4NF8A

Crystal structure of glun1/glun2a ligand-binding domain in complex with glycine and glutamate in peg2000mme
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
287
structure length
285
Chain Sequence
STRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFCIDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLTILVKKGTRITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVELSTMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKSHENGFMEDLDKTWVRYQE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transport protein, receptor
molecule keywords Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1
publication title Structural Insights into Competitive Antagonism in NMDA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 81
structure length 285
sequence length 287
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nf8A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4nf8A02
2Q8JA 3GBAA 2NXOA 5CBSA 1SD3A 3KN8A 2D3IA 4BDOA 1GGGA 4ESWA 2DWIA 1N7XA 3FD3A 5AA2A 4RNSA 2GHBA 3T22A 2P2AA 4KCDA 1FTLA 2X26A 4JWXA 1GR2A 1LAHE 4EXLA 4NMYA 2Y7WA 4UA8A 3IOVA 3BFTA 1FQBA 2DOJA 4F1YA 4R2FA 5TPAA 5CI5A 5DEXB 4F3BA 2QL3A 1YAEA 3RY3A 1LAXA 4YAHX 4E0WA 4PFTA 3H6UA 3IB2A 3DP4A 4P0IA 4LZ7A 2XXPA 3E9XA 4N6PA 4H0WA 5JTYB 2I0BA 4P11A 5KCJB 3T93B 1LAFE 1LCFA 2DXRA 4U4SA 2E0SA 3AXFA 1XC1A 1TWYA 3OOAA 2Q2AA 3VVDA 3N94A 2LAOA 3HPIA 2ZYNA 2PT2A 1P1UA 5K2XA 4KYDA 1QVSA 5AA4B 2DE4A 2OZZA 4Q30B 3PUZE 1A40A 5DTBA 2ONRA 4DLDA 3KBRA 5I58A 4X48A 5EHSA 3KSJA 4F18A 1USYH 4FIMA 4GIZA 3P7IA 1IEJA 4ELQA 3I6VA 1URSA 3PMXA 1JW4A 3TAJA 4EF2A 2Z23A 1M5FA 3RPWA 1MXZA 2XXIA 4EUOA 4NF5B 2E1SA 2H4IA 3C36A 2Y7RA 4RYAA 2XXXA 5ISUA 3O6GA 3GBBA 5AA1A 2DWJA 4OWDA 1URGA 1IUDA 3H6VA 3WAFA 4KD5A 3V8XB 5KDTB 2G93A 3VLUA 4QFOA 3RUMA 1DPEA 2HQ0A 5HPQA 3TTNA 1F9BA 1J1NA 3C31A 5DT6A 2Q89A 4BDQA 2ANJA 2I49A 3DP8A 3UGWA 1B3LA 2F6PA 3HO7A 1FQCA 4GF8A 4KQPA 1B2HA 1S50A 5I56B 2O84X 2OJTA 1B58A 1YTVA 3I5OA 1MM6A 3USDA 2CZLA 5H8FA 3FXQA 2F7BA 1OVBA 3H6WA 1RYXA 1MQJA 1B9JA 4NF4B 3D4GA 4U2RA 1DMBA 4YICA 1POY1 4TQUQ 5HM4B 3MP1A 4MF3A 4OEVA 1P99A 4R2BA 3CFXA 4KI0E 2HZKA 4RPNA 4L17A 4XXUA 5F1QA 5H8HA 4AB5A 2ZYKA 4NF8A 4MLQA 1HSLA 3A3UA 4ZEIA 1ZIUA 4G4PA 1CE2A 2Y84A 1B52A 3MVZA 3U8QA 3KJTA 4HW8A 5DVJA 3W15C 4FATA 1B7HA 1UTBB 2WKYA 3OD7A 4IB2A 1H76A 3FXRA 3UN6A 5CMMA 3SETA 5H8NA 3SESA 4BDNA 3CSBA 5H8QB 2NOOA 3WAEA 1LFHA 5L9MA 4FAJA 5DVFA 1Y4CA 1MG1A 1QKBA 2Y7KA 4LQ5A 1IITA 2DXYA 3MVYA 4DDDA 1B7ZA 1UTHB 2XXHA 3VLVA 3GXAA 4M4GA 3HSTA 5HBCA 2X7QA 3O97A 4RK2A 2PX1A 3PU5A 1D9YA 4JWOA 2QPQA 2DWAA 1DOTA 4RY1A 1NH8A 3SEUA 3TFLA 1US5A 2HEUA 3JZJA 3ONMA 4QHQA 3Q27A 4H6DA 1B3FA 1ZBMA 4NTLA 1LGBC 4O3BA 3IK6B 4E0XA 3G3HA 4HCYA 3K2DA 2W7YA 1LB9A 5L8DA 3E4RA 1EU8A 3C33A 5I59A 3S9LC 1N0TA 4IO2A 2A5TA 3C35A 4OMBA 3RTFB 3MUQA 2PT1A 4MFIA 4EQ7A 1USYE 3CVGA 2O7UA 4RK9A 2FA7A 3FZVA 1MS7A 5ITOA 3IJXB 4RXLA 5JTYA 4POWA 4LONB 3K1NA 5BWJA 4H1XA 3T9VA 4JSOA 3O9PA 5BUUA 2HXWA 3VVEA 4ZEFA 4NWDA 2RC9A 4XKQA 1B0HA 4ND9A 3PUVE 5TP9A 1ELJA 4G8NA 3LBSA 2AL5A 5J1DA 1N3WA 4DZ1A 4ZEBA 4G68C 3OSRA 1B51A 1B5IA 1SQYA 1MXYA 4KFQA 1B1XA 3FV1A 3SEYA 1A8EA 1I69A 1FTJA 3TYHA 1SI0A 4YZZA 2OK2A 3HHGA 4GXAA 1MY2A 3Q29A 5F7VA 1P1OA 1BTJA 2THIA 1SI1A 4KYEA 2PYYA 2V93A 1MPCA 3LSWA 3FASA 3H6TA 4YKKA 4NF5A 4PQJA 4PETA 3U93A 1PC3A 1Y3PA 4G2ZA 3U1OA 2AIXA 3VVFA 5I2KB 2F34A 4ZEKA 1JW5A 4BDLA 3T96B 3QIMA 4LQ2A 5DVIA 2ZYOA 1B46A 1NL5A 3SEXA 1DTZA 3SDFA 2XXQA 3K6UA 2I4BA 2F7CA 3S9NC 3D4CA 3MQ9A 3PD9A 5M2VA 1SDXA 3MZ9A 3TEPA 1MPDA 4GFRA 1OQGA 5I57B 5AA2D 3DELB 4IGRA 3PD8A 1LCTA 4ELOA 2O69A 3HCQA 2YJPA 1XHYA 4OFJA 2QMWA 1R9LA 1Y9UA 2D5WA 3UA8A 1MXWA 3S2VA 3FVNA 5I56A 2QS3A 2V3UA 1AL3A 1B0LA 2QS4A 4DXBA 4R6HA 2Q2CA 3PGFA 2UVHA 4JB7A 3B6WA 2A5SA 1N04A 4R74A 1XT8A 2HFBA 3SEWA 4GL8A 3K6XA 4NF4A 3K6WA 1O64A 4Q0CA 4U21A 4IY5A 3EHTA 2B3BA 5AE4A 3MC2A 5KZTA 3OO7A 2D21A 3FVKA 3G3JA 4C0RA 1Q35A 3IOUA 4RA1A 1QJMA 4JBZA 1S7YA 3MVXA 3TQLA 1PEBA 3EHUA 3H4ZA 3VFJA 1WODA 1D4NA 2X7PA 3K4UA 1NH7A 2BJJX 4IO5A 4R9GA 4TLLB 3SERA 2I4CA 1AMFA 1UTBA 4F1VA 4OFOA 4F2QA 1FTOA 4C1UA 2PMSA 3RQTA 4DE8A 1MY4A 4UACA 4M1VA 1WDNA 1SYIA 1N7WA 3I3VA 1M5BA 2RCBA 5ICTA 3B6QA 4POXA 4KHZE 3BKIB 2ONKE 2AYSA 1B3HA 3ODBA 4OZ9A 4GRKA 2UXAA 2RKMA 2O68A 2F78A 4NE4A 4U22A 1MM7A 3A09A 3B7DA 2NVUB 3SKPA 2DVCA 2V3TA 1UIVA 4ZE9A 4XKNA 2XXWA 5K2YA 2QS2A 3UORA 4GD5A 2DE2A 3G3KA 3IB1A 1JW1A 2IA4A 4BDMA 1H3DA 4R75A 3C9HA 4O3AA 3U72A 3R7XA 1L5TA 5ELVA 2F36A 3M8UA 1DPPA 2XXUA 3TCFA 1FW0A 1A54A 3H3GA 4X9TA 4H67A 3TPAA 1LBCA 1B5HA 2YPNA 1MDQA 4HTGA 1QKAA 5JK4A 3OENA 4ZZAA 4QRZA 2XHDA 4G68B 1JNFA 1H43A 3RNNA 3O28A 4G77A 3OXNA 3OMBA 4ZZEA 4NWCA 3B6TA 5FTHA 4H8JA 3KEIA 3S4UA 3H06B 2REJA 2RC7A 1ZU0A 2V84A 4LP2B 3OELA 5A5XA 1IXGA 2Q88A 4ZS9A 2XXTA 1IXHA 1BP5A 4LATA 4OEUA 3KSXA 3H7MA 3VV5A 3S9EA 1AOVA 3PPOA 2XD3A 1MQDA 1POTA 3VXCA 4H65A 4I62A 3K00A 2VGQA 3JYRA 3KFMA 4FEDA 1M5DA 2ONSA 5CMKA 4F1UA 2PBWA 3M3FA 5JEIA 4QF9A 4EXKA 1IXCA 2O51A 4R6KA 1R9QA 1FQAA 4N07A 2F35A 3LSXA 2XX9A 2QMXA 2ABHA 5AA2B 1ZJLA 1DSNA 1TFDA 3PUXE 1TFAA 4GQOA 3EPEA 3Q25A 4THIA 1GVCA 3MP6A 4H5FA 4EDPA 3O66A 4F22A 3O29A 2VD3A 4YMBA 3LSLA 1XOCA 2VD2A 4X1DA 3HHFA 4LVQA 5L9OA 3K01A 4F3PA 3KN3A 3OEMA 1ANFA 4DCYA 3C4MA 3G3FA 1NMUA 3IO6A 3TZAA 2H25A 4DXUA 3PPRA 1B40A 1MXVA 4YKIA 4KR5A 1VR5A 4NF6B 2M8CA 4R9FA 1H45A 4PE5B 3OO9A 3K1PA 4XIGQ 1NFTA 2HAVA 2DQVA 1NNTA 2FYIA 4OYVA 2OWSA 3HV1A 1JVYA 1TT1A 1I6BA 1SVXB 1SW4A 1NNFA 2ZNTA 2ESNA 4IO6A 4ECFA 5I58B 5H8SA 1TXFA 3TCHA 3QYTA 3MP8A 2UYFA 4OHNA 1R6ZA 1YPNA 2Z8DA 1LFGA 1OMPA 4GWOA 1AH5A 4U4XA 5DEXA 2HCAA 3MZ1A 4GVOA 5CRYA 1QUKA 1Z7ME 3QUJA 1OLAA 1CB6A 4I9DA 2V3QA 1KWHA 3PPQA 3OEKA 3BFUA 4FJPA 4ESXA 1B1HA 5KCJA 1II5A 1LFIA 2Y7IA 1FQFA 1DTGA 1OQHA 1B4HA 3FJMA 4WEPA 3SEVA 3BBRA 3L6GA 1Z7NE 2NWJA 2REGA 5AA4A 4Q5TA 1SW1A 4GLIA 2KLFA 3TELA 1IZ1A 3TDJA 1MY0A 3W9WA 4LA9A 4OQOA 3ZSFA 1R1NA 3QXMA 4GOTA 3MPLA 1I6AA 2RINA 3N26A 5I2NB 1NKXA 1B4ZA 4ONYA 1A7LA 2QSXA 4H5GA 3TTRA 1RYOA 4ELRA 1LBBA 2H9BA 3UP9A 3VLWA 1HSEA 4NEDA 5H8FB 4I1DA 3KJ7A 4U23A 1NNKA 3Q28A 1N3XA 1BLFA 4OESA 2H5YA 5FHNA 2XX8A 2R9JA 4MBPA 1B32A 1VSOA 2G29A 5KDTA 3EN3A 5L9SA 4OTEA 4YU0A 1Q1KA 3V5AA 3MW0A 5H8HB 4NF8B 4DXCA 4YB5A 3ILUB 2V25A 2I0CA 4HCWA 1MY1A 2RF1A 2UVJA 4EQBA 3FGSA 3K6VA 3C34A 1D3KA 1OIBA 5B70A 4PP0A 4JXIA 1MPBA 1QULA 1XVXA 1EZPA 1URDA 4N13A 3FJ7A 1JEUA 5CMCA 4WEDA 3S9MC 1AIVA 3CFLA 4KYSA 1SBPA 1Y3NA 1P1WA 1PDAA 3OO6A 1A55A 3CI8A 4IO3A 4ISUA 1FTMA 2O1MA 4FECA 1MQIA 1A8FA 3CFZA 1NNPA 3Q26A 5ITPA 4XKRA 4TOZA 3RT8A 3N5LA 1M5CA 2HAUA 2B65A 4AQ4A 2UVGA 1MH4A 1OVTA 4U1ZA 2OWTA 1T0KA 4MLVA 4OFLA 1Y4TA 2CMOA 1IXIA 5IKBA 4FE8A 4Z0IA 3GLBA 3TTLA 3IO4A 3FV2A 1PB9A 3TODA 4FORA 4BLAA 2Z8EA 5I59B 4QFKA 2A5TB 2ZNUA 2XX7A 3FJGA 4WXJA 4BDRA 5FHMA 3RN8A 1Y1MA 5H8QA 3PMVA 4F3GA 4U1OA 1MRPA 1Y1ZA 5CMBA 5ICQA 3IAZA 1UTHA 3THIA 1US4A 4NF6A 4IGTA 1MQHA 5FTIA 3PV0E 1LSTA 3R26A 4F29A 1QW0A 1LB8A 4QSCA 1GV8A 3W9VA 3MZBA 5TP9B 1MXXA 3T9HB 5CC2A 1FCKA 4MH5A 3KOTA 4EF1A 4OETA 2F6GA 2NUVA 4YKPA 4F3SA 2F7AA 3PMWA 1H44A 2ZYMA 3ZKKA 1JQFA 3EHSA 2RC8A 3DM0A 1PBQA 1M5EA 1B3GA 3O2AA 3IORA 3C32A 1EZOA 3TUSA 3FATA 2OBGA 1ZTYA 5DYHA 3PPPA 3VDFA 1OLCA 4IO7A 1B6HA 3DP6A 3K1MA 1LLSA 4X1BA 1XS5A 5LOMA 3CSGA 2ZXTA 5EHMA 4LZ8A 4RPOA 4G8MA 3EF7A 2DE3A 1FTKA 3KN7A 4KCCA 1B5JA 3TCGA 3LC8A 2GH9A 3MJNA 4AB6A 2I3WA 2I6EA 3QK6A 4I8CA 2GRVA 1UIUA 3FUZA 1SYHA 1BKAA 5I2NA 2PVUA 3G3GA 3JV9A 5FHOA 3FVOA 4Q8RA 3VXBA 5CM6A 3U92A 3MAMA 4ZDMA 1VFDA 1O7TA 3MWBA 4F19A 3K0VA 3EQ1A 4PFYA 2P0SA 3LR1A 3TTMA 2QJEA 3ZS6A 3ILTB 3T9UA 2GFEA 3OO8A 2OCUA 4OXVA 5I2KA 1FQDA 3FIRA 2DWHA 1ZMGA 4DIGA 1P1NA 3A3CA 3KG2A 4P0GA 2RCAA 2R71A 3RLFE 4ZEDA 1D9VA 4IO4A 3PPNA 3O6IA 2P1SA 3IOTA 4GL0A 1PBPA 2XXRA 3MPKA 5I57A 1VFEA 3TMGA 4F39A 3U94A 3DLNA 3M3KA 1GTKA 4IY6A 5TPAB 5AA3A 3HN0A 3L6HA 2GHAA 1SW2A 2Z8FA 1MQGA 4JWYA 2OLBA 1I6QA 3UK4A 2Y7PA 3GZGA 3N6TA 1MY3A 4G8HA 1ATGA 2I3VA 3PUYE 2YLNA 1N76A 1B3EA 3CIJA 4O3CA 1PB8A 3RT6B 3CR9A 1VE4A 1PB7A 4OVJA 4F31B 2O1LA 4YMAA 1YCJA 2FNCA 2ALUA 2B3FA 4OERA 3FXUA 3N6UA 3IR1A 2DSFA 3OSQA 3KZGA 2DYXA 3IOWA 4QFLA 2IEEA 1QUIA 2QS1A 2F97A 3H03A 1ZKBA 1IIWA 4LZ5A 3VE1B 4DCXA 5TU0A 3RTWB 2UVIA 3IJOB 1S9TA 2DS9A 3V89B 4KPTA 4ELPA 1MXUA 3MBPA 4YKJA 4QFNA 3RGYA 3QSLA 4ZECA 2XD2A 3CRBA 3TKDA 2Z22A 3E3KA 2F8DA 1IQ7A 4R72A 4PFWA 3FVGA 1EZ9A 4Z7EA 3LSFB 2VOZA 1JEVA 3QAXA 3QUFA 3KOSA 3E13X 2H99A 4R73A 3CG1A 1MDP1 5I84A 2I48A 4TLMB 1EH3A 5EYFA 2DVZA 3IL1B 4WKMA 5A5XB 3CG3A 2DP8A 4GXSB 2H98A 1N84A 2O6AA 3V83A 1P1QA 3ZKLA 2XXYA 3LUYA 2VP1A 4RJZA 3KGCA 1JETA 2ZMBA 3PUWE 3IX1A 1B7UA 4YB7A 2ZNSA 1Y3QA 2AL4A 4H8IA 5B7DA 1UQWA 1XVYA 4HS7A 2O7IA 4EQ9A 3G3IA 3TTKA 1RKMA 4XTCQ 4K3FA 1BIYA 1HSJA 4QFPA 1O63A 5CBRA 4PFUA 3R6UA 5IAIA 1FQEA 4XKPA 3M3LA 4C1TA 1ZLQA 4G68A 1Y20A 1LAGE 2HZLA 2I58A 4QSEA 3T9XB 4ZE8A 4OENA 3O6HA 1MH3A 1SW5A 3UIFA 4R6YA 2VHAA 1JVXA 2Q9TA 3K02A 4F2OA 4JDFA 2XXVA 4YB6A 3F11A 1QUJA 3G7WA 3MVWA 5H8NB 2R6GE 1WVJA 3ECRA 4QSDA 4FEBA 1B05A 4JSDA 3T66A 3TQWA 2UYEA 3IB0A 2QRYA 4LUBA 1A99A 2F5XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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