3K01A

Crystal structures of the gach receptor of streptomyces glaucescens gla.o in the unliganded form and in complex with acarbose and an acarbose homolog. comparison with acarbose-loaded maltose binding protein of salmonella typhimurium.
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
391
structure length
391
Chain Sequence
AMVELSGTVTFWDTSNEAEKATYQALAEGFEKEHPKVDVKYVNVPFGEANAKFKNAAGGNSGAPDVMRTEVAWVADFASIGYLAPLDGTPALDDGSDHLPQAAASTRYEGKTYAVPQVIDTLALFYNKELLTKAGVEVPGSVAELKTAAAEITEKTGATGLYLRGDDPYWFLPYLYGEGGDLVDEKNKTVTVDDEAGVRAYRVIKDLVDSKAAITDASDGWNNMQNAFKSGKVAMMVNGPWAIEDVKAGARFKDAGNLGVAPVPAGSAGQGSPQGGWNLSVYAGSKNLDASYAFVKYMSSAKVQQQTTEKLSLLPTRTSVYEVPSVADNEMVKFFKPAVDKAVERPWIAEGNALFEPIRLQMANVLSGETSPDEAAANTGDAYRKLLKDYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transport protein
molecule keywords Acarbose/maltose binding protein GacH
publication title Crystal Structures of the Solute Receptor GacH of Streptomyces glaucescens in Complex with Acarbose and an Acarbose Homolog: Comparison with the Acarbose-Loaded Maltose-Binding Protein of Salmonella typhimurium.
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces glaucescens
total genus 140
structure length 391
sequence length 391
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k01A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3k01A02
3FXUA 5B7DA 2OJTA 2DXYA 4DDDA 1QULA 3UK4A 2V3QA 3A3CA 4R73A 4FATA 1VR5A 3DLNA 4ELPA 3Q26A 4FORA 1MXYA 3UN6A 3THIA 3GLBA 4YKIA 2O51A 3LC8A 3H03A 1D9VA 1RYOA 1DPEA 2F7BA 2HAVA 4NF6A 1Q35A 3OO9A 2Y7WA 2XXTA 4P11A 2QS2A 5F1QA 5L9OA 3Q28A 4OEVA 2Q88A 4XXUA 2O6AA 3SEUA 4IO4A 1LFIA 1SW2A 2ZNUA 5K2XA 3R6UA 4F39A 4RXLA 4X9TA 2F6GA 1GV8A 3CFZA 5IKBA 4TQUQ 4GQOA 4LATA 1FQDA 3OEKA 3MVXA 1PB8A 3FJ7A 1OVBA 2VD3A 4OMBA 1HSJA 1N04A 3I6VA 1IEJA 3TPAA 3S9NC 1ELJA 4ZZEA 4JSOA 4TLMB 3U72A 2D5WA 3KJ7A 2ZNTA 3K6UA 1QJMA 3V83A 3ILTB 2E1SA 4KYSA 4WKMA 5DVJA 3IB2A 5L8DA 4YICA 4WXJA 2VP1A 4OZ9A 3VFJA 2O68A 2DE3A 3MZ9A 5FHNA 3CFLA 3ECRA 5FTHA 1VFEA 4IY6A 4OHNA 3G3FA 1DTGA 2UYEA 1JW1A 1NFTA 2O69A 3MP6A 1B1HA 4KR5A 3A09A 3G3HA 3MQ9A 2PX1A 3KZGA 5ICTA 2UYFA 4NF5B 1RYXA 4DCYA 1B3GA 1B2HA 5I2NB 1N7XA 1NH8A 4H5FA 2XHDA 3LSFB 3O29A 5I56A 3M3FA 3RT8A 3M8UA 4EQ9A 1Y9UA 3PPQA 5B70A 2OK2A 2PVUA 1AH5A 4N07A 5AA4B 3EPEA 4RA1A 5CMCA 4FJPA 1B9JA 4ND9A 2ZMBA 2H9BA 3IOUA 1UIVA 3N26A 4IO5A 2ZXTA 4X1DA 5DEXA 2PT1A 4HW8A 4QFLA 3QAXA 4HCYA 2HCAA 1M5FA 3K1NA 4F2OA 1P1QA 1A8EA 5KDTA 4ZEBA 4NF6B 4U1ZA 3CRBA 1MPBA 3GZGA 3C32A 1QVSA 1EH3A 1F9BA 2XXQA 3FGSA 3C36A 4GXAA 3TAJA 2A5TA 5AA2A 4PP0A 3DELB 3KSXA 2O84X 4EQBA 2YJPA 3TTNA 1R9QA 4G68A 2YPNA 5CI5A 1FTLA 2P0SA 3R7XA 1ZTYA 2UVGA 2BJJX 3W9VA 4F31B 1LGBC 3AXFA 1OMPA 1LAGE 1LAFE 1JETA 4KYDA 1B32A 5CBSA 3PPPA 3G7WA 3FASA 4QF9A 1LFGA 5TU0A 3H7MA 4G8HA 2RINA 3RQTA 3MBPA 2OWTA 1JVXA 2X26A 1QW0A 3IR1A 3K6XA 2PBWA 2RC9A 1CE2A 3QYTA 1JNFA 2W7YA 1XVXA 2VGQA 3KOSA 3HSTA 1ZKBA 5JTYA 4XTCQ 3N6UA 3UP9A 2ZYOA 3OENA 3SKPA 2B3FA 3KGCA 1DTZA 4XKRA 4F3SA 2HZLA 1B3EA 5I2KA 2V3UA 5L9SA 2Y7IA 3HCQA 3OEMA 1KWHA 1YCJA 1Y3PA 3FV1A 4QFKA 3KEIA 1EZ9A 3VV5A 5AA3A 3TUSA 3V8XB 4XKPA 3JZJA 1Y20A 3K1MA 3VE1B 3SEXA 3B6TA 1IIWA 4ZEKA 2V25A 2H25A 4Z0IA 3MVZA 5AE4A 3OO6A 3SDFA 4H67A 4E0XA 3PGFA 4R9FA 3IOVA 3PUXE 4YMBA 1ZIUA 3UORA 5DEXB 3HO7A 4YKKA 4TOZA 2V84A 3T9UA 2M8CA 3IOWA 4ZDMA 3HPIA 1EU8A 3BBRA 5ISUA 3C31A 3N94A 4IO7A 3MP8A 5KDTB 2ONRA 2QRYA 1P1WA 3S2VA 4IY5A 3VXCA 4LZ5A 3PMWA 2G93A 2Q8JA 2A5TB 3CSBA 5AA2B 1QKAA 1A7LA 3OELA 3FXQA 4THIA 3FVKA 1B4ZA 2Z23A 1UTHA 1US4A 3W9WA 3T93B 3RGYA 3PMVA 1MY0A 2F6PA 1MPCA 2G29A 4H0WA 2F8DA 1H76A 1BKAA 3IO6A 5AA2D 2UXAA 3G3GA 4YKPA 4IB2A 4GIZA 3O6IA 4OQOA 2YLNA 4ZEDA 1UQWA 2QSXA 4YAHX 3TMGA 4F1YA 4C0RA 2V3TA 4FEDA 1Z7NE 4H65A 3P7IA 3QUFA 1B58A 3H6UA 2GFEA 4EDPA 3VVDA 4JDFA 1NMUA 1B5HA 1PC3A 4OENA 1R1NA 4RPNA 3VLWA 2XX9A 3PD9A 1HSLA 4DCXA 3GBBA 3MUQA 4AB6A 2F35A 3O66A 2OLBA 1A8FA 5JTYB 4PFUA 4ESWA 3EHUA 1DSNA 3VVFA 2QS4A 3TYHA 1LAHE 5I2KB 1P99A 2UVJA 4R74A 4GVOA 2AIXA 5EYFA 4ZE8A 4R6HA 4L17A 4TLLB 4IGRA 1NNFA 3KN7A 3KG2A 5DVFA 4KD5A 3IJXB 4LVQA 4AQ4A 3TFLA 1MPDA 1H44A 2KLFA 2P1SA 4JSDA 2NVUB 1B51A 4NE4A 1B46A 1XVYA 4Z7EA 3BKIB 4F1VA 1B0HA 4KYEA 3B6WA 1IXGA 4YZZA 2AYSA 1FW0A 2XXRA 4MH5A 3IB1A 3ZKLA 4RJZA 1TXFA 4EXKA 2I49A 1MY4A 2OWSA 1IXIA 1D4NA 5KCJA 1SW5A 3MZ1A 1B0LA 4I9DA 2DQVA 3C34A 4O3CA 3MPKA 4R6KA 2GHAA 4BDLA 4Q30B 1LCTA 4H5GA 4EF2A 2Z8EA 3IAZA 2XXPA 1ZU0A 2Q9TA 1US5A 4F19A 3TDJA 1D9YA 2X7PA 4Q0CA 3O6HA 4U4XA 5TPAB 1B05A 4OFLA 4IO2A 3ILUB 1FTMA 2I6EA 3CR9A 4LP2B 3TKDA 2CZLA 1N0TA 1SQYA 1TFDA 2DE4A 3MJNA 4FE8A 1SI0A 2DWJA 1IQ7A 1AIVA 1YTVA 3SEWA 4NF8B 3S9EA 1Q1KA 2OZZA 3SERA 1URGA 1M5EA 5FTIA 1IXCA 2HXWA 4QFNA 5CM6A 3FV2A 1I69A 4NF4A 4NEDA 1CB6A 1FQBA 5CBRA 3TODA 1MQGA 4RPOA 1B3HA 1P1NA 5H8QB 3FZVA 3N5LA 3RTFB 4MBPA 4R6YA 5TP9B 2ZYMA 3B7DA 4G68C 1DPPA 1YPNA 3O28A 3K0VA 3KOTA 4FIMA 2XXHA 3OOAA 4QRZA 1SI1A 4KPTA 4XIGQ 1B40A 5IAIA 4YMAA 4YB6A 1B5IA 3UGWA 1IUDA 2F34A 1A55A 4IO3A 1Y4TA 4OTEA 2VD2A 1Y3NA 3EQ1A 3RPWA 2XXUA 4RYAA 4IO6A 2AL5A 4LONB 3SEVA 1MQJA 1OQGA 4BDRA 1SW4A 3C35A 3VDFA 5J1DA 1LBBA 2Z8FA 4PETA 1MXZA 3QUJA 3K1PA 3MAMA 2O7UA 3L6GA 2F97A 3H6WA 3WAFA 4GFRA 1BTJA 1B5JA 1MDP1 4MLVA 3HHFA 2H5YA 1NNKA 3EF7A 4ONYA 4I1DA 3TCHA 3U94A 4FECA 3PV0E 3EN3A 1SBPA 2F36A 3IORA 2ZYNA 3OD7A 4R2BA 5JK4A 3E13X 3H06B 1GVCA 3PPOA 2XXVA 4ELQA 4EQ7A 4OESA 1WODA 2QL3A 1P1UA 3UIFA 3O97A 4QFPA 3ZS6A 2DS9A 3OSQA 3ZKKA 2D3IA 1OLAA 2A5SA 3IJOB 3SETA 2I3WA 1MY1A 5EHMA 1XT8A 4H6DA 1PB7A 4PFTA 4OERA 1FQCA 2QPQA 3RUMA 4E0WA 5LOMA 1JEUA 4P0IA 1LFHA 4O3BA 2D21A 1LB8A 3IL1B 4H8IA 3OXNA 4YB7A 4NF4B 2Y7KA 3HN0A 1OLCA 2F7CA 3PU5A 4JBZA 3Q27A 1OQHA 3IX1A 3CG3A 2DOJA 4UA8A 2R71A 1A40A 5H8FA 1DOTA 1FQAA 2HFBA 3PUZE 4EF1A 3TEPA 4LQ5A 1QUJA 1Y1MA 3E4RA 3PPNA 4GL0A 1B7HA 1T0KA 1WDNA 1SD3A 5H8HA 3K4UA 5I58A 2Y84A 3M3KA 4BDQA 4PQJA 3PPRA 4JWOA 4RK2A 3DP8A 2O1MA 3VLUA 3FD3A 5I56B 2DWHA 4F18A 5I59A 4F3GA 1POY1 3TZAA 1MG1A 3TQLA 4ELOA 3T9VA 3QSLA 5ITOA 1GGGA 1H45A 1J1NA 2Y7PA 4ZZAA 3G3KA 2THIA 1NNTA 2LAOA 1B6HA 3L6HA 1JEVA 3E9XA 2QJEA 2I4CA 1MY3A 4YU0A 2PT2A 4POWA 4LUBA 1SYIA 2O7IA 3RY3A 2IEEA 3TELA 1MY2A 1H3DA 4I62A 4QSEA 3TCFA 2F7AA 3U93A 1N3WA 1MXUA 5HPQA 2Z8DA 3Q29A 3IO4A 4MFIA 4POXA 4JXIA 4G68B 1M5BA 2RCAA 3TTRA 3FJMA 4DZ1A 4OETA 1MDQA 2XXIA 1PDAA 1ZJLA 2ONKE 2ZNSA 3FUZA 4QSCA 3QXMA 2CMOA 1MXXA 3D4GA 1NNPA 2XXWA 1FTKA 3T9HB 3K01A 1O63A 2UVHA 3IOTA 4R72A 4UACA 3KN3A 4WEDA 2RCBA 3S9LC 3MC2A 1XS5A 2DE2A 3H3GA 1B3LA 1N3XA 4BDMA 1VSOA 1NH7A 1I6AA 1NKXA 1S9TA 4O3AA 3U92A 4ELRA 2H98A 1WVJA 3H6TA 1ANFA 4LZ7A 5DTBA 4EXLA 2ONSA 2WKYA 4P0GA 1MXWA 1MRPA 3FVNA 1M5DA 2B65A 5FHMA 2NOOA 2ZYKA 3O2AA 4DXCA 3LBSA 2ANJA 4NWDA 1JVYA 3PUWE 1A54A 2F78A 2XX7A 3GXAA 3LUYA 5I2NA 4F29A 3V89B 3EHTA 1BP5A 5H8SA 1IZ1A 5I59B 4G77A 2NWJA 3T66A 4N6PA 4U22A 1B3FA 1FCKA 4F1UA 1YAEA 4F3BA 2R6GE 4RNSA 5I57A 1I6QA 1LBCA 3KBRA 4DLDA 1P1OA 2XD2A 1MH4A 4U21A 3VVEA 1NL5A 1Y4CA 2NXOA 1BLFA 3PMXA 2OCUA 2I3VA 1D3KA 2QS3A 4R75A 2REJA 4HS7A 1BIYA 2X7QA 4K3FA 4GOTA 1AOVA 2RC7A 2I0CA 1OVTA 3U1OA 1QUKA 4Q8RA 4WEPA 5FHOA 4ZS9A 2FA7A 1N7WA 4DE8A 2I0BA 5HM4B 5CC2A 3KSJA 1UTHB 4DXBA 2O1LA 1USYE 1FQFA 4LZ8A 1H43A 3TTKA 2B3BA 1RKMA 3MW0A 5M2VA 3O9PA 3D4CA 4HCWA 3TCGA 5CMKA 1EZOA 4H1XA 2OBGA 4HTGA 3I5OA 1OIBA 4C1TA 1S50A 1R9LA 4LQ2A 3CFXA 4G8MA 4JWYA 1TWYA 2I48A 1LAXA 4OFOA 2QMWA 4OFJA 4XKNA 2Q89A 1USYH 5CRYA 3BFUA 3GBAA 1VFDA 4JB7A 3Q25A 5H8NA 5BUUA 4LA9A 2DP8A 3QIMA 2XD3A 3PD8A 5AA1A 2GH9A 2DVCA 3VLVA 2RF1A 4KQPA 2HAUA 4C1UA 3TTMA 3S4UA 2DXRA 4H8JA 4DIGA 1B4HA 5ITPA 2UVIA 3H4ZA 4R9GA 4YB5A 3G3JA 5HBCA 1A99A 5ICQA 2V93A 4F22A 2I58A 4KCCA 4U2RA 1MM6A 5L9MA 4QFOA 2XXXA 4PFYA 1AL3A 4ZE9A 1LLSA 3PUVE 4ZECA 5A5XA 3W15C 5I57B 3RLFE 3FXRA 2DSFA 2GRVA 1B7UA 1PEBA 5CMBA 2ESNA 1IXHA 5KCJB 1UIUA 3C9HA 4F2QA 3CG1A 4I8CA 3UA8A 1ATGA 2GHBA 3A3UA 4DXUA 4M4GA 3DP6A 5DT6A 3T22A 2Q2CA 2HZKA 2QS1A 1URDA 4GF8A 4GXSB 4QHQA 4YKJA 4F3PA 4XKQA 3FVGA 1Y1ZA 3MPLA 4PE5B 1DMBA 1M5CA 4GRKA 2E0SA 3F11A 1VE4A 2DYXA 1FTOA 3C4MA 3OSRA 4G8NA 3K02A 2IA4A 4BDNA 1AMFA 4BDOA 1I6BA 4Q5TA 3LSXA 5DVIA 1LSTA 5JEIA 3O6GA 3CVGA 4FAJA 1O7TA 1SDXA 1UTBA 2FYIA 3K00A 3MVYA 3R26A 3U8QA 5KZTA 3IK6B 4G4PA 1SW1A 3E3KA 2DWAA 4N13A 2Y7RA 3LSLA 1MS7A 4G2ZA 4PFWA 3LR1A 3K6VA 1GTKA 3KN8A 2R9JA 4X48A 1PB9A 1FTJA 5F7VA 4KCDA 5H8NB 1MXVA 3FATA 4NTLA 3QK6A 3USDA 1LB9A 3KJTA 1B52A 3OO7A 4NMYA 3TQWA 1XC1A 3OO8A 4MF3A 3PUYE 2I4BA 2NUVA 4GL8A 4OVJA 5BWJA 5K2YA 2FNCA 1PBQA 3RTWB 4ZEIA 4IGTA 2H99A 1IITA 3IB0A 2PYYA 3H6VA 3JYRA 4OXVA 2P2AA 2Z22A 1URSA 3FJGA 4BLAA 3K6WA 1MQHA 1XOCA 4M1VA 1FQEA 3N6TA 4OYVA 1QUIA 3OMBA 3MZBA 3C33A 3V5AA 2ALUA 1JW4A 3RN8A 3SESA 3EHSA 5A5XB 3ODBA 4U4SA 3SEYA 1MH3A 3I3VA 3LSWA 1B7ZA 3MP1A 3CI8A 1POTA 3K2DA 3MVWA 1EZPA 4KHZE 2VHAA 1SVXB 3JV9A 2XX8A 1MM7A 1ZMGA 1B1XA 4KI0E 3T96B 3M3LA 1MQDA 2H4IA 4GD5A 1TT1A 1O64A 4OEUA 1ZBMA 5TPAA 3KFMA 1ZLQA 3RT6B 2PMSA 1R6ZA 1XHYA 4FEBA 2REGA 4NWCA 1LCFA 2ABHA 1HSEA 1S7YA 1JW5A 3BFTA 2RKMA 2DVZA 4NF8A 4MLQA 3B6QA 2HQ0A 2VOZA 1UTBB 3CIJA 3TTLA 5ELVA 2DWIA 5DYHA 4ECFA 1TFAA 2RC8A 2XXYA 1L5TA 2QMXA 3T9XB 4RY1A 1N76A 4ZEFA 2F5XA 5I84A 5H8QA 2HEUA 5H8FB 3FIRA 4U23A 2AL4A 5TP9A 3S9MC 4R2FA 4U1OA 4KFQA 4X1BA 3G3IA 3ZSFA 5H8HB 1JQFA 4OWDA 1II5A 3CSGA 5I58B 3FVOA 1MQIA 1QKBA 3VXBA 4NF5A 3MWBA 3HV1A 4GLIA 3HHGA 1SYHA 4QSDA 1PBPA 4GWOA 1GR2A 3ONMA 4ESXA 4EUOA 5CMMA 4ISUA 3WAEA 3RNNA 4JWXA 1Z7ME 3DM0A 5AA4A 1N84A 4RK9A 1Y3QA 3DP4A 5EHSA 4AB5A 2Q2AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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