1HSEA

H253m n terminal lobe of human lactoferrin
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
317
structure length
317
Chain Sequence
RSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRRVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSMAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Iron transport
molecule keywords LACTOFERRIN
publication title Mutagenesis of the histidine ligand in human lactoferrin: iron binding properties and crystal structure of the histidine-253-->methionine mutant.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 93
structure length 317
sequence length 317
ec nomenclature
pdb deposition date 1996-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1hseA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1hseA02
3PPPA 4F1UA 1N04A 1IXGA 4P11A 3RTFB 1JW4A 1RKMA 2F5XA 4Z0IA 3FV1A 2OK2A 4BDMA 5ISUA 1O7TA 2Q89A 1T0KA 4BLAA 1LSTA 5H8FB 2THIA 5IAIA 3Q27A 2DWAA 1Y4CA 2F78A 3EHUA 2P2AA 1USYH 2G29A 1FTJA 1IEJA 4AB5A 4AQ4A 4KD5A 1B58A 2PT1A 3VXCA 5AA2D 4M1VA 2I6EA 2KLFA 2RCAA 2E0SA 4LZ8A 4ELQA 3G3GA 3VVFA 1MQDA 4HCWA 4PQJA 1NH8A 1B3EA 3G7WA 2YPNA 4F3BA 5ICTA 1US5A 2P1SA 3N6TA 5CM6A 1SBPA 4GF8A 4G68C 3TDJA 5A5XA 1ZMGA 4RPNA 2NXOA 4DXUA 4QFPA 5B7DA 4YMBA 4TQUQ 4X9TA 4P0IA 1OVBA 2DE4A 4NF4A 1NFTA 4KYDA 3MP8A 4FAJA 4MLQA 3VVDA 1M5DA 3I6VA 5TP9A 5TPAB 3UK4A 2OCUA 3IJXB 3KG2A 4EXLA 1B9JA 4GOTA 1N76A 2VGQA 4GL0A 4IO6A 1A99A 2I4CA 4LUBA 4ECFA 4LP2B 1NMUA 3BKIB 1UIVA 3PPRA 1QVSA 5DEXB 1Y20A 4RPOA 2ZYKA 5HM4B 1SW5A 3M3FA 4RY1A 5KCJA 4OYVA 4F2QA 4MBPA 1QUJA 3K6VA 4IO4A 2D21A 4I62A 2Z8EA 2D3IA 2ZYMA 1MXXA 4X1DA 2D5WA 5KDTA 3KEIA 4FE8A 2A5TA 4PFTA 3C34A 3ILTB 2H99A 1UTHB 4IO5A 1URGA 1EZPA 1H76A 3KOSA 3U72A 4HTGA 2HEUA 2V93A 4R72A 4F39A 2XXHA 4IY5A 2RC7A 3TCHA 3QSLA 3FJMA 5BWJA 3IOVA 2I4BA 2I58A 3SDFA 1Y3NA 4ZE9A 2ONRA 3FVGA 1DOTA 4FIMA 4FEDA 4ESXA 1H3DA 4RJZA 2F36A 4FATA 4N13A 4G4PA 1BIYA 1Y3PA 4PP0A 5JEIA 4EF1A 4N6PA 3EQ1A 3TMGA 1A8FA 1B2HA 1QJMA 3UIFA 3M3KA 3CG1A 1UQWA 1FTMA 1P1WA 2O1MA 4KYEA 1OQHA 4EXKA 2XXTA 1EU8A 4JWYA 2A5SA 2ANJA 1MQIA 3O29A 4U23A 4JBZA 1B7UA 4ZEFA 3U92A 2XD3A 5H8QA 2ZYNA 4YKIA 3EF7A 1RYOA 5EYFA 1OLAA 3PMXA 3FASA 1YAEA 1MRPA 3U1OA 5I59A 1B7HA 3MZ9A 2XXVA 1A8EA 3H4ZA 4XTCQ 1L5TA 3E13X 1BLFA 3LBSA 1B4ZA 1NL5A 2AIXA 3MQ9A 3IB1A 4WKMA 4GWOA 3KJTA 3OMBA 2NVUB 3DELB 1QKBA 1LFHA 4QSDA 2DSFA 3SERA 3O6GA 1DMBA 2I48A 4ELRA 2V25A 5FHOA 1Y3QA 4F18A 3L6GA 2OJTA 3KN7A 3LSFB 2GFEA 1IXCA 1M5BA 3Q25A 4OZ9A 5H8FA 3ILUB 1ATGA 2QS1A 3S9NC 3S4UA 2Q88A 3KOTA 4LONB 2O51A 3TUSA 4G68B 1QKAA 1SYHA 3H6WA 1N3XA 1Q35A 4ELPA 4R74A 3Q26A 5AA1A 5KCJB 1FQCA 3W15C 1LAHE 2H98A 4TLMB 3IO4A 3K6WA 3MVZA 2DS9A 1Q1KA 3N26A 3W9WA 3AXFA 4FJPA 1JEVA 1RYXA 1BTJA 1JVXA 3A3UA 2VOZA 4F19A 3H6TA 2PX1A 3B6TA 4FORA 4WXJA 2PMSA 2F34A 4NF5A 1HSJA 1LAFE 3EPEA 1Z7ME 2DWJA 1POY1 4DCYA 2Z22A 3FJ7A 4LQ5A 1M5EA 3MAMA 3GBBA 1SW2A 1WODA 4WEDA 3IB0A 3RNNA 1P1OA 1TFAA 3MP6A 3LSWA 4EF2A 3KBRA 1ANFA 3K1PA 1FW0A 3PMWA 1BKAA 1I6AA 4XKRA 3OO7A 3K0VA 3MPLA 2CMOA 2ZYOA 1ZJLA 1UTBB 1FTOA 3VDFA 4POXA 4H5GA 4H0WA 3MC2A 2NWJA 1TXFA 3KN3A 4JDFA 5KZTA 1JETA 5CMCA 3PU5A 3QIMA 2QL3A 1VR5A 4I8CA 4MH5A 1P99A 5L9SA 1URDA 4GVOA 5IKBA 4E0XA 4O3AA 5I59B 4R73A 1MXZA 3D4GA 2HCAA 3WAFA 2QPQA 3K01A 4HW8A 4DIGA 2XXUA 3DM0A 4QRZA 1IXIA 3DLNA 4PFWA 2B3BA 2RF1A 4KQPA 3TTLA 1DPEA 3C9HA 1PB8A 2IEEA 4I9DA 2F6PA 3S2VA 5I57A 3VLWA 1F9BA 2P0SA 3CR9A 3N94A 1D9YA 1EZ9A 1PBQA 3FIRA 1MY2A 4OESA 1NNTA 3C4MA 1FQAA 3TCGA 3A09A 3K6UA 4FEBA 3R26A 5DVIA 3FD3A 3V89B 1JVYA 2AL5A 1GR2A 4NF8A 4U1ZA 4C1TA 3PUZE 1XT8A 1IUDA 2OLBA 5M2VA 2Q9TA 4OERA 1LBCA 3QAXA 3E3KA 4EUOA 2I49A 3PUWE 1WDNA 4TOZA 4POWA 1QUIA 3TCFA 1MXWA 3PUVE 5CBSA 4ISUA 1DSNA 3C33A 1JEUA 1B4HA 4ZZEA 1GGGA 4H6DA 4G8HA 2XXQA 3MUQA 3HPIA 2Y7KA 4F1VA 4GXSB 4NWCA 5ITPA 4F22A 1D3KA 3MBPA 1XVXA 4YKPA 1LB8A 4KFQA 1IXHA 1URSA 3WAEA 1SW1A 3PD8A 3O28A 3S9LC 1SYIA 4NF5B 3LC8A 4YU0A 3IB2A 1SQYA 4GLIA 2HQ0A 1MY1A 3FJGA 4KHZE 4LZ7A 1I69A 3KN8A 3G3IA 4U4XA 3SEYA 3UORA 3B6WA 2AL4A 5L8DA 2F7BA 2REJA 2DOJA 4LQ2A 2Q8JA 1FTKA 1SI1A 2X26A 3H6VA 4G68A 3SEVA 5B70A 4XKQA 2X7QA 2V3UA 4YAHX 5CI5A 1R9LA 3CG3A 3FVNA 3P7IA 1B51A 3H06B 5HPQA 2LAOA 3VE1B 4G2ZA 3MZBA 3RY3A 2WKYA 3DP4A 1B5HA 1MPCA 1B7ZA 1WVJA 4QSCA 1XHYA 5EHSA 4NWDA 2G93A 4H5FA 2DXRA 1MPBA 3A3CA 3MW0A 3OEMA 1EH3A 3GBAA 3U94A 1US4A 2I3WA 3MVWA 2QS2A 3IR1A 4NEDA 1QW0A 5I57B 4YKKA 3RGYA 4DXBA 2V84A 4KR5A 2ZNSA 1ZBMA 4F3PA 1ZTYA 1R9QA 3FVOA 3OOAA 3C31A 4NF8B 3PPQA 3IL1B 4H8IA 4DXCA 2HZLA 5TU0A 4BDLA 5AA4A 3B6QA 1DPPA 4IO2A 1EZOA 1M5CA 3O2AA 2DE2A 2ALUA 2H5YA 3ODBA 4R2BA 3FGSA 3IX1A 4MLVA 5CC2A 1UTBA 2AYSA 2Z8DA 4ZECA 2ONKE 3U8QA 1SI0A 5DT6A 2XX8A 1BP5A 3R6UA 1PB9A 1B6HA 3K02A 1MQHA 1AMFA 1CE2A 1JW5A 3G3KA 4GL8A 5BUUA 4GD5A 4F29A 4ZDMA 4X48A 3T9XB 3C35A 3B7DA 2QJEA 3HCQA 1H44A 1SW4A 1GVCA 3T22A 3K2DA 1II5A 1A40A 2XXWA 4JB7A 1HSEA 2Q2CA 1LAGE 1B3GA 3K4UA 4U4SA 2CZLA 1MDQA 3CFXA 3CSGA 4QHQA 4MF3A 1FCKA 1QUKA 4IO7A 5AE4A 3HHGA 3QUFA 3TTKA 4G77A 4GXAA 3RTWB 2UVJA 3PUXE 1GTKA 2FNCA 3GLBA 4OVJA 2XXIA 4Q8RA 4JWOA 3QXMA 1YPNA 5K2XA 4R6KA 3TZAA 2PYYA 5F1QA 5L9OA 3OENA 4H1XA 3LR1A 2X7PA 4EQBA 2F7CA 4OFOA 2O6AA 3FXQA 2HZKA 4KCCA 2E1SA 3O6HA 1OLCA 3TEPA 4U21A 3M3LA 1D9VA 1Y9UA 4X1BA 3W9VA 5I84A 2DYXA 1LGBC 4R6YA 1NNKA 2O1LA 4F3SA 1P1UA 1M5FA 1B32A 4IY6A 5AA2A 3C36A 3KFMA 2H9BA 3T66A 3O97A 3O6IA 4RK9A 3EHTA 2V3TA 2I3VA 3IORA 4KPTA 1PEBA 2ESNA 3TAJA 1ELJA 3E4RA 5CRYA 3TYHA 3KSJA 5CMKA 3MWBA 2REGA 4EQ9A 2F8DA 2F7AA 2XD2A 4YMAA 2Y7RA 4NF6A 1USYE 2NOOA 2VHAA 3QK6A 4JSOA 4RK2A 3C32A 5DVJA 3DP8A 1I6QA 2IA4A 5H8HB 3V8XB 3VXBA 1FQEA 4ND9A 1B0HA 3RQTA 3T93B 1IIWA 1HSLA 3IK6B 3EHSA 4YZZA 5H8NB 3E9XA 4OWDA 5AA4B 1MM6A 4IGRA 1FQDA 3D4CA 1B3FA 4U2RA 4YKJA 3KGCA 1P1NA 1MY3A 4NE4A 2XXPA 1ZU0A 4DLDA 2QMWA 3OXNA 2UVIA 3H3GA 4O3BA 4OEVA 2QS3A 4G8MA 4OMBA 2V3QA 4H65A 1O64A 1UIUA 1J1NA 2RINA 5F7VA 2RC8A 3JZJA 2GHAA 3L6HA 1VE4A 4G8NA 1AH5A 1MXYA 2OBGA 4LVQA 1B05A 1A55A 2YJPA 1A54A 4MFIA 4TLLB 2DVCA 4L17A 3TTMA 5I2KA 1R6ZA 4EQ7A 1IITA 3U93A 3IOWA 1LFIA 1MPDA 3OO9A 1DTZA 3F11A 3BFTA 3JYRA 3VVEA 1AL3A 2DP8A 4UA8A 1IZ1A 3PUYE 3EN3A 3MVYA 3JV9A 3MP1A 4GQOA 3O66A 3RT8A 3RLFE 3CSBA 2PT2A 4PFYA 1B46A 1S7YA 3SESA 3IO6A 3K1MA 5DYHA 1XS5A 3OSQA 3VLUA 4XKPA 3SETA 4EDPA 2ZXTA 4UACA 1FQFA 3TTNA 4C1UA 1TFDA 4QFOA 4XIGQ 3SEUA 5K2YA 3FATA 5AA2B 2UYEA 3IJOB 4KYSA 3TQLA 4FECA 4RXLA 3ONMA 4H67A 1P1QA 1LFGA 1ZIUA 3DP6A 4OHNA 3HHFA 1MDP1 5EHMA 2Z23A 3FUZA 3OD7A 4U1OA 5L9MA 2BJJX 3OO6A 1JQFA 3SKPA 2RC9A 3K00A 3V83A 3LUYA 2O84X 4NF6B 4YICA 1R1NA 2DWIA 3HN0A 4AB6A 4QFKA 3USDA 4ELOA 2GH9A 4LATA 4GFRA 1LCTA 3UN6A 2DVZA 4QFLA 4H8JA 1NH7A 3PD9A 4Q5TA 1NNFA 2HAVA 4JSDA 4R9FA 4QF9A 1A7LA 1MM7A 3N6UA 1LLSA 1KWHA 3RN8A 4RYAA 1N3WA 2M8CA 4PE5B 4E0WA 5I2NB 4N07A 1TWYA 4ZE8A 2UVGA 1Y1MA 3R7XA 1MQGA 1MS7A 4F31B 2FYIA 4NMYA 1NNPA 1B40A 3ZS6A 1NKXA 2OWSA 1LB9A 4F1YA 2O69A 4QSEA 4ESWA 4DCXA 1LCFA 1PBPA 2Q2AA 3UGWA 2HXWA 1N7WA 3UP9A 1N7XA 3M8UA 4ZEDA 2Y7IA 3K1NA 3GZGA 5H8SA 4BDOA 4ZEIA 3KJ7A 3ECRA 4LZ5A 5HBCA 1SDXA 5I2KB 3VFJA 2OWTA 2ZMBA 2QSXA 4DZ1A 1D4NA 1OMPA 2DE3A 4PFUA 5I56A 3I3VA 3TODA 4NTLA 5H8HA 1VSOA 3PV0E 5JTYA 2Y7WA 5DTBA 1YTVA 2DWHA 3PGFA 4JWXA 5H8NA 3LSLA 4GIZA 3Q29A 3SEWA 3QYTA 1TT1A 1S9TA 3GXAA 4OENA 4HCYA 1LBBA 3HSTA 5FTIA 1B5JA 1B3HA 5CBRA 2Y7PA 1GV8A 3OEKA 5ICQA 1CB6A 4ZEBA 1Y4TA 4BDNA 2I0CA 3KSXA 2F97A 1N84A 2OZZA 2DQVA 3O9PA 2ABHA 4DDDA 4YB7A 3HO7A 4XKNA 3T9UA 4XXUA 4OTEA 2XXXA 3ZKKA 2VD2A 1AIVA 2Z8FA 4OETA 1Y1ZA 2XHDA 4DE8A 3TQWA 3FV2A 4R9GA 2F6GA 2PVUA 2W7YA 5FTHA 5I58A 3VV5A 1PB7A 5AA3A 4ONYA 3S9EA 3MVXA 3PPOA 5A5XB 4QFNA 2UVHA 4OFJA 1QULA 1B0LA 4ZS9A 2GHBA 3K6XA 2HFBA 1JW1A 3FZVA 3PPNA 4R6HA 4NF4B 4OFLA 4THIA 3I5OA 2QS4A 4RA1A 3V5AA 1H45A 5TP9B 5LOMA 2B65A 4Q30B 3ZKLA 3H6UA 2RCBA 2I0BA 1JNFA 1AOVA 1B3LA 3CVGA 1MY0A 1B52A 3BFUA 3RPWA 2QMXA 1Z7NE 1B1HA 2H25A 2GRVA 2O7UA 4HS7A 4JXIA 3IAZA 2RKMA 4KCDA 1MXVA 4Q0CA 2NUVA 3FVKA 3UA8A 1MY4A 5ITOA 2XX7A 2R9JA 1B5IA 2XX9A 4R75A 3T9VA 3QUJA 2O7IA 2QRYA 3TFLA 4C0RA 3FXUA 3G3FA 3ZSFA 1O63A 1FQBA 2FA7A 3CFLA 1MH4A 5FHMA 4YB5A 3S9MC 5KDTB 1SVXB 1OVTA 2A5TB 4KI0E 5ELVA 5DVFA 3G3JA 1XC1A 3FXRA 4IO3A 3T9HB 4YB6A 1XVYA 5I56B 1IQ7A 4ZZAA 1H43A 5FHNA 3OELA 2PBWA 3VLVA 4LA9A 1OQGA 4GRKA 1ZKBA 3KZGA 3Q28A 4P0GA 5JTYB 2Y84A 2H4IA 3MJNA 1XOCA 2VP1A 1MH3A 5TPAA 1DTGA 2YLNA 3CFZA 3OO8A 4WEPA 1S50A 4ZEKA 1ZLQA 3H03A 3CRBA 4R2FA 3MPKA 5I2NA 3BBRA 4I1DA 3MZ1A 3IOUA 2XXRA 3TKDA 3IOTA 4IB2A 4OXVA 1POTA 2R71A 2O68A 2HAUA 4IGTA 2VD3A 2ZNUA 1MXUA 4PETA 1MQJA 1YCJA 3TELA 2UYFA 5DEXA 1MG1A 1B1XA 1PC3A 3OSRA 5CMMA 2UXAA 3LSXA 2DXYA 4F2OA 4BDQA 4OQOA 1SD3A 1LAXA 5H8QB 4U22A 1VFEA 4OEUA 3TPAA 1I6BA 5J1DA 4O3CA 2B3FA 1OIBA 4Z7EA 4K3FA 5I58B 3T96B 4F3GA 3THIA 3RT6B 3PMVA 1UTHA 1PDAA 3TTRA 3CIJA 5CMBA 2ONSA 3N5LA 3SEXA 3G3HA 4RNSA 2ZNTA 1N0TA 2F35A 3CI8A 1VFDA 5JK4A 3HV1A 4BDRA 1FTLA 3RUMA 4M4GA 2R6GE 2XXYA 3H7MA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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