4NF8A

Crystal structure of glun1/glun2a ligand-binding domain in complex with glycine and glutamate in peg2000mme
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
287
structure length
285
Chain Sequence
STRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural Insights into Competitive Antagonism in NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1
molecule tags Transport protein, receptor
source organism Rattus norvegicus
total genus 81
structure length 285
sequence length 287
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nf8A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nf8A02
5HPQA 3OENA 1H76A 3H06B 3TFLA 1BP5A 3ONMA 1SYHA 2W7YA 1M5CA 4N07A 2DP8A 1MY3A 4QRZA 1Y20A 4NF6B 1Y3NA 5CMKA 4OEVA 5I58B 4R72A 3PPRA 4FAJA 1MS7A 4OZ9A 1EU8A 2OZZA 5AA2D 4H6DA 4IY5A 2NXOA 2PT2A 3CG3A 4TQUQ 4QFPA 3FGSA 1Q35A 3M3KA 1SI1A 1OVTA 3ILUB 3O97A 1A8FA 2XXQA 4FECA 4OXVA 4ZEDA 1MXZA 3OO8A 3Q27A 3I3VA 2VGQA 4ZE8A 1H45A 1WDNA 5L9SA 1FQBA 3THIA 5FHOA 5AA3A 3LSLA 3KN8A 4OESA 4F39A 2CZLA 1D9YA 1ZU0A 4P0IA 3QXMA 1TXFA 1B5JA 1SW1A 1NFTA 3CI8A 3FVKA 5M2VA 5BUUA 3MQ9A 1R6ZA 1B7UA 3PUWE 3G3IA 1HSJA 1LGBC 5JTYA 3H6TA 5ELVA 3M3LA 3LC8A 1AOVA 4EUOA 3VDFA 4OTEA 3QAXA 1Q1KA 4H5FA 2D3IA 4OERA 1IIWA 3SKPA 3FIRA 3PPOA 1LAGE 4G8NA 4DIGA 4R75A 3C4MA 4KFQA 1J1NA 3TMGA 3FVGA 4KYSA 4GWOA 3WAEA 3ODBA 2IEEA 3E9XA 1YCJA 4OFJA 3USDA 2I49A 4FEDA 1MY4A 4Z7EA 5JEIA 1B7HA 5AE4A 1BIYA 1MM6A 4JDFA 2XD2A 2D21A 1L5TA 5JTYB 4QF9A 5I2KA 4DXUA 1IXCA 4KR5A 3HSTA 1JVYA 2AL4A 4PFYA 1Z7ME 1D4NA 2HFBA 3N5LA 3IAZA 5F7VA 4OFLA 4GL8A 4KQPA 4JSOA 3IB2A 2OWSA 1A99A 3FJMA 5CM6A 3TTRA 2M8CA 5FHMA 3KBRA 3BFTA 4YKIA 4MLQA 4H67A 5AA2A 4EQBA 1LSTA 3T22A 2ZYKA 1Y3PA 5ITOA 4MLVA 4FIMA 4R6HA 3GZGA 5K2XA 4H1XA 2I58A 2GRVA 5FTIA 5I2KB 2X7QA 1S9TA 2Q89A 1N3WA 3RN8A 3UGWA 4BLAA 3KOSA 3H03A 1MPDA 1TFDA 3CFXA 2BJJX 2QL3A 1DTGA 2I4CA 2DYXA 3FASA 3IOUA 3EN3A 2VD3A 2Z23A 2O68A 5DEXA 2ONSA 3JV9A 4OVJA 1I6QA 3TDJA 2Q88A 2ZYMA 2UVHA 4ESWA 1MH3A 4HS7A 4QSDA 4DCXA 5AA2B 2OCUA 3O66A 2RF1A 2H9BA 2O51A 3TUSA 3OOAA 3PUZE 1XC1A 3HO7A 4F3SA 4O3BA 1URGA 4YMAA 4G4PA 3R26A 1PC3A 4U1ZA 3LSWA 3PUXE 3QUJA 1LAFE 3RPWA 4NMYA 4KI0E 1LB8A 3O6GA 1AH5A 2O69A 3O6HA 1HSLA 3L6GA 2V3TA 1B3LA 3PUVE 1MQHA 4OYVA 5I2NA 3TTNA 1M5DA 3PPNA 3C36A 2OK2A 5DEXB 1II5A 1PB9A 1GV8A 1LLSA 4F22A 4GQOA 3KOTA 1WODA 4HCWA 3EF7A 4DLDA 2RINA 4R9GA 1P1QA 2Y7WA 1ZBMA 3Q29A 4H0WA 1XT8A 1IXHA 3TCHA 4RJZA 2Y7KA 3ZSFA 3ZKKA 1FTLA 2O1MA 1ZTYA 4POXA 1IEJA 3PD8A 2I3WA 2D5WA 2DOJA 3A09A 1Y4TA 4LZ5A 3K2DA 1LCTA 2XHDA 2F97A 1MXWA 2H4IA 2Q2AA 1TFAA 1B52A 3O9PA 3PGFA 1LCFA 4THIA 5KZTA 4PE5B 3RGYA 4JBZA 4R6YA 5B70A 4GRKA 1GTKA 5HM4B 3N94A 4LONB 3FUZA 4WKMA 1A7LA 3CVGA 3KSXA 1LFGA 4MH5A 1VR5A 2YJPA 4MBPA 2I0BA 1VFDA 4LA9A 3TTLA 1PEBA 3VLVA 4DE8A 3K6UA 1B3HA 5L9MA 2PYYA 3TKDA 5L9OA 3EQ1A 1SI0A 1ATGA 2AL5A 3KN3A 1QKAA 1ANFA 5KCJA 3O28A 1QUIA 1LAXA 2Y7IA 2HCAA 3FXUA 1H44A 5I59A 2GHAA 5L8DA 4X1DA 1QKBA 1SW5A 2I4BA 2F8DA 2XXIA 2RC9A 3S9EA 3D4GA 1PB7A 3V5AA 2QMWA 1MPCA 3QIMA 1FQCA 2UYEA 1B0LA 4IGRA 2XXVA 5CBSA 5HBCA 3Q26A 4ELQA 3T66A 3K01A 3K02A 1NKXA 3AXFA 3SDFA 2Y7RA 4G77A 1OMPA 1NH8A 4AQ4A 3PV0E 2PX1A 5KCJB 2ZYOA 2ESNA 4YB5A 5IKBA 3F11A 1ZJLA 4RA1A 4DCYA 2HQ0A 1VSOA 2PBWA 3S9NC 5IAIA 2RC7A 5I59B 3JZJA 3B7DA 4Q0CA 2NWJA 1DOTA 3VE1B 3PPPA 3D4CA 3MZBA 1Z7NE 4ELOA 2OJTA 4ZEKA 1ZKBA 2HAVA 2OLBA 4G8MA 4LP2B 3MP8A 1P99A 3DLNA 4EQ7A 5CC2A 1R9LA 5CMCA 3IOWA 3K1NA 4NE4A 2FYIA 3W9WA 2DVCA 3KN7A 3JYRA 3FVNA 4L17A 3IK6B 5JK4A 4IGTA 4I1DA 4LZ8A 1S50A 3FXRA 3RT6B 4ECFA 1MDP1 1URSA 4NEDA 1PDAA 1Y3QA 4AB6A 4IO4A 3K1MA 3TCFA 1NL5A 1B6HA 3SERA 1NH7A 4NF8A 1N3XA 3H3GA 1B3EA 3HV1A 3MC2A 4ELPA 4U23A 2R71A 4PFUA 1H3DA 4P0GA 4DDDA 1B58A 2A5TA 4R73A 3O6IA 3TQWA 3LSXA 4M1VA 2HZLA 4KCDA 5DVIA 2XX7A 4YU0A 1A54A 4G8HA 4C0RA 2I48A 4F2QA 2I6EA 4DZ1A 4EXKA 1S7YA 4KHZE 1A40A 2R6GE 3IX1A 3OD7A 4KYEA 1P1UA 1US4A 4G2ZA 1QVSA 4JXIA 3VVEA 1USYH 1GR2A 4BDOA 3QSLA 1P1OA 2NUVA 5CI5A 4NF8B 1H43A 3ILTB 1LBCA 3ZS6A 1D3KA 2Q2CA 2DXRA 3BBRA 4U22A 2A5TB 2E0SA 3HCQA 2B3FA 3CSBA 3OELA 4ZZEA 2QS1A 3PPQA 1FQEA 3G3KA 1B5IA 3MAMA 2XXXA 4GF8A 2F6GA 3IJXB 3MVWA 3C9HA 4QFLA 1JQFA 2ZNUA 3N6TA 3A3CA 4EQ9A 3HHFA 2B65A 1MQDA 1FQFA 2F7AA 1IXGA 4FORA 1SD3A 4F31B 4H65A 1MH4A 2XXRA 3MP1A 4NWCA 1BKAA 4E0WA 4AB5A 3MZ1A 1ZIUA 1AMFA 2F5XA 3FVOA 4QFKA 3T93B 3UA8A 4BDLA 3UK4A 1UTHA 1JNFA 1N84A 3IO4A 1UTBA 4O3AA 3EPEA 3IORA 3MVZA 4QFOA 4QFNA 5FHNA 3RTFB 3DP6A 2ZNSA 4NWDA 4F18A 3GBBA 3PMWA 1F9BA 1SYIA 2VHAA 2Q9TA 1JW1A 4OETA 1POTA 1IXIA 4U4SA 4R2FA 4H8JA 1B32A 4R6KA 1MPBA 1O7TA 1VE4A 3KSJA 1NNKA 3TTKA 4ISUA 2Z8DA 3W9VA 1ZLQA 2IA4A 1B1HA 5CMMA 4RPNA 1IITA 1FW0A 1QW0A 1N7XA 4JWXA 4U2RA 3C32A 1JEUA 1Y4CA 3RTWB 1UTHB 1UTBB 2H99A 1MXVA 3R6UA 3VVFA 2NOOA 1ZMGA 4HW8A 2UVIA 3T9XB 5CBRA 3OEMA 3S2VA 3PU5A 3C35A 3SEYA 5H8NA 3UP9A 3ZKLA 3BFUA 4I62A 1XOCA 3FV1A 4BDNA 3VLWA 3U1OA 4TLLB 2P0SA 4G68A 1Y1ZA 4Z0IA 4EXLA 1OQGA 4F2OA 1B7ZA 1MQJA 3KJTA 2VOZA 4RPOA 1DMBA 4GLIA 3SEVA 2DWAA 1JETA 4FE8A 3O2AA 4F1UA 4OEUA 4ZDMA 3HHGA 4H5GA 1PBPA 3TPAA 4YKJA 3FZVA 3V8XB 5H8SA 4YB7A 4PP0A 3P7IA 3DM0A 2XXYA 4MFIA 1MXUA 2Z8FA 2DS9A 2UVJA 4POWA 4KCCA 3B6WA 2XXTA 3SESA 3U93A 1MXYA 4XKNA 2I3VA 2XXPA 3CR9A 4PFWA 1BLFA 3RUMA 4IO3A 3LBSA 4Q30B 4WEDA 4G68C 1UQWA 3T96B 4E0XA 4K3FA 5H8NB 2QMXA 1MG1A 1TWYA 3E3KA 3CG1A 3I5OA 2V3UA 4G68B 4RYAA 3RY3A 4OWDA 1PB8A 2DXYA 5AA4A 3R7XA 2V3QA 1NMUA 4KPTA 1ELJA 5EYFA 1O64A 4IO7A 2F34A 3OEKA 2F35A 3TZAA 1EZ9A 2DSFA 3KGCA 2ZXTA 3E13X 3VFJA 2V93A 3DP4A 3C34A 4JB7A 2GHBA 1MM7A 1NNPA 3VXBA 4BDMA 3MJNA 4QHQA 4JWYA 3MZ9A 1SW4A 2WKYA 5KDTA 2YLNA 3T9HB 1M5BA 3G7WA 1UIVA 4C1UA 4RXLA 1RYOA 4YICA 3K1PA 1FTJA 2QJEA 1UIUA 2VP1A 1LBBA 3U92A 2ABHA 2A5SA 1B4HA 1XHYA 4I9DA 1QJMA 3RLFE 5H8FA 5EHSA 2X7PA 1YTVA 3KEIA 2F36A 3U72A 1M5EA 5AA4B 4IO2A 3MBPA 4UA8A 1OIBA 2ZMBA 5DTBA 2F6PA 3CFLA 3RNNA 1CB6A 4U1OA 1OQHA 5TU0A 3OO9A 2PT1A 5H8QB 1IZ1A 3E4RA 4NF5A 3FD3A 5FTHA 1DTZA 1AL3A 3B6TA 1JVXA 2Z22A 3CRBA 3MVYA 1URDA 1NNFA 4EF2A 3TYHA 3IB1A 4LUBA 5KDTB 3CIJA 4PQJA 2I0CA 5EHMA 1XS5A 2QRYA 2PMSA 4ZEFA 4ESXA 2XX9A 1B46A 4XXUA 1IUDA 3C31A 3ECRA 2UVGA 3IL1B 3OSRA 2RCBA 5H8FB 4F3PA 4EDPA 1N76A 1A55A 1N7WA 5CRYA 1MXXA 1RYXA 4F1YA 4F1VA 1SDXA 3U8QA 5ICTA 1B0HA 4NTLA 1DSNA 2QS2A 1POY1 3G3HA 3GBAA 4YAHX 3MWBA 2ALUA 1GVCA 4YKPA 4NF5B 2ONKE 2XXHA 3IB0A 4WEPA 3SEUA 3SEWA 4RNSA 1MRPA 4JWOA 3IOTA 3TQLA 4F3BA 4IO5A 3H6UA 1B2HA 1SBPA 3KZGA 4X1BA 3DELB 3PUYE 3QK6A 4O3CA 1FCKA 4GVOA 4OQOA 2RC8A 1FTMA 1FTOA 4LATA 2RCAA 2O1LA 5AA1A 4X9TA 3K0VA 3Q25A 3SETA 4XTCQ 2THIA 4ND9A 3K4UA 4JSDA 2OWTA 1T0KA 5ICQA 2CMOA 1JEVA 2UYFA 3TODA 2F7CA 2O7UA 2DE3A 4N13A 4XKRA 1MQGA 5J1DA 1Y1MA 3Q28A 1YAEA 1A8EA 1LFHA 2FNCA 3V89B 1M5FA 4IY6A 5CMBA 3VXCA 4RK9A 1AIVA 2G93A 2O84X 3V83A 1O63A 3S4UA 3QUFA 1TT1A 1B3GA 1XVXA 4M4GA 3IOVA 1SQYA 4OMBA 4I8CA 3UIFA 3MP6A 1N0TA 2F7BA 2Y84A 2V84A 2QPQA 3OO7A 5I84A 3B6QA 1Y9UA 3K6WA 2DE4A 3BKIB 4H8IA 1DPEA 3VLUA 2G29A 4GD5A 3S9LC 1B4ZA 4XKQA 2R9JA 1D9VA 5DT6A 3GXAA 3LSFB 1HSEA 1KWHA 5ISUA 2DWJA 3VV5A 2DVZA 2O7IA 3OO6A 1OLAA 4ELRA 4XIGQ 4DXBA 2ZNTA 3N26A 1SW2A 3PD9A 4BDQA 1JW5A 2HEUA 5DYHA 3TTMA 4OFOA 3K6VA 4YZZA 3UN6A 4ZE9A 3MPLA 3EHTA 5DVJA 1WVJA 2ZYNA 2RKMA 3IJOB 5K2YA 5F1QA 4OHNA 1I69A 4XKPA 1QULA 4ZEIA 1B51A 2KLFA 2GFEA 5H8HA 1MY1A 4WXJA 3IR1A 5TP9A 1VFEA 3M8UA 3U94A 3TCGA 2B3BA 3EHSA 1R1NA 4ZS9A 1BTJA 4GL0A 3LR1A 4RK2A 2LAOA 3PMXA 1MQIA 1B05A 3UORA 3G3GA 2DE2A 5A5XA 4GIZA 3MVXA 3O29A 2QSXA 1MDQA 5TPAA 2HXWA 2REGA 1FQDA 1OVBA 1EZOA 3OMBA 3T9UA 2P1SA 3RT8A 2YPNA 4ZEBA 4LZ7A 1B9JA 4LQ5A 1SVXB 4GFRA 1B1XA 3OXNA 2HAUA 2GH9A 4EF1A 2H5YA 1YPNA 1I6AA 1P1WA 4FJPA 3H6WA 5H8HB 4YB6A 4HTGA 5TP9B 4F3GA 3LUYA 5LOMA 4NF4A 4GXSB 5B7DA 4KD5A 5I56A 1R9QA 4R74A 4PFTA 4UACA 2F78A 2E1SA 2FA7A 3CFZA 3CSGA 3RQTA 1MY2A 4Q8RA 2VD2A 4R9FA 5A5XB 5I57A 1MY0A 5TPAB 1DPPA 5BWJA 1I6BA 4DXCA 1NNTA 3KG2A 3HPIA 2NVUB 4IB2A 4BDRA 2Y7PA 3QYTA 3G3JA 4N6PA 4YKKA 3L6HA 1PBQA 2QS3A 4GOTA 4ZECA 4U21A 1P1NA 3TAJA 4QSCA 4OENA 4MF3A 2Q8JA 3H7MA 3N6UA 3MW0A 2XXWA 1OLCA 3H6VA 4F29A 4Q5TA 1EZPA 3FJ7A 1LFIA 3TEPA 4HCYA 1LAHE 1N04A 4ZZAA 2AIXA 4NF4B 4U4XA 2HZKA 2REJA 5I56B 2DWHA 4F19A 3A3UA 2XD3A 4P11A 2XXUA 4R2BA 3KFMA 1FTKA 3K6XA 2P2AA 1FQAA 3PMVA 3W15C 3C33A 2XX8A 5I57B 5I2NB 1B40A 1B5HA 4X48A 3H4ZA 3SEXA 3M3FA 1LB9A 3MPKA 1USYE 2X26A 4LQ2A 2V25A 3FATA 4GXAA 2OBGA 3WAFA 4YMBA 3VVDA 2DQVA 3MUQA 4TLMB 2AYSA 3FXQA 5H8QA 1US5A 2ANJA 3TELA 1XVYA 3I6VA 5ITPA 2QS4A 3K00A 4LVQA 1EH3A 2ONRA 4FEBA 4NF6A 2H98A 3EHUA 4C1TA 5I58A 4PETA 3GLBA 3OSQA 4KYDA 2PVUA 2UXAA 3FV2A 3DP8A 3IO6A 1QUKA 4IO6A 1B3FA 1GGGA 4FATA 4QSEA 1IQ7A 1CE2A 3T9VA 2O6AA 3KJ7A 3S9MC 2H25A 4TOZA 1RKMA 2DWIA 4ONYA 5DVFA 1QUJA 3G3FA 4RY1A 3FJGA 1JW4A 3HN0A 2Z8EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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