4NF8A

Crystal structure of glun1/glun2a ligand-binding domain in complex with glycine and glutamate in peg2000mme
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
287
structure length
285
Chain Sequence
STRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, receptor
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1
publication title Structural Insights into Competitive Antagonism in NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 81
structure length 285
sequence length 287
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nf8A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nf8A02
1MXYA 3PPRA 1B0HA 4LQ5A 2NOOA 4KYSA 2ZNTA 1S9TA 3U92A 3IB1A 2ZYMA 4FEDA 3RGYA 1MXZA 1B7HA 3K6UA 3MP6A 1LAHE 4NWDA 5I2KB 4M4GA 2G29A 3VDFA 1LGBC 1FQAA 3UK4A 5JTYB 3IJXB 1B7ZA 3L6GA 3PMWA 4JWYA 4DXBA 4G8MA 3IOTA 5FHNA 2Z23A 4E0XA 2F6PA 5I59A 3E9XA 4QSDA 3FVKA 1L5TA 1B1HA 1SVXB 2A5SA 3A3CA 1LBCA 4X1BA 4YKIA 2H5YA 1B3GA 4EF1A 2X7PA 1MG1A 4JDFA 5CBRA 3C33A 4I1DA 1OIBA 2XX7A 1LB9A 5DEXA 3UORA 3SDFA 1H76A 5TP9B 4TOZA 4DIGA 3K1PA 4PFYA 5I56B 2AL5A 3I3VA 1OMPA 4ZDMA 2Z8EA 5TPAB 2I3WA 4ESWA 4QFNA 1B9JA 4R6HA 4OWDA 1B0LA 1POTA 2RCBA 3GBAA 4F3BA 1B7UA 4NF8B 4ECFA 5I57B 1Y1MA 3VFJA 4YB5A 2O7IA 3O2AA 3CG1A 3EN3A 5L9SA 4Z7EA 5HM4B 4U21A 1A7LA 1H43A 3CRBA 4OENA 4ZECA 2THIA 1FQBA 4BDMA 2Q89A 5DT6A 3CFXA 2DSFA 3LC8A 1US5A 4XXUA 5HPQA 2F78A 3H6WA 3KOTA 3OENA 3R7XA 3I6VA 1DSNA 3PGFA 1ELJA 1P1OA 4N07A 4YMAA 4C1UA 4KCCA 3E4RA 2Z8FA 4NE4A 3KJTA 4RPOA 2QS3A 4PQJA 3VVEA 3ONMA 1ZIUA 4F2OA 2V3QA 2DWHA 5IKBA 2B3BA 1LFHA 1SYHA 4ZEIA 2Y7KA 4NF6B 1A55A 4P0GA 1IEJA 2HCAA 1D9YA 3RN8A 1TFAA 2Y7PA 3C32A 1EU8A 3GLBA 3H06B 1P1QA 4RY1A 4I62A 4RYAA 4GXAA 5CMBA 3A09A 3USDA 3ODBA 1SI1A 3IR1A 4G68A 3G3GA 2FA7A 3EHTA 3QK6A 3S4UA 3K01A 3QUJA 4GL0A 2QS4A 2VP1A 2O84X 3K0VA 3Q28A 2YPNA 2QS2A 4R75A 4YAHX 1IXHA 5FTHA 1N7WA 3O6IA 3G3JA 4RPNA 3T93B 3QYTA 1UQWA 3FXRA 2Z22A 1Y1ZA 4ELQA 1SW4A 4H0WA 2QPQA 3KBRA 2P1SA 2OWTA 3S9EA 5I2KA 3F11A 2HZLA 2ANJA 2XXPA 4TQUQ 3V83A 4PFUA 4OFLA 3DP8A 4BDRA 5AA2D 3LUYA 3M3KA 5B70A 3OO6A 1UTBB 5ICTA 2VD2A 4EXKA 3TTRA 2QL3A 2F6GA 2GHBA 5I2NB 3MVYA 2RCAA 3CI8A 3IO4A 4EUOA 3OO9A 3H7MA 3K6WA 3W9WA 3MZBA 2DWJA 1GR2A 3RLFE 3WAEA 4OHNA 5TP9A 3U72A 3MPKA 3O9PA 4GFRA 4PFWA 5I84A 4AB6A 3H03A 5I56A 1NH7A 1B5HA 4F1UA 4THIA 4XKQA 1MY1A 5B7DA 3BFUA 5TPAA 4JWOA 1DOTA 2D3IA 3HPIA 3JZJA 3DELB 1KWHA 4FECA 1GV8A 2DXRA 3IORA 3CSGA 3FIRA 4F3GA 4NF8A 1JVYA 3BBRA 4XKPA 1FTOA 2OCUA 5I57A 4DLDA 3KJ7A 1CB6A 4XKRA 4ISUA 1ZJLA 5CI5A 4YZZA 2F34A 1LBBA 3TODA 1Q35A 3LSWA 4OTEA 2F7CA 2O69A 1D9VA 4G8NA 4DCXA 4YB6A 1Y4TA 1Y3PA 1M5BA 3H6VA 2F36A 1AH5A 2FYIA 1VE4A 1QUJA 1B2HA 4QF9A 1LAFE 3TYHA 2QJEA 4EXLA 4KFQA 1DMBA 4F29A 2Y84A 1FQDA 3SEYA 2Q2CA 5IAIA 3PPNA 4Q30B 4C1TA 4EQ7A 2ZYKA 4QFOA 3MZ1A 1RYXA 1NH8A 4OZ9A 3T9UA 4M1VA 2QSXA 1VR5A 3O29A 3UIFA 3BKIB 3N6TA 1FTLA 2V3TA 1TXFA 5HBCA 4MLQA 1B3FA 4OERA 4NF6A 2PT2A 1XVYA 3FV2A 3TELA 1POY1 2OJTA 3FXUA 2PVUA 3Q26A 4P0IA 1AL3A 2XXUA 4BDOA 3TTLA 1B52A 3GXAA 3FXQA 4U22A 1J1NA 4BDLA 2GHAA 2PT1A 1YCJA 1SI0A 1N04A 1AMFA 1FTJA 2AYSA 4AQ4A 3K6VA 1PC3A 1FTKA 4N6PA 2NUVA 1UIUA 1LLSA 2REGA 2FNCA 1XS5A 3O28A 3D4GA 4KR5A 1SBPA 3FJGA 1H44A 1LCFA 2VHAA 3G3KA 1I6AA 3PUWE 2DS9A 4DE8A 1EZOA 3MW0A 1MDQA 2Q2AA 2DXYA 2DOJA 2RC8A 4GL8A 1MQDA 2R6GE 3LBSA 3UN6A 4GWOA 2IA4A 1MPBA 3K1NA 3V89B 4FJPA 2Q8JA 1UTBA 1FCKA 2V93A 3ILTB 4H65A 1PB8A 1UIVA 4UA8A 3TCGA 2IEEA 5K2YA 1XOCA 1EZPA 2DQVA 2OBGA 1QVSA 2QS1A 3KG2A 4U4SA 3BFTA 5I2NA 3ZS6A 1USYE 3MWBA 4NF5B 3SEVA 5ISUA 1FQCA 1IXCA 4JSOA 1USYH 2ONSA 3FATA 1Y3NA 1HSEA 3T66A 1I6QA 5TU0A 1B51A 3PUZE 3QUFA 2H9BA 4MF3A 3KSXA 4H8IA 2H99A 4F22A 4Z0IA 4IO2A 1IIWA 1OLAA 3KN3A 3L6HA 4KCDA 4R2FA 2UXAA 1N0TA 1MPDA 1B6HA 1B4HA 3JYRA 1B3EA 4LATA 2XXHA 4F39A 3HN0A 3TFLA 3IOWA 3PMVA 1F9BA 3B6TA 4DDDA 1B5IA 1I69A 3FV1A 3MVZA 1OQGA 2LAOA 4WKMA 5EHMA 2HAVA 5I58B 3WAFA 3OSQA 4YKJA 3T22A 3V8XB 3N6UA 2XXQA 3U1OA 1B1XA 1IUDA 4TLMB 2GRVA 4G8HA 4R9FA 3B6QA 4R73A 1S7YA 5J1DA 5CMKA 2F7AA 1JETA 2HZKA 2F97A 3O6HA 2V84A 4U4XA 4HW8A 5AE4A 4WEPA 4KI0E 4F18A 1I6BA 2E1SA 3S9NC 2X7QA 1MXWA 1GGGA 5ITPA 3TEPA 3IJOB 4OVJA 5ICQA 1M5EA 2XD3A 1MY3A 1B32A 3FJMA 3T96B 3MC2A 1B5JA 4G2ZA 5A5XB 4Q0CA 4KYDA 2P2AA 2V25A 3PV0E 3S9MC 1SW5A 2I0CA 1B3HA 1LAGE 2WKYA 1FW0A 2KLFA 1VSOA 1M5CA 3VE1B 3IB2A 2Q88A 4KPTA 3K4UA 4F3SA 3GZGA 2QMXA 3OEMA 4JBZA 3FJ7A 1P99A 1N7XA 3OXNA 5DTBA 4F3PA 5FHOA 2HXWA 4IY5A 2Y7WA 1H3DA 3TMGA 3C34A 5AA4B 3UP9A 3KZGA 1ZLQA 4OESA 3OD7A 1R9QA 5CMCA 4R72A 1P1WA 2GH9A 3MVXA 1Y3QA 3IL1B 1JW5A 4KD5A 1JW1A 2XXTA 1MPCA 3U8QA 4ND9A 1RKMA 4RJZA 2DWAA 3FZVA 4QSEA 2BJJX 3A3UA 3C4MA 1URGA 1QULA 1BIYA 1IZ1A 4K3FA 4FIMA 3CIJA 2OLBA 5DVJA 2B65A 4EDPA 3VVFA 3PUXE 1DPPA 3EHSA 4X9TA 4OMBA 3CFZA 2I4CA 1AOVA 5H8SA 3TTNA 4EQ9A 3CVGA 1TWYA 3N94A 2RKMA 3OELA 4DCYA 1IQ7A 1MXVA 4ZZEA 3HO7A 3KFMA 1MY4A 4HTGA 1LCTA 1OVBA 3IOUA 1PEBA 3H6UA 4IO7A 2VGQA 3E3KA 2A5TB 4BDQA 4NF5A 3PUYE 2H25A 1Z7ME 1Y20A 3RT6B 3RTFB 5DYHA 4E0WA 3EPEA 5F1QA 3U94A 1MXXA 1MH3A 4ESXA 3G3IA 3RNNA 2VOZA 1FQFA 1OLCA 1ANFA 4F1VA 2DP8A 4DXCA 1URSA 4XKNA 3B6WA 2UVHA 3TZAA 3K02A 4U2RA 4X48A 5H8FA 2F5XA 5BUUA 2I4BA 3OOAA 1TT1A 1NMUA 1MM7A 4YKKA 3DP6A 2OWSA 1A8FA 4ELPA 1A54A 3MUQA 5I58A 4IGRA 5K2XA 1S50A 3SKPA 4R9GA 2I3VA 3AXFA 1N3WA 3KGCA 1JEVA 2UVJA 2DE2A 5KZTA 2NXOA 3CFLA 3HCQA 2GFEA 4FORA 1JEUA 3M8UA 1ZU0A 4JWXA 1NNKA 1MRPA 4FE8A 4WXJA 3LSXA 4RXLA 2DVCA 2M8CA 1XHYA 1LFIA 2XXVA 3OMBA 3QAXA 3U93A 2H4IA 1N76A 4KQPA 1M5FA 3VLVA 4O3CA 4I9DA 4RNSA 3C9HA 1Q1KA 3UA8A 3T9XB 1MDP1 3SERA 1XC1A 4H8JA 5A5XA 1FQEA 4BDNA 4POXA 3O66A 1AIVA 2OK2A 2HEUA 1WVJA 1P1NA 1ATGA 1SQYA 2ZMBA 3OSRA 3DM0A 5BWJA 4ZEKA 2HFBA 4FAJA 3C31A 4QFLA 1IITA 4ZS9A 3G3FA 3TTKA 4F1YA 1LB8A 1QUIA 1PBQA 3OO7A 1B3LA 4PETA 3Q25A 5AA4A 2I0BA 3SEXA 2O51A 3TCHA 1MY0A 2ABHA 2XXIA 3EF7A 5DVFA 1EH3A 2XX9A 2HQ0A 3O6GA 3QXMA 2O1MA 2UVIA 4H6DA 3ZSFA 4F19A 4O3AA 3W15C 4OXVA 1NNFA 1MY2A 3ZKLA 4GRKA 1HSJA 1MQIA 1JNFA 2ZNSA 1VFEA 4ZZAA 4GIZA 1SW1A 1WDNA 3RUMA 4ONYA 3QSLA 3T9VA 3OO8A 3MVWA 5F7VA 4WEDA 5H8NB 3MP8A 3IB0A 4IO6A 4KHZE 5ITOA 2D5WA 2RINA 2PMSA 4KYEA 4MH5A 4LZ8A 3Q29A 4YB7A 5ELVA 3ECRA 2DE3A 1JW4A 3R26A 3TDJA 3PPOA 3IAZA 2ALUA 1II5A 4R6YA 2F8DA 2A5TA 3SEWA 3CG3A 4ZE8A 3KOSA 3K6XA 5AA3A 2Y7IA 2ONKE 1NKXA 3G7WA 5EYFA 4NF4B 4G77A 5M2VA 1SW2A 4H5FA 3T9HB 2ESNA 4OFJA 2CZLA 4H67A 4Q8RA 1DPEA 1MM6A 3TQLA 3QIMA 4P11A 3FUZA 4MLVA 5CMMA 4QRZA 4PP0A 1PDAA 3LSLA 3G3HA 3C35A 3SETA 2NWJA 3KEIA 3PPPA 5LOMA 1MQJA 4DXUA 1P1UA 4JXIA 3ZKKA 5H8FB 4C0RA 3C36A 1PB7A 3FD3A 1JQFA 1M5DA 1DTGA 1D3KA 2O7UA 3PD9A 4LQ2A 1US4A 3TAJA 5AA1A 3FVOA 1Y4CA 2ONRA 3OEKA 1HSLA 3RY3A 1ZMGA 2UYFA 4QFKA 3GBBA 3K1MA 5FTIA 1MQHA 1OVTA 4EF2A 4O3BA 4F31B 1A8EA 3EHUA 2XD2A 4LP2B 2ZYOA 3PMXA 3THIA 1IXGA 1UTHB 3N5LA 1R6ZA 4QHQA 1IXIA 2O6AA 2ZNUA 3S2VA 1EZ9A 4ZE9A 1BTJA 3M3FA 4QFPA 2Q9TA 3PUVE 3TKDA 3TUSA 4IB2A 4H1XA 4LA9A 1LSTA 2XX8A 4YKPA 4PE5B 2ZYNA 5L9OA 4H5GA 1OQHA 4U1ZA 1QUKA 2YLNA 4NTLA 4GVOA 1YPNA 3TCFA 1Z7NE 4GXSB 1MH4A 1QJMA 2DWIA 2AL4A 5AA2B 2UVGA 1LAXA 1NL5A 3R6UA 3I5OA 3TTMA 2I6EA 4POWA 2R71A 5H8QA 2RF1A 3E13X 5KDTB 1T0KA 1RYOA 4HS7A 1URDA 3RPWA 2QMWA 1WODA 5KCJB 4ELOA 4IGTA 4ZEBA 3D4CA 4NWCA 2B3FA 4YICA 4DZ1A 5DVIA 5H8HB 1R9LA 1QW0A 3IX1A 4OEVA 4GF8A 3N26A 3MJNA 3MP1A 3H4ZA 3SEUA 3CSBA 1XT8A 3MAMA 4NEDA 3TPAA 1QKBA 1SD3A 2E0SA 2F35A 1PBPA 4ZEDA 3O97A 1N3XA 3RQTA 2DVZA 1BP5A 2I49A 4QSCA 2D21A 1GVCA 4AB5A 5H8NA 3Q27A 1SYIA 1BKAA 1O7TA 1CE2A 4JSDA 4XTCQ 1XVXA 4YU0A 3EQ1A 1B58A 2XHDA 1BLFA 3VXCA 4BLAA 4IO5A 3H3GA 4GQOA 3DLNA 2XXXA 1VFDA 4X1DA 3MQ9A 3HHFA 2I48A 2PYYA 1YTVA 3KN8A 5L9MA 4N13A 1B4ZA 1N84A 2UYEA 3PD8A 5CRYA 1MQGA 1PB9A 5JTYA 4PFTA 3S9LC 5CC2A 4R6KA 4NF4A 5I59B 3FASA 4FEBA 4F2QA 4YMBA 1B40A 1D4NA 4GLIA 3M3LA 3VV5A 2W7YA 5EHSA 3PPQA 1A99A 2DE4A 4JB7A 4G68C 3TQWA 3FVGA 3DP4A 3UGWA 1ZKBA 4ZEFA 2AIXA 4XIGQ 1SDXA 1O64A 1GTKA 1MXUA 2RC7A 5DEXB 2ZXTA 4EQBA 3K00A 4G4PA 4MBPA 3HHGA 1DTZA 4TLLB 4LZ5A 4OFOA 3B7DA 5CBSA 4RK2A 3LSFB 3IOVA 2O68A 1LFGA 5JEIA 4UACA 2NVUB 3MPLA 2XXRA 3VXBA 2O1LA 1QKAA 1JVXA 4I8CA 2CMOA 1B46A 4LZ7A 2PBWA 4FATA 3MBPA 1UTHA 2RC9A 3FGSA 2Z8DA 2PX1A 3W9VA 1MS7A 4L17A 3LR1A 4LVQA 4HCYA 3V5AA 1TFDA 2YJPA 3K2DA 4NMYA 1R1NA 1ZBMA 4HCWA 2P0SA 3IK6B 4OYVA 4R74A 1A40A 5CM6A 4GD5A 4OQOA 4Q5TA 1ZTYA 3FVNA 3MZ9A 1Y9UA 4LUBA 4OEUA 4OETA 3RTWB 2V3UA 1NNPA 2G93A 4IO4A 5AA2A 3HSTA 4MFIA 3RT8A 5JK4A 4ELRA 2I58A 2R9JA 5L8DA 3VVDA 3HV1A 5H8QB 2DYXA 5KDTA 4U1OA 1NFTA 1NNTA 4R2BA 2XXYA 2VD3A 3VLWA 3KN7A 2QRYA 5KCJA 2HAUA 2Y7RA 5H8HA 2REJA 4IO3A 2XXWA 3IO6A 3VLUA 3SESA 2H98A 4LONB 2X26A 4U23A 2OZZA 1FTMA 4RK9A 1B05A 3PU5A 3KSJA 2F7BA 3ILUB 1YAEA 1H45A 1O63A 3P7IA 4GOTA 3H6TA 4G68B 4RA1A 4IY6A 5FHMA 3JV9A 3CR9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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