1VSOA

Crystal structure of the ligand-binding core of iglur5 in complex with the antagonist (s)-atpo at 1.85 a resolution
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
251
structure length
243
Chain Sequence
TLIVTTILEEPYVMYRKSDKPLYGNDRFEGYCLDLLKELSNILGFLYDVKLVPDGKYGAQWNGMVKELIDHRADLAVAPLTITYVREKVIDFSKPFMTLGISILYRKGTPIDSADDLAKQTKIEYGAVRDGSTMTFFKKSKISTYEKMWAFMSSSALVKNSDEGIQRVLTTDYALLMESTSIEYVTQRNCNLTQIGGLIDSKGYGVGTPIGSPYRDKITIAILQLQEEGKLHMMKEKWWRGNG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor, ionotropic kainate 1
publication title Partial agonism and antagonism of the ionotropic glutamate receptor iGLuR5: structures of the ligand-binding core in complex with domoic acid and 2-amino-3-[5-tert-butyl-3-(phosphonomethoxy)-4-isoxazolyl]propionic acid.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 75
structure length 243
sequence length 251
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-03-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1vsoA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1vsoA02
2ZXTA 1B3LA 2I4CA 5DT6A 2GRVA 2QL3A 5ICTA 4GIZA 2ONKE 4ZS9A 1A55A 3TTMA 1SI0A 3H6WA 1B4ZA 3TUSA 4YU0A 4XKNA 1FTJA 3C9HA 4I1DA 2X26A 4NF4A 4FE8A 3ILUB 1PBQA 4Z0IA 2I4BA 1QW0A 4PFWA 1II5A 3SETA 2HCAA 1N3WA 2I0CA 4IGRA 3VVDA 3EHSA 4IO6A 3P7IA 1MY3A 2G29A 1B3HA 3R26A 3PV0E 1A99A 5CMBA 2ALUA 5AA4A 2AL4A 3PUYE 1M5CA 1MG1A 3C4MA 1P1QA 5BWJA 3K6WA 4KYSA 4NF5A 5L9MA 1JQFA 3HHGA 3LUYA 4HW8A 3IB2A 2VP1A 1DSNA 3TODA 3OENA 1QVSA 3M3FA 3TMGA 3MZ1A 3VFJA 4H67A 1MXZA 3CIJA 3S9NC 1DTZA 1FTMA 4ZE8A 3JYRA 1MS7A 2P2AA 4F3GA 4OTEA 4ZEBA 3LSXA 3TTKA 2YPNA 3LSWA 5H8FB 1LAGE 1H43A 5I56B 3DP6A 5L8DA 3PPPA 1B5JA 1MRPA 1IXCA 4YAHX 5A5XB 3VDFA 4IO3A 4R73A 1AL3A 3DP4A 3FVNA 3MQ9A 2ZMBA 2QPQA 1H45A 4XKQA 1NKXA 2UVGA 4YICA 2R71A 3TTRA 1URGA 5B70A 2VGQA 4GOTA 4UACA 3ECRA 1O64A 5ICQA 1LB9A 4JSOA 3MJNA 3KZGA 1S9TA 4OERA 2Z23A 4KQPA 1M5EA 3T9HB 3EHUA 2Y7WA 3C35A 2B3BA 2OWSA 4OEVA 1QUIA 1B1HA 1N0TA 1FQAA 4QFPA 4AB6A 1B0LA 3HSTA 2PBWA 3PMVA 2DE2A 5I56A 1OLCA 3B6WA 3PD8A 2ONSA 4ZEKA 2PT1A 4P0IA 2XXTA 3TDJA 1P1NA 3N26A 3H6UA 5A5XA 2PVUA 1Q35A 4BLAA 3HCQA 4N13A 3QK6A 2OWTA 1QUKA 4F2OA 1SI1A 4F22A 3S9MC 2BJJX 5K2YA 5DEXA 3FASA 2P1SA 4RK2A 1MY4A 4GLIA 4IY6A 4OVJA 2ZYMA 4Q8RA 4YKPA 1MDQA 3IL1B 3V5AA 1BP5A 3AXFA 1VSOA 3MPKA 1USYE 3M3KA 3CG3A 5HM4B 1GR2A 4G68B 4GXSB 4H8JA 1N7WA 4PETA 2V3UA 5FHNA 2QMXA 3GBAA 2PX1A 2RC7A 1B9JA 4P11A 5I57B 1B58A 4JDFA 5AA3A 3H7MA 2H5YA 2DWAA 2Z8DA 5KCJB 3TTNA 3IAZA 4Z7EA 4PFUA 3MUQA 5LOMA 2XXQA 1BLFA 1D9VA 1GVCA 5IKBA 2H98A 2IA4A 4OEUA 3SEWA 3IJXB 4GFRA 1ZBMA 2FNCA 1UTBA 4TLLB 2H25A 3U72A 4MF3A 4ISUA 3CFXA 3KN3A 4FJPA 3Q26A 2O1MA 2IEEA 1UQWA 3PPOA 5CBSA 3E9XA 2ABHA 3QUJA 4F3PA 1UTHB 5CBRA 2F5XA 2QMWA 1YPNA 1QKAA 5I2NA 1N84A 3KSXA 2XHDA 3A3UA 2I58A 4U1OA 2Y7KA 3TTLA 3OMBA 3RT6B 3ONMA 4QFKA 4F19A 4YB7A 4G8NA 5KCJA 4OFLA 2A5TB 2RCBA 2YLNA 3GLBA 3K1MA 1D9YA 3U8QA 3IR1A 3OEKA 1LLSA 5CI5A 2HFBA 3Q29A 1N7XA 5H8HB 4BDNA 1SQYA 3THIA 3PU5A 4OETA 3T96B 3OO9A 3OSRA 2VD3A 4ZEIA 3HHFA 2UXAA 3VLVA 1MQIA 3U92A 1B4HA 2Q9TA 3RTWB 3RGYA 4OZ9A 3KOSA 2QS3A 2H9BA 1LB8A 1GV8A 5K2XA 1SVXB 4H0WA 1MM6A 1IXIA 2DWIA 5DVJA 2THIA 4U4XA 4YZZA 1SW4A 3MBPA 1MXVA 3OO8A 1SBPA 3LSFB 4EUOA 5FTHA 1EZ9A 1VE4A 4F3BA 4F29A 4ELQA 1NMUA 4RJZA 1JEUA 1R6ZA 4QRZA 4KCDA 2QS4A 4TLMB 1JW5A 1B0HA 3SKPA 1AMFA 4NF4B 4ZZEA 1OLAA 3OOAA 3A3CA 1B6HA 4OESA 1B05A 4I62A 1MH4A 1IUDA 1O63A 4WEDA 5ISUA 3QIMA 1A7LA 1OQHA 1IITA 1XOCA 1PB8A 4Q30B 1ZTYA 2FYIA 1Y20A 4RK9A 4JWYA 4LONB 2O7UA 4ND9A 1B46A 4R6YA 4G2ZA 3ODBA 5DVIA 3MZBA 4HTGA 1LCTA 4G77A 2XXWA 1A40A 4GF8A 3UORA 3C32A 4ESWA 4U23A 2G93A 1MM7A 2O1LA 1NNTA 3PGFA 1FW0A 3QXMA 1T0KA 1Y1MA 3O97A 4F2QA 3PPQA 3EHTA 1JVXA 2OLBA 5I2KA 2Q89A 3WAEA 3DLNA 3MP8A 4ESXA 1M5BA 5DYHA 3CI8A 3ILTB 2F97A 5JTYB 4K3FA 3FVOA 4LQ5A 3CFLA 2RC9A 3TCHA 3UN6A 4NWCA 2Q2AA 3VXCA 2ANJA 2OZZA 1SD3A 2F6GA 2OCUA 4U4SA 4HCYA 4XTCQ 3EN3A 4FATA 1VFEA 3FGSA 2RINA 1POTA 2B65A 2H4IA 3T22A 2AIXA 1P1OA 3CFZA 1NNKA 3FUZA 4OQOA 2HAVA 4M1VA 2V3QA 3H6VA 4R6HA 3IB1A 3FZVA 5DTBA 1RYXA 2DXRA 3D4GA 5CC2A 3M3LA 1VFDA 1USYH 3H03A 3EPEA 3H06B 3FJMA 2XXUA 3S2VA 3C33A 4F3SA 2NXOA 3G3IA 2ZNSA 1M5FA 1MY0A 5JTYA 4R72A 2RF1A 2HZKA 1N3XA 3UGWA 4WXJA 3U94A 3V89B 1FQFA 4WKMA 5L9OA 2REGA 3G3KA 4JWXA 3UA8A 3OEMA 3O28A 4OXVA 2AYSA 4R2FA 4KD5A 2GFEA 2O69A 2V84A 3SERA 3IOVA 1SDXA 4OMBA 5DEXB 1SW2A 3RQTA 3VVEA 1R1NA 3MVWA 1NNPA 2I3VA 3K1PA 3OELA 4NWDA 3RLFE 3KEIA 3HO7A 4O3BA 2CMOA 2QSXA 4N6PA 4DXBA 3Q28A 5KDTA 1RKMA 1B40A 1Y4CA 1FTKA 1ZU0A 2XXPA 4DCYA 1B32A 2F7BA 5H8NA 4MH5A 5TP9A 1ZKBA 3TCFA 4AB5A 4M4GA 3VV5A 1Y1ZA 3FVKA 4FIMA 3H3GA 2ESNA 4X1BA 2Z8EA 4LZ8A 3C36A 3LBSA 4KR5A 1P1UA 3E3KA 4GWOA 3PPNA 2PMSA 2R6GE 1ELJA 3CVGA 3PUXE 1ANFA 1MDP1 3K6UA 1UTBB 2Y7IA 2WKYA 3H4ZA 3PUVE 4KYDA 2B3FA 3SEXA 3WAFA 4EF2A 2DVZA 2UVIA 2P0SA 2I3WA 1OQGA 2Z8FA 3BBRA 5AA1A 4QF9A 1XT8A 3PUZE 3FIRA 3K02A 5I2NB 1H76A 2QJEA 1D3KA 1LFHA 4KPTA 4QFLA 1CE2A 3T93B 4BDMA 3E13X 4LA9A 3K6XA 3TAJA 2GHBA 3IO6A 4I9DA 4G4PA 2V25A 2I49A 2XXHA 3RTFB 4EQ7A 4G68C 4QSDA 1IXGA 3GXAA 3N5LA 3K00A 1FQCA 3K01A 5CMKA 3LC8A 5H8QB 1MXUA 3S9EA 1B2HA 1BTJA 3USDA 4KFQA 4ELPA 2Z22A 3BKIB 3MPLA 4XKPA 3KGCA 1Y3NA 1EU8A 4F1UA 1BIYA 1MY2A 1TFDA 2NOOA 3V8XB 4IO7A 4XIGQ 5H8SA 4NF6A 3JV9A 2I48A 3MW0A 4FEDA 3TYHA 4KHZE 4H5FA 3GZGA 3MVXA 5EYFA 4F1YA 1I69A 1URDA 3O6IA 1B5HA 4FEBA 1SW1A 2DWJA 3MP1A 1IXHA 3DP8A 1KWHA 5AA2A 1US4A 3FD3A 5H8QA 1N04A 4F39A 1MQHA 1B51A 2DE3A 5ITPA 1H3DA 3K6VA 4X9TA 4YKKA 4YMAA 3C31A 3T9VA 2XXRA 2GH9A 3TELA 2CZLA 3FATA 2NWJA 4DXCA 4WEPA 1L5TA 1YAEA 3IK6B 2KLFA 1FQEA 4MBPA 3KJ7A 1ATGA 5DVFA 1F9BA 3K1NA 1R9LA 1Q1KA 3V83A 4DXUA 4EXLA 1FTLA 1B3FA 3SESA 3JZJA 3FJGA 4RA1A 4JSDA 4YKIA 4P0GA 1LBBA 1QKBA 1B1XA 4C1TA 4RY1A 3IX1A 3RT8A 2O68A 1B3EA 1GTKA 1NH7A 4H8IA 3FXQA 4U21A 3EQ1A 1MY1A 4C1UA 3OXNA 3CG1A 3IOUA 2O6AA 5J1DA 4POXA 3O6GA 1EZOA 2DSFA 5AA2D 2D5WA 1B3GA 4GL0A 4X48A 4OENA 2ZYOA 4LUBA 5I2KB 3B6QA 2YJPA 3IOWA 1AOVA 3VXBA 1TT1A 2OJTA 2OK2A 2XD3A 4HS7A 2DQVA 4RYAA 3TZAA 1SYIA 2REJA 4YKJA 1XC1A 2O51A 3R7XA 4FORA 5ELVA 1MQGA 1B7UA 2DVCA 4KI0E 5IAIA 1TWYA 3RN8A 4UA8A 3TFLA 4OHNA 3G3GA 1P99A 5I84A 2UVJA 4KYEA 3T9XB 4BDLA 5EHMA 3M8UA 1BKAA 5I58A 1S50A 1JVYA 1US5A 4X1DA 4H65A 1JNFA 1FQDA 3MP6A 1LCFA 1MXXA 3T66A 2DYXA 1JW4A 4QFOA 1NNFA 3IORA 4MLVA 1MXYA 1UIVA 4XKRA 3I5OA 4QFNA 2D3IA 1B5IA 4EXKA 1URSA 3RUMA 2ZYNA 2Q8JA 1OIBA 1LBCA 5JK4A 3ZSFA 3VVFA 4NMYA 1FTOA 4HCWA 4DIGA 1MH3A 4GRKA 4THIA 5M2VA 4EF1A 2E0SA 3N94A 3T9UA 2F34A 2O84X 1XVXA 2ZYKA 4OWDA 1XS5A 1Y3PA 2HEUA 1B7ZA 4RPNA 3IB0A 2RC8A 1OVTA 5CRYA 4U1ZA 4RPOA 3KBRA 3B7DA 3HPIA 2QS2A 3U93A 4MLQA 1HSJA 5KDTB 4XXUA 3Q27A 2W7YA 1WVJA 5HBCA 4O3AA 2HZLA 3K4UA 5H8NB 5F1QA 2R9JA 2DP8A 5TP9B 4QSEA 2LAOA 3B6TA 4JWOA 4OFOA 1ZLQA 2Y7RA 4H1XA 3PUWE 3FJ7A 4IO4A 4ZECA 3O9PA 1MPDA 2UYEA 5ITOA 3MZ9A 4R9GA 5B7DA 4BDOA 3SEUA 4LZ5A 2HXWA 2NVUB 1M5DA 3TQWA 4GVOA 1DMBA 4YB5A 4NF8B 4GXAA 3C34A 2PYYA 2F8DA 3K2DA 3SEYA 1DPEA 3TEPA 4OYVA 1H44A 5TPAB 2Y84A 5EHSA 4NEDA 4PP0A 2DOJA 4BDQA 3SDFA 3IJOB 1WODA 3GBBA 3PMXA 2V3TA 4G8HA 3MVYA 2XXIA 3FV1A 4EQBA 4QHQA 3ZKKA 3TCGA 2XX8A 2F78A 3F11A 4GQOA 1SW5A 1AH5A 3W15C 4NTLA 4R6KA 4O3CA 3KOTA 4ZEDA 1ZJLA 3O29A 4OFJA 3TPAA 4RNSA 4IGTA 2HQ0A 2M8CA 3G3HA 3LSLA 2F7CA 2FA7A 1IQ7A 3E4RA 1XHYA 4IB2A 4MFIA 4DE8A 5H8FA 3O66A 3MC2A 4DLDA 3H6TA 5CM6A 2DWHA 3O6HA 4FECA 3ZKLA 3D4CA 4NF8A 4IY5A 1Y9UA 4U22A 1XVYA 5HPQA 4F1VA 1LAFE 1AIVA 5TPAA 5FHMA 3EF7A 1PB9A 5I59B 1QULA 4F18A 3KN8A 4BDRA 1N76A 4POWA 3KSJA 4ELRA 2ZNUA 5BUUA 1D4NA 2XXYA 3KG2A 4NF6B 3RY3A 1I6BA 5L9SA 3PD9A 1YCJA 3L6GA 3QUFA 4JBZA 5CMMA 3UK4A 4YMBA 4Q0CA 5FHOA 1UIUA 3VLWA 4H5GA 1RYOA 4R75A 1MPCA 4EDPA 3DELB 2QRYA 2RCAA 2I0BA 2Q88A 3PMWA 4R2BA 1PBPA 1A8FA 2X7QA 3DM0A 5AA2B 1FQBA 3FXRA 2O7IA 3RNNA 1ZMGA 4NE4A 3A09A 4L17A 1MQJA 4QSCA 4LP2B 5JEIA 4ONYA 1QJMA 4DDDA 3I3VA 2RKMA 3O2AA 1JEVA 1J1NA 1DOTA 5I59A 2F36A 1S7YA 1WDNA 1QUJA 1PEBA 1I6QA 3BFTA 4TOZA 3CSBA 3N6TA 1CB6A 2AL5A 4C0RA 1HSLA 2F7AA 1PB7A 1NFTA 3IO4A 3MVZA 1Y4TA 4F31B 4AQ4A 4LATA 4GD5A 2VD2A 3KJTA 3FXUA 2F35A 3G7WA 4G68A 1OMPA 1Z7ME 3OSQA 3VE1B 5F7VA 1LSTA 4FAJA 5FTIA 5I57A 1A54A 4G8MA 1MPBA 1B52A 1LGBC 1FCKA 3G3JA 4YB6A 3TKDA 4KCCA 1TFAA 2A5SA 2E1SA 3U1OA 4JXIA 3L6HA 3MAMA 4IO2A 1NH8A 1LFIA 1JW1A 1PDAA 4ZE9A 2I6EA 4PE5B 3W9WA 1HSEA 3BFUA 3K0VA 1B7HA 3HN0A 2NUVA 4TQUQ 2ONRA 4R74A 1JETA 4IO5A 2Y7PA 4GL8A 5TU0A 1Z7NE 1ZIUA 3TQLA 4R9FA 4PQJA 3QAXA 2DS9A 1YTVA 2GHAA 3N6UA 2DXYA 2DE4A 3S4UA 4LZ7A 1IEJA 1UTHA 1Y3QA 2PT2A 1R9QA 1NL5A 2Q2CA 1LAXA 5KZTA 3CSGA 2VHAA 2V93A 4ECFA 3LR1A 3MWBA 1DTGA 2D21A 1P1WA 1EZPA 1EH3A 2HAUA 2XXVA 4H6DA 3ZS6A 3W9VA 3SEVA 3UIFA 2A5TA 3R6UA 2UYFA 2X7PA 3OO7A 1LFGA 1LAHE 3KN7A 3IOTA 3OO6A 2QS1A 4Q5TA 4EQ9A 3QYTA 1GGGA 4ZZAA 1POY1 4DCXA 5CMCA 3G3FA 5I58B 3FVGA 1DPPA 5H8HA 1MXWA 4ZDMA 1O7TA 2H99A 4PFYA 1I6AA 1VR5A 3Q25A 2VOZA 4ZEFA 4E0WA 4RXLA 2XD2A 3QSLA 3CR9A 2XX7A 3HV1A 5AE4A 1TXFA 3OD7A 1MQDA 1IZ1A 4ELOA 3FV2A 4JB7A 4E0XA 2UVHA 1IIWA 2XX9A 3RPWA 4N07A 1PC3A 3I6VA 4I8CA 4DZ1A 3VLUA 3KFMA 2OBGA 2F6PA 5AA4B 2ZNTA 4LVQA 3UP9A 1A8EA 4PFTA 3PPRA 3S9LC 1SYHA 2XXXA 4LQ2A 3CRBA 4NF5B 4U2RA 1OVBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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