1HSEA

H253m n terminal lobe of human lactoferrin
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
317
structure length
317
Chain Sequence
RSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRRVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSMAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords LACTOFERRIN
publication title Mutagenesis of the histidine ligand in human lactoferrin: iron binding properties and crystal structure of the histidine-253-->methionine mutant.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Iron transport
total genus 93
structure length 317
sequence length 317
ec nomenclature
pdb deposition date 1996-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1hseA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1hseA02
3O9PA 4G8NA 1KWHA 3SEXA 4PFUA 1XS5A 1B3GA 4H6DA 2DE4A 1ZIUA 3LBSA 4X1BA 1O64A 3QUFA 5LOMA 1MM7A 3ILTB 5BWJA 3LUYA 1VFEA 4JB7A 3E13X 2OWTA 1CB6A 2DYXA 1S7YA 4NEDA 3T93B 1JVYA 1N76A 2PT1A 1GTKA 4GVOA 1FQBA 4EXKA 3VLVA 3FV2A 1N84A 4BDLA 2AYSA 3VLUA 2Q89A 5FHMA 1R6ZA 3VFJA 1ZMGA 1JQFA 1NNPA 2PMSA 4ZECA 2RCBA 4DDDA 2A5SA 3T66A 2THIA 4R9GA 4NF5A 1SW2A 1TXFA 2OLBA 4RK2A 1N3XA 3VLWA 5TPAB 2XXVA 2Y7PA 2I3VA 3AXFA 3RGYA 4EF2A 4IY5A 1FTLA 4AB5A 2RINA 4JWYA 3TTNA 1QULA 1FTOA 4BDMA 5I84A 4F3SA 3LC8A 4DZ1A 5EYFA 3SEWA 3TODA 3LSLA 1UTBA 5H8QB 2IEEA 3UGWA 2QL3A 4H8JA 4EUOA 1ELJA 1SI1A 3VVFA 3OSRA 4DLDA 2ESNA 4NE4A 3BFUA 5H8FB 2DVZA 1B2HA 1LAHE 1GR2A 3TTMA 4OFOA 1MQIA 2V25A 1B5HA 2A5TA 2XXUA 5EHMA 3T9XB 4I1DA 3TTRA 1VR5A 2RC8A 1JW5A 5ITPA 1LCFA 1LLSA 1ATGA 2ANJA 4OMBA 4G68B 2F8DA 2UXAA 4JBZA 1UIUA 1EZ9A 4LATA 4ELPA 4H8IA 5I58B 4NF4A 1OQGA 4ESXA 1Y1ZA 3RN8A 5FTIA 4QHQA 2I49A 3B6QA 4FATA 1B40A 3K00A 3QIMA 4G4PA 1IXGA 3ZKLA 5KCJA 2VHAA 3VXCA 1H43A 5EHSA 3SESA 1SW4A 5M2VA 3SKPA 3MW0A 3A09A 4LZ7A 2Z22A 1B46A 4NF6B 3W15C 5A5XB 2R6GE 3TDJA 1IIWA 1QUKA 3C32A 3PPQA 1JW1A 1WODA 3SERA 1B0HA 3VVDA 5AA3A 1ZTYA 4KFQA 1H45A 1FCKA 2V3QA 5K2YA 3M3LA 3CVGA 2XXYA 2NVUB 3OSQA 4K3FA 4KR5A 4ZZEA 3PMVA 3QAXA 3GZGA 4U1OA 3UP9A 3MVXA 2XX8A 1FTMA 4OETA 3TFLA 4EXLA 1FW0A 1MPDA 2LAOA 3IJOB 3DP8A 3S9EA 1B1HA 1TFAA 1RKMA 4YAHX 1H3DA 4FEBA 4KPTA 3RY3A 1R1NA 3U72A 3S2VA 1MXUA 3H4ZA 2G29A 3FASA 1PB8A 2UYEA 4GL0A 3ILUB 3H06B 2YLNA 2DSFA 5CMMA 1AMFA 3S9MC 2X26A 4YMBA 4JSDA 4RPOA 5TP9B 4U4XA 4FE8A 1B5IA 2ONRA 4XKPA 3CFXA 3OELA 4C1TA 4JSOA 4FEDA 4LQ5A 4ZS9A 4XKNA 3VDFA 3ODBA 3C34A 3D4CA 3T9VA 3GXAA 3TEPA 4ZEBA 3MPLA 1PEBA 4GRKA 1PDAA 4F3GA 4AB6A 1P1OA 3T9HB 4IO4A 3ONMA 1MY4A 3KSXA 4X9TA 2GHAA 3HO7A 3N6TA 3OO6A 3K0VA 4O3AA 1BP5A 1B05A 3UIFA 4OFJA 1MQGA 1LFGA 3K1PA 2O7UA 3JYRA 4H67A 4WEPA 4RXLA 1B1XA 1US4A 3MAMA 1PB9A 3TCFA 1DMBA 5I56B 2Z23A 1B6HA 1DTGA 3RPWA 4PFWA 4RPNA 2M8CA 1IXCA 4IO7A 3CR9A 1ZBMA 2PVUA 5TPAA 3KN3A 3RT6B 1PBQA 2F7BA 4RK9A 1USYE 1B4ZA 1HSEA 5L9SA 2CMOA 3T96B 2O7IA 2I3WA 1YCJA 3H6WA 5H8HB 3SEYA 2W7YA 5H8QA 2B65A 1LBBA 1LAXA 4POWA 1DPEA 4ELOA 1B5JA 3VE1B 3G3HA 1ZU0A 3HN0A 3QK6A 4GL8A 2I4CA 1NNKA 3USDA 1D4NA 5H8FA 4R75A 3EHTA 4H5GA 2OJTA 5H8NB 2X7QA 3H6TA 4ELQA 3B6WA 3KZGA 3MBPA 2BJJX 4OQOA 4QSDA 1URGA 1NNTA 1NNFA 2I4BA 1VE4A 1D9YA 2DS9A 2QMXA 3FJMA 2REJA 2Q88A 2ZYNA 5DEXB 2DWAA 1ZJLA 1BTJA 1NH7A 3CRBA 1SYHA 4H1XA 4G68A 1S50A 2Q2CA 2UVHA 5I58A 1OVBA 1EH3A 3MPKA 4YB7A 4HW8A 1PC3A 2R71A 3IOTA 1Y9UA 4L17A 3VV5A 1Z7NE 5DT6A 4M4GA 4IO6A 2XXTA 2OBGA 4YB5A 1DOTA 3OO7A 4RNSA 3RTFB 3UORA 4QFPA 4DCXA 4Q0CA 3IL1B 4NF6A 5ITOA 1QKAA 3QYTA 3TUSA 3MZBA 4R2BA 3KBRA 1B51A 2DXYA 4F3BA 2O6AA 5TU0A 1EU8A 1B9JA 3IB0A 3UK4A 4OTEA 2HEUA 5L9MA 1P1QA 2ONKE 4QFLA 4OERA 1AIVA 1AL3A 4HS7A 3QUJA 4R6HA 2DWHA 3PV0E 2F35A 4KI0E 4R9FA 4KYSA 3K2DA 1AH5A 3H3GA 2O1LA 2HAVA 4Q8RA 3E4RA 3TTKA 2I0CA 4FJPA 3SDFA 1B52A 1QUIA 4GIZA 3IOWA 2DQVA 1BKAA 3CSGA 1B32A 3HCQA 1ANFA 2ZMBA 1LB8A 1JEVA 3Q25A 3FV1A 2H9BA 4ZDMA 1D3KA 1TT1A 5TP9A 1M5FA 3E9XA 3MC2A 1M5EA 3EQ1A 1A8EA 3PU5A 3G3FA 4P0IA 2I6EA 3W9WA 1MY3A 1MH3A 2VOZA 3TCHA 1RYOA 1A99A 1SDXA 2HZKA 1ZKBA 3FATA 2P0SA 4G2ZA 1MXZA 1IZ1A 5CI5A 3H6UA 3OD7A 3KN8A 2D5WA 5FHNA 3IB2A 1LSTA 4YB6A 4IGTA 5AA2B 2ABHA 1LAFE 2VP1A 3TQLA 1MY2A 5I56A 1N7WA 1IXIA 3IX1A 3O29A 1B7ZA 2DWIA 3OO8A 4ND9A 2F34A 2XD3A 2Q8JA 5HPQA 2G93A 4XKQA 1A7LA 4YZZA 3CIJA 1POTA 5B7DA 5CRYA 2F78A 3IO6A 2QMWA 5H8HA 3CG1A 4MH5A 4THIA 4N6PA 2Q2AA 3A3CA 1H44A 3KSJA 4G77A 1QW0A 3K02A 1XOCA 2XXHA 4ECFA 4ELRA 2UVGA 4FIMA 3GLBA 1Y3QA 4PFTA 5H8NA 4H65A 3PUWE 2NUVA 4G68C 1SW1A 2D21A 2AIXA 1Y4TA 3V89B 3MZ9A 5DEXA 1GGGA 2QS3A 2XXWA 3M8UA 4NMYA 4FAJA 4LA9A 5DYHA 4OZ9A 2OK2A 4U23A 1SBPA 5CBRA 3SEVA 3UN6A 3O97A 5DVIA 3C31A 3LR1A 1LB9A 4XKRA 2ZNSA 2ALUA 3KEIA 2F7CA 2GHBA 3K6XA 3O6IA 3ZSFA 3OEMA 3M3FA 2DVCA 4EDPA 3FJGA 3L6GA 4R6YA 5J1DA 2H5YA 4R2FA 5ELVA 5AA4A 3KGCA 1QJMA 4X1DA 3FXQA 3TELA 1QKBA 5F7VA 3WAFA 3C35A 1I69A 3FXUA 3KG2A 3HPIA 2ZYKA 5KZTA 3U1OA 3N6UA 4WEDA 2RKMA 2CZLA 3KN7A 3IR1A 3PUZE 1P99A 3O2AA 3HHGA 3PD9A 5CC2A 1FQAA 3FJ7A 3U93A 3ZS6A 3DP6A 4NWDA 1MRPA 5I2NB 2ONSA 3EF7A 4U4SA 2KLFA 3TAJA 5DVJA 3HSTA 5ICQA 4EQ7A 5IAIA 2XXPA 3GBAA 3OO9A 4POXA 1O7TA 2H99A 1MXXA 1YAEA 1N04A 3G3KA 2E0SA 2P1SA 4Q5TA 4H0WA 3BFTA 3FZVA 1GVCA 5CM6A 4EQBA 1I6AA 4OWDA 2HQ0A 2FNCA 2QS2A 4DXCA 3C33A 3PPPA 4G8MA 1LBCA 4GLIA 2B3BA 2DOJA 2VD3A 4F19A 4FECA 4YICA 4F1VA 4OYVA 1WVJA 2PX1A 1ZLQA 4QF9A 4BDOA 3EPEA 1A54A 2O51A 4YU0A 4ZE9A 4MLVA 3OEKA 2HZLA 1TWYA 1DTZA 2Z8FA 3ECRA 4FORA 5AA2A 2XD2A 5KDTB 4MBPA 1Q1KA 1IITA 2VGQA 4GOTA 3TCGA 2PYYA 3K01A 1UQWA 2V3UA 4C1UA 1A8FA 1FQEA 4F18A 3U8QA 4GD5A 2RCAA 1MS7A 4PQJA 5L9OA 1R9LA 3DM0A 2XXQA 1OQHA 3SETA 1QUJA 1D9VA 4Q30B 2HFBA 3Q26A 1MM6A 3E3KA 4H5FA 5JTYB 3O6GA 4F2OA 3P7IA 3FXRA 2ZNTA 3KOTA 1FQFA 3PMWA 1AOVA 3G3GA 4GFRA 3L6HA 2ZYOA 2NOOA 2UYFA 1Y1MA 3OOAA 1EZPA 1B58A 4R73A 4GWOA 3IOVA 4N07A 2YJPA 3TQWA 2DP8A 2F6PA 2DXRA 1YPNA 4IO5A 1OMPA 4E0WA 3TYHA 4GXSB 2HXWA 1N7XA 3KFMA 3KJTA 2RF1A 3IK6B 3FD3A 3CFLA 1XT8A 3PMXA 2Y84A 1SVXB 2B3FA 1IQ7A 3C9HA 3JV9A 4R74A 4GQOA 4LUBA 2FYIA 3R7XA 1S9TA 4NF8B 5A5XA 3R26A 2QSXA 4MF3A 3KOSA 4OEUA 5AE4A 4ONYA 4F39A 5B70A 4OFLA 3K1NA 5I57B 1USYH 4M1VA 1URDA 2HCAA 2QPQA 4PE5B 2DE2A 2H25A 4C0RA 4ZEIA 3THIA 4F29A 1PBPA 4ZZAA 4JWOA 4TOZA 4GF8A 2RC9A 2XXRA 2HAUA 3RT8A 1JNFA 1I6QA 3TPAA 5CMCA 1NMUA 2X7PA 1OLAA 3SEUA 4YKIA 2AL4A 5F1QA 1LCTA 4QFNA 1FTKA 1P1NA 4P11A 2GFEA 1P1UA 5H8SA 3LSWA 4OVJA 2REGA 3K6UA 5CBSA 2DE3A 5L8DA 3KJ7A 3T22A 4PETA 1M5CA 4KD5A 5I59B 3RQTA 3W9VA 1CE2A 2F5XA 2XXXA 3PGFA 1MXWA 4KYEA 3MP6A 5ICTA 4O3BA 3QSLA 1YTVA 3V8XB 5I2NA 2I0BA 4F1YA 2D3IA 2V3TA 5I2KB 2XX9A 4WXJA 3BKIB 4RYAA 4I8CA 1UTHB 4OEVA 3C36A 4IO2A 3O66A 4MLQA 3PPNA 5JEIA 1P1WA 1B3HA 1T0KA 3FIRA 3OXNA 2DWJA 3S4UA 3MZ1A 1OVTA 1OLCA 3B6TA 3H03A 5DVFA 4U21A 4ZE8A 3IJXB 3WAEA 1IEJA 4F22A 1MQDA 4DIGA 2QS1A 1DPPA 1O63A 1URSA 2OZZA 3N26A 3BBRA 1L5TA 3PPOA 4ZEFA 1MQHA 3MVYA 3FUZA 3TMGA 4AQ4A 4I9DA 1Y3NA 1MY1A 1MDP1 5KDTA 1MH4A 1F9BA 1B3LA 3M3KA 4BDRA 5K2XA 1B7HA 4IB2A 4U2RA 1LFHA 2O84X 4JWXA 2GH9A 1POY1 4TLMB 3K4UA 5BUUA 5HM4B 4Z7EA 4XIGQ 3CG3A 1B7UA 1B3FA 3DP4A 1WDNA 4OHNA 5JTYA 2Z8EA 4LZ8A 1IXHA 4HCWA 3S9NC 1MQJA 4KHZE 1B4HA 2PT2A 2WKYA 2I48A 4HCYA 3HV1A 2F36A 3G7WA 2PBWA 3DELB 2O68A 3FGSA 3F11A 2OWSA 4LONB 4X48A 3UA8A 4PP0A 1MPCA 4DXUA 4DCYA 3MJNA 2FA7A 4F3PA 3FVGA 3V83A 3TTLA 2NXOA 4P0GA 2Y7IA 4F2QA 2ZNUA 3MP8A 1MY0A 4KQPA 3FVKA 4NWCA 2F97A 4G8HA 2XX7A 3PUVE 3IOUA 4ESWA 2VD2A 2H4IA 3Q27A 4JDFA 3PD8A 4LZ5A 4NF8A 1N0TA 1HSLA 2O69A 4RY1A 2RC7A 1OIBA 3GBBA 3I5OA 3MVWA 2H98A 3PPRA 3U94A 3LSXA 2P2AA 4QFKA 1XC1A 1LFIA 4EF1A 5I57A 1HSJA 1R9QA 1VFDA 4LQ2A 3A3UA 3K1MA 1SYIA 4ISUA 3CI8A 3H6VA 2UVIA 3QXMA 3MUQA 4DXBA 1SD3A 4IO3A 2E1SA 4IGRA 3G3JA 4BLAA 4EQ9A 3CFZA 2Y7RA 3OMBA 3IAZA 2QS4A 2I58A 4RJZA 2IA4A 3JZJA 2UVJA 4I62A 3ZKKA 2XXIA 1SQYA 1Y3PA 5JK4A 1BLFA 1LAGE 3G3IA 1B0LA 2QRYA 5I59A 1B3EA 2YPNA 1XVYA 1DSNA 4BDNA 1FTJA 3HHFA 1N3WA 2V84A 5CMBA 1JEUA 2F6GA 1H76A 1UIVA 3MP1A 4YKKA 4ZEKA 1MG1A 3U92A 3EN3A 3IORA 4LVQA 2QJEA 2V93A 1IUDA 3DLNA 3PUYE 1JETA 3B7DA 1EZOA 1FQDA 4R72A 3VVEA 4ZEDA 4NF5B 1VSOA 2AL5A 2OCUA 3D4GA 1Q35A 5I2KA 4GXAA 5DTBA 4UA8A 1TFDA 1UTHA 1FQCA 3LSFB 4XXUA 4LP2B 2NWJA 4BDQA 1M5BA 2Y7WA 4U1ZA 4KYDA 4QRZA 1JW4A 1NKXA 3RUMA 3RNNA 1UTBB 3MWBA 2GRVA 4RA1A 3V5AA 2F7AA 1MPBA 3FVOA 4TLLB 4TQUQ 1LGBC 1JVXA 2ZXTA 2ZYMA 4F31B 1NFTA 1PB7A 4QFOA 4Z0IA 2Y7KA 3TKDA 1MDQA 5AA1A 5HBCA 3MVZA 1BIYA 3C4MA 3EHUA 4JXIA 3FVNA 2A5TB 4NTLA 4F1UA 4KCDA 3Q29A 3MQ9A 5AA2D 3PUXE 4N13A 4OESA 4U22A 1RYXA 4YMAA 1J1NA 5FTHA 1Z7ME 4NF4B 2XHDA 1NL5A 3I3VA 5ISUA 1A40A 4DE8A 1QVSA 4PFYA 3S9LC 5KCJB 1I6BA 1GV8A 4HTGA 1XHYA 4UACA 2Q9TA 3RLFE 3CSBA 4WKMA 3T9UA 3IB1A 3TZAA 2Z8DA 1Y20A 4YKPA 4OENA 5FHOA 3OENA 1XVXA 1Y4CA 4IY6A 4OXVA 1SW5A 3R6UA 4QSCA 1NH8A 3O6HA 1MXVA 1A55A 5IKBA 4QSEA 4KCCA 3N5LA 4O3CA 4MFIA 1MXYA 3O28A 3K6WA 1SI0A 3EHSA 1M5DA 1II5A 3N94A 3I6VA 4E0XA 3H7MA 2R9JA 3K6VA 3IO4A 3RTWB 5AA4B 4XTCQ 3VXBA 5CMKA 3Q28A 1US5A 4R6KA 2O1MA 4YKJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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