1HSEA

H253m n terminal lobe of human lactoferrin
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
317
structure length
317
Chain Sequence
RSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRRVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSMAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutagenesis of the histidine ligand in human lactoferrin: iron binding properties and crystal structure of the histidine-253-->methionine mutant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LACTOFERRIN
molecule tags Iron transport
source organism Homo sapiens
total genus 93
structure length 317
sequence length 317
ec nomenclature
pdb deposition date 1996-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1hseA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1hseA02
1HSLA 1B51A 2G93A 2KLFA 3K01A 4GRKA 2HAUA 2QL3A 4G77A 4NF8B 4OFLA 4Q8RA 3B7DA 5I56B 2ONSA 4PP0A 2Q88A 3N6UA 4LVQA 5IKBA 5IAIA 5ICTA 3IJOB 1PBPA 5ISUA 2P0SA 3ONMA 3BFUA 2UYEA 1N3XA 1S9TA 3FXUA 4ZECA 2QSXA 1JW5A 5ICQA 2I58A 1VR5A 2ZNTA 4RY1A 1B1XA 4ND9A 1IXIA 2D5WA 2NUVA 3FVGA 4H6DA 5BUUA 1S50A 3H6UA 2O7IA 2DYXA 3VVDA 2V84A 2Q2AA 2I3WA 3MUQA 1Y1MA 2O1MA 1DTGA 2O7UA 2PX1A 2ZYNA 1MH3A 1N84A 3VDFA 3PU5A 1B58A 4OEUA 2H9BA 3MVZA 3D4GA 1EU8A 1LCFA 1UTBB 2UVIA 1NNPA 3CSGA 1URSA 1UTHB 5CBRA 3IAZA 5H8FA 2RC9A 2Y7KA 5EYFA 4E0WA 4F2OA 1QKAA 3CI8A 3OO9A 3KFMA 4OMBA 1AL3A 1SYHA 1M5DA 2VHAA 2VP1A 3KJTA 3SEUA 1RYOA 2ALUA 4GQOA 2ONKE 1MM7A 4BDMA 2V93A 5JTYB 1FTKA 3LSFB 2R6GE 1P1QA 3C34A 3SETA 4PFYA 5JK4A 2H25A 4KPTA 1YTVA 4FEBA 1PEBA 2O6AA 4F1UA 4ZS9A 2FYIA 4DCYA 4I62A 4QFLA 2DWJA 1MRPA 3K6UA 3TYHA 3E4RA 1R9QA 4O3AA 4BDQA 4TLMB 4U22A 2GH9A 1ANFA 2B65A 3K1PA 3LUYA 3MWBA 3S4UA 5TP9A 2ZNSA 2I49A 1FW0A 5AA1A 1JQFA 1MY0A 3HO7A 4F18A 2AL5A 3FGSA 3TAJA 3I3VA 5I84A 3IOUA 3T93B 1H45A 3VE1B 4NF4B 1B3LA 1VFEA 4MF3A 3IO6A 4IO3A 3Q28A 3OENA 4TQUQ 4R6KA 4R74A 3OEMA 1JEVA 5FTHA 1WVJA 1Z7ME 1QULA 4FIMA 1URDA 3C9HA 1JNFA 2QS2A 1ZJLA 3PUVE 2W7YA 1P1WA 4JXIA 4QHQA 4X1BA 2DVCA 4IO2A 3K6WA 3QUFA 1ATGA 5I2KA 3MW0A 3CIJA 3GBAA 3RGYA 4RXLA 2ANJA 3KZGA 3MJNA 2FNCA 5TP9B 3MPLA 3LC8A 3IB1A 4LZ5A 3V5AA 4EQ7A 2DXYA 3IOTA 2NVUB 1EZ9A 1MDQA 1B0LA 3SEYA 5F7VA 4EXLA 2I4BA 4P0GA 1J1NA 4M1VA 2Z8FA 2DE2A 5H8QA 3VLWA 4NF5B 2F34A 1NNTA 1OQGA 4IGTA 3QK6A 4OYVA 5FTIA 4NMYA 2AIXA 3FZVA 2XXPA 1T0KA 1OVTA 4KR5A 3EN3A 2YPNA 3FATA 4F1YA 5KDTA 4EUOA 3RQTA 4JBZA 4U21A 1I69A 5KZTA 1RYXA 3C36A 2F7AA 4TOZA 2A5SA 1YCJA 3R7XA 2XXHA 4ZEBA 4C1TA 1FTOA 2O69A 3TTNA 5H8HA 3T9UA 1FQEA 4QSEA 4GWOA 4OFJA 1IIWA 4O3CA 3UP9A 3KBRA 3O66A 2I48A 2XX9A 2DWHA 3KSJA 3O9PA 4H8IA 4U23A 3TQWA 3VVEA 4FJPA 2DWIA 3MAMA 1LLSA 3JYRA 3T9HB 1YAEA 2VGQA 3K00A 1MM6A 4DXCA 2O68A 4ELPA 1MXWA 2OWTA 2FA7A 1FCKA 4FATA 3CSBA 3LR1A 4PFTA 1URGA 2F97A 1JVXA 4YKPA 4WKMA 2V25A 3H06B 4F1VA 3E3KA 3U1OA 2F78A 3SEXA 3RPWA 1F9BA 3KN7A 4Q0CA 2XXRA 5LOMA 3PGFA 1UIUA 3MC2A 5HPQA 4NF8A 4ONYA 3ZKKA 2RF1A 1NFTA 3L6HA 3N6TA 3SDFA 2Z23A 4F39A 3USDA 4LZ7A 2OZZA 4H1XA 4BDOA 1QVSA 3U92A 1D9YA 2XXWA 3TELA 4LP2B 5I59A 2F6GA 4X9TA 4ISUA 1LCTA 4GOTA 1N0TA 2ZMBA 4NEDA 1I6BA 4N6PA 4O3BA 2Q89A 4YB7A 2Q9TA 3KN3A 3PPOA 3OO7A 2M8CA 3Q26A 3TTRA 1LAXA 2F36A 2XXXA 3RT6B 3FV2A 2GFEA 1SDXA 1B52A 3CFLA 3MVXA 4N13A 4P11A 1B4ZA 3PMVA 4XKQA 3ILUB 1H76A 3FJGA 4RK2A 1NNFA 3VLUA 4ZZAA 3AXFA 1NNKA 3O6HA 4F3GA 5L9OA 1FTLA 1VFDA 4KHZE 4FORA 1B5HA 3I5OA 1GGGA 1TFDA 1Y1ZA 4C0RA 3FIRA 3G3GA 1SI1A 1MY4A 1ELJA 2I3VA 2XXYA 2ZYMA 5I59B 1A55A 2XXUA 2OLBA 3PUWE 2UVHA 5CRYA 3G3KA 4ZZEA 3FD3A 2A5TA 1UTBA 3TKDA 1MY2A 3RN8A 1UTHA 2ZNUA 3VV5A 1B7HA 1Y4CA 4KI0E 5CMKA 2DOJA 4GIZA 3EQ1A 3K4UA 1Z7NE 3SEVA 1TXFA 5AA2A 4U2RA 3I6VA 4IGRA 3T96B 1UQWA 3OEKA 4DE8A 2F7BA 4E0XA 4MFIA 4F29A 1Y3QA 3R6UA 3MBPA 1OLAA 1JW4A 3ODBA 4NWCA 4G2ZA 2XD2A 1ZTYA 5JTYA 3B6QA 3C35A 1CE2A 1O7TA 2AL4A 4HW8A 5I2NA 2XXVA 3Q25A 1N04A 3MVWA 2O1LA 3PD8A 4F3BA 2THIA 4G4PA 4OXVA 1NKXA 1Y3PA 5ITPA 2XX8A 1MY1A 2I6EA 4G8MA 5CMCA 3HV1A 2A5TB 4HCYA 3IB0A 3K6XA 3MP8A 1IQ7A 2Y7PA 1O63A 1LB8A 4JB7A 1MG1A 2QMXA 1ZBMA 1VE4A 2ABHA 4IB2A 4YZZA 3OO8A 2QRYA 4PETA 4H65A 5AA2B 1NH7A 2OCUA 4HCWA 4N07A 2ZYOA 2I0CA 5FHMA 4RJZA 4R9FA 1FTMA 4P0IA 1JVYA 3JZJA 2QS1A 3CG3A 1PB8A 3KOTA 4PFUA 1B5JA 4RA1A 1LGBC 3C4MA 4GD5A 3E13X 3N94A 3T22A 3OXNA 3SEWA 3IR1A 5DYHA 4NF4A 3UK4A 4K3FA 3VXBA 5I2NB 3MZBA 3H4ZA 5DEXA 1LFIA 1TFAA 4R9GA 5I58B 4DZ1A 1QUIA 2Y7RA 1PDAA 4QFPA 1IEJA 3VXCA 4Z0IA 1AOVA 4EF2A 2HCAA 1XC1A 1ZIUA 1MDP1 1FQFA 1SVXB 2HZLA 2IA4A 4C1UA 1FQBA 3BFTA 5F1QA 1SW5A 4YKJA 2DVZA 2UVGA 5EHMA 4FE8A 1MXYA 4WEDA 1IXCA 2QS4A 3TTKA 2DXRA 3O29A 1M5EA 2P1SA 1II5A 4TLLB 1S7YA 1MPDA 4BDLA 1Q35A 2UYFA 4YB5A 1HSEA 1LAFE 2QS3A 2XXTA 1B9JA 4NF5A 1KWHA 4GL0A 1B4HA 2IEEA 1HSJA 2Z8DA 1ZMGA 5DEXB 3LSLA 3SKPA 4PQJA 3KEIA 4IO7A 4XXUA 1CB6A 4H5GA 4R75A 2PBWA 4ELOA 3A09A 3G3FA 3M3FA 4YMBA 3CVGA 4JWXA 4OETA 3PUXE 2OJTA 3K0VA 1LBCA 1DTZA 1MS7A 3TCHA 3FXRA 5H8NA 2I4CA 5TPAB 4KFQA 4LUBA 3O6GA 4PE5B 5K2XA 4YU0A 1JETA 3OOAA 1POY1 2V3QA 3MPKA 1OVBA 3K02A 4GVOA 3MZ1A 4F22A 3ZKLA 3PV0E 4G8HA 1N3WA 3SERA 4YB6A 5DVJA 2H99A 2Z8EA 2OBGA 5CMBA 4RNSA 2Y7WA 1IITA 1D3KA 1MY3A 2GHBA 3M8UA 3EF7A 4LZ8A 4GFRA 1UIVA 4H8JA 1PB9A 1MXUA 1ZU0A 1MQGA 4GLIA 4NWDA 4FEDA 3FVOA 2XXQA 3O97A 2X26A 3V83A 1A54A 2VOZA 5AA4B 2P2AA 1Y20A 3IOVA 4X1DA 2GHAA 1IZ1A 3CFXA 4NF6B 3IB2A 5H8NB 3RUMA 4KYDA 4Z7EA 1XS5A 4WEPA 1WDNA 4F2QA 1BIYA 1I6AA 1US5A 1B3GA 3IJXB 3W15C 1IXGA 4QSDA 3UORA 3T9XB 1B0HA 3HN0A 3HSTA 1FTJA 1B1HA 1AH5A 2DS9A 4AQ4A 1EZPA 3N5LA 3KSXA 3VLVA 4KQPA 1GVCA 3KGCA 5DVIA 5AA2D 3OELA 4YKIA 1AIVA 3CR9A 3G3HA 4Q30B 5KCJB 1L5TA 2VD2A 2V3TA 1A40A 4ZEKA 1OLCA 2RC7A 1Y3NA 3GXAA 1OQHA 4RPNA 5JEIA 1BTJA 3K1MA 1EZOA 2X7QA 3DELB 4RPOA 5AE4A 4R72A 2XXIA 1SYIA 3B6WA 3JV9A 4JWOA 1P1NA 2DE3A 3MP6A 3RLFE 3MVYA 1BLFA 1MPBA 3THIA 1SI0A 1BKAA 3LSWA 2HEUA 3W9VA 5HM4B 3SESA 2HFBA 4L17A 2B3FA 3FJ7A 3S2VA 4R2BA 2ESNA 3PUYE 4OESA 1GTKA 3LBSA 4FAJA 2H98A 3TZAA 3QAXA 2PT1A 4NTLA 5CI5A 1A8EA 3V8XB 2YJPA 3FJMA 4F3PA 3TDJA 4ELQA 1PB7A 2NXOA 3M3KA 3U72A 1D4NA 5ITOA 1P1OA 3A3UA 1JW1A 1Y4TA 2XD3A 3IK6B 1MQDA 4WXJA 1PBQA 3B6TA 3KJ7A 2H5YA 2Y84A 4PFWA 4OQOA 2UXAA 3QSLA 5K2YA 3UIFA 3M3LA 2Y7IA 5L9MA 2ZYKA 3KG2A 4G68C 1H3DA 1B7ZA 4MBPA 4U4SA 4H67A 1A99A 3GZGA 4QFNA 3IOWA 4MLVA 1YPNA 3PMXA 4OENA 5FHNA 1R6ZA 2DWAA 3S9LC 1DPPA 3HHFA 1QW0A 2RINA 3DM0A 3TODA 4LONB 3RTWB 1DOTA 3ILTB 2G29A 3RNNA 1MXZA 2HAVA 4YKKA 1WODA 5CBSA 3S9NC 4G68B 1D9VA 4QF9A 4U1ZA 4KYEA 1NMUA 3C31A 2DQVA 1POTA 3KN8A 1DPEA 2CZLA 4GXAA 3TTMA 1B46A 3U94A 5A5XB 2ONRA 3UN6A 3PPPA 2OWSA 3MQ9A 1R1NA 1LAGE 1LAHE 4LQ2A 3TPAA 4IO6A 1RKMA 4F31B 4DXBA 4IY5A 3HPIA 4H0WA 5CM6A 2Z22A 3IORA 3K1NA 5CC2A 1H44A 2R9JA 3PPRA 4JDFA 4OHNA 1AMFA 3TUSA 1I6QA 2VD3A 5L9SA 2Q8JA 5I58A 4EQ9A 3H6WA 4AB6A 2GRVA 4Q5TA 4GL8A 1ZKBA 4KCDA 1MPCA 3WAEA 1M5CA 4IY6A 3OD7A 3GBBA 2OK2A 1SD3A 1XVXA 3T66A 1USYE 3OSQA 4YAHX 4HS7A 2RC8A 4BDRA 1B40A 3ZSFA 2I0BA 3BBRA 3EHTA 3QUJA 2QJEA 4QFOA 4OZ9A 4IO4A 4EQBA 3TTLA 3FV1A 3UA8A 3N26A 3OMBA 1A7LA 3EHUA 4XKNA 5FHOA 4UA8A 2D3IA 4QFKA 4I8CA 2O51A 1N7WA 5M2VA 1P99A 3TCFA 1P1UA 4IO5A 1SW2A 3H6VA 4RK9A 3KOSA 3H7MA 1O64A 4R6YA 3PMWA 3FXQA 4DIGA 3PPQA 3FUZA 3K6VA 4EDPA 4ZE9A 4KYSA 1B3HA 2F8DA 5TPAA 4XIGQ 4I9DA 3H3GA 4LQ5A 1B3FA 4AB5A 4OVJA 1M5BA 4THIA 1BP5A 5H8FB 4LA9A 5CMMA 2PT2A 5EHSA 1NH8A 5AA3A 1ZLQA 4BDNA 3CFZA 4H5FA 3QIMA 3TQLA 2NWJA 4XTCQ 5J1DA 4FECA 2PYYA 1B5IA 1Y9UA 3L6GA 1B3EA 4ZEIA 5I57A 3Q29A 4XKRA 2XX7A 4JSDA 1B6HA 2AYSA 1A8FA 3Q27A 3U93A 2HZKA 1NL5A 5AA4A 5ELVA 4MLQA 3TMGA 1FQCA 4JWYA 1SBPA 4ZE8A 4ZEFA 2PMSA 4NF6A 1MQJA 3C32A 1TWYA 2CMOA 3WAFA 4DLDA 2V3UA 1JEUA 3IO4A 4DDDA 2Q2CA 3RT8A 4F19A 4HTGA 3PPNA 1B7UA 3H6TA 3RTFB 3V89B 3D4CA 1TT1A 1IXHA 4OWDA 3UGWA 3O28A 3VFJA 2F7CA 1LFHA 3H03A 4OTEA 2HXWA 1EH3A 5I57B 3DP8A 2DP8A 4OERA 3F11A 5KCJA 1R9LA 3MZ9A 3W9WA 4DXUA 5DTBA 3E9XA 4LATA 1QUJA 4XKPA 4G8NA 1H43A 4ESWA 4YMAA 5BWJA 4UACA 1FQAA 4X48A 3QYTA 2DSFA 4M4GA 2QMWA 4GF8A 1N76A 1MH4A 3G7WA 4EXKA 3PD9A 4OEVA 1OIBA 4ECFA 4POWA 2H4IA 1B05A 2E1SA 2E0SA 3ECRA 5DVFA 2WKYA 2BJJX 3HCQA 3EPEA 1B2HA 4MH5A 4ELRA 4I1DA 5I2KB 3VVFA 3OO6A 2QPQA 3T9VA 4QRZA 3TCGA 1LSTA 4NE4A 3O2AA 3P7IA 4R73A 4OFOA 1VSOA 1US4A 4BLAA 3G3IA 3QXMA 2B3BA 4U4XA 2RCBA 4EF1A 4POXA 5DT6A 3RY3A 1LB9A 3O6IA 5H8QB 1SW1A 1OMPA 5B7DA 3IL1B 3FVNA 1M5FA 2LAOA 2REGA 1GR2A 3CRBA 2F35A 3A3CA 3S9EA 4R2FA 5KDTB 2RKMA 4U1OA 3S9MC 1XOCA 3CG1A 1FQDA 1Q1KA 3HHGA 2O84X 4F3SA 3DLNA 2REJA 5HBCA 2F5XA 1SQYA 1GV8A 2F6PA 3R26A 1MQHA 3DP6A 3MP1A 3FVKA 3FASA 1QUKA 4QSCA 3LSXA 1N7XA 4GXSB 3C33A 3IX1A 1LFGA 3BKIB 5H8HB 1XT8A 1QKBA 4ZDMA 3K2DA 5I56A 4KD5A 4YICA 2RCAA 5TU0A 3TFLA 2YLNA 2R71A 1MQIA 2PVUA 4ESXA 2ZXTA 3EHSA 2DE4A 3G3JA 2XHDA 4G68A 1XHYA 4ZEDA 4KCCA 2UVJA 5H8SA 1PC3A 1DMBA 4JSOA 3U8QA 1B32A 2X7PA 1SW4A 5A5XA 5B70A 3ZS6A 1DSNA 1LBBA 1IUDA 3DP4A 2D21A 3OSRA 1MXXA 5L8DA 2NOOA 3PUZE 1MXVA 4DCXA 3GLBA 4R6HA 1XVYA 4RYAA 1QJMA 2HQ0A 3TEPA 1USYH
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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