1HSEA

H253m n terminal lobe of human lactoferrin
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
317
structure length
317
Chain Sequence
RSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRRVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSMAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mutagenesis of the histidine ligand in human lactoferrin: iron binding properties and crystal structure of the histidine-253-->methionine mutant.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Iron transport
molecule keywords LACTOFERRIN
total genus 93
structure length 317
sequence length 317
ec nomenclature
pdb deposition date 1996-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1hseA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1hseA02
5JK4A 1B40A 1Y4CA 5ICQA 4O3AA 5I56B 3N6UA 2QL3A 3RNNA 1MPCA 3IK6B 2D3IA 3OEMA 4NWCA 3DP6A 4OTEA 1JEVA 4ONYA 4WXJA 3RT8A 4DLDA 4E0WA 3RY3A 1A55A 1SW1A 1ZMGA 2UVJA 3E9XA 3PUYE 4N07A 4O3CA 5HPQA 1NH8A 1R1NA 1AMFA 4YAHX 1B7ZA 1TXFA 3MP8A 4GXSB 1MXWA 2QPQA 4U23A 1I6AA 5H8NA 2D5WA 1B5HA 3KG2A 4LA9A 1VFEA 1FQEA 1LCFA 2NUVA 3BFTA 3K00A 2A5TA 1GGGA 1MPDA 4M4GA 5IKBA 2OCUA 3T9UA 2XXHA 3M3LA 4OZ9A 5DTBA 3UIFA 4L17A 2VP1A 4DZ1A 3B6QA 1SDXA 3FV1A 4N6PA 4Q30B 3I5OA 3N94A 2XXTA 1TT1A 4KFQA 4QFPA 4QSEA 1ZLQA 2I0CA 3OSQA 3FIRA 5EHSA 3D4CA 4ZS9A 1WODA 4K3FA 4BDNA 4OETA 5ICTA 3OD7A 3E4RA 3MP1A 1TFDA 4NF6B 4P0GA 4FORA 2ZYKA 5H8NB 1ELJA 1LB9A 4OMBA 1POY1 3EHSA 3IOWA 1LAXA 3D4GA 3U72A 1FQAA 2ONKE 5AA3A 4H0WA 3S9LC 3BKIB 2REJA 4H67A 5DEXB 4RA1A 2GHAA 4ELQA 1DSNA 1LFHA 4YMBA 4X48A 4F1UA 1N7WA 1NMUA 5KCJB 1UIVA 2VHAA 3O6GA 3R6UA 4IGTA 1QJMA 2DVCA 2LAOA 3QK6A 3S9EA 4NEDA 2O84X 1OLCA 4OEUA 1MQJA 3Q29A 5KDTA 1JW1A 4UACA 5JEIA 3DLNA 3JV9A 1NFTA 3H6VA 3TDJA 2H5YA 1PB8A 2YPNA 2HCAA 3TZAA 3K2DA 1PB9A 2RF1A 4NMYA 3MP6A 4OENA 3B7DA 1HSLA 4U21A 1SW5A 1DTGA 1FQFA 2XXRA 4G8NA 3IJOB 1JQFA 3K01A 3VLVA 5DVIA 3C31A 1GR2A 3CFLA 1JW4A 1MQHA 2XX7A 1D3KA 4RK9A 5L8DA 2F6GA 2PT1A 1LAFE 3A3UA 3FGSA 3K02A 4G77A 4DCXA 4TLMB 1PC3A 4R2FA 5F7VA 1D9VA 2H25A 1XVYA 3K1PA 2O7UA 3MZ9A 3RT6B 5L9SA 4ZECA 1B46A 1QULA 2XHDA 1UTHA 2Q9TA 2V3TA 2XXYA 2Z23A 2E1SA 4G2ZA 4PFWA 2Y7PA 4R2BA 4R9GA 1Z7ME 1AIVA 1JW5A 3LBSA 4KQPA 3C36A 1Y9UA 1OVBA 1XVXA 2R6GE 3T66A 4NF8A 4LVQA 4YKIA 3MJNA 3QXMA 2DWHA 5BWJA 3K1MA 4EF2A 2UYEA 5DVFA 1B58A 4NWDA 5K2XA 3AXFA 4H1XA 1P1NA 1US4A 1OMPA 3MZBA 4OVJA 2DXRA 1GVCA 3ILTB 4FATA 5AA2A 3PMXA 1DMBA 1BP5A 1ATGA 1VSOA 2QMWA 3MVZA 1II5A 4XKNA 1XHYA 2RCAA 3OOAA 2O1MA 4DIGA 2X26A 1URDA 3FVOA 4KI0E 3JYRA 4YKJA 1DPEA 1HSEA 2E0SA 3G7WA 3O9PA 4ELRA 2H9BA 4ECFA 5ISUA 3TQWA 1OQHA 2Y7IA 2QS1A 4F18A 4NF4A 3FZVA 5I59B 3O29A 3PPRA 4GOTA 2PX1A 4JXIA 4QF9A 4MFIA 2ZNSA 3KSJA 2RINA 1MQIA 2OJTA 3VXBA 3QUFA 4FEBA 1O7TA 2F78A 3C33A 3MVYA 4XTCQ 3SKPA 1SVXB 3E13X 4XKQA 4G68A 5DVJA 4BDOA 3KZGA 5I57B 3IAZA 3OO6A 1GTKA 2PMSA 4I8CA 5L9MA 3LC8A 1CB6A 1Q35A 4IO3A 1A8EA 1FQCA 3HHGA 2Z22A 3A09A 5CBRA 5AA4A 4F31B 1FQDA 2KLFA 1H45A 1MY2A 1YTVA 3G3KA 1HSJA 3O2AA 1VE4A 3HN0A 3PMWA 1L5TA 3VVFA 4F3SA 3CRBA 3K6WA 3N26A 1SYHA 3N5LA 4ZEFA 3USDA 4R6YA 4EUOA 1FTJA 4GLIA 5A5XA 4PETA 1H44A 1EZ9A 3VXCA 1NNTA 2Q2CA 2UYFA 4KCCA 2O1LA 3IB0A 2I58A 3DM0A 5B7DA 3G3HA 2XXIA 2HZLA 4Q5TA 5AA2B 4GVOA 5I59A 1MRPA 4GIZA 1LFIA 4HCWA 2RC8A 3PMVA 4GF8A 1UTBA 4BDMA 4Z7EA 5I57A 5DEXA 3OMBA 4XKRA 1SBPA 3BBRA 3MPKA 4PFUA 2IEEA 2P2AA 2X7QA 3O66A 1UIUA 4WKMA 4F1YA 4F3GA 1I69A 3FVKA 4QFLA 4JDFA 1LGBC 2XXVA 4NF6A 1SYIA 2ZYOA 4DE8A 2PVUA 5BUUA 3TTNA 3KN7A 3TTLA 2VD3A 3MWBA 1BKAA 1ZIUA 1ZJLA 4MLQA 1BIYA 1PDAA 2PT2A 2RCBA 3C34A 5TPAB 4AB6A 3ZS6A 4XXUA 3TAJA 3IB2A 1B4ZA 1PEBA 2F7CA 4QHQA 1N3XA 1NNKA 4ZZAA 3SEVA 3GBBA 1B5IA 4EQ9A 3SESA 1XOCA 3B6TA 5TP9A 3VDFA 1P1OA 3KOSA 1TWYA 4OFJA 4NF4B 3EHUA 4YU0A 4BDQA 1AH5A 3PPPA 3PPQA 5FHMA 4ZZEA 2DVZA 3O97A 3FJ7A 1B52A 1YCJA 2GFEA 4TQUQ 5I58B 2GH9A 3UGWA 3PUXE 5AA1A 1EZPA 2DE2A 1QUJA 4FIMA 4P11A 4X1DA 2I4BA 1LB8A 3OO7A 4E0XA 3T22A 5CRYA 2DE3A 3IJXB 5ITPA 1B1XA 2Q2AA 2ZNUA 1XT8A 4M1VA 4ZEIA 3PD9A 1B3GA 2HEUA 1MQGA 2HFBA 1MH4A 3C32A 2NOOA 2XX9A 3G3JA 2DQVA 5DYHA 2RKMA 3EF7A 1MM6A 3HHFA 1FTKA 1FW0A 1MPBA 2I0BA 3FD3A 3IOVA 2F7AA 2F7BA 3LR1A 4H5FA 2AIXA 2OWSA 2V3UA 4KR5A 4OQOA 3HSTA 3IR1A 5FHOA 1F9BA 1T0KA 2UVIA 4DCYA 4OESA 4EQ7A 3TKDA 3TELA 2XD3A 4NF5B 4THIA 3TMGA 3TTKA 1PB7A 3SDFA 4R9FA 4RK2A 1VFDA 5FHNA 3N6TA 5KDTB 2FNCA 3Q28A 4GQOA 4AQ4A 3U94A 2AL5A 1Q1KA 1RYXA 1N04A 2H98A 2ZNTA 1S7YA 4ZDMA 4YMAA 3KEIA 1DOTA 3ECRA 4GL0A 2V93A 2DOJA 3CR9A 3H6WA 3MW0A 1MDQA 1NNFA 2ZXTA 3Q26A 2NXOA 4YB7A 4QSCA 1MM7A 3CSGA 3GBAA 4YICA 3TFLA 3U1OA 4JWYA 2PBWA 3GZGA 3R7XA 2OLBA 1US5A 4TOZA 3THIA 1NH7A 3UA8A 1N3WA 2O7IA 1OLAA 3H7MA 3IO4A 3MBPA 2QSXA 2OWTA 1USYH 4ZEKA 2Y7RA 1B5JA 3QYTA 1B1HA 3VLWA 1URGA 3H6TA 1JEUA 4RYAA 1ZBMA 1P1UA 2F35A 4IO5A 2I4CA 2Z8EA 3BFUA 1H43A 1Y1ZA 1S9TA 2R71A 3I3VA 4OHNA 5EYFA 4HW8A 1RKMA 2G93A 4R72A 1LLSA 3FATA 1M5DA 4ZEBA 3ZKLA 2F5XA 3MUQA 3ODBA 5I2NB 3TUSA 3CI8A 4NF8B 1QKBA 1CE2A 5JTYB 3SERA 3UP9A 3W9WA 1B4HA 1IZ1A 1MG1A 3RTFB 3DP4A 4U22A 3OEKA 1OIBA 1P99A 1J1NA 1JNFA 2ESNA 3CG1A 3IOUA 1IXGA 4NE4A 3OO9A 4OXVA 2V3QA 4R6KA 3TPAA 2I3VA 2Z8DA 3W9VA 2ZYMA 3L6HA 1R6ZA 4NF5A 2UXAA 2QS2A 4R73A 3S4UA 4EXKA 2RC9A 4LUBA 5ITOA 3H3GA 1FTOA 3T9XB 3VV5A 3FV2A 1S50A 1P1QA 3LSLA 2H99A 4FAJA 5J1DA 1FTLA 1EH3A 3G3FA 3KJTA 3O28A 4X9TA 5HBCA 3V8XB 1A54A 1JETA 3VLUA 3FUZA 3I6VA 3WAFA 2X7PA 1LCTA 4GRKA 4ZEDA 1NL5A 3H4ZA 3LSXA 3E3KA 3OELA 4LZ5A 1M5BA 1SD3A 2FYIA 4UA8A 4YZZA 3MQ9A 3KFMA 1O64A 1WDNA 4ZE8A 3LUYA 4TLLB 3FXRA 4OEVA 4R75A 3DP8A 3QSLA 4OFOA 3EPEA 3V5AA 3VVEA 3FXUA 1MXUA 2OK2A 4IY5A 1M5EA 1TFAA 4HS7A 5H8SA 1MXVA 3PV0E 4H8IA 2ALUA 4MF3A 4QFOA 3IL1B 4WEPA 3PPNA 4QSDA 3WAEA 2ONRA 3EN3A 3PPOA 4PFYA 3T96B 3U8QA 3CVGA 1IITA 1IQ7A 2H4IA 3FVGA 4U1OA 3LSWA 1RYOA 5AE4A 1IXHA 2XX8A 2OBGA 3Q27A 1FQBA 3H6UA 2VD2A 5TP9B 3TQLA 5H8HA 3SEXA 5IAIA 1PBQA 3KOTA 3C4MA 3PUZE 1SI1A 2G29A 2Y84A 3MPLA 4G68B 4EQBA 1I6BA 2M8CA 1B6HA 4JWOA 1B7HA 1N76A 2HQ0A 3CIJA 1VR5A 3R26A 5FTHA 1R9LA 1H76A 1Y4TA 4RY1A 1YAEA 3KN8A 4ESWA 3TCFA 1KWHA 3RTWB 3SETA 4X1BA 5CMKA 4OFLA 3G3GA 4H65A 3TEPA 1M5FA 3JZJA 5FTIA 2DWAA 5CI5A 1D4NA 1QUIA 3S9MC 3QAXA 4WEDA 4ELPA 1B0HA 1MXZA 4U4XA 4AB5A 3LSFB 4U4SA 5CMCA 5I84A 4I9DA 2XXUA 1B3FA 2DE4A 2F34A 4U2RA 1ANFA 4FE8A 4Z0IA 3TTRA 1Y1MA 3FASA 1MXYA 4POWA 3TCGA 4LP2B 3S9NC 2ONSA 2HAVA 3PD8A 1POTA 1A7LA 4KCDA 1EU8A 3HV1A 3K6VA 3SEUA 2FA7A 2AL4A 4MLVA 4EXLA 1IIWA 3IB1A 2BJJX 1Y3NA 1O63A 1A40A 3M3KA 4OWDA 4IO2A 2OZZA 4PP0A 1BTJA 4QFKA 2W7YA 2UVHA 1DTZA 1IXIA 1MXXA 2IA4A 1JVXA 2R9JA 4KHZE 4LZ8A 1B9JA 4BLAA 4F3BA 2Q88A 4ND9A 1P1WA 3IORA 2XXXA 4RXLA 2A5SA 3RLFE 3RN8A 2I49A 1MY3A 3IO6A 1ZU0A 4JSOA 4KYDA 4G68C 4JSDA 4H6DA 4BDLA 5I2NA 4IO7A 1B3HA 2DXYA 4LATA 5DT6A 3M3FA 2REGA 4YB5A 4RPNA 4GWOA 4R74A 3VE1B 4BDRA 2I6EA 3MVXA 1ZKBA 2F36A 5I2KA 1MY4A 4G8HA 3MZ1A 4XIGQ 4C1UA 2UVGA 1LAHE 4I1DA 2ZYNA 1N0TA 3QUJA 1MS7A 3PU5A 5HM4B 4I62A 1LBBA 5ELVA 4RPOA 4O3BA 2GHBA 1UTBB 1PBPA 1MY1A 4MH5A 1GV8A 1EZOA 2HAUA 3C35A 5H8FB 4F3PA 4H8JA 1D9YA 2QJEA 1LAGE 1IUDA 3P7IA 3RUMA 4F1VA 1IEJA 2YLNA 5H8QA 4DXUA 4F2QA 5I56A 2HZKA 1LSTA 4F29A 3RGYA 1LBCA 3T9VA 2Q89A 3ILUB 1QUKA 1SI0A 3MVWA 3SEYA 4FECA 2ANJA 2F97A 5I58A 4GXAA 3U93A 3ONMA 4F22A 3IOTA 2XXPA 4JBZA 3CG3A 3KJ7A 1BLFA 3B6WA 2F6PA 4GL8A 4ESXA 3PUVE 1DPPA 3MAMA 2V25A 3EHTA 1OVTA 2P1SA 4PFTA 3V83A 2HXWA 4FEDA 4R6HA 4GFRA 3FJMA 3K1NA 1SQYA 4IY6A 3T9HB 1I6QA 3OENA 1B0LA 1N84A 2V84A 5H8QB 2VGQA 3MC2A 3KSXA 3T93B 3C9HA 5H8HB 4IO4A 4PE5B 1ZTYA 5I2KB 2VOZA 1MDP1 2CMOA 5CM6A 2A5TB 5CMMA 1QVSA 4XKPA 2NVUB 3PGFA 4DXBA 1AOVA 4P0IA 2CZLA 1FCKA 3FJGA 2O51A 4QRZA 1B2HA 4ELOA 1JVYA 1UQWA 3OSRA 4LZ7A 2ZMBA 1AL3A 4Q0CA 3CFXA 3TTMA 3TYHA 4C1TA 3F11A 3GXAA 4DDDA 4LQ2A 5CBSA 2D21A 2PYYA 5KCJA 4N13A 3GLBA 2NWJA 4HCYA 5CMBA 2XD2A 4HTGA 1R9QA 4POXA 4KPTA 5F1QA 3S2VA 2QRYA 3UORA 3V89B 3VVDA 1NKXA 3KGCA 4C0RA 1H3DA 1MQDA 1QKAA 1SW4A 1FTMA 1LFGA 2ABHA 3K4UA 3L6GA 1A99A 2O6AA 2DS9A 3KBRA 4QFNA 3Q25A 4U1ZA 4F19A 5B70A 3FVNA 2THIA 5H8FA 2I3WA 3CSBA 4ISUA 3HCQA 3UN6A 2B3FA 1IXCA 5AA2D 2Y7WA 4KYEA 2GRVA 2O69A 2QS3A 3M8UA 4LONB 2Q8JA 3EQ1A 1MY0A 2QS4A 5EHMA 4LQ5A 3ZSFA 3TCHA 4DXCA 2DWIA 5M2VA 1B7UA 4JWXA 3CFZA 4MBPA 2XXWA 1B3EA 3KN3A 2Z8FA 1B05A 4EF1A 1USYE 4F2OA 3SEWA 3RQTA 2DYXA 2RC7A 4GD5A 4EDPA 2I48A 3H03A 3W15C 5LOMA 3U92A 5TU0A 1B32A 4F39A 4KD5A 4FJPA 4IGRA 2QMXA 4YB6A 3IX1A 3RPWA 3HPIA 3O6HA 4RJZA 3ZKKA 3K6XA 3K0VA 5KZTA 1QW0A 1OQGA 1WVJA 1SW2A 3FXQA 3O6IA 2XXQA 2DSFA 4IB2A 5L9OA 1NNPA 3A3CA 3TODA 1XC1A 5AA4B 3OXNA 2WKYA 4IO6A 2P0SA 3OO8A 2DWJA 1MH3A 4OERA 2B65A 3QIMA 4G8MA 4G4PA 5TPAA 4YKPA 1B3LA 2O68A 3HO7A 4H5GA 1N7XA 2YJPA 3UK4A 1Y3QA 1M5CA 3G3IA 3K6UA 4NTLA 3DELB 5A5XB 1A8FA 1UTHB 4OYVA 5JTYA 3PUWE 1Y3PA 5K2YA 3H06B 2Y7KA 1B51A 4YKKA 4JB7A 2DP8A 3VFJA 1YPNA 1XS5A 5CC2A 1Z7NE 2AYSA 4ZE9A 1URSA 4KYSA 2F8DA 2B3BA 1Y20A 4PQJA 4Q8RA 4RNSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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