3IB2A

Structure of the complex of c-terminal half (c-lobe) of bovine lactoferrin with alpha-methyl-4-(2-methylpropyl) benzene acetic acid
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
345
structure length
341
Chain Sequence
b'YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSLEACAF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Lactotransferrin
publication title The structural basis for the prevention of nonsteroidal antiinflammatory drug-induced gastrointestinal tract damage by the C-lobe of bovine colostrum lactoferrin.
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal binding protein
total genus 109
structure length 341
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2009-07-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ib2A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3ib2A02
1B1HA 2O51A 2NXOA 1B2HA 3H6TA 1PC3A 1EZPA 3N5LA 4XXUA 4YMAA 3K0VA 3KN7A 4GL8A 3M3KA 3PPRA 2VHAA 2PYYA 1Y20A 1Y1MA 3IAZA 4BDLA 3I3VA 4GXAA 2ABHA 2XXPA 1FTLA 3OELA 1M5DA 4OTEA 4GXSB 4OZ9A 2Y7IA 3PUXE 4HS7A 4H0WA 1B3FA 1ZKBA 2UYFA 5KDTA 4FEDA 2OZZA 4HCWA 2VD2A 4NF4A 4RK9A 2QMXA 1B0LA 3G3IA 1QW0A 5I56A 3QK6A 3O66A 2HAUA 3UP9A 5FTIA 1GVCA 2D3IA 4NEDA 3TQWA 3KJTA 2ZYOA 1EZOA 2OK2A 3ZSFA 4RK2A 5KCJA 4QRZA 3K2DA 3K6VA 2GHBA 4GWOA 5FHNA 3H6VA 3MUQA 3KFMA 1PDAA 1ZMGA 2QS1A 3D4GA 3O6IA 3EF7A 2RKMA 1GGGA 4ECFA 4MH5A 3RTWB 2OLBA 4ZZAA 3O6HA 3CFZA 1LFGA 1R6ZA 1MY2A 4NTLA 3TTMA 3MZ9A 2IEEA 5TP9A 3S4UA 1SQYA 4F39A 2ZYKA 4F22A 4X48A 1NH8A 5JEIA 2XXRA 1ZTYA 3EN3A 3B6WA 1M5CA 3H03A 3H06B 3KJ7A 5JTYA 1MPBA 4BDOA 1VFDA 3KG2A 1FTOA 5CMKA 3UK4A 3MVWA 4IGTA 1USYE 4LZ8A 1P1OA 1USYH 3ILTB 1MPCA 4RXLA 2DE2A 3RNNA 3N6UA 4ND9A 3PUZE 4YB7A 3FVNA 3MVXA 3DELB 4N6PA 3U92A 4PFTA 2O6AA 3T22A 3FZVA 4NF5B 4JWYA 4OQOA 3A09A 2FYIA 3CFLA 3FJ7A 4U1ZA 1BIYA 1VE4A 3LBSA 1YPNA 4X9TA 2GH9A 4ISUA 4NF4B 5DVFA 1XHYA 3A3UA 5I56B 4IO5A 2F78A 5H8FA 4KFQA 5F7VA 4Q30B 1BKAA 5DTBA 2DXRA 2YLNA 4ZEFA 1JQFA 3JYRA 3H6WA 2GHAA 4PE5B 1PBPA 1IQ7A 2B3BA 4RA1A 1LGBC 3PV0E 1MY3A 4XKPA 1S7YA 4YU0A 1MH4A 3MC2A 3L6HA 5KCJB 3QXMA 1Q1KA 3CG3A 3PPQA 1O63A 3IJXB 3MPKA 2QPQA 3IO4A 1M5EA 1IXGA 1N7WA 1SI0A 3TCFA 5KZTA 3TTRA 3TCHA 5L9OA 2HEUA 4Z0IA 2Z22A 5I2NA 1FQAA 5TP9B 1NMUA 2I3WA 3VVDA 4NF8A 5A5XA 1DTZA 4YZZA 4MFIA 2HZLA 1LCTA 3G3FA 5FHMA 1MS7A 3F11A 4QFOA 4EXLA 4HW8A 1HSLA 5TU0A 2O84X 5K2YA 5JTYB 2PX1A 3ZKLA 4LVQA 3PPOA 3M3LA 1II5A 2VD3A 1POY1 1B40A 3G3JA 4ZECA 2XXVA 4MF3A 2V25A 3UORA 3RLFE 4C0RA 3G7WA 1Z7ME 2OBGA 1WVJA 1Y3QA 5ICQA 3FJMA 1S9TA 2I4CA 5J1DA 4LQ5A 3PMXA 2V3TA 5CBSA 3PUYE 3O2AA 3FV1A 5LOMA 4Q5TA 4YKPA 2R9JA 2CMOA 4ZZEA 3U1OA 2F7BA 4M4GA 1MDP1 2DWHA 3R7XA 4NMYA 3MZBA 3SEUA 5H8FB 4O3AA 3TKDA 4N07A 1LBBA 2DYXA 1MXYA 1OLCA 2Q2AA 3LC8A 4PFYA 4H8IA 1B4ZA 4BDQA 4ESXA 2E0SA 3S9EA 2REGA 1FTJA 4XKRA 1PB9A 3EPEA 4U21A 3V83A 4EXKA 1S50A 2ZXTA 1B5IA 4QFNA 1H76A 3IL1B 5H8HA 1OIBA 1LAGE 2ONRA 3G3HA 4KHZE 2UYEA 2YJPA 1A7LA 3G3GA 5AA4B 4DLDA 1MM6A 2DP8A 1LB9A 4ESWA 3E3KA 3E9XA 3IJOB 4THIA 1A8EA 1OMPA 3FIRA 1LCFA 5I2NB 2HCAA 2F6PA 2DSFA 3ILUB 4X1BA 3HV1A 4NF8B 2AIXA 4ZS9A 4IY6A 4H67A 1EU8A 5FTHA 3R26A 4WEPA 2XHDA 5ITPA 2O68A 1HSEA 4H65A 4OXVA 3I6VA 3O97A 3IX1A 4KCDA 1BP5A 1B7HA 3PD8A 2RC7A 3O9PA 2XD3A 1URSA 1NNPA 2F7AA 1SBPA 3FV2A 2O69A 5DT6A 1FQDA 3O29A 4ZEKA 4ELRA 2XXTA 4H1XA 2UVHA 3HO7A 1MQJA 4PFWA 1IXCA 3U8QA 4XKQA 2ZNTA 1N84A 1FW0A 4OENA 4OMBA 5EYFA 3RQTA 1GTKA 4LQ2A 3MWBA 2XX9A 4ZE8A 1A55A 2E1SA 4KQPA 1P99A 4Q0CA 3TTKA 2X7PA 4DXCA 2THIA 1NNFA 2QS2A 1VR5A 4OYVA 4GQOA 4NF6A 5L9MA 2Z8FA 2Q89A 3UA8A 1DPPA 3OD7A 3TDJA 1SW2A 4LATA 4QFKA 2REJA 1JW4A 4H5GA 4FATA 1MXVA 1LAXA 5AE4A 2HFBA 2DQVA 3MZ1A 3TZAA 2XXIA 3HSTA 3W9WA 1P1QA 1QVSA 5H8HB 1Q35A 5I2KA 3G3KA 4NF5A 1OQGA 1SYIA 4OETA 4BDNA 5CRYA 4F1UA 3HHFA 3E13X 3VVEA 2ZNUA 1PEBA 2F7CA 3TCGA 3VE1B 2PMSA 2KLFA 3E4RA 1DMBA 2UVGA 3M8UA 4OFOA 2QS3A 1KWHA 3THIA 2QRYA 4O3CA 1NNKA 1LAFE 4KPTA 1ZU0A 4WEDA 4R75A 1R9LA 4YICA 1PB7A 5AA2D 3PMVA 3MQ9A 1R1NA 3EHTA 2Q2CA 3K6XA 4GD5A 4U1OA 1O7TA 5ITOA 2XXWA 5DVJA 1SW5A 4LZ7A 2O1LA 3C4MA 4MLQA 3VLVA 2DVCA 1SYHA 3KEIA 3B6QA 4ONYA 4IB2A 4WXJA 1JVXA 1POTA 4R74A 4OHNA 1YTVA 4H8JA 4RJZA 4YB5A 4RPNA 3U93A 2OWSA 1LBCA 1SW4A 3FATA 4G2ZA 3EQ1A 1US5A 3BBRA 3P7IA 1WODA 1FQEA 4IO2A 3Q28A 3S9NC 3S9LC 2RC9A 3UN6A 3ZS6A 1A8FA 2DE4A 2Y7PA 1P1UA 1B6HA 1VSOA 3ODBA 3UIFA 3K6WA 1GR2A 2PT1A 4ZE9A 2OJTA 4OEUA 4KYSA 2QSXA 4H5FA 3RUMA 1Y4TA 2BJJX 1FCKA 5IKBA 2Q9TA 4NF6B 4F3PA 4I9DA 4GL0A 2I0BA 1QUKA 5H8SA 4DIGA 2OCUA 1H45A 2AYSA 3OO9A 4G68B 4GLIA 5ELVA 1PB8A 2UVJA 4U4XA 1D9YA 3C9HA 3PGFA 1D4NA 2ZYNA 2I58A 3OO6A 5I2KB 2NUVA 1WDNA 1B32A 4N13A 2PVUA 1GV8A 1BLFA 3K6UA 4TLMB 2ESNA 3IOTA 3VLWA 3C33A 1LSTA 3IR1A 2LAOA 4GF8A 2DXYA 1DOTA 2F35A 3GXAA 1FQBA 4PFUA 4H6DA 3BFTA 3CRBA 2F36A 2Y7WA 3K1PA 5CC2A 2HXWA 3MP1A 1QJMA 2RCBA 1P1NA 4R73A 1P1WA 1JEUA 3FXUA 3MP8A 4QFLA 1B3HA 4JSDA 2CZLA 1CB6A 4QSDA 5AA3A 1T0KA 3VDFA 1B1XA 4GRKA 3HPIA 1Y4CA 4JWOA 4IO6A 4IO4A 1DSNA 3QUFA 4E0XA 1UIUA 2I0CA 1URGA 1TXFA 2XD2A 2DE3A 5AA4A 4EQ9A 3LSFB 3TMGA 2P2AA 3KN3A 4FIMA 1B7UA 2QL3A 3TFLA 1I69A 1ELJA 1QUJA 5I58B 4G8NA 3RGYA 2D21A 4Q8RA 1MXWA 4R2BA 3MJNA 1MQIA 1NFTA 5CI5A 1O64A 4GOTA 1MM7A 3GZGA 2XXHA 1FTMA 3OEKA 5IAIA 3RPWA 4DXBA 3RT8A 5TPAB 3SETA 3Q29A 4OWDA 3OENA 3OO7A 1US4A 3T9XB 3C35A 4KD5A 4U23A 5DYHA 1TFAA 5I57B 2IA4A 1MY1A 1YCJA 4POXA 1XOCA 5HBCA 2DVZA 4JDFA 2FNCA 3RY3A 3PUVE 1B4HA 4OERA 3DP8A 2A5SA 1B0HA 1N76A 5CMBA 2XXXA 4KR5A 1JVYA 2F6GA 4POWA 3ECRA 4FJPA 4F2QA 1QULA 1B3EA 1SD3A 3QSLA 2V84A 2ALUA 1N04A 4FEBA 2DS9A 3GLBA 3LSWA 3H6UA 4JB7A 1ZIUA 3N94A 2Y84A 3HCQA 3S9MC 5H8NB 3KSJA 1D9VA 5F1QA 2NOOA 3DM0A 4IO7A 2DWIA 3IOUA 4F31B 4MLVA 3RTFB 1RKMA 2H5YA 4XIGQ 4R6KA 2Y7RA 3O28A 3SEWA 3U72A 4F2OA 4IY5A 5ISUA 3OMBA 4C1TA 1B3LA 4XTCQ 3TTLA 3K02A 2XXQA 3HN0A 4PP0A 3PUWE 1JEVA 1A99A 2ANJA 1MQHA 4TQUQ 1QUIA 1AIVA 3B6TA 3IO6A 2G29A 3BFUA 4TLLB 1AOVA 2F8DA 3QYTA 1UIVA 4YKIA 3CSGA 1MY0A 3T9UA 2F5XA 3C32A 3CR9A 3O6GA 2G93A 2DWAA 4JBZA 1OVTA 2I6EA 3FJGA 1IIWA 3UGWA 4YMBA 1JETA 1JW5A 3T93B 4R2FA 1B52A 2D5WA 1XVYA 3VVFA 3TELA 1URDA 2UXAA 3K1MA 3PD9A 3H7MA 1M5FA 4JSOA 3W9VA 2I4BA 4MBPA 2O1MA 4PETA 1UTHA 3CI8A 2ZYMA 4E0WA 5JK4A 4BDRA 1B51A 4GVOA 3MPLA 1F9BA 2H25A 3ONMA 3K01A 4JWXA 3TAJA 4QF9A 4X1DA 4OESA 3MBPA 1XS5A 3HHGA 1MG1A 1SI1A 4ELOA 2H99A 3CSBA 4R6YA 1B5HA 2FA7A 3V5AA 4TOZA 3N26A 4JXIA 2H4IA 1B7ZA 5FHOA 3LSLA 4G68A 5L8DA 1I6BA 3TODA 4NE4A 2V3UA 5ICTA 5M2VA 2W7YA 3GBAA 1YAEA 4YB6A 4AB6A 3VXCA 2H9BA 3S2VA 5CBRA 4ZDMA 5B70A 4F1YA 4EUOA 4K3FA 4I1DA 1H44A 4G8MA 3TUSA 4DZ1A 3USDA 2XX8A 1N0TA 4IO3A 4QSCA 5EHMA 3FVOA 4FECA 3T96B 3PPPA 3SERA 3T66A 3Q26A 4LONB 2Z8EA 2I49A 1EH3A 5I59B 3CFXA 1FTKA 4M1VA 4EQ7A 3WAEA 1NL5A 5BUUA 3FD3A 4RYAA 1EZ9A 2QMWA 2O7IA 3EHSA 1B3GA 4AQ4A 1ATGA 4YKJA 4F18A 3C31A 4NWCA 5CMMA 3B7DA 2H98A 1BTJA 4YAHX 3WAFA 2R71A 3SESA 1UTHB 4ZEDA 1MXUA 4BLAA 5I58A 4C1UA 1OLAA 1TWYA 1DTGA 4EDPA 1IXIA 1B46A 3SEVA 1MXZA 3DP6A 4R9FA 1N3WA 2YPNA 2I3VA 4ZEBA 3IK6B 3FVGA 5H8QB 2ONKE 2Q88A 1AL3A 2NWJA 5TPAA 2A5TB 2Z23A 4HTGA 4PQJA 2ONSA 3M3FA 3DLNA 4EF1A 3W15C 4G8HA 3FUZA 4UA8A 4OFJA 4KYDA 4KCCA 3KOTA 4R72A 1H43A 5HM4B 1OVBA 5AA1A 5I57A 1LAHE 5DVIA 4P0GA 3T9VA 3OSRA 2VOZA 1I6QA 5L9SA 3VLUA 3AXFA 1A54A 3L6GA 4QFPA 4FAJA 3C36A 2HZKA 1I6AA 4AB5A 4HCYA 4GIZA 4DCXA 1OQHA 3BKIB 1IITA 3IOWA 4G77A 4FORA 4U4SA 1CE2A 5H8NA 3MW0A 1JNFA 3KN8A 3LR1A 1RYXA 5KDTB 3OSQA 5AA2A 1UTBA 1ZJLA 2HAVA 3CIJA 1AMFA 5CMCA 3KBRA 1Y3PA 4DXUA 3IB1A 3TTNA 4O3BA 4U2RA 4F3GA 2PT2A 4QHQA 4RNSA 3VV5A 4LP2B 4OFLA 5HPQA 2I48A 3SDFA 2RCAA 2ZMBA 4DDDA 3RN8A 2QJEA 3VXBA 1JW1A 3TPAA 2DWJA 1VFEA 3KZGA 3FXQA 2AL4A 1ANFA 2GFEA 1ZLQA 4ELQA 4DCYA 1NH7A 3SKPA 4OEVA 4KYEA 1NNTA 1IZ1A 3QIMA 3V89B 2F97A 3VFJA 4IGRA 4QSEA 2X26A 2F34A 3PMWA 1LFHA 2VP1A 3FGSA 3DP4A 5EHSA 3QAXA 3Q27A 2ZNSA 1D3KA 3IB2A 4F3BA 4U22A 1RYOA 4LA9A 1MDQA 3H4ZA 3ZKKA 2X7QA 2Y7KA 3KOSA 4I62A 3LUYA 3KGCA 5B7DA 4KI0E 4I8CA 5DEXA 2XX7A 1PBQA 3CG1A 4OVJA 1N3XA 2B65A 4P0IA 4RY1A 1UQWA 1TT1A 1H3DA 1L5TA 4ELPA 3K1NA 4G68C 4L17A 3OOAA 1FQFA 1LFIA 1ZBMA 1XC1A 3OEMA 1Y1ZA 3C34A 1A40A 4DE8A 1SVXB 1LB8A 3IB0A 1N7XA 2XXUA 3MP6A 1AH5A 3CVGA 4YKKA 1MRPA 1XT8A 3MVZA 5AA2B 3K00A 2DOJA 3KSXA 3LSXA 1UTBB 3IOVA 4WKMA 5I84A 1HSJA 4GFRA 3QUJA 4XKNA 2V3QA 2NVUB 4F29A 1IXHA 3RT6B 2RF1A 1MPDA 1MQGA 1B9JA 2Q8JA 3R6UA 1IUDA 3SEYA 2PBWA 2QS4A 1B58A 4LZ5A 2V93A 3IORA 3SEXA 1IEJA 2R6GE 1B5JA 1J1NA 2RC8A 3JZJA 3FASA 1R9QA 1LLSA 2OWTA 3I5OA 2O7UA 3A3CA 2VGQA 2GRVA 2P0SA 3FVKA 4EQBA 4EF2A 5BWJA 5I59A 2P1SA 4UACA 3PU5A 4LUBA 1Z7NE 1MXXA 4P11A 3N6TA 4G4PA 4Z7EA 3FXRA 2HQ0A 5A5XB 3D4CA 2B3FA 4FE8A 3TYHA 2XXYA 4R6HA 3U94A 4ZEIA 1XVXA 3GBBA 4F3SA 3PPNA 4RPOA 1SW1A 1NKXA 1FQCA 3MAMA 2UVIA 1MQDA 2Z8DA 3MVYA 5CM6A 3Q25A 3TQLA 1M5BA 5DEXB 3OXNA 1Y3NA 4BDMA 2WKYA 1B05A 3T9HB 1MY4A 5H8QA 3TEPA 3V8XB 3JV9A 2A5TA 4NWDA 1QKBA 3OO8A 3EHUA 3K4UA 2RINA 1MH3A 1QKAA 3H3GA 1DPEA 2M8CA 4F19A 4F1VA 1SDXA 1TFDA 4R9GA 2AL5A 5K2XA 1Y9UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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