3GA 1FTOA 2VD2A 3KOTA 3TTKA 1UTHA 2ZNTA 2I3WA 1XC1A 2Q89A 3FJMA 3IO4A 4ISUA 1NMUA 5I58A 5KZTA 5JK4A 1B5JA 1MY4A 2I58A 5L8DA 5F7VA 3SEXA 4Q5TA 5CRYA 3TFLA 3TODA 1EU8A 3TEPA 1AH5A 2V93A 2Q8JA 2RC9A 3L6GA 4F31B 3QUJA 3G3GA 1GGGA 2I4BA 3T9XB 1QUKA 4JSDA 5AA3A 4RK2A 3CG3A 1YPNA 5TP9B 4C1TA 1Y3NA 1IEJA 3FJ7A 3MJNA 3PMXA 4KYEA 4OXVA 1N84A 4ZZEA 3PUXE 3FJGA 3EHTA 5DT6A 3M3LA 3TCHA 3O6GA 2Z8FA 4IY6A 4ECFA 2B65A 3KOSA 1PC3A 3O29A 3OO6A 5J1DA 3O66A 3MC2A 4JXIA 3LSXA 4ELOA 3PPPA 1Y4CA 1ZIUA 2F7BA 3I5OA 3KJ7A 4OEVA 4OETA 5I2NB 5CMCA 1LAHE 2GRVA 1N0TA 4GVOA 5H8FB 1URSA 1XHYA 2GH9A 3W9WA 2XX8A 4C1UA 2DP8A 1JVXA 2DOJA 4HS7A 4N6PA 5I57A 3H4ZA 3JYRA 4RK9A 1S50A 4KFQA 4LUBA 4NF6B 1FQBA 4PP0A 4QSCA 4AB5A 4LZ7A 2NXOA 3ZKKA 1SDXA 4NTLA 4ZEKA 1FW0A 5CMBA 1RYXA 3E13X 1DMBA 2V3UA 3M3FA 4GXAA 4YKPA 3H06B 4QSEA 3ODBA 1XVYA 4NWDA 3V89B 4BDOA 1HSEA 1IITA 1TWYA 2VP1A 3GBBA 3MVXA 5H8QA 1YAEA 4EDPA 2ZNSA 5DVFA 4QFNA 3VLVA 1MY2A 2XD2A 3CSGA 3DLNA 4G8MA 5IAIA 2E0SA 4O3AA 2H4IA 4WEDA 4XXUA 2HCAA 4QF9A 1D4NA 1ANFA 3VFJA 3W15C 5CM6A 1JEVA 4R72A 2UXAA 3MVWA 5K2XA 1Y3QA 4ZECA 1GTKA 1QKBA 1US4A 2UYFA 1POTA 3G7WA 3K0VA 3T96B 1PBQA 4I9DA 4F3BA 2YPNA 3CVGA 3ZKLA 3EPEA 4NF5A 4RA1A 2XXWA 2IA4A 3T9VA 3TPAA 2ONRA 1ZLQA 5H8HA 3PMVA 2B3FA 2LAOA 3GLBA 3H6VA 2Q2AA 3QK6A 5TU0A 3UN6A 4MLVA 3VLUA 2Z8EA 5JTYA 2D3IA 1P1WA 1I69A 4IO3A 4ESXA 3CFXA 4HCWA 1ATGA 5ITPA 1CB6A 4G2ZA 2OJTA 2Z22A 2XXYA 1Y9UA 4DLDA 5I2KB 1N7WA 1B52A 2ZYKA 3EQ1A 3V8XB 3K2DA 2RC7A 4EF2A 2AIXA 4FIMA 2Y7RA 3VVDA 3H03A 3RTWB 4U4SA 3QIMA 4DE8A 5A5XB 3K4UA 4MBPA 2ONKE 4F22A 5A5XA 3RY3A 5KCJB 1Q35A 5FHOA 4DXUA 4JB7A 3TZAA 3UK4A 3H6TA 5KCJA 3IB1A 3K00A 1DTZA 1FTMA 3I6VA 2I49A 3HV1A 3MBPA 4DIGA 4H67A 3RT8A 5EHSA 5FHNA 1J1NA 3OEMA 1QW0A 3T66A 3TCGA 4BDLA 1UIVA 4IB2A 1H43A 1LAFE 2Y84A 3TDJA 1MPBA 3UORA 3VVFA 5I56A 5I57B 2F5XA 3IOUA 3SEVA 4GF8A 3Q29A 2F34A 4RNSA 2F36A 2UVGA 2V25A 5H8FA 2D5WA 1LCFA 5I2NA 3QSLA 4OEUA 3RGYA 3IO6A 1FQCA 2ABHA 2XXPA 3CI8A 3U8QA 2V84A 5HPQA 3WAFA 3IOVA 3MZ1A 3MPKA 4OWDA 1MPCA 1NH7A 3SKPA 1Y1ZA 2QPQA 1TFDA 3S9EA 2Q9TA 3JZJA 1B0LA 3FXQA 3K6VA 1SD3A 4NWCA 3KEIA 3VV5A 5AE4A 4QRZA 1XS5A 4R9GA 3RUMA 3H6UA 3N6TA 4OFJA 2DYXA 2DQVA 2H5YA 5FTHA 1USYH 5F1QA 1LAGE 2WKYA 4JWYA 1B32A 3DP6A 4JSOA 4THIA 5H8NB 3B6WA 2Q88A 4EQ9A 1MY1A 1PB9A 1NNKA 3VXCA 1B9JA 4PFTA 4ELRA 3MP1A 1MXZA 3KFMA 4G8NA 3IB2A 4DZ1A 5H8QB 3CIJA 4PE5B 1IZ1A 1Z7ME 5B7DA 1MM6A 1QKAA 2HAUA 4LATA 4F2OA 4FAJA 3HO7A 1DSNA 4U21A 1S7YA 2DE4A 5AA4A 1MY0A 1OLAA 1B4HA 1S9TA 4XKNA 3PMWA 4YKIA 1B5HA 1SW4A 1POY1 3LSFB 4Q30B 3RT6B 4R74A 4MFIA 1VR5A 2Z8DA 4GRKA 2F78A 3BKIB 1A55A 1MRPA 3OO9A 4KHZE 4KR5A 1R1NA 4F18A 2DE3A 4WEPA 1MH3A 1NH8A 3S2VA 1US5A 4F3SA 1I6AA 4F1YA 4YKKA 1M5EA 3FV2A 4ONYA 5DEXA 2ZYNA 3K1MA 2BJJX 4ELQA 2HEUA 1FTLA 4ZE9A 3VVEA 3O6IA 5CMKA 1D9VA 4H6DA 3IR1A 2GHAA 2ANJA 4OMBA 3THIA 5I84A 3RN8A 2OZZA 4X1BA 4YZZA 5EYFA 4GFRA 3UIFA 1IXCA 2HXWA 1USYE 1VSOA 1B3FA 4X48A 3EHUA 3Q25A 2R71A 2H99A 2UYEA 3IJXB 4NF4A 4EXKA 4EUOA 2XXUA 3CRBA 4NF8B 3O97A 2F8DA 1LCTA 1KWHA 1MQIA 1A7LA 3FD3A 1TXFA 1NNFA 3LUYA 3TMGA 3FVGA 2XX9A 1B1XA 1OMPA 1XOCA 1WVJA 1JW1A 1R9LA 4UA8A 3PUYE 4H8IA 5ELVA 3TAJA 5FHMA 3BFUA 1YCJA 3PGFA 4FJPA 1LSTA 4TOZA 1B7ZA 1SI0A 1QULA 2V3QA 4X9TA 3CSBA 4PQJA 4POWA 3TTNA 4YAHX 3SEUA 3T93B 3RQTA 5I56B 2DWIA 1N7XA 1NFTA 1UQWA 3U1OA 1B51A 2F7AA 3Q27A 3TTRA 1D3KA 1A40A 4IO5A 4KQPA 4JDFA 2CMOA 1MXYA 2G93A 1N04A 4JBZA 4G68A 4TLLB 5AA4B 4FECA 3IAZA 1Y3PA 3R6UA 4MH5A 1D9YA 2F35A 3FV1A 3O6HA 3IL1B 4O3BA 4RY1A 3VLWA 4U2RA 4U4XA 1MQGA 1URDA 3MVZA 2QS3A 2X7QA 4Q8RA 2QL3A 3HHFA 2ZXTA 2PYYA 3OO8A 1M5CA 4EQBA 2X7PA 3MZBA 5ISUA 1P99A 2R9JA 4IGRA 4ZEDA 3FVKA 2F6PA 4ZEFA 4PFUA 4HW8A 2DXYA 1P1OA 4JWXA 3G3HA 3G3FA 3K6WA 5I59B 3PPOA 2ALUA 2DWHA 3PU5A 1P1QA 2P2AA 4F3PA 1TT1A 3D4GA 2XXTA 1NKXA 3FXUA 2RINA 3IORA 4XKQA 3O9PA 4ZZAA 3HPIA 4E0XA 3OMBA 5KDTA 4MF3A 2H98A 4BLAA 1O7TA 1B2HA 3QYTA 1SYIA 1OIBA 1FTKA 3PPNA 4IO4A 2QS4A 1N76A 3KN3A 4KYDA 5DYHA 3VE1B 2Q2CA 4Z7EA 1FCKA 3RPWA 5ICQA 2O7IA 1N3XA 2A5TB 2DVCA 4LZ8A 5BWJA 4GL0A 5JEIA 2AL4A 2RF1A 2O84X 2HQ0A 2QS1A 3HSTA 4UACA 1MS7A 1A8FA 1NNTA 5CMMA 4YU0A 3IOTA 3QXMA 3H3GA 3GXAA 3I3VA 1I6BA 4KD5A 3ECRA 1XT8A 4BDQA 2DWAA 2NOOA 2I4CA 2VD3A 3OO7A 1YTVA 4OQOA 3T22A 1B40A 1M5DA 1MXWA 1URGA 3CFLA 3FIRA 3KSJA 4H5GA 1PBPA 1MQDA 4H8JA 5AA2D 3PUZE 4JWOA 2O51A 4R2FA 4RJZA 1I6QA 1B0HA 4OVJA 3CG1A 3CR9A 3MQ9A 2P1SA 2QSXA 1LB9A 4NF8A 4TQUQ 1EZPA 1OQHA 1OQGA 4G68C 3C34A 2DSFA 3B7DA 3OELA 4IO6A 2UVJA 1ZU0A 2QMXA 3E9XA 3R7XA 2DS9A 2O69A 4KCDA 1ZJLA 4I8CA 1EZ9A 1OLCA 3PPQA 3KJTA 1O64A 1VFEA 3KZGA 3LSLA 3P7IA 3C4MA 4OTEA 4LZ5A 1MQHA 1SBPA 4PFWA 4QFLA 1SW2A 3SETA 3FUZA 4H5FA 4Q0CA 4C0RA 4AQ4A 2HZLA 3OEKA 4IO2A 1GVCA 4BDRA 3QUFA 3HN0A 3N5LA 3E3KA 3RTFB 5IKBA 2X26A 4POXA 2I3VA 1MXUA 4ESWA 4YICA 1B58A 4GQOA 5B70A 2I6EA 3SERA 2Y7IA 4FATA 2DVZA 4G68B 1CE2A 4XKPA 4YB6A 2HFBA 3TQLA 1NNPA 1M5BA 1WODA 1LFHA 4LVQA 2XD3A 5ICTA 2NVUB 1B3GA 1Y4TA 2IEEA 1RKMA 1JNFA 3FATA 4L17A 1AL3A 3IJOB 3OXNA 5DEXB 1ELJA 5FTIA 2REGA 5JTYB 3TYHA 5CI5A 4F2QA 5CBSA 1DPPA 2ZYMA 1PDAA 3ZS6A 1HSLA 4XKRA 3TUSA 3S4UA 1FQEA 5AA2A 3Q26A 1LFIA 3PUVE 3OSRA 2REJA 2VGQA 4BDMA 1B7HA 5EHMA 3TTLA 3KN8A 2XXHA 5BUUA 1MDP1 2UVIA 2P0SA 3PD9A 1SW1A 4GD5A 4OENA 5HM4B 1QJMA 2Y7KA 1Y1MA 4YMAA 4IO7A 1FQAA 4OYVA 5TPAA 5CC2A 4RPOA 4WXJA 1B5IA 1JVYA 4ZDMA 3LC8A 5L9MA 1UTBB 2VHAA 3EF7A 1OVBA 4Z0IA 1A54A 3DM0A 5K2YA 1JQFA 4WKMA 4F19A 2PBWA 1IXHA 1EZOA 4TLMB 3M8UA 1Q1KA 4R6HA 2W7YA 2PT2A 4G4PA 1H45A 3C35A 4KYSA 1F9BA 4QFPA 1MDQA 3ZSFA 2XX7A 2O1MA 1B46A 2Z23A 3LBSA 3U92A 3PD8A 2O6AA 4HTGA 4M1VA 4R6KA 5TP9A 4R75A 3RNNA 3USDA 2OBGA 1QUIA 3ONMA 5I58B 3ILUB 1GV8A 1BIYA 3S9LC 1R6ZA 1JEUA 3EHSA 3K01A 3DELB 4IY5A 2O1LA 2AYSA 5CBRA 5I59A 1B3LA 3U94A 4U1ZA 2E1SA 4QHQA 1TFAA 3VXBA 4H1XA 1BLFA 4P11A 4EXLA 1N3WA 3K1NA 4HCYA 2RCAA 3K6XA 3MWBA 4I62A 4OZ9A 3K02A 4LP2B 4DDDA 3KG2A 1B7UA 4NF4B 3N6UA 1IXGA 4R73A 2GFEA 2XXIA 4FE8A 3U72A 1ZMGA 3SEYA 2I0BA 2YJPA 3G3IA 3FXRA 3IX1A 2XXQA 4K3FA 5DVJA 2FNCA 4X1DA 2FYIA 5DTBA 5HBCA 5AA1A 2R6GE 3FVNA 2O68A 3OOAA 3QAXA 2FA7A 4RYAA 3UGWA 4GL8A 4F1UA 1LB8A 2PT1A 2RC8A 3MAMA 4OESA 4QFOA 4ZEIA 1AIVA 2XHDA 4YKJA 4KPTA 3HHGA 3FASA 5KDTB 3K6UA 1MQJA 1P1NA 2G29A 1PB8A 3FVOA 2AL5A 3N94A 3OENA 5ITOA 1L5TA 2I48A 2F6GA 3E4RA 2RKMA 1Z7NE 3MVYA 3O28A 3GZGA 4N07A 3F11A 5DVIA 2QRYA 3C32A 1B6HA 1FQDA 4FEDA 2M8CA 1LBBA 2VOZA 4NF6A 4ZS9A 3V5AA 4YB7A 2KLFA 1BTJA 2OLBA 1R9QA 1IUDA 1XVXA 1SW5A 3EN3A 3KBRA 3MW0A 3JV9A 1H3DA 4ELPA 1AOVA 1IQ7A 1QVSA 1PEBA 2GHBA 2F97A 1SVXB 4DXCA 2DWJA 1LFGA 2V3TA 3PUWE 4OHNA 3AXFA 3SESA 4H0WA 3A09A 2HAVA 4LONB 2XXVA 4M4GA 4NE4A 4DXBA 5L9SA 3HCQA 1SQYA 1LAXA 1JETA 1PB7A 2A5SA 2ESNA 2XXRA 3S9NC 3V83A 1M5FA 4U22A 4P0IA 2ZYOA 1FTJA 1OVTA 2I0CA 2ZNUA 4KCCA 1MG1A 4F1VA 1MXXA 3TELA 2A5TA 2H25A 3H6WA 3IOWA 1QUJA 4ND9A 3IB0A 1WDNA 4PFYA 4RPNA 4E0WA 2DE2A 3DP4A 1B3HA 3L6HA 1UIUA 4G8HA 4U1OA 5H8HB 2NUVA 2CZLA 3M3KA 2HZKA 3DP8A 2OWSA 1ZTYA 2QS2A 2ZMBA 4R9FA 5L9OA 4RXLA 1MY3A 3T9HB 4XTCQ 1BKAA 3C33A 4YMBA 1FQFA 2PVUA 3RLFE 1SYHA 3WAEA 4MLQA 3OD7A 3C31A 2NWJA 4GIZA 2F7CA 1GR2A 1A8EA 3OSQA 1B1HA 3SEWA 4YB5A 3BBRA 3GBAA 4P0GA 4LQ2A 1P1UA 2B3BA 1O63A 2RCBA 4QFKA 3D4CA 4ZE8A 4R2BA 4NMYA 3TKDA 4R6YA 1MXVA 1EH3A 3LR1A 3T9UA 2THIA 5M2VA 1BP5A 3A3CA 1B4ZA 4QSDA 3Q28A 2O7UA 3C36A 2YLNA 3FGSA 2QMWA 1JW5A 4XIGQ 5LOMA 3MPLA 2OCUA 3G3KA 1LBCA 3A3UA 3K1PA 3MP8A 1SI1A 1IXIA 4F39A 1B3EA 4KI0E
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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