2H98A

Crystal structure of the effector binding domain of a catm variant, catm(v158m)
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
216
structure length
216
Chain Sequence
SQTLRIGYVSSLLYGLLPEIIYLFRQQNPEIHIELIECGTKDQINALKQGKIDLGFGRLKITDPAIRRIMLHKEQLKLAIHKHHHLNQFAATGVHLSQIIDEPMLLYPVSQKPNFATFIQSLFTELGLVPSKLTEIREIQLALGLVAAGEGVCIVPASAMDIGVKNLLYIPILDDDAYSPISLAVRNMDHSNYIPKILACVQEVFATHHIRPLIES
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for the altered regulatory roles of three LysR-type transcritional variants of CatM and BenM: CatM(V158M), CatM(R156H) and BenM(R156H/T157S)
rcsb
molecule keywords HTH-type transcriptional regulator catM
molecule tags Transcription
source organism Acinetobacter sp.
total genus 59
structure length 216
sequence length 216
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2h98A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 2h98A02
1QVSA 5H8NB 3C35A 5L8DA 1MPDA 2Q2CA 4F3SA 4ZS9A 3OO7A 3MBPA 2HQ0A 2QMXA 3O6IA 4DXUA 2NOOA 4G8HA 3RGYA 1ZJLA 2F35A 3N5LA 3VDFA 3ZKLA 4KHZE 1LFGA 4JB7A 4X1BA 5CI5A 4M4GA 3CFZA 2XXIA 1BIYA 2HXWA 2ZYNA 1Y9UA 5A5XA 3VXCA 2RCBA 1IXHA 4ESXA 1UTHB 1IXIA 1TXFA 4YKKA 3C36A 1P1OA 1JVXA 3KBRA 3KN3A 1O7TA 3V8XB 2Z8FA 1PBPA 4NF6A 5CMBA 1M5CA 4GQOA 5B7DA 1B0LA 4RPOA 4TOZA 2AL4A 4ESWA 3RPWA 1URDA 4G68A 2PVUA 4LA9A 3LC8A 4ISUA 4THIA 1DTZA 2R71A 4EQ9A 1AMFA 4RNSA 5KZTA 4GIZA 2A5SA 3K6VA 3Q28A 3H6WA 2HAUA 4GL0A 3TEPA 1RYXA 1N84A 5AA1A 3N6TA 2Z8DA 3E13X 3DP4A 2QSXA 1OVBA 4RXLA 3MP1A 4ZEKA 1GV8A 5A5XB 2D21A 1VR5A 2DYXA 4QSEA 1H45A 4MLQA 1Y1ZA 1JVYA 3FJMA 4IGRA 3K1MA 3HO7A 3L6GA 4HS7A 3PUYE 5TPAA 3U94A 4NF6B 3QIMA 1JEUA 4ZEFA 1IQ7A 4H8JA 4FJPA 3PV0E 4ELRA 1LLSA 3I6VA 3K1PA 1Y3NA 3C32A 4G68B 4NTLA 4QFLA 4PFYA 1R6ZA 3W9WA 1B58A 3USDA 4GRKA 2HZLA 1URGA 1POTA 2AYSA 4FECA 1MY4A 4R2BA 3QK6A 4YZZA 4G4PA 4QFKA 3W15C 4F3PA 3WAFA 4EXLA 4BDQA 3RT8A 1YTVA 4POXA 4RJZA 1GTKA 3OSRA 4F31B 2FNCA 3OEKA 2W7YA 4YB7A 1M5DA 3EF7A 2IA4A 2DWHA 4DXBA 4GD5A 2VP1A 1ZBMA 4ZZAA 2CMOA 3IJOB 3UORA 1US5A 1B1HA 2OWTA 3T66A 2XXTA 1FQAA 1SD3A 3FIRA 4F3GA 1OLCA 3JYRA 2DE2A 1O64A 1Y3QA 5TPAB 3M3FA 1QJMA 3DP8A 4IY5A 5I58A 4NWCA 3A09A 3G3HA 3TTMA 1D3KA 4LQ5A 4GOTA 1MH4A 4K3FA 2H4IA 1MY3A 2ZYOA 3IO6A 4X1DA 4EQBA 1MG1A 5KDTA 3OXNA 2UXAA 4G77A 3UK4A 4Z7EA 1A54A 3TAJA 5M2VA 4OETA 4NWDA 1B32A 1QUJA 1XT8A 3TTKA 3N94A 1PB7A 2DE4A 4OYVA 3PGFA 3K00A 4F1VA 1MXVA 3S9MC 3VLWA 1NFTA 2RF1A 1B52A 1SW2A 4ELOA 3ILUB 4M1VA 4WXJA 2ZNTA 3FZVA 3DM0A 1LGBC 2QRYA 5I59A 3UP9A 4Q30B 1DTGA 1N76A 3OOAA 1AH5A 3H03A 1A99A 4RPNA 3RY3A 3C31A 1B5IA 4BLAA 4F2OA 1SW4A 4XKQA 3THIA 1P1WA 1GR2A 3TZAA 2ONKE 5KDTB 2NUVA 3P7IA 3TTNA 1P99A 1S9TA 4L17A 3UIFA 4KCDA 2H98A 3FXUA 5CMCA 2D5WA 1Y4CA 4H5GA 1D9VA 3L6HA 4XXUA 1P1UA 2NWJA 2QS4A 1JETA 4LZ8A 3MVXA 4OEUA 3O66A 3U1OA 1NL5A 2GFEA 4ONYA 5DT6A 2ONSA 4KQPA 3KOTA 1WODA 1FW0A 5JEIA 5IKBA 1MXWA 5CMKA 5I59B 3PMVA 3FVOA 5H8SA 2PT1A 3PUVE 2QS1A 1PB9A 3KSXA 2Z22A 4OXVA 4RY1A 4I62A 3K6UA 4F29A 3IR1A 2H9BA 2G93A 1I6AA 1MY1A 1YCJA 4ZEIA 3B6WA 3SEUA 3EHUA 4O3BA 3FUZA 3IB0A 2YPNA 2ZYKA 2XXWA 2Y7IA 4WEPA 1B5JA 4HCYA 4OFJA 2XXYA 1HSLA 3TMGA 3OEMA 2Q8JA 3PPPA 2Z8EA 3LR1A 4RA1A 2F6GA 5FTHA 4TLLB 4IO2A 2OWSA 3SERA 2REJA 2VGQA 4FATA 3TPAA 3SEWA 3FVNA 4UACA 2XX7A 4WEDA 3HCQA 3QYTA 2ESNA 2YJPA 4H67A 3GBAA 2F5XA 2O84X 1MQIA 3LSWA 3FVKA 1VE4A 4NMYA 2OJTA 1XVYA 4G68C 3CFXA 3OSQA 2QJEA 1QUKA 3U92A 1EZPA 2DVCA 3M8UA 4NE4A 3O28A 1IITA 3VVFA 5AA2D 1A8FA 1NH8A 5F1QA 1QKBA 3D4GA 4DDDA 1FCKA 1B0HA 1HSJA 2UYEA 4H8IA 1FTLA 1FTOA 3A3CA 2VD3A 1LFIA 4DE8A 2VD2A 4JSDA 1JW1A 1SW1A 3K6WA 1B3FA 4ZEDA 3S9LC 3VVDA 4IO6A 4FE8A 4YICA 3CIJA 4XIGQ 5CC2A 4N07A 1I6QA 2F78A 4YB6A 1IUDA 1QKAA 2QS2A 2Q2AA 5ICTA 1XOCA 4YMAA 3C9HA 1JNFA 4LONB 3VE1B 1B4ZA 4BDLA 3MPKA 1QUIA 1N04A 3SESA 2NVUB 3PPQA 3C33A 4IO5A 3S2VA 3TYHA 4EF2A 3IB2A 1TFDA 3MC2A 3K2DA 4POWA 1FQEA 3TTRA 3ILTB 3ZS6A 3ZKKA 2OK2A 4F39A 3HSTA 4QSCA 3QSLA 2B65A 1ELJA 4E0WA 2OCUA 3PD8A 4PFTA 4LZ5A 1FQDA 5FHNA 5H8FA 3N6UA 3TFLA 2ANJA 3TQWA 2YLNA 5HBCA 1OLAA 4R9FA 2Q89A 3EHTA 3PPRA 4EF1A 4ZZEA 4QFNA 2A5TA 3S4UA 4EQ7A 1XVXA 3MUQA 1SI0A 4IY6A 4RK2A 4OWDA 1B1XA 4MBPA 2XXQA 4P0GA 3I5OA 4AQ4A 4F18A 2Y7KA 4LATA 4FAJA 1EH3A 1S50A 5AA4A 5L9SA 4FIMA 4EDPA 2F6PA 1US4A 1RYOA 5B70A 3RTWB 4OESA 4H65A 2RC7A 1LSTA 3KEIA 5CM6A 2QPQA 4JWYA 3TCGA 2V84A 3EN3A 5L9MA 5H8FB 3B7DA 5EHMA 4KCCA 3JZJA 2V93A 1NNKA 2PT2A 1M5FA 3CSBA 2F7AA 3MVWA 2B3FA 1H44A 4U22A 4ZE9A 4XKRA 4IB2A 2GRVA 1SBPA 3K01A 1JW4A 2A5TB 3IOTA 2O68A 2UYFA 2Y7WA 4OZ9A 4X9TA 2ALUA 4ZEBA 5K2XA 1ZMGA 2F36A 1URSA 1BTJA 3WAEA 3FV2A 4LVQA 1FTMA 3UN6A 2HFBA 2RC9A 4LZ7A 5AA4B 3KGCA 2I4BA 3V83A 4YKIA 1NMUA 1IZ1A 3G3FA 2P1SA 1OQHA 4TLMB 1B46A 2IEEA 4GL8A 1XS5A 4H0WA 2PMSA 2OLBA 2V3TA 2O69A 2XXUA 1LAFE 3C4MA 4U23A 4NEDA 2O51A 3CSGA 1ZU0A 3MVYA 3A3UA 3KN8A 3MAMA 1VFDA 2H5YA 1SQYA 3B6QA 3G3JA 1NNPA 3T96B 1OMPA 4JSOA 3V5AA 2V3QA 4DCYA 2ZYMA 3RTFB 3U93A 2RINA 2UVIA 4N6PA 3OELA 4NF8A 4AB6A 1IEJA 3IX1A 4KYEA 1SYIA 4XTCQ 5LOMA 1POY1 4P0IA 1XC1A 3FXRA 3MZ1A 4OTEA 1B05A 3SDFA 3VFJA 1LCTA 4ZE8A 3TKDA 4R2FA 4ELPA 4HCWA 1F9BA 3PD9A 1MXYA 4NF5A 4BDNA 1MDP1 3VLUA 2XX9A 3G3IA 4BDRA 1BKAA 5I58B 4LQ2A 1II5A 3TTLA 5I2NA 1R9LA 1OVTA 4U21A 4ELQA 5BWJA 4H5FA 1PBQA 3QUJA 2RC8A 4GFRA 4IO7A 1LBBA 2P2AA 1FTKA 1P1QA 4OEVA 5I57A 3IK6B 4QFOA 3PMWA 1LFHA 4ND9A 3H3GA 2H99A 4QSDA 1M5BA 1N0TA 3BFUA 2DWAA 1B7UA 3V89B 2F7BA 3ONMA 2HEUA 2XD2A 2GHAA 4KI0E 1MXZA 2H25A 3MPLA 4OERA 3E3KA 3Q25A 3IO4A 3RNNA 1Y4TA 1WVJA 4NF5B 1B3GA 2Q88A 3H4ZA 1B3HA 4Q5TA 1H3DA 4PE5B 3RUMA 2O7UA 1S7YA 2XXXA 5I2NB 2I0CA 3KFMA 3CRBA 1XHYA 1JW5A 2FYIA 3H7MA 1PC3A 3PPNA 3H06B 4F1YA 1ZKBA 4P11A 4JWXA 4U4SA 5EHSA 5I57B 5HM4B 1DMBA 4JWOA 1YPNA 5AE4A 1NKXA 3KN7A 4G8NA 3RQTA 5TU0A 1B3LA 3U8QA 1FQBA 1NH7A 3R6UA 1MY2A 1AL3A 3T9XB 2DWJA 3Q26A 3RN8A 4OHNA 4OFLA 2XXVA 4R6YA 1R1NA 4MFIA 2Y7RA 2I4CA 3IAZA 3G7WA 1LB8A 3GXAA 4O3CA 2DOJA 2ZNSA 5IAIA 1Y3PA 5H8QA 1B9JA 4OFOA 3FASA 3CI8A 1LBCA 3VLVA 3B6TA 1GVCA 1A55A 3IB1A 3PPOA 3KZGA 1ZIUA 4N13A 3SEYA 3OO6A 3SETA 3Q29A 5ISUA 2F97A 1D4NA 5CBRA 3OO9A 2ZMBA 3T9HB 4AB5A 2Q9TA 2OZZA 3CFLA 3O6GA 2XXHA 3GBBA 3ZSFA 2E0SA 3M3KA 1H43A 3E9XA 4JDFA 2DSFA 1USYH 2M8CA 3TUSA 3LSXA 4MH5A 4C1TA 3EQ1A 1NNFA 1B6HA 4G2ZA 5FHOA 2UVJA 3HHFA 1LAGE 2Y84A 3FVGA 5I84A 3O29A 1A40A 2HZKA 4DXCA 4Z0IA 1MQDA 3OO8A 2VOZA 5BUUA 1B40A 5I2KA 2I49A 3QXMA 5H8QB 4QRZA 5JTYA 5DEXA 1DSNA 2O7IA 1Y1MA 4ECFA 3ODBA 3KJ7A 2XD3A 2DWIA 3LUYA 4F1UA 5CMMA 1DPEA 4Q8RA 2DXYA 3F11A 2PBWA 4RYAA 3QUFA 4R75A 3TODA 2DP8A 5ICQA 3T9UA 2PYYA 3MJNA 2I3WA 3HN0A 1OIBA 3AXFA 4KYDA 5JK4A 3K6XA 5H8HA 3MZ9A 1AOVA 2WKYA 3C34A 2XHDA 3BFTA 2F8DA 4R73A 4H6DA 1B2HA 2LAOA 1GGGA 1I69A 5I56A 4GXSB 4FEBA 5K2YA 2R6GE 4ZDMA 3T93B 1D9YA 1SDXA 1TT1A 2AL5A 4I9DA 3SKPA 2NXOA 1FQFA 3MW0A 4LP2B 3H6VA 1B51A 2B3BA 5I2KB 5DVFA 2I48A 4IO4A 1USYE 2G29A 4U1ZA 5JTYB 5DEXB 4PQJA 4XKPA 5ITOA 2O1LA 4DCXA 4WKMA 3OENA 3SEXA 4RK9A 2QS3A 3KG2A 4U4XA 2ABHA 3OMBA 1ATGA 5KCJA 2DQVA 1UQWA 3SEVA 1MM7A 2E1SA 3LSLA 5J1DA 2KLFA 4R6KA 1MQGA 5H8HB 1JEVA 2R9JA 1O63A 4U1OA 1PB8A 3QAXA 4MF3A 4GLIA 2REGA 4YU0A 1LCFA 4EUOA 1HSEA 1P1NA 1Y20A 1A7LA 5I56B 4QF9A 2CZLA 3R26A 3MP8A 3UGWA 4DIGA 1KWHA 2XX8A 4KD5A 5EYFA 1L5TA 4IO3A 1UIUA 1B3EA 2V3UA 3PMXA 1PDAA 3PUXE 3LSFB 1N7XA 1MS7A 3MZBA 3UA8A 2F34A 2QMWA 1UTBA 4OVJA 5L9OA 4YKJA 3IJXB 3K0VA 1M5EA 3E4RA 4JXIA 2X26A 3JV9A 4GF8A 3FV1A 1B7ZA 5DTBA 3DP6A 4IGTA 4GXAA 3PU5A 5KCJB 1BP5A 3T22A 2ZNUA 4I8CA 5HPQA 4YB5A 3H6UA 1BLFA 2O1MA 4C0RA 1OQGA 1MXUA 3IOUA 4R74A 3VV5A 4XKNA 3TDJA 1TFAA 2V25A 1MRPA 4YKPA 3PUZE 4R9GA 2XXPA 4C1UA 1CE2A 4NF4A 4PETA 1IXGA 4EXKA 2QL3A 1DOTA 5DYHA 3T9VA 3HPIA 1CB6A 1SW5A 1B7HA 4YMBA 3HHGA 4KPTA 1SYHA 3CG1A 3FJGA 3K1NA 3HV1A 4I1DA 1MY0A 1T0KA 1UTBB 4BDOA 5F7VA 1B4HA 4YAHX 1LAHE 2I3VA 2VHAA 3G3KA 4HTGA 1MPBA 5CRYA 3PUWE 2FA7A 1NNTA 1MDQA 3GZGA 1ZLQA 4JBZA 3G3GA 4F19A 3FXQA 1EZOA 4QFPA 3FATA 2RCAA 1Q35A 4F22A 5AA3A 2I0BA 3N26A 1RKMA 4NF4B 1TWYA 1FTJA 4PFWA 1QULA 3H6TA 4F3BA 2UVGA 2P0SA 1JQFA 3CVGA 4ZECA 3FGSA 1FQCA 5FHMA 3RT6B 1MQHA 4KR5A 1N3XA 4R6HA 5AA2A 3KOSA 3OD7A 3I3VA 1Z7NE 4NF8B 3DLNA 2ONRA 1UIVA 3KSJA 4MLVA 2GH9A 1SVXB 1YAEA 4PFUA 4DLDA 1ZTYA 2XXRA 4Q0CA 3MWBA 4G8MA 4LUBA 1LB9A 4QHQA 4PP0A 2THIA 3FJ7A 1AIVA 1VFEA 3S9EA 1B5HA 3O6HA 3MQ9A 1EU8A 1MXXA 1PEBA 1ANFA 1I6BA 4GWOA 1MQJA 4U2RA 2I58A 3MVZA 4UA8A 2F7CA 5ELVA 3M3LA 2OBGA 3KJTA 1DPPA 3TELA 5CBSA 3RLFE 1N7WA 3DELB 4H1XA 5TP9A 2DVZA 5DVIA 3O9PA 2PX1A 4TQUQ 3EHSA 3IORA 5AA2B 4BDMA 2DS9A 2X7PA 3MP6A 4F2QA 5FTIA 2Y7PA 2AIXA 3U72A 4KYSA 1R9QA 3CR9A 1QW0A 1LAXA 2HCAA 4HW8A 1MM6A 4OENA 3TCFA 1VSOA 4X48A 2D3IA 3BBRA 3K4UA 2GHBA 3CG3A 1EZ9A 3GLBA 1MH3A 2DXRA 5DVJA 5H8NA 2DE3A 4KFQA 3TQLA 2RKMA 3BKIB 2Z23A 4GVOA 3IOVA 3W9VA 1H76A 4OQOA 1SI1A 4OMBA 1WDNA 2O6AA 3TCHA 5ITPA 2UVHA 1J1NA 1N3WA 1MPCA 2BJJX 1Z7ME 3FD3A 5TP9B 3VXBA 4FEDA 1Q1KA 1IXCA 3R7XA 2X7QA 3IOWA 3O2AA 3VVEA 4O3AA 2ZXTA 3Q27A 1UTHA 4FORA 3O97A 2HAVA 3ECRA 2I6EA 4R72A 3S9NC 3IL1B 4E0XA 1IIWA 3D4CA 1A8EA 3EPEA 3LBSA 3K02A 4DZ1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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